SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_2416 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_2416 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 9 hits to proteins with known functional sites (download)

P48636 Cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase; AMP nucleosidase; PaLOG; EC 3.2.2.n1; EC 3.2.2.4 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
48% identity, 94% coverage: 3:186/196 of query aligns to 2:185/195 of P48636

query
sites
P48636
S
 
T
L
 
L
N
 
R
R
 
S
L
 
V
A
 
C
I
 
V
Y
 
F
C
 
C
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
P
P
 
G
S
 
A
D
 
S
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
V
 
Q
E
 
E
N
 
A
A
 
A
R
 
V
F
 
A
V
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
H
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
L
G
 
T
V
 
L
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
A
L
 
V
G
 
G
L
 
L
M
 
M
G
 
G
A
 
T
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
A
 
S
L
 
L
V
 
Q
D
 
E
A
 
A
E
|
E
V
 
I
A
 
G
H
 
H
R
 
K
G
 
G
C
 
L
T
 
T
E
 
R
L
 
L
H
 
E
I
 
V
V
 
V
R
 
D
T
 
G
M
|
M
H
 
H
E
 
A
R
|
R
K
|
K
Q
 
A
A
 
R
F
 
M
T
 
A
D
 
E
I
 
L
S
 
A
D
 
D
G
 
A
F
 
F
V
 
I
T
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
L
G
|
G
T
|
T
M
x
L
D
x
E
E
|
E
L
 
L
W
 
F
E
|
E
A
 
V
M
 
W
S
 
T
W
 
W
A
 
G
Q
 
Q
I
 
L
G
 
G
Y
 
Y
H
 
H
A
 
A
K
 
K
P
 
P
V
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
N
 
E
T
 
V
A
 
N
N
 
G
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
P
L
 
L
I
 
L
A
 
T
F
 
F
V
 
L
K
 
D
T
 
H
M
 
L
G
 
V
E
 
D
V
 
E
G
 
R
F
 
F
L
 
V
R
 
R
P
 
A
Q
 
E
H
 
H
Q
 
R
G
 
G
L
 
M
L
 
L
I
 
Q
I
 
R
D
 
G
D
 
A
Q
 
S
L
 
P
D
 
E
G
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
D
K
 
A
M
 
L
A
 
A
A
 
A
H
 
W
V
 
T
P
 
P
A
 
S
T
 
V

5zbkA Crystal structure of type-i log from pseudomonas aeruginosa pao1 in complex with amp (see paper)
48% identity, 93% coverage: 3:184/196 of query aligns to 1:182/182 of 5zbkA

query
sites
5zbkA
S
 
T
L
 
L
N
 
R
R
 
S
L
 
V
A
 
C
I
 
V
Y
 
F
C
 
C
G
 
G
S
x
A
A
 
S
T
 
P
P
 
G
S
 
A
D
 
S
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
V
 
Q
E
 
E
N
 
A
A
 
A
R
 
V
F
 
A
V
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
H
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
L
G
 
T
V
 
L
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
A
L
 
V
G
 
G
L
 
L
M
 
M
G
 
G
A
 
T
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
A
 
S
L
 
L
V
 
Q
D
 
E
A
 
A
E
|
E
V
 
I
A
 
G
H
 
H
R
 
K
G
 
G
C
 
L
T
 
T
E
 
R
L
 
L
H
 
E
I
 
V
V
 
V
R
 
D
T
 
G
M
|
M
H
 
H
E
 
A
R
|
R
K
|
K
Q
 
A
A
 
R
F
 
M
T
 
A
D
 
E
I
 
L
S
 
A
D
 
D
G
 
A
F
 
F
V
 
I
T
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
 
L
G
|
G
T
|
T
M
 
L
D
 
E
E
 
A
L
 
L
W
 
F
E
 
E
A
 
V
M
 
W
S
 
T
W
 
W
A
 
G
Q
 
Q
I
 
L
G
 
G
Y
 
Y
H
 
H
A
 
A
K
 
K
P
 
P
V
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
N
 
E
T
 
V
A
 
N
N
 
G
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
P
L
 
L
I
 
L
A
 
T
F
 
F
V
 
L
K
 
D
T
 
H
M
 
L
G
 
V
E
 
D
V
 
E
G
 
R
F
 
F
L
 
V
R
 
R
P
 
A
Q
 
E
H
 
H
Q
 
R
G
 
G
L
 
M
L
 
L
I
 
Q
I
 
R
D
 
G
D
 
A
Q
 
S
L
 
P
D
 
E
G
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
D
K
 
A
M
 
L
A
 
A
A
 
A
H
 
W
V
 
T
P
 
P

5zblD Crystal structure of type-i log from corynebacterium glutamicum in complex with amp (see paper)
41% identity, 93% coverage: 3:184/196 of query aligns to 1:181/181 of 5zblD

query
sites
5zblD
S
 
T
L
 
L
N
 
Q
R
 
R
L
 
V
A
 
T
I
 
V
Y
 
F
C
 
T
G
 
G
S
|
S
A
 
A
T
 
L
P
 
G
S
 
S
D
 
S
P
 
S
V
 
L
Y
 
Y
V
 
T
E
 
Q
N
 
A
A
 
A
R
 
Q
F
 
T
V
 
L
G
 
A
R
 
K
T
 
T
L
 
A
A
 
V
E
 
D
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
D
V
 
L
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
K
L
 
V
G
 
G
L
 
L
M
|
M
G
 
G
A
 
I
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
F
L
 
L
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
A
I
 
F
G
 
G
V
 
V
I
 
I
P
 
T
Q
 
E
A
 
S
L
 
L
V
 
M
D
 
K
A
 
G
E
 
-
V
 
L
A
 
G
H
 
H
R
 
E
G
 
K
C
 
L
T
 
T
E
 
E
L
 
L
H
 
E
I
 
I
V
 
V
R
 
P
T
 
D
M
 
M
H
 
H
E
 
I
R
|
R
K
|
K
Q
 
R
A
 
R
F
 
M
T
 
A
D
 
E
I
 
L
S
 
G
D
 
D
G
 
G
F
 
F
V
 
I
T
 
A
L
 
M
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
 
A
G
|
G
T
|
T
M
 
L
D
x
E
E
|
E
L
 
L
W
 
F
E
 
E
A
 
V
M
 
W
S
 
T
W
 
W
A
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
G
 
G
Y
 
I
H
 
H
A
 
Q
K
 
K
P
 
P
V
 
V
G
 
A
L
 
L
L
 
Y
N
 
D
T
 
V
A
 
D
N
 
G
F
 
F
Y
 
W
D
 
Q
G
 
P
L
 
L
I
 
L
A
 
E
F
 
M
V
 
L
K
 
E
T
 
Q
M
 
M
G
 
T
E
 
Q
V
 
R
G
 
G
F
 
F
L
 
I
R
 
K
P
 
R
Q
 
D
H
 
F
Q
 
F
G
 
E
L
 
C
L
 
L
I
 
I
I
 
V
D
 
E
D
 
S
Q
 
D
L
 
P
D
 
H
G
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
K
K
 
A
M
 
M
A
 
Q
A
 
T
H
 
W
V
 
T
P
 
P

Q5ZC82 Cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOG; Protein LONELY GUY; EC 3.2.2.n1 from Oryza sativa subsp. japonica (Rice) (see paper)
41% identity, 97% coverage: 2:191/196 of query aligns to 33:222/242 of Q5ZC82

query
sites
Q5ZC82
T
 
S
S
 
R
L
 
F
N
 
R
R
 
R
L
 
I
A
 
C
I
 
V
Y
 
Y
C
 
C
G
 
G
S
 
S
A
 
A
T
 
K
P
 
G
S
 
R
D
 
K
P
 
A
V
 
S
Y
 
Y
V
 
Q
E
 
D
N
 
A
A
 
A
R
 
V
F
 
E
V
 
L
G
 
G
R
 
K
T
 
E
L
 
L
A
 
V
E
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
D
V
 
L
V
 
V
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
G
 
G
R
 
S
L
 
I
G
 
G
L
 
L
M
 
M
G
 
G
A
 
L
V
 
V
A
 
S
D
 
H
A
 
A
A
 
V
L
 
H
E
 
D
A
 
G
G
 
G
G
 
R
E
 
H
V
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
P
 
P
Q
 
K
A
 
S
L
 
L
V
 
M
D
 
P
A
 
R
E
 
E
V
 
V
A
 
T
H
 
G
R
 
E
G
 
P
C
 
V
T
 
G
E
 
E
L
 
V
H
 
R
I
 
A
V
 
V
R
 
S
T
 
G
M
 
M
H
 
H
E
 
E
R
 
R
K
 
K
Q
 
A
A
 
E
F
 
M
T
 
A
D
 
R
I
 
F
S
 
A
D
 
D
G
 
A
F
 
F
V
 
I
T
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
Y
G
 
G
T
 
T
M
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
L
W
 
L
E
 
E
A
 
V
M
 
I
S
 
T
W
 
W
A
 
A
Q
 
Q
I
 
L
G
 
G
Y
 
I
H
 
H
A
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
V
A
 
D
N
 
G
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
P
L
 
F
I
 
L
A
 
S
F
 
F
V
 
I
K
 
D
T
 
M
M
 
A
G
 
V
E
 
S
V
 
E
G
 
G
F
 
F
L
 
I
R
 
A
P
 
E
Q
 
D
H
 
A
Q
 
R
G
 
R
L
 
I
L
 
I
I
 
I
I
 
S
D
 
A
D
 
P
Q
 
T
L
 
A
D
 
R
G
 
E
L
 
L
L
 
V
E
 
L
K
 
K
M
 
L
A
 
E
A
 
E
H
 
Y
V
 
V
P
 
P
A
 
E
T
 
Y
T
 
E
I
 
V
G
 
G
Q
 
L
I
 
V

O05306 Cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase; Protein LONELY GUY homolog; LOG homolog; EC 3.2.2.n1 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
40% identity, 89% coverage: 7:180/196 of query aligns to 13:185/187 of O05306

query
sites
O05306
L
 
V
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
C
 
C
G
 
-
S
 
A
A
 
A
T
 
S
P
 
P
S
 
T
D
 
H
P
 
A
V
 
E
Y
 
L
V
 
L
E
 
E
N
 
L
A
 
A
R
 
A
F
 
E
V
 
V
G
 
G
R
 
A
T
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
W
G
 
T
V
 
L
V
 
V
Y
 
W
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
H
L
 
V
G
 
S
L
 
A
M
|
M
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
A
A
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
W
V
 
T
I
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
I
P
 
P
Q
x
K
A
 
M
L
 
L
V
 
V
D
 
Y
A
 
R
E
|
E
V
 
L
A
 
A
H
 
D
R
 
H
G
 
D
C
 
A
T
 
D
E
 
E
L
 
L
H
 
I
I
 
V
V
 
T
R
 
D
T
 
T
M
 
M
H
 
W
E
 
E
R
|
R
K
 
K
Q
 
Q
A
 
I
F
 
M
T
 
E
D
 
D
I
 
R
S
 
S
D
 
D
G
 
A
F
 
F
V
 
I
T
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
V
G
 
G
T
|
T
M
 
L
D
|
D
E
|
E
L
 
L
W
 
F
E
 
D
A
 
A
M
 
W
S
 
T
W
 
D
A
 
G
Q
 
Y
I
 
L
G
 
G
Y
 
T
H
 
H
A
 
D
K
 
K
P
 
P
V
 
I
G
 
V
L
 
M
L
 
V
N
 
D
T
 
P
A
 
W
N
 
G
F
 
H
Y
 
F
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
R
A
 
A
F
 
W
V
 
L
K
 
N
T
 
G
M
 
L
G
 
L
E
 
D
V
 
T
G
 
G
F
 
Y
L
 
V
R
 
S
P
 
P
Q
 
T
H
 
A
Q
 
M
G
 
E
L
 
R
L
 
L
I
 
V
I
 
V
D
 
V
D
 
D
Q
 
N
L
 
V
D
 
K
G
 
D
L
 
A
L
 
L
E
 
R
K
 
A
M
 
C
A
 
A

7w2iA Crystal structure of log (rv1205) from mycobacterium tuberculosis (see paper)
40% identity, 89% coverage: 7:180/196 of query aligns to 9:181/183 of 7w2iA

query
sites
7w2iA
L
 
V
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
C
 
C
G
 
-
S
 
A
A
 
A
T
 
S
P
 
P
S
 
T
D
 
H
P
 
A
V
 
E
Y
 
L
V
 
L
E
 
E
N
 
L
A
 
A
R
 
A
F
 
E
V
 
V
G
 
G
R
 
A
T
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
W
G
 
T
V
 
L
V
 
V
Y
 
W
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
H
L
 
V
G
 
S
L
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
A
A
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
W
V
 
T
I
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
I
P
 
P
Q
 
K
A
 
M
L
 
L
V
 
V
D
 
Y
A
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
A
H
 
D
R
 
H
G
 
D
C
 
A
T
 
D
E
 
E
L
 
L
H
 
I
I
 
V
V
 
T
R
 
D
T
 
T
M
 
M
H
 
W
E
 
E
R
 
R
K
 
K
Q
 
Q
A
 
I
F
 
M
T
 
E
D
 
D
I
 
R
S
 
S
D
 
D
G
 
A
F
 
F
V
 
I
T
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
V
G
 
G
T
 
T
M
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
W
 
F
E
x
D
A
 
A
M
 
W
S
 
T
W
x
D
A
 
G
Q
 
Y
I
 
L
G
 
G
Y
 
T
H
 
H
A
 
D
K
 
K
P
 
P
V
 
I
G
 
V
L
 
M
L
 
V
N
 
D
T
 
P
A
 
W
N
 
G
F
 
H
Y
 
F
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
R
A
 
A
F
 
W
V
 
L
K
 
N
T
 
G
M
 
L
G
 
L
E
 
D
V
 
T
G
 
G
F
 
Y
L
 
V
R
 
S
P
 
P
Q
 
T
H
 
A
Q
 
M
G
 
E
L
 
R
L
 
L
I
 
V
I
 
V
D
 
V
D
 
D
Q
 
N
L
 
V
D
 
K
G
 
D
L
 
A
L
 
L
E
 
R
K
 
A
M
 
C
A
 
A

3sbxA Crystal structure of a putative uncharacterized protein from mycobacterium marinum bound to adenosine 5'-monophosphate amp (see paper)
40% identity, 89% coverage: 7:180/196 of query aligns to 4:176/177 of 3sbxA

query
sites
3sbxA
L
 
V
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
C
 
C
G
 
A
S
 
A
A
 
A
T
 
-
P
 
P
S
 
T
D
 
H
P
 
P
V
 
E
Y
 
L
V
 
L
E
 
E
N
 
L
A
 
A
R
 
G
F
 
A
V
 
V
G
 
G
R
 
A
T
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
W
G
 
T
V
 
L
V
 
V
Y
 
W
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
H
L
 
V
G
 
S
L
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
S
D
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
A
A
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
W
V
 
T
I
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
I
P
 
P
Q
 
K
A
 
M
L
 
L
V
 
V
D
 
H
A
 
R
E
|
E
V
 
L
A
 
A
H
 
D
R
 
H
G
 
D
C
 
A
T
 
D
E
 
E
L
 
L
H
 
V
I
 
V
V
 
T
R
 
E
T
 
T
M
|
M
H
 
W
E
 
E
R
|
R
K
|
K
Q
 
Q
A
 
V
F
 
M
T
 
E
D
 
D
I
 
R
S
 
A
D
 
N
G
 
A
F
 
F
V
 
I
T
 
T
L
 
L
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
 
V
G
|
G
T
|
T
M
 
L
D
|
D
E
|
E
L
 
L
W
 
L
E
 
D
A
 
V
M
 
W
S
 
T
W
 
E
A
 
G
Q
 
Y
I
 
L
G
 
G
Y
 
M
H
 
H
A
 
D
K
 
K
P
 
S
V
 
I
G
 
V
L
 
V
L
 
L
N
 
D
T
 
P
A
 
W
N
 
G
F
 
H
Y
 
F
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
R
A
 
A
F
 
W
V
 
L
K
 
S
T
 
E
M
 
L
G
 
A
E
 
D
V
 
T
G
 
G
F
 
Y
L
 
V
R
 
S
P
 
R
Q
 
T
H
 
A
Q
 
M
G
 
E
L
 
R
L
 
L
I
 
I
I
 
V
D
 
V
D
 
D
Q
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
D
L
 
A
L
 
L
E
 
Q
K
 
A
M
 
C
A
 
A

5ajuA Crystal structure of ligand-free phosphoribohydroxylase lonely guy from claviceps purpurea in complex with phosphoribose (see paper)
32% identity, 90% coverage: 6:182/196 of query aligns to 4:203/217 of 5ajuA

query
sites
5ajuA
R
 
K
L
 
I
A
 
C
I
 
V
Y
 
F
C
 
C
G
 
G
S
|
S
A
 
S
T
 
G
P
 
G
S
 
A
D
 
S
P
 
P
V
 
A
Y
 
H
V
 
M
E
 
E
N
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
Q
V
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
V
L
 
M
A
 
A
E
 
E
R
 
N
G
 
N
I
 
I
G
 
D
V
 
L
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
T
L
 
V
G
 
G
L
 
L
M
 
M
G
 
G
A
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
R
A
 
T
A
 
V
L
 
C
E
 
S
A
 
I
G
 
N
G
 
G
-
 
P
-
 
E
E
 
S
V
 
V
I
 
H
G
 
G
V
 
I
I
 
I
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
V
D
 
R
A
 
Y
E
 
E
V
 
R
A
 
D
H
 
G
R
 
T
G
 
Y
C
 
Q
T
 
T
-
 
V
-
 
K
-
 
D
-
 
N
-
 
K
-
 
Q
-
 
V
-
 
V
-
 
P
-
 
T
-
 
E
-
 
T
-
 
V
-
 
Y
-
 
G
E
 
R
L
 
T
H
 
T
I
 
V
V
 
V
R
 
K
T
 
D
M
 
M
H
 
H
E
 
T
R
|
R
K
 
K
Q
 
K
A
 
M
F
 
M
T
 
A
D
 
E
-
 
E
-
 
V
I
 
I
S
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
G
D
 
S
G
 
G
F
 
F
V
 
I
T
 
G
L
 
L
P
 
S
G
 
G
G
|
G
T
x
Y
G
|
G
T
|
T
M
 
M
D
 
E
E
|
E
L
 
V
W
 
F
E
 
E
A
 
V
M
 
I
S
 
T
W
 
W
A
 
N
Q
 
Q
I
 
L
G
 
G
Y
 
I
H
 
H
A
 
T
K
 
K
P
 
G
V
 
I
G
 
C
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
V
A
 
E
N
 
G
F
 
Y
Y
 
W
D
 
D
G
 
G
L
 
I
I
 
L
A
 
Q
F
 
W
V
 
I
K
 
N
T
 
M
M
 
A
G
 
A
E
 
A
V
 
Q
G
 
G
F
 
F
L
 
V
R
 
Q
P
 
P
Q
 
G
H
 
N
Q
 
E
G
 
T
L
 
I
L
 
V
I
 
V
I
 
S
D
 
A
D
 
G
Q
 
D
L
 
A
D
 
E
G
 
G
L
 
A
L
 
V
E
 
R
K
 
A
M
 
L
A
 
R
A
 
E
H
 
Y

6gfmA Crystal structure of the escherichia coli nucleosidase ppnn (pppgpp- form) (see paper)
29% identity, 47% coverage: 25:117/196 of query aligns to 169:267/440 of 6gfmA

query
sites
6gfmA
A
 
A
R
 
R
F
 
R
V
 
V
G
 
G
R
 
N
T
 
Q
L
 
L
A
 
G
E
 
L
R
 
R
G
 
E
I
 
L
G
 
N
V
 
I
V
 
C
Y
 
T
G
 
G
G
 
C
G
 
G
R
 
P
L
 
G
G
 
A
L
 
M
M
 
E
G
 
A
A
 
P
V
 
M
A
 
K
D
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
V
-
 
G
-
 
H
-
 
A
-
 
Q
-
 
Q
-
 
R
E
 
Y
A
 
K
G
 
D
G
 
S
E
 
R
V
 
F
I
 
I
G
 
G
V
 
M
I
 
T
P
 
E
Q
 
P
A
 
S
L
 
I
V
 
I
D
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
P
A
 
P
H
 
N
R
 
P
G
 
L
C
 
V
T
 
N
E
 
E
L
 
L
H
 
I
I
 
I
V
 
M
R
 
P
T
 
D
M
 
I
H
 
E
E
 
K
R
 
R
K
 
L
Q
 
E
A
 
A
F
 
F
T
 
V
D
 
R
I
 
I
S
 
A
D
 
H
G
 
G
F
 
I
V
 
I
T
 
I
L
 
F
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
V
G
 
G
T
 
T
M
 
A
D
 
E
E
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Ga0059261_2416 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_2416
MTSLNRLAIYCGSATPSDPVYVENARFVGRTLAERGIGVVYGGGRLGLMGAVADAALEAG
GEVIGVIPQALVDAEVAHRGCTELHIVRTMHERKQAFTDISDGFVTLPGGTGTMDELWEA
MSWAQIGYHAKPVGLLNTANFYDGLIAFVKTMGEVGFLRPQHQGLLIIDDQLDGLLEKMA
AHVPATTIGQIGSKDL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory