SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_3591 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_3591 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q9KNV2 3-dehydroquinate synthase; DHQS; EC 4.2.3.4 from Vibrio cholerae serotype O1 (strain ATCC 39315 / El Tor Inaba N16961)
47% identity, 96% coverage: 1:352/366 of query aligns to 1:346/361 of Q9KNV2

query
sites
Q9KNV2
M
 
M
R
 
E
T
 
R
V
 
I
P
 
T
V
 
V
A
 
N
L
 
L
G
 
G
A
 
E
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
E
 
P
V
 
I
R
 
S
I
 
I
E
 
G
S
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
F
G
 
A
R
 
N
A
 
P
A
 
A
E
 
-
Q
 
-
L
 
L
A
 
L
P
 
S
F
 
L
V
 
S
R
 
A
K
 
K
R
 
Q
P
 
K
F
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
D
x
N
A
 
H
N
 
T
V
 
V
A
 
A
P
 
P
-
 
L
H
 
Y
G
 
A
E
 
P
R
 
A
L
 
I
A
 
I
A
 
S
N
 
L
L
 
L
A
 
D
A
 
H
A
 
I
G
 
G
I
 
C
A
 
Q
S
 
H
E
 
A
T
 
L
I
 
L
I
 
E
L
 
L
P
 
P
P
x
D
G
|
G
E
|
E
G
x
Q
T
x
Y
K
|
K
S
 
T
W
 
L
T
 
E
Q
 
T
L
 
F
E
 
N
S
 
T
L
 
V
L
 
M
D
 
S
R
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
E
L
 
H
G
 
N
I
 
Y
E
 
S
R
 
R
G
 
D
D
 
V
H
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
|
G
V
|
V
I
|
I
G
|
G
D
|
D
L
 
L
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
A
A
 
A
I
 
C
L
 
Y
K
 
Q
R
 
R
G
 
G
C
 
V
N
 
D
F
 
F
V
 
I
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
T
|
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
A
 
S
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
S
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
G
K
|
K
T
 
T
A
 
A
I
 
V
N
 
N
A
 
H
R
 
P
A
 
L
G
 
G
K
|
K
N
|
N
L
 
M
V
 
I
G
 
G
A
 
A
F
 
F
H
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
S
 
K
V
 
A
V
 
V
L
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
T
D
 
D
L
x
C
L
|
L
D
x
T
T
|
T
L
 
L
P
 
P
L
 
A
R
 
R
E
 
E
Q
 
F
R
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
M
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
I
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
L
 
I
I
 
I
D
 
Y
D
 
D
A
 
S
D
 
A
F
 
F
F
 
F
A
 
D
W
 
W
C
 
L
E
 
E
G
 
A
N
 
Q
G
 
M
A
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
Y
A
 
A
G
 
L
D
 
D
P
 
E
N
 
Q
A
 
A
R
 
L
E
 
T
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
R
S
 
C
V
 
C
G
 
Q
A
 
I
K
 
K
A
 
A
R
 
E
I
 
V
V
 
V
A
 
A
D
 
Q
D
 
D
E
 
E
R
 
K
E
 
E
T
 
-
T
 
S
G
 
G
R
 
I
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
L
N
 
N
L
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
F
 
F
G
 
G
H
 
H
A
 
A
L
 
I
E
 
E
A
 
A
E
 
H
T
 
M
G
 
G
F
 
Y
S
 
G
D
 
N
Q
 
-
L
 
W
L
 
L
H
 
H
G
 
G
E
 
E
G
 
A
V
 
V
A
 
S
A
 
A
G
 
G
M
 
T
A
 
V
L
 
M
A
 
A
F
 
A
A
 
K
F
 
T
S
 
A
A
 
Q
R
 
L
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
C
 
I
P
 
D
A
 
A
T
 
S
D
 
Q
A
 
F
E
 
E
R
 
R
V
 
I
A
 
L
A
 
A
H
 
I
L
 
L
K
 
K
A
 
K
S
 
A
G
 
H
L
 
L
P
 
P
H
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
V
S
 
R
A
 
T
G
 
P
I
 
E
A
 
N
T
 
M
N
 
T
G
 
F
A
 
A
R
 
D
L
 
F
V
 
M
E
 
Q
H
 
H
M
 
M
L
 
M
H
 
R
D
 
D
K
 
K
K
 
K
M
 
V
D
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
E
L
 
L
P
 
R
F
 
L
L
 
V
L
 
L
T
 
P
R
 
T
G
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
T
T
 
S
Y
 
A
L
 
V
D
 
V
K
 
K
Q
 
G
V
 
V

3okfA 2.5 angstrom resolution crystal structure of 3-dehydroquinate synthase (arob) from vibrio cholerae
47% identity, 96% coverage: 1:352/366 of query aligns to 2:345/360 of 3okfA

query
sites
3okfA
M
 
M
R
 
E
T
 
R
V
 
I
P
 
T
V
 
V
A
 
N
L
 
L
G
 
G
A
 
E
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
E
 
P
V
 
I
R
 
S
I
 
I
E
 
G
S
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
F
G
 
A
R
 
N
A
 
P
A
 
A
E
 
-
Q
 
-
L
 
L
A
 
L
P
 
S
F
 
L
V
 
S
R
 
A
K
 
K
R
 
Q
P
 
K
F
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
D
x
N
A
 
H
N
 
T
V
 
V
A
 
A
P
 
P
-
x
L
H
 
Y
G
 
A
E
 
P
R
 
A
L
 
I
A
 
I
A
 
S
N
 
L
L
 
L
A
 
D
A
 
H
A
 
I
G
 
G
I
 
C
A
 
Q
S
 
H
E
 
A
T
 
L
I
 
L
I
 
E
L
 
L
P
 
P
P
x
D
G
 
G
E
|
E
G
 
Q
T
 
Y
K
|
K
S
 
T
W
 
L
T
 
E
Q
 
T
L
 
F
E
 
N
S
 
T
L
 
V
L
 
M
D
 
S
R
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
E
L
 
H
G
 
N
I
 
Y
E
 
S
R
 
R
G
 
D
D
 
V
H
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
V
|
V
I
 
I
G
 
G
D
|
D
L
 
L
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
A
A
 
A
I
 
C
L
 
Y
K
 
Q
R
|
R
G
 
G
C
 
V
N
 
D
F
 
F
V
 
I
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
T
|
T
T
|
T
L
 
L
L
|
L
A
 
S
Q
 
Q
V
 
V
D
|
D
S
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
G
K
|
K
T
 
T
A
 
A
I
 
V
N
 
N
A
 
H
R
 
P
A
 
L
G
 
G
K
 
K
N
 
N
L
 
M
V
 
I
G
 
G
A
 
A
F
 
F
H
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
S
 
K
V
 
A
V
 
V
L
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
T
D
 
D
L
 
C
L
 
L
D
 
T
T
|
T
L
|
L
P
 
P
L
 
A
R
 
R
E
|
E
Q
 
F
R
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
M
A
 
A
E
|
E
V
 
V
V
 
I
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
L
 
I
I
 
I
D
 
Y
D
 
D
A
 
S
D
 
A
F
 
F
F
 
F
A
 
D
W
 
W
C
 
L
E
 
E
G
 
A
N
 
Q
G
 
M
A
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
Y
A
 
A
G
 
L
D
 
D
P
 
E
N
 
Q
A
 
A
R
 
L
E
 
T
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
R
S
 
C
V
 
C
G
 
Q
A
 
I
K
|
K
A
 
A
R
 
E
I
 
V
V
 
V
A
 
A
D
 
Q
D
 
D
E
 
E
R
 
K
E
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
G
R
 
I
R
|
R
A
 
A
L
 
L
L
 
L
N
|
N
L
 
L
G
 
G
H
|
H
T
 
T
F
 
F
G
 
G
H
|
H
A
 
A
L
 
I
E
 
E
A
 
A
E
 
H
T
 
M
G
 
G
F
 
Y
S
 
G
D
 
N
Q
 
-
L
 
W
L
 
L
H
|
H
G
 
G
E
 
E
G
 
A
V
 
V
A
 
S
A
 
A
G
 
G
M
 
T
A
 
V
L
 
M
A
 
A
F
 
A
A
 
K
F
 
T
S
 
A
A
 
Q
R
 
L
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
C
 
I
P
 
D
A
 
A
T
 
S
D
 
Q
A
 
F
E
 
E
R
 
R
V
 
I
A
 
L
A
 
A
H
 
I
L
 
L
K
 
K
A
 
K
S
 
A
G
 
H
L
 
L
P
 
P
H
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
V
S
 
R
A
 
T
G
 
P
I
 
E
A
 
N
T
 
M
N
 
T
G
 
F
A
 
A
R
 
D
L
 
F
V
 
M
E
 
Q
H
 
H
M
 
M
L
 
M
H
 
R
D
 
D
K
 
K
K
 
K
M
 
V
D
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
E
L
 
L
P
 
R
F
 
L
L
 
V
L
 
L
T
 
P
R
 
T
G
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
T
T
 
S
Y
 
A
L
 
V
D
 
V
K
 
K
Q
 
G
V
 
V

U3KRF2 3-dehydroquinate synthase, chloroplastic; EC 4.2.3.4 from Actinidia chinensis var. chinensis (Chinese soft-hair kiwi) (see paper)
47% identity, 93% coverage: 4:342/366 of query aligns to 84:419/445 of U3KRF2

query
sites
U3KRF2
V
 
V
P
 
D
V
 
V
A
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
D
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
E
 
P
V
 
I
R
 
Y
I
 
I
E
 
G
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
D
R
 
Q
A
 
P
A
 
-
E
 
D
Q
 
L
L
 
L
A
 
Q
P
 
R
F
 
H
V
 
V
R
 
H
K
 
G
R
 
K
P
 
R
F
 
V
V
 
L
I
 
V
V
 
V
T
 
T
D
x
N
A
 
S
N
 
T
V
 
V
A
 
A
P
 
P
-
 
I
H
 
Y
G
 
L
E
 
D
R
 
K
L
 
V
A
 
V
A
 
G
N
 
A
L
 
L
A
 
T
A
 
N
A
 
G
G
 
N
-
 
P
-
 
N
I
 
V
A
 
S
S
 
V
E
 
E
T
 
S
I
 
V
I
 
I
L
 
L
P
 
P
P
x
D
G
|
G
E
|
E
G
 
K
T
 
Y
K
|
K
S
 
N
W
 
M
T
 
D
Q
 
T
L
 
L
E
 
M
S
 
K
L
 
V
L
 
F
D
 
D
R
 
K
L
 
A
L
 
I
D
 
E
L
 
S
G
 
R
I
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
R
D
 
C
H
 
T
V
 
F
I
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
V
|
V
I
|
I
G
|
G
D
|
D
L
 
M
V
 
C
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
S
 
A
A
 
A
I
 
S
L
 
F
K
 
L
R
 
R
G
 
G
C
 
V
N
 
N
F
 
F
V
 
I
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
T
|
T
T
|
T
L
 
V
L
 
M
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
S
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
G
K
|
K
T
 
T
A
 
G
I
 
I
N
 
N
A
 
H
R
 
R
A
 
L
G
 
G
K
|
K
N
 
N
L
 
L
V
 
I
G
 
G
A
 
A
F
 
F
H
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
S
 
Q
V
 
C
V
 
V
L
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
T
D
 
D
L
x
T
L
|
L
D
x
N
T
|
T
L
 
L
P
 
P
L
 
D
R
 
R
E
 
E
Q
 
L
R
 
A
A
 
S
G
 
G
Y
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
V
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
R
D
 
D
A
 
A
D
 
N
F
 
F
F
 
F
A
 
E
W
 
W
C
 
Q
E
 
E
G
 
K
N
 
N
G
 
M
A
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
M
A
 
A
G
 
R
D
 
D
P
 
P
N
 
S
A
 
A
R
 
L
E
 
A
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
A
 
K
H
 
R
S
 
S
V
 
C
G
 
E
A
 
N
K
|
K
A
 
A
R
 
E
I
 
V
V
 
V
A
 
S
D
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
K
E
 
E
T
 
-
T
 
S
G
 
G
R
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
T
L
 
L
N
 
N
L
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
F
 
F
G
 
G
H
 
H
A
 
A
L
 
I
E
 
E
A
 
T
E
 
G
T
 
F
G
 
G
F
 
Y
S
 
G
D
 
-
Q
 
Q
L
 
W
L
 
L
H
 
H
G
 
G
E
 
E
G
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
M
A
 
V
L
 
M
A
 
A
F
 
V
A
 
D
F
 
M
S
 
S
A
 
Y
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
L
 
W
C
 
I
P
 
D
A
 
E
T
 
S
D
 
I
A
 
V
E
 
N
R
 
R
V
 
A
A
 
H
A
 
N
H
 
I
L
 
L
K
 
Q
A
 
Q
S
 
A
G
 
K
L
 
L
P
 
P
H
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
T
A
 
A
G
 
P
I
 
P
A
 
E
T
 
T
N
 
M
G
 
T
A
 
V
R
 
E
L
 
M
V
 
F
E
 
K
H
 
S
M
 
V
L
 
M
H
 
A
-
 
V
D
 
D
K
 
K
K
 
K
M
 
V
D
 
A
A
 
D
G
 
G
T
 
L
L
 
L
P
 
R
F
 
L
L
 
I
L
 
L
T
 
L
R
 
K
G
 
G

3zokA Structure of 3-dehydroquinate synthase from actinidia chinensis in complex with NAD (see paper)
47% identity, 93% coverage: 4:342/366 of query aligns to 4:339/365 of 3zokA

query
sites
3zokA
V
 
V
P
 
D
V
 
V
A
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
D
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
E
 
P
V
 
I
R
 
Y
I
 
I
E
 
G
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
D
R
 
Q
A
 
P
A
 
-
E
 
D
Q
 
L
L
 
L
A
 
Q
P
 
R
F
 
H
V
 
V
R
 
H
K
 
G
R
 
K
P
 
R
F
 
V
V
 
L
I
 
V
V
 
V
T
 
T
D
 
N
A
 
S
N
x
T
V
|
V
A
 
A
P
 
P
-
 
I
H
 
Y
G
 
L
E
 
D
R
 
K
L
 
V
A
 
V
A
 
G
N
 
A
L
 
L
A
 
T
A
 
N
A
 
E
G
 
N
-
 
P
-
 
N
I
 
V
A
 
S
S
 
V
E
 
E
T
 
S
I
 
V
I
 
I
L
 
L
P
 
P
P
x
D
G
 
G
E
|
E
G
 
K
T
 
Y
K
|
K
S
 
N
W
 
M
T
 
D
Q
 
T
L
 
L
E
 
M
S
 
K
L
 
V
L
 
F
D
 
D
R
 
K
L
 
A
L
 
I
D
 
E
L
 
S
G
 
R
I
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
R
D
 
C
H
 
T
V
 
F
I
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
V
|
V
I
 
I
G
 
G
D
|
D
L
 
M
V
 
C
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
S
 
A
A
 
A
I
 
S
L
 
F
K
 
L
R
|
R
G
 
G
C
 
V
N
 
N
F
 
F
V
 
I
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
T
|
T
T
|
T
L
 
V
L
x
M
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
D
|
D
S
|
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
G
K
|
K
T
 
T
A
 
G
I
 
I
N
 
N
A
 
H
R
 
R
A
 
L
G
 
G
K
|
K
N
 
N
L
 
L
V
 
I
G
 
G
A
 
A
F
 
F
H
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
S
 
Q
V
 
C
V
 
V
L
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
T
D
 
D
L
 
T
L
 
L
D
 
N
T
|
T
L
|
L
P
 
P
L
 
D
R
 
R
E
|
E
Q
 
L
R
 
A
A
 
S
G
 
G
Y
 
L
A
 
A
E
|
E
V
 
V
V
 
V
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
R
D
 
D
A
 
A
D
 
N
F
 
F
F
 
F
A
 
E
W
 
W
C
 
Q
E
 
E
G
 
K
N
 
N
G
 
M
A
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
M
A
 
A
G
 
R
D
 
D
P
 
P
N
 
S
A
 
A
R
 
L
E
 
A
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
A
 
K
H
 
R
S
 
S
V
 
C
G
 
E
A
 
N
K
|
K
A
 
A
R
 
E
I
 
V
V
 
V
A
 
S
D
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
K
E
|
E
T
 
-
T
 
S
G
 
G
R
 
L
R
|
R
A
 
A
L
 
T
L
 
L
N
|
N
L
 
L
G
 
G
H
|
H
T
 
T
F
 
F
G
 
G
H
|
H
A
 
A
L
 
I
E
 
E
A
 
T
E
 
G
T
 
F
G
 
G
F
 
Y
S
 
G
D
 
-
Q
 
Q
L
 
W
L
 
L
H
|
H
G
 
G
E
 
E
G
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
M
A
 
V
L
 
M
A
 
A
F
 
V
A
 
D
F
 
M
S
 
S
A
 
Y
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
L
 
W
C
 
I
P
 
D
A
 
E
T
 
S
D
 
I
A
 
V
E
 
N
R
 
R
V
 
A
A
 
H
A
 
N
H
 
I
L
 
L
K
 
Q
A
 
Q
S
 
A
G
 
K
L
 
L
P
 
P
H
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
T
A
 
A
G
 
P
I
 
P
A
 
E
T
 
T
N
 
M
G
 
T
A
 
V
R
 
E
L
 
M
V
 
F
E
 
K
H
 
S
M
 
V
L
 
M
H
 
A
-
 
V
D
 
D
K
 
K
K
 
K
M
 
V
D
 
A
A
 
D
G
 
G
T
 
L
L
 
L
P
 
R
F
 
L
L
 
I
L
 
L
T
 
L
R
 
K
G
 
G

6llaB Crystal structure of providencia alcalifaciens 3-dehydroquinate synthase (dhqs) in complex with mg2+ and NAD (see paper)
44% identity, 98% coverage: 1:357/366 of query aligns to 2:354/363 of 6llaB

query
sites
6llaB
M
 
M
R
 
E
T
 
K
V
 
V
P
 
T
V
 
V
A
 
T
L
 
L
G
 
D
A
 
E
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
E
 
P
V
 
I
R
 
N
I
 
I
E
 
A
S
 
P
G
 
S
L
 
L
L
 
Y
G
 
-
R
 
Q
A
 
Q
A
 
Q
E
 
D
Q
 
A
L
 
F
A
 
W
P
 
P
F
 
L
V
 
T
R
 
A
K
 
G
R
 
Q
P
 
R
F
 
A
V
 
M
I
 
I
V
 
V
T
 
T
D
 
N
A
 
E
N
 
T
V
x
L
A
 
A
P
 
P
-
 
L
H
 
Y
G
 
L
E
 
H
R
 
K
L
 
I
A
 
Q
A
 
T
N
 
V
L
 
L
A
 
E
A
 
V
A
 
S
G
 
G
I
 
V
A
 
K
S
 
V
E
 
D
T
 
S
I
 
I
I
 
I
L
 
L
P
 
P
P
x
D
G
 
G
E
|
E
G
 
Q
T
 
Y
K
|
K
S
 
S
W
 
L
T
 
F
Q
 
I
L
 
M
E
 
N
S
 
D
L
 
V
L
 
F
D
 
T
R
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
E
L
 
K
G
 
H
I
 
H
E
 
N
R
 
R
G
 
D
D
 
T
H
 
T
V
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
V
|
V
I
 
I
G
 
G
D
|
D
L
 
L
V
 
T
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
A
A
 
A
I
 
S
L
 
Y
K
 
Q
R
|
R
G
 
G
C
 
V
N
 
R
F
 
F
V
 
I
Q
 
Q
I
 
V
P
 
P
T
|
T
T
|
T
L
 
L
L
|
L
A
 
S
Q
 
Q
V
 
V
D
|
D
S
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
G
K
|
K
T
 
T
A
 
A
I
 
V
N
 
N
A
 
H
R
 
P
A
 
L
G
 
G
K
 
K
N
 
N
L
 
M
V
 
I
G
 
G
A
 
A
F
 
F
H
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
S
 
A
V
 
S
V
 
V
L
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
L
D
 
D
L
 
C
L
 
L
D
 
K
T
|
T
L
|
L
P
 
P
L
 
K
R
 
R
E
|
E
Q
 
L
R
 
S
A
 
S
G
 
G
Y
 
L
A
 
A
E
|
E
V
 
V
V
 
I
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
L
 
I
I
 
I
D
 
L
D
 
D
A
 
G
D
 
E
F
 
F
F
 
F
A
 
S
W
 
W
C
 
L
E
 
E
G
 
E
N
 
N
G
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
M
A
 
A
G
 
L
D
 
D
P
 
N
N
 
Q
A
 
A
R
 
M
E
 
A
Y
 
Y
A
 
C
I
 
I
A
 
R
H
 
R
S
 
C
V
 
C
G
 
E
A
 
L
K
|
K
A
 
A
R
 
Q
I
 
V
V
 
V
A
 
A
D
 
A
D
 
D
E
 
E
R
 
K
E
|
E
T
 
T
T
 
S
G
 
G
R
 
L
R
|
R
A
 
A
L
 
L
L
 
L
N
|
N
L
 
L
G
 
G
H
|
H
T
 
T
F
 
F
G
 
G
H
|
H
A
 
A
L
 
I
E
 
E
A
 
A
E
 
E
T
 
M
G
 
G
F
 
Y
S
 
G
D
 
-
Q
 
V
L
 
W
L
 
L
H
|
H
G
 
G
E
 
E
G
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
M
A
 
V
L
 
M
A
 
A
F
 
A
A
 
K
F
 
T
S
 
A
A
 
E
R
 
L
Q
 
I
G
 
G
L
 
Q
C
 
F
P
 
T
A
 
P
T
 
E
D
 
Q
A
 
T
E
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
I
A
 
A
H
 
L
L
 
L
K
 
K
A
 
R
S
 
A
G
 
E
L
 
L
P
 
P
H
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
V
S
 
T
A
 
G
G
 
P
I
 
A
A
 
K
T
 
M
N
 
Q
G
 
P
A
 
D
R
 
D
L
 
Y
V
 
L
E
 
P
H
 
H
M
 
M
L
 
M
H
 
R
D
 
D
K
 
K
K
 
K
M
 
V
D
 
M
A
 
G
G
 
G
T
 
K
L
 
L
P
 
H
F
 
L
L
 
I
L
 
L
T
 
P
R
 
T
G
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
H
T
 
S
Y
 
E
L
 
M
D
 
R
K
 
S
Q
 
D
V
 
V
N
 
D
L
 
A
A
 
S
D
 
T
V
 
V

5eksA Structure of 3-dehydroquinate synthase from acinetobacter baumannii in complex with NAD
44% identity, 97% coverage: 1:354/366 of query aligns to 2:342/355 of 5eksA

query
sites
5eksA
M
 
M
R
 
Q
T
 
T
V
 
L
P
 
H
V
 
V
A
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
E
R
 
R
S
 
R
Y
 
Y
E
 
P
V
 
I
R
 
F
I
 
I
E
 
G
S
 
S
G
 
Q
L
 
L
L
 
-
G
 
-
R
 
D
A
 
P
A
 
K
E
 
Q
Q
 
L
L
 
L
A
 
E
P
 
P
F
 
Y
V
 
I
R
 
H
K
 
G
R
 
Q
P
 
Q
F
 
V
V
 
M
I
 
I
V
 
V
T
 
S
D
x
N
A
 
V
N
 
T
V
|
V
A
 
A
P
 
P
-
 
L
H
 
Y
G
 
L
E
 
S
R
 
H
L
 
Y
A
 
Q
A
 
E
N
 
A
L
 
L
A
 
E
A
 
S
A
 
L
G
 
G
I
 
K
A
 
T
S
 
V
E
 
A
T
 
T
I
 
C
I
 
I
L
 
L
P
 
P
P
x
D
G
 
G
E
|
E
G
 
K
T
 
Y
K
|
K
S
 
D
W
 
I
T
 
Q
Q
 
H
L
 
L
E
 
N
S
 
L
L
 
I
L
 
F
D
 
D
R
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
E
L
 
A
G
 
G
I
 
F
E
 
N
R
 
R
G
 
D
D
 
C
H
 
T
V
 
V
I
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
V
|
V
I
 
I
G
 
G
D
|
D
L
 
M
V
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
S
A
 
A
I
 
C
L
 
F
K
 
Q
R
|
R
G
 
G
C
 
V
N
 
Y
F
 
F
V
 
V
Q
 
Q
I
 
V
P
 
P
T
|
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
A
 
S
Q
 
Q
V
 
V
D
|
D
S
|
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
G
K
|
K
T
 
T
A
 
G
I
 
I
N
 
N
A
 
H
R
 
P
A
 
L
G
 
G
K
 
K
N
 
N
L
 
M
V
 
L
G
 
G
A
 
A
F
 
F
H
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
S
 
Q
V
 
V
V
 
V
L
 
L
I
 
A
D
 
D
P
 
M
D
 
A
L
 
Q
L
 
L
D
 
N
T
|
T
L
|
L
P
 
P
L
 
E
R
 
R
E
|
E
Q
 
L
R
 
S
A
 
A
G
 
G
Y
 
L
A
 
A
E
|
E
V
 
V
V
 
I
K
 
K
Y
 
Y
G
 
A
L
 
L
I
 
L
D
 
G
D
 
D
A
 
E
D
 
D
F
 
F
F
 
L
A
 
V
W
 
W
C
 
L
E
 
E
G
 
E
N
 
N
G
 
M
A
 
D
A
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
A
G
 
R
D
 
D
P
 
A
N
 
D
A
 
L
R
 
L
E
 
A
Y
 
E
A
 
A
I
 
V
A
 
Y
H
 
R
S
 
S
V
 
C
G
 
A
A
 
H
K
|
K
A
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
V
A
 
A
D
 
N
D
 
D
E
 
E
R
 
K
E
 
E
T
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
R
|
R
A
 
A
L
 
L
L
 
L
N
|
N
L
 
L
G
 
G
H
|
H
T
 
T
F
 
F
G
 
G
H
|
H
A
 
A
L
 
I
E
 
E
A
 
S
E
 
Y
T
 
L
G
 
G
F
 
Y
S
 
G
D
 
T
Q
 
-
L
 
W
L
 
L
H
|
H
G
 
G
E
 
E
G
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
T
G
 
G
M
 
M
A
 
V
L
 
M
A
 
A
F
 
A
A
 
D
F
 
L
S
 
S
A
 
Q
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
L
 
W
C
 
I
P
 
S
A
 
N
T
 
E
D
 
D
A
 
V
E
 
A
R
 
R
V
 
T
A
 
K
A
 
K
H
 
I
L
 
I
K
 
Q
A
 
R
S
 
A
G
 
N
L
 
L
P
 
P
H
 
-
D
 
-
L
 
I
A
 
S
S
 
C
A
 
P
G
 
Q
I
 
I
A
 
P
T
 
L
N
 
D
G
 
D
A
 
-
R
 
-
L
 
F
V
 
L
E
 
G
H
 
Y
M
 
M
L
 
A
H
 
H
D
 
D
K
 
K
K
 
K
M
 
V
D
 
Q
A
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
L
P
 
R
F
 
L
L
 
V
L
 
L
T
 
L
R
 
K
G
 
Q
I
 
L
G
 
G
A
 
Q
T
 
A
Y
 
V
L
 
I
D
 
T
K
 
K
Q
 
D
V
 
F
N
 
D
L
 
V

6lk2A Crystal structure of providencia alcalifaciens 3-dehydroquinate synthase (dhqs) in complex with mg2+, NAD and chlorogenic acid (see paper)
44% identity, 98% coverage: 1:357/366 of query aligns to 2:350/357 of 6lk2A

query
sites
6lk2A
M
 
M
R
 
E
T
 
K
V
 
V
P
 
T
V
 
V
A
 
T
L
 
L
G
 
D
A
 
E
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
E
 
P
V
 
I
R
 
N
I
 
I
E
 
A
S
 
P
G
 
S
L
 
L
L
 
Y
G
 
-
R
 
Q
A
 
Q
A
 
Q
E
 
D
Q
 
A
L
 
F
A
 
W
P
 
P
F
 
L
V
 
T
R
 
A
K
 
G
R
 
Q
P
 
R
F
 
A
V
 
M
I
 
I
V
 
V
T
 
T
D
 
N
A
 
E
N
 
T
V
x
L
A
 
A
P
 
P
-
 
L
H
 
Y
G
 
L
E
 
H
R
 
K
L
 
I
A
 
Q
A
 
T
N
 
V
L
 
L
A
 
E
A
 
V
A
 
S
G
 
G
I
 
V
A
 
K
S
 
V
E
 
D
T
 
S
I
 
I
I
 
I
L
 
L
P
 
P
P
x
D
G
 
G
E
|
E
G
 
Q
T
 
Y
K
|
K
S
 
S
W
 
L
T
 
F
Q
 
I
L
 
M
E
 
N
S
 
D
L
 
V
L
 
F
D
 
T
R
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
E
L
 
K
G
 
H
I
 
H
E
 
N
R
 
R
G
 
D
D
 
T
H
 
T
V
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
V
|
V
I
 
I
G
 
G
D
|
D
L
 
L
V
 
T
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
A
A
 
A
I
 
S
L
 
Y
K
 
Q
R
|
R
G
 
G
C
 
V
N
 
R
F
 
F
V
 
I
Q
 
Q
I
 
V
P
 
P
T
|
T
T
|
T
L
 
L
L
|
L
A
 
S
Q
 
Q
V
 
V
D
|
D
S
|
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
G
K
|
K
T
 
T
A
 
A
I
 
V
N
 
N
A
 
H
R
 
P
A
 
L
G
 
G
K
 
K
N
 
N
L
 
M
V
 
I
G
 
G
A
 
A
F
 
F
H
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
S
 
A
V
 
S
V
 
V
L
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
L
D
 
D
L
x
C
L
 
L
D
 
K
T
|
T
L
|
L
P
|
P
L
 
K
R
 
R
E
|
E
Q
 
L
R
 
S
A
 
S
G
 
G
Y
 
L
A
 
A
E
|
E
V
 
V
V
 
I
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
L
 
I
I
 
I
D
 
L
D
 
D
A
 
G
D
 
E
F
 
F
F
 
F
A
 
S
W
 
W
C
 
L
E
 
E
G
 
E
N
 
N
G
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
M
A
 
A
G
 
L
D
 
D
P
 
N
N
 
Q
A
 
A
R
 
M
E
 
A
Y
 
Y
A
 
C
I
 
I
A
 
R
H
 
R
S
 
C
V
 
C
G
 
E
A
 
L
K
|
K
A
 
A
R
 
Q
I
 
V
V
 
V
A
 
A
D
 
A
D
 
D
E
 
E
R
 
-
E
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
G
R
 
L
R
|
R
A
 
A
L
 
L
L
 
L
N
|
N
L
 
L
G
 
G
H
|
H
T
|
T
F
 
F
G
 
G
H
|
H
A
 
A
L
 
I
E
 
E
A
 
A
E
 
E
T
 
M
G
 
G
F
 
Y
S
 
G
D
 
-
Q
 
V
L
 
W
L
 
L
H
|
H
G
 
G
E
 
E
G
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
M
A
 
V
L
 
M
A
 
A
F
 
A
A
 
K
F
 
T
S
 
A
A
 
E
R
 
L
Q
 
I
G
 
G
L
 
Q
C
 
F
P
 
T
A
 
P
T
 
E
D
 
Q
A
 
T
E
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
I
A
 
A
H
 
L
L
 
L
K
 
K
A
 
R
S
 
A
G
 
E
L
 
L
P
 
P
H
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
V
S
 
T
A
 
G
G
 
P
I
 
A
A
 
K
T
 
M
N
 
Q
G
 
P
A
 
D
R
 
D
L
 
Y
V
 
L
E
 
P
H
 
H
M
 
M
L
 
M
H
 
R
D
 
D
K
 
K
K
 
K
M
 
V
D
 
M
A
 
G
G
 
G
T
 
K
L
 
L
P
 
H
F
 
L
L
 
I
L
 
L
T
 
P
R
 
T
G
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
H
T
 
S
Y
 
E
L
 
M
D
 
R
K
 
S
Q
 
D
V
 
V
N
 
D
L
 
A
A
 
S
D
 
T
V
 
V

Q5NFS1 3-dehydroquinate synthase; DHQS; EC 4.2.3.4 from Francisella tularensis subsp. tularensis (strain SCHU S4 / Schu 4)
42% identity, 96% coverage: 12:362/366 of query aligns to 14:356/359 of Q5NFS1

query
sites
Q5NFS1
S
 
S
Y
 
Y
E
 
N
V
 
I
R
 
I
I
 
V
E
 
D
S
 
S
G
 
V
L
 
L
L
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
D
A
 
F
E
 
S
Q
 
H
L
 
I
A
 
L
P
 
E
F
 
Y
V
 
V
R
 
T
K
 
N
R
 
K
P
 
Q
F
 
V
V
 
L
I
 
V
V
 
V
T
 
T
D
x
N
A
 
T
N
 
T
V
 
V
A
 
A
P
 
K
H
 
L
G
 
-
E
 
-
R
 
Y
L
 
L
A
 
T
A
 
K
N
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
L
-
 
V
-
 
D
G
 
D
I
 
L
A
 
D
S
 
V
E
 
R
T
 
T
I
 
C
I
 
I
L
 
L
P
 
E
P
x
D
G
|
G
E
|
E
G
x
Q
T
x
Y
K
|
K
S
 
S
W
 
Q
T
 
Q
Q
 
S
L
 
L
E
 
D
S
 
K
L
 
I
L
 
L
D
 
S
R
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
E
L
 
N
G
 
H
I
 
F
E
 
T
R
 
R
G
 
N
D
 
S
H
 
T
V
 
V
-
 
L
I
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
|
G
V
|
V
I
|
I
G
|
G
D
|
D
L
 
I
V
 
T
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
A
A
 
A
I
 
I
L
 
Y
K
 
Q
R
 
R
G
 
G
C
 
I
N
 
D
F
 
F
V
 
I
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
T
|
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
A
 
S
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
S
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
G
K
|
K
T
 
T
A
 
A
I
 
I
N
 
N
A
 
H
R
 
Q
A
 
L
G
 
G
K
 
K
N
 
N
L
 
M
V
 
I
G
 
G
A
 
A
F
 
F
H
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
S
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
Y
I
 
T
D
 
S
P
 
I
D
 
E
L
x
F
L
x
Y
D
x
K
T
|
T
L
 
L
P
 
P
L
 
Q
R
 
R
E
 
E
Q
 
Y
R
 
I
A
 
A
G
 
G
Y
 
M
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
V
K
 
K
Y
 
Y
G
 
A
L
 
F
I
 
I
D
 
-
D
 
S
A
 
K
D
 
D
F
 
F
F
 
Y
A
 
L
W
 
W
C
 
L
E
 
D
G
 
S
N
 
N
G
 
R
A
 
D
A
 
K
L
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
K
D
 
D
P
 
S
N
 
V
A
 
T
R
 
L
E
 
I
Y
 
E
A
 
M
I
 
V
A
 
K
H
 
R
S
 
S
V
 
C
G
 
Q
A
 
I
K
 
K
A
 
A
R
 
Q
I
 
V
V
 
V
A
 
A
D
 
M
D
 
D
E
 
E
R
 
K
E
 
E
T
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
L
 
L
N
 
N
L
 
F
G
 
G
H
 
H
T
 
T
F
 
F
G
 
G
H
 
H
A
 
A
L
 
I
E
 
E
A
 
K
E
 
C
T
 
Q
G
 
N
F
 
Y
S
 
R
D
 
G
Q
 
-
L
 
L
L
 
K
H
 
H
G
 
G
E
 
E
G
 
A
V
 
V
A
 
G
A
 
V
G
 
G
M
 
M
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
F
 
I
A
 
D
F
 
F
S
 
S
A
 
H
R
 
Y
Q
 
L
G
 
G
L
 
L
C
 
I
P
 
S
A
 
Q
T
 
Q
D
 
Q
A
 
A
E
 
K
R
 
D
V
 
F
A
 
N
A
 
D
H
 
F
L
 
I
K
 
V
A
 
S
S
 
F
G
 
G
L
 
I
-
 
S
-
 
I
-
 
D
-
 
F
P
 
P
H
 
N
D
 
D
L
 
I
A
 
C
S
 
Q
A
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
T
 
-
N
 
-
G
 
-
A
 
K
R
 
E
L
 
F
V
 
L
E
 
E
H
 
A
M
 
M
L
 
L
H
 
L
D
 
D
K
 
K
K
 
K
M
 
N
D
 
S
A
 
N
G
 
K
T
 
E
L
 
L
P
 
K
F
 
F
L
 
I
L
 
L
T
 
I
R
 
E
G
 
N
I
 
I
G
 
G
A
 
S
T
 
L
Y
 
S
L
 
L
D
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
V
 
-
N
 
S
L
 
K
A
 
N
D
 
E
V
 
L
E
 
E
T
 
Q
F
 
F
L
 
L
D
 
D

5hvnA 3.0 angstrom crystal structure of 3-dehydroquinate synthase (arob) from francisella tularensis in complex with NAD.
41% identity, 96% coverage: 12:362/366 of query aligns to 17:351/354 of 5hvnA

query
sites
5hvnA
S
 
S
Y
 
Y
E
 
N
V
 
I
R
 
I
I
 
V
E
 
D
S
 
S
G
 
V
L
 
L
L
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
D
A
 
F
E
 
S
Q
 
H
L
 
I
A
 
L
P
 
E
F
 
Y
V
 
V
R
 
T
K
 
N
R
 
K
P
 
Q
F
 
V
V
 
L
I
 
V
V
 
V
T
 
T
D
x
N
A
 
T
N
 
T
V
 
V
A
 
A
P
 
K
H
x
L
G
 
-
E
 
-
R
 
Y
L
 
L
A
 
T
A
 
K
N
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
L
-
 
V
-
 
D
G
 
D
I
 
L
A
 
D
S
 
V
E
 
R
T
 
T
I
 
C
I
 
I
L
 
L
P
 
E
P
x
D
G
 
G
E
|
E
G
 
Q
T
 
Y
K
|
K
S
 
S
W
 
Q
T
 
Q
Q
 
S
L
 
L
E
 
D
S
 
K
L
 
I
L
 
L
D
 
S
R
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
E
L
 
N
G
 
H
I
 
F
E
 
T
R
 
R
G
 
N
D
 
S
H
 
T
V
 
V
-
 
L
I
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
V
|
V
I
 
I
G
 
G
D
|
D
L
 
I
V
 
T
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
A
A
 
A
I
 
I
L
 
Y
K
 
Q
R
|
R
G
 
G
C
 
I
N
 
D
F
 
F
V
 
I
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
T
|
T
T
|
T
L
 
L
L
|
L
A
 
S
Q
 
Q
V
 
V
D
|
D
S
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
G
K
|
K
T
 
T
A
 
A
I
 
I
N
 
N
A
 
H
R
 
Q
A
 
L
G
 
G
K
 
K
N
 
N
L
 
M
V
 
I
G
 
G
A
 
A
F
 
F
H
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
S
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
Y
I
 
T
D
 
S
P
 
I
D
 
E
L
x
F
L
 
Y
D
 
K
T
|
T
L
|
L
P
 
P
L
 
Q
R
 
R
E
|
E
Q
 
Y
R
 
I
A
 
A
G
 
G
Y
 
M
A
 
A
E
|
E
V
 
V
V
 
V
K
 
K
Y
 
Y
G
 
A
L
 
F
I
 
I
D
 
-
D
 
S
A
 
K
D
 
D
F
 
F
F
 
Y
A
 
L
W
 
W
C
 
L
E
 
D
G
 
S
N
 
N
G
 
R
A
 
D
A
 
K
L
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
K
D
 
D
P
 
S
N
 
V
A
 
T
R
 
L
E
 
I
Y
 
E
A
 
M
I
 
V
A
 
K
H
 
R
S
 
S
V
 
C
G
 
Q
A
 
I
K
|
K
A
 
A
R
 
Q
I
 
V
V
 
V
A
 
A
D
 
M
D
 
D
E
 
-
R
 
-
E
 
-
T
 
-
T
 
T
G
 
G
R
 
A
R
|
R
A
 
A
L
 
I
L
 
L
N
|
N
L
 
F
G
 
G
H
|
H
T
 
T
F
 
F
G
 
G
H
|
H
A
 
A
L
 
I
E
 
E
A
 
K
E
 
C
T
 
Q
G
 
N
F
 
Y
S
 
R
D
 
G
Q
 
-
L
 
L
L
 
K
H
|
H
G
 
G
E
 
E
G
 
A
V
 
V
A
 
G
A
 
V
G
 
G
M
 
M
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
F
 
I
A
 
D
F
 
F
S
 
S
A
 
H
R
 
Y
Q
 
L
G
 
G
L
 
L
C
 
I
P
 
S
A
 
Q
T
 
Q
D
 
Q
A
 
A
E
 
K
R
 
D
V
 
F
A
 
N
A
 
D
H
 
F
L
 
I
K
 
V
A
 
S
S
 
F
G
 
G
L
 
I
-
 
S
-
 
I
-
 
D
-
 
F
P
 
P
H
 
N
D
 
D
L
 
I
A
 
C
S
 
Q
A
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
T
 
-
N
 
-
G
 
-
A
 
K
R
 
E
L
 
F
V
 
L
E
 
E
H
 
A
M
 
M
L
 
L
H
 
L
D
 
D
K
 
N
K
 
K
M
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
E
L
 
L
P
 
K
F
 
F
L
 
I
L
 
L
T
 
I
R
 
E
G
 
N
I
 
I
G
 
G
A
 
S
T
 
L
Y
 
S
L
 
L
D
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
V
 
-
N
 
S
L
 
K
A
 
N
D
 
E
V
 
L
E
 
E
T
 
Q
F
 
F
L
 
L
D
 
D

P56081 3-dehydroquinate synthase; DHQS; EC 4.2.3.4 from Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) (Campylobacter pylori) (see paper)
38% identity, 94% coverage: 1:345/366 of query aligns to 1:323/343 of P56081

query
sites
P56081
M
 
M
R
 
Q
T
 
E
V
 
I
P
 
L
V
 
I
A
 
P
L
 
L
G
 
K
A
 
E
R
 
K
S
 
N
Y
 
Y
E
 
K
V
 
V
R
 
-
I
 
-
E
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
F
L
 
L
G
 
G
R
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
E
L
 
L
A
 
P
P
 
E
F
 
I
V
 
K
R
 
L
K
 
K
R
 
Q
P
 
K
F
 
A
V
 
L
I
 
I
V
 
I
T
 
S
D
 
D
A
 
S
N
 
I
V
 
V
A
 
A
-
 
G
P
 
L
H
 
H
G
 
L
E
 
P
R
 
Y
L
 
L
A
 
L
A
 
E
N
 
R
L
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
E
I
 
V
A
 
-
S
 
-
E
 
R
T
 
V
I
 
C
I
 
V
L
 
I
P
 
E
P
x
S
G
|
G
E
|
E
G
x
K
T
x
Y
K
|
K
S
 
N
W
 
F
T
 
H
Q
 
S
L
 
L
E
 
E
S
 
R
L
 
I
L
 
L
D
 
N
R
 
N
L
 
A
L
 
F
D
 
E
L
 
M
G
 
Q
I
 
L
E
 
N
R
 
R
G
 
H
D
 
S
H
 
L
V
 
M
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
|
G
V
|
V
I
 
I
G
 
S
D
 
D
L
 
M
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
S
A
 
S
I
 
I
L
 
Y
K
 
F
R
 
R
G
 
G
C
 
I
N
 
D
F
 
F
V
 
I
Q
 
N
I
 
I
P
 
P
T
|
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
S
 
A
S
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
G
I
 
I
N
 
N
A
 
T
R
 
P
A
 
Y
G
 
G
K
 
K
N
|
N
L
 
L
V
 
I
G
 
G
A
 
S
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
P
 
P
S
 
K
V
 
A
V
 
V
L
 
Y
I
 
M
D
 
D
P
 
L
D
 
A
L
x
F
L
|
L
D
x
K
T
|
T
L
 
L
P
 
E
L
 
K
R
 
R
E
 
E
Q
 
F
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
Y
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
I
V
 
I
K
 
K
Y
 
M
G
 
A
L
 
V
I
 
C
D
 
F
D
 
D
A
 
K
D
 
N
F
 
L
F
 
V
A
 
E
W
 
R
C
 
L
E
 
E
G
 
T
N
 
K
G
 
D
A
 
L
A
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
K
N
 
D
A
 
C
R
 
L
E
 
E
Y
 
E
A
 
V
I
 
I
A
 
F
H
 
Q
S
 
S
V
 
V
G
 
N
A
 
I
K
 
K
A
 
A
R
 
Q
I
 
V
V
 
V
A
 
V
D
 
Q
D
 
D
E
 
E
R
 
K
E
 
E
T
 
-
T
 
Q
G
 
N
R
 
I
R
 
R
A
 
A
L
 
G
L
 
L
N
 
N
L
 
Y
G
 
G
H
 
H
T
 
T
F
 
F
G
 
G
H
 
H
A
 
A
L
 
I
E
 
E
A
 
K
E
 
E
T
 
T
G
 
D
F
 
Y
S
 
-
D
 
E
Q
 
R
L
 
F
L
 
L
H
 
H
G
 
G
E
 
E
G
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
I
G
 
G
M
 
M
A
 
R
L
 
M
A
 
A
F
 
N
A
 
D
F
 
L
S
 
A
A
 
L
R
 
S
Q
 
L
G
 
G
L
 
M
C
 
L
P
 
T
A
 
L
T
 
K
D
 
E
A
 
Y
E
 
E
R
 
R
V
 
I
A
 
E
A
 
N
H
 
L
L
 
L
K
 
K
A
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
K
H
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
I
S
 
F
A
 
H
G
 
Y
I
 
K
A
 
I
T
 
L
N
 
D
G
 
L
A
 
Q
R
 
K
L
 
F
V
 
Y
E
 
E
H
 
R
M
 
L
L
 
F
H
 
L
D
 
D
K
 
K
K
 
K
M
 
S
D
 
E
A
 
N
G
 
K
T
 
T
L
 
I
P
 
K
F
 
F
L
 
I
L
 
L
T
 
P
R
 
K
G
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
A

6hqvA Pentafunctional arom complex from chaetomium thermophilum (see paper)
39% identity, 87% coverage: 38:356/366 of query aligns to 37:376/1555 of 6hqvA

query
sites
6hqvA
F
 
Y
V
 
V
I
 
L
V
 
I
T
 
T
D
|
D
A
 
T
N
|
N
V
x
L
-
 
Y
-
 
T
-
 
T
-
 
Y
A
 
V
P
 
P
H
 
P
G
 
F
E
 
Q
R
 
A
L
 
V
A
 
F
A
 
E
N
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
P
A
 
R
G
 
D
I
 
V
A
 
R
S
 
L
E
 
L
T
 
T
I
 
Y
I
 
A
L
 
I
P
 
P
P
 
P
G
 
G
E
|
E
G
 
Y
T
 
S
K
|
K
S
 
S
W
 
R
T
 
E
Q
 
T
L
 
K
E
 
A
S
 
E
L
 
I
L
 
E
D
 
D
R
 
W
L
 
M
L
 
L
D
 
S
L
 
H
G
 
A
I
 
C
E
 
T
R
 
R
G
 
D
D
 
T
H
 
V
V
 
I
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
V
|
V
I
 
I
G
 
G
D
|
D
L
 
M
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
A
 
V
S
 
A
A
 
A
I
 
T
L
 
F
K
 
M
R
|
R
G
 
G
C
 
V
N
 
R
F
 
F
V
 
V
Q
 
Q
I
 
V
P
 
P
T
|
T
T
|
T
L
 
L
L
|
L
A
 
A
Q
 
M
V
 
V
D
|
D
S
|
S
S
 
S
V
 
I
G
 
G
G
 
G
K
|
K
T
 
T
A
 
A
I
 
I
N
 
D
A
 
T
R
 
P
A
 
M
G
 
G
K
|
K
N
 
N
L
 
L
V
 
I
G
 
G
A
 
A
F
 
F
H
 
W
Q
 
Q
P
 
P
S
 
R
V
 
R
V
 
I
L
 
Y
I
 
I
D
 
D
P
 
L
D
 
A
L
 
F
L
 
L
D
 
E
T
|
T
L
|
L
P
|
P
L
 
V
R
 
R
E
|
E
Q
 
F
R
 
I
A
 
N
G
 
G
Y
 
M
A
 
A
E
|
E
V
 
V
V
 
I
K
 
K
Y
 
T
G
 
A
L
 
A
I
 
I
D
 
W
D
 
N
A
 
E
D
 
T
F
 
E
F
 
F
A
 
T
W
 
A
C
 
L
E
 
E
G
 
E
N
 
N
G
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
I
L
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
R
-
 
S
-
 
K
A
 
A
G
 
S
D
 
S
P
 
P
N
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
L
Y
 
A
A
 
P
I
 
I
A
 
R
H
 
H
-
 
I
-
 
L
-
 
K
-
 
R
-
 
I
-
 
V
-
 
L
-
 
G
S
 
S
V
 
A
G
 
R
A
 
V
K
|
K
A
 
A
R
 
E
I
 
V
V
 
V
A
 
S
D
 
A
D
 
D
E
 
E
R
 
R
E
|
E
T
 
-
T
 
G
G
 
G
R
 
L
R
|
R
A
 
N
L
 
L
L
 
L
N
|
N
L
 
F
G
 
G
H
|
H
T
 
S
F
 
I
G
 
G
H
|
H
A
 
A
L
 
Y
E
 
E
A
 
A
E
 
I
T
 
-
G
 
-
F
 
L
S
 
A
D
 
P
Q
 
Q
L
 
V
L
 
L
H
|
H
G
 
G
E
 
E
G
 
C
V
 
V
A
 
A
A
 
I
G
 
G
M
 
M
A
 
V
L
 
K
A
 
E
F
 
A
A
 
E
F
 
L
S
 
A
A
 
R
R
 
Y
Q
 
L
G
 
G
L
 
V
C
 
L
P
 
R
A
 
P
T
 
S
D
 
A
A
 
V
E
 
A
R
 
R
V
 
L
A
 
T
A
 
K
H
 
L
L
 
I
K
 
A
A
 
S
S
 
Y
G
 
D
L
 
L
P
 
P
-
 
T
-
 
S
-
 
V
H
 
H
D
 
D
L
 
K
A
 
R
-
 
I
-
 
A
-
 
K
-
 
L
S
 
S
A
 
A
G
 
G
I
 
K
A
 
E
T
 
C
N
 
P
G
 
V
A
 
D
R
 
V
L
 
L
V
 
L
E
 
Q
H
 
K
M
 
M
L
 
A
H
 
V
D
 
D
K
 
K
K
 
K
M
 
N
D
 
E
A
 
G
G
 
R
T
 
K
L
 
K
P
 
K
F
 
I
L
 
V
L
 
L
T
 
L
R
 
S
G
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
K
T
 
T
Y
 
Y
L
 
-
D
 
E
K
 
K
Q
 
K
V
 
A
N
 
T
L
 
V
A
 
V
D
 
D

Sites not aligning to the query:

1dqsA Crystal structure of dehydroquinate synthase (dhqs) complexed with carbaphosphonate, NAD+ and zn2+ (see paper)
39% identity, 85% coverage: 38:347/366 of query aligns to 36:365/381 of 1dqsA

query
sites
1dqsA
F
 
Y
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
D
|
D
A
 
T
N
|
N
V
x
I
-
 
G
-
 
S
-
 
I
-
 
Y
A
 
T
P
 
P
H
 
S
G
 
F
E
 
E
R
 
E
L
 
A
A
 
F
A
 
R
N
 
K
L
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
E
G
 
I
I
 
T
A
 
P
S
 
S
E
 
P
T
 
R
I
 
L
I
 
L
L
 
I
-
 
Y
-
 
N
-
 
R
P
 
P
P
 
P
G
 
G
E
|
E
G
 
V
T
 
S
K
|
K
S
 
S
W
 
R
T
 
Q
Q
 
T
L
 
K
E
 
A
S
 
D
L
 
I
L
 
E
D
 
D
R
 
W
L
 
M
L
 
L
D
 
S
L
 
Q
G
 
N
-
 
P
-
 
P
I
 
C
E
 
G
R
 
R
G
 
D
D
 
T
H
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
V
|
V
I
 
I
G
 
G
D
|
D
L
 
L
V
 
T
G
 
G
F
 
F
A
 
V
S
 
A
A
 
S
I
 
T
L
 
Y
K
 
M
R
|
R
G
 
G
C
 
V
N
 
R
F
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
I
 
V
P
 
P
T
|
T
T
|
T
L
 
L
L
|
L
A
 
A
Q
 
M
V
 
V
D
|
D
S
|
S
S
 
S
V
 
I
G
 
G
G
 
G
K
|
K
T
 
T
A
 
A
I
 
I
N
 
D
A
 
T
R
 
P
A
 
L
G
 
G
K
|
K
N
|
N
L
 
L
V
 
I
G
 
G
A
 
A
F
 
I
H
 
W
Q
 
Q
P
 
P
S
 
T
V
 
K
V
 
I
L
 
Y
I
 
I
D
 
D
P
 
L
D
 
E
L
 
F
L
 
L
D
 
E
T
|
T
L
 
L
P
|
P
L
 
V
R
 
R
E
|
E
Q
 
F
R
 
I
A
 
N
G
 
G
Y
 
M
A
 
A
E
|
E
V
 
V
V
 
I
K
 
K
Y
 
T
G
 
A
L
 
A
I
 
I
D
 
S
D
 
S
A
 
E
D
 
E
F
 
E
F
 
F
A
 
T
W
 
A
C
 
L
E
 
E
G
 
E
N
 
N
G
 
A
A
 
E
A
 
T
L
 
I
L
 
L
A
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
R
-
 
F
-
 
E
G
 
G
D
 
T
P
 
E
N
 
E
A
 
I
R
 
L
E
 
K
Y
 
A
A
 
R
I
 
I
A
 
L
H
 
A
S
 
S
V
 
A
G
 
R
A
 
H
K
|
K
A
 
A
R
 
Y
I
 
V
V
 
V
A
 
S
D
 
A
D
 
D
E
 
E
R
 
R
E
|
E
T
 
-
T
 
G
G
 
G
R
 
L
R
|
R
A
 
N
L
 
L
L
|
L
N
|
N
L
 
W
G
 
G
H
|
H
T
 
S
F
 
I
G
 
G
H
|
H
A
 
A
L
 
I
E
 
E
A
 
A
E
 
I
T
 
-
G
 
-
F
 
L
S
 
T
D
 
P
Q
 
Q
L
 
I
L
 
L
H
|
H
G
 
G
E
 
E
G
 
C
V
 
V
A
 
A
A
 
I
G
 
G
M
 
M
A
 
V
L
 
K
A
 
E
F
 
A
A
 
E
F
 
L
S
 
A
A
 
R
R
 
H
Q
 
L
G
 
G
L
 
I
C
 
L
P
 
K
A
 
G
T
 
V
D
 
A
A
 
V
E
 
S
R
 
R
V
 
I
A
 
V
A
 
K
H
 
C
L
 
L
K
 
A
A
 
A
S
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
H
 
T
D
 
S
L
 
L
A
 
K
S
 
D
A
 
A
G
 
R
I
 
I
A
 
R
T
 
K
N
 
L
G
 
T
A
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
H
-
 
C
-
 
S
-
 
V
-
 
D
R
 
Q
L
 
L
V
 
M
E
 
F
H
 
N
M<