SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_3619 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_3619 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8a9vA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complex with a linear di-adenosine derivative (see paper)
27% identity, 82% coverage: 24:234/257 of query aligns to 24:239/261 of 8a9vA

query
sites
8a9vA
L
 
F
A
 
G
A
 
E
H
 
Y
D
 
D
W
 
M
V
 
E
H
 
Y
P
 
D
D
 
D
-
 
V
E
 
E
A
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
V
V
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
 
G
F
 
T
M
 
F
L
|
L
Q
 
S
T
 
A
L
 
F
H
 
H
M
 
Q
L
 
Y
L
 
E
E
 
E
K
 
R
H
 
L
R
 
D
N
 
E
L
 
I
P
 
A
V
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
I
N
 
H
L
 
T
G
 
G
T
 
H
I
x
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
M
 
A
N
 
D
E
 
-
W
 
W
R
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
A
D
 
D
G
 
K
L
 
L
D
 
V
A
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
G
R
 
E
P
 
Y
F
 
Q
R
 
K
V
 
V
T
 
S
P
 
Y
L
 
P
V
 
L
M
 
L
T
 
K
A
 
T
T
 
T
T
 
V
V
 
K
E
 
Y
G
 
G
D
 
K
T
 
E
H
 
A
V
 
T
L
 
Y
P
 
L
A
 
A
I
 
L
N
|
N
E
|
E
V
 
-
S
 
S
L
 
T
L
 
V
R
 
K
E
 
S
T
 
S
R
 
G
Q
 
G
T
 
P
A
 
F
K
 
V
L
 
V
E
 
D
V
 
V
T
 
V
V
 
I
N
 
N
D
 
D
R
 
-
I
 
I
V
 
H
L
 
F
P
 
E
E
 
R
L
 
F
V
 
R
C
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
A
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
N
 
N
L
 
K
S
|
S
A
 
L
H
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
L
 
M
P
 
H
L
 
P
G
 
S
S
 
I
Q
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
Q
L
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
S
 
A
P
 
S
F
 
I
R
 
N
P
 
N
R
 
R
R
 
V
W
 
Y
R
 
R
-
 
T
-
 
I
G
 
G
A
 
S
-
 
P
-
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
K
K
 
H
T
 
H
R
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
L
 
V
D
 
N
P
 
D
G
 
K
K
 
D
R
 
F
P
 
Q
V
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
D
A
x
H
D
 
L
Q
 
S
R
 
I
E
 
L
V
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
Q
R
 
E
V
 
I
D
 
R
I
 
Y
E
 
E
I
 
V
D
 
S
P
 
A
K
 
K
R
 
K

7zzjA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complex with a linear di-adenosine derivative (see paper)
27% identity, 82% coverage: 24:234/257 of query aligns to 24:239/261 of 7zzjA

query
sites
7zzjA
L
 
F
A
 
G
A
 
E
H
 
Y
D
 
D
W
 
M
V
 
E
H
 
Y
P
 
D
D
 
D
-
 
V
E
 
E
A
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
V
V
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
F
 
T
M
 
F
L
 
L
Q
 
S
T
 
A
L
 
F
H
 
H
M
 
Q
L
 
Y
L
 
E
E
 
E
K
 
R
H
 
L
R
 
D
N
 
E
L
 
I
P
 
A
V
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
I
N
 
H
L
 
T
G
 
G
T
 
H
I
x
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
M
 
A
N
 
D
E
 
-
W
 
W
R
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
A
D
 
D
G
 
K
L
 
L
D
 
V
A
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
G
R
 
E
P
 
Y
F
 
Q
R
 
K
V
 
V
T
 
S
P
 
Y
L
 
P
V
 
L
M
 
L
T
 
K
A
 
T
T
 
T
T
 
V
V
 
K
E
 
Y
G
 
G
D
 
K
T
 
E
H
 
A
V
 
T
L
 
Y
P
 
L
A
 
A
I
 
L
N
|
N
E
|
E
V
 
-
S
 
S
L
 
T
L
 
V
R
 
K
E
 
S
T
 
S
R
 
G
Q
 
G
T
 
P
A
 
F
K
 
V
L
 
V
E
 
D
V
 
V
T
 
V
V
 
I
N
 
N
D
 
D
R
 
-
I
 
I
V
 
H
L
 
F
P
 
E
E
 
R
L
 
F
V
 
R
C
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
A
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
N
 
N
L
 
K
S
|
S
A
 
L
H
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
L
 
M
P
 
H
L
 
P
G
 
S
S
 
I
Q
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
Q
L
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
S
 
A
P
 
S
F
 
I
R
 
N
P
 
N
R
 
R
R
 
V
W
 
Y
R
 
R
-
 
T
-
 
I
G
 
G
A
 
S
-
 
P
-
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
K
K
 
H
T
 
H
R
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
L
 
V
D
 
N
P
 
D
G
 
K
K
 
D
R
 
F
P
 
Q
V
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
D
A
x
H
D
 
L
Q
 
S
R
 
I
E
 
L
V
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
Q
R
 
E
V
 
I
D
 
R
I
 
Y
E
 
E
I
 
V
D
 
S
P
 
A
K
 
K
R
 
K

7zzgA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complex with a linear di-adenosine derivative (see paper)
27% identity, 82% coverage: 24:234/257 of query aligns to 24:239/261 of 7zzgA

query
sites
7zzgA
L
 
F
A
 
G
A
 
E
H
 
Y
D
 
D
W
 
M
V
 
E
H
 
Y
P
 
D
D
 
D
-
 
V
E
 
E
A
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
V
V
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
F
 
T
M
 
F
L
 
L
Q
 
S
T
 
A
L
 
F
H
 
H
M
 
Q
L
 
Y
L
 
E
E
 
E
K
 
R
H
 
L
R
 
D
N
 
E
L
 
I
P
 
A
V
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
I
N
 
H
L
 
T
G
 
G
T
 
H
I
 
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
M
 
A
N
 
D
E
 
-
W
 
W
R
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
A
D
 
D
G
 
K
L
 
L
D
 
V
A
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
G
R
 
E
P
 
Y
F
 
Q
R
 
K
V
 
V
T
 
S
P
 
Y
L
 
P
V
 
L
M
 
L
T
 
K
A
 
T
T
 
T
T
 
V
V
 
K
E
 
Y
G
 
G
D
 
K
T
 
E
H
 
A
V
 
T
L
 
Y
P
 
L
A
 
A
I
 
L
N
|
N
E
|
E
V
 
-
S
 
S
L
 
T
L
 
V
R
 
K
E
 
S
T
 
S
R
 
G
Q
 
G
T
 
P
A
 
F
K
 
V
L
 
V
E
 
D
V
 
V
T
 
V
V
 
I
N
 
N
D
 
D
R
 
-
I
 
I
V
 
H
L
 
F
P
 
E
E
 
R
L
 
F
V
 
R
C
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
A
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
N
 
N
L
 
K
S
|
S
A
 
L
H
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
L
 
M
P
 
H
L
 
P
G
 
S
S
 
I
Q
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
Q
L
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
S
 
A
P
 
S
F
 
I
R
 
N
P
 
N
R
 
R
R
 
V
W
 
Y
R
 
R
-
 
T
-
 
I
G
 
G
A
 
S
-
 
P
-
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
K
K
 
H
T
 
H
R
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
L
 
V
D
 
N
P
 
D
G
 
K
K
 
D
R
 
F
P
 
Q
V
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
D
A
x
H
D
 
L
Q
 
S
R
 
I
E
 
L
V
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
Q
R
 
E
V
 
I
D
 
R
I
 
Y
E
 
E
I
 
V
D
 
S
P
 
A
K
 
K
R
 
K

7zzeA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complex with a linear di-adenosine derivative (see paper)
27% identity, 82% coverage: 24:234/257 of query aligns to 24:239/261 of 7zzeA

query
sites
7zzeA
L
 
F
A
 
G
A
 
E
H
 
Y
D
 
D
W
 
M
V
 
E
H
 
Y
P
 
D
D
 
D
-
 
V
E
 
E
A
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
V
V
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
F
 
T
M
 
F
L
 
L
Q
 
S
T
 
A
L
 
F
H
 
H
M
 
Q
L
 
Y
L
 
E
E
 
E
K
 
R
H
 
L
R
 
D
N
 
E
L
 
I
P
 
A
V
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
I
N
 
H
L
 
T
G
 
G
T
 
H
I
 
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
M
 
A
N
 
D
E
 
-
W
 
W
R
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
A
D
 
D
G
 
K
L
 
L
D
 
V
A
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
G
R
 
E
P
 
Y
F
 
Q
R
 
K
V
 
V
T
 
S
P
 
Y
L
 
P
V
 
L
M
 
L
T
 
K
A
 
T
T
 
T
T
 
V
V
 
K
E
 
Y
G
 
G
D
 
K
T
 
E
H
 
A
V
 
T
L
 
Y
P
 
L
A
 
A
I
 
L
N
|
N
E
|
E
V
 
-
S
 
S
L
 
T
L
 
V
R
 
K
E
 
S
T
 
S
R
 
G
Q
 
G
T
 
P
A
 
F
K
 
V
L
 
V
E
 
D
V
 
V
T
 
V
V
 
I
N
 
N
D
 
D
R
 
-
I
 
I
V
 
H
L
 
F
P
 
E
E
 
R
L
 
F
V
 
R
C
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
A
x
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
N
 
N
L
 
K
S
|
S
A
 
L
H
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
L
 
M
P
 
H
L
 
P
G
 
S
S
 
I
Q
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
Q
L
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
S
 
A
P
 
S
F
 
I
R
 
N
P
 
N
R
 
R
R
 
V
W
 
Y
R
 
R
-
 
T
-
 
I
G
 
G
A
 
S
-
 
P
-
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
K
K
 
H
T
 
H
R
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
L
 
V
D
 
N
P
 
D
G
 
K
K
 
D
R
 
F
P
 
Q
V
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
D
A
x
H
D
 
L
Q
 
S
R
 
I
E
 
L
V
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
Q
R
 
E
V
 
I
D
 
R
I
 
Y
E
 
E
I
 
V
D
 
S
P
 
A
K
 
K
R
 
K

7zzcA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complex with a linear di-adenosine derivative (see paper)
27% identity, 82% coverage: 24:234/257 of query aligns to 24:239/261 of 7zzcA

query
sites
7zzcA
L
 
F
A
 
G
A
 
E
H
 
Y
D
 
D
W
 
M
V
 
E
H
 
Y
P
 
D
D
 
D
-
 
V
E
 
E
A
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
V
V
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
F
 
T
M
 
F
L
|
L
Q
 
S
T
 
A
L
 
F
H
 
H
M
 
Q
L
 
Y
L
 
E
E
 
E
K
 
R
H
 
L
R
 
D
N
 
E
L
 
I
P
 
A
V
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
I
N
 
H
L
 
T
G
 
G
T
 
H
I
 
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
M
 
A
N
 
D
E
 
-
W
 
W
R
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
A
D
 
D
G
 
K
L
 
L
D
 
V
A
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
G
R
 
E
P
 
Y
F
 
Q
R
 
K
V
 
V
T
 
S
P
 
Y
L
 
P
V
 
L
M
 
L
T
 
K
A
 
T
T
 
T
T
 
V
V
 
K
E
 
Y
G
 
G
D
 
K
T
 
E
H
 
A
V
 
T
L
 
Y
P
 
L
A
 
A
I
 
L
N
|
N
E
|
E
V
 
-
S
 
S
L
 
T
L
 
V
R
 
K
E
 
S
T
 
S
R
 
G
Q
 
G
T
 
P
A
 
F
K
 
V
L
 
V
E
 
D
V
 
V
T
 
V
V
 
I
N
 
N
D
 
D
R
 
-
I
 
I
V
 
H
L
 
F
P
 
E
E
 
R
L
 
F
V
 
R
C
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
A
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
N
 
N
L
 
K
S
|
S
A
 
L
H
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
L
 
M
P
 
H
L
 
P
G
 
S
S
 
I
Q
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
Q
L
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
S
 
A
P
 
S
F
 
I
R
 
N
P
 
N
R
 
R
R
 
V
W
 
Y
R
 
R
-
 
T
-
 
I
G
 
G
A
 
S
-
 
P
-
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
K
K
 
H
T
 
H
R
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
L
 
V
D
 
N
P
 
D
G
 
K
K
 
D
R
 
F
P
 
Q
V
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
D
A
 
H
D
 
L
Q
 
S
R
 
I
E
 
L
V
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
Q
R
 
E
V
 
I
D
 
R
I
 
Y
E
 
E
I
 
V
D
 
S
P
 
A
K
 
K
R
 
K

7zzaA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complex with a linear di-adenosine derivative (see paper)
27% identity, 82% coverage: 24:234/257 of query aligns to 24:239/261 of 7zzaA

query
sites
7zzaA
L
 
F
A
 
G
A
 
E
H
 
Y
D
 
D
W
 
M
V
 
E
H
 
Y
P
 
D
D
 
D
-
 
V
E
 
E
A
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
V
V
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
F
 
T
M
 
F
L
|
L
Q
 
S
T
 
A
L
 
F
H
 
H
M
 
Q
L
 
Y
L
 
E
E
 
E
K
 
R
H
 
L
R
 
D
N
 
E
L
 
I
P
 
A
V
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
I
N
 
H
L
 
T
G
 
G
T
 
H
I
 
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
M
 
A
N
 
D
E
 
-
W
 
W
R
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
A
D
 
D
G
 
K
L
 
L
D
 
V
A
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
G
R
 
E
P
 
Y
F
 
Q
R
 
K
V
 
V
T
 
S
P
 
Y
L
 
P
V
 
L
M
 
L
T
 
K
A
 
T
T
 
T
T
 
V
V
 
K
E
 
Y
G
 
G
D
 
K
T
 
E
H
 
A
V
 
T
L
 
Y
P
 
L
A
 
A
I
 
L
N
|
N
E
|
E
V
 
-
S
 
S
L
 
T
L
 
V
R
 
K
E
 
S
T
 
S
R
 
G
Q
 
G
T
 
P
A
 
F
K
 
V
L
 
V
E
 
D
V
 
V
T
 
V
V
 
I
N
 
N
D
 
D
R
 
-
I
 
I
V
 
H
L
 
F
P
 
E
E
 
R
L
 
F
V
 
R
C
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
A
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
N
 
N
L
 
K
S
|
S
A
 
L
H
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
L
 
M
P
 
H
L
 
P
G
 
S
S
 
I
Q
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
Q
L
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
S
 
A
P
 
S
F
 
I
R
 
N
P
 
N
R
 
R
R
 
V
W
 
Y
R
 
R
-
 
T
-
 
I
G
 
G
A
 
S
-
 
P
-
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
K
K
 
H
T
 
H
R
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
L
 
V
D
 
N
P
 
D
G
 
K
K
 
D
R
 
F
P
 
Q
V
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
D
A
 
H
D
 
L
Q
 
S
R
 
I
E
 
L
V
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
Q
R
 
E
V
 
I
D
 
R
I
 
Y
E
 
E
I
 
V
D
 
S
P
 
A
K
 
K
R
 
K

6z61A Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complex with a di-adenosine derivative (see paper)
27% identity, 82% coverage: 24:234/257 of query aligns to 24:239/261 of 6z61A

query
sites
6z61A
L
 
F
A
 
G
A
 
E
H
 
Y
D
 
D
W
 
M
V
 
E
H
 
Y
P
 
D
D
 
D
-
 
V
E
 
E
A
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
V
V
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
 
G
F
 
T
M
 
F
L
|
L
Q
 
S
T
 
A
L
 
F
H
 
H
M
 
Q
L
 
Y
L
 
E
E
 
E
K
 
R
H
 
L
R
 
D
N
 
E
L
 
I
P
 
A
V
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
I
N
 
H
L
 
T
G
 
G
T
 
H
I
 
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
M
 
A
N
 
D
E
 
-
W
 
W
R
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
A
D
 
D
G
 
K
L
 
L
D
 
V
A
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
G
R
 
E
P
 
Y
F
 
Q
R
 
K
V
 
V
T
 
S
P
 
Y
L
 
P
V
 
L
M
 
L
T
 
K
A
 
T
T
 
T
T
 
V
V
 
K
E
 
Y
G
 
G
D
 
K
T
 
E
H
 
A
V
 
T
L
 
Y
P
 
L
A
 
A
I
 
L
N
|
N
E
|
E
V
 
-
S
 
S
L
 
T
L
 
V
R
 
K
E
 
S
T
 
S
R
 
G
Q
 
G
T
 
P
A
 
F
K
 
V
L
 
V
E
 
D
V
 
V
T
 
V
V
 
I
N
 
N
D
 
D
R
 
-
I
 
I
V
 
H
L
 
F
P
 
E
E
 
R
L
 
F
V
 
R
C
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
A
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
N
 
N
L
 
K
S
 
S
A
 
L
H
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
L
 
M
P
 
H
L
 
P
G
 
S
S
 
I
Q
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
Q
L
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
S
 
A
P
 
S
F
 
I
R
 
N
P
 
N
R
 
R
R
 
V
W
 
Y
R
 
R
-
 
T
-
 
I
G
 
G
A
 
S
-
 
P
-
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
K
K
 
H
T
 
H
R
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
L
 
V
D
 
N
P
 
D
G
 
K
K
 
D
R
 
F
P
 
Q
V
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
D
A
 
H
D
 
L
Q
 
S
R
 
I
E
 
L
V
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
Q
R
 
E
V
 
I
D
 
R
I
 
Y
E
 
E
I
 
V
D
 
S
P
 
A
K
 
K
R
 
K

6rr2A Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complexe with an adenine derivative (see paper)
27% identity, 82% coverage: 24:234/257 of query aligns to 24:239/261 of 6rr2A

query
sites
6rr2A
L
 
F
A
 
G
A
 
E
H
 
Y
D
 
D
W
 
M
V
 
E
H
 
Y
P
 
D
D
 
D
-
 
V
E
 
E
A
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
V
V
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
F
 
T
M
 
F
L
 
L
Q
 
S
T
 
A
L
 
F
H
 
H
M
 
Q
L
 
Y
L
 
E
E
 
E
K
 
R
H
 
L
R
 
D
N
 
E
L
 
I
P
 
A
V
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
I
N
 
H
L
 
T
G
 
G
T
 
H
I
 
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
M
 
A
N
 
D
E
 
-
W
 
W
R
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
A
D
 
D
G
 
K
L
 
L
D
 
V
A
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
G
R
 
E
P
 
Y
F
 
Q
R
 
K
V
 
V
T
 
S
P
 
Y
L
 
P
V
 
L
M
 
L
T
 
K
A
 
T
T
 
T
T
 
V
V
 
K
E
 
Y
G
 
G
D
 
K
T
 
E
H
 
A
V
 
T
L
 
Y
P
 
L
A
 
A
I
 
L
N
|
N
E
|
E
V
 
-
S
 
S
L
 
T
L
 
V
R
 
K
E
 
S
T
 
S
R
 
G
Q
 
G
T
 
P
A
 
F
K
 
V
L
 
V
E
 
D
V
 
V
T
 
V
V
 
I
N
 
N
D
 
D
R
 
-
I
 
I
V
 
H
L
 
F
P
 
E
E
 
R
L
 
F
V
 
R
C
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
A
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
N
 
N
L
 
K
S
|
S
A
 
L
H
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
L
 
M
P
 
H
L
 
P
G
 
S
S
 
I
Q
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
Q
L
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
S
 
A
P
 
S
F
 
I
R
 
N
P
 
N
R
 
R
R
 
V
W
 
Y
R
 
R
-
 
T
-
 
I
G
 
G
A
 
S
-
 
P
-
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
K
K
 
H
T
 
H
R
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
L
 
V
D
 
N
P
 
D
G
 
K
K
 
D
R
 
F
P
 
Q
V
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
D
A
 
H
D
 
L
Q
 
S
R
 
I
E
 
L
V
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
Q
R
 
E
V
 
I
D
 
R
I
 
Y
E
 
E
I
 
V
D
 
S
P
 
A
K
 
K
R
 
K

6rgfA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complex with an inhibitor
27% identity, 82% coverage: 24:234/257 of query aligns to 24:239/261 of 6rgfA

query
sites
6rgfA
L
 
F
A
 
G
A
 
E
H
 
Y
D
 
D
W
 
M
V
 
E
H
 
Y
P
 
D
D
 
D
-
 
V
E
 
E
A
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
V
V
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
F
 
T
M
 
F
L
|
L
Q
 
S
T
 
A
L
 
F
H
 
H
M
 
Q
L
 
Y
L
 
E
E
 
E
K
 
R
H
 
L
R
 
D
N
 
E
L
 
I
P
 
A
V
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
I
N
 
H
L
 
T
G
 
G
T
x
H
I
 
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
M
 
A
N
 
D
E
 
-
W
 
W
R
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
A
D
 
D
G
 
K
L
 
L
D
 
V
A
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
G
R
 
E
P
 
Y
F
 
Q
R
 
K
V
 
V
T
 
S
P
 
Y
L
 
P
V
 
L
M
 
L
T
 
K
A
 
T
T
 
T
T
 
V
V
 
K
E
 
Y
G
 
G
D
 
K
T
 
E
H
 
A
V
 
T
L
 
Y
P
 
L
A
 
A
I
 
L
N
|
N
E
|
E
V
 
-
S
 
S
L
 
T
L
 
V
R
 
K
E
 
S
T
 
S
R
 
G
Q
 
G
T
 
P
A
 
F
K
 
V
L
 
V
E
 
D
V
 
V
T
 
V
V
 
I
N
 
N
D
 
D
R
 
-
I
 
I
V
 
H
L
 
F
P
 
E
E
 
R
L
 
F
V
 
R
C
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
A
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
N
 
N
L
 
K
S
|
S
A
 
L
H
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
L
 
M
P
 
H
L
 
P
G
 
S
S
 
I
Q
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
Q
L
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
S
 
A
P
 
S
F
 
I
R
 
N
P
 
N
R
 
R
R
 
V
W
 
Y
R
 
R
-
 
T
-
 
I
G
 
G
A
 
S
-
 
P
-
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
K
K
 
H
T
 
H
R
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
L
 
V
D
 
N
P
 
D
G
 
K
K
 
D
R
 
F
P
 
Q
V
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
D
A
 
H
D
 
L
Q
 
S
R
 
I
E
 
L
V
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
Q
R
 
E
V
 
I
D
 
R
I
 
Y
E
 
E
I
 
V
D
 
S
P
 
A
K
 
K
R
 
K

6rgbA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complexe with an inhibitor (see paper)
27% identity, 82% coverage: 24:234/257 of query aligns to 24:239/261 of 6rgbA

query
sites
6rgbA
L
 
F
A
 
G
A
 
E
H
 
Y
D
 
D
W
 
M
V
 
E
H
 
Y
P
 
D
D
 
D
-
 
V
E
 
E
A
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
V
V
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
F
 
T
M
 
F
L
|
L
Q
 
S
T
 
A
L
 
F
H
 
H
M
 
Q
L
 
Y
L
 
E
E
 
E
K
 
R
H
 
L
R
 
D
N
 
E
L
 
I
P
 
A
V
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
I
N
 
H
L
 
T
G
 
G
T
 
H
I
 
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
M
 
A
N
 
D
E
 
-
W
 
W
R
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
A
D
 
D
G
 
K
L
 
L
D
 
V
A
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
G
R
 
E
P
 
Y
F
 
Q
R
 
K
V
 
V
T
 
S
P
 
Y
L
 
P
V
 
L
M
 
L
T
 
K
A
 
T
T
 
T
T
 
V
V
 
K
E
 
Y
G
 
G
D
 
K
T
 
E
H
 
A
V
 
T
L
 
Y
P
 
L
A
 
A
I
 
L
N
|
N
E
|
E
V
 
-
S
 
S
L
 
T
L
 
V
R
 
K
E
 
S
T
 
S
R
 
G
Q
 
G
T
 
P
A
 
F
K
 
V
L
 
V
E
 
D
V
 
V
T
 
V
V
 
I
N
 
N
D
 
D
R
 
-
I
 
I
V
 
H
L
 
F
P
 
E
E
 
R
L
 
F
V
 
R
C
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
A
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
N
 
N
L
 
K
S
|
S
A
 
L
H
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
L
 
M
P
 
H
L
 
P
G
 
S
S
 
I
Q
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
Q
L
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
S
 
A
P
 
S
F
 
I
R
 
N
P
 
N
R
 
R
R
 
V
W
 
Y
R
 
R
-
 
T
-
 
I
G
 
G
A
 
S
-
 
P
-
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
K
K
 
H
T
 
H
R
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
L
 
V
D
 
N
P
 
D
G
 
K
K
 
D
R
 
F
P
 
Q
V
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
D
A
 
H
D
 
L
Q
 
S
R
 
I
E
 
L
V
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
Q
R
 
E
V
 
I
D
 
R
I
 
Y
E
 
E
I
 
V
D
 
S
P
 
A
K
 
K
R
 
K

6rc5A Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complexe with an adenine derivative (see paper)
27% identity, 82% coverage: 24:234/257 of query aligns to 24:239/261 of 6rc5A

query
sites
6rc5A
L
 
F
A
 
G
A
 
E
H
 
Y
D
 
D
W
 
M
V
 
E
H
 
Y
P
 
D
D
 
D
-
 
V
E
 
E
A
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
V
V
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
F
 
T
M
 
F
L
|
L
Q
 
S
T
 
A
L
 
F
H
 
H
M
 
Q
L
 
Y
L
 
E
E
 
E
K
 
R
H
 
L
R
 
D
N
 
E
L
 
I
P
 
A
V
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
I
N
 
H
L
 
T
G
 
G
T
 
H
I
 
L
G
 
G
F
|
F
L
 
Y
M
 
A
N
 
D
E
 
-
W
 
W
R
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
A
D
 
D
G
 
K
L
 
L
D
 
V
A
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
G
R
 
E
P
 
Y
F
 
Q
R
 
K
V
 
V
T
 
S
P
 
Y
L
 
P
V
 
L
M
 
L
T
 
K
A
 
T
T
 
T
T
 
V
V
 
K
E
 
Y
G
 
G
D
 
K
T
 
E
H
 
A
V
 
T
L
 
Y
P
 
L
A
 
A
I
 
L
N
|
N
E
 
E
V
 
-
S
 
S
L
 
T
L
 
V
R
 
K
E
 
S
T
 
S
R
 
G
Q
 
G
T
 
P
A
 
F
K
 
V
L
 
V
E
 
D
V
 
V
T
 
V
V
 
I
N
 
N
D
 
D
R
 
-
I
 
I
V
 
H
L
 
F
P
 
E
E
 
R
L
 
F
V
 
R
C
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
A
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
 
Y
N
 
N
L
 
K
S
 
S
A
 
L
H
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
L
 
M
P
 
H
L
 
P
G
 
S
S
 
I
Q
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
Q
L
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
S
 
A
P
 
S
F
 
I
R
 
N
P
 
N
R
 
R
R
 
V
W
 
Y
R
 
R
-
 
T
-
 
I
G
 
G
A
 
S
-
 
P
-
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
K
K
 
H
T
 
H
R
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
L
 
V
D
 
N
P
 
D
G
 
K
K
 
D
R
 
F
P
 
Q
V
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
D
A
 
H
D
 
L
Q
 
S
R
 
I
E
 
L
V
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
Q
R
 
E
V
 
I
D
 
R
I
 
Y
E
 
E
I
 
V
D
 
S
P
 
A
K
 
K
R
 
K

6rc4A Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complexe with an adenine derivative (see paper)
27% identity, 82% coverage: 24:234/257 of query aligns to 24:239/261 of 6rc4A

query
sites
6rc4A
L
 
F
A
 
G
A
 
E
H
 
Y
D
 
D
W
 
M
V
 
E
H
 
Y
P
 
D
D
 
D
-
 
V
E
 
E
A
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
V
V
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
 
G
F
 
T
M
 
F
L
 
L
Q
 
S
T
 
A
L
 
F
H
 
H
M
 
Q
L
 
Y
L
 
E
E
 
E
K
 
R
H
 
L
R
 
D
N
 
E
L
 
I
P
 
A
V
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
I
N
 
H
L
 
T
G
 
G
T
 
H
I
 
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
M
 
A
N
 
D
E
 
-
W
 
W
R
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
A
D
 
D
G
 
K
L
 
L
D
 
V
A
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
G
R
 
E
P
 
Y
F
 
Q
R
 
K
V
 
V
T
 
S
P
 
Y
L
 
P
V
 
L
M
 
L
T
 
K
A
 
T
T
 
T
T
 
V
V
 
K
E
 
Y
G
 
G
D
 
K
T
 
E
H
 
A
V
 
T
L
 
Y
P
 
L
A
 
A
I
 
L
N
|
N
E
 
E
V
 
-
S
 
S
L
 
T
L
 
V
R
 
K
E
 
S
T
 
S
R
 
G
Q
 
G
T
 
P
A
 
F
K
 
V
L
 
V
E
 
D
V
 
V
T
 
V
V
 
I
N
 
N
D
 
D
R
 
-
I
 
I
V
 
H
L
 
F
P
 
E
E
 
R
L
 
F
V
 
R
C
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
A
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
 
Y
N
 
N
L
 
K
S
 
S
A
 
L
H
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
L
 
M
P
 
H
L
 
P
G
 
S
S
 
I
Q
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
Q
L
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
S
 
A
P
 
S
F
 
I
R
 
N
P
 
N
R
 
R
R
 
V
W
 
Y
R
 
R
-
 
T
-
 
I
G
 
G
A
 
S
-
 
P
-
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
K
K
 
H
T
 
H
R
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
L
 
V
D
 
N
P
 
D
G
 
K
K
 
D
R
 
F
P
 
Q
V
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
D
A
 
H
D
 
L
Q
 
S
R
 
I
E
 
L
V
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
Q
R
 
E
V
 
I
D
 
R
I
 
Y
E
 
E
I
 
V
D
 
S
P
 
A
K
 
K
R
 
K

6rc2A Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complexe with an adenine derivative (see paper)
27% identity, 82% coverage: 24:234/257 of query aligns to 24:239/261 of 6rc2A

query
sites
6rc2A
L
 
F
A
 
G
A
 
E
H
 
Y
D
 
D
W
 
M
V
 
E
H
 
Y
P
 
D
D
 
D
-
 
V
E
 
E
A
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
V
V
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
 
G
F
 
T
M
 
F
L
 
L
Q
 
S
T
 
A
L
 
F
H
 
H
M
 
Q
L
 
Y
L
 
E
E
 
E
K
 
R
H
 
L
R
 
D
N
 
E
L
 
I
P
 
A
V
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
I
N
 
H
L
 
T
G
 
G
T
 
H
I
 
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
M
 
A
N
 
D
E
 
-
W
 
W
R
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
A
D
 
D
G
 
K
L
 
L
D
 
V
A
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
G
R
 
E
P
 
Y
F
 
Q
R
 
K
V
 
V
T
 
S
P
 
Y
L
 
P
V
 
L
M
 
L
T
 
K
A
 
T
T
 
T
T
 
V
V
 
K
E
 
Y
G
 
G
D
 
K
T
 
E
H
 
A
V
 
T
L
 
Y
P
 
L
A
 
A
I
 
L
N
|
N
E
 
E
V
 
-
S
 
S
L
 
T
L
 
V
R
 
K
E
 
S
T
 
S
R
 
G
Q
 
G
T
 
P
A
 
F
K
 
V
L
 
V
E
 
D
V
 
V
T
 
V
V
 
I
N
 
N
D
 
D
R
 
-
I
 
I
V
 
H
L
 
F
P
 
E
E
 
R
L
 
F
V
 
R
C
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
A
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
 
Y
N
 
N
L
 
K
S
 
S
A
 
L
H
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
L
 
M
P
 
H
L
 
P
G
 
S
S
 
I
Q
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
Q
L
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
S
 
A
P
 
S
F
 
I
R
 
N
P
 
N
R
 
R
R
 
V
W
 
Y
R
 
R
-
 
T
-
 
I
G
 
G
A
 
S
-
 
P
-
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
K
K
 
H
T
 
H
R
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
L
 
V
D
 
N
P
 
D
G
 
K
K
 
D
R
 
F
P
 
Q
V
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
D
A
 
H
D
 
L
Q
 
S
R
 
I
E
 
L
V
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
Q
R
 
E
V
 
I
D
 
R
I
 
Y
E
 
E
I
 
V
D
 
S
P
 
A
K
 
K
R
 
K

6rbxA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complexe with an adenine derivative (see paper)
27% identity, 82% coverage: 24:234/257 of query aligns to 24:239/261 of 6rbxA

query
sites
6rbxA
L
 
F
A
 
G
A
 
E
H
 
Y
D
 
D
W
 
M
V
 
E
H
 
Y
P
 
D
D
 
D
-
 
V
E
 
E
A
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
V
V
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
F
 
T
M
 
F
L
 
L
Q
 
S
T
 
A
L
 
F
H
 
H
M
 
Q
L
 
Y
L
 
E
E
 
E
K
 
R
H
 
L
R
 
D
N
 
E
L
 
I
P
 
A
V
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
I
N
 
H
L
 
T
G
 
G
T
 
H
I
 
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
M
 
A
N
 
D
E
 
-
W
 
W
R
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
A
D
 
D
G
 
K
L
 
L
D
 
V
A
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
G
R
 
E
P
 
Y
F
 
Q
R
 
K
V
 
V
T
 
S
P
 
Y
L
 
P
V
 
L
M
 
L
T
 
K
A
 
T
T
 
T
T
 
V
V
 
K
E
 
Y
G
 
G
D
 
K
T
 
E
H
 
A
V
 
T
L
 
Y
P
 
L
A
 
A
I
 
L
N
|
N
E
 
E
V
 
-
S
 
S
L
 
T
L
 
V
R
 
K
E
 
S
T
 
S
R
 
G
Q
 
G
T
 
P
A
 
F
K
 
V
L
 
V
E
 
D
V
 
V
T
 
V
V
 
I
N
 
N
D
 
D
R
 
-
I
 
I
V
 
H
L
 
F
P
 
E
E
 
R
L
 
F
V
 
R
C
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
A
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
 
Y
N
 
N
L
 
K
S
 
S
A
 
L
H
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
L
 
M
P
 
H
L
 
P
G
 
S
S
 
I
Q
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
Q
L
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
S
 
A
P
 
S
F
 
I
R
 
N
P
 
N
R
 
R
R
 
V
W
 
Y
R
 
R
-
 
T
-
 
I
G
 
G
A
 
S
-
 
P
-
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
K
K
 
H
T
 
H
R
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
L
 
V
D
 
N
P
 
D
G
 
K
K
 
D
R
 
F
P
 
Q
V
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
D
A
 
H
D
 
L
Q
 
S
R
 
I
E
 
L
V
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
Q
R
 
E
V
 
I
D
 
R
I
 
Y
E
 
E
I
 
V
D
 
S
P
 
A
K
 
K
R
 
K

6rbwA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complexe with an adenine derivative (see paper)
27% identity, 82% coverage: 24:234/257 of query aligns to 24:239/261 of 6rbwA

query
sites
6rbwA
L
 
F
A
 
G
A
 
E
H
 
Y
D
 
D
W
 
M
V
 
E
H
 
Y
P
 
D
D
 
D
-
 
V
E
 
E
A
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
V
V
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
F
 
T
M
 
F
L
 
L
Q
 
S
T
 
A
L
 
F
H
 
H
M
 
Q
L
 
Y
L
 
E
E
 
E
K
 
R
H
 
L
R
 
D
N
 
E
L
 
I
P
 
A
V
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
I
N
 
H
L
 
T
G
 
G
T
 
H
I
 
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
M
 
A
N
 
D
E
 
-
W
 
W
R
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
A
D
 
D
G
 
K
L
 
L
D
 
V
A
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
G
R
 
E
P
 
Y
F
 
Q
R
 
K
V
 
V
T
 
S
P
 
Y
L
 
P
V
 
L
M
 
L
T
 
K
A
 
T
T
 
T
T
 
V
V
 
K
E
 
Y
G
 
G
D
 
K
T
 
E
H
 
A
V
 
T
L
 
Y
P
 
L
A
 
A
I
 
L
N
|
N
E
 
E
V
 
-
S
 
S
L
 
T
L
 
V
R
 
K
E
 
S
T
 
S
R
 
G
Q
 
G
T
 
P
A
 
F
K
 
V
L
 
V
E
 
D
V
 
V
T
 
V
V
 
I
N
 
N
D
 
D
R
 
-
I
 
I
V
 
H
L
 
F
P
 
E
E
 
R
L
 
F
V
 
R
C
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
A
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
 
Y
N
 
N
L
 
K
S
 
S
A
 
L
H
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
L
 
M
P
 
H
L
 
P
G
 
S
S
 
I
Q
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
Q
L
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
S
 
A
P
 
S
F
 
I
R
 
N
P
 
N
R
 
R
R
 
V
W
 
Y
R
 
R
-
 
T
-
 
I
G
 
G
A
 
S
-
 
P
-
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
K
K
 
H
T
 
H
R
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
L
 
V
D
 
N
P
 
D
G
 
K
K
 
D
R
 
F
P
 
Q
V
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
D
A
 
H
D
 
L
Q
 
S
R
 
I
E
 
L
V
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
Q
R
 
E
V
 
I
D
 
R
I
 
Y
E
 
E
I
 
V
D
 
S
P
 
A
K
 
K
R
 
K

6rbuA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complexe with an adenine derivative (see paper)
27% identity, 82% coverage: 24:234/257 of query aligns to 24:239/261 of 6rbuA

query
sites
6rbuA
L
 
F
A
 
G
A
 
E
H
 
Y
D
 
D
W
 
M
V
 
E
H
 
Y
P
 
D
D
 
D
-
 
V
E
 
E
A
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
V
V
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
 
G
F
 
T
M
 
F
L
 
L
Q
 
S
T
 
A
L
 
F
H
 
H
M
 
Q
L
 
Y
L
 
E
E
 
E
K
 
R
H
 
L
R
 
D
N
 
E
L
 
I
P
 
A
V
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
I
N
 
H
L
 
T
G
 
G
T
 
H
I
 
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
M
 
A
N
 
D
E
 
-
W
 
W
R
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
A
D
 
D
G
 
K
L
 
L
D
 
V
A
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
G
R
 
E
P
 
Y
F
 
Q
R
 
K
V
 
V
T
 
S
P
 
Y
L
 
P
V
 
L
M
 
L
T
 
K
A
 
T
T
 
T
T
 
V
V
 
K
E
 
Y
G
 
G
D
 
K
T
 
E
H
 
A
V
 
T
L
 
Y
P
 
L
A
 
A
I
 
L
N
|
N
E
 
E
V
 
-
S
 
S
L
 
T
L
 
V
R
 
K
E
 
S
T
 
S
R
 
G
Q
 
G
T
 
P
A
 
F
K
 
V
L
 
V
E
 
D
V
 
V
T
 
V
V
 
I
N
 
N
D
 
D
R
 
-
I
 
I
V
 
H
L
 
F
P
 
E
E
 
R
L
 
F
V
 
R
C
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
A
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
 
Y
N
 
N
L
 
K
S
 
S
A
 
L
H
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
L
 
M
P
 
H
L
 
P
G
 
S
S
 
I
Q
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
Q
L
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
S
 
A
P
 
S
F
 
I
R
 
N
P
 
N
R
 
R
R
 
V
W
 
Y
R
 
R
-
 
T
-
 
I
G
 
G
A
 
S
-
 
P
-
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
K
K
 
H
T
 
H
R
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
L
 
V
D
 
N
P
 
D
G
 
K
K
 
D
R
 
F
P
 
Q
V
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
D
A
 
H
D
 
L
Q
 
S
R
 
I
E
 
L
V
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
Q
R
 
E
V
 
I
D
 
R
I
 
Y
E
 
E
I
 
V
D
 
S
P
 
A
K
 
K
R
 
K

6rbtA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complexe with an adenine derivative (see paper)
27% identity, 82% coverage: 24:234/257 of query aligns to 24:239/261 of 6rbtA

query
sites
6rbtA
L
 
F
A
 
G
A
 
E
H
 
Y
D
 
D
W
 
M
V
 
E
H
 
Y
P
 
D
D
 
D
-
 
V
E
 
E
A
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
V
V
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
|
G
D
|
D
G
|
G
F
 
T
M
 
F
L
 
L
Q
 
S
T
 
A
L
 
F
H
 
H
M
 
Q
L
 
Y
L
 
E
E
 
E
K
 
R
H
 
L
R
 
D
N
 
E
L
 
I
P
 
A
V
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
I
N
 
H
L
 
T
G
 
G
T
 
H
I
 
L
G
 
G
F
|
F
L
 
Y
M
 
A
N
 
D
E
 
-
W
 
W
R
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
A
D
 
D
G
 
K
L
 
L
D
 
V
A
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
G
R
 
E
P
 
Y
F
 
Q
R
 
K
V
 
V
T
 
S
P
 
Y
L
 
P
V
 
L
M
 
L
T
 
K
A
 
T
T
 
T
T
 
V
V
 
K
E
 
Y
G
 
G
D
 
K
T
 
E
H
 
A
V
 
T
L
 
Y
P
 
L
A
 
A
I
 
L
N
|
N
E
 
E
V
 
-
S
 
S
L
 
T
L
 
V
R
 
K
E
 
S
T
 
S
R
 
G
Q
 
G
T
 
P
A
 
F
K
 
V
L
 
V
E
 
D
V
 
V
T
 
V
V
 
I
N
 
N
D
 
D
R
 
-
I
 
I
V
 
H
L
 
F
P
 
E
E
 
R
L
 
F
V
 
R
C
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
A
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
 
Y
N
 
N
L
 
K
S
 
S
A
 
L
H
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
L
 
M
P
 
H
L
 
P
G
 
S
S
 
I
Q
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
Q
L
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
S
 
A
P
 
S
F
 
I
R
 
N
P
 
N
R
 
R
R
 
V
W
 
Y
R
 
R
-
 
T
-
 
I
G
 
G
A
 
S
-
 
P
-
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
K
K
 
H
T
 
H
R
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
L
 
V
D
 
N
P
 
D
G
 
K
K
 
D
R
 
F
P
 
Q
V
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
D
A
 
H
D
 
L
Q
 
S
R
 
I
E
 
L
V
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
Q
R
 
E
V
 
I
D
 
R
I
 
Y
E
 
E
I
 
V
D
 
S
P
 
A
K
 
K
R
 
K

6rbsA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complexe with an adenine derivative (see paper)
27% identity, 82% coverage: 24:234/257 of query aligns to 24:239/261 of 6rbsA

query
sites
6rbsA
L
 
F
A
 
G
A
 
E
H
 
Y
D
 
D
W
 
M
V
 
E
H
 
Y
P
 
D
D
 
D
-
 
V
E
 
E
A
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
V
V
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
 
G
F
 
T
M
 
F
L
 
L
Q
 
S
T
 
A
L
 
F
H
 
H
M
 
Q
L
 
Y
L
 
E
E
 
E
K
 
R
H
 
L
R
 
D
N
 
E
L
 
I
P
 
A
V
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
I
N
 
H
L
 
T
G
 
G
T
 
H
I
 
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
M
 
A
N
 
D
E
 
-
W
 
W
R
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
A
D
 
D
G
 
K
L
 
L
D
 
V
A
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
G
R
 
E
P
 
Y
F
 
Q
R
 
K
V
 
V
T
 
S
P
 
Y
L
 
P
V
 
L
M
 
L
T
 
K
A
 
T
T
 
T
T
 
V
V
 
K
E
 
Y
G
 
G
D
 
K
T
 
E
H
 
A
V
 
T
L
 
Y
P
 
L
A
 
A
I
 
L
N
|
N
E
 
E
V
 
-
S
 
S
L
 
T
L
 
V
R
 
K
E
 
S
T
 
S
R
 
G
Q
 
G
T
 
P
A
 
F
K
 
V
L
 
V
E
 
D
V
 
V
T
 
V
V
 
I
N
 
N
D
 
D
R
 
-
I
 
I
V
 
H
L
 
F
P
 
E
E
 
R
L
 
F
V
 
R
C
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
A
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
 
Y
N
 
N
L
 
K
S
 
S
A
 
L
H
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
L
 
M
P
 
H
L
 
P
G
 
S
S
 
I
Q
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
Q
L
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
S
 
A
P
 
S
F
 
I
R
 
N
P
 
N
R
 
R
R
 
V
W
 
Y
R
 
R
-
 
T
-
 
I
G
 
G
A
 
S
-
 
P
-
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
K
K
 
H
T
 
H
R
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
L
 
V
D
 
N
P
 
D
G
 
K
K
 
D
R
 
F
P
 
Q
V
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
D
A
 
H
D
 
L
Q
 
S
R
 
I
E
 
L
V
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
Q
R
 
E
V
 
I
D
 
R
I
 
Y
E
 
E
I
 
V
D
 
S
P
 
A
K
 
K
R
 
K

6rbqA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complexe with an adenine derivative (see paper)
27% identity, 82% coverage: 24:234/257 of query aligns to 24:239/261 of 6rbqA

query
sites
6rbqA
L
 
F
A
 
G
A
 
E
H
 
Y
D
 
D
W
 
M
V
 
E
H
 
Y
P
 
D
D
 
D
-
 
V
E
 
E
A
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
V
V
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
 
G
F
 
T
M
 
F
L
 
L
Q
 
S
T
 
A
L
 
F
H
 
H
M
 
Q
L
 
Y
L
 
E
E
 
E
K
 
R
H
 
L
R
 
D
N
 
E
L
 
I
P
 
A
V
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
I
N
 
H
L
 
T
G
 
G
T
 
H
I
 
L
G
 
G
F
|
F
L
 
Y
M
 
A
N
 
D
E
 
-
W
 
W
R
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
A
D
 
D
G
 
K
L
 
L
D
 
V
A
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
G
R
 
E
P
 
Y
F
 
Q
R
 
K
V
 
V
T
 
S
P
 
Y
L
 
P
V
 
L
M
 
L
T
 
K
A
 
T
T
 
T
T
 
V
V
 
K
E
 
Y
G
 
G
D
 
K
T
 
E
H
 
A
V
 
T
L
 
Y
P
 
L
A
 
A
I
 
L
N
|
N
E
 
E
V
 
-
S
 
S
L
 
T
L
 
V
R
 
K
E
 
S
T
 
S
R
 
G
Q
 
G
T
 
P
A
 
F
K
 
V
L
 
V
E
 
D
V
 
V
T
 
V
V
 
I
N
 
N
D
 
D
R
 
-
I
 
I
V
 
H
L
 
F
P
 
E
E
 
R
L
 
F
V
 
R
C
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
A
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
N
 
N
L
 
K
S
 
S
A
 
L
H
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
L
 
M
P
 
H
L
 
P
G
 
S
S
 
I
Q
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
Q
L
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
S
 
A
P
 
S
F
 
I
R
 
N
P
 
N
R
 
R
R
 
V
W
 
Y
R
 
R
-
 
T
-
 
I
G
 
G
A
 
S
-
 
P
-
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
K
K
 
H
T
 
H
R
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
L
 
V
D
 
N
P
 
D
G
 
K
K
 
D
R
 
F
P
 
Q
V
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
D
A
 
H
D
 
L
Q
 
S
R
 
I
E
 
L
V
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
Q
R
 
E
V
 
I
D
 
R
I
 
Y
E
 
E
I
 
V
D
 
S
P
 
A
K
 
K
R
 
K

3v7uA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complex with mta (see paper)
27% identity, 82% coverage: 24:234/257 of query aligns to 24:239/261 of 3v7uA

query
sites
3v7uA
L
 
F
A
 
G
A
 
E
H
 
Y
D
 
D
W
 
M
V
 
E
H
 
Y
P
 
D
D
 
D
-
 
V
E
 
E
A
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
V
V
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
F
 
T
M
 
F
L
|
L
Q
 
S
T
 
A
L
 
F
H
 
H
M
 
Q
L
 
Y
L
 
E
E
 
E
K
 
R
H
 
L
R
 
D
N
 
E
L
 
I
P
 
A
V
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
I
N
 
H
L
 
T
G
 
G
T
 
H
I
 
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
M
 
A
N
 
D
E
 
-
W
 
W
R
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
A
D
 
D
G
 
K
L
 
L
D
 
V
A
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
G
R
 
E
P
 
Y
F
 
Q
R
 
K
V
 
V
T
 
S
P
 
Y
L
 
P
V
 
L
M
 
L
T
 
K
A
 
T
T
 
T
T
 
V
V
 
K
E
 
Y
G
 
G
D
 
K
T
 
E
H
 
A
V
 
T
L
 
Y
P
 
L
A
 
A
I
 
L
N
|
N
E
|
E
V
 
-
S
 
S
L
 
T
L
 
V
R
 
K
E
 
S
T
 
S
R
 
G
Q
 
G
T
 
P
A
 
F
K
 
V
L
 
V
E
 
D
V
 
V
T
 
V
V
 
I
N
 
N
D
 
D
R
 
-
I
 
I
V
 
H
L
 
F
P
 
E
E
 
R
L
 
F
V
 
R
C
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
A
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
N
 
N
L
 
K
S
|
S
A
 
L
H
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
L
 
M
P
 
H
L
 
P
G
 
S
S
 
I
Q
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
Q
L
 
L
T
 
T
P
 
E
I
 
M
S
 
A
P
 
S
F
 
I
R
 
N
P
 
N
R
 
R
R
 
V
W
 
Y
R
 
R
-
 
T
-
 
I
G
 
G
A
 
S
-
 
P
-
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
K
K
 
H
T
 
H
R
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
L
 
V
D
 
N
P
 
D
G
 
K
K
 
D
R
 
F
P
 
Q
V
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
D
A
 
H
D
 
L
Q
 
S
R
 
I
E
 
L
V
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
Q
R
 
E
V
 
I
D
 
R
I
 
Y
E
 
E
I
 
V
D
 
S
P
 
A
K
 
K
R
 
K

Query Sequence

>Ga0059261_3619 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_3619
MSGIRRALVASPTNPAEVAAHELLAAHDWVHPDEAEMIVALGGDGFMLQTLHMLLEKHRN
LPVFGMNLGTIGFLMNEWRPDGLDARLARARPFRVTPLVMTATTVEGDTHVLPAINEVSL
LRETRQTAKLEVTVNDRIVLPELVCDGILVATPAGSTAYNLSAHGPILPLGSQMLALTPI
SPFRPRRWRGAILPEKTRISLQVLDPGKRPVSAVADQREVRDVARVDIEIDPKRDLTLLF
DPEHALDDRITMEQFVA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory