SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_1678 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_1678 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8skyB Crystal structure of yisk from bacillus subtilis in complex with oxalate (see paper)
31% identity, 95% coverage: 14:321/325 of query aligns to 14:301/303 of 8skyB

query
sites
8skyB
T
 
V
G
 
G
A
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
D
D
 
D
G
 
E
S
 
K
I
 
I
V
 
M
D
 
D
L
 
L
A
 
Q
A
 
K
A
 
A
A
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
K
E
 
K
R
 
L
G
 
F
M
 
E
L
 
L
S
 
E
T
 
T
-
 
I
-
 
P
-
 
G
-
 
S
M
 
L
L
 
I
A
 
E
L
 
C
I
 
I
E
 
A
G
 
E
G
 
G
E
 
D
P
 
K
A
 
F
L
 
V
D
 
A
A
 
H
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
I
 
L
V
 
A
A
 
E
R
 
W
S
 
A
R
 
K
-
 
K
-
 
P
-
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
L
G
 
G
D
 
S
H
 
F
G
 
M
Y
 
Y
D
 
S
P
 
L
A
 
S
Y
 
E
V
 
V
R
 
K
Y
 
L
L
 
H
P
 
A
P
 
P
L
 
I
P
 
P
V
 
K
P
 
P
-
 
S
-
 
K
N
 
N
S
 
I
I
 
I
R
 
C
D
x
I
F
x
G
A
 
K
N
 
N
F
 
Y
E
 
R
L
 
D
H
|
H
C
 
A
L
 
I
Q
 
E
A
 
M
L
 
-
E
 
-
A
 
-
S
 
-
M
 
-
R
 
-
M
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
A
 
-
G
 
G
F
 
S
K
 
E
A
 
A
S
 
-
G
 
-
A
 
-
Y
 
-
D
 
D
L
 
I
P
 
P
A
 
-
S
 
-
W
 
-
Y
 
-
Q
 
E
R
 
H
P
 
P
Y
 
M
Y
 
V
F
 
F
K
 
T
G
 
K
N
 
S
R
 
P
M
 
V
T
 
T
C
 
V
S
 
T
G
 
G
H
 
H
-
 
G
D
 
D
S
 
I
V
 
V
I
 
K
Q
 
S
W
 
H
P
 
E
R
 
E
F
 
V
S
 
T
G
 
S
T
 
Q
M
 
L
D
 
D
Y
 
Y
E
|
E
L
 
G
E
|
E
F
 
L
A
 
A
A
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
K
R
 
S
G
 
G
A
 
T
D
 
R
I
 
I
A
 
S
E
 
K
A
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
Y
A
 
D
H
 
H
I
 
V
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
M
 
T
I
 
I
Y
 
V
N
 
N
D
|
D
F
 
I
S
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
D
E
 
L
Q
 
Q
V
 
K
R
 
R
D
 
H
Q
 
K
Q
 
Q
F
 
F
R
 
F
M
 
I
G
 
-
P
 
-
S
 
-
K
 
-
G
 
G
K
|
K
D
 
S
F
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
T
N
 
C
A
 
P
M
 
M
G
 
G
P
 
P
W
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
H
R
 
K
D
 
S
E
 
S
L
 
I
P
 
Q
D
 
E
V
 
P
S
 
E
N
 
R
L
 
L
A
 
K
M
 
V
T
 
E
S
 
T
R
 
R
I
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
Q
 
R
G
 
Q
R
 
S
S
 
G
N
 
S
S
 
A
S
 
S
G
 
D
M
 
M
Q
 
I
F
 
F
S
 
S
F
 
I
A
 
P
Q
 
E
C
 
L
I
 
I
A
 
E
F
 
T
V
 
L
S
 
S
R
 
K
D
 
G
E
 
M
T
 
T
L
 
L
Y
 
E
P
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
I
F
 
I
G
 
A
S
 
T
G
|
G
T
|
T
-
 
P
A
 
S
G
 
G
N
 
V
G
 
G
C
 
K
G
 
G
F
 
F
E
 
T
T
 
P
G
 
P
R
 
K
Y
 
F
L
 
L
E
 
R
P
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
K
I
 
I
E
 
D
L
 
I
E
 
T
V
 
I
E
 
D
G
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
T
L
 
L
R
 
S
N
 
N
R
 
Q
I
 
I
G
 
G

8sutA Crystal structure of yisk from bacillus subtilis in complex with reaction product 4-hydroxy-2-oxoglutaric acid (see paper)
31% identity, 95% coverage: 14:321/325 of query aligns to 15:302/303 of 8sutA

query
sites
8sutA
T
 
V
G
 
G
A
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
D
D
 
D
G
 
E
S
 
K
I
 
I
V
 
M
D
 
D
L
 
L
A
 
Q
A
 
K
A
 
A
A
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
K
E
 
K
R
 
L
G
 
F
M
 
E
L
 
L
S
 
E
T
 
T
-
 
I
-
 
P
-
 
G
-
 
S
M
 
L
L
 
I
A
 
E
L
 
C
I
 
I
E
 
A
G
 
E
G
 
G
E
 
D
P
 
K
A
 
F
L
 
V
D
 
A
A
 
H
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
I
 
L
V
 
A
A
 
E
R
 
W
S
 
A
R
 
K
-
 
K
-
 
P
-
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
L
G
 
G
D
 
S
H
 
F
G
 
M
Y
 
Y
D
 
S
P
 
L
A
 
S
Y
 
E
V
 
V
R
 
K
Y
 
L
L
 
H
P
 
A
P
 
P
L
 
I
P
 
P
V
 
K
P
 
P
-
 
S
-
 
K
N
 
N
S
 
I
I
 
I
R
 
C
D
x
I
F
x
G
A
x
K
N
 
N
F
 
Y
E
 
R
L
 
D
H
|
H
C
 
A
L
 
I
Q
 
E
A
 
M
L
 
-
E
 
-
A
 
-
S
 
-
M
 
-
R
 
-
M
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
A
 
-
G
 
G
F
 
S
K
 
E
A
 
A
S
 
-
G
 
-
A
 
-
Y
 
-
D
 
D
L
 
I
P
 
P
A
 
-
S
 
-
W
 
-
Y
 
-
Q
 
E
R
 
H
P
 
P
Y
 
M
Y
 
V
F
|
F
K
 
T
G
 
K
N
 
S
R
 
P
M
 
V
T
 
T
C
 
V
S
 
T
G
 
G
H
 
H
-
 
G
D
 
D
S
 
I
V
 
V
I
 
K
Q
 
S
W
 
H
P
 
E
R
 
E
F
 
V
S
 
T
G
 
S
T
 
Q
M
 
L
D
 
D
Y
 
Y
E
|
E
L
 
G
E
|
E
F
 
L
A
 
A
A
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
K
R
 
S
G
 
G
A
 
T
D
 
R
I
 
I
A
 
S
E
 
K
A
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
Y
A
 
D
H
 
H
I
 
V
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
M
 
T
I
 
I
Y
 
V
N
 
N
D
|
D
F
 
I
S
 
T
A
 
A
R
|
R
D
 
D
E
 
L
Q
|
Q
V
 
K
R
 
R
D
 
H
Q
 
K
Q
 
Q
F
 
F
R
 
F
M
 
I
G
 
-
P
 
-
S
 
-
K
 
-
G
 
G
K
|
K
D
 
S
F
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
T
N
 
C
A
 
P
M
 
M
G
 
G
P
 
P
W
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
H
R
 
K
D
 
S
E
 
S
L
 
I
P
 
Q
D
 
E
V
 
P
S
 
E
N
 
R
L
 
L
A
 
K
M
 
V
T
 
E
S
 
T
R
 
R
I
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
Q
 
R
G
 
Q
R
 
S
S
 
G
N
 
S
S
 
A
S
 
S
G
 
D
M
 
M
Q
 
I
F
 
F
S
 
S
F
 
I
A
 
P
Q
 
E
C
 
L
I
 
I
A
 
E
F
 
T
V
 
L
S
 
S
R
 
K
D
 
G
E
 
M
T
 
T
L
 
L
Y
 
E
P
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
I
F
 
I
G
 
A
S
 
T
G
|
G
T
|
T
-
 
P
A
 
S
G
 
G
N
 
V
G
 
G
C
 
K
G
 
G
F
 
F
E
 
T
T
 
P
G
 
P
R
 
K
Y
 
F
L
 
L
E
 
R
P
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
K
I
 
I
E
 
D
L
 
I
E
 
T
V
 
I
E
 
D
G
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
T
L
 
L
R
 
S
N
 
N
R
 
Q
I
 
I
G
 
G

6iymA Fumarylacetoacetate hydrolase (eafah) from psychrophilic exiguobacterium antarcticum (see paper)
38% identity, 54% coverage: 150:323/325 of query aligns to 108:277/277 of 6iymA

query
sites
6iymA
D
 
D
S
 
P
V
 
I
I
 
E
Q
 
R
W
 
H
P
 
A
R
 
D
F
 
L
S
 
T
G
 
Q
T
 
Q
M
 
L
D
 
D
Y
 
Y
E
|
E
L
 
G
E
|
E
F
 
L
A
 
A
A
 
I
V
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
T
R
 
T
G
 
G
A
 
R
D
 
D
I
 
L
A
 
T
E
 
P
A
 
E
D
 
N
A
 
A
D
 
L
A
 
E
H
 
H
I
 
V
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
M
 
S
I
 
I
Y
 
I
N
 
N
D
|
D
F
 
V
S
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
D
E
 
L
Q
 
Q
V
 
K
R
 
E
D
 
H
Q
 
V
Q
 
Q
F
 
F
R
 
-
M
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
F
K
 
R
G
 
G
K
 
K
D
 
S
F
 
L
D
 
D
T
 
G
G
 
F
N
 
C
A
 
P
M
 
F
G
 
G
P
 
P
W
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
E
D
 
D
E
 
A
L
 
F
P
 
-
D
 
D
V
 
P
S
 
A
N
 
D
L
 
V
A
 
L
M
 
V
T
 
E
S
 
T
R
 
R
I
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
Q
 
R
G
 
Q
R
 
S
S
 
G
N
 
S
S
 
T
S
 
K
G
 
L
M
 
M
Q
 
L
F
 
R
S
 
D
F
 
V
A
 
V
Q
 
T
C
 
I
I
 
L
A
 
T
F
 
E
V
 
V
S
 
S
R
 
R
D
 
G
E
 
M
T
 
T
L
 
L
Y
 
E
P
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
F
 
I
G
 
A
S
 
T
G
 
G
T
 
T
-
 
P
A
 
A
G
 
G
N
 
V
G
 
G
C
 
H
G
 
G
F
 
M
E
 
K
T
 
P
G
 
P
R
 
V
Y
 
Y
L
 
L
E
 
Q
P
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
E
 
D
L
 
V
E
 
S
V
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
H
L
 
L
R
 
Q
N
 
N
R
 
Q
I
 
V
G
 
K
E
 
A
R
 
R

8gstC Crystal structure of l-2,4-diketo-3-deoxyrhamnonate hydrolase from sphingomonas sp. (Pyruvate bound-form) (see paper)
36% identity, 58% coverage: 135:324/325 of query aligns to 94:282/290 of 8gstC

query
sites
8gstC
R
 
E
P
 
P
Y
 
M
Y
 
M
F
 
F
K
 
M
G
 
K
N
 
A
R
 
L
M
 
S
T
 
S
C
 
L
S
 
N
G
 
G
H
 
P
D
 
N
S
 
D
V
 
E
I
 
V
Q
 
V
W
 
L
P
 
P
R
 
K
F
 
N
S
 
S
G
 
T
T
 
H
M
 
G
D
 
D
Y
 
W
E
|
E
L
 
V
E
|
E
F
 
L
A
 
G
A
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
E
R
 
T
G
 
C
A
 
R
D
 
F
I
 
V
A
 
S
E
 
E
A
 
D
D
 
E
A
 
A
D
 
L
A
 
S
H
 
K
I
 
V
F
 
A
G
 
G
Y
 
Y
M
 
V
I
 
L
Y
 
V
N
 
N
D
|
D
F
 
V
S
 
S
A
 
E
R
 
R
-
 
F
D
 
N
E
 
Q
Q
 
K
V
 
Q
R
 
R
D
 
G
Q
 
T
Q
 
Q
F
 
W
R
 
-
M
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
S
K
 
K
G
 
G
K
|
K
D
 
G
F
 
H
D
 
D
T
 
T
G
 
F
N
 
C
A
 
P
M
 
V
G
 
G
P
 
P
W
 
W
I
 
L
V
 
V
T
 
T
R
 
P
D
 
D
E
 
E
L
 
V
P
 
G
D
 
D
V
 
P
S
 
Q
N
 
D
L
 
L
A
 
D
M
 
V
T
 
H
S
 
L
R
 
D
I
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
R
Q
 
M
G
 
Q
R
 
T
S
 
G
N
 
N
S
 
T
S
 
K
G
 
T
M
 
M
Q
 
I
F
 
F
S
 
N
F
 
V
A
 
A
Q
 
Q
C
 
L
I
 
I
A
 
S
F
 
Y
V
 
V
S
 
S
R
 
E
D
 
Y
E
 
I
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
L
F
 
M
G
 
I
S
 
T
G
|
G
T
 
T
-
 
P
A
 
P
G
 
G
N
 
V
G
 
G
C
 
E
G
 
G
F
 
K
E
 
K
-
 
P
T
 
Q
G
 
A
R
 
I
Y
 
Y
L
 
L
E
 
K
P
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
M
E
 
E
L
 
L
E
 
G
V
 
I
E
 
E
G
 
K
I
 
L
G
 
G
V
 
T
L
 
Q
R
 
R
N
 
Q
R
 
Q
I
 
V
G
 
S
E
 
E
R
 
W
R
 
R

Sites not aligning to the query:

8gsrA Crystal structure of l-2,4-diketo-3-deoxyrhamnonate hydrolase from sphingomonas sp. (Apo-form) (see paper)
36% identity, 58% coverage: 135:324/325 of query aligns to 94:282/290 of 8gsrA

query
sites
8gsrA
R
 
E
P
 
P
Y
 
M
Y
 
M
F
 
F
K
 
M
G
 
K
N
 
A
R
 
L
M
 
S
T
 
S
C
 
L
S
 
N
G
 
G
H
 
P
D
 
N
S
 
D
V
 
E
I
 
V
Q
 
V
W
 
L
P
 
P
R
 
K
F
 
N
S
 
S
G
 
T
T
 
H
M
 
G
D
 
D
Y
 
W
E
|
E
L
 
V
E
|
E
F
 
L
A
 
G
A
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
E
R
 
T
G
 
C
A
 
R
D
 
F
I
 
V
A
 
S
E
 
E
A
 
D
D
 
E
A
 
A
D
 
L
A
 
S
H
 
K
I
 
V
F
 
A
G
 
G
Y
 
Y
M
 
V
I
 
L
Y
 
V
N
 
N
D
|
D
F
 
V
S
 
S
A
 
E
R
 
R
-
 
F
D
 
N
E
 
Q
Q
 
K
V
 
Q
R
 
R
D
 
G
Q
 
T
Q
 
Q
F
 
W
R
 
-
M
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
S
K
 
K
G
 
G
K
 
K
D
 
G
F
 
H
D
 
D
T
 
T
G
 
F
N
 
C
A
 
P
M
 
V
G
 
G
P
 
P
W
 
W
I
 
L
V
 
V
T
 
T
R
 
P
D
 
D
E
 
E
L
 
V
P
 
G
D
 
D
V
 
P
S
 
Q
N
 
D
L
 
L
A
 
D
M
 
V
T
 
H
S
 
L
R
 
D
I
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
R
Q
 
M
G
 
Q
R
 
T
S
 
G
N
 
N
S
 
T
S
 
K
G
 
T
M
 
M
Q
 
I
F
 
F
S
 
N
F
 
V
A
 
A
Q
 
Q
C
 
L
I
 
I
A
 
S
F
 
Y
V
 
V
S
 
S
R
 
E
D
 
Y
E
 
I
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
L
F
 
M
G
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
T
-
 
P
A
 
P
G
 
G
N
 
V
G
 
G
C
 
E
G
 
G
F
 
K
E
 
K
-
 
P
T
 
Q
G
 
A
R
 
I
Y
 
Y
L
 
L
E
 
K
P
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
M
E
 
E
L
 
L
E
 
G
V
 
I
E
 
E
G
 
K
I
 
L
G
 
G
V
 
T
L
 
Q
R
 
R
N
 
Q
R
 
Q
I
 
V
G
 
S
E
 
E
R
 
W
R
 
R

3r6oA Crystal structure of a probable 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1, 7- dioateisomerase from mycobacterium abscessus (see paper)
35% identity, 58% coverage: 136:324/325 of query aligns to 77:264/265 of 3r6oA

query
sites
3r6oA
P
 
P
Y
 
V
Y
 
V
F
 
F
K
 
M
G
 
K
N
 
S
R
 
P
M
 
T
T
 
S
C
 
I
S
 
S
G
 
G
H
 
P
D
 
R
S
 
D
V
 
A
I
 
V
Q
 
I
W
 
A
P
 
P
R
 
R
F
 
T
S
 
S
G
 
H
T
 
A
M
 
L
D
 
D
Y
 
Y
E
|
E
L
 
I
E
|
E
F
 
I
A
 
A
A
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
K
R
 
P
G
 
G
A
 
Y
D
 
R
I
 
I
A
 
E
E
 
R
A
 
S
D
 
Q
A
 
A
D
 
I
A
 
K
H
 
H
I
 
V
F
 
A
G
 
G
Y
 
Y
M
 
M
I
 
L
Y
 
A
N
 
N
D
|
D
F
 
I
S
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
D
E
 
V
Q
 
A
V
 
L
R
 
P
D
 
F
Q
 
G
Q
 
Q
F
 
A
R
 
Q
M
 
V
G
 
-
P
 
-
S
 
V
K
 
R
G
 
G
K
 
K
D
 
G
F
 
Y
D
 
P
T
 
T
G
 
F
N
 
C
A
 
P
M
 
T
G
 
G
P
 
P
W
 
W
I
 
L
V
 
F
T
 
T
R
 
T
D
 
G
E
 
S
L
 
D
P
 
T
D
 
T
V
 
F
S
 
E
N
 
T
L
 
F
A
 
D
M
 
F
T
 
E
S
 
L
R
 
R
I
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
Q
 
R
G
 
Q
R
 
S
S
 
G
N
 
S
S
 
T
S
 
V
G
 
D
M
 
M
Q
 
T
F
 
L
S
 
G
F
 
F
A
 
A
Q
 
E
C
 
V
I
 
V
A
 
E
F
 
T
V
 
V
S
 
S
R
 
A
D
 
T
E
 
I
T
 
A
L
 
L
Y
 
R
P
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
I
F
 
I
G
 
L
S
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
P
G
 
G
N
 
-
G
 
G
C
 
C
G
 
G
F
 
F
E
 
Q
-
 
F
-
 
D
T
 
P
G
 
P
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
E
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
A
E
 
H
V
 
S
E
 
A
G
 
K
I
 
L
G
 
G
V
 
K
L
 
M
R
 
R
N
 
L
R
 
P
I
 
V
G
 
H
E
 
D
R
 
E
R
 
K

4dbhA Crystal structure of cg1458 with inhibitor (see paper)
34% identity, 62% coverage: 120:320/325 of query aligns to 79:266/269 of 4dbhA

query
sites
4dbhA
F
 
F
K
 
K
A
 
K
S
 
S
G
 
-
A
 
A
Y
 
E
D
 
S
L
 
L
P
 
P
A
 
P
S
 
T
W
 
L
Y
x
F
Q
 
L
R
 
K
P
 
P
Y
 
-
Y
 
-
F
 
-
K
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
P
M
 
T
T
 
A
C
 
V
S
 
T
G
 
G
H
 
P
D
 
E
S
 
S
V
 
P
I
 
I
Q
 
R
W
 
I
P
 
P
R
 
S
F
 
F
S
 
A
G
 
T
T
 
K
M
 
V
D
 
E
Y
 
F
E
|
E
L
 
G
E
|
E
F
 
L
A
 
A
A
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
K
R
 
P
G
 
C
A
 
K
D
 
N
I
 
V
A
 
K
E
 
A
A
 
D
D
 
D
A
 
W
D
 
K
A
 
S
H
 
V
I
 
V
F
 
L
G
 
G
Y
 
F
M
 
T
I
 
I
Y
 
I
N
 
N
D
|
D
F
 
V
S
 
S
A
 
S
R
 
R
D
 
D
E
 
L
Q
 
Q
V
 
F
R
 
A
D
 
D
Q
 
G
Q
 
Q
F
 
W
R
 
-
M
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
A
K
 
R
G
 
A
K
|
K
D
 
G
F
 
I
D
 
D
T
 
T
G
 
F
N
 
G
A
 
P
M
 
I
G
 
G
P
 
P
W
 
W
I
 
I
V
 
E
T
 
T
R
 
D
D
 
I
E
 
N
L
 
S
P
 
I
D
 
D
V
 
L
S
 
D
N
 
N
L
 
L
A
 
P
M
 
I
T
 
K
S
 
A
R
 
R
I
 
L
-
 
T
-
 
H
N
 
D
G
 
G
E
 
E
V
 
T
Q
 
Q
G
 
L
R
 
K
-
 
Q
-
 
D
S
 
S
N
 
N
S
 
S
S
 
N
G
 
Q
M
 
M
Q
 
I
F
 
M
S
 
K
F
 
M
A
 
G
Q
 
E
C
 
I
I
 
I
A
 
E
F
 
F
V
 
I
S
 
T
R
 
A
D
 
S
E
 
M
T
 
T
L
 
L
Y
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
V
F
 
I
G
 
A
S
 
T
G
 
G
T
x
S
A
 
P
G
 
A
N
 
-
G
 
-
C
 
-
G
 
G
F
 
T
E
 
E
T
 
A
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
L
 
M
E
 
V
P
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
Y
I
 
I
E
 
E
L
 
I
E
 
E
V
 
I
E
 
P
G
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
K
L
 
L
R
 
G
N
 
N
R
 
P
I
 
V

Sites not aligning to the query:

6v77B Crystal structure of a putative hpce protein from mycobacterium smegmatis
33% identity, 57% coverage: 134:319/325 of query aligns to 92:274/279 of 6v77B

query
sites
6v77B
Q
 
E
R
 
H
P
 
P
Y
 
V
Y
 
I
F
 
F
K
 
T
G
 
K
N
 
F
R
 
V
M
 
S
T
 
S
C
 
I
S
 
T
G
 
G
H
 
P
D
 
V
S
 
E
V
 
T
I
 
V
Q
 
Q
W
 
L
P
 
P
R
 
-
F
 
-
S
 
A
G
 
G
T
 
S
M
 
V
D
 
D
Y
 
W
E
|
E
L
 
V
E
|
E
F
 
L
A
 
V
A
 
V
V
 
V
I
 
M
G
 
G
T
 
R
R
 
G
G
 
G
A
 
R
D
 
N
I
 
I
A
 
P
E
 
E
A
 
D
D
 
R
A
 
A
D
 
W
A
 
E
H
 
F
I
 
V
F
 
A
G
 
G
Y
 
V
M
 
S
I
 
V
Y
 
G
N
 
Q
D
|
D
F
 
L
S
 
S
A
 
E
R
 
R
D
 
D
E
 
L
Q
 
Q
V
 
L
R
 
A
D
 
G
Q
 
P
-
 
A
-
 
P
Q
 
Q
F
 
F
R
 
S
M
 
L
G
 
A
P
 
K
S
 
S
K
 
H
G
 
A
K
 
G
D
 
-
F
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
F
N
 
S
A
 
P
M
 
I
G
 
G
P
 
P
W
 
E
I
 
L
V
 
V
T
 
T
R
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
P
S
 
D
N
 
D
L
 
L
A
 
E
M
 
L
T
 
G
S
 
A
R
 
E
I
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
T
Q
 
V
G
 
Q
R
 
H
S
 
S
N
 
R
S
 
T
S
 
S
G
 
Q
M
 
L
Q
 
I
F
 
F
S
 
P
F
 
V
A
 
S
Q
 
N
C
 
L
I
 
I
A
 
A
F
 
Y
V
 
L
S
 
S
R
 
D
D
 
T
E
 
V
T
 
E
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
V
F
 
I
G
 
F
S
 
T
G
 
G
T
 
T
-
 
P
A
 
S
G
 
G
N
 
V
G
 
G
C
 
M
G
 
G
F
 
R
E
 
N
T
 
P
G
 
K
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
E
 
A
P
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
E
I
 
L
E
 
R
L
 
T
E
 
Y
V
 
I
E
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
V
 
E
L
 
F
R
 
T
N
 
Q
R
 
R

3qdfA Crystal structure of 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase from mycobacterium marinum (see paper)
34% identity, 57% coverage: 136:320/325 of query aligns to 76:247/252 of 3qdfA

query
sites
3qdfA
P
 
P
Y
 
V
Y
 
I
F
 
F
K
 
L
G
 
K
N
 
P
R
 
N
M
 
T
T
 
A
C
 
I
S
 
V
G
 
G
H
 
P
D
 
N
S
 
V
V
 
P
I
 
I
Q
 
R
W
 
L
P
 
P
R
 
A
F
 
N
S
 
A
G
 
S
T
 
P
M
 
V
D
 
H
Y
 
F
E
|
E
L
 
G
E
|
E
F
 
L
A
 
A
A
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
R
R
 
P
G
 
C
A
 
K
D
 
D
I
 
V
A
 
S
E
 
A
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
D
 
V
A
 
D
H
 
N
I
 
I
F
 
L
G
 
G
Y
 
Y
M
 
T
I
 
I
Y
 
G
N
 
N
D
|
D
F
 
V
S
 
S
A
 
A
R
 
R
D
 
D
E
 
Q
Q
 
Q
V
 
K
R
 
S
D
 
D
Q
 
G
Q
 
Q
F
 
W
R
 
-
M
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
T
K
 
R
G
 
A
K
 
K
D
 
G
F
 
H
D
 
D
T
 
T
G
 
F
N
 
C
A
 
P
M
 
V
G
 
G
P
 
P
W
 
W
I
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
D
D
 
V
E
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
D
V
 
P
S
 
A
N
 
D
L
 
L
A
x
E
M
 
L
T
 
R
S
 
T
R
 
E
I
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
A
V
 
V
Q
 
K
G
 
Q
R
x
H
S
 
A
N
 
R
S
 
T
S
 
S
G
 
L
M
 
M
Q
 
I
F
 
H
S
 
D
F
 
V
A
 
G
Q
 
A
C
 
I
I
 
V
A
 
E
F
 
W
V
 
I
S
 
S
R
 
A
D
 
V
E
 
M
T
 
T
L
 
L
Y
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
L
F
 
I
G
 
L
S
 
T
G
 
G
T
 
T
-
 
P
A
 
A
G
 
G
N
 
V
G
 
G
C
 
-
G
 
-
F
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
P
L
 
I
E
 
E
P
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
T
I
 
V
E
 
S
L
 
I
E
 
T
V
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
T
L
 
L
R
 
T
N
 
N
R
 
P
I
 
V

1gttA Crystal structure of hpce (see paper)
31% identity, 47% coverage: 134:287/325 of query aligns to 237:387/421 of 1gttA

query
sites
1gttA
Q
 
E
R
 
E
P
 
P
Y
 
L
Y
 
V
F
 
F
K
 
L
G
 
K
N
 
A
R
 
P
M
 
N
T
 
T
C
 
L
S
 
T
G
 
G
H
 
D
D
 
N
S
 
Q
V
 
T
I
 
S
Q
 
V
W
 
R
P
 
P
R
 
N
F
 
N
S
 
I
G
 
E
T
 
Y
M
 
M
D
 
H
Y
 
Y
E
|
E
L
 
A
E
|
E
F
 
L
A
 
V
A
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
K
R
 
Q
G
 
A
A
 
R
D
 
N
I
 
V
A
 
S
E
 
E
A
 
A
D
 
D
A
 
A
D
 
M
A
 
D
H
 
Y
I
 
V
F
 
A
G
 
G
Y
 
Y
M
 
T
I
 
V
Y
 
C
N
 
N
D
|
D
F
 
Y
S
 
A
A
 
I
R
 
R
D
 
D
-
 
Y
-
 
L
E
 
E
Q
 
N
V
 
Y
R
 
Y
D
 
R
Q
 
P
Q
 
N
F
 
L
R
 
R
M
 
V
G
 
-
P
 
-
S
 
-
K
 
-
G
 
-
K
 
K
D
 
S
F
 
R
D
 
D
T
 
G
G
 
L
N
 
T
A
 
P
M
 
M
G
 
L
P
 
S
W
 
T
I
 
I
V
 
V
T
 
P
R
 
K
D
 
E
E
 
A
L
 
I
P
 
P
D
 
D
V
 
P
S
 
H
N
 
N
L
 
L
A
 
T
M
 
L
T
 
R
S
 
T
R
 
F
I
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
Q
 
R
G
 
Q
R
 
Q
S
 
G
N
 
T
S
 
T
S
 
A
G
 
D
M
 
L
Q
 
I
F
 
F
S
 
S
F
 
V
A
 
P
Q
 
F
C
 
L
I
 
I
A
 
A
F
 
Y
V
 
L
S
 
S
R
 
E
D
 
F
E
 
M
T
 
T
L
 
L
Y
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
M
F
 
I
G
 
A
S
 
T
G
 
G
T
 
T

6j5xB Crystal structure of fumarylpyruvate hydrolase from corynebacterium glutamicum in complex with mn2+ and pyruvate (see paper)
30% identity, 49% coverage: 162:319/325 of query aligns to 119:275/280 of 6j5xB

query
sites
6j5xB
M
 
L
D
 
D
Y
 
W
E
|
E
L
 
G
E
|
E
F
 
M
A
 
A
A
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
K
R
 
R
G
 
A
A
 
R
D
 
R
I
 
V
A
 
K
E
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
A
D
 
A
A
 
E
H
 
Y
I
 
I
F
 
A
G
 
G
Y
 
Y
M
 
A
I
 
V
Y
 
M
N
 
N
D
|
D
F
 
Y
S
 
T
A
 
T
R
 
R
D
 
D
E
 
F
Q
 
Q
V
 
Y
R
 
A
D
 
A
Q
 
P
Q
 
A
F
 
K
R
 
T
M
 
P
G
 
Q
P
x
W
S
 
H
K
 
Q
G
 
G
K
|
K
D
 
S
F
 
L
D
 
E
T
 
K
G
 
S
N
 
A
A
 
G
M
 
F
G
 
G
P
 
P
W
 
W
I
 
M
V
 
T
T
 
T
R
 
P
D
 
D
E
 
S
L
 
F
P
 
E
D
 
F
V
 
G
S
 
G
N
 
E
L
 
L
A
 
A
M
 
-
T
 
-
S
 
T
R
 
Y
I
 
L
N
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
K
Q
 
V
G
 
Q
R
 
S
S
 
T
N
 
P
S
 
T
S
 
N
G
 
D
M
 
L
Q
 
V
F
 
F
S
 
S
F
 
P
A
 
E
Q
 
K
C
 
L
I
 
I
A
 
E
F
 
Y
V
 
I
S
 
T
R
 
H
D
 
I
E
 
Y
T
 
P
L
 
L
Y
 
D
P
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
F
 
I
G
 
V
S
 
T
G
|
G
T
|
T
A
 
P
G
 
G
N
 
G
-
 
V
G
 
G
C
 
H
G
 
A
F
 
R
E
 
N
T
 
P
G
 
Q
R
 
R
Y
 
Y
L
 
I
E
 
G
P
 
D
G
 
G
D
 
E
V
 
T
I
 
V
E
 
K
L
 
V
E
 
E
V
 
I
E
 
A
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
F
L
 
I
R
 
E
N
 
N
R
 
K

Sites not aligning to the query:

6j5xA Crystal structure of fumarylpyruvate hydrolase from corynebacterium glutamicum in complex with mn2+ and pyruvate (see paper)
30% identity, 49% coverage: 162:319/325 of query aligns to 119:275/280 of 6j5xA

query
sites
6j5xA
M
 
L
D
 
D
Y
 
W
E
|
E
L
 
G
E
|
E
F
 
M
A
 
A
A
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
K
R
 
R
G
 
A
A
 
R
D
 
R
I
 
V
A
 
K
E
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
A
D
 
A
A
 
E
H
 
Y
I
 
I
F
 
A
G
 
G
Y
 
Y
M
 
A
I
 
V
Y
 
M
N
 
N
D
|
D
F
 
Y
S
 
T
A
 
T
R
 
R
D
 
D
E
 
F
Q
 
Q
V
 
Y
R
 
A
D
 
A
Q
 
P
Q
 
A
F
 
K
R
 
T
M
 
P
G
 
Q
P
 
W
S
 
H
K
 
Q
G
 
G
K
 
K
D
 
S
F
 
L
D
 
E
T
 
K
G
 
S
N
 
A
A
 
G
M
 
F
G
 
G
P
 
P
W
 
W
I
 
M
V
 
T
T
 
T
R
 
P
D
 
D
E
 
S
L
 
F
P
 
E
D
 
F
V
 
G
S
 
G
N
 
E
L
 
L
A
 
A
M
 
-
T
 
-
S
 
T
R
 
Y
I
 
L
N
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
K
Q
 
V
G
 
Q
R
 
S
S
 
T
N
 
P
S
 
T
S
 
N
G
 
D
M
 
L
Q
 
V
F
 
F
S
 
S
F
 
P
A
 
E
Q
 
K
C
 
L
I
 
I
A
 
E
F
 
Y
V
 
I
S
 
T
R
 
H
D
 
I
E
 
Y
T
 
P
L
 
L
Y
 
D
P
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
F
 
I
G
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
P
G
 
G
N
 
G
-
 
V
G
 
G
C
 
H
G
 
A
F
 
R
E
 
N
T
 
P
G
 
Q
R
 
R
Y
 
Y
L
 
I
E
 
G
P
 
D
G
 
G
D
 
E
V
 
T
I
 
V
E
 
K
L
 
V
E
 
E
V
 
I
E
 
A
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
F
L
 
I
R
 
E
N
 
N
R
 
K

6j5yA Crystal structure of fumarylpyruvate hydrolase from pseudomonas aeruginosa in complex with mn2+ and pyruvate (see paper)
29% identity, 52% coverage: 153:320/325 of query aligns to 70:230/233 of 6j5yA

query
sites
6j5yA
I
 
L
Q
 
A
W
 
Y
P
 
P
R
 
S
F
 
Q
S
 
T
G
 
G
T
 
N
M
 
Y
D
 
H
Y
 
Y
E
|
E
L
 
I
E
|
E
F
 
L
A
 
V
A
 
A
V
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
K
R
 
G
G
 
G
A
 
C
D
 
D
I
 
I
A
 
P
E
 
L
A
 
E
D
 
Q
A
 
A
D
 
E
A
 
E
H
 
H
I
 
V
F
 
W
G
 
G
Y
 
Y
M
 
A
I
 
V
Y
 
G
N
 
L
D
|
D
F
 
M
S
 
T
A
 
R
R
 
R
D
 
D
E
 
L
Q
 
Q
V
 
M
R
 
R
D
 
M
Q
 
R
Q
 
E
F
 
M
R
 
G
M
 
R
G
 
P
P
 
W
S
 
E
K
 
I
G
 
G
K
|
K
D
 
A
F
 
F
D
 
D
T
 
R
G
 
S
N
 
A
A
 
P
M
 
I
G
 
G
P
 
P
W
 
-
I
 
L
V
 
Y
T
 
P
R
 
A
D
 
S
E
 
Q
L
 
V
P
 
G
D
 
H
V
 
P
S
 
R
N
 
H
L
 
A
A
 
A
M
 
I
T
 
S
S
 
L
R
 
Q
I
 
V
N
 
D
G
 
G
E
 
E
V
 
D
Q
 
R
G
 
Q
R
 
R
S
 
S
N
 
D
S
 
I
S
 
D
G
 
Q
M
 
L
Q
 
I
F
 
W
S
 
S
F
 
V
A
 
A
Q
 
E
C
 
T
I
 
V
A
 
S
F
 
Y
V
 
L
S
 
S
R
 
R
D
 
F
E
 
F
T
 
E
L
 
L
Y
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
L
F
 
V
G
 
F
S
 
T
G
 
G
T
|
T
A
 
P
G
 
-
N
 
E
G
 
G
C
 
V
G
 
G
F
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
A
L
 
V
E
 
E
P
 
R
G
 
G
D
 
E
V
 
R
I
 
M
E
 
L
L
 
G
E
 
A
V
 
I
E
 
D
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
E
L
 
L
R
 
S
N
 
V
R
 
R
I
 
V

Sites not aligning to the query:

6sbiA X-ray structure of murine fumarylacetoacetate hydrolase domain containing protein 1 (fahd1) in complex with inhibitor oxalate (see paper)
28% identity, 52% coverage: 151:320/325 of query aligns to 51:213/216 of 6sbiA

query
sites
6sbiA
S
 
S
V
 
P
I
 
V
Q
 
L
W
 
M
P
 
P
R
 
A
F
 
Y
S
 
C
G
 
R
T
 
N
M
 
L
D
 
H
Y
 
H
E
|
E
L
 
V
E
|
E
F
 
L
A
 
G
A
 
V
V
 
L
I
 
L
G
 
G
T
 
K
R
 
R
G
 
G
A
 
E
D
 
A
I
 
I
A
 
P
E
 
E
A
 
A
D
 
A
A
 
A
D
 
M
A
 
D
H
 
Y
I
 
V
F
 
A
G
 
G
Y
 
Y
M
 
A
I
 
L
Y
 
C
N
 
L
D
|
D
F
 
M
S
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
D
E
 
V
Q
 
Q
V
 
E
R
 
E
D
 
C
Q
 
K
Q
 
K
F
 
K
R
 
G
M
 
L
G
 
P
P
 
W
S
 
T
K
 
L
G
 
A
K
|
K
D
 
S
F
 
F
D
 
T
T
 
S
G
 
S
N
 
C
A
 
P
M
 
V
G
 
S
P
 
A
W
 
F
I
 
-
V
 
V
T
 
P
R
 
K
D
 
E
E
 
K
L
 
I
P
 
P
D
 
D
V
 
P
S
 
H
N
 
A
L
 
L
A
 
R
M
 
L
T
 
W
S
 
L
R
 
K
I
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
Q
 
R
G
 
Q
R
 
E
S
 
G
N
 
K
S
 
T
S
 
S
G
 
S
M
 
M
Q
 
I
F
 
F
S
 
S
F
 
I
A
 
P
Q
 
Y
C
 
I
I
 
I
A
 
S
F
 
Y
V
 
V
S
 
S
R
 
K
D
 
I
E
 
I
T
|
T
L
 
L
Y
 
E
P
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
L
F
 
I
G
 
L
S
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
P
G
 
-
N
 
K
G
 
G
C
x
V
G
 
G
F
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
P
L
 
I
E
 
K
P
 
E
G
 
N
D
 
D
V
 
E
I
 
I
E
 
E
L
 
A
E
 
G
V
 
I
E
 
D
G
 
G
I
 
V
G
 
V
V
 
S
L
 
M
R
 
R
N
 
F
R
 
K
I
 
V

Sites not aligning to the query:

Q6P587 Acylpyruvase FAHD1, mitochondrial; Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 1; FAH domain-containing protein 1; Oxaloacetate decarboxylase; OAA decarboxylase; YisK-like protein; EC 3.7.1.5; EC 4.1.1.112 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
30% identity, 42% coverage: 151:287/325 of query aligns to 57:192/224 of Q6P587

query
sites
Q6P587
S
 
S
V
 
P
I
 
I
Q
 
L
W
 
M
P
 
P
R
 
A
F
 
Y
S
 
T
G
 
R
T
 
N
M
 
L
D
 
H
Y
 
H
E
|
E
L
 
L
E
|
E
F
 
L
A
 
G
A
 
V
V
 
V
I
 
M
G
 
G
T
 
K
R
 
R
G
 
C
A
 
R
D
 
A
I
 
V
A
 
P
E
 
E
A
 
A
D
 
A
A
 
A
D
 
M
A
 
D
H
 
Y
I
 
V
F
 
G
G
 
G
Y
 
Y
M
 
A
I
 
L
Y
 
C
N
 
L
D
|
D
F
 
M
S
 
T
A
 
A
R
|
R
D
 
D
E
 
V
Q
 
Q
V
 
D
R
 
E
D
 
C
Q
 
K
Q
 
K
F
 
K
R
 
G
M
 
L
G
 
P
P
 
W
S
 
T
K
 
L
G
 
A
K
 
K
D
 
S
F
 
F
D
 
T
T
 
A
G
 
S
N
 
C
A
 
P
M
 
V
G
 
S
P
 
A
W
 
F
I
 
-
V
 
V
T
 
P
R
 
K
D
 
E
E
 
K
L
 
I
P
 
P
D
 
D
V
 
P
S
 
H
N
 
K
L
 
L
A
 
K
M
 
L
T
 
W
S
 
L
R
 
K
I
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
Q
 
R
G
 
Q
R
 
E
S
 
G
N
 
E
S
 
T
S
 
S
G
 
S
M
 
M
Q
 
I
F
 
F
S
 
S
F
 
I
A
 
P
Q
 
Y
C
 
I
I
 
I
A
 
S
F
 
Y
V
 
V
S
 
S
R
 
K
D
 
I
E
 
I
T
 
T
L
 
L
Y
 
E
P
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
I
F
 
I
G
 
L
S
 
T
G
 
G
T
 
T

Sites not aligning to the query:

6fogA X-ray structure of homo sapiens fumarylacetoacetate hydrolase domain containing protein 1 (fahd1) in complex with inhibitor oxalate at 1.94a resolution. (see paper)
30% identity, 42% coverage: 151:287/325 of query aligns to 52:187/218 of 6fogA

query
sites
6fogA
S
 
S
V
 
P
I
 
I
Q
 
L
W
 
M
P
 
P
R
 
A
F
 
Y
S
 
T
G
 
R
T
 
N
M
 
L
D
 
H
Y
 
H
E
|
E
L
 
L
E
|
E
F
 
L
A
 
G
A
 
V
V
 
V
I
 
M
G
 
G
T
 
K
R
 
R
G
 
C
A
 
R
D
 
A
I
 
V
A
 
P
E
 
E
A
 
A
D
 
A
A
 
A
D
 
M
A
 
D
H
 
Y
I
 
V
F
 
G
G
 
G
Y
 
Y
M
 
A
I
 
L
Y
 
C
N
 
L
D
|
D
F
 
M
S
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
D
E
 
V
Q
 
Q
V
 
D
R
 
E
D
 
C
Q
 
K
Q
 
K
F
 
K
R
 
G
M
 
L
G
 
P
P
 
W
S
 
T
K
 
L
G
 
A
K
 
K
D
 
S
F
 
F
D
 
T
T
 
A
G
 
S
N
 
C
A
 
P
M
 
V
G
 
S
P
 
A
W
 
F
I
 
-
V
 
V
T
 
P
R
 
K
D
 
E
E
 
K
L
 
I
P
 
P
D
 
D
V
 
P
S
 
H
N
 
K
L
 
L
A
 
K
M
 
L
T
 
W
S
 
L
R
 
K
I
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
Q
 
R
G
 
Q
R
 
E
S
 
G
N
 
E
S
 
T
S
 
S
G
 
S
M
 
M
Q
 
I
F
 
F
S
 
S
F
 
I
A
 
P
Q
 
Y
C
 
I
I
 
I
A
 
S
F
 
Y
V
 
V
S
 
S
R
 
K
D
 
I
E
 
I
T
 
T
L
 
L
Y
 
E
P
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
I
F
 
I
G
 
L
S
 
T
G
 
G
T
|
T

Sites not aligning to the query:

2q1dX 2-keto-3-deoxy-d-arabinonate dehydratase complexed with magnesium and 2,5-dioxopentanoate (see paper)
27% identity, 66% coverage: 113:325/325 of query aligns to 74:281/281 of 2q1dX

query
sites
2q1dX
P
 
P
E
 
E
A
 
V
A
 
W
Y
 
G
A
 
S
G
|
G
F
x
I
K
 
S
A
 
Y
S
 
N
G
 
V
A
 
A
Y
 
K
D
 
I
L
 
L
P
 
G
A
 
K
S
 
T
W
 
I
Y
 
Y
Q
 
E
R
 
K
P
 
V
Y
 
Y
-
 
D
-
 
A
-
 
V
-
 
R
-
 
P
-
x
E
-
 
I
Y
 
F
F
 
F
K
 
K
G
 
A
N
 
T
R
 
P
M
 
N
T
 
R
C
 
C
S
 
V
G
 
G
H
 
H
D
 
G
S
 
E
V
 
A
I
 
I
Q
 
A
W
 
V
P
 
R
R
 
S
F
 
D
S
 
S
G
 
E
T
 
W
M
 
T
D
 
L
Y
 
P
E
|
E
L
 
P
E
|
E
F
 
L
A
 
A
A
 
V
V
 
V
I
 
L
G
 
-
T
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
D
A
 
S
D
 
N
A
 
G
H
 
K
I
 
I
F
 
L
G
 
G
Y
 
Y
M
 
T
I
 
I
Y
 
M
N
 
D
D
|
D
F
 
V
S
 
S
A
 
A
R
 
R
D
 
D
E
 
L
Q
x
E
V
 
A
R
 
E
D
 
N
Q
 
P
Q
 
L
F
 
Y
R
x
L
M
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
P
K
 
Q
G
 
S
K
 
K
D
 
I
F
 
Y
D
 
A
T
 
G
G
 
C
N
 
C
A
 
A
M
 
F
G
 
G
P
 
P
W
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
I
P
 
K
D
 
N
V
 
P
S
 
Y
N
 
S
L
 
L
A
 
D
M
 
I
T
 
T
S
 
L
R
 
K
I
 
I
N
 
V
G
 
R
E
 
E
-
 
G
-
 
R
-
 
V
-
 
F
V
 
F
Q
 
E
G
 
G
R
 
S
S
 
V
N
 
N
S
 
T
S
 
N
G
 
K
M
 
M
Q
 
R
F
 
R
S
 
K
F
 
I
A
 
E
Q
 
E
C
 
Q
I
 
I
A
 
Q
F
 
Y
V
 
L
S
 
I
R
 
R
D
 
D
E
 
N
T
 
P
L
 
I
Y
 
P
P
 
D
G
 
G
D
 
T
V
 
I
F
 
L
G
 
T
S
 
T
G
|
G
T
|
T
A
 
A
G
 
I
N
 
V
G
 
P
C
 
-
G
 
G
F
 
R
E
 
D
T
 
K
G
 
G
R
 
-
Y
 
-
L
 
L
E
 
K
P
 
D
G
 
E
D
 
D
V
 
I
I
 
V
E
 
E
L
 
I
E
 
T
V
 
I
E
 
S
G
 
N
I
 
I
G
 
G
V
 
T
L
 
L
R
 
I
N
 
T
R
 
P
I
 
V
G
 
K
E
 
K
R
 
R
R
 
R
S
 
K

6jvwB Crystal structure of maleylpyruvate hydrolase from sphingobium sp. Syk-6 in complex with manganese (ii) ion and pyruvate (see paper)
27% identity, 88% coverage: 1:287/325 of query aligns to 1:233/264 of 6jvwB

query
sites
6jvwB
M
 
M
K
 
R
L
 
L
V
 
A
T
 
R
F
 
F
D
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
-
G
 
-
P
 
-
R
 
R
T
 
L
G
 
G
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
D
-
 
E
-
 
I
G
 
A
S
 
D
I
 
I
V
 
T
D
 
A
L
 
L
A
 
T
A
 
G
A
 
A
A
 
D
P
 
P
E
 
A
A
 
Q
E
 
W
R
 
P
G
 
D
M
 
M
L
 
-
S
 
-
T
 
N
M
 
M
L
 
I
A
 
R
L
 
L
I
 
I
-
 
R
-
 
D
-
 
F
E
 
E
G
 
G
G
 
L
E
 
R
P
 
G
A
 
A
L
 
I
D
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
P
I
 
G
V
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
-
R
 
-
G
 
-
D
 
-
H
 
-
G
 
-
Y
 
I
D
 
P
P
 
L
A
 
A
Y
 
Q
V
 
V
R
 
S
Y
 
L
L
 
E
P
 
T
P
 
P
L
 
V
P
 
P
V
 
W
P
 
P
N
 
N
S
 
K
I
 
I
R
 
I
D
 
A
F
 
Y
-
 
P
A
x
V
N
 
N
F
 
Y
E
 
H
L
 
A
H
 
H
C
 
G
L
 
N
Q
 
Q
A
 
G
L
 
-
E
 
-
A
 
-
S
 
-
M
 
-
R
 
-
M
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
A
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
Y
 
-
D
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
W
 
-
Y
 
-
Q
 
-
R
 
-
P
 
-
Y
 
F
Y
x
F
F
 
L
K
 
K
G
 
P
N
 
G
R
 
S
M
 
A
T
 
L
C
 
S
S
 
G
G
 
P
H
 
T
D
 
D
S
 
P
V
 
V
I
 
V
Q
 
L
W
 
-
P
 
P
R
 
A
F
 
V
S
 
P
G
 
G
-
 
R
T
 
E
M
 
V
D
 
H
Y
 
H
E
|
E
L
 
S
E
|
E
F
 
L
A
 
A
A
 
I
V
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
K
R
 
T
G
 
C
A
 
R
D
 
S
I
 
V
A
 
A
E
 
R
A
 
E
D
 
D
A
 
W
D
 
K
A
 
D
H
 
V
I
 
V
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
M
 
A
I
 
C
Y
 
L
N
 
L
D
|
D
F
 
M
S
 
V
A
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
Q
 
-
V
 
V
R
 
R
D
 
G
Q
 
R
Q
 
V
F
 
F
R
 
R
M
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
-
K
 
-
G
 
-
K
|
K
D
 
A
F
 
Y
D
 
D
T
 
T
G
 
F
N
 
C
A
 
P
M
 
V
G
 
G
P
 
P
W
 
W
I
 
I
V
 
T
T
 
T
R
 
A
D
 
D
E
 
A
L
 
V
P
 
N
D
 
D
V
 
P
S
 
A
N
 
T
L
 
L
A
 
D
M
 
M
T
 
K
S
 
L
R
 
W
I
 
V
N
 
N
G
 
D
E
 
D
V
 
L
Q
 
R
G
 
Q
R
 
K
S
 
A
N
 
N
S
 
T
S
 
R
G
 
D
M
 
L
Q
 
V
F
 
L
S
 
D
F
 
I
A
 
P
Q
 
G
C
 
M
I
 
I
A
 
A
F
 
T
V
 
A
S
 
S
R
 
A
D
 
V
E
 
M
T
 
T
L
 
L
Y
 
Q
P
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
I
F
 
I
G
 
A
S
 
T
G
 
G
T
 
T

3bqbX Hexagonal kristal form of 2-keto-3-deoxyarabinonate dehydratase (see paper)
28% identity, 58% coverage: 138:325/325 of query aligns to 116:291/291 of 3bqbX

query
sites
3bqbX
Y
 
F
F
 
F
K
 
K
G
 
A
N
 
T
R
 
P
M
 
N
T
 
R
C
 
C
S
 
V
G
 
G
H
 
H
D
 
G
S
 
E
V
 
A
I
 
I
Q
 
A
W
 
V
P
 
R
R
 
S
F
 
D
S
 
S
G
 
E
T
 
W
M
 
T
D
 
L
Y
 
P
E
 
E
L
 
P
E
|
E
F
 
L
A
 
A
A
 
V
V
 
V
I
 
L
G
 
-
T
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
D
A
 
S
D
 
N
A
 
G
H
 
K
I
 
I
F
 
L
G
 
G
Y
 
Y
M
 
T
I
 
I
Y
 
M
N
 
D
D
|
D
F
 
V
S
 
S
A
 
A
R
 
R
D
 
D
E
 
L
Q
 
E
V
 
A
R
 
E
D
 
N
Q
 
P
Q
 
L
F
 
Y
R
 
L
M
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
P
K
 
Q
G
 
S
K
 
K
D
 
I
F
 
Y
D
 
A
T
 
G
G
 
C
N
 
C
A
 
A
M
 
F
G
 
G
P
 
P
W
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
I
P
 
K
D
 
N
V
 
P
S
 
Y
N
 
S
L
 
L
A
 
D
M
 
I
T
 
T
S
 
L
R
 
K
I
 
I
N
 
V
G
 
R
E
 
E
-
 
G
-
 
R
-
 
V
-
 
F
V
 
F
Q
 
E
G
 
G
R
 
S
S
 
V
N
 
N
S
 
T
S
 
N
G
 
K
M
 
M
Q
 
R
F
 
R
S
 
K
F
 
I
A
 
E
Q
 
E
C
 
Q
I
 
I
A
 
Q
F
 
Y
V
 
L
S
 
I
R
 
R
D
 
D
E
 
N
T
 
P
L
 
I
Y
 
P
P
 
D
G
 
G
D
 
T
V
 
I
F
 
L
G
 
T
S
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
A
G
 
I
N
 
V
G
 
P
C
 
-
G
 
G
F
 
R
E
 
D
T
 
K
G
 
G
R
 
-
Y
 
-
L
 
L
E
 
K
P
 
D
G
 
E
D
 
D
V
 
I
I
 
V
E
 
E
L
 
I
E
 
T
V
 
I
E
 
S
G
 
N
I
 
I
G
 
G
V
 
T
L
 
L
R
 
I
N
 
T
R
 
P
I
 
V
G
 
K
E
 
K
R
 
R
R
 
R
S
 
K

2q1cX 2-keto-3-deoxy-d-arabinonate dehydratase complexed with calcium and 2- oxobutyrate (see paper)
28% identity, 58% coverage: 138:325/325 of query aligns to 116:291/291 of 2q1cX

query
sites
2q1cX
Y
 
F
F
 
F
K
 
K
G
 
A
N
 
T
R
 
P
M
 
N
T
 
R
C
 
C
S
 
V
G
 
G
H
 
H
D
 
G
S
 
E
V
 
A
I
 
I
Q
 
A
W
 
V
P
 
R
R
 
S
F
 
D
S
 
S
G
 
E
T
 
W
M
 
T
D
 
L
Y
 
P
E
|
E
L
 
P
E
|
E
F
 
L
A
 
A
A
 
V
V
 
V
I
 
L
G
 
-
T
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
D
A
 
S
D
 
N
A
 
G
H
 
K
I
 
I
F
 
L
G
 
G
Y
 
Y
M
 
T
I
 
I
Y
 
M
N
 
D
D
|
D
F
 
V
S
 
S
A
 
A
R
 
R
D
 
D
E
 
L
Q
 
E
V
 
A
R
 
E
D
 
N
Q
 
P
Q
 
L
F
 
Y
R
 
L
M
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
P
K
 
Q
G
 
S
K
 
K
D
 
I
F
 
Y
D
 
A
T
 
G
G
 
C
N
 
C
A
 
A
M
 
F
G
 
G
P
 
P
W
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
I
P
 
K
D
 
N
V
 
P
S
 
Y
N
 
S
L
 
L
A
 
D
M
 
I
T
 
T
S
 
L
R
 
K
I
 
I
N
 
V
G
 
R
E
 
E
-
 
G
-
 
R
-
 
V
-
 
F
V
 
F
Q
 
E
G
 
G
R
 
S
S
 
V
N
 
N
S
 
T
S
 
N
G
 
K
M
 
M
Q
 
R
F
 
R
S
 
K
F
 
I
A
 
E
Q
 
E
C
 
Q
I
 
I
A
 
Q
F
 
Y
V
 
L
S
 
I
R
 
R
D
 
D
E
 
N
T
 
P
L
 
I
Y
 
P
P
 
D
G
 
G
D
 
T
V
 
I
F
 
L
G
 
T
S
 
T
G
 
G
T
|
T
A
 
A
G
 
I
N
 
V
G
 
P
C
 
-
G
 
G
F
 
R
E
 
D
T
 
K
G
 
G
R
 
-
Y
 
-
L
 
L
E
 
K
P
 
D
G
 
E
D
 
D
V
 
I
I
 
V
E
 
E
L
 
I
E
 
T
V
 
I
E
 
S
G
 
N
I
 
I
G
 
G
V
 
T
L
 
L
R
 
I
N
 
T
R
 
P
I
 
V
G
 
K
E
 
K
R
 
R
R
 
R
S
 
K

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Ga0059261_1678 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_1678
MKLVTFDAGEGPRTGAIIGDGSIVDLAAAAPEAERGMLSTMLALIEGGEPALDAAREIVA
RSRGDHGYDPAYVRYLPPLPVPNSIRDFANFELHCLQALEASMRMRAASQPDPEAAYAGF
KASGAYDLPASWYQRPYYFKGNRMTCSGHDSVIQWPRFSGTMDYELEFAAVIGTRGADIA
EADADAHIFGYMIYNDFSARDEQVRDQQFRMGPSKGKDFDTGNAMGPWIVTRDELPDVSN
LAMTSRINGEVQGRSNSSGMQFSFAQCIAFVSRDETLYPGDVFGSGTAGNGCGFETGRYL
EPGDVIELEVEGIGVLRNRIGERRS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory