SitesBLAST

SitesBLAST – Find functional sites

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_01518 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_01518 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q8FHC7 D-galactonate dehydratase family member RspA; D-mannonate dehydratase; Starvation sensing protein RspA homolog; EC 4.2.1.-; EC 4.2.1.8 from Escherichia coli O6:H1 (strain CFT073 / ATCC 700928 / UPEC) (see paper)
78% identity, 100% coverage: 1:402/402 of query aligns to 12:415/415 of Q8FHC7

query
sites
Q8FHC7

M

M

K

K

I

I

V

V

R

K

A

A

D

E

V

V

I

F

V

V

T

T

C

C

P

P

G

G

R

R

N

N

F

F

V

V

T

T

L

L

K

K

I

I

V

T

T

T

D

E

E

D

G

G

V

I

H

T

G

G

I

L

G

G

D

D

A

A

T

T

L

L

N

N

G

G

R

R

E

E

L

L

A

S

V

V

A

A

S

S

Y

Y

L

L

K

Q

D

D

H

H

V

L

C

C

P

P

L

Q

L

L

I

I

G

G

R

R

D

D

P

A

G

H

R

R

I

I

E

E

D

D

T

I

W

W

Q

Q

Y

F

L

F

Y

Y

K

K

G

G

A

A

Y

Y

W

W

R

R

G

G

P

P

V

V

T

T

M

M

T

S

A

A

I

I

A

S

A

A

V

V

D

D

M

M

A

A

L

L

W

W

D

D

I

I

L

K

G

A

K

K

V

A

T

A

G

N

M

M

P

P

L

L

Y

Y

K

Q

L

L

G

G

A

A

S

S

R

R

E

E

G

G

V

V

M

M

V

V

Y

Y

G

C

H

H

A

T

T

T

G

G

R

H

D

S

I

I

P

D

E

E

A

A

L

L

D

D

R

D

Y

Y

A

A

E

R

H

H

I

Q

E

E

A

L

G

G

Y

F

Q

K

A

A

I

I

R

R

I

V

Q

Q

C

C

G

G

V

I

P

P

N

G

M

M

R

K

S

T

V

T

Y

Y

G

G

V

M

S

S

K

K

G

G

S

K

G

G

M

L

-

A

Y

Y

E

E

P

P

A

A

T

T

K

K

G

G

A

Q

-

W

V

P

E

E

Q

Q

S

L

W

W

S

S

S

T

E

E

K

K

Y

Y

L

L

D

D

F

F

V

M

P

P

K

K

L

L

F

F

E

D

A

A

V

V

R

R

E

N

K

K

F

F

G

G

F

F

D

D

T

E

H

H

L

L

H

H

D
|
D

V

M

H

H

R

R

L

L

T

T

P

P

I

I

E

E

A

A

R

R

L

F

G

G

K

K

S

S

V

I

E

E

P

D

Y

Y

R

R

L

M

F

F

W

W

M

M

E
|
E

D
|
D

P

P

T

T

P

P

A

A

E

E

N

N

Q

Q

A

E

G

C

F

F

R

R

L

L

I

I

R

R

E

Q

H

H

T

T

V

V

T

T

P

P

I

I

A

A

V

V

G

G

E
|
E

V

V

F

F

N

N

S

S

I

I

W

W

D

D

C

C

K

K

Q

Q

L

L

I

I

E

E

Q

Q

L

L

I

I

D

D

Y

Y

I

I

R

R

A

T

T

T

L

L

T

T

H

H

A

A

G

G

I

I

S

T

H

G

L

M

R

R

I

I

A

A

D

D

F

F

A

A

S

S

L

L

Y

Y

Q

Q

V

V

R

R

T

T

G

G

C

S

H

H

G

G

P

P

S

S

D

D

L

L

S

S

P

P

V

V

C

C

M

M

G

A

A

A

L

L

H

H

F

F

D

D

L

L

W

W

V

V

P

P

N

N

F

F

G

G

V

V

Q

Q

E

E

Y

Y

M

M

G

G

F

Y

P

S

E

E

E

Q

A

M

L

L

E

E

V

V

F

F

P

P

H

H

A

N

W

W

R

T

F

F

D

D

H

N

G

G

M

Y

M

M

H

H

P

P

G

G

D

E

A

K

P

P

G

G

H

L

G

G

V

I

D

E

I

F

D

D

E

E

A

K

A

L

A

A

R

K

F

Y

P

P

Y

Y

D

E

P

P

A

A

Y

Y

L

L

P

P

V

V

A

A

R

R

L

L

E

E

D

D

G

G

T

T

L

L

W

W

S

N

W

W

D223 (= D210) binding
E249 (= E236) binding
D250 (= D237) binding
E275 (= E262) binding

4il2B Crystal structure of d-mannonate dehydratase (rspa) from e. Coli cft073 (efi target efi-501585)
78% identity, 100% coverage: 1:402/402 of query aligns to 1:404/404 of 4il2B

query
sites
4il2B

M

M

K

K

I

I

V

V

R

K

A

A

D

E

V

V

I

F

V

V

T

T

C

C

P

P

G

G

R

R

N

N

F

F

V

V

T

T

L

L

K

K

I

I

V

T

T

T

D

E

E

D

G

G

V

I

H

T

G

G

I

L

G

G

D

D

A

A

T

T

L
|
L

N

N

G
|
G

R

R

E

E

L

L

A

S

V

V

A

A

S

S

Y

Y

L

L

K

Q

D

D

H

H

V

L

C

C

P

P

L

Q

L

L

I

I

G

G

R

R

D

D

P

A

G

H

R

R

I

I

E

E

D

D

T

I

W

W

Q

Q

Y

F

L

F

Y

Y

K

K

G

G

A

A

Y

Y

W
|
W

R

R

G

G

P

P

V

V

T

T

M

M

T

S

A

A

I

I

A

S

A

A

V

V

D

D

M

M

A

A

L

L

W

W

D

D

I

I

L

K

G

A

K

K

V

A

T

A

G

N

M

M

P

P

L

L

Y

Y

K

Q

L

L

G

G

A

A

S

S

R

R

E

E

G

G

V

V

M

M

V

V

Y

Y

G

C

H

H

A

T

T

T

G

G

R

H

D

S

I

I

P

D

E

E

A

A

L

L

D

D

R

D

Y

Y

A

A

E

R

H

H

I

Q

E

E

A

L

G

G

Y

F

Q

K

A

A

I

I

R
|
R

I

V

Q
|
Q

C

C

G

G

V

I

P

P

N

G

M

M

R

K

S

T

V

T

Y
|
Y

G

G

V

M

S

S

K

K

G

G

S

K

G

G

M

L

-

A

Y

Y

E

E

P

P

A

A

T

T

K

K

G

G

A

Q

-

W

V

P

E

E

Q

Q

S

L

W

W

S

S

S

T

E

E

K

K

Y

Y

L

L

D

D

F

F

V

M

P

P

K

K

L

L

F

F

E

D

A

A

V

V

R

R

E

N

K

K

F

F

G

G

F

F

D

D

T

E

H

H

L

L

H

H

D
|
D

V

M

H
|
H

H

H

R

R

L

L

T

T

P

P

I

I

E

E

A

A

R

R

L

F

G

G

K

K

S

S

V

I

E

E

P

D

Y

Y

R

R

L

M

F

F

W

W

M

M

E
|
E

D
|
D

P

P

T

T

P

P

A

A

E

E

N

N

Q

Q

A

E

G

C

F

F

R

R

L

L

I

I

R

R

E

Q

H

H

T

T

V

V

T

T

P

P

I

I

A

A

V

V

G
|
G

E
|
E

V

V

F

F

N

N

S

S

I

I

W

W

D

D

C

C

K

K

Q

Q

L

L

I

I

E

E

Q

Q

L

L

I

I

D

D

Y

Y

I

I

R
|
R

A

T

T
|
T

L

L

T

T

H

H

A

A

G

G

I

I

S

T

H

G

L

M

R

R

I

I

A

A

D

D

F

F

A

A

S

S

L

L

Y

Y

Q

Q

V

V

R

R

T

T

G

G

C

S

H
|
H

G

G

P

P

S

S

D

D

L

L

S

S

P

P

V

V

C

C

M

M

G

A

A

A

L

L

H

H

F

F

D

D

L

L

W

W

V

V

P

P

N

N

F

F

G

G

V

V

Q

Q

E
|
E

Y

Y

M

M

G

G

F

Y

P

S

E

E

E

Q

A

M

L

L

E

E

V

V

F

F

P

P

H

H

A

N

W

W

R

T

F

F

D

D

H

N

G

G

M

Y

M

M

H

H

P

P

G

G

D

E

A

K

P

P

G

G

H

L

G

G

V

I

D

E

I

F

D

D

E

E

A

K

A

L

A

A

R

K

F

Y

P

P

Y

Y

D

E

P

P

A

A

Y

Y

L

L

P

P

V

V

A

A

R

R

L

L

E

E

D

D

G

G

T

T

L

L

W

W

S

N

W
|
W

active site: L36 (= L36), G38 (= G38), W76 (= W76), R147 (= R147), Q149 (= Q149), Y159 (= Y159), D212 (= D210), H214 (= H212), E238 (= E236), G263 (= G261), E264 (= E262), R285 (= R283), T287 (= T285), H314 (= H312), E341 (= E339), W404 (= W402)
binding magnesium ion: D212 (= D210), E238 (= E236), D239 (= D237), E264 (= E262)

C6D9S0 D-galactonate dehydratase family member PC1_0802; D-mannonate dehydratase; EC 4.2.1.-; EC 4.2.1.8 from Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum (strain PC1) (see paper)
78% identity, 100% coverage: 1:402/402 of query aligns to 1:404/404 of C6D9S0

query
sites
C6D9S0

M

M

K

K

I

I

V

V

R

S

A

A

D

E

V

V

I

F

V

V

T

T

C

C

P

P

G

G

R

R

N

N

F

F

V

V

T

T

L

L

K

K

I

I

V

T

T

T

D

D

E

S

G

G

V

L

H

T

G

G

I

L

G

G

D

D

A

A

T

T

L

L

N

N

G

G

R

R

E

E

L

L

A

P

V

V

A

A

S

S

Y

Y

L

L

K

N

D

D

H

H

V

V

C

C

P

P

L

Q

L

L

I

I

G

G

R

R

D

D

P

A

G

H

R

Q

I

I

E

E

D

D

T

I

W

W

Q

Q

Y

Y

L

F

Y

Y

K

K

G

G

A

A

Y

Y

W

W

R

R

G

G

P

P

V

V

T

T

M

M

T

S

A

A

I

I

A

S

A

A

V

V

D

D

M

M

A

A

L

L

W

W

D

D

I

I

L

K

G

A

K

K

V

A

T

A

G

N

M

M

P

P

L

L

Y

Y

K

Q

L

L

G

G

A

A

S

S

R

R

E

T

G

G

V

V

M

M

V

V

Y

Y

G

C

H

H

A

T

T

T

G

G

R

H

D

S

I

I

P

D

E

E

A

V

L

L

D

D

R

D

Y

Y

A

A

E

K

H

H

I

R

E

D

A

Q

G

G

Y

F

Q

K

A

A

I

I

R

R

I

V

Q

Q

C

C

G

G

V

V

P

P

N

G

M

M

R

E

S

T

V

T

Y

Y

G

G

V

M

S

A

K

K

G

G

S

K

G

G

M

L

-

A

Y

Y

E

E

P

P

A

A

T

T

K

K

G

G

A

S

V

L

-

P

E

E

Q

Q

S

L

W

W

S

S

S

T

E

E

K

K

Y

Y

L

L

D

D

F

F

V

T

P

P

K

K

L

L

F

F

E

E

A

A

V

V

R

R

E

D

K

K

F

F

G

G

F

F

D

N

T

E

H

H

L

L

H

H

D
|
D

V

M

H

H

R

R

L

L

T

T

P

P

I

I

E

E

A

A

R

R

L

F

G

G

K

K

S

S

V

V

E

E

P

D

Y

Y

R

R

L

L

F

F

W

W

M

M

E
|
E

D

D

P

P

T

T

P

P

A

A

E

E

N

N

Q

Q

A

A

G

C

F

F

R

R

L

L

I

I

R

R

E

Q

H

H

T

T

V

V

T

T

P

P

I

I

A

A

V

V

G

G

E
|
E

V

V

F

F

N

N

S

S

I

I

W

W

D

D

C

C

K

K

Q

Q

L

L

I

I

E

E

Q

Q

L

L

I

I

D

D

Y

Y

I

I

R

R

A

T

T

T

L

I

T

T

H

H

A

A

G

G

I

I

S

T

H

G

L

M

R

R

I

I

A

A

D

D

F

F

A

A

S

S

L

L

Y

Y

Q

Q

V

V

R

R

T

T

G

G

C

S

H

H

G

G

P

P

S

S

D

D

L

L

S

S

P

P

V

I

C

C

M

M

G

A

A

A

L

L

H

H

F

F

D

D

L

L

W

W

V

V

P

P

N

N

F

F

G

G

V

V

Q

Q

E

E

Y

Y

M

M

G

G

F

Y

P

S

E

E

E

Q

A

M

L

L

E

E

V

V

F

F

P

P

H

H

A

S

W

W

R

T

F

F

D

D

H

N

G

G

M

Y

M

M

H

H

P

P

G

G

D

E

A

K

P

P

G

G

H

L

G

G

V

I

D

E

I

F

D

D

E

E

A

K

A

L

A

A

R

K

F

Y

P

P

Y

Y

D

D

P

P

A

A

Y

Y

L

L

P

P

V

V

A

A

R

R

L

L

E

E

D

D

G

G

T

T

L

L

W

W

S

N

W

W

D212 (= D210) binding
E238 (= E236) binding
E264 (= E262) binding

4e4fB Crystal structure of enolase pc1_0802 (target efi-502240) from pectobacterium carotovorum subsp. Carotovorum pc1
75% identity, 100% coverage: 1:402/402 of query aligns to 2:381/381 of 4e4fB

query
sites
4e4fB

M

M

K

K

I

I

V

V

R

S

A

A

D

E

V

V

I

F

V

V

T

T

C

C

P

P

G

G

R

R

N

N

F

F

V

V

T

T

L

L

K

K

I

I

V

T

T

T

D

D

E

S

G

G

V

L

H

T

G

G

I

L

G

G

D

D

A

A

T

T

L
|
L

N

N

G

G

R
|
R

E

E

L

L

A

P

V

V

A

A

S

S

Y

Y

L

L

K

N

D

D

H

H

V

V

C

C

P

P

L

Q

L

L

I

I

G

G

R

R

D

D

P

A

G

H

R

Q

I

I

E

E

D

D

T

I

W

W

Q

Q

Y

Y

L

F

Y

Y

K

K

G

G

A

A

Y

Y

W

W

R

R

G

G

P

P

V

V

T

T

M

M

T

S

A

A

I

I

A

S

A

A

V

V

D

D

M

M

A

A

L

L

W

W

D

D

I

I

L

K

G

A

K

K

V

A

T

A

G

N

M

M

P

P

L

L

Y

Y

K

Q

L

L

G

G

A

A

S

S

R

R

E

T

G

G

V

V

M

M

V

V

Y

Y

G

C

H

H

A

T

T

T

G

G

R

H

D

S

I

I

P

D

E

E

A

V

L

L

D

D

R

D

Y

Y

A

A

E

K

H

H

I

R

E

D

A

Q

G

G

Y

F

Q

K

A

A

I

I

R
|
R

I

V

Q
|
Q

C

C

G

G

V

-

P

-

N

-

M

-

R

-

S

-

V

-

Y

-

G

-

V

-

S

-

K

-

G

-

S

-

G

-

M

-

Y

-

E

-

P

-

A

-

T

-

K

-

G

S

A

L

V

P

E

E

Q

Q

S

L

W

W

S

S

S

T

E

E

K

K

Y

Y

L

L

D

D

F

F

V

T

P

P

K

K

L

L

F

F

E

E

A

A

V

V

R

R

E

D

K

K

F

F

G

G

F

F

D

N

T

E

H

H

L

L

H

H

D
|
D

V

M

H
|
H

H

H

R

R

L

L

T

T

P

P

I

I

E

E

A

A

R

R

L

F

G

G

K

K

S

S

V

V

E

E

P

D

Y

Y

R

R

L

L

F

F

W

W

M

M

E
|
E

D

D

P

P

T

T

P

P

A

A

E

E

N

N

Q

Q

A

A

G

C

F

F

R

R

L

L

I

I

R

R

E

Q

H

H

T

T

V

V

T

T

P

P

I

I

A

A

V

V

G
|
G

E
|
E

V
|
V

F

F

N

N

S

S

I

I

W

W

D

D

C

C

K

K

Q

Q

L

L

I

I

E

E

Q

Q

L

L

I

I

D

D

Y

Y

I

I

R
|
R

A

T

T
|
T

L

I

T

T

H

H

A

A

G

G

I

I

S

T

H

G

L

M

R

R

I

I

A

A

D

D

F

F

A

A

S

S

L

L

Y

Y

Q

Q

V

V

R

R

T

T

G

G

C

S

H
|
H

G

G

P
|
P

S

S

D

D

L

L

S

S

P

P

V

I

C

C

M

M

G

A

A

A

L

L

H

H

F

F

D

D

L

L

W

W

V

V

P

P

N

N

F

F

G

G

V

V

Q

Q

E
|
E

Y

Y

M

M

G

G

F

Y

P

S

E

E

E

Q

A

M

L

L

E

E

V

V

F

F

P

P

H

H

A

S

W

W

R

T

F

F

D

D

H

N

G

G

M

Y

M

M

H

H

P

P

G

G

D

E

A

K

P

P

G

G

H

L

G

G

V

I

D

E

I

F

D

D

E

E

A

K

A

L

A

A

R

K

F

Y

P

P

Y

Y

D

D

P

P

A

A

Y

Y

L

L

P

P

V

V

A

A

R

R

L

L

E

E

D

D

G

G

T

T

L

L

W

W

S

N

W
|
W

active site: L37 (= L36), R40 (= R39), R148 (= R147), Q150 (= Q149), D189 (= D210), H191 (= H212), E215 (= E236), G240 (= G261), E241 (= E262), V242 (= V263), R262 (= R283), T264 (= T285), H291 (= H312), P293 (= P314), E318 (= E339), W381 (= W402)
binding magnesium ion: D189 (= D210), E215 (= E236), E241 (= E262)

3thuA Crystal structure of an enolase from sphingomonas sp. Ska58 (efi target efi-501683) with bound mg
70% identity, 100% coverage: 2:402/402 of query aligns to 5:405/405 of 3thuA

query
sites
3thuA

K

K

I

I

V

I

R

D

A

A

D

K

V

V

I

I

V

I

T

T

C

C

P

P

G

G

R

R

N

N

F

F

V

V

T

T

L

L

K

K

I

I

V

M

T

T

D

D

E

E

G

G

V

V

H

Y

G

G

I

L

G

G

D

D

A

A

T

T

L
|
L

N

N

G

G

R

R

E
|
E

L

L

A

A

V

V

A

A

S

S

Y

Y

L

L

K

T

D

D

H

H

V

V

C

I

P

P

L

C

L

L

I

I

G

G

R

R

D

D

P

A

G

H

R

R

I

I

E

E

D

D

T

L

W

W

Q

Q

Y

Y

L

L

Y

Y

K

K

G

G

A

A

Y

Y

W
|
W

R

R

G

G

P

P

V

V

T

T

M

M

T

T

A

A

I

I

A

A

V

V

D

D

M

M

A

A

L

L

W

W

D

D

I

I

L

K

G

G

K

K

V

I

T

A

G

G

M

L

P

P

L

V

Y

Y

K

Q

L

L

G

G

A

A

S

S

R

R

E

E

G

G

V

V

M

M

V

V

Y

Y

G
|
G

H

H

A

A

T

N

G

G

R

T

D

T

I

I

P

E

E

D

A

T

L

V

D

K

R

V

Y

A

A

L

E

D

H

Y

I

Q

E

A

A

Q

G

G

Y

Y

Q

K

A

A

I

I

R
|
R

I

L

Q
|
Q

C

C

G

G

V

V

P

P

N

G

M

M

R

A

S

S

V

T

Y
|
Y

G

G

V

V

S

S

K

K

G

D

S

K

G

Y

M

F

Y

Y

E

E

P

P

A

A

T

D

K

A

G

D

A

L

V

P

E

T

E

E

Q

N

S

I

W

W

S

N

S

T

E

S

K

K

Y

Y

L

L

D

R

F

I

V

V

P

P

K

E

L

L

F

F

E

K

A

A

V

A

R

R

E

E

K

S

F

L

G

G

F

W

D

D

T

V

H

H

L

L

H

H

D
|
D

V

I

H
|
H

H

H

R

R

L

L

T

T

P

P

I

I

E

E

A

A

A

G

R

R

L

L

G

G

K

Q

S

D

V

L

E

E

P

P

Y

Y

R

R

L

P

F

F

W

W

M

L

E
|
E

D

D

P

A

T

T

P

P

A

A

E

E

N

N

Q

Q

A

E

G

A

F

F

R

R

L

L

I

I

R

R

E

Q

H

H

T

T

V

T

T

A

P

P

I

L

A

A

V

V

G
|
G

E
|
E

V

I

F

F

N

N

S

S

I

I

W

W

D

D

C

A

K

K

Q

D

L

L

I

I

E

Q

E

N

Q

Q

L

L

I

I

D

D

Y

Y

I

I

R
|
R

A

A

T
|
T

L

V

T

V

H

H

A

A

G

G

I

I

S

T

H

H

L

L

R

R

I

I

A

A

D

A

F

L

A

A

S

D

L

L

Y

Y

Q

Q

V

I

R

R

T

T

G

G

C

C

H
|
H

G

G

P

A

S

T

D

D

L

L

S

S

P

P

V

V

C

C

M

M

G

A

A

A

L

L

H

H

F

F

D

D

L

L

W

S

V

V

P

P

N

N

F

F

G

G

V

I

Q

Q

E
|
E

Y

Y

M

M

G

R

F

H

P

M

E

P

E

E

A

T

L

D

E

A

V

V

F

F

P

P

H

H

A

A

W

Y

R

T

F

F

D

A

H

D

G

G

M

M

H

H

P

P

G

G

D

D

A

Q

P

P

G

G

H

L

G

G

V

V

D

D

I

I

D

D

E

E

A

D

A

L

A

A

R

G

F

Y

P

E

Y

Y

D

K

P

R

A

A

Y

F

L

L

P

P

V

V

A

N

R

R

L

L

E

E

D

D

G

G

T

T

L

M

W

F

S

N

W
|
W

active site: L39 (= L36), E43 (= E40), W79 (= W76), G124 (= G121), R150 (= R147), Q152 (= Q149), Y162 (= Y159), D213 (= D210), H215 (= H212), E239 (= E236), G264 (= G261), E265 (= E262), R286 (= R283), T288 (= T285), H315 (= H312), E342 (= E339), W405 (= W402)
binding magnesium ion: D213 (= D210), E239 (= E236), E265 (= E262)

Q1NAJ2 D-mannonate dehydratase; ManD; EC 4.2.1.8 from Sphingomonas sp. (strain SKA58) (see paper)
70% identity, 100% coverage: 2:402/402 of query aligns to 3:403/403 of Q1NAJ2

query
sites
Q1NAJ2

K

K

I

I

V

I

R

D

A

A

D

K

V

V

I

I

V

I

T

T

C

C

P

P

G

G

R

R

N

N

F

F

V

V

T

T

L

L

K

K

I

I

V

M

T

T

D

D

E

E

G

G

V

V

H

Y

G

G

I

L

G

G

D

D

A

A

T

T

L

L

N

N

G

G

R

R

E

E

L

L

A

A

V

V

A

A

S

S

Y

Y

L

L

K

T

D

D

H

H

V

V

C

I

P

P

L

C

L

L

I

I

G

G

R

R

D

D

P

A

G

H

R

R

I

I

E

E

D

D

T

L

W

W

Q

Q

Y

Y

L

L

Y

Y

K

K

G

G

A

A

Y

Y

W

W

R

R

G

G

P

P

V

V

T

T

M

M

T

T

A

A

I

I

A

A

V

V

D

D

M

M

A

A

L

L

W

W

D

D

I

I

L

K

G

G

K

K

V

I

T

A

G

G

M

L

P

P

L

V

Y

Y

K

Q

L

L

G

G

A

A

S

S

R

R

E

E

G

G

V

V

M

M

V

V

Y

Y

G

G

H

H

A

A

T

N

G

G

R

T

D

T

I

I

P

E

E

D

A

T

L

V

D

K

R

V

Y

A

A

L

E

D

H

Y

I

Q

E

A

A

Q

G

G

Y

Y

Q

K

A

A

I

I

R

R

I

L

Q

Q

C

C

G

G

V

V

P

P

N

G

M

M

R

A

S

S

V

T

Y

Y

G

G

V

V

S

S

K

K

G

D

S

K

G

Y

M

F

Y

Y

E

E

P

P

A

A

T

D

K

A

G

D

A

L

V

P

E

T

E

E

Q

N

S

I

W

W

S

N

S

T

E

S

K

K

Y

Y

L

L

D

R

F

I

V

V

P

P

K

E

L

L

F

F

E

K

A

A

V

A

R

R

E

E

K

S

F

L

G

G

F

W

D

D

T

V

H

H

L

L

H

H

D
|
D

V

I

H

H

R

R

L

L

T

T

P

P

I

I

E

E

A

A

A

G

R

R

L

L

G

G

K

Q

S

D

V

L

E

E

P

P

Y

Y

R

R

L

P

F

F

W

W

M

L

E
|
E

D

D

P

A

T

T

P

P

A

A

E

E

N

N

Q

Q

A

E

G

A

F

F

R

R

L

L

I

I

R

R

E

Q

H

H

T

T

V

T

T

A

P

P

I

L

A

A

V

V

G

G

E
|
E

V

I

F

F

N

N

S

S

I

I

W

W

D

D

C

A

K

K

Q

D

L

L

I

I

E

Q

E

N

Q

Q

L

L

I

I

D

D

Y

Y

I

I

R

R

A

A

T

T

L

V

T

V

H

H

A

A

G

G

I

I

S

T

H

H

L

L

R

R

I

I

A

A

D

A

F

L

A

A

S

D

L

L

Y

Y

Q

Q

V

I

R

R

T

T

G

G

C

C

H

H

G

G

P

A

S

T

D

D

L

L

S

S

P

P

V

V

C

C

M

M

G

A

A

A

L

L

H

H

F

F

D

D

L

L

W

S

V

V

P

P

N

N

F

F

G

G

V

I

Q

Q

E

E

Y

Y

M

M

G

R

F

H

P

M

E

P

E

E

A

T

L

D

E

A

V

V

F

F

P

P

H

H

A

A

W

Y

R

T

F

F

D

A

H

D

G

G

M

M

H

H

P

P

G

G

D

D

A

Q

P

P

G

G

H

L

G

G

V

V

D

D

I

I

D

D

E

E

A

D

A

L

A

A

R

G

F

Y

P

E

Y

Y

D

K

P

R

A

A

Y

F

L

L

P

P

V

V

A

N

R

R

L

L

E

E

D

D

G

G

T

T

L

M

W

F

S

N

W

W

D211 (= D210) binding
E237 (= E236) binding
E263 (= E262) binding

Q1QT89 D-galactonate dehydratase family member ManD; D-gluconate dehydratase; D-mannonate dehydratase; EC 4.2.1.-; EC 4.2.1.39; EC 4.2.1.8 from Chromohalobacter salexigens (strain ATCC BAA-138 / DSM 3043 / CIP 106854 / NCIMB 13768 / 1H11) (see paper)
69% identity, 100% coverage: 1:402/402 of query aligns to 1:403/403 of Q1QT89

query
sites
Q1QT89

M

M

K

K

I

I

V

R

R

D

A

A

D

Y

V

T

I

I

V

V

T

T

C

C

P

P

G

G

R

R

N

N

F

F

V

V

T

T

L

L

K

K

I

I

V

V

T

T

D

E

E

S

G

G

V

T

H

H

G

G

I

I

G

G

D

D

A

A

T

T

L

L

N

N

G

G

R

R

E

E

L

M

A

A

V

V

A

A

S

A

Y

Y

L

L

K

D

D

E

H

H

V

V

C

V

P

P

L

A

L

L

I

I

G

G

R

R

D

D

P

A

G

G

R

R

I

I

E

E

D

D

T

T

W

W

Q

Q

Y

Y

L

L

Y

Y

K

R

G

G

A

A

Y

Y

W

W

R

R

G

G

P

P

V

V

T

T

M

M

T

T

A

A

I

I

A

A

V

V

D

D

M

M

A

A

L

L

W

W

D

D

I

I

L

K

G

A

K

K

V

A

T

A

G

G

M

M

P

P

L

L

Y

Y

K

Q

L

L

G

G

A

K

S

S

R

R

E

E

G

R

V

V

M

M

V

T

Y

Y

G

A

H

H

A

C

T

T

G

G

R

Q

D

T

I

I

P

E

E

D

A

C

L

L

D

G

R

E

Y

V

A

A

E

R

H

H

I

V

E

E

A

L

G

G

Y

Y

Q

R

A

A

I

V

R

R

I

V

Q

Q

C

S

G

G

V

V

P

P

N

G

M

I

R

E

S

T

V

T

Y

Y

G

G

V

V

S

A

K

K

G

T

S

P

G

G

-

E

M

R

Y

Y

E

E

P

P

A

A

T

D

K

S

G

S

A

L

V

P

E

A

E

E

Q

H

S

V

W

W

S

S

S

T

E

E

K

K

Y

Y

L

L

D

N

F

H

V

A

P

P

K

K

L

L

F

F

E

A

A

A

V

V

R

R

E

E

K

R

F

F

G

G

F

D

D

D

T

L

H

H

L

V

L

L

H

H

D
|
D

V

V

H

H

R

R

L

L

T

T

P

P

I

I

E

E

A

A

R

R

L

L

G

G

K

K

S

A

V

V

E

E

P

P

Y

Y

R

H

L

L

F

F

W

W

M

L

E
|
E

D

D

P

C

T

V

P

P

A

A

E

E

N

N

Q

Q

A

E

G

S

F

L

R

R

L

L

I

I

R

R

E

E

H

H

T

T

V

T

T

T

P

P

I

L

A

A

V

I

G

G

E
|
E

V

V

F

F

N

N

S

S

I

I

W

H

D

D

C

C

K

R

Q

E

L

L

I

I

E

Q

E

N

Q

Q

L

W

I

I

D

D

Y

Y

I

I

R

R

A

M

T

P

L

L

T

T

H

H

A

G

G

G

I

I

S

T

H

A

L

M

R

R

I

V

A

A

D

D

F

L

A

A

S

S

L

L

Y

Y

Q

H

V

V

R

R

T

T

G

G

C

F

H
|
H

G

G

P
|
P

S

T

D

D

L

L

S

S

P

P

V

V

C

C

M

L

G

G

A

A

L

I

H

H

F

F

D

D

L

T

W

W

V

V

P

P

N

N

F

F

G

G

V

I

Q

Q

E

E

Y

H

M

M

G

P

F

H

P

T

E

D

E

E

A

T

L

D

E

A

V

V

F

F

P

P

H

H

A

D

W

Y

R

R

F

F

D

E

H

D

G

G

M

H

M

F

H

L

P

A

G

G

D

E

A

S

P

P

G

G

H

H

G

G

V

V

D

D

I

I

D

D

E

E

A

E

A

L

A

A

R

K

F

Y

P

P

Y

Y

D

E

P

R

A

A

Y

S

L

L

P

P

V

V

A

N

R

R

L

L

E

E

D

D

G

G

T

T

L

L

W

W

S

H

W

W

D211 (= D210) binding
E237 (= E236) binding
E263 (= E262) binding
H313 (= H312) mutation to N: Abolishes activity with D-gluconate and D-mannonate.; mutation to Q: Abolishes activity with D-gluconate. No effect on activity with D-mannonate.
P315 (= P314) mutation to A: Strongly increases activity with D-mannonate. Slightly decreases activity with D-gluconate.

4kwsA Crystal structure of d-mannonate dehydratase from chromohalobacter salexigens complexed with mg and glycerol
68% identity, 100% coverage: 1:402/402 of query aligns to 1:397/397 of 4kwsA

query
sites
4kwsA

M

L

K

K

I

I

V

R

R

D

A

A

D

Y

V

T

I

I

V

V

T

T

C

C

P

P

G

G

R

R

N

N

F

F

V

V

T

T

L

L

K

K

I

I

V

V

T

T

D

E

E

S

G

G

V

T

H

H

G

G

I

I

G

G

D

D

A

A

T

T

L

L

N

N

G

G

R

R

E

E

L

M

A

A

V

V

A

A

S

A

Y

Y

L

L

K

D

D

E

H

H

V

V

C

V

P

P

L

A

L

L

I

I

G

G

R

R

D

D

P

A

G

G

R

R

I

I

E

E

D

D

T

T

W

W

Q

Q

Y

Y

L

L

Y

Y

K

R

G

G

A

A

Y

Y

W

W

R

R

G

G

P

P

V

V

T

T

M

M

T

T

A

A

I

I

A

A

V

V

D

D

M

M

A

A

L

L

W

W

D

D

I

I

L

K

G

A

K

K

V

A

T

A

G

G

M

M

P

P

L

L

Y

Y

K

Q

L

L

G

G

A

K

S

S

R

R

E

E

G

R

V

V

M

M

V

T

Y

Y

G

A

H
|
H

A

C

T

T

G

G

R

Q

D

T

I

I

P

E

E

D

A

C

L

L

D

G

R

E

Y

V

A

A

E

R

H

H

I

V

E

E

A

L

G

G

Y

Y

Q

R

A

A

I

V

R
|
R

I

V

Q
|
Q

C

S

G

G

V

V

P

P

N

G

M

I

R

E

S

T

V

T

Y
|
Y

G

G

V

V

S

A

K

-

G

-

S

-

G

-

M

-

Y

Y

E

E

P

P

A

A

T

D

K

S

G

S

A

L

V

P

E

A

E

E

Q

H

S

V

W

W

S

S

S

T

E

E

K

K

Y

Y

L

L

D

N

F

H

V

A

P

P

K

K

L

L

F

F

E

A

A

A

V

V

R

R

E

E

K

R

F

F

G

G

F

D

D

D

T

L

H

H

L

V

L

L

H

H

D
|
D

V

V

H
|
H

H

H

R

R

L

L

T

T

P

P

I

I

E

E

A

A

R

R

L

L

G

G

K

K

S

A

V

V

E

E

P

P

Y

Y

R

H

L

L

F

F

W

W

M

L

E
|
E

D

D

P

C

T

V

P

P

A

A

E

E

N

N

Q

Q

A

E

G

S

F

L

R

R

L

L

I

I

R

R

E

E

H

H

T

T

V

T

T

T

P

P

I

L

A

A

V

I

G
|
G

E
|
E

V

V

F

F

N

N

S

S

I

I

W

H

D

D

C

C

K

R

Q

E

L

L

I

I

E

Q

E

N

Q

Q

L

W

I

I

D

D

Y

Y

I

I

R
|
R

A

M

T
x
P

L

L

T

T

H

H

A

G

G

G

I

I

S

T

H

A

L

M

R

R

I

V

A

A

D

D

F

L

A

A

S

S

L

L

Y

Y

Q

H

V

V

R

R

T

T

G

G

C

F

H
|
H

G
|
G

P

P

S

T

D

D

L

L

S

S

P

P

V

V

C

C

M

L

G

G

A

A

L

I

H

H

F

F

D

D

L

T

W

W

V

V

P

P

N

N

F

F

G

G

V

I

Q

Q

E
|
E

Y

H

M

M

G

P

F

H

P

T

E

D

E

E

A

T

L

D

E

A

V

V

F

F

P

P

H

H

A

D

W

Y

R

R

F

F

D

E

H

D

G

G

M

H

M

F

H

L

P

A

G

G

D

E

A

S

P

P

G

G

H

H

G

G

V

V

D

D

I

I

D

D

E

E

A

E

A

L

A

A

R

K

F

Y

P

P

Y

Y

D

E

P

R

A

A

Y

S

L

L

P

P

V

V

A

N

R

R

L

L

E

E

D

D

G

G

T

T

L

L

W

W

S

H

W
|
W

active site: H122 (= H122), R147 (= R147), Q149 (= Q149), Y159 (= Y159), D205 (= D210), H207 (= H212), E231 (= E236), G256 (= G261), E257 (= E262), R278 (= R283), P280 (≠ T285), H307 (= H312), G308 (= G313), E334 (= E339), W397 (= W402)
binding magnesium ion: D205 (= D210), E231 (= E236), E257 (= E262)

3qkeA Crystal structure of d-mannonate dehydratase from chromohalobacter salexigens complexed with mg and d-gluconate
68% identity, 100% coverage: 1:402/402 of query aligns to 1:397/397 of 3qkeA

query
sites
3qkeA

M

L

K

K

I

I

V

R

R

D

A

A

D

Y

V

T

I

I

V

V

T

T

C

C

P

P

G

G

R

R

N

N

F

F

V

V

T

T

L

L

K

K

I

I

V

V

T

T

D

E

E

S

G

G

V

T

H

H

G

G

I

I

G

G

D

D

A

A

T

T

L

L

N
|
N

G

G

R

R

E

E

L

M

A

A

V

V

A

A

S

A

Y

Y

L

L

K

D

D

E

H

H

V

V

C

V

P

P

L

A

L

L

I

I

G

G

R

R

D

D

P

A

G

G

R

R

I

I

E

E

D

D

T

T

W

W

Q

Q

Y

Y

L

L

Y

Y

K

R

G

G

A

A

Y

Y

W

W

R

R

G

G

P

P

V

V

T

T

M

M

T

T

A

A

I

I

A

A

V

V

D

D

M

M

A

A

L

L

W

W

D

D

I

I

L

K

G

A

K

K

V

A

T

A

G

G

M

M

P

P

L

L

Y

Y

K

Q

L

L

G

G

A

K

S

S

R

R

E

E

G

R

V

V

M

M

V

T

Y

Y

G

A

H
|
H

A

C

T

T

G

G

R

Q

D

T

I

I

P

E

E

D

A

C

L

L

D

G

R

E

Y

V

A

A

E

R

H

H

I

V

E

E

A

L

G

G

Y

Y

Q

R

A

A

I

V

R
|
R

I

V

Q
|
Q

C

S

G

G

V

V

P

P

N

G

M

I

R

E

S

T

V

T

Y
|
Y

G

G

V

V

S

A

K

-

G

-

S

-

G

-

M

-

Y

Y

E

E

P

P

A

A

T

D

K

S

G

S

A

L

V

P

E

A

E

E

Q

H

S

V

W

W

S

S

S

T

E

E

K

K

Y

Y

L

L

D

N

F

H

V

A

P

P

K

K

L

L

F

F

E

A

A

A

V

V

R

R

E

E

K

R

F

F

G

G

F

D

D

D

T

L

H

H

L

V

L

L

H

H

D
|
D

V

V

H
|
H

H

H

R

R

L

L

T

T

P

P

I

I

E

E

A

A

R

R

L

L

G

G

K

K

S

A

V

V

E

E

P

P

Y

Y

R

H

L

L

F

F

W

W

M

L

E
|
E

D

D

P

C

T

V

P

P

A

A

E

E

N

N

Q

Q

A

E

G

S

F

L

R

R

L

L

I

I

R

R

E

E

H

H

T

T

V

T

T

T

P

P

I

L

A

A

V

I

G
|
G

E
|
E

V

V

F

F

N

N

S

S

I

I

W

H

D

D

C

C

K

R

Q

E

L

L

I

I

E

Q

E

N

Q

Q

L

W

I

I

D

D

Y

Y

I

I

R
|
R

A

M

T
x
P

L

L

T

T

H

H

A

G

G

G

I

I

S

T

H

A

L

M

R

R

I

V

A

A

D

D

F

L

A

A

S

S

L

L

Y

Y

Q

H

V

V

R

R

T

T

G

G

C

F

H
|
H

G
|
G

P
|
P

S

T

D
|
D

L

L

S

S

P

P

V

V

C

C

M

L

G

G

A

A

L

I

H

H

F

F

D

D

L

T

W

W

V

V

P

P

N

N

F

F

G

G

V

I

Q

Q

E
|
E

Y

H

M

M

G

P

F

H

P

T

E

D

E

E

A

T

L

D

E

A

V

V

F

F

P

P

H

H

A

D

W

Y

R

R

F

F

D

E

H

D

G

G

M

H

M

F

H

L

P

A

G

G

D

E

A

S

P

P

G

G

H

H

G

G

V

V

D

D

I

I

D

D

E

E

A

E

A

L

A

A

R

K

F

Y

P

P

Y

Y

D

E

P

R

A

A

Y

S

L

L

P

P

V

V

A

N

R

R

L

L

E

E

D

D

G

G

T

T

L

L

W

W

S

H

W
|
W

active site: H122 (= H122), R147 (= R147), Q149 (= Q149), Y159 (= Y159), D205 (= D210), H207 (= H212), E231 (= E236), G256 (= G261), E257 (= E262), R278 (= R283), P280 (≠ T285), H307 (= H312), G308 (= G313), E334 (= E339), W397 (= W402)
binding D-gluconic acid: N37 (= N37), Y159 (= Y159), D205 (= D210), H207 (= H212), E257 (= E262), H307 (= H312), P309 (= P314), D311 (= D316), E334 (= E339), W397 (= W402)
binding magnesium ion: D205 (= D210), E231 (= E236), E257 (= E262)

B3PDB1 D-galactonate dehydratase family member RspA; D-mannonate dehydratase; Starvation sensing protein RspA homolog; EC 4.2.1.-; EC 4.2.1.8 from Cellvibrio japonicus (strain Ueda107) (Pseudomonas fluorescens subsp. cellulosa) (see paper)
66% identity, 100% coverage: 1:402/402 of query aligns to 1:402/402 of B3PDB1

query
sites
B3PDB1

M

M

K

K

I

I

V

V

R

D

A

A

D

K

V

V

I

I

V

V

T

T

C

C

P

P

G

G

R

R

N

N

F

F

V

V

T

T

L

L

K

K

I

I

V

V

T

T

D

D

E

Q

G

G

V

I

H

Y

G

G

I

I

G

G

D

D

A

A

T

T

L

L

N

N

G

G

R

R

E

E

L

K

A

S

V

V

A

V

S

S

Y

Y

L

L

K

E

D

D

H

Y

V

L

C

I

P

P

L

V

L

L

I

I

G

G

R

R

D

D

P

P

G

Q

R

Q

I

I

E

E

D

D

T

I

W

W

Q

Q

Y

F

L

F

Y

Y

K

R

G

G

A

A

Y

Y

W

W

R

R

G

G

P

P

V

V

T

G

M

M

T

T

A

A

I

L

A

A

V

I

D

D

M

V

A

A

L

L

W

W

D

D

I

I

L

K

G

A

K

K

V

L

T

A

G

N

M

M

P

P

L

L

Y

Y

K

Q

L

L

G

G

A

K

S

S

R

R

E

E

G

R

V

I

M

L

V

S

Y

Y

G

T

H

H

A

A

T

N

G

G

R

K

D

D

I

L

P

D

E

S

A

T

L

L

D

E

R

A

Y

V

A

R

E

K

H

A

I

K

E

D

A

K

G

G

Y

Y

Q

K

A

A

I

I

R

R

I

V

Q

Q

C

C

G

G

V

I

P

P

N

G

M

I

R

A

S

K

V

T

Y

Y

G

G

V

V

S

S

K

T

G

N

S

T

G

K

M

S

Y

Y

E

E

P

P

A

A

T

D

K

A

G

D

A

L

V

P

E

S

E

V

Q

E

S

V

W

W

S

S

S

T

E

E

K

K

Y

Y

L

L

D

N

F

Y

V

I

P

P

K

D

L

V

F

F

E

A

A

A

V

V

R

R

E

K

K

E

F

F

G

G

F

P

D

D

T

I

H

H

L

L

H

H

D
|
D

V

V

H

H

R

R

L

L

T

T

P

P

I

I

E

E

A

A

R

R

L

L

G

G

K

K

S

A

V

L

E

E

P

P

Y

Y

R

H

L

L

F

F

W

W

M

M

E
|
E

D

D

P

A

T

V

P

P

A

A

E

E

N

N

Q

Q

A

E

G

S

F

F

R

K

L

L

I

I

R

R

E

Q

H

H

T

T

V

T

T

T

P

P

I

L

A

A

V

V

G

G

E
|
E

V

V

F

F

N

N

S

S

I

I

W

H

D

D

C

C

K

R

Q

E

L

L

I

I

E

Q

E

N

Q

Q

L

W

I

I

D

D

Y

Y

I

I

R

R

A

T

T

T

L

I

T

V

H

H

A

A

G

G

I

I

S

S

H

Q

L

M

R

R

I

I

A

A

D

D

F

F

A

A

S

S

L

L

Y

F

Q

H

V

V

R

R

T

T

G

G

C

F

H

H

G

G

P

A

S

T

D

D

L

L

S

S

P

P

V

V

C

C

M

M

G

G

A

A

L

L

H

H

F

F

D

D

L

Y

W

W

V

V

P

P

N

N

F

F

G

G

V

I

Q

Q

E

E

Y

H

M

M

G

A

F

H

P

S

E

E

E

Q

A

M

L

N

E

A

V

V

F

F

P

P

H

H

A

A

W

Y

R

T

F

F

D

N

H

D

G

G

M

Y

M

F

H

T

P

P

G

G

D

E

A

K

P

P

G

G

H

H

G

G

V

V

D

D

I

I

D

D

E

E

A

K

A

L

A

A

R

Q

F

Y

P

P

Y

Y

D

K

P

R

A

A

Y

C

L

L

P

P

V

V

A

N

R

R

L

L

E

E

D

D

G

G

T

T

L

L

W

W

S

H

W

W

D210 (= D210) binding
E236 (= E236) binding
E262 (= E262) binding

4fi4A Crystal structure of mannonate dehydratase prk15072 (target efi- 502214) from caulobacter sp. K31
67% identity, 100% coverage: 1:402/402 of query aligns to 6:407/407 of 4fi4A

query
sites
4fi4A

M

L

K

K

I

I

V

I

R

D

A

A

D

K

V

V

I

I

V

V

T

T

C

C

P

P

G

G

R

R

N

N

F

F

V

V

T

T

L

L

K

K

I

I

V

T

T

T

D

S

E

D

G

G

V

V

H

T

G

G

I

V

G

G

D

D

A

A

T

T

L
|
L

N

N

G

G

R
|
R

E

E

L

L

A

A

V

V

A

V

S

S

Y

Y

L

L

K

R

D

D

H

H

V

M

C

I

P

P

L

C

L

L

I

I

G

G

R

R

D

D

P

A

G

H

R

R

I

I

E

E

D

D

T

V

W

W

Q

Q

Y

F

L

F

Y

Y

K

R

G

G

A

S

Y

Y

W

W

R

R

R

G

G

G

P

P

V

V

T

A

M

M

T

T

A

A

I

L

A

A

V

V

D

D

M

M

A

A

L

L

W

W

D

D

I

I

L

K

G

A

K

K

V

L

T

A

G

G

M

M

P

P

L

L

Y

Y

K

Q

L

L

G

G

A

A

S

C

R

R

E

E

G

G

V

V

M

M

V

V

Y

Y

G

G

H
|
H

A

A

T

N

G

G

R

E

D

T

I

I

P

E

E

D

A

T

L

I

D

A

R

E

Y

A

A

R

E

K

H

Y

I

Q

E

A

A

L

G

G

Y

Y

Q

K

A

A

I

I

R
|
R

I

L

Q
|
Q

C

S

G

G

V

V

P

P

N

G

M

L

R

P

S

S

V

T

Y
|
Y

G

G

V

V

S

S

K

G

G

D

S

K

G

M

M

F

Y

Y

E

E

P

P

A

A

T

D

K

G

G

N

A

L

V

P

E

T

E

E

Q

N

S

V

W

W

S
|
S

S

T

E

S

K

K

Y

Y

L

L

D

K

F

H

V

A

P

P

K

K

L

L

F

F

E

E

A

A

V

A

R

R

E

E

K

A

F

L

G

G

F

D

D

D

T

V

H

H

L

L

H

H

D
|
D

V

V

H
|
H

H

H

R

R

L

L

T

T

P

P

I

I

E

E

A

A

A

G

R

R

L

L

G

G

K

K

S

D

V

L

E

E

P

P

Y

Y

R

R

L

L

F

F

W

W

M

L

E
|
E

D

D

P

A

T

V

P

P

A

A

E

E

N

N

Q

Q

A

A

G

G

F

F

R

R

L

L

I

I

R

R

E

Q

H

H

T

T

V

T

T

T

P

P

I

L

A

A

V

V

G
|
G

E
|
E

V
x
I

F

F

N

S

S

H

I

V

W

W

D

D

C

C

K

K

Q

Q

L

L

I

I

E

E

Q

Q

L

L

I

I

D

D

Y

Y

I

L

R
|
R

A

A

T
|
T

L

V

T

L

H

H

A

A

G

G

I

I

S

T

H

N

L

L

R

R

R

K

I

I

A

A

D

A

F

F

A

A

S

D

L

L

Y

H

Q

H

V

V

R

R

T

T

G

G

C
|
C

H
|
H

G
|
G

P
x
A

S

T

D

D

L

L

S

S

P

P

V

I

C

T

M

M

G

A

A

A

L

L

H

H

F

F

D

D

L

L

W

S

V

V

P

S

N

N

F

F

G

G

V

L

Q

Q

E
|
E

Y

Y

M

M

G

R

F

H

P

T

E

P

E

E

A

T

L

D

E

A

V

V

F

F

P

P

H

H

A

A

W

Y

R

S

F

Y

D

K

H

D

G

G

M

M

M

L

H

H

P

P

G

G

D

E

A

A

P

P

G

G

H

L

G

G

V

V

D

D

I

I

D

D

E

E

A

A

A

L

A

A

A

G

R

Q

F

Y

P

P

Y

Y

D

K

P

R

A

A

Y

Y

L

L

P

P

V

V

A

N

R

R

L

L

E

E

D

D

G

G

T

T

L

M

W

Y

S

N

W
|
W

active site: L41 (= L36), R44 (= R39), H127 (= H122), R152 (= R147), Q154 (= Q149), Y164 (= Y159), S187 (= S182), D215 (= D210), H217 (= H212), E241 (= E236), G266 (= G261), E267 (= E262), I268 (≠ V263), R288 (= R283), T290 (= T285), C316 (= C311), H317 (= H312), G318 (= G313), A319 (≠ P314), E344 (= E339), W407 (= W402)
binding magnesium ion: D215 (= D210), E241 (= E236), E267 (= E262)

B0T0B1 D-mannonate dehydratase Caul1427; ManD; EC 4.2.1.8 from Caulobacter sp. (strain K31) (see paper)
67% identity, 100% coverage: 1:402/402 of query aligns to 2:403/403 of B0T0B1

query
sites
B0T0B1

M

L

K

K

I

I

V

I

R

D

A

A

D

K

V

V

I

I

V

V

T

T

C

C

P

P

G

G

R

R

N

N

F

F

V

V

T

T

L

L

K

K

I

I

V

T

T

T

D

S

E

D

G

G

V

V

H

T

G

G

I

V

G

G

D

D

A

A

T

T

L

L

N

N

G

G

R

R

E

E

L

L

A

A

V

V

A

V

S

S

Y

Y

L

L

K

R

D

D

H

H

V

M

C

I

P

P

L

C

L

L

I

I

G

G

R

R

D

D

P

A

G

H

R

R

I

I

E

E

D

D

T

V

W

W

Q

Q

Y

F

L

F

Y

Y

K

R

G
</