SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_2792 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_2792 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2d1yA Crystal structure of tt0321 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
43% identity, 98% coverage: 3:244/246 of query aligns to 3:237/240 of 2d1yA

query
sites
2d1yA
L
 
F
A
 
A
G
 
G
R
 
K
R
 
G
I
 
V
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
E
 
Q
L
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
L
L
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
C
D
|
D
R
x
L
S
x
R
D
 
P
D
 
E
L
 
G
L
 
-
R
 
K
S
 
E
A
 
V
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
S
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
A
A
 
F
V
 
F
L
 
Q
A
x
V
D
|
D
L
|
L
A
 
E
D
 
D
E
 
E
A
 
R
Q
 
E
L
 
R
L
 
V
A
 
R
A
 
F
V
 
V
A
 
E
K
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
Y
A
 
A
M
 
L
G
 
G
G
 
R
I
 
V
D
 
D
G
 
V
I
 
L
V
 
V
N
 
N
G
x
N
A
|
A
G
x
A
I
|
I
A
 
A
G
 
A
S
 
P
Q
 
G
P
 
S
L
 
A
D
 
L
A
 
T
L
 
V
D
 
R
R
 
L
E
 
P
S
 
E
W
 
W
D
 
R
R
 
R
F
 
V
V
 
L
A
 
E
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
T
A
 
A
P
 
P
Y
 
M
L
 
H
I
 
L
C
 
S
R
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
A
P
 
R
H
 
E
L
 
M
Q
 
R
V
 
K
T
 
V
G
 
G
N
 
G
A
 
G
T
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
V
A
 
A
S
|
S
G
 
V
Q
 
Q
A
 
G
L
 
L
L
 
F
P
 
A
N
 
E
A
 
Q
P
 
E
G
x
N
I
 
-
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
A
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
N
F
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
S
L
 
L
G
 
A
A
 
L
E
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
L
R
 
R
I
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
I
 
A
V
x
I
D
 
A
T
|
T
P
 
-
M
 
-
V
 
-
Q
 
E
G
x
A
V
|
V
L
 
L
G
 
E
G
 
A
Y
 
I
A
 
A
R
 
R
P
 
R
D
 
D
D
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
W
V
 
E
Q
 
D
Q
 
L
Y
 
H
A
 
A
M
 
L
K
 
R
R
 
R
V
 
L
A
 
G
R
 
K
P
 
P
S
 
E
E
 
E
L
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
E
 
E
A
 
K
S
 
A
S
 
S
Y
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
I
L
 
L
A
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
M
T
 
T

5t5qC Crystal structure of short-chain dehydrogenase/reductase sdr:glucose/ribitol dehydrogenase from brucella melitensis
39% identity, 98% coverage: 1:242/246 of query aligns to 3:241/245 of 5t5qC

query
sites
5t5qC
M
 
F
K
 
E
L
 
F
A
 
E
G
 
N
R
 
R
R
 
T
I
 
L
L
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
x
N
S
x
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
A
 
H
R
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
N
L
 
L
A
 
V
L
 
L
L
 
T
D
|
D
R
x
L
S
 
D
D
 
R
D
 
E
L
 
G
L
 
L
R
 
D
S
 
A
A
 
F
A
 
A
Q
 
A
A
 
S
S
 
L
G
 
G
G
 
S
T
 
P
A
 
E
V
 
R
L
 
I
A
 
A
D
 
T
L
 
I
-
 
K
-
 
A
-
x
D
-
x
A
-
 
S
-
 
S
A
 
A
D
 
D
E
 
D
A
 
A
Q
 
E
L
 
-
L
 
-
A
 
K
A
 
T
V
 
V
A
 
A
K
 
L
A
 
A
A
 
M
Q
 
E
A
 
R
M
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
D
 
D
G
 
F
I
 
L
V
 
V
N
 
P
G
x
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
Y
G
 
Q
S
 
A
Q
 
K
P
 
P
L
 
F
D
 
A
A
 
E
L
 
M
D
 
S
R
 
D
E
 
A
S
 
D
W
 
W
D
 
H
R
 
R
F
 
T
V
 
I
A
 
S
I
|
I
N
 
N
L
 
L
T
 
D
A
 
G
P
 
V
Y
 
F
L
 
Y
I
 
L
C
 
C
R
 
K
A
 
R
A
 
A
L
 
L
P
 
P
H
 
A
L
 
L
Q
 
K
V
 
-
T
 
-
G
 
E
N
 
D
A
 
S
T
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
T
I
 
L
A
 
A
S
|
S
G
 
-
Q
 
L
A
 
A
L
 
A
L
 
Y
P
 
R
N
 
G
A
 
A
P
 
Y
G
 
V
I
x
N
A
 
A
A
 
H
Y
|
Y
A
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
M
V
 
V
A
 
S
F
 
M
T
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
S
A
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
K
I
 
T
R
 
R
A
 
V
N
 
N
V
 
G
V
 
V
A
 
S
P
|
P
G
 
G
I
 
I
V
x
I
D
 
E
T
|
T
P
 
P
M
|
M
V
 
T
Q
 
S
G
 
E
V
 
L
L
 
L
G
 
K
G
 
-
Y
 
-
A
 
T
R
 
R
P
 
M
D
 
D
D
 
E
A
 
T
P
 
-
F
 
-
V
 
M
Q
 
T
Q
 
Q
Y
 
T
A
 
P
M
 
L
K
 
K
R
 
R
V
 
L
A
 
G
R
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
S
A
 
V
I
 
I
L
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
C
S
 
S
E
 
P
A
 
A
S
 
A
S
 
S
Y
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
E
V
 
T
L
 
I
A
 
Q
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

7xqmB Indel-mutant short chain dehydrogenase bound to sah (see paper)
40% identity, 98% coverage: 3:244/246 of query aligns to 4:243/253 of 7xqmB

query
sites
7xqmB
L
 
F
A
 
A
G
 
G
R
 
K
R
 
G
I
 
V
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
-
A
 
-
S
 
G
G
 
G
I
|
I
G
 
G
R
 
-
A
 
A
T
 
I
A
 
A
E
 
Q
L
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
L
L
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
C
D
|
D
R
x
L
S
x
R
D
 
P
D
 
E
L
 
G
L
 
-
R
 
K
S
 
E
A
 
V
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
S
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
A
A
 
F
V
 
F
L
 
Q
A
x
V
D
 
D
L
|
L
A
 
E
D
 
D
E
 
E
A
 
R
Q
 
E
L
 
R
L
 
V
A
 
R
A
 
F
V
 
V
A
 
E
K
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
Y
A
 
A
M
 
L
G
 
G
G
 
R
I
 
V
D
 
D
G
 
V
I
 
L
V
 
V
N
 
N
G
x
N
A
|
A
G
x
A
I
 
I
A
 
A
G
 
A
S
 
P
Q
 
G
P
 
S
L
 
A
D
 
L
A
 
T
L
 
V
D
 
R
R
 
L
E
 
P
S
 
E
W
 
W
D
 
R
R
 
R
F
 
V
V
 
L
A
 
E
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
T
A
 
A
P
 
P
Y
 
M
L
 
H
I
 
L
C
 
S
R
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
A
P
 
R
H
 
E
L
 
M
Q
 
R
V
 
K
T
 
V
G
 
G
N
 
G
A
 
G
T
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
V
Q
 
Q
A
 
G
L
 
L
L
 
F
P
 
A
N
 
E
A
 
Q
P
 
E
G
 
N
I
 
-
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
A
 
N
A
 
A
T
 
S
K
 
K
A
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
N
F
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
S
L
 
L
G
 
A
A
 
L
E
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
L
R
 
R
I
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
A
V
 
I
D
 
A
T
 
T
P
 
E
M
 
A
V
 
V
Q
 
L
G
 
E
V
 
A
L
 
I
G
 
A
G
 
L
Y
 
S
A
 
P
R
 
D
P
 
P
D
 
E
D
 
R
A
 
T
-
 
R
-
 
R
P
 
D
F
 
W
V
 
E
Q
 
D
Q
 
L
Y
 
H
A
 
A
M
 
L
K
 
R
R
 
R
V
 
L
A
 
G
R
 
K
P
 
P
S
 
E
E
 
E
L
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
E
 
E
A
 
K
S
 
A
S
 
S
Y
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
I
L
 
L
A
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
M
T
 
T

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
36% identity, 96% coverage: 9:244/246 of query aligns to 9:246/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
T
 
V
A
 
A
E
 
H
L
 
S
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
K
L
 
V
A
 
I
L
 
V
L
 
S
D
|
D
R
x
I
S
 
N
D
 
E
D
 
D
L
 
H
L
 
G
R
 
N
S
 
K
A
 
A
A
 
V
Q
 
E
-
 
D
-
 
I
-
 
K
A
 
A
S
 
Q
G
 
G
G
 
G
T
 
E
A
 
A
-
 
S
-
 
F
V
 
V
L
 
K
A
|
A
D
|
D
L
x
T
A
 
S
D
 
N
E
 
P
A
 
E
Q
 
E
L
 
V
L
 
E
A
 
A
A
 
L
V
 
V
A
 
K
K
 
R
A
 
T
A
 
V
Q
 
E
A
 
I
M
 
Y
G
 
G
G
 
R
I
 
L
D
 
D
G
 
I
I
 
A
V
 
C
N
 
N
G
x
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
 
G
G
 
G
S
 
E
Q
 
Q
P
 
A
L
 
L
D
 
A
A
 
G
-
 
D
L
 
Y
D
 
G
R
 
L
E
 
D
S
 
S
W
 
W
D
 
R
R
 
K
F
 
V
V
 
L
A
 
S
I
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
D
A
 
G
P
 
V
Y
 
F
L
 
Y
I
 
G
C
 
C
R
 
K
A
 
Y
A
 
E
L
 
L
P
 
E
H
 
Q
L
 
M
Q
 
E
V
 
K
T
 
N
G
 
G
N
 
G
A
 
G
T
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
M
A
 
A
S
|
S
G
 
I
Q
 
H
A
 
G
L
 
I
L
 
V
P
 
A
N
 
-
A
 
A
P
 
P
G
 
L
I
 
S
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
A
 
T
A
 
S
T
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
N
L
 
I
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
Y
A
 
G
P
 
Q
R
 
K
-
 
N
I
 
I
R
 
R
A
 
C
N
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
G
P
|
P
G
x
A
I
x
Y
V
x
I
D
 
E
T
 
T
P
 
P
M
x
L
V
 
L
Q
 
E
G
 
S
V
 
L
L
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
A
 
T
R
 
K
P
 
E
D
 
M
D
 
K
A
 
E
P
 
A
F
 
L
V
 
I
Q
 
S
Q
 
K
Y
 
H
A
 
P
M
 
M
K
 
G
R
 
R
V
 
L
A
 
G
R
 
K
P
 
P
S
 
E
E
 
E
L
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
L
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
S
S
 
S
E
 
E
A
 
K
S
 
S
S
 
S
Y
 
F
V
 
M
T
 
T
G
 
G
T
 
G
V
 
Y
L
 
Y
A
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
T
 
T

6d9yB Crystal structure of a short chain dehydrogenase/reductase sdr from burkholderia phymatum with partially occupied NAD
39% identity, 99% coverage: 1:243/246 of query aligns to 5:248/251 of 6d9yB

query
sites
6d9yB
M
 
I
K
 
D
L
 
L
A
 
E
G
 
G
R
 
R
R
 
V
I
 
V
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
T
 
V
A
 
A
E
 
Q
L
 
R
F
 
A
A
 
L
R
 
R
E
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
W
D
|
D
R
x
L
S
 
D
D
 
A
D
 
E
L
 
R
L
 
L
-
 
A
-
 
R
-
 
S
-
 
E
R
 
R
S
 
E
A
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
L
S
 
G
G
 
K
G
 
V
T
 
C
A
 
A
V
 
V
L
 
T
A
x
V
D
|
D
L
x
Q
A
 
T
D
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
L
 
I
L
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
G
K
 
K
A
 
T
A
 
L
Q
 
A
A
 
A
M
 
F
G
 
G
G
 
A
I
 
I
D
 
D
G
 
V
I
 
L
V
 
I
N
 
N
G
 
C
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
 
T
G
 
G
S
 
G
Q
 
N
P
 
G
L
 
T
D
 
T
-
 
W
A
 
E
L
 
L
D
 
E
R
 
P
E
 
D
S
 
V
W
 
W
D
 
R
R
 
Q
F
 
V
V
 
I
A
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
I
A
 
G
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
C
 
C
R
 
R
A
 
A
A
 
V
L
 
V
P
 
P
H
 
Q
L
 
M
Q
 
L
V
 
K
T
 
Q
G
 
G
N
 
Y
A
 
G
T
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
-
 
V
-
 
A
G
 
G
Q
 
K
A
 
E
L
 
G
L
 
N
P
 
P
N
 
N
A
 
A
P
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
S
A
 
H
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
T
R
 
K
-
 
N
I
 
I
R
 
L
A
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
T
P
|
P
G
x
A
I
x
A
V
x
A
D
 
K
T
|
T
P
 
E
M
 
I
V
 
F
Q
 
D
G
 
S
V
 
M
L
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
A
 
K
R
 
Q
P
 
E
D
 
H
D
 
I
A
 
D
P
 
Y
F
 
M
V
 
L
Q
 
S
Q
 
K
Y
 
I
A
 
P
M
 
M
K
 
N
R
 
R
V
 
F
A
 
L
R
 
L
P
 
P
S
 
D
E
 
E
L
 
A
A
 
A
E
 
S
A
 
L
I
 
I
L
 
L
F
 
W
L
 
L
S
 
G
S
 
S
E
 
E
A
 
D
S
 
C
S
 
A
Y
 
F
V
 
S
T
 
T
G
 
G
T
 
S
V
 
V
L
 
F
A
 
D
V
 
L
D
 
S
G
 
G
G
 
G
R
 
R

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
32% identity, 99% coverage: 1:244/246 of query aligns to 3:253/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
M
 
M
K
 
N
L
 
L
A
 
T
G
 
D
R
 
K
R
 
T
I
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
T
 
A
A
 
V
E
 
Q
L
 
A
F
 
F
A
 
L
R
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
A
 
N
L
 
V
A
 
V
L
 
V
L
 
A
D
|
D
R
x
I
S
 
D
D
 
E
D
 
A
L
 
Q
L
 
G
R
 
E
S
 
A
A
 
M
A
 
V
Q
 
R
A
 
K
S
 
E
G
 
N
G
 
N
T
 
D
A
 
R
-
 
L
-
 
H
-
 
F
V
 
V
L
 
Q
A
x
T
D
 
D
L
x
I
A
 
T
D
 
D
E
 
E
A
 
A
Q
 
A
L
 
C
L
 
Q
A
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
E
K
 
S
A
 
A
A
 
V
Q
 
H
A
 
T
M
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
L
D
 
D
G
 
V
I
 
L
V
 
I
N
 
N
G
x
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
A
 
E
G
 
I
S
 
V
Q
 
A
P
 
P
L
 
I
D
 
H
A
 
E
L
 
M
D
 
E
R
 
L
E
 
S
S
 
D
W
 
W
D
 
N
R
 
K
F
 
V
V
 
L
A
 
Q
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
T
A
 
G
P
 
M
Y
 
F
L
 
L
I
 
M
C
 
S
R
 
K
A
 
H
A
 
A
L
 
L
P
 
K
H
 
H
L
 
M
Q
 
L
V
 
A
T
 
A
G
 
G
N
 
K
A
 
G
T
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
G
 
V
Q
 
G
A
 
G
L
 
L
L
 
V
P
 
A
N
 
-
A
 
W
P
 
P
G
 
D
I
 
I
A
 
P
A
 
A
Y
|
Y
A
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
L
 
V
V
 
L
A
 
Q
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
M
G
 
A
A
 
V
E
 
D
L
 
Y
A
 
A
P
 
K
-
 
H
R
 
Q
I
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
V
 
C
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
I
|
I
V
x
I
D
 
D
T
 
T
P
 
P
M
 
L
V
 
N
Q
 
E
G
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
K
G
 
S
Y
 
F
A
 
L
R
 
E
P
 
N
D
 
N
D
 
E
A
 
G
P
 
T
F
 
L
V
 
E
Q
 
E
Q
 
I
Y
 
K
A
 
K
M
 
E
K
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
V
-
 
N
-
 
P
-
 
L
-
 
L
R
 
R
V
 
L
A
 
G
R
 
K
P
 
P
S
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
V
I
 
M
L
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
E
 
D
A
 
L
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
V
 
M
T
 
T
G
 
G
T
 
S
V
 
A
L
 
I
A
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
T
 
T

2q2qD Structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from pseudomonas putida (see paper)
38% identity, 98% coverage: 3:242/246 of query aligns to 2:251/255 of 2q2qD

query
sites
2q2qD
L
 
L
A
 
K
G
 
G
R
 
K
R
 
T
I
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
G
T
 
I
A
 
A
E
 
Q
L
 
V
F
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
N
L
 
I
A
 
V
L
 
L
L
 
N
D
 
G
R
x
F
S
 
G
D
 
D
D
 
P
L
 
A
L
 
P
R
 
A
S
 
L
A
 
A
A
 
E
Q
 
I
A
 
A
S
 
R
G
 
H
G
 
G
T
 
V
A
 
K
V
 
A
L
 
V
-
 
H
-
 
H
-
 
P
A
 
A
D
|
D
L
|
L
A
 
S
D
 
D
E
 
V
A
 
A
Q
 
Q
L
 
I
L
 
E
A
 
A
A
 
L
V
 
F
A
 
A
K
 
L
A
 
A
A
 
E
Q
 
R
A
 
E
M
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
I
I
 
L
V
 
V
N
 
N
G
x
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
A
 
Q
G
 
H
S
 
V
Q
 
A
P
 
P
L
 
V
D
 
E
A
 
Q
L
 
F
D
 
P
R
 
L
E
 
E
S
 
S
W
 
W
D
 
D
R
 
K
F
 
I
V
 
I
A
 
A
I
x
L
N
 
N
L
 
L
T
 
S
A
 
A
P
 
V
Y
 
F
L
 
H
I
 
G
C
 
T
R
 
R
A
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
P
H
 
G
L
 
M
Q
 
R
V
 
A
T
 
R
G
 
N
N
 
W
A
 
G
T
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
G
 
V
Q
 
H
A
 
G
L
 
L
L
 
V
P
 
-
N
 
G
A
 
S
P
 
T
G
 
G
I
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
L
 
V
V
 
V
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
V
L
 
V
G
 
G
A
 
L
E
 
E
L
 
T
A
 
A
-
 
T
P
 
S
R
 
N
I
 
V
R
 
T
A
 
C
N
 
N
V
 
A
V
 
I
A
 
C
P
|
P
G
|
G
I
x
W
V
|
V
D
 
L
T
|
T
P
 
P
M
x
L
V
|
V
Q
 
Q
G
 
K
V
 
Q
L
 
I
G
 
D
G
 
D
Y
x
R
A
 
A
R
 
A
P
 
N
D
 
G
D
 
G
A
 
D
P
 
P
F
 
L
V
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
Y
 
H
A
 
D
M
 
L
K
 
L
R
 
A
V
 
E
A
 
K
R
 
Q
P
 
P
S
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
F
-
 
V
-
 
T
-
 
P
-
 
E
E
 
H
L
 
L
A
 
G
E
 
E
A
 
L
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
C
S
 
S
E
 
E
A
 
A
S
 
G
S
 
S
Y
 
Q
V
 
V
T
 
R
G
 
G
T
 
A
V
 
A
L
 
W
A
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3toxA Crystal structure of a short chain dehydrogenase in complex with NAD(p) from sinorhizobium meliloti 1021
39% identity, 98% coverage: 2:242/246 of query aligns to 2:249/254 of 3toxA

query
sites
3toxA
K
 
R
L
 
L
A
 
E
G
 
G
R
 
K
R
 
I
I
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
A
A
 
A
E
 
L
L
 
L
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
K
L
 
V
A
 
V
L
 
V
L
 
T
D
x
A
R
|
R
S
x
N
D
 
G
D
 
N
L
 
A
L
 
L
R
 
A
S
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
D
-
 
E
-
 
I
A
 
A
A
 
G
Q
 
G
A
 
G
S
 
G
G
 
E
G
 
A
T
 
A
A
 
A
V
 
L
L
 
A
A
 
G
D
 
D
L
x
V
A
 
G
D
 
D
E
 
E
A
 
A
Q
 
L
L
 
H
L
 
E
A
 
A
A
 
L
V
 
V
A
 
E
K
 
L
A
 
A
A
 
V
Q
 
R
A
 
R
M
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
L
D
 
D
G
 
T
I
 
A
V
 
F
N
 
N
G
x
N
A
|
A
G
|
G
I
 
A
A
 
L
G
 
G
S
 
A
Q
 
M
-
 
G
P
 
E
L
 
I
D
 
S
A
 
S
L
 
L
D
 
S
R
 
V
E
 
E
S
 
G
W
 
W
D
 
R
R
 
E
F
 
T
V
 
L
A
 
D
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
A
 
S
P
 
A
Y
 
F
L
 
L
I
 
A
C
 
A
R
 
K
A
 
Y
A
 
Q
L
 
V
P
 
P
H
 
A
L
 
I
Q
 
A
V
 
A
T
 
L
G
 
G
N
 
G
A
 
G
T
 
S
I
 
L
V
 
T
N
 
F
I
x
T
A
 
S
S
|
S
G
 
F
Q
 
V
A
 
G
L
 
H
L
 
T
P
 
A
N
 
G
A
 
F
P
 
A
G
 
G
I
x
V
A
 
A
A
 
P
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
F
 
L
T
 
V
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
A
A
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
A
R
 
R
-
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
L
A
 
L
P
|
P
G
 
G
I
x
G
V
x
T
D
 
D
T
|
T
P
 
P
M
 
A
V
 
N
Q
 
F
G
 
A
V
 
N
L
 
L
G
 
P
G
 
G
Y
 
-
A
 
A
R
 
A
P
 
P
D
 
E
D
 
T
A
 
R
P
 
G
F
 
F
V
 
V
Q
 
E
Q
 
G
-
 
L
Y
 
H
A
 
A
M
 
L
K
 
K
R
 
R
V
 
I
A
 
A
R
 
R
P
 
P
S
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
A
L
 
L
F
 
Y
L
 
L
S
 
A
S
 
S
E
 
D
A
 
G
S
 
A
S
 
S
Y
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
A
L
 
L
A
 
L
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

5itvD Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
32% identity, 99% coverage: 1:244/246 of query aligns to 3:225/227 of 5itvD

query
sites
5itvD
M
 
M
K
 
N
L
 
L
A
 
T
G
 
D
R
 
K
R
 
T
I
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
T
 
A
A
 
V
E
 
Q
L
 
A
F
 
F
A
 
L
R
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
A
 
N
L
 
V
A
 
V
L
 
V
L
 
A
D
|
D
R
x
I
S
 
D
D
 
E
D
 
A
L
 
Q
L
 
G
R
 
E
S
 
A
A
 
M
A
 
V
Q
 
R
A
 
K
S
 
E
G
 
N
G
 
N
-
 
D
-
 
R
-
 
L
T
 
H
A
 
F
V
 
V
L
 
Q
A
x
T
D
|
D
L
x
I
A
 
T
D
 
D
E
 
E
A
 
A
Q
 
A
L
 
C
L
 
Q
A
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
E
K
 
S
A
 
A
A
 
V
Q
 
H
A
 
T
M
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
L
D
 
D
G
 
V
I
 
L
V
 
I
N
 
N
G
x
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
E
G
 
I
S
 
V
Q
 
A
P
 
P
L
 
I
D
 
H
A
 
E
L
 
M
D
 
E
R
 
L
E
 
S
S
 
D
W
 
W
D
 
N
R
 
K
F
 
V
V
 
L
A
 
Q
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
T
A
 
G
P
 
M
Y
 
F
L
 
L
I
 
M
C
 
S
R
 
K
A
 
H
A
 
A
L
 
L
P
 
K
H
 
H
L
 
M
Q
 
L
V
 
A
T
 
A
G
 
G
N
 
K
A
 
G
T
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
G
 
V
Q
 
G
A
 
G
L
 
L
L
 
V
P
 
A
N
 
-
A
 
W
P
 
P
G
 
D
I
 
I
A
 
P
A
 
A
Y
|
Y
A
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
L
 
V
V
 
L
A
 
Q
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
M
G
 
A
A
 
V
E
 
D
L
 
Y
A
 
A
P
 
K
-
 
H
R
 
Q
I
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
V
 
C
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
I
 
I
V
x
I
D
 
D
T
 
T
P
 
L
M
 
-
V
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
A
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
-
V
 
-
Q
 
-
Q
 
-
Y
 
-
A
 
-
M
 
-
K
 
-
R
 
R
V
 
L
A
 
G
R
 
K
P
 
P
S
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
V
I
 
M
L
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
E
 
D
A
 
L
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
V
 
M
T
 
T
G
 
G
T
 
S
V
 
A
L
 
I
A
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
T
 
T

A7IQH5 2-(S)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase 3; S-HPCDH 3; 2-[(S)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase 3; Aliphatic epoxide carboxylation component IV; Epoxide carboxylase component IV; SHPCDH3; EC 1.1.1.269 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 2 papers)
40% identity, 89% coverage: 27:244/246 of query aligns to 29:253/255 of A7IQH5

query
sites
A7IQH5
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
K
L
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
I
D
|
D
R
 
L
S
 
D
D
 
Q
D
 
G
L
 
L
L
 
A
-
 
E
R
 
R
S
 
S
A
 
A
A
 
A
Q
 
M
A
 
L
S
 
S
G
 
T
G
 
G
T
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
F
-
 
G
A
 
A
D
|
D
L
x
V
A
 
T
D
 
K
E
 
A
A
 
A
Q
 
D
L
 
I
L
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
T
K
 
S
A
 
A
A
 
E
Q
 
Q
A
 
T
M
 
I
G
 
G
G
 
S
I
 
L
D
 
T
G
 
G
I
 
L
V
 
V
N
 
N
G
x
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
S
 
F
Q
 
G
P
 
S
L
 
V
D
 
H
A
 
D
L
 
A
D
 
D
R
 
A
E
 
A
S
 
A
W
 
W
D
 
D
R
 
R
F
 
I
V
 
M
A
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
V
T
 
T
A
 
G
P
 
T
Y
 
F
L
 
L
I
 
A
C
 
S
R
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
A
H
 
G
L
 
M
Q
 
L
V
 
E
T
 
R
G
 
H
N
 
K
A
 
G
T
 
T
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
F
A
 
G
S
|
S
G
 
-
Q
 
V
A
 
A
L
 
G
L
 
L
P
 
V
N
 
G
A
 
I
P
 
P
G
 
T
I
 
M
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
I
V
 
V
A
 
N
F
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
Q
L
 
M
G
 
A
A
 
A
E
 
D
L
 
Y
A
 
S
P
 
G
R
 
R
-
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
C
P
 
P
G
 
G
I
x
T
V
|
V
-
x
T
D
x
S
T
|
T
P
x
G
M
 
M
V
 
G
Q
 
Q
G
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
-
Y
 
-
A
 
-
R
 
-
P
 
S
D
 
D
D
 
T
A
 
S
P
 
P
F
 
E
V
 
V
Q
 
Q
-
 
A
-
 
R
-
x
R
-
 
L
-
 
A
Q
x
K
Y
|
Y
A
 
P
M
 
I
K
 
G
R
 
R
V
 
F
A
 
G
R
 
T
P
 
P
S
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
V
L
 
I
F
 
F
L
 
L
S
 
L
S
 
S
E
 
D
A
 
Q
S
 
A
S
 
A
Y
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
A
L
 
F
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
M
T
 
T

Sites not aligning to the query:

4ituA Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) bound to s-hpc and nadh (see paper)
40% identity, 89% coverage: 27:244/246 of query aligns to 27:251/253 of 4ituA

query
sites
4ituA
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
K
L
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
I
D
|
D
R
x
L
S
 
D
D
 
Q
D
 
G
L
 
L
L
 
A
-
 
E
R
 
R
S
 
S
A
 
A
A
 
A
Q
 
M
A
 
L
S
 
S
G
 
T
G
 
G
T
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
F
-
 
G
A
 
A
D
|
D
L
x
V
A
 
T
D
 
K
E
 
A
A
 
A
Q
 
D
L
 
I
L
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
T
K
 
S
A
 
A
A
 
E
Q
 
Q
A
 
T
M
 
I
G
 
G
G
 
S
I
 
L
D
 
T
G
 
G
I
 
L
V
 
V
N
 
N
G
x
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
S
 
F
Q
 
G
P
 
S
L
 
V
D
 
H
A
 
D
L
 
A
D
 
D
R
 
A
E
 
A
S
 
A
W
 
W
D
 
D
R
 
R
F
 
I
V
 
M
A
 
A
I
x
V
N
|
N
L
 
V
T
 
T
A
 
G
P
 
T
Y
 
F
L
 
L
I
 
A
C
 
S
R
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
A
H
 
G
L
 
M
Q
 
L
V
 
E
T
 
R
G
 
H
N
 
K
A
 
G
T
 
T
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
F
A
 
G
S
|
S
G
 
-
Q
 
V
A
 
A
L
 
G
L
 
L
P
 
V
N
 
G
A
 
I
P
 
P
G
 
T
I
 
M
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
I
V
 
V
A
 
N
F
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
Q
L
 
M
G
 
A
A
 
A
E
 
D
L
 
Y
A
 
S
P
 
G
R
 
R
-
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
 
G
I
x
T
V
|
V
-
 
T
D
 
S
T
|
T
P
 
G
M
|
M
V
 
G
Q
 
Q
G
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
-
Y
 
-
A
 
-
R
 
-
P
 
S
D
 
D
D
 
T
A
 
S
P
 
P
F
 
E
V
 
V
Q
 
Q
-
 
A
-
 
R
-
x
R
-
 
L
-
 
A
Q
 
K
Y
|
Y
A
 
P
M
 
I
K
 
G
R
 
R
V
 
F
A
 
G
R
 
T
P
 
P
S
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
V
L
 
I
F
 
F
L
 
L
S
 
L
S
 
S
E
 
D
A
 
Q
S
 
A
S
 
A
Y
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
A
L
 
F
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
M
T
 
T

Sites not aligning to the query:

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
34% identity, 98% coverage: 2:242/246 of query aligns to 4:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
K
 
R
L
 
L
A
 
Q
G
 
D
R
 
K
R
 
V
I
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
T
 
A
A
 
A
E
 
R
L
 
V
F
 
F
A
 
M
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
K
L
 
V
A
 
V
L
 
I
L
 
A
D
|
D
R
x
F
S
 
N
D
 
E
D
 
A
L
 
A
L
 
G
R
 
K
S
 
E
A
 
A
A
 
V
Q
 
E
A
 
A
S
 
N
G
 
P
G
 
G
T
 
V
A
 
V
V
 
F
L
 
I
-
 
R
A
x
V
D
|
D
L
x
V
A
 
S
D
 
D
E
 
R
A
 
E
Q
 
S
L
 
V
L
 
H
A
 
R
A
 
L
V
 
V
A
 
E
K
 
N
A
 
V
A
 
A
Q
 
E
A
 
R
M
 
F
G
 
G
G
 
K
I
 
I
D
 
D
G
 
I
I
 
L
V
 
I
N
 
N
G
x
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
A
 
T
G
 
R
S
x
D
Q
 
S
P
 
M
L
 
L
D
 
S
A
x
K
L
 
M
D
 
T
R
 
V
E
 
D
S
 
Q
W
 
F
D
 
Q
R
 
Q
F
 
V
V
 
I
A
 
N
I
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
A
 
G
P
 
V
Y
 
F
L
 
H
I
 
C
C
 
T
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
L
P
 
P
H
 
Y
L
 
M
Q
 
A
V
 
E
T
 
Q
G
 
G
N
 
K
A
 
G
T
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
S
S
|
S
G
 
V
Q
 
T
A
 
G
L
 
T
L
 
Y
P
 
G
N
|
N
A
x
V
P
 
-
G
 
G
I
x
Q
A
 
T
A
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
G
F
 
M
T
 
T
K
 
K
A
 
T
L
 
W
G
 
A
A
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
R
R
 
K
-
 
G
I
 
I
R
 
N
A
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
I
x
F
V
x
T
D
 
E
T
|
T
P
 
A
M
|
M
V
 
V
Q
 
A
G
 
E
V
 
V
L
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
A
 
-
R
 
-
P
 
P
D
 
E
D
 
K
A
 
V
-
 
I
-
 
E
P
x
K
F
 
M
V
 
K
Q
 
A
Q
 
Q
Y
 
V
A
 
P
M
 
M
K
 
G
R
 
R
V
 
L
A
 
G
R
 
K
P
 
P
S
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
A
I
 
Y
L
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
E
 
H
A
 
E
S
 
S
S
 
D
Y
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
G
T
 
H
V
 
V
L
 
L
A
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

2cfcA Structural basis for stereo selectivity in the (r)- and (s)-hydroxypropylethane thiosulfonate dehydrogenases (see paper)
35% identity, 97% coverage: 6:244/246 of query aligns to 3:248/250 of 2cfcA

query
sites
2cfcA
R
 
R
R
 
V
I
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
S
S
|
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
R
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
A
E
 
T
L
 
R
F
 
F
A
 
L
R
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
D
A
 
R
L
 
V
A
 
A
L
 
A
L
 
L
D
|
D
R
x
L
S
 
S
D
 
A
D
 
E
L
 
T
L
 
L
R
 
E
S
 
E
A
 
T
A
 
A
Q
 
R
-
 
T
-
 
H
-
 
W
-
 
H
-
 
A
-
 
Y
A
 
A
S
 
D
G
 
K
G
 
V
T
 
L
A
 
R
V
 
V
L
 
R
A
|
A
D
|
D
L
x
V
A
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
G
Q
 
D
L
 
V
L
 
N
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
A
A
 
T
A
 
M
Q
 
E
A
 
Q
M
 
F
G
 
G
G
 
A
I
 
I
D
 
D
G
 
V
I
 
L
V
 
V
N
 
N
G
x
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
A
 
T
G
 
G
S
 
N
Q
 
S
P
 
E
L
 
A
D
 
G
A
 
V
L
 
L
D
 
H
R
 
T
-
 
T
-
 
P
-
 
V
E
 
E
S
 
Q
W
 
F
D
 
D
R
 
K
F
 
V
V
 
M
A
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
V
T
 
R
A
 
G
P
 
I
Y
 
F
L
 
L
I
 
G
C
 
C
R
 
R
A
 
A
A
 
V
L
 
L
P
 
P
H
 
H
L
 
M
Q
 
L
V
 
L
T
 
Q
G
 
G
N
 
A
A
 
G
T
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
G
 
V
Q
 
A
A
 
S
L
 
L
L
 
V
P
 
A
N
 
-
A
x
F
P
 
P
G
 
G
I
x
R
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
A
 
T
A
 
T
T
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
V
V
 
L
A
 
Q
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
V
G
 
A
A
 
V
E
 
D
L
 
Y
A
 
A
P
 
G
R
 
S
-
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
C
N
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
I
x
M
V
x
I
D
 
E
T
|
T
P
|
P
M
|
M
V
x
T
Q
 
Q
G
x
W
V
x
R
L
 
L
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
A
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
D
A
 
Q
P
 
P
F
 
E
V
 
L
Q
 
R
Q
 
D
Y
 
Q
A
 
V
M
 
L
K
 
A
R
 
R
V
 
I
A
 
P
R
 
Q
P
 
K
-
 
E
-
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
S
 
A
E
 
Q
L
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
M
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
G
E
 
E
A
 
D
S
 
A
S
 
T
Y
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
G
T
 
A
V
 
A
L
 
L
A
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
R
 
Y
T
 
T

Q56840 2-(R)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase; R-HPCDH; 2-[(R)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase; Aliphatic epoxide carboxylation component III; Epoxide carboxylase component III; RHPCDH1; EC 1.1.1.268 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 4 papers)
35% identity, 97% coverage: 6:244/246 of query aligns to 3:248/250 of Q56840

query
sites
Q56840
R
 
R
R
 
V
I
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
S
|
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
R
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
A
E
 
T
L
 
R
F
 
F
A
 
L
R
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
D
A
 
R
L
 
V
A
 
A
L
 
A
L
 
L
D
|
D
R
 
L
S
 
S
D
 
A
D
 
E
L
 
T
L
 
L
R
 
E
S
 
E
A
 
T
A
 
A
Q
 
R
-
 
T
-
 
H
-
 
W
-
 
H
-
 
A
-
 
Y
A
 
A
S
 
D
G
 
K
G
 
V
T
 
L
A
 
R
V
 
V
L
 
R
A
 
A
D
|
D
L
x
V
A
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
G
Q
 
D
L
 
V
L
 
N
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
A
A
 
T
A
 
M
Q
 
E
A
 
Q
M
 
F
G
 
G
G
 
A
I
 
I
D
 
D
G
 
V
I
 
L
V
 
V
N
 
N
G
x
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
T
G
 
G
S
 
N
Q
 
S
P
 
E
L
 
A
D
 
G
A
 
V
L
 
L
D
 
H
R
 
T
-
 
T
-
 
P
-
 
V
E
 
E
S
 
Q
W
 
F
D
 
D
R
 
K
F
 
V
V
 
M
A
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
V
T
 
R
A
 
G
P
 
I
Y
 
F
L
 
L
I
 
G
C
 
C
R
 
R
A
 
A
A
 
V
L
 
L
P
 
P
H
 
H
L
 
M
Q
 
L
V
 
L
T
 
Q
G
 
G
N
 
A
A
 
G
T
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
G
 
V
Q
 
A
A
 
S
L
 
L
L
 
V
P
 
A
N
 
-
A
 
F
P
 
P
G
 
G
I
x
R
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
A
 
T
A
 
T
T
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
V
V
 
L
A
 
Q
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
V
G
 
A
A
 
V
E
 
D
L
 
Y
A
 
A
P
 
G
R
 
S
-
 
G
I
 
I
R
|
R
A
 
C
N
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
C
P
 
P
G
 
G
I
 
M
V
x
I
D
x
E
T
|
T
P
|
P
M
|
M
V
 
T
Q
 
Q
G
x
W
V
x
R
L
 
L
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
A
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
D
A
 
Q
P
 
P
F
 
E
V
 
L
Q
x
R
Q
 
D
Y
 
Q
A
 
V
M
 
L
K
 
A
R
|
R
V
 
I
A
 
P
R
 
Q
P
 
K
-
 
E
-
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
S
 
A
E
 
Q
L
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
M
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
G
E
 
E
A
 
D
S
 
A
S
 
T
Y
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
G
T
 
A
V
 
A
L
 
L
A
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
R
 
Y
T
 
T

Sites not aligning to the query:

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
37% identity, 98% coverage: 2:242/246 of query aligns to 7:249/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
K
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
K
R
 
V
I
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
|
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
G
E
 
R
L
 
R
F
 
L
A
 
R
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
T
L
 
V
A
 
V
L
 
V
L
 
G
D
|
D
R
x
I
S
 
D
D
 
P
D
 
T
L
 
T
L
 
G
R
 
K
S
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
A
 
E
S
 
L
G
 
E
G
 
G
T
 
L
A
 
F
V
 
V
L
 
P
A
x
V
D
|
D
L
x
V
A
 
S
D
 
E
E
 
Q
A
 
E
Q
 
A
L
 
V
L
 
D
A
 
N
A
 
L
V
 
F
A
 
D
K
 
T
A
 
A
A
 
A
Q
 
S
A
 
T
M
 
F
G
 
G
G
 
R
I
 
V
D
 
D
G
 
I
I
 
A
V
 
F
N
 
N
G
x
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
-
G
 
-
S
 
S
Q
 
P
P
 
P
L
 
E
D
 
D
A
 
D
L
 
L
-
 
I
-
 
E
-
 
N
-
 
T
D
 
D
R
 
L
E
 
P
S
 
A
W
 
W
D
 
Q
R
 
R
F
 
V
V
 
Q
A
 
D
I
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
K
A
 
S
P
 
V
Y
 
Y
L
 
L
I
 
S
C
 
C
R
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
R
H
 
H
L
 
M
Q
 
V
V
 
P
T
 
A
G
 
G
N
 
K
A
 
G
T
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
G
 
F
Q
 
V
A
 
A
L
 
V
L
 
M
P
 
G
N
 
S
A
 
A
P
 
T
G
 
S
I
x
Q
A
 
I
A
 
S
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
L
 
V
V
 
L
A
 
A
F
 
M
T
 
S
K
 
R
A
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
V
E
 
Q
L
 
Y
A
 
A
P
 
R
R
 
Q
-
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
L
A
 
C
P
|
P
G
 
G
I
x
P
V
|
V
D
 
N
T
 
T
P
 
P
M
 
L
V
 
L
Q
 
Q
G
 
E
V
 
L
L
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
F
A
 
A
R
 
K
P
 
D
D
 
P
D
 
E
-
 
R
-
 
A
A
 
A
P
 
R
F
 
R
V
 
L
Q
 
V
Q
 
H
Y
 
I
A
 
P
M
 
L
K
 
G
R
 
R
V
 
F
A
 
A
R
 
E
P
 
P
S
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
A
A
 
A
I
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
E
 
D
A
 
D
S
 
A
S
 
S
Y
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
V
 
T
L
 
F
A
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1iy8A Crystal structure of levodione reductase (see paper)
36% identity, 99% coverage: 2:244/246 of query aligns to 1:255/258 of 1iy8A

query
sites
1iy8A
K
 
R
L
 
F
A
 
T
G
 
D
R
 
R
R
 
V
I
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
G
S
|
S
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
T
A
 
A
E
 
V
L
 
R
F
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
K
L
 
L
A
 
S
L
 
L
L
 
V
D
|
D
R
x
V
S
 
S
D
 
S
D
 
E
L
 
G
L
 
L
R
 
E
S
 
A
A
 
S
A
 
K
Q
 
A
A
 
A
S
 
V
G
 
L
G
 
E
T
 
T
A
 
A
-
 
P
-
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
L
-
 
T
V
 
T
L
 
V
A
|
A
D
|
D
L
x
V
A
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
L
 
V
L
 
E
A
 
A
A
 
Y
V
 
V
A
 
T
K
 
A
A
 
T
A
 
T
Q
 
E
A
 
R
M
 
F
G
 
G
G
 
R
I
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
F
V
 
F
N
 
N
G
x
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
A
 
E
G
 
G
S
 
K
Q
 
Q
-
 
N
P
 
P
L
 
T
D
 
E
A
 
S
L
 
F
D
 
T
R
 
A
E
 
A
S
 
E
W
 
F
D
 
D
R
 
K
F
 
V
V
 
V
A
 
S
I
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
R
A
 
G
P
 
V
Y
 
F
L
 
L
I
 
G
C
 
L
R
 
E
A
 
K
A
 
V
L
 
L
P
 
K
H
 
I
L
 
M
Q
 
R
V
 
E
T
 
Q
G
 
G
N
 
S
A
 
G
T
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
-
 
V
-
 
G
G
 
G
Q
 
I
A
 
R
L
 
G
L
 
I
P
 
G
N
 
N
A
x
Q
P
 
S
G
 
G
I
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
L
 
V
V
 
V
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
N
L
 
S
G
 
A
A
 
V
E
 
E
L
 
Y
A
 
G
P
 
R
R
 
Y
-
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
I
N
 
N
V
 
A
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
I
 
A
V
 
I
D
 
W
T
|
T
P
|
P
M
|
M
V
 
V
Q
 
E
G
 
N
V
 
S
L
 
M
G
 
K
G
 
Q
Y
 
L
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
N
A
 
P
R
 
R
P
 
K
D
 
A
D
 
A
A
 
E
P
 
E
F
 
F
V
 
I
Q
 
Q
Q
 
V
Y
 
N
A
 
P
M
 
S
K
 
K
R
 
R
V
 
Y
A
 
G
R
 
E
P
 
A
S
 
P
E
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
A
A
 
V
I
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
L
S
 
S
E
 
D
A
 
D
S
 
A
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
A
T
 
T
V
 
V
L
 
V
A
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
T
 
S

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
36% identity, 99% coverage: 2:244/246 of query aligns to 10:264/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
K
 
R
L
 
F
A
 
T
G
 
D
R
 
R
R
 
V
I
 
V
L
|
L
I
|
I
T
|
T
G
|
G
A
x
G
A
x
G
S
|
S
G
|
G
I
x
L
G
|
G
R
|
R
A
|
A
T
|
T
A
|
A
E
x
V
L
x
R
F
x
L
A
|
A
R
x
A
E
|
E
G
|
G
A
|
A
A
x
K
L
|
L
A
x
S
L
|
L
L
 
V
D
 
D
R
 
V
S
 
S
D
 
S
D
 
E
L
 
G
L
 
L
R
 
E
S
 
A
A
 
S
A
 
K
Q
 
A
A
 
A
S
 
V
G
 
L
G
 
E
T
 
T
A
 
A
-
 
P
-
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
L
-
 
T
V
 
T
L
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
V
A
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
L
 
V
L
 
E
A
 
A
A
 
Y
V
 
V
A
 
T
K
 
A
A
 
T
A
 
T
Q
 
E
A
 
R
M
 
F
G
 
G
G
 
R
I
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
F
V
 
F
N
 
N
G
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
x
E
G
 
G
S
 
K
Q
 
Q
-
 
N
P
 
P
L
 
T
D
 
E
A
 
S
L
 
F
D
 
T
R
 
A
E
 
A
S
 
E
W
 
F
D
 
D
R
 
K
F
 
V
V
 
V
A
 
S
I
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
R
A
 
G
P
 
V
Y
 
F
L
 
L
I
 
G
C
 
L
R
 
E
A
 
K
A
 
V
L
 
L
P
 
K
H
 
I
L
 
M
Q
 
R
V
 
E
T
 
Q
G
 
G
N
 
S
A
 
G
T
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
I
 
T
A
 
A
S
 
S
-
 
V
-
 
G
G
 
G
Q
 
I
A
 
R
L
 
G
L
 
I
P
 
G
N
 
N
A
 
Q
P
 
S
G
 
G
I
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
A
K
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
V
V
 
V
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
N
L
 
S
G
 
A
A
 
V
E
 
E
L
 
Y
A
 
G
P
 
R
R
 
Y
-
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
I
N
 
N
V
 
A
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
A
V
 
I
D
 
W
T
 
T
P
 
P
M
 
M
V
 
V
Q
 
E
G
 
N
V
 
S
L
 
M
G
 
K
G
 
Q
Y
 
L
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
N
A
 
P
R
 
R
P
 
K
D
 
A
D
 
A
A
 
E
P
 
E
F
 
F
V
 
I
Q
 
Q
Q
 
V
Y
 
N
A
 
P
M
 
S
K
 
K
R
 
R
V
 
Y
A
 
G
R
 
E
P
 
A
S
 
P
E
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
A
A
 
V
I
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
L
S
 
S
E
 
D
A
 
D
S
 
A
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
A
T
 
T
V
 
V
L
 
V
A
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
T
 
S

7krmC Putative fabg bound to nadh from acinetobacter baumannii
36% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 1:244/244 of 7krmC

query
sites
7krmC
M
 
M
K
 
L
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
R
 
K
R
 
V
I
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
|
S
-
 
E
-
 
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
T
A
 
A
E
 
E
L
 
I
F
 
F
A
 
A
R
 
Q
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
K
L
 
V
A
 
I
L
 
I
L
 
V
D
|
D
R
x
L
S
 
D
D
 
L
D
 
A
L
 
Q
L
 
S
R
 
Q
S
 
N
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
-
 
L
-
 
G
S
 
E
G
 
G
G
 
H
T
 
M
A
 
G
V
 
L
L
 
A
A
|
A
D
x
N
L
x
V
A
 
A
D
 
N
E
 
E
A
 
E
Q
 
Q
L
 
V
L
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
E
K
 
Q
A
 
A
A
 
L
Q
 
Q
A
 
H
M
 
Y
G
 
G
G
 
K
I
 
I
D
 
D
G
 
I
I
 
L
V
 
I
N
 
N
G
x
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
-
G
 
-
S
 
T
Q
 
Q
P
 
P
L
 
I
D
 
K
A
 
T
L
 
L
D
 
D
-
 
I
-
 
Q
R
 
R
E
 
S
S
 
D
W
 
Y
D
 
D
R
 
R
F
 
V
V
 
L
A
 
D
I
x
V
N
 
S
L
 
L
T
 
R
A
 
G
P
 
T
Y
 
L
L
 
I
I
 
M
C
 
S
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
I
P
 
P
H
 
S
L
 
M
Q
 
K
V
 
A
T
 
N
G
 
G
N
 
G
A
 
G
T
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
C
I
 
L
A
 
S
S
|
S
G
 
V
Q
 
S
A
 
A
L
 
-
L
 
-
P
 
Q
N
 
R
A
 
G
P
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
F
A
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
H
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
L
A
 
G
F
 
L
T
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
M
G
 
A
A
 
R
E
 
E
L
 
F
-
 
G
A
 
G
P
 
D
R
 
Q
I
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
V
 
S
V
 
L
A
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
L
V
x
I
D
 
Q
T
|
T
P
 
D
M
 
M
V
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
A
 
-
R
 
-
P
 
N
D
 
D
D
 
D
-
 
R
-
 
R
A
 
H
P
 
D
F
 
I
V
 
L
Q
 
A
Q
 
G
Y
 
I
A
 
P
M
 
L
K
 
G
R
 
R
V
 
L
A
 
G
R
 
K
P
 
A
S
 
Q
E
 
D
L
 
V
A
 
A
E
 
N
A
 
A
I
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
E
 
D
A
 
L
S
 
S
S
 
A
Y
 
Y
V
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
V
V
 
T
L
 
L
A
 
D
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
M
T
 
L
F
 
I
H
 
H

5jydB Crystal structure of a putative short chain dehydrogenase from burkholderia cenocepacia
39% identity, 98% coverage: 2:242/246 of query aligns to 44:288/292 of 5jydB

query
sites
5jydB
K
 
R
L
 
L
A
 
V
G
 
G
R
 
R
R
 
K
I
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
D
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
A
A
 
A
E
 
I
L
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
D
L
 
V
A
 
A
L
 
I
-
 
G
-
 
Y
-
x
L
-
 
P
L
 
V
D
x
E
R
 
E
S
 
S
D
 
D
-
 
A
-
 
R
-
 
E
-
 
V
-
 
V
D
 
A
L
 
L
L
 
I
R
 
R
S
 
A
A
 
A
A
 
G
Q
 
R
A
 
Q
S
 
A
G
 
-
G
 
-
T
 
V
A
 
A
V
 
L
L
 
P
A
 
G
D
|
D
L
x
I
A
 
R
D
 
D
E
 
E
A
 
T
Q
 
F
L
 
C
L
 
Q
A
 
R
A
 
L
V
 
V
A
 
A
K
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
M
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
L
D
 
D
G
 
I
I
 
L
V
 
V
N
 
N
G
x
N
A
|
A
G
 
-
I
 
-
A
|
A
G
 
R
S
 
Q
Q
 
Q
P
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
S
L
 
I
D
 
G
R
 
E
-
 
M
-
 
T
-
 
T
E
 
E
S
 
H
W
 
F
D
 
D
R
 
A
F
 
T
V
 
V
A
 
K
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
Y
A
 
G
P
 
M
Y
 
F
L
 
W
I
 
I
C
 
T
R
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
I
P
 
P
H
 
H
L
 
L
Q
 
P
V
 
P
T
 
-
G
 
-
N
 
G
A
 
A
T
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
T
S
|
S
G
 
V
Q
 
Q
A
 
A
L
 
V
L
 
R
P
 
A
N
 
S
A
 
A
P
 
-
G
 
N
I
x
L
A
 
L
A
 
D
Y
|
Y
A
 
A
A
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
I
V
 
I
A
 
A
F
 
F
T
 
T
K
 
R
A
 
S
L
 
L
G
 
A
A
 
K
E
 
Q
L
 
L
A
 
G
P
 
P
R
 
R
-
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
I
x
P
V
x
Y
D
 
W
T
|
T
P
 
P
M
x
L
V
x
Q
Q
 
S
G
 
S
V
 
-
L
 
-
G
 
G
G
 
G
Y
 
Q
A
 
P
R
x
P
P
 
E
D
 
T
D
 
V
A
 
V
P
 
N
F
 
Y
V
 
A
Q
 
A
Q
 
G
Y
 
S
A
 
P
M
 
Y
K
 
G
R
 
R
V
 
P
A
 
G
R
 
Q
P
 
P
S
 
A
E
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
P
A
 
L
I
 
Y
L
 
V
F
 
A
L
 
L
S
 
A
S
 
A
E
 
S
A
 
E
S
 
T
S
 
S
Y
 
Y
V
 
A
T
 
N
G
 
G
T
 
Q
V
 
V
L
 
W
A
 
G
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4gh5A Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) (see paper)
40% identity, 89% coverage: 27:244/246 of query aligns to 27:246/248 of 4gh5A

query
sites
4gh5A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
K
L
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
I
D
|
D
R
x
L
S
 
D
D
 
Q
D
 
G
L
 
L
L
 
A
-
 
E
R
 
R
S
 
S
A
 
A
A
 
A
Q
 
M
A
 
L
S
 
S
G
 
T
G
 
G
T
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
F
-
 
G
A
|
A
D
|
D
L
x
V
A
 
T
D
 
K
E
 
A
A
 
A
Q
 
D
L
 
I
L
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
T
K
 
S
A
 
A
A
 
E
Q
 
Q
A
 
T
M
 
I
G
 
G
G
 
S
I
 
L
D
 
T
G
 
G
I
 
L
V
 
V
N
 
N
G
x
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
S
 
F
Q
 
G
P
 
S
L
 
V
D
 
H
A
 
D
L
 
A
D
 
D
R
 
A
E
 
A
S
 
A
W
 
W
D
 
D
R
 
R
F
 
I
V
 
M
A
 
A
I
x
V
N
|
N
L
 
V
T
 
T
A
 
G
P
 
T
Y
 
F
L
 
L
I
 
A
C
 
S
R
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
A
H
 
G
L
 
M
Q
 
L
V
 
E
T
 
R
G
 
H
N
 
K
A
 
G
T
 
T
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
F
A
 
G
S
|
S
G
 
-
Q
 
V
A
 
A
L
 
G
L
 
L
P
 
V
N
 
G
A
 
I
P
 
P
G
 
T
I
 
M
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
I
V
 
V
A
 
N
F
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
Q
L
 
M
G
 
A
A
 
A
E
 
D
L
 
Y
A
 
S
P
 
G
R
 
R
-
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
 
G
I
 
T
V
|
V
-
 
T
D
 
S
T
|
T
P
x
G
M
|
M
V
 
G
Q
 
Q
G
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
A
 
-
R
 
-
P
 
P
D
 
E
-
 
V
D
 
Q
A
 
A
P
 
R
F
 
R
V
 
L
Q
 
A
Q
 
K
Y
 
Y
A
 
P
M
 
I
K
 
G
R
 
R
V
 
F
A
 
G
R
 
T
P
 
P
S
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
V
L
 
I
F
 
F
L
 
L
S
 
L
S
 
S
E
 
D
A
 
Q
S
 
A
S
 
A
Y
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
A
L
 
F
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
M
T
 
T

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Ga0059261_2792 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_2792
MKLAGRRILITGAASGIGRATAELFAREGAALALLDRSDDLLRSAAQASGGTAVLADLAD
EAQLLAAVAKAAQAMGGIDGIVNGAGIAGSQPLDALDRESWDRFVAINLTAPYLICRAAL
PHLQVTGNATIVNIASGQALLPNAPGIAAYAATKAGLVAFTKALGAELAPRIRANVVAPG
IVDTPMVQGVLGGYARPDDAPFVQQYAMKRVARPSELAEAILFLSSEASSYVTGTVLAVD
GGRTFH

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory