SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_2906 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_2906 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
42% identity, 96% coverage: 7:252/257 of query aligns to 5:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
L
 
L
D
 
Q
G
 
D
R
 
K
S
 
V
V
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
Q
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
E
T
 
A
A
 
A
H
 
R
L
 
V
L
 
F
Y
 
M
E
 
K
L
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
V
T
 
V
L
 
I
L
 
A
D
|
D
R
x
F
N
 
N
E
 
E
E
 
A
R
 
A
L
 
G
S
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
V
S
 
E
A
 
A
F
 
-
D
 
N
A
 
P
Q
 
G
R
 
V
I
 
V
L
 
F
V
 
I
Q
 
R
C
x
V
G
 
-
S
x
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
R
 
R
S
 
E
F
 
S
V
 
V
G
 
H
R
 
R
A
 
L
M
 
V
A
 
E
A
 
N
H
 
V
I
 
A
A
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
A
 
K
V
 
I
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
T
x
D
A
 
S
M
 
M
I
 
L
E
 
S
K
|
K
M
 
M
T
 
T
L
 
V
E
 
D
D
 
Q
W
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
V
 
V
I
 
I
D
 
N
V
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
H
M
 
C
L
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
G
 
L
T
 
P
T
 
Y
M
 
M
I
 
A
A
 
E
R
 
Q
A
 
G
K
 
K
E
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
-
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
S
 
S
S
|
S
D
 
V
A
 
T
G
 
G
R
 
T
K
 
Y
G
 
G
T
x
N
I
x
V
G
 
G
Q
|
Q
I
 
T
N
 
N
Y
|
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
I
 
M
T
 
T
M
 
K
S
 
T
A
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
W
 
L
G
 
A
R
 
R
H
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
x
P
G
 
G
V
x
F
V
x
T
E
 
E
T
|
T
E
 
A
M
|
M
T
 
V
-
 
A
E
 
E
I
 
V
A
 
-
R
 
-
S
 
P
E
 
E
K
 
K
F
 
V
R
 
I
D
 
E
R
x
K
Y
 
M
L
 
K
S
 
A
N
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
F
 
L
L
 
G
S
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
D
A
 
I
A
 
A
Y
 
N
S
 
A
I
 
Y
A
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
H
A
 
E
S
 
S
A
 
D
F
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
H
H
 
V
L
 
L
S
 
H
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

P73826 Acetoacetyl-CoA reductase; EC 1.1.1.36 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
39% identity, 97% coverage: 5:254/257 of query aligns to 4:239/240 of P73826

query
sites
P73826
M
 
L
S
 
G
L
 
L
D
 
E
G
 
D
R
 
K
S
 
V
V
 
I
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
N
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
A
A
 
A
T
 
I
A
 
V
H
 
K
L
 
L
L
 
L
Y
 
Q
E
 
E
L
 
M
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
V
T
 
A
L
 
F
L
 
T
D
 
D
R
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
D
-
 
G
-
 
G
N
 
N
E
 
T
E
 
E
R
 
A
L
 
L
S
 
G
E
 
V
A
 
V
A
 
A
S
 
N
A
 
V
F
 
T
D
 
D
A
 
L
Q
 
E
R
 
S
I
 
M
L
 
T
V
 
A
Q
 
A
C
 
A
G
 
A
S
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
R
 
K
S
 
-
F
 
-
V
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
I
 
-
A
 
-
R
 
-
F
 
L
G
 
G
A
 
P
V
 
V
D
 
Y
G
 
G
L
 
V
V
 
V
N
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
K
T
 
D
A
 
N
M
 
F
I
 
F
E
 
P
K
 
K
M
 
L
T
 
T
L
 
P
E
 
A
D
 
D
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
L
D
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
A
N
 
Y
M
 
S
L
 
I
Q
 
K
A
 
P
V
 
F
G
 
I
T
 
E
T
 
G
M
 
M
I
 
Y
A
 
E
R
 
R
A
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
K
P
 
A
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
A
I
 
I
S
 
S
S
|
S
D
 
I
A
 
S
G
 
G
R
 
E
K
 
R
G
 
G
T
 
N
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
N
 
N
Y
|
Y
G
 
S
A
 
A
A
 
T
K
|
K
S
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
I
 
M
T
 
M
M
 
K
S
 
S
A
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
W
 
G
G
 
A
R
 
R
H
 
Y
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
A
N
 
N
S
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
P
G
 
G
V
 
F
V
 
I
E
 
D
T
 
T
E
 
E
M
 
M
T
 
T
E
 
-
I
 
L
A
 
A
R
 
I
S
 
R
E
 
E
K
 
D
F
 
I
R
 
R
D
 
E
R
 
K
Y
 
I
L
 
T
S
 
K
N
 
E
I
 
I
P
 
P
L
 
F
G
 
R
R
 
R
F
 
F
L
 
G
S
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
E
A
 
I
A
 
A
Y
 
W
S
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
P
 
P
-
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
S
F
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
H
 
V
L
 
L
S
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
A
G
 
H
H
 
H

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
39% identity, 98% coverage: 5:255/257 of query aligns to 4:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
M
 
M
S
 
N
L
 
L
D
 
E
G
 
G
R
 
K
S
 
V
V
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
Q
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
H
 
E
L
 
L
L
 
L
Y
 
A
E
 
E
L
 
R
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
V
T
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
N
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
I
S
 
G
E
 
T
A
 
A
A
x
T
S
 
S
A
 
E
F
 
S
D
 
G
A
 
A
Q
 
Q
R
 
A
I
 
I
L
 
S
V
 
D
Q
 
Y
C
 
L
G
 
G
-
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
M
-
 
A
-
 
L
S
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
N
R
 
P
S
 
E
F
 
S
V
 
I
G
 
E
R
 
A
A
 
V
M
 
L
A
 
K
A
 
A
H
 
I
I
 
T
A
 
D
R
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
T
 
D
A
 
N
M
 
L
I
 
L
E
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
L
 
E
E
 
E
D
 
E
W
 
W
Q
 
S
A
 
D
V
 
I
I
 
M
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
V
 
I
F
 
F
N
 
R
M
 
L
L
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
L
T
 
R
T
 
G
M
 
M
I
 
M
A
 
K
R
 
K
A
 
R
K
 
Q
E
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
-
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
V
S
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
T
K
 
M
G
 
G
T
 
N
I
 
A
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
I
 
F
T
 
T
M
 
K
S
 
S
A
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
E
W
 
V
G
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
T
V
 
V
A
 
A
Y
x
P
G
|
G
V
 
F
V
x
I
E
 
E
T
|
T
E
 
D
M
|
M
T
 
T
E
 
K
I
 
A
A
 
L
R
 
N
S
 
D
E
 
E
K
 
Q
F
 
-
R
 
R
D
 
T
R
 
A
Y
 
T
L
 
L
S
 
A
N
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
L
 
G
S
 
D
P
 
P
D
 
R
E
 
E
A
 
I
A
 
A
Y
 
S
S
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
P
A
 
E
S
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
H
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
M
H
 
Y
I
 
M

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
39% identity, 98% coverage: 5:255/257 of query aligns to 4:242/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
M
 
M
S
 
N
L
 
L
D
 
E
G
 
G
R
 
K
S
 
V
V
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
H
 
E
L
 
L
L
 
L
Y
 
A
E
 
E
L
 
R
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
V
T
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
N
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
I
S
 
G
E
 
T
A
 
A
A
x
T
S
 
S
A
 
E
F
 
S
D
 
G
A
 
A
Q
 
Q
R
 
A
I
 
I
L
 
S
V
 
D
Q
 
Y
C
 
L
G
 
G
-
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
M
-
 
A
-
 
L
S
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
N
R
 
P
S
 
E
F
 
S
V
 
I
G
 
E
R
 
A
A
 
V
M
 
L
A
 
K
A
 
A
H
 
I
I
 
T
A
 
D
R
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
T
 
D
A
 
N
M
 
L
I
 
L
E
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
L
 
E
E
 
E
D
 
E
W
 
W
Q
 
S
A
 
D
V
 
I
I
 
M
D
 
E
V
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
V
 
I
F
 
F
N
 
R
M
 
L
L
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
L
T
 
R
T
 
G
M
 
M
I
 
M
A
 
K
R
 
K
A
 
R
K
 
Q
E
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
-
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
V
S
x
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
T
K
 
M
G
 
G
T
 
N
I
 
A
G
 
G
Q
|
Q
I
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
I
 
F
T
 
T
M
 
K
S
 
S
A
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
E
W
 
V
G
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
T
V
 
V
A
 
A
Y
x
P
G
|
G
V
 
F
V
 
I
E
 
E
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
 
-
E
 
-
I
 
-
A
 
-
R
 
-
S
 
N
E
 
D
K
 
E
F
 
Q
R
 
R
D
 
T
R
 
A
Y
 
T
L
 
L
S
 
A
N
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
L
 
G
S
 
D
P
 
P
D
 
R
E
 
E
A
 
I
A
 
A
Y
 
S
S
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
P
A
 
E
S
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
H
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
M
H
 
Y
I
 
M

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
38% identity, 96% coverage: 10:255/257 of query aligns to 5:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
R
 
K
S
 
S
V
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
Q
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
S
T
 
I
A
 
A
H
 
L
L
 
Q
L
 
L
Y
 
A
E
 
E
L
 
E
G
 
G
A
 
Y
H
 
N
V
 
V
T
 
A
L
 
V
-
 
N
-
 
Y
-
 
A
-
 
G
L
 
S
D
 
K
R
 
E
N
 
K
E
 
A
E
 
E
R
 
A
L
 
V
S
 
V
E
 
E
A
 
E
A
 
I
S
 
K
A
 
A
F
 
K
D
 
G
A
 
V
Q
 
D
R
 
S
I
 
F
L
 
A
V
 
I
Q
 
Q
C
 
A
G
 
-
S
 
N
I
 
V
T
 
A
D
 
D
R
 
A
S
 
D
F
 
E
V
 
V
G
 
K
R
 
A
A
 
M
M
 
I
A
 
K
A
 
E
H
 
V
I
 
V
A
 
S
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
A
 
S
V
 
L
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
T
 
D
A
 
N
M
 
L
I
 
L
E
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
L
 
E
E
 
Q
D
 
E
W
 
W
Q
 
D
A
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
C
L
 
I
Q
 
Q
A
 
K
V
 
A
G
 
T
T
 
P
T
 
Q
M
 
M
I
 
L
A
 
R
R
 
Q
A
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
R
P
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
S
S
|
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
A
K
 
V
G
 
G
T
 
N
I
 
P
G
 
G
Q
|
Q
I
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
S
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
I
 
L
T
 
T
M
 
K
S
 
S
A
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
W
 
L
G
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
P
G
 
G
V
 
F
V
 
I
E
 
V
T
 
S
E
 
D
M
 
M
T
 
T
E
 
D
I
 
-
A
 
A
R
 
L
S
 
S
E
 
D
K
 
E
F
 
L
R
 
K
D
 
E
R
 
Q
Y
 
M
L
 
L
S
 
T
N
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
A
R
 
R
F
 
F
L
 
G
S
 
Q
P
 
D
D
 
T
E
 
D
A
 
I
A
 
A
Y
 
N
S
 
T
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
K
S
 
A
A
 
K
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
H
 
T
L
 
I
S
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
M
H
 
Y
I
 
M

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
42% identity, 96% coverage: 6:252/257 of query aligns to 3:243/247 of P73574

query
sites
P73574
S
 
A
L
 
L
D
 
T
G
 
A
R
 
Q
S
 
V
V
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
|
A
A
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
A
H
 
L
L
 
A
L
 
L
Y
 
A
E
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
M
H
 
K
V
 
V
T
 
V
L
 
V
L
 
-
D
 
-
R
 
-
N
 
N
E
 
Y
E
 
A
R
 
Q
L
 
S
S
 
S
E
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
D
A
 
A
F
 
V
D
 
V
A
 
A
Q
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
E
R
 
A
I
 
I
L
 
A
V
 
V
Q
 
Q
C
 
A
G
 
-
S
 
N
I
 
V
T
 
A
D
 
N
R
 
A
S
 
D
F
 
E
V
 
V
G
 
D
R
 
Q
A
 
L
M
 
I
A
 
K
A
 
T
H
 
T
I
 
L
A
 
D
R
 
K
F
 
F
G
 
S
A
 
R
V
 
I
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
T
 
D
A
 
T
M
 
L
I
 
L
E
 
L
K
 
R
M
 
M
T
 
K
L
 
L
E
 
E
D
 
D
W
 
W
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
L
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
L
M
 
C
L
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
S
T
 
K
T
 
L
M
 
M
I
 
L
A
 
K
R
 
Q
A
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
K
P
 
S
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
T
S
 
S
D
 
V
A
 
A
G
 
G
R
 
M
K
 
M
G
 
G
T
 
N
I
x
P
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
N
 
N
Y
 
Y
G
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
I
 
F
T
 
T
M
 
K
S
 
T
A
 
V
A
 
A
R
 
K
E
 
E
W
 
L
G
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
P
G
 
G
V
x
F
V
 
I
E
 
A
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
E
 
E
I
 
N
A
 
L
R
x
N
S
 
A
E
 
E
K
 
P
F
 
I
R
 
-
D
 
-
R
 
-
Y
 
-
L
 
L
S
 
Q
N
 
F
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
A
R
 
R
F
 
Y
L
 
G
S
 
Q
P
 
P
D
 
E
E
 
E
A
 
V
A
 
A
Y
 
G
S
 
T
I
 
I
A
 
R
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
T
-
 
D
P
 
P
A
 
A
S
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
H
 
T
L
 
F
S
 
N
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
38% identity, 96% coverage: 10:255/257 of query aligns to 2:239/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
R
 
K
S
 
S
V
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
S
T
 
I
A
 
A
H
 
L
L
 
Q
L
 
L
Y
 
A
E
 
E
L
 
E
G
 
G
A
 
Y
H
 
N
V
 
V
T
 
A
L
 
V
-
x
N
-
x
Y
-
x
A
-
x
G
L
x
S
D
 
K
R
 
E
N
 
K
E
 
A
E
 
E
R
 
A
L
 
V
S
 
V
E
 
E
A
 
E
A
 
I
S
 
K
A
 
A
F
 
K
D
 
G
A
 
V
Q
 
D
R
 
S
I
 
F
L
 
A
V
 
I
Q
 
Q
C
x
A
G
 
-
S
x
N
I
x
V
T
 
A
D
 
D
R
 
A
S
 
D
F
 
E
V
 
V
G
 
K
R
 
A
A
 
M
M
 
I
A
 
K
A
 
E
H
 
V
I
 
V
A
 
S
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
A
 
S
V
 
L
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
T
 
D
A
 
N
M
 
L
I
 
L
E
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
L
 
E
E
 
Q
D
 
E
W
 
W
Q
 
D
A
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
x
T
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
C
L
 
I
Q
 
Q
A
 
K
V
 
A
G
 
T
T
 
P
T
 
Q
M
 
M
I
 
L
A
 
R
R
 
Q
A
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
R
P
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
S
S
|
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
A
K
 
V
G
 
G
T
 
N
I
 
P
G
 
G
Q
|
Q
I
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
S
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
I
 
L
T
 
T
M
 
K
S
 
S
A
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
W
 
L
G
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
x
P
G
|
G
V
 
F
V
 
I
E
 
V
T
 
S
E
 
D
M
 
M
T
 
T
E
 
-
I
 
-
A
 
-
R
 
-
S
 
-
E
 
D
K
 
E
F
 
L
R
 
K
D
 
E
R
 
Q
Y
 
M
L
 
L
S
 
T
N
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
A
R
 
R
F
 
F
L
 
G
S
 
Q
P
 
D
D
 
T
E
 
D
A
 
I
A
 
A
Y
 
N
S
 
T
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
K
S
 
A
A
 
K
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
H
 
T
L
 
I
S
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
M
H
 
Y
I
 
M

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
38% identity, 97% coverage: 3:252/257 of query aligns to 2:244/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
N
 
N
P
 
A
M
 
M
S
 
K
L
 
L
D
 
A
G
 
S
R
 
K
S
 
T
V
 
A
I
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
F
A
 
G
T
 
I
A
 
A
H
 
Q
L
 
V
L
 
L
Y
 
A
E
 
R
L
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
R
V
 
V
T
 
I
L
 
I
L
 
A
D
|
D
R
|
R
N
 
D
E
 
A
E
 
H
R
 
G
L
 
E
S
 
A
E
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
L
F
 
R
D
 
E
-
 
S
-
 
G
A
 
A
Q
 
Q
R
 
A
I
 
L
L
 
F
V
 
I
Q
 
S
C
|
C
G
 
-
S
 
N
I
|
I
T
 
A
D
 
E
R
 
K
S
 
T
F
 
Q
V
 
V
G
 
E
R
 
A
A
 
L
M
 
F
A
 
S
A
 
Q
H
 
A
I
 
E
A
 
E
R
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
T
 
N
R
 
R
T
 
D
A
 
A
M
 
M
I
 
L
E
 
H
K
 
K
M
 
L
T
 
T
L
 
E
E
 
A
D
 
D
W
 
W
Q
 
D
A
 
T
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
|
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
N
 
L
M
 
C
L
 
M
Q
 
Q
A
 
Q
V
 
A
G
 
A
T
 
I
T
 
R
M
 
M
I
 
R
A
 
E
R
 
R
A
 
G
K
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
A
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
A
S
 
S
D
 
-
A
 
A
G
 
S
R
 
W
K
 
L
G
 
G
T
 
N
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
N
 
N
Y
|
Y
G
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
S
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
V
G
 
G
I
 
M
T
 
T
M
 
K
S
 
T
A
 
A
A
 
C
R
 
R
E
 
E
W
 
L
G
 
A
R
 
K
H
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
I
A
 
C
Y
 
P
G
 
G
V
 
F
V
x
I
E
 
D
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
|
T
E
 
R
I
 
-
A
 
G
R
 
V
S
 
P
E
 
E
K
 
N
F
 
V
R
 
W
D
 
Q
R
 
I
Y
 
M
L
 
V
S
 
S
N
 
K
I
 
I
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
Y
F
 
A
L
 
G
S
 
E
P
 
A
D
 
K
E
 
D
A
 
V
A
 
G
Y
 
E
S
 
C
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
G
S
 
A
A
 
R
F
 
Y
I
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
E
H
 
V
L
 
I
S
 
N
V
 
V
N
 
G
G
 
G
G
 
G

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
39% identity, 96% coverage: 6:252/257 of query aligns to 2:236/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
S
 
K
L
 
L
D
 
E
G
 
G
R
 
K
S
 
V
V
 
A
I
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
Q
x
K
G
|
G
I
x
L
G
 
G
L
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
A
H
 
L
L
 
A
L
 
Y
Y
 
A
E
 
E
L
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
V
T
 
I
L
 
A
L
 
G
D
|
D
R
x
L
N
 
G
E
 
D
E
 
-
R
 
-
L
 
L
S
 
T
E
 
Y
A
 
S
A
 
H
S
 
P
A
 
N
F
 
V
D
 
E
A
 
G
Q
 
M
R
 
Y
I
x
L
L
 
-
V
 
-
Q
 
-
C
 
-
G
 
-
S
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
R
 
V
S
 
T
F
 
G
V
 
V
G
 
E
R
 
K
A
 
F
M
 
Y
A
 
Q
A
 
S
H
 
V
I
 
I
A
 
D
R
 
K
F
 
Y
G
 
G
A
 
K
V
 
I
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
T
 
T
R
 
K
T
 
D
A
 
A
M
 
M
I
 
T
E
 
R
K
 
K
M
 
M
T
 
T
L
 
E
E
 
A
D
 
Q
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
L
L
 
T
Q
 
R
A
 
L
V
 
V
G
 
G
T
 
P
T
 
Q
M
 
M
I
 
Q
A
 
T
R
 
N
A
 
G
K
 
Y
E
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
-
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
V
K
 
F
G
 
G
T
 
N
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
T
K
|
K
S
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
I
 
L
T
 
T
M
 
M
S
 
T
A
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
W
 
F
G
 
A
R
 
L
H
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
I
A
 
A
Y
x
P
G
|
G
V
 
Y
V
x
I
E
 
-
T
 
-
E
 
-
M
 
M
T
|
T
E
 
D
I
 
I
A
 
L
R
 
K
S
 
T
-
 
V
-
 
P
E
 
Q
K
 
D
F
 
L
R
 
L
D
 
D
R
 
K
Y
 
F
L
 
A
S
 
A
N
 
L
I
 
T
P
 
M
L
 
L
G
 
N
R
 
R
F
 
L
L
 
G
S
 
Q
P
 
P
D
 
E
E
 
E
A
 
I
A
 
A
Y
 
K
S
 
V
I
 
A
A
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
D
S
 
A
A
 
S
F
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
H
 
T
L
 
I
S
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G

1edoA The x-ray structure of beta-keto acyl carrier protein reductase from brassica napus complexed with NADP+ (see paper)
39% identity, 94% coverage: 12:252/257 of query aligns to 4:241/244 of 1edoA

query
sites
1edoA
V
 
V
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
H
 
L
L
 
S
L
 
L
Y
 
G
E
 
K
L
 
A
G
 
G
A
 
C
H
 
K
V
 
V
T
 
L
L
 
V
-
x
N
-
x
Y
-
x
A
-
x
R
L
x
S
D
 
A
R
 
K
N
 
A
E
 
A
E
 
E
R
 
E
L
 
V
S
 
S
E
 
K
A
 
Q
A
 
I
S
 
E
A
 
A
F
 
Y
D
 
G
A
 
G
Q
 
Q
R
 
A
I
 
I
L
 
T
V
 
F
Q
 
G
C
 
-
G
 
G
S
x
D
I
x
V
T
 
S
D
 
K
R
 
E
S
 
A
F
 
D
V
 
V
G
 
E
R
 
A
A
 
M
M
 
M
A
 
K
A
 
T
H
 
A
I
 
I
A
 
D
R
 
A
F
 
W
G
 
G
A
 
T
V
 
I
D
 
D
G
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
T
 
D
A
 
T
M
 
L
I
 
L
E
 
I
K
 
R
M
 
M
T
 
K
L
 
K
E
 
S
D
 
Q
W
 
W
Q
 
D
A
 
E
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
L
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
L
M
 
C
L
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
G
 
T
T
 
K
T
 
I
M
 
M
I
 
M
A
 
K
R
 
K
A
 
R
K
 
K
E
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
-
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
A
S
|
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
L
K
 
I
G
 
G
T
 
N
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
I
 
F
T
 
S
M
 
K
S
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
W
 
G
G
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
S
 
V
V
 
V
A
 
C
Y
x
P
G
|
G
V
 
F
V
x
I
E
 
A
T
x
S
E
 
D
M
|
M
T
 
T
E
 
A
I
 
-
A
 
K
R
 
L
S
 
G
E
 
E
K
 
D
F
 
M
R
 
E
D
 
K
R
 
K
Y
 
I
L
 
L
S
 
G
N
 
T
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
T
L
 
G
S
 
Q
P
 
P
D
 
E
E
 
N
A
 
V
A
 
A
Y
 
G
S
 
L
I
 
V
A
 
E
F
 
F
L
 
L
-
 
A
L
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
A
S
 
A
A
 
S
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
H
 
A
L
 
F
S
 
T
V
 
I
N
 
D
G
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
37% identity, 96% coverage: 5:252/257 of query aligns to 1:244/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
M
S
 
T
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
R
 
K
S
 
V
V
 
A
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
S
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
D
T
 
I
A
 
A
H
 
I
L
 
N
L
 
L
Y
 
A
E
 
K
L
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
N
V
 
I
T
 
F
L
 
F
-
x
N
-
x
Y
-
x
N
-
x
G
-
x
S
-
 
P
-
 
E
-
 
A
L
 
A
D
 
E
R
 
E
N
 
T
E
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
V
S
 
A
E
 
E
A
 
H
A
 
G
S
 
V
A
 
E
F
 
V
D
 
E
A
 
A
Q
 
M
R
 
K
I
 
A
L
x
N
V
|
V
Q
 
A
C
 
I
G
 
A
S
 
E
I
 
D
T
 
V
D
 
D
R
 
A
S
 
F
F
 
F
V
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
K
A
 
Q
H
 
A
I
 
I
A
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
A
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
T
 
D
A
 
N
M
 
L
I
 
L
E
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
L
 
E
E
 
D
D
 
E
W
 
W
Q
 
D
A
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
N
 
L
M
 
C
L
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
S
T
 
R
T
 
T
M
 
M
I
 
M
A
 
K
R
 
Q
A
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
R
P
 
A
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
S
 
A
S
|
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
L
K
 
I
G
 
G
T
 
N
I
 
A
G
 
G
Q
|
Q
I
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
V
A
 
A
A
 
S
K
|
K
S
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
I
 
L
T
 
T
M
 
K
S
 
T
A
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
E
W
 
L
G
 
A
R
 
P
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
x
P
G
 
G
V
 
F
V
x
I
E
 
T
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
E
 
D
I
 
-
A
 
K
R
 
L
S
 
D
E
 
E
K
 
K
F
 
T
R
 
K
D
 
E
R
 
A
Y
 
M
L
 
L
S
 
A
N
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
A
F
 
Y
L
 
G
S
 
T
P
 
T
D
 
E
E
 
D
A
 
I
A
 
A
Y
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
A
S
 
S
A
 
K
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
H
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
38% identity, 98% coverage: 5:255/257 of query aligns to 1:243/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
M
 
M
S
 
S
L
 
F
D
 
E
G
 
G
R
 
K
S
 
I
V
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
Q
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
H
 
E
L
 
T
L
 
L
Y
 
V
E
 
A
L
 
R
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
V
T
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
N
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
I
S
 
G
E
 
T
A
 
A
A
x
T
S
 
S
A
 
E
F
 
S
D
 
G
A
 
A
Q
 
Q
R
 
A
I
 
I
L
 
S
V
 
D
Q
 
Y
C
 
L
G
 
G
S
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
M
-
x
L
-
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
R
 
P
S
 
A
F
 
S
V
 
I
G
 
E
R
 
S
A
 
V
M
 
L
A
 
E
A
 
N
H
 
V
I
 
R
A
 
A
R
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
E
V
 
V
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
T
 
D
A
 
N
M
 
L
I
 
L
E
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
L
 
D
E
 
D
D
 
E
W
 
W
Q
 
N
A
 
D
V
 
I
I
 
I
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
N
 
R
M
 
L
L
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
M
T
 
R
T
 
A
M
 
M
I
 
M
A
 
K
R
 
K
A
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
R
P
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
T
K
 
M
G
 
G
T
 
N
I
 
A
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
S
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
I
G
 
G
I
 
F
T
 
S
M
 
K
S
 
S
A
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
W
 
V
G
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
P
G
 
G
V
 
F
V
 
I
E
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
E
 
R
I
 
-
A
 
A
R
 
L
S
 
T
E
 
D
K
 
E
F
 
Q
R
 
R
D
 
A
R
 
G
Y
 
T
L
 
L
S
 
A
N
 
A
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
L
 
G
S
 
T
P
 
P
D
 
N
E
 
E
A
 
I
A
 
A
Y
 
S
S
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
E
S
 
A
A
 
S
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
H
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
M
H
 
Y
I
 
M

5vmlA Crystal structure of acetoacetyl-coa reductase from burkholderia pseudomallei 1710b with bound NADP
38% identity, 96% coverage: 10:255/257 of query aligns to 3:244/245 of 5vmlA

query
sites
5vmlA
R
 
R
S
 
I
V
 
A
I
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
M
Q
x
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
T
A
 
S
T
 
I
A
 
C
H
 
Q
L
 
R
L
 
L
Y
 
H
E
 
K
L
 
D
G
 
G
A
 
F
H
 
R
V
 
V
T
 
V
L
 
A
-
 
G
L
x
C
D
x
G
R
 
P
N
 
N
E
 
S
E
 
P
R
|
R
L
 
R
-
 
V
-
 
K
-
 
W
-
 
L
-
 
E
S
 
D
E
 
Q
A
 
K
A
 
A
S
 
L
A
 
G
F
 
F
D
 
D
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
I
 
F
L
 
Y
V
 
A
Q
 
S
C
 
E
G
|
G
S
x
N
I
x
V
T
 
G
D
 
D
R
 
W
S
 
D
F
 
S
V
 
T
G
 
K
R
 
Q
A
 
A
M
 
F
A
 
D
A
 
K
H
 
V
I
 
K
A
 
A
R
 
E
F
 
V
G
 
G
A
 
E
V
 
I
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
T
 
D
A
 
V
M
 
V
I
 
F
E
 
R
K
 
K
M
 
M
T
 
T
L
 
R
E
 
E
D
 
D
W
 
W
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
V
 
L
F
 
F
N
 
N
M
 
V
L
 
T
Q
 
K
A
 
Q
V
 
V
G
 
I
T
 
D
T
 
G
M
 
M
I
 
V
A
 
E
R
 
R
A
 
G
K
 
W
E
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
-
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
S
S
|
S
D
 
V
A
 
N
G
 
G
R
 
Q
K
 
K
G
 
G
T
 
Q
I
 
F
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
N
 
N
Y
|
Y
G
 
S
A
 
T
A
 
A
K
|
K
S
 
A
G
 
G
V
 
I
L
 
H
G
 
G
I
 
F
T
 
T
M
 
M
S
 
S
A
 
L
A
 
A
R
 
Q
E
 
E
W
 
V
G
 
A
R
 
T
H
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
T
V
 
V
A
 
S
Y
x
P
G
|
G
V
 
Y
V
x
I
E
 
G
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
V
E
 
K
I
 
A
A
 
I
R
 
R
S
 
P
E
 
D
K
 
V
F
 
L
R
 
-
D
 
E
R
 
K
Y
 
I
L
 
V
S
 
A
N
 
T
I
 
I
P
 
P
L
 
V
G
 
R
R
 
R
F
 
L
L
 
G
S
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
E
A
 
I
A
 
G
Y
 
S
S
 
I
I
 
V
A
 
A
F
 
W
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
E
A
 
E
S
 
S
A
 
G
F
 
F
I
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
H
 
D
L
 
F
S
 
S
V
 
L
N
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
L
H
 
H
I
 
M

9clyB Crystal structure of the 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, cylg, from streptococcus agalactiae 2603v/r
35% identity, 95% coverage: 10:252/257 of query aligns to 4:238/242 of 9clyB

query
sites
9clyB
R
 
K
S
 
V
V
 
A
I
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
T
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
T
H
 
K
L
 
E
L
 
L
Y
 
Y
E
 
K
L
 
E
G
 
G
A
 
Y
H
 
K
V
 
V
T
 
I
L
 
A
L
 
I
-
x
Y
-
x
N
-
x
S
-
 
N
D
 
D
R
 
A
N
 
K
E
 
A
E
 
R
R
 
A
L
 
L
S
 
Q
E
 
E
A
 
E
A
 
L
S
 
P
A
 
K
F
 
L
D
 
D
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
V
V
 
Y
Q
 
K
C
|
C
G
 
-
S
x
N
I
|
I
T
 
S
D
 
D
R
 
A
S
 
K
F
 
A
V
 
V
G
 
Q
R
 
K
A
 
L
M
 
V
A
 
T
A
 
K
H
 
I
I
 
F
A
 
R
R
 
E
F
 
Y
G
 
G
A
 
G
V
 
I
D
 
D
G
 
C
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
V
R
 
R
T
 
D
A
 
G
M
 
F
I
 
F
E
 
L
K
 
M
M
 
M
T
 
S
L
 
K
E
 
E
D
 
K
W
 
W
Q
 
M
A
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
N
V
 
I
N
 
N
L
 
I
T
 
M
G
 
G
V
 
L
F
 
V
N
 
N
M
 
M
L
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
L
T
 
K
T
 
I
M
 
M
I
 
K
A
 
A
R
 
K
A
 
R
K
 
I
E
 
Q
G
 
G
E
 
K
A
 
-
N
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
V
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
D
 
T
A
 
S
G
 
G
R
 
I
K
 
A
G
 
G
T
 
Q
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
S
A
 
A
A
 
T
K
|
K
S
 
G
G
 
A
V
 
I
L
 
I
G
 
S
I
 
I
T
 
T
M
 
K
S
 
T
A
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
W
 
F
G
 
A
R
 
S
H
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
I
N
 
N
S
 
C
V
 
V
A
 
S
Y
 
P
G
|
G
V
 
F
V
x
I
E
 
E
T
|
T
E
 
D
M
|
M
T
 
T
-
 
N
E
 
E
I
 
L
A
 
Q
R
 
N
S
 
K
E
 
E
K
 
E
F
 
L
R
 
K
D
 
E
R
 
H
Y
 
L
L
 
-
S
 
-
N
 
-
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
K
R
 
R
F
 
F
L
 
G
S
 
Q
P
 
P
D
 
E
E
 
E
A
 
V
A
 
A
Y
 
W
S
 
L
I
 
V
A
 
S
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
E
A
 
K
S
 
A
A
 
N
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
K
H
 
N
L
 
I
S
 
V
V
 
I
N
 
D
G
 
G
G
 
G

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
38% identity, 98% coverage: 5:255/257 of query aligns to 1:243/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
M
 
M
S
 
N
L
 
F
D
 
E
G
 
G
R
 
K
S
 
I
V
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
|
A
A
x
S
Q
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
H
 
E
L
 
T
L
 
L
Y
 
A
E
 
A
L
 
R
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
V
T
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
N
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
I
S
 
G
E
 
T
A
 
A
A
x
T
S
 
S
A
 
E
F
 
N
D
 
G
A
 
A
Q
 
Q
R
 
A
I
 
I
L
 
S
V
 
D
Q
 
Y
C
 
L
G
 
G
S
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
M
-
 
L
-
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
R
 
P
S
 
A
F
 
S
V
 
I
G
 
E
R
 
S
A
 
V
M
 
L
A
 
E
A
 
K
H
 
I
I
 
R
A
 
A
R
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
E
V
 
V
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
T
 
D
A
 
N
M
 
L
I
 
L
E
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
L
 
D
E
 
E
D
 
E
W
 
W
Q
 
N
A
 
D
V
 
I
I
 
I
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
N
 
R
M
 
L
L
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
M
T
 
R
T
 
A
M
 
M
I
 
M
A
 
K
R
 
K
A
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
R
P
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
 
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
T
K
 
M
G
 
G
T
 
N
I
 
G
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
x
A
A
|
A
A
|
A
K
|
K
S
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
I
G
 
G
I
 
F
T
 
S
M
 
K
S
 
S
A
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
W
 
V
G
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
P
G
 
G
V
 
F
V
x
I
E
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
E
 
R
I
 
-
A
 
A
R
 
L
S
 
S
E
 
D
K
 
D
F
 
Q
R
 
R
D
 
A
R
 
G
Y
 
I
L
 
L
S
 
A
N
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
L
 
G
S
 
G
P
 
A
D
 
Q
E
 
E
A
 
I
A
 
A
Y
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
E
S
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
x
E
H
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
M
H
 
Y
I
 
M

5u9pB Crystal structure of a gluconate 5-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia j2315 in complex with NADP and tartrate
37% identity, 98% coverage: 2:252/257 of query aligns to 9:256/261 of 5u9pB

query
sites
5u9pB
I
 
L
N
 
D
P
 
R
M
 
F
S
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
R
 
R
S
 
R
V
 
A
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
G
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
T
T
 
L
A
 
A
H
 
R
L
 
G
L
 
L
Y
 
A
E
 
E
L
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
A
V
 
I
T
 
V
L
 
I
L
 
N
D
 
D
R
|
R
N
 
N
E
 
E
E
 
E
R
 
K
L
 
A
S
 
A
E
 
T
A
 
L
A
 
A
S
 
R
A
 
R
F
 
F
D
 
R
A
 
D
Q
 
E
R
 
G
I
 
F
L
 
A
V
 
A
Q
 
D
C
 
H
G
 
A
-
 
V
-
 
F
S
x
D
I
x
V
T
 
A
D
 
E
R
 
H
S
 
A
F
 
Q
V
 
V
G
 
R
R
 
A
A
 
A
M
 
I
A
 
D
A
 
E
H
 
F
I
 
E
A
 
A
R
 
R
F
 
V
G
 
G
A
 
A
V
 
I
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
Q
R
 
R
T
 
R
A
 
A
M
 
P
I
 
L
E
 
D
K
 
A
M
 
F
T
 
E
L
 
P
E
 
D
D
 
D
W
 
W
Q
 
H
A
 
A
V
 
L
I
 
M
D
 
R
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
V
L
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
G
 
A
T
 
R
T
 
H
M
 
M
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
G
K
 
H
E
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
-
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
C
S
|
S
D
 
V
A
 
Q
G
 
S
R
 
E
K
 
L
G
 
A
T
 
R
I
 
P
G
 
T
Q
 
I
I
 
A
N
 
P
Y
|
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
T
K
|
K
S
 
G
G
 
A
V
 
V
L
 
R
G
 
M
I
 
L
T
 
T
M
 
K
S
 
G
A
 
M
A
 
C
R
 
A
E
 
D
W
 
W
G
 
A
R
 
R
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
Q
V
 
A
N
 
N
S
 
G
V
 
L
A
 
A
Y
x
P
G
 
G
V
 
Y
V
x
F
E
 
E
T
|
T
E
 
E
M
x
L
T
x
N
E
 
R
-
 
A
I
 
L
A
 
V
R
 
D
S
 
D
E
 
A
K
 
A
F
 
F
R
 
S
D
 
D
R
 
W
Y
 
L
L
 
C
S
 
K
N
 
R
I
 
T
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
W
L
 
G
S
 
Q
P
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
L
A
 
C
Y
 
G
S
 
A
I
 
A
A
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
D
F
 
F
I
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
Q
H
 
T
L
 
L
S
 
F
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
37% identity, 98% coverage: 5:255/257 of query aligns to 1:243/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
M
 
M
S
 
S
L
 
F
D
 
E
G
 
G
R
 
K
S
 
I
V
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
H
 
E
L
 
T
L
 
L
Y
 
V
E
 
A
L
 
R
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
V
T
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
N
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
I
S
 
G
E
 
T
A
 
A
A
 
T
S
 
S
A
 
E
F
 
N
D
 
G
A
 
A
Q
 
K
R
 
N
I
 
I
L
 
S
V
 
D
Q
 
Y
C
 
L
G
 
G
S
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
M
-
 
L
-
 
N
I
 
V
T
 
T
D
 
D
R
 
P
S
 
A
F
 
S
V
 
I
G
 
E
R
 
S
A
 
V
M
 
L
A
 
E
A
 
N
H
 
I
I
 
R
A
 
A
R
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
E
V
 
V
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
T
 
D
A
 
N
M
 
L
I
 
L
E
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
L
 
D
E
 
D
D
 
E
W
 
W
Q
 
N
A
 
D
V
 
I
I
 
I
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
N
 
R
M
 
L
L
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
M
T
 
R
T
 
A
M
|
M
I
 
M
A
 
K
R
 
K
A
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
R
P
 
C
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
 
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
T
K
 
M
G
 
G
T
 
N
I
 
A
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
N
 
N
Y
 
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
S
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
I
G
 
G
I
 
F
T
 
S
M
 
K
S
 
S
A
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
W
 
V
G
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
P
G
 
G
V
 
F
V
 
I
E
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
E
 
R
I
 
-
A
 
A
R
 
L
S
 
S
E
 
D
K
 
D
F
 
Q
R
 
R
D
 
A
R
 
G
Y
 
I
L
 
L
S
 
A
N
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
L
 
G
S
 
G
P
 
A
D
 
Q
E
 
E
A
 
I
A
 
A
Y
 
S
S
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
x
A
S
|
S
P
 
D
A
 
E
S
 
A
A
 
S
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
H
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
M
H
 
Y
I
 
M

5vt6A Crystal structure of acetoacetyl-coa reductase from burkholderia pseudomallei 1710b complexed with NADP
37% identity, 96% coverage: 10:256/257 of query aligns to 2:245/245 of 5vt6A

query
sites
5vt6A
R
 
R
S
 
V
V
 
A
I
 
F
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
M
Q
x
G
G
|
G
I
x
L
G
 
G
L
 
A
A
 
A
T
 
I
A
 
S
H
 
R
L
 
R
L
 
L
Y
 
H
E
 
D
L
 
A
G
 
G
A
 
M
H
 
A
V
 
V
T
 
A
L
 
V
L
 
S
-
x
H
-
x
S
D
 
E
R
 
R
N
|
N
E
 
D
E
 
H
R
 
V
L
 
S
S
 
T
E
 
W
A
 
L
A
 
M
S
 
H
A
 
E
F
 
R
D
 
D
A
 
A
Q
 
G
R
 
R
I
 
D
L
 
F
V
 
K
Q
 
A
C
 
Y
G
 
A
-
x
V
S
x
D
I
x
V
T
 
A
D
 
D
R
 
F
S
 
E
F
 
S
V
 
C
G
 
E
R
 
R
A
 
C
M
 
A
A
 
E
A
 
K
H
 
V
I
 
L
A
 
A
R
 
D
F
 
F
G
 
G
A
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
T
 
D
A
 
A
M
 
T
I
 
F
E
 
M
K
 
K
M
 
M
T
 
T
L
 
K
E
 
G
D
|
D
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
M
D
 
R
V
 
T
N
 
D
L
 
L
T
 
D
G
 
A
V
 
M
F
 
F
N
 
N
M
 
V
L
 
T
Q
 
K
A
 
Q
V
 
F
G
 
I
T
 
A
T
 
G
M
 
M
I
 
V
A
 
E
R
 
R
A
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
R
P
 
F
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
S
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
N
G
 
G
R
 
S
K
 
R
G
 
G
T
 
A
I
 
F
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
A
A
 
S
A
 
A
K
|
K
S
 
A
G
 
G
V
 
I
L
 
H
G
 
G
I
 
F
T
 
T
M
 
K
S
 
T
A
 
L
A
 
A
R
 
L
E
 
E
W
 
T
G
 
A
R
 
K
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
T
V
 
V
A
 
S
Y
x
P
G
 
G
V
x
Y
V
x
L
E
 
A
T
|
T
E
 
A
M
 
M
T
 
V
E
 
E
I
 
A
A
 
V
R
 
P
S
 
Q
E
 
D
K
 
V
F
 
L
R
 
E
D
 
A
R
 
K
Y
 
I
L
 
L
S
 
P
N
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
V
G
 
G
R
 
R
F
 
L
L
 
G
S
 
R
P
 
P
D
 
D
E
 
E
A
 
V
A
 
A
Y
 
A
S
 
L
I
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
C
S
 
S
P
 
D
A
 
D
S
 
A
A
 
G
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
H
 
D
L
 
L
S
 
A
V
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
M
H
 
H
I
 
M
T
 
S

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
38% identity, 97% coverage: 6:255/257 of query aligns to 1:242/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
S
 
N
L
 
F
D
 
E
G
 
G
R
 
K
S
 
I
V
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
Q
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
H
 
E
L
 
T
L
 
L
Y
 
A
E
 
A
L
 
R
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
V
T
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
N
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
I
S
 
G
E
 
T
A
 
A
A
x
T
S
 
S
A
 
E
F
 
N
D
 
G
A
 
A
Q
 
Q
R
 
A
I
 
I
L
 
S
V
 
D
Q
 
Y
C
 
L
G
 
G
S
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
M
-
 
L
-
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
R
 
P
S
 
A
F
 
S
V
 
I
G
 
E
R
 
S
A
 
V
M
 
L
A
 
E
A
 
K
H
 
I
I
 
R
A
 
A
R
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
E
V
 
V
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
T
 
D
A
 
N
M
 
L
I
 
L
E
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
L
 
D
E
 
E
D
x
E
W
 
W
Q
 
N
A
 
D
V
 
I
I
 
I
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
N
 
R
M
 
L
L
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
M
T
 
R
T
 
A
M
 
M
I
 
M
A
 
K
R
 
K
A
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
R
P
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
T
K
 
M
G
 
G
T
 
N
I
 
G
G
 
G
Q
|
Q
I
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
S
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
I
G
 
G
I
 
F
T
 
S
M
 
K
S
 
S
A
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
W
 
V
G
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
x
P
G
|
G
V
 
F
V
x
I
E
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
E
 
R
I
 
-
A
 
A
R
 
L
S
 
S
E
 
D
K
 
D
F
 
Q
R
 
R
D
 
A
R
 
G
Y
 
I
L
 
L
S
 
A
N
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
L
 
G
S
 
G
P
 
A
D
 
Q
E
 
E
A
 
I
A
 
A
Y
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
E
S
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
x
E
H
x
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
M
H
 
Y
I
 
M

7emgB Carbonyl reductase variant 4 (r123c/l209p/f183y/v61k) from serratia marcescens complexed with NADP+ (see paper)
38% identity, 97% coverage: 6:255/257 of query aligns to 1:242/243 of 7emgB

query
sites
7emgB
S
 
S
L
 
F
D
 
E
G
 
G
R
 
K
S
 
I
V
 
V
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
Q
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
H
 
E
L
 
T
L
 
F
Y
 
V
E
 
A
L
 
R
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
V
T
 
-
L
 
I
L
 
G
D
 
T
R
 
A
N
x
T
E
 
S
E
 
E
R
 
S
L
 
G
S
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
I
S
 
S
A
 
G
F
 
Y
D
 
L
A
 
G
Q
 
A
R
 
N
I
 
G
L
 
K
V
 
G
Q
 
F
C
 
M
G
 
L
S
x
N
I
x
V
T
 
K
D
 
D
R
 
A
S
 
Q
F
 
S
V
 
I
G
 
D
R
 
S
A
 
V
M
 
L
A
 
A
A
 
S
H
 
I
I
 
R
A
 
A
R
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
E
V
 
I
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
T
 
D
A
 
N
M
 
L
I
 
L
E
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
L
 
D
E
 
D
D
 
E
W
 
W
Q
 
E
A
 
D
V
 
I
I
 
L
D
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
V
 
V
F
 
F
N
 
R
M
 
L
L
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
M
T
 
C
T
 
A
M
 
M
I
 
M
A
 
K
R
 
K
A
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
R
P
 
F
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
 
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
T
K
 
M
G
 
G
T
 
N
I
 
A
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
N
 
N
Y
 
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
S
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
I
G
 
G
I
 
F
T
 
S
M
 
K
S
 
S
A
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
W
 
V
G
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
P
G
 
G
V
 
Y
V
 
I
E
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
E
 
R
I
 
-
A
 
A
R
 
L
S
 
T
E
 
D
K
 
D
F
 
Q
R
 
R
D
 
A
R
 
G
Y
 
I
L
 
L
S
 
S
N
 
S
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
N
R
 
R
F
 
P
L
 
G
S
 
D
P
 
A
D
 
K
E
 
E
A
 
I
A
 
A
Y
 
S
S
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
E
S
 
A
A
 
G
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
H
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
M
H
 
Y
I
 
M

Query Sequence

>Ga0059261_2906 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_2906
MINPMSLDGRSVIITGAAQGIGLATAHLLYELGAHVTLLDRNEERLSEAASAFDAQRILV
QCGSITDRSFVGRAMAAHIARFGAVDGLVNNAGITRTAMIEKMTLEDWQAVIDVNLTGVF
NMLQAVGTTMIARAKEGEANPGAIVNISSDAGRKGTIGQINYGAAKSGVLGITMSAAREW
GRHGIRVNSVAYGVVETEMTEIARSEKFRDRYLSNIPLGRFLSPDEAAYSIAFLLSPASA
FITGQHLSVNGGGHITA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory