SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_2703 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_2703 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4yerA Crystal structure of an abc transporter atp-binding protein (tm_1403) from thermotoga maritima msb8 at 2.35 a resolution
39% identity, 81% coverage: 1:254/313 of query aligns to 1:255/285 of 4yerA

query
sites
4yerA
M
 
M
Q
 
E
P
 
D
I
 
I
L
 
I
S
 
V
V
 
V
R
 
E
G
 
N
V
 
L
S
 
V
K
 
K
T
 
K
Y
x
F
A
 
G
S
 
D
G
 
-
H
x
F
K
 
E
A
 
A
L
 
V
G
 
K
S
 
G
V
 
V
D
 
S
L
 
F
D
 
S
I
 
V
N
 
K
K
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
I
F
 
F
A
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
I
 
I
S
 
H
I
 
M
I
 
L
C
 
T
G
 
T
I
 
L
V
 
L
T
 
K
P
 
P
S
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
K
I
 
A
V
 
W
V
 
V
D
 
A
G
 
G
H
 
H
D
 
D
A
 
V
I
 
L
S
 
K
E
 
E
P
 
P
R
 
R
A
 
E
A
 
V
R
 
R
M
 
R
K
 
K
I
 
I
G
 
G
L
 
I
V
 
V
P
 
F
Q
 
Q
E
 
D
L
 
Q
S
 
S
V
 
L
D
 
D
M
 
R
F
 
E
E
 
L
T
 
T
V
 
A
Q
 
Y
A
 
E
T
 
N
T
 
M
R
 
Y
Y
 
I
S
 
H
R
 
G
R
 
K
L
 
I
F
 
Y
G
 
G
R
 
Y
P
 
G
A
 
G
N
 
E
-
 
K
-
 
L
D
 
K
A
 
K
Y
 
R
I
 
I
D
 
L
Q
 
E
V
 
L
L
 
L
K
 
E
D
 
F
L
 
V
S
 
E
L
 
L
Y
 
L
D
 
E
K
 
F
R
 
K
N
 
D
S
 
K
K
 
P
V
 
V
M
 
K
E
x
T
L
x
F
S
|
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
K
 
A
R
 
R
R
 
R
V
 
L
L
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
I
H
 
H
E
 
E
P
 
P
D
 
E
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
I
G
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
P
S
 
H
L
 
T
R
 
R
R
 
A
D
 
H
M
 
M
W
 
W
K
 
E
L
 
Y
I
 
I
G
 
S
S
 
K
L
 
M
-
 
K
R
 
K
E
 
E
R
 
H
G
 
N
T
 
M
T
 
T
I
 
I
I
 
F
L
 
L
T
 
T
T
 
T
H
 
H
Y
 
Y
I
 
M
E
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
E
E
 
Q
M
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
I
I
 
I
N
 
D
K
 
H
G
 
G
E
 
K
L
 
I
L
 
I
L
 
A
V
 
L
E
 
G
G
 
T
K
 
P
A
 
T
E
 
E
L
 
L
M
 
K
K
 
R
K
 
M
L
 
V
G
 
G
K
 
K
R
 
E
E
 
I
M
 
I
D
 
Y
I
 
V
A
 
R
-
 
D
L
 
F
V
 
I
E
 
E
P
 
S
M
 
C
T
 
R
A
 
K
I
 
L
P
 
P
-
 
D
G
 
G
E
 
R
L
 
L
E
 
E
E
 
-
W
 
-
H
 
-
L
 
L
A
 
N
L
 
V
E
 
E
D
 
D

7roqA Alternative structure of human abca1
35% identity, 91% coverage: 26:311/313 of query aligns to 792:1087/1831 of 7roqA

query
sites
7roqA
L
 
L
D
 
N
I
 
F
N
 
Y
K
 
E
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
F
 
T
A
 
S
L
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
T
I
 
M
S
 
S
I
 
I
I
 
L
C
 
T
G
 
G
I
 
L
V
 
F
T
 
P
P
 
P
S
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
T
I
 
A
V
 
Y
V
 
I
D
 
L
G
 
G
H
 
K
D
 
D
A
 
I
I
 
R
S
 
S
E
 
E
P
 
M
R
 
S
A
 
T
A
 
I
R
 
R
M
 
Q
K
 
N
I
 
L
G
 
G
L
 
V
V
 
C
P
 
P
Q
 
Q
E
 
H
-
 
N
L
 
V
S
 
L
V
 
F
D
 
D
M
 
M
F
 
L
E
 
-
T
 
T
V
 
V
Q
 
E
A
 
E
T
 
H
T
 
I
R
 
W
Y
 
F
S
 
Y
R
 
A
R
 
R
L
 
L
F
 
K
G
 
G
R
 
L
P
 
S
A
 
E
N
 
K
D
 
H
-
 
V
-
 
K
A
 
A
Y
 
E
I
 
M
D
 
E
Q
 
Q
V
 
M
L
 
A
K
 
L
D
 
D
L
 
V
S
 
G
L
 
L
Y
 
S
D
 
S
K
 
K
R
 
L
N
 
K
S
 
S
K
 
K
V
 
T
M
 
S
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
K
 
Q
R
 
R
R
 
K
V
 
L
L
 
S
I
 
V
A
 
A
K
 
L
A
 
A
L
 
F
A
 
V
H
 
G
E
 
G
P
 
S
D
 
K
I
 
V
L
 
V
F
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
P
S
 
Y
L
 
S
R
 
R
R
 
R
D
 
G
M
 
I
W
 
W
K
 
E
L
 
L
I
 
L
G
 
L
S
 
K
L
 
Y
R
 
R
E
 
Q
R
 
-
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
I
I
 
I
L
 
L
T
 
S
T
 
T
H
 
H
Y
 
H
I
 
M
E
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
D
E
 
V
M
 
L
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
I
G
 
A
V
 
I
I
 
I
N
 
S
K
 
H
G
 
G
E
 
K
L
 
L
L
 
C
L
 
C
V
 
V
E
 
G
G
 
S
K
 
S
A
 
L
E
 
F
L
 
L
M
 
K
K
 
N
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
K
 
T
R
 
G
E
 
Y
M
 
Y
D
 
-
I
 
L
A
 
T
L
 
L
V
 
V
E
 
K
P
 
K
M
 
L
T
 
T
-
 
I
-
 
D
-
 
V
-
 
S
A
 
A
I
 
I
P
 
S
G
 
N
E
 
L
L
 
I
E
 
R
E
 
K
W
 
-
H
 
H
L
 
V
A
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
R
-
 
L
L
 
V
E
 
E
D
 
D
E
 
I
G
 
G
H
 
H
R
 
E
L
 
L
R
 
T
Y
 
Y
T
 
V
F
 
L
D
 
P
A
 
Y
Q
 
E
A
 
A
E
 
A
R
 
K
T
 
E
G
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
V
-
 
E
-
 
L
I
 
F
P
 
H
S
 
E
L
 
I
L
 
D
R
 
D
K
 
R
L
 
L
G
 
S
D
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
I
Q
 
-
F
 
-
K
 
S
D
 
S
L
 
Y
D
 
G
T
 
I
S
 
S
K
 
E
S
 
T
S
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
E
I
 
I
F
 
F
V
 
L
D
 
K
L
 
V
V
 
A
E
 
W
T
 
K
R
 
L
N
 
T
E
 
Q
E
 
Q
K
 
Q

Sites not aligning to the query:

8ee6A Cryo-em structure of human abca7 in pe/ch nanodiscs (see paper)
34% identity, 97% coverage: 1:305/313 of query aligns to 620:933/1808 of 8ee6A

query
sites
8ee6A
M
 
L
Q
 
S
P
 
P
I
 
G
L
 
V
S
 
S
V
 
V
R
 
R
G
 
S
V
 
L
S
 
E
K
 
K
T
 
R
Y
x
F
-
 
P
A
 
G
S
 
S
G
 
P
H
 
Q
K
 
P
A
|
A
L
 
L
G
 
R
S
 
G
V
 
L
D
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
F
N
 
Y
K
 
Q
G
 
G
E
 
H
I
 
I
F
 
T
A
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
I
 
L
S
 
S
I
 
I
I
 
L
C
 
S
G
 
G
I
 
L
V
 
F
T
 
P
P
 
P
S
 
S
S
 
G
G
 
G
T
 
S
I
 
A
V
 
F
V
 
I
D
 
L
G
 
G
H
 
H
D
 
D
A
 
V
I
 
R
S
 
S
E
 
S
P
 
M
R
 
A
A
 
A
A
 
I
R
 
R
M
 
P
K
 
H
I
 
L
G
 
G
L
 
V
V
 
C
P
 
P
Q
 
Q
-
 
Y
E
 
N
L
 
V
S
 
L
V
 
F
D
 
D
M
 
M
F
 
L
E
 
-
T
 
T
V
 
V
Q
 
D
A
 
E
T
 
H
T
 
V
R
 
W
Y
 
F
S
 
Y
R
 
G
R
 
R
L
 
L
F
 
K
G
 
G
R
 
L
P
 
S
A
 
A
N
 
A
-
 
V
-
 
V
D
 
G
A
 
P
Y
 
E
I
 
Q
D
 
D
Q
 
R
V
 
L
L
 
L
K
 
Q
D
 
D
L
 
V
S
 
G
L
 
L
Y
 
V
D
 
S
K
 
K
R
 
Q
N
 
S
S
 
V
K
 
Q
V
 
T
M
 
R
E
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
K
 
Q
R
 
R
R
 
K
V
 
L
L
 
S
I
 
V
A
 
A
K
 
I
A
 
A
L
 
F
A
 
V
H
 
G
E
 
G
P
 
S
D
 
Q
I
 
V
L
 
V
F
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
P
S
 
A
L
 
S
R
 
R
R
 
R
D
 
G
M
 
I
W
 
W
K
 
E
L
 
L
I
 
L
G
 
L
S
 
K
L
 
Y
R
 
R
E
 
E
R
 
-
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
L
I
 
I
L
 
L
T
 
S
T
 
T
H
 
H
Y
 
H
I
 
L
E
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
E
E
 
L
M
 
L
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
V
I
 
V
N
 
A
K
 
G
G
 
G
E
 
R
L
 
L
L
 
C
L
 
C
V
 
C
E
 
G
G
 
S
K
 
P
A
 
L
E
 
F
L
 
L
M
 
R
K
 
R
K
 
H
L
 
L
G
 
G
K
 
S
R
 
G
E
 
Y
M
 
Y
D
 
-
I
 
L
A
 
T
L
 
L
V
 
V
E
 
K
P
 
A
M
 
V
T
 
G
A
 
T
-
 
P
-
 
Q
I
 
L
P
 
L
G
 
A
E
 
L
L
 
V
E
 
Q
E
 
H
W
 
W
-
 
V
-
 
P
-
 
G
H
 
A
L
 
R
A
 
L
L
 
V
E
 
E
D
 
E
E
 
L
G
 
P
H
 
H
R
 
E
L
 
L
R
 
V
Y
 
L
T
 
V
F
 
-
D
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
G
 
-
I
 
L
P
 
P
S
 
Y
L
 
T
L
 
G
R
 
A
K
 
H
L
 
D
G
 
G
D
 
S
L
 
F
G
 
A
I
 
T
Q
 
L
F
 
F
K
 
R
D
 
E
L
 
L
D
 
D
T
 
T
-
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
R
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
Y
-
 
G
-
 
I
S
 
S
K
 
D
S
 
T
S
 
S
L
 
L
E
 
E
D
 
E
I
 
I
F
 
F
V
 
L
D
 
K
L
 
V
V
 
V
E
 
E

Sites not aligning to the query:

7tbwA The structure of atp-bound abca1 (see paper)
35% identity, 96% coverage: 5:305/313 of query aligns to 754:1048/1928 of 7tbwA

query
sites
7tbwA
L
 
V
S
 
S
V
 
I
R
 
Q
G
 
N
V
 
L
S
 
V
K
 
K
T
 
V
Y
|
Y
A
 
R
S
x
D
G
 
G
H
 
M
K
|
K
-
 
V
A
 
A
L
 
V
G
 
D
S
 
G
V
 
L
D
 
A
L
 
L
D
 
N
I
 
F
N
 
Y
K
 
E
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
F
 
T
A
 
S
L
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
 
T
L
 
T
I
 
M
S
 
S
I
 
I
I
 
L
C
 
T
G
 
G
I
 
L
V
 
F
T
 
P
P
 
P
S
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
T
I
 
A
V
 
Y
V
 
I
D
 
L
G
 
G
H
 
K
D
 
D
A
 
I
I
 
R
S
 
S
E
 
E
P
 
M
R
 
S
A
 
T
A
 
I
R
 
R
M
 
Q
K
 
N
I
 
L
G
 
G
L
 
V
V
 
C
P
 
P
Q
|
Q
E
 
H
-
 
N
L
 
V
S
 
L
V
 
F
D
 
D
M
 
M
F
 
L
E
 
-
T
 
T
V
 
V
Q
 
E
A
 
E
T
 
H
T
 
I
R
 
W
Y
 
F
S
 
Y
R
 
A
R
 
R
L
 
L
F
 
K
G
 
G
R
 
L
P
 
S
A
 
E
N
 
K
D
 
H
-
 
V
-
 
K
A
 
A
Y
 
E
I
 
M
D
 
E
Q
 
Q
V
 
M
L
 
A
K
 
L
D
 
D
L
 
V
S
 
G
L
 
L
-
 
P
Y
 
S
D
 
S
K
 
K
R
 
L
N
 
K
S
 
S
K
 
K
V
 
T
M
 
S
E
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
K
 
Q
R
 
R
R
 
K
V
 
L
L
 
S
I
 
V
A
 
A
K
 
L
A
 
A
L
 
F
A
 
V
H
 
G
E
 
G
P
 
S
D
 
K
I
 
V
L
 
V
F
 
I
L
 
L
D
|
D
E
x
Q
P
 
P
T
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
P
S
 
Y
L
 
S
R
 
R
R
 
R
D
 
G
M
 
I
W
 
W
K
 
E
L
 
L
I
 
L
G
 
L
S
 
K
L
 
Y
R
 
R
E
 
Q
R
 
-
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
I
I
 
I
L
 
L
T
 
S
T
 
T
H
|
H
Y
 
H
I
 
M
E
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
D
E
 
V
M
 
L
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
I
G
 
A
V
 
I
I
 
I
N
 
S
K
 
H
G
 
G
E
 
K
L
 
L
L
 
C
L
 
C
V
 
V
E
 
G
G
 
S
K
 
S
A
 
L
E
 
F
L
 
L
M
 
K
K
 
N
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
K
 
T
R
 
G
E
 
Y
M
 
Y
D
 
-
I
 
L
A
 
T
L
 
L
V
 
V
E
 
K
P
 
-
M
 
-
T
 
S
A
 
A
I
 
I
P
 
S
G
 
N
E
 
L
L
 
I
E
 
R
E
 
K
W
 
-
H
 
H
L
 
V
A
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
R
-
 
L
L
 
V
E
 
E
D
 
D
E
 
I
G
 
G
H
 
H
R
 
E
L
 
L
R
 
T
Y
 
Y
T
 
V
F
 
L
D
 
P
A
 
A
Q
 
F
A
 
V
E
 
E
R
 
-
T
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
-
L
 
L
L
 
F
R
 
H
K
 
E
L
 
I
G
 
D
D
 
D
L
 
-
G
 
-
I
 
-
Q
 
R
F
 
I
K
 
S
D
 
S
L
 
Y
D
 
G
T
 
I
S
 
S
K
 
E
S
 
T
S
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
E
I
 
I
F
 
F
V
 
L
D
 
K
L
 
V
V
 
A
E
 
E

Sites not aligning to the query:

8eopA Cryo-em structure of nanodisc reconstituted human abca7 eq mutant in atp bound closed state (see paper)
38% identity, 79% coverage: 3:250/313 of query aligns to 648:891/1687 of 8eopA

query
sites
8eopA
P
 
P
I
 
G
L
 
V
S
 
S
V
 
V
R
 
R
G
 
S
V
 
L
S
 
E
K
 
K
T
 
R
Y
x
F
-
 
P
A
 
G
S
|
S
G
 
P
H
 
Q
K
 
P
A
|
A
L
 
L
G
 
R
S
 
G
V
 
L
D
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
F
N
 
Y
K
 
Q
G
 
G
E
 
H
I
 
I
F
 
T
A
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
I
 
L
S
 
S
I
 
I
I
 
L
C
 
S
G
 
G
I
 
L
V
 
F
T
 
P
P
 
P
S
 
S
S
 
G
G
 
G
T
 
S
I
 
A
V
 
F
V
 
I
D
 
L
G
 
G
H
 
H
D
 
D
A
 
V
I
 
R
S
 
S
E
 
S
P
 
M
R
 
A
A
 
A
A
 
I
R
 
R
M
 
P
K
 
H
I
 
L
G
 
G
L
 
V
V
 
C
P
 
P
Q
 
Q
-
 
Y
E
 
N
L
 
V
S
 
L
V
 
F
D
 
D
M
 
M
F
 
L
E
 
-
T
 
T
V
 
V
Q
 
D
A
 
E
T
 
H
T
 
V
R
 
W
Y
 
F
S
 
Y
R
 
G
R
 
R
L
 
L
F
 
K
G
 
G
R
 
L
P
 
S
A
 
A
N
 
A
-
 
V
-
 
V
D
 
G
A
 
P
Y
 
E
I
 
Q
D
 
D
Q
 
R
V
 
L
L
 
L
K
 
Q
D
 
D
L
 
V
S
 
G
L
 
L
Y
 
V
D
 
S
K
 
K
R
 
Q
N
 
S
S
 
V
K
 
Q
V
 
T
M
 
R
E
x
H
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
K
 
Q
R
 
R
R
 
K
V
 
L
L
 
S
I
 
V
A
 
A
K
 
I
A
 
A
L
 
F
A
 
V
H
 
G
E
 
G
P
 
S
D
 
Q
I
 
V
L
 
V
F
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
P
S
 
A
L
 
S
R
 
R
R
 
R
D
 
G
M
 
I
W
 
W
K
 
E
L
 
L
I
 
L
G
 
L
S
 
K
L
 
Y
R
 
R
E
 
E
R
 
-
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
L
I
 
I
L
 
L
T
 
S
T
 
T
H
 
H
Y
 
H
I
 
L
E
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
E
E
 
L
M
 
L
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
V
I
 
V
N
 
A
K
 
G
G
 
G
E
 
R
L
 
L
L
 
C
L
 
C
V
 
C
E
 
-
G
 
G
K
 
S
A
 
P
E
 
L
L
 
F
M
 
L
K
 
R
K
 
R
L
 
L
G
 
-
K
 
-
R
 
E
E
 
E
M
 
I
D
 
F
I
 
L
A
 
K
L
 
V
V
 
V
E
 
E
P
 
E
M
 
C
T
 
A
A
 
-
I
 
-
P
 
-
G
 
G
E
 
R
L
 
V
E
 
Q
E
 
G
W
 
W
H
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7e7qA Cryo-em structure of human abca4 in atp-bound state (see paper)
31% identity, 97% coverage: 3:305/313 of query aligns to 790:1092/1958 of 7e7qA

query
sites
7e7qA
P
 
P
I
 
G
L
 
V
S
 
C
V
 
V
R
 
K
G
 
N
V
 
L
S
 
V
K
 
K
T
 
I
Y
x
F
-
 
E
A
 
P
S
x
C
G
 
G
H
 
R
K
 
P
A
|
A
L
 
V
G
 
D
S
 
R
V
 
L
D
 
N
L
 
I
D
 
T
I
 
F
N
 
Y
K
 
E
G
 
N
E
 
Q
I
 
I
F
 
T
A
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
|
N
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
I
 
L
S
 
S
I
 
I
I
 
L
C
 
T
G
 
G
I
 
L
V
 
L
T
 
P
P
 
P
S
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
T
I
 
V
V
 
L
V
 
V
D
 
G
G
 
G
H
 
R
D
 
D
A
 
I
I
 
E
S
 
T
E
 
S
P
 
L
R
 
D
A
 
A
A
 
V
R
 
R
M
 
Q
K
 
S
I
 
L
G
 
G
L
 
M
V
 
C
P
 
P
Q
|
Q
E
 
H
L
 
N
S
 
I
V
 
L
D
 
F
M
 
H
F
 
H
E
 
L
T
 
T
V
 
V
Q
 
A
A
 
E
T
 
H
T
 
M
R
 
L
Y
 
F
S
 
Y
R
 
A
R
 
Q
L
 
L
F
 
K
G
 
G
R
 
K
P
 
S
A
 
Q
N
 
E
D
 
E
A
 
A
Y
 
Q
I
 
L
D
 
E
Q
 
M
-
 
E
-
 
A
V
 
M
L
 
L
K
 
E
D
 
D
L
 
T
S
 
G
L
 
L
Y
 
H
D
 
H
K
 
K
R
 
R
N
 
N
S
 
E
K
 
E
V
 
A
M
 
Q
E
 
D
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
M
 
M
K
 
Q
R
 
R
R
 
K
V
 
L
L
 
S
I
 
V
A
 
A
K
 
I
A
 
A
L
 
F
A
 
V
H
 
G
E
 
D
P
 
A
D
 
K
I
 
V
L
 
V
F
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
P
S
 
Y
L
 
S
R
 
R
R
 
R
D
 
S
M
 
I
W
 
W
K
 
D
L
 
L
I
 
L
G
 
L
S
 
K
L
 
Y
R
 
R
E
 
S
R
 
-
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
I
I
 
I
L
 
M
T
 
S
T
 
T
H
 
H
Y
 
H
I
 
M
E
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
D
E
 
L
M
 
L
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
I
G
 
A
V
 
I
I
 
I
N
 
A
K
 
Q
G
 
G
E
 
R
L
 
-
L
 
L
L
 
Y
V
 
C
E
 
S
G
 
G
K
 
T
A
 
P
E
 
L
L
 
F
M
 
L
K
 
K
K
 
N
L
 
C
G
 
F
K
 
G
R
 
T
E
 
G
M
 
L
D
 
Y
I
 
L
A
 
T
L
 
L
V
 
V
-
 
R
-
 
K
-
 
D
-
 
V
-
 
N
E
 
E
P
 
L
M
 
M
T
 
D
A
 
V
I
 
V
P
 
L
G
 
H
E
 
H
L
 
V
E
 
P
E
 
E
W
 
A
H
 
K
L
 
L
A
 
-
L
 
V
E
 
E
D
 
C
E
 
I
G
 
G
H
 
Q
R
 
E
L
 
L
R
 
I
Y
 
F
T
 
L
F
 
L
D
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
P
E
 
K
R
 
H
T
 
R
G
 
A
I
 
Y
P
 
A
S
 
S
L
 
L
L
 
F
R
 
R
K
 
E
L
 
L
G
 
E
D
 
E
L
 
T
G
 
G
I
 
L
Q
 
-
F
 
-
K
 
S
D
 
S
L
 
F
D
 
G
T
 
I
S
 
S
K
 
D
S
 
T
S
 
P
L
 
L
E
 
E
D
 
E
I
 
I
F
 
F
V
 
L
D
 
K
L
 
V
V
 
T
E
 
E

Sites not aligning to the query:

7lkzA Structure of atp-bound human abca4 (see paper)
31% identity, 97% coverage: 3:305/313 of query aligns to 707:1024/1920 of 7lkzA

query
sites
7lkzA
P
 
P
I
 
G
L
 
V
S
 
C
V
 
V
R
 
K
G
 
N
V
 
L
S
 
V
K
 
K
T
 
I
Y
x
F
-
 
E
A
 
P
S
 
C
G
 
G
H
 
R
K
 
P
A
|
A
L
 
V
G
 
D
S
 
R
V
 
L
D
 
N
L
 
I
D
 
T
I
 
F
N
 
Y
K
 
E
G
 
N
E
 
Q
I
 
I
F
 
T
A
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
 
T
L
 
T
I
 
L
S
 
S
I
 
I
I
 
L
C
 
T
G
 
G
I
 
L
V
 
L
T
 
P
P
 
P
S
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
T
I
 
V
V
 
L
V
 
V
D
 
G
G
 
G
H
 
R
D
 
D
A
 
I
I
 
E
S
 
T
E
 
S
P
 
L
R
 
D
A
 
A
A
 
V
R
 
R
M
 
Q
K
 
S
I
 
L
G
 
G
L
 
M
V
 
C
P
 
P
Q
|
Q
E
 
H
L
 
N
S
 
I
V
 
L
D
 
F
M
 
H
F
 
H
E
 
L
T
 
T
V
 
V
Q
 
A
A
 
E
T
 
H
T
 
M
R
 
L
Y
 
F
S
 
Y
R
 
A
R
 
Q
L
 
L
F
 
K
G
 
G
R
 
K
P
 
S
A
 
Q
N
 
E
D
 
E
A
 
A
Y
 
Q
I
 
L
D
 
E
Q
 
M
-
 
E
-
 
A
V
 
M
L
 
L
K
 
E
D
 
D
L
 
T
S
 
G
L
 
L
Y
 
H
D
 
H
K
|
K
R
 
R
N
 
N
S
 
E
K
 
E
V
 
A
M
 
Q
E
x
D
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
K
 
Q
R
 
R
R
 
K
V
 
L
L
 
S
I
 
V
A
 
A
K
 
I
A
 
A
L
 
F
A
 
V
H
 
G
E
 
D
P
 
A
D
 
K
I
 
V
L
 
V
F
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
P
S
 
Y
L
 
S
R
 
R
R
 
R
D
 
S
M
 
I
W
 
W
K
 
D
L
 
L
I
 
L
G
 
L
S
 
K
L
 
Y
R
 
R
E
 
S
R
 
-
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
I
I
 
I
L
 
M
T
 
S
T
 
T
H
 
H
Y
 
H
I
 
M
E
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
D
E
 
L
M
 
L
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
I
G
 
A
V
 
I
I
 
I
N
 
A
K
 
Q
G
 
G
E
 
R
L
 
-
L
 
L
L
 
Y
V
 
C
E
 
S
G
 
G
K
 
T
A
 
P
E
 
L
L
 
F
M
 
L
K
 
K
K
 
N
L
 
C
G
 
F
K
 
G
R
 
T
E
 
G
M
 
L
D
 
Y
I
 
L
A
 
T
L
 
L
V
 
V
E
 
R
P
 
K
M
 
M
T
 
K
A
 
Q
I
 
V
-
 
L
P
 
D
G
 
G
E
 
D
L
 
V
E
 
N
E
 
E
W
 
L
-
 
M
-
 
D
-
 
V
-
 
V
-
 
L
-
 
H
H
 
H
L
 
V
A
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
L
L
 
V
E
 
E
D
 
C
E
 
I
G
 
G
H
 
Q
R
 
E
L
 
L
R
 
I
Y
 
F
-
 
L
-
 
L
-
 
P
-
 
N
-
 
K
T
 
N
F
 
F
D
 
K
A
 
H
Q
 
R
A
 
A
E
 
Y
R
 
A
T
 
S
G
 
L
I
 
F
P
 
R
S
 
E
L
 
L
L
 
E
R
 
E
K
 
T
L
 
L
G
 
A
D
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
L
Q
 
-
F
 
-
K
 
S
D
 
S
L
 
F
D
 
G
T
 
I
S
 
S
K
 
D
S
 
T
S
 
P
L
 
L
E
 
E
D
 
E
I
 
I
F
 
F
V
 
L
D
 
K
L
 
V
V
 
T
E
 
E

Sites not aligning to the query:

P78363 Retinal-specific phospholipid-transporting ATPase ABCA4; ATP-binding cassette sub-family A member 4; RIM ABC transporter; RIM proteinv; RmP; Retinal-specific ATP-binding cassette transporter; Stargardt disease protein; EC 7.6.2.1 from Homo sapiens (Human) (see 43 papers)
34% identity, 76% coverage: 3:241/313 of query aligns to 927:1166/2273 of P78363

query
sites
P78363
P
|
P
I
x
G
L
x
V
S
x
C
V
|
V
R
x
K
G
x
N
V
x
L
S
x
V
K
|
K
T
x
I
Y
x
F
-
x
E
A
x
P
S
x
C
G
|
G
H
x
R
K
x
P
A
|
A
L
x
V
G
x
D
S
x
R
V
x
L
D
x
N
L
x
I
D
x
T
I
x
F
N
x
Y
K
x
E
G
x
N
E
x
Q
I
|
I
F
x
T
A
|
A
L
x
F
L
|
L
G
|
G
P
x
H
N
|
N
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
x
T
I
x
L
S
|
S
I
|
I
I
x
L
C
x
T
G
|
G
I
x
L
V
x
L
T
x
P
P
|
P
S
x
T
S
|
S
G
|
G
T
|
T
I
x
V
V
x
L
V
|
V
D
x
G
G
|
G
H
x
R
D
|
D
A
x
I
I
x
E
S
x
T
E
x
S
P
x
L
R
x
D
A
|
A
A
x
V
R
|
R
M
x
Q
K
x
S
I
x
L
G
|
G
L
x
M
V
x
C
P
|
P
Q
|
Q
E
x
H
L
x
N
S
x
I
V
x
L
D
x
F
M
x
H
F
x
H
E
x
L
T
|
T
V
|
V
Q
x
A
A
x
E
T
x
H
T
x
M
R
x
L