SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_00991 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_00991 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5ktlA Dihydrodipicolinate synthase from the industrial and evolutionarily important cyanobacteria anabaena variabilis. (see paper)
30% identity, 93% coverage: 3:276/295 of query aligns to 5:278/295 of 5ktlA

query
sites
5ktlA
F
 
F
E
 
G
G
 
T
V
 
V
H
 
L
T
 
T
P
 
A
L
 
M
V
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
K
 
K
A
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
S
I
 
V
D
 
N
H
 
Y
T
 
A
L
 
V
L
 
A
G
 
A
K
 
E
H
 
L
A
 
A
V
 
A
N
 
H
L
 
L
A
 
V
G
 
D
R
 
N
-
 
G
V
 
T
A
 
D
G
 
T
L
 
L
G
 
V
V
 
V
G
 
C
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
x
S
Y
 
P
A
 
T
L
|
L
S
 
S
F
 
W
D
 
D
E
 
E
R
x
E
V
 
Y
Q
 
N
T
 
L
F
 
F
N
 
V
T
x
E
V
 
V
A
 
L
E
x
Q
A
 
T
A
 
V
G
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
A
Y
 
K
L
 
V
T
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
C
N
 
G
A
 
S
T
 
N
T
 
S
T
 
T
K
 
K
E
 
E
V
 
A
I
 
I
R
 
A
L
 
A
G
 
T
Q
 
Q
E
 
K
A
 
A
K
 
A
R
 
K
A
 
I
G
 
G
L
 
V
N
 
H
A
 
G
L
 
T
L
 
L
L
 
Q
A
 
V
A
 
V
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
A
 
N
Q
 
K
P
 
P
T
 
P
Q
 
Q
D
 
A
E
 
G
L
 
L
L
 
Y
S
 
Q
H
 
H
L
 
F
L
 
Q
K
 
A
V
 
I
D
 
A
D
 
Q
S
 
A
L
 
C
-
 
P
D
 
D
M
 
L
P
 
P
V
 
L
M
 
L
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
F
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
H
 
N
I
 
L
G
 
S
D
 
P
N
 
E
V
 
T
L
 
V
S
 
V
K
 
R
L
 
L
L
 
A
E
 
E
R
 
I
P
 
D
N
 
N
F
 
I
I
 
I
A
 
G
M
 
V
K
|
K
E
 
E
S
 
A
T
 
S
G
 
G
D
 
N
I
 
L
S
 
D
H
 
Q
L
 
A
H
 
G
H
 
E
L
 
I
A
 
R
T
 
R
H
 
S
F
 
T
R
 
P
D
 
K
R
 
E
L
 
F
V
 
Q
L
 
I
S
 
Y
C
 
A
G
 
G
M
 
D
D
 
D
D
 
S
Q
 
L
A
 
T
L
 
L
E
 
P
F
 
L
F
 
L
V
 
A
W
 
I
G
 
G
A
 
A
K
 
K
S
 
G
W
 
V
V
|
V
G
 
S
G
 
V
A
 
A
S
 
S
N
 
H
F
 
L
L
 
V
P
 
G
E
 
N
A
 
Q
H
 
L
T
 
Q
A
 
Q
L
 
M
L
 
I
D
 
Q
A
 
A
C
 
-
V
 
F
K
 
N
H
 
S
G
 
G
D
 
Q
F
 
V
A
 
T
T
 
V
G
 
A
R
 
S
K
 
D
L
 
I
M
 
H
A
 
L
Q
 
R
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
L
L
 
F
E
 
K
L
 
A
L
 
L
E
 
F
R
 
I
S
 
T
G
 
T
K
 
N
F
 
P
I
 
I
Q
 
P
Y
 
-
V
 
I
R
 
K
Y
 
Q
G
 
A
C
 
L
E
 
K
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
T
 
W
P
 
E
V
 
V
G
 
G
V
 
S
A
 
T
R
 
R
A
 
P
P
 
P
L
 
L
G
 
S
T
 
D
L
 
A
D
 
D

3lbcD D-sialic acid aldolase complexed with l-arabinose
29% identity, 99% coverage: 2:293/295 of query aligns to 4:295/296 of 3lbcD

query
sites
3lbcD
S
 
N
F
 
L
E
 
R
G
 
G
V
 
V
H
 
M
T
 
A
P
 
A
L
 
L
V
 
L
T
 
T
P
 
P
F
 
F
K
 
D
A
 
Q
D
 
Q
G
 
Q
E
 
A
I
 
L
D
 
D
H
 
K
T
 
A
L
 
S
L
 
L
G
 
R
K
 
R
H
 
L
A
 
V
-
 
Q
V
 
F
N
 
N
L
 
I
A
 
Q
G
 
Q
R
 
G
V
 
I
A
 
D
G
 
G
L
 
L
G
 
Y
V
 
V
G
 
G
G
 
G
T
x
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
A
Y
 
F
A
 
V
L
 
Q
S
 
S
F
 
L
D
 
S
E
 
E
R
 
R
V
 
E
Q
 
Q
T
 
V
F
 
L
N
 
E
T
 
I
V
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
E
A
 
A
G
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
I
Y
 
K
L
 
L
T
 
I
A
 
A
G
 
H
I
 
V
N
 
G
A
 
C
T
 
V
T
 
S
T
 
T
K
 
A
E
 
E
V
 
S
I
 
Q
R
 
Q
L
 
L
G
 
A
Q
 
A
E
 
S
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
Y
G
 
G
L
 
F
N
 
D
A
 
A
L
 
V
L
 
S
L
 
A
A
 
V
A
 
T
P
 
P
Y
 
F
Y
|
Y
A
 
Y
Q
 
P
P
 
F
T
 
S
Q
 
F
D
 
E
E
 
E
L
 
H
L
 
C
S
 
D
H
 
H
L
 
Y
L
 
R
K
 
A
V
 
I
D
 
I
D
 
D
S
 
S
L
 
A
D
 
D
-
 
G
M
 
L
P
 
P
V
 
M
M
 
V
L
 
V
Y
|
Y
N
 
N
F
 
I
P
 
P
A
 
A
R
x
L
T
 
S
G
 
G
T
 
V
H
 
K
I
 
L
G
 
T
D
 
L
N
 
D
V
 
Q
L
 
I
S
 
N
K
 
T
L
 
L
L
 
V
E
 
T
R
 
L
P
 
P
N
 
G
F
 
V
I
 
G
A
 
A
M
 
L
K
|
K
E
 
Q
S
 
T
T
 
S
G
 
G
D
|
D
I
 
L
S
x
Y
H
 
Q
L
 
M
H
 
E
H
 
Q
L
 
I
A
 
R
T
 
R
H
 
E
F
 
H
R
 
P
D
 
D
R
 
-
L
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
Y
C
 
N
G
 
G
M
 
Y
D
 
D
D
 
E
Q
 
I
A
 
F
L
 
A
E
 
S
F
 
G
F
 
L
V
 
L
W
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
D
S
 
G
W
 
G
V
x
I
G
 
G
G
 
S
A
 
T
S
 
Y
N
 
N
F
 
I
L
 
M
P
 
G
E
 
W
A
 
R
H
 
Y
T
 
Q
A
 
G
L
 
I
L
 
V
D
 
K
A
 
A
C
 
-
V
 
L
K
 
K
H
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
I
A
 
Q
T
 
T
G
 
A
R
 
Q
K
 
K
L
 
L
M
 
Q
A
 
T
Q
 
E
L
 
C
L
 
N
P
 
K
V
 
V
L
 
I
E
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
I
R
 
K
S
 
T
G
 
G
K
 
V
F
 
F
-
 
R
-
 
G
I
 
L
Q
 
K
Y
 
T
V
 
V
R
 
L
Y
 
H
G
 
Y
C
 
M
E
 
D
L
 
V
A
 
V
G
 
S
T
 
V
P
 
P
V
 
-
G
 
-
V
 
L
A
 
C
R
 
R
A
 
K
P
 
P
L
 
F
G
 
G
T
 
P
L
 
V
D
 
D
E
 
E
N
 
K
E
 
Y
R
 
L
S
 
P
G
 
E
F
 
L
A
 
K
K
 
A
L
 
L
V
 
A
R
 
Q
P
 
Q
L
 
L
L
 
M
S
 
Q
N
 
E

2wpbA Crystal structure of the e192n mutant of e. Coli n-acetylneuraminic acid lyase in complex with pyruvate and the inhibitor (2r,3r)-2,3,4- trihydroxy-n,n-dipropylbutanamide in space group p21 crystal form i (see paper)
29% identity, 99% coverage: 2:293/295 of query aligns to 9:300/302 of 2wpbA

query
sites
2wpbA
S
 
N
F
 
L
E
 
R
G
 
G
V
 
V
H
 
M
T
 
A
P
 
A
L
 
L
V
 
L
T
 
T
P
 
P
F
 
F
K
 
D
A
 
Q
D
 
Q
G
 
Q
E
 
A
I
 
L
D
 
D
H
 
K
T
 
A
L
 
S
L
 
L
G
 
R
K
 
R
H
 
L
A
 
V
-
 
Q
V
 
F
N
 
N
L
 
I
A
 
Q
G
 
Q
R
 
G
V
 
I
A
 
D
G
 
G
L
 
L
G
 
Y
V
 
V
G
 
G
G
 
G
T
x
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
A
Y
 
F
A
 
V
L
 
Q
S
 
S
F
 
L
D
 
S
E
 
E
R
 
R
V
 
E
Q
 
Q
T
 
V
F
 
L
N
 
E
T
 
I
V
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
E
A
 
A
G
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
I
Y
 
K
L
 
L
T
 
I
A
 
A
G
 
H
I
 
V
N
 
G
A
 
C
T
 
V
T
 
S
T
 
T
K
 
A
E
 
E
V
 
S
I
 
Q
R
 
Q
L
 
L
G
 
A
Q
 
A
E
 
S
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
Y
G
 
G
L
 
F
N
 
D
A
 
A
L
 
V
L
 
S
L
 
A
A
 
V
A
 
T
P
 
P
Y
 
F
Y
|
Y
A
 
Y
Q
 
P
P
 
F
T
 
S
Q
 
F
D
 
E
E
 
E
L
 
H
L
 
C
S
 
D
H
 
H
L
 
Y
L
 
R
K
 
A
V
 
I
D
 
I
D
 
D
S
 
S
L
 
A
D
 
D
-
 
G
M
 
L
P
 
P
V
 
M
M
 
V
L
 
V
Y
|
Y
N
 
N
F
 
I
P
 
P
A
 
A
R
x
L
T
 
S
G
 
G
T
 
V
H
 
K
I
 
L
G
 
T
D
 
L
N
 
D
V
 
Q
L
 
I
S
 
N
K
 
T
L
 
L
L
 
V
E
 
T
R
 
L
P
 
P
N
 
G
F
 
V
I
 
G
A
 
A
M
 
L
K
|
K
E
 
Q
S
 
T
T
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
L
S
 
Y
H
 
Q
L
 
M
H
 
E
H
 
Q
L
 
I
A
 
R
T
 
R
H
 
E
F
 
H
R
 
P
D
 
D
R
 
-
L
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
Y
C
 
N
G
|
G
M
x
Y
D
|
D
D
x
N
Q
 
I
A
 
F
L
 
A
E
 
S
F
 
G
F
 
L
V
 
L
W
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
D
S
 
G
W
 
G
V
x
I
G
 
G
G
x
S
A
 
T
S
 
Y
N
 
N
F
 
I
L
 
M
P
 
G
E
 
W
A
 
R
H
 
Y
T
 
Q
A
 
G
L
 
I
L
 
V
D
 
K
A
 
A
C
 
-
V
 
L
K
 
K
H
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
I
A
 
Q
T
 
T
G
 
A
R
 
Q
K
 
K
L
 
L
M
 
Q
A
 
T
Q
 
E
L
 
C
L
 
N
P
 
K
V
 
V
L
 
I
E
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
I
R
 
K
S
 
T
G
 
G
K
 
V
F
 
F
-
 
R
-
 
G
I
 
L
Q
 
K
Y
 
T
V
 
V
R
 
L
Y
 
H
G
 
Y
C
 
M
E
 
D
L
 
V
A
 
V
G
 
S
T
 
V
P
 
P
V
 
-
G
 
-
V
 
L
A
 
C
R
 
R
A
 
K
P
 
P
L
 
F
G
 
G
T
 
P
L
 
V
D
 
D
E
 
E
N
 
K
E
 
Y
R
 
L
S
 
P
G
 
E
F
 
L
A
 
K
K
 
A
L
 
L
V
 
A
R
 
Q
P
 
Q
L
 
L
L
 
M
S
 
Q
N
 
E

1fdzA N-acetylneuraminate lyase in complex with pyruvate via borohydride reduction (see paper)
29% identity, 99% coverage: 2:293/295 of query aligns to 1:292/292 of 1fdzA

query
sites
1fdzA
S
 
N
F
 
L
E
 
R
G
 
G
V
 
V
H
 
M
T
 
A
P
 
A
L
 
L
V
 
L
T
 
T
P
 
P
F
 
F
K
 
D
A
 
Q
D
 
Q
G
 
Q
E
 
A
I
 
L
D
 
D
H
 
K
T
 
A
L
 
S
L
 
L
G
 
R
K
 
R
H
 
L
A
 
V
-
 
Q
V
 
F
N
 
N
L
 
I
A
 
Q
G
 
Q
R
 
G
V
 
I
A
 
D
G
 
G
L
 
L
G
x
Y
V
 
V
G
 
G
G
|
G
T
x
S
T
|
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
A
Y
 
F
A
 
V
L
 
Q
S
 
S
F
 
L
D
 
S
E
 
E
R
 
R
V
 
E
Q
 
Q
T
 
V
F
 
L
N
 
E
T
 
I
V
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
E
A
 
G
G
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
I
Y
 
K
L
 
L
T
 
I
A
 
A
G
 
H
I
 
V
N
 
G
A
 
C
T
 
V
T
 
T
T
 
T
K
 
A
E
 
E
V
 
S
I
 
Q
R
 
Q
L
 
L
G
 
A
Q
 
A
E
 
S
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
Y
G
 
G
L
 
F
N
 
D
A
 
A
L
 
V
L
 
S
L
 
A
A
 
V
A
 
T
P
 
P
Y
 
F
Y
|
Y
A
 
Y
Q
 
P
P
 
F
T
 
S
Q
 
F
D
 
E
E
 
E
L
 
H
L
 
C
S
 
D
H
 
H
L
 
Y
L
 
R
K
 
A
V
 
I
D
 
I
D
 
D
S
 
S
L
 
A
D
 
D
-
 
G
M
 
L
P
 
P
V
 
M
M
 
V
L
 
V
Y
|
Y
N
 
N
F
 
I
P
 
P
A
 
A
R
x
L
T
 
S
G
 
G
T
 
V
H
 
K
I
 
L
G
 
T
D
 
L
N
 
D
V
 
Q
L
 
I
S
 
N
K
 
T
L
 
L
L
 
V
E
 
T
R
 
L
P
 
P
N
 
G
F
 
V
I
 
G
A
 
A
M
 
L
K
|
K
E
 
Q
S
 
T
T
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
L
S
 
Y
H
 
Q
L
 
M
H
 
E
H
 
Q
L
 
I
A
 
R
T
 
R
H
 
E
F
 
H
R
 
P
D
 
D
R
 
-
L
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
Y
C
 
N
G
 
G
M
 
Y
D
 
D
D
 
E
Q
 
I
A
 
F
L
 
A
E
 
S
F
 
G
F
 
L
V
 
L
W
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
D
S
 
G
W
 
G
V
x
I
G
 
G
G
 
S
A
 
T
S
 
Y
N
 
N
F
 
I
L
 
M
P
 
G
E
 
W
A
 
R
H
 
Y
T
 
Q
A
 
G
L
 
I
L
 
V
D
 
K
A
 
A
C
 
-
V
 
L
K
 
K
H
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
I
A
 
Q
T
 
T
G
 
A
R
 
Q
K
 
K
L
 
L
M
 
Q
A
 
T
Q
 
E
L
 
C
L
 
N
P
 
K
V
 
V
L
 
I
E
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
I
R
 
K
S
 
T
G
 
G
K
 
V
F
 
F
-
 
R
-
 
G
I
 
L
Q
 
K
Y
 
T
V
 
V
R
 
L
Y
 
H
G
 
Y
C
 
M
E
 
D
L
 
V
A
 
V
G
 
S
T
 
V
P
 
P
V
 
-
G
 
-
V
 
L
A
 
C
R
 
R
A
 
K
P
 
P
L
 
F
G
 
G
T
 
P
L
 
V
D
 
D
E
 
E
N
 
K
E
 
Y
R
 
L
S
 
P
G
 
E
F
 
L
A
 
K
K
 
A
L
 
L
V
 
A
R
 
Q
P
 
Q
L
 
L
L
 
M
S
 
Q
N
 
E

1fdyA N-acetylneuraminate lyase in complex with hydroxypyruvate (see paper)
29% identity, 99% coverage: 2:293/295 of query aligns to 1:292/292 of 1fdyA

query
sites
1fdyA
S
 
N
F
 
L
E
 
R
G
 
G
V
 
V
H
 
M
T
 
A
P
 
A
L
 
L
V
 
L
T
 
T
P
 
P
F
 
F
K
 
D
A
 
Q
D
 
Q
G
 
Q
E
 
A
I
 
L
D
 
D
H
 
K
T
 
A
L
 
S
L
 
L
G
 
R
K
 
R
H
 
L
A
 
V
-
 
Q
V
 
F
N
 
N
L
 
I
A
 
Q
G
 
Q
R
 
G
V
 
I
A
 
D
G
 
G
L
 
L
G
x
Y
V
 
V
G
 
G
G
|
G
T
x
S
T
|
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
A
Y
 
F
A
 
V
L
 
Q
S
 
S
F
 
L
D
 
S
E
 
E
R
 
R
V
 
E
Q
 
Q
T
 
V
F
 
L
N
 
E
T
 
I
V
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
E
A
 
G
G
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
I
Y
 
K
L
 
L
T
 
I
A
 
A
G
 
H
I
 
V
N
 
G
A
 
C
T
 
V
T
 
T
T
 
T
K
 
A
E
 
E
V
 
S
I
 
Q
R
 
Q
L
 
L
G
 
A
Q
 
A
E
 
S
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
Y
G
 
G
L
 
F
N
 
D
A
 
A
L
 
V
L
 
S
L
 
A
A
 
V
A
 
T
P
 
P
Y
 
F
Y
|
Y
A
 
Y
Q
 
P
P
 
F
T
 
S
Q
 
F
D
 
E
E
 
E
L
 
H
L
 
C
S
 
D
H
 
H
L
 
Y
L
 
R
K
 
A
V
 
I
D
 
I
D
 
D
S
 
S
L
 
A
D
 
D
-
 
G
M
 
L
P
 
P
V
 
M
M
 
V
L
 
V
Y
|
Y
N
 
N
F
 
I
P
 
P
A
 
A
R
x
L
T
 
S
G
 
G
T
 
V
H
 
K
I
 
L
G
 
T
D
 
L
N
 
D
V
 
Q
L
 
I
S
 
N
K
 
T
L
 
L
L
 
V
E
 
T
R
 
L
P
 
P
N
 
G
F
 
V
I
 
G
A
 
A
M
 
L
K
|
K
E
 
Q
S
 
T
T
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
L
S
 
Y
H
 
Q
L
 
M
H
 
E
H
 
Q
L
 
I
A
 
R
T
 
R
H
 
E
F
 
H
R
 
P
D
 
D
R
 
-
L
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
Y
C
 
N
G
 
G
M
 
Y
D
 
D
D
 
E
Q
 
I
A
 
F
L
 
A
E
 
S
F
 
G
F
 
L
V
 
L
W
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
D
S
 
G
W
 
G
V
x
I
G
 
G
G
 
S
A
 
T
S
 
Y
N
 
N
F
 
I
L
 
M
P
 
G
E
 
W
A
 
R
H
 
Y
T
 
Q
A
 
G
L
 
I
L
 
V
D
 
K
A
 
A
C
 
-
V
 
L
K
 
K
H
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
I
A
 
Q
T
 
T
G
 
A
R
 
Q
K
 
K
L
 
L
M
 
Q
A
 
T
Q
 
E
L
 
C
L
 
N
P
 
K
V
 
V
L
 
I
E
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
I
R
 
K
S
 
T
G
 
G
K
 
V
F
 
F
-
 
R
-
 
G
I
 
L
Q
 
K
Y
 
T
V
 
V
R
 
L
Y
 
H
G
 
Y
C
 
M
E
 
D
L
 
V
A
 
V
G
 
S
T
 
V
P
 
P
V
 
-
G
 
-
V
 
L
A
 
C
R
 
R
A
 
K
P
 
P
L
 
F
G
 
G
T
 
P
L
 
V
D
 
D
E
 
E
N
 
K
E
 
Y
R
 
L
S
 
P
G
 
E
F
 
L
A
 
K
K
 
A
L
 
L
V
 
A
R
 
Q
P
 
Q
L
 
L
L
 
M
S
 
Q
N
 
E

4dxvA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with mg and cl ions at 1.80 a resolution
31% identity, 73% coverage: 2:215/295 of query aligns to 1:215/291 of 4dxvA

query
sites
4dxvA
S
 
T
F
 
I
E
 
Q
G
 
G
V
 
S
H
 
I
T
 
V
P
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
K
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
E
 
G
I
 
V
D
 
D
H
 
W
T
 
K
L
 
S
L
 
L
G
 
E
K
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
W
H
 
H
A
 
I
V
 
E
N
 
Q
L
 
G
A
 
T
G
 
N
R
 
S
V
 
I
A
 
V
G
 
A
L
 
V
G
 
G
V
 
-
G
 
-
G
 
-
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
A
Y
 
S
A
 
T
L
 
L
S
 
S
F
 
M
D
 
E
E
 
E
R
 
H
V
 
T
Q
 
Q
T
 
V
F
 
I
N
 
K
T
 
E
V
 
I
A
 
I
E
 
R
A
 
V
A
 
A
G
 
N
G
 
K
K
 
R
T
 
I
Y
 
P
L
 
I
T
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
T
N
 
G
A
 
A
T
 
N
T
 
S
T
 
T
K
 
R
E
 
E
V
 
A
I
 
I
R
 
E
L
 
L
G
 
T
Q
 
K
E
 
A
A
 
A
K
 
K
R
 
D
A
 
L
G
 
G
L
 
A
N
 
D
A
 
A
L
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
V
A
x
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
A
 
N
Q
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
D
 
E
E
 
G
L
 
L
L
 
Y
S
 
Q
H
 
H
L
 
Y
L
 
K
K
 
A
V
 
I
D
 
A
D
 
E
S
 
A
L
 
V
D
 
E
M
 
L
P
 
P
V
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
|
N
F
x
V
P
|
P
A
 
G
R
|
R
T
|
T
G
 
G
T
 
V
H
 
D
I
 
L
G
 
S
D
 
N
N
 
D
V
 
T
L
 
A
S
 
V
K
 
R
L
 
L
L
 
A
E
 
E
R
 
I
P
 
P
N
 
N
F
 
I
I
 
V
A
 
G
M
 
I
K
|
K
E
 
D
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V
S
 
P
H
 
R
L
 
G
H
 
K
H
 
A
L
 
L
A
 
I
T
 
D
H
 
A
F
 
L
R
 
N
D
 
G
R
 
K
L
 
M
V
 
A
L
 
V
S
 
Y
C
 
S
G
 
G
M
 
D
D
 
D
D
 
E
Q
 
T
A
 
A
L
 
W
E
 
E
F
 
L
F
 
M
V
 
L
W
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
S
 
G
W
 
N
V
x
I
G
 
S
G
 
V
A
 
T
S
 
A
N
 
N
F
 
I
L
 
A
P
 
P
E
 
K
A
 
A
H
 
M
T
 
S

3u8gA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with oxalic acid at 1.80 a resolution
31% identity, 73% coverage: 2:215/295 of query aligns to 1:215/291 of 3u8gA

query
sites
3u8gA
S
 
T
F
 
I
E
 
Q
G
 
G
V
 
S
H
 
I
T
 
V
P
x
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
K
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
E
 
G
I
 
V
D
 
D
H
 
W
T
 
K
L
 
S
L
 
L
G
 
E
K
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
W
H
 
H
A
 
I
V
 
E
N
 
Q
L
 
G
A
 
T
G
 
N
R
 
S
V
 
I
A
 
V
G
 
A
L
 
V
G
|
G
V
 
-
G
 
-
G
 
-
T
|
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
A
Y
 
S
A
 
T
L
 
L
S
 
S
F
 
M
D
 
E
E
 
E
R
 
H
V
 
T
Q
 
Q
T
 
V
F
 
I
N
 
K
T
 
E
V
 
I
A
 
I
E
 
R
A
 
V
A
 
A
G
 
N
G
 
K
K
 
R
T
 
I
Y
 
P
L
 
I
T
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
T
N
 
G
A
 
A
T
 
N
T
 
S
T
 
T
K
 
R
E
 
E
V
 
A
I
 
I
R
 
E
L
 
L
G
 
T
Q
 
K
E
 
A
A
 
A
K
 
K
R
 
D
A
 
L
G
 
G
L
 
A
N
 
D
A
 
A
L
 
A
L
|
L
L
 
L
A
 
V
A
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
A
 
N
Q
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
D
 
E
E
 
G
L
 
L
L
 
Y
S
 
Q
H
 
H
L
 
Y
L
 
K
K
 
A
V
 
I
D
 
A
D
 
E
S
 
A
L
 
V
D
 
E
M
 
L
P
 
P
V
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
F
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
T
 
V
H
 
D
I
 
L
G
 
S
D
 
N
N
 
D
V
 
T
L
 
A
S
 
V
K
 
R
L
 
L
L
 
A
E
 
E
R
 
I
P
 
P
N
 
N
F
 
I
I
 
V
A
 
G
M
 
I
K
|
K
E
 
D
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V
S
 
P
H
 
R
L
 
G
H
 
K
H
 
A
L
 
L
A
 
I
T
 
D
H
 
A
F
 
L
R
 
N
D
 
G
R
 
K
L
 
M
V
 
A
L
 
V
S
 
Y
C
 
S
G
 
G
M
 
D
D
 
D
D
 
E
Q
 
T
A
 
A
L
 
W
E
 
E
F
 
L
F
 
M
V
 
L
W
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
S
 
G
W
 
N
V
x
I
G
 
S
G
 
V
A
 
T
S
 
A
N
 
N
F
 
I
L
 
A
P
 
P
E
 
K
A
 
A
H
 
M
T
 
S

3tdfA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 2-ketobutanoic acid at 1.99 a resolution
31% identity, 73% coverage: 2:215/295 of query aligns to 1:215/291 of 3tdfA

query
sites
3tdfA
S
 
T
F
 
I
E
 
Q
G
 
G
V
 
S
H
 
I
T
 
V
P
x
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
K
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
E
 
G
I
 
V
D
 
D
H
 
W
T
 
K
L
 
S
L
 
L
G
 
E
K
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
W
H
 
H
A
 
I
V
 
E
N
 
Q
L
 
G
A
 
T
G
 
N
R
 
S
V
 
I
A
 
V
G
 
A
L
 
V
G
 
G
V
 
-
G
 
-
G
 
-
T
|
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
A
Y
 
S
A
 
T
L
 
L
S
 
S
F
 
M
D
 
E
E
 
E
R
 
H
V
 
T
Q
 
Q
T
 
V
F
 
I
N
 
K
T
 
E
V
 
I
A
 
I
E
 
R
A
 
V
A
 
A
G
 
N
G
 
K
K
 
R
T
 
I
Y
 
P
L
 
I
T
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
T
N
 
G
A
 
A
T
 
N
T
 
S
T
 
T
K
 
R
E
 
E
V
 
A
I
 
I
R
 
E
L
 
L
G
 
T
Q
 
K
E
 
A
A
 
A
K
 
K
R
 
D
A
 
L
G
 
G
L
 
A
N
 
D
A
 
A
L
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
V
A
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
A
 
N
Q
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
D
 
E
E
 
G
L
 
L
L
 
Y
S
 
Q
H
 
H
L
 
Y
L
 
K
K
 
A
V
 
I
D
 
A
D
 
E
S
 
A
L
 
V
D
 
E
M
 
L
P
 
P
V
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
F
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
T
 
V
H
 
D
I
 
L
G
 
S
D
 
N
N
 
D
V
 
T
L
 
A
S
 
V
K
 
R
L
 
L
L
 
A
E
 
E
R
 
I
P
 
P
N
 
N
F
 
I
I
 
V
A
 
G
M
 
I
K
|
K
E
 
D
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V
S
 
P
H
 
R
L
 
G
H
 
K
H
 
A
L
 
L
A
 
I
T
 
D
H
 
A
F
 
L
R
 
N
D
 
G
R
 
K
L
 
M
V
 
A
L
 
V
S
 
Y
C
 
S
G
 
G
M
 
D
D
 
D
D
 
E
Q
 
T
A
 
A
L
 
W
E
 
E
F
 
L
F
 
M
V
 
L
W
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
S
 
G
W
 
N
V
x
I
G
 
S
G
 
V
A
 
T
S
 
A
N
 
N
F
 
I
L
 
A
P
 
P
E
 
K
A
 
A
H
 
M
T
 
S

3tceA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 5-hydroxylysine at 2.6 a resolution
31% identity, 73% coverage: 2:215/295 of query aligns to 1:215/291 of 3tceA

query
sites
3tceA
S
 
T
F
 
I
E
 
Q
G
 
G
V
 
S
H
 
I
T
 
V
P
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
K
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
E
 
G
I
 
V
D
 
D
H
 
W
T
 
K
L
 
S
L
 
L
G
 
E
K
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
W
H
 
H
A
 
I
V
 
E
N
 
Q
L
 
G
A
 
T
G
 
N
R
 
S
V
 
I
A
 
V
G
 
A
L
 
V
G
 
G
V
 
-
G
 
-
G
 
-
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
A
Y
x
S
A
 
T
L
|
L
S
 
S
F
 
M
D
 
E
E
 
E
R
x
H
V
 
T
Q
 
Q
T
 
V
F
 
I
N
 
K
T
 
E
V
 
I
A
 
I
E
 
R
A
 
V
A
 
A
G
 
N
G
 
K
K
 
R
T
 
I
Y
 
P
L
 
I
T
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
T
N
 
G
A
 
A
T
 
N
T
 
S
T
 
T
K
 
R
E
 
E
V
 
A
I
 
I
R
 
E
L
 
L
G
 
T
Q
 
K
E
 
A
A
 
A
K
 
K
R
 
D
A
 
L
G
 
G
L
 
A
N
 
D
A
 
A
L
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
V
A
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
A
 
N
Q
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
D
 
E
E
 
G
L
 
L
L
 
Y
S
 
Q
H
 
H
L
 
Y
L
 
K
K
 
A
V
 
I
D
 
A
D
 
E
S
 
A
L
 
V
D
 
E
M
 
L
P
 
P
V
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
F
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
T
 
V
H
 
D
I
 
L
G
 
S
D
 
N
N
 
D
V
 
T
L
 
A
S
 
V
K
 
R
L
 
L
L
 
A
E
 
E
R
 
I
P
 
P
N
 
N
F
 
I
I
 
V
A
 
G
M
 
I
K
|
K
E
 
D
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V
S
 
P
H
 
R
L
 
G
H
 
K
H
 
A
L
 
L
A
 
I
T
 
D
H
 
A
F
 
L
R
 
N
D
 
G
R
 
K
L
 
M
V
 
A
L
 
V
S
 
Y
C
 
S
G
 
G
M
 
D
D
 
D
D
 
E
Q
 
T
A
 
A
L
 
W
E
 
E
F
 
L
F
 
M
V
 
L
W
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
S
 
G
W
 
N
V
x
I
G
 
S
G
 
V
A
 
T
S
 
A
N
 
N
F
 
I
L
 
A
P
 
P
E
 
K
A
 
A
H
 
M
T
 
S

3rk8A Crystal structure of the chloride inhibited dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with pyruvate at 1.8 a resolution
31% identity, 73% coverage: 2:215/295 of query aligns to 1:215/291 of 3rk8A

query
sites
3rk8A
S
 
T
F
 
I
E
 
Q
G
 
G
V
 
S
H
 
I
T
 
V
P
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
K
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
E
 
G
I
 
V
D
 
D
H
 
W
T
 
K
L
 
S
L
 
L
G
 
E
K
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
W
H
 
H
A
 
I
V
 
E
N
 
Q
L
 
G
A
 
T
G
 
N
R
 
S
V
 
I
A
 
V
G
 
A
L
 
V
G
 
G
V
 
-
G
 
-
G
 
-
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
A
Y
 
S
A
 
T
L
 
L
S
 
S
F
 
M
D
 
E
E
 
E
R
 
H
V
 
T
Q
 
Q
T
 
V
F
 
I
N
 
K
T
 
E
V
 
I
A
 
I
E
 
R
A
 
V
A
 
A
G
 
N
G
 
K
K
 
R
T
 
I
Y
 
P
L
 
I
T
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
T
N
 
G
A
 
A
T
 
N
T
 
S
T
 
T
K
 
R
E
 
E
V
 
A
I
 
I
R
 
E
L
 
L
G
 
T
Q
 
K
E
 
A
A
 
A
K
 
K
R
 
D
A
 
L
G
 
G
L
 
A
N
 
D
A
 
A
L
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
V
A
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
A
 
N
Q
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
D
 
E
E
 
G
L
 
L
L
 
Y
S
 
Q
H
 
H
L
 
Y
L
 
K
K
 
A
V
 
I
D
 
A
D
 
E
S
 
A
L
 
V
D
 
E
M
 
L
P
 
P
V
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
F
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
T
 
V
H
 
D
I
 
L
G
 
S
D
 
N
N
 
D
V
 
T
L
 
A
S
 
V
K
 
R
L
 
L
L
 
A
E
 
E
R
 
I
P
 
P
N
 
N
F
 
I
I
 
V
A
 
G
M
 
I
K
|
K
E
 
D
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V
S
 
P
H
 
R
L
 
G
H
 
K
H
 
A
L
 
L
A
 
I
T
 
D
H
 
A
F
 
L
R
 
N
D
 
G
R
 
K
L
 
M
V
 
A
L
 
V
S
 
Y
C
 
S
G
|
G
M
 
D
D
 
D
D
 
E
Q
 
T
A
 
A
L
 
W
E
 
E
F
 
L
F
 
M
V
 
L
W
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
S
 
G
W
 
N
V
x
I
G
 
S
G
 
V
A
 
T
S
 
A
N
 
N
F
 
I
L
 
A
P
 
P
E
 
K
A
 
A
H
 
M
T
 
S

Sites not aligning to the query:

3pueB Crystal structure of the complex of dhydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with lysine at 2.6a resolution
31% identity, 73% coverage: 2:215/295 of query aligns to 1:215/291 of 3pueB

query
sites
3pueB
S
 
T
F
 
I
E
 
Q
G
 
G
V
 
S
H
 
I
T
 
V
P
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
K
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
E
 
G
I
 
V
D
 
D
H
 
W
T
 
K
L
 
S
L
 
L
G
 
E
K
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
W
H
 
H
A
 
I
V
 
E
N
 
Q
L
 
G
A
 
T
G
 
N
R
 
S
V
 
I
A
 
V
G
 
A
L
 
V
G
 
G
V
 
-
G
 
-
G
 
-
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
A
Y
 
S
A
 
T
L
 
L
S
 
S
F
 
M
D
 
E
E
 
E
R
 
H
V
 
T
Q
 
Q
T
 
V
F
 
I
N
 
K
T
 
E
V
 
I
A
 
I
E
 
R
A
 
V
A
 
A
G
 
N
G
 
K
K
 
R
T
 
I
Y
 
P
L
 
I
T
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
T
N
 
G
A
 
A
T
 
N
T
 
S
T
 
T
K
 
R
E
 
E
V
 
A
I
 
I
R
 
E
L
 
L
G
 
T
Q
 
K
E
 
A
A
 
A
K
 
K
R
 
D
A
 
L
G
 
G
L
 
A
N
 
D
A
 
A
L
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
V
A
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
A
 
N
Q
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
D
 
E
E
 
G
L
 
L
L
 
Y
S
 
Q
H
 
H
L
 
Y
L
 
K
K
 
A
V
 
I
D
 
A
D
 
E
S
 
A
L
 
V
D
 
E
M
 
L
P
 
P
V
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
F
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
T
 
V
H
 
D
I
 
L
G
 
S
D
 
N
N
 
D
V
 
T
L
 
A
S
 
V
K
 
R
L
 
L
L
 
A
E
 
E
R
 
I
P
 
P
N
 
N
F
 
I
I
 
V
A
 
G
M
 
I
K
|
K
E
 
D
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V
S
 
P
H
 
R
L
 
G
H
 
K
H
 
A
L
 
L
A
 
I
T
 
D
H
 
A
F
 
L
R
 
N
D
 
G
R
 
K
L
 
M
V
 
A
L
 
V
S
 
Y
C
 
S
G
 
G
M
 
D
D
 
D
D
 
E
Q
 
T
A
 
A
L
 
W
E
 
E
F
 
L
F
 
M
V
 
L
W
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
S
 
G
W
 
N
V
x
I
G
 
S
G
 
V
A
 
T
S
 
A
N
 
N
F
 
I
L
 
A
P
 
P
E
 
K
A
 
A
H
 
M
T
 
S

Sites not aligning to the query:

4bwlC Structure of the y137a mutant of e. Coli n-acetylneuraminic acid lyase in complex with pyruvate, n-acetyl-d-mannosamine and n- acetylneuraminic acid (see paper)
29% identity, 99% coverage: 2:293/295 of query aligns to 4:295/296 of 4bwlC

query
sites
4bwlC
S
 
N
F
 
L
E
 
R
G
 
G
V
 
V
H
 
M
T
 
A
P
 
A
L
 
L
V
 
L
T
 
T
P
 
P
F
 
F
K
 
D
A
 
Q
D
 
Q
G
 
Q
E
 
A
I
 
L
D
 
D
H
 
K
T
 
A
L
 
S
L
 
L
G
 
R
K
 
R
H
 
L
A
 
V
-
 
Q
V
 
F
N
 
N
L
 
I
A
 
Q
G
 
Q
R
 
G
V
 
I
A
 
D
G
 
G
L
 
L
G
 
Y
V
 
V
G
 
G
G
 
G
T
x
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
A
Y
 
F
A
 
V
L
 
Q
S
 
S
F
 
L
D
 
S
E
 
E
R
 
R
V
 
E
Q
 
Q
T
 
V
F
 
L
N
 
E
T
 
I
V
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
E
A
 
A
G
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
I
Y
 
K
L
 
L
T
 
I
A
 
A
G
 
H
I
 
V
N
 
G
A
 
C
T
 
V
T
 
S
T
 
T
K
 
A
E
 
E
V
 
S
I
 
Q
R
 
Q
L
 
L
G
 
A
Q
 
A
E
 
S
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
Y
G
 
G
L
 
F
N
 
D
A
 
A
L
 
V
L
 
S
L
 
A
A
 
V
A
 
T
P
 
P
Y
 
F
Y
|
Y
A
 
Y
Q
 
P
P
 
F
T
 
S
Q
 
F
D
 
E
E
 
E
L
 
H
L
 
C
S
 
D
H
 
H
L
 
Y
L
 
R
K
 
A
V
 
I
D
 
I
D
 
D
S
 
S
L
 
A
D
 
D
-
 
G
M
 
L
P
 
P
V
 
M
M
 
V
L
 
V
Y
x
A
N
 
N
F
x
I
P
 
P
A
 
A
R
x
L
T
 
S
G
 
G
T
 
V
H
 
K
I
 
L
G
 
T
D
 
L
N
 
D
V
 
Q
L
 
I
S
 
N
K
 
T
L
 
L
L
 
V
E
 
T
R
 
L
P
 
P
N
 
G
F
 
V
I
 
G
A
 
A
M
 
L
K
|
K
E
 
Q
S
x
T
T
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
L
S
 
Y
H
 
Q
L
 
M
H
 
E
H
 
Q
L
 
I
A
 
R
T
 
R
H
 
E
F
 
H
R
 
P
D
 
D
R
 
-
L
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
Y
C
 
N
G
|
G
M
 
Y
D
|
D
D
x
E
Q
 
I
A
 
F
L
 
A
E
 
S
F
 
G
F
 
L
V
 
L
W
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
D
S
 
G
W
 
G
V
x
I
G
 
G
G
x
S
A
 
T
S
 
Y
N
 
N
F
 
I
L
 
M
P
 
G
E
 
W
A
 
R
H
 
Y
T
 
Q
A
 
G
L
 
I
L
 
V
D
 
K
A
 
A
C
 
-
V
 
L
K
 
K
H
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
I
A
 
Q
T
 
T
G
 
A
R
 
Q
K
 
K
L
 
L
M
 
Q
A
 
T
Q
 
E
L
 
C
L
 
N
P
 
K
V
 
V
L
 
I
E
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
I
R
 
K
S
 
T
G
 
G
K
 
V
F
|
F
-
 
R
-
 
G
I
 
L
Q
 
K
Y
 
T
V
 
V
R
 
L
Y
 
H
G
 
Y
C
 
M
E
 
D
L
 
V
A
 
V
G
 
S
T
 
V
P
 
P
V
 
-
G
 
-
V
 
L
A
 
C
R
 
R
A
 
K
P
 
P
L
 
F
G
 
G
T
 
P
L
 
V
D
 
D
E
 
E
N
 
K
E
 
Y
R
 
L
S
 
P
G
 
E
F
 
L
A
 
K
K
 
A
L
 
L
V
 
A
R
 
Q
P
 
Q
L
 
L
L
 
M
S
 
Q
N
 
E

4bwlA Structure of the y137a mutant of e. Coli n-acetylneuraminic acid lyase in complex with pyruvate, n-acetyl-d-mannosamine and n- acetylneuraminic acid (see paper)
29% identity, 99% coverage: 2:293/295 of query aligns to 6:297/299 of 4bwlA

query
sites
4bwlA
S
 
N
F
 
L
E
 
R
G
 
G
V
 
V
H
 
M
T
 
A
P
 
A
L
 
L
V
 
L
T
 
T
P
 
P
F
 
F
K
 
D
A
 
Q
D
 
Q
G
 
Q
E
 
A
I
 
L
D
 
D
H
 
K
T
 
A
L
 
S
L
 
L
G
 
R
K
 
R
H
 
L
A
 
V
-
 
Q
V
 
F
N
 
N
L
 
I
A
 
Q
G
 
Q
R
 
G
V
 
I
A
 
D
G
 
G
L
 
L
G
 
Y
V
 
V
G
 
G
G
 
G
T
x
S
T
|
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
A
Y
 
F
A
 
V
L
 
Q
S
 
S
F
 
L
D
 
S
E
 
E
R
 
R
V
 
E
Q
 
Q
T
 
V
F
 
L
N
 
E
T
 
I
V
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
E
A
 
A
G
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
I
Y
 
K
L
 
L
T
 
I
A
 
A
G
 
H
I
 
V
N
 
G
A
 
C
T
 
V
T
 
S
T
 
T
K
 
A
E
 
E
V
 
S
I
 
Q
R
 
Q
L
 
L
G
 
A
Q
 
A
E
 
S
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
Y
G
 
G
L
 
F
N
 
D
A
 
A
L
 
V
L
 
S
L
 
A
A
 
V
A
 
T
P
 
P
Y
 
F
Y
|
Y
A
 
Y
Q
 
P
P
 
F
T
 
S
Q
 
F
D
 
E
E
 
E
L
 
H
L
 
C
S
 
D
H
 
H
L
 
Y
L
 
R
K
 
A
V
 
I
D
 
I
D
 
D
S
 
S
L
 
A
D
 
D
-
 
G
M
 
L
P
 
P
V
 
M
M
 
V
L
 
V
Y
x
A
N
 
N
F
 
I
P
 
P
A
 
A
R
x
L
T
 
S
G
 
G
T
 
V
H
 
K
I
 
L
G
 
T
D
 
L
N
 
D
V
 
Q
L
 
I
S
 
N
K
 
T
L
 
L
L
 
V
E
 
T
R
 
L
P
 
P
N
 
G
F
 
V
I
 
G
A
 
A
M
 
L
K
|
K
E
 
Q
S
x
T
T
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
L
S
 
Y
H
 
Q
L
 
M
H
 
E
H
 
Q
L
 
I
A
 
R
T
 
R
H
 
E
F
 
H
R
 
P
D
 
D
R
 
-
L
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
Y
C
 
N
G
|
G
M
x
Y
D
|
D
D
x
E
Q
 
I
A
 
F
L
 
A
E
 
S
F
 
G
F
 
L
V
 
L
W
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
D
S
 
G
W
 
G
V
x
I
G
 
G
G
x
S
A
 
T
S
 
Y
N
 
N
F
 
I
L
 
M
P
 
G
E
 
W
A
 
R
H
 
Y
T
 
Q
A
 
G
L
 
I
L
 
V
D
 
K
A
 
A
C
 
-
V
 
L
K
 
K
H
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
I
A
 
Q
T
 
T
G
 
A
R
 
Q
K
 
K
L
 
L
M
 
Q
A
 
T
Q
 
E
L
 
C
L
 
N
P
 
K
V
 
V
L
 
I
E
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
I
R
 
K
S
 
T
G
 
G
K
 
V
F
|
F
-
 
R
-
 
G
I
 
L
Q
 
K
Y
 
T
V
 
V
R
 
L
Y
 
H
G
 
Y
C
 
M
E
 
D
L
 
V
A
 
V
G
 
S
T
 
V
P
 
P
V
 
-
G
 
-
V
 
L
A
 
C
R
 
R
A
 
K
P
 
P
L
 
F
G
 
G
T
 
P
L
 
V
D
 
D
E
 
E
N
 
K
E
 
Y
R
 
L
S
 
P
G
 
E
F
 
L
A
 
K
K
 
A
L
 
L
V
 
A
R
 
Q
P
 
Q
L
 
L
L
 
M
S
 
Q
N
 
E

3na8A Crystal structure of a putative dihydrodipicolinate synthetase from pseudomonas aeruginosa
33% identity, 93% coverage: 2:276/295 of query aligns to 2:276/291 of 3na8A

query
sites
3na8A
S
 
S
F
 
I
E
 
H
G
 
G
V
 
I
H
 
I
T
 
G
P
 
Y
L
 
T
V
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
K
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
G
I
 
L
D
 
D
H
 
L
T
 
P
L
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
R
H
 
S
A
 
I
V
 
E
N
 
R
L
 
L
A
 
I
-
 
D
G
 
G
R
 
G
V
 
V
A
 
H
G
 
A
L
 
I
G
 
A
V
 
P
G
 
L
G
 
G
T
x
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
G
Y
 
A
A
 
Y
L
 
L
S
 
S
-
 
D
-
 
P
-
 
E
F
 
W
D
 
D
E
 
E
R
 
V
V
 
V
Q
 
D
-
 
F
T
 
T
F
 
L
N
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
H
A
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
R
T
 
V
Y
 
P
L
 
T
T
 
I
A
 
V
G
 
S
I
 
V
N
 
S
A
 
D
T
 
L
T
 
T
T
 
T
K
 
A
E
 
K
V
 
T
I
 
V
R
 
R
L
 
R
G
 
A
Q
 
Q
E
 
F
A
 
A
K
 
E
R
 
S
A
 
L
G
 
G
L
 
A
N
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
M
L
 
V
A
 
L
A
 
P
P
 
I
Y
 
S
Y
|
Y
A
 
W
Q
 
K
P
 
L
T
 
N
Q
 
E
D
 
A
E
 
E
L
 
V
L
 
F
S
 
Q
H
 
H
L
 
Y
L
 
R
K
 
A
V
 
V
D
 
G
D
 
E
S
 
A
L
 
I
D
 
G
M
 
V
P
 
P
V
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
F
 
N
P
 
P
A
 
G
R
x
T
T
 
S
G
 
G
T
 
I
H
 
D
I
 
M
G
 
S
D
 
V
N
 
E
V
 
L
L
 
I
S
 
L
K
 
R
L
 
I
L
x
V
-
 
R
E
 
E
R
x
V
P
x
D
N
 
N
F
x
V
I
 
T
A
 
M
M
 
V
K
|
K
E
 
E
S
 
S
T
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
I
S
 
Q
H
 
R
L
 
M
H
 
H
H
 
K
L
 
L
A
 
R
T
 
L
H
 
L
F
 
G
R
 
E
D
 
G
R
 
R
L
 
V
V
 
P
L
 
F
S
 
Y
C
 
N
G
 
G
M
 
C
D
 
N
D
 
P
Q
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
F
 
A
F
 
F
V
 
V
W
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
S
 
G
W
 
W
V
x
C
G
 
S
G
 
A
A
 
A
S
 
P
N
 
N
F
 
L
L
 
I
P
 
P
E
 
T
A
 
L
H
 
N
T
 
G
A
 
Q
L
 
L
L
 
Y
D
 
Q
A
 
A
C
 
-
V
 
V
K
 
L
H
 
D
G
 
G
D
 
D
F
 
L
A
 
E
T
 
K
G
 
A
R
 
R
K
 
A
L
 
L
M
 
F
A
 
Y
Q
 
R
L
 
Q
L
 
L
P
 
P
V
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
F
L
 
I
E
 
L
R
 
R
S
 
R
G
 
G
K
 
-
F
 
L
I
 
P
Q
 
T
Y
 
T
V
 
I
R
 
K
Y
 
A
G
 
G
C
 
L
E
 
G
L
 
L
A
 
S
G
 
G
T
 
L
P
 
E
V
 
V
G
 
G
V
 
A
A
 
P
R
 
R
A
 
L
P
 
P
L
 
V
G
 
Q
T
 
A
L
 
L
D
 
D

4ptnA Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein in complex with magnesium cation coordinated l-glyceraldehyde (see paper)
28% identity, 95% coverage: 3:281/295 of query aligns to 3:286/298 of 4ptnA

query
sites
4ptnA
F
 
F
E
 
T
G
 
G
V
 
I
H
 
I
T
 
P
P
|
P
L
 
V
V
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
K
 
T
A
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
Q
I
 
L
D
 
D
H
 
K
T
 
P
L
 
G
L
 
T
G
 
A
K
 
A
H
 
L
A
 
I
V
 
D
N
 
D
L
 
L
-
 
I
A
 
K
G
 
A
R
 
G
V
 
V
A
 
D
G
 
G
L
 
L
G
 
F
V
 
F
G
 
L
G
 
G
T
x
S
T
x
G
G
 
G
E
 
E
Y
 
F
Y
 
S
A
 
Q
L
 
L
S
 
G
F
 
A
D
 
E
E
 
E
R
 
R
V
 
K
Q
 
A
T
 
I
F
 
A
N
 
R
T
 
F
V
 
A
A
 
I
E
 
D
A
 
H
A
 
V
G
 
D
G
 
R
K
 
R
T
 
V
Y
 
P
L
 
V
T
 
L
A
 
I
G
 
G
I
 
T
N
 
G
A
 
G
T
 
T
T
 
N
T
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
T
I
 
I
R
 
E
L
 
L
G
 
S
Q
 
Q
E
 
H
A
 
A
K
 
Q
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
A
N
 
D
A
 
G
L
 
I
L
 
V
L
 
V
A
 
I
A
 
N
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
A
 
W
Q
 
K
P
 
V
T
 
S
Q
 
E
D
 
A
E
 
N
L
 
L
L
 
I
S
 
R
H
 
Y
L
 
F
L
 
E
K
 
Q
V
 
V
D
 
A
D
 
D
S
 
S
L
 
V
D
 
T
M
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
F
 
F
P
 
P
A
 
A
R
x
L
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
H
 
D
I
 
L
G
 
T
D
 
P
N
 
A
V
 
L
L
 
V
S
 
K
K
 
T
L
 
L
L
 
A
E
 
D
-
 
S
R
 
R
P
 
S
N
 
N
F
 
I
I
 
I
A
 
G
M
 
I
K
|
K
E
 
D
S
 
T
T
 
I
G
 
D
D
 
S
I
 
V
S
 
A
H
 
H
L
 
L
H
 
R
-
 
S
-
 
M
-
 
I
H
 
H
L
 
T
A
 
V
T
 
K
H
 
G
F
 
A
R
 
H
D
 
P
R
 
H
L
 
F
V
 
T
L
 
V
S
 
L
C
 
C
G
|
G
M
x
Y
D
 
D
D
 
D
Q
 
H
A
 
L
L
 
F
E
 
N
F
 
T
F
 
L
V
 
L
W
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
D
S
 
G
W
 
A
V
x
I
G
 
S
G
x
A
A
 
S
S
 
G
N
 
N
F
 
F
L
 
A
P
 
P
E
 
Q
A
 
V
H
 
S
T
 
V
A
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
K
A
 
A
C
 
W
V
 
-
K
 
R
H
 
D
G
 
G
D
 
D
F
 
V
A
 
A
T
 
K
G
 
A
R
 
A
K
 
G
L
 
Y
M
 
H
A
 
Q
Q
 
T
L
 
L
L
 
L
P
 
Q
V
 
I
L
 
P
E
 
Q
L
 
M
L
 
Y
E
 
Q
R
 
L
S
 
D
G
 
T
K
 
P
F
 
F
I
 
V
Q
 
N
Y
 
V
V
 
I
R
 
K
Y
 
E
G
 
A
C
 
I
E
 
V
L
 
L
A
 
C
G
 
G
T
 
R
P
 
P
V
 
V
G
 
S
V
 
T
-
 
H
A
 
V
R
 
L
A
 
P
P
 
P
L
 
A
G
 
S
T
 
P
L
 
L
D
 
D
E
 
E
N
 
P
E
 
R
R
 
K
S
 
A

4onvA Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein in complex with 2- keto-3-deoxy gluconate
28% identity, 95% coverage: 3:281/295 of query aligns to 3:286/298 of 4onvA

query
sites
4onvA
F
 
F
E
 
T
G
 
G
V
 
I
H
 
I
T
 
P
P
|
P
L
 
V
V
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
K
 
T
A
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
Q
I
 
L
D
 
D
H
 
K
T
 
P
L
 
G
L
 
T
G
 
A
K
 
A
H
 
L
A
 
I
V
 
D
N
 
D
L
 
L
-
 
I
A
 
K
G
 
A
R
 
G
V
 
V
A
 
D
G
 
G
L
 
L
G
x
F
V
 
F
G
 
L
G
|
G
T
x
S
T
 
G
G
 
G
E
 
E
Y
 
F
Y
 
S
A
 
Q
L
 
L
S
 
G
F
 
A
D
 
E
E
 
E
R
 
R
V
 
K
Q
 
A
T
 
I
F
 
A
N
 
R
T
 
F
V
 
A
A
 
I
E
 
D
A
 
H
A
 
V
G
 
D
G
 
R
K
 
R
T
 
V
Y
 
P
L
 
V
T
 
L
A
 
I
G
 
G
I
 
T
N
 
G
A
 
G
T
 
T
T
 
N
T
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
T
I
 
I
R
 
E
L
 
L
G
 
S
Q
 
Q
E
 
H
A
 
A
K
 
Q
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
A
N
 
D
A
 
G
L
 
I
L
 
V
L
 
V
A
 
I
A
 
N
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
A
 
W
Q
 
K
P
 
V
T
 
S
Q
 
E
D
 
A
E
 
N
L
 
L
L
 
I
S
 
R
H
 
Y
L
 
F
L
 
E
K
 
Q
V
 
V
D
 
A
D
 
D
S
 
S
L
 
V
D
 
T
M
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
F
 
F
P
 
P
A
 
A
R
x
L
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
H
 
D
I
 
L
G
 
T
D
 
P
N
 
A
V
 
L
L
 
V
S
 
K
K
 
T
L
 
L
L
 
A
E
 
D
-
 
S
R
 
R
P
 
S
N
 
N
F
 
I
I
 
I
A
 
G
M
 
I
K
|
K
E
 
D
S
 
T
T
 
I
G
 
D
D
 
S
I
 
V
S
 
A
H
 
H
L
 
L
H
 
R
-
 
S
-
 
M
-
 
I
H
 
H
L
 
T
A
 
V
T
 
K
H
 
G
F
 
A
R
 
H
D
 
P
R
 
H
L
 
F
V
 
T
L
 
V
S
 
L
C
 
C
G
|
G
M
x
Y
D
 
D
D
 
D
Q
 
H
A
 
L
L
 
F
E
 
N
F
 
T
F
 
L
V
 
L
W
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
D
S
 
G
W
 
A
V
x
I
G
x
S
G
 
A
A
 
S
S
 
G
N
 
N
F
 
F
L
 
A
P
 
P
E
 
Q
A
 
V
H
 
S
T
 
V
A
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
K
A
 
A
C
 
W
V
 
-
K
 
R
H
 
D
G
 
G
D
 
D
F
 
V
A
 
A
T
 
K
G
 
A
R
 
A
K
 
G
L
 
Y
M
 
H
A
 
Q
Q
 
T
L
 
L
L
 
L
P
 
Q
V
 
I
L
 
P
E
 
Q
L
 
M
L
 
Y
E
 
Q
R
 
L
S
 
D
G
 
T
K
 
P
F
 
F
I
 
V
Q
 
N
Y
 
V
V
 
I
R
 
K
Y
 
E
G
 
A
C
 
I
E
 
V
L
 
L
A
 
C
G
 
G
T
 
R
P
 
P
V
 
V
G
 
S
V
 
T
-
 
H
A
 
V
R
 
L
A
 
P
P
 
P
L
 
A
G
 
S
T
 
P
L
 
L
D
 
D
E
 
E
N
 
P
E
 
R
R
 
K
S
 
A

4oe7D Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein, in complex with aldol condensed product of pyruvate and glyoxal
28% identity, 95% coverage: 3:281/295 of query aligns to 3:286/298 of 4oe7D

query
sites
4oe7D
F
 
F
E
 
T
G
 
G
V
 
I
H
 
I
T
 
P
P
|
P
L
 
V
V
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
K
 
T
A
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
Q
I
 
L
D
 
D
H
 
K
T
 
P
L
 
G
L
 
T
G
 
A
K
 
A
H
 
L
A
 
I
V
 
D
N
 
D
L
 
L
-
 
I
A
 
K
G
 
A
R
 
G
V
 
V
A
 
D
G
 
G
L
 
L
G
 
F
V
 
F
G
 
L
G
|
G
T
x
S
T
x
G
G
 
G
E
 
E
Y
 
F
Y
 
S
A
 
Q
L
 
L
S
 
G
F
 
A
D
 
E
E
 
E
R
 
R
V
 
K
Q
 
A
T
 
I
F
 
A
N
 
R
T
 
F
V
 
A
A
 
I
E
 
D
A
 
H
A
 
V
G
 
D
G
 
R
K
 
R
T
 
V
Y
 
P
L
 
V
T
 
L
A
 
I
G
 
G
I
 
T
N
 
G
A
 
G
T
 
T
T
 
N
T
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
T
I
 
I
R
 
E
L
 
L
G
 
S
Q
 
Q
E
 
H
A
 
A
K
 
Q
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
A
N
 
D
A
 
G
L
 
I
L
 
V
L
 
V
A
 
I
A
 
N
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
A
 
W
Q
 
K
P
 
V
T
 
S
Q
 
E
D
 
A
E
 
N
L
 
L
L
 
I
S
 
R
H
 
Y
L
 
F
L
 
E
K
 
Q
V
 
V
D
 
A
D
 
D
S
 
S
L
 
V
D
 
T
M
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
F
|
F
P
 
P
A
 
A
R
x
L
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
H
 
D
I
 
L
G
 
T
D
 
P
N
 
A
V
 
L
L
 
V
S
 
K
K
 
T
L
 
L
L
 
A
E
 
D
-
 
S
R
 
R
P
 
S
N
 
N
F
 
I
I
 
I
A
 
G
M
 
I
K
|
K
E
 
D
S
x
T
T
 
I
G
 
D
D
 
S
I
 
V
S
 
A
H
 
H
L
 
L
H
 
R
-
 
S
-
 
M
-
 
I
H
 
H
L
 
T
A
 
V
T
 
K
H
 
G
F
 
A
R
 
H
D
 
P
R
 
H
L
 
F
V
 
T
L
 
V
S
 
L
C
 
C
G
|
G
M
 
Y
D
 
D
D
 
D
Q
 
H
A
 
L
L
 
F
E
 
N
F
 
T
F
 
L
V
 
L
W
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
D
S
 
G
W
 
A
V
x
I
G
 
S
G
 
A
A
 
S
S
 
G
N
 
N
F
 
F
L
 
A
P
 
P
E
 
Q
A
 
V
H
 
S
T
 
V
A
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
K
A
 
A
C
 
W
V
 
-
K
 
R
H
 
D
G
 
G
D
 
D
F
 
V
A
 
A
T
 
K
G
 
A
R
 
A
K
 
G
L
 
Y
M
 
H
A
 
Q
Q
 
T
L
 
L
L
 
L
P
 
Q
V
 
I
L
 
P
E
 
Q
L
 
M
L
 
Y
E
 
Q
R
 
L
S
 
D
G
 
T
K
 
P
F
 
F
I
 
V
Q
 
N
Y
 
V
V
 
I
R
 
K
Y
 
E
G
 
A
C
 
I
E
 
V
L
 
L
A
 
C
G
 
G
T
 
R
P
 
P
V
 
V
G
 
S
V
 
T
-
 
H
A
 
V
R
 
L
A
 
P
P
 
P
L
 
A
G
 
S
T
 
P
L
 
L
D
 
D
E
 
E
N
 
P
E
 
R
R
 
K
S
 
A

4oe7B Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein, in complex with aldol condensed product of pyruvate and glyoxal
28% identity, 95% coverage: 3:281/295 of query aligns to 3:286/298 of 4oe7B

query
sites
4oe7B
F
 
F
E
 
T
G
 
G
V
 
I
H
 
I
T
 
P
P
|
P
L
 
V
V
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
K
 
T
A
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
Q
I
 
L
D
 
D
H
 
K
T
 
P
L
 
G
L
 
T
G
 
A
K
 
A
H
 
L
A
 
I
V
 
D
N
 
D
L
 
L
-
 
I
A
 
K
G
 
A
R
 
G
V
 
V
A
 
D
G
 
G
L
 
L
G
 
F
V
 
F
G
 
L
G
|
G
T
x
S
T
x
G
G
 
G
E
 
E
Y
 
F
Y
 
S
A
 
Q
L
 
L
S
 
G
F
 
A
D
 
E
E
 
E
R
 
R
V
 
K
Q
 
A
T
 
I
F
 
A
N
 
R
T
 
F
V
 
A
A
 
I
E
 
D
A
 
H
A
 
V
G
 
D
G
 
R
K
 
R
T
 
V
Y
 
P
L
 
V
T
 
L
A
 
I
G
 
G
I
 
T
N
 
G
A
 
G
T
 
T
T
 
N
T
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
T
I
 
I
R
 
E
L
 
L
G
 
S
Q
 
Q
E
 
H
A
 
A
K
 
Q
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
A
N
 
D
A
 
G
L
 
I
L
 
V
L
 
V
A
 
I
A
 
N
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
A
 
W
Q
 
K
P
 
V
T
 
S
Q
 
E
D
 
A
E
 
N
L
 
L
L
 
I
S
 
R
H
 
Y
L
 
F
L
 
E
K
 
Q
V
 
V
D
 
A
D
 
D
S
 
S
L
 
V
D
 
T
M
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
F
|
F
P
 
P
A
 
A
R
x
L
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
H
 
D
I
 
L
G
 
T
D
 
P
N
 
A
V
 
L
L
 
V
S
 
K
K
 
T
L
 
L
L
 
A
E
 
D
-
 
S
R
 
R
P
 
S
N
 
N
F
 
I
I
 
I
A
 
G
M
 
I
K
|
K
E
 
D
S
x
T
T
 
I
G
 
D
D
 
S
I
 
V
S
 
A
H
 
H
L
 
L
H
 
R
-
 
S
-
 
M
-
 
I
H
 
H
L
 
T
A
 
V
T
 
K
H
 
G
F
 
A
R
 
H
D
 
P
R
 
H
L
 
F
V
 
T
L
 
V
S
 
L
C
 
C
G
|
G
M
 
Y
D
 
D
D
 
D
Q
 
H
A
 
L
L
 
F
E
 
N
F
 
T
F
 
L
V
 
L
W
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
D
S
 
G
W
 
A
V
x
I
G
 
S
G
 
A
A
 
S
S
 
G
N
 
N
F
 
F
L
 
A
P
 
P
E
 
Q
A
 
V
H
 
S
T
 
V
A
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
K
A
 
A
C
 
W
V
 
-
K
 
R
H
 
D
G
 
G
D
 
D
F
 
V
A
 
A
T
 
K
G
 
A
R
 
A
K
 
G
L
 
Y
M
 
H
A
 
Q
Q
 
T
L
 
L
L
 
L
P
 
Q
V
 
I
L
 
P
E
 
Q
L
 
M
L
 
Y
E
 
Q
R
 
L
S
 
D
G
 
T
K
 
P
F
 
F
I
 
V
Q
 
N
Y
 
V
V
 
I
R
 
K
Y
 
E
G
 
A
C
 
I
E
 
V
L
 
L
A
 
C
G
 
G
T
 
R
P
 
P
V
 
V
G
 
S
V
 
T
-
 
H
A
 
V
R
 
L
A
 
P
P
 
P
L
 
A
G
 
S
T
 
P
L
 
L
D
 
D
E
 
E
N
 
P
E
 
R
R
 
K
S
 
A

4oe7A Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein, in complex with aldol condensed product of pyruvate and glyoxal
28% identity, 95% coverage: 3:281/295 of query aligns to 3:286/298 of 4oe7A

query
sites
4oe7A
F
 
F
E
 
T
G
 
G
V
 
I
H
 
I
T
 
P
P
|
P
L
 
V
V
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
K
 
T
A
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
Q
I
 
L
D
 
D
H
 
K
T
 
P
L
 
G
L
 
T
G
 
A
K
 
A
H
 
L
A
 
I
V
 
D
N
 
D
L
 
L
-
 
I
A
 
K
G
 
A
R
 
G
V
 
V
A
 
D
G
 
G
L
 
L
G
 
F
V
 
F
G
 
L
G
|
G
T
x
S
T
x
G
G
 
G
E
 
E
Y
 
F
Y
 
S
A
 
Q
L
 
L
S
 
G
F
 
A
D
 
E
E
 
E
R
 
R
V
 
K
Q
 
A
T
 
I
F
 
A
N
 
R
T
 
F
V
 
A
A
 
I
E
 
D
A
 
H
A
 
V
G
 
D
G
 
R
K
 
R
T
 
V
Y
 
P
L
 
V
T
 
L
A
 
I
G
 
G
I
 
T
N
 
G
A
 
G
T
 
T
T
 
N
T
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
T
I
 
I
R
 
E
L
 
L
G
 
S
Q
 
Q
E
 
H
A
 
A
K
 
Q
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
A
N
 
D
A
 
G
L
 
I
L
 
V
L
 
V
A
 
I
A
 
N
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
A
 
W
Q
 
K
P
 
V
T
 
S
Q
 
E
D
 
A
E
 
N
L
 
L
L
 
I
S
 
R
H
 
Y
L
 
F
L
 
E
K
 
Q
V
 
V
D
 
A
D
 
D
S
 
S
L
 
V
D
 
T
M
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
F
 
F
P
 
P
A
 
A
R
x
L
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
H
 
D
I
 
L
G
 
T
D
 
P
N
 
A
V
 
L
L
 
V
S
 
K
K
 
T
L
 
L
L
 
A
E
 
D
-
 
S
R
 
R
P
 
S
N
 
N
F
 
I
I
 
I
A
 
G
M
 
I
K
|
K
E
 
D
S
 
T
T
 
I
G
 
D
D
 
S
I
 
V
S
 
A
H
 
H
L
 
L
H
 
R
-
 
S
-
 
M
-
 
I
H
 
H
L
 
T
A
 
V
T
 
K
H
 
G
F
 
A
R
 
H
D
 
P
R
 
H
L
 
F
V
 
T
L
 
V
S
 
L
C
 
C
G
 
G
M
 
Y
D
 
D
D
 
D
Q
 
H
A
 
L
L
 
F
E
 
N
F
 
T
F
 
L
V
 
L
W
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
D
S
 
G
W
 
A
V
x
I
G
 
S
G
 
A
A
 
S
S
 
G
N
 
N
F
 
F
L
 
A
P
 
P
E
 
Q
A
 
V
H
 
S
T
 
V
A
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
K
A
 
A
C
 
W
V
 
-
K
 
R
H
 
D
G
 
G
D
 
D
F
 
V
A
 
A
T
 
K
G
 
A
R
 
A
K
 
G
L
 
Y
M
 
H
A
 
Q
Q
 
T
L
 
L
L
 
L
P
 
Q
V
 
I
L
 
P
E
 
Q
L
 
M
L
 
Y
E
 
Q
R
 
L
S
 
D
G
 
T
K
 
P
F
 
F
I
 
V
Q
 
N
Y
 
V
V
 
I
R
 
K
Y
 
E
G
 
A
C
 
I
E
 
V
L
 
L
A
 
C
G
 
G
T
 
R
P
 
P
V
 
V
G
 
S
V
 
T
-
 
H
A
 
V
R
 
L
A
 
P
P
 
P
L
 
A
G
 
S
T
 
P
L
 
L
D
 
D
E
 
E
N
 
P
E
 
R
R
 
K
S
 
A

3nevA Crystal structure of yage, a prophage protein from e. Coli k12 in complex with kdgal (see paper)
28% identity, 95% coverage: 3:281/295 of query aligns to 3:286/298 of 3nevA

query
sites
3nevA
F
 
F
E
 
T
G
 
G
V
 
I
H
 
I
T
 
P
P
|
P
L
 
V
V
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
K
 
T
A
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
Q
I
 
L
D
 
D
H
 
K
T
 
P
L
 
G
L
 
T
G
 
A
K
 
A
H
 
L
A
 
I
V
 
D
N
 
D
L
 
L
-
 
I
A
 
K
G
 
A
R
 
G
V
 
V
A
 
D
G
 
G
L
 
L
G
 
F
V
 
F
G
 
L
G
|
G
T
x
S
T
x
G
G
 
G
E
 
E
Y
 
F
Y
 
S
A
 
Q
L
 
L
S
 
G
F
 
A
D
 
E
E
 
E
R
 
R
V
 
K
Q
 
A
T
 
I
F
 
A
N
 
R
T
 
F
V
 
A
A
 
I
E
 
D
A
 
H
A
 
V
G
 
D
G
 
R
K
 
R
T
 
V
Y
 
P
L
 
V
T
 
L
A
 
I
G
 
G
I
 
T
N
 
G
A
 
G
T
 
T
T
 
N
T
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
T
I
 
I
R
 
E
L
 
L
G
 
S
Q
 
Q
E
 
H
A
 
A
K
 
Q
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
A
N
 
D
A
 
G
L
 
I
L
 
V
L
 
V
A
 
I
A
 
N
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
A
 
W
Q
 
K
P
 
V
T
 
S
Q
 
E
D
 
A
E
 
N
L
 
L
L
 
I
S
 
R
H
 
Y
L
 
F
L
 
E
K
 
Q
V
 
V
D
 
A
D
 
D
S
 
S
L
 
V
D
 
T
M
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
F
|
F
P
 
P
A
 
A
R
x
L
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
H
 
D
I
 
L
G
 
T
D
 
P
N
 
A
V
 
L
L
 
V
S
 
K
K
 
T
L
 
L
L
 
A
E
 
D
-
 
S
R
 
R
P
 
S
N
 
N
F
 
I
I
 
I
A
 
G
M
 
I
K
|
K
E
 
D
S
x
T
T
 
I
G
 
D
D
 
S
I
 
V
S
 
A
H
 
H
L
 
L
H
 
R
-
 
S
-
 
M
-
 
I
H
 
H
L
 
T
A
 
V
T
 
K
H
 
G
F
 
A
R
 
H
D
 
P
R
 
H
L
 
F
V
 
T
L
 
V
S
 
L
C
 
C
G
|
G
M
 
Y
D
 
D
D
 
D
Q
 
H
A
 
L
L
 
F
E
 
N
F
 
T
F
 
L
V
 
L
W
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
D
S
 
G
W
 
A
V
x
I
G
 
S
G
x
A
A
 
S
S
 
G
N
 
N
F
 
F
L
 
A
P
 
P
E
 
Q
A
 
V
H
 
S
T
 
V
A
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
K
A
 
A
C
 
W
V
 
-
K
 
R
H
 
D
G
 
G
D
 
D
F
 
V
A
 
A
T
 
K
G
 
A
R
 
A
K
 
G
L
 
Y
M
 
H
A
 
Q
Q
 
T
L
 
L
L
 
L
P
 
Q
V
 
I
L
 
P
E
 
Q
L
 
M
L
 
Y
E
 
Q
R
 
L
S
 
D
G
 
T
K
 
P
F
 
F
I
 
V
Q
 
N
Y
 
V
V
 
I
R
 
K
Y
 
E
G
 
A
C
 
I
E
 
V
L
 
L
A
 
C
G
 
G
T
 
R
P
 
P
V
 
V
G
 
S
V
 
T
-
 
H
A
 
V
R
 
L
A
 
P
P
 
P
L
 
A
G
 
S
T
 
P
L
 
L
D
 
D
E
 
E
N
 
P
E
 
R
R
 
K
S
 
A

Query Sequence

>H281DRAFT_00991 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_00991
MSFEGVHTPLVTPFKADGEIDHTLLGKHAVNLAGRVAGLGVGGTTGEYYALSFDERVQTF
NTVAEAAGGKTYLTAGINATTTKEVIRLGQEAKRAGLNALLLAAPYYAQPTQDELLSHLL
KVDDSLDMPVMLYNFPARTGTHIGDNVLSKLLERPNFIAMKESTGDISHLHHLATHFRDR
LVLSCGMDDQALEFFVWGAKSWVGGASNFLPEAHTALLDACVKHGDFATGRKLMAQLLPV
LELLERSGKFIQYVRYGCELAGTPVGVARAPLGTLDENERSGFAKLVRPLLSNAQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory