SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_3126 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_3126 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1lluA The ternary complex of pseudomonas aeruginosa alcohol dehydrogenase with its coenzyme and weak substrate (see paper)
34% identity, 29% coverage: 66:268/707 of query aligns to 32:267/341 of 1lluA

query
sites
1lluA
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
D
 
V
K
 
K
I
 
I
R
 
E
T
 
A
D
 
S
G
 
G
L
 
V
K
x
C
P
x
H
T
|
T
-
 
D
I
x
L
E
x
H
A
 
A
V
 
A
F
 
E
N
 
G
K
x
D
-
 
W
-
 
P
L
 
V
D
 
K
Q
 
P
P
 
P
L
 
L
P
 
P
M
 
F
-
 
I
-
 
P
G
 
G
Y
x
H
C
x
E
N
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
Y
V
 
V
A
 
A
E
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
S
G
 
G
V
 
V
T
 
T
G
 
R
Y
 
V
A
 
K
V
 
E
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
-
 
G
-
 
I
-
 
P
-
x
W
-
 
L
-
 
Y
-
 
T
-
 
A
-
x
C
-
 
G
-
 
C
-
x
C
-
 
E
-
 
H
-
x
C
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
W
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
x
C
-
 
E
-
 
S
-
 
Q
-
x
Q
-
 
N
-
 
T
-
 
G
-
 
Y
A
 
S
S
 
V
N
 
N
G
 
G
K
 
G
H
 
Y
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
V
L
 
L
V
 
A
P
 
D
L
 
P
N
 
N
L
 
Y
S
 
V
A
 
G
R
 
I
V
 
L
P
 
P
D
 
K
A
 
N
V
 
V
S
 
E
D
 
F
E
 
A
E
 
E
-
 
I
A
 
A
S
 
P
F
 
I
T
 
L
V
x
C
L
 
A
G
 
G
A
 
V
I
x
T
A
 
V
L
 
Y
Q
 
K
G
 
G
I
 
L
R
 
K
L
 
Q
V
 
T
Q
 
N
P
 
A
T
 
R
L
 
P
G
 
G
E
 
Q
A
 
W
I
 
V
V
 
A
V
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
I
G
|
G
L
x
G
I
x
L
G
 
G
L
 
H
I
 
V
T
 
A
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Y
L
 
A
R
 
R
A
 
A
Q
 
M
G
 
G
C
 
L
R
 
H
V
 
V
L
 
A
G
 
A
I
 
I
D
|
D
F
x
I
D
 
D
P
 
D
A
 
A
K
|
K
L
 
L
A
 
E
M
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
K
M
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
S
V
 
L
V
 
T
D
 
V
L
 
N
S
 
A
A
 
R
G
 
Q
Q
 
E
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
E
A
 
A
G
 
-
I
 
I
A
 
Q
F
 
R
S
 
D
R
 
I
G
 
G
R
 
-
G
 
G
I
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
|
A
A
x
V
T
x
S
K
 
N
S
 
S
S
x
A
E
 
-
P
 
-
I
 
F
H
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
I
K
 
G
M
 
M
S
 
A
R
 
R
K
 
R
R
 
G
G
 
G
R
 
T
I
 
I
V
 
A
L
 
L
V
|
V
G
 
G
V
x
L

Sites not aligning to the query:

3s2fE Crystal structure of furx nadh:furfural
29% identity, 36% coverage: 14:268/707 of query aligns to 16:264/340 of 3s2fE

query
sites
3s2fE
S
 
T
V
 
I
V
 
D
D
 
E
V
 
V
P
 
P
V
 
V
P
 
P
Q
 
Q
A
 
P
G
 
G
R
 
P
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
L
 
Q
I
 
V
R
 
K
T
 
I
S
 
E
H
 
-
T
 
-
L
 
-
I
 
-
S
 
A
A
 
S
G
 
G
T
 
V
E
x
C
R
x
H
M
x
T
L
 
D
V
 
L
D
x
H
F
 
A
G
 
A
K
 
D
A
 
G
N
 
D
W
|
W
I
 
P
D
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
-
I
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
V
K
 
K
P
 
P
T
 
T
I
 
L
E
 
-
A
 
-
V
 
-
F
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
-
P
 
P
L
 
F
P
 
I
M
 
P
G
 
G
Y
x
H
C
x
E
N
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
Y
V
 
V
A
 
S
E
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
S
G
 
G
V
 
V
T
 
S
G
 
R
Y
 
V
A
 
K
V
 
E
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
-
 
G
-
 
V
-
 
P
-
x
W
-
 
L
-
 
Y
-
 
S
-
 
A
-
x
C
-
 
G
-
 
Y
-
x
C
-
 
E
-
 
H
-
x
C
-
 
L
-
 
Q
-
 
G
-
 
W
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
x
C
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
x
Q
-
 
N
-
 
T
-
 
G
-
 
Y
A
 
S
S
 
V
N
 
N
G
 
G
K
 
G
H
 
Y
A
 
G
E
 
E
Y
 
Y
A
 
V
L
 
V
V
 
A
P
 
D
L
 
P
N
 
N
L
 
Y
S
 
V
A
 
G
R
 
L
V
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
K
V
 
V
S
 
G
D
 
F
E
 
V
E
 
E
-
 
I
A
 
A
S
 
P
F
 
I
T
 
L
V
x
C
L
 
A
G
 
G
A
 
V
I
x
T
A
 
V
L
 
Y
Q
 
K
G
 
G
I
 
L
R
 
K
L
 
V
V
 
T
Q
 
D
P
 
T
T
 
R
L
 
P
G
 
G
E
 
Q
A
 
W
I
 
V
V
 
V
V
 
I
S
 
S
G
|
G
L
 
I
G
|
G
L
x
G
I
x
L
G
 
G
L
 
H
I
 
V
T
 
A
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Y
L
 
A
R
 
R
A
 
A
Q
 
M
G
 
G
C
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
A
G
 
A
I
 
V
D
|
D
F
x
I
D
 
D
P
 
D
A
 
A
K
|
K
L
 
L
A
 
N
M
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
R
M
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
A
D
 
V
L
 
N
S
 
A
A
 
R
G
 
D
Q
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
-
A
 
A
A
 
A
G
 
W
I
 
L
A
 
Q
F
 
K
S
 
E
R
 
I
G
 
G
R
 
-
G
 
G
I
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
|
T
A
|
A
A
x
V
T
 
-
K
 
-
S
 
S
S
 
P
E
 
K
P
 
A
I
 
F
H
 
S
Q
 
Q
A
 
A
A
 
I
K
 
G
M
 
M
S
 
V
R
 
R
K
 
R
R
 
G
G
 
G
R
 
T
I
 
I
V
 
A
L
 
L
V
x
N
G
|
G
V
x
L

Sites not aligning to the query:

3s2fA Crystal structure of furx nadh:furfural
29% identity, 36% coverage: 14:268/707 of query aligns to 16:264/340 of 3s2fA

query
sites
3s2fA
S
 
T
V
 
I
V
 
D
D
 
E
V
 
V
P
 
P
V
 
V
P
 
P
Q
 
Q
A
 
P
G
 
G
R
 
P
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
L
 
Q
I
 
V
R
 
K
T
 
I
S
 
E
H
 
-
T
 
-
L
 
-
I
 
-
S
 
A
A
 
S
G
 
G
T
 
V
E
x
C
R
x
H
M
x
T
L
 
D
V
 
L
D
x
H
F
 
A
G
 
A
K
 
D
A
 
G
N
 
D
W
 
W
I
 
P
D
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
-
I
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
V
K
 
K
P
 
P
T
 
T
I
 
L
E
 
-
A
 
-
V
 
-
F
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
-
P
 
P
L
 
F
P
 
I
M
 
P
G
 
G
Y
x
H
C
x
E
N
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
Y
V
 
V
A
 
S
E
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
S
G
 
G
V
 
V
T
 
S
G
 
R
Y
 
V
A
 
K
V
 
E
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
-
 
G
-
 
V
-
 
P
-
x
W
-
 
L
-
 
Y
-
 
S
-
 
A
-
x
C
-
 
G
-
 
Y
-
x
C
-
 
E
-
 
H
-
x
C
-
 
L
-
 
Q
-
 
G
-
 
W
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
x
C
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
x
Q
-
 
N
-
 
T
-
 
G
-
 
Y
A
 
S
S
 
V
N
 
N
G
 
G
K
 
G
H
 
Y
A
 
G
E
 
E
Y
 
Y
A
 
V
L
 
V
V
 
A
P
 
D
L
 
P
N
 
N
L
 
Y
S
 
V
A
 
G
R
 
L
V
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
K
V
 
V
S
 
G
D
 
F
E
 
V
E
 
E
-
 
I
A
 
A
S
 
P
F
 
I
T
 
L
V
x
C
L
 
A
G
 
G
A
 
V
I
x
T
A
 
V
L
 
Y
Q
 
K
G
 
G
I
 
L
R
 
K
L
 
V
V
 
T
Q
 
D
P
 
T
T
 
R
L
 
P
G
 
G
E
 
Q
A
 
W
I
 
V
V
 
V
V
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
G
I
 
L
G
 
G
L
 
H
I
 
V
T
 
A
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Y
L
 
A
R
 
R
A
 
A
Q
 
M
G
 
G
C
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
A
G
 
A
I
 
V
D
 
D
F
 
I
D
 
D
P
 
D
A
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
N
M
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
R
M
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
A
D
 
V
L
 
N
S
 
A
A
 
R
G
 
D
Q
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
-
A
 
A
A
 
A
G
 
W
I
 
L
A
 
Q
F
 
K
S
 
E
R
 
I
G
 
G
R
 
-
G
 
G
I
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
A
A
 
V
T
 
-
K
 
-
S
 
S
S
 
P
E
 
K
P
 
A
I
 
F
H
 
S
Q
 
Q
A
 
A
A
 
I
K
 
G
M
 
M
S
 
V
R
 
R
K
 
R
R
 
G
G
 
G
R
 
T
I
 
I
V
 
A
L
 
L
V
 
N
G
 
G
V
 
L

Sites not aligning to the query:

3s2eE Crystal structure of furx nadh complex 1
29% identity, 36% coverage: 14:268/707 of query aligns to 16:264/340 of 3s2eE

query
sites
3s2eE
S
 
T
V
 
I
V
 
D
D
 
E
V
 
V
P
 
P
V
 
V
P
 
P
Q
 
Q
A
 
P
G
 
G
R
 
P
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
L
 
Q
I
 
V
R
 
K
T
 
I
S
 
E
H
 
-
T
 
-
L
 
-
I
 
-
S
 
A
A
 
S
G
 
G
T
 
V
E
x
C
R
x
H
M
x
T
L
 
D
V
 
L
D
x
H
F
 
A
G
 
A
K
 
D
A
 
G
N
 
D
W
 
W
I
 
P
D
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
-
I
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
V
K
 
K
P
 
P
T
 
T
I
 
L
E
 
-
A
 
-
V
 
-
F
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
-
P
 
P
L
 
F
P
 
I
M
 
P
G
 
G
Y
x
H
C
x
E
N
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
Y
V
 
V
A
 
S
E
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
S
G
 
G
V
 
V
T
 
S
G
 
R
Y
 
V
A
 
K
V
 
E
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
-
 
G
-
 
V
-
 
P
-
 
W
-
 
L
-
 
Y
-
 
S
-
 
A
-
x
C
-
 
G
-
 
Y
-
x
C
-
 
E
-
 
H
-
x
C
-
 
L
-
 
Q
-
 
G
-
 
W
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
x
C
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
x
Q
-
 
N
-
 
T
-
 
G
-
 
Y
A
 
S
S
 
V
N
 
N
G
 
G
K
 
G
H
 
Y
A
 
G
E
 
E
Y
 
Y
A
 
V
L
 
V
V
 
A
P
 
D
L
 
P
N
 
N
L
 
Y
S
 
V
A
 
G
R
 
L
V
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
K
V
 
V
S
 
G
D
 
F
E
 
V
E
 
E
-
 
I
A
 
A
S
 
P
F
 
I
T
 
L
V
x
C
L
 
A
G
 
G
A
 
V
I
x
T
A
 
V
L
 
Y
Q
 
K
G
 
G
I
 
L
R
 
K
L
 
V
V
 
T
Q
 
D
P
 
T
T
 
R
L
 
P
G
 
G
E
 
Q
A
 
W
I
 
V
V
 
V
V
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
I
G
|
G
L
x
G
I
x
L
G
 
G
L
 
H
I
 
V
T
 
A
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Y
L
 
A
R
 
R
A
 
A
Q
 
M
G
 
G
C
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
A
G
 
A
I
 
V
D
|
D
F
x
I
D
 
D
P
 
D
A
 
A
K
|
K
L
 
L
A
 
N
M
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
R
M
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
A
D
 
V
L
 
N
S
 
A
A
 
R
G
 
D
Q
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
-
A
 
A
A
 
A
G
 
W
I
 
L
A
 
Q
F
 
K
S
 
E
R
 
I
G
 
G
R
 
-
G
 
G
I
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
|
T
A
|
A
A
x
V
T
 
-
K
 
-
S
|
S
S
 
P
E
 
K
P
x
A
I
 
F
H
 
S
Q
 
Q
A
 
A
A
 
I
K
 
G
M
 
M
S
 
V
R
 
R
K
 
R
R
 
G
G
 
G
R
 
T
I
 
I
V
 
A
L
 
L
V
x
N
G
|
G
V
x
L

Sites not aligning to the query:

3s2eA Crystal structure of furx nadh complex 1
29% identity, 36% coverage: 14:268/707 of query aligns to 16:264/340 of 3s2eA

query
sites
3s2eA
S
 
T
V
 
I
V
 
D
D
 
E
V
 
V
P
 
P
V
 
V
P
 
P
Q
 
Q
A
 
P
G
 
G
R
 
P
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
L
 
Q
I
 
V
R
 
K
T
 
I
S
 
E
H
 
-
T
 
-
L
 
-
I
 
-
S
 
A
A
 
S
G
 
G
T
 
V
E
x
C
R
x
H
M
x
T
L
 
D
V
 
L
D
x
H
F
 
A
G
 
A
K
 
D
A
 
G
N
 
D
W
 
W
I
 
P
D
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
-
I
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
V
K
 
K
P
 
P
T
 
T
I
 
L
E
 
-
A
 
-
V
 
-
F
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
-
P
 
P
L
 
F
P
 
I
M
 
P
G
 
G
Y
x
H
C
x
E
N
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
Y
V
 
V
A
 
S
E
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
S
G
 
G
V
 
V
T
 
S
G
 
R
Y
 
V
A
 
K
V
 
E
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
-
 
G
-
 
V
-
 
P
-
 
W
-
 
L
-
 
Y
-
 
S
-
 
A
-
x
C
-
 
G
-
 
Y
-
x
C
-
 
E
-
 
H
-
x
C
-
 
L
-
 
Q
-
 
G
-
 
W
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
x
C
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
x
Q
-
 
N
-
 
T
-
 
G
-
 
Y
A
 
S
S
 
V
N
 
N
G
 
G
K
 
G
H
 
Y
A
 
G
E
 
E
Y
 
Y
A
 
V
L
 
V
V
 
A
P
 
D
L
 
P
N
 
N
L
 
Y
S
 
V
A
 
G
R
 
L
V
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
K
V
 
V
S
 
G
D
 
F
E
 
V
E
 
E
-
 
I
A
 
A
S
 
P
F
 
I
T
 
L
V
x
C
L
 
A
G
 
G
A
 
V
I
x
T
A
 
V
L
 
Y
Q
 
K
G
 
G
I
 
L
R
 
K
L
 
V
V
 
T
Q
 
D
P
 
T
T
 
R
L
 
P
G
 
G
E
 
Q
A
 
W
I
 
V
V
 
V
V
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
G
I
 
L
G
 
G
L
 
H
I
 
V
T
 
A
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Y
L
 
A
R
 
R
A
 
A
Q
 
M
G
 
G
C
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
A
G
 
A
I
 
V
D
 
D
F
 
I
D
 
D
P
 
D
A
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
N
M
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
R
M
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
A
D
 
V
L
 
N
S
 
A
A
 
R
G
 
D
Q
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
-
A
 
A
A
 
A
G
 
W
I
 
L
A
 
Q
F
 
K
S
 
E
R
 
I
G
 
G
R
 
-
G
 
G
I
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
A
A
 
V
T
 
-
K
 
-
S
 
S
S
 
P
E
 
K
P
 
A
I
 
F
H
 
S
Q
 
Q
A
 
A
A
 
I
K
 
G
M
 
M
S
 
V
R
 
R
K
 
R
R
 
G
G
 
G
R
 
T
I
 
I
V
 
A
L
 
L
V
 
N
G
 
G
V
 
L

Sites not aligning to the query:

P12311 Alcohol dehydrogenase; ADH-T; EC 1.1.1.1 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see paper)
29% identity, 26% coverage: 90:273/707 of query aligns to 56:267/337 of P12311

query
sites
P12311
P
 
P
L
 
L
P
 
I
M
 
P
G
 
G
Y
 
H
C
 
E
N
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
V
V
 
I
A
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
G
 
H
Y
 
L
A
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
-
 
G
-
 
I
-
 
P
-
 
W
-
 
L
-
 
Y
-
 
S
-
 
A
-
 
C
-
 
G
-
 
H
-
 
C
-
 
D
-
 
Y
-
 
C
-
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
Q
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
C
-
 
E
-
 
R
-
 
Q
-
 
Q
-
 
N
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
A
 
S
S
 
V
N
 
D
G
 
G
K
 
G
H
 
Y
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
C
L
 
R
V
 
A
P
 
A
L
 
A
N
 
D
L
 
Y
S
 
V
A
 
V
R
 
K
V
 
I
P
 
P
D
 
D
A
 
N
V
 
L
S
 
S
D
 
F
E
 
E
E
 
E
A
 
A
S
 
A
-
 
P
F
 
I
T
 
F
V
 
C
L
 
A
G
 
G
A
 
V
I
 
T
A
 
T
L
 
Y
Q
 
K
G
 
A
I
 
L
R
 
K
L
 
V
V
 
T
Q
 
G
P
 
A
T
 
K
L
 
P
G
 
G
E
 
E
A
 
W
I
 
V
V
 
A
V
 
I
S
 
Y
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
G
I
 
L
G
 
G
L
 
H
I
 
V
T
 
A
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Y
L
 
A
R
 
K
A
 
A
Q
 
M
G
 
G
C
 
L
R
 
N
V
 
V
L
 
V
G
 
A
I
 
V
D
 
D
F
 
L
D
 
G
P
 
D
A
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
E
M
 
L
A
 
A
R
 
K
S
 
Q
M
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
D
V
 
L
V
 
V
D
 
-
L
 
V
S
 
N
A
 
P
G
 
K
Q
 
H
D
 
D
P
 
D
V
 
A
A
 
A
A
 
Q
G
 
W
I
 
I
A
 
K
F
 
E
S
 
K
R
 
V
G
 
G
R
 
-
G
 
G
I
 
V
D
 
H
G
 
A
V
 
T
I
 
V
V
 
V
T
 
T
A
 
A
A
 
V
T
 
S
K
 
K
S
 
A
S
 
A
E
 
-
P
 
-
I
 
F
H
 
E
Q
 
S
A
 
A
A
 
Y
K
 
K
M
 
S
S
 
I
R
 
R
K
 
R
R
 
G
G
 
G
R
 
A
I
 
C
V
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
L
T
 
P
G
 
P
L
 
E
E
 
E
L
 
I

Sites not aligning to the query:

1rjwA Crystal structure of NAD(+)-dependent alcohol dehydrogenase from bacillus stearothermophilus strain lld-r (see paper)
29% identity, 27% coverage: 90:278/707 of query aligns to 56:272/339 of 1rjwA

query
sites
1rjwA
P
 
P
L
 
L
P
 
I
M
 
P
G
 
G
Y
x
H
C
x
E
N
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
I
V
 
V
A
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
G
 
H
Y
 
L
A
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
-
 
G
-
 
I
-
 
P
-
 
W
-
 
L
-
 
Y
-
 
S
-
 
A
-
x
C
-
 
G
-
 
H
-
x
C
-
 
D
-
 
Y
-
x
C
-
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
Q
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
x
C
-
 
E
-
 
H
-
 
Q
-
x
K
-
 
N
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
A
 
S
S
 
V
N
 
D
G
 
G
K
 
G
H
 
Y
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
C
L
 
R
V
 
A
P
 
A
L
 
A
N
 
D
L
 
Y
S
 
V
A
 
V
R
 
K
V
 
I
P
 
P
D
 
D
A
 
N
V
 
L
S
 
S
D
 
F
E
 
E
E
 
E
A
 
A
S
 
A
-
 
P
F
 
I
T
 
F
V
x
C
L
 
A
G
 
G
A
 
V
I
x
T
A
 
T
L
 
Y
Q
 
K
G
 
A
I
 
L
R
 
K
L
 
V
V
 
T
Q
 
G
P
 
A
T
 
K
L
 
P
G
 
G
E
 
E
A
 
W
I
 
V
V
 
A
V
 
I
S
 
Y
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
G
I
 
L
G
 
G
L
 
H
I
 
V
T
 
A
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Y
L
 
A
R
 
K
A
 
A
Q
 
M
G
 
G
C
 
L
R
 
N
V
 
V
L
 
V
G
 
A
I
 
V
D
 
D
F
 
I
D
 
G
P
 
D
A
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
E
M
 
L
A
 
A
R
 
K
S
 
E
M
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
D
V
 
L
V
 
V
D
 
V
L
 
N
S
 
P
A
 
L
G
 
K
Q
 
E
D
 
D
P
 
-
V
 
-
A
 
A
A
 
A
G
 
K
I
 
F
A
 
M
F
 
K
S
 
E
R
 
K
G
 
V
R
 
G
G
 
G
I
 
V
D
 
H
G
 
A
V
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
A
 
A
A
 
V
T
 
S
K
 
K
S
 
-
S
 
-
E
 
-
P
 
P
I
 
A
H
 
F
Q
 
Q
A
 
S
A
 
A
K
 
Y
M
 
N
S
 
S
R
 
I
K
 
R
R
 
R
-
 
G
G
 
G
R
 
A
I
 
C
V
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
L
T
 
P
G
 
P
L
 
E
E
 
E
L
 
M
S
 
P
R
 
I
A
 
P
D
 
I
F
 
F

Sites not aligning to the query:

4z6kA Alcohol dehydrogenase from the antarctic psychrophile moraxella sp. Tae 123
28% identity, 32% coverage: 44:268/707 of query aligns to 5:262/345 of 4z6kA

query
sites
4z6kA
M
 
V
L
 
L
V
 
H
D
 
E
F
 
F
G
 
G
K
 
Q
A
 
S
N
 
L
W
 
Q
I
 
I
D
 
E
K
 
E
A
 
V
R
 
D
Q
 
I
Q
 
P
P
 
T
D
 
P
K
 
G
A
 
A
R
 
G
Q
 
E
V
 
I
L
 
V
D
 
V
K
 
K
I
 
M
R
 
Q
T
 
A
D
 
S
G
 
G
L
 
V
K
x
C
P
x
H
T
|
T
-
 
D
I
 
L
E
x
H
A
 
A
V
 
V
F
 
E
N
 
G
-
 
D
-
 
W
-
 
P
-
 
V
K
 
K
L
 
P
D
 
S
Q
 
P
P
 
P
L
 
F
P
 
I
M
 
P
G
 
G
Y
x
H
C
x
E
N
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
L
V
 
I
A
 
T
E
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
T
G
 
H
Y
 
V
A
 
K
V
 
E
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
W
-
 
L
-
 
Y
-
 
S
-
 
A
-
x
C
-
 
G
-
 
H
-
x
C
-
 
T
-
 
H
-
x
C
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
W
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
x
C
-
 
E
-
 
S
-
 
Q
-
x
Q
-
 
N
-
 
S
-
 
G
-
 
Y
A
 
S
S
 
V
N
 
N
G
 
G
K
 
S
H
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
V
L
 
L
V
 
A
P
 
N
L
 
A
N
 
N
L
 
Y
S
 
V
A
 
G
R
 
I
V
 
I
P
 
P
D
 
E
A
 
S
V
 
V
-
 
D
S
 
S
D
 
I
E
 
E
E
 
I
A
 
A
S
 
P
F
 
V
T
 
L
V
x
C
L
 
A
G
 
G
A
 
V
I
x
T
A
 
V
L
 
Y
Q
 
K
G
 
G
I
 
L
R
 
K
L
 
M
V
 
T
Q
 
D
P
 
T
T
 
K
L
 
P
G
 
G
E
 
D
A
 
W
I
 
V
V
 
V
V
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
G
I
 
L
G
 
G
L
 
H
I
 
M
T
 
A
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Y
L
 
A
R
 
I
A
 
A
Q
 
M
G
 
G
C
 
L
R
 
N
V
 
V
L
 
A
G
 
A
I
 
V
D
 
D
F
 
I
D
 
D
P
 
D
A
 
D
K
 
K
L
 
L
A
 
A
M
 
F
A
 
A
R
 
K
S
 
K
M
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
V
 
T
D
 
V
L
 
N
S
 
A
A
 
K
G
 
N
Q
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
-
A
 
-
A
 
A
G
 
E
I
 
Y
A
 
L
F
 
Q
S
 
K
R
 
E
G
 
I
R
 
G
G
 
G
I
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
A
A
 
V
T
 
-
K
 
-
S
 
S
S
 
A
E
 
K
P
 
A
I
 
F
H
 
D
Q
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
S
M
 
M
S
 
L
R
 
R
K
 
R
R
 
G
G
 
G
R
 
T
I
 
L
V
 
V
L
 
C
V
 
N
G
 
G
V
 
L

Sites not aligning to the query:

5vm2A Crystal structure of eck1772, an oxidoreductase/dehydrogenase of unknown specificity involved in membrane biogenesis from escherichia coli
26% identity, 33% coverage: 121:351/707 of query aligns to 123:328/347 of 5vm2A

query
sites
5vm2A
G
 
G
K
 
A
H
 
L
A
 
T
E
 
H
Y
 
Y
A
 
L
L
 
C
V
 
H
P
 
P
L
 
E
N
 
S
L
 
F
S
 
T
A
 
Y
R
 
K
V
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
N
V
 
M
S
 
D
D
 
T
E
 
M
E
 
E
A
 
G
S
 
T
F
 
L
T
 
V
V
x
E
L
x
P
G
 
A
A
 
A
I
 
V
A
x
G
L
 
M
Q
 
H
G
 
A
I
 
A
R
 
M
L
 
L
V
 
A
Q
 
D
P
 
V
T
 
K
L
 
P
G
 
G
E
 
K
A
 
K
I
 
I
V
 
I
V
 
I
S
 
L
G
 
G
L
 
A
G
 
G
L
 
C
I
 
I
G
 
G
L
 
L
I
 
M
T
 
T
V
 
L
Q
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
Q
G
 
A
C
 
C
R
 
K
V
 
C
L
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
V
I
 
V
D
 
D
F
 
V
D
 
L
P
 
E
A
 
K
K
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
R
 
E
S
 
Q
M
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
T
V
 
V
V
 
V
D
 
I
L
 
N
S
 
G
A
 
A
G
 
K
Q
 
E
D
 
D
P
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
R
G
 
C
I
 
Q
A
 
Q
F
 
F
S
 
T
R
 
E
G
 
D
R
 
M
G
 
G
I
 
A
D
 
D
G
 
I
V
 
V
I
 
F
V
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
G
T
 
-
K
 
-
S
 
S
S
 
A
E
 
V
P
 
T
I
 
V
H
 
K
Q
 
Q
A
 
A
A
 
P
K
 
Y
M
 
L
S
 
V
R
 
M
K
 
R
R
 
G
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
M
L
 
I
V
 
V
G
 
G
-
 
T
V
 
V
T
 
P
G
 
G
L
 
A
E
 
S
L
 
A
S
 
I
R
 
N
A
 
F
D
 
L
F
 
K
F
 
I
E
 
N
K
 
R
E
 
E
L
 
V
T
 
T
F
 
I
Q
 
Q
V
 
T
S
 
V
C
 
F
S
 
R
Y
 
Y
G
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
D
 
-
P
 
-
N
 
-
Y
 
-
E
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
A
N
 
N
D
 
R
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
G
 
-
F
 
-
V
 
-
R
 
-
W
 
-
T
 
-
E
 
-
Q
 
-
R
 
-
N
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
T
L
 
I
D
 
E
M
 
A
M
 
I
A
 
S
S
 
S
G
 
G
A
 
R
L
 
F
D
 
D
V
 
V
K
 
K
P
 
S
L
 
M
I
 
V
S
 
T
H
 
H
R
 
I
F
 
Y
A
 
D
I
 
Y
D
 
R
D
 
D
A
 
V
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
Y
 
F

Sites not aligning to the query:

Q8GIX7 Alcohol dehydrogenase; ADH; EC 1.1.1.1 from Moraxella sp. (strain TAE123) (see paper)
28% identity, 32% coverage: 44:268/707 of query aligns to 5:262/338 of Q8GIX7

query
sites
Q8GIX7
M
 
V
L
 
L
V
 
H
D
 
E
F
 
F
G
 
G
K
 
Q
A
 
S
N
 
L
W
 
Q
I
 
I
D
 
E
K
 
E
A
 
V
R
 
D
Q
 
I
Q
 
P
P
 
T
D
 
P
K
 
G
A
 
A
R
 
G
Q
 
E
V
 
I
L
 
V
D
 
V
K
 
K
I
 
M
R
 
Q
T
 
A
D
 
S
G
 
G
L
 
V
K
x
C
P
 
H
T
 
T
-
 
D
I
 
L
E
 
H
A
 
A
V
 
V
F
 
E
N
 
G
-
 
D
-
 
W
-
 
P
-
 
V
K
 
K
L
 
P
D
 
S
Q
 
P
P
 
P
L
 
F
P
 
I
M
 
P
G
 
G
Y
x
H
C
x
E
N
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
L
V
 
I
A
 
T
E
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
T
G
 
H
Y
 
V
A
 
K
V
 
E
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
W
-
 
L
-
 
Y
-
 
S
-
 
A
-
x
C
-
 
G
-
 
H
-
x
C
-
 
T
-
 
H
-
x
C
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
W
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
x
C
-
 
E
-
 
S
-
 
Q
-
 
Q
-
 
N
-
 
S
-
 
G
-
 
Y
A
 
S
S
 
V
N
 
N
G
 
G
K
 
S
H
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
V
L
 
L
V
 
A
P
 
N
L
 
A
N
 
N
L
 
Y
S
 
V
A
 
G
R
 
I
V
 
I
P
 
P
D
 
E
A
 
S
V
 
V
-
 
D
S
 
S
D
 
I
E
 
E
E
 
I
A
 
A
S
 
P
F
 
V
T
 
L
V
x
C
L
 
A
G
 
G
A
 
V
I
 
T
A
 
V
L
 
Y
Q
 
K
G
 
G
I
 
L
R
 
K
L
 
M
V
 
T
Q
 
D
P
 
T
T
 
K
L
 
P
G
 
G
E
 
D
A
 
W
I
 
V
V
 
V
V
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
G
I
 
L
G
 
G
L
 
H
I
 
M
T
 
A
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Y
L
 
A
R
 
I
A
 
A
Q
 
M
G
 
G
C
 
L
R
 
N
V
 
V
L
 
A
G
 
A
I
 
V
D
 
D
F
 
I
D
 
D
P
 
D
A
 
D
K
 
K
L
 
L
A
 
A
M
 
F
A
 
A
R
 
K
S
 
K
M
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
V
 
T
D
 
V
L
 
N
S
 
A
A
 
K
G
 
N
Q
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
-
A
 
-
A
 
A
G
 
E
I
 
Y
A
 
L
F
 
Q
S
 
K
R
 
E
G
 
I
R
 
G
G
 
G
I
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
A
A
 
V
T
 
-
K
 
-
S
 
S
S
 
A
E
 
K
P
 
A
I
 
F
H
 
D
Q
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
S
M
 
M
S
 
L
R
 
R
K
 
R
R
 
G
G
 
G
R
 
T
I
 
L
V
 
V
L
 
C
V
 
N
G
 
G
V
 
L

3piiA Crystal structure of mutant of ht- alcohol dehydrogenase with substrate analogue butyramide
29% identity, 27% coverage: 90:278/707 of query aligns to 56:272/337 of 3piiA

query
sites
3piiA
P
 
P
L
 
L
P
 
I
M
 
P
G
 
G
Y
x
H
C
x
E
N
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
I
V
 
V
A
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
G
 
H
Y
 
L
A
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
-
 
G
-
 
I
-
 
P
-
x
W
-
 
L
-
 
Y
-
 
S
-
 
A
-
x
C
-
 
G
-
 
H
-
x
C
-
 
D
-
 
Y
-
x
C
-
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
Q
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
x
C
-
 
E
-
 
H
-
 
Q
-
x
K
-
 
N
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
A
 
S
S
 
V
N
 
D
G
 
G
K
 
G
H
 
Y
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
C
L
 
R
V
 
A
P
 
A
L
 
A
N
 
D
L
 
Y
S
 
V
A
 
V
R
 
K
V
 
I
P
 
P
D
 
D
A
 
N
V
 
L
S
 
S
D
 
F
E
 
E
E
 
E
A
 
A
S
 
A
-
 
P
F
 
I
T
 
F
V
x
C
L
 
A
G
 
G
A
 
V
I
x
T
A
 
T
L
 
Y
Q
 
K
G
 
A
I
 
L
R
 
K
L
 
V
V
 
T
Q
 
G
P
 
A
T
 
K
L
 
P
G
 
G
E
 
E
A
 
W
I
 
V
V
 
A
V
 
I
S
 
Y
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
G
I
 
F
G
 
G
L
 
H
I
 
V
T
 
A
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Y
L
 
A
R
 
K
A
 
A
Q
 
M
G
 
G
C
 
L
R
 
N
V
 
V
L
 
V
G
 
A
I
 
V
D
 
D
F
 
I
D
 
G
P
 
D
A
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
E
M
 
L
A
 
A
R
 
K
S
 
E
M
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
D
V
 
L
V
 
V
D
 
V
L
 
N
S
 
P
A
 
L
G
 
K
Q
 
E
D
 
D
P
 
-
V
 
-
A
 
A
A
 
A
G
 
K
I
 
F
A
 
M
F
 
K
S
 
E
R
 
K
G
 
V
R
 
G
G
 
G
I
 
V
D
 
H
G
 
A
V
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
A
 
A
A
 
V
T
 
S
K
 
K
S
 
-
S
 
-
E
 
-
P
 
P
I
 
A
H
 
F
Q
 
Q
A
 
S
A
 
A
K
 
Y
M
 
N
S
 
S
R
 
I
K
 
R
R
 
R
-
 
G
G
 
G
R
 
A
I
 
C
V
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
L
T
 
P
G
 
P
L
 
E
E
 
E
L
 
M
S
 
P
R
 
I
A
 
P
D
 
I
F
 
F

Sites not aligning to the query:

Q00796 Sorbitol dehydrogenase; SDH; (R,R)-butanediol dehydrogenase; L-iditol 2-dehydrogenase; Polyol dehydrogenase; Ribitol dehydrogenase; RDH; Xylitol dehydrogenase; XDH; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.4; EC 1.1.1.14; EC 1.1.1.56; EC 1.1.1.9 from Homo sapiens (Human) (see 10 papers)
22% identity, 49% coverage: 11:357/707 of query aligns to 18:341/357 of Q00796

query
sites
Q00796
G
 
G
K
 
D
T
 
L
S
 
R
V
 
L
V
 
E
D
 
N
V
 
Y
P
 
P
V
 
I
P
 
P
Q
 
E
A
 
P
G
 
G
R
 
P
G
 
N
Q
 
E
L
 
V
L
 
L
I
 
L
R
 
R
T
 
M
S
 
-
H
 
H
T
 
S
L
 
V
I
 
G
S
 
I
A
x
C
G
 
G
T
 
S
E
 
D
R
 
V
M
 
H
L
 
Y
V
 
W
D
 
E
F
 
Y
G
 
G
K
 
R
-
 
I
A
 
G
N
 
N
W
 
F
I
 
I
D
 
V
K
 
K
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
-
I
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
-
T
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
F
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
K
P
 
P
L
 
M
P
 
V
M
 
L
G
 
G
Y
x
H
C
x
E
N
 
A
V
 
S
G
 
G
R
 
T
V
 
V
A
 
E
E
 
K
V
 
V
G
 
G
A
 
S
G
 
S
V
 
V
T
 
K
G
 
H
Y
 
L
A
 
K
V
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
A
S
 
I
N
 
E
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
P
-
 
R
-
 
E
-
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
F
G
 
C
K
 
K
H
 
M
A
 
G
E
x
R
Y
 
Y
A
 
N
L
 
L
V
 
S
P
 
P
L
 
S
-
 
I
-
 
F
-
 
F
-
 
C
-
 
A
-
 
T
-
 
P
-
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
G
N
 
N
L
 
L
S
 
C
-
 
R
-
 
F
-
 
Y
-
 
K
-
x
H
-
 
N
-
 
A
-
 
A
-
 
F
-
 
C
A
 
Y
R
 
K
V
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
N
V
 
V
S
 
T
D
 
F
E
 
E
E
 
E
A
 
G
S
x
A
F
 
L
T
 
I
V
 
E
L
 
P
G
 
L
A
 
S
I
 
V
A
 
G
L
 
I
Q
 
H
G
 
A
I
 
C
R
 
R
L
 
R
V
 
G
Q
 
G
P
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
E
 
H
A
 
K
I
 
V
V
 
L
V
 
V
S
 
C
G
 
G
L
 
A
G
 
G
L
 
P
I
|
I
G
 
G
L
 
M
I
 
V
T
 
T
V
 
L
Q
 
L
L
 
V
L
 
A
R
 
K
A
 
A
Q
 
M
G
 
G
-
 
A
C
 
A
R
 
Q
V
 
V
L
 
V
G
 
V
I
 
T
D
|
D
F
 
L
D
 
S
P
 
A
A
 
T
K
x
R
L
 
L
A
 
S
M
 
K
A
 
A
R
 
K
S
 
E
M
 
I
G
 
G
A
 
A
E
 
D
V
 
L
V
 
V
D
 
L
L
 
Q
S
 
I
A
 
S
G
 
K
Q
 
E
D
 
S
P
 
P
V
 
Q
A
 
E
A
 
I
G
 
A
I
 
R
A
 
K
F
 
V
S
 
E
R
 
G
G
x
Q
R
 
L
G
 
G
I
 
C
D
 
K
G
 
P
V
 
E
I
 
V
V
 
T
T
 
I
A
 
E
A
 
C
T
 
T
K
 
G
S
 
A
S
 
E
E
 
A
P
 
S
I
 
I
H
 
Q
Q
 
A
A
 
G
A
 
I
K
 
Y
M
 
A
S
 
T
R
 
R
K
 
S
R
 
G
G
 
G
R
x
N
I
 
L
V
 
V
L
 
L
V
|
V
G
|
G
V
x
L
T
 
-
G
 
G
L
 
S
E
 
E
L
 
M
S
 
T
R
 
T
A
 
V
D
 
P
F
 
L
F
 
L
E
 
H
-
 
A
-
 
A
-
 
I
K
 
R
E
 
E
L
 
V
T
 
D
F
 
I
Q
 
K
V
 
-
S
 
-
C
 
-
S
 
-
Y
 
-
G
 
G
P
x
V
G
x
F
R
|
R
Y
 
Y
D
 
-
P
 
-
N
 
-
Y
 
-
E
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
C
N
 
N
D
 
T
Y
 
W
P
 
P
V
 
V
G
 
A
F
 
-
V
 
-
R
 
-
W
 
-
T
 
-
E
 
-
Q
 
-
R
 
-
N
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
I
D
 
S
M
 
M
M
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
K
A
 
S
L
 
V
D
 
N
V
 
V
K
 
K
P
 
P
L
 
L
I
x
V
S
 
T
H
 
H
R
 
R
F
 
F
A
 
P
I
 
L
D
 
E
D
 
K
A
 
A
E
 
L
G
 
E
A
 
A
Y
 
F
G
 
E
L
 
T
I
 
F
S
 
K
G
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1pl6A Human sdh/nadh/inhibitor complex (see paper)
22% identity, 49% coverage: 11:357/707 of query aligns to 17:340/356 of 1pl6A

query
sites
1pl6A
G
 
G
K
 
D
T
 
L
S
 
R
V
 
L
V
 
E
D
 
N
V
 
Y
P
 
P
V
 
I
P
 
P
Q
 
E
A
 
P
G
 
G
R
 
P
G
 
N
Q
 
E
L
 
V
L
 
L
I
 
L
R
 
R
T
 
M
S
 
-
H
 
H
T
 
S
L
 
V
I
 
G
S
 
I
A
x
C
G
|
G
T
x
S
E
 
D
R
 
V
M
x
H
L
 
Y
V
 
W
D
 
E
F
 
Y
G
 
G
K
 
R
-
x
I
A
 
G
N
 
N
W
x
F
I
 
I
D
 
V
K
 
K
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
-
I
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
-
T
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
F
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
K
P
 
P
L
 
M
P
 
V
M
 
L
G
 
G
Y
x
H
C
x
E
N
 
A
V
 
S
G
 
G
R
 
T
V
 
V
A
 
E
E
 
K
V
 
V
G
 
G
A
 
S
G
 
S
V
 
V
T
 
K
G
 
H
Y
 
L
A
 
K
V
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
A
S
 
I
N
 
E
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
P
-
x
R
-
 
E
-
 
N
-
x
D
-
 
E
-
 
F
G
x
C
K
 
K
H
 
M
A
 
G
E
 
R
Y
 
Y
A
 
N
L
 
L
V
x
S
P
 
P
L
 
S
-
 
I
-
x
F
-
 
F
-
 
C
-
 
A
-
 
T
-
 
P
-
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
G
N
 
N
L
 
L
S
 
C
-
 
R
-
 
F
-
 
Y
-
 
K
-
 
H
-
 
N
-
 
A
-
 
A
-
 
F
-
 
C
A
 
Y
R
 
K
V
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
N
V
 
V
S
 
T
D
 
F
E
 
E
E
 
E
A
 
G
S
 
A
F
 
L
T
 
I
V
x
E
L
x
P
G
 
L
A
 
S
I
 
V
A
x
G
L
 
I
Q
 
H
G
 
A
I
 
C
R
 
R
L
 
R
V
 
G
Q
 
G
P
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
E
 
H
A
 
K
I
 
V
V
 
L
V
 
V
S
 
C
G
 
G
L
 
A
G
|
G
L
x
P
I
|
I
G
 
G
L
 
M
I
 
V
T
 
T
V
 
L
Q
 
L
L
 
V
L
 
A
R
 
K
A
 
A
Q
 
M
G
 
G
-
 
A
C
 
A
R
 
Q
V
 
V
L
 
V
G
 
V
I
 
T
D
|
D
F
x
L
D
 
S
P
 
A
A
 
T
K
x
R
L
 
L
A
 
S
M
 
K
A
 
A
R
 
K
S
 
E
M
 
I
G
 
G
A
 
A
E
 
D
V
 
L
V
 
V
D
 
L
L
 
Q
S
 
I
A
 
S
G
 
K
Q
 
E
D
 
S
P
 
P
V
 
Q
A
 
E
A
 
I
G
 
A
I
 
R
A
 
K
F
 
V
S
 
E
R
 
G
G
 
Q
R
 
L
G
 
G
I
 
C
D
 
K
G
 
P
V
 
E
I
 
V
V
 
T
T
 
I
A
 
E
A
x
C
T
|
T
K
 
G
S
 
A
S
 
E
E
 
A
P
 
S
I
 
I
H
 
Q
Q
 
A
A
 
G
A
 
I
K
 
Y
M
 
A
S
 
T
R
 
R
K
 
S
R
 
G
G
 
G
R
 
T
I
 
L
V
 
V
L
 
L
V
|
V
G
|
G
V
x
L
T
 
-
G
 
G
L
 
S
E
 
E
L
 
M
S
 
T
R
 
T
A
 
V
D
 
P
F
 
L
F
 
L
E
 
H
-
 
A
-
 
A
-
 
I
K
 
R
E
 
E
L
 
V
T
 
D
F
 
I
Q
 
K
V
 
-
S
 
-
C
 
-
S
 
-
Y
 
-
G
 
G
P
 
V
G
x
F
R
|
R
Y
 
Y
D
 
-
P
 
-
N
 
-
Y
 
-
E
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
C
N
 
N
D
 
T
Y
 
W
P
 
P
V
 
V
G
 
A
F
 
-
V
 
-
R
 
-
W
 
-
T
 
-
E
 
-
Q
 
-
R
 
-
N
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
I
D
 
S
M
 
M
M
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
K
A
 
S
L
 
V
D
 
N
V
 
V
K
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
V
S
 
T
H
 
H
R
 
R
F
 
F
A
 
P
I
 
L
D
 
E
D
 
K
A
 
A
E
 
L
G
 
E
A
 
A
Y
 
F
G
 
E
L
 
T
I
 
F
S
 
K
G
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3meqA Crystal structure of alcohol dehydrogenase from brucella melitensis
30% identity, 26% coverage: 86:268/707 of query aligns to 54:266/341 of 3meqA

query
sites
3meqA
K
 
K
L
 
P
D
 
N
Q
 
P
P
 
P
L
 
F
P
 
I
M
 
P
G
 
G
Y
x
H
C
x
E
N
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
F
V
 
V
A
 
S
E
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
S
G
 
G
V
 
V
T
 
K
G
 
H
Y
 
V
A
 
K
V
 
E
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
-
 
G
-
 
I
-
 
P
-
 
W
-
 
L
-
 
Y
-
 
T
-
 
A
-
x
C
-
 
G
-
 
H
-
x
C
-
 
R
-
 
H
-
x
C
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
W
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
x
C
-
 
E
-
 
E
-
 
Q
-
x
L
-
 
N
-
 
T
-
 
G
-
 
Y
A
 
S
S
 
V
N
 
N
G
 
G
K
 
G
H
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
V
L
 
V
V
 
A
P
 
D
L
 
P
N
 
N
L
 
F
S
 
V
A
 
G
R
 
H
V
 
L
P
 
P
D
 
K
A
 
N
V
 
I
S
 
D
-
 
F
D
 
N
E
 
E
E
 
I
A
 
A
S
 
P
F
 
V
T
 
L
V
x
C
L
 
A
G
 
G
A
 
V
I
x
T
A
 
V
L
 
Y
Q
 
K
G
 
G
I
 
L
R
 
K
L
 
V
V
 
T
Q
 
D
P
 
T
T
 
K
L
 
P
G
 
G
E
 
D
A
 
W
I
 
V
V
 
V
V
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
I
G
|
G
L
x
G
I
x
L
G
 
G
L
 
H
I
 
M
T
 
A
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Y
L
 
A
R
 
R
A
 
A
Q
 
M
G
 
G
C
 
L
R
 
N
V
 
V
L
 
A
G
 
A
I
 
V
D
|
D
F
x
I
D
 
D
P
 
D
A
 
R
K
|
K
L
 
L
A
 
D
M
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
R
M
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
T
V
 
V
-
 
T
V
 
V
D
 
N
L
 
A
S
 
K
A
 
T
G
 
V
Q
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
-
A
 
A
A
 
A
G
 
Y
I
 
I
A
 
R
F
 
K
S
 
E
R
 
T
G
 
D
R
 
G
G
 
G
I
 
A
D
 
Q
G
 
G
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
|
T
A
|
A
A
x
V
T
 
-
K
 
-
S
|
S
S
 
P
E
 
K
P
x
A
I
 
F
H
 
E
Q
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
G
M
 
M
S
 
V
R
 
A
K
 
R
R
 
G
G
 
G
R
 
T
I
 
V
V
 
S
L
 
L
V
x
N
G
|
G
V
x
L

Sites not aligning to the query:

6z42A The low resolution structure of a zinc-dependent alcohol dehydrogenase from halomonas elongata.
26% identity, 36% coverage: 17:268/707 of query aligns to 20:262/336 of 6z42A

query
sites
6z42A
D
 
E
V
 
V
P
 
P
V
 
V
P
 
P
Q
 
R
A
 
P
G
 
G
R
 
P
G
 
G
Q
 
E
L
 
I
L
 
L
I
 
V
R
 
K
T
 
V
S
 
A
H
 
-
T
 
-
L
 
-
I
 
-
S
 
A
A
 
S
G
 
G
T
 
V
E
x
C
R
 
H
M
x
T
L
 
D
V
 
L
D
x
H
F
 
A
G
 
A
K
 
R
A
 
G
N
 
D
W
 
W
I
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
-
I
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
P
L
 
V
K
 
K
P
 
P
T
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
F
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
D
 
E
Q
 
P
P
 
P
L
 
F
P
 
I
M
 
P
G
 
G
Y
x
H
C
x
E
N
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
H
V
 
V
A
 
V
E
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
R
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
G
 
H
Y
 
V
A
 
K
V
 
E
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
-
 
G
-
 
V
-
 
P
-
 
W
-
 
L
-
 
Y
-
 
S
-
 
T
A
x
C
S
 
G
N
 
H
G
x
C
K
 
E
H
 
H
A
x
C
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
W
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
x
C
-
 
E
-
 
S
-
 
Q
-
 
Q
-
 
N
-
 
T
-
 
G
-
 
Y
-
 
S
-
 
V
-
 
N
-
 
G
E
 
E
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
V
 
A
P
 
Q
L
 
A
N
 
D
L
 
Y
S
 
V
A
 
G
R
 
K
V
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
N
V
 
V
S
 
G
D
 
F
E
 
V
E
 
E
-
 
I
A
 
A
S
 
P
F
 
V
T
 
L
V
x
C
L
 
A
G
 
G
A
 
V
I
 
T
A
 
V
L
 
Y
Q
 
K
G
 
G
I
 
L
R
 
K
L
 
M
V
 
T
Q
 
D
P
 
T
T
 
R
L
 
P
G
 
G
E
 
Q
A
 
W
I
 
V
V
 
V
V
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
G
I
 
L
G
 
G
L
 
H
I
 
M
T
 
A
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Y
L
 
A
R
 
R
A
 
A
Q
 
M
G
 
G
C
 
L
R
 
N
V
 
V
L
 
A
G
 
A
I
 
V
D
 
D
F
 
V
D
 
D
P
 
D
A
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
A
M
 
L
A
 
A
R
 
E
S
 
R
M
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
T
V
 
I
V
 
T
D
 
V
L
 
N
S
 
A
A
 
M
G
 
Q
Q
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
-
A
 
A
A
 
R
G
 
Y
I
 
L
A
 
K
F
 
Q
S
 
T
R
 
I
G
 
G
R
 
-
G
 
G
I
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
A
A
 
V
T
 
-
K
 
-
S
 
S
S
 
P
E
 
K
P
 
A
I
 
F
H
 
E
Q
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
G
M
 
M
S
 
I
R
 
R
K
 
R
R
 
G
G
 
G
R
 
T
I
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
N
G
 
G
V
 
L

6iqdA Crystal structure of alcohol dehydrogenase from geobacillus stearothermophilus (see paper)
26% identity, 32% coverage: 47:273/707 of query aligns to 8:267/336 of 6iqdA

query
sites
6iqdA
D
 
E
F
 
F
G
 
K
K
 
K
A
 
A
N
 
L
W
 
E
I
 
I
D
 
K
K
 
E
A
 
V
R
 
E
Q
 
R
Q
 
P
P
 
K
D
 
L
K
 
E
A
 
E
R
 
G
Q
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
V
K
 
K
I
 
I
R
 
E
T
 
A
D
 
C
G
 
G
L
 
V
K
x
C
P
 
H
T
|
T
-
 
D
I
 
L
E
x
H
A
 
A
V
 
A
F
 
H
N
 
G
-
 
D
-
 
W
-
 
P
-
 
I
K
 
K
L
 
P
D
 
K
Q
 
L
P
 
P
L
 
L
P
 
I
M
 
P
G
 
G
Y
x
H
C
x
E
N
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
I
V
 
V
A
 
V
E
 
E
V
 
V
G
 
A
A
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
K
G
 
S
Y
 
I
A
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
-
 
G
-
 
I
-
 
P
-
 
W
-
 
L
-
 
Y
-
 
S
-
 
A
-
x
C
-
 
G
-
 
E
-
x
C
-
 
E
-
 
Y
-
x
C
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
Q
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
x
C
-
 
P
-
 
H
-
 
Q
-
 
L
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
A
 
S
S
 
V
N
 
D
G
 
G
K
 
G
H
 
Y
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
C
L
 
K
V
 
A
P
 
P
L
 
A
N
 
D
L
 
Y
S
 
V
A
 
A
R
 
K
V
 
I
P
 
P
D
 
D
A
 
N
V
 
L
S
 
D
D
 
P
E
 
V
E
 
E
-
 
V
A
 
A
S
 
P
F
 
I
T
 
L
V
x
C
L
 
A
G
 
G
A
 
V
I
 
T
A
 
T
L
 
Y
Q
 
K
G
 
A
I
 
L
R
 
K
L
 
V
V
 
S
Q
 
G
P
 
A
T
 
R
L
 
P
G
 
G
E
 
E
A
 
W
I
 
V
V
 
A
V
 
I
S
 
Y
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
G
I
 
L
G
 
G
L
 
H
I
 
I
T
 
A
V
 
L
Q
 
Q
L
 
Y
L
 
A
R
 
K
A
 
A
Q
 
M
G
 
G
C
 
L
R
 
N
V
 
V
L
 
V
G
 
A
I
 
V
D
 
D
F
 
I
D
 
S
P
 
D
A
 
E
K
 
K
L
 
S
A
 
K
M
 
L
A
 
A
R
 
K
S
 
D
M
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
D
V
 
I
V
 
A
D
 
I
L
 
N
S
 
G
A
 
L
G
 
K
Q
 
E
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
K
A
 
A
G
 
-
I
 
-
A
 
I
F
 
H
S
 
D
R
 
Q
G
 
V
R
 
G
G
 
G
I
 
V
D
 
H
G
 
A
V
 
A
I
 
I
V
 
S
T
 
V
A
 
A
A
 
V
T
 
N
K
 
K
S
 
K
S
 
A
E
 
-
P
 
-
I
 
F
H
 
E
Q
 
Q
A
 
A
A
 
Y
K
 
Q
M
 
S
S
 
V
R
 
K
K
 
R
R
 
G
G
 
G
R
 
T
I
 
L
V
 
V
L
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
L
T
 
P
G
 
N
L
 
A
E
 
D
L
 
L

2eerB Structural study of project id st2577 from sulfolobus tokodaii strain7
26% identity, 33% coverage: 45:274/707 of query aligns to 6:278/347 of 2eerB

query
sites
2eerB
L
 
L
V
 
V
D
 
E
F
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
P
N
 
L
W
 
K
I
 
L
D
 
E
K
 
D
A
 
I
R
 
P
Q
 
I
Q
 
P
P
 
K
D
 
P
K
 
K
A
 
G
R
 
S
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
D
 
I
K
 
K
I
 
I
R
 
E
T
 
A
D
 
A
G
 
G
L
 
V
K
x
C
P
x
H
T
x
S
-
 
D
-
 
V
-
x
H
-
 
M
-
 
R
-
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
F
-
 
G
-
 
N
-
 
L
-
 
R
-
 
I
I
 
V
E
 
E
A
 
D
V
 
L
F
 
G
N
 
V
K
 
K
L
 
L
D
 
-
Q
 
-
P
 
P
L
 
V
P
 
T
M
 
L
G
 
G
Y
x
H
C
x
E
N
 
I
V
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
I
A
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
D
G
 
E
V
 
V
T
 
V
G
 
G
Y
 
Y
A
 
S
V
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
V
N
 
N
-
 
P
-
 
W
-
 
E
-
 
G
-
x
E
-
 
G
-
 
N
-
x
C
-
 
Y
-
 
Y
-
x
C
-
 
R
-
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
E
-
 
H
-
 
L
-
x
C
-
 
D
-
 
S
-
 
P
-
x
R
-
 
W
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
N
-
 
Y
-
 
D
G
 
G
K
 
A
H
 
Y
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
P
-
 
H
L
 
Y
N
 
K
L
 
Y
S
 
L
A
 
Y
R
 
K
V
 
L
P
 
R
D
 
R
A
 
L
V
 
S
S
 
A
D
 
V
E
 
E
E
 
A
A
 
A
S
 
P
F
 
L
T
 
T
V
x
C
L
 
S
G
 
G
A
 
V
I
x
T
A
 
T
L
 
Y
Q
 
R
G
 
A
I
 
V
R
 
R
L
 
K
V
 
A
Q
 
S
P
 
L
T
 
D
L
 
P
G
 
S
E
 
K
A
 
T
I
 
L
V
 
V
V
 
V
S
 
I
G
|
G
L
 
A
G
 
G
L
x
G
-
x
G
I
x
L
G
 
G
L
 
T
I
 
M
T
 
A
V
 
I
Q
 
Q
L
 
I
L
 
A
R
 
K
A
 
A
-
 
V
Q
 
S
G
 
G
C
 
A
R
 
T
V
 
I
L
 
I
G
 
G
I
 
V
D
|
D
F
x
V
D
x
R
P
 
E
A
 
E
K
 
A
L
 
L
A
 
E
M
 
A
A
 
A
R
 
K
S
 
R
M
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
D
V
 
Y
V
 
V
D
 
I
L
 
N
S
 
A
A
 
S
G
 
S
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
S
A
 
E
G
 
I
I
 
R
A
 
R
F
 
I
S
 
T
R
 
Q
G
 
G
R
 
K
G
 
G
I
 
A
D
 
D
G
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
D
T
x
L
A
x
N
A
 
N
T
 
S
K
 
E
S
 
K
S
 
T
E
 
L
P
 
S
I
 
I
H
 
Y
Q
 
-
A
 
-
A
 
P
K
 
Y
M
 
V
S
 
L
R
 
A
K
 
K
R
 
Q
G
 
G
R
 
K
I
 
Y
V
 
V
L
 
M
V
|
V
G
|
G
V
x
L
T
x
F
G
 
G
L
 
A
E
 
D
L
 
L
S
 
K

Sites not aligning to the query:

2dfvA Hyperthermophilic threonine dehydrogenase from pyrococcus horikoshii (see paper)
23% identity, 49% coverage: 14:358/707 of query aligns to 16:337/346 of 2dfvA

query
sites
2dfvA
S
 
E
V
 
L
V
 
V
D
 
E
V
 
V
P
 
D
V
 
V
P
 
P
Q
 
K
A
 
P
G
 
G
R
 
P
G
 
G
Q
 
E
L
 
V
L
 
L
I
 
I
R
 
K
T
 
V
S
 
L
H
 
A
T
 
T
L
 
S
I
 
I
S
 
-
A
x
C
G
|
G
T
|
T
E
 
-
R
 
-
M
 
-
L
 
-
V
 
-
D
 
D
F
 
L
G
x
H
K
 
I
A
 
Y
N
 
E
W
 
W
I
 
N
D
 
E
K
 
W
A
 
A
R
 
Q
Q
 
S
Q
 
R
P
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
-
I
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
I
K
 
K
P
 
P
T
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
F
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
-
P
 
P
L
 
Q
P
 
I
M
 
M
G
 
G
Y
x
H
C
x
E
N
 
V
V
 
A
G
 
G
R
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
E
V
 
I
G
 
G
A
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
E
G
 
G
Y
 
I
A
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
Y
V
 
V
A
 
S
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
H
-
 
I
-
 
V
-
x
C
-
 
G
-
 
K
-
x
C
-
 
Y
-
 
A
-
x
C
-
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
Q
-
 
Y
-
 
H
-
 
V
-
x
C
-
 
Q
-
 
N
-
 
T
-
x
K
-
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
V
-
 
D
S
 
T
N
 
D
G
 
G
K
 
V
H
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
L
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
A
N
 
Q
L
 
N
S
 
I
A
 
W
R
 
K
V
 
N
P
 
P
D
 
K
A
 
S
V
 
I
S
 
P
D
 
P
E
 
E
E
 
Y
A
 
A
S
 
T
F
 
L
T
 
Q
V
 
E
L
x
P
G
 
L
A
 
G
I
 
N
A
|
A
L
 
V
Q
 
D
G
 
T
I
 
V
R
 
-
L
 
L
V
 
A
Q
 
G
P
 
P
T
 
I
L
 
S
G
 
G
E
 
K
A
 
S
I
 
V
V
 
L
V
 
I
S
 
T
G
 
G
L
 
A
G
|
G
L
x
P
I
x
L
G
 
G
L
 
L
I
 
L
T
 
G
V
 
I
Q
 
A
L
 
V
L
 
A
R
 
K
A
 
A
Q
 
S
G
 
G
C
 
A
R
 
Y
V
 
P
L
 
V
G
 
-
I
 
I
D
 
V
F
 
S
D
x
E
P
|
P
A
 
S
K
 
D
L
 
F
-
x
R
-
 
R
A
 
E
M
 
L
A
 
A
R
 
K
S
 
K
M
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
D
V
 
Y
V
 
V
D
 
I
L
 
N
S
 
P
A
 
F
G
 
E
Q
 
E
D
 
D
P
 
V
V
 
V
A
 
K
A
 
E
G
 
V
I
 
M
A
 
D
F
 
I
S
 
T
R
 
D
G
 
G
R
 
N
G
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
-
V
 
-
I
 
V
V
 
F
T
 
L
A
 
E
A
x
F
T
x
S
K
 
G
S
x
A
S
 
P
E
 
K
P
 
A
I
 
L
H
 
E
Q
 
Q
A
 
G
A
 
L
K
 
Q
M
 
A
S
 
V
R
 
T
K
 
P
R
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
S
L
 
L
V
x
L
G
|
G
V
x
L
T
 
Y
G
 
P
L
 
G
E
 
K
L
 
V
S
 
T
R
 
I
A
 
D
D
 
-
F
 
-
F
 
F
E
 
N
K
 
N
E
 
L
L
 
I
T
 
I
F
 
F
Q
 
K
V
 
A
S
 
L
C
 
T
S
 
I
Y
 
Y
G
 
G
-
x
I
P
x
T
G
 
G
R
 
R
Y
 
H
D
 
-
P
 
-
N
 
-
Y
 
-
E
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
N
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
-
F
 
-
V
 
-
R
 
L
W
 
W
T
 
-
E
 
-
Q
 
-
R
 
E
N
 
T
F
 
W
E
 
Y
A
 
T
V
 
V
L
 
S
D
 
R
M
 
L
M
 
L
A
 
Q
S
 
S
G
 
G
A
 
K
L
 
L
D
 
N
V
 
L
K
 
D
P
 
P
L
 
I
I
 
I
S
 
T
H
 
H
R
 
K
F
 
Y
-
 
K
A
 
G
I
 
F
D
 
D
D
 
K
A
 
Y
E
 
E
G
 
E
A
 
A
Y
 
F
G
 
E
L
 
L
I
 
M
S
 
R
G
 
A
G
 
G
E
 
K

Sites not aligning to the query:

O58389 L-threonine 3-dehydrogenase; L-ThrDH; TDH; L-threonine dehydrogenase; EC 1.1.1.103 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3) (see 2 papers)
23% identity, 49% coverage: 14:358/707 of query aligns to 18:339/348 of O58389

query
sites
O58389
S
 
E
V
 
L
V
 
V
D
 
E
V
 
V
P
 
D
V
 
V
P
 
P
Q
 
K
A
 
P
G
 
G
R
 
P
G
 
G
Q
 
E
L
 
V
L
 
L
I
 
I
R
 
K
T
 
V
S
 
L
H
 
A
T
 
T
L
 
S
I
 
I
S
 
-
A
x
C
G
 
G
T
|
T
E
 
-
R
 
-
M
 
-
L
 
-
V
 
-
D
 
D
F
 
L
G
 
H
K
 
I
A
 
Y
N
 
E
W
 
W
I
 
N
D
 
E
K
 
W
A
 
A
R
 
Q
Q
 
S
Q
 
R
P
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
-
I
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
I
K
 
K
P
 
P
T
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
F
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
-
P
 
P
L
 
Q
P
 
I
M
 
M
G
 
G
Y
x
H
C
x
E
N
 
V
V
 
A
G
 
G
R
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
E
V
 
I
G
 
G
A
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
E
G
 
G
Y
 
I
A
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
Y
V
 
V
A
 
S
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
H
-
 
I
-
 
V
-
x
C
-
 
G
-
 
K
-
x
C
-
 
Y
-
 
A
-
x
C
-
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
Q
-
 
Y
-
 
H
-
 
V
-
x
C
-
 
Q
-
 
N
-
 
T
-
 
K
-
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
V
-
 
D
S
 
T
N
 
D
G
 
G
K
 
V
H
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
L
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
A
N
 
Q
L
 
N
S
 
I
A
 
W
R
 
K
V
 
N
P
 
P
D
 
K
A
 
S
V
 
I
S
 
P
D
 
P
E
 
E
E
 
Y
A
 
A
S
 
T
F
 
L
T
 
Q
V
x
E
L
 
P
G
 
L
A
 
G
I
 
N
A
 
A
L
 
V
Q
 
D
G
 
T
I
 
V
R
 
-
L
 
L
V
 
A
Q
 
G
P
 
P
T
 
I
L
 
S
G
 
G
E
 
K
A
 
S
I
 
V
V
 
L
V
 
I
S
 
T
G
 
G
L
 
A
G
 
G
L
 
P
I
x
L
G
 
G
L
 
L
I
 
L
T
 
G
V
 
I
Q
 
A
L
 
V
L
 
A
R
 
K
A
 
A
Q
 
S
G
 
G
C
 
A
R
 
Y
V
 
P
L
 
V
G
 
-
I
 
I
D
 
V
F
 
S
D
x
E
P
 
P
A
 
S
K
 
D
L
 
F
-
x
R
-
 
R
A
 
E
M
 
L
A
 
A
R
 
K
S
 
K
M
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
D
V
 
Y
V
 
V
D
 
I
L
 
N
S
 
P
A
 
F
G
 
E
Q
 
E
D
 
D
P
 
V
V
 
V
A
 
K
A
 
E
G
 
V
I
 
M
A
 
D
F
 
I
S
 
T
R
 
D
G
 
G
R
 
N
G
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
-
V
 
-
I
 
V
V
 
F
T
 
L
A
 
E
A
 
F
T
 
S
K
 
G
S
 
A
S
 
P
E
 
K
P
 
A
I
 
L
H
 
E
Q
 
Q
A
 
G
A
 
L
K
 
Q
M
 
A
S
 
V
R
 
T
K
 
P
R
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
S
L
 
L
V
x
L
G
|
G
V
x
L
T
 
Y
G
 
P
L
 
G
E
 
K
L
 
V
S
 
T
R
 
I
A
 
D
D
 
-
F
 
-
F
 
F
E
 
N
K
 
N
E
 
L
L
 
I
T
 
I
F
 
F
Q
 
K
V
 
A
S
 
L
C
 
T
S
 
I
Y
 
Y
G
 
G
-
x
I
P
x
T
G
 
G
R
|
R
Y
 
H
D
 
-
P
 
-
N
 
-
Y
 
-
E
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
N
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
-
F
 
-
V
 
-
R
 
L
W
 
W
T
 
-
E
 
-
Q
 
-
R
 
E
N
 
T
F
 
W
E
 
Y
A
 
T
V
 
V
L
 
S
D
 
R
M
 
L
M
 
L
A
 
Q
S
 
S
G
 
G
A
 
K
L
 
L
D
 
N
V
 
L
K
 
D
P
 
P
L
 
I
I
 
I
S
 
T
H
 
H
R
 
K
F
 
Y
-
 
K
A
 
G
I
 
F
D
 
D
D
 
K
A
 
Y
E
 
E
G
 
E
A
 
A
Y
 
F
G
 
E
L
 
L
I
 
M
S
 
R
G
 
A
G
 
G
E
 
K

7y9pA Xylitol dehydrogenase s96c/s99c/y102c mutant(thermostabilized form) from pichia stipitis (see paper)
25% identity, 40% coverage: 87:368/707 of query aligns to 57:357/357 of 7y9pA

query
sites
7y9pA
L
 
L
D
 
T
Q
 
K
P
 
P
L
 
M
P
 
V
M
 
L
G
 
G
Y
x
H
C
x
E
N
 
S
V
 
A
G
 
G
R
 
T
V
 
V
A
 
V
E
 
Q
V
 
V
G
 
G
A
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
T
G
 
S
Y
 
L
A
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
N
V
 
V
A
 
A
-
 
I
-
 
E
-
 
P
-
 
G
-
 
I
-
 
P
-
x
C
-
 
R
-
 
F
-
x
C
S
 
D
N
 
E
G
x
C
K
 
K
H
 
S
A
 
G
E
 
H
Y
 
Y
A
 
N
L
 
L
V
x
C
P
 
P
L
 
H
-
 
M
-
 
A
-
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
T
-
 
P
-
 
N
-
 
E
-
 
P
-
 
N
-
 
P
-
 
P
-
 
G
-
 
T
-
 
L
-
 
C
-
 
K
-
 
Y
-
 
F
-
 
K
-
 
S
-
 
P
-
 
E
N
 
D
L
 
F
S
 
L
A
 
V
R
 
K
V
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
H
V
 
V
S
 
S
D
 
L
E
 
E
E
 
L
A
 
G
S
 
A
F
 
L
T
 
V
V
 
E
L
 
P
G
 
L
A
 
S
I
 
V
A
 
G
L
 
V
Q
 
H
G
 
A
I
 
S
R
 
K
L
 
L
V
 
G
Q
 
S
P
 
V
T
 
A
L
 
F
G
 
G
E
 
D
A
 
Y
I
 
V
V
 
A
V
 
V
S
 
F
G
 
G
L
 
A
G
 
G
L
 
P
I
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
T
 
A
V
 
A
Q
 
A
L
 
V
L
 
A
R
 
K
A
 
T
Q
 
F
G
 
G
C
 
A
R
 
K
-
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
V
I
 
V
D
 
D
F
 
I
D
 
F
P
 
D
A
 
N
K
 
K
L
 
L
A
 
K
M
 
M
A
 
A
R
 
K
S
 
D
M
 
I
G
 
G
A
 
A
E
 
A
V
 
T
V
 
H
D
 
T
L
 
F
S
 
N
A
 
S
G
 
K
Q
 
T
D
 
G
P
 
G
V
 
S
A
 
E
A
 
E
G
 
L
I
 
I
A
 
K
F
 
-
S
 
A
R
 
F
G
 
G
R
 
G
G
 
N
I
 
V
D
 
P
G
 
N
V
 
V
I
 
V
V
 
L
T
 
E
A
 
-
A
 
C
T
 
T
K
 
G
S
 
A
S
 
E
E
 
P
P
 
C
I
 
I
H
 
K
Q
 
L
A
 
G
A
 
V
K
 
D
M
 
A
S
 
I
R
 
A
K
 
P
R
 
G
G
 
G
R
 
R
I
 
F
V
 
V
L
 
Q
V
 
V
G
 
G
V
 
N
T
 
A
G
 
A
-
 
G
-
 
P
L
 
V
E
 
S
L
 
F
S
 
P
R
 
I
A
 
T
D
 
V
F
 
F
F
 
A
E
 
M
K
 
K
E
 
E
L
 
L
T
 
T
F
 
L
Q
 
F
V
 
G
S
 
S
C
 
F
S
 
R
Y
 
Y
G
 
G
-
 
F
-
 
N
-
 
D
-
 
Y
-
 
K
-
 
T
-
 
A
P
 
V
G
 
G
R
 
I
Y
 
F
D
 
D
P
 
T
N
 
N
Y
 
Y
E
 
Q
Q
 
N
G
 
G
G
 
R
N
 
E
D
 
N
Y
 
A
P
 
P
V
 
I
G
 
D
F
 
F
V
 
-
R
 
-
W
 
-
T
 
-
E
 
E
Q
 
Q
R
 
-
N
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
M
 
-
M
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
L
I
 
I
S
 
T
H
 
H
R
 
R
F
 
Y
A
 
K
I
 
F
D
 
K
D
 
D
A
 
A
E
 
I
G
 
E
A
 
A
Y
 
Y
G
 
D
L
 
L
I
 
V
S
 
R
G
 
A
G
 
G
E
 
K
P
 
G
S
 
A
L
 
V
G
 
K
V
 
C
L
 
L
L
 
I
D
 
D
Y
 
G
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Ga0059261_3126 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_3126
VKQVLQNLRSGKTSVVDVPVPQAGRGQLLIRTSHTLISAGTERMLVDFGKANWIDKARQQ
PDKARQVLDKIRTDGLKPTIEAVFNKLDQPLPMGYCNVGRVAEVGAGVTGYAVGDRVASN
GKHAEYALVPLNLSARVPDAVSDEEASFTVLGAIALQGIRLVQPTLGEAIVVSGLGLIGL
ITVQLLRAQGCRVLGIDFDPAKLAMARSMGAEVVDLSAGQDPVAAGIAFSRGRGIDGVIV
TAATKSSEPIHQAAKMSRKRGRIVLVGVTGLELSRADFFEKELTFQVSCSYGPGRYDPNY
EQGGNDYPVGFVRWTEQRNFEAVLDMMASGALDVKPLISHRFAIDDAEGAYGLISGGEPS
LGVLLDYPQDAEAARATTIALKDGAGPGVSGAPSVSFIGSGNYATGMLIPVFKKAGATLD
TIASKEGVTGVHAGRKFGFAATTTDSDSLLAGTSDAVVITTRHNSHGAMVAAALKAGKSV
FVEKPLCLTLAEQAEIETAYAAAGGAARLMVGYNRRFAPQVQKMKVLLAGVTGPKAFVMT
VNAGAIPAEHWTQNSEIGGGRIIGEACHFVDLLRFLAGAPLTGWSRIGMESATADTVSLS
LTFADGSIGTVHYFANGSKAFSKERLEVFAAGRILQLDNFRKLTGFGWPGFSTMKLSRQD
KGQAACAQAFLASLAGGPAPIPVDQIFEINRVCIDLANADTPGGENA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory