SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_01296 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_01296 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6oc6A Lanthanide-dependent methanol dehydrogenase xoxf from methylobacterium extorquens, in complex with lanthanum and pyrroloquinoline quinone (see paper)
64% identity, 95% coverage: 26:601/605 of query aligns to 2:578/579 of 6oc6A

query
sites
6oc6A
D
 
E
S
 
S
Q
 
V
L
 
L
D
 
K
G
 
G
L
 
V
M
 
A
K
 
-
S
 
N
P
 
P
S
 
A
N
 
E
W
 
Q
A
 
V
A
 
L
Q
 
Q
A
 
T
G
 
V
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
H
 
T
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
P
 
K
L
 
L
K
 
D
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
E
 
A
N
 
S
N
 
N
V
 
V
G
 
K
K
 
N
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
W
 
W
T
 
T
M
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
A
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
N
T
 
I
M
 
M
Y
 
Y
I
 
V
H
 
H
S
 
T
P
 
P
F
 
F
P
 
P
N
 
N
K
 
I
V
 
V
I
 
Y
A
 
A
I
 
L
N
 
D
L
 
L
-
 
D
K
 
Q
D
 
G
Q
 
A
T
 
K
F
 
I
L
 
V
W
 
W
Q
 
K
Y
 
Y
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
Q
 
Q
D
 
D
D
 
P
S
 
S
V
 
V
V
 
I
S
 
P
V
 
V
M
 
M
C
|
C
C
|
C
D
 
D
T
 
T
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
G
 
A
D
 
D
G
 
G
K
 
A
I
 
I
F
 
L
L
 
L
Q
 
H
Q
 
Q
A
 
A
D
 
D
T
 
T
K
 
T
L
 
L
V
 
V
A
 
S
L
 
L
N
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
S
G
 
G
D
 
K
V
 
V
V
 
N
W
 
W
T
 
S
A
 
V
Q
 
K
N
 
N
G
 
G
N
 
D
S
 
P
K
 
S
A
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
N
 
N
T
|
T
N
 
A
A
 
T
P
 
V
H
 
L
V
 
P
F
 
V
G
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
I
T
 
V
G
 
G
I
 
I
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
G
 
C
R
 
H
L
 
V
I
 
T
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
I
 
L
K
 
K
T
 
S
G
 
G
K
 
K
P
 
K
A
 
V
W
 
W
T
 
R
A
 
G
Y
 
Y
S
 
S
T
 
I
G
 
G
P
 
P
D
 
D
K
 
D
D
 
Q
M
 
L
L
 
I
M
 
V
D
 
D
P
 
P
D
 
E
K
 
K
T
 
T
M
 
T
T
 
S
Y
 
L
A
 
G
D
 
K
G
 
-
K
 
-
M
 
-
V
 
-
P
 
P
V
 
I
G
 
G
A
 
K
D
 
D
S
 
S
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
T
W
 
W
K
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
Q
W
 
W
K
 
K
L
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
C
T
 
T
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
F
A
 
S
W
 
Y
D
 
D
P
 
P
K
 
K
L
 
L
N
 
D
L
 
L
V
 
M
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
G
 
G
N
|
N
P
 
P
G
 
S
T
 
T
W
 
W
N
 
N
P
 
P
T
 
K
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
S
M
 
M
S
 
T
I
 
I
M
 
W
A
 
A
R
 
R
D
 
N
L
 
P
N
 
D
T
 
T
G
 
G
M
 
M
A
 
A
K
 
K
W
 
W
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
D
|
D
G
 
G
V
 
I
N
 
N
E
 
E
M
 
M
I
 
I
L
 
L
S
 
T
D
 
D
L
 
Q
T
 
K
I
 
F
D
 
D
G
 
G
K
 
K
K
 
D
V
 
R
P
 
P
A
 
L
I
 
L
V
 
T
H
 
H
F
 
F
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
N
 
D
R
 
R
E
 
A
S
 
T
G
 
G
Q
 
E
L
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
F
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
V
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
A
D
 
T
S
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
D
S
 
K
G
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
T
-
 
Y
-
 
G
K
 
R
P
 
P
I
 
L
R
 
V
N
 
V
A
 
S
A
 
K
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
Q
 
E
A
 
Q
A
 
N
G
 
G
S
 
E
D
 
D
H
 
V
N
 
N
V
 
S
K
 
K
G
 
G
I
 
I
C
 
C
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
T
K
 
K
D
|
D
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
A
 
A
Y
 
F
D
 
S
P
 
P
N
 
K
S
 
T
S
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
Y
V
 
V
P
 
P
T
 
T
N
 
N
H
 
H
V
 
V
C
 
C
M
 
M
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
F
 
F
D
 
R
V
 
V
D
 
T
Y
 
Y
V
 
T
S
 
P
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
S
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
G
 
A
P
 
P
N
 
G
E
 
S
N
 
H
N
 
G
A
 
G
M
 
M
G
 
G
N
 
N
F
 
F
I
 
I
A
 
A
W
 
W
D
 
D
A
 
N
A
 
L
K
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
I
V
 
K
W
 
W
S
 
S
K
 
N
P
 
P
E
 
E
K
 
Q
F
 
F
S
 
S
V
 
A
W
|
W
S
 
G
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
D
I
 
V
A
 
V
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
E
G
 
G
Y
 
F
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
V
R
 
D
I
 
S
K
 
K
D
 
T
G
 
G
K
 
K
E
 
E
L
 
L
W
 
Y
R
 
K
F
 
F
K
 
K
T
 
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
N
 
N
V
 
V
F
 
M
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
E
Y
 
H
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
H
V
 
V
G
 
A
V
 
V
Y
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
M
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
T
K
 
D
S
 
P
T
 
N
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
R
 
A
E
 
A
L
 
L
A
 
S
K
 
S
Y
 
Y
T
 
T
A
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
Q
L
 
L
F
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
S
I
 
L
P
 
P

6damA Crystal structure of lanthanide-dependent methanol dehydrogenase xoxf from methylomicrobium buryatense 5g (see paper)
63% identity, 95% coverage: 26:601/605 of query aligns to 1:562/563 of 6damA

query
sites
6damA
D
 
N
S
 
S
Q
 
E
L
 
V
D
 
E
G
 
K
L
 
L
M
 
T
K
 
K
S
 
N
P
 
P
S
 
A
N
 
N
W
 
W
A
 
A
A
 
T
Q
 
W
A
 
G
G
 
G
D
 
N
Y
 
Y
A
 
H
N
 
G
H
 
T
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
P
 
E
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
E
 
T
N
 
S
N
 
N
V
 
V
G
 
K
K
 
N
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
A
 
A
W
 
W
T
 
T
M
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
A
 
G
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
N
D
 
D
T
 
V
M
 
M
Y
 
Y
I
 
I
H
 
H
S
 
T
P
 
P
F
 
F
P
 
P
N
 
N
K
 
T
V
 
V
I
 
Y
A
 
A
I
 
I
N
 
D
L
 
Q
K
 
K
D
 
T
Q
 
Q
T
 
A
F
 
V
L
 
I
W
 
W
Q
 
E
Y
 
Y
Q
 
T
P
 
P
K
 
Q
Q
 
Q
D
 
D
-
 
A
D
 
D
S
 
V
V
 
T
V
 
I
S
 
P
V
 
V
M
 
M
C
|
C
C
|
C
D
 
D
T
 
T
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
K
 
K
I
 
I
F
 
F
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
S
D
 
D
T
 
T
K
 
V
L
 
L
V
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
D
 
K
V
 
R
V
 
V
W
 
W
T
 
S
A
 
V
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
N
 
D
S
 
P
K
 
K
A
 
L
G
 
G
E
 
M
T
 
T
N
 
N
T
|
T
N
 
Q
A
 
A
P
 
P
H
 
L
V
 
V
F
 
V
G
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
I
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
F
L
 
L
I
 
A
A
 
A
Y
 
Y
D
 
N
I
 
I
K
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
L
A
 
D
W
 
W
T
 
K
A
 
G
Y
 
Y
S
 
S
T
 
M
G
 
G
P
 
P
D
 
D
K
 
A
D
 
D
M
 
T
L
 
L
M
 
I
D
 
N
P
 
P
D
 
T
K
 
K
T
 
T
M
 
T
T
 
T
Y
 
W
A
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
M
 
V
V
 
Q
P
 
P
V
 
V
G
 
G
A
 
K
D
 
D
S
 
S
S
 
S
L
 
T
K
 
S
S
 
T
W
 
W
K
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
Q
W
 
W
K
 
K
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
T
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
A
 
S
W
 
Y
D
 
D
P
 
P
K
 
E
L
 
L
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
G
 
G
N
|
N
P
 
P
G
 
S
T
 
T
W
 
W
N
 
N
P
 
P
T
 
A
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
S
M
 
M
S
 
S
I
 
L
M
 
W
A
 
A
R
 
R
D
 
N
L
 
A
N
 
D
T
 
T
G
 
G
M
 
E
A
 
V
K
 
K
W
 
W
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
|
D
G
 
G
V
 
I
N
 
N
E
 
E
M
 
V
I
 
A
L
 
L
S
 
V
D
 
D
L
 
Q
T
 
E
I
 
I
D
 
K
G
 
G
K
 
Q
K
 
M
V
 
R
P
 
K
A
 
T
I
 
A
V
 
V
H
 
H
F
 
F
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
N
 
D
R
 
R
E
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
F
 
F
D
 
D
P
 
K
A
 
A
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
A
D
 
S
S
 
H
V
 
V
D
 
D
L
 
M
K
 
K
S
 
S
G
 
G
K
 
R
P
 
P
I
 
Q
R
 
V
N
 
V
A
 
S
A
 
Q
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
Q
 
E
A
 
Y
A
 
N
G
 
G
S
 
E
D
 
D
H
 
V
N
 
N
V
 
T
K
 
E
G
 
G
I
 
V
C
 
C
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
S
K
 
K
D
x
N
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
A
 
V
A
 
S
Y
 
Y
D
 
S
P
 
P
N
 
Q
S
 
T
S
 
G
L
 
Y
F
 
F
L
 
Y
V
 
I
P
 
S
T
 
G
N
 
N
H
 
H
V
 
V
C
 
C
M
 
M
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
F
 
F
D
 
E
V
 
V
D
 
E
Y
 
Y
V
 
T
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
S
M
 
M
Y
 
F
P
 
P
G
 
A
P
 
G
N
 
K
E
 
D
-
 
V
-
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
D
-
 
G
N
 
S
N
 
N
A
 
N
M
 
L
G
 
G
N
 
Q
F
 
F
I
 
T
A
 
A
W
 
W
D
 
D
A
 
A
A
 
T
K
 
T
G
 
G
K
 
K
I
 
I
V
 
I
W
 
W
S
 
S
K
 
N
P
 
K
E
 
E
K
 
Q
F
 
F
S
 
S
V
 
V
W
|
W
S
 
S
G
 
G
A
 
S
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
V
A
 
V
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
V
R
 
D
I
 
A
K
 
K
D
 
T
G
 
G
K
 
K
E
 
E
L
 
L
W
 
Y
R
 
R
F
 
F
K
 
K
T
 
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
N
 
N
V
 
V
F
 
N
T
 
T
Y
 
W
Q
 
E
Y
 
Y
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
V
 
V
Y
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
S
G
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
-
T
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
L
A
 
S
K
 
S
Y
 
Y
T
 
T
A
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
F
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
I
 
L
P
 
P

7ce5A Methanol-pqq bound methanol dehydrogenase (mdh) from methylococcus capsulatus (bath) (see paper)
54% identity, 95% coverage: 26:600/605 of query aligns to 1:573/573 of 7ce5A

query
sites
7ce5A
D
 
N
S
 
S
Q
 
E
L
 
L
D
 
D
G
 
R
L
 
L
M
 
S
K
 
K
S
 
D
P
 
D
S
 
R
N
 
N
W
 
W
A
 
V
A
 
M
Q
 
Q
A
 
T
G
 
K
D
 
D
Y
 
Y
A
 
S
N
 
A
H
 
T
R
 
H
Y
 
F
S
 
S
P
 
R
L
 
L
K
 
T
Q
 
E
I
 
I
N
 
N
E
 
S
N
 
H
N
 
N
V
 
V
G
 
K
K
 
N
L
 
L
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
W
 
W
T
 
T
M
 
L
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
T
L
 
L
R
 
H
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
D
D
 
G
T
 
I
M
 
M
Y
 
Y
I
 
I
H
 
H
S
 
T
P
 
P
F
 
F
P
 
P
N
 
N
K
 
N
V
 
V
I
 
Y
A
 
A
I
 
V
N
 
D
L
 
L
K
 
N
D
 
D
-
 
T
Q
 
R
T
 
K
F
 
M
L
 
L
W
 
W
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
K
P
 
P
K
 
K
Q
 
Q
D
 
N
D
 
P
S
 
A
V
 
A
V
 
R
S
 
A
V
 
V
M
 
A
C
|
C
C
|
C
D
 
D
T
 
V
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
-
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
H
G
 
G
D
 
P
G
 
A
K
 
K
I
 
I
F
 
F
L
 
L
Q
 
N
Q
 
Q
A
 
L
D
 
D
T
 
G
K
 
H
L
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
E
V
 
I
W
 
W
T
 
K
A
 
M
Q
 
E
N
 
N
G
 
S
N
 
D
S
 
I
K
 
A
A
 
M
G
 
G
E
 
S
T
 
T
N
 
L
T
|
T
N
 
G
A
 
A
P
 
P
H
 
F
V
 
V
F
 
V
G
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
L
T
 
V
G
 
G
I
 
S
S
x
A
G
|
G
G
x
A
E
|
E
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
Y
L
 
V
I
 
T
A
 
A
Y
 
Y
D
 
N
I
 
I
K
 
K
T
 
D
G
 
G
K
 
K
P
 
Q
A
 
E
W
 
W
T
 
R
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
T
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
K
 
E
D
 
D
M
 
L
L
 
L
M
 
L
D
 
D
P
 
K
D
 
D
K
 
F
T
 
N
M
 
K
T
 
D
Y
 
N
A
 
P
D
 
H
G
 
Y
K
 
G
M
 
Q
V
 
F
P
 
G
V
 
L
G
 
G
A
 
-
D
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
L
K
 
S
S
 
T
W
 
W
K
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
N
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
A
 
A
W
 
Y
D
 
D
P
 
P
K
 
K
L
 
L
N
 
D
L
 
M
V
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
G
 
G
N
|
N
P
 
P
G
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
E
T
 
T
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
T
M
 
M
S
 
T
I
 
I
M
 
W
A
 
G
R
 
R
D
 
D
L
 
A
N
 
D
T
 
T
G
 
G
M
 
R
A
 
A
K
 
K
W
 
F
V
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
N
E
 
Y
M
 
M
I
 
G
L
 
L
S
 
S
D
 
E
L
 
Q
T
 
E
I
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
K
K
 
L
V
 
T
P
 
P
A
 
L
I
 
L
V
 
T
H
 
H
F
 
P
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
L
G
 
V
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
E
 
E
S
 
T
G
 
G
Q
 
A
L
 
L
L
 
V
V
 
N
A
 
A
Q
 
F
K
 
K
F
 
I
D
 
D
P
 
D
A
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
V
D
 
K
S
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
K
S
 
T
G
 
G
K
 
L
P
 
P
I
 
I
R
 
R
N
 
D
A
 
P
A
 
E
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
Q
 
R
A
 
M
A
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
D
H
 
H
N
 
N
V
 
A
K
 
K
G
 
G
I
 
I
C
 
C
P
 
P
A
 
S
A
 
A
L
 
M
G
 
G
S
 
Y
K
 
H
D
x
N
Q
 
Q
Q
 
G
P
 
I
A
 
E
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
N
 
D
S
 
K
S
 
K
L
 
L
F
 
F
L
 
F
V
 
M
P
 
G
T
 
V
N
 
N
H
 
H
V
 
I
C
 
C
M
 
M
D
 
D
Y
 
W
E
 
E
P
 
P
F
 
F
D
 
M
V
 
L
D
 
P
Y
 
Y
V
 
R
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
N
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
P
 
P
N
 
-
E
 
-
N
 
K
N
 
G
A
 
M
M
 
L
G
 
G
N
 
Q
F
 
V
I
 
K
A
 
A
W
 
M
D
 
N
A
 
A
A
 
V
K
 
T
G
 
G
K
 
K
I
 
M
V
 
E
W
 
W
S
 
E
K
 
V
P
 
P
E
 
E
K
 
K
F
 
F
S
 
A
V
 
V
W
|
W
S
 
G
G
 
G
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
D
I
 
L
A
 
V
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
F
L
 
I
K
 
K
A
 
A
V
 
R
R
 
D
I
 
T
K
 
R
D
 
T
G
 
G
K
 
E
E
 
L
L
 
K
W
 
W
R
 
Q
F
 
F
K
 
Q
T
 
L
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
N
 
H
V
 
P
F
 
I
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
Q
Y
 
H
Q
 
N
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
G
 
A
V
 
I
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
V
A
 
F
G
 
D
L
 
L
E
 
K
K
 
D
S
 
P
T
 
T
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
A
Y
 
F
R
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
H
Y
 
Y
T
 
T
A
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
L
 
V
F
 
F
V
 
V
F
 
F
A
 
S
I
 
L

7cdlC Holo-methanol dehydrogenase (mdh) with cys131-cys132 reduced from methylococcus capsulatus (bath) (see paper)
54% identity, 95% coverage: 26:600/605 of query aligns to 1:573/573 of 7cdlC

query
sites
7cdlC
D
 
N
S
 
S
Q
 
E
L
 
L
D
 
D
G
 
R
L
 
L
M
 
S
K
 
K
S
 
D
P
 
D
S
 
R
N
 
N
W
 
W
A
 
V
A
 
M
Q
 
Q
A
 
T
G
 
K
D
 
D
Y
 
Y
A
 
S
N
 
A
H
 
T
R
 
H
Y
 
F
S
 
S
P
 
R
L
 
L
K
 
T
Q
 
E
I
 
I
N
 
N
E
 
S
N
 
H
N
 
N
V
 
V
G
 
K
K
 
N
L
 
L
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
W
 
W
T
 
T
M
 
L
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
T
L
 
L
R
 
H
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
D
D
 
G
T
 
I
M
 
M
Y
 
Y
I
 
I
H
 
H
S
 
T
P
 
P
F
 
F
P
 
P
N
 
N
K
 
N
V
 
V
I
 
Y
A
 
A
I
 
V
N
 
D
L
 
L
K
 
N
D
 
D
-
 
T
Q
 
R
T
 
K
F
 
M
L
 
L
W
 
W
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
K
P
 
P
K
 
K
Q
 
Q
D
 
N
D
 
P
S
 
A
V
 
A
V
 
R
S
 
A
V
 
V
M
 
A
C
 
C
C
 
C
D
 
D
T
 
V
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
-
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
H
G
 
G
D
 
P
G
 
A
K
 
K
I
 
I
F
 
F
L
 
L
Q
 
N
Q
 
Q
A
 
L
D
 
D
T
 
G
K
 
H
L
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
E
V
 
I
W
 
W
T
 
K
A
 
M
Q
 
E
N
 
N
G
 
S
N
 
D
S
 
I
K
 
A
A
 
M
G
 
G
E
 
S
T
 
T
N
 
L
T
|
T
N
 
G
A
 
A
P
 
P
H
 
F
V
 
V
F
 
V
G
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
L
T
 
V
G
 
G
I
 
S
S
x
A
G
 
G
G
x
A
E
|
E
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
Y
L
 
V
I
 
T
A
 
A
Y
 
Y
D
 
N
I
 
I
K
 
K
T
 
D
G
 
G
K
 
K
P
 
Q
A
 
E
W
 
W
T
 
R
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
T
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
K
 
E
D
 
D
M
 
L
L
 
L
M
 
L
D
 
D
P
 
K
D
 
D
K
 
F
T
 
N
M
 
K
T
 
D
Y
 
N
A
 
P
D
 
H
G
 
Y
K
 
G
M
 
Q
V
 
F
P
 
G
V
 
L
G
 
G
A
 
-
D
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
L
K
 
S
S
 
T
W
 
W
K
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
N
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
A
 
A
W
 
Y
D
 
D
P
 
P
K
 
K
L
 
L
N
 
D
L
 
M
V
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
G
 
G
N
|
N
P
 
P
G
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
E
T
 
T
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
T
M
 
M
S
 
T
I
 
I
M
 
W
A
 
G
R
 
R
D
 
D
L
 
A
N
 
D
T
 
T
G
 
G
M
 
R
A
 
A
K
 
K
W
 
F
V
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
N
E
 
Y
M
 
M
I
 
G
L
 
L
S
 
S
D
 
E
L
 
Q
T
 
E
I
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
K
K
 
L
V
 
T
P
 
P
A
 
L
I
 
L
V
 
T
H
 
H
F
 
P
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
L
G
 
V
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
E
 
E
S
 
T
G
 
G
Q
 
A
L
 
L
L
 
V
V
 
N
A
 
A
Q
 
F
K
 
K
F
 
I
D
 
D
P
 
D
A
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
V
D
 
K
S
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
K
S
 
T
G
 
G
K
 
L
P
 
P
I
 
I
R
 
R
N
 
D
A
 
P
A
 
E
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
Q
 
R
A
 
M
A
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
D
H
 
H
N
 
N
V
 
A
K
 
K
G
 
G
I
 
I
C
 
C
P
 
P
A
 
S
A
 
A
L
 
M
G
 
G
S
 
Y
K
 
H
D
x
N
Q
 
Q
Q
 
G
P
 
I
A
 
E
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
N
 
D
S
 
K
S
 
K
L
 
L
F
 
F
L
 
F
V
 
M
P
 
G
T
 
V
N
 
N
H
 
H
V
 
I
C
 
C
M
 
M
D
 
D
Y
 
W
E
 
E
P
 
P
F
 
F
D
 
M
V
 
L
D
 
P
Y
 
Y
V
 
R
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
N
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
P
 
P
N
 
-
E
 
-
N
 
K
N
 
G
A
 
M
M
 
L
G
 
G
N
 
Q
F
 
V
I
 
K
A
 
A
W
 
M
D
 
N
A
 
A
A
 
V
K
 
T
G
 
G
K
 
K
I
 
M
V
 
E
W
 
W
S
 
E
K
 
V
P
 
P
E
 
E
K
 
K
F
 
F
S
 
A
V
 
V
W
|
W
S
 
G
G
 
G
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
D
I
 
L
A
 
V
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
F
L
 
I
K
 
K
A
 
A
V
 
R
R
 
D
I
 
T
K
 
R
D
 
T
G
 
G
K
 
E
E
 
L
L
 
K
W
 
W
R
 
Q
F
 
F
K
 
Q
T
 
L
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
N
 
H
V
 
P
F
 
I
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
Q
Y
 
H
Q
 
N
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
G
 
A
V
 
I
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
V
A
 
F
G
 
D
L
 
L
E
 
K
K
 
D
S
 
P
T
 
T
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
A
Y
 
F
R
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
H
Y
 
Y
T
 
T
A
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
L
 
V
F
 
F
V
 
V
F
 
F
A
 
S
I
 
L

4aahA Methanol dehydrogenase from methylophilus w3a1 (see paper)
52% identity, 95% coverage: 26:600/605 of query aligns to 1:571/571 of 4aahA

query
sites
4aahA
D
 
D
S
 
A
Q
 
D
L
 
L
D
 
D
G
 
K
L
 
Q
M
 
V
K
 
N
S
 
T
P
 
A
S
 
G
N
 
A
W
 
W
A
 
P
A
 
I
Q
 
A
A
 
T
G
 
G
D
 
G
Y
 
Y
A
 
Y
N
 
S
H
 
Q
R
 
H
Y
 
N
S
 
S
P
 
P
L
 
L
K
 
A
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
E
 
K
N
 
S
N
 
N
V
 
V
G
 
K
K
 
N
L
 
V
Q
 
K
V
 
A
A
 
A
W
 
W
T
 
S
M
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
N
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
D
T
 
M
M
 
M
Y
 
Y
I
 
V
H
 
H
S
 
S
P
 
A
F
 
F
P
 
P
N
 
N
K
 
N
V
 
T
I
 
Y
A
 
A
I
 
L
N
 
N
L
 
L
K
 
N
D
 
D
Q
 
P
-
 
G
T
 
K
F
 
I
L
 
V
W
 
W
Q
 
Q
Y
 
H
Q
 
K
P
 
P
K
 
K
Q
 
Q
D
 
D
D
 
A
S
 
S
V
 
T
V
 
K
S
 
A
V
 
V
M
 
M
C
|
C
C
|
C
D
 
D
T
 
V
V
 
V
N
 
D
R
|
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
D
 
A
G
 
G
K
 
Q
I
 
I
F
 
V
L
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
A
D
 
N
T
 
G
K
 
H
L
 
L
V
 
L
A
 
A
L
 
L
N
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
D
 
K
V
 
I
V
 
N
W
 
W
T
 
E
A
 
V
Q
 
E
N
 
V
G
 
C
N
 
D
S
 
P
K
 
K
A
 
V
G
 
G
E
 
S
T
 
T
N
 
L
T
 
T
N
 
Q
A
 
A
P
 
P
H
 
F
V
 
V
F
 
A
G
 
K
D
 
D
K
 
T
V
 
V
L
 
L
T
 
M
G
 
G
I
 
C
S
|
S
G
 
G
G
x
A
E
|
E
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
A
L
 
V
I
 
N
A
 
A
Y
 
F
D
 
D
I
 
L
K
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
L
A
 
K
W
 
W
T
 
R
A
 
A
Y
 
F
S
 
A
T
 
T
G
 
G
P
 
S
D
 
D
K
 
D
D
 
S
M
 
V
L
 
R
M
 
L
D
 
A
P
 
K
D
 
D
K
 
F
T
 
N
M
 
S
T
 
A
Y
 
N
A
 
P
D
 
H
G
 
Y
K
 
G
M
 
Q
V
 
F
P
 
G
V
 
L
G
 
G
A
 
T
D
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
-
K
 
K
S
 
T
W
 
W
K
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
N
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
A
 
A
W
 
Y
D
 
D
P
 
P
K
 
K
L
 
L
N
 
N
L
 
L
V
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
G
 
G
N
|
N
P
 
P
G
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
E
T
 
T
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
T
M
 
M
S
 
T
I
 
I
M
 
W
A
 
G
R
 
R
D
 
D
L
 
L
N
 
D
T
 
T
G
 
G
M
 
M
A
 
A
K
 
K
W
 
W
V
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
D
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
N
E
 
Q
M
 
M
I
 
V
L
 
L
S
 
T
D
 
D
L
 
Q
T
 
P
I
 
V
D
 
N
G
 
G
K
 
K
K
 
M
V
 
T
P
 
P
A
 
L
I
 
L
V
 
S
H
 
H
F
 
I
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
I
G
 
L
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
E
 
E
S
 
N
G
 
G
Q
 
N
L
 
L
L
 
I
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
F
 
V
D
 
D
P
 
P
A
 
A
V
 
V
N
 
N
W
 
V
A
 
F
D
 
K
S
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
K
S
 
T
G
 
G
K
 
T
P
 
P
I
 
V
R
 
R
N
 
D
A
 
P
A
 
E
Y
 
F
S
 
A
T
 
T
Q
 
R
A
 
M
A
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
D
H
 
H
N
 
K
V
 
G
K
 
T
G
 
N
I
 
I
C
 
C
P
 
P
A
 
S
A
 
A
L
 
M
G
 
G
S
 
F
K
 
H
D
x
N
Q
 
Q
Q
 
G
P
 
V
A
 
D
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
N
 
E
S
 
S
S
 
R
L
 
T
F
 
L
L
 
Y
V
 
A
P
 
G
T
 
L
N
 
N
H
 
H
V
 
I
C
 
C
M
 
M
D
 
D
Y
 
W
E
 
E
P
 
P
F
 
F
D
 
M
V
 
L
D
 
P
Y
 
Y
V
 
R
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
A
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
P
 
P
N
 
N
-
 
G
-
 
P
E
 
T
N
 
K
N
 
K
A
 
E
M
 
M
G
 
G
N
 
Q
F
 
I
I
 
R
A
 
A
W
 
F
D
 
D
A
 
L
A
 
T
K
 
T
G
 
G
K
 
K
I
 
A
V
 
K
W
 
W
S
 
T
K
 
K
P
 
W
E
 
E
K
 
K
F
 
F
S
 
A
V
 
A
W
|
W
S
 
G
G
 
G
A
 
T
L
 
L
A
 
Y
T
 
T
A
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
L
A
 
V
F
 
W
Y
 
Y
G
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
L
R
 
D
I
 
N
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
E
 
E
L
 
L
W
 
W
R
 
N
F
 
F
K
 
K
T
 
M
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
G
I
 
I
G
 
G
N
 
S
V
 
P
F
 
M
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
S
Y
 
F
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
G
 
G
V
 
S
Y
 
M
S
 
Y
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
W
|
W
A
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
V
A
 
F
G
 
D
L
 
L
E
 
T
K
 
D
S
 
P
T
 
S
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
A
Y
 
F
R
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
K
 
N
Y
 
H
T
 
T
A
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
G
L
 
L
F
 
M
V
 
V
F
 
F
A
 
S
I
 
L

4maeA Methanol dehydrogenase from methylacidiphilum fumariolicum solv (see paper)
53% identity, 95% coverage: 26:600/605 of query aligns to 1:576/577 of 4maeA

query
sites
4maeA
D
 
N
S
 
D
Q
 
E
L
 
L
D
 
I
G
 
K
L
 
L
M
 
E
K
 
K
S
 
E
P
 
P
S
 
G
N
 
Q
W
 
W
A
 
V
A
 
M
Q
 
Q
A
 
N
G
 
K
D
 
N
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
H
 
T
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
P
 
E
L
 
L
K
 
N
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
E
 
T
N
 
K
N
 
N
V
 
V
G
 
S
K
 
R
L
 
L
Q
 
R
V
 
L
A
 
A
W
 
W
T
 
S
M
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
A
 
G
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
T
T
 
T
M
 
M
Y
 
Y
I
 
V
H
 
H
S
 
S
P
 
A
F
 
Y
P
 
P
N
 
N
K
 
H
V
 
V
I
 
Y
A
 
A
I
 
L
N
 
D
L
 
L
K
 
T
D
 
Q
Q
 
K
T
 
P
F
 
Y
L
 
A
-
 
I
-
 
K
W
 
W
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
T
P
 
P
K
 
V
Q
 
Q
D
 
N
D
 
S
S
 
Q
V
 
A
V
 
V
S
 
A
V
 
V
M
 
A
C
|
C
C
|
C
D
 
D
T
 
V
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
G
 
A
D
 
N
G
 
G
K
 
K
I
 
I
F
 
F
L
 
M
Q
 
T
Q
 
T
A
 
L
D
 
D
T
 
G
K
 
Q
L
 
I
V
 
I
A
 
A
L
 
L
N
 
D
A
 
A
K
 
N
T
 
T
G
 
G
D
 
K
V
 
E
V
 
L
W
 
W
T
 
K
A
 
M
Q
 
K
N
 
H
G
 
A
N
 
D
S
 
V
K
 
T
A
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
N
 
I
T
|
T
N
 
G
A
 
A
P
 
P
H
 
L
V
 
V
F
 
V
G
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
L
T
 
V
G
 
G
I
 
V
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
R
L
 
V
I
 
G
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
K
 
N
T
 
T
G
 
G
K
 
N
P
 
R
A
 
V
W
 
W
T
 
L
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
T
 
Q
G
 
G
P
 
P
D
 
D
K
 
E
D
 
E
M
 
V
L
 
L
M
 
L
D
 
D
P
 
S
D
 
D
K
 
F
T
 
N
M
 
K
T
 
E
Y
 
F
A
 
P
D
 
Q
G
 
H
K
 
G
M
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
G
A
 
P
D
 
G
S
 
D
S
 
G
L
 
T
K
 
K
S
 
T
W
 
W
K
 
P
G
 
G
D
 
E
Q
 
Q
W
 
W
K
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
T
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
A
 
S
W
 
Y
D
 
D
P
 
P
K
 
A
L
 
L
N
 
D
L
 
L
V
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
G
 
S
N
|
N
P
 
P
G
 
G
T
 
T
W
 
W
N
 
N
P
 
A
T
 
E
Q
 
Q
R
 
R
P
 
K
-
 
G
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
S
M
 
C
S
 
T
I
 
I
M
 
F
A
 
A
R
 
R
D
 
R
L
 
P
N
 
D
T
 
T
G
 
G
M
 
K
A
 
A
K
 
R
W
 
W
V
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
 
W
D
 
D
E
 
S
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
|
D
G
 
G
V
 
V
N
 
N
E
 
E
M
 
M
I
 
I
L
 
L
S
 
P
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
V
D
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
T
P
 
P
A
 
C
I
 
L
V
 
V
H
 
H
F
 
F
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
T
 
V
L
 
L
N
 
D
R
 
R
E
 
R
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
L
 
I
V
 
E
A
 
A
Q
 
Q
K
 
P
F
 
F
D
 
-
P
 
V
A
 
Y
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
A
D
 
K
S
 
E
V
 
I
D
 
S
L
 
K
K
 
E
S
 
N
G
 
D
K
 
R
P
 
P
I
 
V
R
 
E
N
 
I
A
 
P
A
 
E
Y
 
K
S
 
R
T
 
T
Q
 
K
A
 
Q
A
 
G
G
 
-
S
 
-
D
 
-
H
 
V
N
 
D
V
 
T
K
 
K
G
 
G
I
 
I
C
 
C
P
 
P
A
 
N
A
 
S
L
 
M
G
 
G
S
 
G
K
 
K
D
|
D
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
A
 
A
Y
 
F
D
 
S
P
 
P
N
 
Q
S
 
T
S
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
Y
V
 
V
P
 
P
T
 
T
N
 
N
H
 
N
V
 
M
C
 
C
M
 
M
D
 
N
Y
 
Y
E
 
E
P
 
G
F
 
V
D
 
E
V
 
A
D
 
T
Y
 
Y
V
 
T
S
 
A
G
 
G
Q
 
A
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
N
L
 
V
S
 
L
M
 
M
Y
 
Y
P
 
S
G
 
G
P
 
H
N
 
E
-
 
G
E
 
K
N
 
D
N
 
D
A
 
Y
M
 
Y
G
 
G
N
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
C
W
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
R
V
 
V
W
 
W
S
 
E
K
 
I
P
 
H
E
 
E
K
 
H
F
 
F
S
 
P
V
 
V
W
|
W
S
 
S
G
 
G
A
 
P
L
 
V
A
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
L
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
M
E
 
D
G
 
G
Y
 
W
L
 
F
K
 
K
A
 
A
V
 
V
R
 
D
I
 
I
K
 
K
D
 
T
G
 
G
K
 
K
E
 
V
L
 
L
W
 
W
R
 
Q
F
 
Q
K
 
K
T
 
L
P
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
N
 
N
V
 
P
F
 
I
T
 
T
Y
 
F
Q
 
L
-
 
G
Y
 
P
Q
 
D
G
 
K
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
G
 
A
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
F
G
 
G
I
 
I
G
 
A
M
 
V
A
 
A
A
 
Q
G
 
N
L
 
L
-
 
P
-
 
P
E
 
D
K
 
D
S
 
P
T
 
Y
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
-
 
V
G
 
A
Y
 
Y
R
 
Q
E
 
A
-
 
G
L
 
L
A
 
P
K
 
K
Y
 
A
T
 
T
A
 
T
L
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
E
L
 
L
F
 
Y
V
 
V
F
 
F
A
 
A
I
 
L

6fkwA Europium-containing methanol dehydrogenase (see paper)
53% identity, 95% coverage: 26:600/605 of query aligns to 1:576/576 of 6fkwA

query
sites
6fkwA
D
 
N
S
 
D
Q
 
E
L
 
L
D
 
I
G
 
K
L
 
L
M
 
E
K
 
K
S
 
E
P
 
P
S
 
G
N
 
Q
W
 
W
A
 
V
A
 
M
Q
 
Q
A
 
N
G
 
K
D
 
N
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
H
 
T
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
P
 
E
L
 
L
K
 
N
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
E
 
T
N
 
K
N
 
N
V
 
V
G
 
S
K
 
R
L
 
L
Q
 
R
V
 
L
A
 
A
W
 
W
T
 
S
M
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
A
 
G
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
T
T
 
T
M
 
M
Y
 
Y
I
 
V
H
 
H
S
 
S
P
 
A
F
 
Y
P
 
P
N
 
N
K
 
H
V
 
V
I
 
Y
A
 
A
I
 
L
N
 
D
L
 
L
K
 
T
D
 
Q
Q
 
K
T
 
P
F
 
Y
L
 
A
-
 
I
-
 
K
W
 
W
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
T
P
 
P
K
 
V
Q
 
Q
D
 
N
D
 
S
S
 
Q
V
 
A
V
 
V
S
 
A
V
 
V
M
 
A
C
|
C
C
|
C
D
 
D
T
 
V
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
G
 
A
D
 
N
G
 
G
K
 
K
I
 
I
F
 
F
L
 
M
Q
 
T
Q
 
T
A
 
L
D
 
D
T
 
G
K
 
Q
L
 
I
V
 
I
A
 
A
L
 
L
N
 
D
A
 
A
K
 
N
T
 
T
G
 
G
D
 
K
V
 
E
V
 
L
W
 
W
T
 
K
A
 
M
Q
 
K
N
 
H
G
 
A
N
 
D
S
 
V
K
 
T
A
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
N
 
I
T
|
T
N
 
G
A
 
A
P
 
P
H
 
L
V
 
V
F
 
V
G
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
L
T
 
V
G
 
G
I
 
V
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
R
L
 
V
I
 
G
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
K
 
N
T
 
T
G
 
G
K
 
N
P
 
R
A
 
V
W
 
W
T
 
L
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
T
 
Q
G
 
G
P
 
P
D
 
D
K
 
E
D
 
E
M
 
V
L
 
L
M
 
L
D
 
D
P
 
S
D
 
D
K
 
F
T
 
N
M
 
K
T
 
E
Y
 
F
A
 
P
D
 
Q
G
 
H
K
 
G
M
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
G
A
 
P
D
 
G
S
 
D
S
 
G
L
 
T
K
 
K
S
 
T
W
 
W
K
 
P
G
 
G
D
 
E
Q
 
Q
W
 
W
K
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
T
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
A
 
S
W
 
Y
D
 
D
P
 
P
K
 
A
L
 
L
N
 
D
L
 
L
V
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
G
 
S
N
|
N
P
 
P
G
 
G
T
 
T
W
 
W
N
 
N
P
 
A
T
 
E
Q
 
Q
R
 
R
P
 
K
-
 
G
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
S
M
 
C
S
 
T
I
 
I
M
 
F
A
 
A
R
 
R
D
 
R
L
 
P
N
 
D
T
 
T
G
 
G
M
 
K
A
 
A
K
 
R
W
 
W
V
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
 
W
D
 
D
E
 
S
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
|
D
G
 
G
V
 
V
N
 
N
E
 
E
M
 
M
I
 
I
L
 
L
S
 
P
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
V
D
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
T
P
 
P
A
 
C
I
 
L
V
 
V
H
 
H
F
 
F
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
T
 
V
L
 
L
N
 
D
R
 
R
E
 
R
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
L
 
I
V
 
E
A
 
A
Q
 
Q
K
 
P
F
 
F
D
 
-
P
 
V
A
 
Y
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
A
D
 
K
S
 
E
V
 
I
D
 
S
L
 
K
K
 
E
S
 
N
G
 
D
K
 
R
P
 
P
I
 
V
R
 
E
N
 
I
A
 
P
A
 
E
Y
 
K
S
 
R
T
 
T
Q
 
K
A
 
Q
A
 
G
G
 
-
S
 
-
D
 
-
H
 
V
N
 
D
V
 
T
K
 
K
G
 
G
I
 
I
C
 
C
P
 
P
A
 
N
A
 
S
L
 
M
G
 
G
S
 
G
K
 
K
D
|
D
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
A
 
A
Y
 
F
D
 
S
P
 
P
N
 
Q
S
 
T
S
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
Y
V
 
V
P
 
P
T
 
T
N
 
N
H
 
N
V
 
M
C
 
C
M
 
M
D
 
N
Y
 
Y
E
 
E
P
 
G
F
 
V
D
 
E
V
 
A
D
 
T
Y
 
Y
V
 
T
S
 
A
G
 
G
Q
 
A
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
N
L
 
V
S
 
L
M
 
M
Y
 
Y
P
 
S
G
 
G
P
 
H
N
 
E
-
 
G
E
 
K
N
 
D
N
 
D
A
 
Y
M
 
Y
G
 
G
N
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
C
W
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
R
V
 
V
W
 
W
S
 
E
K
 
I
P
 
H
E
 
E
K
 
H
F
 
F
S
 
P
V
 
V
W
|
W
S
 
S
G
 
G
A
 
P
L
 
V
A
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
L
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
M
E
 
D
G
 
G
Y
 
W
L
 
F
K
 
K
A
 
A
V
 
V
R
 
D
I
 
I
K
 
K
D
 
T
G
 
G
K
 
K
E
 
V
L
 
L
W
 
W
R
 
Q
F
 
Q
K
 
K
T
 
L
P
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
N
 
N
V
 
P
F
 
I
T
 
T
Y
 
F
Q
 
L
-
 
G
Y
 
P
Q
 
D
G
 
K
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
G
 
A
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
F
G
 
G
I
 
I
G
 
A
M
 
V
A
 
A
A
 
Q
G
 
N
L
 
L
-
 
P
-
 
P
E
 
D
K
 
D
S
 
P
T
 
Y
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
-
 
V
G
 
A
Y
 
Y
R
 
Q
E
 
A
-
 
G
L
 
L
A
 
P
K
 
K
Y
 
A
T
 
T
A
 
T
L
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
E
L
 
L
F
 
Y
V
 
V
F
 
F
A
 
A
I
 
L

P16027 Methanol dehydrogenase [cytochrome c] subunit 1; MDH large subunit alpha; MEDH; EC 1.1.2.7 from Methylorubrum extorquens (strain ATCC 14718 / DSM 1338 / JCM 2805 / NCIMB 9133 / AM1) (Methylobacterium extorquens) (see 3 papers)
51% identity, 96% coverage: 23:602/605 of query aligns to 25:609/626 of P16027

query
sites
P16027
A
|
A
Q
x
Y
A
|
A
D
 
N
S
 
D
Q
 
K
L
 
L
D
 
V
G
 
E
L
 
L
M
 
S
K
 
K
S
 
S
P
 
D
S
 
D
N
 
N
W
 
W
A
 
V
A
 
M
Q
 
P
A
 
G
G
 
K
D
 
N
Y
 
Y
A
 
D
N
 
S
H
 
N
R
 
N
Y
 
F
S
 
S
P
 
D
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
E
 
K
N
 
G
N
 
N
V
 
V
G
 
K
K
 
Q
L
 
L
Q
 
R
V
 
P
A
 
A
W
 
W
T
 
T
M
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
L
L
 
L
R
 
N
G
 
G
H
 
H
E
 
E
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
D
D
 
G
T
 
K
M
 
M
Y
 
Y
I
 
I
H
 
H
S
 
T
P
 
S
F
 
F
P
 
P
N
 
N
K
 
N
V
 
T
I
 
F
A
 
A
I
 
L
N
 
G
L
 
L
K
 
D
D
 
D
Q
 
P
-
 
G
T
 
T
F
 
I
L
 
L
W
 
W
Q
 
Q
Y
 
D
Q
 
K
P
 
P
K
 
K
Q
 
Q
D
 
N
D
 
P
S
 
A
V
 
A
V
 
R
S
 
A
V
 
V
M
 
A
C
|
C
C
|
C
D
 
D
T
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
-
 
W
-
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
K
 
K
-
 
T
-
 
P
-
 
A
-
 
L
I
 
I
F
 
L
L
 
K
Q
 
T
Q
 
Q
A
 
L
D
 
D
T
 
G
K
 
N
L
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
K
 
E
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
T
V
 
V
W
 
W
T
 
K
A
 
V
Q
 
E
N
 
N
G
 
S
N
 
D
S
 
I
K
 
K
A
 
V
G
 
G
E
 
S
T
 
T
N
 
L
T
 
T
N
 
I
A
 
A
P
 
P
H
 
Y
V
 
V
F
 
V
G
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
I
T
 
I
G
 
G
I
 
S
S
 
S
G
 
G
G
 
A
E
 
E
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
Y
L
 
L
I
 
T
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
I
 
V
K
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
Q
A
 
V
W
 
W
T
 
R
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
T
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
K
 
K
D
 
D
M
 
L
L
 
L
M
 
L
D
 
A
P
 
S
D
 
D
K
 
F
T
 
N
M
 
I
T
 
K
Y
 
N
A
 
P
D
 
H
G
 
Y
K
 
G
M
 
Q
V
 
K
P
 
G
V
 
L
G
 
G
A
 
T
D
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
-
K
 
G
S
 
T
W
 
W
K
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
N
W
 
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
A
 
A
W
 
Y
D
 
D
P
 
P
K
 
G
L
 
T
N
 
N
L
 
L
V
 
I
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
G
T
 
T
G
 
G
N
 
N
P
 
P
G
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
E
T
 
T
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
T
M
 
M
S
 
T
I
 
I
M
 
F
A
 
G
R
 
R
D
 
D
L
 
A
N
 
D
T
 
T
G
 
G
M
 
E
A
 
A
K
 
K
W
 
F
V
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
N
E
 
V
M
 
M
I
 
M
L
 
L
S
 
S
D
 
E
L
 
Q
T
 
K
-
 
D
I
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
K
 
A
V
 
R
P
 
K
A
 
L
I
 
L
V
 
T
H
 
H
F
 
P
D
 
D
R
 
R
N
 
N
G
 
G
F
 
I
G
 
V
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
N
 
D
R
 
R
E
 
T
S
 
D
G
 
G
Q
 
A
L
 
L
L
 
V
V
 
S
A
 
A
Q
 
N
K
 
K
F
 
L
D
 
D
P
 
D
A
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
V
A
 
F
D
 
K
S
 
S
V
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
K
S
 
T
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
I
 
V
R
 
R
N
 
D
A
 
P
A
 
E
Y
 
Y
S
 
G
T
 
T
Q
 
R
A
 
M
A
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
D
H
 
H
N
 
L
V
 
A
K
 
K
G
 
D
I
 
I
C
|
C
P
 
P
A
 
S
A
 
A
L
 
M
G
 
G
S
 
Y
K
 
H
D
 
N
Q
 
Q
Q
 
G
P
 
H
A
 
D
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
N
 
K
S
 
R
S
 
E
L
 
L
F
 
F
L
 
F
V
 
M
P
 
G
T
 
I
N
 
N
H
 
H
V
 
I
C
|
C
M
 
M
D
 
D
Y
 
W
E
 
E
P
 
P
F
 
F
D
 
M
V
 
L
D
 
P
Y
 
Y
V
 
R
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
N
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
P
 
P
N
 
K
E
 
G
N
 
D
-
 
R
-
 
Q
-
 
N
-
 
Y
N
 
E
A
 
G
M
 
L
G
 
G
N
 
Q
F
 
I
I
 
K
A
 
A
W
 
Y
D
 
N
A
 
A
A
 
I
K
 
T
G
 
G
K
 
D
I
 
Y
V
 
K
W
 
W
S
 
E
K
 
K
P
 
M
E
 
E
K
 
R
F
 
F
S
 
A
V
 
V
W
 
W
S
 
G
G
 
G
A
 
T
L
 
M
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
D
I
 
L
A
 
V
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
R
R
 
D
I
 
S
K
 
D
D
 
T
G
 
G
K
 
D
E
 
L
L
 
L
W
 
W
R
 
K
F
 
F
K
 
K
T
 
I
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
A
I
 
I
G
 
G
N
 
Y
V
 
P
F
 
M
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
T
Y
 
H
Q
 
K
G
 
G
K
 
T
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
G
 
A
V
 
I
Y
 
Y
S
 
Y
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
W
 
W
A
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
V
A
 
F
G
 
D
L
 
L
E
 
A
K
 
D
S
 
P
T
 
T
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
A
Y
 
F
R
 
K
E
 
K
L
 
L
A
 
A
K
 
N
Y
 
Y
T
 
T
A
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
G
L
 
V
F
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
S
I
 
L
P
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1w6sC The high resolution structure of methanol dehydrogenase from methylobacterium extorquens (see paper)
51% identity, 95% coverage: 26:602/605 of query aligns to 1:582/596 of 1w6sC

query
sites
1w6sC
D
 
N
S
 
D
Q
 
K
L
 
L
D
 
V
G
 
E
L
 
L
M
 
S
K
 
K
S
 
S
P
 
D
S
 
D
N
 
N
W
 
W
A
 
V
A
 
M
Q
 
P
A
 
G
G
 
K
D
 
N
Y
 
Y
A
 
D
N
 
S
H
 
N
R
 
N
Y
 
F
S
 
S
P
 
D
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
E
 
K
N
 
G
N
 
N
V
 
V
G
 
K
K
 
Q
L
 
L
Q
 
R
V
 
P
A
 
A
W
 
W
T
 
T
M
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
L
L
 
L
R
 
N
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
D
D
 
G
T
 
K
M
 
M
Y
 
Y
I
 
I
H
 
H
S
 
T
P
 
S
F
 
F
P
 
P
N
 
N
K
 
N
V
 
T
I
 
F
A
 
A
I
 
L
N
 
G
L
 
L
K
 
D
D
 
D
Q
 
P
-
 
G
T
 
T
F
 
I
L
 
L
W
 
W
Q
 
Q
Y
 
D
Q
 
K
P
 
P
K
 
K
Q
 
Q
D
 
N
D
 
P
S
 
A
V
 
A
V
 
R
S
 
A
V
 
V
M
 
A
C
|
C
C
|
C
D
 
D
T
 
L
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
-
 
W
-
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
K
 
K
-
 
T
-
 
P
-
 
A
-
 
L
I
 
I
F
 
L
L
 
K
Q
 
T
Q
 
Q
A
 
L
D
 
D
T
 
G
K
 
N
L
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
K
 
E
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
T
V
 
V
W
 
W
T
 
K
A
 
V
Q
 
E
N
 
N
G
 
S
N
 
D
S
 
I
K
 
K
A
 
V
G
 
G
E
 
S
T
 
T
N
 
L
T
|
T
N
 
I
A
 
A
P
 
P
H
 
Y
V
 
V
F
 
V
G
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
I
T
 
I
G
 
G
I
 
S
S
|
S
G
 
G
G
x
A
E
|
E
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
Y
L
 
L
I
 
T
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
I
 
V
K
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
Q
A
 
V
W
 
W
T
 
R
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
T
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
K
 
K
D
 
D
M
 
L
L
 
L
M
 
L
D
 
A
P
 
S
D
 
D
K
 
F
T
 
N
M
 
I
T
 
K
Y
 
N
A
 
P
D
 
H
G
 
Y
K
 
G
M
 
Q
V
 
K
P
 
G
V
 
L
G
 
G
A
 
T
D
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
-
K
 
G
S
 
T
W
 
W
K
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
N
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
A
 
A
W
 
Y
D
 
D
P
 
P
K
 
G
L
 
T
N
 
N
L
 
L
V
 
I
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
G
T
 
T
G
 
G
N
|
N
P
 
P
G
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
E
T
 
T
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
T
M
 
M
S
 
T
I
 
I
M
 
F
A
 
G
R
 
R
D
 
D
L
 
A
N
 
D
T
 
T
G
 
G
M
 
E
A
 
A
K
 
K
W
 
F
V
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
N
E
 
V
M
 
M
I
 
M
L
 
L
S
 
S
D
 
E
L
 
Q
T
 
K
-
 
D
I
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
K
 
A
V
 
R
P
 
K
A
 
L
I
 
L
V
 
T
H
 
H
F
 
P
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
I
G
 
V
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
N
 
D
R
 
R
E
 
T
S
 
D
G
 
G
Q
 
A
L
 
L
L
 
V
V
 
S
A
 
A
Q
 
N
K
 
K
F
 
L
D
 
D
P
 
D
A
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
V
A
 
F
D
 
K
S
 
S
V
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
K
S
 
T
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
I
 
V
R
 
R
N
 
D
A
 
P
A
 
E
Y
 
Y
S
 
G
T
 
T
Q
 
R
A
 
M
A
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
D
H
 
H
N
 
L
V
 
A
K
 
K
G
 
D
I
 
I
C
 
C
P
 
P
A
 
S
A
 
A
L
 
M
G
 
G
S
 
Y
K
 
H
D
x
N
Q
 
Q
Q
 
G
P
 
H
A
 
D
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
N
 
K
S
 
R
S
 
E
L
 
L
F
 
F
L
 
F
V
 
M
P
 
G
T
 
I
N
 
N
H
 
H
V
 
I
C
 
C
M
 
M
D
 
D
Y
 
W
E
 
E
P
 
P
F
 
F
D
 
M
V
 
L
D
 
P
Y
 
Y
V
 
K
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
N
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
P
 
P
N
 
K
E
 
G
N
 
D
-
 
R
-
 
Q
-
 
N
-
 
Y
N
 
E
A
 
G
M
 
L
G
 
G
N
 
Q
F
 
I
I
 
K
A
 
A
W
 
Y
D
 
N
A
 
A
A
 
I
K
 
T
G
 
G
K
 
D
I
 
Y
V
 
K
W
 
W
S
 
E
K
 
K
P
 
M
E
 
E
K
 
R
F
 
F
S
 
A
V
 
V
W
|
W
S
 
G
G
 
G
A
 
T
L
 
M
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
D
I
 
L
A
 
V
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
R
R
 
D
I
 
S
K
 
D
D
 
T
G
 
G
K
 
D
E
 
L
L
 
L
W
 
W
R
 
K
F
 
F
K
 
K
T
 
I
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
A
I
 
I
G
 
G
N
 
Y
V
 
P
F
 
M
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
T
Y
 
H
Q
 
K
G
 
G
K
 
T
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
G
 
A
V
 
I
Y
 
Y
S
 
Y
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
W
|
W
A
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
V
A
 
F
G
 
D
L
 
L
E
 
A
K
 
D
S
 
P
T
 
T
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
A
Y
 
F
R
 
K
E
 
K
L
 
L
A
 
A
K
 
N
Y
 
Y
T
 
T
A
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
G
L
 
V
F
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
S
I
 
L
P
 
D
G
 
G

P12293 Methanol dehydrogenase [cytochrome c] subunit 1; MDH large subunit alpha; MEDH; EC 1.1.2.7 from Paracoccus denitrificans (see 2 papers)
47% identity, 98% coverage: 8:602/605 of query aligns to 20:613/631 of P12293

query
sites
P12293
L
x
M
G
|
G
L
|
L
A
|
A
I
x
V
L
|
L
A
x
T
S
x
T
A
|
A
A
x
P
M
 
-
S
 
-
S
 
-
I
 
-
V
 
-
A
|
A
Q
x
T
A
|
A
D
 
N
S
 
D
Q
 
Q
L
 
L
D
 
V
G
 
E
L
 
L
M
 
A
K
 
K
S
 
D
P
 
P
S
 
A
N
 
N
W
 
W
A
 
V
A
 
M
Q
 
T
A
 
G
G
 
R
D
 
D
Y
 
Y
A
 
N
N
 
A
H
 
Q
R
 
N
Y
 
Y
S
 
S
P
 
E
L
 
M
K
 
T
Q
 
D
I
 
I
N
 
N
E
 
K
N
 
E
N
 
N
V
 
V
G
 
K
K
 
Q
L
 
L
Q
 
R
V
 
P
A
 
A
W
 
W
T
 
S
M
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
H
G
 
G
H
 
H
E
 
E
G
 
G
A
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
D
T
 
R
M
 
M
Y
 
F
I
 
I
H
 
H
S
 
T
P
 
P
F
 
F
P
 
P
N
 
N
K
 
T
V
 
T
I
 
F
A
 
A
I
 
L
N
 
D
L
 
L
K
 
N
D
 
E
Q
 
P
-
 
G
T
 
K
F
 
I
L
 
L
W
 
W
Q
 
Q
Y
 
N
Q
 
K
P
 
P
K
 
K
Q
 
Q
D
 
N
D
 
P
S
 
T
V
 
A
V
 
R
S
 
T
V
 
V
M
 
A
C
|
C
C
|
C
D
 
D
T
 
V
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
-
 
W
-
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
D
K
 
Q
-
 
V
-
 
K
-
 
P
-
 
L
I
 
I
F
 
F
L
 
R
Q
 
T
Q
 
Q
A
 
L
D
 
D
T
 
G
K
 
H
L
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
M
N
 
D
A
 
A
K
 
E
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
T
V
 
R
W
 
W
T
 
I
A
 
M
Q
 
E
N
 
N
G
 
S
N
 
D
S
 
I
K
 
K
A
 
V
G
 
G
E
 
S
T
 
T
N
 
L
T
 
T
N
 
I
A
 
A
P
 
P
H
 
Y
V
 
V
F
 
I
G
 
K
D
 
D
K
 
L
V
 
V
L
 
L
T
 
V
G
 
G
I
 
S
S
 
S
G
 
G
G
 
A
E
 
E
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
Y
L
 
V
I
 
T
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
I
 
V
K
 
K
T
 
S
G
 
G
K
 
E
P
 
M
A
 
R
W
 
W
T
 
R
A
 
A
Y
 
F
S
 
A
T
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
K
 
E
D
 
E
M
 
L
L
 
L
M
 
L
D
 
A
P
 
E
D
 
D
K
 
F
T
 
N
M
 
A
T
 
P
Y
 
N
A
 
P
D
 
H
G
 
Y
K
 
G
M
 
Q
V
 
K
P
 
N
V
 
L
G
 
G
A
 
-
D
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
L
K
 
E
S
 
T
W
 
W
K
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
N
W
 
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
A
 
A
W
 
Y
D
 
D
P
 
P
K
 
E
L
 
V
N
 
D
L
 
L
V
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
G
 
G
N
 
N
P
 
P
G
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
E
T
 
T
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
T
M
 
M
S
 
A
I
 
I
M
 
W
A
 
G
R
 
R
D
 
E
L
 
A
N
 
T
T
 
T
G
 
G
M
 
E
A
 
A
K
 
K
W
 
F
V
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
 
D
Y
 
Y
D
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
N
E
 
V
M
 
M
I
 
M
L
 
L
S
 
S
D
 
E
L
 
Q
T
 
E
-
 
D
I
 
K
D
 
Q
G
 
G
K
 
Q
K
 
M
V
 
R
P
 
K
A
 
L
I
 
L
V
 
T
H
 
H
F
 
P
D
 
D
R
 
R
N
 
N
G
 
G
F
 
I
G
 
V
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
N
 
D
R
 
R
E
 
T
S
 
N
G
 
G
Q
 
D
L
 
L
L
 
I
V
 
S
A
 
A
Q
 
D
K
 
K
F
 
M
D
 
D
P
 
D
A
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
V
D
 
K
S
 
E
V
 
V
D
 
Q
L
 
L
K
 
D
S
 
T
G
 
G
K
 
L
P
 
P
I
 
V
R
 
R
N
 
D
A
 
P
A
 
E
Y
 
F
S
 
G
T
 
T
Q
 
R
A
 
M
A
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
D
H
 
H
N
 
K
V
 
A
K
 
R
G
 
D
I
 
I
C
|
C
P
 
P
A
 
S
A
 
A
L
 
M
G
 
G
S
 
Y
K
 
H
D
 
N
Q
 
Q
Q
 
G
P
 
H
A
 
D
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
N
 
E
S
 
R
S
 
K
L
 
V
F
 
F
L
 
M
V
 
L
P
 
G
T
 
I
N
 
N
H
 
H
V
 
I
C
|
C
M
 
M
D
 
D
Y
 
W
E
 
E
P
 
P
F
 
F
D
 
M
V
 
L
D
 
P
Y
 
Y
V
 
R
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
T
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
P
 
P
N
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
A
E
 
E
N
 
R
N
 
A
A
 
G
M
 
A
G
 
G
N
 
Q
F
 
I
I
 
K
A
 
A
W
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
I
K
 
S
G
 
G
K
 
E
I
 
M
V
 
K
W
 
W
S
 
E
K
 
K
P
 
M
E
 
E
K
 
R
F
 
F
S
 
S
V
 
V
W
 
W
S
 
G
G
 
G
A
 
T
L
 
M
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
L
A
 
T
F
 
F
Y
 
Y
G
 
V
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
F
L
 
I
K
 
K
A
 
A
V
 
R
R
 
D
I
 
S
K
 
D
D
 
T
G
 
G
K
 
D
E
 
L
L
 
L
W
 
W
R
 
K
F
 
F
K
 
K
T
 
L
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
N
 
H
V
 
P
F
 
M
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
K
Y
 
H
Q
 
D
G
 
G
K
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
G
 
A
V
 
I
Y
 
M
S
 
Y
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
W
 
W
A
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
V
A
 
F
G
 
D
L
 
L
E
 
A
K
 
D
S
 
P
T
 
T
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
A
Y
 
F
R
 
K
E
 
R
L
 
L
A
 
Q
K
 
E
Y
 
F
T
 
T
A
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
G
L
 
V
F
 
M
V
 
V
F
 
F
A
 
S
I
 
L
P
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1lrwA Crystal structure of methanol dehydrogenase from p. Denitrificans (see paper)
48% identity, 95% coverage: 26:602/605 of query aligns to 1:582/600 of 1lrwA

query
sites
1lrwA
D
 
N
S
 
D
Q
 
Q
L
 
L
D
 
V
G
 
E
L
 
L
M
 
A
K
 
K
S
 
D
P
 
P
S
 
A
N
 
N
W
 
W
A
 
V
A
 
M
Q
 
T
A
 
G
G
 
R
D
 
D
Y
 
Y
A
 
N
N
 
A
H
 
Q
R
 
N
Y
 
Y
S
 
S
P
 
E
L
 
M
K
 
T
Q
 
D
I
 
I
N
 
N
E
 
K
N
 
E
N
 
N
V
 
V
G
 
K
K
 
Q
L
 
L
Q
 
R
V
 
P
A
 
A
W
 
W
T
 
S
M
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
H
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
A
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
D
T
 
R
M
 
M
Y
 
F
I
 
I
H
 
H
S
 
T
P
 
P
F
 
F
P
 
P
N
 
N
K
 
T
V
 
T
I
 
F
A
 
A
I
 
L
N
 
D
L
 
L
K
 
N
D
 
E
Q
 
P
-
 
G
T
 
K
F
 
I
L
 
L
W
 
W
Q
 
Q
Y
 
N
Q
 
K
P
 
P
K
 
K
Q
 
Q
D
 
N
D
 
P
S
 
T
V
 
A
V
 
R
S
 
T
V
 
V
M
 
A
C
|
C
C
|
C
D
 
D
T
 
V
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
-
 
W
-
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
D
K
 
Q
-
 
V
-
 
K
-
 
P
-
 
L
I
 
I
F
 
F
L
 
R
Q
 
T
Q
 
Q
A
 
L
D
 
D
T
 
G
K
 
H
L
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
M
N
 
D
A
 
A
K
 
E
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
T
V
 
R
W
 
W
T
 
I
A
 
M
Q
 
E
N
 
N
G
 
S
N
 
D
S
 
I
K
 
K
A
 
V
G
 
G
E
 
S
T
 
T
N
 
L
T
|
T
N
 
I
A
 
A
P
 
P
H
 
Y
V
 
V
F
 
I
G
 
K
D
 
D
K
 
L
V
 
V
L
 
L
T
 
V
G
 
G
I
 
S
S
|
S
G
|
G
G
x
A
E
|
E
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
Y
L
 
V
I
 
T
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
I
 
V
K
 
K
T
 
S
G
 
G
K
 
E
P
 
M
A
 
R
W
 
W
T
 
R
A
 
A
Y
 
F
S
 
A
T
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
K
 
E
D
 
E
M
 
L
L
 
L
M
 
L
D
 
A
P
 
E
D
 
D
K
 
F
T
 
N
M
 
A
T
 
P
Y
 
N
A
 
P
D
 
H
G
 
Y
K
 
G
M
 
Q
V
 
K
P
 
N
V
 
L
G
 
G
A
 
-
D
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
L
K
 
E
S
 
T
W
 
W
K
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
N
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
A
 
A
W
 
Y
D
 
D
P
 
P
K
 
E
L
 
V
N
 
D
L
 
L
V
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
G
 
G
N
|
N
P
 
P
G
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
E
T
 
T
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
T
M
 
M
S
 
A
I
 
I
M
 
W
A
 
G
R
 
R
D
 
E
L
 
A
N
 
T
T
 
T
G
 
G
M
 
E
A
 
A
K
 
K
W
 
F
V
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
N
E
 
V
M
 
M
I
 
M
L
 
L
S
 
S
D
 
E
L
 
Q
T
 
E
-
 
D
I
 
K
D
 
Q
G
 
G
K
 
Q
K
 
M
V
 
R
P
 
K
A
 
L
I
 
L
V
 
T
H
 
H
F
 
P
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
I
G
 
V
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
N
 
D
R
 
R
E
 
T
S
 
N
G
 
G
Q
 
D
L
 
L
L
 
I
V
 
S
A
 
A
Q
 
D
K
 
K
F
 
M
D
 
D
P
 
D
A
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
V
D
 
K
S
 
E
V
 
V
D
 
Q
L
 
L
K
 
D
S
 
T
G
 
G
K
 
L
P
 
P
I
 
V
R
 
R
N
 
D
A
 
P
A
 
E
Y
 
F
S
 
G
T
 
T
Q
 
R
A
 
M
A
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
D
H
 
H
N
 
K
V
 
A
K
 
R
G
 
D
I
 
I
C
 
C
P
 
P
A
 
S
A
 
A
L
 
M
G
 
G
S
 
Y
K
 
H
D
 
N
Q
 
Q
Q
 
G
P
 
H
A
 
D
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
N
 
E
S
 
R
S
 
K
L
 
V
F
 
F
L
 
M
V
 
L
P
 
G
T
 
I
N
 
N
H
 
H
V
 
I
C
 
C
M
 
M
D
 
D
Y
 
W
E
 
E
P
 
P
F
 
F
D
 
M
V
 
L
D
 
P
Y
 
Y
V
 
R
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
T
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
P
 
P
-
 
K
-
 
G
N
 
D
E
 
R
N
 
G
N
 
N
A
 
A
-
 
S
-
 
G
M
 
L
G
 
G
N
 
Q
F
 
I
I
 
K
A
 
A
W
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
I
K
 
S
G
 
G
K
 
E
I
 
M
V
 
K
W
 
W
S
 
E
K
 
K
P
 
M
E
 
E
K
 
R
F
 
F
S
 
S
V
 
V
W
|
W
S
 
G
G
 
G
A
 
T
L
 
M
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
L
A
 
T
F
 
F
Y
 
Y
G
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
F
L
 
I
K
 
K
A
 
A
V
 
R
R
 
D
I
 
S
K
 
D
D
 
T
G
 
G
K
 
D
E
 
L
L
 
L
W
 
W
R
 
K
F
 
F
K
 
K
T
 
L
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
N
 
H
V
 
P
F
 
M
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
K
Y
 
H
Q
 
D
G
 
G
K
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
G
 
A
V
 
I
Y
 
M
S
 
Y
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
W
|
W
A
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
V
A
 
F
G
 
D
L
 
L
E
 
A
K
 
D
S
 
P
T
 
T
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
A
Y
 
F
R
 
K
E
 
R
L
 
L
A
 
Q
K
 
E
Y
 
F
T
 
T
A
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
G
L
 
V
F
 
M
V
 
V
F
 
F
A
 
S
I
 
L
P
 
D
G
 
G

2d0vA Crystal structure of methanol dehydrogenase from hyphomicrobium denitrificans (see paper)
49% identity, 96% coverage: 26:604/605 of query aligns to 1:584/597 of 2d0vA

query
sites
2d0vA
D
 
N
S
 
D
Q
 
K
L
 
L
D
 
I
G
 
E
L
 
L
M
 
S
K
 
N
S
 
S
P
 
N
S
 
E
N
 
N
W
 
W
A
 
V
A
 
M
Q
 
P
A
 
G
G
 
K
D
 
N
Y
 
Y
A
 
D
N
 
S
H
 
N
R
 
N
Y
 
Y
S
 
S
P
 
T
L
 
S
K
 
T
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
E
 
V
N
 
D
N
 
N
V
 
V
G
 
K
K
 
Q
L
 
L
Q
 
K
V
 
H
A
 
A
W
 
W
T
 
S
M
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
E
L
 
L
R
 
H
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
D
T
 
V
M
 
M
Y
 
Y
I
 
V
H
 
H
S
 
S
P
 
S
F
 
F
P
 
P
N
 
N
K
 
K
V
 
T
I
 
F
A
 
A
I
 
L
N
 
D
L
 
L
K
 
N
D
 
D
Q
 
P
-
 
G
T
 
H
F
 
I
L
 
L
W
 
W
Q
 
Q
Y
 
H
Q
 
S
P
 
P
K
 
K
Q
 
Q
D
 
D
D
 
P
S
 
A
V
 
A
V
 
R
S
 
S
V
 
V
M
 
A
C
 
C
C
 
C
D
 
D
T
 
L
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
-
 
W
-
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
D
K
 
K
-
 
T
-
 
P
-
 
S
-
 
L
I
 
I
F
 
I
L
 
K
Q
 
T
Q
 
Q
A
 
L
D
 
D
T
 
G
K
 
H
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
E
V
 
F
W
 
W
T
 
K
A
 
V
Q
 
E
N
 
N
G
 
G
N
 
D
S
 
I
K
 
K
A
 
V
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
N
 
L
T
|
T
N
 
Q
A
 
A
P
 
P
H
 
Y
V
 
V
F
 
V
G
 
H
D
 
D
K
 
L
V
 
A
L
 
I
T
 
V
G
 
G
I
 
S
S
|
S
G
|
G
G
x
A
E
|
E
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
H
L
 
V
I
 
T
A
 
A
Y
 
Y
D
 
N
I
 
V
K
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
Q
A
 
A
W
 
W
T
 
R
A
 
Y
Y
 
Y
S
 
A
T
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
K
 
A
D
 
E
M
 
I
L
 
G
M
 
L
D
 
A
P
 
D
D
 
D
K
 
F
T
 
N
M
 
S
T
 
A
Y
 
N
A
 
P
D
 
H
G
 
Y
K
 
G
M
 
Q
V
 
K
P
 
G
V
 
L
G
 
G
A
 
T
D
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
-
K
 
A
S
 
T
W
 
W
K
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
N
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
A
 
A
W
 
Y
D
 
D
P
 
P
K
 
A
L
 
A
N
 
N
L
 
L
V
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
G
 
G
N
|
N
P
 
P
G
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
E
T
 
T
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
T
M
 
M
S
 
T
I
 
I
M
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
A
N
 
D
T
 
T
G
 
G
M
 
K
A
 
M
K
 
K
W
 
F
V
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
D
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
N
E
 
V
M
 
I
I
 
M
L
 
L
S
 
S
D
 
E
L
 
Q
T
 
T
I
 
D
D
 
K
-
 
T
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
R
P
 
K
A
 
L
I
 
L
V
 
T
H
 
H
F
 
P
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
I
G
 
V
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
N
 
D
R
 
R
E
 
E
S
 
N
G
 
G
Q
 
D
L
 
L
L
 
I
V
 
S
A
 
A
Q
 
D
K
 
K
F
 
L
D
 
D
P
 
D
A
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
V
A
 
F
D
 
K
S
 
T
V
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
K
S
 
T
G
 
G
K
 
L
P
 
P
I
 
V
R
 
R
N
 
D
A
 
P
A
 
E
Y
 
Y
S
 
G
T
 
T
Q
 
R
A
 
M
A
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
D
H
 
H
N
 
K
V
 
G
K
 
T
G
 
D
I
 
I
C
 
C
P
 
P
A
 
S
A
 
A
L
 
M
G
 
G
S
 
Y
K
 
H
D
x
N
Q
 
Q
Q
 
G
P
 
H
A
 
D
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
N
 
Q
S
 
K
S
 
Q
L
 
L
F
 
F
L
 
F
V
 
M
P
 
G
T
 
I
N
 
N
H
 
H
V
 
I
C
 
C
M
 
M
D
 
D
Y
 
W
E
 
E
P
 
P
F
 
F
D
 
M
V
 
L
D
 
P
Y
 
Y
V
 
R
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
W
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
P
 
P
N
 
K
E
 
G
N
 
D
N
 
R
-
 
Q
-
 
N
-
 
Y
-
 
L
A
 
G
M
 
L
G
 
G
N
 
Q
F
 
I
I
 
K
A
 
A
W
 
Y
D
 
N
A
 
A
A
 
I
K
 
T
G
 
N
K
 
E
I
 
Y
V
 
K
W
 
W
S
 
Q
K
 
H
P
 
M
E
 
E
K
 
R
F
 
F
S
 
S
V
 
V
W
|
W
S
 
G
G
 
G
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
N
I
 
L
A
 
V
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
F
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
R
R
 
N
I
 
S
K
 
D
D
 
T
G
 
G
K
 
E
E
 
L
L
 
V
W
 
W
R
 
K
F
 
H
K
 
K
T
 
L
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
N
 
Y
V
 
P
F
 
M
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
E
Y
 
H
Q
 
K
G
 
G
K
 
V
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
G
 
A
V
 
V
Y
 
M
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
V
A
 
F
G
 
D
L
 
L
E
 
Q
K
 
D
S
 
P
T
 
T
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
A
Y
 
F
R
 
K
E
 
N
L
 
L
A
 
Q
K
 
N
Y
 
Y
T
 
T
A
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
L
 
L
F
 
E
V
 
V
F
 
F
A
 
S
I
 
L
P
 
D
G
 
G
G
 
K
N
 
N

5xm3A Crystal structure of methanol dehydrogenase from methylophaga aminisulfidivorans (see paper)
49% identity, 95% coverage: 26:602/605 of query aligns to 1:582/596 of 5xm3A

query
sites
5xm3A
D
 
N
S
 
D
Q
 
K
L
 
L
D
 
V
G
 
E
L
 
L
M
 
S
K
 
K
S
 
S
P
 
N
S
 
E
N
 
N
W
 
W
A
 
V
A
 
M
Q
 
Q
A
 
G
G
 
K
D
 
D
Y
 
F
A
 
S
N
 
G
H
 
T
R
 
H
Y
 
Y
S
 
S
P
 
T
L
 
A
K
 
K
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
E
 
K
N
 
D
N
 
N
V
 
V
G
 
K
K
 
K
L
 
L
Q
 
R
V
 
P
A
 
S
W
 
W
T
 
S
M
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
N
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
N
D
 
G
T
 
T
M
 
M
Y
 
Y
I
 
I
H
 
H
S
 
T
P
 
P
F
 
F
P
 
P
N
 
N
K
 
N
V
 
T
I
 
F
A
 
A
I
 
I
N
 
D
L
 
L
K
 
D
D
 
E
Q
 
P
T
 
G
F
 
V
L
 
I
-
 
K
W
 
W
Q
 
E
Y
 
H
Q
 
K
P
 
P
K
 
K
Q
 
Q
D
 
D
D
 
P
S
 
A
V
 
A
V
 
R
S
 
A
V
 
V
M
 
A
C
|
C
C
 
C
D
 
D
T
 
V
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
-
 
W
-
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
D
K
 
K
-
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
M
I
 
I
F
 
V
L
 
K
Q
 
S
Q
 
L
A
 
L
D
 
D
T
 
G
K
 
H
L
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
K
 
E
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
E
V
 
Y
W
 
W
T
 
K
A
 
V
Q
 
E
N
 
N
G
 
G
N
 
D
S
 
I
K
 
S
A
 
V
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
N
 
E
T
|
T
N
 
A
A
 
A
P
 
P
H
 
F
V
 
V
F
 
A
G
 
K
D
 
D
K
 
L
V
 
V
L
 
I
T
 
Q
G
 
G
I
 
S
S
|
S
G
|
G
G
x
A
E
|
E
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
Y
L
 
V
I
 
T
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
K
 
H
T
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
M
A
 
V
W
 
W
T
 
R
A
 
W
Y
 
Y
S
 
A
T
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
K
 
A
D
 
D
M
 
V
L
 
G
M
 
L
D
 
D
P
 
K
D
 
D
K
 
F
T
 
N
M
 
-
T
 
-
Y
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
K
M
 
H
V
 
N
P
 
P
V
 
H
G
 
Y
A
 
G
D
 
Q
S
 
K
S
 
G
L
 
L
-
 
G
-
 
T
K
 
S
S
 
T
W
 
W
K
 
E
G
 
D
D
 
N
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
N
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
A
 
A
W
 
Y
D
 
D
P
 
P
K
 
Q
L
 
L
N
 
D
L
 
M
V
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
G
 
G
N
|
N
P
 
P
G
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
E
T
 
T
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
T
M
 
M
S
 
T
I
 
I
M
 
W
A
 
G
R
 
R
D
 
D
L
 
L
N
 
E
T
 
T
G
 
G
M
 
L
A
 
A
K
 
K
W
 
F
V
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
N
E
 
V
M
 
M
I
 
M
L
 
L
S
 
S
D
 
E
L
 
Q
T
 
K
-
 
D
I
 
K
D
 
N
G
 
G
K
 
K
K
 
M
V
 
R
P
 
K
A
 
L
I
 
L
V
 
T
H
 
H
F
 
P
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
I
G
 
I
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
N
 
D
R
 
R
E
 
E
S
 
T
G
 
G
Q
 
D
L
 
L
L
 
V
V
 
S
A
 
A
Q
 
N
K
 
K
F
 
M
D
 
D
P
 
D
A
 
T
V
 
A
N
 
N
W
 
W
A
 
V
D
 
K
S
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
E
S
 
T
G
 
G
K
 
L
P
 
P
I
 
I
R
 
R
N
 
D
A
 
P
A
 
E
Y
 
Y
S
 
G
T
 
T
Q
 
R
A
 
M
A
 
G
G
 
-
S
 
-
D
 
-
H
 
H
N
 
R
V
 
S
K
 
R
G
 
D
I
 
V
C
 
C
P
 
P
A
 
S
A
 
A
L
 
M
G
 
G
S
 
F
K
 
H
D
x
N
Q
 
Q
Q
 
G
P
 
F
A
 
D
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
N
 
K
S
 
R
S
 
E
L
 
L
F
 
F
L
 
Y
V
 
L
P
 
G
T
 
I
N
 
N
H
 
H
V
 
L
C
 
C
M
 
M
D
 
D
Y
 
W
E
 
E
P
 
P
F
 
F
D
 
M
V
 
L
D
 
P
Y
 
Y
V
 
R
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
N
L
 
V
S
 
W
M
 
T
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
P
 
P
-
 
K
-
 
G
N
 
D
E
 
R
N
 
Q
N
 
N
A
 
G
M
 
I
G
 
G
N
 
S
-
 
G
-
 
Q
F
 
V
I
 
K
A
 
A
W
 
Y
D
 
N
A
 
A
A
 
I
K
 
T
G
 
G
K
 
E
I
 
F
V
 
A
W
 
W
S
 
E
K
 
K
P
 
M
E
 
E
K
 
K
F
 
F
S
 
S
V
 
V
W
|
W
S
 
G
G
 
G
A
 
T
L
 
T
A
 
A
T
 
T
A
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
L
A
 
V
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
F
L
 
I
K
 
K
A
 
A
V
 
R
R
 
D
I
 
A
K
 
D
D
 
T
G
 
G
K
 
K
E
 
L
L
 
L
W
 
W
R
 
K
F
 
F
K
 
K
T
 
L
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
N
 
H
V
 
P
F
 
M
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
T
Y
 
H
Q
 
K
G
 
G
K
 
T
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
G
 
A
V
 
I
Y
 
N
S
 
Y
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
P
G
 
A
I
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
V
A
 
F
G
 
D
L
 
L
E
 
N
K
 
D
S
 
P
T
 
S
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
A
Y
 
F
R
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
Y
 
N
T
 
T
A
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
G
L
 
V
F
 
M
V
 
V
F
 
F
A
 
S
I
 
L
P
 
D
G
 
G

7o6zB Structure of a neodymium-containing, xoxf1-type methanol dehydrogenase (see paper)
48% identity, 94% coverage: 32:600/605 of query aligns to 7:588/588 of 7o6zB

query
sites
7o6zB
L
 
L
M
 
T
K
 
E
S
 
N
P
 
P
S
 
K
N
 
N
W
 
W
A
 
A
A
 
A
Q
 
P
A
 
G
G
 
K
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
H
 
T
R
 
R
Y
 
H
S
 
S
P
 
P
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
E
 
T
N
 
Q
N
 
N
V
 
V
G
 
K
K
 
G
L
 
L
Q
 
H
V
 
M
A
 
A
W
 
W
T
 
S
M
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
D
T
 
R
M
 
M
Y
 
Y
I
 
V
H
 
V
S
 
T
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
N
 
N
K
 
I
V
 
V
I
 
W
A
 
A
I
 
L
N
 
D
L
 
I
-
 
S
-
 
K
-
 
G
K
 
N
D
 
S
Q
 
Y
T
 
E
F
 
V
L
 
L
W
 
W
Q
 
K
Y
 
Y
Q
 
A
P
 
P
K
 
R
Q
 
Q
D
 
D
D
 
D
S
 
K
V
 
A
V
 
V
S
 
S
V
 
T
M
 
A
C
|
C
C
|
C
D
 
D
T
 
T
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
A
A
 
S
Y
 
Y
G
 
A
D
 
D
G
 
G
K
 
K
I
 
I
F
 
V
L
 
F
Q
 
N
Q
 
T
A
 
L
D
 
D
T
 
G
K
 
Y
L
 
V
V
 
V
A
 
C
L
 
L
N
 
D
A
 
A
K
 
N
T
 
T
G
 
G
D
 
K
V
 
E
V
 
L
W
 
W
T
 
K
A
 
T
Q
 
K
N
 
F
G
 
A
N
 
D
S
 
V
K
 
N
A
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
N
 
S
T
|
T
N
 
P
A
 
A
P
 
P
H
 
I
V
 
I
F
 
V
G
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
Y
S
x
G
G
|
G
G
x
D
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
R
L
 
F
I
 
A
A
 
A
Y
 
F
D
 
D
I
 
L
K
 
N
T
 
S
G
 
G
K
 
K
P
 
M
A
 
V
W
 
W
T
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
T
 
N
G
 
G
P
 
P
D
 
D
K
 
S
D
 
D
M
 
V
L
 
L
M
 
L
D
 
G
P
 
P
D
 
D
K
 
F
T
 
N
M
 
S
T
 
K
Y
 
H
A
 
P
D
 
E
G
 
Y
K
 
G
M
 
Q
V
 
-
P
 
-
V
 
A
G
 
G
A
 
Q
D
 
D
S
 
L
S
 
G
L
 
V
K
 
K
S
 
T
W
 
Y
K
 
P
G
 
D
D
 
E
Q
 
E
W
 
W
K
 
K
L
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
C
T
 
A
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
A
 
S
W
 
Y
D
 
D
P
 
P
K
 
K
L
 
L
N
 
D
L
 
L
V
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
N
T
 
T
G
 
G
N
|
N
P
 
P
G
 
G
T
 
L
W
|
W
N
 
S
P
 
P
T
 
S
Q
 
Y
R
 
R
P
 
T
G
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
T
-
 
H
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
N
-
 
E
-
 
P
-
 
W
-
 
K
-
 
W
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
S
M
 
M
S
 
T
I
 
I
M
 
F
A
 
A
R
 
R
D
 
K
L
 
P
N
 
D
T
 
T
G
 
G
M
 
E
A
 
A
K
 
V
W
 
W
V
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
 
F
D
 
D
E
 
Q
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
|
D
G
 
G
V
 
I
N
 
N
E
 
E
M
 
D
I
 
V
L
 
L
S
 
V
D
 
D
L
 
I
T
 
T
I
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
S
K
 
K
V
 
K
P
 
P
A
 
C
I
 
L
V
 
V
H
 
H
F
 
F
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
C
Y
 
Y
T
 
V
L
 
L
N
 
N
R
 
R
E
 
T
S
 
D
G
 
G
Q
 
T
L
 
I
L
 
I
V
 
R
A
 
A
Q
 
N
K
 
K
F
 
F
D
 
-
P
 
V
A
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
A
D
 
E
S
 
K
V
 
I
D
 
D
L
 
M
K
 
K
S
 
T
G
 
G
K
 
R
P
 
P
I
 
V
R
 
K
N
 
V
A
 
K
A
 
E
Y
 
H
S
 
S
T
 
P
Q
 
F
A
 
E
A
 
V
G
 
G
S
 
K
D
 
A
H
 
V
N
 
Q
V
 
A
K
 
-
G
 
-
I
 
-
C
 
Y
P
 
P
A
 
S
A
 
A
L
 
M
G
 
G
S
 
G
K
 
K
D
|
D
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
A
 
V
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
P
 
P
N
 
K
S
 
E
-
 
P
S
 
N
L
 
V
F
 
F
L
 
Y
V
 
A
P
 
P
T
 
T
N
 
N
H
 
N
V
 
W
C
 
G
M
 
M
D
 
T
Y
 
L
E
 
E
P
 
P
F
 
M
D
 
E
V
 
R
D
 
A
Y
 
H
V
 
T
S
 
N
-
 
Q
G
 
G
Q
 
S
P
 
V
Y
 
Y
V
 
V
G
 
F
A
 
A
T
 
N
L
 
V
S
 
L
M
 
M
Y
 
-
P
 
-
G
 
K
P
 
P
N
 
E
E
 
K
N
 
P
N
 
G
A
 
V
M
 
M
G
 
G
N
 
R
F
 
F
I
 
K
A
 
A
W
 
F
D
 
D
A
 
V
A
 
I
K
 
T
G
 
G
K
 
K
I
 
A
V
 
R
W
 
W
S
 
D
K
 
I
P
 
P
E
 
E
K
 
R
F
 
F
S
 
P
V
 
T
W
|
W
S
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
T
A
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
L
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
W
L
 
F
K
 
K
A
 
A
V
 
V
R
 
D
I
 
R
K
 
K
D
 
T
G
 
G
K
 
K
E
 
V
L
 
L
W
 
W
R
 
Q
F
 
Q
K
 
K
T
 
L
P
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
N
 
N
V
 
P
F
 
I
T
 
S
Y
 
Y
Q
 
E
Y
 
V
Q
 
G
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
G
 
S
V
 
V
Y
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
I
G
 
G
I
 
L
G
 
P
M
 
V
A
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
D
K
 
P
S
 
A
T
 
D
E
 
P
-
 
Y
-
 
G
G
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
V
V
 
S
G
 
G
G
 
M
Y
 
A
R
 
A
E
 
E
L
 
N
A
 
G
K
 
F
Y
 
Y
T
 
N
-
 
I
A
 
P
L
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
F
 
Y
V
 
T
F
 
F
A
 
C
I
 
V

7o6zA Structure of a neodymium-containing, xoxf1-type methanol dehydrogenase (see paper)
48% identity, 94% coverage: 32:600/605 of query aligns to 7:588/588 of 7o6zA

query
sites
7o6zA
L
 
L
M
 
T
K
 
E
S
 
N
P
 
P
S
 
K
N
 
N
W
 
W
A
 
A
A
 
A
Q
 
P
A
 
G
G
 
K
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
H
 
T
R
 
R
Y
 
H
S
 
S
P
 
P
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
E
 
T
N
 
Q
N
 
N
V
 
V
G
 
K
K
 
G
L
 
L
Q
 
H
V
 
M
A
 
A
W
 
W
T
 
S
M
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
H
 
H
E
 
E
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
D
T
 
R
M
 
M
Y
 
Y
I
 
V
H
 
V
S
 
T
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
N
 
N
K
 
I
V
 
V
I
 
W
A
 
A
I
 
L
N
 
D
L
 
I
-
 
S
-
 
K
-
 
G
K
 
N
D
 
S
Q
 
Y
T
 
E
F
 
V
L
 
L
W
 
W
Q
 
K
Y
 
Y
Q
 
A
P
 
P
K
 
R
Q
 
Q
D
 
D
D
 
D
S
 
K
V
 
A
V
 
V
S
 
S
V
 
T
M
 
A
C
 
C
C
 
C
D
 
D
T
 
T
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
L
 
A
A
 
S
Y
 
Y
G
 
A
D
 
D
G
 
G
K
 
K
I
 
I
F
 
V
L
 
F
Q
 
N
Q
 
T
A
 
L
D
 
D
T
 
G
K
 
Y
L
 
V
V
 
V
A
 
C
L
 
L
N
 
D
A
 
A
K
 
N
T
 
T
G
 
G
D
 
K
V
 
E
V
 
L
W
 
W
T
 
K
A
 
T
Q
 
K
N
 
F
G
 
A
N
 
D
S
 
V
K
 
N
A
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
N
 
S
T
 
T
N
 
P
A
 
A
P
 
P
H
 
I
V
 
I
F
 
V
G
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
Y
S
 
G
G
 
G
G
 
D
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
R
L
 
F
I
 
A
A
 
A
Y
 
F
D
 
D
I
 
L
K
 
N
T
 
S
G
 
G
K
 
K
P
 
M
A
 
V
W
 
W
T
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
T
 
N
G
 
G
P
 
P
D
 
D
K
 
S
D
 
D
M
 
V
L
 
L
M
 
L
D
 
G
P
 
P
D
 
D
K
 
F
T
 
N
M
 
S
T
 
K
Y
 
H
A
 
P
D
 
E
G
 
Y
K
 
G
M
 
Q
V
 
-
P
 
-
V
 
A
G
 
G
A
 
Q
D
 
D
S
 
L
S
 
G
L
 
V
K
 
K
S
 
T
W
 
Y
K
 
P
G
 
D
D
 
E
Q
 
E
W
 
W
K
 
K
L
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
C
T
 
A
W
 
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
A
 
S
W
 
Y
D
 
D
P
 
P
K
 
K
L
 
L
N
 
D
L
 
L
V
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
N
T
 
T
G
 
G
N
|
N
P
 
P
G
 
G
T
 
L
W
|
W
N
 
S
P
 
P
T
 
S
Q
 
Y
R
 
R
P
 
T
G
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
T
-
 
H
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
N
-
 
E
-
 
P
-
 
W
-
 
K
-
 
W
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
S
M
 
M
S
 
T
I
 
I
M
 
F
A
 
A
R
 
R
D
 
K
L
 
P
N
 
D
T
 
T
G
 
G
M
 
E
A
 
A
K
 
V
W
 
W
V
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
 
F
D
 
D
E
 
Q
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
|
D
G
 
G
V
 
I
N
 
N
E
 
E
M
 
D
I
 
V
L
 
L
S
 
V
D
 
D
L
 
I
T
 
T
I
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
S
K
 
K
V
 
K
P
 
P
A
 
C
I
 
L
V
 
V
H
 
H
F
 
F
D
 
D
R
 
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
C
Y
 
Y
T
 
V
L
 
L
N
 
N
R
 
R
E
 
T
S
 
D
G
 
G
Q
 
T
L
 
I
L
 
I
V
 
R
A
 
A
Q
 
N
K
 
K
F
 
F
D
 
-
P
 
V
A
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
A
D
 
E
S
 
K
V
 
I
D
 
D
L
 
M
K
 
K
S
 
T
G
 
G
K
 
R
P
 
P
I
 
V
R
 
K
N
 
V
A
 
K
A
 
E
Y
 
H
S
 
S
T
 
P
Q
 
F
A
 
E
A
 
V
G
 
G
S
 
K
D
 
A
H
 
V
N
 
Q
V
 
A
K
 
-
G
 
-
I
 
-
C
 
Y
P
 
P
A
 
S
A
 
A
L
 
M
G
 
G
S
 
G
K
 
K
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
A
 
V
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
P
 
P
N
 
K
S
 
E
-
 
P
S
 
N
L
 
V
F
 
F
L
 
Y
V
 
A
P
 
P
T
 
T
N
 
N
H
 
N
V
 
W
C
 
G
M
 
M
D
 
T
Y
 
L
E
 
E
P
 
P
F
 
M
D
 
E
V
 
R
D
 
A
Y
 
H
V
 
T
S
 
N
-
 
Q
G
 
G
Q
 
S
P
 
V
Y
 
Y
V
 
V
G
 
F
A
 
A
T
 
N
L
 
V
S
 
L
M
 
M
Y
 
-
P
 
-
G
 
K
P
 
P
N
 
E
E
 
K
N
 
P
N
 
G
A
 
V
M
 
M
G
 
G
N
 
R
F
 
F
I
 
K
A
 
A
W
 
F
D
 
D
A
 
V
A
 
I
K
 
T
G
 
G
K
 
K
I
 
A
V
 
R
W
 
W
S
 
D
K
 
I
P
 
P
E
 
E
K
 
R
F
 
F
S
 
P
V
 
T
W
 
W
S
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
T
A
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
L
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
W
L
 
F
K
 
K
A
 
A
V
 
V
R
 
D
I
 
R
K
 
K
D
 
T
G
 
G
K
 
K
E
 
V
L
 
L
W
 
W
R
 
Q
F
 
Q
K
 
K
T
 
L
P
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
N
 
N
V
 
P
F
 
I
T
 
S
Y
 
Y
Q
 
E
Y
 
V
Q
 
G
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
G
 
S
V
 
V
Y
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
W
|
W
A
 
I
G
 
G
I
 
L
G
 
P
M
 
V
A
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
D
K
 
P
S
 
A
T
 
D
E
 
P
-
 
Y
-
 
G
G
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
V
V
 
S
G
 
G
G
 
M
Y
 
A
R
 
A
E
 
E
L
 
N
A
 
G
K
 
F
Y
 
Y
T
 
N
-
 
I
A
 
P
L
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
F
 
Y
V
 
T
F
 
F
A
 
C
I
 
V

6zcvA Crystal structure of lanthanide-dependent alcohol dehydrogenase pedh from pseudomonas putida kt2440
38% identity, 87% coverage: 34:559/605 of query aligns to 12:529/562 of 6zcvA

query
sites
6zcvA
K
 
K
S
 
N
P
 
P
S
 
Q
N
 
Q
W
 
I
A
 
V
A
 
T
Q
 
N
A
 
G
G
 
L
D
 
G
Y
 
V
A
 
Q
N
 
G
H
 
Q
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
L
 
L
K
 
D
Q
 
L
I
 
L
N
 
N
E
 
V
N
 
N
N
 
N
V
 
V
G
 
K
K
 
E
L
 
L
Q
 
R
V
 
P
A
 
V
W
 
W
T
 
A
M
 
F
S
 
S
T
 
F
G
 
G
-
 
G
-
 
E
V
 
K
L
 
Q
R
 
R
G
 
G
H
 
Q
E
x
Q
G
 
A
A
 
Q
P
 
P
L
 
L
V
 
I
I
 
K
G
 
D
D
 
G
T
 
V
M
 
M
Y
 
Y
I
 
L
H
 
T
S
 
G
P
 
S
F
 
Y
P
 
-
N
 
S
K
 
R
V
 
V
I
 
F
A
 
A
I
 
V
N
 
D
L
 
A
K
 
R
D
 
T
Q
 
G
T
 
K
F
 
K
L
 
L
W
 
W
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
D
P
 
A
K
 
R
Q
 
L
D
 
P
D
 
D
S
 
D
V
 
I
V
 
R
S
 
P
V
 
-
M
 
-
C
|
C
C
|
C
D
 
D
T
 
V
V
x
I
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
V
A
 
A
Y
 
L
G
 
Y
D
 
G
G
 
N
K
 
L
I
 
V
F
 
F
L
 
F
Q
 
G
Q
 
T
A
 
L
D
 
D
T
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
K
K
 
D
T
 
T
G
 
G
D
 
K
V
 
V
V
 
V
W
 
W
T
 
S
A
 
K
Q
 
K
N
 
V
G
 
A
N
 
D
S
 
H
K
 
K
A
 
E
G
 
G
E
 
Y
T
 
S
N
 
I
T
x
S
N
 
A
A
 
A
P
 
P
H
 
M
V
 
I
F
 
V
G
x
N
D
 
G
K
|
K
V
 
L
L
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
V
S
 
A
G
|
G
G
|
G
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
V
G
 
G
R
 
K
L
 
I
I
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
D
 
N
I
 
P
K
 
E
T
 
N
G
 
G
K
 
E
P
 
L
A
 
L
W
 
W
T
 
M
A
 
R
Y
 
P
S
 
T
T
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
-
M
 
-
L
 
-
M
 
V
D
 
E
P
 
G
D
 
H
K
 
M
T
 
G
M
 
Y
T
 
V
Y
 
Y
A
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
M
 
A
V
 
I
P
 
E
V
 
N
G
 
G
A
 
I
D
 
S
-
 
G
-
 
G
S
 
E
S
 
A
L
 
G
K
 
K
S
 
T
W
 
W
K
 
P
G
 
G
D
 
D
Q
 
L
W
 
W
K
 
K
L
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
A
T
 
A
T
 
P
W
|
W
G
 
L
W
 
G
Y
 
G
A
 
Y
W
 
Y
D
 
D
P
 
P
K
 
E
L
 
T
N
 
N
L
 
L
V
 
I
Y
 
L
Y
 
F
G
 
G
T
 
T
G
 
G
N
|
N
P
 
P
G
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
S
T
 
H
Q
 
L
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
L
W
 
Y
S
 
S
M
 
S
S
 
S
I
 
R
M
 
L
A
 
A
R
 
L
D
 
N
L
x
P
N
x
D
T
 
D
G
 
G
M
 
T
A
 
I
K
 
K
W
 
W
V
 
H
Y
 
F
Q
 
Q
M
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
G
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
D
|
D
G
 
G
V
 
V
N
 
N
E
 
E
M
 
L
I
 
I
L
 
S
S
 
F
D
 
N
L
 
Y
T
 
K
I
 
D
D
 
G
G
 
G
K
 
K
K
 
E
V
 
V
P
 
K
A
 
A
I
 
A
V
 
A
H
 
T
F
 
A
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
F
Y
 
Y
T
 
V
L
 
L
N
 
D
R
 
R
E
 
T
S
 
N
G
 
G
Q
 
K
L
 
F
L
 
I
V
 
R
A
 
G
Q
 
F
K
 
P
F
 
F
D
 
V
P
 
D
A
 
K
V
 
I
N
 
T
W
 
W
A
 
A
D
 
T
S
 
G
V
 
L
D
 
D
L
 
-
K
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
R
P
 
P
I
 
I
R
 
Y
N
 
N
A
 
D
A
 
A
Y
 
S
S
 
R
T
 
P
Q
 
G
A
 
A
A
 
P
G
 
G
S
 
S
D
 
E
H
 
-
N
 
-
V
 
A
K
 
K
G
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
V
-
 
F
I
 
V
C
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
A
K
 
K
D
x
N
Q
 
W
Q
 
M
P
 
P
A
 
M
A
 
A
Y
 
Y
D
 
N
P
 
K
N
 
D
S
 
T
S
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
Y
V
 
V
P
 
P
T
 
S
N
 
N
H
 
E
V
 
W
C
 
G
M
 
M
D
 
D
Y
 
I
E
 
W
P
 
N
F
 
E
D
 
G
V
 
I
D
 
A
Y
 
Y
V
 
K
S
 
K
G
 
G
Q
 
A
P
 
A
Y
 
F
V
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
G
L
 
F
S
 
T
M
 
I
Y
 
K
P
 
P
G
 
-
P
 
L
N
 
N
E
 
E
N
 
-
N
 
D
A
 
Y
M
 
I
G
 
G
N
 
V
F
 
L
I
 
R
A
 
A
W
 
I
D
 
D
A
 
P
A
 
V
K
 
S
G
 
G
K
 
K
I
 
E
V
 
V
W
 
W
S
 
R
K
 
H
P
 
K
E
 
N
K
 
Y
F
 
A
S
 
P
V
 
L
W
|
W
S
 
G
G
 
G
A
 
V
L
 
L
A
 
T
T
 
T
A
 
K
G
 
G
G
 
N
I
 
L
A
 
V
F
 
F
Y
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
P
E
 
E
G
 
G
Y
 
F
L
 
L
K
 
Q
A
 
A
V
 
F
R
 
N
I
 
A
K
 
K
D
 
T
G
 
G
K
 
D
E
 
K
L
 
V
W
 
W
R
 
E
F
 
F
K
 
Q
T
 
T
P
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
L
G
 
G
N
 
S
V
 
P
F
 
V
T
 
T
Y
 
W
Q
 
E
Y
 
M
Q
 
D
G
 
G
K
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
G
 
S
V
 
V
Y
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
W
G
 
G
G
|
G

Sites not aligning to the query:

Q4W6G0 Quinohemoprotein alcohol dehydrogenase ADH-IIG; ADH IIG; Alcohol dehydrogenase (azurin); EC 1.1.9.1 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see 2 papers)
35% identity, 92% coverage: 2:559/605 of query aligns to 8:570/718 of Q4W6G0

query
sites
Q4W6G0
N
x
S
L
|
L
R
x
P
T
x
L
T
x
K
V
x
S
L
|
L
G
x
A
L
x
V
A
|
A
I
x
V
L
|
L
A
x
L
S
|
S
-
x
L
A
|
A
A
x
G
M
x
T
S
x
P
S
x
A
I
x
L
V
x
A
A
|
A
Q
x
D
A
x
I
D
x
P
S
x
A
Q
x
N
L
x
V
D
|
D
G
|
G
L
x
A
M
x
R
-
x
I
-
x
I
-
x
A
-
x
A
-
x
D
K
|
K
S
x
E
P
|
P
S
x
G
N
|
N
W
|
W
A
x
M
A
x
S
Q
x
T
A
x
G
G
x
R
D
x
T
Y
|
Y
A
x
D
N
x
E
H
x
Q
R
|
R
Y
|
Y
S
|
S
P
|
P
L
|
L
K
|
K
Q
|
Q
I
|
I
N
x
S
E
x
D
N
x
Q
N
|
N
V
|
V
G
|
G
K
x
Q
L
|
L
Q
x
G
V
x
L
A
|
A
W
|
W
T
x
S
M
x
Y
S
x
K
T
x
L
G
x
D
V
x
L
L
x
D
R
|
R
G
|
G
H
x
V
E
|
E
G
x
A
A
x
T
P
|
P
L
x
I
V
|
V
I
x
V
G
x
D
D
x
G
T
x
A
M
|
M
Y
|
Y
I
x
T
H
x
T
S
x
G
P
|
P
F
|
F
P
 
-
N
x
S
K
x
V
V
|
V
I
x
Y
A
|
A
I
x
L
N
x
D
L
x
A
K
x
R
D
|
D
Q
x
G
T
x
R
F
x
L
L
x
I
W
|
W
Q
x
K
Y
|
Y
Q
x
D
P
|
P
K
x
Q
Q
x
S
D
|
D
D
x
R
S
x
H
V
x
R
V
x
A
S
x
G
V
x
E
M
x
A
C
|
C
C
|
C
D
|
D
T
x
A
V
|
V
N
|
N
R
|
R
G
|
G
L
x
V
A
|
A
Y
x
V
G
x
W
D
x
K
G
|
G
K
|
K
I
x
V
F
x
Y
L
x
V
Q
x
G
Q
x
V
A
x
L
D
|
D
T
x
G
K
x
R
L
|
L
V
x
E
A
|
A
L
x
I
N
x
D
A
|
A
K
|
K
T
|
T
G
|
G
D
x
Q
V
x
R
V
x
A
W
|
W
T
x
S
A
x
V
Q
x
D
-
x
T
N
x
R
G
x
A
N
x
D
S
x
H
K
|
K
A
x
R
G
x
S
E
x
Y
T
|
T
N
x
I
T
|
T
N
x
G
A
|
A
P
|
P
H
x
R
V
|
V
F
x
V
G
x
N
D
x
G
K
|
K
V
|
V
L
x
V
T
x
I
G
|
G
I
x
N
S
x
G
G
|
G
G
x
A
E
|
E
F
|
F
G
|
G
V
|
V
R
|
R
G
|
G
R
x
Y
L
x
V
I
x
T
A
|
A
Y
|
Y
D
|
D
I
x
A
K
x
E
T
|
T
G
|
G
K
|
K
P
x
E
A
|
A
W
|
W
T
x
R
A
x
F
Y
|
Y
S
x
T
T
x
V
G
x
P
P
x
G
D
|
D
K
x
P
D
x
K
M
x
L
L
x
P
M
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
M
 
-
T
 
-
Y
 
-
A
x
P
D
x
E
G
|
G
K
|
K
M
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
-
G
|
G
A
x
M
D
x
E
S
x
I
S
x
A
L
x
A
K
|
K
S
x
T
W
|
W
K
x
F
G
|
G
D
|
D
Q
x
A
W
x
Y
-
x
V
-
x
E
K
x
Q
L
x
G
G
|
G
G
|
G
G
|
G
T
|
T
T
x
A
W
|
W
G
x
D
W
x
S
Y
x
F
A
|
A
W
x
Y
D
|
D
P
|
P
K
x
E
L
|
L
N
|
N
L
|
L
V
x
L
Y
|
Y
Y
x
I
G
|
G
T
x
V
G
|
G
N
|
N
P
x
G
G
x
S
T
x
L
W
|
W
N
x
D
P
|
P
-
x
K
-
x
W
-
x
R
T
x
S
Q
|
Q
R
x
A
P
x
K
G
|
G
D
|
D
N
|
N
K
x
L
W
x
F
S
x
L
M
x
S
S
|
S
I
|
I
M
x
V
A
|
A
R
x
V
D
x
N
L
x
A
N
x
D
T
|
T
G
|
G
M
x
E
A
x
Y
K
x
V
W
|
W
V
x
H
Y
|
Y
Q
|
Q
M
x
T
T
|
T
P
|
P
H
x
G
D
|
D
E
x
A
W
|
W
D
|
D
Y
|
Y
D
x
T
G
x
A
V
x
T
N
x
Q
E
x
H
M
|
M
I
|
I
L
|
L
S
x
A
D
x
E
L
|
L
T
x
P
I
|
I
D
|
D
G
|
G
K
|
K
K
x
P
V
x
R
P
x
K
A
x
V
I
x
L
V
x
M
H
x
Q
F
x
A
D
x
P
R
x
K
N
|
N
G
|
G
F
|
F
G
x
F
Y
|
Y
T
x
V
L
x
I
N
x
D
R
|
R
E
x
A
S
x
T
G
|
G
Q
x
E
L
|
L
L
|
L
V
x
S
A
|
A
Q
x
K
K
x
G
F
x
I
D
x
V
P
|
P
A
x
Q
V
 
-
N
x
S
W
|
W
A
x
T
D
x
K
S
x
G
V
x
M
D
|
D
L
x
M
K
|
K
S
x
T
G
|
G
K
x
R
P
|
P
I
|
I
R
x
L
N
x
D
A
x
E
A
x
E
Y
x
N
S
x
A
T
x
A
Q
x
Y
A
x
W
A
x
K
G
x
N
S
x
G
D
x
K
H
x
R
N
|
N
V
x
L
K
 
-
G
 
-
I
x
V
C
x
T
P
|
P
A
|
A
A
x
F
L
x
W
G
|
G
S
x
A
K
x
H
D
|
D
Q
x
W
Q
|
Q
P
|
P
A
x
M
A
x
S
Y
|
Y
D
x
N
P
|
P
N
x
D
S
x
T
S
x
G
L
|
L
F
x
V
L
x
Y
V
x
I
P
|
P
T
x
A
N
x
H
H
x
I
V
x
M
C
x
S
M
x
A
D
x
Y
Y
|
Y
E
|
E
-
x
H
-
x
I
-
x
P
-
x
E
-
x
A
-
x
P
-
x
K
-
x
R
-
x
N
P
|
P
F
|
F
D
x
K
V
x
S
D
x
M
Y
|
Y
V
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
P
 
-
Y
x
Q
V
x
L
G
|
G
A
x
L
T
x
R
L
x
T
S
x
G
M
|
M
Y
x
M
P
|
P
G
x
E
P
x
G
N
x
A
E
|
E
-
x
G
-
x
L
-
x
L
-
x
E
-
x
M
-
x
A
N
x
K
N
x
S
A
x
W
M
x
S
G
|
G
N
x
K
F
x
L
I
|
I
A
|
A
W
|
W
D
|
D
A
x
P
A
x
V
K
|
K
G
x
Q
K
x
Q
I
x
A
V
x
A
W
|
W
S
x
E
K
x
V
P
|
P
E
x
Y
K
x
V
F
x
T
S
x
I
V
x
F
W
x
N
S
x
G
G
|
G
A
x
T
L
|
L
A
x
S
T
|
T
A
|
A
G
|
G
G
x
N
I
x
L
A
x
V
F
|
F
Y
x
E
G
|
G
T
x
S
L
x
A
E
x
D
G
|
G
Y
x
R
L
x
V
K
x
I
A
|
A
V
x
Y
R
x
A
I
x
A
K
x
D
D
x
T
G
|
G
K
x
E
E
x
K
L
|
L
W
|
W
R
x
E
F
x
Q
K
x
P
T
x
A
P
x
A
S
|
S
G
|
G
I
x
V
I
x
M
G
x
A
N
x
A
V
x
P
F
x
V
T
|
T
Y
|
Y
Q
x
S
Y
x
V
Q
x
D
G
|
G
K
x
E
Q
|
Q
Y
|
Y
V
|
V
G
x
T
V
x
F
Y
x
M
S
x
A
G
|
G
I
x
W
G
|
G
G
|
G

Sites not aligning to the query:

1yiqA Molecular cloning and structural analysis of quinohemoprotein alcohol dehydrogenase adhiig from pseudomonas putida hk5. Compariison to the other quinohemoprotein alcohol dehydrogenase adhiib found in the same microorganism. (see paper)
36% identity, 87% coverage: 34:559/605 of query aligns to 17:541/684 of 1yiqA

query
sites
1yiqA
K
 
K
S
 
E
P
 
P
S
 
G
N
 
N
W
 
W
A
 
M
A
 
S
Q
 
T
A
 
G
G
 
R
D
 
T
Y
 
Y
A
 
D
N
 
E
H
 
Q
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
I
 
I
N
 
S
E
 
D
N
 
Q
N
 
N
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
Q
 
G
V
 
L
A
 
A
W
 
W
T
 
S
M
 
Y
S
 
K
T
 
L
G
 
D
V
 
L
L
 
D
R
 
R
G
 
G
H
 
V
E
|
E
G
 
A
A
 
T
P
 
P
L
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
D
D
 
G
T
 
V
M
 
M
Y
 
Y
I
 
T
H
 
T
S
 
G
P
 
P
F
 
F
P
 
-
N
 
S
K
 
V
V
 
V
I
 
Y
A
 
A
I
 
L
N
 
D
L
 
A
K
 
R
D
 
D
Q
 
G
T
 
R
F
 
L
L
 
I
W
 
W
Q
 
K
Y
 
Y
Q
 
D
P
 
P
K
 
Q
Q
 
S
D
 
D
D
 
R
S
 
H
V
 
R
V
 
A
S
 
G
V
 
E
M
 
A
C
|
C
C
|
C
D
 
D
T
 
A
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
V
A
 
A
Y
 
V
G
 
W
D
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
V
F
 
Y
L
 
V
Q
 
G
Q
 
V
A
 
L
D
 
D
T
 
G
K
 
R
L
 
L
V
 
E
A
 
A
L
 
I
N
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
D
 
Q
V
 
R
V
 
A
W
 
W
T
 
S
A
 
V
Q
 
D
-
 
T
N
 
R
G
 
A
N
 
D
S
 
H
K
 
K
A
 
R
G
 
S
E
 
Y
T
 
T
N
 
I
T
|
T
N
 
G
A
 
A
P
 
P
H
 
R
V
 
V
F
 
V
G
 
N
D
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
V
T
 
I
G
 
G
I
 
N
S
x
G
G
|
G
G
x
A
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
Y
L
 
V
I
 
T
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
I
 
A
K
 
E
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
E
A
 
A
W
 
W
T
 
R
A
 
F
Y
 
Y
S
 
T
T
 
V
G
 
P
P
 
G
D
 
D
K
 
P
D
 
K
M
 
L
L
 
P
M
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
M
 
-
T
 
-
Y
 
-
A
 
P
D
 
E
G
 
G
K
 
K
M
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
G
A
 
M
D
 
E
S
 
I
S
 
A
L
 
A
K
 
K
S
 
T
W
 
W
K
 
F
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
W
 
Y
-
 
V
-
 
E
K
 
Q
L
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
A
W
|
W
G
 
D
W
 
S
Y
 
F
A
 
A
W
 
Y
D
 
D
P
 
P
K
 
E
L
 
L
N
 
N
L
 
L
V
 
L
Y
 
Y
Y
 
I
G
 
G
T
 
V
G
 
G
N
|
N
P
 
G
G
 
S
T
 
L
W
 
W
N
 
D
P
 
P
-
 
K
-
 
W
-
 
R
T
 
S
Q
 
Q
R
 
A
P
 
K
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
L
W
 
F
S
 
L
M
 
S
S
 
S
I
 
I
M
 
V
A
 
A
R
 
V
D
 
N
L
 
A
N
 
D
T
 
T
G
 
G
M
 
E
A
 
Y
K
 
V
W
 
W
V
 
H
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
T
T
 
T
P
 
P
H
 
G
D
 
D
E
 
A
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
 
T
G
 
A
V
 
T
N
 
Q
E
 
H
M
 
M
I
 
I
L
 
L
S
 
A
D
 
E
L
 
L
T
 
P
I
 
I
D
 
D
G
 
G
K
 
K
K
 
P
V
 
R
P
 
K
A
 
V
I
 
L
V
 
M
H
 
Q
F
 
A
D
 
P
R
x
K
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
F
Y
 
Y
T
 
V
L
 
I
N
 
D
R
 
R
E
 
A
S
 
T
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
V
 
S
A
 
A
Q
 
K
K
 
G
F
 
I
D
 
V
P
 
P
A
 
Q
V
 
-
N
 
S
W
 
W
A
 
T
D
 
K
S
 
G
V
 
M
D
 
D
L
 
M
K
 
K
S
 
T
G
 
G
K
 
R
P
 
P
I
 
I
R
 
L
N
 
D
A
 
E
A
 
E
Y
 
N
S
 
A
T
 
A
Q
 
Y
A
 
W
A
 
K
G
 
N
S
 
G
D
 
K
H
 
R
N
 
N
V
 
L
K
 
-
G
 
-
I
 
V
C
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
F
L
 
W
G
 
G
S
 
A
K
 
H
D
|
D
Q
x
W
Q
 
Q
P
 
P
A
 
M
A
 
S
Y
 
Y
D
 
N
P
 
P
N
 
D
S
 
T
S
 
G
L
 
L
F
 
V
L
 
Y
V
 
I
P
 
P
T
 
A
N
 
H
H
 
I
V
 
M
C
 
S
M
 
A
D
 
Y
Y
 
Y
E
 
E
-
 
H
-
 
I
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
P
-
 
K
-
 
R
-
 
N
P
 
P
F
 
F
D
 
K
V
 
S
D
 
M
Y
 
Y
V
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
P
 
-
Y
 
Q
V
 
L
G
 
G
A
 
L
T
 
R
L
 
T
S
 
G
M
 
M
Y
 
M
P
 
P
G
 
E
P
 
G
N
 
A
E
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
M
-
 
A
N
 
K
N
 
S
A
 
W
M
 
S
G
 
G
N
 
K
F
 
L
I
 
I
A
 
A
W
 
W
D
 
D
A
 
P
A
 
V
K
 
K
G
 
Q
K
 
Q
I
 
A
V
 
A
W
 
W
S
 
E
K
 
V
P
 
P
E
 
Y
K
 
V
F
 
T
S
 
I
V
x
F
W
 
N
S
 
G
G
 
G
A
 
T
L
 
L
A
 
S
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
N
I
 
L
A
 
V
F
 
F
Y
 
E
G
 
G
T
 
S
L
 
A
E
 
D
G
 
G
Y
 
R
L
 
V
K
 
I
A
 
A
V
 
Y
R
 
A
I
 
A
K
 
D
D
 
T
G
 
G
K
 
E
E
 
K
L
 
L
W
 
W
R
 
E
F
 
Q
K
 
P
T
 
A
P
 
A
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
M
G
 
A
N
 
A
V
 
P
F
 
V
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
S
Y
 
V
Q
 
D
G
 
G
K
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
G
 
T
V
 
F
Y
 
M
S
 
A
G
 
G
I
 
W
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q9Z4J7 Quinoprotein ethanol dehydrogenase; QEDH; Quinoprotein alcohol dehydrogenase (cytochrome c); Quinoprotein alcohol dehydrogenase (cytochrome c550); EC 1.1.2.8 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see 4 papers)
37% identity, 91% coverage: 49:601/605 of query aligns to 62:614/623 of Q9Z4J7

query
sites
Q9Z4J7
H
 
Q
R
 
R
Y
 
W
S
 
S
P
 
P
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
I
 
V
N
 
N
E
 
A
N
 
D
N
 
N
V
 
V
G
 
F
K
 
K
L
 
L
Q
 
T
V
 
P
A
 
A
W
 
W
T
 
S
M
 
Y
S
 
S
T
 
F
G
 
G
-
 
D
-
 
E
V
 
K
L
 
Q
R
 
R
G
 
G
H
 
Q
E
|
E
G
 
S
A
 
Q
P
 
A
L
 
I
V
 
V
I
 
S
G
 
D
D
 
G
T
 
V
M
 
I
Y
 
Y
I
 
V
H
 
T
S
 
A
P
 
S
F
 
Y
P
 
-
N
 
S
K
 
R
V
 
L
I
 
F
A
 
A
I
 
L
N
 
D
L
 
A
K
 
K
D
 
T
Q
 
G
T
 
K
F
 
R
L
 
L
W
 
W
Q
 
T
Y
 
Y
Q
 
N
P
 
H
K
 
R
Q
 
L
D
 
P
D
 
D
S
 
D
V
 
I
V
 
R
S
 
P
V
 
-
M
 
-
C
|
C
C
|
C
D
 
D
T
 
V
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
A
A
 
A
-
 
I
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
-
K
 
K
I
 
V
F
 
F
L
 
F
Q
 
G
Q
 
T
A
 
L
D
 
D
T
 
A
K
 
S
L
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
K
K
 
N
T
 
T
G
 
G
D
 
K
V
 
V
V
 
V
W
 
W
T
 
K
A
 
K
Q
 
K
N
 
F
G
 
A
N
 
D
S
 
H
K
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
Y
T
 
T
N
 
M
T
|
T
N
 
G
A
 
A
P
 
P
H
 
T
V
 
I
F
 
V
G
 
K
D
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
T
 
L
-
 
I
-
x
H
G
|
G
I
x
S
S
 
S
G
 
G
G
 
D
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
L
I
 
F
A
 
A
Y
 
R
D
 
D
I
 
P
K
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
E
A
 
I
W
 
W
T
 
M
A
 
R
Y
 
P
S
 
F
T
 
V
G
 
E
P
 
G
D
 
H
K
 
M
D
 
G
M
 
R
L
 
L
M
 
N
D
 
G
P
 
K
D
 
D
K
 
S
T
 
T
M
 
V
T
 
T
Y
 
-
A
 
G
D
 
D
G
 
V
K
 
K
M
 
A
V
 
P
P
 
S
V
 
W
G
 
P
A
 
D
D
 
D
S
 
R
S
 
N
L
 
S
K
 
P
S
 
T
W
 
G
K
 
K
G
 
V
D
 
E
Q
 
S
W
 
W
K
 
S
L
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
P
W
 
W
G
 
Q
W
 
S
Y
 
A
A
 
S
W
 
F
D
 
D
P
 
A
K
 
E
L
 
T
N
 
N
L
 
T
V
 
I
Y
 
I
Y
 
V
G
 
G
T
 
A
G
 
G
N
|
N
P
 
P
G
 
G
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
T
T
 
W
Q
 
A
R
 
R
P
 
T
G
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
H
-
 
D
-
 
Y
D
 
D
N
 
S
K
 
L
W
 
Y
S
 
T
M
 
S
S
 
G
I
 
Q
M
 
V
A
 
G
R
 
V
D
 
D
L
 
P
N
 
S
T
 
S
G
 
G
M
 
E
A
 
V
K
 
K
W
 
W
V
 
F
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
H
T
 
T
P
 
P
H
 
N
D
 
D
E
 
A
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
D
 
S
G
 
G
V
 
N
N
 
N
E
 
E
M
 
L
I
 
V
L
 
L
S
 
F
D
 
D
L
 
Y
T
 
K
I
 
A
-
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
K
 
I
V
 
V
P
 
K
A
 
A
I
 
T
V
 
A
H
 
H
F
 
A
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
F
Y
 
Y
T
 
V
L
 
V
N
 
D
R
 
R
E
 
S
S
 
N
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
L
 
Q
V
 
N
A
 
A
Q
 
F
K
 
P
F
 
F
D
 
V
P
 
D
A
 
N
V
 
I
N
 
T
W
 
W
A
 
A
D
 
S
S
 
H
V
 
I
D
 
D
L
 
L
K
 
K
S
 
T
G
 
G
K
 
R
P
 
P
I
 
V
R
 
E
N
 
R
A
 
E
A
 
G
Y
 
Q
S
 
R
-
 
P
-
 
P
T
 
L
Q
 
P
A
 
E
A
 
P
G
 
G
S
 
Q
D
 
K
H
 
H
-
 
G
N
 
K
V
 
A
K
 
V
G
 
E
I
 
V
C
 
S
P
 
P
A
 
P
A
 
F
L
 
L
G
 
G
S
 
G
K
 
K
D
 
N
Q
 
W
Q
 
N
P
 
P
A
 
M
A
 
A
Y
 
Y
D
 
S
P
 
Q
N
 
D
S
 
T
S
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
Y
V
 
V
P
 
P
T
 
A
N
 
N
H
 
H
V
 
W
C
 
K
M
 
E
D
 
D
Y
 
Y
E
 
W
P
 
T
F
 
E
D
 
E
V
 
V
D
 
S
Y
 
Y
V
 
T
S
 
K
G
 
G
Q
 
S
P
 
A
Y
 
Y
V
 
L
G
 
G
A
 
M
T
 
G
L
 
F
S
 
R
-
 
I
-
 
K
-
 
R
M
 
M
Y
 
Y
P
 
-
G
 
-
P
 
-
N
 
-
E
 
-
N
 
D
N
 
D
A
 
H
M
 
V
G
 
G
N
 
S
F
 
L
I
 
R
A
 
A
W
 
M
D
 
D
A
 
P
A
 
V
K
 
S
G
 
G
K
 
K
I
 
V
V
 
V
W
 
W
S
 
E
K
 
H
P
 
K
E
 
E
K
 
H
F
 
L
S
 
P
V
 
L
W
|
W
S
 
A
G
 
G
A
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
N
I
 
L
A
 
V
F
 
F
Y
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
G
E
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
F
K
 
K
A
 
A
V
 
F
R
 
D
I
 
A
K
 
K
D
 
S
G
 
G
K
 
K
E
 
E
L
 
L
W
 
W
R
 
K
F
 
F
K
 
Q
T
 
T
P
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
I
I
 
V
G
 
S
N
 
P
V
 
P
F
 
I
T
 
T
Y
 
W
Q
 
E
Y
 
Q
Q
 
D
G
 
G
K
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
L
G
 
G
V
 
V
Y
 
T
S
 
V
G
 
G
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
-
x
A
-
 
V
-
 
P
-
 
L
W
 
W
A
 
G
G
 
G
I
 
-
G
 
D
M
 
M
A
 
A
A
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
-
T
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
D
L
 
L
A
 
T
K
 
R
Y
 
P
T
 
V
A
 
A
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
T
 
S
L
 
F
F
 
W
V
 
V
F
 
F
A
 
K
I
 
L
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1flgA Crystal structure of the quinoprotein ethanol dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa (see paper)
37% identity, 91% coverage: 49:601/605 of query aligns to 28:580/582 of 1flgA

query
sites
1flgA
H
 
Q
R
 
R
Y
 
W
S
 
S
P
 
P
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
I
 
V
N
 
N
E
 
A
N
 
D
N
 
N
V
 
V
G
 
F
K
 
K
L
 
L
Q
 
T
V
 
P
A
 
A
W
 
W
T
 
S
M
 
Y
S
 
S
T
 
F
G
 
G
-
 
D
-
 
E
V
 
K
L
 
Q
R
 
R
G
 
G
H
 
Q
E
|
E
G
 
S
A
 
Q
P
 
A
L
 
I
V
 
V
I
 
S
G
 
D
D
 
G
T
 
V
M
 
I
Y
 
Y
I
 
V
H
 
T
S
 
A
P
 
S
F
 
Y
P
 
-
N
 
S
K
 
R
V
 
L
I
 
F
A
 
A
I
 
L
N
 
D
L
 
A
K
 
K
D
 
T
Q
 
G
T
 
K
F
 
R
L
 
L
W
 
W
Q
 
T
Y
 
Y
Q
 
N
P
 
H
K
 
R
Q
 
L
D
 
P
D
 
D
S
 
D
V
 
I
V
 
R
S
 
P
V
 
-
M
 
-
C
|
C
C
|
C
D
 
D
T
 
V
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
A
A
 
A
-
 
I
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
-
K
 
K
I
 
V
F
 
F
L
 
F
Q
 
G
Q
 
T
A
 
L
D
 
D
T
 
A
K
 
S
L
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
K
K
 
N
T
 
T
G
 
G
D
 
K
V
 
V
V
 
V
W
 
W
T
 
K
A
 
K
Q
 
K
N
 
F
G
 
A
N
 
D
S
 
H
K
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
Y
T
 
T
N
 
M
T
|
T
N
 
G
A
 
A
P
 
P
H
 
T
V
 
I
F
 
V
G
 
K
D
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
T
 
L
-
 
I
-
 
H
G
 
G
I
 
S
S
|
S
G
|
G
G
x
D
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
L
I
 
F
A
 
A
Y
 
R
D
 
D
I
 
P
K
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
E
A
 
I
W
 
W
T
 
M
A
 
R
Y
 
P
S
 
F
T
 
V
G
 
E
P
 
G
D
 
H
K
 
M
D
 
G
M
 
R
L
 
L
M
 
N
D
 
G
P
 
K
D
 
D
K
 
S
T
 
T
M
 
V
T
 
T
Y
 
-
A
 
G
D
 
D
G
 
V
K
 
K
M
 
A
V
 
P
P
 
S
V
 
W
G
 
P
A
 
D
D
 
D
S
 
R
S
 
N
L
 
S
K
 
P
S
 
T
W
 
G
K
 
K
G
 
V
D
 
E
Q
 
S
W
 
W
K
 
S
L
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
P
W
|
W
G
 
Q
W
 
S
Y
 
A
A
 
S
W
 
F
D
 
D
P
 
A
K
 
E
L
 
T
N
 
N
L
 
T
V
 
I
Y
 
I
Y
 
V
G
 
G
T
 
A
G
 
G
N
|
N
P
 
P
G
 
G
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
T
T
 
W
Q
 
A
R
 
R
P
 
T
G
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
H
-
 
D
-
 
Y
D
 
D
N
 
S
K
 
L
W
 
Y
S
 
T
M
 
S
S
 
G
I
 
Q
M
 
V
A
 
G
R
 
V
D
 
D
L
 
P
N
 
S
T
 
S
G
 
G
M
 
E
A
 
V
K
 
K
W
 
W
V
 
F
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
H
T
 
T
P
 
P
H
 
N
D
 
D
E
 
A
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
D
 
S
G
 
G
V
 
N
N
 
N
E
 
E
M
 
L
I
 
V
L
 
L
S
 
F
D
 
D
L
 
Y
T
 
K
I
 
A
-
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
K
 
I
V
 
V
P
 
K
A
 
A
I
 
T
V
 
A
H
 
H
F
 
A
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
F
Y
 
Y
T
 
V
L
 
V
N
 
D
R
 
R
E
 
S
S
 
N
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
L
 
Q
V
 
N
A
 
A
Q
 
F
K
 
P
F
 
F
D
 
V
P
 
D
A
 
N
V
 
I
N
 
T
W
 
W
A
 
A
D
 
S
S
 
H
V
 
I
D
 
D
L
 
L
K
 
K
S
 
T
G
 
G
K
 
R
P
 
P
I
 
V
R
 
E
N
 
R
A
 
E
A
 
G
Y
 
Q
S
 
R
-
 
P
-
 
P
T
 
L
Q
 
P
A
 
E
A
 
P
G
 
G
S
 
Q
D
 
K
H
 
H
-
 
G
N
 
K
V
 
A
K
 
V
G
 
E
I
 
V
C
 
S
P
 
P
A
 
P
A
 
F
L
 
L
G
 
G
S
 
G
K
 
K
D
x
N
Q
x
W
Q
 
N
P
 
P
A
 
M
A
 
A
Y
 
Y
D
 
S
P
 
Q
N
 
D
S
 
T
S
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
Y
V
 
V
P
 
P
T
 
A
N
 
N
H
 
H
V
 
W
C
 
K
M
 
E
D
 
D
Y
 
Y
E
 
W
P
 
T
F
 
E
D
 
E
V
 
V
D
 
S
Y
 
Y
V
 
T
S
 
K
G
 
G
Q
 
S
P
 
A
Y
 
Y
V
 
L
G
 
G
A
 
M
T
 
G
L
 
F
S
 
R
-
 
I
-
 
K
-
 
R
M
 
M
Y
 
Y
P
 
-
G
 
-
P
 
-
N
 
-
E
 
-
N
 
D
N
 
D
A
 
H
M
 
V
G
 
G
N
 
S
F
 
L
I
 
R
A
 
A
W
 
M
D
 
D
A
 
P
A
 
V
K
 
S
G
 
G
K
 
K
I
 
V
V
 
V
W
 
W
S
 
E
K
 
H
P
 
K
E
 
E
K
 
H
F
 
L
S
 
P
V
 
L
W
|
W
S
 
A
G
 
G
A
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
N
I
 
L
A
 
V
F
 
F
Y
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
G
E
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
F
K
 
K
A
 
A
V
 
F
R
 
D
I
 
A
K
 
K
D
 
S
G
 
G
K
 
K
E
 
E
L
 
L
W
 
W
R
 
K
F
 
F
K
 
Q
T
 
T
P
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
I
I
 
V
G
 
S
N
 
P
V
 
P
F
 
I
T
 
T
Y
 
W
Q
 
E
Y
 
Q
Q
 
D
G
 
G
K
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
L
G
 
G
V
 
V
Y
 
T
S
 
V
G
 
G
I
 
Y
G
 
G
G
|
G
-
x
A
-
 
V
-
 
P
-
 
L
W
 
W
A
 
G
G
 
G
I
 
-
G
 
D
M
 
M
A
 
A
A
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
-
T
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
D
L
 
L
A
 
T
K
 
R
Y
 
P
T
 
V
A
 
A
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
T
 
S
L
 
F
F
 
W
V
 
V
F
 
F
A
 
K
I
 
L
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>H281DRAFT_01296 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_01296
MNLRTTVLGLAILASAAMSSIVAQADSQLDGLMKSPSNWAAQAGDYANHRYSPLKQINEN
NVGKLQVAWTMSTGVLRGHEGAPLVIGDTMYIHSPFPNKVIAINLKDQTFLWQYQPKQDD
SVVSVMCCDTVNRGLAYGDGKIFLQQADTKLVALNAKTGDVVWTAQNGNSKAGETNTNAP
HVFGDKVLTGISGGEFGVRGRLIAYDIKTGKPAWTAYSTGPDKDMLMDPDKTMTYADGKM
VPVGADSSLKSWKGDQWKLGGGTTWGWYAWDPKLNLVYYGTGNPGTWNPTQRPGDNKWSM
SIMARDLNTGMAKWVYQMTPHDEWDYDGVNEMILSDLTIDGKKVPAIVHFDRNGFGYTLN
RESGQLLVAQKFDPAVNWADSVDLKSGKPIRNAAYSTQAAGSDHNVKGICPAALGSKDQQ
PAAYDPNSSLFLVPTNHVCMDYEPFDVDYVSGQPYVGATLSMYPGPNENNAMGNFIAWDA
AKGKIVWSKPEKFSVWSGALATAGGIAFYGTLEGYLKAVRIKDGKELWRFKTPSGIIGNV
FTYQYQGKQYVGVYSGIGGWAGIGMAAGLEKSTEGLGAVGGYRELAKYTALGGTLFVFAI
PGGNS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory