SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_2827 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_2827 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6iunB Crystal structure of enoyl-coa hydratase (ech) from ralstonia eutropha h16 in complex with NAD
44% identity, 97% coverage: 12:675/683 of query aligns to 6:687/692 of 6iunB

query
sites
6iunB
V
 
V
E
 
Q
D
 
D
G
 
G
V
 
V
A
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
T
L
 
L
D
 
D
F
 
N
P
 
P
P
 
P
V
 
V
N
 
N
A
 
G
M
 
L
S
 
G
P
 
H
A
 
S
L
 
T
M
 
R
D
 
L
G
 
G
L
 
I
Y
 
V
D
 
E
A
 
G
L
 
M
M
 
T
A
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
D
D
 
D
D
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
I
I
 
T
C
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
K
T
 
A
F
 
F
I
 
S
A
 
G
G
 
G
A
|
A
D
 
D
L
 
I
K
 
R
S
 
E
L
x
F
G
 
N
-
 
T
-
 
P
K
 
K
V
 
A
Q
 
M
P
 
Q
K
x
E
V
 
P
D
 
T
F
 
L
F
x
H
A
 
S
L
 
V
Q
 
I
D
 
R
S
 
V
I
 
L
E
 
E
N
 
G
S
 
S
P
 
S
K
 
K
P
 
P
T
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
V
H
 
H
G
 
S
T
 
V
A
 
A
L
 
M
G
 
G
G
|
G
G
 
G
M
 
L
E
|
E
T
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
G
F
 
C
H
 
N
Y
 
Y
R
 
R
I
 
V
A
 
A
V
 
S
P
 
K
S
 
G
A
 
A
R
 
Q
M
 
I
G
 
A
L
 
L
P
 
P
E
|
E
V
 
V
N
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
|
G
G
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
T
 
I
G
 
G
A
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
A
D
 
N
L
 
M
L
 
I
I
 
V
S
 
S
G
 
G
R
 
T
Q
 
P
V
 
V
G
 
L
A
 
S
K
 
E
E
 
K
A
 
F
L
 
A
T
 
G
I
 
T
G
 
K
L
 
L
I
 
F
D
 
D
R
 
E
L
 
I
A
 
V
A
 
-
E
 
D
G
 
G
A
 
D
L
 
V
R
 
L
E
 
P
D
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
K
F
 
F
A
 
A
K
 
Q
E
 
N
L
 
V
V
 
G
D
 
A
A
 
A
G
 
T
E
 
G
P
 
P
P
 
H
K
 
P
R
 
K
I
 
V
R
 
R
D
 
D
C
 
L
E
 
-
A
 
-
K
 
K
V
 
V
A
 
R
A
 
H
D
 
E
R
 
N
K
 
P
D
 
E
A
 
G
N
 
Y
L
 
L
-
 
G
F
 
F
E
 
A
R
 
R
F
 
-
R
 
-
T
 
N
S
 
T
H
 
V
A
 
A
K
 
A
Q
 
M
L
 
A
N
 
K
G
 
N
L
 
F
D
 
P
A
 
A
P
 
P
Q
 
-
A
 
-
I
 
-
V
 
L
R
 
K
C
 
C
V
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
-
V
 
V
A
 
A
G
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
K
P
 
P
W
 
F
E
 
E
K
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
x
K
I
 
Q
E
 
E
R
 
R
T
 
E
E
 
G
F
 
F
Q
 
L
T
 
Y
L
 
L
L
 
V
A
 
T
G
 
T
P
 
P
Q
 
E
S
 
S
A
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
R
H
 
H
V
 
A
F
 
F
M
 
F
A
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
S
K
 
K
I
 
I
P
 
P
G
 
D
L
 
V
R
 
P
A
 
E
D
 
G
L
 
T
P
 
P
L
 
T
I
 
R
P
 
K
V
 
I
T
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
A
I
 
V
V
x
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
T
|
T
M
|
M
G
 
G
S
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
S
M
 
M
A
 
N
F
 
F
L
 
L
A
 
N
A
 
A
G
 
G
F
 
I
A
 
P
V
 
V
T
 
T
V
 
I
V
 
L
E
|
E
T
|
T
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
D
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
G
H
 
I
I
 
I
T
 
R
A
 
K
T
 
N
L
 
Y
Q
 
E
S
 
N
R
 
S
V
 
A
E
 
K
R
 
K
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
T
A
 
Q
D
 
E
K
 
K
A
 
V
E
 
E
A
 
Q
Q
 
R
I
 
M
A
 
G
A
 
L
L
 
L
T
 
S
P
 
T
T
 
T
L
 
L
D
 
S
L
x
Y
S
 
D
A
 
D
L
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
I
V
 
I
E
 
E
A
|
A
I
x
V
F
|
F
E
|
E
N
 
E
L
 
M
A
 
G
A
x
V
K
 
K
Q
 
E
A
 
T
L
x
V
F
 
F
G
 
K
T
 
K
L
 
L
S
 
D
A
 
E
I
 
V
V
 
A
R
 
K
P
 
Q
D
 
G
T
 
A
I
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
S
N
|
N
T
|
T
S
|
S
F
x
T
L
 
L
D
 
D
V
 
V
D
 
N
A
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
S
G
 
F
A
 
T
A
 
K
G
 
R
P
 
P
E
 
Q
R
 
D
V
 
V
L
 
V
G
 
G
M
 
M
H
|
H
F
 
F
F
 
F
S
 
S
P
 
P
A
 
A
N
 
N
V
 
V
M
 
M
R
 
K
L
 
L
L
 
L
E
|
E
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
G
A
 
E
K
 
K
T
 
T
S
 
G
E
 
K
A
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
T
V
 
V
M
 
M
A
 
Q
L
 
V
A
 
G
K
 
K
K
 
K
L
 
I
G
 
K
K
 
K
A
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
V
S
 
S
G
 
G
V
 
V
C
 
C
F
 
D
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
N
|
N
R
 
R
M
 
M
L
 
I
A
 
E
A
 
Q
R
 
Y
Q
 
S
V
 
R
H
 
Q
A
 
A
D
 
G
A
 
Y
M
 
L
V
 
L
L
 
D
A
 
E
G
 
G
V
 
A
L
 
L
P
 
P
W
 
E
N
 
Q
I
 
V
D
 
D
R
 
K
I
 
A
L
 
I
T
 
E
G
 
K
F
 
F
G
 
G
F
 
F
P
 
A
M
 
M
G
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
R
M
 
M
L
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
N
D
 
D
I
 
I
G
 
G
W
 
W
-
 
A
-
 
I
-
 
R
-
 
K
-
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
K
-
 
P
E
 
E
G
 
I
D
 
Q
T
 
Y
D
 
S
S
 
K
V
 
T
K
 
A
S
 
D
R
 
L
L
 
L
V
 
C
A
 
E
A
 
M
G
 
G
R
 
R
K
 
F
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
S
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Y
 
W
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
Y
E
 
K
-
 
A
-
 
G
N
 
D
K
 
R
T
 
K
P
 
P
S
 
Y
P
 
P
S
 
N
Q
 
Q
T
 
Q
A
 
V
L
 
N
D
 
D
V
 
M
I
 
I
A
 
V
G
 
Q
L
 
H
A
 
S
S
 
K
-
 
D
V
 
L
A
 
G
P
 
I
G
 
T
S
 
R
V
 
R
T
 
K
L
 
I
S
 
S
D
 
D
R
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
V
D
 
E
R
 
R
L
 
L
L
 
V
L
 
F
P
 
A
M
 
L
I
 
V
N
 
N
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
R
I
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
A
L
 
S
R
 
K
G
 
A
S
 
S
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
M
V
 
V
W
 
Y
I
 
L
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
W
 
F
P
 
P
A
 
L
Q
 
F
T
 
R
G
 
G
G
 
G
P
 
P
M
 
M
F
 
L
H
 
Y
A
 
A
D
 
D
A
 
Q
I
 
V
G
 
G
L
 
L
-
 
Y
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
M
T
 
K
R
 
R
V
 
Y
V
 
A
D
 
K
G
 
G
L
 
Y
R
 
H
H
 
G
M
 
E
G
 
A
V
 
W
E
 
Q
P
 
V
A
 
A
A
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
Q
K
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
D
E
 
E
G
 
G

3zwaA Crystal structure of rat peroxisomal multifunctional enzyme type 1 (rpmfe1) complexed with 3s-hydroxy-hexanoyl-coa (see paper)
39% identity, 98% coverage: 10:675/683 of query aligns to 11:710/727 of 3zwaA

query
sites
3zwaA
L
 
L
T
 
R
V
 
L
E
 
P
D
 
H
G
 
S
V
 
L
A
 
A
I
 
M
V
 
I
T
 
R
L
 
L
D
 
C
F
 
N
P
 
P
P
|
P
V
|
V
N
 
N
A
|
A
M
 
V
S
 
S
P
 
P
A
 
T
L
 
V
M
 
I
D
 
R
G
 
E
L
 
V
Y
 
R
D
 
N
A
 
G
L
 
L
M
 
Q
A
 
K
A
 
A
L
 
G
S
 
S
D
 
D
D
 
H
A
 
T
A
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
I
I
 
C
C
 
G
A
 
A
G
 
N
R
 
G
T
 
N
F
 
F
I
 
C
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
L
x
I
K
 
H
S
 
G
L
x
F
G
 
S
K
 
A
V
 
F
Q
 
T
P
 
P
K
 
G
V
 
L
D
 
A
F
 
L
F
x
G
A
 
S
L
 
L
Q
 
V
D
 
D
S
 
E
I
 
I
E
 
Q
N
 
R
S
 
Y
P
 
Q
K
 
K
P
 
P
T
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
I
H
 
Q
G
 
G
T
x
V
A
 
A
L
|
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
M
 
L
E
|
E
T
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
G
F
 
C
H
 
H
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
A
V
 
N
P
 
A
S
 
K
A
 
A
R
|
R
M
 
V
G
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
N
 
T
L
|
L
G
 
G
L
x
I
L
 
L
P
|
P
G
|
G
G
x
A
G
 
R
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
T
 
V
G
 
G
A
 
V
E
 
P
A
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
I
I
 
T
S
 
S
G
 
G
R
 
K
Q
x
Y
V
 
L
G
 
S
A
 
A
K
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
R
I
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
L
D
 
D
R
 
A
L
 
V
A
 
V
A
 
K
E
 
S
G
 
D
A
 
P
L
 
V
R
 
-
E
 
E
D
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
K
F
 
F
A
 
A
K
 
Q
E
 
K
L
 
I
V
 
I
D
 
D
A
 
K
G
 
P
E
 
I
P
 
E
P
 
P
K
 
R
R
 
R
I
 
I
R
 
F
D
 
N
C
 
-
E
 
-
A
 
K
K
 
P
V
 
V
A
 
P
A
 
S
D
 
L
R
 
P
K
 
N
D
 
M
A
 
D
N
 
S
L
 
V
F
 
F
E
 
A
R
 
E
F
 
A
R
 
I
T
 
A
S
 
K
H
 
V
A
 
R
K
 
K
Q
 
Q
L
 
Y
N
 
P
G
 
G
L
 
V
D
 
L
A
 
A
P
 
P
Q
 
E
A
 
T
I
 
C
V
 
V
R
 
R
C
 
S
V
 
I
E
 
Q
A
 
A
A
 
S
V
 
V
A
 
K
G
 
H
P
 
P
W
 
Y
E
 
E
K
 
V
G
 
G
L
 
I
A
x
K
I
 
E
E
 
E
R
 
E
T
 
K
E
 
L
F
|
F
Q
 
M
T
 
Y
L
 
L
L
 
R
A
 
A
G
 
S
P
 
G
Q
 
Q
S
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
H
 
Y
V
 
A
F
 
F
M
 
F
A
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
S
A
 
A
Q
 
N
K
 
K
I
 
W
P
 
S
-
 
T
-
 
P
-
 
S
-
 
G
G
 
A
L
 
S
R
 
W
A
 
K
D
 
T
L
 
A
P
 
S
L
 
A
I
 
Q
P
 
P
V
 
V
T
 
S
K
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
L
G
 
G
T
 
T
M
 
M
G
 
G
S
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
A
M
 
I
A
 
S
F
 
F
L
 
A
A
 
R
A
 
V
G
 
G
F
 
I
A
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
A
V
 
V
E
 
E
T
 
S
Q
 
D
Q
 
P
A
 
K
A
 
Q
L
 
L
D
 
D
R
 
A
G
 
A
V
 
K
A
 
K
H
 
I
I
 
I
T
 
T
A
 
F
T
 
T
L
 
L
Q
 
E
-
 
K
-
 
E
-
 
A
S
 
S
R
 
R
V
 
A
E
 
H
R
 
Q
G
 
N
K
 
G
L
 
Q
A
 
A
A
 
S
D
 
A
K
 
K
A
 
P
E
 
K
A
 
L
Q
 
R
I
 
F
A
 
S
A
 
S
L
 
S
T
 
T
P
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
S
 
K
A
 
E
L
 
L
A
 
S
D
 
T
A
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
V
F
 
F
E
 
E
N
 
D
L
 
M
A
 
N
A
 
L
K
 
K
Q
 
K
A
 
K
L
 
V
F
 
F
G
 
A
T
 
E
L
 
L
S
 
S
A
 
A
I
 
L
V
 
C
R
 
K
P
 
P
D
 
G
T
 
A
I
 
F
L
 
L
A
 
C
T
 
T
N
 
N
T
 
T
S
|
S
F
 
A
L
 
L
D
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
S
G
 
S
A
 
T
A
 
D
G
 
R
P
 
P
E
 
Q
R
 
L
V
 
V
L
 
I
G
 
G
M
 
T
H
|
H
F
 
F
F
 
F
S
 
S
P
 
P
A
 
A
N
 
H
V
 
V
M
 
M
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
V
 
V
V
 
I
R
 
P
A
 
S
A
 
R
K
 
Y
T
 
S
S
 
S
E
 
P
A
 
T
V
 
T
L
 
I
A
 
A
S
 
T
V
 
V
M
 
M
A
 
S
L
 
L
A
 
S
K
 
K
K
 
K
L
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
I
A
 
G
V
 
V
V
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
N
C
 
C
F
 
Y
G
 
G
F
 
F
I
 
V
G
 
G
N
|
N
R
 
R
M
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
P
R
 
Y
Q
 
Y
V
 
N
H
 
Q
A
 
G
D
 
F
A
 
F
M
 
L
V
 
L
L
 
E
A
 
E
G
 
G
V
 
S
L
 
K
P
 
P
W
 
E
N
 
D
I
 
V
D
 
D
R
 
G
I
 
V
L
 
L
T
 
E
G
 
E
F
 
F
G
 
G
F
 
F
P
 
K
M
 
M
G
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
R
M
 
V
L
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
V
G
 
G
W
 
W
-
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
K
-
 
G
E
 
Q
G
 
G
D
 
L
T
 
T
-
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
G
D
 
T
S
 
P
V
 
V
K
 
R
S
 
K
R
 
R
-
 
G
-
 
N
-
 
S
-
 
R
-
 
Y
-
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
M
L
 
L
V
 
C
A
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
F
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
S
 
T
G
 
G
A
 
K
G
 
G
Y
 
W
Y
 
Y
D
 
Q
Y
 
Y
E
 
D
N
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
R
-
 
I
K
 
H
T
 
K
P
 
P
S
 
D
P
 
P
S
 
W
-
 
L
Q
 
S
T
 
T
A
 
F
L
 
L
D
 
S
V
 
Q
I
 
Y
A
 
R
G
 
E
L
 
V
A
 
H
S
 
H
V
 
I
A
 
E
P
 
-
G
 
-
S
 
Q
V
 
R
T
 
T
L
 
I
S
 
S
D
 
K
R
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
D
 
E
R
 
R
L
 
C
L
 
L
L
 
Y
P
 
S
M
 
L
I
 
I
N
 
N
E
 
E
G
 
A
A
 
F
K
 
R
I
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
M
A
 
A
L
 
A
R
 
R
G
 
P
S
 
E
D
 
H
I
 
I
D
 
D
L
 
V
V
 
I
W
 
Y
I
 
L
T
 
H
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
A
 
R
Q
 
H
T
 
K
G
 
G
G
 
G
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
 
Y
A
 
A
D
 
A
A
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
P
R
 
T
V
 
V
V
 
L
D
 
E
G
 
K
L
 
L
R
 
Q
H
 
K
M
 
Y
-
 
Y
-
 
R
-
 
Q
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
I
-
 
P
G
 
Q
V
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
S
A
 
D
L
 
Y
L
 
L
L
 
R
K
 
R
L
 
L
A
 
V
S
 
A
E
 
Q
G
 
G

5omoA Crystal structure of rat peroxisomal multifunctional enzyme type-1 (rpmfe1) complexed with with 3s-hydroxy-decanoyl-coa and 3-keto- decanoyl-coa
39% identity, 98% coverage: 10:675/683 of query aligns to 10:709/725 of 5omoA

query
sites
5omoA
L
 
L
T
 
R
V
 
L
E
 
P
D
 
H
G
 
S
V
 
L
A
 
A
I
 
M
V
 
I
T
 
R
L
 
L
D
 
C
F
 
N
P
 
P
P
|
P
V
|
V
N
 
N
A
|
A
M
x
V
S
|
S
P
|
P
A
 
T
L
 
V
M
 
I
D
 
R
G
 
E
L
 
V
Y
 
R
D
 
N
A
 
G
L
 
L
M
 
Q
A
 
K
A
 
A
L
 
G
S
 
S
D
 
D
D
 
H
A
 
T
A
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
I
I
 
C
C
 
G
A
 
A
G
 
N
R
 
G
T
 
N
F
 
F
I
 
C
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
L
x
I
K
 
H
S
 
G
L
x
F
G
 
S
K
 
A
V
 
F
Q
 
T
P
|
P
K
x
G
V
 
L
D
 
A
F
x
L
F
x
G
A
 
S
L
 
L
Q
 
V
D
 
D
S
 
E
I
 
I
E
 
Q
N
 
R
S
 
Y
P
 
Q
K
 
K
P
 
P
T
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
I
H
 
Q
G
 
G
T
x
V
A
 
A
L
|
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
M
 
L
E
|
E
T
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
G
F
 
C
H
 
H
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
A
V
 
N
P
 
A
S
 
K
A
 
A
R
 
R
M
 
V
G
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
N
 
T
L
|
L
G
 
G
L
x
I
L
 
L
P
|
P
G
|
G
G
x
A
G
 
R
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
T
 
V
G
 
G
A
 
V
E
 
P
A
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
I
I
 
T
S
 
S
G
 
G
R
 
K
Q
x
Y
V
 
L
G
 
S
A
 
A
K
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
R
I
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
L
D
 
D
R
 
A
L
 
V
A
 
V
A
 
K
E
 
S
G
 
D
A
 
P
L
 
V
R
 
-
E
 
E
D
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
K
F
 
F
A
 
A
K
 
Q
E
 
K
L
 
I
V
 
I
D
 
D
A
 
K
G
 
P
E
 
I
P
 
E
P
 
P
K
 
R
R
 
R
I
 
I
R
 
F
D
 
N
C
 
-
E
 
-
A
 
K
K
 
P
V
 
V
A
 
P
A
 
S
D
 
L
R
 
P
K
 
N
D
 
M
A
 
D
N
 
S
L
 
V
F
 
F
E
 
A
R
 
E
F
 
A
R
 
I
T
 
A
S
 
K
H
 
V
A
 
R
K
 
K
Q
 
Q
L
 
Y
N
 
P
G
 
G
L
 
V
D
 
L
A
 
A
P
 
P
Q
 
E
A
 
T
I
 
C
V
 
V
R
 
R
C
 
S
V
 
I
E
 
Q
A
 
A
A
 
S
V
 
V
A
 
K
G
 
H
P
 
P
W
 
Y
E
 
E
K
 
V
G
 
G
L
 
I
A
x
K
I
 
E
E
 
E
R
 
E
T
 
K
E
 
L
F
|
F
Q
 
M
T
 
Y
L
 
L
L
 
R
A
 
A
G
 
S
P
 
G
Q
 
Q
S
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
H
 
Y
V
 
A
F
|
F
M
 
F
A
 
A
E
 
E
R
x
K
A
 
S
A
 
A
Q
 
N
K
 
K
I
 
W
P
 
S
-
 
T
-
 
P
-
 
S
-
 
G
G
 
A
L
 
S
R
 
W
A
 
K
D
 
T
L
 
A
P
 
S
L
 
A
I
 
Q
P
 
P
V
 
V
T
 
S
K
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
L
G
 
G
T
 
T
M
 
M
G
 
G
S
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
A
M
 
I
A
 
S
F
 
F
L
 
A
A
 
R
A
 
V
G
 
G
F
 
I
A
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
A
V
 
V
E
 
E
T
 
S
Q
 
D
Q
 
P
A
 
K
A
 
Q
L
 
L
D
 
D
R
 
A
G
 
A
V
 
K
A
 
K
H
 
I
I
 
I
T
 
T
A
 
F
T
 
T
L
 
L
Q
 
E
-
 
K
-
 
E
-
 
A
S
 
S
R
 
R
V
 
A
E
 
H
R
 
Q
G
 
N
K
 
G
L
 
Q
A
 
A
A
 
S
D
 
A
K
 
K
A
 
P
E
 
K
A
 
L
Q
 
R
I
 
F
A
 
S
A
 
S
L
 
S
T
 
T
P
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
S
 
K
A
 
E
L
 
L
A
 
S
D
 
T
A
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
V
F
 
F
E
 
E
N
 
D
L
 
M
A
 
N
A
 
L
K
 
K
Q
 
K
A
 
K
L
 
V
F
 
F
G
 
A
T
 
E
L
 
L
S
 
S
A
 
A
I
 
L
V
 
C
R
 
K
P
 
P
D
 
G
T
 
A
I
 
F
L
 
L
A
 
C
T
 
T
N
 
N
T
 
T
S
|
S
F
 
A
L
 
L
D
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
S
G
 
S
A
 
T
A
 
D
G
 
R
P
 
P
E
 
Q
R
 
L
V
 
V
L
 
I
G
 
G
M
 
T
H
|
H
F
 
F
F
|
F
S
|
S
P
|
P
A
 
A
N
x
H
V
 
V
M
|
M
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
V
 
V
V
 
I
R
 
P
A
 
S
A
 
R
K
 
Y
T
 
S
S
 
S
E
 
P
A
 
T
V
 
T
L
 
I
A
 
A
S
 
T
V
 
V
M
 
M
A
 
S
L
 
L
A
 
S
K
 
K
K
 
K
L
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
I
A
 
G
V
 
V
V
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
N
C
 
C
F
 
Y
G
 
G
F
 
F
I
 
V
G
 
G
N
|
N
R
 
R
M
 
M
L
 
L
A
|
A
A
 
P
R
 
Y
Q
 
Y
V
 
N
H
 
Q
A
 
G
D
 
F
A
 
F
M
 
L
V
 
L
L
 
E
A
 
E
G
 
G
V
 
S
L
 
K
P
 
P
W
 
E
N
 
D
I
 
V
D
 
D
R
 
G
I
 
V
L
 
L
T
 
E
G
 
E
F
 
F
G
 
G
F
 
F
P
x
K
M
|
M
G
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
R
M
x
V
L
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
x
V
G
 
G
W
 
W
-
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
K
-
 
G
E
 
Q
G
 
G
D
 
L
T
 
T
-
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
G
D
 
T
S
 
P
V
 
V
K
 
R
S
 
K
R
 
R
-
 
G
-
 
N
-
 
S
-
 
R
-
 
Y
-
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
M
L
 
L
V
 
C
A
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
F
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
S
 
T
G
 
G
A
 
K
G
 
G
Y
 
W
Y
 
Y
D
 
Q
Y
 
Y
E
 
D
N
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
R
-
 
I
K
 
H
T
 
K
P
 
P
S
 
D
P
 
P
S
 
W
-
 
L
Q
 
S
T
 
T
A
 
F
L
 
L
D
 
S
V
 
Q
I
 
Y
A
 
R
G
 
E
L
 
V
A
 
H
S
 
H
V
 
I
A
 
E
P
 
-
G
 
-
S
 
Q
V
 
R
T
 
T
L
 
I
S
 
S
D
 
K
R
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
D
 
E
R
 
R
L
 
C
L
 
L
L
 
Y
P
 
S
M
 
L
I
 
I
N
 
N
E
 
E
G
 
A
A
 
F
K
 
R
I
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
M
A
 
A
L
 
A
R
 
R
G
 
P
S
 
E
D
 
H
I
 
I
D
 
D
L
 
V
V
 
I
W
 
Y
I
 
L
T
 
H
G
|
G
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
A
 
R
Q
 
H
T
 
K
G
 
G
G
 
G
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
 
Y
A
 
A
D
 
A
A
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
P
R
 
T
V
 
V
V
 
L
D
 
E
G
 
K
L
 
L
R
 
Q
H
 
K
M
 
Y
-
 
Y
-
 
R
-
 
Q
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
I
-
 
P
G
 
Q
V
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
S
A
 
D
L
 
Y
L
 
L
L
 
R
K
 
R
L
 
L
A
 
V
S
 
A
E
 
Q
G
 
G

5mgbA Crystal structure of rat peroxisomal multifunctional enzyme type-1 (rpmfe1) complexed with acetoacetyl-coa and NAD (see paper)
39% identity, 98% coverage: 10:675/683 of query aligns to 10:709/725 of 5mgbA

query
sites
5mgbA
L
 
L
T
 
R
V
 
L
E
 
P
D
 
H
G
 
S
V
 
L
A
 
A
I
 
M
V
 
I
T
 
R
L
 
L
D
 
C
F
 
N
P
 
P
P
|
P
V
|
V
N
 
N
A
 
A
M
 
V
S
 
S
P
 
P
A
 
T
L
 
V
M
 
I
D
 
R
G
 
E
L
 
V
Y
 
R
D
 
N
A
 
G
L
 
L
M
 
Q
A
 
K
A
 
A
L
 
G
S
 
S
D
 
D
D
 
H
A
 
T
A
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
I
I
 
C
C
 
G
A
 
A
G
 
N
R
 
G
T
 
N
F
 
F
I
 
C
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
L
x
I
K
 
H
S
 
G
L
x
F
G
 
S
K
 
A
V
 
F
Q
 
T
P
 
P
K
 
G
V
 
L
D
 
A
F
 
L
F
x
G
A
 
S
L
 
L
Q
 
V
D
 
D
S
 
E
I
 
I
E
 
Q
N
 
R
S
 
Y
P
 
Q
K
 
K
P
 
P
T
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
I
H
 
Q
G
 
G
T
x
V
A
 
A
L
|
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
M
 
L
E
|
E
T
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
G
F
 
C
H
 
H
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
A
V
 
N
P
 
A
S
 
K
A
 
A
R
 
R
M
 
V
G
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
N
 
T
L
|
L
G
 
G
L
 
I
L
 
L
P
|
P
G
|
G
G
 
A
G
 
R
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
T
 
V
G
 
G
A
 
V
E
 
P
A
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
I
I
 
T
S
 
S
G
 
G
R
 
K
Q
x
Y
V
 
L
G
 
S
A
 
A
K
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
R
I
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
L
D
 
D
R
 
A
L
 
V
A
 
V
A
 
K
E
 
S
G
 
D
A
 
P
L
 
V
R
 
-
E
 
E
D
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
K
F
 
F
A
 
A
K
 
Q
E
 
K
L
 
I
V
 
I
D
 
D
A
 
K
G
 
P
E
 
I
P
 
E
P
 
P
K
 
R
R
 
R
I
 
I
R
 
F
D
 
N
C
 
-
E
 
-
A
 
K
K
 
P
V
 
V
A
 
P
A
 
S
D
 
L
R
 
P
K
 
N
D
 
M
A
 
D
N
 
S
L
 
V
F
 
F
E
 
A
R
 
E
F
 
A
R
 
I
T
 
A
S
 
K
H
 
V
A
 
R
K
 
K
Q
 
Q
L
 
Y
N
 
P
G
 
G
L
 
V
D
 
L
A
 
A
P
 
P
Q
 
E
A
 
T
I
 
C
V
 
V
R
 
R
C
 
S
V
 
I
E
 
Q
A
 
A
A
 
S
V
 
V
A
 
K
G
 
H
P
 
P
W
 
Y
E
 
E
K
 
V
G
 
G
L
 
I
A
x
K
I
 
E
E
 
E
R
 
E
T
 
K
E
 
L
F
 
F
Q
 
M
T
 
Y
L
 
L
L
 
R
A
 
A
G
 
S
P
 
G
Q
 
Q
S
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
H
 
Y
V
 
A
F
 
F
M
 
F
A
 
A
E
 
E
R
x
K
A
 
S
A
 
A
Q
 
N
K
 
K
I
 
W
P
 
S
-
 
T
-
 
P
-
 
S
-
 
G
G
 
A
L
 
S
R
 
W
A
 
K
D
 
T
L
 
A
P
 
S
L
 
A
I
 
Q
P
 
P
V
 
V
T
 
S
K
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
V
V
x
L
G
|
G
A
 
L
G
|
G
T
|
T
M
|
M
G
 
G
S
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
A
M
 
I
A
 
S
F
 
F
L
 
A
A
 
R
A
 
V
G
 
G
F
 
I
A
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
A
V
 
V
E
|
E
T
x
S
Q
 
D
Q
 
P
A
 
K
A
x
Q
L
 
L
D
 
D
R
 
A
G
 
A
V
 
K
A
 
K
H
 
I
I
 
I
T
 
T
A
 
F
T
 
T
L
 
L
Q
 
E
-
 
K
-
 
E
-
 
A
S
 
S
R
 
R
V
 
A
E
 
H
R
 
Q
G
 
N
K
 
G
L
 
Q
A
 
A
A
 
S
D
 
A
K
 
K
A
 
P
E
 
K
A
 
L
Q
 
R
I
 
F
A
 
S
A
 
S
L
 
S
T
 
T
P
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
S
 
K
A
 
E
L
 
L
A
 
S
D
 
T
A
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
V
E
 
E
A
|
A
I
x
V
F
|
F
E
|
E
N
 
D
L
 
M
A
 
N
A
 
L
K
|
K
Q
 
K
A
 
K
L
 
V
F
 
F
G
 
A
T
 
E
L
 
L
S
 
S
A
 
A
I
 
L
V
 
C
R
 
K
P
 
P
D
 
G
T
 
A
I
 
F
L
 
L
A
 
C
T
 
T
N
|
N
T
|
T
S
|
S
F
 
A
L
 
L
D
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
S
G
 
S
A
 
T
A
 
D
G
 
R
P
 
P
E
 
Q
R
 
L
V
 
V
L
 
I
G
 
G
M
 
T
H
|
H
F
|
F
F
 
F
S
|
S
P
 
P
A
 
A
N
 
H
V
 
V
M
 
M
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
V
 
V
V
 
I
R
 
P
A
 
S
A
 
R
K
 
Y
T
 
S
S
 
S
E
 
P
A
 
T
V
 
T
L
 
I
A
 
A
S
 
T
V
 
V
M
 
M
A
 
S
L
 
L
A
 
S
K
 
K
K
 
K
L
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
I
A
 
G
V
 
V
V
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
N
C
 
C
F
 
Y
G
 
G
F
 
F
I
 
V
G
 
G
N
|
N
R
 
R
M
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
P
R
 
Y
Q
 
Y
V
 
N
H
 
Q
A
 
G
D
 
F
A
 
F
M
 
L
V
 
L
L
 
E
A
 
E
G
 
G
V
 
S
L
 
K
P
 
P
W
 
E
N
 
D
I
 
V
D
 
D
R
 
G
I
 
V
L
 
L
T
 
E
G
 
E
F
 
F
G
 
G
F
 
F
P
 
K
M
 
M
G
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
R
M
 
V
L
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
V
G
 
G
W
 
W
-
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
K
-
 
G
E
 
Q
G
 
G
D
 
L
T
 
T
-
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
G
D
 
T
S
 
P
V
 
V
K
 
R
S
 
K
R
 
R
-
 
G
-
 
N
-
 
S
-
 
R
-
 
Y
-
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
M
L
 
L
V
 
C
A
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
F
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
S
 
T
G
 
G
A
 
K
G
 
G
Y
 
W
Y
 
Y
D
 
Q
Y
 
Y
E
 
D
N
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
R
-
 
I
K
 
H
T
 
K
P
 
P
S
 
D
P
 
P
S
 
W
-
 
L
Q
 
S
T
 
T
A
 
F
L
 
L
D
 
S
V
 
Q
I
 
Y
A
 
R
G
 
E
L
 
V
A
 
H
S
 
H
V
 
I
A
 
E
P
 
-
G
 
-
S
 
Q
V
 
R
T
 
T
L
 
I
S
 
S
D
 
K
R
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
D
 
E
R
 
R
L
 
C
L
 
L
L
 
Y
P
 
S
M
 
L
I
 
I
N
 
N
E
 
E
G
 
A
A
 
F
K
 
R
I
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
M
A
 
A
L
 
A
R
 
R
G
 
P
S
 
E
D
 
H
I
 
I
D
 
D
L
 
V
V
 
I
W
 
Y
I
 
L
T
 
H
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
A
 
R
Q
 
H
T
 
K
G
 
G
G
 
G
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
 
Y
A
 
A
D
 
A
A
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
P
R
 
T
V
 
V
V
 
L
D
 
E
G
 
K
L
 
L
R
 
Q
H
 
K
M
 
Y
-
 
Y
-
 
R
-
 
Q
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
I
-
 
P
G
 
Q
V
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
S
A
 
D
L
 
Y
L
 
L
L
 
R
K
 
R
L
 
L
A
 
V
S
 
A
E
 
Q
G
 
G

3zwcA Crystal structure of rat peroxisomal multifunctional enzyme type 1 (rpmfe1) complexed with 3s-hydroxy-decanoyl-coa (see paper)
39% identity, 98% coverage: 10:675/683 of query aligns to 10:709/725 of 3zwcA

query
sites
3zwcA
L
 
L
T
 
R
V
 
L
E
 
P
D
 
H
G
 
S
V
 
L
A
 
A
I
 
M
V
 
I
T
 
R
L
 
L
D
 
C
F
 
N
P
 
P
P
|
P
V
|
V
N
 
N
A
|
A
M
 
V
S
 
S
P
 
P
A
 
T
L
 
V
M
x
I
D
 
R
G
 
E
L
 
V
Y
 
R
D
 
N
A
 
G
L
 
L
M
 
Q
A
 
K
A
 
A
L
 
G
S
 
S
D
 
D
D
 
H
A
 
T
A
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
I
I
 
C
C
 
G
A
 
A
G
 
N
R
 
G
T
 
N
F
 
F
I
 
C
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
L
x
I
K
x
H
S
 
G
L
x
F
G
 
S
K
 
A
V
 
F
Q
 
T
P
|
P
K
x
G
V
x
L
D
x
A
F
x
L
F
x
G
A
 
S
L
 
L
Q
 
V
D
 
D
S
 
E
I
 
I
E
 
Q
N
 
R
S
 
Y
P
 
Q
K
 
K
P
 
P
T
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
I
H
 
Q
G
 
G
T
x
V
A
 
A
L
|
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
M
 
L
E
|
E
T
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
G
F
 
C
H
 
H
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
A
V
 
N
P
 
A
S
 
K
A
 
A
R
 
R
M
 
V
G
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
N
 
T
L
|
L
G
 
G
L
 
I
L
 
L
P
|
P
G
|
G
G
x
A
G
 
R
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
T
 
V
G
 
G
A
 
V
E
 
P
A
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
I
I
 
T
S
 
S
G
 
G
R
 
K
Q
x
Y
V
 
L
G
 
S
A
 
A
K
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
R
I
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
L
D
 
D
R
 
A
L
 
V
A
 
V
A
 
K
E
 
S
G
 
D
A
 
P
L
 
V
R
 
-
E
 
E
D
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
K
F
 
F
A
 
A
K
 
Q
E
 
K
L
 
I
V
 
I
D
 
D
A
 
K
G
 
P
E
 
I
P
 
E
P
 
P
K
 
R
R
 
R
I
 
I
R
 
F
D
 
N
C
 
-
E
 
-
A
 
K
K
 
P
V
 
V
A
 
P
A
 
S
D
 
L
R
 
P
K
 
N
D
 
M
A
 
D
N
 
S
L
 
V
F
 
F
E
 
A
R
 
E
F
 
A
R
 
I
T
 
A
S
 
K
H
 
V
A
 
R
K
 
K
Q
 
Q
L
 
Y
N
 
P
G
 
G
L
 
V
D
 
L
A
 
A
P
 
P
Q
 
E
A
 
T
I
 
C
V
 
V
R
 
R
C
 
S
V
 
I
E
 
Q
A
 
A
A
 
S
V
 
V
A
 
K
G
 
H
P
 
P
W
 
Y
E
 
E
K
 
V
G
 
G
L
 
I
A
x
K
I
 
E
E
 
E
R
 
E
T
 
K
E
 
L
F
|
F
Q
 
M
T
 
Y
L
 
L
L
 
R
A
 
A
G
 
S
P
 
G
Q
 
Q
S
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
H
 
Y
V
 
A
F
 
F
M
 
F
A
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
S
A
 
A
Q
 
N
K
 
K
I
 
W
P
 
S
-
 
T
-
 
P
-
 
S
-
 
G
G
 
A
L
 
S
R
 
W
A
 
K
D
 
T
L
 
A
P
 
S
L
 
A
I
 
Q
P
 
P
V
 
V
T
 
S
K
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
V
V
x
L
G
|
G
A
x
L
G
|
G
T
|
T
M
|
M
G
 
G
S
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
A
M
 
I
A
 
S
F
 
F
L
 
A
A
 
R
A
 
V
G
 
G
F
 
I
A
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
A
V
|
V
E
|
E
T
x
S
Q
 
D
Q
 
P
A
 
K
A
x
Q
L
 
L
D
 
D
R
 
A
G
 
A
V
 
K
A
 
K
H
 
I
I
 
I
T
 
T
A
 
F
T
 
T
L
 
L
Q
 
E
-
 
K
-
 
E
-
 
A
S
 
S
R
 
R
V
 
A
E
 
H
R
 
Q
G
 
N
K
 
G
L
 
Q
A
 
A
A
 
S
D
 
A
K
 
K
A
 
P
E
 
K
A
 
L
Q
 
R
I
 
F
A
 
S
A
 
S
L
 
S
T
 
T
P
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
S
 
K
A
 
E
L
 
L
A
 
S
D
 
T
A
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
V
E
 
E
A
|
A
I
x
V
F
|
F
E
|
E
N
 
D
L
 
M
A
 
N
A
x
L
K
|
K
Q
 
K
A
 
K
L
 
V
F
 
F
G
 
A
T
 
E
L
 
L
S
 
S
A
 
A
I
 
L
V
 
C
R
 
K
P
 
P
D
 
G
T
 
A
I
 
F
L
 
L
A
 
C
T
 
T
N
|
N
T
 
T
S
|
S
F
 
A
L
 
L
D
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
S
G
 
S
A
 
T
A
 
D
G
 
R
P
 
P
E
 
Q
R
 
L
V
 
V
L
 
I
G
 
G
M
 
T
H
|
H
F
|
F
F
 
F
S
|
S
P
 
P
A
 
A
N
 
H
V
 
V
M
 
M
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
V
 
V
V
 
I
R
 
P
A
 
S
A
 
R
K
 
Y
T
 
S
S
 
S
E
 
P
A
 
T
V
 
T
L
 
I
A
 
A
S
 
T
V
 
V
M
 
M
A
 
S
L
 
L
A
 
S
K
 
K
K
 
K
L
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
I
A
 
G
V
 
V
V
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
N
C
 
C
F
 
Y
G
 
G
F
 
F
I
 
V
G
 
G
N
|
N
R
 
R
M
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
P
R
 
Y
Q
 
Y
V
 
N
H
 
Q
A
 
G
D
 
F
A
 
F
M
 
L
V
 
L
L
 
E
A
 
E
G
 
G
V
 
S
L
 
K
P
 
P
W
 
E
N
 
D
I
 
V
D
 
D
R
 
G
I
 
V
L
 
L
T
 
E
G
 
E
F
 
F
G
 
G
F
 
F
P
 
K
M
 
M
G
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
R
M
 
V
L
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
V
G
 
G
W
 
W
-
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
K
-
 
G
E
 
Q
G
 
G
D
 
L
T
 
T
-
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
G
D
 
T
S
 
P
V
 
V
K
 
R
S
 
K
R
 
R
-
 
G
-
 
N
-
 
S
-
 
R
-
 
Y
-
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
M
L
 
L
V
 
C
A
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
F
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
S
 
T
G
 
G
A
 
K
G
 
G
Y
 
W
Y
 
Y
D
 
Q
Y
 
Y
E
 
D
N
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
R
-
 
I
K
 
H
T
 
K
P
 
P
S
 
D
P
 
P
S
 
W
-
 
L
Q
 
S
T
 
T
A
 
F
L
 
L
D
 
S
V
 
Q
I
 
Y
A
 
R
G
 
E
L
 
V
A
 
H
S
 
H
V
 
I
A
 
E
P
 
-
G
 
-
S
 
Q
V
 
R
T
 
T
L
 
I
S
 
S
D
 
K
R
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
D
 
E
R
 
R
L
 
C
L
 
L
L
 
Y
P
 
S
M
 
L
I
 
I
N
 
N
E
 
E
G
 
A
A
 
F
K
 
R
I
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
M
A
 
A
L
 
A
R
 
R
G
 
P
S
 
E
D
 
H
I
 
I
D
 
D
L
 
V
V
 
I
W
 
Y
I
 
L
T
 
H
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
A
 
R
Q
 
H
T
 
K
G
 
G
G
 
G
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
 
Y
A
 
A
D
 
A
A
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
P
R
 
T
V
 
V
V
 
L
D
 
E
G
 
K
L
 
L
R
 
Q
H
 
K
M
 
Y
-
 
Y
-
 
R
-
 
Q
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
I
-
 
P
G
 
Q
V
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
S
A
 
D
L
 
Y
L
 
L
L
 
R
K
 
R
L
 
L
A
 
V
S
 
A
E
 
Q
G
 
G

2x58A The crystal structure of mfe1 liganded with coa (see paper)
39% identity, 98% coverage: 10:675/683 of query aligns to 10:709/725 of 2x58A

query
sites
2x58A
L
 
L
T
 
R
V
 
L
E
 
P
D
 
H
G
 
S
V
 
L
A
 
A
I
 
M
V
 
I
T
 
R
L
 
L
D
 
C
F
 
N
P
 
P
P
|
P
V
|
V
N
 
N
A
|
A
M
 
V
S
 
S
P
 
P
A
 
T
L
 
V
M
 
I
D
 
R
G
 
E
L
 
V
Y
 
R
D
 
N
A
 
G
L
 
L
M
 
Q
A
 
K
A
 
A
L
 
G
S
 
S
D
 
D
D
 
H
A
 
T
A
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
I
I
 
C
C
 
G
A
 
A
G
 
N
R
 
G
T
 
N
F
 
F
I
 
C
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
|
D
L
x
I
K
x
H
S
 
G
L
x
F
G
 
S
K
 
A
V
 
F
Q
 
T
P
 
P
K
 
G
V
 
L
D
 
A
F
 
L
F
x
G
A
 
S
L
 
L
Q
 
V
D
 
D
S
 
E
I
 
I
E
 
Q
N
 
R
S
 
Y
P
 
Q
K
 
K
P
 
P
T
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
I
H
 
Q
G
 
G
T
x
V
A
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
M
 
L
E
|
E
T
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
G
F
 
C
H
 
H
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
A
V
 
N
P
 
A
S
 
K
A
 
A
R
 
R
M
 
V
G
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
N
 
T
L
|
L
G
 
G
L
 
I
L
 
L
P
|
P
G
|
G
G
 
A
G
 
R
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
T
 
V
G
 
G
A
 
V
E
 
P
A
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
I
I
 
T
S
 
S
G
 
G
R
 
K
Q
x
Y
V
 
L
G
 
S
A
 
A
K
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
R
I
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
L
D
 
D
R
 
A
L
 
V
A
 
V
A
 
K
E
 
S
G
 
D
A
 
P
L
 
V
R
 
-
E
 
E
D
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
K
F
 
F
A
 
A
K
 
Q
E
 
K
L
 
I
V
 
I
D
 
D
A
 
K
G
 
P
E
 
I
P
 
E
P
 
P
K
 
R
R
 
R
I
 
I
R
 
F
D
 
N
C
 
-
E
 
-
A
 
K
K
 
P
V
 
V
A
 
P
A
 
S
D
 
L
R
 
P
K
 
N
D
 
M
A
 
D
N
 
S
L
 
V
F
 
F
E
 
A
R
 
E
F
 
A
R
 
I
T
 
A
S
 
K
H
 
V
A
 
R
K
 
K
Q
 
Q
L
 
Y
N
 
P
G
 
G
L
 
V
D
 
L
A
 
A
P
 
P
Q
 
E
A
 
T
I
 
C
V
 
V
R
 
R
C
 
S
V
 
I
E
 
Q
A
 
A
A
 
S
V
 
V
A
 
K
G
 
H
P
 
P
W
 
Y
E
 
E
K
 
V
G
 
G
L
 
I
A
x
K
I
 
E
E
 
E
R
 
E
T
 
K
E
 
L
F
 
F
Q
 
M
T
 
Y
L
 
L
L
 
R
A
 
A
G
 
S
P
 
G
Q
 
Q
S
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
H
 
Y
V
 
A
F
 
F
M
 
F
A
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
S
A
 
A
Q
 
N
K
 
K
I
 
W
P
 
S
-
 
T
-
 
P
-
 
S
-
 
G
G
 
A
L
 
S
R
 
W
A
 
K
D
 
T
L
 
A
P
 
S
L
 
A
I
 
Q
P
 
P
V
 
V
T
 
S
K
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
V
V
x
L
G
|
G
A
 
L
G
|
G
T
|
T
M
|
M
G
 
G
S
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
A
M
 
I
A
 
S
F
 
F
L
 
A
A
 
R
A
 
V
G
 
G
F
 
I
A
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
A
V
|
V
E
|
E
T
x
S
Q
 
D
Q
 
P
A
 
K
A
x
Q
L
 
L
D
 
D
R
 
A
G
 
A
V
 
K
A
 
K
H
 
I
I
 
I
T
 
T
A
 
F
T
 
T
L
 
L
Q
 
E
-
 
K
-
 
E
-
 
A
S
 
S
R
 
R
V
 
A
E
 
H
R
 
Q
G
 
N
K
 
G
L
 
Q
A
 
A
A
 
S
D
 
A
K
 
K
A
 
P
E
 
K
A
 
L
Q
 
R
I
 
F
A
 
S
A
 
S
L
 
S
T
 
T
P
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
S
 
K
A
 
E
L
 
L
A
 
S
D
 
T
A
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
V
E
 
E
A
|
A
I
x
V
F
|
F
E
 
E
N
 
D
L
 
M
A
 
N
A
x
L
K
 
K
Q
 
K
A
 
K
L
 
V
F
 
F
G
 
A
T
 
E
L
 
L
S
 
S
A
 
A
I
 
L
V
 
C
R
 
K
P
 
P
D
 
G
T
 
A
I
 
F
L
 
L
A
 
C
T
 
T
N
 
N
T
 
T
S
|
S
F
 
A
L
 
L
D
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
S
G
 
S
A
 
T
A
 
D
G
 
R
P
 
P
E
 
Q
R
 
L
V
 
V
L
 
I
G
 
G
M
 
T
H
|
H
F
 
F
F
 
F
S
 
S
P
 
P
A
 
A
N
 
H
V
 
V
M
 
M
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
V
 
V
V
 
I
R
 
P
A
 
S
A
 
R
K
 
Y
T
 
S
S
 
S
E
 
P
A
 
T
V
 
T
L
 
I
A
 
A
S
 
T
V
 
V
M
 
M
A
 
S
L
 
L
A
 
S
K
 
K
K
 
K
L
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
I
A
 
G
V
 
V
V
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
N
C
 
C
F
 
Y
G
 
G
F
 
F
I
 
V
G
 
G
N
|
N
R
 
R
M
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
P
R
 
Y
Q
 
Y
V
 
N
H
 
Q
A
 
G
D
 
F
A
 
F
M
 
L
V
 
L
L
 
E
A
 
E
G
 
G
V
 
S
L
 
K
P
 
P
W
 
E
N
 
D
I
 
V
D
 
D
R
 
G
I
 
V
L
 
L
T
 
E
G
 
E
F
 
F
G
 
G
F
 
F
P
 
K
M
 
M
G
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
R
M
 
V
L
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
V
G
 
G
W
 
W
-
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
K
-
 
G
E
 
Q
G
 
G
D
 
L
T
 
T
-
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
G
D
 
T
S
 
P
V
 
V
K
 
R
S
 
K
R
 
R
-
 
G
-
 
N
-
 
S
-
 
R
-
 
Y
-
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
M
L
 
L
V
 
C
A
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
F
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
S
 
T
G
 
G
A
 
K
G
 
G
Y
 
W
Y
 
Y
D
 
Q
Y
 
Y
E
 
D
N
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
R
-
 
I
K
 
H
T
 
K
P
 
P
S
 
D
P
 
P
S
 
W
-
 
L
Q
 
S
T
 
T
A
 
F
L
 
L
D
 
S
V
 
Q
I
 
Y
A
 
R
G
 
E
L
 
V
A
 
H
S
 
H
V
 
I
A
 
E
P
 
-
G
 
-
S
 
Q
V
 
R
T
 
T
L
 
I
S
 
S
D
 
K
R
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
D
 
E
R
 
R
L
 
C
L
 
L
L
 
Y
P
 
S
M
 
L
I
 
I
N
 
N
E
 
E
G
 
A
A
 
F
K
 
R
I
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
M
A
 
A
L
 
A
R
 
R
G
 
P
S
 
E
D
 
H
I
 
I
D
 
D
L
 
V
V
 
I
W
 
Y
I
 
L
T
 
H
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
A
 
R
Q
 
H
T
 
K
G
 
G
G
 
G
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
 
Y
A
 
A
D
 
A
A
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
P
R
 
T
V
 
V
V
 
L
D
 
E
G
 
K
L
 
L
R
 
Q
H
 
K
M
 
Y
-
 
Y
-
 
R
-
 
Q
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
I
-
 
P
G
 
Q
V
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
S
A
 
D
L
 
Y
L
 
L
L
 
R
K
 
R
L
 
L
A
 
V
S
 
A
E
 
Q
G
 
G

6zicAAA structure of rat peroxisomal multifunctional enzyme type-1 (rpmfe1) complexed with 3s-hydroxybutanoyl-coa and nadh'
39% identity, 98% coverage: 10:675/683 of query aligns to 10:707/723 of 6zicAAA

query
sites
6zicAAA
L
 
L
T
 
R
V
 
L
E
 
P
D
 
H
G
 
S
V
 
L
A
 
A
I
 
M
V
 
I
T
 
R
L
 
L
D
 
C
F
 
N
P
 
P
P
|
P
V
|
V
N
 
N