SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_01195 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_01195 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2hmcA The crystal structure of dihydrodipicolinate synthase dapa from agrobacterium tumefaciens
73% identity, 99% coverage: 1:310/314 of query aligns to 5:314/314 of 2hmcA

query
sites
2hmcA
M
 
M
S
 
T
N
 
A
N
 
S
I
 
I
F
 
F
T
 
S
G
 
G
T
 
V
I
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
M
 
M
T
 
T
P
 
P
C
 
C
T
 
R
A
 
Q
D
 
D
R
 
R
L
 
T
P
 
P
D
 
D
Y
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
R
K
 
K
A
 
G
R
 
K
E
 
E
L
 
L
V
 
I
N
 
A
L
 
D
G
 
G
M
 
M
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
C
 
C
G
 
G
S
|
S
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
T
E
 
D
A
 
E
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
M
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
E
R
 
R
L
 
L
V
 
V
A
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
T
 
V
I
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
|
A
V
 
V
N
 
N
S
 
T
K
 
A
E
 
S
A
 
A
I
 
V
S
 
A
H
 
H
A
 
A
A
 
V
H
 
H
A
 
A
A
 
Q
K
 
K
V
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
K
G
 
G
L
 
L
M
 
M
V
 
V
I
 
I
P
|
P
R
 
R
V
 
V
L
|
L
S
 
S
R
 
R
G
 
G
A
 
S
S
 
V
P
 
I
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
H
 
H
F
 
F
A
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
L
E
 
S
A
 
A
A
 
A
P
 
P
A
 
E
L
 
I
P
 
P
A
 
A
V
 
V
I
 
I
Y
|
Y
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
R
 
R
A
 
A
D
 
D
L
 
L
F
 
F
F
 
F
E
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
A
R
 
E
Y
 
H
P
 
K
N
 
N
L
 
L
I
 
V
G
 
G
F
 
F
K
|
K
E
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
P
A
 
A
D
 
D
M
 
M
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
N
I
 
I
T
|
T
S
 
S
Q
x
R
D
 
D
D
|
D
T
 
E
V
|
V
T
 
T
L
 
L
M
 
M
A
 
I
G
 
G
V
 
V
D
 
D
T
 
T
Q
 
A
V
 
V
F
 
V
H
 
H
G
 
G
F
 
F
V
 
V
N
 
N
C
 
C
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
I
|
I
T
 
T
G
 
G
I
 
I
G
 
G
N
 
N
A
 
V
L
 
L
P
 
P
R
 
K
E
 
E
V
 
V
L
 
I
Q
 
H
L
 
L
V
 
C
D
 
K
L
 
L
C
 
S
R
 
Q
K
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
G
D
 
D
V
 
A
T
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
A
Q
 
R
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
L
E
 
E
S
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
V
L
 
L
S
 
S
S
 
S
F
 
F
D
 
D
E
 
E
G
 
G
T
 
P
D
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
F
K
 
K
Y
 
Y
L
 
M
M
 
M
V
 
V
L
 
L
N
 
K
G
 
G
D
 
D
T
 
K
E
 
E
Y
 
Y
S
 
T
L
 
L
H
 
H
F
 
F
Y
 
N
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
T
E
 
D
A
 
S
Q
 
Q
R
 
R
R
 
G
Y
 
Y
A
 
V
Q
 
E
T
 
A
Q
 
Q
Y
 
F
E
 
K
L
 
L
F
 
F
R
 
N
N
 
S
W
 
W
Y
 
Y
A
 
A
E
 
D
W
 
W
S
 
S
K
 
K

Q8UGL3 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) (Agrobacterium tumefaciens (strain C58)) (see paper)
33% identity, 68% coverage: 5:218/314 of query aligns to 1:213/294 of Q8UGL3

query
sites
Q8UGL3
I
 
M
F
 
F
T
 
K
G
 
G
T
 
S
I
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
M
 
I
T
 
T
P
 
P
C
 
F
T
 
T
A
 
D
D
 
N
R
 
G
L
 
S
P
 
V
D
 
D
Y
 
E
D
 
K
A
 
A
L
 
F
V
 
A
A
 
A
K
 
H
A
 
V
R
 
E
E
 
W
L
 
Q
V
 
I
N
 
A
L
 
E
G
 
G
M
 
S
S
 
N
A
 
G
V
 
L
V
 
V
Y
 
P
C
 
V
G
 
G
S
 
T
M
x
T
G
 
G
D
 
E
W
 
S
P
|
P
L
 
T
L
 
L
T
 
S
E
 
H
A
 
D
Q
 
E
R
x
H
Q
 
K
-
 
R
-
 
V
-
 
V
E
 
E
G
 
L
V
 
C
A
 
I
R
 
E
L
 
V
V
 
A
A
 
A
A
 
K
G
 
R
I
 
V
P
 
P
T
 
V
I
 
I
V
 
A
G
 
G
T
 
A
G
 
G
A
 
S
V
x
N
N
 
N
S
 
T
K
 
D
E
|
E
A
 
A
I
 
I
S
 
E
H
 
L
A
 
A
A
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
Q
K
 
E
V
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
D
G
 
A
L
 
L
M
 
L
V
 
V
I
 
V
P
 
T
R
 
P
V
x
Y
L
 
Y
S
 
N
R
 
K
G
 
-
A
 
-
S
 
-
P
 
-
A
 
P
A
 
T
Q
 
Q
K
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
F
A
 
A
H
 
H
F
 
F
A
 
S
A
 
A
I
 
V
L
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
V
P
 
-
A
 
K
L
 
L
P
 
P
A
 
I
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
S
 
I
P
 
P
Y
 
P
Y
 
R
G
 
S
F
 
V
A
 
V
T
 
D
R
 
M
A
 
S
-
 
P
D
 
E
L
 
T
F
 
M
F
 
G
E
 
A
L
 
L
R
 
V
G
 
K
R
 
A
Y
 
H
P
 
K
N
 
N
L
 
I
I
 
I
G
 
G
F
 
V
K
|
K
E
 
D
F
 
A
G
 
T
G
 
G
A
 
K
A
 
L
D
 
D
M
 
-
R
 
R
Y
 
V
A
 
S
A
 
E
E
 
Q
H
 
R
I
 
I
T
 
S
S
 
C
Q
 
G
D
 
K
D
 
D
T
 
F
V
 
V
T
 
Q
L
 
L
M
 
-
A
 
S
G
 
G
V
 
E
D
 
D
T
 
G
Q
 
T
V
 
A
F
 
L
H
 
-
G
 
G
F
 
F
V
 
N
N
 
A
C
 
H
G
 
G
A
 
G
T
 
V
G
 
G
A
 
C
I
 
I
T
 
S
G
 
V
I
 
T
G
 
A
N
 
N
A
 
V
L
 
A
P
 
P
R
 
R

4i7wA Agrobacterium tumefaciens dhdps with lysine and pyruvate
32% identity, 68% coverage: 5:218/314 of query aligns to 1:213/294 of 4i7wA

query
sites
4i7wA
I
 
M
F
 
F
T
 
K
G
 
G
T
 
S
I
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
M
 
I
T
 
T
P
 
P
C
 
F
T
 
T
A
 
D
D
 
N
R
 
G
L
 
A
P
 
V
D
 
D
Y
 
E
D
 
Q
A
 
A
L
 
F
V
 
A
A
 
A
K
 
H
A
 
V
R
 
E
E
 
W
L
 
Q
V
 
I
N
 
A
L
 
E
G
 
G
M
 
S
S
 
N
A
 
G
V
 
L
V
 
V
Y
 
P
C
 
V
G
 
G
S
x
T
M
 
T
G
 
G
D
 
E
W
x
S
P
|
P
L
 
T
L
|
L
T
 
S
E
 
H
A
 
D
Q
 
E
R
x
H
Q
 
K
-
 
R
-
 
V
-
 
V
E
 
E
G
 
L
V
 
C
A
 
I
R
 
E
L
 
V
V
 
A
A
 
A
A
 
K
G
 
R
I
 
V
P
 
P
T
 
V
I
 
I
V
 
A
G
 
G
T
 
A
G
 
G
A
 
S
V
x
N
N
 
N
S
 
T
K
 
D
E
|
E
A
 
A
I
 
I
S
 
E
H
 
L
A
 
A
A
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
Q
K
 
D
V
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
D
G
 
A
L
 
L
M
 
L
V
 
V
I
 
V
P
 
T
R
 
P
V
x
Y
L
x
Y
S
 
N
R
 
K
G
 
-
A
 
-
S
 
-
P
 
-
A
 
P
A
 
T
Q
 
Q
K
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
F
A
 
A
H
 
H
F
 
F
A
 
S
A
 
A
I
 
V
L
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
V
P
 
-
A
 
K
L
 
L
P
 
P
A
 
I
V
 
V
I
 
I
Y
|
Y
N
 
N
S
 
I
P
 
P
Y
 
P
Y
x
R
G
 
S
F
 
V
A
 
V
T
 
D
R
 
M
A
 
S
-
 
P
D
 
E
L
 
T
F
 
M
F
 
G
E
 
A
L
 
L
R
 
V
G
 
K
R
 
A
Y
 
H
P
 
K
N
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
V
K
|
K
E
 
D
F
 
A
G
 
T
G
 
G
A
 
K
A
 
L
D
 
D
M
 
-
R
 
R
Y
 
V
A
 
S
A
 
E
E
 
Q
H
 
R
I
 
I
T
 
S
S
 
C
Q
 
G
D
 
K
D
 
D
T
 
F
V
 
I
T
 
Q
L
 
L
M
 
-
A
 
S
G
 
G
V
 
E
D
 
D
T
 
S
Q
 
T
V
 
A
F
 
L
H
 
-
G
 
G
F
 
F
V
 
N
N
 
A
C
 
H
G
 
G
A
 
G
T
 
V
G
 
G
A
 
C
I
|
I
T
 
S
G
 
V
I
 
S
G
 
A
N
 
N
A
 
V
L
 
A
P
 
P
R
 
R

7mjfA Crystal structure of candidatus liberibacter solanacearum dihydrodipicolinate synthase with pyruvate and succinic semi-aldehyde bound in active site
31% identity, 78% coverage: 5:248/314 of query aligns to 1:237/296 of 7mjfA

query
sites
7mjfA
I
 
M
F
 
F
T
 
Q
G
 
R
T
 
S
I
 
I
P
 
P
A
|
A
L
 
L
M
 
I
T
 
T
P
 
P
C
 
F
T
 
T
A
 
K
D
 
D
R
 
N
L
 
L
P
 
I
D
 
D
Y
 
E
D
 
D
A
 
S
L
 
F
V
 
V
A
 
D
K
 
H
A
 
I
R
 
E
E
 
W
L
 
Q
V
 
I
N
 
S
L
 
E
G
 
G
M
 
S
S
 
S
A
 
G
V
 
L
V
 
V
Y
 
P
C
 
A
G
 
G
S
x
T
M
x
T
G
 
G
D
 
E
W
 
S
P
 
S
L
 
T
L
 
L
T
 
S
E
 
Y
A
 
E
Q
 
E
R
 
H
Q
 
C
E
 
R
G
 
V
V
 
V
A
 
E
R
 
L
L
 
C
V
 
V
-
 
K
-
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
G
-
 
R
I
 
V
P
 
P
T
 
V
I
 
M
V
 
A
G
 
G
T
 
A
G
 
G
A
 
S
V
 
N
N
 
N
S
 
T
K
 
K
E
 
E
A
 
S
I
 
I
S
 
E
H
 
L
A
 
A
A
 
Q
H
 
Y
A
 
A
A
 
Q
K
 
N
V
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
D
G
 
A
L
 
L
M
 
L
V
 
V
I
 
V
P
 
V
R
 
P
V
 
Y
L
 
Y
S
 
N
R
 
K
G
 
-
A
 
P
S
 
N
P
 
K
A
 
K
A
 
G
Q
 
L
K
 
L
A
 
A
H
 
H
F
 
F
A
 
G
A
 
S
I
 
I
L
 
A
E
 
N
A
 
A
A
 
V
P
 
-
A
 
S
L
 
L
P
 
P
A
 
I
V
 
Y
I
 
I
Y
|
Y
N
 
N
S
 
N
P
 
P
Y
 
S
Y
x
R
G
 
T
-
 
V
F
 
I
A
 
E
T
 
M
R
 
D
A
 
V
D
 
D
L
 
T
F
 
M
F
 
A
E
 
E
L
 
L
R
 
V
G
 
K
R
 
T
Y
 
Y
P
 
S
N
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
V
K
|
K
E
 
D
F
 
A
G
 
T
G
 
G
A
 
R
A
 
I
D
 
E
M
 
L
R
 
A
Y
 
-
A
 
S
A
 
G
E
 
Q
H
 
R
I
 
I
T
 
A
S
 
C
Q
 
G
D
 
S
D
 
D
T
 
F
V
 
I
T
 
Q
L
 
L
M
 
-
A
 
S
G
|
G
V
 
D
D
 
D
T
 
S
Q
 
S
V
 
A
F
 
L
H
 
-
G
 
G
F
 
F
V
 
N
N
 
V
C
 
H
G
 
G
A
 
G
T
 
V
G
 
G
A
 
C
I
 
I
T
 
S
G
 
V
I
 
T
G
 
A
N
 
N
A
 
V
L
 
A
P
 
P
R
 
R
E
 
-
V
 
-
L
 
-
Q
 
I
L
 
C
V
 
A
D
 
E
L
 
F
C
 
Q
R
 
K
K
 
A
A
 
I
A
 
S
K
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
-
T
 
-
A
 
-
R
 
Y
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
Y
E
 
Q
S
 
D
A
 
K
L
 
L

7lvlA Dihydrodipicolinate synthase bound with allosteric inhibitor (s)- lysine from candidatus liberibacter solanacearum
31% identity, 78% coverage: 5:248/314 of query aligns to 1:237/296 of 7lvlA

query
sites
7lvlA
I
 
M
F
 
F
T
 
Q
G
 
R
T
 
S
I
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
M
 
I
T
 
T
P
 
P
C
 
F
T
 
T
A
 
K
D
 
D
R
 
N
L
 
L
P
 
I
D
 
D
Y
 
E
D
 
D
A
 
S
L
 
F
V
 
V
A
 
D
K
 
H
A
 
I
R
 
E
E
 
W
L
 
Q
V
 
I
N
 
S
L
 
E
G
 
G
M
 
S
S
 
S
A
 
G
V
 
L
V
 
V
Y
 
P
C
 
A
G
 
G
S
x
T
M
 
T
G
 
G
D
 
E
W
x
S
P
x
S
L
 
T
L
|
L
T
 
S
E
 
Y
A
 
E
Q
 
E
R
 
H
Q
 
C
E
 
R
G
 
V
V
 
V
A
 
E
R
 
L
L
 
C
V
 
V
-
 
K
-
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
G
-
 
R
I
 
V
P
 
P
T
 
V
I
 
M
V
 
A
G
 
G
T
 
A
G
 
G
A
 
S
V
 
N
N
 
N
S
 
T
K
 
K
E
 
E
A
 
S
I
 
I
S
 
E
H
 
L
A
 
A
A
 
Q
H
 
Y
A
 
A
A
 
Q
K
 
N
V
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
D
G
 
A
L
 
L
M
 
L
V
 
V
I
 
V
P
 
V
R
 
P
V
x
Y
L
x
Y
S
 
N
R
 
K
G
 
-
A
 
P
S
 
N
P
 
K
A
 
K
A
 
G
Q
 
L
K
 
L
A
 
A
H
 
H
F
 
F
A
 
G
A
 
S
I
 
I
L
 
A
E
 
N
A
 
A
A
 
V
P
 
-
A
 
S
L
 
L
P
 
P
A
 
I
V
 
Y
I
 
I
Y
|
Y
N
 
N
S
 
N
P
 
P
Y
 
S
Y
x
R
G
 
T
-
 
V
F
 
I
A
 
E
T
 
M
R
 
D
A
 
V
D
 
D
L
 
T
F
 
M
F
 
A
E
 
E
L
 
L
R
 
V
G
 
K
R
 
T
Y
 
Y
P
 
S
N
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
V
K
|
K
E
 
D
F
 
A
G
 
T
G
 
G
A
 
R
A
 
I
D
 
E
M
 
L
R
 
A
Y
 
-
A
 
S
A
 
G
E
 
Q
H
 
R
I
 
I
T
 
A
S
 
C
Q
 
G
D
 
S
D
 
D
T
 
F
V
 
I
T
 
Q
L
 
L
M
 
-
A
 
S
G
 
G
V
 
D
D
 
D
T
 
S
Q
 
S
V
 
A
F
 
L
H
 
-
G
 
G
F
 
F
V
 
N
N
 
V
C
 
H
G
 
G
A
 
G
T
 
V
G
 
G
A
 
C
I
|
I
T
 
S
G
 
V
I
 
T
G
 
A
N
 
N
A
 
V
L
 
A
P
 
P
R
 
R
E
 
-
V
 
-
L
 
-
Q
 
I
L
 
C
V
 
A
D
 
E
L
 
F
C
 
Q
R
 
K
K
 
A
A
 
I
A
 
S
K
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
-
T
 
-
A
 
-
R
 
Y
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
Y
E
 
Q
S
 
D
A
 
K
L
 
L

4ptnA Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein in complex with magnesium cation coordinated l-glyceraldehyde (see paper)
28% identity, 85% coverage: 5:272/314 of query aligns to 2:266/298 of 4ptnA

query
sites
4ptnA
I
 
L
F
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
I
I
 
I
P
 
P
A
x
P
L
 
V
M
 
S
T
 
T
P
 
I
C
 
F
T
 
T
A
 
A
D
 
D
R
 
G
L
 
Q
P
 
L
D
 
D
Y
 
K
D
 
P
A
 
G
L
 
T
V
 
A
A
 
A
K
 
L
A
 
I
R
 
D
E
 
D
L
 
L
V
 
I
N
 
K
L
 
A
G
 
G
M
 
V
S
 
D
A
 
G
V
 
L
V
 
F
Y
 
F
C
 
L
G
 
G
S
|
S
M
x
G
G
 
G
D
 
E
W
 
F
P
 
S
L
 
Q
L
 
L
T
 
G
E
 
-
A
 
A
Q
 
E
R
 
E
Q
 
R
E
 
K
G
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
F
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
H
V
 
V
A
 
D
A
 
R
G
 
R
I
 
V
P
 
P
T
 
V
I
 
L
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
G
V
 
T
N
 
N
S
 
A
K
 
R
E
 
E
A
 
T
I
 
I
S
 
E
H
 
L
A
 
S
A
 
Q
H
 
H
A
 
A
A
 
Q
K
 
Q
V
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
D
G
 
G
L
 
I
M
 
V
V
 
V
I
 
I
P
 
N
R
 
P
V
 
Y
L
x
Y
S
 
W
R
 
K
G
 
-
A
 
V
S
 
S
P
 
E
A
 
A
A
 
N
Q
 
L
K
 
I
A
 
R
H
 
Y
F
 
F
A
 
E
A
 
Q
I
 
V
L
 
A
E
 
D
A
 
S
A
 
V
P
 
-
A
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
V
V
 
M
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
 
F
P
 
P
-
 
A
Y
x
L
Y
 
T
G
 
G
F
 
Q
A
 
D
T
 
L
R
 
T
A
 
P
D
 
A
L
 
L
F
 
V
F
 
K
E
 
T
L
 
L
R
 
A
G
 
D
R
 
S
Y
 
R
P
 
S
N
 
N
L
 
I
I
 
I
G
 
G
F
 
I
K
|
K
E
 
D
-
 
T
F
 
I
G
 
D
G
 
S
A
 
V
A
 
A
D
 
H
M
 
L
R
 
R
Y
 
S
A
 
M
A
 
I
E
 
H
H
 
T
I
 
V
T
 
K
S
 
G
Q
 
A
D
 
H
D
 
P
T
 
H
V
 
F
T
 
T
L
 
V
M
 
L
A
 
C
G
|
G
V
x
Y
D
 
D
T
 
D
Q
 
H
V
 
L
F
 
F
H
 
N
G
 
T
F
 
L
V
 
L
N
 
-
C
 
L
G
 
G
A
 
G
T
 
D
G
 
G
A
 
A
I
|
I
T
 
S
G
x
A
I
 
S
G
 
G
N
 
N
A
 
F
L
 
A
P
 
P
R
 
Q
E
 
V
V
 
S
L
 
V
Q
 
N
L
 
L
V
 
L
D
 
K
L
 
A
C
 
W
R
 
R
K
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
V
T
 
A
A
 
-
R
 
-
R
 
K
Q
 
A
A
 
A
R
 
G
E
 
Y
L
 
H
E
 
Q
S
 
T
A
 
L
L
 
L
A
 
Q
V
 
I
L
 
P
S
 
Q
S
 
M
F
 
Y
D
 
Q
E
 
L
G
 
D
T
 
T
D
 
P
L
 
F
V
 
V
L
 
N
Y
 
V
Y
 
I
K
 
K
Y
 
E
L
 
A
M
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
C
G
 
G

4onvA Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein in complex with 2- keto-3-deoxy gluconate
28% identity, 85% coverage: 5:272/314 of query aligns to 2:266/298 of 4onvA

query
sites
4onvA
I
 
L
F
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
I
I
 
I
P
 
P
A
x
P
L
 
V
M
 
S
T
 
T
P
 
I
C
 
F
T
 
T
A
 
A
D
 
D
R
 
G
L
 
Q
P
 
L
D
 
D
Y
 
K
D
 
P
A
 
G
L
 
T
V
 
A
A
 
A
K
 
L
A
 
I
R
 
D
E
 
D
L
 
L
V
 
I
N
 
K
L
 
A
G
 
G
M
 
V
S
 
D
A
 
G
V
 
L
V
x
F
Y
 
F
C
 
L
G
|
G
S
|
S
M
 
G
G
 
G
D
 
E
W
 
F
P
 
S
L
 
Q
L
 
L
T
 
G
E
 
-
A
 
A
Q
 
E
R
 
E
Q
 
R
E
 
K
G
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
F
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
H
V
 
V
A
 
D
A
 
R
G
 
R
I
 
V
P
 
P
T
 
V
I
 
L
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
G
V
 
T
N
 
N
S
 
A
K
 
R
E
 
E
A
 
T
I
 
I
S
 
E
H
 
L
A
 
S
A
 
Q
H
 
H
A
 
A
A
 
Q
K
 
Q
V
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
D
G
 
G
L
 
I
M
 
V
V
 
V
I
 
I
P
 
N
R
 
P
V
 
Y
L
x
Y
S
 
W
R
 
K
G
 
-
A
 
V
S
 
S
P
 
E
A
 
A
A
 
N
Q
 
L
K
 
I
A
 
R
H
 
Y
F
 
F
A
 
E
A
 
Q
I
 
V
L
 
A
E
 
D
A
 
S
A
 
V
P
 
-
A
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
V
V
 
M
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
 
F
P
 
P
-
 
A
Y
x
L
Y
 
T
G
 
G
F
 
Q
A
 
D
T
 
L
R
 
T
A
 
P
D
 
A
L
 
L
F
 
V
F
 
K
E
 
T
L
 
L
R
 
A
G
 
D
R
 
S
Y
 
R
P
 
S
N
 
N
L
 
I
I
 
I
G
 
G
F
 
I
K
|
K
E
 
D
-
 
T
F
 
I
G
 
D
G
 
S
A
 
V
A
 
A
D
 
H
M
 
L
R
 
R
Y
 
S
A
 
M
A
 
I
E
 
H
H
 
T
I
 
V
T
 
K
S
 
G
Q
 
A
D
 
H
D
 
P
T
 
H
V
 
F
T
 
T
L
 
V
M
 
L
A
 
C
G
|
G
V
x
Y
D
 
D
T
 
D
Q
 
H
V
 
L
F
 
F
H
 
N
G
 
T
F
 
L
V
 
L
N
 
-
C
 
L
G
 
G
A
 
G
T
 
D
G
 
G
A
 
A
I
|
I
T
x
S
G
 
A
I
 
S
G
 
G
N
 
N
A
 
F
L
 
A
P
 
P
R
 
Q
E
 
V
V
 
S
L
 
V
Q
 
N
L
 
L
V
 
L
D
 
K
L
 
A
C
 
W
R
 
R
K
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
V
T
 
A
A
 
-
R
 
-
R
 
K
Q
 
A
A
 
A
R
 
G
E
 
Y
L
 
H
E
 
Q
S
 
T
A
 
L
L
 
L
A
 
Q
V
 
I
L
 
P
S
 
Q
S
 
M
F
 
Y
D
 
Q
E
 
L
G
 
D
T
 
T
D
 
P
L
 
F
V
 
V
L
 
N
Y
 
V
Y
 
I
K
 
K
Y
 
E
L
 
A
M
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
C
G
 
G

4oe7D Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein, in complex with aldol condensed product of pyruvate and glyoxal
28% identity, 85% coverage: 5:272/314 of query aligns to 2:266/298 of 4oe7D

query
sites
4oe7D
I
 
L
F
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
I
I
 
I
P
 
P
A
x
P
L
 
V
M
 
S
T
 
T
P
 
I
C
 
F
T
 
T
A
 
A
D
 
D
R
 
G
L
 
Q
P
 
L
D
 
D
Y
 
K
D
 
P
A
 
G
L
 
T
V
 
A
A
 
A
K
 
L
A
 
I
R
 
D
E
 
D
L
 
L
V
 
I
N
 
K
L
 
A
G
 
G
M
 
V
S
 
D
A
 
G
V
 
L
V
 
F
Y
 
F
C
 
L
G
|
G
S
|
S
M
x
G
G
 
G
D
 
E
W
 
F
P
 
S
L
 
Q
L
 
L
T
 
G
E
 
-
A
 
A
Q
 
E
R
 
E
Q
 
R
E
 
K
G
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
F
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
H
V
 
V
A
 
D
A
 
R
G
 
R
I
 
V
P
 
P
T
 
V
I
 
L
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
G
V
 
T
N
 
N
S
 
A
K
 
R
E
 
E
A
 
T
I
 
I
S
 
E
H
 
L
A
 
S
A
 
Q
H
 
H
A
 
A
A
 
Q
K
 
Q
V
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
D
G
 
G
L
 
I
M
 
V
V
 
V
I
 
I
P
 
N
R
 
P
V
 
Y
L
x
Y
S
 
W
R
 
K
G
 
-
A
 
V
S
 
S
P
 
E
A
 
A
A
 
N
Q
 
L
K
 
I
A
 
R
H
 
Y
F
 
F
A
 
E
A
 
Q
I
 
V
L
 
A
E
 
D
A
 
S
A
 
V
P
 
-
A
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
V
V
 
M
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
x
F
P
 
P
-
 
A
Y
x
L
Y
 
T
G
 
G
F
 
Q
A
 
D
T
 
L
R
 
T
A
 
P
D
 
A
L
 
L
F
 
V
F
 
K
E
 
T
L
 
L
R
 
A
G
 
D
R
 
S
Y
 
R
P
 
S
N
 
N
L
 
I
I
 
I
G
 
G
F
 
I
K
|
K
E
 
D
-
x
T
F
 
I
G
 
D
G
 
S
A
 
V
A
 
A
D
 
H
M
 
L
R
 
R
Y
 
S
A
 
M
A
 
I
E
 
H
H
 
T
I
 
V
T
 
K
S
 
G
Q
 
A
D
 
H
D
 
P
T
 
H
V
 
F
T
 
T
L
 
V
M
 
L
A
 
C
G
|
G
V
 
Y
D
 
D
T
 
D
Q
 
H
V
 
L
F
 
F
H
 
N
G
 
T
F
 
L
V
 
L
N
 
-
C
 
L
G
 
G
A
 
G
T
 
D
G
 
G
A
 
A
I
|
I
T
 
S
G
 
A
I
 
S
G
 
G
N
 
N
A
 
F
L
 
A
P
 
P
R
 
Q
E
 
V
V
 
S
L
 
V
Q
 
N
L
 
L
V
 
L
D
 
K
L
 
A
C
 
W
R
 
R
K
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
V
T
 
A
A
 
-
R
 
-
R
 
K
Q
 
A
A
 
A
R
 
G
E
 
Y
L
 
H
E
 
Q
S
 
T
A
 
L
L
 
L
A
 
Q
V
 
I
L
 
P
S
 
Q
S
 
M
F
 
Y
D
 
Q
E
 
L
G
 
D
T
 
T
D
 
P
L
 
F
V
 
V
L
 
N
Y
 
V
Y
 
I
K
 
K
Y
 
E
L
 
A
M
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
C
G
 
G

4oe7B Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein, in complex with aldol condensed product of pyruvate and glyoxal
28% identity, 85% coverage: 5:272/314 of query aligns to 2:266/298 of 4oe7B

query
sites
4oe7B
I
 
L
F
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
I
I
 
I
P
 
P
A
x
P
L
 
V
M
 
S
T
 
T
P
 
I
C
 
F
T
 
T
A
 
A
D
 
D
R
 
G
L
 
Q
P
 
L
D
 
D
Y
 
K
D
 
P
A
 
G
L
 
T
V
 
A
A
 
A
K
 
L
A
 
I
R
 
D
E
 
D
L
 
L
V
 
I
N
 
K
L
 
A
G
 
G
M
 
V
S
 
D
A
 
G
V
 
L
V
 
F
Y
 
F
C
 
L
G
|
G
S
|
S
M
x
G
G
 
G
D
 
E
W
 
F
P
 
S
L
 
Q
L
 
L
T
 
G
E
 
-
A
 
A
Q
 
E
R
 
E
Q
 
R
E
 
K
G
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
F
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
H
V
 
V
A
 
D
A
 
R
G
 
R
I
 
V
P
 
P
T
 
V
I
 
L
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
G
V
 
T
N
 
N
S
 
A
K
 
R
E
 
E
A
 
T
I
 
I
S
 
E
H
 
L
A
 
S
A
 
Q
H
 
H
A
 
A
A
 
Q
K
 
Q
V
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
D
G
 
G
L
 
I
M
 
V
V
 
V
I
 
I
P
 
N
R
 
P
V
 
Y
L
x
Y
S
 
W
R
 
K
G
 
-
A
 
V
S
 
S
P
 
E
A
 
A
A
 
N
Q
 
L
K
 
I
A
 
R
H
 
Y
F
 
F
A
 
E
A
 
Q
I
 
V
L
 
A
E
 
D
A
 
S
A
 
V
P
 
-
A
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
V
V
 
M
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
x
F
P
 
P
-
 
A
Y
x
L
Y
 
T
G
 
G
F
 
Q
A
 
D
T
 
L
R
 
T
A
 
P
D
 
A
L
 
L
F
 
V
F
 
K
E
 
T
L
 
L
R
 
A
G
 
D
R
 
S
Y
 
R
P
 
S
N
 
N
L
 
I
I
 
I
G
 
G
F
 
I
K
|
K
E
 
D
-
x
T
F
 
I
G
 
D
G
 
S
A
 
V
A
 
A
D
 
H
M
 
L
R
 
R
Y
 
S
A
 
M
A
 
I
E
 
H
H
 
T
I
 
V
T
 
K
S
 
G
Q
 
A
D
 
H
D
 
P
T
 
H
V
 
F
T
 
T
L
 
V
M
 
L
A
 
C
G
|
G
V
 
Y
D
 
D
T
 
D
Q
 
H
V
 
L
F
 
F
H
 
N
G
 
T
F
 
L
V
 
L
N
 
-
C
 
L
G
 
G
A
 
G
T
 
D
G
 
G
A
 
A
I
|
I
T
 
S
G
 
A
I
 
S
G
 
G
N
 
N
A
 
F
L
 
A
P
 
P
R
 
Q
E
 
V
V
 
S
L
 
V
Q
 
N
L
 
L
V
 
L
D
 
K
L
 
A
C
 
W
R
 
R
K
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
V
T
 
A
A
 
-
R
 
-
R
 
K
Q
 
A
A
 
A
R
 
G
E
 
Y
L
 
H
E
 
Q
S
 
T
A
 
L
L
 
L
A
 
Q
V
 
I
L
 
P
S
 
Q
S
 
M
F
 
Y
D
 
Q
E
 
L
G
 
D
T
 
T
D
 
P
L
 
F
V
 
V
L
 
N
Y
 
V
Y
 
I
K
 
K
Y
 
E
L
 
A
M
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
C
G
 
G

4oe7A Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein, in complex with aldol condensed product of pyruvate and glyoxal
28% identity, 85% coverage: 5:272/314 of query aligns to 2:266/298 of 4oe7A

query
sites
4oe7A
I
 
L
F
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
I
I
 
I
P
 
P
A
x
P
L
 
V
M
 
S
T
 
T
P
 
I
C
 
F
T
 
T
A
 
A
D
 
D
R
 
G
L
 
Q
P
 
L
D
 
D
Y
 
K
D
 
P
A
 
G
L
 
T
V
 
A
A
 
A
K
 
L
A
 
I
R
 
D
E
 
D
L
 
L
V
 
I
N
 
K
L
 
A
G
 
G
M
 
V
S
 
D
A
 
G
V
 
L
V
 
F
Y
 
F
C
 
L
G
|
G
S
|
S
M
x
G
G
 
G
D
 
E
W
 
F
P
 
S
L
 
Q
L
 
L
T
 
G
E
 
-
A
 
A
Q
 
E
R
 
E
Q
 
R
E
 
K
G
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
F
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
H
V
 
V
A
 
D
A
 
R
G
 
R
I
 
V
P
 
P
T
 
V
I
 
L
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
G
V
 
T
N
 
N
S
 
A
K
 
R
E
 
E
A
 
T
I
 
I
S
 
E
H
 
L
A
 
S
A
 
Q
H
 
H
A
 
A
A
 
Q
K
 
Q
V
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
D
G
 
G
L
 
I
M
 
V
V
 
V
I
 
I
P
 
N
R
 
P
V
 
Y
L
x
Y
S
 
W
R
 
K
G
 
-
A
 
V
S
 
S
P
 
E
A
 
A
A
 
N
Q
 
L
K
 
I
A
 
R
H
 
Y
F
 
F
A
 
E
A
 
Q
I
 
V
L
 
A
E
 
D
A
 
S
A
 
V
P
 
-
A
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
V
V
 
M
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
 
F
P
 
P
-
 
A
Y
x
L
Y
 
T
G
 
G
F
 
Q
A
 
D
T
 
L
R
 
T
A
 
P
D
 
A
L
 
L
F
 
V
F
 
K
E
 
T
L
 
L
R
 
A
G
 
D
R
 
S
Y
 
R
P
 
S
N
 
N
L
 
I
I
 
I
G
 
G
F
 
I
K
|
K
E
 
D
-
 
T
F
 
I
G
 
D
G
 
S
A
 
V
A
 
A
D
 
H
M
 
L
R
 
R
Y
 
S
A
 
M
A
 
I
E
 
H
H
 
T
I
 
V
T
 
K
S
 
G
Q
 
A
D
 
H
D
 
P
T
 
H
V
 
F
T
 
T
L
 
V
M
 
L
A
 
C
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
T
 
D
Q
 
H
V
 
L
F
 
F
H
 
N
G
 
T
F
 
L
V
 
L
N
 
-
C
 
L
G
 
G
A
 
G
T
 
D
G
 
G
A
 
A
I
|
I
T
 
S
G
 
A
I
 
S
G
 
G
N
 
N
A
 
F
L
 
A
P
 
P
R
 
Q
E
 
V
V
 
S
L
 
V
Q
 
N
L
 
L
V
 
L
D
 
K
L
 
A
C
 
W
R
 
R
K
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
V
T
 
A
A
 
-
R
 
-
R
 
K
Q
 
A
A
 
A
R
 
G
E
 
Y
L
 
H
E
 
Q
S
 
T
A
 
L
L
 
L
A
 
Q
V
 
I
L
 
P
S
 
Q
S
 
M
F
 
Y
D
 
Q
E
 
L
G
 
D
T
 
T
D
 
P
L
 
F
V
 
V
L
 
N
Y
 
V
Y
 
I
K
 
K
Y
 
E
L
 
A
M
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
C
G
 
G

3nevA Crystal structure of yage, a prophage protein from e. Coli k12 in complex with kdgal (see paper)
28% identity, 85% coverage: 5:272/314 of query aligns to 2:266/298 of 3nevA

query
sites
3nevA
I
 
L
F
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
I
I
 
I
P
 
P
A
x
P
L
 
V
M
 
S
T
 
T
P
 
I
C
 
F
T
 
T
A
 
A
D
 
D
R
 
G
L
 
Q
P
 
L
D
 
D
Y
 
K
D
 
P
A
 
G
L
 
T
V
 
A
A
 
A
K
 
L
A
 
I
R
 
D
E
 
D
L
 
L
V
 
I
N
 
K
L
 
A
G
 
G
M
 
V
S
 
D
A
 
G
V
 
L
V
 
F
Y
 
F
C
 
L
G
|
G
S
|
S
M
x
G
G
 
G
D
 
E
W
 
F
P
 
S
L
 
Q
L
 
L
T
 
G
E
 
-
A
 
A
Q
 
E
R
 
E
Q
 
R
E
 
K
G
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
F
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
H
V
 
V
A
 
D
A
 
R
G
 
R
I
 
V
P
 
P
T
 
V
I
 
L
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
G
V
 
T
N
 
N
S
 
A
K
 
R
E
 
E
A
 
T
I
 
I
S
 
E
H
 
L
A
 
S
A
 
Q
H
 
H
A
 
A
A
 
Q
K
 
Q
V
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
D
G
 
G
L
 
I
M
 
V
V
 
V
I
 
I
P
 
N
R
 
P
V
 
Y
L
x
Y
S
 
W
R
 
K
G
 
-
A
 
V
S
 
S
P
 
E
A
 
A
A
 
N
Q
 
L
K
 
I
A
 
R
H
 
Y
F
 
F
A
 
E
A
 
Q
I
 
V
L
 
A
E
 
D
A
 
S
A
 
V
P
 
-
A
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
V
V
 
M
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
x
F
P
 
P
-
 
A
Y
x
L
Y
 
T
G
 
G
F
 
Q
A
 
D
T
 
L
R
 
T
A
 
P
D
 
A
L
 
L
F
 
V
F
 
K
E
 
T
L
 
L
R
 
A
G
 
D
R
 
S
Y
 
R
P
 
S
N
 
N
L
 
I
I
 
I
G
 
G
F
 
I
K
|
K
E
 
D
-
x
T
F
 
I
G
 
D
G
 
S
A
 
V
A
 
A
D
 
H
M
 
L
R
 
R
Y
 
S
A
 
M
A
 
I
E
 
H
H
 
T
I
 
V
T
 
K
S
 
G
Q
 
A
D
 
H
D
 
P
T
 
H
V
 
F
T
 
T
L
 
V
M
 
L
A
 
C
G
|
G
V
 
Y
D
 
D
T
 
D
Q
 
H
V
 
L
F
 
F
H
 
N
G
 
T
F
 
L
V
 
L
N
 
-
C
 
L
G
 
G
A
 
G
T
 
D
G
 
G
A
 
A
I
|
I
T
 
S
G
x
A
I
 
S
G
 
G
N
 
N
A
 
F
L
 
A
P
 
P
R
 
Q
E
 
V
V
 
S
L
 
V
Q
 
N
L
 
L
V
 
L
D
 
K
L
 
A
C
 
W
R
 
R
K
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
V
T
 
A
A
 
-
R
 
-
R
 
K
Q
 
A
A
 
A
R
 
G
E
 
Y
L
 
H
E
 
Q
S
 
T
A
 
L
L
 
L
A
 
Q
V
 
I
L
 
P
S
 
Q
S
 
M
F
 
Y
D
 
Q
E
 
L
G
 
D
T
 
T
D
 
P
L
 
F
V
 
V
L
 
N
Y
 
V
Y
 
I
K
 
K
Y
 
E
L
 
A
M
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
C
G
 
G

Q86XE5 4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase, mitochondrial; Dihydrodipicolinate synthase-like; DHDPS-like protein; Probable 2-keto-4-hydroxyglutarate aldolase; Probable KHG-aldolase; Protein 569272; EC 4.1.3.16 from Homo sapiens (Human) (see paper)
29% identity, 79% coverage: 8:254/314 of query aligns to 37:283/327 of Q86XE5

query
sites
Q86XE5
G
 
G
T
 
I
I
 
Y
P
 
P
A
 
P
L
 
V
M
 
T
T
 
T
P
 
P
C
 
F
T
 
T
A
 
A
D
 
T
R
 
A
L
 
E
P
 
V
D
 
D
Y
 
Y
D
 
G
A
 
K
L
 
L
V
 
E
A
 
E
K
 
N
A
 
L
R
 
H
E
 
K
L
 
L
V
 
G
N
 
T
L
 
F
G
 
P
M
 
F
S
 
R
A
 
G
V
 
F
V
 
V
Y
 
V
C
 
Q
G
 
G
S
|
S
M
x
N
G
 
G
D
 
E
W
 
F
P
 
P
L
 
F
L
 
L
T
 
T
E
 
S
A
 
S
Q
 
E
R
 
R
Q
 
L
E
 
E
G
 
V
V
 
V
A
 
S
R
 
R
L
 
V
V
 
R
A
 
Q
A
 
A
G
 
-
I
 
M
P
 
P
T
 
K
-
 
N
-
 
R
-
 
L
-
 
L
I
 
L
V
 
A
G
 
G
T
 
S
G
 
G
A
 
C
V
 
E
N
 
S
S
 
T
K
 
Q
E
 
A
A
 
T
I
 
V
S
 
E
H
 
M
A
 
T
A
 
V
H
 
S
A
 
M
A
 
A
K
 
Q
V
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
D
G
 
A
L
 
A
M
 
M
V
 
V
I
 
V
P
 
T
R
 
P
V
 
C
L
x
Y
S
 
Y
R
 
R
G
 
G
-
 
R
A
 
M
S
 
S
P
 
S
A
 
A
A
 
A
Q
 
L
K
 
I
A
 
H
H
 
H
F
 
Y
A
 
T
A
 
K
I
 
V
L
 
A
E
 
D
A
 
L
A
 
S
P
 
P
A
 
-
L
 
I
P
 
P
A
 
V
V
 
V
I
 
L
Y
|
Y
N
 
S
S
 
V
P
 
P
-
 
A
Y
 
N
Y
 
T
G
 
G
F
 
L
A
 
D
T
 
L
R
 
P
A
 
V
D
 
D
L
 
A
F
 
V
F
 
V
E
 
T
L
 
L
R
 
-
G
 
S
R
 
Q
Y
 
H
P
 
P
N
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
M
K
|
K
E
 
D
F
x
S
G
 
G
G
 
G
A
 
D
A
 
V
D
 
T
M
 
R
R
 
I
Y
 
G
A
 
L
A
 
I
E
 
V
H
 
H
I
 
K
T
 
T
S
 
R
Q
 
K
D
 
Q
D
 
D
T
 
-
V
 
F
T
 
Q
L
 
V
M
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
S
D
 
A
T
 
G
Q
 
F
V
 
L
F
 
M
H
 
A
G
 
S
F
 
Y
V
 
A
N
 
-
C
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
V
G
 
G
A
 
G
I
 
V
T
 
C
G
 
A
I
 
L
G
 
A
N
 
N
A
 
V
L
 
L
P
 
G
R
 
A
E
 
Q
V
 
V
L
 
C
Q
 
Q
L
 
L
V
 
E
D
 
R
L
 
L
C
 
C
R
 
C
K
 
T
A
 
G
A
 
Q
K
 
W
G
 
E
D
 
D
V
 
A
T
 
Q
A
 
-
R
 
K
R
 
L
Q
 
Q
A
 
H
R
 
R
E
 
L
L
 
I
E
 
E
S
 
P
A
 
N
L
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
T
S
 
R
S
 
R
F
 
F

Q5HG25 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Staphylococcus aureus (strain COL) (see paper)
27% identity, 79% coverage: 4:252/314 of query aligns to 3:245/295 of Q5HG25

query
sites
Q5HG25
N
 
H
I
 
L
F
 
F
T
 
E
G
 
G
T
 
V
I
 
G
P
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
T
T
 
T
P
 
P
C
 
F
T
 
T
A
 
N
D
 
N
R
 
K
L
 
V
P
 
-
D
 
N
Y
 
I
D
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
K
A
 
T
K
 
H
A
 
V
R
 
N
E
 
F
L
 
L
V
 
L
N
 
E
L
 
N
G
 
N
M
 
A
S
 
Q
A
 
A
V
 
I
V
 
I
Y
 
V
C
 
N
G
 
G
S
 
T
M
x
T
G
 
A
D
 
E
W
 
S
P
 
P
L
 
T
L
 
L
T
 
T
E
 
T
A
 
D
Q
 
E
R
 
K
Q
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
L
E
 
K
G
 
T
V
 
V
A
 
I
R
 
D
L
 
L
V
 
V
A
 
D
A
 
K
G
 
R
I
 
V
P
 
P
T
 
V
I
 
I
V
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
T
V
 
N
N
 
D
S
 
T
K
 
E
E
 
K
A
 
S
I
 
I
S
 
Q
H
 
A
A
 
S
A
 
I
H
 
Q
A
 
A
A
 
K
K
 
A
V
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
G
 
A
L
 
I
M
 
M
V
 
L
I
 
I
P
 
T
R
 
P
V
 
Y
L
 
Y
S
 
N
R
 
K
G
 
T
A
 
N
S
 
Q
P
 
R
A
 
G
A
 
L
Q
 
V
K
 
K
A
 
-
H
 
H
F
 
F
A
 
E
A
 
A
I
 
I
L
 
A
E
 
D
A
 
A
A
 
V
P
 
-
A
 
K
L
 
L
P
 
P
A
 
V
V
 
V
I
 
L
Y
 
Y
N
 
N
S
 
V
P
 
P
Y
 
S
Y
 
R
G
 
T
F
 
N
A
 
M
T
 
T
R
 
I
A
 
E
D
 
P
L
 
E
F
 
T
F
 
V
E
 
E
L
 
I
R
 
L
G
 
S
R
 
Q
Y
 
H
P
 
P
N
 
Y
L
 
I
I
 
V
G
 
A
F
 
L
K
|
K
E
 
D
F
 
-
G
 
-
G
 
A
A
 
T
A
 
N
D
 
D
M
 
F
R
 
E
Y
 
Y
A
 
-
A
 
L
E
 
E
H
 
E
I
 
V
T
 
K
S
 
K
Q
 
R
D
 
I
D
 
D
T
 
T
V
 
N
T
 
S
-
 
F
-
 
A
L
 
L
M
 
Y
A
 
S
G
 
G
V
 
N
D
 
D
T
 
D
Q
 
N
V
 
V
F
 
V
H
 
E
G
 
-
F
 
Y
V
 
Y
N
 
Q
C
 
R
G
 
G
A
 
G
T
 
Q
G
 
G
A
 
V
I
 
I
T
 
S
G
 
V
I
 
I
G
 
A
N
 
N
A
 
V
L
 
I
P
 
P
R
 
K
E
 
E
V
 
F
L
 
Q
Q
 
A
L
 
L
V
 
Y
D
 
D
L
 
-
C
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
A
A
 
Q
K
 
Q
G
 
S
D
 
G
V
 
L
T
 
D
A
 
I
R
 
Q
R
 
D
Q
 
Q
A
 
F
R
 
K
E
 
P
L
 
I
E
 
G
S
 
T
A
 
L
L
 
L
A
 
S
V
 
A
L
 
L
S
 
S

3di1B Crystal structure of the staphylococcus aureus dihydrodipicolinate synthase-pyruvate complex (see paper)
27% identity, 79% coverage: 4:252/314 of query aligns to 3:245/291 of 3di1B

query
sites
3di1B
N
 
H
I
 
L
F
 
F
T
 
E
G
 
G
T
 
V
I
 
G
P
 
V
A
|
A
L
 
L
M
 
T
T
 
T
P
 
P
C
 
F
T
 
T
A
 
N
D
 
N
R
 
K
L
 
V
P
 
-
D
 
N
Y
 
I
D
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
K
A
 
T
K
 
H
A
 
V
R
 
N
E
 
F
L
 
L
V
 
L
N
 
E
L
 
N
G
 
N
M
 
A
S
 
Q
A
 
A
V
 
I
V
 
I
Y
 
V
C
 
N
G
|
G
S
x
T
M
x
T
G
 
A
D
 
E
W
 
S
P
 
P
L
 
T
L
 
L
T
 
T
E
 
T
A
 
D
Q
 
E
R
 
K
Q
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
L
E
 
K
G
 
T
V
 
V
A
 
I
R
 
D
L
 
L
V
 
V
A
 
D
A
 
K
G
 
R
I
 
V
P
 
P
T
 
V
I
 
I
V
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
T
V
 
N
N
 
D
S
 
T
K
 
E
E
 
K
A
 
S
I
 
I
S
 
Q
H
 
A
A
 
S
A
 
I
H
 
Q
A
 
A
A
 
K
K
 
A
V
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
G
 
A
L
 
I
M
 
M
V
 
L
I
 
I
P
 
T
R
 
P
V
 
Y
L
x
Y
S
 
N
R
 
K
G
 
T
A
 
N
S
 
Q
P
 
R
A
 
G
A
 
L
Q
 
V
K
 
K
A
 
-
H
 
H
F
 
F
A
 
E
A
 
A
I
 
I
L
 
A
E
 
D
A
 
A
A
 
V
P
 
-
A
 
K
L
 
L
P
 
P
A
 
V
V
 
V
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
 
V
P
 
P
Y
 
S
Y
x
R
G
 
T
F
 
N
A
 
M
T
 
T
R
 
I
A
 
E
D
 
P
L
 
E
F
 
T
F
 
V
E
 
E
L
 
I
R
 
L
G
 
S
R
 
Q
Y
 
H
P
 
P
N
 
Y
L
 
I
I
 
V
G
 
A
F
 
L
K
|
K
E
 
D
F
 
-
G
 
-
G
 
A
A
 
T
A
 
N
D
 
D
M
 
F
R
 
E
Y
 
Y
A
 
-
A
 
L
E
 
E
H
 
E
I
 
V
T
 
K
S
 
K
Q
 
R
D
 
I
D
 
D
T
 
T
V
 
N
T
 
S
-
 
F
-
 
A
L
 
L
M
 
Y
A
 
S
G
 
G
V
 
N
D
 
D
T
 
D
Q
 
N
V
 
V
F
 
V
H
 
E
G
 
-
F
 
Y
V
 
Y
N
 
Q
C
 
R
G
 
G
A
 
G
T
 
Q
G
 
G
A
 
V
I
|
I
T
 
S
G
 
V
I
 
I
G
 
A
N
 
N
A
 
V
L
 
I
P
 
P
R
 
K
E
 
E
V
 
F
L
 
Q
Q
 
A
L
 
L
V
 
Y
D
 
D
L
 
-
C
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
A
A
 
Q
K
 
Q
G
 
S
D
 
G
V
 
L
T
 
D
A
 
I
R
 
Q
R
 
D
Q
 
Q
A
 
F
R
 
K
E
 
P
L
 
I
E
 
G
S
 
T
A
 
L
L
 
L
A
 
S
V
 
A
L
 
L
S
 
S

4fhaA Structure of dihydrodipicolinate synthase from streptococcus pneumoniae,bound to pyruvate and lysine
29% identity, 64% coverage: 10:210/314 of query aligns to 11:209/307 of 4fhaA

query
sites
4fhaA
I
 
I
P
 
T
A
 
A
L
 
F
M
 
I
T
 
T
P
 
P
C
 
F
T
 
H
A
 
E
D
 
D
R
 
G
L
 
S
P
 
I
D
 
N
Y
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
P
A
 
A
K
 
L
A
 
I
R
 
E
E
 
H
L
 
L
V
 
L
N
 
A
L
 
H
G
 
H
M
 
T
S
 
D
A
 
G
V
 
I
V
 
L
Y
 
L
C
 
A
G
 
G
S
 
T
M
 
T
G
 
A
D
 
E
W
x
S
P
|
P
L
 
T
L
|
L
T
 
T
E
x
H
A
 
D
Q
 
E
R
x
E
Q
 
L
E
 
E
-
 
L
-
 
F
-
 
A
G
 
A
V
 
V
A
 
Q
R
 
K
L
 
V
V
 
V
A
 
N
A
 
G
G
 
R
I
 
V
P
 
P
T
 
L
I
 
I
V
 
A
G
 
G
T
 
V
G
 
G
A
 
T
V
 
N
N
 
D
S
 
T
K
 
R
E
 
D
A
 
S
I
 
I
S
 
E
H
 
F
A
 
V
A
 
K
H
 
E
A
 
V
A
 
A
K
 
E
V
 
F
G
 
G
-
 
G
-
 
F
A
 
A
S
 
A
G
 
G
L
 
L
M
 
A
V
 
I
I
 
V
P
 
P
R
x
Y
V
 
Y
L
 
-
S
 
-
R
 
N
G
 
K
A
 
P
S
 
S
P
 
Q
A
 
E
A
 
G
Q
 
M
K
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
F
A
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
A
E
 
D
A
 
A
A
 
S
P
 
-
A
 
D
L
 
L
P
 
P
A
 
I
V
 
I
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
S
 
I
P
 
P
Y
 
G
Y
 
R
G
 
V
F
 
V
A
 
V
T
 
E
R
 
L
A
 
T
D
 
P
L
 
E
F
 
T
F
 
M
E
 
L
L
 
R
R
 
L
G
 
A
R
 
D
Y
 
H
P
 
P
N
 
N
L
 
I
I
 
I
G
 
G
F
 
V
K
 
K
E
 
E
F
 
C
G
 
T
G
 
S
A
 
L
A
 
A
D
 
N
M
 
M
R
 
A
Y
 
Y
A
 
L
A
 
I
E
 
E
H
 
H
I
 
-
T
 
-
S
 
-
Q
 
K
D
 
P
D
 
E
T
 
E
V
 
F
T
 
L
L
 
I
M
 
Y
A
 
T
G
 
G
V
 
E
D
 
D
T
 
G
Q
 
D
V
 
A
F
 
F
H
 
H
G
 
A
F
 
-
V
 
M
N
 
N
C
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
D
G
 
G
A
 
V
I
 
I
T
 
S

Q07607 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; Protein MosA; EC 4.3.3.7 from Rhizobium meliloti (Ensifer meliloti) (Sinorhizobium meliloti) (see paper)
27% identity, 68% coverage: 5:217/314 of query aligns to 1:211/292 of Q07607

query
sites
Q07607
I
 
M
F
 
F
T
 
E
G
 
G
T
 
S
I
 
I
P
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
V
T
 
T
P
 
P
C
 
F
T
 
A
A
 
D
D
 
D
R
 
R
L
 
I
P
 
-
D
 
D
Y
 
E
D
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
H
A
 
D
K
 
L
A
 
V
R
 
E
E
 
W
L
 
Q
V
 
I
N
 
E
L
 
E
G
 
G
M
 
S
S
 
F
A
 
G
V
 
L
V
 
V
Y
 
P
C
 
C
G
 
G
S
 
T
M
 
T
G
 
G
D
 
E
W
 
S
P
 
P
L
 
T
L
 
L
T
 
S
E
 
K
A
 
S
Q
 
E
R
 
H
Q
 
E
E
 
Q
G
 
V
V
 
V
A
 
E
R
 
I
L
 
T
V
 
I
A
 
K
A
 
T
G
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
R
I
 
V
P
 
P
T
 
V
I
 
I
V
 
A
G
 
G
T
 
A
G
 
G
A
 
S
V
 
N
N
 
S
S
 
T
K
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
I
S
 
A
H
 
F
A
 
V
A
 
R
H
 
H
A
 
A
A
 
Q
K
 
N
V
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
D
G
 
G
L
 
V
M
 
L
V
 
I
I
 
V
P
 
S
R
 
P
V
 
Y
L
 
Y
S
 
N
R
 
K
G
 
P
A
 
T
S
 
Q
P
 
E
A
 
G
A
 
I
Q
 
Y
K
 
Q
A
 
-
H
 
H
F
 
F
A
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
-
E
 
D
A
 
A
A
 
A
P
 
S
A
 
T
L
 
I
P
 
P
A
 
I
V
 
I
I
 
V
Y
 
Y
N
 
N
S
 
I
P
 
P
-
 
G
Y
 
R
Y
 
S
G
 
A
F
 
I
A
 
E
T
 
I
R
 
H
A
 
V
D
 
E
L
 
T
F
 
L
F
 
A
E
 
R
L
 
I
R
 
F
G
 
E
R
 
D
Y
 
C
P
 
P
N
 
N
L
 
V
I
 
K
G
 
G
F
 
V
K
|
K
E
 
D
F
 
A
G
 
T
G
 
G
A
 
N
A
 
L
D
 
-
M
 
L
R
 
R
Y
 
P
A
 
S
A
 
L
E
 
E
H
 
R
I
 
M
T
 
A
S
 
C
Q
 
G
D
 
E
D
 
D
T
 
-
V
 
F
T
 
N
L
 
L
M
 
L
A
 
T
G
 
G
V
 
E
D
 
D
T
 
G
Q
 
T
V
 
A
F
 
L
H
 
-
G
 
G
F
 
Y
V
 
M
N
 
A
C
 
H
G
 
G
A
 
G
T
 
H
G
 
G
A
 
C
I
 
I
T
 
S
G
 
V
I
 
T
G
 
A
N
 
N
A
 
V
L
 
A
P
 
P

1o5kA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase (tm1521) from thermotoga maritima at 1.80 a resolution
25% identity, 79% coverage: 4:251/314 of query aligns to 1:247/295 of 1o5kA

query
sites
1o5kA
N
 
H
I
 
M
F
 
F
T
 
R
G
 
G
T
 
V
I
 
G
P
 
T
A
 
A
L
 
I
M
 
V
T
 
T
P
 
P
C
 
F
T
 
K
A
 
N
D
 
G
R
 
E
L
 
L
P
 
-
D
 
D
Y
 
L
D
 
E
A
 
S
L
 
Y
V
 
E
A
 
R
K
 
L
A
 
V
R
 
R
E
 
Y
L
 
Q
V
 
L
N
 
E
L
 
N
G
 
G
M
 
V
S
 
N
A
 
A
V
 
L
V
 
I
Y
 
V
C
 
L
G
 
G
S
x
T
M
 
T
G
 
G
D
 
E
W
 
S
P
 
P
L
 
T
L
 
V
T
 
N
E
 
E
A
 
D
Q
 
E
R
 
R
Q
 
E
E
 
K
G
 
L
V
 
V
A
 
S
R
 
R
-
 
T
-
 
L
-
x
E
L
 
I
V
 
V
A
x
D
A
 
G
G
 
K
I
 
I
P
 
P
T
 
V
I
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
A
G
 
G
A
 
T
V
 
N
N
 
S
S
 
T
K
 
E
E
 
K
A
 
T
I
 
L
S
 
K
H
 
L
A
 
V
A
 
K
H
 
Q
A
 
A
A
 
E
K
 
K
V
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
N
G
 
G
L
 
V
M
 
L
V
 
V
I
 
V
P
 
T
R
 
P
V
 
Y
L
x
Y
S
 
N
R
 
K
G
 
P
A
 
T
S
 
Q
P
 
E
A
 
G
A
 
L
Q
 
Y
K
 
Q
A
 
-
H
 
H
F
 
Y
A
 
K
A
 
Y
I
 
I
L
 
S
E
 
E
A
 
R
A
 
T
P
 
-
A
 
D
L
 
L
P
 
G
A
 
I
V
 
V
I
 
V
Y
|
Y
N
 
N
S
 
V
P
 
P
-
 
G
Y
x
R
Y
 
T
G
 
G
F
 
V
A
 
N
T
 
V
R
 
L
A
 
P
D
 
E
L
 
T
F
 
A
F
 
A
E
 
R
L
 
I
R
 
A
G
 
A
R
 
D
Y
 
L
P
 
K
N
 
N
L
 
V
I
 
V
G
 
G
F
 
I
K
|
K
E
 
E
F
 
A
G
 
N
G
 
P
A
 
D
A
 
I
D
 
D
M
 
Q
R
 
I
Y
 
D
A
 
R
A
 
T
E
 
V
H
 
S
I
 
L
T
 
T
S
 
K
Q
 
Q
D
 
A
D
 
R
T
 
S
V
 
D
T
 
F
L
 
M
M
 
V
-
 
W
A
 
S
G
 
G
V
 
N
D
 
D
T
 
D
Q
 
R
V
 
T
F
 
F
H
 
Y
G
 
-
F
 
L
V
 
L
N
 
C
C
 
A
G
 
G
A
 
G
T
 
D
G
 
G
A
 
V
I
|
I
T
 
S
G
 
V
I
 
V
G
 
S
N
 
N
A
 
V
L
 
A
P
 
P
R
 
K
E
 
-
V
 
-
L
 
-
Q
 
Q
L
 
M
V
 
V
D
 
E
L
 
L
C
 
C
R
 
A
K
 
E
A
 
Y
A
 
F
K
 
S
G
 
G
D
 
N
V
 
L
T
 
E
A
 
K
R
 
S
R
 
R
Q
 
E
A
 
V
-
 
H
R
 
R
E
 
K
L
 
L
E
 
R
S
 
P
A
 
L
L
 
M
A
 
K
V
 
A
L
 
L

Q9X1K9 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
25% identity, 79% coverage: 5:251/314 of query aligns to 1:246/294 of Q9X1K9

query
sites
Q9X1K9
I
 
M
F
 
F
T
 
R
G
 
G
T
 
V
I
 
G
P
 
T
A
 
A
L
 
I
M
 
V
T
 
T
P
 
P
C
 
F
T
 
K
A
 
N
D
 
G
R
 
E
L
 
L
P
 
-
D
 
D
Y
 
L
D
 
E
A
 
S
L
 
Y
V
 
E
A
 
R
K
 
L
A
 
V
R
 
R
E
 
Y
L
 
Q
V
 
L
N
 
E
L
 
N
G
 
G
M
 
V
S
 
N
A
 
A
V
 
L
V
 
I
Y
 
V
C
 
L
G
 
G
S
 
T
M
 
T
G
 
G
D
 
E
W
 
S
P
 
P
L
 
T
L
 
V
T
 
N
E
 
E
A
 
D
Q
 
E
R
 
R
Q
 
E
E
 
K
G
 
L
V
 
V
A
 
S
R
 
R
-
 
T
-
 
L
-
 
E
L
 
I
V
 
V
A
 
D
A
 
G
G
 
K
I
 
I
P
 
P
T
 
V
I
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
A
G
 
G
A
 
T
V
 
N
N
 
S
S
 
T
K
 
E
E
 
K
A
 
T
I
 
L
S
 
K
H
 
L
A
 
V
A
 
K
H
 
Q
A
 
A
A
 
E
K
 
K
V
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
N
G
 
G
L
 
V
M
 
L
V
 
V
I
 
V
P
 
T
R
 
P
V
 
Y
L
 
Y
S
 
N
R
 
K
G
 
P
A
 
T
S
 
Q
P
 
E
A
 
G
A
 
L
Q
 
Y
K
 
Q
A
 
-
H
 
H
F
 
Y
A
 
K
A
 
Y
I
 
I
L
 
S
E
 
E
A
 
R
A
 
T
P
 
-
A
 
D
L
 
L
P
 
G
A
 
I
V
 
V
I
 
V
Y
 
Y
N
 
N
S
 
V
P
 
P
-
 
G
Y
 
R
Y
 
T
G
 
G
F
 
V
A
 
N
T
 
V
R
 
L
A
 
P
D
 
E
L
 
T
F
 
A
F
 
A
E
 
R
L
 
I
R
 
A
G
 
A
R
 
D
Y
 
L
P
 
K
N
 
N
L
 
V
I
 
V
G
 
G
F
 
I
K
 
K
E
 
E
F
 
A
G
 
N
G
 
P
A
x
D
A
x
I
D
|
D
M
 
Q
R
 
I
Y
 
D
A
 
R
A
 
T
E
 
V
H
 
S
I
 
L
T
 
T
S
 
K
Q
 
Q
D
 
A
D
 
R
T
 
S
V
 
D
T
 
F
L
 
M
M
 
V
-
 
W
A
 
S
G
 
G
V
 
N
D
 
D
T
 
D
Q
 
R
V
 
T
F
 
F
H
 
Y
G
 
-
F
 
L
V
 
L
N
 
C
C
 
A
G
 
G
A
 
G
T
 
D
G
 
G
A
 
V
I
 
I
T
 
S
G
 
V
I
 
V
G
 
S
N
 
N
A
 
V
L
 
A
P
 
P
R
 
K
E
 
-
V
 
-
L
 
-
Q
 
Q
L
 
M
V
 
V
D
 
E
L
 
L
C
 
C
R
 
A
K
 
E
A
 
Y
A
 
F
K
 
S
G
 
G
D
 
N
V
 
L
T
 
E
A
 
K
R
 
S
R
 
R
Q
 
E
A
 
V
-
 
H
R
 
R
E
 
K
L
 
L
E
 
R
S
 
P
A
 
L
L
 
M
A
 
K
V
 
A
L
 
L

5c55A Crystal structure of the y138f mutant of c.Glutamicum n- acetylneuraminic acid lyase in complex with pyruvate
27% identity, 71% coverage: 6:227/314 of query aligns to 2:227/307 of 5c55A

query
sites
5c55A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
V
I
 
I
P
 
P
A
x
P
L
 
V
M
 
M
T
 
T
P
 
P
C
 
L
T
 
H
A
 
A
D
 
D
R
 
G
L
 
S
P
 
V
D
 
D
Y
 
V
D
 
E
A
 
S
L
 
L
V
 
R
A
 
K
K
 
L
A
 
V
R
 
D
E
 
H
L
 
L
V
 
I
N
 
N
L
 
G
G
 
G
M
 
V
S
 
D
A
 
G
V
 
L
V
 
F
Y
 
A
C
 
L
G
 
G
S
|
S
M
x
S
G
 
G
D
 
E
W
 
A
P
 
A
L
 
F
L
 
L
T
 
T
E
 
R
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
K
E
 
L
G
 
A
V
 
L
A
 
T
R
 
T
L
 
I
V
 
I
-
 
E
-
 
H
-
 
T
A
 
A
A
 
G
G
 
R
I
 
V
P
 
P
T
 
V
I
 
T
V
 
A
G
 
G
T
 
V
G
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
T
S
 
T
K
 
A
E
 
R
A
 
V
I
 
I
S
 
E
H
 
L
A
 
V
A
 
E
H
 
D
A
 
A
A
 
L
K
 
E
V
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
V
V
 
A
I
 
T
P
 
A
R
 
P
V
 
F
L
x
Y
S
 
T
R
 
R
G
 
T
A
 
H
S
 
D
P
 
V
A
 
E
A
 
I
Q
 
E
K
 
E
A
 
-
H
 
H
F
 
F
A
 
R
A
 
K
I
 
I
L
 
H
E
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
A
 
E
L
 
L
P
 
P
A
 
L
V
 
F
I
 
A
Y
x
F
N
 
N
S
 
I
P
 
P
Y
 
V
Y
x
S
G
 
V
F
 
H
A
 
S
T
 
N
R
 
L
A
 
N
D
 
P
L
 
V
F
 
M
F
 
L
E
 
L
L
 
T
R
 
L
G
 
A
R
 
K
Y
 
D
P
 
G
N
 
V
L
 
L
I
 
A
G
 
G
F
 
T
K
|
K
E
 
D
F
 
S
G
 
S
G
 
G
A
 
N
A
 
D
D
 
G
M
 
A
R
 
I
Y
 
R
A
 
S
A
 
L
E
 
-
H
 
-
I
 
I
T
 
E
S
 
A
Q
 
R
D
 
D
D
 
D
T
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
E
-
 
Q
V
 
F
T
 
K
L
 
I
M
 
L
A
 
T
G
 
G
V
 
S
D
 
E
T
 
T
Q
 
T
V
 
V
F
 
D
H
 
F
G
 
A
F
 
Y
V
 
L
N
 
-
C
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
D
G
 
G
A
 
V
I
x
V
T
 
P
G
 
G
I
 
L
G
 
G
N
 
N
A
 
V
L
 
D
P
 
P
R
 
A
E
 
A
V
 
Y
L
 
A
Q
 
A
L
 
L
V
 
A
D
 
K
L
 
L
C
 
C

5ktlA Dihydrodipicolinate synthase from the industrial and evolutionarily important cyanobacteria anabaena variabilis. (see paper)
32% identity, 58% coverage: 6:188/314 of query aligns to 5:196/295 of 5ktlA

query
sites
5ktlA
F
 
F
T
 
G
G
 
T
T
 
V
I
 
L
P
 
T
A
 
A
L
 
M
M
 
I
T
 
T
P
 
P
C
 
F
T
 
K
A
 
A
D
 
D
R
 
G
L
 
S
P
 
V
D
 
N
Y
 
Y
D
 
A
A
 
V
L
 
A
V
 
A
A
 
E
K
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
H
L
 
L
V
 
V
N
 
D
L
 
N
G
 
G
M
 
T
S
 
D
A
 
T
V
 
L
V
 
V
Y
 
V
C
 
C
G
 
G
S
x
T
M
 
T
G
 
G
D
 
E
W
x
S
P
 
P
L
 
T
L
|
L
T
 
S
-
 
W
-
 
D
-
 
E
E
|
E
A
 
Y
Q
 
N
R
 
L
Q
 
F
E
 
V
G
x
E
V
 
V
A
 
L
R
x
Q
L
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
G
G
 
K
I
 
A
P
 
K
T
 
V
I
 
I
V
 
A
G
 
G
T
 
C
G
 
G
A
 
S
V
 
N
N
 
S
S
 
T
K
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
I
S
 
A
H
 
A
A
 
T
A
 
Q
H
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
V
S
 
H
G
 
G
-
 
T
L
 
L
M
 
Q
V
 
V
I
 
V
P
 
P
R
 
Y
V
x
Y
L
 
-
S
 
-
R
 
N
G
 
K
A
 
P
S
 
P
P
 
Q
A
 
A
A
 
G
Q
 
L
K
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
F
A
 
Q
A
 
A
I
 
I
L
 
A
E
 
Q
A
 
A
A
 
C
P
 
P
A
 
D
L
 
L
P
 
P
A
 
L
V
 
L
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
 
V
P
 
P
-
 
G
Y
x
R
Y
 
T
G
 
G
F
 
Q
A
 
N
T
 
L
R
 
S
A
 
P
D
 
E
L
 
T
F
 
V
F
 
V
E
 
R
L
 
L
R
 
-
G
 
A
R
 
E
Y
 
I
P
 
D
N
 
N
L
 
I
I
 
I
G
 
G
F
 
V
K
|
K
E
 
E
F
 
A
G
 
S
G
 
G
-
 
N
-
 
L
-
 
D
-
 
Q
A
 
A
A
 
G
D
 
E
M
 
I
R
 
R
Y
 
R
A
 
S
A
 
T
E
 
P
-
 
K
-
 
E
-
 
F
H
 
Q
I
 
I
T
 
Y
S
 
A
Q
 
G
D
 
D
D
 
D
T
 
S
V
 
L
T
 
T
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>H281DRAFT_01195 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_01195
MSNNIFTGTIPALMTPCTADRLPDYDALVAKARELVNLGMSAVVYCGSMGDWPLLTEAQR
QEGVARLVAAGIPTIVGTGAVNSKEAISHAAHAAKVGASGLMVIPRVLSRGASPAAQKAH
FAAILEAAPALPAVIYNSPYYGFATRADLFFELRGRYPNLIGFKEFGGAADMRYAAEHIT
SQDDTVTLMAGVDTQVFHGFVNCGATGAITGIGNALPREVLQLVDLCRKAAKGDVTARRQ
ARELESALAVLSSFDEGTDLVLYYKYLMVLNGDTEYSLHFYETDALSEAQRRYAQTQYEL
FRNWYAEWSKEVNA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory