SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_1625 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_1625 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 12 hits to proteins with known functional sites (download)

Q6BF16 2-dehydro-3-deoxy-6-phosphogalactonate aldolase; 2-oxo-3-deoxygalactonate 6-phosphate aldolase; 6-phospho-2-dehydro-3-deoxygalactonate aldolase; 6-phospho-2-keto-3-deoxygalactonate aldolase; KDPGal; EC 4.1.2.21 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
49% identity, 93% coverage: 15:207/208 of query aligns to 8:200/205 of Q6BF16

query
sites
Q6BF16
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
I
 
I
L
 
L
R
|
R
G
 
G
V
 
I
K
 
T
P
 
P
G
 
D
E
 
E
V
 
A
E
 
L
A
 
A
I
 
H
G
 
V
D
 
G
A
 
A
L
 
V
A
 
I
D
 
D
A
 
A
G
 
G
F
 
F
T
 
D
L
 
A
I
 
V
E
|
E
V
 
I
P
 
P
L
 
L
N
 
N
S
 
S
P
 
P
D
 
Q
P
 
W
F
 
E
E
 
Q
S
 
S
I
 
I
T
 
P
R
 
A
L
 
I
A
 
V
R
 
D
R
 
A
L
 
Y
G
 
G
D
 
D
R
 
K
A
 
A
M
 
L
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
V
L
 
L
R
 
K
E
 
P
A
 
E
E
 
Q
V
 
V
T
 
D
A
 
A
V
 
L
A
 
A
E
 
R
S
 
M
A
 
G
G
 
C
R
 
Q
L
 
L
I
 
I
V
 
V
S
 
T
P
 
P
N
 
N
A
 
I
S
 
H
P
 
S
A
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
R
A
 
R
T
 
A
A
 
V
A
 
G
H
 
Y
G
 
G
L
 
M
I
 
T
S
 
V
L
 
C
P
 
P
G
 
G
I
 
C
A
 
A
T
 
T
P
 
A
T
 
T
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
Q
A
 
A
L
 
L
K
|
K
L
 
I
F
 
F
P
 
P
A
 
S
E
 
S
A
 
A
A
 
F
S
 
G
P
 
P
V
 
Q
A
 
Y
L
 
I
K
 
K
A
 
A
M
 
L
R
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
S
A
 
D
T
 
I
R
 
A
V
 
V
L
 
F
P
 
A
V
|
V
G
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
T
P
 
P
D
 
E
T
 
N
I
 
L
Q
 
A
P
 
Q
W
 
W
R
 
I
D
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
C
S
 
A
G
 
G
F
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
S
A
 
D
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
P
 
A
G
 
G
F
 
Q
S
 
S
A
 
V
A
 
E
E
 
R
V
 
T
G
 
A
A
 
Q
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
V
R
 
K
A
 
A
L
 
Y

2v82A Kdpgal complexed to kdpgal (see paper)
49% identity, 92% coverage: 15:206/208 of query aligns to 7:198/205 of 2v82A

query
sites
2v82A
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
I
 
I
L
 
L
R
|
R
G
 
G
V
 
I
K
 
T
P
 
P
G
 
D
E
 
E
V
 
A
E
 
L
A
 
A
I
 
H
G
 
V
D
 
G
A
 
A
L
 
V
A
 
I
D
 
D
A
 
A
G
 
G
F
 
F
T
 
D
L
 
A
I
 
V
E
|
E
V
 
I
P
 
P
L
 
L
N
|
N
S
 
S
P
 
P
D
 
Q
P
 
W
F
 
E
E
 
Q
S
 
S
I
 
I
T
 
P
R
 
A
L
 
I
A
 
V
R
 
D
R
 
A
L
 
Y
G
 
G
D
 
D
R
 
K
A
 
A
M
 
L
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
V
L
 
L
R
 
K
E
 
P
A
 
E
E
 
Q
V
 
V
T
 
D
A
 
A
V
 
L
A
 
A
E
 
R
S
 
M
A
 
G
G
 
C
R
 
Q
L
 
L
I
 
I
V
|
V
S
x
T
P
 
P
N
 
N
A
 
I
S
 
H
P
 
S
A
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
R
A
 
R
T
 
A
A
 
V
A
 
G
H
 
Y
G
 
G
L
 
M
I
 
T
S
 
V
L
 
C
P
 
P
G
 
G
I
 
C
A
 
A
T
 
T
P
 
A
T
 
T
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
Q
A
 
A
L
 
L
K
|
K
L
 
I
F
|
F
P
 
P
A
 
S
E
 
S
A
 
A
A
 
F
S
 
G
P
 
P
V
 
Q
A
 
Y
L
 
I
K
 
K
A
 
A
M
 
L
R
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
S
A
 
D
T
 
I
R
 
A
V
 
V
L
 
F
P
 
A
V
|
V
G
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
T
P
 
P
D
 
E
T
 
N
I
 
L
Q
 
A
P
 
Q
W
 
W
R
 
I
D
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
C
S
 
A
G
 
G
F
 
A
G
 
G
L
 
L
G
|
G
S
|
S
A
 
D
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
P
 
A
G
 
G
F
 
Q
S
 
S
A
 
V
A
 
E
E
 
R
V
 
T
G
 
A
A
 
Q
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
V
R
 
K
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1wa3D Mechanism of the class i kdpg aldolase (see paper)
32% identity, 95% coverage: 11:207/208 of query aligns to 6:199/203 of 1wa3D

query
sites
1wa3D
F
 
F
A
 
K
Q
 
K
C
 
H
P
 
K
L
 
I
I
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
A
V
 
N
K
 
S
P
 
V
G
 
E
E
 
E
V
 
A
E
 
K
A
 
E
I
 
K
G
 
A
D
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
F
D
 
E
A
 
G
G
 
G
F
 
V
T
 
H
L
 
L
I
 
I
E
|
E
V
 
I
P
 
T
L
 
F
N
x
T
S
 
V
P
 
P
D
 
D
P
 
A
F
 
D
E
 
T
S
 
V
I
 
I
T
 
K
R
 
E
L
 
L
A
 
S
R
 
F
R
 
L
L
 
K
G
 
E
D
 
K
R
 
G
A
 
A
M
 
I
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
V
L
 
T
R
 
S
E
 
V
A
 
E
E
 
Q
V
 
C
T
 
R
A
 
K
V
 
A
A
 
V
E
 
E
S
 
S
A
 
G
G
 
A
R
 
E
L
 
F
I
 
I
V
 
V
S
|
S
P
|
P
N
 
H
A
 
L
S
 
D
P
 
E
A
 
E
V
 
I
I
 
S
A
 
Q
A
 
F
T
 
C
A
 
K
A
 
E
H
 
K
G
 
G
L
 
V
I
 
F
S
 
Y
L
 
M
P
 
P
G
 
G
I
 
V
A
 
M
T
 
T
P
 
P
T
 
T
E
 
E
A
 
L
F
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
M
D
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
H
T
 
T
A
 
I
L
 
L
K
|
K
L
 
L
F
|
F
P
 
P
A
 
G
E
 
E
A
 
V
A
 
V
S
 
G
P
 
P
V
 
Q
A
 
F
L
 
V
K
 
K
A
 
A
M
 
M
R
 
K
A
 
G
V
 
P
L
 
F
P
 
P
V
 
-
A
 
N
T
 
V
R
 
K
V
 
F
L
 
V
P
 
P
V
 
T
G
 
G
G
|
G
I
 
V
T
 
N
P
 
L
D
 
D
T
 
N
I
 
V
Q
 
C
P
 
E
W
 
W
R
 
F
D
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
S
 
L
G
 
A
F
 
V
G
 
G
L
 
V
G
|
G
S
|
S
A
 
A
L
 
L
Y
 
V
R
 
K
P
 
G
G
 
-
F
 
-
S
 
T
A
 
P
A
 
D
E
 
E
V
 
V
G
 
R
A
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
K
A
 
A
F
 
F
V
 
V
R
 
E
A
 
K
L
 
I

1euaA Schiff base intermediate in kdpg aldolase from escherichia coli (see paper)
34% identity, 69% coverage: 31:174/208 of query aligns to 32:171/213 of 1euaA

query
sites
1euaA
I
 
M
G
 
A
D
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
V
D
 
A
A
 
G
G
 
G
F
 
V
T
 
R
L
 
V
I
 
L
E
|
E
V
 
V
P
 
T
L
 
L
N
x
R
S
 
T
P
 
E
D
 
C
P
 
A
F
 
V
E
 
D
S
 
A
I
 
I
T
 
R
R
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
E
L
 
V
G
 
P
D
 
E
R
 
-
A
 
A
M
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
V
L
 
L
R
 
N
E
 
P
A
 
Q
E
 
Q
V
 
L
T
 
A
A
 
E
V
 
V
A
 
T
E
 
E
S
 
A
A
 
G
G
 
A
R
 
Q
L
 
F
I
 
A
V
x
I
S
 
S
P
 
P
N
 
G
A
 
L
S
 
T
P
 
E
A
 
P
V
 
L
I
 
L
A
 
K
A
 
A
T
 
-
A
 
A
A
 
T
H
 
E
G
 
G
L
 
T
I
 
I
S
 
P
L
 
L
-
 
I
P
 
P
G
 
G
I
 
I
A
 
S
T
 
T
P
 
V
T
 
S
E
 
E
A
 
L
F
 
M
A
 
L
A
 
G
L
 
M
D
 
D
A
 
Y
G
 
G
A
 
L
T
 
K
A
 
E
L
 
F
K
|
K
L
 
F
F
 
F
P
 
P
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
N
S
 
G
P
 
G
V
 
V
A
 
-
L
 
-
K
 
K
A
 
A
M
 
L
R
 
Q
A
 
A
V
 
I
L
 
A
-
 
G
P
 
P
V
 
F
A
 
S
T
 
Q
-
 
V
R
 
R
V
 
F
L
 
C
P
 
P
V
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
S
P
 
P
D
 
A
T
 
N
I
 
-
Q
 
-
P
 
-
W
 
Y
R
 
R
D
 
D

P0A955 KHG/KDPG aldolase; EC 4.1.3.16; EC 4.1.2.14 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
34% identity, 69% coverage: 31:174/208 of query aligns to 32:171/213 of P0A955

query
sites
P0A955
I
 
M
G
 
A
D
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
V
D
 
A
A
 
G
G
 
G
F
 
V
T
 
R
L
 
V
I
 
L
E
|
E
V
 
V
P
 
T
L
 
L
N
x
R
S
 
T
P
 
E
D
 
C
P
 
A
F
 
V
E
 
D
S
 
A
I
 
I
T
 
R
R
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
E
L
 
V
G
 
P
D
 
E
R
 
-
A
 
A
M
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
V
L
 
L
R
 
N
E
 
P
A
 
Q
E
 
Q
V
 
L
T
 
A
A
 
E
V
 
V
A
 
T
E
 
E
S
 
A
A
 
G
G
 
A
R
 
Q
L
 
F
I
 
A
V
 
I
S
 
S
P
 
P
N
 
G
A
 
L
S
 
T
P
 
E
A
 
P
V
 
L
I
 
L
A
 
K
A
 
A
T
 
-
A
 
A
A
 
T
H
 
E
G
 
G
L
 
T
I
 
I
S
 
P
L
 
L
-
 
I
P
 
P
G
 
G
I
 
I
A
 
S
T
 
T
P
 
V
T
 
S
E
 
E
A
 
L
F
 
M
A
 
L
A
 
G
L
 
M
D
 
D
A
 
Y
G
 
G
A
 
L
T
 
K
A
 
E
L
 
F
K
|
K
L
 
F
F
 
F
P
 
P
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
N
S
 
G
P
 
G
V
 
V
A
 
-
L
 
-
K
 
K
A
 
A
M
 
L
R
 
Q
A
 
A
V
 
I
L
 
A
-
 
G
P
 
P
V
 
F
A
 
S
T
 
Q
-
 
V
R
 
R
V
 
F
L
 
C
P
 
P
V
x
T
G
 
G
G
|
G
I
 
I
T
 
S
P
 
P
D
 
A
T
x
N
I
 
-
Q
 
-
P
 
-
W
 
Y
R
 
R
D
 
D

Sites not aligning to the query:

5xsfA Crystal structure of the 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase of zymomonas mobilis zm4 with 3-phosphoglycerate
32% identity, 74% coverage: 15:168/208 of query aligns to 13:164/209 of 5xsfA

query
sites
5xsfA
P
 
P
L
 
V
I
 
M
A
 
P
I
 
V
L
 
L
R
x
V
G
 
I
V
x
E
K
x
D
P
 
I
G
 
A
E
x
D
V
 
A
E
 
K
A
 
P
I
 
I
G
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
V
D
 
A
A
 
G
G
 
G
F
 
L
T
 
N
L
 
V
I
 
L
E
 
E
V
 
V
P
 
T
L
 
L
N
 
R
S
 
T
P
 
P
D
 
C
P
 
A
F
 
L
E
 
E
S
 
A
I
 
I
T
 
K
R
 
I
L
 
M
A
 
K
R
 
E
R
 
V
L
 
P
G
 
G
D
 
-
R
 
-
A
 
A
M
 
V
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
L
 
L
R
 
N
E
 
A
A
 
K
E
 
M
V
 
L
T
 
D
A
 
Q
V
 
A
A
 
Q
E
 
E
S
 
A
A
 
G
G
 
C
R
 
E
L
 
F
I
 
F
V
 
V
S
 
S
P
 
P
N
 
G
A
 
L
S
 
T
P
 
A
A
 
D
V
 
L
I
 
G
A
 
K
A
 
H
T
 
A
A
 
V
A
 
A
H
 
Q
G
 
K
L
 
A
I
 
A
S
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
V
A
 
A
T
 
N
P
 
A
T
 
A
E
 
D
A
 
V
F
 
M
A
 
L
A
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
L
T
 
D
A
 
R
L
 
F
K
 
K
L
 
F
F
 
F
P
 
P
A
 
A
E
 
E
A
 
N
A
 
I
S
 
G
P
 
G
V
 
L
-
 
P
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
S
M
 
M
R
 
A
A
 
S
V
 
V
L
 
F
P
 
R
V
 
-
A
 
Q
T
 
V
R
 
R
V
 
F
L
 
C
P
 
P
V
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
P
D
 
T
T
 
S

1mxsA Crystal structure of 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate (kdpg) aldolase from pseudomonas putida. (see paper)
32% identity, 76% coverage: 15:172/208 of query aligns to 21:174/216 of 1mxsA

query
sites
1mxsA
P
 
P
L
 
V
I
 
I
A
 
T
I
 
I
L
 
A
R
 
R
G
 
-
V
 
-
K
 
-
P
 
E
G
 
E
E
 
D
V
 
I
E
 
L
A
 
P
I
 
L
G
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
G
G
 
G
F
 
I
T
 
R
L
 
T
I
 
L
E
|
E
V
 
V
P
 
T
L
 
L
N
x
R
S
 
S
P
 
Q
D
 
H
P
 
G
F
 
L
E
 
K
S
 
A
I
 
I
T
 
Q
R
 
V
L
 
L
A
 
-
R
 
R
R
 
E
L
 
Q
G
 
R
D
 
P
R
 
E
A
 
L
M
 
C
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
V
L
 
L
R
 
D
E
 
R
A
 
S
E
 
M
V
 
F
T
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
E
E
 
A
S
 
A
A
 
G
G
 
A
R
 
Q
L
 
F
I
 
V
V
|
V
S
x
T
P
|
P
N
 
G
A
 
I
S
 
T
P
 
E
A
 
D
V
 
I
I
 
L
A
 
E
A
 
A
T
 
G
A
 
V
A
 
D
H
 
S
G
 
E
L
 
I
I
 
P
S
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
I
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
S
E
 
E
A
 
I
F
 
M
A
 
M
A
 
G
L
 
Y
D
 
A
A
 
L
G
 
G
A
 
Y
T
 
R
A
 
R
L
 
F
K
|
K
L
 
L
F
 
F
P
 
P
A
 
A
E
 
E
A
 
I
A
 
S
S
 
G
P
 
G
V
 
V
-
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
A
M
 
F
R
 
G
A
 
G
V
 
-
L
 
-
P
 
P
V
 
F
A
 
G
-
 
D
T
 
I
R
 
R
V
 
F
L
 
C
P
 
P
V
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
N
P
 
P
D
 
A
T
 
N
I
 
V
Q
 
R
P
 
N
W
 
Y

P00885 2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate aldolase; KDPG-aldolase; Phospho-2-dehydro-3-deoxygluconate aldolase; Phospho-2-keto-3-deoxygluconate aldolase; EC 4.1.2.14 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see paper)
32% identity, 76% coverage: 15:172/208 of query aligns to 31:184/226 of P00885

query
sites
P00885
P
 
P
L
 
V
I
 
I
A
 
T
I
 
I
L
 
A
R
 
R
G
 
-
V
 
-
K
 
-
P
 
E
G
 
E
E
 
D
V
 
I
E
 
L
A
 
P
I
 
L
G
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
G
G
 
G
F
 
I
T
 
R
L
 
T
I
 
L
E
 
E
V
 
V
P
 
T
L
 
L
N
 
R
S
 
S
P
 
Q
D
 
H
P
 
G
F
 
L
E
 
K
S
 
A
I
 
I
T
 
Q
R
 
V
L
 
L
A
 
-
R
 
R
R
 
E
L
 
Q
G
 
R
D
 
P
R
 
E
A
 
L
M
 
C
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
L
 
L
R
 
D
E
 
R
A
 
S
E
 
M
V
 
F
T
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
E
E
 
A
S
 
A
A
 
G
G
 
A
R
 
Q
L
 
F
I
 
V
V
 
V
S
 
T
P
 
P
N
 
G
A
 
I
S
 
T
P
 
E
A
 
D
V
 
I
I
 
L
A
 
E
A
 
A
T
 
G
A
 
V
A
 
D
H
 
S
G
 
E
L
 
I
I
 
P
S
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
I
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
S
E
 
E
A
 
I
F
 
M
A
 
M
A
 
G
L
 
Y
D
 
A
A
 
L
G
 
G
A
 
Y
T
 
R
A
 
R
L
 
F
K
|
K
L
 
L
F
 
F
P
 
P
A
 
A
E
 
E
A
 
I
A
 
S
S
 
G
P
 
G
V
 
V
-
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
A
M
 
F
R
 
G
A
 
G
V
 
-
L
 
-
P
 
P
V
 
F
A
 
G
T
 
D
-
 
I
R
 
R
V
 
F
L
 
C
P
 
P
V
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
N
P
 
P
D
 
A
T
 
N
I
 
V
Q
 
R
P
 
N
W
 
Y

Sites not aligning to the query:

1wauA Structure of kdpg aldolase e45n mutant (see paper)
33% identity, 69% coverage: 31:174/208 of query aligns to 32:171/213 of 1wauA

query
sites
1wauA
I
 
M
G
 
A
D
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
V
D
 
A
A
 
G
G
 
G
F
 
V
T
 
R
L
 
V
I
 
L
E
x
N
V
 
V
P
 
T
L
 
L
N
x
R
S
 
T
P
 
E
D
 
C
P
 
A
F
 
V
E
 
D
S
 
A
I
 
I
T
 
R
R
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
E
L
 
V
G
 
P
D
 
E
R
 
-
A
 
A
M
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
L
 
L
R
 
N
E
 
P
A
 
Q
E
 
Q
V
 
L
T
 
A
A
 
E
V
 
V
A
 
T
E
 
E
S
 
A
A
 
G
G
 
A
R
 
Q
L
 
F
I
 
A
V
 
I
S
 
S
P
 
P
N
 
G
A
 
L
S
 
T
P
 
E
A
 
P
V
 
L
I
 
L
A
 
K
A
 
A
T
 
-
A
 
A
A
 
T
H
 
E
G
 
G
L
 
T
I
 
I
S
 
P
L
 
L
-
 
I
P
 
P
G
 
G
I
 
I
A
 
S
T
 
T
P
 
V
T
 
S
E
 
E
A
 
L
F
 
M
A
 
L
A
 
G
L
 
M
D
 
D
A
 
Y
G
 
G
A
 
L
T
 
K
A
 
E
L
 
F
K
|
K
L
 
F
F
 
F
P
 
P
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
N
S
 
G
P
 
G
V
 
V
A
 
-
L
 
-
K
 
K
A
 
A
M
 
L
R
 
Q
A
 
A
V
 
I
L
 
A
-
 
G
P
 
P
V
 
F
A
 
S
-
 
Q
T
 
V
R
 
R
V
 
F
L
 
C
P
 
P
V
 
T
G
|
G
G
|
G
I
 
I
T
 
S
P
 
P
D
 
A
T
 
N
I
 
-
Q
 
-
P
 
-
W
 
Y
R
 
R
D
 
D

Sites not aligning to the query:

2c0aB Mechanism of the class i kdpg aldolase (see paper)
31% identity, 69% coverage: 31:174/208 of query aligns to 33:172/214 of 2c0aB

query
sites
2c0aB
I
 
M
G
 
A
D
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
V
D
 
A
A
 
G
G
 
G
F
 
V
T
 
R
L
 
V
I
 
L
E
x
N
V
 
V
P
 
T
L
 
L
N
x
R
S
 
T
P
 
E
D
 
C
P
 
A
F
 
V
E
 
D
S
 
A
I
 
I
T
 
R
R
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
E
L
 
V
G
 
P
D
 
E
R
 
-
A
 
A
M
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
L
 
L
R
 
N
E
 
P
A
 
Q
E
 
Q
V
 
L
T
 
A
A
 
E
V
 
V
A
 
T
E
 
E
S
 
A
A
 
G
G
 
A
R
 
Q
L
 
F
I
 
A
V
 
I
S
 
S
P
 
P
N
 
G
A
 
L
S
 
T
P
 
E
A
 
P
V
 
L
I
 
L
A
 
K
A
 
A
T
 
A
A
 
T
A
 
E
H
 
G
G
 
T
L
 
I
I
 
P
S
 
L
L
 
I
P
 
P
G
 
G
I
 
I
A
 
S
T
 
T
P
 
V
T
 
S
E
 
E
A
 
L
F
 
M
A
 
L
A
 
G
L
 
M
D
 
D
A
 
Y
G
 
G
A
 
L
T
 
K
A
x
E
L
 
F
K
|
K
L
 
F
F
 
F
P
 
P
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
N
S
 
G
P
 
G
V
 
V
A
 
-
L
 
-
K
 
K
A
 
A
M
 
L
R
 
Q
A
 
A
V
 
I
L
 
A
-
 
G
P
 
P
V
 
F
A
 
S
-
 
Q
T
 
V
R
 
R
V
 
F
L
 
C
P
 
P
V
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
S
P
 
P
D
 
A
T
 
N
I
 
-
Q
 
-
P
 
-
W
 
Y
R
 
R
D
 
D

Sites not aligning to the query:

6oviA Crystal structure of kdpg aldolase from legionella pneumophila with pyruvate captured at low ph as a covalent carbinolamine intermediate
26% identity, 78% coverage: 11:172/208 of query aligns to 9:169/210 of 6oviA

query
sites
6oviA
F
 
F
A
 
A
Q
 
A
C
 
S
P
 
P
L
 
V
I
 
I
A
 
P
I
 
V
L
 
I
R
 
V
G
 
I
V
 
K
K
 
E
P
 
L
G
 
E
E
 
D
V
 
A
E
 
L
A
 
P
I
 
L
G
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
F
D
 
A
A
 
G
G
 
G
F
 
I
T
 
H
L
 
V
I
 
L
E
|
E
V
 
V
P
 
T
L
 
L
N
x
R
S
 
T
P
 
P
D
 
V
P
 
A
F
 
I
E
 
K
S
 
A
I
 
L
T
 
E
R
 
L
L
 
L
A
 
I
R
 
N
R
 
T
L
 
F
G
 
P
D
 
D
R
 
E
A
 
-
M
 
L
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
V
L
 
I
R
 
T
E
 
P
A
 
G
E
 
Q
V
 
F
T
 
H
A
 
D
V
 
V
A
 
V
E
 
A
S
 
A
A
 
G
G
 
A
R
 
R
L
 
F
I
 
A
V
 
I
S
 
S
P
|
P
N
 
G
A
 
Q
S
 
T
P
 
R
A
 
E
V
 
L
I
 
L
A
 
I
A
 
A
T
 
G
A
 
Q
A
 
K
H
 
S
G
 
E
L
 
I
I
 
P
S
 
L
L
 
I
P
 
P
G
 
G
I
 
V
A
 
A
T
 
S
P
 
V
T
 
S
E
 
E
A
 
L
F
 
M
A
 
E
A
 
G
L
 
L
D
 
G
A
 
M
G
 
G
A
 
Y
T
 
N
A
 
H
L
 
F
K
|
K
L
 
F
F
|
F
P
 
P
A
 
A
E
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
G
P
 
G
V
 
I
-
 
P
A
 
M
L
 
L
K
 
K
A
 
A
M
 
I
R
 
S
A
 
G
V
 
V
L
 
F
P
 
P
V
 
-
A
 
Q
T
 
V
R
 
K
V
 
F
L
 
C
P
 
P
V
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
N
P
 
S
D
 
K
T
 
N
I
 
Y
Q
 
E
P
 
E
W
 
Y

3vcrA Crystal structure of a putative kdpg (2-keto-3-deoxy-6- phosphogluconate) aldolase from oleispira antarctica (see paper)
32% identity, 67% coverage: 34:172/208 of query aligns to 32:175/216 of 3vcrA

query
sites
3vcrA
A
 
A
L
 
L
A
 
V
D
 
A
A
 
G
G
 
G
F
 
V
T
 
H
L
 
L
I
 
L
E
|
E
V
 
V
P
 
T
L
 
L
N
x
R
S
 
T
P
 
E
D
 
A
P
 
G
F
 
L
E
 
A
S
 
A
I
 
I
T
 
S
R
 
A
L
 
I
A
 
K
R
 
K
R
 
A
L
 
V
G
 
P
D
 
E
R
 
-
A
 
A
M
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
V
L
 
C
R
 
T
E
 
A
A
 
D
E
 
D
V
 
F
T
 
Q
A
 
K
V
 
A
A
 
I
E
 
D
S
 
A
A
 
G
G
 
A
R
 
Q
L
 
F
I
 
I
V
|
V
S
|
S
P
|
P
N
 
G
A
 
L
S
 
T
P
 
P
A
 
E
V
 
L
I
 
I
A
 
E
A
 
K
T
 
A
A
 
K
A
 
Q
H
 
V
G
 
K
L
 
L
-
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
W
-
 
Q
-
 
G
I
 
V
S
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
A
T
 
S
E
 
E
A
 
V
F
 
M
A
 
I
A
 
A
L
 
A
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
I
T
 
T
A
 
Q
L
 
L
K
|
K
L
 
C
F
 
F
P
 
P
A
 
A
E
 
S
A
 
A
A
 
I
S
 
G
P
 
G
V
 
A
A
 
K
-
 
L
L
 
L
K
 
K
A
 
A
M
 
W
R
 
S
A
 
G
V
 
P
L
 
F
P
 
P
V
 
-
A
 
D
T
 
I
R
 
Q
V
 
F
L
 
C
P
 
P
V
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
S
P
 
K
D
 
D
T
 
N
I
 
Y
Q
 
K
P
 
E
W
 
Y

Query Sequence

>Ga0059261_1625 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_1625
MNHLAAFDVAFAQCPLIAILRGVKPGEVEAIGDALADAGFTLIEVPLNSPDPFESITRLA
RRLGDRAMVGGGTVLREAEVTAVAESAGRLIVSPNASPAVIAATAAHGLISLPGIATPTE
AFAALDAGATALKLFPAEAASPVALKAMRAVLPVATRVLPVGGITPDTIQPWRDAGASGF
GLGSALYRPGFSAAEVGARAAAFVRALA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory