SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_2908 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_2908 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5jbxB Crystal structure of liuc in complex with coenzyme a and malonic acid (see paper)
34% identity, 87% coverage: 31:269/275 of query aligns to 25:258/261 of 5jbxB

query
sites
5jbxB
K
x
R
M
x
R
N
 
N
A
|
A
L
 
I
D
 
S
G
 
R
P
 
A
M
 
M
F
 
L
D
 
K
A
 
E
L
 
L
I
 
G
A
 
E
A
 
L
A
 
V
E
 
T
S
 
R
V
 
V
A
 
S
V
 
S
D
 
S
P
 
R
T
 
D
I
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
I
S
 
T
G
 
G
E
 
A
G
 
G
-
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
|
A
G
 
G
I
x
A
D
|
D
L
|
L
E
x
K
S
 
E
L
x
R
Q
 
A
A
 
T
L
 
M
M
 
A
S
 
E
D
 
D
E
 
E
G
 
V
K
 
R
Q
 
A
A
 
F
M
x
L
Q
 
D
S
 
-
R
 
-
S
 
-
H
 
-
G
 
G
L
 
L
A
x
R
N
 
R
R
 
T
Y
 
F
Q
 
R
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
A
W
 
I
R
 
E
E
 
K
V
 
S
P
 
D
V
 
C
P
 
V
V
 
F
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
I
H
 
N
G
 
G
V
 
A
A
 
A
F
x
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
L
 
T
Q
x
E
I
 
L
P
 
A
L
 
L
G
 
A
A
 
C
D
 
D
I
 
L
R
 
R
I
 
V
S
 
A
A
 
A
P
 
P
D
 
A
T
 
A
K
 
E
F
 
L
S
 
G
L
 
L
M
x
T
E
|
E
V
 
V
R
 
K
W
x
L
G
 
G
I
|
I
V
 
I
P
|
P
D
x
G
M
 
G
A
 
G
G
 
G
T
 
T
V
 
Q
L
 
R
L
 
L
R
 
A
S
 
R
I
 
L
V
 
V
R
 
G
E
 
P
D
 
G
V
 
R
L
 
A
R
 
K
E
 
D
L
 
L
I
 
I
Y
 
L
T
 
T
A
 
A
R
 
R
V
x
R
F
 
I
T
 
N
G
 
A
I
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
F
S
 
S
M
 
V
G
 
G
I
 
L
V
 
A
T
 
N
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
P
N
 
E
P
 
G
H
 
H
V
 
L
A
 
L
A
 
A
L
 
V
E
 
A
-
 
Y
-
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
E
S
 
S
I
 
V
A
 
V
E
 
E
Q
 
N
G
 
A
P
 
P
R
 
I
A
 
A
V
 
V
R
 
A
A
 
T
A
 
A
K
 
K
Q
 
H
L
 
A
L
 
I
N
 
D
E
 
E
T
 
G
Q
 
T
S
 
G
V
 
L
S
 
E
P
 
L
Q
 
D
V
 
D
A
 
A
L
 
L
L
x
A
S
 
L
E
 
E
S
 
L
E
 
R
A
 
K
Q
 
Y
V
 
E
G
 
E
L
 
I
L
|
L
A
 
K
G
 
T
P
 
E
D
 
D
Q
 
R
I
 
L
E
 
E
A
 
G
L
 
L
N
 
R
A
 
A
H
 
F
A
 
A
E
 
E
Q
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
Y
 
V
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

O53561 Enoyl-CoA hydratase EchA19; EC 4.2.1.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
30% identity, 93% coverage: 17:271/275 of query aligns to 14:265/266 of O53561

query
sites
O53561
R
 
R
A
 
R
G
 
G
A
 
H
V
 
T
A
 
L
D
 
I
I
 
V
R
 
T
L
 
M
R
 
N
R
 
R
P
 
P
F
 
A
K
 
A
M
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
S
G
 
T
P
 
E
M
 
M
F
 
M
D
 
R
A
 
I
L
 
M
I
 
V
A
 
Q
A
 
A
A
 
W
E
 
D
S
 
R
V
 
V
A
 
D
V
 
N
D
 
D
P
 
P
T
 
D
I
 
I
R
 
R
A
 
C
V
 
C
V
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
A
G
 
G
K
 
G
A
 
Y
F
 
F
C
 
C
A
 
A
G
 
G
I
 
M
D
 
D
L
 
L
E
 
-
S
 
-
L
 
-
Q
 
K
A
 
A
L
 
A
M
 
T
S
 
Q
D
 
K
E
 
P
G
 
P
K
 
G
Q
 
D
A
 
S
M
 
F
Q
 
K
S
 
D
R
 
G
S
 
S
H
 
Y
G
 
G
L
 
P
A
 
S
N
 
R
R
 
-
Y
 
-
Q
 
I
Q
 
D
A
 
A
A
 
L
L
 
L
A
 
K
W
 
G
R
 
R
E
 
R
V
 
L
P
 
T
V
 
K
P
 
P
V
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
V
H
 
E
G
 
G
V
 
P
A
 
A
F
 
I
G
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
T
Q
 
E
I
 
I
P
 
L
L
 
Q
G
 
G
A
 
T
D
 
D
I
 
I
R
 
R
I
 
V
S
 
A
A
 
G
P
 
E
D
 
S
T
 
A
K
|
K
F
|
F
S
x
G
L
x
I
M
x
S
E
|
E
V
x
A
R
x
K
W
 
W
G
 
S
I
 
L
V
 
Y
P
 
P
D
 
M
M
 
G
A
 
G
G
 
S
T
 
A
V
 
V
L
 
R
L
 
L
R
 
V
S
 
R
I
 
Q
V
 
I
R
 
P
E
 
Y
D
 
T
V
 
L
L
 
A
R
 
C
E
 
D
L
 
L
I
 
L
Y
 
L
T
 
T
A
 
G
R
 
R
V
 
H
F
 
I
T
 
T
G
 
A
I
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
K
S
 
E
M
 
M
G
 
G
I
 
L
V
 
I
T
 
G
Q
 
H
L
 
V
A
 
V
A
 
P
N
 
D
P
 
G
H
 
Q
-
 
A
-
 
L
V
 
T
A
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
S
 
D
S
 
A
I
 
I
A
 
S
E
 
A
Q
 
N
G
 
G
P
 
P
R
 
L
A
 
A
V
 
V
R
 
Q
A
 
A
A
 
I
K
 
L
Q
 
R
L
 
S
L
 
I
N
 
R
E
 
E
T
 
T
Q
 
E
S
 
C
V
 
M
S
 
P
P
 
E
Q
 
N
V
 
E
A
 
A
L
 
F
L
 
K
S
 
I
E
 
D
S
 
T
E
 
Q
A
 
I
Q
 
G
V
 
I
G
 
K
L
 
V
L
 
F
A
 
L
G
 
S
P
 
D
D
 
D
Q
 
A
I
 
K
E
 
E
A
 
G
L
 
P
N
 
R
A
 
A
H
 
F
A
 
A
E
 
E
Q
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
Y
 
N
Y
 
F
T
 
Q
D
 
N

5zaiC Crystal structure of 3-hydroxypropionyl-coa dehydratase from metallosphaera sedula (see paper)
30% identity, 94% coverage: 11:269/275 of query aligns to 4:256/259 of 5zaiC

query
sites
5zaiC
D
 
E
R
 
T
V
 
I
S
 
E
I
 
T
G
 
K
R
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
N
V
 
L
A
 
F
D
 
W
I
 
I
R
 
T
L
 
L
R
 
N
R
 
R
P
 
P
F
 
D
K
|
K
M
x
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
N
G
 
A
P
 
K
M
 
L
F
 
L
D
 
E
A
 
E
L
 
L
I
 
D
A
 
R
A
 
A
A
 
V
E
 
S
S
 
Q
V
 
A
A
 
E
V
 
S
D
 
D
P
 
P
T
 
E
I
 
I
R
 
R
A
 
V
V
 
I
V
 
I
L
 
I
S
 
T
G
 
G
E
 
K
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
|
A
G
|
G
I
x
A
D
|
D
L
x
I
E
 
T
S
 
Q
L
x
F
Q
 
N
A
 
Q
L
 
L
M
 
T
S
 
P
D
 
A
E
 
E
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
A
M
 
W
Q
 
K
S
 
F
R
x
S
S
 
K
H
 
K
G
 
G
L
x
R
A
 
E
N
 
I
R
 
M
Y
 
D
Q
 
K
Q
 
I
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
S
W
 
-
R
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
K
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
M
L
 
I
H
 
N
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
L
Q
x
E
I
 
L
P
 
A
L
 
L
G
 
A
A
 
C
D
 
D
I
 
I
R
 
R
I
 
I
S
 
A
A
 
A
P
 
E
D
 
E
T
 
A
K
 
Q
F
 
L
S
 
G
L
 
L
M
x
P
E
|
E
V
 
I
R
 
N
W
 
L
G
 
G
I
|
I
V
 
Y
P
|
P
D
x
G
M
 
Y
A
 
G
G
 
G
T
 
T
V
 
Q
L
 
R
L
 
L
R
 
T
S
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
G
E
 
K
D
 
G
V
 
R
L
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
M
I
 
M
Y
 
M
T
 
T
A
 
G
R
 
D
V
x
R
F
 
I
T
 
P
G
 
G
I
 
K
E
 
D
A
 
A
A
 
E
S
 
K
M
 
Y
G
 
G
I
 
L
V
 
V
T
 
N
Q
 
R
L
 
V
A
 
V
-
 
P
-
 
L
A
 
A
N
 
N
P
 
L
H
 
E
V
 
Q
A
 
E
A
 
T
L
 
R
E
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
E
S
 
K
I
 
I
A
 
A
E
 
K
Q
 
K
G
 
S
P
 
P
R
 
I
A
 
S
V
 
L
R
 
A
A
 
L
A
 
I
K
 
K
Q
 
E
L
 
V
L
 
V
N
 
N
E
 
R
T
 
G
Q
 
L
S
 
D
V
 
S
S
 
P
P
 
L
Q
 
L
V
 
S
A
 
G
L
 
L
L
x
A
S
 
L
E
 
E
S
 
S
E
 
V
A
 
G
Q
 
W
V
 
G
G
 
V
L
 
V
L
x
F
A
 
S
G
 
T
P
 
E
D
 
D
Q
 
K
I
 
K
E
 
E
A
 
G
L
 
V
N
 
S
A
 
A
H
x
F
A
 
L
E
 
E
Q
x
K
R
 
R
K
 
E
P
 
P
Y
 
T
Y
 
F

Q62651 Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial; EC 5.3.3.- from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
32% identity, 89% coverage: 21:265/275 of query aligns to 66:317/327 of Q62651

query
sites
Q62651
V
 
V
A
 
L
D
 
H
I
 
V
R
 
Q
L
 
L
R
 
N
R
 
R
P
 
P
F
 
E
K
 
K
M
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
M
D
 
N
G
 
R
P
 
A
M
 
F
F
 
W
D
 
R
A
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
E
A
 
C
A
 
F
E
 
Q
S
 
K
V
 
I
A
 
S
V
 
K
D
 
D
P
 
S
T
 
D
I
 
C
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
M
F
 
F
C
 
T
A
 
S
G
 
G
I
 
I
D
 
D
L
 
L
-
 
M
-
 
D
-
 
M
-
 
A
-
 
S
E
 
D
S
 
I
L
 
L
Q
 
Q
A
 
P
L
 
P
M
 
G
S
 
D
D
 
D
E
 
V
G
 
A
K
 
R
Q
 
I
A
 
A
M
 
W
Q
 
Y
S
 
L
R
 
R
S
 
D
H
 
-
G
 
-
L
 
L
A
 
I
N
 
S
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
Q
Q
 
K
A
 
T
A
 
F
L
 
T
A
 
V
W
 
I
R
 
E
E
 
K
V
 
C
P
 
P
V
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
I
H
 
H
G
 
G
V
 
G
A
 
C
F
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
V
Q
x
D
I
 
L
P
 
I
L
 
S
G
 
A
A
 
C
D
 
D
I
 
I
R
 
R
I
 
Y
S
 
C
A
 
T
P
 
Q
D
 
D
T
 
A
K
 
F
F
 
F
S
 
Q
L
 
V
M
 
K
E
|
E
V
 
V
R
 
D
W
 
V
G
 
G
I
 
L
V
 
A
P
 
A
D
|
D
M
 
V
A
 
-
G
 
G
T
 
T
V
 
L
-
 
Q
-
 
R
L
 
L
L
 
P
R
 
K
S
 
V
I
 
I
V
 
G
R
 
N
E
 
R
D
 
S
V
 
L
L
 
V
R
 
N
E
 
E
L
 
L
I
 
T
Y
 
F
T
 
T
A
 
A
R
 
R
V
 
K
F
 
M
T
 
M
G
 
A
I
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
L
S
 
D
M
 
S
G
 
G
I
 
L
V
 
V
T
 
S
Q
 
R
L
 
V
A
 
F
A
 
P
N
 
D
P
 
K
H
 
D
V
 
V
-
 
M
-
 
L
-
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
F
E
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
A
S
 
D
I
 
I
A
 
S
E
 
S
Q
 
K
G
 
S
P
 
P
R
 
V
A
 
A
V
 
V
R
 
Q
A
 
G
A
 
S
K
 
K
Q
 
I
L
 
N
L
 
L
N
 
I
E
 
Y
T
 
S
Q
 
R
S
 
D
V
 
H
S
 
S
P
 
V
Q
 
D
V
 
E
A
 
S
L
 
L
L
 
D
S
 
Y
E
 
M
S
 
A
E
 
T
A
 
W
Q
 
N
V
 
M
G
 
S
L
 
M
L
 
L
A
 
Q
G
 
T
P
 
Q
D
 
D
Q
 
I
I
 
I
E
 
K
A
 
S
L
 
V
N
 
Q
A
 
A
H
 
A
A
 
M
E
 
E
Q
 
K
R
 
K

6slbAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
32% identity, 92% coverage: 17:269/275 of query aligns to 9:254/257 of 6slbAAA

query
sites
6slbAAA
R
 
R
A
 
Q
G
 
D
A
 
G
V
 
V
A
 
L
D
 
V
I
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
N
R
 
R
P
 
P
F
 
E
K
 
K
M
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
I
D
 
T
G
 
G
P
 
E
M
 
L
F
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
L
E
 
K
S
 
E
V
 
G
A
 
E
V
 
E
D
 
D
P
 
R
T
 
E
I
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
L
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
A
G
 
G
K
x
R
A
 
A
F
 
F
C
 
S
A
|
A
G
 
G
I
x
Q
D
|
D
L
|
L
E
 
-
S
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
M
 
-
S
 
T
D
 
E
E
x
F
G
 
G
K
 
D
Q
 
R
A
 
K
M
 
P
Q
 
D
S
x
Y
R
 
E
S
 
A
H
 
H
G
 
-
L
 
-
A
x
L
N
 
R
R
 
R
Y
 
Y
Q
x
N
Q
 
R
A
 
V
A
 
V
L
 
E
A
 
A
W
 
L
R
 
S
E
 
G
V
 
L
P
 
E
V
 
K
P
 
P
V
 
L
I
 
V
A
 
V
A
 
A
L
 
V
H
 
N
G
 
G
V
 
V
A
 
A
F
 
A
G
 
G
G
x
A
G
 
G
L
 
M
Q
x
S
I
 
L
P
 
A
L
 
L
G
 
W
A
 
G
D
 
D
I
 
L
R
 
R
I
 
L
S
 
A
A
 
A
P
 
V
D
 
G
T
 
A
K
 
S
F
 
F
S
 
T
L
 
T
M
x
A
E
x
F
V
 
V
R
 
R
W
 
I
G
 
G
I
x
L
V
 
V
P
|
P
D
|
D
M
 
S
A
 
G
G
 
L
T
 
S
V
 
F
L
 
L
L
 
L
R
 
P
S
 
R
I
 
L
V
 
V
R
 
G
E
 
L
D
 
A
V
 
K
L
 
A
R
 
Q
E
 
E
L
 
L
I
 
L
Y
 
L
T
 
L
A
 
S
R
 
P
V
 
R
F
 
L
T
 
S
G
 
A
I
 
E
E
 
E
A
 
A
A
 
L
S
 
A
M
 
L
G
 
G
I
 
L
V
 
V
T
 
H
Q
 
R
L
 
V
-
 
V
-
 
P
A
 
A
A
 
E
N
 
K
P
 
L
H
 
M
V
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
S
L
 
L
A
 
A
S
 
K
S
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
Q
Q
 
G
G
 
P
P
 
T
R
 
R
A
 
A
V
 
Y
R
 
A
A
 
L
A
 
T
K
 
K
Q
 
K
L
 
L
L
 
L
N
 
L
E
 
E
T
 
T
Q
 
Y
S
 
R
V
 
L
S
 
S
P
 
L
Q
 
T
V
 
E
A
 
A
L
 
L
L
x
A
S
 
L
E
 
E
S
 
A
E
 
V
A
 
L
Q
 
Q
V
 
G
G
 
Q
L
 
A
L
x
G
A
 
Q
G
 
T
P
 
Q
D
 
D
Q
 
H
I
 
E
E
 
E
A
 
G
L
 
V
N
 
R
A
 
A
H
 
F
A
 
R
E
 
E
Q
 
K
R
 
R
K
 
P
P
 
P
Y
 
R
Y
 
F

3q0jC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase in complex with the inhibitor acetoacetylcoa
29% identity, 96% coverage: 8:270/275 of query aligns to 1:255/255 of 3q0jC

query
sites
3q0jC
M
 
M
I
 
T
G
 
Y
D
 
E
R
 
T
V
 
I
S
 
L
I
 
V
G
 
E
R
 
R
A
 
D
G
 
Q
A
 
R
V
 
V
A
 
G
D
 
I
I
 
I
R
 
T
L
 
L
R
 
N
R
 
R
P
 
P
F
x
Q
K
x
A
M
x
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
D
 
N
G
 
S
P
 
Q
M
 
V
F
 
M
D
 
N
A
 
E
L
 
V
I
 
T
A
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
T
S
 
E
V
 
L
A
 
D
V
 
D
D
 
D
P
 
P
T
 
D
I
 
I
R
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
S
 
T
G
 
G
E
 
S
G
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
|
G
I
x
A
D
|
D
L
x
I
E
x
K
S
 
E
L
x
M
Q
 
A
A
 
D
L
 
L
M
 
T
S
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
M
 
-
Q
 
-
S
 
-
R
 
-
S
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
F
A
 
A
N
 
D
R
 
A
Y
 
F
Q
x
T
Q
 
A
A
 
D
A
 
F
L
x
F
A
 
A
-
 
T
W
 
W
R
 
G
E
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
A
V
 
V
P
 
R
V
 
T
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
V
H
 
A
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
F
 
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
L
 
C
Q
x
E
I
 
L
P
 
A
L
 
M
G
 
M
A
 
C
D
 
D
I
 
V
R
 
L
I
 
I
S
 
A
A
 
A
P
 
D
D
 
T
T
 
A
K
 
K
F
 
F
S
 
G
L
 
Q
M
x
P
E
|
E
V
 
I
R
 
K
W
 
L
G
 
G
I
x
V
V
 
L
P
|
P
D
x
G
M
|
M
A
 
G
G
 
G
T
 
S
V
 
Q
L
 
R
L
 
L
R
 
T
S
 
R
I
 
A
V
 
I
R
 
G
E
 
K
D
 
A
V
 
K
L
 
A
R
 
M
E
 
D
L
 
L
I
 
I
Y
 
L
T
 
T
A
 
G
R
 
R
V
 
T
F
 
M
T
 
D
G
 
A
I
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
E
S
 
R
M
 
S
G
 
G
I
 
L
V
 
V
T
 
S
Q
 
R
L
 
V
-
 
V
-
 
P
A
 
A
A
 
D
N
 
D
P
 
L
H
 
L
V
 
T
A
 
E
A
 
A
L
 
R
E
 
A
L
 
T
A
 
A
S
 
T
S
 
T
I
 
I
A
 
S
E
 
Q
Q
 
M
G
 
S
P
 
A
R
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
M
A
 
A
K
 
K
Q
 
E
L
 
A
L
 
V
N
 
N
E
 
R
T
 
A
Q
 
F
S
 
E
V
 
S
S
 
S
P
 
L
Q
 
S
V
 
E
A
 
G
L
 
L
L
|
L
S
 
Y
E
 
E
S
 
R
E
 
R
A
 
L
Q
 
F
V
 
H
G
 
S
L
 
A
L
x
F
A
 
A
G
 
T
P
 
E
D
 
D
Q
 
Q
I
 
S
E
 
E
A
 
G
L
 
M
N
 
A
A
 
A
H
 
F
A
 
I
E
 
E
Q
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
Y
 
Q
Y
 
F
T
 
T

3q0gC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
29% identity, 96% coverage: 8:270/275 of query aligns to 1:255/255 of 3q0gC

query
sites
3q0gC
M
 
M
I
 
T
G
 
Y
D
 
E
R
 
T
V
 
I
S
 
L
I
 
V
G
 
E
R
 
R
A
 
D
G
 
Q
A
 
R
V
 
V
A
 
G
D
 
I
I
 
I
R
 
T
L
 
L
R
 
N
R
 
R
P
 
P
F
 
Q
K
 
A
M
x
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
N
G
 
S
P
 
Q
M
 
V
F
 
M
D
 
N
A
 
E
L
 
V
I
 
T
A
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
T
S
 
E
V
 
L
A
 
D
V
 
D
D
 
D
P
 
P
T
 
D
I
 
I
R
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
S
 
T
G
 
G
E
 
S
G
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
 
G
I
x
A
D
 
D
L
x
I
E
x
K
S
 
E
L
x
M
Q
 
A
A
 
D
L
 
L
M
 
T
S
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
M
 
-
Q
 
-
S
 
-
R
 
-
S
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
F
A
 
A
N
 
D
R
 
A
Y
 
F
Q
x
T
Q
 
A
A
 
D
A
 
F
L
x
F
A
 
A
-
 
T
W
 
W
R
 
G
E
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
A
V
 
V
P
 
R
V
 
T
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
V
H
 
A
G
 
G
V
x
Y
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
C
Q
x
E
I
 
L
P
 
A
L
 
M
G
 
M
A
 
C
D
 
D
I
 
V
R
 
L
I
 
I
S
 
A
A
 
A
P
 
D
D
 
T
T
 
A
K
 
K
F
 
F
S
 
G
L
 
Q
M
x
P
E
|
E
V
 
I
R
 
K
W
x
L
G
 
G
I
x
V
V
 
L
P
|
P
D
x
G
M
 
M
A
 
G
G
 
G
T
 
S
V
 
Q
L
 
R
L
 
L
R
 
T
S
 
R
I
 
A
V
 
I
R
 
G
E
 
K
D
 
A
V
 
K
L
 
A
R
 
M
E
 
D
L
 
L
I
 
I
Y
 
L
T
 
T
A
 
G
R
 
R
V
 
T
F
 
M
T
 
D
G
 
A
I
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
E
S
 
R
M
 
S
G
 
G
I
 
L
V
 
V
T
 
S
Q
 
R
L
 
V
-
 
V
-
 
P
A
 
A
A
 
D
N
 
D
P
 
L
H
 
L
V
 
T
A
 
E
A
 
A
L
 
R
E
 
A
L
 
T
A
 
A
S
 
T
S
 
T
I
 
I
A
 
S
E
 
Q
Q
 
M
G
 
S
P
 
A
R
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
M
A
 
A
K
 
K
Q
 
E
L
 
A
L
 
V
N
 
N
E
 
R
T
 
A
Q
 
F
S
 
E
V
 
S
S
 
S
P
 
L
Q
 
S
V
 
E
A
 
G
L
 
L
L
|
L
S
 
Y
E
 
E
S
 
R
E
 
R
A
 
L
Q
 
F
V
 
H
G
 
S
L
 
A
L
x
F
A
 
A
G
 
T
P
 
E
D
 
D
Q
 
Q
I
 
S
E
 
E
A
 
G
L
 
M
N
 
A
A
 
A
H
 
F
A
 
I
E
 
E
Q
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
Y
 
Q
Y
 
F
T
 
T

3h81A Crystal structure of enoyl-coa hydratase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
30% identity, 90% coverage: 24:270/275 of query aligns to 16:254/256 of 3h81A

query
sites
3h81A
I
 
I
R
 
T
L
 
L
R
 
N
R
 
R
P
 
P
F
 
Q
K
 
A
M
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
N
G
 
S
P
 
Q
M
 
V
F
 
M
D
 
N
A
 
E
L
 
V
I
 
T
A
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
T
S
 
E
V
 
L
A
 
D
V
 
D
D
 
D
P
 
P
T
 
D
I
 
I
R
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
S
 
T
G
 
G
E
 
S
G
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
 
A
G
 
G
I
x
A
D
 
D
L
 
I
E
 
K
S
 
E
L
x
M
Q
 
A
A
 
D
L
 
L
M
 
T
S
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
M
 
-
Q
 
-
S
 
-
R
 
-
S
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
F
A
 
A
N
 
D
R
 
A
Y
 
F
Q
x
T
Q
 
A
A
 
D
A
 
F
L
x
F
A
 
A
-
 
T
W
 
W
R
 
G
E
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
A
V
 
V
P
 
R
V
 
T
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
V
H
 
A
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
C
Q
x
E
I
 
L
P
 
A
L
 
M
G
 
M
A
 
C
D
 
D
I
 
V
R
 
L
I
 
I
S
 
A
A
 
A
P
 
D
D
 
T
T
 
A
K
 
K
F
 
F
S
 
G
L
 
Q
M
x
P
E
|
E
V
 
I
R
 
K
W
 
L
G
 
G
I
x
V
V
 
L
P
|
P
D
x
G
M
 
M
A
 
G
G
 
G
T
 
S
V
 
Q
L
 
R
L
 
L
R
 
T
S
 
R
I
 
A
V
 
I
R
 
G
E
 
K
D
 
A
V
 
K
L
 
A
R
 
M
E
 
D
L
 
L
I
 
I
Y
 
L
T
 
T
A
 
G
R
 
R
V
 
T
F
 
M
T
 
D
G
 
A
I
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
E
S
 
R
M
 
S
G
 
G
I
 
L
V
 
V
T
 
S
Q
 
R
L
 
V
-
 
V
-
 
P
A
 
A
A
 
D
N
 
D
P
 
L
H
 
L
V
 
T
A
 
E
A
 
A
L
 
R
E
 
A
L
 
T
A
 
A
S
 
T
S
 
T
I
 
I
A
 
S
E
 
Q
Q
 
M
G
 
S
P
 
A
R
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
M
A
 
A
K
 
K
Q
 
E
L
 
A
L
 
V
N
 
N
E
 
R
T
 
A
Q
 
F
S
 
E
V
 
S
S
 
S
P
 
L
Q
 
S
V
 
E
A
 
G
L
 
L
L
|
L
S
 
Y
E
 
E
S
 
R
E
 
R
A
 
L
Q
 
F
V
 
H
G
 
S
L
 
A
L
x
F
A
 
A
G
 
T
P
 
E
D
 
D
Q
|
Q
I
 
S
E
 
E
A
 
G
L
 
M
N
 
A
A
 
A
H
 
F
A
 
I
E
 
E
Q
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
Y
 
Q
Y
 
F
T
 
T

3q0gD Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
29% identity, 90% coverage: 24:270/275 of query aligns to 16:250/250 of 3q0gD

query
sites
3q0gD
I
 
I
R
 
T
L
 
L
R
 
N
R
 
R
P
 
P
F
 
Q
K
 
A
M
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
N
G
 
S
P
 
Q
M
 
V
F
 
M
D
 
N
A
 
E
L
 
V
I
 
T
A
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
T
S
 
E
V
 
L
A
 
D
V
 
D
D
 
D
P
 
P
T
 
D
I
 
I
R
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
S
 
T
G
 
G
E
 
S
G
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
 
A
G
 
G
I
x
A
D
 
D
L
 
I
E
 
K
S
 
E
L
x
M
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
M
 
-
S
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
M
 
-
Q
 
-
S
 
-
R
 
-
S
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
F
A
 
A
N
 
D
R
 
A
Y
 
F
Q
x
T
Q
 
A
A
 
D
A
 
F
L
x
F
A
 
A
-
 
T
W
 
W
R
 
G
E
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
A
V
 
V
P
 
R
V
 
T
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
V
H
 
A
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
C
Q
x
E
I
 
L
P
 
A
L
 
M
G
 
M
A
 
C
D
 
D
I
 
V
R
 
L
I
 
I
S
 
A
A
 
A
P
 
D
D
 
T
T
 
A
K
 
K
F
 
F
S
 
G
L
 
Q
M
x
P
E
|
E
V
 
I
R
 
K
W
 
L
G
 
G
I
x
V
V
 
L
P
|
P
D
x
G
M
 
M
A
 
G
G
 
G
T
 
S
V
 
Q
L
 
R
L
 
L
R
 
T
S
 
R
I
 
A
V
 
I
R
 
G
E
 
K
D
 
A
V
 
K
L
 
A
R
 
M
E
 
D
L
 
L
I
 
I
Y
 
L
T
 
T
A
 
G
R
 
R
V
 
T
F
 
M
T
 
D
G
 
A
I
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
E
S
 
R
M
 
S
G
 
G
I
 
L
V
 
V
T
 
S
Q
 
R
L
 
V
-
 
V
-
 
P
A
 
A
A
 
D
N
 
D
P
 
L
H
 
L
V
 
T
A
 
E
A
 
A
L
 
R
E
 
A
L
 
T
A
 
A
S
 
T
S
 
T
I
 
I
A
 
S
E
 
Q
Q
 
M
G
 
S
P
 
A
R
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
M
A
 
A
K
 
K
Q
 
E
L
 
A
L
 
V
N
 
N
E
 
R
T
 
A
Q
 
F
S
 
E
V
 
S
S
 
S
P
 
L
Q
 
S
V
 
E
A
 
G
L
 
L
L
|
L
S
 
Y
E
 
E
S
 
R
E
 
R
A
 
L
Q
x
F
V
 
H
G
 
S
L
 
A
L
x
F
A
 
A
G
 
T
P
 
E
D
 
D
Q
 
Q
I
 
S
E
 
E
A
 
G
L
 
M
N
 
A
A
 
A
H
x
F
A
 
I
E
 
E
Q
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
Y
 
Q
Y
 
F
T
 
T

6slaAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
31% identity, 92% coverage: 17:269/275 of query aligns to 6:242/245 of 6slaAAA

query
sites
6slaAAA
R
 
R
A
 
Q
G
 
D
A
 
G
V
 
V
A
 
L
D
 
V
I
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
N
R
 
R
P
 
P
F
 
E
K
 
K
M
x
L
N
 
N
A
 
A
L
 
I
D
 
T
G
 
G
P
 
E
M
 
L
F
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
L
E
 
K
S
 
E
V
 
G
A
 
E
V
 
E
D
 
D
P
 
R
T
 
E
I
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
L
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
A
G
 
G
K
 
R
A
 
A
F
 
F
C
 
S
A
|
A
G
 
G
I
x
Q
D
|
D
L
|
L
E
 
-
S
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
M
 
-
S
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
M
 
-
Q
 
-
S
 
T
R
 
E
S
 
A
H
 
H
G
 
-
L
 
-
A
x
L
N
 
R
R
 
R
Y
|
Y
Q
x
N
Q
 
R
A
 
V
A
 
V
L
 
E
A
 
A
W
 
L
R
 
S
E
 
G
V
 
L
P
 
E
V
 
K
P
 
P
V
 
L
I
 
V
A
 
V
A
 
A
L
 
V
H
 
N
G
 
G
V
 
V
A
 
A
F
x
A
G
|
G
G
x
A
G
 
G
L
 
M
Q
x
S
I
 
L
P
 
A
L
 
L
G
 
W
A
 
G
D
 
D
I
 
L
R
 
R
I
 
L
S
 
A
A
 
A
P
 
V
D
 
G
T
 
A
K
 
S
F
 
F
S
 
T
L
 
T
M
x
A
E
x
F
V
 
V
R
 
R
W
x
I
G
 
G
I
x
L
V
 
V
P
|
P
D
x
N
M
 
S
A
 
G
G
 
L
T
 
S
V
 
F
L
 
L
L
 
L
R
 
P
S
 
R
I
 
L
V
 
V
R
 
G
E
 
L
D
 
A
V
 
K
L
 
A
R
 
Q
E
 
E
L
 
L
I
 
L
Y
 
L
T
 
L
A
 
S
R
 
P
V
 
R
F
 
L
T
 
S
G
 
A
I
 
E
E
 
E
A
 
A
A
 
L
S
 
A
M
 
L
G
 
G
I
 
L
V
 
V
T
 
H
Q
 
R
L
 
V
-
 
V
-
 
P
A
 
A
A
 
E
N
 
K
P
 
L
H
 
M
V
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
S
L
 
L
A
 
A
S
 
K
S
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
Q
Q
 
G
G
 
P
P
 
T
R
 
R
A
 
A
V
 
Y
R
 
A
A
 
L
A
 
T
K
 
K
Q
 
K
L
 
L
L
 
L
N
 
L
E
 
E
T
 
T
Q
 
Y
S
 
R
V
 
L
S
 
S
P
 
L
Q
 
T
V
 
E
A
 
A
L
 
L
L
x
A
S
 
L
E
 
E
S
 
A
E
 
V
A
 
L
Q
 
Q
V
 
G
G
 
Q
L
 
A
L
x
G
A
 
Q
G
 
T
P
 
Q
D
 
D
Q
 
H
I
 
E
E
 
E
A
 
G
L
 
V
N
 
R
A
 
A
H
x
F
A
 
R
E
 
E
Q
x
K
R
 
R
K
 
P
P
 
P
Y
 
R
Y
 
F

5du6A Crystal structure of m. Tuberculosis echa6 bound to ligand gsk059a. (see paper)
30% identity, 93% coverage: 13:269/275 of query aligns to 3:239/242 of 5du6A

query
sites
5du6A
V
 
I
S
 
G
I
 
I
G
 
T
R
 
Q
A
 
A
G
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
L
D
 
T
I
 
I
R
 
E
L
 
L
R
 
Q
R
 
R
P
 
P
F
 
E
K
 
R
M
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
N
G
 
S
P
 
Q
M
 
L
F
 
V
D
 
E
A
 
E
L
 
L
I
 
T
A
 
Q
A
 
A
A
 
I
E
 
R
S
 
K
V
 
-
A
 
A
V
 
G
D
 
D
P
 
G
T
 
S
I
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
Q
G
 
G
K
 
T
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
 
A
G
 
G
I
x
A
D
 
D
L
 
L
E
 
S
S
 
G
L
 
F
Q
 
A
A
 
A
L
 
D
M
 
Y
S
x
P
D
 
D
-
 
R
-
x
L
-
x
I
E
 
E
G
 
L
K
 
H
Q
 
K
A
 
A
M
 
M
Q
x
D
S
 
A
R
 
S
S
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
R
 
-
Y
 
-
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
W
 
-
R
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
P
V
 
M
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
G
A
 
A
L
 
I
H
 
N
G
 
G
V
 
P
A
 
A
F
 
I
G
 
G
G
x
A
G
 
G
L
 
L
Q
|
Q
I
 
L
P
 
A
L
 
M
G
 
Q
A
 
C
D
 
D
I
 
L
R
 
R
I
 
V
S
 
V
A
 
A
P
 
P
D
 
D
T
 
A
K
 
F
F
 
F
S
 
Q
L
 
F
M
x
P
E
x
T
V
 
S
R
 
K
W
 
Y
G
 
G
I
x
L
V
 
A
P
x
L
D
|
D
M
 
N
A
x
W
G
 
S
T
 
I
V
 
R
L
 
R
L
 
L
R
 
S
S
 
S
I
 
L
V
 
V
R
 
G
E
 
H
D
 
G
V
 
R
L
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
M
I
 
L
Y
 
L
T
 
S
A
 
A
R
 
E
V
 
K
F
 
L
T
 
T
G
 
A
I
 
E
E
 
I
A
 
A
A
 
L
S
 
H
M
 
T
G
 
G
I
 
M
V
 
A
T
 
N
Q
 
R
L
 
I
A
 
G
A
 
T
N
 
L
P
 
A
H
 
D
V
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
-
E
 
-
L
 
W
A
 
A
S
 
A
S
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
R
Q
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
L
A
 
A
V
 
I
R
 
Q
A
 
H
A
 
A
K
 
K
Q
 
R
L
 
V
L
 
L
N
 
N
E
 
D
T
 
D
Q
 
G
S
 
A
V
 
I
S
 
-
P
 
-
Q
 
E
V
 
E
A
|
A
L
 
W
L
x
P
S
 
A
E
 
H
S
x
K
E
 
E
A
 
L
Q
x
F
V
 
D
G
 
K
L
 
A
L
x
W
A
 
G
G
 
S
P
 
Q
D
 
D
Q
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
Q
N
 
V
A
 
A
H
 
R
A
 
M
E
 
E
Q
 
K
R
 
R
K
 
P
P
 
P
Y
 
K
Y
 
F

2hw5C The crystal structure of human enoyl-coenzyme a (coa) hydratase short chain 1, echs1
28% identity, 93% coverage: 16:271/275 of query aligns to 12:259/260 of 2hw5C

query
sites
2hw5C
G
 
G
R
 
K
A
 
N
G
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
G
D
 
L
I
 
I
R
 
Q
L
 
L
R
 
N
R
 
R
P
 
P
F
x
K
K
x
A
M
x
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
D
 
C
G
 
D
P
 
G
M
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
E
L
 
L
I
 
N
A
 
Q
A
 
A
A
 
L
E
 
K
S
 
I
V
 
F
A
 
E
V
 
E
D
 
D
P
 
P
T
 
A
I
 
V
R
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
G
G
 
D
K
|
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
 
A
G
 
G
I
x
A
D
 
D
L
x
I
E
 
K
S
 
E
L
x
M
Q
 
Q
A
 
N
L
 
L
M
 
-
S
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
M
 
-
Q
 
-
S
 
S
R
 
F
S
 
Q
H
 
D
G
 
C
L
 
Y
A
x
S
N
 
S
R
 
K
Y
 
F
Q
x
L
Q
 
K
A
 
H
A
 
W
L
 
D
A
 
H
W
 
L
R
 
T
E
 
Q
V
 
V
P
 
K
V
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
V
H
 
N
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
F
|
F
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
C
Q
x
E
I
 
L
P
 
A
L
 
M
G
 
M
A
 
C
D
 
D
I
 
I
R
 
I
I
 
Y
S
 
A
A
 
G
P
 
E
D
 
K
T
 
A
K
 
Q
F
 
F
S
 
A
L
 
Q
M
x
P
E
|
E
V
 
I
R
 
L
W
 
I
G
 
G
I
x
T
V
 
I
P
|
P
D
x
G
M
 
A
A
 
G
G
 
G
T
 
T
V
 
Q
L
 
R
L
 
L
R
 
T
S
 
R
I
 
A
V
 
V
R
 
G
E
 
K
D
 
S
V
 
L
L
 
A
R
 
M
E
 
E
L
 
M
I
 
V
Y
 
L
T
 
T
A
 
G
R
 
D
V
 
R
F
 
I
T
 
S
G
 
A
I
 
Q
E
 
D
A
 
A
A
 
K
S
 
Q
M
 
A
G
 
G
I
 
L
V
 
V
T
 
S
Q
 
K
L
 
I
A
 
C
A
 
P
N
 
V
P
 
E
H
 
T
V
 
L
A
 
V
-
 
E
-
 
E
A
 
A
L
 
I
E
 
Q
L
 
C
A
 
A
S
 
E
S
 
K
I
 
I
A
 
A
E
 
S
Q
 
N
G
 
S
P
 
K
R
 
I
A
 
V
V
 
V
R
 
A
A
 
M
A
 
A
K
 
K
Q
 
E
L
 
S
L
 
V
N
 
N
E
 
A
T
 
A
Q
 
F
S
 
E
V
 
M
S
 
T
P
 
L
Q
 
T
V
 
E
A
 
G
L
 
S
L
x
K
S
 
L
E
 
E
S
 
K
E
 
K
A
 
L
Q
 
F
V
 
Y
G
 
S
L
 
T
L
x
F
A
 
A
G
 
T
P
 
D
D
 
D
Q
 
R
I
 
K
E
 
E
A
 
G
L
 
M
N
 
T
A
 
A
H
 
F
A
 
V
E
 
E
Q
 
K
R
 
R
K
 
K
P
 
A
Y
 
N
Y
 
F
T
 
K
D
 
D

5ducA Crystal structure of m. Tuberculosis echa6 bound to ligand gsk951a (see paper)
31% identity, 93% coverage: 13:269/275 of query aligns to 3:241/244 of 5ducA

query
sites
5ducA
V
 
I
S
 
G
I
 
I
G
 
T
R
 
Q
A
 
A
G
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
L
D
 
T
I
 
I
R
 
E
L
 
L
R
 
Q
R
 
R
P
 
P
F
 
E
K
 
R
M
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
N
G
 
S
P
 
Q
M
 
L
F
 
V
D
 
E
A
 
E
L
 
L
I
 
T
A
 
Q
A
 
A
A
 
I
E
 
R
S
 
K
V
 
-
A
 
A
V
 
G
D
 
D
P
 
G
T
 
S
I
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
Q
G
 
G
K
 
T
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
 
A
G
 
G
I
x
A
D
 
D
L
 
L
E
 
-
S
 
S
L
 
G
Q
x
D
A
 
A
L
 
F
M
 
A
S
 
A
D
 
D
E
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
M
 
-
Q
 
-
S
 
-
R
 
-
S
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
Y
A
x
P
N
 
D
R
 
R
Y
x
L
Q
x
I
Q
 
E
A
 
L
A
x
H
L
 
K
A
 
A
W
 
M
R
x
D
E
 
A
V
 
S
P
 
P
V
 
M
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
G
A
 
A
L
 
I
H
 
N
G
 
G
V
 
P
A
 
A
F
 
I
G
 
G
G
x
A
G
 
G
L
 
L
Q
|
Q
I
 
L
P
 
A
L
 
M
G
 
Q
A
 
C
D
 
D
I
 
L
R
 
R
I
 
V
S
 
V
A
 
A
P
 
P
D
 
D
T
 
A
K
 
F
F
 
F
S
 
Q
L
 
F
M
x
P
E
x
T
V
 
S
R
 
K
W
 
Y
G
 
G
I
x
L
V
 
A
P
x
L
D
|
D
M
 
N
A
x
W
G
 
S
T
 
I
V
 
R
L
 
R
L
 
L
R
 
S
S
 
S
I
 
L
V
 
V
R
 
G
E
 
H
D
 
G
V
 
R
L
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
M
I
 
L
Y
 
L
T
 
S
A
 
A
R
 
E
V
 
K
F
 
L
T
 
T
G
 
A
I
 
E
E
 
I
A
 
A
A
 
L
S
 
H
M
 
T
G
 
G
I
 
M
V
 
A
T
 
N
Q
 
R
L
 
I
A
 
G
A
 
T
N
 
L
P
 
A
H
 
D
V
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
-
E
 
-
L
 
W
A
 
A
S
 
A
S
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
R
Q
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
L
A
 
A
V
 
I
R
 
Q
A
 
H
A
 
A
K
 
K
Q
 
R
L
 
V
L
 
L
N
 
N
E
 
D
T
 
D
Q
 
G
S
 
A
V
 
I
S
 
-
P
 
-
Q
 
E
V
 
E
A
 
A
L
 
W
L
x
P
S
 
A
E
 
H
S
 
K
E
 
E
A
 
L
Q
x
F
V
 
D
G
 
K
L
 
A
L
x
W
A
 
G
G
 
S
P
 
Q
D
 
D
Q
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
Q
N
 
V
A
 
A
H
 
R
A
 
M
E
 
E
Q
 
K
R
 
R
K
 
P
P
 
P
Y
 
K
Y
 
F

5du4A Crystal structure of m. Tuberculosis echa6 bound to ligand gsk366a (see paper)
31% identity, 93% coverage: 13:269/275 of query aligns to 3:241/244 of 5du4A

query
sites
5du4A
V
 
I
S
 
G
I
 
I
G
 
T
R
 
Q
A
 
A
G
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
L
D
 
T
I
 
I
R
 
E
L
 
L
R
 
Q
R
 
R
P
 
P
F
 
E
K
 
R
M
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
N
G
 
S
P
 
Q
M
 
L
F
 
V
D
 
E
A
 
E
L
 
L
I
 
T
A
 
Q
A
 
A
A
 
I
E
 
R
S
 
K
V
 
-
A
 
A
V
 
G
D
 
D
P
 
G
T
 
S
I
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
Q
G
 
G
K
 
T
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
 
A
G
 
G
I
x
A
D
 
D
L
 
L
E
 
-
S
 
S
L
 
G
Q
x
D
A
 
A
L
 
F
M
 
A
S
 
A
D
 
D
E
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
M
 
-
Q
 
-
S
 
-
R
 
-
S
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
Y
A
x
P
N
 
D
R
 
R
Y
x
L
Q
x
I
Q
 
E
A
 
L
A
x
H
L
 
K
A
 
A
W
 
M
R
x
D
E
 
A
V
 
S
P
 
P
V
 
M
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
G
A
 
A
L
 
I
H
 
N
G
 
G
V
 
P
A
 
A
F
 
I
G
 
G
G
x
A
G
 
G
L
 
L
Q
|
Q
I
 
L
P
 
A
L
 
M
G
 
Q
A
 
C
D
 
D
I
 
L
R
 
R
I
 
V
S
 
V
A
 
A
P
 
P
D
 
D
T
 
A
K
 
F
F
 
F
S
 
Q
L
 
F
M
x
P
E
x
T
V
 
S
R
 
K
W
 
Y
G
 
G
I
x
L
V
 
A
P
x
L
D
|
D
M
 
N
A
x
W
G
 
S
T
 
I
V
 
R
L
 
R
L
 
L
R
 
S
S
 
S
I
 
L
V
 
V
R
 
G
E
 
H
D
 
G
V
 
R
L
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
M
I
 
L
Y
 
L
T
 
S
A
 
A
R
 
E
V
 
K
F
 
L
T
 
T
G
 
A
I
 
E
E
 
I
A
 
A
A
 
L
S
 
H
M
 
T
G
 
G
I
 
M
V
 
A
T
 
N
Q
 
R
L
 
I
A
 
G
A
 
T
N
 
L
P
 
A
H
 
D
V
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
-
E
 
-
L
 
W
A
 
A
S
 
A
S
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
R
Q
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
L
A
 
A
V
 
I
R
 
Q
A
 
H
A
 
A
K
 
K
Q
 
R
L
 
V
L
 
L
N
 
N
E
 
D
T
 
D
Q
 
G
S
 
A
V
 
I
S
 
-
P
 
-
Q
 
E
V
 
E
A
 
A
L
 
W
L
x
P
S
 
A
E
 
H
S
 
K
E
 
E
A
 
L
Q
 
F
V
 
D
G
 
K
L
 
A
L
x
W
A
 
G
G
 
S
P
 
Q
D
 
D
Q
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
Q
N
 
V
A
 
A
H
 
R
A
 
M
E
 
E
Q
 
K
R
 
R
K
 
P
P
 
P
Y
 
K
Y
 
F

5dtwA Crystal structure of m. Tuberculosis echa6 bound to c20-coa (see paper)
31% identity, 93% coverage: 13:269/275 of query aligns to 3:241/244 of 5dtwA

query
sites
5dtwA
V
 
I
S
 
G
I
 
I
G
 
T
R
 
Q
A
 
A
G
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
L
D
 
T
I
 
I
R
 
E
L
 
L
R
 
Q
R
|
R
P
 
P
F
x
E
K
x
R
M
x
R
N
 
N
A
|
A
L
 
L
D
 
N
G
 
S
P
 
Q
M
 
L
F
 
V
D
 
E
A
 
E
L
 
L
I
 
T
A
 
Q
A
 
A
A
 
I
E
 
R
S
 
K
V
 
-
A
 
A
V
 
G
D
 
D
P
 
G
T
 
S
I
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
Q
G
 
G
K
 
T
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
|
A
G
 
G
I
x
A
D
|
D
L
|
L
E
 
-
S
 
S
L
 
G
Q
x
D
A
 
A
L
 
F
M
 
A
S
 
A
D
 
D
E
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
M
 
-
Q
 
-
S
 
-
R
 
-
S
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
Y
A
x
P
N
 
D
R
 
R
Y
 
L
Q
x
I
Q
 
E
A
 
L
A
x
H
L
 
K
A
 
A
W
 
M
R
x
D
E
 
A
V
 
S
P
 
P
V
 
M
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
G
A
 
A
L
 
I
H
 
N
G
 
G
V
 
P
A
 
A
F
 
I
G
|
G
G
x
A
G
 
G
L
 
L
Q
|
Q
I
 
L
P
 
A
L
 
M
G
 
Q
A
 
C
D
 
D
I
 
L
R
 
R
I
 
V
S
 
V
A
 
A
P
 
P
D
 
D
T
 
A
K
 
F
F
 
F
S
 
Q
L
 
F
M
x
P
E
x
T
V
 
S
R
 
K
W
x
Y
G
 
G
I
x
L
V
 
A
P
x
L
D
|
D
M
 
N
A
x
W
G
 
S
T
 
I
V
 
R
L
 
R
L
 
L
R
 
S
S
 
S
I
 
L
V
 
V
R
 
G
E
 
H
D
 
G
V
 
R
L
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
M
I
 
L
Y
 
L
T
 
S
A
 
A
R
 
E
V
 
K
F
 
L
T
 
T
G
 
A
I
 
E
E
 
I
A
 
A
A
 
L
S
 
H
M
 
T
G
 
G
I
 
M
V
 
A
T
 
N
Q
 
R
L
 
I
A
 
G
A
 
T
N
 
L
P
 
A
H
 
D
V
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
-
E
 
-
L
 
W
A
 
A
S
 
A
S
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
R
Q
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
L
A
 
A
V
 
I
R
 
Q
A
 
H
A
 
A
K
 
K
Q
 
R
L
 
V
L
 
L
N
 
N
E
 
D
T
 
D
Q
 
G
S
 
A
V
 
I
S
 
-
P
 
-
Q
 
E
V
 
E
A
 
A
L
 
W
L
x
P
S
 
A
E
 
H
S
 
K
E
 
E
A
 
L
Q
 
F
V
 
D
G
 
K
L
 
A
L
x
W
A
 
G
G
 
S
P
 
Q
D
 
D
Q
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
Q
N
 
V
A
 
A
H
 
R
A
 
M
E
 
E
Q
 
K
R
 
R
K
 
P
P
 
P
Y
 
K
Y
 
F

5dufA Crystal structure of m. Tuberculosis echa6 bound to ligand gsk729a (see paper)
31% identity, 93% coverage: 13:269/275 of query aligns to 4:242/245 of 5dufA

query
sites
5dufA
V
 
I
S
 
G
I
 
I
G
 
T
R
 
Q
A
 
A
G
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
L
D
 
T
I
 
I
R
 
E
L
 
L
R
 
Q
R
 
R
P
 
P
F
 
E
K
 
R
M
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
N
G
 
S
P
 
Q
M
 
L
F
 
V
D
 
E
A
 
E
L
 
L
I
 
T
A
 
Q
A
 
A
A
 
I
E
 
R
S
 
K
V
 
-
A
 
A
V
 
G
D
 
D
P
 
G
T
 
S
I
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
Q
G
 
G
K
 
T
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
 
A
G
 
G
I
x
A
D
 
D
L
 
L
E
 
-
S
 
S
L
 
G
Q
x
D
A
 
A
L
 
F
M
 
A
S
 
A
D
 
D
E
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
M
 
-
Q
 
-
S
 
-
R
 
-
S
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
Y
A
x
P
N
 
D
R
 
R
Y
x
L
Q
x
I
Q
 
E
A
 
L
A
x
H
L
 
K
A
 
A
W
 
M
R
x
D
E
 
A
V
 
S
P
 
P
V
 
M
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
G
A
 
A
L
 
I
H
 
N
G
 
G
V
 
P
A
 
A
F
 
I
G
 
G
G
x
A
G
 
G
L
 
L
Q
|
Q
I
 
L
P
 
A
L
 
M
G
 
Q
A
 
C
D
 
D
I
 
L
R
 
R
I
 
V
S
 
V
A
 
A
P
 
P
D
 
D
T
 
A
K
 
F
F
 
F
S
 
Q
L
 
F
M
x
P
E
x
T
V
 
S
R
 
K
W
 
Y
G
 
G
I
x
L
V
 
A
P
x
L
D
|
D
M
 
N
A
x
W
G
 
S
T
 
I
V
 
R
L
 
R
L
 
L
R
 
S
S
 
S
I
 
L
V
 
V
R
 
G
E
 
H
D
 
G
V
 
R
L
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
M
I
 
L
Y
 
L
T
 
S
A
 
A
R
 
E
V
 
K
F
 
L
T
 
T
G
 
A
I
 
E
E
 
I
A
 
A
A
 
L
S
 
H
M
 
T
G
 
G
I
 
M
V
 
A
T
 
N
Q
 
R
L
 
I
A
 
G
A
 
T
N
 
L
P
 
A
H
 
D
V
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
-
E
 
-
L
 
W
A
 
A
S
 
A
S
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
R
Q
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
L
A
 
A
V
 
I
R
 
Q
A
 
H
A
 
A
K
 
K
Q
 
R
L
 
V
L
 
L
N
 
N
E
 
D
T
 
D
Q
 
G
S
 
A
V
 
I
S
 
-
P
 
-
Q
 
E
V
 
E
A
 
A
L
 
W
L
x
P
S
 
A
E
 
H
S
 
K
E
 
E
A
 
L
Q
 
F
V
 
D
G
 
K
L
 
A
L
x
W
A
 
G
G
 
S
P
 
Q
D
 
D
Q
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
Q
N
 
V
A
 
A
H
 
R
A
 
M
E
 
E
Q
 
K
R
 
R
K
 
P
P
 
P
Y
 
K
Y
 
F

O69762 Hydroxycinnamoyl-CoA hydratase-lyase; HCHL; P-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase; Trans-feruloyl-CoA hydratase/vanillin synthase; EC 4.1.2.61 from Pseudomonas fluorescens (see 2 papers)
30% identity, 78% coverage: 20:233/275 of query aligns to 18:230/276 of O69762

query
sites
O69762
A
 
G
V
 
I
A
 
A
D
 
F
I
 
V
R
 
I
L
 
L
R
 
N
R
 
R
P
 
P
F
 
E
K
|
K
M
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
M
D
 
S
G
 
P
P
 
T
M
 
L
F
 
N
D
 
R
A
 
E
L
 
M
I
 
I
A
 
D
A
 
V
A
 
L
E
 
E
S
 
T
V
 
L
A
 
E
V
 
Q
D
 
D
P
 
P
T
 
A
I
 
A
R
 
G
A
 
V
V
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
A
G
 
G
K
 
E
A
 
A
F
 
W
C
 
T
A
|
A
G
 
G
I
x
M
D
 
D
L
|
L
E
 
K
S
 
E
L
x
Y
Q
 
F
A
 
R
L
 
E
M
 
V
S
 
-
D
 
D
E
 
A
G
 
G
K
 
P
Q
 
E
A
 
I
M
 
L
Q
 
Q
S
 
E
R
 
K
S
 
I
H
 
R
G
 
R
L
 
E
A
 
A
N
 
S
R
 
Q
Y
 
W
Q
 
Q
Q
 
W
A
 
K
A
 
L
L
 
L
A
 
-
W
 
-
R
 
R
E
 
M
V
 
Y
P
 
A
V
 
K
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
M
L
 
V
H
 
N
G
 
G
V
 
W
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
F
Q
x
S
I
 
P
P
 
L
L
 
V
G
 
A
A
 
C
D
 
D
I
 
L
R
 
A
I
 
I
S
 
C
A
 
A
P
 
D
D
 
E
T
 
A
K
 
T
F
 
F
S
 
G
L
 
L
M
x
S
E
|
E
V
 
I
R
 
N
W
|
W
G
 
G
I
 
I
V
 
P
P
 
P
D
 
-
M
 
-
A
 
-
G
|
G
T
 
N
V
 
L
L
 
V
L
 
S
R
 
K
S
 
A
I
 
M
V
 
A
R
 
D
E
 
T
D
 
V
V
 
G
L
 
H
R
 
R
E
 
Q
L
 
S
I
 
L
Y
 
Y
-
 
Y
-
 
I
-
 
M
T
 
T
A
 
G
R
 
K
V
 
T
F
 
F
T
 
G
G
 
G
I
 
Q
E
 
K
A
 
A
A
 
A
S
 
E
M
 
M
G
 
G
I
 
L
V
 
V
T
 
N
Q
 
E
L
 
S
A
 
V
-
 
P
-
 
L
A
 
A
N
 
Q
P
 
L
H
 
R
V
 
E
A
 
V
A
 
T
L
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
S
 
R
S
 
N
I
 
L
A
 
L
E
 
E
Q
 
K
G
 
N
P
 
P
R
 
V
A
 
V
V
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
A
K
 
K
Q
 
H
L
 
G
L
 
F
N
 
K
E
 
R
T
 
C
Q
 
R
S
 
E
V
 
L
S
 
T

Sites not aligning to the query:

2vssD Wild-type hydroxycinnamoyl-coa hydratase lyase in complex with acetyl- coa and vanillin (see paper)
30% identity, 78% coverage: 20:233/275 of query aligns to 16:228/246 of 2vssD

query
sites
2vssD
A
 
G
V
 
I
A
 
A
D
 
F
I
 
V
R
 
I
L
 
L
R
 
N
R
 
R
P
 
P
F
x
E
K
|
K
M
x
R
N
 
N
A
|
A
L
 
M
D
 
S
G
 
P
P
 
T
M
 
L
F
 
N
D
 
R
A
 
E
L
 
M
I
 
I
A
 
D
A
 
V
A
 
L
E
 
E
S
 
T
V
 
L
A
 
E
V
 
Q
D
 
D
P
 
P
T
 
A
I
 
A
R
 
G
A
 
V
V
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
A
G
 
G
K
 
E
A
 
A
F
 
W
C
 
T
A
|
A
G
 
G
I
x
M
D
|
D
L
|
L
E
 
K
S
 
E
L
x
Y
Q
x
F
A
 
R
L
 
E
M
 
V
S
 
-
D
|
D
E
 
A
G
 
G
K
 
P
Q
 
E
A
 
I
M
 
L
Q
 
Q
S
 
E
R
 
K
S
 
I
H
 
R
G
x
R
L
 
E
A
 
A
N
 
S
R
x
Q
Y
 
W
Q
|
Q
Q
 
W
A
 
K
A
 
L
L
 
L
A
 
-
W
 
-
R
 
R
E
 
M
V
 
Y
P
 
A
V
 
K
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
M
L
 
V
H
 
N
G
 
G
V
x
W
A
 
C
F
|
F
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
F
Q
x
S
I
 
P
P
 
L
L
 
V
G
 
A
A
 
C
D
 
D
I
 
L
R
 
A
I
 
I
S
 
C
A
 
A
P
 
D
D
 
E
T
 
A
K
 
T
F
 
F
S
 
G
L
 
L
M
x
S
E
|
E
V
 
I
R
 
N
W
 
W
G
 
G
I
|
I
V
 
P
P
|
P
D
 
-
M
 
-
A
 
-
G
|
G
T
x
N
V
 
L
L
 
V
L
 
S
R
 
K
S
 
A
I
 
M
V
 
A
R
 
D
E
 
T
D
 
V
V
 
G
L
 
H
R
 
R
E
 
Q
L
 
S
I
 
L
Y
 
Y
-
 
Y
-
 
I
-
 
M
T
 
T
A
 
G
R
 
K
V
 
T
F
 
F
T
 
G
G
 
G
I
 
Q
E
 
K
A
 
A
A
 
A
S
 
E
M
 
M
G
 
G
I
 
L
V
 
V
T
 
N
Q
 
E
L
 
S
A
 
V
-
 
P
-
 
L
A
 
A
N
 
Q
P
 
L
H
 
R
V
 
E
A
 
V
A
 
T
L
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
S
 
R
S
 
N
I
 
L
A
 
L
E
 
E
Q
 
K
G
 
N
P
 
P
R
 
V
A
 
V
V
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
A
K
 
K
Q
 
H
L
 
G
L
 
F
N
 
K
E
 
R
T
 
C
Q
 
R
S
 
E
V
 
L
S
 
T

Sites not aligning to the query:

2vssB Wild-type hydroxycinnamoyl-coa hydratase lyase in complex with acetyl- coa and vanillin (see paper)
30% identity, 78% coverage: 20:233/275 of query aligns to 15:227/247 of 2vssB

query
sites
2vssB
A
 
G
V
 
I
A
 
A
D
 
F
I
 
V
R
 
I
L
 
L
R
 
N
R
 
R
P
 
P
F
x
E
K
|
K
M
x
R
N
 
N
A
|
A
L
 
M
D
 
S
G
 
P
P
 
T
M
 
L
F
 
N
D
 
R
A
 
E
L
 
M
I
 
I
A
 
D
A
 
V
A
 
L
E
 
E
S
 
T
V
 
L
A
 
E
V
 
Q
D
 
D
P
 
P
T
 
A
I
 
A
R
 
G
A
 
V
V
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
A
G
 
G
K
 
E
A
 
A
F
 
W
C
 
T
A
|
A
G
 
G
I
x
M
D
|
D
L
 
L
E
 
K
S
 
E
L
x
Y
Q
 
F
A
 
R
L
 
E
M
 
V
S
 
-
D
|
D
E
 
A
G
 
G
K
 
P
Q
 
E
A
 
I
M
 
L
Q
 
Q
S
 
E
R
 
K
S
 
I
H
 
R
G
x
R
L
 
E
A
 
A
N
 
S
R
x
Q
Y
 
W
Q
 
Q
Q
 
W
A
 
K
A
 
L
L
 
L
A
 
-
W
 
-
R
 
R
E
 
M
V
 
Y
P
 
A
V
 
K
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
M
L
 
V
H
 
N
G
 
G
V
x
W
A
 
C
F
|
F
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
F
Q
x
S
I
 
P
P
 
L
L
 
V
G
 
A
A
 
C
D
 
D
I
 
L
R
 
A
I
 
I
S
 
C
A
 
A
P
 
D
D
 
E
T
 
A
K
 
T
F
 
F
S
 
G
L
 
L
M
x
S
E
|
E
V
 
I
R
 
N
W
 
W
G
 
G
I
|
I
V
 
P
P
|
P
D
 
-
M
 
-
A
 
-
G
|
G
T
 
N
V
 
L
L
 
V
L
 
S
R
 
K
S
 
A
I
 
M
V
 
A
R
 
D
E
 
T
D
 
V
V
 
G
L
 
H
R
 
R
E
 
Q
L
 
S
I
 
L
Y
 
Y
-
 
Y
-
 
I
-
 
M
T
 
T
A
 
G
R
 
K
V
 
T
F
 
F
T
 
G
G
 
G
I
 
Q
E
 
K
A
 
A
A
 
A
S
 
E
M
 
M
G
 
G
I
 
L
V
 
V
T
 
N
Q
 
E
L
 
S
A
 
V
-
 
P
-
 
L
A
 
A
N
 
Q
P
 
L
H
 
R
V
 
E
A
 
V
A
 
T
L
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
S
 
R
S
 
N
I
 
L
A
 
L
E
 
E
Q
 
K
G
 
N
P
 
P
R
 
V
A
 
V
V
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
A
K
 
K
Q
 
H
L
 
G
L
 
F
N
 
K
E
 
R
T
 
C
Q
 
R
S
 
E
V
 
L
S
 
T

Sites not aligning to the query:

Q5LLW6 Methylthioacryloyl-CoA hydratase; EC 4.2.1.155 from Ruegeria pomeroyi (strain ATCC 700808 / DSM 15171 / DSS-3) (Silicibacter pomeroyi) (see paper)
32% identity, 82% coverage: 17:242/275 of query aligns to 17:236/267 of Q5LLW6

query
sites
Q5LLW6
R
 
R
A
 
D
G
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
C
D
 
V
I
 
V
R
 
T
L
 
L
R
 
N
R
 
R
P
 
P
F
 
D
K
|
K
M
x
R
N
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
V
P
 
A
M
 
T
F
 
I
D
 
E
A
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
T
A
 
F
A
 
F
E
 
-
S
 
S
V
 
T
A
 
A
V
 
H
D
 
R
P
 
K
T
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
A
G
 
G
K
 
D
A
 
H
F
 
F
C
 
C
A
|
A
G
 
G
I
x
L
D
 
D
L
|
L
-
 
V
E
 
E
S
 
H
L
 
W
Q
 
K
A
 
A
L
 
D
M
 
R
S
 
S
D
 
A
E
 
D
G
 
D
K
 
F
Q
 
M
A
 
H
M
 
V
Q
 
C
S
 
L
R
 
R
S
 
W
H
 
H
G
 
E
L
 
A
A
 
F
N
 
N
R
 
K
Y
 
M
Q
 
E
Q
 
Y
A
 
G
A
 
G
L
 
-
A
 
-
W
 
-
R
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
H
 
R
G
 
G
V
 
A
A
 
V
F
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
L
Q
x
E
I
 
L
P
 
A
L
 
S
G
 
A
A
 
A
D
 
H
I
 
L
R
 
R
I
 
V
S
 
M
A
 
D
P
 
Q
D
 
S
T
 
T
K
 
Y
F
 
F
S
 
A
L
 
L
M
 
P
E
|
E
V
 
G
R
 
Q
W
x
R
G
 
G
I
 
I
V
 
F
P
 
T
D
x
G
M
 
G
A
 
G
G
 
A
T
 
T
V
 
I
L
 
R
L
 
V
R
 
S
S
 
D
I
 
M
V
 
I
R
 
G
E
 
K
D
 
Y
V
 
R
L
 
M
R
 
I
E
 
D
L
 
M
I
 
I
Y
 
L
T
 
T
A
 
G
R
 
R
V
 
V
F
 
Y
T
 
Q
G
 
G
I
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
D
M
 
L
G
 
G
I
 
L
V
 
A
T
 
Q
Q
 
Y
L
 
I
A
 
T
A
 
E
N
 
G
P
 
S
H
 
S
V
 
F
-
 
D
A
 
K
A
 
A
L
 
M
E
 
E
L
 
L
A
 
A
S
 
D
S
 
K
I
 
I
A
 
A
E
 
S
Q
 
N
G
 
L
P
 
P
R
 
L
A
 
T
V
 
N
R
 
F
A
 
A
A
 
I
K
 
C
Q
 
S
L
 
A
L
 
I
N
 
S
E
 
H
T
 
M
Q
 
Q
S
 
N
V
 
M
S
 
S
P
 
G
Q
 
L
V
 
D
A
 
A
L
 
A
L
 
Y
S
 
A
E
 
E
S
 
A

Query Sequence

>Ga0059261_2908 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_2908
MRQLQERMIGDRVSIGRAGAVADIRLRRPFKMNALDGPMFDALIAAAESVAVDPTIRAVV
LSGEGKAFCAGIDLESLQALMSDEGKQAMQSRSHGLANRYQQAALAWREVPVPVIAALHG
VAFGGGLQIPLGADIRISAPDTKFSLMEVRWGIVPDMAGTVLLRSIVREDVLRELIYTAR
VFTGIEAASMGIVTQLAANPHVAALELASSIAEQGPRAVRAAKQLLNETQSVSPQVALLS
ESEAQVGLLAGPDQIEALNAHAEQRKPYYTDPEVS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory