SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_2843 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_2843 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
39% identity, 94% coverage: 2:248/263 of query aligns to 7:253/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
Q
 
R
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
T
A
x
G
G
 
G
A
|
A
N
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
L
G
 
A
A
 
T
A
 
G
L
 
R
A
 
R
L
 
L
A
 
R
G
 
A
M
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
T
I
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
G
D
|
D
I
|
I
D
 
D
A
 
P
H
 
T
N
 
T
G
 
G
A
 
K
R
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
D
A
 
E
I
 
L
E
 
E
A
 
G
I
 
L
G
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
F
R
 
V
P
 
P
A
x
V
D
|
D
M
x
V
M
 
S
Q
 
E
A
 
Q
D
 
E
Q
 
A
A
 
V
R
 
D
A
 
N
L
 
L
V
 
F
D
 
D
F
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
S
E
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
G
 
I
V
 
S
R
 
P
P
 
P
R
 
E
A
 
D
F
 
D
L
 
L
D
 
I
Q
 
E
N
 
N
E
 
T
G
 
D
-
 
L
-
 
P
N
 
A
W
 
W
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
T
 
Q
D
 
D
L
 
I
N
 
N
F
 
L
T
 
K
S
 
S
M
 
V
L
 
Y
A
 
L
A
 
S
T
 
C
Q
 
R
S
 
A
A
 
A
A
 
L
R
 
R
V
 
H
M
 
M
-
 
V
-
 
P
A
 
A
N
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
T
A
 
A
S
|
S
T
 
F
E
 
V
A
 
A
L
 
V
R
 
M
A
 
G
A
 
S
P
 
A
G
 
T
F
 
S
S
x
Q
V
 
I
-
 
S
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
C
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
M
 
V
V
 
L
E
 
A
F
 
M
T
 
S
K
 
R
T
 
E
M
 
L
A
 
G
L
 
V
E
 
Q
L
 
Y
A
 
A
P
 
R
R
 
Q
A
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
A
I
 
L
A
 
C
P
|
P
D
 
G
L
x
P
I
x
V
D
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
L
L
 
L
R
 
Q
P
 
E
H
 
L
M
 
F
P
 
A
T
 
K
D
 
D
P
 
P
A
 
E
R
 
R
I
 
A
A
 
A
A
 
R
R
 
R
D
 
L
R
 
V
H
 
H
V
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
F
A
 
A
T
 
E
I
 
P
H
 
E
E
 
E
A
 
L
G
 
A
S
 
A
V
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
D
A
 
A
S
 
S
W
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
T
 
T
I
 
F
P
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
S
A
 
S
A
 
A

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
37% identity, 92% coverage: 3:245/263 of query aligns to 3:245/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
G
A
x
S
N
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
G
 
D
A
 
I
A
 
A
L
 
I
A
 
N
L
 
L
A
 
A
G
 
K
M
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
N
I
 
I
V
 
F
L
 
F
G
x
N
D
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
H
x
Y
N
|
N
G
|
G
A
x
S
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
E
R
 
E
V
 
T
A
 
A
A
 
K
A
 
L
I
 
V
E
 
A
A
 
E
I
 
H
G
 
G
R
 
V
R
 
E
A
 
V
A
 
E
F
 
A
R
 
M
P
 
K
A
 
A
D
x
N
M
x
V
M
 
A
Q
 
I
A
 
A
D
 
E
Q
 
D
A
 
V
R
 
D
A
 
A
L
 
F
V
 
F
D
 
K
F
 
Q
A
 
A
A
 
I
A
 
E
E
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
G
x
I
V
 
T
R
 
R
P
 
D
R
 
N
A
 
L
F
 
L
L
 
M
D
 
R
Q
 
M
N
 
K
E
 
E
G
 
D
N
 
E
W
 
W
Q
 
D
R
 
D
V
 
V
T
 
I
D
 
N
L
x
I
N
 
N
F
 
L
T
 
K
S
 
G
M
 
T
L
 
F
A
 
L
A
 
C
T
 
T
Q
 
K
S
 
A
A
 
V
A
 
S
R
 
R
V
 
T
M
 
M
A
 
M
N
 
K
-
 
Q
-
 
R
G
 
A
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
M
A
 
A
S
|
S
T
 
V
E
 
V
A
 
G
L
 
L
R
 
I
A
 
G
A
 
N
P
 
A
G
 
G
F
x
Q
S
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
C
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
M
 
V
V
 
I
E
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
T
 
T
M
 
T
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
R
A
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
C
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
D
 
G
L
 
F
I
|
I
D
 
T
T
|
T
P
 
D
G
 
M
L
 
T
-
 
D
R
 
K
P
 
L
H
 
D
M
 
E
P
 
K
T
 
T
D
 
K
P
 
E
A
 
A
R
 
M
I
 
L
A
 
A
A
 
-
R
 
-
D
 
-
R
 
-
H
 
Q
V
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
A
M
 
Y
A
 
G
T
 
T
I
 
T
H
 
E
E
 
D
A
 
I
G
 
A
S
 
N
V
 
A
I
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
A
A
 
S
S
 
K
W
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
T
 
T
I
 
L
P
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
M

7djsD Crystal structure of isopiperitenol dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa complexed with NAD
38% identity, 93% coverage: 3:247/263 of query aligns to 3:250/251 of 7djsD

query
sites
7djsD
L
 
L
Q
 
S
G
 
G
K
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
G
A
 
A
N
 
A
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
G
 
A
A
 
T
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
L
 
F
A
 
A
G
 
A
M
 
A
G
 
G
A
 
V
D
 
K
I
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
A
D
|
D
I
x
L
D
 
D
A
 
S
H
 
A
N
 
G
G
 
G
A
 
E
R
 
G
V
 
T
A
 
V
A
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
R
A
 
Q
I
 
A
G
 
G
R
 
G
R
 
E
A
 
A
A
 
V
F
 
F
R
 
I
P
 
R
A
x
C
D
|
D
M
x
V
M
 
T
Q
 
R
A
 
D
D
 
A
Q
 
E
A
 
V
R
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
D
 
E
F
 
G
A
 
C
A
 
A
A
 
A
E
 
A
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
Y
L
 
A
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
-
 
I
G
 
E
V
 
I
R
 
E
P
 
Q
R
 
G
A
 
K
F
 
L
L
 
A
D
 
D
Q
 
G
N
 
N
E
 
E
G
 
A
N
 
E
W
 
F
Q
 
D
R
 
A
V
 
I
T
 
M
D
 
A
L
 
V
N
 
N
F
 
V
T
 
K
S
 
G
M
 
V
L
 
W
A
 
L
A
 
C
T
 
M
Q
 
K
S
 
H
A
 
Q
A
 
I
R
 
P
V
 
L
M
 
M
-
 
L
-
 
A
A
 
Q
N
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
T
A
 
A
S
|
S
T
 
V
E
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
G
A
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
K
F
 
M
S
 
S
V
 
I
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
S
K
|
K
A
 
H
A
 
A
M
 
V
V
 
I
E
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
T
 
S
M
 
A
A
 
A
L
 
I
E
 
E
L
 
Y
A
 
A
P
 
K
R
 
K
A
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
A
I
 
V
A
 
C
P
 
P
D
x
A
L
x
V
I
 
I
D
 
D
T
 
T
P
 
D
G
 
M
L
 
F
R
 
R
P
 
R
H
 
A
M
 
Y
P
 
E
T
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
R
R
 
K
I
 
A
A
 
E
A
 
F
R
 
A
D
 
A
R
 
A
H
 
M
V
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
V
A
 
G
T
 
R
I
 
V
H
 
E
E
 
E
A
 
I
G
 
A
S
 
A
V
 
A
I
 
V
A
 
L
F
 
Y
L
 
L
A
 
C
S
 
S
P
 
D
A
 
N
A
 
A
S
 
G
W
 
F
V
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
I
T
 
A
I
 
L
P
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
A

4urfB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
36% identity, 93% coverage: 3:247/263 of query aligns to 3:247/248 of 4urfB

query
sites
4urfB
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
A
A
x
G
N
|
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
G
 
T
A
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
T
L
 
Y
A
 
A
G
 
A
M
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
N
I
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
S
D
|
D
I
|
I
D
 
S
A
 
D
H
 
E
N
 
W
G
 
G
A
 
R
R
 
E
V
 
T
A
 
L
A
 
A
A
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
G
I
 
K
G
 
G
R
 
G
R
 
K
A
 
A
A
 
V
F
 
F
R
 
Q
P
 
H
A
 
A
D
|
D
M
x
T
M
 
A
Q
 
H
A
 
P
D
 
E
Q
 
D
A
 
H
R
 
D
A
 
E
L
 
L
V
 
I
D
 
A
F
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
R
E
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
-
x
G
-
x
I
-
 
S
G
|
G
G
 
E
V
 
F
R
 
T
P
 
P
R
 
T
A
 
A
F
 
-
L
 
-
D
 
E
Q
 
T
N
 
T
E
 
D
G
 
A
N
 
Q
W
 
W
Q
 
Q
R
|
R
V
 
V
T
 
I
D
 
G
L
 
I
N
 
N
F
 
L
T
 
S
S
 
G
M
 
V
L
 
F
A
 
Y
A
 
G
T
 
V
Q
 
R
S
 
A
A
 
Q
A
 
I
R
 
R
V
 
A
M
 
M
-
 
L
-
 
E
A
 
T
N
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
E
 
A
A
 
G
L
 
Q
R
 
I
A
 
G
A
 
I
P
 
E
G
 
G
F
x
I
S
 
T
V
 
P
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
C
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
M
 
V
V
 
V
E
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
T
 
T
M
 
V
A
 
A
L
 
W
E
 
E
L
 
Y
A
 
G
P
 
S
R
 
K
A
 
G
I
 
I
R
|
R
V
 
I
N
 
N
C
 
S
I
 
V
A
 
G
P
|
P
D
x
A
L
 
F
I
|
I
D
 
N
T
|
T
P
 
T
G
 
-
L
 
L
R
 
V
P
 
Q
H
 
N
M
 
V
P
 
P
T
 
L
D
 
E
P
 
T
A
 
R
R
 
R
I
 
-
A
 
-
A
 
Q
R
 
L
D
 
E
R
 
Q
H
 
M
V
 
H
P
 
A
L
|
L
G
x
R
R
|
R
M
 
L
A
 
G
T
 
E
I
 
T
H
 
E
E
 
E
A
 
V
G
 
A
S
 
N
V
 
L
I
 
V
A
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
S
S
|
S
P
 
D
A
 
K
A
 
A
S
 
S
W
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
T
 
Y
I
 
Y
P
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
Y
T
 
L
A
 
A

4urfA Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
36% identity, 93% coverage: 3:247/263 of query aligns to 3:247/248 of 4urfA

query
sites
4urfA
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
A
A
x
G
N
|
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
G
 
T
A
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
T
L
 
Y
A
 
A
G
 
A
M
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
N
I
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
S
D
|
D
I
|
I
D
 
S
A
 
D
H
 
E
N
x
W
G
 
G
A
 
R
R
 
E
V
 
T
A
 
L
A
 
A
A
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
G
I
 
K
G
 
G
R
 
G
R
 
K
A
 
A
A
 
V
F
 
F
R
 
Q
P
 
H
A
 
A
D
|
D
M
x
T
M
 
A
Q
 
H
A
 
P
D
 
E
Q
 
D
A
 
H
R
 
D
A
 
E
L
 
L
V
 
I
D
 
A
F
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
R
E
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
-
x
G
-
x
I
-
x
S
G
|
G
G
x
E
V
 
F
R
x
T
P
 
P
R
 
T
A
 
A
F
 
-
L
 
-
D
x
E
Q
 
T
N
x
T
E
 
D
G
 
A
N
x
Q
W
 
W
Q
 
Q
R
|
R
V
 
V
T
 
I
D
 
G
L
 
I
N
 
N
F
 
L
T
 
S
S
 
G
M
 
V
L
 
F
A
 
Y
A
 
G
T
 
V
Q
 
R
S
 
A
A
 
Q
A
 
I
R
 
R
V
 
A
M
 
M
-
 
L
-
 
E
A
 
T
N
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
E
 
A
A
 
G
L
 
Q
R
 
I
A
 
G
A
 
I
P
 
E
G
 
G
F
x
I
S
 
T
V
 
P
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
C
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
M
 
V
V
 
V
E
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
T
 
T
M
 
V
A
 
A
L
 
W
E
 
E
L
 
Y
A
 
G
P
x
S
R
 
K
A
x
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
C
 
S
I
 
V
A
 
G
P
|
P
D
 
A
L
 
F
I
|
I
D
 
N
T
|
T
P
 
T
G
 
-
L
 
L
R
 
V
P
 
Q
H
 
N
M
 
V
P
 
P
T
 
L
D
 
E
P
 
T
A
 
R
R
 
R
I
 
-
A
 
-
A
 
Q
R
 
L
D
 
E
R
 
Q
H
 
M
V
 
H
P
 
A
L
 
L
G
 
R
R
 
R
M
 
L
A
 
G
T
 
E
I
 
T
H
 
E
E
 
E
A
 
V
G
 
A
S
 
N
V
 
L
I
 
V
A
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
S
S
 
S
P
 
D
A
 
K
A
 
A
S
 
S
W
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
x
S
T
x
Y
I
 
Y
P
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
Y
T
 
L
A
 
A

4ureB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
36% identity, 93% coverage: 3:247/263 of query aligns to 3:247/248 of 4ureB

query
sites
4ureB
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
G
G
 
A
A
 
G
N
|
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
G
 
T
A
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
T
L
 
Y
A
 
A
G
 
A
M
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
N
I
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
S
D
 
D
I
 
I
D
 
S
A
 
D
H
 
E
N
 
W
G
 
G
A
 
R
R
 
E
V
 
T
A
 
L
A
 
A
A
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
G
I
 
K
G
 
G
R
 
G
R
 
K
A
 
A
A
 
V
F
 
F
R
 
Q
P
 
H
A
 
A
D
 
D
M
 
T
M
 
A
Q
 
H
A
 
P
D
 
E
Q
 
D
A
 
H
R
 
D
A
 
E
L
 
L
V
 
I
D
 
A
F
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
R
E
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
 
A
-
x
G
-
 
I
-
 
S
G
 
G
G
 
E
V
 
F
R
 
T
P
 
P
R
 
T
A
 
A
F
 
-
L
 
-
D
 
E
Q
 
T
N
 
T
E
 
D
G
 
A
N
 
Q
W
 
W
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
T
 
I
D
 
G
L
 
I
N
 
N
F
 
L
T
 
S
S
 
G
M
 
V
L
 
F
A
 
Y
A
 
G
T
 
V
Q
 
R
S
 
A
A
 
Q
A
 
I
R
 
R
V
 
A
M
 
M
-
 
L
-
 
E
A
 
T
N
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
E
 
A
A
 
G
L
 
Q
R
 
I
A
 
G
A
 
I
P
 
E
G
 
G
F
x
I
S
 
T
V
 
P
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
C
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
M
 
V
V
 
V
E
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
T
 
T
M
 
V
A
 
A
L
 
W
E
 
E
L
 
Y
A
 
G
P
 
S
R
 
K
A
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
C
 
S
I
 
V
A
 
G
P
|
P
D
x
A
L
 
F
I
 
I
D
 
N
T
 
T
P
 
T
G
 
-
L
 
L
R
 
V
P
 
Q
H
 
N
M
 
V
P
 
P
T
 
L
D
 
E
P
 
T
A
 
R
R
 
R
I
 
-
A
 
-
A
 
Q
R
 
L
D
 
E
R
 
Q
H
 
M
V
 
H
P
 
A
L
 
L
G
 
R
R
 
R
M
 
L
A
 
G
T
 
E
I
 
T
H
 
E
E
 
E
A
 
V
G
 
A
S
 
N
V
 
L
I
 
V
A
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
S
S
 
S
P
 
D
A
 
K
A
 
A
S
 
S
W
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
T
 
Y
I
 
Y
P
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
Y
T
 
L
A
 
A

3ay6B Crystal structure of bacillus megaterium glucose dehydrogenase 4 a258f mutant in complex with nadh and d-glucose (see paper)
33% identity, 93% coverage: 3:246/263 of query aligns to 11:257/267 of 3ay6B

query
sites
3ay6B
L
 
L
Q
 
K
G
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
A
x
G
G
 
G
A
 
S
N
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
E
 
R
G
 
A
A
 
M
A
 
A
L
 
V
A
 
R
L
 
F
A
 
G
G
 
Q
M
 
E
G
 
E
A
 
A
D
 
K
I
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
N
D
 
Y
I
x
Y
D
 
N
A
 
N
H
 
E
N
 
E
G
 
E
A
 
A
R
 
L
V
 
D
A
 
A
A
 
K
A
 
K
-
 
E
I
 
V
E
 
E
A
 
E
I
 
A
G
 
G
R
 
G
R
 
Q
A
 
A
A
 
I
F
 
I
R
 
V
P
 
Q
A
 
G
D
|
D
M
x
V
M
 
T
Q
 
K
A
 
E
D
 
E
Q
 
D
A
 
V
R
 
V
A
 
N
L
 
L
V
 
V
D
 
Q
F
 
T
A
 
A
A
 
I
A
 
K
E
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
G
x
V
V
x
E
R
 
N
P
 
P
R
 
V
A
 
P
F
 
S
L
 
H
D
 
E
Q
 
L
N
 
S
E
 
L
G
 
D
N
 
N
W
 
W
Q
 
N
R
 
K
V
 
V
T
 
I
D
 
D
L
 
T
N
 
N
F
 
L
T
 
T
S
 
G
M
 
A
L
 
F
A
 
L
A
 
G
T
 
S
Q
 
R
S
 
E
A
 
A
A
 
I
R
 
K
V
 
Y
M
 
F
A
 
V
N
 
E
G
 
N
-
 
D
-
 
I
-
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
V
V
 
I
N
 
N
V
x
M
A
 
S
S
|
S
T
 
V
E
x
H
A
 
E
L
 
M
R
 
I
A
 
P
A
x
W
P
 
P
G
 
L
F
 
F
S
 
V
V
 
H
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
M
 
M
V
 
K
E
 
L
F
 
M
T
 
T
K
 
E
T
 
T
M
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
Y
A
 
A
P
 
P
R
 
K
A
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
N
I
 
I
A
 
G
P
|
P
D
x
G
L
 
A
I
x
M
D
 
N
T
|
T
P
|
P
G
 
-
L
x
I
R
x
N
P
 
A
H
 
E
M
x
K
P
 
F
T
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
R
 
Q
I
 
R
A
 
A
A
 
D
R
 
V
D
 
E
R
 
S
H
 
M
V
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
Y
M
 
I
A
 
G
T
 
K
I
 
P
H
 
E
E
 
E
A
 
V
G
 
A
S
 
A
V
 
V
I
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
S
A
 
Q
A
 
A
S
 
S
W
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
I
T
 
T
I
 
L
P
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
M
T
 
T

1g6kA Crystal structure of glucose dehydrogenase mutant e96a complexed with NAD+
33% identity, 93% coverage: 3:246/263 of query aligns to 5:251/261 of 1g6kA

query
sites
1g6kA
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
A
 
G
G
 
S
A
 
S
N
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
E
 
K
G
 
S
A
 
M
A
 
A
L
 
I
A
 
R
L
 
F
A
 
A
G
 
T
M
 
E
G
 
K
A
 
A
D
 
K
I
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
N
D
 
Y
I
x
R
D
 
S
A
 
K
H
 
E
N
 
D
G
 
E
A
 
A
R
 
N
-
 
S
V
 
V
A
 
L
A
 
E
A
 
E
I
 
I
E
 
K
A
 
K
I
 
V
G
 
G
R
 
G
R
 
E
A
 
A
A
 
I
F
 
A
R
 
V
P
 
K
A
 
G
D
|
D
M
x
V
M
 
T
Q
 
V
A
 
E
D
 
S
Q
 
D
A
 
V
R
 
I
A
 
N
L
 
L
V
 
V
D
 
Q
F
 
S
A
 
A
A
 
I
A
 
K
E
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
G
 
L
V
 
A
R
 
N
P
 
P
R
 
V
A
 
S
F
 
S
L
 
H
D
 
E
Q
 
M
N
 
S
E
 
L
G
 
S
N
 
D
W
 
W
Q
 
N
R
 
K
V
 
V
T
 
I
D
 
D
L
 
T
N
 
N
F
 
L
T
 
T
S
 
G
M
 
A
L
 
F
A
 
L
A
 
G
T
 
S
Q
 
R
S
 
E
A
 
A
A
 
I
R
 
K
V
 
Y
M
 
F
A
 
V
N
 
E
G
 
N
-
 
D
-
 
I
-
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
V
V
 
I
N
 
N
V
x
M
A
 
S
S
|
S
T
 
V
E
 
H
A
 
E
L
 
K
R
 
I
A
 
P
A
 
W
P
 
P
G
 
L
F
 
F
S
 
V
V
 
H
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
M
 
M
V
 
K
E
 
L
F
 
M
T
 
T
K
 
E
T
 
T
M
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
Y
A
 
A
P
 
P
R
 
K
A
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
N
I
 
I
A
 
G
P
|
P
D
x
G
L
 
A
I
|
I
D
 
N
T
|
T
P
 
P
G
 
-
L
 
I
R
 
N
P
 
A
H
 
E
M
 
K
P
 
F
T
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
E
R
 
Q
I
 
R
A
 
A
A
 
D
R
 
V
D
 
E
R
 
S
H
 
M
V
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
Y
M
 
I
A
 
G
T
 
E
I
 
P
H
 
E
E
 
E
A
 
I
G
 
A
S
 
A
V
 
V
I
 
A
A
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
S
A
 
E
A
 
A
S
 
S
W
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
I
T
 
T
I
 
L
P
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
M
T
 
T

P40288 Glucose 1-dehydrogenase; EC 1.1.1.47 from Priestia megaterium (Bacillus megaterium) (see 2 papers)
33% identity, 93% coverage: 3:246/263 of query aligns to 5:251/261 of P40288

query
sites
P40288
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
V
V
|
V
V
x
I
T
|
T
A
x
G
G
x
S
A
x
S
N
x
T
G
|
G
I
x
L
G
|
G
E
x
K
G
x
S
A
x
M
A
|
A
L
x
I
A
x
R
L
x
F
A
|
A
G
x
T
M
x
E
G
x
K
A
|
A
D
x
K
I
x
V
V
|
V
L
 
V
G
 
N
D
 
Y
I
 
R
D
 
S
A
 
K
H
 
E
N
 
D
G
 
E
A
 
A
R
 
N
-
 
S
V
 
V
A
 
L
A
 
E
A
 
E
I
 
I
E
 
K
A
 
K
I
 
V
G
 
G
R
 
G
R
 
E
A
 
A
A
 
I
F
 
A
R
 
V
P
 
K
A
 
G
D
 
D
M
 
V
M
 
T
Q
 
V
A
 
E
D
 
S
Q
 
D
A
 
V
R
 
I
A
 
N
L
 
L
V
 
V
D
 
Q
F
 
S
A
 
A
A
 
I
A
 
K
E
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
L
V
x
E
R
 
N
P
 
P
R
 
V
A
 
S
F
 
S
L
 
H
D
 
E
Q
 
M
N
 
S
E
 
L
G
 
S
N
x
D
W
 
W
Q
 
N
R
 
K
V
|
V
T
 
I
D
 
D
L
 
T
N
 
N
F
 
L
T
 
T
S
 
G
M
 
A
L
 
F
A
 
L
A
 
G
T
 
S
Q
 
R
S
 
E
A
 
A
A
 
I
R
 
K
V
 
Y
M
 
F
A
 
V
N
x
E
G
 
N
-
 
D
-
 
I
-
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
V
V
 
I
N
 
N
V
 
M
A
 
S
S
 
S
T
 
V
E
 
H
A
 
E
L
 
K
R
 
I
A
 
P
A
 
W
P
 
P
G
 
L
F
 
F
S
 
V
V
 
H
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
S
K
 
K
A
 
G
A
 
G
M
 
M
V
 
K
E
 
L
F
 
M
T
 
T
K
 
E
T
 
T
M
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
Y
A
 
A
P
 
P
R
 
K
A
 
G
I
 
I
R
 
R
V
|
V
N
 
N
C
 
N
I
 
I
A
 
G
P
 
P
D
 
G
L
 
A
I
 
I
D
 
N
T
 
T
P
|
P
G
 
-
L
 
I
R
 
N
P
 
A
H
 
E
M
 
K
P
 
F
T
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
E
R
 
Q
I
 
R
A
 
A
A
 
D
R
 
V
D
x
E
R
 
S
H
 
M
V
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
x
Y
M
 
I
A
 
G
T
 
E
I
 
P
H
 
E
E
 
E
A
 
I
G
 
A
S
 
A
V
 
V
I
 
A
A
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
S
A
 
E
A
 
A
S
 
S
W
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
I
T
 
T
I
 
L
P
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
M
T
 
T

Sites not aligning to the query:

7v0hG Crystal structure of putative glucose 1-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia in complex with NADP and a potential reaction product
37% identity, 93% coverage: 2:245/263 of query aligns to 8:252/253 of 7v0hG

query
sites
7v0hG
Q
 
K
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
A
A
x
S
N
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
A
G
 
A
A
 
I
A
 
A
L
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
D
M
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
A
I
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
N
D
 
Y
I
x
A
D
x
S
A
x
S
H
 
K
N
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
D
-
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
S
A
 
A
I
 
I
E
 
T
A
 
E
I
 
A
G
 
G
R
 
G
R
 
R
A
 
A
A
 
V
F
 
A
R
 
V
P
 
G
A
x
G
D
|
D
M
x
V
M
 
S
Q
 
K
A
 
A
D
 
A
Q
 
D
A
 
A
R
 
Q
A
 
R
L
 
I
V
 
V
D
 
D
F
 
T
A
 
A
A
 
I
A
 
E
E
 
T
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
S
G
|
G
G
 
V
V
x
Y
R
 
E
P
 
F
R
 
A
A
 
P
F
 
I
L
 
E
D
 
A
Q
 
I
N
 
T
E
 
E
G
 
E
N
 
H
W
 
Y
Q
 
R
R
 
R
V
 
Q
T
 
F
D
 
D
L
 
T
N
 
N
F
 
V
T
 
F
S
 
G
M
 
V
L
 
L
A
 
L
A
 
T
T
 
T
Q
 
Q
S
 
A
A
 
A
A
 
V
R
 
K
V
 
H
M
 
L
A
 
G
N
 
E
G
 
G
G
 
A
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
S
S
|
S
T
 
V
E
 
V
A
 
T
L
 
S
R
 
I
A
 
T
A
 
P
P
 
P
G
 
A
F
 
S
S
 
A
V
 
V
Y
|
Y
A
 
S
A
 
G
C
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
M
 
V
V
 
D
E
 
A
F
 
I
T
 
T
K
 
G
T
 
V
M
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
P
R
 
R
A
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
A
I
 
I
A
 
N
P
|
P
D
x
G
L
x
M
I
|
I
D
 
V
T
|
T
P
 
E
G
|
G
L
 
-
R
 
-
P
 
-
H
 
-
M
 
-
P
 
-
T
|
T
D
 
H
P
 
S
A
 
A
R
 
G
I
|
I
A
 
I
A
 
G
R
 
S
D
 
D
R
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
Q
-
 
V
-
 
L
-
 
G
H
 
Q
V
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
G
T
 
E
I
 
P
H
 
N
E
 
D
A
 
I
G
 
A
S
 
S
V
 
V
I
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
D
A
 
A
S
 
R
W
 
W
V
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
E
T
 
H
I
 
L
P
 
V
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G
I
 
L

2d1yA Crystal structure of tt0321 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
41% identity, 93% coverage: 5:248/263 of query aligns to 5:239/240 of 2d1yA

query
sites
2d1yA
G
 
G
K
 
K
V
 
G
A
 
V
V
 
L
V
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
G
A
 
A
N
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
G
 
A
A
 
I
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
L
 
F
A
 
A
G
 
R
M
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
L
I
 
V
V
 
A
L
 
L
G
 
C
D
|
D
I
x
L
D
x
R
A
 
P
H
 
E
N
 
-
G
 
G
A
 
K
R
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
E
A
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
-
R
 
-
A
 
G
A
 
A
F
 
F
R
 
F
P
 
Q
A
x
V
D
|
D
M
x
L
M
 
E
Q
 
D
A
 
E
D
 
R
Q
 
E
A
 
R
R
 
V
A
 
R
L
 
F
V
 
V
D
 
E
F
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
Y
E
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
A
G
x
I
V
 
A
R
 
A
P
 
P
R
 
G
A
 
S
F
 
A
L
 
L
D
 
T
Q
 
V
N
 
R
E
 
L
G
 
P
N
 
E
W
 
W
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
T
 
L
D
 
E
L
 
V
N
 
N
F
 
L
T
 
T
S
 
A
M
 
P
L
 
M
A
 
H
A
 
L
T
 
S
Q
 
A
S
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
E
M
 
M
-
 
R
-
 
K
A
 
V
N
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
|
V
A
 
A
S
|
S
T
 
V
E
 
Q
A
 
G
L
 
L
R
 
F
A
 
A
A
 
E
P
 
Q
G
 
E
F
x
N
S
 
A
V
 
A
Y
|
Y
A
 
N
A
 
A
C
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
M
 
L
V
 
V
E
 
N
F
 
L
T
 
T
K
 
R
T
 
S
M
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
L
A
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
D
x
G
L
 
A
I
|
I
D
 
A
T
|
T
P
 
E
G
x
A
L
x
V
R
 
L
P
 
E
H
 
A
M
 
I
P
 
-
T
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
A
R
 
R
I
 
R
A
 
D
A
 
W
R
 
E
D
 
D
R
 
L
H
 
H
V
 
A
P
 
-
L
 
L
G
 
R
R
 
R
M
 
L
A
 
G
T
 
K
I
 
P
H
 
E
E
 
E
A
 
V
G
 
A
S
 
E
V
 
A
I
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
E
A
 
K
A
 
A
S
 
S
W
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
I
I
 
L
P
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
M
T
 
T
A
 
A
A
 
S

5t5qC Crystal structure of short-chain dehydrogenase/reductase sdr:glucose/ribitol dehydrogenase from brucella melitensis
36% identity, 94% coverage: 2:248/263 of query aligns to 4:245/245 of 5t5qC

query
sites
5t5qC
Q
 
E
L
 
F
Q
 
E
G
 
N
K
 
R
V
 
T
A
 
L
V
 
V
V
 
L
T
 
T
A
 
G
G
 
A
A
x
N
N
x
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
G
 
A
A
 
I
A
 
A
L
 
E
A
 
L
L
 
F
A
 
H
G
 
A
M
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
N
I
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
T
D
|
D
I
x
L
D
 
D
A
 
R
H
 
E
N
 
G
G
 
L
A
 
D
R
 
A
V
 
F
A
 
A
A
 
A
A
 
S
I
 
L
E
 
G
A
 
S
I
 
P
G
 
E
R
 
R
R
 
I
A
 
A
A
 
T
F
 
I
R
 
K
P
 
-
A
 
A
D
|
D
M
x
A
M
 
S
Q
 
S
A
 
A
D
 
D
Q
 
D
A
 
A
R
 
E
A
 
K
L
 
T
V
 
V
D
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
M
A
 
E
E
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
P
N
x
S
A
 
A
G
 
G
G
 
I
V
 
Y
R
 
Q
P
 
A
R
 
K
A
 
P
F
 
F
L
 
A
D
 
E
Q
 
M
N
 
S
E
 
D
G
 
A
N
 
D
W
 
W
Q
 
H
R
 
R
V
 
T
T
 
I
D
 
S
L
x
I
N
 
N
F
 
L
T
 
D
S
 
G
M
 
V
L
 
F
A
 
Y
A
 
L
T
 
C
Q
 
K
S
 
R
A
 
A
A
 
L
R
 
P
V
 
A
M
 
L
A
 
K
N
 
E
G
 
D
G
 
S
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
T
V
 
L
A
 
A
S
|
S
T
 
L
E
 
A
A
 
A
L
 
Y
R
 
R
A
 
G
A
 
A
P
 
Y
G
 
V
F
x
N
S
 
A
V
 
H
Y
|
Y
A
 
G
A
 
A
C
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
M
 
M
V
 
V
E
 
S
F
 
M
T
 
T
K
 
R
T
 
A
M
 
L
A
 
S
L
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
K
A
 
T
I
 
-
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
G
I
 
V
A
 
S
P
|
P
D
 
G
L
 
I
I
|
I
D
 
E
T
|
T
P
 
P
G
x
M
L
 
T
R
 
S
P
 
E
H
 
L
M
 
L
P
 
K
T
 
T
D
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
R
I
 
M
A
 
D
A
 
E
R
 
T
D
 
M
R
 
T
H
 
Q
V
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
K
R
 
R
M
 
L
A
 
G
T
 
K
I
 
P
H
 
S
E
 
E
A
 
I
G
 
A
S
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
P
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
S
W
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
E
T
 
T
I
 
I
P
 
Q
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
Y
A
 
M
A
 
A

4za2D Crystal structure of pectobacterium carotovorum 2-keto-3-deoxy-d- gluconate dehydrogenase complexed with NAD+ (see paper)
36% identity, 92% coverage: 3:244/263 of query aligns to 8:243/247 of 4za2D

query
sites
4za2D
L
 
L
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
I
T
 
T
A
x
G
G
 
C
A
x
D
N
 
T
G
 
G
I
x
L
G
 
G
E
 
Q
G
 
G
A
 
M
A
 
A
L
 
I
A
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
Q
M
 
A
G
 
G
A
 
C
D
 
D
I
 
I
V
 
V
L
 
-
G
 
-
D
 
G
I
 
V
D
 
N
A
x
I
H
 
V
N
 
E
G
 
P
A
 
K
R
 
D
V
 
T
A
 
I
A
 
E
A
 
K
I
 
V
E
 
T
A
 
A
I
 
L
G
 
G
R
 
R
R
 
R
A
 
F
A
 
L
F
 
S
R
 
L
P
 
T
A
 
A
D
|
D
M
|
M
M
 
S
Q
 
N
A
 
V
D
 
S
Q
 
G
A
 
H
R
 
A
A
 
E
L
 
L
V
 
V
D
 
E
F
 
K
A
 
A
A
 
V
A
 
A
E
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
H
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
G
 
I
V
 
I
R
 
R
P
 
R
R
 
E
A
 
D
F
 
A
L
 
I
D
 
E
Q
 
F
N
 
S
E
 
E
G
 
K
N
 
N
W
 
W
Q
 
D
R
 
D
V
 
V
T
 
M
D
 
N
L
|
L
N
 
N
F
 
I
T
 
K
S
 
S
M
 
V
L
 
F
A
 
F
A
 
M
T
 
S
Q
 
Q
S
 
T
A
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
Q
M
 
F
-
 
I
-
 
K
-
 
Q
A
 
G
N
 
K
G
 
G
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
A
S
|
S
T
 
M
E
 
L
A
 
S
L
 
F
R
 
Q
A
 
G
A
 
G
P
 
I
G
 
R
F
 
V
S
 
P
V
 
S
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
C
 
S
K
|
K
A
 
S
A
 
A
M
 
V
V
 
M
E
 
G
F
 
V
T
 
T
K
 
R
T
 
L
M
 
M
A
 
A
L
 
N
E
 
E
L
 
W
A
 
A
P
 
K
R
 
H
A
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
C
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
D
x
G
L
 
Y
I
x
M
D
 
A
T
|
T
P
 
N
G
x
N
L
 
T
R
 
Q
P
 
E
H
 
R
M
 
S
P
 
K
T
 
E
D
 
I
P
 
L
A
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
R
 
-
H
 
-
V
 
-
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
M
 
W
A
 
G
T
 
L
I
 
P
H
 
Q
E
 
D
A
 
L
G
 
M
S
 
G
V
 
P
I
 
S
A
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
S
A
 
A
A
 
S
S
 
D
W
 
Y
V
 
I
T
 
N
G
 
G
A
 
Y
T
 
T
I
 
I
P
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
37% identity, 92% coverage: 3:245/263 of query aligns to 4:244/247 of P73574

query
sites
P73574
L
 
L
Q
 
T
G
 
A
K
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
G
G
x
A
A
 
S
N
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
K
G
 
A
A
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
A
M
 
T
G
 
G
A
 
M
D
 
K
I
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
N
D
 
Y
I
 
A
D
 
Q
A
 
S
H
 
S
N
 
T
G
 
A
A
 
A
R
 
D
-
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
E
I
 
I
E
 
I
A
 
A
I
 
N
G
 
G
R
 
G
R
 
E
A
 
A
A
 
I
F
 
A
R
 
V
P
 
Q
A
 
A
D
 
N
M
 
V
M
 
A
Q
 
N
A
 
A
D
 
D
Q
 
E
A
 
V
R
 
D
A
 
Q
L
 
L
V
 
I
D
 
K
F
 
T
A
 
T
A
 
L
A
 
D
E
 
K
F
 
F
G
 
S
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
I
V
 
T
R
 
R
P
 
D
R
 
T
A
 
L
F
 
L
L
 
L
D
 
R
Q
 
M
N
 
K
E
 
L
G
 
E
N
 
D
W
 
W
Q
 
Q
R
 
A
V
 
V
T
 
I
D
 
D
L
 
L
N
 
N
F
 
L
T
 
T
S
 
G
M
 
V
L
 
F
A
 
L
A
 
C
T
 
T
Q
 
K
S
 
A
A
 
V
A
 
S
R
 
K
V
 
L
M
 
M
-
 
L
-
 
K
A
 
Q
N
 
K
G
 
S
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
T
S
 
S
T
 
V
E
 
A
A
 
G
L
 
M
R
 
M
A
 
G
A
 
N
P
|
P
G
 
G
F
 
Q
S
 
A
V
 
N
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
C
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
M
 
V
V
 
I
E
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
T
 
T
M
 
V
A
 
A
L
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
S
R
 
R
A
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
C
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
D
 
G
L
x
F
I
 
I
D
 
A
T
 
T
P
 
D
G
 
-
L
 
M
R
 
T
P
 
E
H
 
N
M
 
L
P
x
N
T
 
A
D
 
E
P
 
P
A
 
I
R
 
L
I
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
R
 
Q
H
 
F
V
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
A
R
 
R
M
 
Y
A
 
G
T
 
Q
I
 
P
H
 
E
E
 
E
A
 
V
G
 
A
S
 
G
V
 
T
I
 
I
A
 
R
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
T
-
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
A
W
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
T
 
T
I
 
F
P
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
M

2ztlA Closed conformation of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase complexed with NAD+ and l-3-hydroxybutyrate (see paper)
38% identity, 93% coverage: 3:247/263 of query aligns to 2:259/260 of 2ztlA

query
sites
2ztlA
L
 
L
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
S
A
 
T
N
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
L
G
 
G
A
 
I
A
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
A
M
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
V
 
V
L
 
L
G
 
-
D
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
H
 
-
N
 
N
G
 
G
A
x
F
R
 
G
V
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
K
I
 
V
-
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
H
G
 
G
R
 
V
R
 
K
A
 
V
A
 
L
F
 
Y
R
 
D
P
 
G
A
 
A
D
 
D
M
x
L
M
 
S
Q
 
K
A
 
G
D
 
E
Q
 
A
A
 
V
R
 
R
A
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
F
 
N
A
 
A
A
 
V
A
 
R
E
 
Q
F
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
G
 
I
V
x
Q
R
 
H
P
 
T
R
 
A
A
 
L
F
 
I
L
 
E
D
 
D
Q
 
F
N
 
P
E
 
T
G
 
E
N
 
K
W
 
W
Q
 
D
R
 
A
V
 
I
T
 
L
D
 
A
L
|
L
N
|
N
F
 
L
T
 
S
S
 
A
M
 
V
L
 
F
A
 
H
A
 
G
T
 
T
Q
 
A
S
 
A
A
 
A
A
 
L
R
 
P
V
 
H
M
 
M
A
 
K
N
 
K
G
 
Q
G
 
G
-
 
F
-
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
T
 
A
E
x
H
A
 
G
L
 
L
R
 
V
A
 
A
A
 
S
P
 
A
G
 
N
F
x
K
S
 
S
V
 
A
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
C
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
M
 
V
V
 
V
E
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
T
 
V
M
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
T
A
 
A
P
 
G
R
 
Q
A
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
A
N
 
N
C
 
A
I
 
I
A
 
C
P
|
P
D
 
G
L
x
W
I
x
V
D
 
R
T
|
T
P
 
P
G
 
L
L
x
V
R
 
E
P
 
K
H
x
Q
M
 
I
P
 
S
T
 
A
D
x
L
P
 
A
A
 
E
R
 
K
-
 
N
-
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
Q
-
 
E
I
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
R
D
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
S
R
 
E
H
 
K
V
 
Q
P
 
P
L
 
S
G
 
L
R
 
Q
M
 
F
A
 
V
T
 
T
I
 
P
H
 
E
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
T
I
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
A
W
 
Q
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
T
T
 
T
I
 
V
P
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
W
T
 
T
A
 
A

1wmbA Crystal structure of NAD dependent d-3-hydroxybutylate dehydrogenase (see paper)
38% identity, 93% coverage: 3:247/263 of query aligns to 2:259/260 of 1wmbA

query
sites
1wmbA
L
 
L
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
A
 
G
G
 
S
A
 
T
N
 
S
G
|
G
I
 
I
G
 
G
E
 
L
G
 
G
A
 
I
A
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
A
M
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
V
 
V
L
 
L
G
 
-
D
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
H
 
-
N
 
N
G
 
G
A
 
F
R
 
G
V
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
K
I
 
V
-
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
H
G
 
G
R
 
V
R
 
K
A
 
V
A
 
L
F
 
Y
R
 
D
P
 
G
A
 
A
D
 
D
M
 
L
M
 
S
Q
 
K
A
 
G
D
 
E
Q
 
A
A
 
V
R
 
R
A
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
F
 
N
A
 
A
A
 
V
A
 
R
E
 
Q
F
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
I
V
 
Q
R
 
H
P
 
T
R
 
A
A
 
L
F
 
I
L
 
E
D
 
D
Q
 
F
N
 
P
E
 
T
G
 
E
N
 
K
W
 
W
Q
 
D
R
 
A
V
 
I
T
 
L
D
 
A
L
 
L
N
|
N
F
 
L
T
 
S
S
 
A
M
 
V
L
 
F
A
 
H
A
 
G
T
 
T
Q
 
A
S
 
A
A
 
A
A
 
L
R
 
P
V
 
H
M
 
M
A
 
K
N
 
K
G
 
Q
G
 
G
-
 
F
-
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
T
 
A
E
 
H
A
 
G
L
 
L
R
 
V
A
 
A
A
 
S
P
 
A
G
 
N
F
 
K
S
 
S
V
 
A
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
C
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
M
 
V
V
 
V
E
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
T
 
V
M
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
T
A
 
A
P
 
G
R
 
Q
A
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
A
N
 
N
C
 
A
I
 
I
A
 
C
P
 
P
D
 
G
L
 
W
I
 
V
D
 
R
T
 
T
P
 
P
G
 
L
L
 
V
R
 
E
P
 
K
H
 
Q
M
 
I
P
 
S
T
 
A
D
x
L
P
 
A
A
 
E
R
 
K
-
 
N
-
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
Q
-
 
E
I
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
R
D
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
S
R
 
E
H
 
K
V
 
Q
P
 
P
L
 
S
G
 
L
R
 
Q
M
 
F
A
 
V
T
 
T
I
 
P
H
 
E
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
T
I
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
A
W
 
Q
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
T
T
 
T
I
 
V
P
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
x
W
T
 
T
A
 
A

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
36% identity, 93% coverage: 1:245/263 of query aligns to 4:244/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
V
 
M
Q
 
N
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
A
A
x
S
N
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
E
 
K
G
 
A
A
 
I
A
 
A
L
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
E
M
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
K
I
 
-
V
 
V
L
 
I
G
 
G
D
 
T
I
 
A
D
x
T
A
 
S
H
 
E
N
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
V
 
-
A
 
-
A
 
A
A
 
I
I
 
S
E
 
D
A
 
Y
I
 
L
G
 
G
R
 
D
R
 
N
A
 
G
A
 
K
F
 
G
R
 
M
P
 
A
A
 
L
D
x
N
M
x
V
M
 
T
Q
 
N
A
 
P
D
 
E
Q
 
S
A
 
I
R
 
E
A
 
A
L
 
V
V
 
L
D
 
K
F
 
A
A
 
I
A
 
T
A
 
D
E
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
G
x
I
V
 
T
R
 
R
P
 
D
R
 
N
A
 
L
F
 
L
L
 
M
D
 
R
Q
 
M
N
 
K
E
 
E
G
 
E
N
 
E
W
 
W
Q
 
S
R
 
D
V
 
I
T
 
M
D
 
E
L
 
T
N
 
N
F
 
L
T
 
T
S
 
S
M
 
I
L
 
F
A
 
R
A
 
L
T
 
S
Q
 
K
S
 
A
A
 
V
A
 
L
R
 
R
V
 
G
M
 
M
A
 
M
N
 
K
G
 
K
-
 
R
-
 
Q
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
|
V
A
 
G
S
|
S
T
 
V
E
 
V
A
 
G
L
 
T
R
 
M
A
 
G
A
 
N
P
 
A
G
 
G
F
 
Q
S
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
M
 
V
V
 
I
E
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
T
 
S
M
 
M
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
S
R
 
R
A
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
C
 
T
I
 
V
A
 
A
P
|
P
D
x
G
L
 
F
I
|
I
D
 
E
T
|
T
P
 
D
G
x
M
L
 
T
R
 
K
P
 
A
H
 
L
M
 
-
P
 
-
T
 
N
D
 
D
P
 
E
A
 
Q
R
 
R
I
 
T
A
 
A
A
 
T
R
 
L
D
 
-
R
 
A
H
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
G
T
 
D
I
 
P
H
 
R
E
 
E
A
 
I
G
 
A
S
 
S
V
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
P
A
 
E
A
 
A
S
 
A
W
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
T
 
T
I
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
M

1nfqA Rv2002 gene product from mycobacterium tuberculosis (see paper)
37% identity, 94% coverage: 2:247/263 of query aligns to 3:239/244 of 1nfqA

query
sites
1nfqA
Q
 
R
L
 
L
Q
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
S
A
 
G
G
 
G
A
 
A
N
x
R
G
|
G
I
x
M
G
 
G
E
 
A
G
 
S
A
 
H
A
 
V
L
 
R
A
 
A
L
 
M
A
 
V
G
 
A
M
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
I
 
V
V
 
V
L
 
F
G
 
G
D
|
D
I
 
I
D
x
L
A
 
D
H
 
E
N
 
E
G
 
G
A
 
K
R
 
A
V
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
E
I
 
L
E
 
A
A
 
D
I
 
A
G
 
A
R
 
R
R
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
Y
R
 
V
P
 
H
A
x
L
D
|
D
M
x
V
M
 
T
Q
 
Q
A
 
P
D
 
A
Q
 
Q
A
 
W
R
 
K
A
 
A
L
 
A
V
 
V
D
 
D
F
 
T
A
 
A
A
 
V
A
 
T
E
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
H
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
G
 
I
V
x
L
R
 
N
P
 
I
R
 
G
A
 
T
F
 
I
L
 
E
D
 
D
Q
 
Y
N
 
A
E
 
L
G
 
T
N
 
E
W
 
W
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
T
 
L
D
 
D
L
 
V
N
 
N
F
 
L
T
 
T
S
 
G
M
 
V
L
 
F
A
 
L
A
 
G
T
 
I
Q
 
R
S
 
A
A
 
V
A
 
V
R
 
K
V
 
P
M
 
M
-
 
K
-
 
E
A
 
A
N
 
G
G
 
R
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
E
|
E
A
 
G
L
 
L
R
 
A
A
 
G
A
 
T
P
 
V
G
 
A
F
x
C
S
 
H
V
 
G
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
C
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
M
 
V
V
 
R
E
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
T
 
S
M
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
P
R
 
S
A
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
S
I
 
I
A
 
H
P
|
P
D
 
G
L
 
L
I
x
V
D
 
K
T
|
T
P
|
P
G
 
-
L
x
M
R
x
T
P
 
D
H
 
W
M
x
V
P
 
P
T
 
E
D
 
D
P
x
I
A
x
F
R
 
Q
I
 
T
A
 
A
A
 
-
R
 
-
D
 
-
R
 
-
H
 
-
V
 
-
P
 
-
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
A
A
 
A
T
 
E
I
 
P
H
 
V
E
 
E
A
 
V
G
 
S
S
 
N
V
 
L
I
 
V
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
E
A
 
S
S
 
S
W
 
Y
V
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
E
I
 
F
P
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
T
T
 
V
A
 
A

1nffA Crystal structure of rv2002 gene product from mycobacterium tuberculosis (see paper)
37% identity, 94% coverage: 2:247/263 of query aligns to 3:239/244 of 1nffA

query
sites
1nffA
Q
 
R
L
 
L
Q
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
S
A
x
G
G
 
G
A
 
A
N
x
R
G
|
G
I
x
M
G
 
G
E
 
A
G
 
S
A
 
H
A
 
V
L
 
R
A
 
A
L
 
M
A
 
V
G
 
A
M
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
I
 
V
V
 
V
L
 
F
G
 
G
D
|
D
I
|
I
D
x
L
A
 
D
H
 
E
N
 
E
G
 
G
A
 
K
R
 
A
V
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
E
I
 
L
E
 
A
A
 
D
I
 
A
G
 
A
R
 
R
R
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
Y
R
 
V
P
 
H
A
x
L
D
|
D
M
x
V
M
 
T
Q
 
Q
A
 
P
D
 
A
Q
 
Q
A
 
W
R
 
K
A
 
A
L
 
A
V
 
V
D
 
D
F
 
T
A
 
A
A
 
V
A
 
T
E
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
H
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
G
x
I
V
 
L
R
 
N
P
 
I
R
 
G
A
 
T
F
 
I
L
 
E
D
 
D
Q
 
Y
N
 
A
E
 
L
G
 
T
N
 
E
W
 
W
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
T
 
L
D
 
D
L
 
V
N
 
N
F
 
L
T
 
T
S
 
G
M
 
V
L
 
F
A
 
L
A
 
G
T
 
I
Q
 
R
S
 
A
A
 
V
A
 
V
R
 
K
V
 
P
M
 
M
-
 
K
-
 
E
A
 
A
N
 
G
G
 
R
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
E
 
E
A
 
G
L
 
L
R
 
A
A
 
G
A
 
T
P
 
V
G
 
A
F
 
C
S
 
H
V
 
G
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
C
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
M
 
V
V
 
R
E
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
T
 
S
M
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
P
R
 
S
A
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
S
I
 
I
A
 
H
P
|
P
D
 
G
L
 
L
I
x
V
D
 
K
T
|
T
P
|
P
G
 
-
L
x
M
R
x
T
P
 
D
H
 
W
M
 
V
P
 
P
T
 
E
D
 
D
P
 
I
A
 
F
R
 
Q
I
 
T
A
 
A
A
 
-
R
 
-
D
 
-
R
 
-
H
 
-
V
 
-
P
 
-
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
A
A
 
A
T
 
E
I
 
P
H
 
V
E
 
E
A
 
V
G
 
S
S
 
N
V
 
L
I
 
V
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
E
A
 
S
S
 
S
W
 
Y
V
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
E
I
 
F
P
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
T
T
 
V
A
 
A

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
36% identity, 93% coverage: 1:245/263 of query aligns to 4:240/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
V
 
M
Q
 
N
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
A
A
x
S
N
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
K
G
 
A
A
 
I
A
 
A
L
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
E
M
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
K
I
 
-
V
 
V
L
 
I
G
 
G
D
 
T
I
 
A
D
x
T
A
 
S
H
 
E
N
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
V
 
-
A
 
-
A
 
A
A
 
I
I
 
S
E
 
D
A
 
Y
I
 
L
G
 
G
R
 
D
R
 
N
A
 
G
A
 
K
F
 
G
R
 
M
P
 
A
A
 
L
D
x
N
M
x
V
M
 
T
Q
 
N
A
 
P
D
 
E
Q
 
S
A
 
I
R
 
E
A
 
A
L
 
V
V
 
L
D
 
K
F
 
A
A
 
I
A
 
T
A
 
D
E
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
G
 
I
V
 
T
R
 
R
P
 
D
R
 
N
A
 
L
F
 
L
L
 
M
D
 
R
Q
 
M
N
 
K
E
 
E
G
 
E
N
 
E
W
 
W
Q
 
S
R
 
D
V
 
I
T
 
M
D
 
E
L
 
T
N
|
N
F
 
L
T
 
T
S
 
S
M
 
I
L
 
F
A
 
R
A
 
L
T
 
S
Q
 
K
S
 
A
A
 
V
A
 
L
R
 
R
V
 
G
M
 
M
A
 
M
N
 
K
G
 
K
-
 
R
-
 
Q
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
V
A
x
G
S
|
S
T
 
V
E
 
V
A
 
G
L
 
T
R
 
M
A
 
G
A
 
N
P
 
A
G
 
G
F
x
Q
S
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
M
 
V
V
 
I
E
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
T
 
S
M
 
M
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
S
R
 
R
A
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
C
 
T
I
 
V
A
 
A
P
|
P
D
x
G
L
 
F
I
 
I
D
 
E
T
|
T
P
 
D
G
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
H
 
-
M
 
-
P
 
M
T
 
N
D
 
D
P
 
E
A
 
Q
R
 
R
I
 
T
A
 
A
A
 
T
R
 
L
D
 
-
R
 
A
H
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
G
T
 
D
I
 
P
H
 
R
E
 
E
A
 
I
G
 
A
S
 
S
V
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
P
A
 
E
A
 
A
S
 
A
W
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
T
 
T
I
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
M

Query Sequence

>Ga0059261_2843 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_2843
VQLQGKVAVVTAGANGIGEGAALALAGMGADIVLGDIDAHNGARVAAAIEAIGRRAAFRP
ADMMQADQARALVDFAAAEFGRIDILVNNAGGVRPRAFLDQNEGNWQRVTDLNFTSMLAA
TQSAARVMANGGAIVNVASTEALRAAPGFSVYAACKAAMVEFTKTMALELAPRAIRVNCI
APDLIDTPGLRPHMPTDPARIAARDRHVPLGRMATIHEAGSVIAFLASPAASWVTGATIP
VDGGITAAGGWHRSETGNWQLAS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory