SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_01493 H281DRAFT_01493 aspartate carbamoyltransferase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1ml4A The pala-liganded aspartate transcarbamoylase catalytic subunit from pyrococcus abyssi (see paper)
41% identity, 73% coverage: 85:400/430 of query aligns to 2:306/307 of 1ml4A

query
sites
1ml4A
W
 
W
E
 
K
G
 
G
K
 
R
P
 
-
Q
 
D
L
 
V
L
 
I
S
 
S
V
 
I
D
 
R
Q
 
D
F
 
F
S
 
S
R
 
K
D
 
E
S
 
D
V
 
I
E
 
E
A
 
T
L
 
V
F
 
L
R
 
A
V
 
T
A
 
A
D
 
E
I
 
R
M
 
L
Q
 
E
P
 
R
I
 
E
A
 
L
R
 
K
R
 
E
R
 
K
K
 
G
I
 
Q
S
 
L
R
 
E
V
 
Y
L
 
A
E
 
K
G
 
G
A
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
E
A
 
S
A
 
A
F
 
M
C
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
A
V
 
V
C
 
I
D
 
G
T
 
F
T
 
A
G
 
E
F
 
A
T
 
S
F
 
T
S
 
S
S
 
S
M
 
V
A
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
I
 
L
Y
 
R
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
K
V
 
T
M
 
V
S
 
E
G
 
Q
Y
 
Y
V
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
I
V
 
V
I
 
I
R
|
R
H
 
H
P
 
P
E
 
K
Q
 
E
G
 
G
S
 
A
V
 
A
A
 
R
E
 
L
F
 
A
A
 
A
R
 
E
A
 
V
T
 
A
N
 
E
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
S
G
 
N
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
Q
 
K
R
 
K
E
 
E
F
 
F
S
 
G
R
 
R
L
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
-
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
L
H
 
K
I
 
I
A
 
G
L
 
L
V
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
V
 
A
K
 
E
L
 
A
L
 
L
A
 
T
L
 
F
Y
 
Y
R
 
-
G
 
D
I
 
V
K
 
E
F
 
L
T
 
Y
L
 
L
I
 
I
S
 
S
P
 
P
P
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
R
M
 
M
P
 
P
G
 
R
Y
 
H
I
 
I
I
 
V
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
S
 
R
R
 
E
N
 
K
G
 
G
H
 
M
V
 
K
I
 
V
E
 
V
Q
 
E
T
 
T
H
 
T
D
 
T
L
 
L
P
 
E
T
 
D
G
 
V
L
 
I
R
 
G
G
 
K
A
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
A
 
V
T
|
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
P
D
 
D
E
 
E
-
 
Q
S
 
E
F
 
Y
E
 
L
G
 
K
Y
 
V
T
 
K
P
 
G
D
 
S
F
 
Y
Q
 
Q
I
 
V
N
 
N
Q
 
L
A
 
K
L
 
V
V
 
L
D
 
E
S
 
K
V
 
-
C
 
A
G
 
K
S
 
D
D
 
E
T
 
L
L
 
R
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
V
N
 
D
D
 
E
L
 
I
S
 
H
V
 
P
D
 
E
L
 
V
N
 
D
H
 
N
D
 
T
S
 
K
R
 
H
L
 
A
A
 
I
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
V
D
 
F
N
 
N
G
|
G
I
 
V
P
 
P
V
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
A
V
 
L
L
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
V

P20054 Multifunctional protein pyr1-3; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Dictyostelium discoideum (Social amoeba)
40% identity, 83% coverage: 44:399/430 of query aligns to 1885:2222/2225 of P20054

query
sites
P20054
Q
 
Q
E
 
S
S
 
T
R
 
Q
A
 
H
M
 
L
P
 
P
E
 
L
I
 
V
V
 
G
E
 
S
R
 
N
F
 
L
V
 
A
S
 
S
E
 
A
I
 
V
V
 
L
V
 
N
H
 
K
G
 
K
E
 
E
P
 
D
G
 
T
D
 
L
R
 
Q
Y
 
T
T
 
A
Q
 
F
S
 
N
V
 
I
D
 
S
S
 
D
Q
 
N
S
 
S
L
 
L
A
 
A
S
 
G
Q
 
K
M
 
-
L
 
-
W
 
-
E
 
-
G
 
-
K
 
-
P
 
-
Q
 
H
L
 
I
L
 
F
S
 
S
V
 
V
D
 
K
Q
 
Q
F
 
F
S
 
N
R
 
R
D
 
K
S
 
Q
V
 
L
E
 
H
A
 
A
L
 
L
F
 
F
R
 
G
V
 
I
A
 
A
D
 
H
I
 
E
M
 
M
Q
 
R
P
 
I
I
 
L
A
 
V
R
 
K
R
 
R
R
 
S
K
 
G
I
 
G
S
 
S
R
 
D
V
 
L
L
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
K
V
 
V
L
 
L
G
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
Q
V
 
C
S
 
S
F
 
F
G
 
T
A
 
A
A
 
A
F
 
M
C
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
C
 
V
D
 
-
T
 
T
T
 
V
G
 
D
F
 
N
T
 
V
F
 
S
S
 
S
S
 
S
M
 
V
A
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
I
 
I
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
Q
V
 
T
M
 
L
S
 
E
G
 
S
Y
 
Y
V
 
C
D
 
D
A
 
A
L
 
V
V
 
C
I
 
M
R
 
R
H
 
H
P
 
P
E
 
A
Q
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
A
 
E
E
 
S
F
 
A
A
 
I
R
 
Q
A
 
V
T
 
A
N
 
K
V
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
V
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
R
 
E
E
 
E
F
 
L
S
 
G
R
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
T
V
 
V
D
 
N
G
 
G
A
 
L
H
 
T
I
 
I
A
 
T
L
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
V
 
V
K
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
N
Y
 
Y
R
 
Q
G
 
-
I
 
V
K
 
K
F
 
I
T
 
N
L
 
Y
I
 
V
S
 
S
P
 
P
P
 
S
M
 
S
L
 
L
E
 
S
M
 
M
P
 
P
G
 
T
Y
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
K
Q
 
E
I
 
L
S
 
N
R
 
E
N
 
K
G
 
G
H
 
I
V
 
E
I
 
Q
E
 
K
Q
 
E
T
 
Y
H
 
T
D
 
N
L
 
I
P
 
E
T
 
S
G
 
I
L
 
L
R
 
P
G
 
T
A
 
T
D
 
N
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
A
 
V
T
 
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
Q
D
 
S
-
 
I
E
 
E
S
 
E
F
 
Y
E
 
E
G
 
K
Y
 
V
T
 
K
P
 
D
D
 
S
F
 
F
Q
 
I
I
 
I
N
 
T
Q
 
P
A
 
H
L
 
T
V
 
L
D
 
T
S
 
K
V
 
A
C
 
-
G
 
S
S
 
D
D
 
N
T
 
M
L
 
I
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
I
N
 
N
D
 
E
L
 
I
S
 
S
V
 
P
D
 
E
L
 
V
N
 
D
H
 
S
D
 
D
S
 
P
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
M
D
 
E
N
 
N
G
 
G
I
 
L
P
 
Y
V
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
S
I
 
L
F
 
L
A
 
A
V
 
L
L
 
V
L
 
F
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6ys6B Arabidopsis aspartate transcarbamoylase complex with pala (see paper)
44% identity, 70% coverage: 96:398/430 of query aligns to 14:309/312 of 6ys6B

query
sites
6ys6B
Q
 
Q
F
 
F
S
 
D
R
 
R
D
 
E
S
 
M
V
 
L
E
 
S
A
 
A
L
 
I
F
 
F
R
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
R
I
 
E
M
 
M
Q
 
E
P
 
K
I
 
I
A
 
E
R
 
K
R
 
S
R
 
S
K
 
S
I
 
Q
S
 
S
R
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
Y
V
 
L
L
 
M
G
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
E
A
 
S
A
 
A
F
 
M
C
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
E
V
 
V
C
 
L
D
 
T
T
 
T
-
 
E
T
 
N
G
 
A
F
 
R
T
 
E
F
 
F
S
 
S
S
|
S
M
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
Y
 
E
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
R
V
 
T
M
 
V
S
 
E
G
 
G
Y
 
Y
V
 
S
D
 
D
A
 
I
L
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
F
E
 
E
Q
 
S
G
 
G
S
 
A
V
 
A
A
 
R
E
 
K
F
 
A
A
 
A
R
 
A
A
 
T
T
 
A
N
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
P
G
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
V
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
R
 
S
E
 
E
F
 
I
S
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
-
K
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
D
G
 
G
A
 
I
H
 
S
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
A
Y
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
R
S
 
S
L
 
L
V
 
A
K
 
Y
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
K
Y
 
F
R
 
K
G
 
D
I
 
V
K
 
K
F
 
I
T
 
Y
L
 
F
I
 
V
S
 
S
P
 
P
P
 
E
M
 
I
L
 
V
E
 
K
M
 
M
P
 
K
G
 
D
Y
 
D
I
 
I
I
 
K
E
 
D
Q
 
Y
I
 
L
S
 
T
R
 
S
N
 
S
G
 
G
H
 
V
V
 
E
I
 
W
E
 
E
Q
 
E
T
 
S
H
 
S
D
 
D
L
 
L
P
 
M
T
 
E
G
 
V
L
 
A
R
 
S
G
 
K
A
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
A
 
Q
T
|
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
G
D
 
E
-
 
R
-
 
L
E
 
D
S
 
L
F
 
Y
E
 
E
G
 
A
Y
 
A
T
 
R
P
 
G
D
 
K
F
 
F
Q
 
I
I
 
V
N
 
D
Q
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
-
S
 
G
V
 
V
C
 
M
G
 
Q
S
 
K
D
 
K
T
 
A
L
 
I
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
L
N
 
D
D
 
E
L
 
I
S
 
T
V
 
A
D
 
D
L
 
V
N
 
D
H
 
A
D
 
D
S
 
P
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
A
D
 
K
N
 
N
G
|
G
I
 
L
P
 
F
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
K
V
 
L
L
 
L
L
 
L

6ypoA Arabidopsis aspartate transcarbamoylase bound to ump (see paper)
44% identity, 70% coverage: 96:398/430 of query aligns to 14:309/312 of 6ypoA

query
sites
6ypoA
Q
 
Q
F
 
F
S
 
D
R
 
R
D
 
E
S
 
M
V
 
L
E
 
S
A
 
A
L
 
I
F
 
F
R
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
R
I
 
E
M
 
M
Q
 
E
P
 
K
I
 
I
A
 
E
R
 
K
R
 
S
R
 
S
K
 
S
I
 
Q
S
 
S
R
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
Y
V
 
L
L
 
M
G
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
E
A
 
S
A
 
A
F
 
M
C
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
E
V
 
V
C
 
L
D
 
T
T
 
T
-
 
E
T
 
N
G
 
A
F
 
R
T
 
E
F
 
F
S
 
S
S
 
S
M
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
Y
 
E
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
R
V
 
T
M
 
V
S
 
E
G
 
G
Y
 
Y
V
 
S
D
 
D
A
 
I
L
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
F
E
 
E
Q
 
S
G
 
G
S
 
A
V
 
A
A
 
R
E
 
K
F
 
A
A
 
A
R
 
A
A
 
T
T
 
A
N
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
P
G
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
V
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
R
 
S
E
 
E
F
 
I
S
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
-
K
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
D
G
 
G
A
 
I
H
 
S
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
A
Y
 
N
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
R
S
 
S
L
 
L
V
 
A
K
 
Y
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
K
Y
 
F
R
 
K
G
 
D
I
 
V
K
 
K
F
 
I
T
 
Y
L
 
F
I
 
V
S
 
S
P
 
P
P
 
E
M
 
I
L
 
V
E
 
K
M
 
M
P
 
K
G
 
D
Y
 
D
I
 
I
I
 
K
E
 
D
Q
 
Y
I
 
L
S
 
T
R
 
S
N
 
S
G
 
G
H
 
V
V
 
E
I
 
W
E
 
E
Q
 
E
T
 
S
H
 
S
D
 
D
L
 
L
P
 
M
T
 
E
G
 
V
L
 
A
R
 
S
G
 
K
A
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
A
 
Q
T
|
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
G
D
 
E
-
 
R
-
 
L
E
 
D
S
 
L
F
 
Y
E
 
E
G
 
A
Y
 
A
T
 
R
P
 
G
D
 
K
F
 
F
Q
 
I
I
 
V
N
 
D
Q
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
-
S
 
G
V
 
V
C
 
M
G
 
Q
S
 
K
D
 
K
T
 
A
L
 
I
I
 
I
M
 
M
H
|
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
L
N
 
D
D
 
E
L
 
I
S
 
T
V
 
A
D
 
D
L
 
V
N
 
D
H
 
A
D
 
D
S
 
P
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
A
D
 
K
N
 
N
G
|
G
I
 
L
P
 
F
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
K
V
 
L
L
 
L
L
 
L

6yvbC Arabidopsis aspartate transcarbamoylase complex with carbamoyl phosphate (see paper)
44% identity, 70% coverage: 96:398/430 of query aligns to 26:321/324 of 6yvbC

query
sites
6yvbC
Q
 
Q
F
 
F
S
 
D
R
 
R
D
 
E
S
 
M
V
 
L
E
 
S
A
 
A
L
 
I
F
 
F
R
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
R
I
 
E
M
 
M
Q
 
E
P
 
K
I
 
I
A
 
E
R
 
K
R
 
S
R
 
S
K
 
S
I
 
Q
S
 
S
R
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
Y
V
 
L
L
 
M
G
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
E
A
 
S
A
 
A
F
 
M
C
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
E
V
 
V
C
 
L
D
 
T
T
 
T
-
 
E
T
 
N
G
 
A
F
 
R
T
 
E
F
 
F
S
 
S
S
 
S
M
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
Y
 
E
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
R
V
 
T
M
 
V
S
 
E
G
 
G
Y
 
Y
V
 
S
D
 
D
A
 
I
L
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
F
E
 
E
Q
 
S
G
 
G
S
 
A
V
 
A
A
 
R
E
 
K
F
 
A
A
 
A
R
 
A
A
 
T
T
 
A
N
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
P
G
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
V
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
R
 
S
E
 
E
F
 
I
S
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
-
K
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
D
G
 
G
A
 
I
H
 
S
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
A
Y
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
R
S
 
S
L
 
L
V
 
A
K
 
Y
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
K
Y
 
F
R
 
K
G
 
D
I
 
V
K
 
K
F
 
I
T
 
Y
L
 
F
I
 
V
S
 
S
P
 
P
P
 
E
M
 
I
L
 
V
E
 
K
M
 
M
P
 
K
G
 
D
Y
 
D
I
 
I
I
 
K
E
 
D
Q
 
Y
I
 
L
S
 
T
R
 
S
N
 
S
G
 
G
H
 
V
V
 
E
I
 
W
E
 
E
Q
 
E
T
 
S
H
 
S
D
 
D
L
 
L
P
 
M
T
 
E
G
 
V
L
 
A
R
 
S
G
 
K
A
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
A
 
Q
T
|
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
G
D
 
E
-
 
R
-
 
L
E
 
D
S
 
L
F
 
Y
E
 
E
G
 
A
Y
 
A
T
 
R
P
 
G
D
 
K
F
 
F
Q
 
I
I
 
V
N
 
D
Q
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
-
S
 
G
V
 
V
C
 
M
G
 
Q
S
 
K
D
 
K
T
 
A
L
 
I
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
L
N
 
D
D
 
E
L
 
I
S
 
T
V
 
A
D
 
D
L
 
V
N
 
D
H
 
A
D
 
D
S
 
P
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
A
D
 
K
N
 
N
G
|
G
I
 
L
P
 
F
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
K
V
 
L
L
 
L
L
 
L

P49077 Aspartate carbamoyltransferase, chloroplastic; Aspartate transcarbamylase; ATCase; EC 2.1.3.2 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
43% identity, 70% coverage: 96:398/430 of query aligns to 92:387/390 of P49077

query
sites
P49077
Q
 
Q
F
 
F
S
 
D
R
 
R
D
 
E
S
 
M
V
 
L
E
 
S
A
 
A
L
 
I
F
 
F
R
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
R
I
 
E
M
 
M
Q
 
E
P
 
K
I
 
I
A
 
E
R
 
K
R
 
S
R
 
S
K
 
S
I
 
Q
S
 
S
R
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
Y
V
 
L
L
 
M
G
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
E
A
 
S
A
 
A
F
 
M
C
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
E
V
 
V
C
 
L
D
 
T
T
 
T
-
 
E
T
 
N
G
 
A
F
 
R
T
 
E
F
 
F
S
 
S
S
 
S
M
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
Y
 
E
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
R
V
 
T
M
 
V
S
 
E
G
 
G
Y
 
Y
V
 
S
D
 
D
A
 
I
L
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
F
E
 
E
Q
 
S
G
 
G
S
 
A
V
 
A
A
 
R
E
 
K
F
 
A
A
 
A
R
 
A
A
 
T
T
 
A
N
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
P
G
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
V
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
R
 
S
E
 
E
F
 
I
S
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
-
K
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
D
G
 
G
A
 
I
H
 
S
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
A
Y
 
N
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
R
S
 
S
L
 
L
V
 
A
K
 
Y
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
K
Y
 
F
R
 
K
G
 
D
I
 
V
K
 
K
F
 
I
T
 
Y
L
 
F
I
 
V
S
 
S
P
 
P
P
 
E
M
 
I
L
 
V
E
 
K
M
 
M
P
 
K
G
 
D
Y
 
D
I
 
I
I
 
K
E
 
D
Q
 
Y
I
 
L
S
 
T
R
 
S
N
 
S
G
 
G
H
 
V
V
 
E
I
 
W
E
 
E
Q
 
E
T
 
S
H
 
S
D
 
D
L
 
L
P
 
M
T
 
E
G
 
V
L
 
A
R
 
S
G
 
K
A
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
A
 
Q
T
 
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
G
D
 
E
-
 
R
-
 
L
E
 
D
S
 
L
F
 
Y
E
 
E
G
 
A
Y
 
A
T
 
R
P
 
G
D
 
K
F
 
Y
Q
 
I
I
 
V
N
 
D
Q
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
-
S
 
G
V
 
V
C
 
M
G
 
Q
S
 
K
D
 
K
T
 
A
L
 
I
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
L
N
 
D
D
 
E
L
 
I
S
 
T
V
 
A
D
 
D
L
 
V
N
 
D
H
 
A
D
 
D
S
 
P
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
A
D
 
K
N
 
N
G
 
G
I
 
L
P
 
F
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
K
V
 
L
L
 
L
L
 
L

5g1nE Aspartate transcarbamoylase domain of human cad bound to pala (see paper)
41% identity, 72% coverage: 90:399/430 of query aligns to 7:305/307 of 5g1nE

query
sites
5g1nE
Q
 
H
L
 
I
L
 
L
S
 
S
V
 
V
D
 
Q
Q
 
Q
F
 
F
S
 
T
R
 
K
D
 
D
S
 
Q
V
 
M
E
 
S
A
 
H
L
 
L
F
 
F
R
 
N
V
 
V
A
 
A
D
 
H
I
 
T
M
 
L
Q
 
R
P
 
M
I
 
M
A
 
V
R
 
Q
R
 
K
R
 
E
K
 
R
I
 
S
S
 
L
R
 
D
V
 
I
L
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
K
V
 
V
L
 
M
G
 
A
N
 
S
L
 
M
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
V
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
S
V
 
S
S
 
S
F
 
F
G
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
M
C
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
A
V
 
V
C
 
L
D
 
S
T
 
F
T
 
S
G
 
E
F
 
A
T
 
T
F
 
-
S
 
S
S
|
S
M
 
V
A
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
I
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
S
S
 
V
R
 
Q
V
 
T
M
 
M
S
 
S
G
 
C
Y
 
Y
V
 
A
D
 
D
A
 
V
L
 
V
V
 
V
I
 
L
R
|
R
H
 
H
P
 
P
E
 
Q
Q
 
P
G
 
G
S
 
A
V
 
V
A
 
E
E
 
L
F
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
H
T
 
C
N
 
R
V
 
R
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
V
G
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
I
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
R
 
E
E
 
E
F
 
L
S
 
G
R
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
T
V
 
V
D
 
N
G
 
G
A
 
M
H
 
T
I
 
I
A
 
T
L
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
H
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
V
 
A
K
 
C
L
 
L
L
 
L
A
 
T
L
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
G
 
-
I
 
V
K
 
S
F
 
L
T
 
R
L
 
Y
I
 
V
S
 
A
P
 
P
P
 
P
M
 
S
L
 
L
E
 
R
M
 
M
P
 
P
G
 
P
Y
 
T
I
 
V
I
 
R
E
 
A
Q
 
F
I
 
V
S
 
A
R
 
S
N
 
R
G
 
G
H
 
T
V
 
K
I
 
Q
E
 
E
Q
 
E
T
 
F
H
 
E
D
 
S
L
 
I
P
 
E
T
 
E
G
 
A
L
 
L
R
 
P
G
 
D
A
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
A
 
M
T
|
T
R
|
R
I
 
I
Q
|
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
-
 
G
T
 
S
D
 
T
E
 
Q
S
 
E
F
 
Y
E
 
E
G
 
A
Y
 
C
T
 
F
P
 
G
D
 
Q
F
 
F
Q
 
I
I
 
L
N
 
T
Q
 
P
A
 
H
L
 
I
V
 
M
D
 
-
S
 
T
V
 
R
C
 
A
G
 
K
S
 
K
D
 
K
T
 
M
L
 
V
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
x
M
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
V
N
 
N
D
 
E
L
 
I
S
 
S
V
 
V
D
 
E
L
 
V
N
 
D
H
 
S
D
 
D
S
 
P
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
A
D
 
E
N
 
N
G
|
G
I
 
M
P
 
Y
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
A
V
 
T
L
 
V
L
 
L
G
 
G

P08955 Multifunctional protein CAD; Carbamoyl phosphate synthetase 2-aspartate transcarbamylase-dihydroorotase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Mesocricetus auratus (Golden hamster) (see paper)
41% identity, 72% coverage: 90:399/430 of query aligns to 1925:2223/2225 of P08955

query
sites
P08955
Q
 
H
L
 
I
L
 
L
S
 
S
V
 
V
D
 
K
Q
 
Q
F
 
F
S
 
T
R
 
K
D
 
D
S
 
Q
V
 
M
E
 
S
A
 
H
L
 
L
F
 
F
R
 
N
V
 
V
A
 
A
D
 
H
I
 
T
M
 
L
Q
 
R
P
 
M
I
 
M
A
 
V
R
 
Q
R
 
K
R
 
E
K
 
R
I
 
S
S
 
L
R
 
D
V
 
I
L
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
K
V
 
V
L
 
M
G
 
A
N
 
S
L
 
M
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
V
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
S
V
 
S
S
 
S
F
 
F
G
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
M
C
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
A
V
 
V
C
 
L
D
 
S
T
 
F
T
 
S
G
 
E
F
 
A
T
 
T
F
 
-
S
 
S
S
 
S
M
 
V
A
 
Q
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
I
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
S
S
 
V
R
 
Q
V
 
T
M
 
M
S
 
S
G
 
C
Y
 
Y
V
 
A
D
 
D
A
 
V
L
 
V
V
 
V
I
 
L
R
 
R
H
 
H
P
 
P
E
 
Q
Q
 
P
G
 
G
S
 
A
V
 
V
A
 
E
E
 
L
F
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
H
T
 
C
N
 
R
V
 
R
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
I
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
R
 
E
E
 
E
F
 
L
S
 
G
R
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
T
V
 
V
D
 
N
G
 
G
A
 
M
H
 
T
I
 
I
A
 
T
L
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
V
 
A
K
 
C
L
 
L
L
 
L
A
 
T
L
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
G
 
-
I
 
V
K
 
S
F
 
L
T
 
R
L
 
Y
I
 
V
S
 
A
P
 
P
P
 
P
M
 
S
L
 
L
E
 
R
M
 
M
P
 
P
G
 
P
Y
 
S
I
 
V
I
 
W
E
 
D
Q
 
F
I
 
V
S
 
A
R
 
S
N
 
R
G
 
G
H
 
T
V
 
K
I
 
Q
E
 
E
Q
 
E
T
 
F
H
 
E
D
 
S
L
 
I
P
 
E
T
 
E
G
 
A
L
 
L
R
 
P
G
 
D
A
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
A
 
M
T
 
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
-
 
G
T
 
S
D
 
T
E
 
Q
S
 
E
F
 
Y
E
 
E
G
 
A
Y
 
C
T
 
F
P
 
G
D
 
Q
F
 
F
Q
 
I
I
 
L
N
 
T
Q
 
P
A
 
H
L
 
I
V
 
M
D
 
T
S
 
R
V
 
A
C
 
-
G
 
K
S
 
K
D
 
K
T
 
M
L
 
V
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
L
 
M
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
V
N
 
N
D
 
E
L
 
I
S
 
S
V
 
V
D
 
E
L
 
V
N
 
D
H
 
S
D
 
D
S
 
P
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
A
D
 
E
N
 
N
G
 
G
I
 
M
P
 
Y
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
A
V
 
T
L
 
V
L
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P27708 Multifunctional protein CAD; Carbamoyl phosphate synthetase 2-aspartate transcarbamylase-dihydroorotase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
41% identity, 72% coverage: 90:399/430 of query aligns to 1925:2223/2225 of P27708

query
sites
P27708
Q
x
H
L
x
I
L
|
L
S
|
S
V
|
V
D
x
Q
Q
|
Q
F
|
F
S
x
T
R
x
K
D
|
D
S
x
Q
V
x
M
E
x
S
A
x
H
L
|
L
F
|
F
R
x
N
V
|
V
A
|
A
D
x
H
I
x
T
M
x
L
Q
x
R
P
x
M
I
x
M
A
x
V
R
x
Q
R
x
K
R
x
E
K
x
R
I
x
S
S
x
L
R
x
D
V
x
I
L
|
L
E
x
K
G
|
G
A
x
K
V
|
V
L
x
M
G
x
A
N
x
S
L
x
M
F
|
F
F
x
Y
E
|
E
A
x
V
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
x
S
V
x
S
S
|
S
F
|
F
G
x
A
A
|
A
A
|
A
F
x
M
C
x
A
R
|
R
L
|
L
G
|
G
G
|
G
S
x
A
V
|
V
C
x
L
D
x
S
T
x
F
T
x
S
G
x
E
F
x
A
T
|
T
F
 
-
S
|
S
S
|
S
M
x
V
A
x
Q
K
|
K
G
|
G
E
|
E
S
|
S
I
x
L
Y
x
A
D
|
D
T
x
S
S
x
V
R
x
Q
V
x
T
M
|
M
S
|
S
G
x
C
Y
|
Y
V
x
A
D
|
D
A
x
V
L
x
V
V
|
V
I
x
L
R
|
R
H
|
H
P
|
P
E
x
Q
Q
x
P
G
|
G
S
x
A
V
|
V
A
x
E
E
x
L
F
x
A
A
|
A
R
x
K
A
x
H
T
x
C
N
x
R
V
x
R
P
|
P
V
|
V
I
|
I
N
|
N
G
x
A
G
|
G
D
|
D
G
|
G
P
x
V
G
|
G
E
|
E
H
|
H
P
|
P
S
x
T
Q
|
Q
A
|
A
L
|
L
L
|
L
D
|
D
L
x
I
Y
x
F
T
|
T
I
|
I
Q
x
R
R
x
E
E
|
E
F
x
L
S
x
G
R
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
I
x
T
V
|
V
D
x
N
G
|
G
A
x
M
H
x
T
I
|
I
A
x
T
L
x
M
V
|
V
G
|
G
D
|
D
L
|
L
K
|
K
Y
x
H
G
|
G
R
|
R
T
|
T
V
|
V
H
|
H
S
|
S
L
|
L
V
x
A
K
x
C
L
|
L
L
|
L
A
x
T
L
x
Q
Y
|
Y
R
|
R
G
 
-
I
x
V
K
x
S
F
x
L
T
x
R
L
x
Y
I
x
V
S
x
A
P
|
P
P
|
P
M
x
S
L
|
L
E
x
R
M
|
M
P
|
P
G
x
P
Y
x
T
I
x
V
I
x
R
E
x
A
Q
x
F
I
x
V
S
x
A
R
x
S
N
x
R
G
|
G
H
x
T
V
x
K
I
x
Q
E
|
E
Q
x
E
T
x
F
H
x
E
D
x
S
L
x
I
P
x
E
T
x
E
G
x
A
L
|
L
R
x
P
G
x
D
A
x
T
D
|
D
V
|
V
V
x
L
Y
|
Y
A
x
M
T
|
T
R
|
R
I
|
I
Q
|
Q
K
|
K
E
|
E
R
|
R
F
|
F
-
x
G
T
x
S
D
x
T
E
x
Q
S
x
E
F
x
Y
E
|
E
G
x
A
Y
x
C
T
x
F
P
x
G
D
x
Q
F
|
F
Q
x
I
I
x
L
N
x
T
Q
x
P
A
x
H
L
x
I
V
x
M
D
x
T
S
x
R
V
x
A
C
 
-
G
x
K
S
x
K
D
x
K
T
x
M
L
x
V
I
x
V
M
|
M
H
|
H
P
|
P
L
x
M
P
|
P
R
|
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
x
V
N
|
N
D
x
E
L
x
I
S
|
S
V
|
V
D
x
E
L
x
V
N
x
D
H
x
S
D
|
D
S
x
P
R
|
R
L
x
A
A
|
A
I
x
Y
F
|
F
R
|
R
Q
|
Q
T
x
A
D
x
E
N
|
N
G
|
G
I
x
M
P
x
Y
V
x
I
R
|
R
M
|
M
A
|
A
I
x
L
F
x
L
A
|
A
V
x
T
L
x
V
L
|
L
G
|
G

Sites not aligning to the query:

4eknB Structure of the catalytic chain of methanococcus jannaschii aspartate transcarbamoylase in a hexagonal crystal form (see paper)
41% identity, 72% coverage: 90:398/430 of query aligns to 3:300/304 of 4eknB

query
sites
4eknB
Q
 
H
L
 
L
L
 
I
S
 
S
V
 
M
D
 
K
Q
 
D
F
 
I
S
 
G
R
 
K
D
 
E
S
 
E
V
 
I
E
 
L
A
 
E
L
 
I
F
 
L
R
 
D
V
 
E
A
 
A
D
 
R
I
 
K
M
 
M
Q
 
E
P
 
E
I
 
L
A
 
L
R
 
N
R
 
T
R
 
K
K
 
R
I
 
P
S
 
L
R
 
K
V
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
A
N
 
T
L
 
V
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
E
A
 
T
A
 
A
F
 
M
C
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
E
V
 
V
C
 
I
D
 
T
T
 
M
T
 
T
G
 
D
F
 
L
T
 
K
F
 
S
S
 
S
S
 
S
M
 
V
A
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
I
 
L
Y
 
I
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
R
V
 
V
M
 
I
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
D
 
D
A
 
I
L
 
I
V
 
V
I
 
L
R
 
R
H
 
H
P
 
P
E
 
S
Q
 
E
G
 
G
S
 
A
V
 
A
A
 
R
E
 
L
F
 
A
A
 
S
R
 
E
A
 
Y
T
 
S
N
 
Q
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
S
G
 
N
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
Q
 
M
R
 
R
E
 
E
F
 
I
S
 
G
R
 
R
L
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
-
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
I
H
 
K
I
 
I
A
 
A
L
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
|
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
V
 
V
K
 
Y
L
 
A
L
 
L
A
 
S
L
 
L
Y
 
F
R
 
E
G
 
N
I
 
V
K
 
E
F
 
M
T
 
Y
L
 
F
I
 
V
S
 
S
P
 
P
P
 
K
M
 
E
L
 
L
E
 
R
M
 
L
P
 
P
G
 
K
Y
 
D
I
 
I
I
 
I
E
 
E
Q
 
D
I
 
L
S
 
K
R
 
A
N
 
K
G
 
N
H
 
I
V
 
K
I
 
F
E
 
Y
Q
 
E
T
 
K
H
 
E
D
 
S
L
 
L
P
 
D
T
 
D
G
 
L
L
 
D
R
 
D
G
 
D
A
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
A
 
V
T
|
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
P
D
 
D
-
 
P
E
 
N
S
 
E
F
 
Y
E
 
E
G
 
K
Y
 
V
T
 
K
P
 
G
D
 
S
F
 
Y
Q
 
K
I
 
I
N
 
K
Q
 
R
A
 
E
L
 
Y
V
 
V
D
 
E
S
 
-
V
 
-
C
 
-
G
 
G
S
 
K
D
 
K
T
 
F
L
 
I
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
V
N
 
D
D
 
E
L
 
I
S
 
D
V
 
Y
D
 
D
L
 
V
N
 
D
H
 
D
D
 
L
S
 
P
R
 
Q
L
 
A
A
 
K
I
 
Y
F
 
F
R
 
K
Q
 
Q
T
 
S
D
 
F
N
 
Y
G
|
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
I
F
 
L
A
 
K
V
 
K
L
 
L
L
 
I

5g1pA Aspartate transcarbamoylase domain of human cad bound to carbamoyl phosphate (see paper)
41% identity, 72% coverage: 90:399/430 of query aligns to 4:290/292 of 5g1pA

query
sites
5g1pA
Q
 
H
L
 
I
L
 
L
S
 
S
V
 
V
D
 
Q
Q
 
Q
F
 
F
S
 
T
R
 
K
D
 
D
S
 
Q
V
 
M
E
 
S
A
 
H
L
 
L
F
 
F
R
 
N
V
 
V
A
 
A
D
 
H
I
 
T
M
 
L
Q
 
R
P
 
M
I
 
M
A
 
V
R
 
Q
R
 
K
R
 
E
K
 
R
I
 
S
S
 
L
R
 
D
V
 
I
L
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
K
V
 
V
L
 
M
G
 
A
N
 
S
L
 
M
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
V
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
S
V
 
S
S
 
S
F
 
F
G
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
M
C
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
A
V
 
V
C
 
L
D
 
S
T
 
F
T
 
S
G
 
E
F
 
A
T
 
T
F
 
-
S
 
S
S
 
S
M
 
V
A
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
I
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
S
S
 
V
R
 
Q
V
 
T
M
 
M
S
 
S
G
 
C
Y
 
Y
V
 
A
D
 
D
A
 
V
L
 
V
V
 
V
I
 
L
R
|
R
H
 
H
P
 
P
E
 
Q
Q
 
P
G
 
G
S
 
A
V
 
V
A
 
E
E
 
L
F
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
H
T
 
C
N
 
R
V
 
R
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
V
G
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
I
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
R
 
E
E
 
E
F
 
L
S
 
G
R
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
T
V
 
V
D
 
N
G
 
G
A
 
M
H
 
T
I
 
I
A
 
T
L
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
V
 
A
K
 
C
L
 
L
L
 
L
A
 
T
L
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
G
 
-
I
 
V
K
 
S
F
 
L
T
 
R
L
 
Y
I
 
V
S
 
A
P
 
P
P
 
P
M
 
S
L
 
L
E
 
R
M
 
M
P
 
P
G
 
P
Y
 
T
I
 
V
I
 
R
E
 
A
Q
 
F
I
 
V
S
 
A
R
 
-
N
 
S
G
 
G
H
 
T
V
 
K
I
 
Q
E
 
E
Q
 
E
T
 
F
H
 
E
D
 
S
L
 
I
P
 
E
T
 
E
G
 
A
L
 
L
R
 
P
G
 
D
A
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
A
 
M
T
|
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
-
D
 
-
E
 
-
S
 
-
F
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
P
 
-
D
 
Q
F
 
F
Q
 
I
I
 
L
N
 
T
Q
 
P
A
 
H
L
 
I
V
 
M
D
 
T
S
 
R
V
 
-
C
 
A
G
 
K
S
 
K
D
 
K
T
 
M
L
 
V
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
x
M
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
V
N
 
N
D
 
E
L
 
I
S
 
S
V
 
V
D
 
E
L
 
V
N
 
D
H
 
S
D
 
D
S
 
P
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
A
D
 
E
N
 
N
G
|
G
I
 
M
P
 
Y
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
A
V
 
T
L
 
V
L
 
L
G
 
G

Q18990 Multifunctional protein pyr-1; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Caenorhabditis elegans (see 3 papers)
42% identity, 72% coverage: 90:399/430 of query aligns to 1878:2194/2198 of Q18990

query
sites
Q18990
Q
 
N
L
 
C
L
 
I
S
 
S
V
 
V
D
 
K
Q
 
H
F
 
L
S
 
D
R
 
K
D
 
G
S
 
Q
V
 
I
E
 
N
A
 
R
L
 
I
F
 
F
R
 
E
V
 
L
A
 
A
D
 
D
-
 
R
I
 
Y
M
 
K
Q
 
H
P
 
D
I
 
V
A
 
E
R
 
K
R
 
G
R
 
H
K
 
P
I
 
L
S
 
T
R
 
H
V
 
I
L
 
L
E
 
N
G
 
G
A
 
K
V
 
V
L
 
L
G
 
V
N
 
N
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
V
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
S
V
 
C
S
 
S
F
 
F
G
 
S
A
 
A
A
 
A
F
 
M
C
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
C
 
-
D
 
I
T
 
S
T
 
V
G
 
D
F
 
S
T
 
Q
F
 
S
S
 
S
S
 
S
M
 
V
A
 
Q
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
Y
 
E
D
 
D
T
 
T
S
 
V
R
 
Q
V
 
V
M
 
L
S
 
G
G
 
S
Y
 
Y
V
 
G
D
 
D
A
 
I
L
 
L
V
 
V
I
 
L
R
 
R
H
 
S
P
 
N
E
 
E
Q
 
N
G
 
G
S
 
A
V
 
A
A
 
D
E
 
R
F
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
V
T
 
C
N
 
D
V
 
Q
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
T
G
 
G
E
 
E
H
 
H
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
V
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
R
 
Q
E
 
E
F
 
M
S
 
G
R
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
T
V
 
V
D
 
N
G
 
G
A
 
L
H
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
V
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
C
L
 
L
Y
 
Y
R
 
K
G
 
D
I
 
I
K
 
T
F
 
L
T
 
H
L
 
Y
I
 
V
S
 
A
P
 
P
P
 
S
M
 
T
-
 
E
L
 
L
E
 
E
M
 
M
P
 
P
G
 
Q
Y
 
E
I
 
V
I
 
L
E
 
D
Q
 
Y
I
 
V
S
 
S
R
 
S
N
 
K
G
 
S
H
 
N
V
 
F
I
 
V
E
 
Q
Q
 
K
T
 
K
H
 
F
-
 
T
D
 
S
L
 
L
P
 
A
T
 
E
G
 
G
L
 
I
R
 
N
G
 
H
A
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
A
 
V
T
 
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
S
D
 
S
-
 
P
E
 
D
S
 
E
F
 
Y
E
 
N
G
 
K
Y
 
V
T
 
K
P
 
G
D
 
S
F
 
Y
Q
 
V
I
 
I
N
 
N
Q
 
A
A
 
K
L
 
L
V
 
L
D
 
N
S
 
E
V
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
D
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
P
-
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
L
-
 
V
-
 
P
C
 
A
G
 
R
S
 
S
D
 
L
T
 
P
L
 
I
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
V
N
 
D
D
 
E
L
 
I
S
 
A
V
 
V
D
 
E
L
 
L
N
 
D
H
 
H
D
 
D
S
 
E
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
A
D
 
K
N
 
N
G
 
G
I
 
V
P
 
F
V
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
S
I
 
I
F
 
L
A
 
S
V
 
L
L
 
L
L
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P05990 Multifunctional protein r; Protein rudimentary; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Drosophila melanogaster (Fruit fly) (see 2 papers)
38% identity, 76% coverage: 72:399/430 of query aligns to 1904:2218/2224 of P05990

query
sites
P05990
Q
 
R
S
 
T
V
 
T
D
 
N
S
 
S
Q
 
N
S
 
P
L
 
V
A
 
A
S
 
H
Q
 
S
M
 
L
L
 
M
W
 
-
E
 
-
G
 
G
K
 
K
P
 
-
Q
 
H
L
 
I
L
 
L
S
 
A
V
 
V
D
 
D
Q
 
M
F
 
F
S
 
N
R
 
K
D
 
D
S
 
H
V
 
L
E
 
N
A
 
D
L
 
I
F
 
F
R
 
N
V
 
L
A
 
A
D
 
Q
I
 
L
M
 
L
Q
 
K
P
 
L
I
 
R
A
 
G
R
 
T
R
 
K
-
 
D
R
 
R
K
 
P
I
 
V
S
 
D
R
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
P
G
 
G
A
 
K
V
 
I
L
 
M
G
 
A
N
 
S
L
 
V
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
V
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
Q
V
 
C
S
 
S
F
 
F
G
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
M
C
 
L
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
R
V
 
V
C
 
I
D
 
S
T
 
M
T
 
D
G
 
N
F
 
I
T
 
T
F
 
-
S
 
S
S
 
S
M
 
V
A
 
K
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
I
 
L
Y
 
E
D
 
D
T
 
S
S
 
I
R
 
K
V
 
V
M
 
V
S
 
S
G
 
S
Y
 
Y
V
 
A
D
 
D
A
 
V
L
 
V
V
 
V
I
 
L
R
 
R
H
 
H
P
 
P
E
 
S
Q
 
P
G
 
G
S
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
R
F
 
A
A
 
A
R
 
T
A
 
F
T
 
S
N
 
R
V
 
K
P
 
P
V
 
L
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
I
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
R
 
E
E
 
E
F
 
F
S
 
G
R
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
T
V
 
V
D
 
N
G
 
G
A
 
L
H
 
T
I
 
I
A
 
T
L
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
V
 
A
K
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
T
L
 
L
Y
 
Y
R
 
-
G
 
N
I
 
V
K
 
N
F
 
L
T
 
Q
L
 
Y
I
 
V
S
 
A
P
 
P
P
 
N
M
 
S
L
 
L
E
 
Q
M
 
M
P
 
P
G
 
D
Y
 
E
I
 
V
I
 
V
E
 
Q
Q
 
F
I
 
V
S
 
H
R
 
Q
N
 
R
G
 
G
H
 
V
V
 
K
I
 
Q
E
 
L
Q
 
F
T
 
A
H
 
R
D
 
D
L
 
L
P
 
K
T
 
N
G
 
V
L
 
L
R
 
P
G
 
D
A
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
A
 
M
T
 
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
D
D
 
N
-
 
V
E
 
E
S
 
D
F
 
Y
E
 
E
G
 
K
-
 
C
-
 
C
-
 
G
-
 
H
-
 
L
-
 
V
Y
 
L
T
 
T
P
 
P
D
 
E
F
 
H
Q
 
M
I
 
M
N
 
R
Q
 
A
A
 
K
L
 
-
V
 
-
D
 
-
S
 
-
V
 
-
C
 
-
G
 
-
S
 
K
D
 
R
T
 
S
L
 
I
I
 
V
M
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
L
N
 
N
D
 
E
L
 
I
S
 
S
V
 
R
D
 
E
L
 
I
N
 
D
H
 
S
D
 
D
S
 
P
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
A
D
 
E
N
 
Y
G
 
G
I
 
M
P
 
Y
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
A
V
 
M
L
 
V
L
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P07259 Multifunctional protein URA2; Pyrimidine-specific carbamoyl phosphate synthase-aspartate carbamoyl transferase; CPSase-ATCase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
36% identity, 91% coverage: 12:401/430 of query aligns to 1852:2213/2214 of P07259

query
sites
P07259
A
 
A
M
 
K
R
 
R
R
 
R
L
 
F
N
x
S
M
 
I
T
 
T
R
 
E
E
 
E
T
 
A
F
 
I
A
 
A
G
 
D
R
 
N
I
 
L
G
 
D
V
 
A
S
 
A
R
 
E
R
 
D
A
 
A
L
 
I
D
 
-
T
 
-
W
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
P
D
 
E
D
 
Q
S
 
P
Q
 
L
E
 
E
S
 
Q
R
 
K
A
 
L
M
 
M
P
 
S
E
 
S
I
 
R
V
 
P
E
 
P
R
 
R
F
 
-
V
 
-
S
 
-
E
 
E
I
 
L
V
 
V
V
 
A
H
 
P
G
 
G
E
 
A
P
 
-
G
 
-
D
 
-
R
 
-
Y
 
-
T
 
I
Q
 
Q
S
 
N
V
 
L
D
 
-
S
 
-
Q
 
-
S
 
-
L
 
I
A
 
R
S
 
S
Q
 
N
M
 
N
L
 
P
W
 
F
E
 
R
G
 
G
K
 
R
P
 
-
Q
 
H
L
 
I
L
 
L
S
 
S
V
 
I
D
 
K
Q
 
Q
F
 
F
S
 
K
R
 
R
D
 
S
S
 
D
V
 
F
E
 
H
A
 
V
L
 
L
F
 
F
R
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
Q
I
 
E
M
 
L
Q
 
R
P
 
A
I
 
A
A
 
V
R
 
A
R
 
R
R
 
E
K
 
G
I
 
V
S
 
L
R
 
D
V
 
L
L
 
M
E
 
K
G
 
G
A
 
H
V
 
V
L
 
I
G
 
T
N
 
T
L
 
I
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
C
V
 
S
S
 
S
F
 
F
G
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
M
C
 
E
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
R
V
 
I
C
 
V
D
 
N
T
 
V
T
 
N
G
 
P
F
 
L
T
 
V
F
 
-
S
 
S
S
 
S
M
 
V
A
 
K
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
Y
 
Q
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
R
V
 
T
M
 
L
S
 
A
G
 
C
Y
 
Y
V
 
S
D
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
V
I
 
M
R
 
R
H
 
H
P
 
S
E
 
E
Q
 
E
G
 
M
S
 
S
V
 
V
A
 
H
E
 
I
F
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
Y
T
 
S
N
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
G
D
 
N
G
 
G
P
 
S
G
 
R
E
 
E
H
 
H
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
F
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
R
 
E
E
 
E
F
 
I
S
 
G
R
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
T
V
 
V
D
 
N
G
 
G
A
 
I
H
 
T
I
 
V
A
 
T
L
 
F
V
 
M
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
V
 
C
K
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
M
L
 
H
Y
 
Y
R
 
Q
G
 
-
I
 
V
K
 
R
F
 
I
T
 
N
L
 
L
I
 
V
S
 
S
P
 
P
P
 
P
M
 
E
L
 
L
E
 
R
M
 
L
P
 
P
G
 
E
Y
 
G
I
 
L
I
 
R
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
S
 
R
R
 
K
N
 
A
G
 
G
H
 
L
V
 
L
-
 
G
I
 
V
E
 
E
Q
 
S
T
 
I
H
 
E
D
 
L
L
 
T
P
 
P
T
 
H
G
 
I
L
 
I
R
 
S
G
 
K
A
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
A
 
C
T
 
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
E
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
N
D
 
S
E
 
P
S
 
E
F
 
E
E
 
Y
G
 
A
Y
 
R
T
 
L
P
 
K
D
 
D
F
 
T
Q
 
Y
I
 
I
N
 
V
Q
 
D
A
 
N
L
 
K
V
 
I
D
 
L
S
 
A
V
 
H
C
 
A
G
 
K
S
 
E
D
 
N
T
 
M
L
 
A
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
V
N
 
N
D
 
E
L
 
I
S
 
K
V
 
E
D
 
E
L
 
V
N
 
D
H
 
Y
D
 
D
S
 
H
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
M
D
 
K
N
 
Y
G
 
G
I
 
L
P
 
F
V
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
A
V
 
M
L
 
V
L
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
D

Q09794 Multifunctional protein ura1; Pyrimidine-specific carbamoyl phosphate synthase-aspartate carbamoyl transferase; CPSase-ATCase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
40% identity, 74% coverage: 88:405/430 of query aligns to 1936:2244/2244 of Q09794

query
sites
Q09794
K
 
R
P
 
K
Q
 
H
L
 
I
L
 
I
S
 
S
V
 
V
D
 
H
Q
 
Q
F
 
V
S
 
T
R
 
R
D
 
S
S
 
D
V
 
L
E
 
H
A
 
V
L
 
L
F
 
F
R
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
H
I
 
Q
M
 
M
Q
 
R
P
 
I
I
 
I
A
 
V
R
 
E
R
 
R
R
 
Q
K
 
G
I
 
V
S
 
I
R
 
D
V
 
L
L
 
C
E
 
Y
G
 
G
A
 
K
V
 
L
L
 
L
G
 
C
N
 
T
L
 
M
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
S
V
 
S
S
 
S
F
 
F
G
 
D
A
 
A
A
 
A
F
 
M
C
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
K
V
 
V
C
 
V
D
 
A
T
 
V
T
 
T
G
 
A
F
 
-
T
 
S
F
 
A
S
 
S
S
 
S
M
 
V
A
 
N
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
I
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
R
V
 
T
M
 
L
S
 
G
G
 
C
Y
 
Y
V
 
G
D
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
V
I
 
L
R
 
R
H
 
H
P
 
P
E
 
S
Q
 
I
G
 
E
S
 
S
V
 
A
A
 
R
E
 
I
F
 
A
A
 
A
R
 
N
A
 
F
T
 
S
N
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
G
D
 
N
G
 
G
P
 
S
G
 
K
E
 
E
H
 
H
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
F
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
R
 
E
E
 
E
F
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
L
G
 
G
K
 
S
I
 
-
V
 
V
D
 
N
G
 
G
A
 
L
H
 
T
I
 
I
A
 
T
L
 
F
V
 
I
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
V
 
A
K
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
F
Y
 
W
R
 
H
G
 
-
I
 
V
K
 
E
F
 
L
T
 
H
L
 
L
I
 
V
S
 
S
P
 
P
P
 
E
M
 
Q
L
 
L
E
 
A
M
 
L
P
 
P
G
 
D
Y
 
D
I
 
V
I
 
K
E
 
D
Q
 
D
I
 
I
S
 
R
R
 
A
N
 
N
G
 
G
-
 
L
H
 
N
V
 
F
I
 
I
E
 
E
Q
 
H
T
 
R
H
 
E
D
 
L
L
 
T
P
 
K
T
 
E
G
 
V
L
 
V
R
 
A
G
 
Q
A
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
A
 
C
T
 
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
A
D
 
S
-
 
V
E
 
D
S
 
E
F
 
Y
E
 
E
G
 
K
Y
 
L
T
 
K
P
 
D
D
 
S
F
 
F
Q
 
I
I
 
V
N
 
D
Q
 
N
A
 
S
L
 
V
V
 
L
D
 
A
S
 
S
V
 
-
C
 
A
G
 
K
S
 
S
D
 
H
T
 
C
L
 
I
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
N
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
R
D
 
E
L
 
I
S
 
S
V
 
E
D
 
E
L
 
V
N
 
D
H
 
F
D
 
D
S
 
Q
-
 
R
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
M
D
 
R
N
 
Y
G
 
G
I
 
L
P
 
Y
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
A
V
 
C
L
 
V
L
 
M
G
 
G
V
 
A
E
 
T
K
 
E
L
 
V
V
 
A
Q
 
N

Sites not aligning to the query:

8bplA Aspartate transcarbamoylase mutant (n2045c, r2238c) from chaetomium thermophilum cad-like bound to carbamoyl phosphate (see paper)
40% identity, 73% coverage: 88:399/430 of query aligns to 15:316/316 of 8bplA

query
sites
8bplA
K
 
K
P
 
S
Q
 
H
L
 
V
L
 
L
S
 
S
V
 
V
D
 
T
Q
 
Q
F
 
F
S
 
T
R
 
R
D
 
A
S
 
D
V
 
L
E
 
H
A
 
L
L
 
L
F
 
F
R
 
Q
V
 
I
A
 
A
D
 
Q
I
 
E
M
 
M
Q
 
R
P
 
L
I
 
G
A
 
V
R
 
Q
R
 
R
R
 
E
K
 
G
I
 
V
S
 
L
R
 
D
V
 
I
L
 
L
E
 
R
G
 
G
A
 
K
V
 
V
L
 
L
G
 
C
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
S
V
 
A
S
 
S
F
 
F
G
 
D
A
 
A
A
 
A
F
 
M
C
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
R
V
 
T
C
 
I
D
 
P
T
 
I
T
 
Q
G
 
T
F
 
S
T
 
T
F
 
-
S
 
S
S
 
S
M
 
V
A
 
Q
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
Y
 
Q
D
 
D
T
 
T
S
 
L
R
 
R
V
 
T
M
 
L
S
 
A
G
 
C
Y
 
Y
V
 
S
D
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
V
I
 
L
R
|
R
H
 
H
P
 
P
E
 
D
Q
 
E
G
 
K
S
 
C
V
 
V
A
 
D
E
 
V
F
 
A
A
 
K
R
 
K
A
 
Y
T
 
C
N
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
G
D
 
N
G
 
G
P
 
S
G
 
K
E
 
E
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
F
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
R
 
E
E
 
E
F
 
L
S
 
G
R
 
T
L
 
M
G
 
-
K
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
Q
G
 
G
A
 
L
H
 
T
I
 
I
A
 
T
L
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
P
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
V
 
V
K
 
Y
L
 
L
L
 
L
A
 
R
L
 
H
Y
 
Y
R
 
Q
G
 
-
I
 
V
K
 
K
F
 
V
T
 
Q
L
 
L
I
 
V
S
 
S
P
 
P
P
 
K
M
 
A
L
 
L
E
 
R
M
 
L
P
 
P
G
 
P
Y
 
A
I
 
V
I
 
R
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
S
 
V
R
 
D
N
 
A
G
 
G
H
 
Q
V
 
L
I
 
L
E
 
C
Q
 
E
T
 
S
H
 
E
D
 
A
L
 
L
-
 
T
P
 
P
T
 
E
G
 
I
L
 
L
R
 
G
G
 
R
A
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
A
 
C
T
 
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
P
D
 
S
-
 
L
E
 
A
S
 
E
F
 
F
E
 
E
G
 
A
Y
 
V
T
 
K
P
 
D
D
 
S
F
 
Y
Q
 
R
I
 
I
N
 
D
Q
 
Y
A
 
S
L
 
T
V
 
L
D
 
K
S
 
Y
V
 
A
C
 
-
G
 
K
S
 
P
D
 
T
T
 
T
L
 
V
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
D
 
N
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
E
D
 
E
L
 
V
S
 
A
V
 
E
D
 
E
L
 
V
N
 
D
H
 
F
D
 
D
S
 
Q
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
M
D
 
C
N
 
Y
G
 
G
I
 
L
P
 
Y
V
 
C
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
A
V
 
L
L
 
V
L
 
M
G
 
S

6jktA Crystal structure of aspartate transcarbamoylase from trypanosoma cruzi in complex with n-(phosphonacetyl)-l-aspartic acid (pala).
41% identity, 73% coverage: 86:399/430 of query aligns to 13:310/310 of 6jktA

query
sites
6jktA
E
 
K
G
 
G
K
 
K
P
 
-
Q
 
S
L
 
I
L
 
T
S
 
S
V
 
A
D
 
E
Q
 
Q
F
 
F
S
 
S
R
 
R
D
 
A
S
 
D
V
 
I
E
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
I
R
 
H
V
 
L
A
 
A
D
 
S
I
 
A
M
 
M
Q
 
Q
P
 
R
I
 
K
A
 
I
R
 
D
R
 
A
R
 
G
K
 
E
I
 
V
S
 
L
R
 
N
V
 
L
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
A
 
R
V
 
I
L
 
M
G
 
T
N
 
P
L
 
L
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
D
S
|
S
T
x
S
R
|
R
T
|
T
R
 
F
V
 
S
S
 
S
F
 
F
G
 
C
A
 
A
A
 
A
F
 
M
C
 
I
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
C
 
V
D
 
N
T
 
F
T
 
K
G
 
-
F
 
V
T
 
E
F
 
A
S
 
S
S
|
S
M
 
I
A
 
N
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
R
V
 
T
M
 
L
S
 
D
G
 
S
Y
 
Y
V
 
S
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
E
 
R
Q
 
Q
G
 
D
S
 
A
V
 
I
A
 
E
E
 
E
F
 
A
A
 
L
R
 
S
A
 
V
T
 
A
N
 
Q
V
 
H
P
 
P
V
 
I
I
 
L
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
N
G
 
G
P
 
A
G
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
T
Y
 
L
T
 
T
I
 
I
Q
 
H
R
 
S
E
 
E
F
 
L
S
 
G
R
 
S
L
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
-
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
I
H
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
I
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
M
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
V
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
V
L
 
R
Y
 
N
R
 
F
G
 
S
I
 
I
K
 
K
F
 
C
T
 
V
-
 
F
L
 
L
I
 
V
S
 
A
P
 
P
P
 
D
M
 
A
L
 
L
E
 
Q
M
 
M
P
 
P
G
 
Q
Y
 
D
I
 
V
I
 
L
E
 
E
-
 
P
-
 
L
-
 
Q
-
 
H
Q
 
E
I
 
I
S
 
A
R
 
T
N
 
K
G
 
G
H
 
V
V
 
I
I
 
I
E
 
H
Q
 
R
T
 
T
H
 
H
D
 
A
L
 
L
P
 
T
T
 
D
G
 
E
-
 
V
L
 
M
R
 
Q
G
 
K
A
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
A
 
T
T
|
T
R
|
R
I
 
L
Q
|
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
-
D
 
-
E
 
-
S
 
-
F
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
P
 
-
D
 
D
F
 
I
Q
 
T
I
 
I
N
 
D
Q
 
A
A
 
A
L
 
R
V
 
M
D
 
-
S
 
R
V
 
L
C
 
A
G
 
K
S
 
E
D
 
K
T
 
M
L
 
I
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
D
 
N
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
D
D
 
E
L
 
L
S
 
S
V
 
T
D
 
T
L
 
V
N
 
D
H
 
A
D
 
D
S
 
P
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
M
D
 
R
N
 
Y
G
|
G
I
 
M
P
 
F
V
 
M
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
I
F
 
L
A
 
W
V
 
S
L
 
V
L
 
L
G
 
A

6jksD Crystal structure of aspartate transcarbamoylase from trypanosoma cruzi in complex with carbamoyl phosphate (cp) and aspartate (asp)
41% identity, 73% coverage: 86:399/430 of query aligns to 13:328/328 of 6jksD

query
sites
6jksD
E
 
K
G
 
G
K
 
K
P
 
-
Q
 
S
L
 
I
L
 
T
S
 
S
V
 
A
D
 
E
Q
 
Q
F
 
F
S
 
S
R
 
R
D
 
A
S
 
D
V
 
I
E
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
I
R
 
H
V
 
L
A
 
A
D
 
S
I
 
A
M
 
M
Q
 
Q
P
 
R
I
 
K
A
 
I
R
 
D
R
 
A
R
 
G
K
 
E
I
 
V
S
 
L
R
 
N
V
 
L
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
A
 
R
V
 
I
L
 
M
G
 
T
N
 
P
L
 
L
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
D
S
|
S
T
x
S
R
|
R
T
|
T
R
 
F
V
 
S
S
 
S
F
 
F
G
 
C
A
 
A
A
 
A
F
 
M
C
 
I
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
C
 
V
D
 
N
T
 
F
T
 
K
G
 
-
F
 
V
T
 
E
F
 
A
S
 
S
S
 
S
M
 
I
A
 
N
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
R
V
 
T
M
 
L
S
 
D
G
 
S
Y
 
Y
V
 
S
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
E
 
R
Q
 
Q
G
 
D
S
 
A
V
 
I
A
 
E
E
 
E
F
 
A
A
 
L
R
 
S
A
 
V
T
 
A
N
 
Q
V
 
H
P
 
P
V
 
I
I
 
L
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
N
G
 
G
P
 
A
G
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
T
Y
 
L
T
 
T
I
 
I
Q
 
H
R
 
S
E
 
E
F
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
L
G
 
G
K
 
S
I
 
-
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
I
H
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
I
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
M
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
V
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
V
L
 
R
Y
 
N
R
 
F
G
 
S
I
 
I
K
 
K
F
 
C
T
 
V
-
 
F
L
 
L
I
 
V
S
 
A
P
 
P
P
 
D
M
 
A
L
 
L
E
 
Q
M
 
M
P
 
P
G
 
Q
Y
 
D
I
 
V
I
 
L
E
 
E
-
 
P
-
 
L
-
 
Q
-
 
H
Q
 
E
I
 
I
S
 
A
R
 
T
N
 
K
G
 
G
H
 
V
V
 
I
I
 
I
E
 
H
Q
 
R
T
 
T
H
 
H
D
 
A
L
 
L
P
 
T
T
 
D
G
 
E
-
 
V
L
 
M
R
 
Q
G
 
K
A
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
A
 
T
T
|
T
R
|
R
I
 
L
Q
|
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
M
D
 
A
-
 
S
-
 
T
-
 
S
-
 
D
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
L
E
 
Q
S
 
S
F
 
F
E
 
A
G
 
A
Y
 
-
T
 
K
P
 
A
D
 
D
F
 
I
Q
 
T
I
 
I
N
 
D
Q
 
A
A
 
A
L
 
R
V
 
M
D
 
-
S
 
R
V
 
L
C
 
A
G
 
K
S
 
E
D
 
K
T
 
M
L
 
I
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
D
 
N
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
D
D
 
E
L
 
L
S
 
S
V
 
T
D
 
T
L
 
V
N
 
D
H
 
A
D
 
D
S
 
P
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
M
D
 
R
N
 
Y
G
|
G
I
 
M
P
 
F
V
 
M
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
I
F
 
L
A
 
W
V
 
S
L
 
V
L
 
L
G
 
A

7zeaB Crystal structure of truncated aspartate transcarbamoylase from plasmodium falciparum with bound inhibitor o-benzylhydroxylamine (see paper)
33% identity, 80% coverage: 74:418/430 of query aligns to 9:346/346 of 7zeaB

query
sites
7zeaB
V
 
I
D
 
D
S
 
L
Q
 
D
S
 
K
L
 
I
A
 
M
S
 
T
Q
 
K
M
 
M
L
 
-
W
 
-
E
 
-
G
 
K
K
 
N
P
 
K
Q
 
S
L
 
V
L
 
I
S
 
N
V
 
I
D
 
D
Q
 
D
F
 
V
S
 
D
R
 
D
D
 
E
S
 
E
V
 
L
E
 
L
A
 
A
L
 
I
F
 
L
R
 
Y
V
 
T
A
 
S
D
 
K
I
 
Q
M
 
F
Q
 
E
P
 
K
I
 
I
A
 
L
R
 
K
R
 
N
R
 
N
K
 
E
I
 
D
S
 
S
R
 
K
V
 
Y
L
 
L
E
 
E
G
 
N
A
 
K
V
 
V
L
 
F
G
 
C
N
 
S
L
 
V
F
 
F
F
 
L
E
 
E
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
R
V
 
C
S
 
S
F
 
F
G
 
D
A
 
A
A
 
A
F
 
I
C
 
L
R
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
S
S
 
K
V
 
V
C
 
L
D
 
N
T
 
I
T
 
T
G
 
D
F
 
M
T
 
N
F
 
S
S
 
T
S
 
S
M
x
F
A
 
Y
K
 
K
G
 
G
E
|
E
S
 
T
I
 
V
Y
 
E
D
 
D
T
x
A
S
 
F
R
 
K
V
 
I
M
x
L
S
 
S
G
 
T
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
A
 
G
L
 
I
V
 
I
I
 
Y
R
 
R
H
 
D
P
 
P
E
 
S
Q
 
K
G
 
K
S
 
N
V
 
V
A
 
D
E
 
I
F
 
A
A
 
V
R
 
S
A
 
S
T
 
S
N
 
S
V
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
N
G
 
G
P
 
T
G
 
G
E
 
E
H
 
H
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
F
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
Q
 
H
R
 
N
E
 
Y
F
 
F
S
 
P
R
 
F
L
 
I
-
 
L
-
 
D
G
 
R
K
 
N
I
 
I
V
 
N
D
 
K
G
 
K
A
 
L
H
 
N
I
 
I
A
 
A
L
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
V
 
S
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
S
L
 
R
Y
 
Y
R
 
-
G
 
N
I
 
V
K
 
S
F
 
F
T
 
N
L
 
F
I
 
V
S
 
S
P
 
C
P
 
K
M
 
S
L
 
L
E
 
N
M
 
I
P
 
P
G
 
K
Y
 
D
I
 
I
I
 
V
E
 
N
Q
 
T
I
 
I
S
 
T
R
 
Y
N
 
N
-
 
L
-
 
K
-
 
K
-
 
N
-
 
N
-
 
F
-
 
Y
-
 
S
G
 
D
H
 
D
V
 
S
I
 
I
E
 
K
Q
 
Y
T
 
F
H
 
D
D
 
N
L
 
L
P
 
E
T
 
E
G
 
G
L
 
L
R
 
E
G
 
D
A
 
V
D
 
H
V
 
I
V
 
I
Y
 
Y
A
 
M
T
 
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
T
D
 
D
-
 
V
E
 
D
S
 
E
F
 
Y
E
 
N
G
 
Q
Y
 
Y
T
 
K
P
 
N
D
 
A
F
 
F
Q
 
I
I
 
L
N
 
S
Q
 
N
A
 
K
L
 
T
V
 
L
D
 
E
S
 
N
V
 
T
C
 
-
G
 
R
S
 
D
D
 
D
T
 
T
L
 
K
I
 
I
M
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
V
N
 
N
D
 
E
L
 
I
S
 
K
V
 
V
D
 
E
L
 
V
N
 
D
H
 
S
D
 
N
S
 
P
R
 
K
L
 
S
A
 
V
I
 
Y
F
 
F
R
 
T
Q
 
Q
T
 
A
D
 
E
N
 
N
G
 
G
I
 
L
P
 
Y
V
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
Y
V
 
L
L
 
I
L
 
F
G
 
-
V
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
V
 
-
Q
 
-
H
 
-
S
 
S
M
 
S
R
 
T
D
 
S
A
 
S
A
 
A
W
 
W
R
 
S
P
 
H
P
 
P
A
 
Q
Y
 
F

7zidB Crystal structure of truncated aspartate transcarbamoylase from plasmodium falciparum in complex with bda-14 (see paper)
35% identity, 72% coverage: 91:399/430 of query aligns to 14:326/331 of 7zidB

query
sites
7zidB
L
 
V
L
 
I
S
 
N
V
 
I
D
 
D
Q
 
D
F
 
V
S
 
D
R
 
D
D
 
E
S
 
E
V
 
L
E
 
L
A
 
A
L
 
I
F
 
L
R
 
Y
V
 
T
A
 
S
D
 
K
I
 
Q
M
 
F
Q
 
E
P
 
K
I
 
I
A
 
L
R
 
K
R
 
N
R
 
N
K
 
E
I
 
D
S
 
S
R
 
K
V
 
Y
L
 
L
E
 
E
G
 
N
A
 
K
V
 
V
L
 
F
G
 
C
N
 
S
L
 
V
F
 
F
F
 
L
E
 
E
A
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
C
S
 
S
F
 
F
G
 
D
A
 
A
A
 
A
F
 
I
C
 
L
R
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
S
S
 
K
V
 
V
C
 
L
D
 
N
T
 
I
T
 
T
G
 
D
F
 
M
T
 
N
F
 
S
S
 
T
S
 
S
M
 
F
A
 
Y
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
V
Y
 
E
D
 
D
T
 
A
S
 
F
R
 
K
V
 
I
M
 
L
S
 
S
G
 
T
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
A
 
G
L
 
I
V
 
I
I
 
Y
R
 
R
H
 
D
P
 
P
E
 
S
Q
 
K
G
 
K
S
 
N
V
 
V
A
 
D
E
 
I
F
 
A
A
 
V
R
 
S
A
 
S
T
 
S
N
 
S
V
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
N
G
 
G
P
 
T
G
 
G
E
 
E
H
 
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
F
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
Q
 
H
R
 
N
E
 
Y
F
 
F
S
 
P
R
 
F
L
 
I
-
 
L
-
 
D
G
 
R
K
 
N
I
 
I
V
 
N
D
 
K
G
 
K
A
 
L
H
 
N
I
 
I
A
 
A
L
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
V
 
S
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
S
L
 
R
Y
 
Y
R
 
-
G
 
N
I
 
V
K
 
S
F
 
F
T
 
N
L
 
F
I
 
V
S
 
S
P
 
C
P
 
K
M
 
S
L
 
L
E
 
N
M
 
I
P
 
P
G
 
K
Y
 
D
I
 
I
I
 
V
E
 
N
Q
 
T
I
 
I
S
 
T
R
 
Y
N
 
N
-
 
L
-
 
K
-
 
K
-
 
N
-
 
N
-
 
F
-
 
Y
-
 
S
G
 
D
H
 
D
V
 
S
I
 
I
E
 
K
Q
 
Y
T
 
F
H
 
D
D
 
N
L
 
L
P
 
E
T
 
E
G
 
G
L
 
L
R
 
E
G
 
D
A
 
V
D
 
H
V
 
I
V
 
I
Y
 
Y
A
 
M
T
 
T
R
|
R
I
 
I
Q
|
Q
K
 
K
E
|
E
R
 
R
F
 
F
T
 
T
D
 
D
-
 
V
E
 
D
S
 
E
F
 
Y
E
 
N
G
 
Q
Y
 
Y
T
 
K
P
 
N
D
 
A
F
 
F
Q
 
I
I
 
L
N
 
S
Q
 
N
A
 
K
L
 
T
V
 
L
D
 
E
S
 
N
V
 
T
C
 
-
G
 
R
S
 
D
D
 
D
T
 
T
L
 
K
I
 
I
M
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
V
N
 
N
D
 
E
L
 
I
S
 
K
V
 
V
D
 
E
L
 
V
N
 
D
H
 
S
D
 
N
S
 
P
R
 
K
L
 
S
A
 
V
I
 
Y
F
 
F
R
 
T
Q
 
Q
T
 
A
D
 
E
N
 
N
G
 
G
I
 
L
P
 
Y
V
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
Y
V
 
L
L
 
I
L
 
F
G
 
S

Query Sequence

>H281DRAFT_01493 H281DRAFT_01493 aspartate carbamoyltransferase
MSVPQQAFLRDAMRRLNMTRETFAGRIGVSRRALDTWLLPDDSQESRAMPEIVERFVSEI
VVHGEPGDRYTQSVDSQSLASQMLWEGKPQLLSVDQFSRDSVEALFRVADIMQPIARRRK
ISRVLEGAVLGNLFFEASTRTRVSFGAAFCRLGGSVCDTTGFTFSSMAKGESIYDTSRVM
SGYVDALVIRHPEQGSVAEFARATNVPVINGGDGPGEHPSQALLDLYTIQREFSRLGKIV
DGAHIALVGDLKYGRTVHSLVKLLALYRGIKFTLISPPMLEMPGYIIEQISRNGHVIEQT
HDLPTGLRGADVVYATRIQKERFTDESFEGYTPDFQINQALVDSVCGSDTLIMHPLPRDS
RPGANDLSVDLNHDSRLAIFRQTDNGIPVRMAIFAVLLGVEKLVQHSMRDAAWRPPAYLG
PDDAVFHGID

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory