SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_2871 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_2871 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3ak4A Crystal structure of nadh-dependent quinuclidinone reductase from agrobacterium tumefaciens
42% identity, 97% coverage: 6:252/254 of query aligns to 5:257/258 of 3ak4A

query
sites
3ak4A
L
 
L
E
 
S
G
 
G
R
 
R
R
 
K
I
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
S
S
x
K
G
|
G
M
x
I
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
I
V
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
P
 
D
A
 
K
M
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
V
V
 
A
S
 
I
L
 
A
D
|
D
L
|
L
N
 
D
A
 
V
D
 
M
A
 
A
G
 
A
-
 
Q
A
 
A
R
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
G
-
 
L
E
 
E
A
 
N
G
 
G
A
 
G
T
 
F
F
 
A
L
 
V
A
 
E
V
|
V
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
K
K
 
R
A
 
A
S
 
S
V
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
T
 
M
N
 
Q
Q
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
L
D
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
V
 
L
L
 
L
I
 
C
H
 
A
A
x
N
A
|
A
G
|
G
I
 
V
A
 
S
P
 
T
G
 
M
A
 
R
P
 
P
A
 
A
E
 
V
S
 
D
I
 
I
P
 
T
P
 
D
E
 
E
Q
 
E
W
 
W
L
 
D
E
 
F
A
 
N
I
 
F
A
 
D
V
 
V
N
 
N
A
 
A
T
 
R
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
L
V
 
A
N
 
N
Q
 
Q
A
 
I
V
 
A
F
 
C
P
 
R
H
 
H
L
 
F
-
 
L
-
 
A
K
 
S
D
 
N
H
 
T
G
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
I
I
 
V
N
 
N
F
x
T
A
 
A
S
|
S
S
 
L
A
 
A
G
 
A
I
 
K
K
 
V
G
 
G
Y
 
A
P
 
P
G
 
L
K
x
L
A
 
A
A
 
H
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
F
A
 
A
V
 
V
V
 
F
A
 
G
W
 
W
V
 
T
R
 
Q
S
 
A
I
 
L
A
 
A
S
 
R
E
 
E
W
 
M
G
 
A
R
 
P
Y
 
K
N
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
C
P
 
P
-
x
G
T
 
F
I
x
V
W
 
K
T
|
T
P
 
A
M
|
M
Y
 
Q
D
 
E
K
 
R
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
W
-
x
E
-
 
A
T
 
E
R
 
L
S
 
R
S
 
G
M
 
M
S
 
T
T
 
P
D
 
E
Q
 
A
L
 
V
A
 
R
A
 
A
H
 
E
D
 
Y
A
 
V
A
 
S
L
 
L
K
 
T
V
 
-
A
 
-
I
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
P
L
 
L
G
 
G
D
 
R
I
 
I
R
 
E
-
 
E
-
 
P
R
 
E
D
 
D
L
 
V
V
 
A
P
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
A
A
 
A
H
 
R
F
 
F
M
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
G
I
 
I
P
 
N
V
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
V
L
 
R
M
 
M

7wbcA Hydroxysteroid dehydrogenase wild-type complexed with NAD+ and (4s)-2- 2-methyl-2,4-pentanediol
35% identity, 98% coverage: 6:254/254 of query aligns to 3:250/250 of 7wbcA

query
sites
7wbcA
L
 
L
E
 
R
G
 
G
R
 
K
R
 
T
I
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
 
G
G
|
G
M
x
I
G
 
G
A
 
R
G
 
A
L
 
V
V
 
T
R
 
R
A
 
V
L
 
F
P
 
V
A
 
R
M
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
L
S
 
F
L
 
V
D
|
D
L
x
V
N
 
D
A
 
D
D
 
D
A
 
R
G
 
G
A
 
R
R
 
A
V
 
L
A
 
E
G
 
S
E
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
G
A
 
A
G
 
G
-
 
G
-
 
E
A
 
A
T
 
K
F
 
F
L
 
L
A
 
Q
V
x
A
D
|
D
V
x
I
T
 
S
D
 
R
K
 
R
A
 
E
S
 
S
V
 
A
D
 
D
A
 
Q
A
 
I
T
 
R
N
 
D
Q
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
F
D
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
H
 
N
A
x
N
A
 
A
G
 
H
I
 
A
A
 
S
P
 
R
G
 
Q
A
 
A
P
 
L
A
 
L
E
 
V
S
 
E
I
 
H
P
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
M
W
 
F
L
 
E
E
 
L
A
 
S
I
 
F
A
 
G
V
 
T
N
 
G
A
 
F
T
x
Y
G
x
P
T
 
T
F
 
V
L
x
H
V
 
L
N
 
M
Q
 
Q
A
 
A
V
 
C
F
 
Y
P
 
P
H
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
Q
H
 
A
G
 
R
G
 
G
A
 
S
I
 
V
I
 
V
N
 
N
F
|
F
A
 
G
S
|
S
S
 
G
A
 
S
G
 
A
I
 
L
K
 
D
G
 
G
Y
 
M
P
 
P
G
 
T
K
 
Q
A
 
T
A
 
S
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
E
A
 
A
V
 
I
V
 
R
A
 
A
W
 
V
V
 
S
R
 
R
S
 
V
I
 
A
A
 
A
S
 
N
E
 
E
W
 
W
G
 
A
R
 
A
Y
 
D
N
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
A
 
C
P
|
P
T
 
-
I
 
-
W
 
-
T
 
-
P
 
-
M
 
-
Y
x
F
D
x
A
K
 
A
T
|
T
R
 
E
S
x
G
S
x
V
M
 
Q
S
 
A
T
 
W
D
 
Q
Q
 
Q
-
 
A
L
 
F
A
 
P
A
 
D
H
 
R
D
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
A
K
 
A
V
 
A
A
 
K
I
 
V
P
 
P
I
 
L
G
 
-
G
 
Q
K
 
R
L
 
I
G
 
G
D
 
D
I
 
P
R
 
E
R
 
T
D
 
D
L
 
I
V
 
A
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
D
A
 
S
H
 
K
F
 
Y
M
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
I
 
L
P
 
M
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
S
L
 
I
M
 
K
M
 
L
R
 
R

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
33% identity, 96% coverage: 6:249/254 of query aligns to 5:251/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
L
 
L
E
 
T
G
 
D
R
 
K
R
 
T
I
 
V
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
|
S
G
|
G
M
x
I
G
 
G
A
 
Y
G
 
A
L
 
A
V
 
V
R
 
Q
A
 
A
L
 
F
P
 
L
A
 
G
M
 
Q
G
 
Q
A
 
A
R
 
N
V
 
V
V
 
V
S
 
V
L
 
A
D
|
D
L
x
I
N
 
D
A
 
E
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
D
 
E
A
 
A
G
 
M
A
 
V
R
 
R
V
 
K
A
 
E
G
 
N
E
 
N
A
 
D
G
 
R
A
 
L
T
 
H
F
 
F
L
 
V
A
 
Q
V
x
T
D
 
D
V
x
I
T
 
T
D
 
D
K
 
E
A
 
A
S
 
A
V
 
C
D
 
Q
A
 
H
A
 
A
T
 
V
N
 
E
Q
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
H
A
 
T
L
 
F
D
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
I
H
 
N
A
x
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
A
 
E
P
 
I
G
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
I
E
 
H
S
 
E
I
 
M
P
 
E
P
 
L
E
 
S
Q
 
D
W
 
W
L
 
N
E
 
K
A
 
V
I
 
L
A
 
Q
V
 
V
N
 
N
A
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
M
F
 
F
L
 
L
V
 
M
N
 
S
Q
 
K
A
 
H
V
 
A
F
 
L
P
 
K
H
 
H
L
 
M
K
 
L
D
 
A
H
 
A
G
 
G
-
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
I
I
 
I
N
 
N
F
x
T
A
 
C
S
|
S
S
 
V
A
 
G
G
 
G
I
 
L
K
 
V
G
 
A
Y
 
W
P
 
P
G
 
D
K
 
I
A
 
P
A
 
A
Y
|
Y
A
 
N
A
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
V
V
 
L
A
 
Q
W
 
L
V
 
T
R
 
K
S
 
S
I
 
M
A
 
A
S
 
V
E
 
D
W
 
Y
G
 
A
R
 
K
Y
 
H
N
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
C
P
|
P
-
x
G
T
x
I
I
|
I
W
 
D
T
 
T
P
 
P
M
 
L
Y
 
N
D
 
E
K
 
K
T
 
S
-
 
F
-
 
L
-
 
E
R
 
N
S
 
N
S
 
E
M
 
G
S
 
T
T
 
L
D
 
E
Q
 
E
L
 
I
A
 
K
A
 
K
H
 
E
D
 
K
A
 
A
A
 
K
L
 
V
K
 
N
V
 
P
A
 
L
I
 
L
P
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
K
K
 
P
L
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
E
D
 
E
L
 
I
V
 
A
P
 
N
V
 
V
V
 
M
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
L
A
 
S
H
 
S
F
 
Y
M
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
I
 
A
I
 
I
P
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
34% identity, 97% coverage: 6:252/254 of query aligns to 5:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
L
 
L
E
 
Q
G
 
D
R
 
K
R
 
V
I
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
S
x
N
G
|
G
M
x
I
G
 
G
A
 
L
G
 
E
L
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
V
L
 
F
P
 
M
A
 
K
M
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
V
S
 
I
L
 
A
D
|
D
L
x
F
N
 
N
A
 
E
D
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
K
R
 
E
-
 
A
V
 
V
A
 
E
G
 
A
E
 
N
A
 
P
G
 
G
A
 
V
T
 
V
F
 
F
L
 
I
A
 
R
V
|
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
K
 
R
A
 
E
S
 
S
V
 
V
D
 
H
A
 
R
A
 
L
T
 
V
N
 
E
Q
 
N
A
 
V
V
 
A
A
 
E
A
 
R
L
 
F
D
 
G
G
 
K
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
I
H
 
N
A
x
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
A
 
T
P
 
R
G
x
D
A
 
S
P
 
M
A
 
L
E
 
S
S
x
K
I
 
M
P
 
T
P
 
V
E
 
D
Q
 
Q
W
 
F
L
 
Q
E
 
Q
A
 
V
I
 
I
A
 
N
V
 
V
N
|
N
A
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
H
V
 
C
N
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
F
 
L
P
 
P
H
 
Y
L
 
M
K
 
A
D
 
E
H
 
Q
G
 
G
-
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
F
x
T
A
 
S
S
|
S
S
 
V
A
 
T
G
 
G
I
 
T
K
 
Y
G
 
G
Y
x
N
P
x
V
G
 
G
K
x
Q
A
 
T
A
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
V
 
I
A
 
G
W
 
M
V
 
T
R
 
K
S
 
T
I
 
W
A
 
A
S
 
K
E
 
E
W
 
L
G
 
A
R
 
R
Y
 
K
N
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
T
 
G
I
x
F
W
 
-
T
 
-
P
 
-
M
 
-
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
T
|
T
R
 
E
S
x
T
S
 
A
M
|
M
S
 
V
T
 
A
D
 
E
Q
 
V
L
 
P
A
 
E
A
 
K
H
 
V
D
 
I
A
 
E
A
x
K
L
 
M
K
 
K
V
 
A
A
 
Q
I
 
V
P
 
P
I
 
M
G
 
-
G
 
G
K
 
R
L
 
L
G
 
G
D
 
K
I
 
-
R
 
P
R
 
E
D
 
D
L
 
I
V
 
A
P
 
N
V
 
A
V
 
Y
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
G
 
E
A
 
S
H
 
D
F
 
Y
M
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
H
I
 
V
I
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
I
L
 
M
M
 
M

1iy8A Crystal structure of levodione reductase (see paper)
32% identity, 95% coverage: 9:249/254 of query aligns to 5:253/258 of 1iy8A

query
sites
1iy8A
R
 
R
R
 
V
I
 
V
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
G
S
|
S
G
|
G
M
x
L
G
 
G
A
 
R
G
 
A
L
 
T
V
 
A
R
 
V
A
 
R
L
 
L
P
 
A
A
 
A
M
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
L
V
 
S
S
 
L
L
 
V
D
|
D
L
x
V
N
 
S
A
 
S
D
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
A
A
 
A
G
 
V
A
 
L
R
 
E
V
 
T
A
 
A
G
 
P
E
 
D
A
 
A
G
 
E
A
 
V
T
 
L
F
 
T
L
 
T
A
 
V
V
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
K
 
E
A
 
A
S
 
Q
V
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
Y
T
 
V
N
 
T
Q
 
A
A
 
T
V
 
T
A
 
E
A
 
R
L
 
F
D
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
G
L
 
F
I
 
F
H
 
N
A
x
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
A
 
E
-
 
G
P
 
K
G
 
Q
A
 
N
P
 
P
A
 
T
E
 
E
S
 
S
I
 
F
P
 
T
P
 
A
E
 
A
Q
 
E
W
 
F
L
 
D
E
 
K
A
 
V
I
 
V
A
 
S
V
 
I
N
 
N
A
 
L
T
 
R
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
L
V
 
G
N
 
L
Q
 
E
A
 
K
V
 
V
F
 
L
P
 
K
H
 
I
L
 
M
K
 
R
D
 
E
H
 
Q
G
 
G
-
 
S
G
 
G
A
 
M
I
 
V
I
 
V
N
 
N
F
x
T
A
 
A
S
|
S
S
 
V
A
 
G
G
 
G
I
 
I
K
 
R
G
 
G
Y
 
I
P
 
G
G
 
N
K
x
Q
A
 
S
A
 
G
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
H
A
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
G
W
 
L
V
 
T
R
 
R
S
 
N
I
 
S
A
 
A
S
 
V
E
 
E
W
 
Y
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
N
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
|
P
-
x
G
T
 
A
I
 
I
W
 
W
T
|
T
P
|
P
M
|
M
Y
 
V
D
 
E
K
 
N
T
 
S
R
 
M
S
 
K
S
 
Q
M
 
L
S
 
D
T
 
P
D
 
E
-
 
N
-
 
P
Q
 
R
L
 
K
A
 
A
A
 
A
H
 
E
D
 
E
A
 
F
A
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
I
A
 
Q
I
 
V
P
 
N
I
 
P
G
 
S
G
 
K
K
 
R
L
 
Y
G
 
G
D
 
E
I
 
A
R
 
-
R
 
P
D
 
E
L
 
I
V
 
A
P
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
D
A
 
A
H
 
S
F
 
Y
M
 
V
T
 
N
G
 
A
Q
 
T
I
 
V
I
 
V
P
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
33% identity, 95% coverage: 9:249/254 of query aligns to 14:262/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
R
 
R
R
 
V
I
 
V
I
x
L
V
x
I
T
|
T
G
|
G
G
|
G
A
x
G
S
|
S
G
|
G
M
x
L
G
|
G
A
x
R
G
x
A
L
x
T
V
x
A
R
x
V
A
x
R
L
|
L
P
x
A
A
|
A
M
x
E
G
|
G
A
|
A
R
x
K
V
x
L
V
x
S
S
x
L
L
 
V
D
 
D
L
 
V
N
 
S
A
 
S
D
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
A
A
 
A
G
 
V
A
 
L
R
 
E
V
 
T
A
 
A
G
 
P
E
 
D
A
 
A
G
 
E
A
 
V
T
 
L
F
 
T
L
 
T
A
 
V
V
 
A
D
 
D
V
 
V
T
 
S
D
 
D
K
 
E
A
 
A
S
 
Q
V
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
Y
T
 
V
N
 
T
Q
 
A
A
 
T
V
 
T
A
 
E
A
 
R
L
 
F
D
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
G
L
 
F
I
 
F
H
 
N
A
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
x
E
-
 
G
P
 
K
G
 
Q
A
 
N
P
 
P
A
 
T
E
 
E
S
 
S
I
 
F
P
 
T
P
 
A
E
 
A
Q
 
E
W
 
F
L
 
D
E
 
K
A
 
V
I
 
V
A
 
S
V
 
I
N
 
N
A
 
L
T
 
R
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
L
V
 
G
N
 
L
Q
 
E
A
 
K
V
 
V
F
 
L
P
 
K
H
 
I
L
 
M
K
 
R
D
 
E
H
 
Q
G
 
G
-
 
S
G
 
G
A
 
M
I
 
V
I
 
V
N
 
N
F
 
T
A
 
A
S
 
S
S
 
V
A
 
G
G
 
G
I
 
I
K
 
R
G
 
G
Y
 
I
P
 
G
G
 
N
K
 
Q
A
 
S
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
H
A
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
G
W
 
L
V
 
T
R
 
R
S
 
N
I
 
S
A
 
A
S
 
V
E
 
E
W
 
Y
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
N
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
-
 
G
T
 
A
I
 
I
W
 
W
T
 
T
P
 
P
M
 
M
Y
 
V
D
 
E
K
 
N
T
 
S
R
 
M
S
 
K
S
 
Q
M
 
L
S
 
-
T
 
-
D
 
D
Q
 
P
L
 
E
A
 
N
A
 
P
H
 
R
D
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
E
K
 
E
-
 
F
V
 
I
A
 
Q
I
 
V
P
 
N
I
 
P
G
 
S
G
 
K
K
 
R
L
 
Y
G
 
G
D
 
E
I
 
A
R
 
-
R
 
P
D
 
E
L
 
I
V
 
A
P
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
D
A
 
A
H
 
S
F
 
Y
M
 
V
T
 
N
G
 
A
Q
 
T
I
 
V
I
 
V
P
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

8cxaA Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from mycobacterium smegmatis with bound NAD
37% identity, 96% coverage: 6:249/254 of query aligns to 3:247/251 of 8cxaA

query
sites
8cxaA
L
 
L
E
 
A
G
 
N
R
 
R
R
 
V
I
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
S
x
Q
G
|
G
M
x
I
G
 
G
A
 
R
G
 
I
L
 
Y
V
 
A
R
 
E
A
 
R
L
 
F
P
 
A
A
 
E
M
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
V
 
V
S
 
V
L
 
A
D
|
D
L
 
I
N
 
N
A
 
E
D
 
P
A
 
K
G
 
A
A
 
T
R
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
S
E
 
S
-
 
I
-
 
T
-
 
S
-
 
L
-
 
G
A
 
G
G
 
R
A
 
A
T
 
I
F
 
A
L
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
K
 
V
A
 
E
S
 
S
V
 
V
D
 
N
A
 
R
A
 
M
T
 
V
N
 
D
Q
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
F
D
 
G
G
 
T
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
H
 
N
A
x
N
A
 
A
G
x
A
I
 
I
A
 
F
P
x
S
G
 
T
-
 
L
-
 
K
-
 
M
A
 
K
P
 
P
A
 
F
E
 
E
S
 
E
I
 
I
P
 
S
P
 
G
E
 
D
Q
 
E
W
 
W
L
 
D
E
 
K
A
 
L
I
 
F
A
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
A
T
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
V
 
C
N
 
C
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
F
 
S
P
 
P
H
 
V
L
 
M
-
 
R
K
 
K
D
 
N
H
 
Q
G
 
Y
G
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
F
x
I
A
x
S
S
|
S
S
 
S
A
 
V
G
 
V
I
 
V
K
 
T
G
 
G
Y
 
R
P
 
P
G
 
N
K
 
Y
A
 
A
A
 
H
Y
|
Y
A
 
I
A
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
W
A
 
A
W
 
L
V
 
T
R
 
H
S
 
A
I
 
L
A
 
A
S
 
T
E
 
E
W
 
M
G
 
G
R
 
T
Y
 
D
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
S
P
|
P
T
x
H
-
 
G
I
|
I
W
 
I
T
 
T
P
 
E
M
x
I
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
P
R
 
R
S
 
E
S
 
T
M
 
I
S
 
S
T
 
E
D
 
E
-
 
G
-
 
W
Q
 
R
L
 
R
A
 
N
A
 
L
H
 
E
D
 
E
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
K
 
K
V
 
-
A
 
-
I
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
R
L
 
K
G
 
G
D
 
D
I
 
A
R
 
-
R
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
V
P
 
G
V
 
I
V
 
L
A
 
L
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
E
A
 
S
H
 
K
F
 
F
M
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
I
 
V
P
 
A
V
 
L
D
 
D
G
 
A
G
 
G

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
34% identity, 96% coverage: 6:249/254 of query aligns to 3:242/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
L
 
I
E
 
Q
G
 
N
R
 
R
R
 
V
I
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
A
 
A
S
|
S
G
 
G
M
 
M
G
 
G
A
 
K
G
 
Q
L
 
T
V
 
A
R
 
L
A
 
R
L
 
F
P
 
A
A
 
E
M
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
V
 
V
S
 
I
L
 
N
D
|
D
L
 
I
N
 
D
A
 
A
D
 
E
A
 
K
G
 
V
A
 
R
R
 
A
V
 
T
A
 
V
G
 
D
E
 
E
A
 
F
G
 
S
A
 
A
T
 
R
F
 
G
L
 
H
A
 
R
V
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
A
D
|
D
V
x
I
T
 
G
D
 
N
K
 
K
A
 
A
S
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
A
 
M
T
 
V
N
 
K
Q
 
Q
A
 
T
V
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
F
D
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
H
 
N
A
x
N
A
 
A
G
 
G
I
 
M
A
 
E
P
 
R
G
 
A
A
 
G
P
 
A
A
 
L
E
 
R
S
 
K
I
 
L
P
 
S
P
 
E
E
 
A
Q
 
D
W
 
W
L
 
D
E
 
V
A
 
T
I
 
I
A
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
L
T
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
V
 
C
N
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
F
 
H
P
 
G
H
 
H
L
 
M
-
 
V
K
 
E
D
 
N
H
 
K
G
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
F
 
I
A
 
A
S
 
S
S
 
R
A
 
A
G
 
W
I
 
L
K
 
G
G
 
G
Y
 
-
P
 
A
G
 
G
K
 
Q
A
 
T
A
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
A
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
G
W
 
M
V
 
T
R
 
R
S
 
A
I
 
L
A
 
A
S
 
I
E
 
E
W
 
L
G
 
G
R
 
R
Y
 
A
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
-
 
G
T
 
L
I
 
I
W
 
H
T
 
T
P
 
P
M
 
M
Y
 
W
D
 
-
K
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
S
 
-
M
 
-
S
 
-
T
 
-
D
 
D
Q
 
E
L
 
L
A
 
P
A
 
E
H
 
K
D
 
D
A
 
Q
A
 
Q
L
 
F
K
 
L
V
 
L
A
 
S
I
 
R
P
 
Q
I
 
P
G
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
G
D
 
E
I
 
-
R
 
P
R
 
D
D
 
D
L
 
I
V
 
A
P
 
N
V
 
T
V
 
L
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
G
 
D
A
 
S
H
 
G
F
 
F
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
I
 
L
P
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
34% identity, 96% coverage: 6:249/254 of query aligns to 2:241/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
E
 
Q
G
 
N
R
 
R
R
 
V
I
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
A
 
A
S
 
S
G
 
G
M
|
M
G
 
G
A
 
K
G
 
Q
L
 
T
V
 
A
R
 
L
A
 
R
L
 
F
P
 
A
A
 
E
M
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
V
 
V
S
 
I
L
 
N
D
|
D
L
x
I
N
 
D
A
 
A
D
 
E
A
 
K
G
 
V
A
 
R
R
 
A
V
 
T
A
 
V
G
 
D
E
 
E
A
 
F
G
 
S
A
 
A
T
 
R
F
 
G
L
 
H
A
 
R
V
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
A
D
 
D
V
x
I
T
 
G
D
 
N
K
 
K
A
 
A
S
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
A
 
M
T
 
V
N
 
K
Q
 
Q
A
 
T
V
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
F
D
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
H
 
N
A
x
N
A
 
A
G
|
G
I
 
M
A
 
E
P
 
R
G
 
A
A
 
G
P
 
A
A
 
L
E
 
R
S
 
K
I
 
L
P
 
S
P
 
E
E
 
A
Q
 
D
W
 
W
L
 
D
E
 
V
A
 
T
I
 
I
A
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
L
T
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
V
 
C
N
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
F
 
H
P
 
G
H
 
H
L
 
M
-
 
V
K
 
E
D
 
N
H
 
K
G
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
F
x
I
A
 
A
S
|
S
S
 
R
A
 
A
G
 
W
I
 
L
K
 
G
G
 
G
Y
 
-
P
 
A
G
 
G
K
 
Q
A
 
T
A
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
A
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
G
W
 
M
V
 
T
R
 
R
S
 
A
I
 
L
A
 
A
S
 
I
E
 
E
W
 
L
G
 
G
R
 
R
Y
 
A
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
-
 
G
T
 
L
I
|
I
W
 
H
T
 
T
P
 
P
M
 
M
Y
 
W
D
 
-
K
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
S
 
-
M
 
-
S
 
-
T
 
-
D
 
D
Q
 
E
L
 
L
A
 
P
A
 
E
H
 
K
D
 
D
A
 
Q
A
 
Q
L
 
F
K
 
L
V
 
L
A
 
S
I
 
R
P
 
Q
I
 
P
G
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
G
D
 
E
I
 
-
R
 
P
R
 
D
D
 
D
L
 
I
V
 
A
P
 
N
V
 
T
V
 
L
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
G
 
D
A
 
S
H
 
G
F
 
F
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
I
 
L
P
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

3rwbA Crystal structure of complex of 4pal (4-pyridoxolactone) and pldh (tetrameric pyridoxal 4-dehydrogenase) from mesorhizobium loti
34% identity, 98% coverage: 6:254/254 of query aligns to 4:246/247 of 3rwbA

query
sites
3rwbA
L
 
L
E
 
A
G
 
G
R
 
K
R
 
T
I
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
S
x
Q
G
|
G
M
x
I
G
 
G
A
 
K
G
 
A
L
 
I
V
 
A
R
 
A
A
 
R
L
 
L
P
 
A
A
 
A
M
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
V
V
 
I
S
 
V
L
 
S
D
|
D
L
x
I
N
 
N
A
 
A
D
 
E
A
 
G
G
 
A
A
 
K
R
 
A
V
 
A
A
 
A
G
 
A
E
 
S
A
 
I
G
 
G
-
 
K
-
 
K
A
 
A
T
 
R
F
 
A
L
 
I
A
 
A
V
 
A
D
|
D
V
x
I
T
 
S
D
 
D
K
 
P
A
 
G
S
 
S
V
 
V
D
 
K
A
 
A
A
 
L
T
 
F
N
 
A
Q
 
E
A
 
I
V
 
Q
A
 
A
A
 
L
L
 
T
D
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
H
 
N
A
x
N
A
|
A
G
x
S
I
 
I
A
 
V
P
 
P
G
 
F
A
 
V
P
 
A
A
 
W
E
 
D
S
 
D
I
 
V
P
 
D
P
 
L
E
 
D
Q
 
H
W
 
W
L
 
R
E
 
K
A
 
I
I
 
I
A
 
D
V
 
V
N
 
N
A
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
I
V
 
V
N
 
T
Q
 
R
A
 
A
V
 
G
F
 
T
P
 
D
H
 
Q
L
 
M
K
 
R
D
 
A
H
 
A
G
 
G
-
 
K
-
 
A
G
 
G
A
 
R
I
 
V
I
 
I
N
 
S
F
x
I
A
 
A
S
|
S
S
x
N
A
x
T
G
 
F
I
 
F
K
 
A
G
 
G
Y
 
T
P
 
P
G
 
N
K
x
M
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
V
V
 
I
A
 
G
W
 
F
V
 
T
R
 
R
S
 
A
I
 
L
A
 
A
S
 
T
E
 
E
W
 
L
G
 
G
R
 
K
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
R
 
T
V
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
T
P
|
P
T
 
G
I
x
L
W
 
-
T
 
-
P
 
-
M
 
-
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
S
 
-
M
x
I
S
 
E
T
x
S
D
 
D
Q
x
G
L
x
V
A
 
K
A
 
A
-
 
S
-
 
P
H
|
H
D
 
N
A
 
E
A
 
A
L
 
F
K
 
G
V
 
F
A
 
V
I
 
E
P
 
M
I
 
L
G
 
Q
G
 
A
K
 
M
L
 
K
G
 
G
D
 
K
I
 
G
R
 
Q
-
 
P
R
 
E
D
 
H
L
 
I
V
 
A
P
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
D
A
 
A
H
 
R
F
 
W
M
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
I
 
L
P
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
A
G
 
G
A
 
-
L
 
-
M
 
M
M
 
V
R
 
R

3ndrA Crystal structure of tetrameric pyridoxal 4-dehydrogenase from mesorhizobium loti
34% identity, 98% coverage: 6:254/254 of query aligns to 4:246/247 of 3ndrA

query
sites
3ndrA
L
 
L
E
 
A
G
 
G
R
 
K
R
 
T
I
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
S
x
Q
G
|
G
M
x
I
G
 
G
A
 
K
G
 
A
L
 
I
V
 
A
R
 
A
A
 
R
L
 
L
P
 
A
A
 
A
M
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
V
V
 
I
S
 
V
L
 
S
D
|
D
L
x
I
N
 
N
A
 
A
D
 
E
A
 
G
G
 
A
A
 
K
R
 
A
V
 
A
A
 
A
G
 
A
E
 
S
A
 
I
G
 
G
-
 
K
-
 
K
A
 
A
T
 
R
F
 
A
L
 
I
A
 
A
V
 
A
D
|
D
V
x
I
T
 
S
D
 
D
K
 
P
A
 
G
S
 
S
V
 
V
D
 
K
A
 
A
A
 
L
T
 
F
N
 
A
Q
 
E
A
 
I
V
 
Q
A
 
A
A
 
L
L
 
T
D
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
H
 
N
A
x
N
A
|
A
G
x
S
I
 
I
A
 
V
P
 
P
G
 
F
A
 
V
P
 
A
A
 
W
E
 
D
S
 
D
I
 
V
P
 
D
P
 
L
E
 
D
Q
 
H
W
 
W
L
 
R
E
 
K
A
 
I
I
 
I
A
 
D
V
|
V
N
 
N
A
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
I
V
 
V
N
 
T
Q
 
R
A
 
A
V
 
G
F
 
T
P
 
D
H
 
Q
L
 
M
K
 
R
D
 
A
H
 
A
G
 
G
-
 
K
-
 
A
G
 
G
A
 
R
I
 
V
I
 
I
N
 
S
F
x
I
A
 
A
S
|
S
S
 
N
A
 
T
G
 
F
I
 
F
K
 
A
G
 
G
Y
 
T
P
 
P
G
 
N
K
 
M
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
V
V
 
I
A
 
G
W
 
F
V
 
T
R
 
R
S
 
A
I
 
L
A
 
A
S
 
T
E
 
E
W
 
L
G
 
G
R
 
K
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
R
 
T
V
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
T
P
|
P
T
 
G
I
x
L
W
 
-
T
 
-
P
 
-
M
 
-
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
S
 
-
M
x
I
S
 
E
T
x
S
D
 
D
Q
x
G
L
x
V
A
 
K
A
 
A
-
 
S
-
 
P
H
 
H
D
 
N
A
 
E
A
 
A
L
 
F
K
 
G
V
 
F
A
 
V
I
 
E
P
 
M
I
 
L
G
 
Q
G
 
A
K
 
M
L
 
K
G
 
G
D
 
K
I
 
G
R
 
Q
-
 
P
R
 
E
D
 
H
L
 
I
V
 
A
P
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
D
A
 
A
H
 
R
F
 
W
M
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
I
 
L
P
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
A
G
 
G
A
 
-
L
 
-
M
 
M
M
 
V
R
 
R

5u9pB Crystal structure of a gluconate 5-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia j2315 in complex with NADP and tartrate
36% identity, 97% coverage: 3:249/254 of query aligns to 10:256/261 of 5u9pB

query
sites
5u9pB
D
 
D
R
 
R
M
 
F
-
 
R
L
 
L
E
 
D
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
A
 
G
S
x
R
G
|
G
M
x
I
G
 
G
A
 
L
G
 
T
L
 
L
V
 
A
R
 
R
A
 
G
L
 
L
P
 
A
A
 
E
M
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
I
V
 
V
S
 
I
L
 
N
D
 
D
L
x
R
N
 
N
A
 
E
D
 
E
A
 
K
G
 
A
A
 
A
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
R
R
 
R
V
 
F
A
 
R
G
 
D
E
 
E
A
 
G
G
 
F
A
 
A
T
 
A
F
 
D
L
 
H
A
 
A
V
 
V
-
 
F
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
E
K
 
H
A
 
A
S
 
Q
V
 
V
D
 
R
A
 
A
A
 
A
T
 
I
N
 
D
Q
 
E
A
 
F
V
 
E
A
 
A
A
 
R
L
 
V
D
 
G
G
 
A
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
H
 
N
A
x
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
 
Q
P
 
R
G
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
L
E
 
D
S
 
A
I
 
F
P
 
E
P
 
P
E
 
D
Q
 
D
W
 
W
L
 
H
E
 
A
A
 
L
I
 
M
A
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
L
T
 
D
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
N
V
 
V
N
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
F
 
A
P
 
R
H
 
H
L
 
M
K
 
I
D
 
A
H
 
R
G
 
G
-
 
H
G
 
G
A
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
F
x
I
A
 
C
S
|
S
S
 
V
A
 
Q
G
 
S
I
 
E
K
 
L
G
 
A
Y
 
R
P
 
P
G
 
T
K
 
I
A
 
A
A
 
P
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
T
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
R
A
 
M
W
 
L
V
 
T
R
 
K
S
 
G
I
 
M
A
 
C
S
 
A
E
 
D
W
 
W
G
 
A
R
 
R
Y
 
Y
N
 
G
I
 
I
R
 
Q
V
 
A
N
 
N
A
 
G
I
 
L
A
 
A
P
|
P
T
 
G
I
 
-
W
 
-
T
 
-
P
 
-
M
 
-
Y
 
Y
D
x
F
K
 
E
T
|
T
R
 
E
S
x
L
S
x
N
M
 
R
S
 
A
T
 
L
D
 
V
Q
 
D
L
 
D
A
 
A
A
 
A
H
 
F
D
 
S
A
 
D
A
 
W
L
 
L
K
 
C
V
 
K
A
 
R
I
 
T
P
 
P
I
 
-
G
 
A
G
 
G
K
 
R
L
 
W
G
 
G
D
 
Q
I
 
V
R
 
-
R
 
D
D
 
E
L
 
L
V
 
C
P
 
G
V
 
A
V
 
A
A
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
A
G
 
A
A
 
S
H
 
D
F
 
F
M
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
I
 
L
P
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6qheA Alcohol dehydrogenase from arthrobacter sp. Ts-15 in complex with NAD+
37% identity, 96% coverage: 6:248/254 of query aligns to 5:252/261 of 6qheA

query
sites
6qheA
L
 
M
E
 
R
G
 
N
R
 
R
R
 
V
I
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
x
M
G
|
G
M
|
M
G
 
G
A
 
N
G
 
G
L
 
C
V
 
A
R
 
R
A
 
K
L
 
L
P
 
A
A
 
E
M
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
Y
S
 
L
L
 
I
D
|
D
L
x
R
N
 
S
-
 
N
-
 
L
A
 
V
D
 
A
A
 
A
G
 
A
A
 
A
R
 
Q
V
 
D
A
 
M
G
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
-
 
L
-
 
N
A
 
A
T
 
N
F
 
H
L
 
V
A
 
Q
V
 
V
D
|
D
V
x
I
T
 
T
D
 
D
K
 
Q
A
 
E
S
 
S
V
 
L
D
 
T
A
 
S
A
 
A
T
 
Y
N
 
D
Q
 
G
A
 
I
V
 
A
A
 
A
A
 
E
L
 
S
D
 
G
G
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
H
 
N
A
|
A
A
|
A
G
 
G
I
 
V
A
 
G
P
 
D
G
 
S
A
 
R
P
 
M
A
 
F
E
 
L
S
 
D
I
 
V
P
 
D
P
 
D
E
 
A
Q
 
H
W
 
Y
L
 
K
E
 
K
A
 
V
I
 
I
A
 
D
V
 
V
N
 
N
A
 
V
T
 
R
G
 
G
T
 
T
F
 
W
L
 
N
V
 
S
N
 
C
Q
 
R
A
 
A
V
 
A
F
 
V
P
 
P
H
 
H
-
 
M
L
 
L
K
 
S
D
 
N
H
 
K
G
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
F
 
F
A
 
G
S
|
S
S
 
I
A
 
S
G
 
G
-
 
P
I
 
I
K
 
V
G
 
A
Y
 
D
P
 
P
G
 
G
K
 
W
A
 
T
A
 
V
Y
|
Y
A
 
A
A
 
L
A
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
F
A
 
G
W
 
F
V
 
T
R
 
K
S
 
A
I
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
E
W
 
F
G
 
A
R
 
G
Y
 
Q
N
 
N
I
 
I
R
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
L
P
|
P
-
x
G
T
 
S
I
x
M
W
 
D
T
|
T
P
|
P
M
|
M
Y
 
M
D
 
R
K
 
A
T
 
A
R
 
A
S
 
A
S
 
D
M
 
T
S
 
N
T
 
P
D
 
A
Q
 
D
L
 
P
A
 
Q
A
 
S
H
 
V
D
 
I
A
 
D
A
 
E
L
 
I
K
 
A
V
 
A
A
 
A
I
 
V
P
 
P
I
 
L
G
 
-
G
 
K
K
 
R
L
 
L
G
 
G
D
 
T
I
 
I
R
 
-
R
 
D
D
 
D
L
 
A
V
 
G
P
 
N
V
 
L
V
 
A
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
L
A
 
A
H
 
S
F
 
Y
M
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
I
 
I
P
 
V
V
 
L
D
 
D
G
 
G

3pk0B Crystal structure of short-chain dehydrogenase/reductase sdr from mycobacterium smegmatis (see paper)
35% identity, 97% coverage: 6:252/254 of query aligns to 8:253/262 of 3pk0B

query
sites
3pk0B
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
R
 
S
I
 
V
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
T
S
 
K
G
|
G
M
 
I
G
 
G
A
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
A
R
 
T
A
 
V
L
 
F
P
 
A
A
 
R
M
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
N
V
 
V
-
 
A
V
 
V
S
 
A
L
 
G
D
 
R
L
 
S
N
 
T
A
 
A
D
 
D
A
 
I
G
 
D
A
 
A
R
 
C
V
 
V
A
 
A
-
 
D
-
 
L
-
x
D
-
 
Q
-
 
L
G
|
G
E
 
S
A
x
G
G
 
K
A
 
V
T
 
I
F
 
G
L
 
V
A
 
Q
V
 
T
D
 
D
V
 
V
T
 
S
D
 
D
K
 
R
A
 
A
S
 
Q
V
 
C
D
 
D
A
 
A
A
 
L
T
 
A
N
 
G
Q
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
E
L
 
F
D
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
V
I
 
C
H
 
A
A
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
F
P
 
P
G
 
D
A
 
A
P
 
P
A
 
L
E
 
A
S
 
T
I
 
M
P
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
W
 
L
L
 
N
E
 
G
A
 
I
I
 
F
A
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
V
T
 
N
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
Y
V
 
A
N
 
V
Q
 
Q
A
 
A
V
 
C
F
 
L
P
 
D
H
 
A
L
 
L
K
 
I
D
 
A
H
 
S
G
 
G
G
 
S
A
 
G
I
 
R
I
 
V
N
 
V
F
 
L
A
 
T
S
 
S
S
|
S
-
 
I
-
 
T
A
 
G
G
 
P
I
 
I
K
 
T
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
x
W
A
 
S
A
 
H
Y
|
Y
A
 
G
A
 
A
A
 
T
K
|
K
G
 
A
A
 
A
V
 
Q
V
 
L
A
 
G
W
 
F
V
 
M
R
 
R
S
 
T
I
 
A
A
 
A
S
 
I
E
 
E
W
 
L
G
 
A
R
 
P
Y
 
H
N
 
K
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
M
P
 
P
T
 
-
I
 
-
W
 
-
T
 
-
P
 
-
M
 
-
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
G
S
 
N
M
 
I
S
 
M
T
 
T
D
 
E
Q
 
G
L
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
N
-
 
G
A
 
E
A
 
E
H
 
Y
D
 
I
A
 
A
A
 
S
L
 
M
K
 
A
V
 
R
A
 
S
I
 
I
P
 
P
I
 
-
G
 
A
G
 
G
K
 
A
L
 
L
G
 
G
D
 
-
I
 
T
R
 
P
R
 
E
D
 
D
L
 
I
V
 
G
P
 
H
V
 
L
V
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
T
D
 
K
G
 
E
A
 
A
H
 
G
F
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
I
 
I
P
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
Q
L
 
V
M
 
L

P9WGT1 3-alpha-(or 20-beta)-hydroxysteroid dehydrogenase; NADH-dependent 3alpha, 20beta-hydroxysteroid dehydrogenase; EC 1.1.1.53 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
36% identity, 99% coverage: 1:251/254 of query aligns to 1:239/260 of P9WGT1

query
sites
P9WGT1
M
 
M
A
 
S
D
 
G
R
 
R
M
 
L
L
x
I
E
 
-
G
 
G
R
 
K
R
 
V
I
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
x
R
G
|
G
M
|
M
G
 
G
A
 
A
G
 
S
L
 
H
V
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
M
P
 
V
A
 
A
M
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
V
S
 
F
L
 
G
D
|
D
L
 
I
N
 
L
A
 
D
D
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
K
R
 
A
V
|
V
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
L
G
 
A
A
 
D
T
 
A
-
 
A
-
 
R
F
 
Y
L
 
V
A
 
H
V
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
Q
K
 
P
A
 
A
S
 
Q
V
 
W
D
x
T
A
 
A
A
 
A
T
 
V
N
 
D
Q
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
F
D
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
H
V
 
V
L
 
L
I
 
V
H
 
N
A
x
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
L
P
 
N
G
 
I
A
 
G
P
 
T
A
 
I
E
 
E
S
 
D
I
 
Y
P
 
A
P
 
L
E
 
T
Q
 
E
W
 
W
L
 
Q
E
 
R
A
 
I
I
 
L
A
 
D
V
 
V
N
 
N
A
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
L
V
 
G
N
 
I
Q
 
R
A
 
A
V
 
V
F
 
V
P
 
K
H
 
P
L
 
M
K
 
K
D
 
E
H
 
A
G
 
G
-
 
R
G
 
G
A
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
F
 
I
A
 
S
S
|
S
S
 
I
A
 
E
G
 
G
I
 
L
K
 
A
G
 
G
Y
 
T
P
 
V
G
 
A
K
 
C
A
 
H
A
 
G
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
A
 
T
K
|
K
G
 
F
A
 
A
V
 
V
V
 
R
A
 
G
W
 
L
V
 
T
R
 
K
S
 
S
I
 
T
A
 
A
S
 
L
E
 
E
W
 
L
G
 
G
R
 
P
Y
 
S
N
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
I
A
 
H
P
|
P
-
x
G
T
x
L
I
x
V
W
x
K
T
|
T
P
|
P
M
|
M
Y
x
T
D
 
D
K
 
W
T
 
V
R
 
P
S
 
E
S
 
D
M
 
I
S
 
F
T
 
Q
D
 
T
Q
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
-
H
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
K
 
R
V
 
A
A
 
A
I
 
E
P
 
P
I
 
V
G
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
-
D
 
E
L
 
V
V
 
S
P
 
N
V
 
L
V
 
V
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
E
A
 
S
H
 
S
F
 
Y
M
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
I
 
E
I
 
F
P
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
T
L
 
V

4ituA Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) bound to s-hpc and nadh (see paper)
37% identity, 86% coverage: 32:249/254 of query aligns to 29:249/253 of 4ituA

query
sites
4ituA
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
A
S
 
L
L
 
I
D
|
D
L
|
L
N
 
D
A
 
Q
D
 
G
A
 
L
G
 
A
A
 
E
R
 
R
V
 
S
A
 
A
-
 
A
-
 
M
-
 
L
-
 
S
-
 
T
G
 
G
E
 
G
A
 
A
G
 
V
A
 
A
T
 
K
F
 
G
L
 
F
A
 
G
V
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
K
K
 
A
A
 
A
S
 
D
V
 
I
D
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
I
N
 
T
Q
 
S
A
 
A
V
 
E
A
 
Q
A
 
T
L
 
I
D
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
T
V
 
G
L
 
L
I
 
V
H
 
N
A
x
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
P
 
G
G
 
F
A
 
G
P
 
S
A
 
V
E
 
H
S
 
D
I
 
A
P
 
D
P
 
A
E
 
A
Q
 
A
W
 
W
L
 
D
E
 
R
A
 
I
I
 
M
A
 
A
V
|
V
N
|
N
A
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
V
 
A
N
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
A
F
 
L
P
 
A
-
 
G
H
 
M
L
 
L
K
 
E
D
 
R
H
 
H
G
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
I
I
 
V
N
 
N
F
|
F
A
 
G
S
|
S
S
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
L
K
 
V
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
G
 
T
K
 
M
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
A
 
N
W
 
L
V
 
T
R
 
R
S
 
Q
I
 
M
A
 
A
S
 
A
E
 
D
W
 
Y
G
 
S
R
 
G
Y
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
C
P
|
P
-
 
G
-
x
T
T
x
V
I
 
T
W
 
S
T
|
T
P
 
G
M
|
M
Y
 
G
D
 
Q
K
 
Q
T
 
L
R
 
L
S
 
G
S
 
S
M
 
D
S
 
T
T
 
S
D
 
P
Q
 
E
L
 
V
A
 
Q
A
 
A
H
 
R
D
x
R
A
 
L
A
 
A
L
 
-
K
 
-
V
 
-
A
 
K
I
x
Y
P
 
P
I
 
I
G
 
-
G
 
G
K
 
R
L
 
F
G
 
G
D
 
-
I
 
T
R
 
P
R
 
E
D
 
D
L
 
I
V
 
A
P
 
E
V
 
A
V
 
V
A
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
Q
A
 
A
H
 
A
F
 
F
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
I
 
A
I
 
F
P
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

A7IQH5 2-(S)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase 3; S-HPCDH 3; 2-[(S)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase 3; Aliphatic epoxide carboxylation component IV; Epoxide carboxylase component IV; SHPCDH3; EC 1.1.1.269 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 2 papers)
37% identity, 86% coverage: 32:249/254 of query aligns to 31:251/255 of A7IQH5

query
sites
A7IQH5
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
A
S
 
L
L
 
I
D
|
D
L
 
L
N
 
D
A
 
Q
D
 
G
A
 
L
G
 
A
A
 
E
R
 
R
V
 
S
A
 
A
-
 
A
-
 
M
-
 
L
-
 
S
-
 
T
G
 
G
E
 
G
A
 
A
G
 
V
A
 
A
T
 
K
F
 
G
L
 
F
A
 
G
V
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
K
K
 
A
A
 
A
S
 
D
V
 
I
D
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
I
N
 
T
Q
 
S
A
 
A
V
 
E
A
 
Q
A
 
T
L
 
I
D
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
T
V
 
G
L
 
L
I
 
V
H
 
N
A
x
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
P
 
G
G
 
F
A
 
G
P
 
S
A
 
V
E
 
H
S
 
D
I
 
A
P
 
D
P
 
A
E
 
A
Q
 
A
W
 
W
L
 
D
E
 
R
A
 
I
I
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
V
 
A
N
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
A
F
 
L
P
 
A
-
 
G
H
 
M
L
 
L
K
 
E
D
 
R
H
 
H
G
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
I
I
 
V
N
 
N
F
 
F
A
 
G
S
|
S
S
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
L
K
 
V
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
G
 
T
K
 
M
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
A
 
N
W
 
L
V
 
T
R
 
R
S
 
Q
I
 
M
A
 
A
S
 
A
E
 
D
W
 
Y
G
 
S
R
 
G
Y
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
C
P
 
P
-
 
G
-
x
T
T
x
V
I
x
T
W
x
S
T
|
T
P
x
G
M
 
M
Y
 
G
D
 
Q
K
 
Q
T
 
L
R
 
L
S
 
G
S
 
S
M
 
D
S
 
T
T
 
S
D
 
P
Q
 
E
L
 
V
A
 
Q
A
 
A
H
 
R
D
x
R
A
 
L
A
 
A
L
 
-
K
 
-
V
 
-
A
x
K
I
x
Y
P
 
P
I
 
I
G
 
-
G
 
G
K
 
R
L
 
F
G
 
G
D
 
-
I
 
T
R
 
P
R
 
E
D
 
D
L
 
I
V
 
A
P
 
E
V
 
A
V
 
V
A
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
Q
A
 
A
H
 
A
F
 
F
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
I
 
A
I
 
F
P
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4gh5A Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) (see paper)
37% identity, 86% coverage: 32:249/254 of query aligns to 29:244/248 of 4gh5A

query
sites
4gh5A
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
A
S
 
L
L
 
I
D
|
D
L
|
L
N
 
D
A
 
Q
D
 
G
A
 
L
G
 
A
A
 
E
R
 
R
V
 
S
A
 
A
-
 
A
-
 
M
-
 
L
-
 
S
-
 
T
G
 
G
E
 
G
A
 
A
G
 
V
A
 
A
T
 
K
F
 
G
L
 
F
A
 
G
V
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
K
K
 
A
A
 
A
S
 
D
V
 
I
D
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
I
N
 
T
Q
 
S
A
 
A
V
 
E
A
 
Q
A
 
T
L
 
I
D
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
T
V
 
G
L
 
L
I
 
V
H
 
N
A
x
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
P
 
G
G
 
F
A
 
G
P
 
S
A
 
V
E
 
H
S
 
D
I
 
A
P
 
D
P
 
A
E
 
A
Q
 
A
W
 
W
L
 
D
E
 
R
A
 
I
I
 
M
A
 
A
V
|
V
N
|
N
A
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
V
 
A
N
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
A
F
 
L
P
 
A
-
 
G
H
 
M
L
 
L
K
 
E
D
 
R
H
 
H
G
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
I
I
 
V
N
 
N
F
|
F
A
 
G
S
|
S
S
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
L
K
 
V
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
G
 
T
K
 
M
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
A
 
N
W
 
L
V
 
T
R
 
R
S
 
Q
I
 
M
A
 
A
S
 
A
E
 
D
W
 
Y
G
 
S
R
 
G
Y
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
C
P
|
P
T
 
G
I
 
T
W
x
V
T
 
T
P
 
S
M
 
-
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
R
 
-
S
x
T
S
x
G
M
|
M
S
 
G
T
 
Q
D
 
Q
Q
 
L
L
 
L
A
 
P
A
 
E
H
 
V
D
 
Q
A
 
A
A
 
R
L
 
R
K
 
L
V
 
A
A
 
K
I
 
Y
P
 
P
I
 
I
G
 
-
G
 
G
K
 
R
L
 
F
G
 
G
D
 
-
I
 
T
R
 
P
R
 
E
D
 
D
L
 
I
V
 
A
P
 
E
V
 
A
V
 
V
A
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
Q
A
 
A
H
 
A
F
 
F
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
I
 
A
I
 
F
P
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5jy1A Crystal structure of putative short-chain dehydrogenase/reductase from burkholderia xenovorans lb400 bound to NAD
34% identity, 96% coverage: 5:249/254 of query aligns to 3:248/266 of 5jy1A

query
sites
5jy1A
M
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
Q
R
 
R
R
 
V
I
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
G
S
 
G
G
|
G
M
x
I
G
 
G
A
 
R
G
 
G
L
 
V
V
 
A
R
 
R
A
 
S
L
 
F
P
 
G
A
 
N
M
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
V
 
I
S
 
I
L
 
A
D
x
E
L
x
I
N
 
N
A
 
E
D
 
S
A
 
T
G
 
G
A
 
R
R
 
Q
V
 
V
A
 
E
G
 
Q
E
 
E
-
 
I
-
 
R
-
 
E
-
 
M
-
 
G
A
 
G
G
 
R
A
 
S
T
 
L
F
 
F
L
 
V
A
 
K
V
x
T
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
S
K
 
K
A
 
A
S
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
V
N
 
R
Q
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
Q
L
 
F
D
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
H
 
N
A
x
N
A
|
A
G
x
F
I
x
V
-
 
P
A
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
V
P
 
L
A
 
L
E
 
E
S
 
E
I
 
K
P
 
T
P
 
D
E
 
E
Q
 
M
W
 
L
L
 
E
E
 
Q
A
 
T
I
 
L
A
 
T
V
 
T
N
 
S
A
 
L
T
 
W
G
 
A
T
 
T
F
 
W
L
 
W
V
 
A
N
 
M
Q
 
R
A
 
A
V
 
A
F
 
F
-
 
V
P
 
P
H
 
M
L
 
R
K
 
E
D
 
R
H
 
R
G
 
W
G
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
F
 
F
A
 
Y
S
|
S
S
 
I
A
 
D
G
 
T
I
 
E
K
 
T
G
 
G
Y
 
A
P
 
W
G
 
L
K
x
H
A
 
G
A
 
D
Y
|
Y
A
 
N
A
 
T
A
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
I
V
 
V
A
 
G
W
 
L
V
 
T
R
 
R
S
 
S
I
 
A
A
 
A
S
 
S
E
 
E
W
 
W
G
 
G
R
 
R
Y
 
F
N
 
N
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
|
P
T
|
T
I
x
A
W
 
M
T
 
G
P
x
A
M
 
T
Y
 
F
D
 
F
K
 
E
T
 
L
R
 
-
S
 
-
S
 
A
M
 
A
S
 
K
T
 
N
D
x
P
Q
 
E
L
 
F
A
 
A
A
 
E
H
 
R
D
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
-
K
 
-
V
 
-
A
 
A
I
 
R
P
 
P
I
 
L
G
 
-
G
 
G
K
 
R
L
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
P
R
 
E
R
 
Q
D
 
D
L
 
I
V
 
G
P
 
P
V
 
A
V
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
A
S
 
S
D
 
E
G
 
M
A
 
S
H
 
R
F
 
F
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
I
 
T
I
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6b9uA Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from brucella melitensis complexed with nadh
33% identity, 96% coverage: 6:249/254 of query aligns to 2:241/244 of 6b9uA

query
sites
6b9uA
L
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
K
R
 
V
I
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
G
S
|
S
G
|
G
M
x
F
G
 
G
A
 
E
G
 
G
L
 
M
V
 
A
R
 
K
A
 
R
L
 
F
P
 
A
A
 
K
M
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
V
S
 
I
L
 
V
D
|
D
L
x
R
N
 
D
A
 
K
D
 
A
A
 
G
G
 
A
A
 
E
R
 
R
V
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
E
A
 
I
G
 
G
A
 
D
T
 
A
F
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
V
-
 
A
-
x
A
D
|
D
V
x
I
T
 
S
D
 
K
K
 
E
A
 
A
S
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
T
 
V
N
 
E
Q
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
S
A
 
K
L
 
F
D
 
G
G
 
K
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
H
 
N
A
x
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
 
G
P
 
H
G
 
K
A
 
P
P
 
Q
-
 
N
A
 
A
E
 
E
S
 
L
I
 
V
P
 
E
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
W
 
F
L
 
D
E
 
R
A
 
I
I
 
V
A
 
G
V
 
V
N
 
N
A
 
V
T
 
R
G
 
G
T
 
V
F
 
Y
L
 
L
V
 
M
N
 
T
Q
 
R
A
 
K
V
 
L
F
 
I
P
 
P
H
 
H
L
 
F
K
 
K
D
 
E
H
 
N
G
 
G
G
 
A
A
 
K
-
 
G
-
 
Q
-
 
E
-
 
C
-
 
V
I
 
I
I
 
L
N
 
N
F
x
V
A
 
A
S
|
S
S
 
T
A
 
G
G
 
A
I
 
G
K
 
R
G
 
P
Y
 
R
P
 
P
G
 
N
K
x
L
A
 
A
A
 
W
Y
|
Y
A
 
N
A
 
A
A
 
T
K
|
K
G
 
G
A
 
W
V
 
V
V
 
V
A
 
S
W
 
V
V
 
T
R
 
K
S
 
A
I
 
L
A
 
A
S
 
I
E
 
E
W
 
L
G
 
A
R
 
P
Y
 
A
N
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
V
A
 
A
I
 
L
-
 
N
-
 
P
-
 
V
-
x
A
-
x
G
-
 
E
A
x
T
P
|
P
T
x
L
I
 
L
W
 
T
T
 
T
P
x
F
M
 
M
Y
 
R
D
 
K
K
 
K
T
 
F
R
 
R
S
 
D
S
 
S
M
 
I
S
 
P
T
 
M
D
 
G
Q
 
R
L
 
L
A
 
L
A
 
K
H
 
P
D
 
D
A
 
-
A
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
-
D
 
D
L
 
L
V
 
A
P
 
E
V
 
A
V
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
P
G
 
Q
A
 
A
H
 
S
F
 
M
M
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
V
I
 
A
I
 
L
P
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>Ga0059261_2871 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_2871
MADRMLEGRRIIVTGGASGMGAGLVRALPAMGARVVSLDLNADAGARVAGEAGATFLAVD
VTDKASVDAATNQAVAALDGLDVLIHAAGIAPGAPAESIPPEQWLEAIAVNATGTFLVNQ
AVFPHLKDHGGAIINFASSAGIKGYPGKAAYAAAKGAVVAWVRSIASEWGRYNIRVNAIA
PTIWTPMYDKTRSSMSTDQLAAHDAALKVAIPIGGKLGDIRRDLVPVVAFLASDGAHFMT
GQIIPVDGGALMMR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory