SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_01454 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_01454 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 18 hits to proteins with known functional sites (download)

5dvjA Crystal structure of galactose complexed periplasmic glucose binding protein (ppgbp) from p. Putida csv86 (see paper)
40% identity, 91% coverage: 26:398/412 of query aligns to 2:379/396 of 5dvjA

query
sites
5dvjA
P
 
P
L
 
G
K
 
T
A
 
V
N
 
D
V
 
V
I
 
L
H
 
H
W
|
W
W
|
W
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
|
E
S
 
A
A
 
K
A
 
A
I
 
V
R
 
E
Q
 
T
F
 
L
A
 
K
D
 
Q
A
 
Q
Y
 
I
N
 
Q
K
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
F
Q
 
I
W
 
W
I
 
K
D
 
D
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
x
G
D
x
G
Q
 
G
A
 
A
R
 
A
S
 
A
T
 
M
A
 
T
I
 
V
-
 
L
-
 
K
N
 
T
R
 
R
I
 
A
V
 
I
G
 
S
G
 
G
D
 
N
P
 
P
P
 
P
T
 
S
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
F
 
I
N
x
K
T
 
-
S
 
G
K
 
P
Q
 
D
F
 
I
H
 
Q
D
 
E
L
 
W
I
 
G
D
 
A
Q
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
N
 
T
N
 
E
V
 
L
D
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
A
E
 
N
N
 
K
W
 
W
S
 
D
G
 
D
V
 
L
F
 
L
P
 
P
Q
 
R
S
 
Q
I
 
V
L
 
A
D
 
D
S
 
I
I
 
M
K
 
K
V
 
Y
K
 
D
G
 
G
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
V
A
 
A
A
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
N
I
 
I
H
 
H
M
 
R
P
 
V
A
 
N
W
 
W
F
 
L
F
 
W
Y
 
I
S
 
N
K
 
P
P
 
Q
A
 
V
F
 
F
Q
 
D
K
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
A
T
 
K
A
 
V
E
 
-
P
 
P
Q
 
T
S
 
T
Y
 
L
D
 
D
E
 
E
F
 
L
I
 
F
A
 
A
D
 
A
L
 
A
G
 
D
K
 
K
L
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
F
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
H
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
W
 
W
Q
 
Q
E
 
D
K
 
S
I
 
T
T
 
V
F
 
F
D
 
E
A
 
D
V
 
L
L
 
V
A
 
L
D
 
S
V
 
I
G
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
L
 
G
Y
 
Y
L
 
H
K
 
A
V
 
A
Y
 
F
R
 
V
D
 
D
H
 
L
D
 
D
A
 
E
N
 
K
A
 
T
V
 
L
K
 
T
S
 
G
D
 
P
A
 
Q
F
 
M
K
 
T
K
 
E
V
 
A
L
 
F
I
 
A
A
 
T
F
 
L
K
 
K
R
 
R
L
 
L
H
 
G
D
 
T
F
 
Y
V
 
M
D
 
D
A
 
P
G
 
N
S
 
R
P
 
A
G
 
G
R
 
R
N
 
D
W
|
W
N
 
N
D
 
I
A
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
E
V
 
V
I
 
I
S
 
N
G
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
M
Q
 
Q
I
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
K
 
K
G
 
S
E
 
E
F
 
W
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
 
G
Q
 
K
S
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
K
E
 
D
F
 
Y
G
 
Q
C
 
C
-
 
V
-
 
A
F
 
F
P
 
P
G
 
G
F
 
T
G
 
Q
P
 
G
H
 
S
S
 
F
P
 
A
Y
 
Y
L
 
N
V
 
I
A
 
-
G
 
-
D
|
D
V
 
S
F
 
L
V
 
A
F
 
M
P
 
F
K
 
K
S
 
L
D
 
K
N
 
D
A
 
A
S
 
N
T
 
D
V
 
I
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
D
L
 
L
A
 
A
T
 
K
V
 
V
M
 
A
T
 
L
S
 
E
P
 
P
P
 
E
A
 
F
Q
 
Q
V
 
T
A
 
V
F
 
F
S
 
N
A
 
Q
K
 
N
K
|
K
G
 
G
S
 
S
I
 
L
P
 
P
I
 
V
R
 
R
P
 
Q
D
 
D
V
 
M
D
 
D
A
 
M
G
 
S
S
 
K
L
 
F
D
 
D
I
 
A
C
 
C
A
 
T
K
 
Q
E
 
K
G
 
S
I
 
A
A
 
A
I
 
D
M
 
F
K
 
K
D
 
E
K
 
A
S
 
A
R
 
K
-
 
G
Q
 
D
L
 
G
P
 
L
N
 
Q
P
 
P
E
 
S
M
 
M
L
 
A
L
x
H
S
 
N
P
 
M
D
 
A
T
 
T
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
I
I
 
F
D
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
N
F
 
F
W
 
L
N
 
N
K
 
D
N
 
P
Q
 
Q
S
 
A

5dviA High resolution crystal structure of glucose complexed periplasmic glucose binding protein (ppgbp) from p. Putida csv86 (see paper)
40% identity, 91% coverage: 26:398/412 of query aligns to 2:379/396 of 5dviA

query
sites
5dviA
P
 
P
L
 
G
K
 
T
A
 
V
N
 
D
V
 
V
I
 
L
H
 
H
W
|
W
W
|
W
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
|
E
S
 
A
A
 
K
A
 
A
I
 
V
R
 
E
Q
 
T
F
 
L
A
 
K
D
 
Q
A
 
Q
Y
 
I
N
 
Q
K
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
F
Q
 
I
W
 
W
I
 
K
D
 
D
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
G
D
x
G
Q
 
G
A
 
A
R
 
A
S
 
A
T
 
M
A
 
T
I
 
V
-
 
L
-
 
K
N
 
T
R
 
R
I
 
A
V
 
I
G
 
S
G
 
G
D
 
N
P
 
P
P
 
P
T
 
S
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
F
 
I
N
x
K
T
 
-
S
 
G
K
 
P
Q
 
D
F
 
I
H
 
Q
D
 
E
L
 
W
I
 
G
D
 
A
Q
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
N
 
T
N
 
E
V
 
L
D
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
A
E
 
N
N
 
K
W
 
W
S
 
D
G
 
D
V
 
L
F
 
L
P
 
P
Q
 
R
S
 
Q
I
 
V
L
 
A
D
 
D
S
 
I
I
 
M
K
 
K
V
 
Y
K
 
D
G
 
G
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
V
A
 
A
A
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
N
I
 
I
H
 
H
M
 
R
P
 
V
A
 
N
W
 
W
F
 
L
F
 
W
Y
 
I
S
 
N
K
 
P
P
 
Q
A
 
V
F
 
F
Q
 
D
K
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
A
T
 
K
A
 
V
E
 
-
P
 
P
Q
 
T
S
 
T
Y
 
L
D
 
D
E
 
E
F
 
L
I
 
F
A
 
A
D
 
A
L
 
A
G
 
D
K
 
K
L
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
F
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
H
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
W
 
W
Q
 
Q
E
 
D
K
 
S
I
 
T
T
 
V
F
 
F
D
 
E
A
 
D
V
 
L
L
 
V
A
 
L
D
 
S
V
 
I
G
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
L
 
G
Y
 
Y
L
 
H
K
 
A
V
 
A
Y
 
F
R
 
V
D
 
D
H
 
L
D
 
D
A
 
E
N
 
K
A
 
T
V
 
L
K
 
T
S
 
G
D
 
P
A
 
Q
F
 
M
K
 
T
K
 
E
V
 
A
L
 
F
I
 
A
A
 
T
F
 
L
K
 
K
R
 
R
L
 
L
H
 
G
D
 
T
F
 
Y
V
 
M
D
 
D
A
 
P
G
 
N
S
 
R
P
 
A
G
 
G
R
 
R
N
 
D
W
 
W
N
 
N
D
 
I
A
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
E
V
 
V
I
 
I
S
 
N
G
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
M
Q
 
Q
I
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
K
 
K
G
 
S
E
 
E
F
 
W
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
 
G
Q
 
K
S
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
K
E
 
D
F
 
Y
G
 
Q
C
 
C
-
 
V
-
 
A
F
 
F
P
 
P
G
 
G
F
 
T
G
 
Q
P
 
G
H
 
S
S
 
F
P
 
A
Y
 
Y
L
x
N
V
 
I
A
 
-
G
 
-
D
|
D
V
 
S
F
 
L
V
 
A
F
 
M
P
 
F
K
 
K
S
 
L
D
 
K
N
 
D
A
 
A
S
 
N
T
 
D
V
 
I
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
D
L
 
L
A
 
A
T
 
K
V
 
V
M
 
A
T
 
L
S
 
E
P
 
P
P
 
E
A
 
F
Q
 
Q
V
 
T
A
 
V
F
 
F
S
 
N
A
 
Q
K
 
N
K
|
K
G
 
G
S
 
S
I
 
L
P
 
P
I
 
V
R
 
R
P
 
Q
D
 
D
V
 
M
D
 
D
A
 
M
G
 
S
S
 
K
L
 
F
D
 
D
I
 
A
C
 
C
A
 
T
K
 
Q
E
 
K
G
 
S
I
 
A
A
 
A
I
 
D
M
 
F
K
 
K
D
 
E
K
 
A
S
 
A
R
 
K
-
 
G
Q
 
D
L
 
G
P
 
L
N
 
Q
P
 
P
E
 
S
M
 
M
L
 
A
L
x
H
S
 
N
P
 
M
D
 
A
T
 
T
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
I
I
 
F
D
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
N
F
 
F
W
 
L
N
 
N
K
 
D
N
 
P
Q
 
Q
S
 
A

8hqqA Crystal structure of the glucose-binding protein sar11_0769 from "candidatus pelagibacter ubique" htcc1062 bound to glucose
40% identity, 91% coverage: 28:401/412 of query aligns to 4:385/398 of 8hqqA

query
sites
8hqqA
K
 
K
A
 
A
N
 
E
V
 
V
I
 
L
H
 
H
W
|
W
W
 
W
T
 
T
S
 
G
G
 
G
G
 
G
E
|
E
S
 
A
A
 
K
A
 
A
I
 
L
R
 
K
Q
 
V
F
 
L
A
 
Q
D
 
D
A
 
E
Y
 
F
N
 
A
K
 
A
A
 
Q
G
 
N
G
 
G
Q
 
V
W
 
W
I
 
L
D
 
D
N
 
M
A
 
P
V
 
V
A
 
S
G
 
G
A
 
G
-
x
G
-
 
G
D
 
D
Q
 
A
A
 
A
R
 
M
S
 
Q
T
 
T
A
 
L
I
 
K
N
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
V
G
 
A
G
 
N
D
 
D
P
 
A
P
 
P
T
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
F
 
I
N
x
K
T
 
-
S
 
G
K
 
P
Q
 
T
F
 
I
H
 
Q
D
 
E
L
 
Y
I
 
D
D
 
E
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
V
-
 
A
-
 
P
N
 
Y
N
 
N
V
 
I
D
 
D
D
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
K
K
 
K
E
 
E
N
 
G
W
 
W
S
 
D
G
 
N
V
 
L
F
 
L
P
 
S
Q
 
K
S
 
Q
I
 
V
L
 
A
D
 
S
S
 
H
I
 
M
K
 
K
V
 
C
K
 
D
G
 
D
H
 
G
-
 
K
-
 
A
Y
 
Y
Y
 
C
A
 
A
A
 
A
P
 
P
V
 
V
D
 
N
I
 
I
H
|
H
M
 
R
P
 
I
A
 
D
W
 
W
F
 
I
F
 
W
Y
 
A
S
 
N
K
 
K
P
 
K
A
 
V
F
 
L
Q
 
D
K
 
S
A
 
N
G
 
G
I
 
I
T
 
K
A
 
M
E
 
-
P
 
P
Q
 
S
S
 
T
Y
 
W
D
 
A
E
 
E
F
 
F
I
 
N
A
 
A
D
 
A
L
 
A
G
 
D
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
A
 
N
G
 
G
V
 
I
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
H
G
 
G
G
 
S
Q
 
Q
P
 
P
W
 
W
Q
 
Q
E
 
D
K
 
A
I
 
T
T
 
V
F
 
F
D
 
E
A
 
A
V
 
V
L
 
A
A
 
L
D
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
G
P
 
N
D
 
D
L
 
F
Y
 
Y
L
 
R
K
 
K
V
 
A
Y
 
F
R
 
V
D
 
D
H
 
L
D
 
D
A
 
A
N
 
A
A
 
T
V
 
L
K
 
G
S
 
G
D
 
S
A
 
T
F
 
M
K
 
T
K
 
K
V
 
V
L
 
F
I
 
D
A
 
Q
F
 
M
K
 
R
R
 
K
L
 
L
H
 
K
D
 
G
F
 
Y
V
 
T
D
 
D
A
 
A
G
 
G
S
 
S
P
 
P
G
 
G
R
 
R
N
 
D
W
 
W
N
 
N
D
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
G
L
 
M
V
 
V
I
 
M
S
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
A
V
 
F
Q
 
Q
I
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
F
 
F
S
 
A
A
 
A
A
 
N
K
 
N
Q
 
M
S
 
A
A
 
P
G
 
G
K
 
K
E
 
D
F
 
Y
G
 
I
C
 
C
F
 
A
P
 
P
G
 
-
F
 
T
G
 
P
P
 
S
H
 
N
S
 
N
P
 
G
Y
 
Y
L
 
L
V
 
Y
A
 
N
G
 
V
D
|
D
V
 
S
F
 
F
V
 
I
F
 
F
P
 
Y
K
 
K
S
 
V
D
 
K
N
 
G
A
 
K
S
 
D
T
 
K
V
 
V
K
 
E
A
 
G
Q
 
Q
N
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
S
V
 
L
M
 
M
T
 
M
S
 
G
P
 
K
P
 
N
A
 
F
Q
 
Q
V
 
K
A
 
V
F
 
F
S
 
N
A
 
I
K
 
Y
K
|
K
G
 
G
S
 
S
I
 
I
P
 
P
I
 
A
R
 
R
P
 
L
D
 
D
V
 
V
D
 
S
A
 
M
G
 
D
S
 
E
L
 
F
D
 
D
I
 
M
C
 
C
A
 
A
K
 
K
E
 
K
G
 
S
I
 
N
A
 
A
I
 
D
M
 
L
K
 
K
-
 
T
-
 
A
-
 
G
D
 
S
K
 
K
S
 
G
R
 
G
Q
 
L
L
 
L
P
 
P
N
 
S
-
 
F
-
 
A
P
x
H
E
 
G
M
 
M
L
 
A
L
 
L
S
 
R
P
 
L
D
 
A
T
 
Q
Q
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
I
I
 
Q
D
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
E
F
 
H
W
 
F
N
 
N
K
 
S
N
 
N
Q
 
M
S
 
S
V
 
S
D
 
S
D
 
D

4r2bA Crystal structure of sugar transporter oant_3817 from ochrobactrum anthropi, target efi-510528, with bound glucose
38% identity, 93% coverage: 30:411/412 of query aligns to 8:392/395 of 4r2bA

query
sites
4r2bA
N
 
E
V
 
V
I
 
L
H
 
H
W
|
W
W
 
W
T
 
T
S
 
A
G
 
G
G
 
G
E
|
E
S
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
L
R
 
D
Q
 
V
F
 
L
A
 
K
D
 
K
A
 
D
Y
 
L
N
 
E
K
 
K
A
 
K
G
 
G
G
 
I
Q
 
S
W
 
W
I
 
T
D
 
D
N
 
M
A
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
x
G
-
x
G
-
 
G
D
 
T
Q
 
E
A
 
A
R
 
M
S
 
T
T
 
V
A
 
L
I
 
R
N
 
A
R
 
R
I
 
V
V
 
T
G
 
A
G
 
G
D
 
N
P
 
A
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
V
Q
 
Q
F
 
M
N
 
-
T
 
L
S
 
G
K
 
F
Q
 
D
F
 
I
H
 
R
D
 
D
L
 
W
I
 
A
D
 
E
Q
 
Q
G
 
G
L
 
A
L
 
L
N
 
G
N
 
N
V
 
L
D
 
D
D
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
N
K
 
K
E
 
E
N
 
G
W
 
W
S
 
E
G
 
K
V
 
V
F
 
I
P
 
P
Q
 
A
S
 
P
I
 
L
L
 
Q
D
 
E
S
 
F
I
 
A
K
 
K
V
 
Y
K
 
D
G
 
G
H
 
H
Y
 
W
Y
 
I
A
 
A
A
 
A
P
 
P
V
 
V
D
 
N
I
 
V
H
|
H
M
 
S
P
 
T
A
 
N
W
 
W
F
 
M
F
 
W
Y
 
I
S
 
N
K
 
K
P
 
A
A
 
A
F
 
L
Q
 
D
K
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
-
T
 
G
A
 
K
E
 
E
P
 
P
Q
 
T
S
 
N
Y
 
W
D
 
D
E
 
E
F
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
L
L
 
L
G
 
D
K
 
K
L
 
F
R
 
K
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
V
 
I
I
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
A
F
 
H
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
W
 
W
Q
 
Q
E
 
D
K
 
A
I
 
T
T
 
I
F
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
V
A
 
L
D
 
S
V
 
F
G
 
G
G
 
-
P
 
T
D
 
D
L
 
F
Y
 
Y
L
 
K
K
 
K
V
 
A
Y
 
F
R
 
I
D
 
D
H
 
L
D
 
D
A
 
P
N
 
E
A
 
T
V
 
L
K
 
G
S
 
S
D
 
D
A
 
T
F
 
M
K
 
K
K
 
Q
V
 
A
L
 
F
I
 
D
A
 
R
F
 
M
K
 
T
R
 
K
L
 
L
H
 
R
D
 
S
F
 
Y
V
 
V
D
 
D
A
 
D
G
 
N
S
 
F
P
 
S
G
 
G
R
 
R
N
 
D
W
|
W
N
 
N
D
 
L
A
 
A
T
 
S
A
 
A
L
 
M
V
 
V
I
 
I
S
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
Q
 
Q
I
 
F
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
F
 
F
S
 
V
A
 
K
A
 
A
K
 
G
Q
 
K
S
 
K
A
 
P
G
 
G
K
 
E
E
 
D
F
 
F
G
 
V
C
 
C
F
 
M
P
 
R
G
 
Y
F
 
P
G
 
G
P
 
T
H
 
Q
S
 
G
P
 
A
Y
 
I
L
 
T
V
 
F
A
 
N
G
 
S
D
|
D
V
 
M
F
 
F
V
 
A
F
 
M
P
 
F
K
 
K
S
 
V
D
 
-
N
 
S
A
 
E
S
 
D
T
 
K
V
 
V
K
 
P
A
 
A
Q
 
Q
N
 
L
L
 
E
L
 
M
A
 
A
T
 
S
V
 
A
M
 
I
T
 
E
S
 
S
P
 
P
P
 
T
A
 
F
Q
 
Q
V
 
S
A
 
A
F
 
F
S
 
N
A
 
V
K
 
V
K
|
K
G
 
G
S
 
S
I
 
A
P
 
P
I
 
A
R
 
R
P
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
P
A
 
D
G
 
T
S
 
D
L
 
F
D
 
D
I
 
A
C
 
C
A
 
G
K
 
K
E
 
K
G
 
A
I
 
I
A
 
A
I
 
D
M
 
E
K
 
K
D
 
E
K
 
A
S
 
S
R
 
E
Q
 
K
-
 
G
-
 
T
-
 
M
-
 
L
-
 
G
-
 
S
-
 
M
-
 
A
-
x
H
-
 
G
L
 
Y
P
 
A
N
 
N
P
 
P
E
 
A
M
 
A
L
 
V
L
 
-
S
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
Q
 
K
G
 
N
A
 
A
L
 
I
I
 
Y
D
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
R
F
 
Q
W
 
F
N
 
N
K
 
G
N
 
Q
Q
 
L
S
 
S
V
 
S
D
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
V
K
 
K
A
 
E
F
 
L
A
 
V
G
 
S
A
 
A
L
 
V
K
 
E

2b3fA Thermus thermophilus glucose/galactose binding protein bound with galactose (see paper)
29% identity, 78% coverage: 27:348/412 of query aligns to 1:322/392 of 2b3fA

query
sites
2b3fA
L
 
M
K
 
K
A
 
L
N
 
E
V
 
I
I
 
F
H
 
S
W
|
W
W
|
W
T
 
-
S
 
A
G
 
G
G
 
D
E
|
E
S
 
G
A
 
P
A
 
A
I
 
L
R
 
E
Q
 
A
F
 
L
A
 
I
D
 
R
A
 
L
Y
 
Y
N
 
K
K
 
Q
A
 
K
-
 
Y
-
 
P
G
 
G
G
 
V
Q
 
E
W
 
V
I
 
I
D
 
N
N
 
A
A
 
T
V
 
V
A
 
T
G
 
G
A
x
G
D
x
A
-
 
G
-
 
V
Q
 
N
A
 
A
R
 
R
S
 
A
T
 
V
A
 
L
I
 
K
N
 
T
R
 
R
I
 
M
V
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
D
P
 
P
P
 
P
T
 
D
A
 
T
A
 
F
Q
 
Q
F
 
V
N
x
H
T
 
A
S
 
G
K
 
-
Q
 
-
F
 
-
H
 
M
D
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
G
Q
 
T
G
 
W
L
 
V
L
 
V
-
 
A
N
 
N
N
 
R
V
 
M
D
 
E
D
 
D
V
 
L
A
 
S
A
 
A
-
 
L
-
 
F
-
 
R
K
 
Q
E
 
E
N
 
G
W
 
W
S
 
L
G
 
Q
V
 
A
F
 
F
P
 
P
Q
 
K
S
 
G
I
 
L
L
 
I
D
 
D
S
 
L
I
 
I
K
 
S
V
 
Y
K
 
K
G
 
G
H
 
G
Y
 
I
Y
 
W
A
 
S
A
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
N
I
 
I
H
 
H
M
 
R
P
 
S
A
 
N
W
 
V
F
 
M
F
 
W
Y
 
Y
S
 
L
K
 
P
P
 
A
A
 
K
F
 
L
Q
 
K
K
 
G
A
 
W
G
 
G
I
 
V
T
 
N
A
 
P
E
 
-
P
 
P
Q
 
R
S
 
T
Y
 
W
D
 
D
E
 
K
F
 
F
I
 
L
A
 
A
D
 
T
L
 
C
G
 
Q
K
 
T
L
 
L
R
 
K
A
 
Q
A
 
K
G
 
G
V
 
L
-
 
E
I
 
A
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
-
Q
 
E
P
 
N
W
 
W
Q
 
T
E
 
Q
K
 
Q
I
 
H
T
 
L
F
 
W
D
 
E
A
 
S
V
 
V
L
 
A
A
 
L
D
 
A
V
 
V
G
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
D
L
 
D
Y
 
W
L
 
N
K
 
N
V
 
L
Y
 
W
R
 
N
D
 
G
H
 
K
-
 
L
-
 
K
-
 
F
-
 
T
D
 
D
A
 
P
N
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
R
S
 
A
D
 
-
A
 
-
F
 
-
K
 
-
K
 
-
V
 
-
L
 
W
I
 
E
A
 
V
F
 
F
K
 
G
R
 
R
L
 
V
H
 
L
D
 
D
F
 
C
V
 
A
D
 
N
A
 
K
G
 
D
S
 
A
P
 
A
G
 
G
R
 
L
N
 
S
W
 
W
N
 
Q
D
 
Q
A
 
A
T
 
V
A
 
D
L
 
R
V
 
V
I
 
V
S
 
Q
G
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
A
V
 
F
Q
 
N
I
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
K
 
A
G
 
G
E
 
Y
F
 
M
S
 
T
A
 
T
A
 
T
-
 
L
K
 
K
Q
 
L
S
 
K
A
 
P
G
 
G
K
 
T
E
 
D
F
 
F
G
 
A
C
 
W
F
 
A
P
 
P
G
 
S
F
 
P
G
 
G
P
 
T
H
 
Q
S
 
G
P
 
V
Y
 
F
L
 
M
V
 
M
A
 
L
G
 
S
D
|
D
V
 
S
F
 
F
V
 
G
F
 
L
P
 
P
K
 
K
S
 
G
D
 
A
N
 
K
A
 
-
S
 
N
T
 
R
V
 
Q
K
 
N
A
 
A
Q
 
I
N
 
N
L
 
W
L
 
L
A
 
R
T
 
L
V
 
V
M
 
-
T
 
G
S
 
S
P
 
K
P
 
E
A
 
G
Q
 
Q
V
 
D
A
 
T
F
 
S
S
 
N
A
 
P
K
 
L
K
|
K
G
 
G
S
 
S
I
 
I
P
 
A
I
 
A
R
 
R
P
 
L
D
 
D
V
 
S
D
 
D

Sites not aligning to the query:

2b3bC Thermus thermophilus glucose/galactose binding protein with bound glucose (see paper)
29% identity, 78% coverage: 27:348/412 of query aligns to 1:322/392 of 2b3bC

query
sites
2b3bC
L
 
M
K
 
K
A
 
L
N
 
E
V
 
I
I
 
F
H
 
S
W
|
W
W
 
W
T
 
-
S
 
A
G
 
G
G
 
D
E
|
E
S
 
G
A
 
P
A
 
A
I
 
L
R
 
E
Q
 
A
F
 
L
A
 
I
D
 
R
A
 
L
Y
 
Y
N
 
K
K
 
Q
A
 
K
-
 
Y
-
 
P
G
 
G
G
 
V
Q
 
E
W
 
V
I
 
I
D
 
N
N
 
A
A
 
T
V
 
V
A
 
T
G
 
G
A
 
G
D
x
A
-
 
G
-
 
V
Q
 
N
A
 
A
R
 
R
S
 
A
T
 
V
A
 
L
I
 
K
N
 
T
R
 
R
I
 
M
V
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
D
P
 
P
P
 
P
T
 
D
A
 
T
A
 
F
Q
 
Q
F
 
V
N
x
H
T
 
A
S
 
G
K
 
-
Q
 
-
F
 
-
H
 
M
D
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
G
Q
 
T
G
 
W
L
 
V
L
 
V
-
 
A
N
 
N
N
 
R
V
 
M
D
 
E
D
 
D
V
 
L
A
 
S
A
 
A
-
 
L
-
 
F
-
 
R
K
 
Q
E
 
E
N
 
G
W
 
W
S
 
L
G
 
Q
V
 
A
F
 
F
P
 
P
Q
 
K
S
 
G
I
 
L
L
 
I
D
 
D
S
 
L
I
 
I
K
 
S
V
 
Y
K
 
K
G
 
G
H
 
G
Y
 
I
Y
 
W
A
 
S
A
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
N
I
 
I
H
 
H
M
 
R
P
 
S
A
 
N
W
 
V
F
 
M
F
 
W
Y
 
Y
S
 
L
K
 
P
P
 
A
A
 
K
F
 
L
Q
 
K
K
 
G
A
 
W
G
 
G
I
 
V
T
 
N
A
 
P
E
 
-
P
 
P
Q
 
R
S
 
T
Y
 
W
D
 
D
E
 
K
F
 
F
I
 
L
A
 
A
D
 
T
L
 
C
G
 
Q
K
 
T
L
 
L
R
 
K
A
 
Q
A
 
K
G
 
G
V
 
L
-
 
E
I
 
A
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
-
Q
 
E
P
 
N
W
 
W
Q
 
T
E
 
Q
K
 
Q
I
 
H
T
 
L
F
 
W
D
 
E
A
 
S
V
 
V
L
 
A
A
 
L
D
 
A
V
 
V
G
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
D
L
 
D
Y
 
W
L
 
N
K
 
N
V
 
L
Y
 
W
R
 
N
D
 
G
H
 
K
-
 
L
-
 
K
-
 
F
-
 
T
D
 
D
A
 
P
N
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
R
S
 
A
D
 
-
A
 
-
F
 
-
K
 
-
K
 
-
V
 
-
L
 
W
I
 
E
A
 
V
F
 
F
K
 
G
R
 
R
L
 
V
H
 
L
D
 
D
F
 
C
V
 
A
D
 
N
A
 
K
G
 
D
S
 
A
P
 
A
G
 
G
R
 
L
N
 
S
W
 
W
N
 
Q
D
 
Q
A
 
A
T
 
V
A
 
D
L
 
R
V
 
V
I
 
V
S
 
Q
G
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
A
V
 
F
Q
 
N
I
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
K
 
A
G
 
G
E
 
Y
F
 
M
S
 
T
A
 
T
A
 
T
-
 
L
K
 
K
Q
 
L
S
 
K
A
 
P
G
 
G
K
 
T
E
 
D
F
 
F
G
 
A
C
 
W
F
 
A
P
 
P
G
 
S
F
 
P
G
 
G
P
 
T
H
 
Q
S
 
G
P
 
V
Y
 
F
L
 
M
V
 
M
A
 
L
G
 
S
D
|
D
V
 
S
F
 
F
V
 
G
F
 
L
P
 
P
K
 
K
S
 
G
D
 
A
N
 
K
A
 
-
S
 
N
T
 
R
V
 
Q
K
 
N
A
 
A
Q
 
I
N
 
N
L
 
W
L
 
L
A
 
R
T
 
L
V
 
V
M
 
-
T
 
G
S
 
S
P
 
K
P
 
E
A
 
G
Q
 
Q
V
 
D
A
 
T
F
 
S
S
 
N
A
 
P
K
 
L
K
|
K
G
 
G
S
 
S
I
 
I
P
 
A
I
 
A
R
 
R
P
 
L
D
 
D
V
 
S
D
 
D

Sites not aligning to the query:

2b3bA Thermus thermophilus glucose/galactose binding protein with bound glucose (see paper)
29% identity, 78% coverage: 27:348/412 of query aligns to 1:322/392 of 2b3bA

query
sites
2b3bA
L
 
M
K
 
K
A
 
L
N
 
E
V
 
I
I
 
F
H
 
S
W
|
W
W
|
W
T
 
-
S
 
A
G
 
G
G
 
D
E
|
E
S
 
G
A
 
P
A
 
A
I
 
L
R
 
E
Q
 
A
F
 
L
A
 
I
D
 
R
A
 
L
Y
 
Y
N
 
K
K
 
Q
A
 
K
-
 
Y
-
 
P
G
 
G
G
 
V
Q
 
E
W
 
V
I
 
I
D
 
N
N
 
A
A
 
T
V
 
V
A
 
T
G
 
G
A
 
G
D
x
A
-
 
G
-
 
V
Q
 
N
A
 
A
R
 
R
S
 
A
T
 
V
A
 
L
I
 
K
N
 
T
R
 
R
I
 
M
V
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
D
P
 
P
P
 
P
T
 
D
A
 
T
A
 
F
Q
 
Q
F
 
V
N
x
H
T
 
A
S
 
G
K
 
-
Q
 
-
F
 
-
H
 
M
D
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
G
Q
 
T
G
 
W
L
 
V
L
 
V
-
 
A
N
 
N
N
 
R
V
 
M
D
 
E
D
 
D
V
 
L
A
 
S
A
 
A
-
 
L
-
 
F
-
 
R
K
 
Q
E
 
E
N
 
G
W
 
W
S
 
L
G
 
Q
V
 
A
F
 
F
P
 
P
Q
 
K
S
 
G
I
 
L
L
 
I
D
 
D
S
 
L
I
 
I
K
 
S
V
 
Y
K
 
K
G
 
G
H
 
G
Y
 
I
Y
 
W
A
 
S
A
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
N
I
 
I
H
 
H
M
 
R
P
 
S
A
 
N
W
 
V
F
 
M
F
 
W
Y
 
Y
S
 
L
K
 
P
P
 
A
A
 
K
F
 
L
Q
 
K
K
 
G
A
 
W
G
 
G
I
 
V
T
 
N
A
 
P
E
 
-
P
 
P
Q
 
R
S
 
T
Y
 
W
D
 
D
E
 
K
F
 
F
I
 
L
A
 
A
D
 
T
L
 
C
G
 
Q
K
 
T
L
 
L
R
 
K
A
 
Q
A
 
K
G
 
G
V
 
L
-
 
E
I
 
A
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
-
Q
 
E
P
 
N
W
 
W
Q
 
T
E
 
Q
K
 
Q
I
 
H
T
 
L
F
 
W
D
 
E
A
 
S
V
 
V
L
 
A
A
 
L
D
 
A
V
 
V
G
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
D
L
 
D
Y
 
W
L
 
N
K
 
N
V
 
L
Y
 
W
R
 
N
D
 
G
H
 
K
-
 
L
-
 
K
-
 
F
-
 
T
D
 
D
A
 
P
N
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
R
S
 
A
D
 
-
A
 
-
F
 
-
K
 
-
K
 
-
V
 
-
L
 
W
I
 
E
A
 
V
F
 
F
K
 
G
R
 
R
L
 
V
H
 
L
D
 
D
F
 
C
V
 
A
D
 
N
A
 
K
G
 
D
S
 
A
P
 
A
G
 
G
R
 
L
N
 
S
W
 
W
N
 
Q
D
 
Q
A
 
A
T
 
V
A
 
D
L
 
R
V
 
V
I
 
V
S
 
Q
G
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
A
V
 
F
Q
 
N
I
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
K
 
A
G
 
G
E
 
Y
F
 
M
S
 
T
A
 
T
A
 
T
-
 
L
K
 
K
Q
 
L
S
 
K
A
 
P
G
 
G
K
 
T
E
 
D
F
 
F
G
 
A
C
 
W
F
 
A
P
 
P
G
 
S
F
 
P
G
 
G
P
 
T
H
 
Q
S
 
G
P
 
V
Y
 
F
L
 
M
V
 
M
A
 
L
G
 
S
D
|
D
V
 
S
F
 
F
V
 
G
F
 
L
P
 
P
K
 
K
S
 
G
D
 
A
N
 
K
A
 
-
S
 
N
T
 
R
V
 
Q
K
 
N
A
 
A
Q
 
I
N
 
N
L
 
W
L
 
L
A
 
R
T
 
L
V
 
V
M
 
-
T
 
G
S
 
S
P
 
K
P
 
E
A
 
G
Q
 
Q
V
 
D
A
 
T
F
 
S
S
 
N
A
 
P
K
 
L
K
|
K
G
 
G
S
 
S
I
 
I
P
 
A
I
 
A
R
 
R
P
 
L
D
 
D
V
 
S
D
 
D

Sites not aligning to the query:

3vxcA Crystal structure of xylobiose-bxle complex from streptomyces thermoviolaceus opc-520
30% identity, 46% coverage: 102:291/412 of query aligns to 79:261/398 of 3vxcA

query
sites
3vxcA
L
 
L
L
 
V
N
 
D
N
 
L
V
 
T
D
 
D
D
 
V
V
 
I
A
 
K
A
 
S
K
 
D
E
 
E
N
 
V
W
 
L
S
 
S
G
 
T
V
 
G
F
 
F
P
 
L
Q
 
P
S
 
S
I
 
V
L
 
V
D
 
A
S
 
A
I
 
G
K
 
S
V
 
L
K
 
D
G
 
G
H
 
H
Y
 
E
Y
 
Y
A
 
G
A
 
I
P
 
P
V
 
M
D
x
R
I
 
G
H
 
M
M
x
Q
P
 
P
A
 
V
W
 
L
F
 
L
F
 
F
Y
 
Y
S
 
N
K
 
K
P
 
S
A
 
V
F
 
F
Q
 
A
K
 
E
A
 
H
G
 
K
I
 
L
T
 
T
A
 
P
E
 
-
P
 
P
Q
 
T
S
 
T
Y
 
W
D
 
D
E
 
Q
F
 
L
I
 
L
A
 
D
D
 
N
L
 
V
G
 
A
K
 
K
L
 
L
R
 
K
A
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
T
P
 
P
L
 
F
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
G
-
 
V
Q
 
E
P
 
I
W
|
W
Q
 
P
E
 
E
K
 
L
I
 
M
T
 
W
F
 
L
D
 
E
A
 
Y
V
 
L
L
 
V
A
 
D
D
 
R
V
 
I
G
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
Q
L
 
V
Y
 
F
L
 
D
K
 
K
V
 
I
Y
 
-
R
 
R
D
 
N
H
 
G
D
 
D
A
 
A
N
 
S
A
 
G
V
 
W
K
 
G
S
 
D
D
 
P
A
 
A
F
 
-
K
 
-
K
 
-
V
 
V
L
 
L
I
 
K
A
 
A
F
 
A
K
 
Q
R
 
T
L
 
V
H
 
K
D
 
Q
F
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
E
G
 
G
S
 
A
P
 
F
G
 
G
R
 
K
N
 
G
W
 
F
N
 
S
D
 
S
-
 
V
-
 
S
-
 
Y
-
 
N
-
 
N
-
 
G
-
 
G
A
 
A
T
 
P
A
 
A
L
 
L
V
 
L
I
 
A
S
 
K
G
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
M
Q
 
H
I
 
L
M
 
M
G
 
G
D
 
S
W
|
W
A
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
E
F
 
Y
S
 
S
A
 
T
A
 
-
K
 
-
Q
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
K
 
-
E
 
Q
F
 
L
G
 
G
C
 
K
F
 
F
P
 
P
G
 
D
F
 
F

Sites not aligning to the query:

3oo6A Crystal structures and biochemical characterization of the bacterial solute receptor acbh reveal an unprecedented exclusive substrate preference for b-d-galactopyranose (see paper)
29% identity, 57% coverage: 74:307/412 of query aligns to 49:281/390 of 3oo6A

query
sites
3oo6A
I
 
I
N
 
S
R
 
N
I
 
Y
V
 
L
G
 
Q
G
 
G
D
 
T
P
 
P
P
 
D
T
 
S
A
 
L
A
 
A
Q
 
T
F
 
W
N
 
F
T
 
A
S
 
G
K
 
Y
Q
x
R
F
 
L
H
 
Q
D
 
F
L
 
F
I
 
A
D
 
A
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
L
 
L
N
 
T
N
 
P
V
 
I
D
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
W
A
 
D
K
 
K
E
 
I
N
 
-
W
 
-
S
 
G
G
 
G
V
 
T
F
 
F
P
 
N
Q
 
D
S
 
A
I
 
A
L
 
K
D
 
S
S
 
L
I
 
S
K
 
K
-
 
G
V
 
L
K
 
D
G
 
G
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
L
A
 
V
P
 
P
V
 
L
D
 
-
I
 
Y
H
 
N
M
x
Y
P
 
P
A
x
W
W
 
V
F
 
V
F
 
F
Y
 
Y
S
 
N
K
 
K
P
 
S
A
 
V
F
 
F
Q
 
Q
K
 
S
A
 
K
G
 
G
I
 
Y
T
 
E
A
 
V
E
 
-
P
 
P
Q
 
A
S
 
S
Y
 
W
D
 
E
E
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
A
D
 
L
L
 
A
G
 
R
K
 
K
L
 
M
R
 
Q
A
 
S
A
 
D
G
 
G
V
 
L
I
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
F
G
 
A
G
 
D
Q
 
K
P
 
D
-
 
G
W
|
W
Q
 
P
E
 
A
K
 
L
I
 
G
T
 
T
F
 
F
D
 
D
A
 
I
V
 
L
L
 
N
A
 
L
D
 
R
V
 
I
G
 
N
G
 
G
P
 
Y
D
 
D
L
 
Y
Y
 
H
L
 
I
K
 
K
V
 
L
Y
 
M
R
 
K
D
 
-
H
 
H
D
 
E
A
 
V
N
 
P
A
 
W
V
 
T
K
 
D
S
 
P
D
 
-
A
 
G
F
 
V
K
 
T
K
 
K
V
 
V
L
 
F
I
 
D
A
 
Q
F
 
W
K
 
R
R
 
E
L
 
L
H
 
A
D
 
A
F
 
Y
V
 
Q
D
 
Q
A
 
K
G
 
G
S
 
A
P
 
N
G
 
G
R
 
R
N
 
T
W
 
W
N
 
Q
D
 
D
A
 
A
T
 
A
A
 
K
L
 
A
V
 
L
I
 
E
S
 
N
G
 
K
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
M
Q
 
M
I
 
F
M
 
Q
G
 
G
D
 
S
W
 
N
A
 
Q
K
 
V
G
 
A
E
 
A
F
 
N
S
 
Y
A
 
S
A
 
A
K
 
K
Q
 
N
S
 
L
A
 
P
G
 
D
K
 
L
E
 
D
F
 
F
G
 
F
C
 
V
F
 
F
P
 
P
G
 
A
F
 
I
G
 
N
P
 
P
H
 
Q
-
 
Y
-
 
G
S
 
T
P
 
D
Y
 
Y
L
 
M
V
 
D
A
 
A
-
 
P
G
 
T
D
 
D
V
 
G
F
 
F
V
 
I
F
 
L
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4c1tA Structure of the xylo-oligosaccharide specific solute binding protein from bifidobacterium animalis subsp. Lactis bl-04 in complex with arabinoxylotriose (see paper)
28% identity, 56% coverage: 121:352/412 of query aligns to 97:339/396 of 4c1tA

query
sites
4c1tA
Q
 
K
S
 
T
I
 
T
L
 
L
D
 
S
S
 
A
I
 
A
K
 
T
V
 
F
K
 
D
G
 
G
H
 
K
Y
 
V
Y
 
Y
A
 
G
A
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
S
I
 
V
H
 
E
M
 
-
P
 
P
A
 
G
W
 
G
F
 
M
F
 
W
Y
 
Y
S
 
S
K
 
K
P
 
D
A
 
L
F
 
F
Q
 
K
K
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
S
A
 
D
E
 
V
P
 
P
Q
 
A
S
 
T
Y
 
Y
D
 
E
E
 
E
F
 
L
I
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
A
G
 
K
K
 
K
L
 
L
R
 
K
A
 
D
A
 
S
G
 
G
V
 
T
I
 
D
P
 
A
L
 
I
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
K
-
 
D
P
 
A
W
|
W
Q
 
P
E
 
A
K
 
A
I
x
H
T
 
W
F
 
Y
D
 
Y
A
 
W
V
 
L
L
 
V
A
 
L
D
 
R
V
 
E
G
 
C
G
 
S
P
 
P
D
 
E
L
 
V
Y
 
Y
L
 
D
K
 
K
V
 
S
Y
 
V
R
 
Q
D
 
D
H
 
H
D
 
D
-
 
F
A
 
S
N
 
N
A
 
A
V
 
C
K
 
W
S
 
V
D
 
N
A
 
A
F
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
L
-
 
Q
-
 
E
L
 
L
I
 
K
A
 
D
F
 
L
K
 
K
R
 
V
L
 
F
H
 
N
D
 
D
F
 
G
V
 
F
D
 
L
A
 
T
G
 
T
S
 
T
P
 
A
G
x
Q
R
 
Q
N
 
G
W
 
A
N
 
N
D
 
S
A
 
S
T
 
A
A
 
G
L
 
L
V
 
L
I
 
A
S
 
N
G
 
H
K
 
K
A
 
A
G
 
A
V
 
M
Q
 
E
I
 
L
M
 
M
G
 
G
D
 
A
W
|
W
A
 
E
K
 
P
G
 
G
E
 
V
F
 
L
S
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
T
-
 
P
A
 
D
A
 
Q
K
 
K
Q
 
P
S
 
M
A
 
A
G
 
D
K
 
L
E
 
G
F
 
F
G
 
F
C
 
A
F
 
F
P
 
P
G
 
E
F
 
V
-
 
A
-
 
G
G
 
G
P
 
E
H
 
G
S
 
E
P
 
P
Y
 
G
L
 
A
V
 
L
A
 
M
G
 
G
D
 
G
V
 
V
F
 
T
V
 
Y
F
 
F
-
 
C
-
 
V
-
 
N
P
 
P
K
 
K
S
 
A
D
 
S
N
 
Q
A
 
T
S
 
S
T
 
-
V
 
I
K
 
D
A
 
F
Q
 
V
N
 
N
L
 
Y
L
 
M
A
 
G
T
 
E
V
 
K
M
 
K
T
 
N
S
 
Q
P
 
E
P
 
D
A
 
Y
Q
 
A
V
 
K
A
 
A
F
|
F
S
 
S
A
 
T
K
 
I
K
 
P
G
 
A
S
 
S
I
 
E
P
 
P
I
 
A
R
 
R
P
 
A
D
 
V
V
 
V
D
 
T
A
 
D
G
 
E
S
 
S
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7ehqA Chitin oligosaccharide binding protein (see paper)
26% identity, 43% coverage: 124:301/412 of query aligns to 104:286/406 of 7ehqA

query
sites
7ehqA
L
 
L
D
 
R
S
 
E
I
 
F
K
 
T
V
 
V
K
 
D
G
 
G
H
 
K
Y
 
I
Y
 
Y
A
 
G
A
 
L
P
 
P
V
 
-
D
 
E
I
 
A
H
 
G
M
x
F
P
 
V
A
 
E
W
 
G
F
 
F
F
 
Y
Y
 
Y
S
 
N
K
 
T
P
 
K
A
 
L
F
 
F
Q
 
A
K
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
S
E
 
A
P
 
P
Q
 
K
S
 
T
Y
 
W
D
 
D
E
 
E
F
 
F
I
 
T
A
 
K
D
 
A
L
 
L
G
 
E
K
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
K
G
 
N
V
 
I
I
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
A
F
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
S
G
 
G
Q
 
D
P
 
G
W
|
W
Q
 
A
E
 
I
K
 
N
I
 
M
T
 
L
F
 
A
D
 
N
A
 
S
V
 
L
L
 
F
A
 
V
D
 
A
V
 
T
G
 
A
G
 
G
P
 
P
D
 
E
L
 
A
Y
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
Y
 
-
R
 
Q
D
 
E
H
 
G
D
 
F
A
 
A
N
 
K
A
 
G
V
 
T
K
 
T
S
 
K
D
 
W
A
 
T
F
 
D
K
 
P
K
 
A
V
 
V
L
 
L
I
 
D
A
 
G
F
 
F
K
 
K
R
 
R
L
 
L
H
 
K
D
 
D
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
K
-
 
G
F
 
Y
V
 
I
D
 
D
A
 
P
G
 
N
S
 
V
P
 
L
G
 
G
R
 
L
N
 
K
W
 
Y
N
 
S
D
 
E
A
 
G
T
 
Q
A
 
A
L
 
K
V
 
F
I
 
Y
S
 
T
G
 
G
K
 
Q
A
 
A
G
 
A
V
 
M
Q
 
L
I
 
F
M
 
D
G
 
G
D
 
S
W
|
W
A
 
A
K
 
T
G
 
S
E
 
A
F
 
I
S
 
L
A
 
D
A
 
K
K
 
D
Q
 
K
S
 
S
A
 
T
G
 
V
K
 
K
E
 
D
-
 
N
-
 
V
-
 
G
F
 
Y
G
 
F
C
 
R
F
 
F
P
 
P
G
 
N
F
 
I
G
 
G
P
 
G
H
 
K
S
 
G
P
 
D
Y
 
N
L
 
L
V
 
I
A
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1urgA X-ray structures from the maltose-maltodextrin binding protein of the thermoacidophilic bacterium alicyclobacillus acidocaldarius (see paper)
24% identity, 63% coverage: 116:375/412 of query aligns to 87:330/373 of 1urgA

query
sites
1urgA
S
 
T
G
 
G
V
 
L
F
 
Y
P
 
A
Q
 
P
S
 
N
I
 
T
L
 
I
D
 
D
S
 
A
I
 
I
K
 
K
V
 
V
K
 
N
G
 
G
H
 
T
Y
 
M
Y
 
Y
A
 
S
A
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
S
I
 
V
H
x
Q
M
 
V
P
 
A
A
 
A
W
 
I
F
 
Y
F
 
-
Y
 
-
S
 
-
K
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
Y
Q
 
N
K
 
K
A
 
K
G
 
L
I
 
V
T
 
P
A
 
Q
E
 
P
P
 
P
Q
 
Q
S
 
T
Y
 
W
D
 
A
E
 
E
F
 
F
I
 
V
A
 
K
D
 
D
L
 
A
G
 
N
K
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
I
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
A
F
 
H
G
 
G
G
 
F
Q
 
M
P
 
Y
W
 
D
Q
 
Q
E
 
A
K
x
N
I
 
L
T
x
Y
F
 
F
D
 
D
-
 
Y
A
 
A
V
 
I
L
 
I
A
 
G
D
 
G
V
 
Y
G
 
G
G
 
G
P
 
-
D
 
-
L
 
-
Y
 
-
L
 
-
K
 
Y
V
 
V
Y
 
F
R
 
K
D
 
D
H
 
N
-
 
N
-
 
G
-
 
T
-
 
L
D
 
D
A
 
P
N
 
N
A
 
N
V
 
I
K
 
G
S
 
L
D
 
D
A
 
T
F
 
P
K
 
G
K
 
A
V
 
V
L
 
Q
I
 
-
A
 
A
F
 
Y
K
 
T
R
 
L
L
 
M
H
 
R
D
 
D
F
 
M
V
 
V
D
 
S
A
 
K
-
 
Y
-
 
H
-
 
W
G
 
M
S
 
T
P
 
P
G
 
S
R
 
T
N
 
N
W
 
G
N
 
S
D
 
I
A
 
A
T
 
K
A
 
A
L
 
E
V
 
F
I
 
L
S
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
I
G
 
G
V
 
M
Q
 
Y
I
 
V
M
 
S
G
 
G
D
 
P
W
 
W
A
 
D
K
 
T
G
 
A
E
 
D
F
 
I
S
 
E
A
 
K
A
 
A
K
 
K
Q
 
I
S
 
D
A
 
F
G
 
G
-
 
V
K
 
T
E
 
P
F
 
W
G
 
P
C
 
T
F
 
L
P
 
P
G
 
N
F
 
G
G
 
K
P
 
H
H
 
A
S
 
T
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
V
 
G
A
 
V
G
 
I
D
 
T
V
 
A
F
 
F
V
 
V
F
 
-
P
 
-
K
 
-
S
 
N
D
 
K
N
 
E
A
 
S
S
 
K
T
 
T
V
 
Q
K
 
A
A
 
A
Q
 
D
N
 
W
L
 
S
L
 
L
A
 
V
T
 
Q
V
 
A
M
 
L
T
 
T
S
 
S
P
 
A
P
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
V
 
Q
A
 
M
F
 
Y
S
 
F
A
 
R
K
 
D
K
 
S
G
 
Q
S
 
Q
I
 
I
P
 
P
I
 
A
R
 
L
P
 
L
D
 
S
V
 
V
D
 
Q
A
 
R
G
 
S
S
 
S
L
 
A
D
 
V
I
 
Q
C
 
S
A
 
S
K
 
P
E
 
T
G
 
F
I
 
K
A
 
A
I
 
F
M
 
V
K
 
E
D
 
Q
K
 
L
S
 
R
R
 
Y
Q
 
A
L
 
V
P
 
P
N
 
M
P
 
P
E
 
N
M
 
I

Sites not aligning to the query:

2z8fA The galacto-n-biose-/lacto-n-biose i-binding protein (gl-bp) of the abc transporter from bifidobacterium longum in complex with lacto-n- tetraose (see paper)
33% identity, 23% coverage: 77:169/412 of query aligns to 59:147/401 of 2z8fA

query
sites
2z8fA
I
 
V
V
 
K
G
 
S
G
 
G
D
 
E
P
 
A
P
 
P
T
 
D
A
 
L
A
 
A
Q
 
Q
F
 
V
N
 
G
T
 
Y
S
 
A
K
 
-
Q
 
E
F
 
L
H
 
P
D
 
E
L
 
V
I
 
F
D
 
T
Q
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
L
N
 
Q
N
 
D
V
 
V
D
 
T
D
 
Q
V
 
Y
A
 
A
A
 
-
K
 
-
E
 
E
N
 
Q
W
 
Y
S
 
K
G
 
N
V
 
D
F
 
F
P
 
A
Q
 
S
S
 
G
I
 
P
L
 
Y
D
 
S
S
 
L
I
 
V
K
 
Q
V
 
V
K
 
G
G
 
G
H
 
K
Y
 
A
Y
 
Y
A
 
G
A
 
L
P
 
P
V
 
Q
D
|
D
I
 
T
H
 
G
M
 
-
P
 
P
A
 
L
W
 
V
F
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
S
 
N
K
 
K
P
 
A
A
 
E
F
 
F
Q
 
E
K
 
K
A
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
I
P
 
P
Q
 
Q
S
 
T
Y
 
A
D
 
D
E
 
E
F
 
F
I
 
I

Sites not aligning to the query:

2z8dA The galacto-n-biose-/lacto-n-biose i-binding protein (gl-bp) of the abc transporter from bifidobacterium longum in complex with lacto-n- biose (see paper)
33% identity, 23% coverage: 77:169/412 of query aligns to 59:147/401 of 2z8dA

query
sites
2z8dA
I
 
V
V
 
K
G
 
S
G
 
G
D
 
E
P
 
A
P
 
P
T
 
D
A
 
L
A
 
A
Q
 
Q
F
 
V
N
 
G
T
 
Y
S
 
A
K
 
-
Q
 
E
F
 
L
H
 
P
D
 
E
L
 
V
I
 
F
D
 
T
Q
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
L
N
 
Q
N
 
D
V
 
V
D
 
T
D
 
Q
V
 
Y
A
 
A
A
 
-
K
 
-
E
 
E
N
 
Q
W
 
Y
S
 
K
G
 
N
V
 
D
F
 
F
P
 
A
Q
 
S
S
 
G
I
 
P
L
 
Y
D
 
S
S
 
L
I
 
V
K
 
Q
V
 
V
K
 
G
G
 
G
H
 
K
Y
 
A
Y
 
Y
A
 
G
A
 
L
P
 
P
V
 
Q
D
|
D
I
 
T
H
 
G
M
 
-
P
 
P
A
 
L
W
 
V
F
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
S
 
N
K
 
K
P
 
A
A
 
E
F
 
F
Q
 
E
K
 
K
A
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
I
P
 
P
Q
 
Q
S
 
T
Y
 
A
D
 
D
E
 
E
F
 
F
I
 
I

Sites not aligning to the query:

4r9gA Cpmnbp1 with mannotriose bound (see paper)
24% identity, 66% coverage: 37:308/412 of query aligns to 11:291/394 of 4r9gA

query
sites
4r9gA
S
 
A
G
 
G
G
 
P
E
x
D
S
 
G
A
 
D
A
 
A
I
 
V
R
 
V
Q
 
S
F
 
L
A
 
A
D
 
K
A
 
E
Y
 
Y
N
 
S
K
 
K
A
 
T
-
 
H
-
 
P
G
 
N
G
 
V
Q
 
Q
W
 
I
I
 
K
D
 
A
N
 
Q
A
 
M
V
 
V
A
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
G
Q
 
I
A
 
A
R
 
-
S
 
A
T
 
K
A
 
F
I
 
L
N
 
S
R
 
A
I
 
V
V
 
A
G
 
A
G
 
G
D
 
N
P
 
P
P
 
P
T
 
D
A
 
L
A
 
V
Q
 
L
F
 
Y
N
x
W
T
 
G
S
 
Q
K
x
D
Q
 
A
F
 
L
H
 
P
D
 
G
L
 
L
I
 
A
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
L
 
A
L
 
I
N
 
I
N
 
P
V
 
L
D
 
D
D
 
D
V
 
Y
A
 
L
A
 
K
K
 
D
E
 
V
N
 
D
W
 
T
S
 
S
G
 
K
V
 
F
F
 
F
P
 
-
Q
 
E
S
 
A
I
 
A
L
 
Y
D
 
N
S
 
A
I
 
M
K
 
K
V
 
Y
K
 
K
G
 
G
H
 
K
Y
 
I
Y
 
Y
A
 
G
A
 
L
P
 
P
V
 
E
D
 
M
I
 
V
H
x
N
M
 
V
P
x
R
A
 
V
W
 
-
F
 
L
F
 
F
Y
 
W
S
 
N
K
 
K
P
 
D
A
 
L
F
 
F
Q
 
K
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
I
 
L
T
 
-
A
 
-
E
 
D
P
 
P
Q
 
N
S
 
T
Y
 
P
D
 
P
E
 
K
F
 
T
I
 
I
A
 
A
D
 
E
L
 
L
-
 
D
-
 
Q
-
 
M
-
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
K
-
 
T
-
 
K
-
 
N
G
 
G
K
 
T
L
 
I
R
 
E
A
 
Q
A
 
M
G
 
G
V
 
F
I
 
I
P
 
P
L
 
W
A
 
I
F
 
G
G
x
Q
G
 
G
Q
x
V
P
 
P
W
x
H
Q
 
V
E
 
M
K
 
A
I
 
G
T
 
V
F
 
F
D
 
G
A
 
T
V
 
S
L
 
L
A
 
V
D
 
D
V
 
S
G
 
N
G
 
G
P
 
N
D
 
P
L
 
I
Y
 
L
L
 
S
K
 
P
V
 
D
Y
 
K
R
 
N
D
 
P
H
 
Q
D
 
L
A
 
L
N
 
N
A
 
L
V
 
L
K
 
K
S
 
W
D
 
E
A
 
V
F
 
S
K
 
Y
K
 
S
V
 
D
L
 
K
I
 
Y
A
 
G
F
 
A
K
 
M
R
 
N
L
 
I
H
 
N
D
 
K
F
 
F
V
 
I
D
 
A
A
 
G
G
 
M
S
 
S
P
 
-
G
 
-
R
 
Q
N
|
N
W
 
S
N
 
S
D
 
Q
A
 
A
T
 
N
A
 
D
L
 
P
V
 
F
I
 
V
S
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
V
G
 
A
V
 
M
Q
 
M
I
 
I
M
 
S
G
 
G
D
 
E
W
|
W
A
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
Q
F
 
I
S
 
N
A
 
A
A
 
N
K
 
K
Q
 
Q
S
 
Y
A
 
N
G
 
P
K
 
K
-
 
L
E
 
N
F
 
F
G
 
G
C
 
V
F
 
G
P
 
P
-
 
I
-
 
P
-
 
Q
-
 
A
G
 
P
F
 
G
G
 
G
P
 
K
H
 
P
S
 
M
P
 
P
Y
 
S
L
 
L
V
 
M
A
 
D
G
 
G
D
x
N
V
 
T
F
 
W
V
 
M
F
 
I
P
 
P
K
 
K

Sites not aligning to the query:

6h0hA The abc transporter associated binding protein from b. Animalis subsp. Lactis bl-04 in complex with beta-1,6-galactobiose (see paper)
27% identity, 33% coverage: 43:179/412 of query aligns to 13:148/410 of 6h0hA

query
sites
6h0hA
A
 
S
I
 
L
R
 
K
Q
 
Q
F
 
I
A
 
A
D
 
A
A
 
D
Y
 
Y
N
 
E
K
 
K
A
 
K
G
 
T
G
 
G
Q
 
I
W
 
K
I
 
V
D
 
N
N
 
L
A
 
K
V
 
N
A
 
V
G
 
G
A
 
T
D
x
N
Q
 
T
A
 
K
R
 
E
S
 
Y
T
 
T
A
 
Q
I
 
L
N
 
D
R
 
N
I
 
A
V
 
I
-
 
E
-
 
A
G
 
G
G
 
S
D
 
G
P
 
A
P
 
P
T
 
D
A
 
V
A
 
A
Q
 
Q
F
 
I
N
x
E
T
 
Y
S
 
Y
K
 
A
Q
 
L
F
 
P
H
 
Q
D
 
Y
L
 
A
I
 
I
D
 
K
Q
 
G
G
 
N
L
 
L
L
 
L
N
 
D
N
 
I
V
 
T
D
 
D
D
 
K
V
 
T
A
 
S
A
 
G
K
 
Y
E
 
E
N
 
D
W
 
F
S
 
Y
G
 
N
V
 
P
F
 
G
P
 
P
Q
 
W
S
 
S
I
 
-
L
 
-
D
 
-
S
 
S
I
 
V
K
 
Q
V
 
I
K
 
D
G
 
G
H
 
K
Y
 
V
Y
 
Y
A
 
A
A
 
L
P
 
P
V
 
I
D
|
D
I
 
A
H
 
G
M
 
-
P
 
P
A
 
M
W
 
A
F
 
F
F
 
F
Y
 
Y
S
 
N
K
 
K
P
 
E
A
 
I
F
 
F
Q
 
D
K
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
D
A
 
G
E
 
E
P
 
K
-
 
I
Q
 
K
S
 
T
Y
 
W
D
 
D
E
 
D
F
 
Y
I
 
Y
A
 
E
D
 
A
L
 
A
G
 
K
K
 
K
L
 
I
R
 
H
A
 
A
A
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4r9fA Cpmnbp1 with mannobiose bound (see paper)
23% identity, 57% coverage: 74:308/412 of query aligns to 57:299/402 of 4r9fA

query
sites
4r9fA
I
 
L
N
 
S
R
 
A
I
 
V
V
 
A
G
 
A
G
 
G
D
 
N
P
 
P
P
 
P
T
 
D
A
 
L
A
 
V
Q
 
L
F
 
Y
N
x
W
T
 
G
S
 
Q
K
 
D
Q
 
A
F
 
L
H
 
P
D
 
G
L
 
L
I
 
A
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
L
 
A
L
 
I
N
 
I
N
 
P
V
 
L
D
 
D
D
 
D
V
 
Y
A
 
L
A
 
K
K
 
D
E
 
V
N
 
D
W
 
T
S
 
S
G
 
K
V
 
F
F
 
F
P
 
-
Q
 
E
S
 
A
I
 
A
L
 
Y
D
 
N
S
 
A
I
 
M
K
 
K
V
 
Y
K
 
K
G
 
G
H
 
K
Y
 
I
Y
 
Y
A
 
G
A
 
L
P
 
P
V
 
E
D
 
M
I
 
V
H
x
N
M
 
V
P
x
R
A
 
V
W
 
-
F
 
L
F
 
F
Y
 
W
S
 
N
K
 
K
P
 
D
A
 
L
F
 
F
Q
 
K
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
I
 
L
T
 
-
A
 
-
E
 
D
P
 
P
Q
 
N
S
 
T
Y
 
P
D
 
P
E
 
K
F
 
T
I
 
I
A
 
A
D
 
E
L
 
L
-
 
D
-
 
Q
-
 
M
-
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
K
-
 
T
-
 
K
-
 
N
G
 
G
K
 
T
L
 
I
R
 
E
A
 
Q
A
 
M
G
 
G
V
 
F
I
 
I
P
 
P
L
 
W
A
 
I
F
 
G
G
x
Q
G
 
G
Q
 
V
P
 
P
W
 
H
Q
 
V
E
 
M
K
 
A
I
 
G
T
 
V
F
 
F
D
 
G
A
 
T
V
 
S
L
 
L
A
 
V
D
 
D
V
 
S
G
 
N
G
 
G
P
 
N
D
 
P
L
 
I
Y
 
L
L
 
S
K
 
P
V
 
D
Y
 
K
R
 
N
D
 
P
H
 
Q
D
 
L
A
 
L
N
 
N
A
 
L
V
 
L
K
 
K
S
 
W
D
 
E
A
 
V
F
 
S
K
 
Y
K
 
S
V
 
D
L
 
K
I
 
Y
A
 
G
F
 
A
K
 
M
R
 
N
L
 
I
H
 
N
D
 
K
F
 
F
V
 
I
D
 
A
A
 
G
G
 
M
S
 
S
P
 
-
G
 
-
R
 
Q
N
|
N
W
 
S
N
 
S
D
 
Q
A
 
A
T
 
N
A
 
D
L
 
P
V
 
F
I
 
V
S
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
V
G
 
A
V
 
M
Q
 
M
I
 
I
M
 
S
G
 
G
D
 
E
W
|
W
A
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
Q
F
 
I
S
 
N
A
 
A
A
 
N
K
 
K
Q
 
Q
S
 
Y
A
 
N
G
 
P
K
 
K
-
 
L
E
 
N
F
 
F
G
 
G
C
 
V
F
 
G
P
 
P
-
 
I
-
 
P
-
 
Q
-
 
A
G
 
P
F
 
G
G
 
G
P
 
K
H
 
P
S
 
M
P
 
P
Y
 
S
L
 
L
V
 
M
A
 
D
G
 
G
D
x
N
V
 
T
F
 
W
V
 
M
F
 
I
P
 
P
K
 
K

Sites not aligning to the query:

7vfqC Wild type glta from bifidobacterium infantis jcm 1222 complexed with lacto-n-tetraose
31% identity, 26% coverage: 77:185/412 of query aligns to 55:158/397 of 7vfqC

query
sites
7vfqC
I
 
V
V
 
K
G
 
A
G
 
G
D
 
N
P
 
A
P
 
P
T
 
D
A
 
L
A
 
A
Q
 
Q
F
 
V
N
 
G
T
 
Y
S
 
A
K
 
-
Q
 
E
F
 
V
H
 
P
D
 
E
L
 
V
I
 
F
D
 
T
Q
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
L
N
 
Q
N
 
D
V
 
V
D
 
T
D
 
D
V
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
K
E
 
-
N
 
-
W
 
Y
S
 
K
G
 
D
V
 
D
F
 
F
P
 
A
Q
 
S
S
 
A
I
 
P
L
 
F
D
 
A
S
 
L
I
 
M
K
 
Q
V
 
V
K
 
D
G
 
G
H
 
K
Y
 
T
Y
 
Y
A
 
G
A
 
L
P
 
P
V
 
Q
D
|
D
I
 
T
H
 
G
M
 
-
P
 
P
A
 
L
W
 
A
F
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
S
 
N
K
 
A
P
 
A
A
 
E
F
 
F
Q
 
E
K
 
K
A
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
E
 
-
P
 
P
Q
 
K
S
 
T
Y
 
A
D
 
D
E
 
E
F
 
L
I
 
I
A
 
E
D
 
T
L
 
A
G
 
K
K
 
K
L
 
T
R
 
A
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
V
 
K
I
 
Y
P
 
I
L
 
M
A
 
T
F
 
F

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>H281DRAFT_01454 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_01454
MNSRKTVLRAMVAALAMHGVLAYAEPLKANVIHWWTSGGESAAIRQFADAYNKAGGQWID
NAVAGADQARSTAINRIVGGDPPTAAQFNTSKQFHDLIDQGLLNNVDDVAAKENWSGVFP
QSILDSIKVKGHYYAAPVDIHMPAWFFYSKPAFQKAGITAEPQSYDEFIADLGKLRAAGV
IPLAFGGQPWQEKITFDAVLADVGGPDLYLKVYRDHDANAVKSDAFKKVLIAFKRLHDFV
DAGSPGRNWNDATALVISGKAGVQIMGDWAKGEFSAAKQSAGKEFGCFPGFGPHSPYLVA
GDVFVFPKSDNASTVKAQNLLATVMTSPPAQVAFSAKKGSIPIRPDVDAGSLDICAKEGI
AIMKDKSRQLPNPEMLLSPDTQGALIDVVTNFWNKNQSVDDAQKAFAGALKS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory