SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_2545 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_2545 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3ijpB Crystal structure of dihydrodipicolinate reductase from bartonella henselae at 2.0a resolution (see paper)
52% identity, 86% coverage: 36:242/242 of query aligns to 60:266/267 of 3ijpB

query
sites
3ijpB
D
 
D
D
 
D
P
 
P
A
 
E
V
 
S
L
 
A
A
 
F
A
 
S
A
 
N
A
 
T
D
 
E
A
 
G
L
 
I
V
 
L
D
 
D
F
 
F
S
 
S
T
 
Q
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
L
 
-
E
 
-
S
 
S
H
 
V
L
 
L
A
 
Y
A
 
A
A
 
N
R
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
Q
T
 
K
P
 
S
I
 
L
V
 
I
-
 
H
-
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
 
F
T
 
S
A
 
K
Q
 
T
H
 
E
H
 
E
A
 
A
L
 
Q
I
 
I
D
 
A
D
 
D
A
 
F
A
 
A
R
 
K
E
 
Y
I
 
T
A
 
T
V
 
I
L
 
V
Q
 
K
T
 
S
G
 
G
N
 
N
T
 
M
S
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
N
L
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
R
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
A
L
 
L
G
 
D
P
 
D
D
 
D
W
 
F
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
A
 
Y
E
 
E
M
 
M
H
|
H
H
 
H
R
 
A
Q
 
N
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
S
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
E
G
 
G
R
 
R
A
 
N
V
 
I
S
 
M
L
 
L
G
 
K
E
 
N
V
 
V
R
 
S
V
 
V
A
 
N
D
 
G
R
 
R
A
 
S
G
 
G
L
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
K
R
 
R
A
 
E
E
 
K
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
C
L
 
S
R
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
T
V
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
D
H
 
H
L
 
S
V
 
I
V
 
T
L
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
E
G
 
N
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
V
L
 
L
A
 
S
H
 
H
R
 
I
A
 
A
E
 
Q
D
 
E
R
 
R
A
 
S
I
 
I
F
 
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
A
A
 
K
D
 
N
K
 
H
P
 
E
A
 
N
G
 
G
R
 
L
Y
 
Y
T
 
S
M
 
M
D
 
L
A
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3ijpA Crystal structure of dihydrodipicolinate reductase from bartonella henselae at 2.0a resolution (see paper)
52% identity, 86% coverage: 36:242/242 of query aligns to 60:266/266 of 3ijpA

query
sites
3ijpA
D
 
D
D
 
D
P
 
P
A
 
E
V
 
S
L
 
A
A
 
F
A
 
S
A
 
N
A
 
T
D
 
E
A
 
G
L
 
I
V
 
L
D
 
D
F
|
F
S
|
S
T
x
Q
P
 
P
A
 
Q
A
|
A
L
 
-
E
 
-
S
 
S
H
 
V
L
 
L
A
 
Y
A
 
A
A
 
N
R
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
Q
T
 
K
P
 
S
I
 
L
V
 
I
-
 
H
-
 
I
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
L
 
F
T
 
S
A
 
K
Q
 
T
H
 
E
H
 
E
A
 
A
L
 
Q
I
 
I
D
 
A
D
 
D
A
 
F
A
 
A
R
 
K
E
 
Y
I
 
T
A
 
T
V
 
I
L
 
V
Q
 
K
T
 
S
G
|
G
N
|
N
T
x
M
S
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
N
L
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
R
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
A
L
 
L
G
 
D
P
 
D
D
 
D
W
 
F
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
A
 
Y
E
 
E
M
 
M
H
|
H
H
 
H
R
 
A
Q
 
N
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
S
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
E
G
 
G
R
 
R
A
 
N
V
 
I
S
 
M
L
 
L
G
 
K
E
 
N
V
 
V
R
 
S
V
 
V
A
 
N
D
 
G
R
 
R
A
 
S
G
 
G
L
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
K
R
 
R
A
 
E
E
 
K
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
C
L
 
S
R
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
T
V
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
D
H
 
H
L
 
S
V
 
I
V
 
T
L
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
E
G
 
N
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
V
L
 
L
A
 
S
H
 
H
R
 
I
A
 
A
E
 
Q
D
 
E
R
 
R
A
 
S
I
 
I
F
|
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
A
A
 
K
D
 
N
K
 
H
P
 
E
A
 
N
G
 
G
R
 
L
Y
 
Y
T
 
S
M
 
M
D
 
L
A
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5temA Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,6 pyridine dicarboxylic and nadh (see paper)
44% identity, 96% coverage: 11:242/242 of query aligns to 52:266/266 of 5temA

query
sites
5temA
G
 
G
R
 
K
M
 
F
G
 
D
V
 
V
A
 
V
I
 
V
R
 
C
D
 
D
I
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
K
Q
 
Q
G
 
I
V
 
D
K
 
Q
F
 
F
A
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
D
A
 
V
L
 
I
V
 
I
D
 
D
F
|
F
S
x
T
T
 
A
P
 
P
A
 
A
A
x
S
L
 
T
E
 
L
S
 
N
H
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
L
A
 
C
R
 
Q
A
 
Q
A
 
Y
G
 
G
T
 
K
P
 
S
I
 
I
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
L
 
F
T
 
T
A
 
E
Q
 
E
H
 
Q
H
 
R
A
 
E
L
 
Q
I
 
I
D
 
D
D
 
L
A
 
V
A
 
A
R
 
Q
E
 
Q
I
 
V
A
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
M
T
 
A
G
x
P
N
|
N
T
x
Y
S
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
N
L
 
L
L
 
V
A
 
F
R
 
K
L
 
L
V
 
L
R
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
V
L
 
M
G
 
G
P
 
D
D
 
Y
W
 
C
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
A
 
V
E
 
E
M
 
A
H
|
H
H
|
H
R
 
R
Q
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
I
M
 
G
L
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
G
G
 
A
R
 
M
A
 
G
V
 
N
S
 
K
L
 
L
G
 
S
E
 
D
V
 
V
R
 
A
V
 
V
A
 
Y
D
 
A
R
 
R
A
 
E
G
 
G
L
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
A
 
T
E
 
K
G
 
D
T
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
T
L
 
I
R
 
R
G
 
A
G
 
G
T
 
D
V
 
I
I
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
L
 
T
V
 
A
V
 
M
L
 
F
A
 
A
G
 
D
A
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
T
H
 
H
R
 
K
A
 
A
E
 
T
D
 
D
R
 
R
A
 
M
I
 
T
F
|
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
V
W
 
W
L
 
L
A
 
H
D
 
E
K
 
K
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
F
Y
 
Y
T
 
T
M
 
M
D
 
T
A
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5tejB Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,5 furan dicarboxylic and nadh (see paper)
44% identity, 96% coverage: 11:242/242 of query aligns to 52:266/269 of 5tejB

query
sites
5tejB
G
 
G
R
 
K
M
 
F
G
 
D
V
 
V
A
 
V
I
 
V
R
 
C
D
 
D
I
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
K
Q
 
Q
G
 
I
V
 
D
K
 
Q
F
 
F
A
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
D
A
 
V
L
 
I
V
 
I
D
 
D
F
|
F
S
x
T
T
 
A
P
 
P
A
 
A
A
x
S
L
 
T
E
 
L
S
 
N
H
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
L
A
 
C
R
 
Q
A
 
Q
A
 
Y
G
 
G
T
 
K
P
 
S
I
 
I
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
L
 
F
T
 
T
A
 
E
Q
 
E
H
 
Q
H
 
R
A
 
E
L
 
Q
I
 
I
D
 
D
D
 
L
A
 
V
A
 
A
R
 
Q
E
 
Q
I
 
V
A
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
M
T
 
A
G
x
P
N
|
N
T
x
Y
S
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
N
L
 
L
L
 
V
A
 
F
R
 
K
L
 
L
V
 
L
R
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
V
L
 
M
G
 
G
P
 
D
D
 
Y
W
 
C
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
A
 
V
E
 
E
M
 
A
H
|
H
H
|
H
R
 
R
Q
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
I
M
 
G
L
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
G
G
 
A
R
 
M
A
 
G
V
 
N
S
 
K
L
 
L
G
 
S
E
 
D
V
 
V
R
 
A
V
 
V
A
 
Y
D
 
A
R
 
R
A
 
E
G
 
G
L
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
A
 
T
E
 
K
G
 
D
T
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
T
L
 
I
R
 
R
G
 
A
G
 
G
T
 
D
V
 
I
I
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
L
 
T
V
 
A
V
 
M
L
 
F
A
 
A
G
 
D
A
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
T
H
 
H
R
 
K
A
 
A
E
 
T
D
 
D
R
 
R
A
 
M
I
 
T
F
|
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
V
W
 
W
L
 
L
A
 
H
D
 
E
K
 
K
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
F
Y
 
Y
T
 
T
M
 
M
D
 
T
A
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5tejA Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,5 furan dicarboxylic and nadh (see paper)
44% identity, 96% coverage: 11:242/242 of query aligns to 52:266/269 of 5tejA

query
sites
5tejA
G
 
G
R
 
K
M
 
F
G
 
D
V
 
V
A
 
V
I
 
V
R
 
C
D
 
D
I
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
K
Q
 
Q
G
 
I
V
 
D
K
 
Q
F
 
F
A
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
D
A
 
V
L
 
I
V
 
I
D
 
D
F
|
F
S
x
T
T
 
A
P
 
P
A
 
A
A
x
S
L
 
T
E
 
L
S
 
N
H
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
L
A
 
C
R
 
Q
A
 
Q
A
 
Y
G
 
G
T
 
K
P
 
S
I
 
I
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
L
 
F
T
 
T
A
 
E
Q
 
E
H
 
Q
H
 
R
A
 
E
L
 
Q
I
 
I
D
 
D
D
 
L
A
 
V
A
 
A
R
 
Q
E
 
Q
I
 
V
A
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
M
T
 
A
G
x
P
N
 
N
T
 
Y
S
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
N
L
 
L
L
 
V
A
 
F
R
 
K
L
 
L
V
 
L
R
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
V
L
 
M
G
 
G
P
 
D
D
 
Y
W
 
C
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
A
 
V
E
 
E
M
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
Q
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
I
M
 
G
L
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
G
G
 
A
R
 
M
A
 
G
V
 
N
S
 
K
L
 
L
G
 
S
E
 
D
V
 
V
R
 
A
V
 
V
A
 
Y
D
 
A
R
 
R
A
 
E
G
 
G
L
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
A
 
T
E
 
K
G
 
D
T
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
T
L
 
I
R
 
R
G
 
A
G
 
G
T
 
D
V
 
I
I
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
L
 
T
V
 
A
V
 
M
L
 
F
A
 
A
G
 
D
A
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
T
H
 
H
R
 
K
A
 
A
E
 
T
D
 
D
R
 
R
A
 
M
I
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
V
W
 
W
L
 
L
A
 
H
D
 
E
K
 
K
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
F
Y
 
Y
T
 
T
M
 
M
D
 
T
A
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4ywjA Crystal structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase (htpa reductase) from pseudomonas aeruginosa
43% identity, 100% coverage: 1:242/242 of query aligns to 1:267/268 of 4ywjA

query
sites
4ywjA
M
 
M
S
 
R
S
 
R
I
 
I
G
 
A
I
 
V
Y
 
V
G
 
G
S
 
A
L
 
A
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
V
 
K
A
 
N
I
 
L
R
 
I
D
 
E
I
 
A
L
 
V
A
 
Q
E
 
Q
Q
 
T
G
 
G
V
 
-
K
 
G
F
 
A
A
 
A
G
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
x
D
-
x
R
-
 
P
-
 
D
-
 
S
-
 
T
-
 
L
-
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
G
 
G
D
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
R
-
 
I
-
 
G
-
 
V
-
 
P
-
 
L
-
 
S
-
 
G
D
 
D
P
 
L
A
 
G
V
 
K
L
 
V
A
 
C
A
 
E
A
 
E
A
 
F
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
I
D
 
D
F
|
F
S
x
T
T
 
H
P
 
P
A
 
S
A
x
V
L
 
T
E
 
L
S
 
K
H
 
N
L
 
I
A
 
E
A
 
Q
A
 
C
R
 
R
A
 
K
A
 
A
G
 
R
T
 
R
P
 
A
I
 
M
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
L
 
F
T
 
S
A
 
A
Q
 
D
H
 
E
H
 
K
A
 
L
L
 
L
I
 
L
D
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
K
E
 
D
I
 
I
A
 
P
V
 
I
L
 
V
Q
 
F
T
 
A
G
x
A
N
|
N
T
x
F
S
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
N
L
 
L
L
 
C
A
 
L
R
 
K
L
 
L
V
 
L
R
 
D
E
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
R
R
 
V
L
 
L
G
 
G
P
 
D
D
 
E
W
 
V
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
A
 
I
E
 
E
M
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
Q
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
R
L
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
Q
G
 
A
R
 
L
A
 
G
V
 
R
S
 
D
L
 
L
G
 
Q
E
 
E
V
 
V
R
 
A
V
 
V
A
 
Y
D
 
G
R
 
R
A
 
E
G
 
G
L
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
A
E
 
R
G
 
E
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
G
 
G
T
 
D
V
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
D
H
 
H
L
 
T
V
 
V
V
 
L
L
 
F
A
 
A
G
 
A
A
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
T
H
 
H
R
 
K
A
 
A
E
 
S
D
 
S
R
|
R
A
 
M
I
 
T
F
|
F
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
A
 
E
D
 
G
K
 
K
P
 
E
A
 
N
G
 
G
R
 
L
Y
 
Y
T
 
D
M
 
M
D
 
Q
A
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L

P04036 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase; HTPA reductase; EC 1.17.1.8 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
47% identity, 81% coverage: 46:242/242 of query aligns to 74:270/273 of P04036

query
sites
P04036
D
 
D
A
 
V
L
 
F
V
 
I
D
 
D
F
 
F
S
x
T
T
x
R
P
 
P
A
 
E
A
 
G
L
 
T
E
 
L
S
 
N
H
 
H
L
 
L
A
 
A
A
 
F
A
 
C
R
 
R
A
 
Q
A
 
H
G
 
G
T
 
K
P
 
G
I
 
M
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
L
 
F
T
 
D
A
 
E
Q
 
A
H
 
G
H
 
K
A
 
Q
L
 
A
I
 
I
D
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
A
V
 
I
L
 
V
Q
 
F
T
x
A
G
x
A
N
|
N
T
x
F
S
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
N
L
 
V
L
 
M
A
 
L
R
 
K
L
 
L
V
 
L
R
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
V
L
 
M
G
 
G
P
 
D
D
 
Y
W
 
T
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
A
 
I
E
 
E
M
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
Q
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
A
L
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
H
G
 
A
R
 
L
A
 
D
V
 
K
S
 
D
L
 
L
G
 
K
E
 
D
V
 
C
R
 
A
V
 
V
A
 
Y
D
 
S
R
 
R
A
 
E
G
 
G
L
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
A
 
V
E
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
G
 
G
T
 
D
V
 
I
I
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
L
 
T
V
 
A
V
 
M
L
 
F
A
 
A
G
 
D
A
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
T
H
 
H
R
 
K
A
 
A
E
 
S
D
 
S
R
|
R
A
 
M
I
 
T
F
|
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
A
 
S
D
 
G
K
 
K
P
 
E
A
 
S
G
 
G
R
 
L
Y
 
F
T
 
D
M
 
M
D
 
R
A
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1drwA Escherichia coli dhpr/nhdh complex (see paper)
47% identity, 81% coverage: 46:242/242 of query aligns to 73:269/272 of 1drwA

query
sites
1drwA
D
 
D
A
 
V
L
 
F
V
 
I
D
 
D
F
|
F
S
x
T
T
x
R
P
 
P
A
 
E
A
 
G
L
 
T
E
 
L
S
 
N
H
 
H
L
 
L
A
 
A
A
 
F
A
 
C
R
 
R
A
 
Q
A
 
H
G
 
G
T
 
K
P
 
G
I
 
M
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
L
 
F
T
 
D
A
 
E
Q
 
A
H
 
G
H
 
K
A
 
Q
L
 
A
I
 
I
D
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
A
V
 
I
L
 
V
Q
 
F
T
 
A
G
x
A
N
|
N
T
x
F
S
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
N
L
 
V
L
 
M
A
 
L
R
 
K
L
 
L
V
 
L
R
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
V
L
 
M
G
 
G
P
 
D
D
 
Y
W
 
T
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
A
 
I
E
 
E
M
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
Q
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
A
L
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
H
G
 
A
R
 
L
A
 
D
V
 
K
S
 
D
L
 
L
G
 
K
E
 
D
V
 
C
R
 
A
V
 
V
A
 
Y
D
 
S
R
 
R
A
 
E
G
 
G
L
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
A
 
V
E
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
G
 
G
T
 
D
V
 
I
I
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
L
 
T
V
 
A
V
 
M
L
 
F
A
 
A
G
 
D
A
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
T
H
 
H
R
 
K
A
 
A
E
 
S
D
 
S
R
 
R
A
 
M
I
 
T
F
|
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
A
 
S
D
 
G
K
 
K
P
 
E
A
 
S
G
 
G
R
 
L
Y
 
F
T
 
D
M
 
M
D
 
R
A
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1dihA Three-dimensional structure of e. Coli dihydrodipicolinate reductase (see paper)
47% identity, 81% coverage: 46:242/242 of query aligns to 73:269/272 of 1dihA

query
sites
1dihA
D
 
D
A
 
V
L
 
F
V
 
I
D
 
D
F
|
F
S
x
T
T
x
R
P
 
P
A
 
E
A
x
G
L
 
T
E
 
L
S
 
N
H
 
H
L
 
L
A
 
A
A
 
F
A
 
C
R
 
R
A
 
Q
A
 
H
G
 
G
T
 
K
P
 
G
I
 
M
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
L
 
F
T
 
D
A
 
E
Q
 
A
H
 
G
H
 
K
A
 
Q
L
 
A
I
 
I
D
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
A
V
 
I
L
 
V
Q
 
F
T
 
A
G
 
A
N
|
N
T
x
F
S
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
N
L
 
V
L
 
M
A
 
L
R
 
K
L
 
L
V
 
L
R
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
V
L
 
M
G
 
G
P
 
D
D
 
Y
W
 
T
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
A
 
I
E
 
E
M
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
Q
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
A
L
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
H
G
 
A
R
 
L
A
 
D
V
 
K
S
 
D
L
 
L
G
 
K
E
 
D
V
 
C
R
 
A
V
 
V
A
 
Y
D
 
S
R
 
R
A
 
E
G
 
G
L
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
A
 
V
E
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
G
 
G
T
 
D
V
 
I
I
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
L
 
T
V
 
A
V
 
M
L
 
F
A
 
A
G
 
D
A
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
T
H
 
H
R
 
K
A
 
A
E
 
S
D
 
S
R
|
R
A
 
M
I
 
T
F
|
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
A
 
S
D
 
G
K
 
K
P
 
E
A
 
S
G
 
G
R
 
L
Y
 
F
T
 
D
M
 
M
D
 
R
A
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1arzB Escherichia coli dihydrodipicolinate reductase in complex with nadh and 2,6 pyridine dicarboxylate (see paper)
47% identity, 81% coverage: 46:242/242 of query aligns to 70:266/269 of 1arzB

query
sites
1arzB
D
 
D
A
 
V
L
 
F
V
 
I
D
 
D
F
|
F
S
x
T
T
x
R
P
 
P
A
 
E
A
x
G
L
 
T
E
 
L
S
 
N
H
|
H
L
 
L
A
 
A
A
 
F
A
 
C
R
 
R
A
 
Q
A
 
H
G
 
G
T
 
K
P
 
G
I
 
M
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
L
 
F
T
 
D
A
 
E
Q
 
A
H
 
G
H
 
K
A
 
Q
L
 
A
I
 
I
D
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
A
V
 
I
L
 
V
Q
 
F
T
 
A
G
x
A
N
|
N
T
x
F
S
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
N
L
 
V
L
 
M
A
 
L
R
 
K
L
 
L
V
 
L
R
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
V
L
 
M
G
 
G
P
 
D
D
 
Y
W
 
T
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
A
 
I
E
 
E
M
 
A
H
|
H
H
|
H
R
 
R
Q
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
L
M
 
A
L
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
H
G
 
A
R
 
L
A
 
D
V
 
K
S
 
D
L
 
L
G
 
K
E
 
D
V
 
C
R
 
A
V
 
V
A
 
Y
D
 
S
R
 
R
A
 
E
G
 
G
L
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
A
 
V
E
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
G
 
G
T
 
D
V
 
I
I
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
L
 
T
V
 
A
V
 
M
L
 
F
A
 
A
G
 
D
A
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
T
H
 
H
R
 
K
A
 
A
E
 
S
D
 
S
R
 
R
A
 
M
I
 
T
F
|
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
A
 
S
D
 
G
K
 
K
P
 
E
A
 
S
G
 
G
R
 
L
Y
 
F
T
 
D
M
 
M
D
 
R
A
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1drvA Escherichia coli dhpr/acnadh complex (see paper)
47% identity, 81% coverage: 46:242/242 of query aligns to 71:267/270 of 1drvA

query
sites
1drvA
D
 
D
A
 
V
L
 
F
V
 
I
D
 
D
F
|
F
S
x
T
T
x
R
P
 
P
A
 
E
A
x
G
L
 
T
E
 
L
S
 
N
H
 
H
L
 
L
A
 
A
A
 
F
A
 
C
R
 
R
A
 
Q
A
 
H
G
 
G
T
 
K
P
 
G
I
 
M
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
 
F
T
 
D
A
 
E
Q
 
A
H
 
G
H
 
K
A
 
Q
L
 
A
I
 
I
D
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
A
V
 
I
L
 
V
Q
 
F
T
 
A
G
x
A
N
 
N
T
x
F
S
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
N
L
 
V
L
 
M
A
 
L
R
 
K
L
 
L
V
 
L
R
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
V
L
 
M
G
 
G
P
 
D
D
 
Y
W
 
T
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
A
 
I
E
 
E
M
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
Q
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
A
L
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
H
G
 
A
R
 
L
A
 
D
V
 
K
S
 
D
L
 
L
G
 
K
E
 
D
V
 
C
R
 
A
V
 
V
A
 
Y
D
 
S
R
 
R
A
 
E
G
 
G
L
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
A
 
V
E
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
G
 
G
T
 
D
V
 
I
I
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
L
 
T
V
 
A
V
 
M
L
 
F
A
 
A
G
 
D
A
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
T
H
 
H
R
 
K
A
 
A
E
 
S
D
 
S
R
|
R
A
 
M
I
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
A
 
S
D
 
G
K
 
K
P
 
E
A
 
S
G
 
G
R
 
L
Y
 
F
T
 
D
M
 
M
D
 
R
A
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1druA Escherichia coli dhpr/nadh complex (see paper)
47% identity, 81% coverage: 46:242/242 of query aligns to 71:267/270 of 1druA

query
sites
1druA
D
 
D
A
 
V
L
 
F
V
 
I
D
 
D
F
|
F
S
x
T
T
x
R
P
 
P
A
 
E
A
x
G
L
 
T
E
 
L
S
 
N
H
 
H
L
 
L
A
 
A
A
 
F
A
 
C
R
 
R
A
 
Q
A
 
H
G
 
G
T
 
K
P
 
G
I
 
M
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
L
 
F
T
 
D
A
 
E
Q
 
A
H
 
G
H
 
K
A
 
Q
L
 
A
I
 
I
D
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
A
V
 
I
L
 
V
Q
 
F
T
 
A
G
x
A
N
|
N
T
x
F
S
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
N
L
 
V
L
 
M
A
 
L
R
 
K
L
 
L
V
 
L
R
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
V
L
 
M
G
 
G
P
 
D
D
 
Y
W
 
T
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
A
 
I
E
 
E
M
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
Q
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
A
L
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
H
G
 
A
R
 
L
A
 
D
V
 
K
S
 
D
L
 
L
G
 
K
E
 
D
V
 
C
R
 
A
V
 
V
A
 
Y
D
 
S
R
 
R
A
 
E
G
 
G
L
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
A
 
V
E
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
G
 
G
T
 
D
V
 
I
I
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
L
 
T
V
 
A
V
 
M
L
 
F
A
 
A
G
 
D
A
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
T
H
 
H
R
 
K
A
 
A
E
 
S
D
 
S
R
 
R
A
 
M
I
 
T
F
|
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
A
 
S
D
 
G
K
 
K
P
 
E
A
 
S
G
 
G
R
 
L
Y
 
F
T
 
D
M
 
M
D
 
R
A
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1arzA Escherichia coli dihydrodipicolinate reductase in complex with nadh and 2,6 pyridine dicarboxylate (see paper)
47% identity, 81% coverage: 46:242/242 of query aligns to 71:267/270 of 1arzA

query
sites
1arzA
D
 
D
A
 
V
L
 
F
V
 
I
D
 
D
F
 
F
S
 
T
T
 
R
P
 
P
A
 
E
A
 
G
L
 
T
E
 
L
S
 
N
H
 
H
L
 
L
A
 
A
A
 
F
A
 
C
R
 
R
A
 
Q
A
 
H
G
 
G
T
 
K
P
 
G
I
 
M
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
 
F
T
 
D
A
 
E
Q
 
A
H
 
G
H
 
K
A
 
Q
L
 
A
I
 
I
D
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
A
V
 
I
L
 
V
Q
 
F
T
 
A
G
 
A
N
 
N
T
 
F
S
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
N
L
 
V
L
 
M
A
 
L
R
 
K
L
 
L
V
 
L
R
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
V
L
 
M
G
 
G
P
 
D
D
 
Y
W
 
T
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
A
 
I
E
 
E
M
 
A
H
|
H
H
|
H
R
 
R
Q
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
A
L
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
H
G
 
A
R
 
L
A
 
D
V
 
K
S
 
D
L
 
L
G
 
K
E
 
D
V
 
C
R
 
A
V
 
V
A
 
Y
D
 
S
R
 
R
A
 
E
G
 
G
L
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
A
 
V
E
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
G
 
G
T
 
D
V
 
I
I
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
L
 
T
V
 
A
V
 
M
L
 
F
A
 
A
G
 
D
A
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
T
H
 
H
R
 
K
A
 
A
E
 
S
D
 
S
R
 
R
A
 
M
I
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
A
 
S
D
 
G
K
 
K
P
 
E
A
 
S
G
 
G
R
 
L
Y
 
F
T
 
D
M
 
M
D
 
R
A
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
L

Q9X1K8 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase; HTPA reductase; EC 1.17.1.8 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:240/242 of query aligns to 4:212/216 of Q9X1K8

query
sites
Q9X1K8
G
 
G
I
 
I
Y
 
V
G
 
G
S
 
Y
L
x
S
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
V
 
Q
A
 
E
I
 
I
R
 
Q
D
 
K
I
 
V
L
 
F
A
 
S
E
 
E
Q
 
K
G
 
G
V
 
H
K
 
E
F
 
L
A
 
V
-
 
L
-
 
K
-
 
V
-
 
D
-
 
V
G
 
N
G
 
G
A
 
V
D
 
E
A
 
E
G
 
L
D
 
D
D
 
S
P
 
P
A
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
D
A
 
V
L
 
V
V
 
I
D
 
D
F
 
F
S
 
S
T
 
S
P
 
P
A
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
P
S
 
K
H
 
T
L
 
V
A
 
D
A
 
L
A
 
C
R
 
K
A
 
K
A
 
Y
G
 
R
T
 
A
P
 
G
I
 
L
V
 
V
I
 
L
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
A
L
 
L
T
 
K
A
 
E
Q
 
E
H
 
H
H
 
L
A
 
Q
L
 
M
I
 
L
D
 
R
D
 
E
A
 
L
A
 
S
R
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
Q
T
x
A
G
x
Y
N
|
N
T
x
F
S
 
S
L
 
I
G
 
G
V
 
I
V
 
N
L
 
V
L
 
L
A
 
K
R
 
R
L
 
F
V
 
L
R
 
S
E
 
E
A
 
L
A
 
V
T
 
K
R
 
V
L
 
L
G
 
-
P
 
E
D
 
D
W
 
W
D
 
D
I
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
V
E
 
E
M
 
T
H
 
H
H
 
H
R
 
R
Q
 
F
K
|
K
V
 
K
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
I
M
 
L
L
 
L
G
 
-
E
 
-
A
 
E
A
 
S
A
 
A
A
 
L
G
 
G
R
 
K
A
 
S
V
 
V
S
 
P
L
 
I
G
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
H
S
 
S
L
 
L
R
 
R
G
 
V
G
 
G
T
 
G
V
 
V
I
 
P
G
 
G
D
 
D
H
 
H
L
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
F
A
 
G
G
 
N
A
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
T
I
 
I
E
 
E
L
 
I
A
 
K
H
 
H
R
 
R
A
 
A
E
 
I
D
 
S
R
 
R
A
 
T
I
 
V
F
 
F
A
 
A
R
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
E
W
 
F
L
 
L
A
 
V
D
 
G
K
 
K
P
 
D
A
 
P
G
 
G
R
 
M
Y
 
Y
T
 
S
M
 
F
D
 
E
A
 
E
V
 
V
L
 
I

1vm6B Crystal structure of dihydrodipicolinate reductase (tm1520) from thermotoga maritima at 2.27 a resolution
36% identity, 98% coverage: 5:240/242 of query aligns to 9:217/218 of 1vm6B

query
sites
1vm6B
G
 
G
I
 
I
Y
 
V
G
|
G
S
 
Y
L
x
S
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
V
 
Q
A
 
E
I
 
I
R
 
Q
D
 
K
I
 
V
L
 
F
A
 
S
E
 
E
Q
 
K
G
 
G
V
 
H
K
 
E
F
 
L
A
 
V
-
 
L
-
 
K
-
 
V
-
x
D
-
x
V
G
 
N
G
 
G
A
 
V
D
 
E
A
 
E
G
 
L
D
 
D
D
 
S
P
 
P
A
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
D
A
 
V
L
 
V
V
 
I
D
 
D
F
|
F
S
|
S
T
x
S
P
 
P
A
x
E
A
|
A
L
 
L
E
 
P
S
 
K
H
 
T
L
 
V
A
 
D
A
 
L
A
 
C
R
 
K
A
 
K
A
 
Y
G
 
R
T
 
A
P
 
G
I
 
L
V
 
V
I
 
L
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
A
L
 
L
T
 
K
A
 
E
Q
 
E
H
 
H
H
 
L
A
 
Q
L
 
M
I
 
L
D
 
R
D
 
E
A
 
L
A
 
S
R
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
Q
T
 
A
G
x
Y
N
|
N
T
x
F
S
 
S
L
 
I
G
 
G
V
 
I
V
 
N
L
 
V
L
 
L
A
 
K
R
 
R
L
 
F
V
 
L
R
 
S
E
 
E
A
 
L
A
 
V
T
 
K
R
 
V
L
 
L
G
 
-
P
 
E
D
 
D
W
 
W
D
 
D
I
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
V
E
 
E
M
 
T
H
|
H
H
 
H
R
 
R
Q
 
F
K
|
K
V
 
K
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
I
M
 
L
L
 
L
G
 
-
E
 
-
A
 
E
A
 
S
A
 
A
A
 
L
G
 
G
R
 
K
A
 
S
V
 
V
S
 
P
L
 
I
G
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
H
S
 
S
L
 
L
R
 
R
G
 
V
G
 
G
T
 
G
V
 
V
I
 
P
G
 
G
D
 
D
H
 
H
L
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
F
A
 
G
G
 
N
A
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
T
I
 
I
E
 
E
L
 
I
A
 
K
H
 
H
R
 
R
A
 
A
E
 
I
D
 
S
R
 
R
A
 
T
I
 
V
F
|
F
A
 
A
R
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
E
W
 
F
L
 
L
A
 
V
D
 
G
K
 
K
P
 
D
A
 
P
G
 
G
R
 
M
Y
 
Y
T
 
S
M
 
F
D
 
E
A
 
E
V
 
V
L
 
I

5wolA Crystal structure of dihydrodipicolinate reductase dapb from coxiella burnetii
32% identity, 90% coverage: 5:223/242 of query aligns to 8:213/230 of 5wolA

query
sites
5wolA
G
 
G
I
 
I
Y
 
N
G
|
G
S
x
K
L
x
M
G
 
G
R
 
R
M
 
-
G
 
-
V
 
V
A
 
V
I
 
K
R
 
E
D
 
N
I
 
I
L
 
T
A
 
A
E
 
Q
Q
 
S
G
 
D
V
 
L
K
 
E
F
 
L
A
 
V
G
 
S
G
 
G
A
 
T
D
x
G
A
x
R
G
 
Q
D
 
D
D
 
D
P
 
L
A
 
A
-
 
K
-
 
T
V
 
I
L
 
Q
A
 
T
A
 
T
A
 
H
A
 
A
D
 
D
A
 
V
L
 
V
V
 
I
D
 
D
F
|
F
S
x
T
T
|
T
P
 
P
A
 
Q
A
x
S
L
 
V
E
 
F
S
 
H
H
 
N
L
 
A
A
 
E
A
 
I
A
 
I
R
 
I
A
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
A
P
 
R
I
 
P
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
L
Q
 
E
H
 
Q
H
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
L
D
 
D
D
 
K
A
 
Q
A
 
C
R
 
R
-
 
N
-
 
K
E
 
K
I
 
L
A
 
G
V
 
A
L
 
I
Q
 
V
T
 
A
G
x
P
N
|
N
T
x
F
S
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
M
A
 
M
R
 
K
L
 
Y
V
 
A
R
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
H
R
 
Y
L
 
F
G
 
P
P
 
-
D
 
-
W
 
-
D
 
D
I
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
I
E
 
E
M
 
M
H
|
H
H
 
H
R
 
S
Q
 
Q
K
|
K
V
 
I
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
|
T
A
 
A
L
 
I
M
x
K
L
 
T
G
 
A
E
 
Q
A
 
M
A
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
L
 
I
G
 
G
E
 
E
V
 
M
R
 
R
V
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
S
A
 
S
R
 
R
A
 
A
E
 
R
G
 
G
T
 
E
I
 
I
G
 
K
-
 
N
-
 
G
-
 
I
-
 
P
F
 
I
A
 
H
S
 
S
L
 
I
R
 
R
G
 
L
G
 
P
T
 
G
V
 
L
I
 
F
G
 
S
D
 
H
H
 
Q
L
 
S
V
 
V
V
 
I
L
 
F
A
 
G
G
 
S
A
 
N
G
 
G
E
 
E
R
 
T
I
 
L
E
 
T
L
 
I
A
 
R
H
 
H
R
 
D
A
 
G
E
 
M
D
 
D
R
 
R
A
 
N
I
 
C
F
 
T
A
 
M
R
 
P
G
 
G
A
 
I
V
 
F
R
 
M
A
 
A
A
 
C

Sites not aligning to the query:

1yl5A Crystal structure of mycobacterium tuberculosis dihydrodipicolinate reductase (rv2773c) (crystal form a) (see paper)
27% identity, 100% coverage: 1:242/242 of query aligns to 2:246/247 of 1yl5A

query
sites
1yl5A
M
 
M
S
 
A
S
 
R
I
 
V
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
G
 
G
S
 
A
L
 
K
G
 
G
R
 
K
M
 
V
G
 
G
-
 
A
V
 
T
A
 
M
I
 
V
R
 
R
D
 
A
I
x
V
L
x
A
A
 
A
E
x
A
Q
 
D
G
 
D
V
x
L
K
 
T
F
 
L
A
 
S
G
 
A
G
 
E
A
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
G
D
 
D
D
 
P
P
 
L
A
 
S
V
 
L
L
 
L
A
 
T
-
 
D
A
 
G
A
 
N
A
 
T
D
 
E
A
 
V
L
 
V
V
 
I
D
 
D
F
 
F
S
 
T
T
 
H
P
 
P
A
 
D
A
 
V
L
 
V
E
 
M
S
 
G
H
 
N
L
 
L
A
 
E
A
 
F
A
 
L
R
 
I
A
 
D
A
 
N
G
 
G
T
 
I
P
 
H
I
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
 
F
T
 
T
A
 
A
Q
 
E
H
 
R
H
 
F
A
 
Q
L
 
Q
I
 
V
D
 
E
D
 
S
-
 
W
-
 
L
-
 
V
A
 
A
A
 
K
R
 
P
E
 
N
I
 
T
A
 
S
V
 
V
L
 
L
Q
 
I
T
 
A
G
 
P
N
 
N
T
 
F
S
 
A
L
 
I
G
 
G
V
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
S
A
 
M
R
 
H
L
 
F
V
 
A
R
 
K
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
T
 
R
R
 
F
L
 
F
G
 
D
P
 
-
D
 
-
W
 
-
D
 
S
I
 
A
E
 
E
I
 
V
A
 
I
E
 
E
M
 
L
H
|
H
H
 
H
R
 
P
Q
 
H
K
|
K
V
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
A
M
 
R
L
 
T
G
 
A
E
 
K
A
 
L
A
 
I
A
 
A
A
 
E
G
 
A
R
 
R
A
 
K
V
 
-
S
 
G
L
 
L
G
 
P
E
 
P
V
 
N
R
 
P
V
 
D
A
 
A
D
 
T
R
 
S
A
 
T
G
 
S
L
 
L
T
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
G
E
 
A
G
 
D
T
 
V
I
 
D
G
 
G
F
 
I
A
 
P
-
 
V
-
 
H
S
 
A
L
 
V
R
 
R
G
 
L
G
 
A
T
 
G
V
 
L
I
 
V
G
 
A
D
 
H
H
 
Q
L
 
E
V
 
V
V
 
L
L
 
F
A
 
G
G
 
T
A
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
T
I
 
L
E
 
T
L
 
I
A
 
R
H
 
H
R
 
D
A
 
S
E
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
T
I
 
S
F
 
F
A
 
V
R
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
L
R
 
L
A
 
A
A
 
V
L
 
R
W
 
R
L
 
I
A
 
A
D
 
E
K
 
R
P
 
P
A
 
G
G
 
L
R
 
T
Y
 
V
T
 
G
M
 
L
D
 
E
A
 
P
V
 
L
L
 
L
G
 
D
L
 
L

1p9lA Structure of m. Tuberculosis dihydrodipicolinate reductase in complex with nadh and 2,6 pdc (see paper)
27% identity, 99% coverage: 4:242/242 of query aligns to 3:244/245 of 1p9lA

query
sites
1p9lA
I
 
V
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
G
|
G
S
 
A
L
 
K
G
|
G
R
x
K
M
x
V
G
 
G
V
 
T
A
 
T
-
 
M
I
 
V
R
 
R
D
 
A
I
 
V
L
 
A
A
 
A
E
 
A
Q
 
D
G
 
D
V
 
L
K
 
T
F
 
L
A
 
S
G
 
A
G
 
E
A
 
L
D
|
D
A
|
A
G
 
G
D
 
D
D
 
P
P
 
L
A
 
S
V
 
L
L
 
L
A
 
T
-
 
D
A
 
G
A
 
N
A
 
T
D
 
E
A
 
V
L
 
V
V
 
I
D
 
D
F
|
F
S
x
T
T
 
H
P
 
P
A
 
D
A
x
V
L
 
V
E
 
M
S
 
G
H
 
N
L
 
L
A
 
E
A
 
F
A
 
L
R
 
I
A
 
D
A
 
N
G
 
G
T
 
I
P
 
H
I
 
A
V
 
V
I
 
V
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
L
 
F
T
 
T
A
 
A
Q
 
E
H
 
R
H
 
F
A
 
Q
L
 
Q
I
 
V
D
 
E
D
 
S
-
 
W
-
 
L
-
 
V
A
 
A
A
 
K
R
 
P
E
 
N
I
 
T
A
 
S
V
 
V
L
 
L
Q
 
I
T
 
A
G
x
P
N
|
N
T
x
F
S
 
A
L
 
I
G
 
G
V
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
S
A
 
M
R
 
H
L
 
F
V
 
A
R
 
K
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
T
 
R
R
 
F
L
 
F
G
 
D
P
 
-
D
 
-
W
 
-
D
 
S
I
 
A
E
 
E
I
 
V
A
 
I
E
 
E
M
 
L
H
|
H
H
|
H
R
 
P
Q
 
H
K
|
K
V
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
A
M
 
R
L
 
T
G
 
A
E
 
K
A
 
L
A
 
I
A
 
A
A
 
E
G
 
A
R
 
R
A
 
K
V
 
-
S
 
G
L
 
L
G
 
P
E
 
P
V
 
N
R
 
P
V
 
D
A
 
A
D
 
T
R
 
S
A
 
T
G
 
S
L
 
L
T
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
G
E
 
A
G
 
D
T
 
V
I
 
D
G
 
G
F
 
I
A
 
P
-
 
V
-
 
H
S
 
A
L
 
V
R
 
R
G
 
L
G
 
A
T
 
G
V
 
L
I
 
V
G
x
A
D
 
H
H
 
Q
L
 
E
V
 
V
V
 
L
L
 
F
A
 
G
G
 
T
A
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
T
I
 
L
E
 
T
L
 
I
A
 
R
H
 
H
R
 
D
A
 
S
E
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
T
I
 
S
F
|
F
A
 
V
R
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
L
R
 
L
A
 
A
A
 
V
L
 
R
W
 
R
L
 
I
A
 
A
D
 
E
K
 
R
P
 
P
A
 
G
G
 
L
R
 
T
Y
 
V
T
 
G
M
 
L
D
 
E
A
 
P
V
 
L
L
 
L
G
 
D
L
 
L

1c3vA Dihydrodipicolinate reductase from mycobacterium tuberculosis complexed with NADPH and pdc (see paper)
27% identity, 99% coverage: 4:242/242 of query aligns to 3:244/245 of 1c3vA

query
sites
1c3vA
I
 
V
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
G
 
G
S
 
A
L
x
K
G
|
G
R
x
K
M
x
V
G
 
G
V
 
T
A
 
T
-
 
M
I
 
V
R
 
R
D
 
A
I
 
V
L
 
A
A
 
A
E
 
A
Q
 
D
G
 
D
V
 
L
K
 
T
F
 
L
A
 
S
G
 
A
G
 
E
A
 
L
D
|
D
A
|
A
G
 
G
D
 
D
D
 
P
P
 
L
A
 
S
V
 
L
L
 
L
A
 
T
-
 
D
A
 
G
A
 
N
A
 
T
D
 
E
A
 
V
L
 
V
V
 
I
D
 
D
F
|
F
S
x
T
T
 
H
P
 
P
A
 
D
A
x
V
L
 
V
E
 
M
S
 
G
H
 
N
L
 
L
A
 
E
A
 
F
A
 
L
R
 
I
A
 
D
A
 
N
G
 
G
T
 
I
P
 
H
I
 
A
V
 
V
I
 
V
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
L
 
F
T
 
T
A
 
A
Q
 
E
H
 
R
H
 
F
A
 
Q
L
 
Q
I
 
V
D
 
E
D
 
S
-
 
W
-
 
L
-
 
V
A
 
A
A
 
K
R
 
P
E
 
N
I
 
T
A
 
S
V
 
V
L
 
L
Q
 
I
T
 
A
G
x
P
N
|
N
T
 
F
S
 
A
L
 
I
G
 
G
V
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
S
A
 
M
R
 
H
L
 
F
V
 
A
R
 
K
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
T
 
R
R
 
F
L
 
F
G
 
D
P
 
-
D
 
-
W
 
-
D
 
S
I
 
A
E
 
E
I
 
V
A
 
I
E
 
E
M
 
L
H
|
H
H
 
H
R
 
P
Q
 
H
K
|
K
V
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
A
M
 
R
L
 
T
G
 
A
E
 
K
A
 
L
A
 
I
A
 
A
A
 
E
G
 
A
R
 
R
A
 
K
V
 
-
S
 
G
L
 
L
G
 
P
E
 
P
V
 
N
R
 
P
V
 
D
A
 
A
D
 
T
R
 
S
A
 
T
G
 
S
L
 
L
T
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
G
E
 
A
G
 
D
T
 
V
I
 
D
G
 
G
F
 
I
A
 
P
-
 
V
-
 
H
S
 
A
L
 
V
R
 
R
G
 
L
G
 
A
T
 
G
V
 
L
I
 
V
G
x
A
D
 
H
H
 
Q
L
 
E
V
 
V
V
 
L
L
 
F
A
 
G
G
 
T
A
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
T
I
 
L
E
 
T
L
 
I
A
 
R
H
 
H
R
 
D
A
 
S
E
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
T
I
 
S
F
|
F
A
 
V
R
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
L
R
 
L
A
 
A
A
 
V
L
 
R
W
 
R
L
 
I
A
 
A
D
 
E
K
 
R
P
 
P
A
 
G
G
 
L
R
 
T
Y
 
V
T
 
G
M
 
L
D
 
E
A
 
P
V
 
L
L
 
L
G
 
D
L
 
L

5ugvA Dapb from mycobacterium tuberculosis (see paper)
27% identity, 99% coverage: 4:242/242 of query aligns to 4:245/245 of 5ugvA

query
sites
5ugvA
I
 
V
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
G
|
G
S
 
A
L
 
K
G
|
G
R
x
K
M
x
V
G
 
G
-
 
A
V
 
T
A
 
M
I
 
V
R
 
R
D
 
A
I
 
V
L
 
A
A
 
A
E
 
A
Q
 
D
G
 
D
V
 
L
K
 
T
F
 
L
A
 
S
G
 
A
G
 
E
A
 
L
D
|
D
A
|
A
G
 
G
D
 
D
D
 
P
P
 
L
A
 
S
V
 
L
L
 
L
A
 
T
-
 
D
A
 
G
A
 
N
A
 
T
D
 
E
A
 
V
L
 
V
V
 
I
D
 
D
F
|
F
S
x
T
T
 
H
P
 
P
A
 
D
A
x
V
L
 
V
E
 
M
S
 
G
H
 
N
L
 
L
A
 
E
A
 
F
A
 
L
R
 
I
A
 
D
A
 
N
G
 
G
T
 
I
P
 
H
I
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
L
 
F
T
 
T
A
 
A
Q
 
E
H
 
R
H
 
F
A
 
Q
L
 
Q
I
 
V
D
 
E
D
 
S
-
 
W
-
 
L
-
 
V
A
 
A
A
 
K
R
 
P
E
 
N
I
 
T
A
 
S
V
 
V
L
 
L
Q
 
I
T
 
A
G
 
P
N
 
N
T
 
F
S
 
A
L
 
I
G
 
G
V
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
S
A
 
M
R
 
H
L
 
F
V
 
A
R
 
K
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
T
 
R
R
 
F
L
 
F
G
 
D
P
 
-
D
 
-
W
 
-
D
 
S
I
 
A
E
 
E
I
 
V
A
 
I
E
 
E
M
 
L
H
 
H
H
 
H
R
 
P
Q
 
H
K
 
K
V
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
A
M
 
R
L
 
T
G
 
A
E
 
K
A
 
L
A
 
I
A
 
A
A
 
E
G
 
A
R
 
R
A
 
K
V
 
-
S
 
G
L
 
L
G
 
P
E
 
P
V
 
N
R
 
P
V
 
D
A
 
A
D
 
T
R
 
S
A
 
T
G
 
S
L
 
L
T
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
G
E
 
A
G
 
D
T
 
V
I
 
D
G
 
G
F
 
I
A
 
P
-
 
V
-
 
H
S
 
A
L
 
V
R
 
R
G
 
L
G
 
A
T
 
G
V
 
L
I
 
V
G
 
A
D
 
H
H
 
Q
L
 
E
V
 
V
V
 
L
L
 
F
A
 
G
G
 
T
A
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
T
I
 
L
E
 
T
L
 
I
A
 
R
H
 
H
R
 
D
A
 
S
E
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
T
I
 
S
F
 
F
A
 
V
R
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
L
R
 
L
A
 
A
A
 
V
L
 
R
W
 
R
L
 
I
A
 
A
D
 
E
K
 
R
P
 
P
A
 
G
G
 
L
R
 
T
Y
 
V
T
 
G
M
 
L
D
 
E
A
 
P
V
 
L
L
 
L
G
 
D
L
 
L

Query Sequence

>Ga0059261_2545 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_2545
MSSIGIYGSLGRMGVAIRDILAEQGVKFAGGADAGDDPAVLAAAADALVDFSTPAALESH
LAAARAAGTPIVIGTTGLTAQHHALIDDAAREIAVLQTGNTSLGVVLLARLVREAATRLG
PDWDIEIAEMHHRQKVDAPSGTALMLGEAAAAGRAVSLGEVRVADRAGLTGARAEGTIGF
ASLRGGTVIGDHLVVLAGAGERIELAHRAEDRAIFARGAVRAALWLADKPAGRYTMDAVL
GL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory