SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_2879 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_2879 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8gobA Crystal structure of glycerol dehydrogenase in the presence of NAD+ (see paper)
38% identity, 99% coverage: 1:356/358 of query aligns to 1:361/367 of 8gobA

query
sites
8gobA
M
 
M
I
 
D
R
 
R
I
 
I
F
 
I
G
 
Q
G
 
S
P
 
P
T
 
G
R
 
K
Y
 
Y
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
P
 
A
G
 
D
A
 
V
I
 
I
G
 
N
E
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
E
L
 
Y
T
 
L
E
 
K
R
 
P
L
 
L
T
 
A
K
 
E
R
 
R
P
 
W
L
 
L
L
 
V
V
 
V
V
 
G
D
|
D
A
 
K
D
x
F
V
 
V
L
 
L
P
 
G
F
 
F
V
 
A
E
 
Q
A
 
S
Q
 
T
L
 
V
S
 
E
T
 
K
A
 
S
F
 
F
-
 
K
-
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
L
P
 
V
S
 
V
I
 
E
T
 
I
L
 
A
A
 
P
F
 
F
R
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
C
T
 
S
H
 
Q
A
 
N
A
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
R
L
 
L
V
 
R
E
 
G
Q
 
I
A
 
A
G
 
E
D
 
T
A
 
A
D
 
Q
C
 
C
-
 
G
-
 
A
V
 
I
I
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
K
|
K
G
 
T
L
 
L
D
|
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
G
 
A
V
 
L
A
 
A
F
 
H
K
 
F
L
 
M
G
 
G
L
 
V
P
 
P
F
 
V
I
 
A
A
 
I
V
 
A
P
 
P
S
x
T
I
|
I
A
 
A
S
|
S
N
x
T
D
|
D
S
x
A
P
 
P
T
 
C
G
x
S
R
 
A
S
x
L
M
 
S
A
x
V
I
 
I
Y
|
Y
N
 
T
D
 
D
E
 
E
H
 
G
V
 
E
L
 
F
V
 
D
A
 
R
I
 
Y
E
 
L
T
 
L
I
 
L
P
 
P
D
 
N
S
 
N
P
 
P
L
 
N
L
 
M
V
 
V
V
 
I
T
 
V
D
 
D
T
 
T
Q
 
K
L
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
G
A
|
A
P
 
P
A
 
A
R
 
R
F
 
L
L
 
L
R
 
A
T
 
A
G
 
G
M
 
I
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
T
K
 
W
F
 
F
E
 
E
A
 
A
E
 
R
R
 
A
A
 
C
V
 
S
A
 
R
D
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
T
N
 
T
F
 
M
F
 
A
G
 
G
T
 
G
R
 
K
Q
 
C
L
 
T
R
 
Q
T
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
L
C
 
C
Y
 
Y
Q
 
N
T
 
T
L
 
L
R
 
L
E
 
E
H
 
E
G
 
G
V
 
E
A
 
K
A
 
A
M
 
M
A
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
Q
H
 
H
E
 
V
P
 
V
D
 
T
E
 
P
A
 
A
F
 
L
E
 
E
A
 
R
V
 
V
V
 
I
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
L
 
Y
M
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
V
A
 
G
W
 
F
E
 
E
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
A
Y
 
A
A
 
A
H
|
H
A
 
A
V
 
V
V
 
H
R
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
T
K
 
A
A
 
I
R
 
P
G
 
D
A
 
A
A
 
H
S
 
H
A
 
Y
P
 
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
E
H
 
K
V
 
V
G
 
A
Y
 
F
A
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
T
Q
 
Q
L
 
L
A
 
V
I
 
L
E
 
E
G
 
N
R
 
A
D
 
P
D
 
V
G
 
E
F
 
E
I
 
I
L
 
E
D
 
T
V
 
V
I
 
A
G
 
A
F
 
L
N
 
S
R
 
H
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
I
S
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
D
 
D
M
 
I
G
 
K
S
 
E
P
 
D
T
 
V
P
 
P
D
 
A
E
 
K
I
 
M
A
 
R
E
 
I
I
 
V
A
 
A
R
 
E
L
 
A
T
 
A
T
 
C
I
 
-
G
 
-
P
 
-
K
 
A
G
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
T
I
 
I
V
 
H
N
 
N
-
 
M
-
 
P
-
 
G
-
 
G
A
 
A
G
 
T
P
 
P
G
 
D
Q
 
Q
I
 
V
A
 
Y
D
 
A
A
 
A
I
 
L
K
 
L
R
 
V
V
 
A
E
 
D
Q
 
Q
L
 
Y
A
 
G
T
 
Q
R
 
R

8goaA Crystal structure of glycerol dehydrogenase in the absence of NAD+ (see paper)
38% identity, 99% coverage: 1:356/358 of query aligns to 1:361/367 of 8goaA

query
sites
8goaA
M
 
M
I
 
D
R
 
R
I
 
I
F
 
I
G
 
Q
G
 
S
P
 
P
T
 
G
R
 
K
Y
 
Y
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
P
 
A
G
 
D
A
 
V
I
 
I
G
 
N
E
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
E
L
 
Y
T
 
L
E
 
K
R
 
P
L
 
L
T
 
A
K
 
E
R
 
R
P
 
W
L
 
L
L
 
V
V
 
V
V
 
G
D
 
D
A
 
K
D
 
F
V
 
V
L
 
L
P
 
G
F
 
F
V
 
A
E
 
Q
A
 
S
Q
 
T
L
 
V
S
 
E
T
 
K
A
 
S
F
 
F
-
 
K
-
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
L
P
 
V
S
 
V
I
 
E
T
 
I
L
 
A
A
 
P
F
 
F
R
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
C
T
 
S
H
 
Q
A
 
N
A
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
R
L
 
L
V
 
R
E
 
G
Q
 
I
A
 
A
G
 
E
D
 
T
A
 
A
D
 
Q
C
 
C
-
 
G
-
 
A
V
 
I
I
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
T
L
 
L
D
 
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
G
 
A
V
 
L
A
 
A
F
 
H
K
 
F
L
 
M
G
 
G
L
 
V
P
 
P
F
 
V
I
 
A
A
 
I
V
 
A
P
 
P
S
 
T
I
 
I
A
 
A
S
 
S
N
 
T
D
 
D
S
 
A
P
 
P
T
 
C
G
 
S
R
 
A
S
 
L
M
 
S
A
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
D
E
 
E
H
 
G
V
 
E
L
 
F
V
 
D
A
 
R
I
 
Y
E
 
L
T
 
L
I
 
L
P
 
P
D
 
N
S
 
N
P
 
P
L
 
N
L
 
M
V
 
V
V
 
I
T
 
V
D
 
D
T
 
T
Q
 
K
L
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
A
R
 
R
F
 
L
L
 
L
R
 
A
T
 
A
G
 
G
M
 
I
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
T
K
 
W
F
 
F
E
 
E
A
 
A
E
 
R
R
 
A
A
 
C
V
 
S
A
 
R
D
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
T
N
 
T
F
 
M
F
 
A
G
 
G
T
 
G
R
 
K
Q
 
C
L
 
T
R
 
Q
T
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
L
C
 
C
Y
 
Y
Q
 
N
T
 
T
L
 
L
R
 
L
E
 
E
H
 
E
G
 
G
V
 
E
A
 
K
A
 
A
M
 
M
A
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
Q
H
 
H
E
 
V
P
 
V
D
 
T
E
 
P
A
 
A
F
 
L
E
 
E
A
 
R
V
 
V
V
 
I
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
L
 
Y
M
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
V
A
 
G
W
 
F
E
 
E
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
A
Y
 
A
A
 
A
H
|
H
A
 
A
V
 
V
V
 
H
R
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
T
K
 
A
A
 
I
R
 
P
G
 
D
A
 
A
A
 
H
S
 
H
A
 
Y
P
 
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
E
H
 
K
V
 
V
G
 
A
Y
 
F
A
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
T
Q
 
Q
L
 
L
A
 
V
I
 
L
E
 
E
G
 
N
R
 
A
D
 
P
D
 
V
G
 
E
F
 
E
I
 
I
L
 
E
D
 
T
V
 
V
I
 
A
G
 
A
F
 
L
N
 
S
R
 
H
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
I
S
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
D
 
D
M
 
I
G
 
K
S
 
E
P
 
D
T
 
V
P
 
P
D
 
A
E
 
K
I
 
M
A
 
R
E
 
I
I
 
V
A
 
A
R
 
E
L
 
A
T
 
A
T
 
C
I
 
-
G
 
-
P
 
-
K
 
A
G
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
T
I
 
I
V
 
H
N
 
N
-
 
M
-
 
P
-
 
G
-
 
G
A
 
A
G
 
T
P
 
P
G
 
D
Q
 
Q
I
 
V
A
 
Y
D
 
A
A
 
A
I
 
L
K
 
L
R
 
V
V
 
A
E
 
D
Q
 
Q
L
 
Y
A
 
G
T
 
Q
R
 
R

5zxlA Structure of glda from e.Coli (see paper)
38% identity, 99% coverage: 1:356/358 of query aligns to 1:361/367 of 5zxlA

query
sites
5zxlA
M
 
M
I
 
D
R
 
R
I
 
I
F
 
I
G
 
Q
G
 
S
P
 
P
T
 
G
R
 
K
Y
 
Y
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
P
 
A
G
 
D
A
 
V
I
 
I
G
 
N
E
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
E
L
 
Y
T
 
L
E
 
K
R
 
P
L
 
L
T
 
A
K
 
E
R
 
R
P
 
W
L
 
L
L
 
V
V
 
V
V
 
G
D
 
D
A
 
K
D
 
F
V
 
V
L
 
L
P
 
G
F
 
F
V
 
A
E
 
Q
A
 
S
Q
 
T
L
 
V
S
 
E
T
 
K
A
 
S
F
 
F
-
 
K
-
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
L
P
 
V
S
 
V
I
 
E
T
 
I
L
 
A
A
 
P
F
 
F
R
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
C
T
 
S
H
 
Q
A
 
N
A
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
R
L
 
L
V
 
R
E
 
G
Q
 
I
A
 
A
G
 
E
D
 
T
A
 
A
D
 
Q
C
 
C
-
 
G
-
 
A
V
 
I
I
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
T
L
 
L
D
 
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
G
 
A
V
 
L
A
 
A
F
 
H
K
 
F
L
 
M
G
 
G
L
 
V
P
 
P
F
 
V
I
 
A
A
 
I
V
 
A
P
 
P
S
 
T
I
 
I
A
 
A
S
 
S
N
 
T
D
|
D
S
 
A
P
 
P
T
 
C
G
 
S
R
 
A
S
 
L
M
 
S
A
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
D
E
 
E
H
 
G
V
 
E
L
 
F
V
 
D
A
 
R
I
 
Y
E
 
L
T
 
L
I
 
L
P
 
P
D
 
N
S
 
N
P
 
P
L
 
N
L
 
M
V
 
V
V
 
I
T
 
V
D
 
D
T
 
T
Q
 
K
L
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
A
R
 
R
F
 
L
L
 
L
R
 
A
T
 
A
G
 
G
M
 
I
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
T
K
 
W
F
 
F
E
 
E
A
 
A
E
 
R
R
 
A
A
 
C
V
 
S
A
 
R
D
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
T
N
 
T
F
 
M
F
 
A
G
 
G
T
 
G
R
 
K
Q
 
C
L
 
T
R
 
Q
T
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
L
C
 
C
Y
 
Y
Q
 
N
T
 
T
L
 
L
R
 
L
E
 
E
H
 
E
G
 
G
V
 
E
A
 
K
A
 
A
M
 
M
A
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
Q
H
 
H
E
 
V
P
 
V
D
 
T
E
 
P
A
 
A
F
 
L
E
 
E
A
 
R
V
 
V
V
 
I
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
L
 
Y
M
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
V
A
 
G
W
x
F
E
 
E
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
A
Y
 
A
A
 
A
H
|
H
A
 
A
V
 
V
V
x
H
R
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
T
K
 
A
A
 
I
R
 
P
G
 
D
A
 
A
A
 
H
S
 
H
A
 
Y
P
 
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
E
H
 
K
V
 
V
G
 
A
Y
 
F
A
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
T
Q
 
Q
L
 
L
A
 
V
I
 
L
E
 
E
G
 
N
R
 
A
D
 
P
D
 
V
G
 
E
F
 
E
I
 
I
L
 
E
D
 
T
V
 
V
I
 
A
G
 
A
F
 
L
N
 
S
R
 
H
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
I
S
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
D
 
D
M
 
I
G
 
K
S
 
E
P
 
D
T
 
V
P
 
P
D
 
A
E
 
K
I
 
M
A
 
R
E
 
I
I
 
V
A
 
A
R
 
E
L
 
A
T
 
A
T
 
C
I
 
-
G
 
-
P
 
-
K
 
A
G
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
T
I
 
I
V
 
H
N
 
N
-
 
M
-
 
P
-
 
G
-
 
G
A
 
A
G
 
T
P
 
P
G
 
D
Q
 
Q
I
 
V
A
 
Y
D
 
A
A
 
A
I
 
L
K
 
L
R
 
V
V
 
A
E
 
D
Q
 
Q
L
 
Y
A
 
G
T
 
Q
R
 
R

P0A9S5 Glycerol dehydrogenase; GDH; GLDH; (R)-aminopropanol dehydrogenase; 1,2-propanediol dehydrogenase; D-1-amino-2-propanol oxidoreductase; EC 1.1.1.6; EC 1.1.1.75 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
38% identity, 99% coverage: 1:356/358 of query aligns to 1:361/367 of P0A9S5

query
sites
P0A9S5
M
 
M
I
 
D
R
 
R
I
 
I
F
 
I
G
 
Q
G
 
S
P
 
P
T
 
G
R
 
K
Y
 
Y
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
P
 
A
G
 
D
A
 
V
I
 
I
G
 
N
E
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
E
L
 
Y
T
 
L
E
 
K
R
 
P
L
 
L
T
 
A
K
 
E
R
 
R
P
 
W
L
 
L
L
 
V
V
 
V
V
 
G
D
 
D
A
 
K
D
 
F
V
 
V
L
 
L
P
 
G
F
 
F
V
 
A
E
 
Q
A
 
S
Q
 
T
L
 
V
S
 
E
T
 
K
A
 
S
F
 
F
-
 
K
-
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
L
P
 
V
S
 
V
I
 
E
T
 
I
L
 
A
A
 
P
F
 
F
R
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
C
T
 
S
H
 
Q
A
 
N
A
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
R
L
 
L
V
 
R
E
 
G
Q
 
I
A
 
A
G
 
E
D
 
T
A
 
A
D
 
Q
C
 
C
-
 
G
-
 
A
V
 
I
I
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
T
L
 
L
D
 
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
G
 
A
V
 
L
A
 
A
F
 
H
K
 
F
L
 
M
G
 
G
L
 
V
P
 
P
F
 
V
I
 
A
A
 
I
V
 
A
P
 
P
S
 
T
I
 
I
A
 
A
S
 
S
N
 
T
D
|
D
S
 
A
P
 
P
T
 
C
G
 
S
R
 
A
S
 
L
M
 
S
A
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
D
E
 
E
H
 
G
V
 
E
L
 
F
V
 
D
A
 
R
I
 
Y
E
 
L
T
 
L
I
 
L
P
 
P
D
 
N
S
 
N
P
 
P
L
 
N
L
 
M
V
 
V
V
 
I
T
 
V
D
 
D
T
 
T
Q
 
K
L
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
A
R
 
R
F
 
L
L
 
L
R
 
A
T
 
A
G
 
G
M
 
I
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
T
K
 
W
F
 
F
E
 
E
A
 
A
E
 
R
R
 
A
A
 
C
V
 
S
A
 
R
D
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
T
N
 
T
F
 
M
F
 
A
G
 
G
T
 
G
R
 
K
Q
 
C
L
 
T
R
 
Q
T
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
L
C
 
C
Y
 
Y
Q
 
N
T
 
T
L
 
L
R
 
L
E
 
E
H
 
E
G
 
G
V
 
E
A
 
K
A
 
A
M
 
M
A
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
Q
H
 
H
E
 
V
P
 
V
D
 
T
E
 
P
A
 
A
F
 
L
E
 
E
A
 
R
V
 
V
V
 
I
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
L
 
Y
M
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
V
A
 
G
W
 
F
E
 
E
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
A
Y
 
A
A
 
A
H
|
H
A
 
A
V
 
V
V
 
H
R
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
T
K
 
A
A
 
I
R
 
P
G
 
D
A
 
A
A
 
H
S
 
H
A
 
Y
P
 
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
E
H
 
K
V
 
V
G
 
A
Y
 
F
A
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
T
Q
 
Q
L
 
L
A
 
V
I
 
L
E
 
E
G
 
N
R
 
A
D
 
P
D
 
V
G
 
E
F
 
E
I
 
I
L
 
E
D
 
T
V
 
V
I
 
A
G
 
A
F
 
L
N
 
S
R
 
H
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
I
S
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
D
 
D
M
 
I
G
 
K
S
 
E
P
 
D
T
 
V
P
 
P
D
 
A
E
 
K
I
 
M
A
 
R
E
 
I
I
 
V
A
 
A
R
 
E
L
 
A
T
 
A
T
 
C
I
 
-
G
 
-
P
 
-
K
 
A
G
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
T
I
 
I
V
 
H
N
 
N
-
 
M
-
 
P
-
 
G
-
 
G
A
 
A
G
 
T
P
 
P
G
 
D
Q
 
Q
I
 
V
A
 
Y
D
 
A
A
 
A
I
 
L
K
 
L
R
 
V
V
 
A
E
 
D
Q
 
Q
L
 
Y
A
 
G
T
 
Q
R
 
R

Q9WYQ4 Glycerol dehydrogenase; GDH; GLDH; EC 1.1.1.6 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
39% identity, 88% coverage: 8:323/358 of query aligns to 8:325/364 of Q9WYQ4

query
sites
Q9WYQ4
P
 
P
T
 
G
R
 
R
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
P
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
N
E
 
I
L
 
L
G
 
E
T
 
E
L
 
E
T
 
L
E
 
S
R
 
R
L
 
F
T
 
G
K
 
E
R
 
R
P
 
A
L
 
F
L
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
A
 
D
D
 
F
V
 
V
L
 
D
P
 
K
F
 
N
V
 
V
E
 
L
A
 
G
Q
 
E
-
 
N
L
 
F
S
 
F
T
 
S
A
 
S
F
 
F
A
 
T
G
 
K
R
 
V
P
 
R
S
 
V
I
 
N
T
 
K
L
 
Q
A
 
I
F
 
F
R
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
C
T
 
S
H
 
D
A
 
E
A
 
E
I
 
I
D
 
E
L
 
R
L
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
L
V
 
V
E
 
E
Q
 
E
A
 
-
G
 
-
D
 
E
A
 
T
D
 
D
C
 
V
V
 
V
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
T
L
 
L
D
 
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
G
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
Y
K
 
K
L
 
L
G
 
K
L
 
K
P
 
P
F
 
V
I
 
V
A
 
I
V
 
V
P
 
P
S
 
T
I
 
I
A
 
A
S
 
S
N
 
T
D
 
D
S
 
A
P
 
P
T
 
C
G
 
S
R
 
A
S
 
L
M
 
S
A
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
P
E
 
N
H
 
G
V
 
E
L
 
F
V
 
K
A
 
R
I
 
Y
E
 
L
T
 
F
I
 
L
P
 
P
D
 
R
S
 
N
P
 
P
L
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
L
T
 
V
D
 
D
T
 
T
Q
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
A
R
 
R
F
 
F
L
 
L
R
 
V
T
 
A
G
 
G
M
 
M
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
T
K
 
W
F
 
F
E
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
S
A
 
C
V
 
K
A
 
Q
D
 
K
G
 
Y
A
 
A
S
 
P
N
 
N
F
 
M
F
 
T
G
 
G
T
 
R
R
 
L
Q
 
G
L
 
S
R
 
M
T
 
T
A
 
A
L
 
Y
A
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
R
A
 
L
C
 
C
Y
 
Y
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
R
 
L
E
 
E
H
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
A
M
 
K
A
 
R
A
 
S
A
 
V
E
 
E
R
 
E
H
 
K
E
 
S
P
 
V
D
 
T
E
 
P
A
 
A
F
 
L
E
 
E
A
 
K
V
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
L
 
L
M
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
G
W
 
F
E
 
E
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
A
Y
 
A
A
 
A
H
|
H
A
 
A
V
 
I
V
 
H
R
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
T
K
 
V
A
 
L
R
 
E
G
 
N
A
 
T
A
 
H
S
 
K
A
 
Y
P
 
L
H
|
H
G
 
G
D
 
E
H
 
K
V
 
V
G
 
A
Y
 
I
A
 
G
T
 
V
L
 
L
V
 
A
Q
 
S
L
 
L
A
 
F
I
 
L
E
 
T
G
 
D
R
 
K
D
 
P
D
 
R
G
 
K
F
 
M
I
 
I
L
 
E
D
 
E
V
 
V
I
 
Y
G
 
S
F
 
F
N
 
C
R
 
E
S
 
E
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
T
S
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
I
D
 
G
M
 
L
G
 
D
S
 
G
P
 
V
T
 
S
P
 
D
D
 
E
E
 
D
I
 
L
A
 
M
E
 
K
I
 
V
A
 
A
R
 
E

1kq3A Crystal structure of a glycerol dehydrogenase (tm0423) from thermotoga maritima at 1.5 a resolution (see paper)
39% identity, 88% coverage: 8:323/358 of query aligns to 9:326/364 of 1kq3A

query
sites
1kq3A
P
 
P
T
 
G
R
 
R
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
P
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
N
E
 
I
L
 
L
G
 
E
T
 
E
L
 
E
T
 
L
E
 
S
R
 
R
L
 
F
T
 
G
K
 
E
R
 
R
P
 
A
L
 
F
L
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
A
 
D
D
 
F
V
 
V
L
 
D
P
 
K
F
 
N
V
 
V
E
 
L
A
 
G
Q
 
E
-
 
N
L
 
F
S
 
F
T
 
S
A
 
S
F
 
F
A
 
T
G
 
K
R
 
V
P
 
R
S
 
V
I
 
N
T
 
K
L
 
Q
A
 
I
F
 
F
R
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
C
T
 
S
H
 
D
A
 
E
A
 
E
I
 
I
D
 
E
L
 
R
L
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
L
V
 
V
E
 
E
Q
 
E
A
 
-
G
 
-
D
 
E
A
 
T
D
 
D
C
 
V
V
 
V
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
T
L
 
L
D
 
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
G
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
Y
K
 
K
L
 
L
G
 
K
L
 
K
P
 
P
F
 
V
I
 
V
A
 
I
V
 
V
P
 
P
S
 
T
I
 
I
A
 
A
S
 
S
N
 
T
D
 
D
S
 
A
P
 
P
T
 
C
G
 
S
R
 
A
S
 
L
M
 
S
A
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
P
E
 
N
H
 
G
V
 
E
L
 
F
V
 
K
A
 
R
I
 
Y
E
 
L
T
 
F
I
 
L
P
 
P
D
 
R
S
 
N
P
 
P
L
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
L
T
 
V
D
 
D
T
 
T
Q
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
A
R
 
R
F
 
F
L
 
L
R
 
V
T
 
A
G
 
G
M
 
M
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
T
K
 
W
F
 
F
E
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
S
A
 
C
V
 
K
A
 
Q
D
 
K
G
 
Y
A
 
A
S
 
P
N
 
N
F
 
M
F
 
T
G
 
G
T
 
R
R
 
L
Q
 
G
L
 
S
R
 
M
T
 
T
A
 
A
L
 
Y
A
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
R
A
 
L
C
 
C
Y
 
Y
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
R
 
L
E
 
E
H
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
A
M
 
K
A
 
R
A
 
S
A
 
V
E
 
E
R
 
E
H
 
K
E
 
S
P
 
V
D
 
T
E
 
P
A
 
A
F
 
L
E
 
E
A
 
K
V
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
L
 
L
M
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
G
W
 
F
E
 
E
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
A
Y
 
A
A
 
A
H
|
H
A
 
A
V
 
I
V
x
H
R
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
T
K
 
V
A
 
L
R
 
E
G
 
N
A
 
T
A
 
H
S
 
K
A
 
Y
P
 
L
H
|
H
G
 
G
D
 
E
H
 
K
V
 
V
G
 
A
Y
 
I
A
 
G
T
 
V
L
 
L
V
 
A
Q
 
S
L
 
L
A
 
F
I
 
L
E
 
T
G
 
D
R
 
K
D
 
P
D
 
R
G
 
K
F
 
M
I
 
I
L
 
E
D
 
E
V
 
V
I
 
Y
G
 
S
F
 
F
N
 
C
R
 
E
S
 
E
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
T
S
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
I
D
 
G
M
 
L
G
 
D
S
 
G
P
 
V
T
 
S
P
 
D
D
 
E
E
 
D
I
 
L
A
 
M
E
 
K
I
 
V
A
 
A
R
 
E

4mcaA Crystal structure of glycerol dehydrogenase from serratia to 1.9a
35% identity, 90% coverage: 1:323/358 of query aligns to 1:327/367 of 4mcaA

query
sites
4mcaA
M
 
M
I
 
L
R
 
R
I
 
I
F
 
I
G
 
Q
G
 
S
P
 
P
T
 
G
R
 
K
Y
 
Y
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
P
 
A
G
 
N
A
 
A
I
 
L
G
 
A
E
 
A
L
 
V
G
 
G
T
 
Q
L
 
Y
T
 
A
E
 
K
R
 
S
L
 
L
T
 
A
K
 
D
R
x
H
P
 
Y
L
 
L
L
 
V
V
 
I
V
 
A
D
 
D
A
 
D
D
 
F
V
 
V
L
 
M
P
 
K
F
 
L
V
 
A
E
 
G
A
 
D
Q
 
T
L
 
L
-
 
M
-
 
G
S
 
S
T
 
L
A
 
Q
F
 
Q
A
 
H
G
 
G
R
 
V
P
 
K
S
 
H
I
 
H
T
 
A
L
 
A
A
 
L
F
 
F
R
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
C
T
 
C
H
 
H
A
 
K
A
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
R
L
 
L
V
 
G
E
 
R
Q
 
E
A
 
L
G
 
K
D
 
A
A
 
H
D
 
G
C
|
C
-
 
R
-
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
T
L
 
L
D
 
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
G
 
A
V
 
I
A
 
A
F
 
H
K
 
Y
L
 
Q
G
 
Q
L
 
L
P
 
P
F
 
V
I
 
V
A
 
L
V
 
I
P
 
P
S
 
T
I
 
I
A
 
A
S
 
S
N
 
T
D
 
D
S
 
A
P
 
P
T
 
T
G
 
S
R
 
A
S
 
L
M
 
S
A
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
E
E
 
Q
H
 
G
V
 
E
L
 
F
V
 
A
A
 
E
I
 
Y
E
 
L
T
 
I
I
 
Y
P
 
P
D
 
R
S
 
N
P
 
P
L
 
D
L
 
M
V
 
V
V
 
V
T
 
M
D
 
D
T
 
V
Q
 
A
L
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
V
R
 
R
F
 
L
L
 
L
R
 
V
T
 
A
G
 
G
M
 
M
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
S
K
 
T
K
 
Y
F
 
F
E
 
E
A
 
A
E
 
Q
R
 
A
A
 
C
V
 
F
A
 
D
D
 
A
G
 
Q
A
 
A
S
 
T
N
 
S
F
 
M
F
 
A
G
 
G
T
 
G
R
 
K
Q
 
S
L
 
T
R
 
L
T
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
S
I
 
L
A
 
A
D
 
R
A
 
L
C
 
C
Y
 
Y
Q
 
D
T
 
T
L
 
L
R
 
L
E
 
A
H
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
K
A
 
A
M
 
K
A
 
L
A
 
A
A
 
V
E
 
E
R
 
A
H
 
G
E
 
V
P
 
V
D
 
T
E
 
E
A
 
A
F
 
V
E
 
E
A
 
R
V
 
I
V
 
I
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
L
 
Y
M
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
I
A
 
G
W
 
F
E
 
E
S
 
S
G
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
A
Y
 
A
A
 
A
H
|
H
A
 
A
V
 
I
V
 
H
R
 
N
G
 
G
L
 
F
V
 
T
K
 
V
A
 
L
R
 
E
G
 
E
A
 
C
A
 
H
S
 
H
A
 
L
P
 
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
E
H
 
K
V
 
V
G
 
A
Y
 
F
A
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
V
I
 
L
E
 
Q
G
 
N
R
 
S
D
 
P
D
 
M
G
 
A
F
 
Q
I
 
I
L
 
E
D
 
T
V
 
V
I
 
L
G
 
A
F
 
F
N
 
C
R
 
H
S
 
R
V
 
I
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
I
S
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
M
D
 
G
M
 
V
G
 
S
S
 
G
P
 
D
T
 
A
P
 
V
D
 
E
E
 
K
I
 
I
A
 
M
E
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
Q

1ta9B Crystal structure of glycerol dehydrogenase from schizosaccharomyces pombe
34% identity, 99% coverage: 3:356/358 of query aligns to 8:367/394 of 1ta9B

query
sites
1ta9B
R
 
R
I
 
I
F
 
F
G
 
T
G
 
S
P
 
P
T
 
Q
R
 
K
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
P
 
R
G
 
H
A
 
A
I
 
F
G
 
T
E
 
R
L
 
S
G
 
Y
T
 
M
L
 
Y
T
 
V
E
 
K
R
 
K
L
 
W
-
 
A
T
 
T
K
 
K
R
 
S
P
 
A
L
 
V
L
 
V
V
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
Q
D
 
N
V
 
V
L
 
W
P
 
N
F
 
I
V
 
C
E
 
A
A
 
N
Q
 
K
L
 
I
-
 
V
-
 
D
S
 
S
T
 
L
A
 
S
F
 
Q
A
 
N
G
 
G
R
 
M
P
 
T
S
 
V
I
 
T
T
 
K
L
 
L
A
 
V
F
 
F
R
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
A
T
 
S
H
 
L
A
 
V
A
 
E
I
 
L
D
 
D
L
 
K
L
 
L
V
 
R
E
 
K
Q
 
Q
A
 
C
-
 
P
G
 
D
D
 
D
A
 
T
D
 
Q
C
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
T
L
 
M
D
 
D
A
 
S
A
 
A
K
 
K
G
 
Y
V
 
I
A
 
A
F
 
H
K
 
S
L
 
M
G
 
N
L
 
L
P
 
P
F
 
S
I
 
I
A
 
I
V
 
C
P
 
P
S
 
T
I
 
T
A
 
A
S
 
S
N
 
S
D
 
D
S
 
A
P
 
A
T
 
T
G
 
S
R
 
S
S
 
L
M
 
S
A
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
P
E
 
D
H
 
G
V
 
Q
L
 
F
V
 
Q
A
 
K
I
 
Y
E
 
S
T
 
F
I
 
Y
P
 
P
D
 
L
S
 
N
P
 
P
L
 
N
L
 
L
V
 
I
V
 
F
T
 
I
D
 
D
T
 
T
Q
 
D
L
 
V
I
 
I
A
 
V
N
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
V
R
 
R
F
 
F
L
 
L
R
 
I
T
 
S
G
 
G
M
 
I
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
S
K
 
T
K
 
W
F
 
V
E
 
E
A
 
T
E
 
E
R
 
S
A
 
V
V
 
I
A
 
R
D
 
S
G
 
N
A
 
S
S
 
T
N
 
S
F
 
F
F
 
A
G
 
G
T
 
G
R
 
V
Q
 
A
L
 
S
R
 
I
T
 
A
A
 
G
L
 
R
A
 
Y
I
 
I
A
 
A
D
 
R
A
 
A
C
 
C
Y
 
K
Q
 
D
T
 
T
L
 
L
R
 
E
E
 
K
H
 
Y
G
 
A
V
 
L
A
 
S
A
 
A
M
 
I
A
 
L
A
 
S
A
 
N
E
 
T
R
 
R
H
 
G
E
 
V
P
 
C
D
 
T
E
 
E
A
 
A
F
 
F
E
 
E
A
 
N
V
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
L
 
L
M
 
M
A
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
G
W
 
F
E
 
E
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
A
Y
 
A
A
 
A
H
|
H
A
 
A
V
 
I
V
x
H
R
 
N
G
 
G
L
 
M
V
 
T
K
 
A
A
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
P
A
 
V
S
 
H
-
 
R
A
 
L
P
 
M
H
|
H
G
 
G
D
 
E
H
 
K
V
 
V
G
 
A
Y
 
Y
A
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
L
 
V
A
 
V
I
 
L
E
 
E
G
 
D
R
 
W
D
 
P
D
 
L
G
 
E
F
 
D
I
 
F
L
 
N
D
 
N
V
 
L
I
 
A
G
 
S
F
 
F
N
 
M
R
 
A
S
 
K
V
 
C
G
 
H
L
 
L
P
 
P
A
 
I
S
 
T
L
 
L
A
 
E
E
 
E
L
 
L
D
 
G
M
 
I
G
 
P
S
 
N
P
 
V
T
 
T
P
 
D
D
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
L
E
 
M
I
 
V
A
 
G
R
 
R
L
 
-
T
 
A
T
 
T
I
 
L
G
 
R
P
 
P
K
 
D
G
 
E
G
 
S
-
 
I
-
 
H
R
 
N
I
 
M
I
 
S
V
 
K
N
 
K
A
 
F
G
 
N
P
 
P
G
 
S
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
K
R
 
A
V
 
V
E
 
D
Q
 
S
L
 
Y
A
 
S
T
 
Q
R
 
K

O13702 Glycerol dehydrogenase 1; GDH; GLDH; EC 1.1.1.6 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast)
34% identity, 99% coverage: 3:356/358 of query aligns to 64:423/450 of O13702

query
sites
O13702
R
 
R
I
 
I
F
 
F
G
 
T
G
 
S
P
 
P
T
 
Q
R
 
K
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
P
 
R
G
 
H
A
 
A
I
 
F
G
 
T
E
 
R
L
 
S
G
 
Y
T
 
M
L
 
Y
T
 
V
E
 
K
R
 
K
L
 
W
-
 
A
T
 
T
K
 
K
R
 
S
P
 
A
L
 
V
L
 
V
V
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
Q
D
 
N
V
 
V
L
 
W
P
 
N
F
 
I
V
 
C
E
 
A
A
 
N
Q
 
K
L
 
I
-
 
V
-
 
D
S
 
S
T
 
L
A
 
S
F
 
Q
A
 
N
G
 
G
R
 
M
P
 
T
S
 
V
I
 
T
T
 
K
L
 
L
A
 
V
F
 
F
R
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
A
T
 
S
H
 
L
A
 
V
A
 
E
I
 
L
D
 
D
L
 
K
L
 
L
V
 
R
E
 
K
Q
 
Q
A
 
C
-
 
P
G
 
D
D
 
D
A
 
T
D
 
Q
C
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
T
L
 
M
D
 
D
A
 
S
A
 
A
K
 
K
G
 
Y
V
 
I
A
 
A
F
 
H
K
 
S
L
 
M
G
 
N
L
 
L
P
 
P
F
 
S
I
 
I
A
 
I
V
 
C
P
 
P
S
 
T
I
 
T
A
 
A
S
 
S
N
 
S
D
 
D
S
 
A
P
 
A
T
 
T
G
 
S
R
 
S
S
 
L
M
 
S
A
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
P
E
 
D
H
 
G
V
 
Q
L
 
F
V
 
Q
A
 
K
I
 
Y
E
 
S
T
 
F
I
 
Y
P
 
P
D
 
L
S
 
N
P
 
P
L
 
N
L
 
L
V
 
I
V
 
F
T
 
I
D
 
D
T
 
T
Q
 
D
L
 
V
I
 
I
A
 
V
N
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
V
R
 
R
F
 
F
L
 
L
R
 
I
T
 
S
G
 
G
M
 
I
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
S
K
 
T
K
 
W
F
 
V
E
 
E
A
 
T
E
 
E
R
 
S
A
 
V
V
 
I
A
 
R
D
 
S
G
 
N
A
 
S
S
 
T
N
 
S
F
 
F
F
 
A
G
 
G
T
 
G
R
 
V
Q
 
A
L
 
S
R
 
I
T
 
A
A
 
G
L
 
R
A
 
Y
I
 
I
A
 
A
D
 
R
A
 
A
C
 
C
Y
 
K
Q
 
D
T
 
T
L
 
L
R
 
E
E
 
K
H
 
Y
G
 
A
V
 
L
A
 
S
A
 
A
M
 
I
A
 
L
A
 
S
A
 
N
E
 
T
R
 
R
H
 
G
E
 
V
P
 
C
D
 
T
E
 
E
A
 
A
F
 
F
E
 
E
A
 
N
V
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
L
 
L
M
 
M
A
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
G
W
 
F
E
 
E
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
A
Y
 
A
A
 
A
H
|
H
A
 
A
V
 
I
V
 
H
R
 
N
G
 
G
L
 
M
V
 
T
K
 
A
A
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
P
A
 
V
S
 
H
A
 
R
-
 
L
P
 
M
H
|
H
G
 
G
D
 
E
H
 
K
V
 
V
G
 
A
Y
 
Y
A
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
L
 
V
A
 
V
I
 
L
E
 
E
G
 
D
R
 
W
D
 
P
D
 
L
G
 
E
F
 
D
I
 
F
L
 
N
D
 
N
V
 
L
I
 
A
G
 
S
F
 
F
N
 
M
R
 
A
S
 
K
V
 
C
G
 
H
L
 
L
P
 
P
A
 
I
S
 
T
L
 
L
A
 
E
E
 
E
L
 
L
D
 
G
M
 
I
G
 
P
S
 
N
P
 
V
T
 
T
P
 
D
D
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
L
E
 
M
I
 
V
A
 
G
R
 
R
L
 
-
T
 
A
T
 
T
I
 
L
G
 
R
P
 
P
K
 
D
G
 
E
G
 
S
-
 
I
-
 
H
R
 
N
I
 
M
I
 
S
V
 
K
N
 
K
A
 
F
G
 
N
P
 
P
G
 
S
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
K
R
 
A
V
 
V
E
 
D
Q
 
S
L
 
Y
A
 
S
T
 
Q
R
 
K

P32816 Glycerol dehydrogenase; GDH; GLDH; GlyDH; EC 1.1.1.6 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see 2 papers)
33% identity, 98% coverage: 3:354/358 of query aligns to 5:361/370 of P32816

query
sites
P32816
R
 
R
I
 
V
F
 
F
G
 
I
G
 
S
P
 
P
T
 
A
R
 
K
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
P
 
K
G
 
N
A
 
V
I
 
I
G
 
T
E
 
K
L
 
I
G
 
A
T
 
N
L
 
Y
T
 
L
E
 
E
R
 
G
L
 
I
T
 
G
K
 
N
R
 
K
P
 
T
L
 
V
L
 
V
V
 
I
V
 
A
D
|
D
A
 
E
D
 
I
V
 
V
L
 
W
P
 
K
F
 
I
V
 
A
E
 
G
A
 
H
Q
 
T
L
 
I
S
 
V
T
 
N
A
 
E
F
 
L
A
 
K
-
 
K
-
 
G
G
 
N
R
 
I
P
 
A
S
 
A
I
 
E
T
 
E
L
 
V
A
 
V
F
 
F
R
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
A
T
 
S
H
 
R
A
 
N
A
 
E
I
 
V
D
 
E
L
 
R
L
 
I
-
 
A
-
 
N
V
 
I
E
 
A
Q
 
R
A
 
K
G
 
A
D
 
E
A
 
A
D
 
A
C
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
|
G
K
|
K
G
 
T
L
 
L
D
 
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
G
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
D
K
 
E
L
 
L
G
 
D
L
 
A
P
 
Y
F
 
I
I
 
V
A
 
I
V
 
V
P
 
P
S
x
T
I
 
A
A
 
A
S
|
S
N
 
T
D
|
D
S
 
A
P
 
P
T
 
T
G
x
S
R
 
A
S
x
L
M
 
S
A
 
V
I
 
I
Y
|
Y
N
 
S
D
 
D
E
 
D
H
 
G
V
 
V
L
 
F
V
 
E
A
 
S
I
 
Y
E
 
R
T
 
F
I
 
Y
P
 
K
D
 
K
S
 
N
P
 
P
L
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
L
T
 
V
D
 
D
T
 
T
Q
 
K
L
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
P
 
P
A
 
P
R
 
R
F
 
L
L
 
L
R
 
A
T
 
S
G
 
G
M
 
I
G
 
A
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
T
K
 
W
F
 
V
E
 
E
A
 
A
E
 
R
R
 
S
A
 
V
V
 
I
A
 
K
D
 
S
G
 
G
A
 
G
S
 
K
N
 
T
F
 
M
F
 
A
G
 
G
T
 
G
R
 
I
Q
 
P
L
 
T
R
 
I
T
 
A
A
 
A
L
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
K
C
 
C
Y
 
E
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
R
 
F
E
 
K
H
 
Y
G
 
G
V
 
K
A
 
L
A
 
A
M
 
Y
A
 
E
A
 
S
A
 
V
E
 
K
R
 
A
H
 
K
E
 
V
P
 
V
D
 
T
E
 
P
A
 
A
F
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
L
 
L
M
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
G
W
 
F
E
 
E
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
A
Y
 
A
A
 
A
H
|
H
A
 
A
V
 
I
V
 
H
R
 
N
G
 
G
L
 
F
V
 
T
K
 
A
A
 
L
R
 
E
G
 
G
A
 
E
A
 
I
S
 
H
A
 
H
-
 
L
P
 
T
H
|
H
G
 
G
D
 
E
H
 
K
V
 
V
G
 
A
Y
 
F
A
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
E
G
 
E
R
 
H
D
 
S
D
 
Q
G
 
Q
F
 
E
I
 
I
L
 
E
D
 
R
V
 
Y
I
 
I
G
 
E
F
 
L
N
 
Y
R
 
L
S
|
S
V
 
L
G
 
D
L
 
L
P
 
P
A
 
V
S
 
T
L
 
L
A
 
E
E
 
D
L
 
I
D
 
K
M
 
L
G
 
K
S
 
D
P
 
A
T
 
S
P
 
R
D
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
L
E
 
K
I
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
A
T
 
A
T
 
T
I
 
A
G
 
E
P
 
G
K
 
E
G
 
T
G
 
I
R
 
H
I
 
N
I
 
A
V
 
F
N
 
N
A
 
V
G
 
T
P
 
A
G
 
D
Q
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
F
R
 
A
V
 
A
E
 
D
Q
 
Q
L
 
Y
A
 
A

1jq5A Bacillus stearothermophilus glycerol dehydrogenase complex with NAD+ (see paper)
33% identity, 98% coverage: 3:354/358 of query aligns to 4:360/366 of 1jq5A

query
sites
1jq5A
R
 
R
I
 
V
F
 
F
G
 
I
G
 
S
P
 
P
T
 
A
R
 
K
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
P
 
K
G
 
N
A
 
V
I
 
I
G
 
T
E
 
K
L
 
I
G
 
A
T
 
N
L
 
Y
T
 
L
E
 
E
R
 
G
L
 
I
T
 
G
K
 
N
R
 
K
P
 
T
L
 
V
L
 
V
V
 
I
V
 
A
D
|
D
A
 
E
D
 
I
V
 
V
L
 
W
P
 
K
F
x
I
V
 
A
E
 
G
A
 
H
Q
 
T
L
 
I
S
 
V
T
 
N
A
 
E
F
 
L
A
 
K
-
 
K
-
 
G
G
 
N
R
 
I
P
 
A
S
 
A
I
 
E
T
 
E
L
 
V
A
 
V
F
 
F
R
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
A
T
 
S
H
 
R
A
 
N
A
 
E
I
 
V
D
 
E
L
 
R
L
 
I
-
 
A
-
 
N
V
 
I
E
 
A
Q
 
R
A
 
K
G
 
A
D
 
E
A
 
A
D
 
A
C
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
K
|
K
G
 
T
L
 
L
D
|
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
G
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
D
K
 
E
L
 
L
G
 
D
L
 
A
P
 
Y
F
 
I
I
 
V
A
 
I
V
 
V
P
 
P
S
x
T
I
 
A
A
 
A
S
|
S
N
x
T
D
|
D
S
x
A
P
 
P
T
 
T
G
x
S
R
 
A
S
x
L
M
 
S
A
x
V
I
 
I
Y
|
Y
N
 
S
D
 
D
E
 
D
H
 
G
V
 
V
L
 
F
V
 
E
A
 
S
I
 
Y
E
 
R
T
 
F
I
 
Y
P
 
K
D
 
K
S
 
N
P
 
P
L
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
L
T
 
V
D
 
D
T
 
T
Q
 
K
L
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
N
A
|
A
P
|
P
A
 
P
R
 
R
F
 
L
L
 
L
R
 
A
T
 
S
G
 
G
M
 
I
G
 
A
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
T
K
 
W
F
 
V
E
 
E
A
 
A
E
 
R
R
 
S
A
 
V
V
 
I
A
 
K
D
 
S
G
 
G
A
 
G
S
 
K
N
 
T
F
 
M
F
 
A
G
 
G
T
 
G
R
 
I
Q
 
P
L
 
T
R
 
I
T
 
A
A
 
A
L
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
K
C
 
C
Y
 
E
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
R
 
F
E
 
K
H
 
Y
G
 
G
V
 
K
A
 
L
A
 
A
M
 
Y
A
 
E
A
 
S
A
 
V
E
 
K
R
 
A
H
 
K
E
 
V
P
 
V
D
 
T
E
 
P
A
 
A
F
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
L
 
L
M
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
G
W
 
F
E
 
E
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
A
Y
 
A
A
 
A
H
|
H
A
 
A
V
 
I
V
x
H
R
 
N
G
 
G
L
 
F
V
 
T
K
 
A
A
 
L
R
 
E
G
 
G
A
x
E
A
 
I
S
 
H
A
x
H
-
 
L
P
 
T
H
|
H
G
 
G
D
 
E
H
 
K
V
 
V
G
 
A
Y
 
F
A
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
E
G
 
E
R
 
H
D
 
S
D
 
Q
G
 
Q
F
 
E
I
 
I
L
 
E
D
 
R
V
 
Y
I
 
I
G
 
E
F
 
L
N
 
Y
R
 
L
S
 
C
V
 
L
G
 
D
L
 
L
P
 
P
A
 
V
S
 
T
L
 
L
A
 
E
E
 
D
L
 
I
D
 
K
M
 
L
G
 
K
S
 
D
P
 
A
T
 
S
P
 
R
D
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
L
E
 
K
I
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
A
T
 
A
T
 
T
I
 
A
G
 
E
P
 
G
K
 
E
G
 
T
G
 
I
R
 
H
I
 
N
I
 
A
V
 
F
N
 
N
A
 
V
G
 
T
P
 
A
G
 
D
Q
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
F
R
 
A
V
 
A
E
 
D
Q
 
Q
L
 
Y
A
 
A

5xn8A Structure of glycerol dehydrogenase crystallised as a contaminant
34% identity, 91% coverage: 1:326/358 of query aligns to 1:330/365 of 5xn8A

query
sites
5xn8A
M
 
M
I
 
L
R
 
K
I
 
V
F
 
I
G
 
Q
G
 
S
P
 
P
T
 
G
R
 
K
Y
 
Y
V
 
L
Q
 
Q
G
 
G
P
 
P
G
 
D
A
 
A
I
 
S
G
 
T
E
 
L
L
 
F
G
 
G
T
 
A
L
 
Y
T
 
A
E
 
K
R
 
N
L
 
L
T
 
A
K
 
E
R
 
S
P
 
F
L
 
F
L
 
V
V
 
I
V
 
A
D
 
D
A
 
D
D
 
F
V
 
V
L
 
M
P
 
K
F
 
L
V
 
A
E
 
G
A
 
D
Q
 
K
L
 
V
S
 
L
T
 
N
A
 
G
F
 
L
A
 
H
G
 
S
R
 
H
P
 
-
S
 
D
I
 
I
T
 
S
L
 
L
A
 
H
-
 
A
-
 
E
-
 
R
F
 
F
R
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
C
T
 
S
H
 
H
A
 
V
A
 
E
I
 
I
D
 
R
L
 
R
L
 
L
V
 
I
E
 
A
Q
 
I
A
 
L
G
 
K
D
 
Q
A
 
H
D
 
G
C
 
C
-
 
R
-
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
T
L
 
L
D
 
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
G
 
A
V
 
I
A
 
G
F
 
Y
K
 
Y
L
 
Q
G
 
K
L
 
L
P
 
P
F
 
V
I
 
V
A
 
V
V
 
I
P
 
P
S
 
T
I
 
I
A
 
A
S
 
S
N
 
T
D
 
D
S
 
A
P
 
P
T
 
T
G
 
S
R
 
A
S
 
L
M
 
S
A
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
E
E
 
A
H
 
G
V
 
E
L
 
F
V
 
E
A
 
E
I
 
Y
E
 
L
T
 
I
I
 
Y
P
 
P
D
 
K
S
 
N
P
 
P
L
 
D
L
 
M
V
 
V
V
 
V
T
 
M
D
 
D
T
 
T
Q
 
A
L
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
V
R
 
R
F
 
L
L
 
L
R
 
V
T
 
S
G
 
G
M
 
M
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
S
K
 
T
K
 
W
F
 
F
E
 
E
A
 
A
E
 
K
R
 
A
A
 
C
V
 
Y
A
 
D
D
 
A
G
 
R
A
 
A
S
 
T
N
 
S
F
 
M
F
 
A
G
 
G
T
 
G
R
 
Q
Q
 
S
L
 
T
R
 
E
T
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
S
I
 
L
A
 
A
D
 
R
A
 
L
C
 
C
Y
 
Y
Q
 
D
T
 
T
L
 
L
R
 
L
E
 
A
H
 
E
G
 
G
V
 
E
A
 
K
A
 
A
M
 
R
A
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
R
 
A
H
 
G
E
 
V
P
 
V
D
 
T
E
 
D
A
 
A
F
 
L
E
 
E
A
 
R
V
 
I
V
 
I
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
L
 
Y
M
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
I
A
 
G
W
 
F
E
 
E
S
 
S
G
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
A
Y
 
A
A
 
A
H
|
H
A
 
A
V
 
I
V
 
H
R
 
N
G
 
G
L
 
F
V
 
T
K
 
I
A
 
L
R
 
E
G
 
E
A
 
C
A
 
H
S
 
H
A
 
L
P
 
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
E
H
 
K
V
 
V
G
 
A
Y
 
F
A
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
V
I
 
L
E
 
Q
G
 
N
R
 
S
D
 
P
D
 
M
G
 
E
F
 
E
I
 
I
L
 
E
D
 
T
V
 
V
I
 
L
G
 
G
F
 
F
N
 
C
R
 
E
S
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
V
S
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
L
 
M
D
 
G
M
 
V
G
 
K
S
 
E
P
 
G
T
 
I
P
 
D
D
 
D
E
 
K
I
 
I
A
 
A
E
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
A
T
 
T
T
 
C

1jqaA Bacillus stearothermophilus glycerol dehydrogenase complex with glycerol (see paper)
32% identity, 98% coverage: 3:354/358 of query aligns to 3:355/361 of 1jqaA

query
sites
1jqaA
R
 
R
I
 
V
F
 
F
G
 
I
G
 
S
P
 
P
T
 
A
R
 
K
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
P
 
K
G
 
N
A
 
V
I
 
I
G
 
T
E
 
K
L
 
I
G
 
A
T
 
N
L
 
Y
T
 
L
E
 
E
R
 
G
L
 
I
T
 
G
K
 
N
R
 
K
P
 
T
L
 
V
L
 
V
V
 
I
V
 
A
D
 
D
A
 
E
D
 
I
V
 
V
L
 
W
P
 
K
F
 
I
V
 
A
E
 
G
A
 
H
Q
 
T
L
 
I
S
 
V
T
 
N
A
 
E
F
 
L
A
 
K
-
 
K
-
 
G
G
 
N
R
 
I
P
 
A
S
 
A
I
 
E
T
 
E
L
 
V
A
 
V
F
 
F
R
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
A
T
 
S
H
 
R
A
 
N
A
 
E
I
 
V
D
 
E
L
 
R
L
 
I
-
 
A
-
 
N
V
 
I
E
 
A
Q
 
R
A
 
K
G
 
A
D
 
E
A
 
A
D
 
A
C
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
T
L
 
L
D
 
D
A
 
T
A
 
A
K
 
K
G
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
D
K
 
E
L
 
L
G
 
D
L
 
A
P
 
Y
F
 
I
I
 
V
A
 
I
V
 
V
P
 
P
S
 
T
I
 
A
A
 
A
S
 
S
N
 
T
D
|
D
S
 
A
P
 
P
T
 
T
G
 
S
R
 
A
S
 
L
M
 
S
A
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
-
D
 
-
E
 
-
H
 
-
V
 
V
L
 
F
V
 
E
A
 
S
I
 
Y
E
 
R
T
 
F
I
 
Y
P
 
K
D
 
K
S
 
N
P
 
P
L
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
L
T
 
V
D
 
D
T
 
T
Q
 
K
L
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
P
 
P
A
 
P
R
 
R
F
 
L
L
 
L
R
 
A
T
 
S
G
 
G
M
 
I
G
 
A
D
|
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
T
K
 
W
F
 
V
E
 
E
A
 
A
E
 
R
R
 
S
A
 
V
V
 
I
A
 
K
D
 
S
G
 
G
A
 
G
S
 
K
N
 
T
F
 
M
F
 
A
G
 
G
T
 
G
R
 
I
Q
 
P
L
 
T
R
 
I
T
 
A
A
 
A
L
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
K
C
 
C
Y
 
E
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
R
 
F
E
 
K
H
 
Y
G
 
G
V
 
K
A
 
L
A
 
A
M
 
Y
A
 
E
A
 
S
A
 
V
E
 
K
R
 
A
H
 
K
E
 
V
P
 
V
D
 
T
E
 
P
A
 
A
F
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
N
V
 
T
L
 
L
M
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
G
W
x
F
E
 
E
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
A
Y
 
A
A
 
A
H
|
H
A
 
A
V
 
I
V
x
H
R
 
N
G
 
G
L
 
F
V
 
T
K
 
A
A
 
L
R
 
E
G
 
G
A
x
E
A
 
I
S
 
H
A
x
H
-
 
L
P
 
T
H
|
H
G
 
G
D
 
E
H
 
K
V
 
V
G
 
A
Y
 
F
A
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
E
G
 
E
R
 
H
D
 
S
D
 
Q
G
 
Q
F
 
E
I
 
I
L
 
E
D
 
R
V
 
Y
I
 
I
G
 
E
F
 
L
N
 
Y
R
 
L
S
 
C
V
 
L
G
 
D
L
 
L
P
 
P
A
 
V
S
 
T
L
 
L
A
 
E
E
 
D
L
 
I
D
 
K
M
 
L
G
 
K
S
 
D
P
 
A
T
 
S
P
 
R
D
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
L
E
 
K
I
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
A
T
 
A
T
 
T
I
 
A
G
 
E
P
 
G
K
 
E
G
 
T
G
 
I
R
 
H
I
 
N
I
 
A
V
 
F
N
 
N
A
 
V
G
 
T
P
 
A
G
 
D
Q
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
F
R
 
A
V
 
A
E
 
D
Q
 
Q
L
 
Y
A
 
A

3uhjA Crystal structure of a probable glycerol dehydrogenase from sinorhizobium meliloti 1021
35% identity, 94% coverage: 1:335/358 of query aligns to 1:331/357 of 3uhjA

query
sites
3uhjA
M
 
M
I
 
A
R
 
R
I
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
P
T
 
N
R
 
K
Y
 
Y
V
 
I
Q
 
Q
G
 
R
P
 
A
G
 
G
A
 
E
I
 
I