SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_4061 Ga0059261_4061 Transcriptional regulator/sugar kinase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1xc3A Structure of a putative fructokinase from bacillus subtilis (see paper)
36% identity, 95% coverage: 10:286/291 of query aligns to 6:288/295 of 1xc3A

query
sites
1xc3A
I
 
I
E
 
E
T
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
K
 
K
L
 
F
L
 
V
A
 
C
R
 
A
L
 
V
V
 
G
R
 
R
D
 
E
E
 
D
G
 
G
-
 
T
V
 
I
V
 
I
A
 
D
E
 
R
A
 
I
R
 
E
W
 
F
P
 
P
T
 
T
T
 
K
S
 
M
P
 
P
E
 
D
A
 
E
A
 
T
E
 
I
A
 
E
A
 
K
L
 
V
L
 
I
A
 
Q
F
 
Y
A
 
F
G
 
S
R
 
Q
T
 
F
P
 
S
L
 
L
A
 
Q
G
 
A
V
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
G
A
 
S
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
D
V
 
N
D
 
D
P
 
K
A
 
T
A
 
S
A
 
Q
N
 
T
Y
 
Y
G
 
G
E
 
T
V
 
I
L
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
K
 
K
P
 
A
G
 
G
W
 
W
T
 
R
G
 
H
A
 
Y
N
 
P
L
 
F
R
 
L
A
 
Q
A
 
T
L
 
V
E
 
K
Q
 
N
A
 
E
L
 
M
G
 
K
V
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
G
I
 
F
D
 
S
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
G
E
 
E
A
 
F
A
 
L
A
 
F
G
 
G
A
 
E
G
 
A
Q
 
K
G
 
G
C
 
L
S
 
D
S
 
S
L
 
C
A
 
L
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
A
A
 
I
R
 
V
D
 
E
G
 
G
R
 
R
T
 
L
L
 
L
T
 
Q
G
 
G
A
 
L
L
 
S
H
 
H
P
 
P
E
 
E
M
 
M
G
 
G
H
|
H
V
 
I
P
 
Y
V
 
I
L
 
R
R
 
R
F
 
H
E
 
P
G
 
D
D
 
D
P
 
V
T
 
Y
P
 
Q
S
 
G
A
 
K
C
|
C
P
 
P
F
 
Y
H
|
H
S
 
G
G
 
D
C
|
C
A
 
F
E
 
E
G
 
G
M
 
L
A
 
A
A
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
V
 
I
Q
 
E
R
 
A
R
 
R
L
 
W
G
 
G
G
 
K
K
 
K
L
 
A
L
 
A
E
 
D
D
 
L
S
 
S
P
 
-
A
 
-
D
 
D
F
 
I
A
 
A
A
 
Q
V
 
V
A
 
W
D
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
Y
Y
 
Y
L
 
I
G
 
A
Q
 
Q
L
 
A
F
 
L
A
 
A
T
 
Q
I
 
Y
V
 
I
L
 
L
A
 
I
W
 
L
S
 
A
P
 
P
H
 
K
R
 
K
I
 
I
V
 
I
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
V
M
 
M
D
 
Q
V
 
Q
P
 
K
G
 
Q
L
 
V
G
 
F
K
 
S
A
 
Y
A
 
I
T
 
Y
V
 
Q
R
 
Y
M
 
V
R
 
P
V
 
K
A
 
I
L
 
M
G
 
N
G
 
S
Y
 
Y
G
 
L
V
 
D
G
 
F
S
 
S
A
 
E
V
 
L
G
 
S
E
 
D
-
 
D
-
 
I
A
 
S
D
 
D
F
 
Y
I
 
I
R
 
V
S
 
P
A
 
P
A
 
R
L
 
L
-
 
G
E
 
S
H
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
I
E
 
I
G
 
G
A
 
T
L
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
H
Q
 
Q
A
 
A

3lm9A Crystal structure of fructokinase with adp and fructose bound in the active site (see paper)
36% identity, 95% coverage: 10:286/291 of query aligns to 6:288/294 of 3lm9A

query
sites
3lm9A
I
 
I
E
 
E
T
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
K
 
K
L
 
F
L
 
V
A
 
C
R
 
A
L
 
V
V
 
G
R
 
R
D
 
E
E
 
D
G
 
G
-
 
T
V
 
I
V
 
I
A
 
D
E
 
R
A
 
I
R
 
E
W
 
F
P
 
P
T
 
T
T
 
K
S
 
M
P
 
P
E
 
D
A
 
E
A
 
T
E
 
I
A
 
E
A
 
K
L
 
V
L
 
I
A
 
Q
F
 
Y
A
 
F
G
 
S
R
 
Q
T
 
F
P
 
S
L
 
L
A
 
Q
G
 
A
V
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
G
A
 
S
F
 
F
G
|
G
P
 
P
V
 
V
V
 
D
V
 
N
D
 
D
P
 
K
A
 
T
A
 
S
A
 
Q
N
 
T
Y
 
Y
G
 
G
E
 
T
V
 
I
L
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
K
 
K
P
 
A
G
 
G
W
 
W
T
 
R
G
 
H
A
 
Y
N
 
P
L
 
F
R
 
L
A
 
Q
A
 
T
L
 
V
E
 
K
Q
 
N
A
 
E
L
 
M
G
 
K
V
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
G
I
 
F
D
 
S
T
 
T
D
|
D
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
G
E
 
E
A
 
F
A
 
L
A
 
F
G
 
G
A
 
E
G
 
A
Q
 
K
G
 
G
C
 
L
S
 
D
S
 
S
L
 
C
A
 
L
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
V
 
I
G
|
G
T
|
T
G
 
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
A
A
 
I
R
 
V
D
 
E
G
 
G
R
 
R
T
 
L
L
 
L
T
 
Q
G
 
G
A
 
L
L
 
S
H
 
H
P
 
P
E
|
E
M
 
M
G
 
G
H
|
H
V
 
I
P
 
Y
V
 
I
L
 
R
R
 
R
F
 
H
E
 
P
G
 
D
D
 
D
P
 
V
T
 
Y
P
 
Q
S
 
G
A
 
K
C
|
C
P
 
P
F
 
Y
H
|
H
S
 
G
G
 
D
C
|
C
A
 
F
E
|
E
G
 
G
M
 
L
A
 
A
A
 
S
G
|
G
P
|
P
A
 
A
V
 
I
Q
x
E
R
 
A
R
 
R
L
 
W
G
 
G
G
 
K
K
 
K
L
x
A
L
 
A
E
 
D
D
 
L
S
 
S
P
 
-
A
 
-
D
 
D
F
 
I
A
 
A
A
 
Q
V
 
V
A
 
W
D
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
Y
Y
 
Y
L
 
I
G
 
A
Q
 
Q
L
 
A
F
 
L
A
 
A
T
 
Q
I
 
Y
V
 
I
L
 
L
A
 
I
W
 
L
S
 
A
P
 
P
H
 
K
R
 
K
I
 
I
V
 
I
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
|
G
V
 
V
M
 
M
D
 
Q
V
 
Q
P
 
K
G
 
Q
L
 
V
G
 
F
K
 
S
A
 
Y
A
 
I
T
 
Y
V
 
Q
R
 
Y
M
 
V
R
 
P
V
 
K
A
 
I
L
 
M
G
 
N
G
 
S
Y
 
Y
G
 
L
V
 
D
G
 
F
S
 
S
A
 
E
V
 
L
G
 
S
E
 
D
-
 
D
-
 
I
A
 
S
D
 
D
F
 
Y
I
 
I
R
 
V
S
 
P
A
 
P
A
 
R
L
 
L
-
 
G
E
 
S
H
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
I
E
 
I
G
 
G
A
 
T
L
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
H
Q
 
Q
A
 
A

1z05A Crystal structure of the rok family transcriptional regulator, homolog of e.Coli mlc protein.
26% identity, 55% coverage: 75:233/291 of query aligns to 152:334/396 of 1z05A

query
sites
1z05A
G
 
G
E
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
Q
T
 
M
P
 
P
K
 
H
P
 
Y
G
 
N
W
 
V
T
 
K
G
 
N
A
 
L
N
 
A
L
 
L
R
 
G
A
 
P
A
 
E
L
 
I
E
 
Y
Q
 
K
A
 
A
L
 
T
G
 
G
V
 
L
P
 
P
V
 
V
A
 
F
I
 
V
D
 
A
T
 
N
D
 
D
V
 
T
N
 
R
A
 
A
A
 
W
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
K
A
 
L
A
 
F
G
 
G
A
 
H
G
 
S
Q
 
Q
G
 
D
C
 
V
S
 
D
S
 
N
L
 
S
A
 
V
Y
 
L
V
 
I
T
 
S
V
 
I
G
 
H
T
 
H
G
 
G
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
V
R
 
L
D
 
D
G
 
G
R
 
R
T
 
V
L
 
L
T
 
Q
G
 
G
A
 
R
L
 
-
H
 
H
-
 
G
-
 
N
-
 
I
P
 
G
E
 
E
M
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
I
P
 
Q
V
 
I
L
 
-
R
 
-
F
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
D
P
 
P
T
 
Q
P
 
G
S
 
K
A
 
R
C
|
C
P
 
H
F
x
C
-
 
G
H
 
N
S
 
Y
G
 
G
C
|
C
A
 
L
E
 
E
G
 
T
M
 
V
A
 
A
A
 
S
G
 
S
P
 
Q
A
 
A
V
 
I
Q
 
R
R
 
D
R
 
Q
L
 
V
G
 
T
G
 
A
K
 
R
L
 
I
L
 
Q
E
 
A
D
 
G
S
 
E
P
 
P
A
 
S
D
 
C
F
 
L
A
 
A
A
 
T
V
 
V
A
 
E
D
 
E
-
 
I
-
 
S
-
 
I
-
 
E
-
 
D
-
 
I
-
 
C
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
D
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
I
-
 
Q
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
R
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
A
L
 
A
F
 
I
A
 
A
T
 
I
I
 
V
V
 
I
L
 
N
A
 
L
W
 
F
S
 
N
P
 
P
H
 
E
R
 
K
I
 
I
V
 
L
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
V
V
 
I

2yi1A Crystal structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetyl mannosamine 6-phosphate and adp. (see paper)
33% identity, 66% coverage: 8:199/291 of query aligns to 6:201/308 of 2yi1A

query
sites
2yi1A
L
 
L
A
 
A
I
 
V
E
 
D
T
 
L
G
|
G
G
|
G
T
|
T
K
x
N
L
 
L
L
x
R
A
 
V
R
 
A
L
 
I
V
 
V
R
 
S
D
 
M
E
 
K
G
 
G
V
 
E
V
 
I
A
 
V
E
 
K
A
 
K
R
 
Y
W
 
T
-
 
Q
-
 
F
-
 
N
P
 
P
T
 
K
T
 
T
S
 
Y
P
 
E
E
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
Q
-
 
M
A
 
C
A
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
A
L
 
E
A
 
A
F
 
V
A
 
K
G
 
L
R
 
N
T
 
C
P
 
R
L
 
I
A
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
S
A
 
T
F
x
G
G
|
G
P
x
R
V
 
V
V
 
-
V
 
-
D
 
N
P
 
P
A
 
R
A
 
E
A
 
-
N
 
-
Y
 
-
G
 
G
E
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
H
T
x
S
P
x
T
K
 
K
-
x
L
-
 
I
P
 
Q
G
 
E
W
 
W
T
 
N
G
 
S
A
 
V
N
 
D
L
 
L
R
 
R
A
 
T
A
 
P
L
 
L
E
 
S
Q
 
D
A
 
T
L
 
L
G
 
H
V
 
L
P
 
P
V
 
V
A
 
W
I
 
V
D
 
D
T
x
N
D
|
D
V
 
G
N
|
N
A
 
C
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
R
A
 
K
A
 
F
G
 
G
A
 
Q
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
C
 
L
S
 
E
S
 
N
L
 
F
A
 
V
Y
 
T
V
 
L
T
 
I
V
 
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
x
G
G
 
G
L
 
I
A
 
I
R
 
H
D
 
Q
G
 
H
R
 
E
T
 
L
L
 
I
T
 
H
G
 
G
A
 
S
-
 
S
-
 
F
L
 
C
H
 
A
P
x
A
E
|
E
M
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
L
P
 
V
V
 
V
L
 
-
R
 
-
F
 
-
E
 
S
G
 
L
D
 
D
P
 
G
T
 
P
P
 
D
S
x
C
A
 
S
C
|
C
P
 
G
F
 
S
H
 
H
S
 
-
G
 
G
C
|
C
A
 
I
E
|
E
G
 
A
M
 
Y
A
 
A
A
 
S
G
|
G
P
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
R
 
R
R
 
E
L
 
-
G
 
-
G
 
A
K
 
K
L
 
K
L
 
L
E
 
H
D
 
D

Sites not aligning to the query:

2yhyA Structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetylmannosamine and adp (see paper)
33% identity, 66% coverage: 8:199/291 of query aligns to 6:201/308 of 2yhyA

query
sites
2yhyA
L
 
L
A
 
A
I
 
V
E
 
D
T
 
L
G
|
G
G
|
G
T
|
T
K
x
N
L
 
L
L
x
R
A
 
V
R
 
A
L
 
I
V
 
V
R
 
S
D
 
M
E
 
K
G
 
G
V
 
E
V
 
I
A
 
V
E
 
K
A
 
K
R
 
Y
W
 
T
-
 
Q
-
 
F
-
 
N
P
 
P
T
 
K
T
 
T
S
 
Y
P
 
E
E
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
Q
-
 
M
A
 
C
A
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
A
L
 
E
A
 
A
F
 
V
A
 
K
G
 
L
R
 
N
T
 
C
P
 
R
L
 
I
A
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
S
A
 
T
F
 
G
G
 
G
P
 
R
V
 
V
V
 
-
V
 
-
D
 
N
P
 
P
A
 
R
A
 
E
A
 
-
N
 
-
Y
 
-
G
 
G
E
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
H
T
 
S
P
 
T
K
 
K
-
 
L
-
 
I
P
 
Q
G
 
E
W
 
W
T
 
N
G
 
S
A
 
V
N
 
D
L
 
L
R
 
R
A
 
T
A
 
P
L
 
L
E
 
S
Q
 
D
A
 
T
L
 
L
G
 
H
V
 
L
P
 
P
V
 
V
A
 
W
I
 
V
D
 
D
T
x
N
D
 
D
V
 
G
N
|
N
A
 
C
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
R
A
 
K
A
 
F
G
 
G
A
 
Q
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
C
 
L
S
 
E
S
 
N
L
 
F
A
 
V
Y
 
T
V
 
L
T
 
I
V
 
T
G
 
G
T
|
T
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
x
G
G
 
G
L
 
I
A
 
I
R
 
H
D
 
Q
G
 
H
R
 
E
T
 
L
L
 
I
T
 
H
G
 
G
A
 
S
-
 
S
-
 
F
L
 
C
H
 
A
P
x
A
E
 
E
M
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
L
P
 
V
V
 
V
L
 
-
R
 
-
F
 
-
E
 
S
G
 
L
D
 
D
P
 
G
T
 
P
P
 
D
S
x
C
A
 
S
C
|
C
P
 
G
F
 
S
H
 
H
S
 
-
G
 
G
C
|
C
A
 
I
E
 
E
G
 
A
M
 
Y
A
 
A
A
 
S
G
|
G
P
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
R
 
R
R
 
E
L
 
-
G
 
-
G
 
A
K
 
K
L
 
K
L
 
L
E
 
H
D
 
D

Sites not aligning to the query:

Q9Y223 Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase; UDP-GlcNAc-2-epimerase/ManAc kinase; EC 3.2.1.183; EC 2.7.1.60 from Homo sapiens (Human) (see 18 papers)
33% identity, 66% coverage: 8:200/291 of query aligns to 410:606/722 of Q9Y223

query
sites
Q9Y223
L
 
L
A
 
A
I
 
V
E
x
D
T
 
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
K
x
N
L
 
L
L
x
R
A
 
V
R
 
A
L
 
I
V
 
V
R
 
S
D
 
M
E
 
K
G
 
G
V
 
E
V
 
I
A
 
V
E
 
K
A
 
K
R
 
Y
W
 
T
-
 
Q
-
 
F
-
 
N
P
 
P
T
 
K
T
 
T
S
 
Y
P
 
E
E
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
Q
-
 
M
A
 
C
A
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
A
L
 
E
A
 
A
F
 
V
A
 
K
G
 
L
R
 
N
T
 
C
P
 
R
L
 
I
A
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
|
I
A
 
S
A
 
T
F
 
G
G
|
G
P
x
R
V
 
V
V
 
-
V
 
-
D
 
N
P
 
P
A
 
R
A
 
E
A
 
-
N
 
-
Y
 
-
G
 
G
E
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
H
T
 
S
P
x
T
K
 
K
-
 
L
-
 
I
P
 
Q
G
 
E
W
 
W
T
 
N
G
 
S
A
 
V
N
 
D
L
 
L
R
 
R
A
 
T
A
 
P
L
 
L
E
 
S
Q
 
D
A
 
T
L
 
L
G
 
H
V
 
L
P
 
P
V
 
V
A
 
W
I
 
V
D
 
D
T
x
N
D
|
D
V
 
G
N
|
N
A
 
C
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
|
A
E
 
E
A
 
R
A
 
K
A
x
F
G
 
G
A
 
Q
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
C
 
L
S
 
E
S
 
N
L
 
F
A
 
V
Y
 
T
V
 
L
T
 
I
V
 
T
G
 
G
T
 
T
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
L
 
I
A
 
I
R
 
H
D
 
Q
G
 
H
R
 
E
T
 
L
L
 
I
T
 
H
G
 
G
A
 
S
L
 
S
H
 
F
-
 
C
-
 
A
P
 
A
E
|
E
M
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
L
P
 
V
V
|
V
L
 
-
R
 
-
F
 
-
E
 
S
G
 
L
D
 
D
P
x
G
T
 
P
P
 
D
S
x
C
A
 
S
C
|
C
P
 
G
F
 
S
H
 
H
S
 
-
G
 
G
C
|
C
A
x
I
E
|
E
G
 
A
M
 
Y
A
 
A
A
 
S
G
 
G
P
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
R
 
R
R
 
E
L
 
-
G
 
-
G
 
A
K
 
K
L
 
K
L
 
L
E
 
H
D
 
D
S
 
E

Sites not aligning to the query:

7p9pAAA Ubiquitin-like protein SMT3,N-acetyl-D-glucosamine kinase
27% identity, 79% coverage: 7:235/291 of query aligns to 4:260/304 of 7p9pAAA

query
sites
7p9pAAA
W
 
Y
L
 
Y
A
 
G
I
 
F
E
 
D
T
 
I
G
 
G
G
|
G
T
|
T
K
|
K
L
 
I
L
 
E
A
 
F
R
 
G
L
 
A
V
 
F
R
 
-
D
 
D
E
 
A
G
 
D
V
 
L
V
 
V
A
 
R
E
 
V
A
 
A
R
 
R
W
 
E
P
 
R
T
 
V
T
 
A
S
 
T
P
 
P
E
 
T
A
 
E
A
 
S
E
 
Y
A
 
A
A
 
A
L
 
F
L
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
V
-
 
N
-
 
N
-
 
A
-
 
D
A
 
A
F
 
E
A
 
F
G
 
G
R
 
V
T
 
K
P
 
G
L
 
T
A
 
V
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
P
 
P
V
 
G
V
 
I
V
 
A
D
 
D
P
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
V
N
 
E
Y
 
T
G
 
G
E
 
K
V
 
L
L
 
L
A
 
T
T
 
S
P
 
N
K
 
I
P
 
P
G
 
A
W
 
A
T
 
M
G
 
G
A
 
H
N
 
T
L
 
L
R
 
Q
A
 
R
A
 
D
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
A
 
R
L
 
L
G
 
Q
V
 
R
P
 
P
V
 
V
A
 
K
I
 
I
D
 
E
T
 
N
D
 
D
V
 
A
N
 
N
A
 
C
A
 
F
A
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
E
A
 
A
A
 
W
A
 
D
G
 
E
A
 
D
G
 
L
Q
 
R
G
 
G
C
 
E
S
 
P
S
 
S
L
 
V
A
 
L
Y
 
G
V
 
L
T
 
I
V
 
L
G
|
G
T
|
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
I
R
 
F
D
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
V
L
 
H
T
 
S
G
 
G
-
 
R
-
 
A
A
 
N
L
 
I
H
 
A
P
 
G
E
 
E
M
 
I
G
 
G
H
|
H
-
 
T
-
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
Y
-
 
D
-
 
A
V
 
L
P
 
K
V
 
L
L
 
L
R
 
G
F
 
M
E
 
E
G
 
N
D
 
A
P
 
P
T
 
I
-
 
F
P
 
P
S
x
C
A
 
G
C
|
C
P
 
K
F
 
-
H
 
N
S
 
S
G
 
G
C
|
C
A
 
I
E
 
D
G
 
N
M
 
Y
A
 
L
A
 
S
G
|
G
P
 
R
A
 
G
V
 
F
Q
x
E
R
 
Q
R
 
L
L
 
Y
G
 
D
G
 
H
K
 
Y
L
 
F
L
 
S
E
 
E
D
 
K
S
 
L
P
 
S
A
|
A
D
 
P
F
 
-
A
x
E
A
 
I
V
 
I
A
 
A
D
x
H
Y
 
Y
-
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
V
-
 
Q
-
 
H
-
 
V
-
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
M
-
 
E
-
 
L
L
 
L
G
 
A
Q
 
I
L
 
C
F
 
L
A
 
A
T
 
N
I
 
I
V
 
F
L
 
T
A
 
C
W
 
L
S
 
D
P
 
P
H
 
H
R
 
V
I
 
V
V
 
V
V
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
V
 
L
M
 
S
D
x
N

7p9lAAA Ubiquitin-like protein SMT3,N-acetyl-D-glucosamine kinase
27% identity, 79% coverage: 7:235/291 of query aligns to 3:259/303 of 7p9lAAA

query
sites
7p9lAAA
W
 
Y
L
 
Y
A
 
G
I
 
F
E
 
D
T
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
T
K
 
K
L
 
I
L
 
E
A
 
F
R
 
G
L
 
A
V
 
F
R
 
-
D
 
D
E
 
A
G
 
D
V
 
L
V
 
V
A
 
R
E
 
V
A
 
A
R
 
R
W
 
E
P
 
R
T
 
V
T
 
A
S
 
T
P
 
P
E
 
T
A
 
E
A
 
S
E
 
Y
A
 
A
A
 
A
L
 
F
L
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
V
-
 
N
-
 
N
-
 
A
-
 
D
A
 
A
F
 
E
A
 
F
G
 
G
R
 
V
T
 
K
P
 
G
L
 
T
A
 
V
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
P
|
P
V
x
G
V
 
I
V
 
A
D
 
D
P
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
V
N
 
E
Y
 
T
G
 
G
E
 
K
V
 
L
L
 
L
A
 
T
T
x
S
P
 
N
K
 
I
P
 
P
G
 
A
W
 
A
T
 
M
G
 
G
A
 
H
N
 
T
L
 
L
R
 
Q
A
 
R
A
 
D
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
A
 
R
L
 
L
G
 
Q
V
 
R
P
 
P
V
 
V
A
 
K
I
 
I
D
 
E
T
x
N
D
|
D
V
 
A
N
 
N
A
 
C
A
 
F
A
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
E
A
 
A
A
 
W
A
 
D
G
 
E
A
 
D
G
 
L
Q
 
R
G
 
G
C
 
E
S
 
P
S
 
S
L
 
V
A
 
L
Y
 
G
V
 
L
T
 
I
V
 
L
G
|
G
T
|
T
G
|
G
I
x
V
G
|
G
A
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
I
R
 
F
D
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
V
L
 
H
T
 
S
G
 
G
-
 
R
-
 
A
A
 
N
L
 
I
H
 
A
P
 
G
E
|
E
M
 
I
G
 
G
H
|
H
-
 
T
-
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
Y
-
 
D
-
 
A
V
 
L
P
 
K
V
 
L
L
 
L
R
 
G
F
 
M
E
 
E
G
 
N
D
 
A
P
 
P
T
 
I
-
 
F
P
 
P
S
x
C
A
 
G
C
|
C
P
 
K
F
 
-
H
 
N
S
 
S
G
 
G
C
|
C
A
 
I
E
x
D
G
 
N
M
 
Y
A
 
L
A
 
S
G
 
G
P
 
R
A
 
G
V
 
F
Q
 
E
R
 
Q
R
 
L
L
 
Y
G
 
D
G
 
H
K
 
Y
L
 
F
L
 
S
E
 
E
D
 
K
S
 
L
P
 
S
A
 
A
D
 
P
F
 
-
A
x
E
A
 
I
V
 
I
A
 
A
D
x
H
Y
 
Y
-
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
V
-
 
Q
-
 
H
-
 
V
-
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
M
-
 
E
-
 
L
L
 
L
G
 
A
Q
 
I
L
 
C
F
 
L
A
 
A
T
 
N
I
 
I
V
 
F
L
 
T
A
 
C
W
 
L
S
 
D
P
 
P
H
 
H
R
 
V
I
 
V
V
 
V
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
L
M
 
S
D
 
N

O35826 Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase; UDP-GlcNAc-2-epimerase/ManAc kinase; EC 3.2.1.183; EC 2.7.1.60 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
33% identity, 66% coverage: 8:200/291 of query aligns to 410:606/722 of O35826

query
sites
O35826
L
|
L
A
|
A
I
x
V
E
x
D
T
x
L
G
|
G
G
|
G
T
|
T
K
x
N
L
|
L
L
x
R
A
x
V
R
x
A
L
x
I
V
|
V
R
x
S
D
x
M
E
x
K
G
|
G
V
x
E
V
x
I
A
x
V
E
x
K
A
x
K
R
x
Y
W
x
T
-
x
Q
-
x
F
-
x
N
P
|
P
T
x
K
T
|
T
S
x
Y
P
x
E
E
|
E
-
x
R
-
x
I
-
x
S
-
x
L
-
x
I
-
x
L
-
x
Q
-
x
M
A
x
C
A
x
V
E
|
E
A
|
A
A
|
A
L
x
A
L
x
E
A
|
A
F
x
V
A
x
K
G
x
L
R
x
N
T
x
C
P
x
R
L
x
I
A
x
L
G
|
G
V
|
V
G
|
G
I
|
I
A
x
S
A
x
T
F
x
G
G
|
G
P
x
R
V
 
-
V
 
-
V
|
V
D
x
N
P
|
P
A
x
Q
A
x
E
A
 
-
N
 
-
Y
 
-
G
|
G
E
x
V
V
|
V
L
|
L
A
x
H
T
x
S
P
x
T
K
|
K
-
x
L
-
x
I
P
x
Q
G
x
E
W
|
W
T
x
N
G
x
S
A
x
V
N
x
D
L
|
L
R
|
R
A
x
T
A
x
P
L
|
L
E
x
S
Q
x
D
A
x
T
L
|
L
G
x
H
V
x
L
P
|
P
V
|
V
A
x
W
I
x
V
D
|
D
T
x
N
D
|
D
V
x
G
N
|
N
A
x
C
A
|
A
A
|
A
L
x
M
A
|
A
E
|
E
A
x
R
A
x
K
A
x
F
G
|
G
A
x
Q
G
|
G
Q
x
K
G
|
G
C
x
Q
S
x
E
S
x
N
L
x
F
A
x
V
Y
x
T
V
x
L
T
x
I
V
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
I
|
I
G
|
G
A
x
G
G
|
G
L
x
I
A
x
I
R
x
H
D
x
Q
G
x
H
R
x
E
T
x
L
L
x
I
T
x
H
G
|
G
A
x
S
L
x
S
H
x
F
-
x
C
-
x
A
P
x
A
E
|
E
M
x
L
G
|
G
H
|
H
V
x
L
P
x
V
V
|
V
L
 
-
R
 
-
F
 
-
E
x
S
G
x
L
D
|
D
P
x
G
T
x
P
P
x
D
S
x
C
A
x
S
C
|
C
P
x
G
F
x
S
H
|
H
S
 
-
G
|
G
C
|
C
A
x
I
E
|
E
G
x
A
M
x
Y
A
|
A
A
x
S
G
|
G
P
x
M
A
|
A
V
x
L
Q
|
Q
R
|
R
R
x
E
L
 
-
G
 
-
G
x
A
K
|
K
L
x
K
L
|
L
E
x
H
D
|
D
S
x
E

Sites not aligning to the query:

7p7wBBB Ubiquitin-like protein SMT3,N-acetyl-D-glucosamine kinase
26% identity, 79% coverage: 7:236/291 of query aligns to 6:263/306 of 7p7wBBB

query
sites
7p7wBBB
W
 
Y
L
 
Y
A
 
G
I
 
F
E
 
D
T
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
T
K
 
K
L
 
I
L
 
E
A
 
F
R
 
G
L
 
A
V
 
F
R
 
-
D
 
D
E
 
A
G
 
D
V
 
L
V
 
V
A
 
R
E
 
V
A
 
A
R
 
R
W
 
E
P
 
R
T
 
V
T
 
A
S
 
T
P
 
P
E
 
T
A
 
E
A
 
S
E
 
Y
A
 
A
A
 
A
L
 
F
L
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
V
-
 
N
-
 
N
-
 
A
-
 
D
A
 
A
F
 
E
A
 
F
G
 
G
R
 
V
T
 
K
P
 
G
L
 
T
A
 
V
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
P
 
P
V
 
G
V
 
I
V
 
A
D
 
D
P
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
V
N
 
E
Y
 
T
G
 
G
E
 
K
V
 
L
L
 
L
A
 
T
T
 
S
P
 
N
K
 
I
P
 
P
G
 
A
W
 
A
T
 
M
G
 
G
A
 
H
N
 
T
L
 
L
R
 
Q
A
 
R
A
 
D
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
A
 
R
L
 
L
G
 
Q
V
 
R
P
 
P
V
 
V
A
 
K
I
 
I
D
 
E
T
 
N
D
 
D
V
 
A
N
 
N
A
 
C
A
 
F
A
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
E
A
 
A
A
 
W
A
 
D
G
 
E
A
 
D
G
 
L
Q
 
R
G
 
G
C
 
E
S
 
P
S
 
S
L
 
V
A
 
L
Y
 
G
V
 
L
T
 
I
V
 
L
G
|
G
T
|
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
I
R
 
F
D
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
V
L
 
H
T
 
S
G
 
G
-
 
R
-
 
A
A
 
N
L
 
I
H
 
A
P
 
G
E
 
E
M
 
I
G
 
G
H
|
H
-
 
T
-
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
Y
-
 
D
-
 
A
V
 
L
P
 
K
V
 
L
L
 
L
R
 
G
F
 
M
E
 
E
G
 
N
D
 
A
P
 
P
T
 
I
-
 
F
P
 
P
S
x
C
A
 
G
C
|
C
P
 
K
F
 
-
H
 
N
S
 
S
G
 
G
C
|
C
A
 
I
E
 
D
G
 
N
M
 
Y
A
 
L
A
 
S
G
|
G
P
 
R
A
 
G
V
 
F
Q
x
E
R
 
Q
R
 
L
L
 
Y
G
 
D
G
 
H
K
 
Y
L
 
F
L
 
S
E
 
E
D
 
K
S
 
L
P
 
S
A
 
A
D
 
P
F
 
-
A
 
E
A
 
I
V
 
I
A
 
A
D
 
H
Y
 
Y
-
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
V
-
 
Q
-
 
H
-
 
V
-
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
M
-
 
E
-
 
L
L
 
L
G
 
A
Q
 
I
L
 
C
F
 
L
A
 
A
T
 
N
I
 
I
V
 
F
L
 
T
A
 
C
W
 
L
S
 
D
P
 
P
H
 
H
R
 
V
I
 
V
V
 
V
V
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
V
 
L
M
 
S
D
x
N
V
 
F

2qm1B Crystal structure of glucokinase from enterococcus faecalis
25% identity, 79% coverage: 5:233/291 of query aligns to 6:272/325 of 2qm1B

query
sites
2qm1B
R
 
K
T
 
K
W
 
I
L
 
I
A
 
G
I
 
I
E
 
D
T
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
K
 
T
L
 
I
L
 
K
A
 
F
R
 
A
L
 
I
V
 
L
R
 
T
D
 
T
E
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
Q
E
 
Q
A
 
-
R
 
K
W
 
W
P
 
S
T
 
I
T
 
E
S
 
T
-
 
N
-
 
I
-
 
L
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
H
-
 
I
-
 
V
P
 
P
E
 
S
A
 
I
A
 
I
E
 
E
A
 
S
A
 
I
L
 
R
-
 
H
-
 
R
-
 
I
-
 
D
L
 
L
A
 
Y
F
 
N
A
 
M
G
 
K
R
 
K
T
 
E
P
 
D
L
 
F
A
 
V
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
M
A
 
G
A
 
T
F
 
P
G
 
G
P
 
S
V
 
V
V
 
D
V
 
I
D
 
E
P
 
K
A
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
Y
 
-
G
 
G
E
 
T
V
 
V
L
 
V
A
 
G
T
 
A
P
 
Y
K
 
N
P
 
L
G
 
N
W
 
W
T
 
T
G
 
T
A
 
V
N
 
Q
-
 
P
L
 
V
R
 
K
A
 
E
A
 
Q
L
 
I
E
 
E
Q
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
F
A
 
A
I
 
L
D
 
D
T
x
N
D
 
D
V
 
A
N
|
N
A
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
G
E
 
E
A
 
R
A
 
W
A
 
K
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
G
 
N
C
 
N
S
 
P
S
 
D
L
 
V
A
 
I
Y
 
F
V
 
I
T
 
T
V
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
A
x
G
G
 
G
L
 
I
A
 
V
R
 
A
D
 
A
G
 
G
R
 
K
T
 
L
L
 
L
T
 
H
G
 
G
A
 
V
-
 
A
-
 
G
L
 
C
H
 
A
P
 
G
E
 
E
M
 
V
G
 
G
H
|
H
V
 
V
P
 
T
V
 
V
L
 
-
R
 
-
F
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
D
P
 
P
T
 
N
P
 
G
S
 
F
A
 
D
C
|
C
P
 
T
F
x
C
-
 
G
H
 
K
S
 
R
G
 
G
C
|
C
A
 
L
E
 
E
G
 
T
M
 
V
A
 
S
A
 
S
G
 
A
P
 
T
A
 
G
V
 
V
-
 
V
-
 
R
-
 
V
Q
 
A
R
 
R
R
 
H
L
 
L
G
 
S
G
 
E
K
 
E
L
 
F
L
 
A
E
 
G
D
 
D
S
 
S
P
 
E
A
 
L
-
 
K
-
 
Q
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
D
-
 
V
-
 
S
-
 
S
-
 
K
-
 
D
-
 
V
-
 
F
D
 
E
F
 
F
A
 
A
A
 
E
V
 
K
A
 
G
D
 
D
Y
 
H
L
 
F
G
 
A
Q
 
L
L
 
M
F
 
V
A
 
V
T
 
D
I
 
R
V
 
V
L
 
C
A
 
F
W
 
Y
-
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
N
-
 
L
-
 
G
-
 
N
-
 
T
-
 
L
S
 
N
P
 
P
H
 
D
R
 
S
I
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
V

2yhwA High-resolution crystal structures of n-acetylmannosamine kinase: insights about substrate specificity, activity and inhibitor modelling. (see paper)
34% identity, 66% coverage: 8:199/291 of query aligns to 6:201/309 of 2yhwA

query
sites
2yhwA
L
 
L
A
 
A
I
 
V
E
 
D
T
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
K
 
N
L
 
L
L
 
R
A
 
V
R
 
A
L
 
I
V
 
V
R
 
S
D
 
M
E
 
K
G
 
G
V
 
E
V
 
I
A
 
V
E
 
K
A
 
K
R
 
Y
W
 
T
-
 
Q
-
 
F
-
 
N
P
 
P
T
 
K
T
 
T
S
 
Y
P
 
E
E
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
Q
-
 
M
A
 
C
A
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
A
L
 
E
A
 
A
F
 
V
A
 
K
G
 
L
R
 
N
T
 
C
P
 
R
L
 
I
A
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
S
A
 
T
F
 
G
G
 
G
P
 
R
V
 
V
V
 
-
V
 
-
D
 
N
P
 
P
A
 
R
A
 
E
A
 
-
N
 
-
Y
 
-
G
 
G
E
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
H
T
 
S
P
 
T
K
 
K
-
 
L
-
 
I
P
 
Q
G
 
E
W
 
W
T
 
N
G
 
S
A
 
V
N
 
D
L
 
L
R
 
R
A
 
T
A
 
P
L
 
L
E
 
S
Q
 
D
A
 
T
L
 
L
G
 
H
V
 
L
P
 
P
V
 
V
A
 
W
I
 
V
D
 
D
T
x
N
D
 
D
V
 
G
N
|
N
A
 
C
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
R
A
 
K
A
 
F
G
 
G
A
 
Q
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
C
 
L
S
 
E
S
 
N
L
 
F
A
 
V
Y
 
T
V
 
L
T
 
I
V
 
T
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
x
G
G
 
G
L
 
I
A
 
I
R
 
H
D
 
Q
G
 
H
R
 
E
T
 
L
L
 
I
T
 
H
G
 
G
A
 
S
-
 
S
-
 
F
L
 
C
H
 
A
P
x
A
E
 
E
M
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
L
P
 
-
V
 
V
L
 
V
R
 
S
F
 
L
E
 
N
G
 
G
D
 
-
P
 
P
T
 
D
P
x
C
S
 
S
A
 
-
C
|
C
P
 
G
F
 
S
H
 
H
S
 
-
G
 
G
C
|
C
A
 
I
E
 
E
G
 
A
M
 
Y
A
 
A
A
 
S
G
 
G
P
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
R
 
R
R
 
E
L
 
-
G
 
-
G
 
A
K
 
K
L
 
K
L
 
L
E
 
H
D
 
D

3vglA Crystal structure of a rok family glucokinase from streptomyces griseus in complex with glucose and amppnp (see paper)
34% identity, 63% coverage: 8:190/291 of query aligns to 4:185/312 of 3vglA

query
sites
3vglA
L
 
I
A
 
G
I
 
V
E
 
D
T
 
I
G
|
G
G
 
G
T
|
T
K
|
K
L
 
I
L
 
A
A
 
A
R
 
G
L
 
V
V
 
V
R
 
D
D
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
R
V
 
I
A
 
L
E
 
S
A
 
T
R
 
F
W
 
K
P
 
V
T
 
A
T
 
T
S
 
P
P
 
P
E
 
T
A
 
A
-
 
E
-
 
G
-
 
I
A
 
V
E
 
D
A
 
A
A
 
I
L
 
C
L
 
A
A
 
A
F
 
V
A
 
A
G
 
G
R
 
A
T
 
S
P
 
E
-
 
G
-
 
H
-
 
D
L
 
V
A
 
E
G
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
G
A
 
A
F
 
A
G
|
G
P
 
-
V
 
-
V
 
Y
V
 
V
D
 
D
P
 
D
A
 
K
A
 
R
A
 
A
N
 
T
Y
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
V
L
 
L
A
 
F
T
 
A
P
|
P
K
 
N
P
 
I
G
 
D
W
 
W
T
 
R
G
 
H
A
 
E
N
 
P
L
 
L
R
 
K
A
 
D
A
 
K
L
 
V
E
 
E
Q
 
Q
A
 
R
L
 
V
G
 
G
V
 
L
P
 
P
V
 
V
A
 
V
I
 
V
D
 
E
T
x
N
D
|
D
V
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
W
A
 
G
E
 
E
A
 
Y
A
 
R
A
 
F
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
-
 
H
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
I
C
 
C
S
 
I
S
 
T
L
 
L
A
x
G
Y
x
T
V
 
G
T
x
L
V
x
G
G
 
G
T
 
G
G
 
I
I
 
I
G
 
I
A
 
G
G
 
N
L
 
K
A
 
L
R
 
R
D
 
R
G
 
G
R
 
R
T
 
F
L
 
G
T
 
V
G
 
A
A
 
A
L
 
-
H
 
-
P
 
-
E
|
E
M
 
F
G
 
G
H
|
H
V
 
I
P
 
R
V
 
V
L
 
V
R
 
-
F
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
P
T
 
D
P
 
G
S
 
L
A
 
L
C
|
C
P
 
G
F
x
C
H
 
G
S
 
S
-
 
Q
G
 
G
C
|
C
A
 
W
E
|
E
G
 
Q
M
 
Y
A
 
A
A
 
S
G
|
G
P
 
R
A
 
A
V
 
L
Q
 
V
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3vgkB Crystal structure of a rok family glucokinase from streptomyces griseus (see paper)
34% identity, 63% coverage: 8:190/291 of query aligns to 4:185/312 of 3vgkB

query
sites
3vgkB
L
 
I
A
 
G
I
 
V
E
 
D
T
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
T
K
 
K
L
 
I
L
 
A
A
 
A
R
 
G
L
 
V
V
 
V
R
 
D
D
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
R
V
 
I
A
 
L
E
 
S
A
 
T
R
 
F
W
 
K
P
 
V
T
 
A
T
 
T
S
 
P
P
 
P
E
 
T
A
 
A
-
 
E
-
 
G
-
 
I
A
 
V
E
 
D
A
 
A
A
 
I
L
 
C
L
 
A
A
 
A
F
 
V
A
 
A
G
 
G
R
 
A
T
 
S
P
 
E
-
 
G
-
 
H
-
 
D
L
 
V
A
 
E
G
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
G
A
 
A
F
 
A
G
 
G
P
 
-
V
 
-
V
 
Y
V
 
V
D
 
D
P
 
D
A
 
K
A
 
R
A
 
A
N
 
T
Y
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
V
L
 
L
A
 
F
T
 
A
P
 
P
K
 
N
P
 
I
G
 
D
W
 
W
T
 
R
G
 
H
A
 
E
N
 
P
L
 
L
R
 
K
A
 
D
A
 
K
L
 
V
E
 
E
Q
 
Q
A
 
R
L
 
V
G
 
G
V
 
L
P
 
P
V
 
V
A
 
V
I
 
V
D
 
E
T
 
N
D
 
D
V
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
W
A
 
G
E
 
E
A
 
Y
A
 
R
A
 
F
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
-
 
H
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
I
C
 
C
S
 
I
S
 
T
L
 
L
A
 
G
Y
 
T
V
 
G
T
 
L
V
 
G
G
 
G
T
 
G
G
 
I
I
 
I
G
 
I
A
 
G
G
 
N
L
 
K
A
 
L
R
 
R
D
 
R
G
 
G
R
 
R
T
 
F
L
 
G
T
 
V
G
 
A
A
 
A
L
 
-
H
 
-
P
 
-
E
 
E
M
 
F
G
 
G
H
|
H
V
 
I
P
 
R
V
 
V
L
 
V
R
 
-
F
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
P
T
 
D
P
 
G
S
 
L
A
 
L
C
|
C
P
 
G
F
x
C
H
 
G
S
 
S
-
 
Q
G
 
G
C
|
C
A
 
W
E
 
E
G
 
Q
M
 
Y
A
 
A
A
 
S
G
 
G
P
 
R
A
 
A
V
 
L
Q
 
V
R
 
R

5f7rA Rok repressor lmo0178 from listeria monocytogenes bound to inducer (see paper)
25% identity, 70% coverage: 27:231/291 of query aligns to 24:252/306 of 5f7rA

query
sites
5f7rA
V
 
I
V
 
I
A
 
E
E
 
N
A
 
T
R
 
S
W
 
I
P
 
P
T
 
F
T
 
S
S
 
S
P
 
E
E
 
K
A
 
K
A
 
P
E
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
I
L
 
E
A
 
L
F
 
I
A
 
A
G
 
K
R
 
N
T
 
V
P
 
K
-
 
K
-
 
M
-
 
C
-
 
G
-
 
N
-
 
R
-
 
D
-
 
M
-
 
N
-
 
H
L
 
L
A
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
A
A
 
I
F
 
S
G
|
G
P
 
L
V
 
V
V
 
-
V
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
N
A
 
R
N
 
K
Y
 
K
G
 
G
E
 
T
V
 
V
L
 
I
A
 
R
T
 
S
P
 
T
K
 
M
P
 
L
G
 
G
W
 
W
T
 
E
G
 
N
A
 
V
N
 
A
L
 
L
R
 
E
A
 
A
A
 
M
L
 
L
E
 
H
Q
 
A
A
 
H
L
 
F
-
 
P
G
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
Y
I
 
V
D
 
D
T
 
K
D
x
N
V
 
I
N
 
N
A
 
C
A
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
L
A
 
W
A
 
L
G
 
G
A
 
E
G
 
G
Q
 
K
G
 
Q
C
 
S
S
 
N
S
 
N
L
 
F
A
 
A
Y
 
T
V
 
V
T
x
S
V
|
V
G
 
G
T
 
A
G
|
G
I
x
L
G
|
G
A
 
L
G
 
S
L
 
V
A
 
V
R
 
I
D
 
N
G
 
R
R
 
Q
T
 
I
L
 
Y
T
 
Y
G
 
G
A
 
A
L
 
Q
-
 
G
-
 
G
H
 
A
P
 
G
E
|
E
M
 
F
G
 
G
H
|
H
V
 
T
P
 
T
V
 
I
L
 
-
R
 
-
F
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
Q
P
 
P
T
 
G
P
 
G
S
 
Y
A
 
K
C
|
C
P
 
H
F
x
C
-
 
G
H
 
Q
S
 
K
G
 
G
C
|
C
A
 
L
E
|
E
G
 
-
M
 
M
A
 
Y
A
 
A
G
 
S
P
 
E
A
 
F
V
 
Y
Q
 
F
R
 
R
R
 
N
L
 
R
G
 
G
G
 
E
K
 
E
L
 
L
L
 
K
E
 
E
D
 
A
S
 
Y
P
 
P
A
 
L
D
 
N
-
 
D
-
 
F
-
 
H
F
 
F
A
 
D
A
 
K
V
 
V
A
 
A
-
 
K
-
 
S
-
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
M
-
 
A
-
 
T
-
 
E
-
 
L
-
 
M
-
 
G
-
 
K
-
 
M
-
 
G
D
 
E
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
Y
L
 
G
F
 
I
A
 
R
T
 
N
I
 
I
V
 
I
L
 
N
A
 
T
W
 
F
S
 
N
P
 
P
H
 
E
R
 
K
I
 
V
V
 
I
V
 
I
G
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P32718 D-allose kinase; Allokinase; EC 2.7.1.55 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
28% identity, 72% coverage: 77:285/291 of query aligns to 82:298/309 of P32718

query
sites
P32718
V
 
I
L
 
I
A
 
S
T
 
T
P
 
P
K
 
N
P
 
L
G
 
P
W
 
L
T
 
T
G
 
A
A
 
A
N
 
D
L
 
L
R
 
Y
A
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
D
A
 
K
L
 
L
E
 
E
Q
 
N
A
 
T
L
 
L
G
 
N
V
 
C
P
 
P
V
 
V
A
 
E
I
 
F
D
 
S
T
 
R
D
 
D
V
 
V
N
 
N
A
 
L
A
 
Q
A
 
L
L
 
S
A
 
W
E
 
D
A
 
V
A
 
V
A
 
E
G
 
N
A
 
R
-
 
L
G
 
T
Q
 
Q
G
 
Q
C
 
L
S
 
V
S
 
L
L
 
A
A
 
A
Y
 
Y
V
 
L
T
 
-
V
 
-
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
M
G
 
G
A
x
F
G
 
A
L
 
V
A
 
W
R
 
M
D
 
N
G
 
G
R
 
A
T
 
P
L
 
W
T
 
T
G
 
G
A
 
A
-
 
H
-
 
G
L
 
V
H
 
A
P
 
G
E
 
E
M
 
L
G
 
G
H
 
H
V
 
I
P
 
P
V
 
L
L
 
-
R
 
-
F
 
-
E
 
-
G
 
G
D
 
D
P
 
M
T
 
T
P
 
Q
S
 
H
A
 
C
C
 
A
P
 
C
F
 
G
H
 
N
S
 
P
G
 
G
C
 
C
A
 
L
E
 
E
G
 
T
M
 
N
A
 
C
A
 
S
G
 
G
P
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
R
R
 
R
R
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
W
L
 
Y
E
 
E
D
 
Q
S
 
Q
P
 
P
A
 
R
D
 
N
F
 
Y
-
 
P
-
 
L
-
 
R
-
 
D
-
 
L
-
 
F
-
 
V
-
 
H
A
 
A
A
 
E
V
 
N
A
 
A
D
 
P
Y
 
F
L
 
V
G
 
Q
Q
 
S
L
 
L
F
 
L
-
 
E
-
 
N
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
S
V
 
I
L
 
N
A
 
L
W
 
F
S
 
D
P
 
P
H
 
D
R
 
A
I
 
V
V
 
I
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
V
M
 
M
D
 
D
V
 
M
P
 
P
G
 
A
L
 
F
G
 
P
K
 
R
A
 
E
A
 
T
T
 
L
V
 
V
R
 
A
M
 
M
R
 
T
V
 
Q
A
 
K
L
 
Y
G
 
L
G
 
R
Y
 
R
G
 
P
V
 
L
G
 
P
S
 
H
A
 
Q
V
 
V
G
 
-
E
 
-
A
 
V
D
 
R
F
 
F
I
 
I
R
 
A
S
 
A
A
 
S
A
 
S
L
 
S
E
 
D
H
 
F
A
 
N
G
 
G
L
 
A
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
A
I
 
I
L
 
L
A
 
A
R
 
H
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

P50456 DNA-binding transcriptional repressor Mlc; Making large colonies protein; Membrane linked control from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
31% identity, 48% coverage: 93:231/291 of query aligns to 181:342/406 of P50456

query
sites
P50456
A
 
A
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
A
 
H
L
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
Y
I
 
I
D
 
Q
T
 
H
D
 
D
V
 
I
N
 
S
A
 
A
A
 
W
A
 
T
L
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
L
A
 
F
G
 
G
A
 
A
G
 
S
Q
 
R
G
 
G
C
 
A
S
 
R
S
 
D
L
 
V
A
 
I
Y
 
Q
V
 
V
T
 
V
V
 
I
G
 
D
T
 
H
G
 
N
I
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
I
R
 
T
D
 
D
G
 
G
R
 
H
T
 
L
L
 
L
-
 
H
-
 
A
-
 
G
T
 
S
G
 
S
A
 
S
L
 
L
H
 
-
P
 
V
E
 
E
M
 
I
G
 
G
H
|
H
V
 
T
P
 
Q
V
 
V
L
 
-
R
 
-
F
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
D
P
 
P
T
 
Y
P
 
G
S
 
K
A
 
R
C
|
C
P
 
Y
F
x
C
-
 
G
H
 
N
S
 
H
G
 
G
C
|
C
A
 
L
E
 
E
G
 
T
M
 
I
A
 
A
A
 
S
G
 
V
P
 
D
A
 
S
V
 
I
-
 
L
-
 
E
-
 
L
-
 
A
Q
 
Q
R
 
L
R
 
R
L
 
L
-
 
N
-
 
Q
-
 
S
-
 
M
-
 
S
-
 
S
-
 
M
-
 
L
-
 
H
G
 
G
G
 
Q
K
 
P
L
 
L
L
 
T
E
 
V
D
 
D
S
 
S
P
 
L
A
 
C
D
 
Q
F
 
A
A
 
A
A
 
L
V
x
R
A
 
G
D
 
D
Y
 
L
L
|
L
-
 
A
-
 
K
-
 
D
-
 
I
-
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
H
-
 
V
G
 
G
Q
 
R
L
 
I
F
 
L
A
 
A
T
 
I
I
 
M
V
 
V
L
 
N
A
 
L
W
 
F
S
 
N
P
 
P
H
 
Q
R
 
K
I
 
I
V
 
L
V
 
I
G
 
G
G
 
S

Sites not aligning to the query:

1z6rA Crystal structure of mlc from escherichia coli (see paper)
31% identity, 48% coverage: 93:231/291 of query aligns to 157:318/382 of 1z6rA

query
sites
1z6rA
A
 
A
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
A
 
H
L
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
Y
I
 
I
D
 
Q
T
 
H
D
 
D
V
 
I
N
 
S
A
 
A
A
 
W
A
 
T
L
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
L
A
 
F
G
 
G
A
 
A
G
 
S
Q
 
R
G
 
G
C
 
A
S
 
R
S
 
D
L
 
V
A
 
I
Y
 
Q
V
 
V
T
 
V
V
 
I
G
 
D
T
 
H
G
 
N
I
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
I
R
 
T
D
 
D
G
 
G
R
 
H
T
 
L
L
 
L
-
 
H
-
 
A
-
 
G
T
 
S
G
 
S
A
 
S
L
 
L
H
 
-
P
 
V
E
 
E
M
 
I
G
 
G
H
|
H
V
 
T
P
 
Q
V
 
V
L
 
-
R
 
-
F
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
D
P
 
P
T
 
Y
P
 
G
S
 
K
A
 
R
C
|
C
P
 
Y
F
x
C
-
 
G
H
 
N
S
 
H
G
 
G
C
|
C
A
 
L
E
 
E
G
 
T
M
 
I
A
 
A
A
 
S
G
 
V
P
 
D
A
 
S
V
 
I
-
 
L
-
 
E
-
 
L
-
 
A
Q
 
Q
R
 
L
R
 
R
L
 
L
-
 
N
-
 
Q
-
 
S
-
 
M
-
 
S
-
 
S
-
 
M
-
 
L
-
 
H
G
 
G
G
 
Q
K
 
P
L
 
L
L
 
T
E
 
V
D
 
D
S
 
S
P
 
L
A
 
C
D
 
Q
F
 
A
A
 
A
A
 
L
V
 
R
A
 
G
D
 
D
Y
 
L
L
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
D
-
 
I
-
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
H
-
 
V
G
 
G
Q
 
R
L
 
I
F
 
L
A
 
A
T
 
I
I
 
M
V
 
V
L
 
N
A
 
L
W
 
F
S
 
N
P
 
P
H
 
Q
R
 
K
I
 
I
V
 
L
V
 
I
G
 
G
G
 
S

5f7qE Rok repressor lmo0178 from listeria monocytogenes bound to operator (see paper)
25% identity, 70% coverage: 27:231/291 of query aligns to 105:336/396 of 5f7qE

query
sites
5f7qE
V
 
I
V
 
I
A
 
E
E
 
N
A
 
T
R
 
S
W
 
I
P
 
P
T
 
F
T
 
S
S
 
S
P
 
E
E
 
K
A
 
K
A
 
P
E
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
I
L
 
E
A
 
L
F
 
I
A
 
A
G
 
K
R
 
N
T
 
V
P
 
K
-
 
K
-
 
M
-
 
C
-
 
G
-
 
N
-
 
R
-
 
D
-
 
M
-
 
N
-
 
H
L
 
L
A
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
A
A
 
I
F
 
S
G
 
G
P
 
L
V
 
V
V
 
-
V
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
N
A
 
R
N
 
K
Y
 
K
G
 
G
E
 
T
V
 
V
L
 
I
A
 
R
T
 
S
P
 
T
K
 
M
P
 
L
G
 
G
W
 
W
T
 
E
G
 
N
A
 
V
N
 
A
L
 
L
R
 
E
A
 
A
A
 
M
L
 
L
E
 
H
Q
 
A
A
 
H
L
 
F
-
 
P
G
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
Y
I
 
V
D
 
D
T
 
K
D
 
N
V
 
I
N
 
N
A
 
C
A
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
L
A
 
W
A
 
L
G
 
G
A
 
E
G
 
G
Q
 
K
G
 
Q
C
 
S
S
 
N
S
 
N
L
 
F
A
 
A
Y
 
T
V
 
V
T
 
S
V
 
V
G
 
G
T
 
A
G
 
G
I
 
L
G
 
G
A
 
L
G
 
S
L
 
V
A
 
V
R
 
I
D
 
N
G
 
R
R
 
Q
T
 
I
L
 
Y
T
 
Y
G
 
G
A
 
A
L
 
Q
-
 
G
-
 
G
H
 
A
P
 
G
E
 
E
M
 
F
G
 
G
H
|
H
V
 
T
P
 
T
V
 
I
L
 
-
R
 
-
F
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
Q
P
 
P
T
 
G
P
 
G
S
 
Y
A
 
K
C
|
C
P
 
H
F
x
C
-
 
G
H
 
Q
S
 
K
G
 
G
C
|
C
A
 
L
E
 
E
G
 
-
M
 
M
A
 
Y
A
 
A
G
 
S
P
 
E
A
 
F
V
 
Y
Q
 
F
R
 
R
R
 
N
L
 
R
G
 
G
G
 
E
K
 
E
L
 
L
L
 
K
E
 
E
D
 
A
S
 
Y
P
 
P
A
 
T
-
 
S
-
 
E
-
 
L
-
 
N
D
 
D
F
 
F
A
 
H
-
 
F
-
 
D
-
 
K
-
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
S
-
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
M
-
 
A
-
 
T
-
 
E
-
 
L
-
 
M
-
 
G
A
 
K
V
 
M
A
 
G
D
 
E
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
Y
L
 
G
F
 
I
A
 
R
T
 
N
I
 
I
V
 
I
L
 
N
A
 
T
W
 
F
S
 
N
P
 
P
H
 
E
R
 
K
I
 
V
V
 
I
V
 
I
G
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3vovB Crystal structure of rok hexokinase from thermus thermophilus (see paper)
44% identity, 37% coverage: 83:190/291 of query aligns to 81:186/298 of 3vovB

query
sites
3vovB
P
 
P
G
 
G
W
 
V
T
 
Q
G
 
D
A
 
F
N
 
P
L
 
I
R
 
R
A
 
R
A
 
I
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
L
 
T
G
 
G
V
 
R
P
 
P
V
 
V
A
 
F
I
 
L
D
 
E
T
 
N
D
 
D
V
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
H
A
 
H
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
Q
 
Q
G
 
G
C
 
E
S
 
E
S
 
S
L
 
S
A
 
L
Y
 
Y
V
 
L
T
 
T
V
 
V
G
 
S
T
 
T
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
L
 
V
A
 
V
R
 
L
D
 
G
G
 
G
R
 
R
T
 
V
L
 
L
T
 
R
G
 
G
A
 
E
L
 
R
H
 
G
P
 
Q
-
 
G
-
 
G
E
 
E
M
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
L
P
 
T
V
 
L
L
 
L
R
 
-
F
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
P
T
 
G
P
 
G
S
 
P
A
 
A
C
|
C
P
 
G
F
x
C
-
 
G
H
 
L
S
 
E
G
 
G
C
|
C
A
 
L
E
 
E
G
 
A
M
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
P
 
R
A
 
A
V
 
L
Q
 
E
R
 
R

Query Sequence

>Ga0059261_4061 Ga0059261_4061 Transcriptional regulator/sugar kinase
MSDMRTWLAIETGGTKLLARLVRDEGVVAEARWPTTSPEAAEAALLAFAGRTPLAGVGIA
AFGPVVVDPAAANYGEVLATPKPGWTGANLRAALEQALGVPVAIDTDVNAAALAEAAAGA
GQGCSSLAYVTVGTGIGAGLARDGRTLTGALHPEMGHVPVLRFEGDPTPSACPFHSGCAE
GMAAGPAVQRRLGGKLLEDSPADFAAVADYLGQLFATIVLAWSPHRIVVGGGVMDVPGLG
KAATVRMRVALGGYGVGSAVGEADFIRSAALEHAGLEGALILARQAAARAG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory