SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_1981 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_1981 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 6 hits to proteins with known functional sites (download)

Q837U5 Putative agmatine deiminase; Agmatine iminohydrolase; EC 3.5.3.12 from Enterococcus faecalis (strain ATCC 700802 / V583) (see paper)
31% identity, 98% coverage: 6:321/321 of query aligns to 18:364/365 of Q837U5

query
sites
Q837U5
P
 
P
P
 
G
E
 
E
W
 
F
A
 
E
K
 
P
H
 
Q
K
 
E
A
 
K
V
 
V
W
 
W
I
 
M
G
 
I
F
 
W
P
 
P
S
 
E
H
 
R
P
 
P
E
 
D
L
 
N
W
 
W
E
 
R
S
 
-
L
 
-
N
 
D
A
 
G
A
 
G
R
 
K
A
 
P
E
 
V
V
 
Q
A
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
T
R
 
N
A
 
V
V
 
A
H
 
K
A
 
A
D
 
I
G
 
S
A
 
Q
G
 
F
E
 
T
Q
 
P
V
 
M
L
 
N
L
 
V
V
 
V
A
 
V
A
 
S
D
 
Q
E
 
Q
E
 
Q
A
 
F
A
 
Q
T
 
N
A
 
C
A
 
R
R
 
R
L
 
Q
L
 
L
A
 
P
G
 
P
D
 
E
A
 
I
A
 
T
K
 
-
V
 
V
V
 
Y
V
 
E
A
 
M
P
 
S
F
 
N
G
 
N
D
 
D
I
 
A
W
 
W
L
 
V
R
 
R
D
 
D
T
 
C
G
 
G
-
 
P
-
 
S
V
 
F
I
 
V
V
 
I
D
 
N
N
 
D
R
 
H
G
 
G
V
 
E
-
 
I
-
 
R
G
 
G
H
 
V
D
 
D
F
 
W
E
 
T
F
 
F
N
 
N
G
 
A
W
 
W
G
 
G
G
 
G
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
L
K
 
Y
Y
 
F
H
 
P
Y
 
W
E
 
D
G
 
Q
D
 
D
V
 
D
E
 
L
V
 
V
G
 
A
A
 
Q
L
 
K
L
 
I
A
 
C
D
 
E
K
 
I
R
 
E
R
 
H
M
 
V
E
 
D
-
 
S
V
 
Y
Q
 
R
P
 
T
H
 
D
D
 
D
W
 
F
V
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
F
D
 
H
W
 
V
D
 
D
G
 
G
T
 
Q
G
 
G
L
 
T
V
 
V
V
 
L
T
 
T
T
 
T
E
 
E
Q
 
M
C
 
C
L
 
L
L
 
L
N
 
S
R
 
E
N
 
G
R
 
R
N
 
N
P
 
P
T
 
Q
L
 
L
S
 
S
Q
 
K
R
 
E
E
 
A
A
 
I
E
 
E
E
 
Q
R
 
K
L
 
L
Y
 
C
T
 
D
D
 
Y
L
 
L
G
 
N
F
 
V
D
 
E
R
 
K
V
 
V
L
 
L
W
 
W
L
 
L
G
 
G
N
 
D
G
 
G
L
 
I
A
 
D
M
 
P
D
 
E
H
 
E
T
 
T
D
 
N
G
 
G
H
 
H
V
 
V
D
 
D
N
 
D
L
 
V
A
 
A
R
 
C
F
 
F
V
 
I
G
 
A
E
 
P
N
 
G
R
 
E
L
 
V
A
 
A
-
 
C
I
 
I
P
 
Y
V
 
T
P
 
E
E
 
D
E
 
Q
N
 
N
D
 
S
P
 
P
N
 
F
W
 
Y
L
 
E
V
 
A
Y
 
A
A
 
Q
D
 
D
A
 
A
R
 
Y
R
 
Q
R
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
M
-
 
T
-
 
D
-
 
A
-
 
K
A
 
G
E
 
R
A
 
Q
F
 
L
G
 
K
V
 
V
E
 
H
V
 
K
V
 
L
P
 
C
I
 
C
P
 
P
S
 
V
P
 
K
G
 
N
R
 
V
V
 
T
I
 
I
H
 
K
G
 
G
D
 
S
-
 
F
-
 
K
-
 
I
-
 
D
-
 
F
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
M
-
 
P
-
 
R
-
 
E
-
 
D
-
 
G
E
 
D
V
 
I
V
 
C
P
 
I
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
M
N
 
N
F
 
F
Y
 
L
I
 
I
G
 
T
N
 
N
A
 
D
A
 
G
V
 
V
V
 
I
I
 
V
P
 
P
V
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
D
P
 
E
N
 
N
D
 
D
R
 
H
K
 
L
A
 
A
V
 
L
E
 
E
T
 
Q
I
 
V
G
 
Q
A
 
T
L
 
M
F
 
F
P
 
P
G
 
D
R
 
K
E
 
K
A
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
V
R
 
N
A
 
T
D
 
V
H
 
E
I
 
V
L
 
V
T
 
Y
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
N
F
 
I
H
 
H
C
|
C
I
 
I
S
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
I
 
E
P
 
P
K
 
K

6nicD Crystal structure of medicago truncatula agmatine iminohydrolase (deiminase) in complex with 6-aminohexanamide (see paper)
33% identity, 98% coverage: 6:320/321 of query aligns to 6:358/360 of 6nicD

query
sites
6nicD
P
 
P
P
 
A
E
 
E
W
 
W
A
 
E
K
 
P
H
 
H
K
 
S
A
 
Q
V
 
C
W
 
W
I
 
I
G
 
G
F
 
W
P
 
P
S
 
E
H
 
R
P
 
A
E
 
D
L
 
N
W
 
W
E
 
R
S
 
D
L
 
-
N
 
G
A
 
A
A
 
V
R
 
H
A
 
A
E
 
Q
V
 
L
A
 
V
A
 
-
F
 
F
A
 
T
R
 
R
A
 
V
V
 
A
H
 
A
A
 
A
D
 
I
G
 
S
A
 
R
G
 
F
E
 
E
Q
 
K
V
 
V
L
 
T
L
 
V
V
 
C
A
 
A
A
 
S
D
 
S
E
 
A
E
 
Q
A
 
W
A
 
E
T
 
N
A
 
A
A
 
R
R
 
N
L
 
Q
L
 
L
A
 
P
G
 
-
D
 
D
A
 
H
A
 
V
K
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
E
A
 
I
P
 
S
F
 
S
G
 
N
D
 
D
I
 
S
W
|
W
L
 
F
R
 
R
D
|
D
T
 
I
G
 
G
-
 
P
-
 
T
-
 
F
-
 
V
-
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
E
V
 
T
I
 
D
V
 
A
D
 
E
N
 
H
R
 
R
G
 
I
V
 
A
G
 
G
H
 
I
D
 
D
F
 
W
E
 
T
F
 
F
N
 
N
G
 
S
W
|
W
G
 
G
G
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
C
K
 
Y
Y
 
C
H
 
D
Y
 
W
E
 
S
G
 
L
D
 
D
V
 
S
E
 
L
V
 
V
G
 
K
A
 
K
L
 
K
L
 
I
A
 
L
D
 
D
K
 
V
R
 
E
R
 
R
M
 
I
E
 
P
V
 
R
Q
 
F
P
 
S
H
 
H
D
 
S
W
 
M
V
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
 
H
W
 
V
D
 
D
G
 
G
T
 
E
G
 
G
L
 
T
V
 
C
V
 
I
T
 
T
T
 
T
E
 
E
Q
 
E
C
 
C
L
 
L
L
 
L
N
 
N
R
 
K
N
 
N
R
 
R
N
 
N
P
 
P
T
 
H
L
 
L
S
 
S
Q
 
K
R
 
S
E
 
Q
A
 
I
E
 
E
E
 
D
R
 
E
L
 
L
Y
 
K
T
 
A
D
 
Y
L
 
L
G
 
G
F
 
V
D
 
R
R
 
K
V
 
V
L
 
I
W
 
W
L
 
L
G
 
P
N
 
R
G
 
G
L
 
L
-
 
Y
A
 
G
M
 
D
D
 
D
H
 
D
T
|
T
D
 
N
G
 
G
H
|
H
V
 
V
D
|
D
N
 
N
L
 
M
A
 
C
R
 
C
F
 
F
V
 
V
G
 
R
E
 
P
N
 
G
R
 
A
L
 
V
A
 
L
I
 
L
P
 
S
-
 
W
V
 
T
P
 
D
E
 
D
E
 
K
N
 
T
D
 
D
P
 
P
N
 
Q
W
 
Y
L
 
-
V
 
-
Y
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
E
R
 
R
R
 
S
A
 
E
E
 
E
A
 
A
F
 
Y
G
 
S
V
 
L
-
 
F
-
 
S
-
 
S
-
 
V
-
 
T
-
 
D
-
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
R
-
 
K
-
 
F
E
 
E
V
 
V
V
 
I
P
 
K
I
 
L
P
 
H
S
 
V
P
 
P
G
 
G
R
 
P
-
 
L
-
 
Y
-
 
M
-
 
T
-
 
E
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
V
 
V
I
 
F
H
 
Q
G
 
D
D
 
D
E
 
G
V
 
A
V
 
K
P
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
L
-
 
A
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
V
N
 
N
F
 
F
Y
 
Y
I
 
I
G
 
A
N
 
N
A
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
I
 
A
P
 
P
V
 
Q
Y
 
F
G
 
G
Q
 
D
P
 
K
N
 
K
-
 
W
D
 
D
R
 
D
K
 
E
A
 
A
V
 
I
E
 
R
T
 
V
I
 
L
G
 
S
A
 
K
L
 
T
F
 
F
P
 
P
G
 
H
R
 
H
E
 
E
A
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
I
R
 
E
-
 
G
A
 
S
D
 
R
H
 
E
I
 
I
L
 
V
T
 
L
G
 
S
G
 
G
G
 
G
S
 
N
F
 
I
H
 
H
C
|
C
I
 
I
S
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
I
 
Q
P
 
P

G7JT50 Agmatine deiminase; Agmatine iminohydrolase; MtAIH; EC 3.5.3.12 from Medicago truncatula (Barrel medic) (Medicago tribuloides) (see paper)
33% identity, 98% coverage: 6:320/321 of query aligns to 16:372/374 of G7JT50

query
sites
G7JT50
P
 
P
P
 
A
E
 
E
W
 
W
A
 
E
K
 
P
H
 
H
K
 
S
A
 
Q
V
 
C
W
 
W
I
 
I
G
 
G
F
 
W
P
 
P
S
 
E
H
 
R
P
 
A
E
 
D
L
 
N
W
 
W
E
 
R
S
 
D
L
 
-
N
 
G
A
 
A
A
 
V
R
 
H
A
 
A
E
 
Q
V
 
L
A
 
V
A
 
-
F
 
F
A
 
T
R
 
R
A
 
V
V
 
A
H
 
A
A
 
A
D
 
I
G
 
S
A
 
R
G
 
F
E
 
E
Q
 
K
V
 
V
L
 
T
L
 
V
V
 
C
A
 
A
A
 
S
D
 
S
E
 
A
E
 
Q
A
 
W
A
 
E
T
 
N
A
 
A
A
 
R
R
 
N
L
 
Q
L
 
L
A
 
P
G
 
-
D
 
D
A
 
H
A
 
V
K
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
E
A
 
I
P
 
S
F
 
S
G
 
N
D
 
D
I
 
S
W
 
W
L
 
F
R
 
R
D
 
D
T
 
I
G
 
G
V
 
P
I
 
T
V
 
F
-
 
V
-
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
T
-
 
S
-
 
K
-
 
S
-
 
D
-
 
D
-
 
A
D
 
E
N
 
H
R
 
R
G
 
I
V
 
A
G
 
G
H
 
I
D
 
D
F
 
W
E
 
T
F
 
F
N
 
N
G
 
S
W
 
W
G
 
G
G
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
C
K
 
Y
Y
 
C
H
 
D
Y
 
W
E
 
S
G
 
L
D
 
D
V
 
S
E
 
L
V
 
V
G
 
K
A
 
K
L
 
K
L
 
I
A
 
L
D
 
D
K
 
V
R
 
E
R
 
R
M
 
I
E
 
P
V
 
R
Q
 
F
P
 
S
H
 
H
D
 
S
W
 
M
V
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
 
H
W
 
V
D
 
D
G
 
G
T
 
E
G
 
G
L
 
T
V
 
C
V
 
I
T
 
T
T
 
T
E
 
E
Q
 
E
C
 
C
L
 
L
L
 
L
N
 
N
R
 
K
N
 
N
R
 
R
N
 
N
P
 
P
T
 
H
L
 
L
S
 
S
Q
 
K
R
 
S
E
 
Q
A
 
I
E
 
E
E
 
D
R
 
E
L
 
L
Y
 
K
T
 
A
D
 
Y
L
 
L
G
 
G
F
 
V
D
 
R
R
 
K
V
 
V
L
 
I
W
 
W
L
 
L
G
 
P
N
 
R
G
 
G
L
 
L
-
 
Y
A
 
G
M
 
D
D
 
D
H
x
D
T
 
T
D
 
N
G
 
G
H
 
H
V
 
V
D
|
D
N
 
N
L
 
M
A
 
C
R
 
C
F
 
F
V
 
V
G
 
R
E
 
P
N
 
G
R
 
A
L
 
V
A
 
L
I
 
L
P
 
S
-
 
W
V
 
T
P
 
D
E
 
D
E
 
K
N
 
T
D
 
D
P
 
P
N
 
Q
W
 
Y
L
 
-
V
 
-
Y
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
E
R
 
R
R
 
S
A
 
E
E
 
E
A
 
A
F
 
Y
G
 
S
V
 
L
-
 
F
-
 
S
-
 
S
-
 
V
-
 
T
-
 
D
-
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
R
-
 
K
-
 
F
E
 
E
V
 
V
V
 
I
P
 
K
I
 
L
P
 
H
S
 
V
P
 
P
G
 
G
R
 
P
-
 
L
-
 
Y
-
 
M
-
 
T
-
 
E
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
V
 
V
I
 
F
H
 
Q
G
 
D
D
 
D
E
 
G
V
 
A
V
 
K
P
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
L
-
 
A
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
V
N
 
N
F
 
F
Y
 
Y
I
 
I
G
 
A
N
 
N
A
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
I
 
A
P
 
P
V
 
Q
Y
 
F
G
 
G
Q
 
D
P
 
K
N
 
K
-
 
W
D
 
D
R
 
D
K
 
E
A
 
A
V
 
I
E
 
R
T
 
V
I
 
L
G
 
S
A
 
K
L
 
T
F
 
F
P
 
P
G
 
H
R
 
H
E
 
E
A
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
I
R
 
E
-
 
G
A
 
S
D
 
R
H
 
E
I
 
I
L
 
V
T
 
L
G
 
S
G
 
G
G
 
G
S
 
N
F
 
I
H
 
H
C
 
C
I
 
I
S
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
I
 
Q
P
 
P

3h7cX Crystal structure of arabidopsis thaliana agmatine deiminase from cell free expression
33% identity, 98% coverage: 6:320/321 of query aligns to 16:365/369 of 3h7cX

query
sites
3h7cX
P
 
P
P
 
A
E
 
E
W
 
W
A
 
D
K
 
S
H
 
H
K
 
A
A
 
Q
V
 
T
W
 
W
I
 
I
G
 
G
F
 
W
P
 
P
S
 
E
H
 
R
P
 
Q
E
 
D
L
x
N
W
 
W
E
 
R
S
 
H
L
 
-
N
 
N
A
 
A
A
 
L
R
 
P
A
 
A
E
 
Q
V
 
-
A
 
R
A
 
V
F
 
F
A
 
A
R
 
G
A
 
V
V
 
A
H
 
K
A
 
A
D
 
I
G
 
S
A
 
K
G
 
F
E
 
E
Q
 
P
V
 
V
L
 
T
L
 
V
V
 
C
A
 
A
A
 
S
D
 
P
E
 
A
E
 
Q
A
 
W
A
 
E
T
 
N
A
 
A
A
 
R
R
 
K
L
 
Q
L
 
L
A
 
P
G
 
E
D
 
D
A
 
I
A
 
-
K
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
E
A
 
M
P
 
S
F
 
M
G
 
N
D
 
D
I
 
S
W
|
W
L
 
F
R
 
R
D
 
D
T
 
S
G
 
G
-
 
P
-
 
T
-
 
F
-
 
I
V
 
V
I
 
R
V
 
K
D
 
R
N
 
N
R
 
R
G
 
N
V
 
I
-
 
A
G
 
G
H
 
I
D
|
D
F
x
W
E
 
N
F
 
F
N
 
N
G
 
A
W
|
W
G
 
G
G
 
G
K
 
A
-
 
N
-
 
D
-
 
G
-
x
C
Y
 
Y
H
 
N
-
 
D
Y
 
W
E
 
S
G
 
H
D
 
D
V
 
L
E
 
L
V
 
V
G
 
S
A
 
R
L
 
K
L
 
I
A
 
L
D
 
A
K
 
L
R
 
E
R
 
R
M
 
I
E
 
P
V
 
R
Q
 
F
P
 
Q
H
 
H
D
 
S
W
 
M
V
 
I
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
 
H
W
 
V
D
 
D
G
 
G
T
 
E
G
 
G
L
 
T
V
 
C
V
 
L
T
 
V
T
 
T
E
 
E
Q
 
E
C
 
C
L
 
L
L
 
L
N
 
N
R
 
K
N
 
N
R
 
R
N
 
N
P
 
P
T
 
H
L
 
M
S
 
S
Q
 
K
R
 
E
E
 
Q
A
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
E
L
 
L
Y
 
K
T
 
K
D
 
Y
L
 
L
G
 
G
F
 
V
D
 
Q
R
 
S
V
 
F
L
 
I
W
 
W
L
 
L
G
 
P
N
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
Y
M
 
G
D
 
D
H
 
E
-
x
D
T
|
T
D
 
N
G
 
G
H
 
H
V
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
M
A
 
C
R
 
C
F
 
F
V
 
A
G
 
R
E
 
P
N
 
G
R
 
V
L
 
V
A
 
L
I
 
L
P
 
S
-
 
W
V
 
T
P
 
D
E
 
D
E
 
E
N
 
T
D
 
D
P
 
P
N
 
Q
W
 
Y
L
 
E
V
 
R
Y
 
S
A
 
V
D
 
E
A
 
A
R
 
L
R
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
S
-
 
N
-
 
S
-
 
I
-
 
D
-
 
A
R
 
R
A
 
G
E
 
R
A
 
K
F
 
I
G
 
Q
V
 
V
E
 
I
V
 
K
V
 
L
P
 
Y
I
 
I
P
 
P
S
 
E
P
 
P
-
 
L
-
 
Y
-
 
M
-
 
T
-
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
S
G
 
S
R
 
G
V
 
I
I
 
T
H
 
Q
G
 
D
D
 
G
E
 
E
V
 
A
V
 
I
P
 
P
-
x
R
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
L
-
 
A
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
V
N
 
N
F
 
F
Y
 
Y
I
 
I
G
 
A
N
 
N
A
 
G
A
 
G
V
 
I
V
 
I
I
 
A
P
 
P
V
 
Q
Y
 
F
G
 
G
Q
 
D
P
 
P
-
 
I
N
 
R
D
 
D
R
 
K
K
 
E
A
 
A
V
 
I
E
 
R
T
 
V
I
 
L
G
 
S
A
 
D
L
 
T
F
 
F
P
 
P
G
 
H
R
 
H
E
 
S
A
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
I
R
 
E
-
 
N
A
 
A
D
 
R
H
 
E
I
 
I
L
 
V
T
 
L
G
x
A
G
|
G
G
 
G
S
 
N
F
 
I
H
 
H
C
 
C
I
 
I
S
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
I
 
Q
P
 
P

Q8GWW7 Agmatine deiminase; Agmatine iminohydrolase; Protein EMBRYO DEFECTIVE 1873; EC 3.5.3.12 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
33% identity, 98% coverage: 6:320/321 of query aligns to 16:372/383 of Q8GWW7

query
sites
Q8GWW7
P
 
P
P
 
A
E
 
E
W
 
W
A
 
D
K
 
S
H
 
H
K
 
A
A
 
Q
V
 
T
W
 
W
I
 
I
G
 
G
F
 
W
P
 
P
S
 
E
H
 
R
P
 
Q
E
 
D
L
 
N
W
 
W
E
 
R
S
 
H
L
 
-
N
 
N
A
 
A
A
 
L
R
 
P
A
 
A
E
 
Q
V
 
-
A
 
R
A
 
V
F
 
F
A
 
A
R
 
D
A
 
V
V
 
A
H
 
K
A
 
A
D
 
I
G
 
S
A
 
K
G
 
F
E
 
E
Q
 
P
V
 
V
L
 
T
L
 
V
V
 
C
A
 
A
A
 
S
D
 
P
E
 
A
E
 
Q
A
 
W
A
 
E
T
 
N
A
 
A
A
 
R
R
 
K
L
 
Q
L
 
L
A
 
P
G
 
E
D
 
D
A
 
I
A
 
-
K
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
E
A
 
M
P
 
S
F
 
M
G
 
N
D
 
D
I
 
S
W
 
W
L
 
F
R
 
R
D
 
D
T
 
S
G
 
G
-
 
P
-
 
T
V
 
F
I
 
I
V
 
V
D
 
R
N
 
K
R
 
R
G
 
P
V
 
V
-
 
K
-
 
L
-
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
R
-
 
N
-
 
I
-
 
A
G
 
G
H
 
I
D
 
D
F
 
W
E
 
N
F
 
F
N
 
N
G
 
A
W
 
W
G
 
G
G
 
G
K
 
A
-
 
N
-
 
D
-
 
G
-
 
C
Y
 
Y
H
 
N
-
 
D
Y
 
W
E
 
S
G
 
H
D
 
D
V
 
L
E
 
L
V
 
V
G
 
S
A
 
R
L
 
K
L
 
I
A
 
L
D
 
A
K
 
L
R
 
E
R
 
R
M
 
I
E
 
P
V
 
R
Q
 
F
P
 
Q
H
 
H
D
 
S
W
 
M
V
 
I
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
 
H
W
 
V
D
 
D
G
 
G
T
 
E
G
 
G
L
 
T
V
 
C
V
 
L
T
 
V
T
 
T
E
 
E
Q
 
E
C
|
C
L
 
L
L
 
L
N
 
N
R
 
K
N
 
N
R
 
R
N
 
N
P
 
P
T
 
H
L
 
M
S
 
S
Q
 
K
R
 
E
E
 
Q
A
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
E
L
 
L
Y
 
K
T
 
K
D
 
Y
L
 
L
G
 
G
F
 
V
D
 
Q
R
 
S
V
 
F
L
 
I
W
 
W
L
 
L
G
 
P
N
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
Y
M
 
G
D
 
D
H
 
E
-
 
D
T
 
T
D
 
N
G
 
G
H
 
H
V
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
M
A
x
C
R
x
C
F
 
F
V
 
A
G
 
R
E
 
P
N
 
G
R
 
V
L
 
V
A
 
L
I
 
L
P
 
S
-
 
W
V
 
T
P
 
D
E
 
D
E
 
E
N
 
T
D
 
D
P
 
P
N
 
Q
W
 
Y
L
 
E
V
 
R
Y
 
S
A
 
V
D
 
E
A
 
A
R
 
L
R
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
S
-
 
N
-
 
S
-
 
I
-
 
D
-
 
A
R
 
R
A
 
G
E
 
R
A
 
K
F
 
I
G
 
Q
V
 
V
E
 
I
V
 
K
V
 
L
P
 
Y
I
 
I
P
 
P
S
 
E
P
 
P
-
 
L
-
 
Y
-
 
M
-
 
T
-
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
S
G
 
S
R
 
G
V
 
I
I
 
T
H
 
Q
G
 
D
D
 
G
E
 
E
V
 
A
V
 
I
P
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
L
-
 
A
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
V
N
 
N
F
 
F
Y
 
Y
I
 
I
G
 
A
N
 
N
A
 
G
A
 
G
V
 
I
V
 
I
I
 
A
P
 
P
V
 
Q
Y
 
F
G
 
G
Q
 
D
P
 
P
-
 
I
N
 
R
D
 
D
R
 
K
K
 
E
A
 
A
V
 
I
E
 
R
T
 
V
I
 
L
G
 
S
A
 
D
L
 
T
F
 
F
P
 
P
G
 
H
R
 
H
E
 
S
A
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
I
R
 
E
-
 
N
A
 
A
D
 
R
H
 
E
I
 
I
L
 
V
T
 
L
G
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
N
F
 
I
H
 
H
C
|
C
I
 
I
S
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
I
 
Q
P
 
P

6b2wA C. Jejuni c315s agmatine deiminase with substrate bound (see paper)
30% identity, 97% coverage: 7:317/321 of query aligns to 14:326/333 of 6b2wA

query
sites
6b2wA
P
 
P
E
 
E
W
 
W
A
 
S
K
 
E
H
 
Q
K
 
E
A
 
Y
V
 
L
W
 
M
I
 
L
G
 
S
F
 
L
P
 
P
S
 
H
H
 
E
P
 
K
E
 
S
L
 
D
W
 
W
E
 
-
S
 
-
L
 
-
N
 
N
A
 
P
A
 
Y
R
 
L
A
 
E
E
 
E
V
 
I
-
 
L
A
 
Q
A
 
S
F
 
Y
A
 
K
R
 
E
A
 
F
V
 
V
H
 
K
A
 
V
D
 
V
G
 
S
A
 
E
G
 
F
E
 
Q
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
P
D
 
K
E
 
Q
E
 
S
A
 
D
A
 
F
T
 
E
A
 
N
A
 
F
R
 
K
L
 
D
L
 
I
A
 
K
G
 
N
D
 
-
A
 
-
A
 
V
K
 
E
V
 
F
V
 
F
V
 
K
A
 
C
P
 
D
F
 
T
G
 
N
D
 
D
I
 
T
W
|
W
L
 
I
R
 
R
D
|
D
T
 
F
G
 
G
V
 
A
I
 
I
-
 
D
-
 
I
V
 
V
D
 
E
N
 
N
-
 
G
R
 
R
G
 
L
V
 
K
G
 
A
H
 
L
D
 
D
F
 
F
E
 
T
F
 
F
N
 
N
G
 
A
W
|
W
G
 
G
G
 
N
K
 
K
Y
x
F
H
 
Q
Y
 
S
E
 
E
G
 
L
D
 
D
V
 
N
E
 
A
V
 
V
G
 
N
A
 
S
L
 
K
L
 
L
A
 
F
D
 
K
K
 
E
R
 
K
R
 
F
M
 
K
E
 
E
V
 
E
Q
 
L
P
 
K
H
 
K
-
 
V
D
 
D
W
 
F
V
 
I
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
 
D
W
 
F
D
 
N
G
 
G
T
 
E
G
 
G
L
 
V
V
 
M
V
 
L
T
 
T
T
 
S
E
 
S
Q
 
H
C
 
C
L
 
L
L
 
L
N
 
N
R
 
E
N
 
N
R
 
R
N
 
N
P
 
S
T
 
H
L
 
L
S
 
N
Q
 
K
R
 
T
E
 
Q
A
 
I
E
 
D
E
 
T
R
 
K
L
 
L
Y
 
K
T
 
E
D
 
I
L
 
F
G
 
G
F
 
L
D
 
K
R
 
Q
V
 
I
L
 
I
W
 
W
L
 
L
G
 
E
N
 
N
G
 
G
L
 
F
A
 
I
M
 
K
-
 
G
D
 
D
H
x
D
T
|
T
D
 
D
G
 
H
H
|
H
V
 
I
D
 
D
N
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
I
G
 
D
E
 
K
N
 
N
R
 
T
L
 
I
A
 
A
I
 
H
P
 
C
V
 
I
P
 
C
E
 
E
-
 
D
E
 
E
N
 
E
D
 
D
P
 
E
N
 
H
W
 
Y
L
 
L
V
 
P
Y
 
L
A
 
Q
D
 
K
A
 
M
R
 
K
R
 
E
R
 
E
A
 
L
E
 
K
A
 
K
F
 
T
G
 
G
V
 
F
E
 
D
V
 
L
V
 
L
P
 
E
I
 
L
P
 
P
S
 
I
P
 
P
G
 
K
R
 
P
V
 
L
I
 
Y
H
 
Y
G
 
E
D
 
E
E
 
R
V
 
R
V
 
L
P
 
G
A
 
A
S
 
T
Y
 
Y
M
 
A
N
 
N
F
 
F
Y
 
V
I
 
F
G
 
I
N
 
N
A
 
N
A
 
A
V
 
L
V
 
I
I
 
V
P
 
P
V
 
F
Y
 
Y
G
 
K
Q
 
D
P
 
K
N
 
N
D
 
D
R
 
E
K
 
I
A
 
I
V
 
A
E
 
K
T
 
R
I
 
L
G
 
S
A
 
K
L
 
A
F
 
L
P
 
P
G
 
N
R
 
H
E
 
K
A
 
I
V
 
I
G
 
G
L
 
V
R
 
D
A
 
A
D
 
R
H
 
V
I
 
F
L
 
L
T
 
R
G
x
Q
G
x
N
G
 
G
S
 
S
F
 
L
H
 
H
C
x
S
I
 
S
S
 
C
Q
 
Q

Query Sequence

>Ga0059261_1981 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_1981
MKATPPPEWAKHKAVWIGFPSHPELWESLNAARAEVAAFARAVHADGAGEQVLLVAADEE
AATAARLLAGDAAKVVVAPFGDIWLRDTGVIVDNRGVGHDFEFNGWGGKYHYEGDVEVGA
LLADKRRMEVQPHDWVLEGGSIDWDGTGLVVTTEQCLLNRNRNPTLSQREAEERLYTDLG
FDRVLWLGNGLAMDHTDGHVDNLARFVGENRLAIPVPEENDPNWLVYADARRRAEAFGVE
VVPIPSPGRVIHGDEVVPASYMNFYIGNAAVVIPVYGQPNDRKAVETIGALFPGREAVGL
RADHILTGGGSFHCISQQIPK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory