SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_01829 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_01829 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4dxvA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with mg and cl ions at 1.80 a resolution
26% identity, 67% coverage: 10:224/319 of query aligns to 1:209/291 of 4dxvA

query
sites
4dxvA
S
 
T
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
I
 
S
V
 
I
P
 
V
V
 
A
M
 
I
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
L
D
 
K
S
 
D
G
 
G
A
 
G
I
 
V
D
 
D
Y
 
W
A
 
K
G
 
S
L
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
E
W
 
W
Y
 
H
L
 
I
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
S
 
T
D
 
N
A
 
S
L
 
I
F
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
G
Q
x
T
S
 
T
S
 
G
E
 
E
M
 
A
Q
 
S
F
 
T
L
 
L
T
 
S
L
 
M
A
 
E
E
 
E
R
 
H
G
 
T
A
 
Q
L
 
V
G
 
I
R
 
K
F
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
R
K
 
V
V
 
A
A
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
-
V
 
I
V
 
I
S
 
A
G
 
G
H
 
T
I
 
G
S
 
A
D
 
N
D
 
S
P
 
T
D
 
R
A
 
E
Q
 
A
A
 
I
E
 
E
E
 
L
L
 
T
N
 
K
V
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
D
T
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
A
 
A
I
 
A
V
 
L
L
 
L
V
 
V
T
|
T
N
 
P
R
 
Y
L
x
Y
D
 
N
-
 
K
P
 
P
A
 
T
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
M
 
L
-
 
Y
Q
 
Q
A
 
H
F
 
Y
A
 
K
A
 
A
N
 
I
L
 
A
K
 
E
R
 
A
L
 
V
L
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
I
L
 
L
Y
|
Y
E
x
N
C
x
V
P
|
P
A
 
G
P
x
R
Y
x
T
R
 
G
R
 
V
L
 
D
L
 
L
S
 
S
D
 
N
D
 
D
E
 
T
L
 
A
K
 
V
L
 
R
C
 
L
I
 
A
D
 
E
T
 
I
G
 
P
R
 
N
F
 
I
I
 
V
M
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
D
V
 
A
S
 
T
C
 
G
D
 
D
L
 
V
A
 
P
T
 
R
V
 
G
K
 
K
R
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
D
L
 
A
A
 
L
Q
 
N
G
 
G
S
 
K
P
 
-
L
 
M
K
 
A
I
 
V
L
 
Y
N
 
S
A
 
G
N
 
D
A
 
D
A
 
E
I
 
T
A
 
A
W
 
W
D
 
E
A
 
L
M
 
M
K
 
L
A
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
D
G
 
G
F
 
N
N
x
I
G
 
S
V
 
V
F
 
T
T
 
A
N
 
N
F
 
I

3u8gA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with oxalic acid at 1.80 a resolution
26% identity, 67% coverage: 10:224/319 of query aligns to 1:209/291 of 3u8gA

query
sites
3u8gA
S
 
T
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
I
 
S
V
 
I
P
 
V
V
x
A
M
 
I
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
L
D
 
K
S
 
D
G
 
G
A
 
G
I
 
V
D
 
D
Y
 
W
A
 
K
G
 
S
L
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
E
W
 
W
Y
 
H
L
 
I
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
S
 
T
D
 
N
A
 
S
L
 
I
F
 
V
A
 
A
V
 
V
A
x
G
Q
x
T
S
x
T
S
 
G
E
 
E
M
 
A
Q
 
S
F
 
T
L
 
L
T
 
S
L
 
M
A
 
E
E
 
E
R
 
H
G
 
T
A
 
Q
L
 
V
G
 
I
R
 
K
F
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
R
K
 
V
V
 
A
A
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
-
V
 
I
V
 
I
S
 
A
G
 
G
H
 
T
I
 
G
S
 
A
D
 
N
D
 
S
P
 
T
D
 
R
A
 
E
Q
 
A
A
 
I
E
 
E
E
 
L
L
 
T
N
 
K
V
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
D
T
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
A
 
A
I
 
A
V
x
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
N
 
P
R
 
Y
L
x
Y
D
 
N
-
 
K
P
 
P
A
 
T
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
M
 
L
-
 
Y
Q
 
Q
A
 
H
F
 
Y
A
 
K
A
 
A
N
 
I
L
 
A
K
 
E
R
 
A
L
 
V
L
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
I
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
P
x
R
Y
 
T
R
 
G
R
 
V
L
 
D
L
 
L
S
 
S
D
 
N
D
 
D
E
 
T
L
 
A
K
 
V
L
 
R
C
 
L
I
 
A
D
 
E
T
 
I
G
 
P
R
 
N
F
 
I
I
 
V
M
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
D
V
 
A
S
 
T
C
 
G
D
 
D
L
 
V
A
 
P
T
 
R
V
 
G
K
 
K
R
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
D
L
 
A
A
 
L
Q
 
N
G
 
G
S
 
K
P
 
-
L
 
M
K
 
A
I
 
V
L
 
Y
N
 
S
A
 
G
N
 
D
A
 
D
A
 
E
I
 
T
A
 
A
W
 
W
D
 
E
A
 
L
M
 
M
K
 
L
A
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
D
G
 
G
F
 
N
N
x
I
G
 
S
V
 
V
F
 
T
T
 
A
N
 
N
F
 
I

3tdfA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 2-ketobutanoic acid at 1.99 a resolution
26% identity, 67% coverage: 10:224/319 of query aligns to 1:209/291 of 3tdfA

query
sites
3tdfA
S
 
T
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
I
 
S
V
 
I
P
 
V
V
x
A
M
 
I
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
L
D
 
K
S
 
D
G
 
G
A
 
G
I
 
V
D
 
D
Y
 
W
A
 
K
G
 
S
L
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
E
W
 
W
Y
 
H
L
 
I
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
S
 
T
D
 
N
A
 
S
L
 
I
F
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
G
Q
x
T
S
x
T
S
 
G
E
 
E
M
 
A
Q
 
S
F
 
T
L
 
L
T
 
S
L
 
M
A
 
E
E
 
E
R
 
H
G
 
T
A
 
Q
L
 
V
G
 
I
R
 
K
F
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
R
K
 
V
V
 
A
A
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
-
V
 
I
V
 
I
S
 
A
G
 
G
H
 
T
I
 
G
S
 
A
D
 
N
D
 
S
P
 
T
D
 
R
A
 
E
Q
 
A
A
 
I
E
 
E
E
 
L
L
 
T
N
 
K
V
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
D
T
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
A
 
A
I
 
A
V
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
N
 
P
R
 
Y
L
x
Y
D
 
N
-
 
K
P
 
P
A
 
T
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
M
 
L
-
 
Y
Q
 
Q
A
 
H
F
 
Y
A
 
K
A
 
A
N
 
I
L
 
A
K
 
E
R
 
A
L
 
V
L
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
I
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
P
x
R
Y
 
T
R
 
G
R
 
V
L
 
D
L
 
L
S
 
S
D
 
N
D
 
D
E
 
T
L
 
A
K
 
V
L
 
R
C
 
L
I
 
A
D
 
E
T
 
I
G
 
P
R
 
N
F
 
I
I
 
V
M
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
D
V
 
A
S
 
T
C
 
G
D
 
D
L
 
V
A
 
P
T
 
R
V
 
G
K
 
K
R
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
D
L
 
A
A
 
L
Q
 
N
G
 
G
S
 
K
P
 
-
L
 
M
K
 
A
I
 
V
L
 
Y
N
 
S
A
 
G
N
 
D
A
 
D
A
 
E
I
 
T
A
 
A
W
 
W
D
 
E
A
 
L
M
 
M
K
 
L
A
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
D
G
 
G
F
 
N
N
x
I
G
 
S
V
 
V
F
 
T
T
 
A
N
 
N
F
 
I

3tceA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 5-hydroxylysine at 2.6 a resolution
26% identity, 67% coverage: 10:224/319 of query aligns to 1:209/291 of 3tceA

query
sites
3tceA
S
 
T
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
I
 
S
V
 
I
P
 
V
V
 
A
M
 
I
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
L
D
 
K
S
 
D
G
 
G
A
 
G
I
 
V
D
 
D
Y
 
W
A
 
K
G
 
S
L
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
E
W
 
W
Y
 
H
L
 
I
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
S
 
T
D
 
N
A
 
S
L
 
I
F
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
G
Q
x
T
S
 
T
S
 
G
E
 
E
M
 
A
Q
x
S
F
 
T
L
|
L
T
 
S
L
 
M
A
 
E
E
 
E
R
x
H
G
 
T
A
 
Q
L
 
V
G
 
I
R
 
K
F
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
R
K
 
V
V
 
A
A
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
-
V
 
I
V
 
I
S
 
A
G
 
G
H
 
T
I
 
G
S
 
A
D
 
N
D
 
S
P
 
T
D
 
R
A
 
E
Q
 
A
A
 
I
E
 
E
E
 
L
L
 
T
N
 
K
V
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
D
T
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
A
 
A
I
 
A
V
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
N
 
P
R
x
Y
L
x
Y
D
 
N
-
 
K
P
 
P
A
 
T
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
M
 
L
-
 
Y
Q
 
Q
A
 
H
F
 
Y
A
 
K
A
 
A
N
 
I
L
 
A
K
 
E
R
 
A
L
 
V
L
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
I
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
P
x
R
Y
 
T
R
 
G
R
 
V
L
 
D
L
 
L
S
 
S
D
 
N
D
 
D
E
 
T
L
 
A
K
 
V
L
 
R
C
 
L
I
 
A
D
 
E
T
 
I
G
 
P
R
 
N
F
 
I
I
 
V
M
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
D
V
 
A
S
 
T
C
 
G
D
 
D
L
 
V
A
 
P
T
 
R
V
 
G
K
 
K
R
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
D
L
 
A
A
 
L
Q
 
N
G
 
G
S
 
K
P
 
-
L
 
M
K
 
A
I
 
V
L
 
Y
N
 
S
A
 
G
N
 
D
A
 
D
A
 
E
I
 
T
A
 
A
W
 
W
D
 
E
A
 
L
M
 
M
K
 
L
A
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
D
G
 
G
F
 
N
N
x
I
G
 
S
V
 
V
F
 
T
T
 
A
N
 
N
F
 
I

3rk8A Crystal structure of the chloride inhibited dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with pyruvate at 1.8 a resolution
26% identity, 67% coverage: 10:224/319 of query aligns to 1:209/291 of 3rk8A

query
sites
3rk8A
S
 
T
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
I
 
S
V
 
I
P
 
V
V
 
A
M
 
I
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
L
D
 
K
S
 
D
G
 
G
A
 
G
I
 
V
D
 
D
Y
 
W
A
 
K
G
 
S
L
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
E
W
 
W
Y
 
H
L
 
I
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
S
 
T
D
 
N
A
 
S
L
 
I
F
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
G
Q
x
T
S
 
T
S
 
G
E
 
E
M
 
A
Q
 
S
F
 
T
L
 
L
T
 
S
L
 
M
A
 
E
E
 
E
R
 
H
G
 
T
A
 
Q
L
 
V
G
 
I
R
 
K
F
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
R
K
 
V
V
 
A
A
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
-
V
 
I
V
 
I
S
 
A
G
 
G
H
 
T
I
 
G
S
 
A
D
 
N
D
 
S
P
 
T
D
 
R
A
 
E
Q
 
A
A
 
I
E
 
E
E
 
L
L
 
T
N
 
K
V
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
D
T
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
A
 
A
I
 
A
V
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
N
 
P
R
 
Y
L
x
Y
D
 
N
-
 
K
P
 
P
A
 
T
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
M
 
L
-
 
Y
Q
 
Q
A
 
H
F
 
Y
A
 
K
A
 
A
N
 
I
L
 
A
K
 
E
R
 
A
L
 
V
L
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
I
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
P
x
R
Y
 
T
R
 
G
R
 
V
L
 
D
L
 
L
S
 
S
D
 
N
D
 
D
E
 
T
L
 
A
K
 
V
L
 
R
C
 
L
I
 
A
D
 
E
T
 
I
G
 
P
R
 
N
F
 
I
I
 
V
M
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
D
V
 
A
S
 
T
C
 
G
D
 
D
L
 
V
A
 
P
T
 
R
V
 
G
K
 
K
R
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
D
L
 
A
A
 
L
Q
 
N
G
 
G
S
 
K
P
 
-
L
 
M
K
 
A
I
 
V
L
 
Y
N
 
S
A
x
G
N
 
D
A
 
D
A
 
E
I
 
T
A
 
A
W
 
W
D
 
E
A
 
L
M
 
M
K
 
L
A
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
D
G
 
G
F
 
N
N
x
I
G
 
S
V
 
V
F
 
T
T
 
A
N
 
N
F
 
I

Sites not aligning to the query:

3pueB Crystal structure of the complex of dhydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with lysine at 2.6a resolution
26% identity, 67% coverage: 10:224/319 of query aligns to 1:209/291 of 3pueB

query
sites
3pueB
S
 
T
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
I
 
S
V
 
I
P
 
V
V
 
A
M
 
I
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
L
D
 
K
S
 
D
G
 
G
A
 
G
I
 
V
D
 
D
Y
 
W
A
 
K
G
 
S
L
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
E
W
 
W
Y
 
H
L
 
I
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
S
 
T
D
 
N
A
 
S
L
 
I
F
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
G
Q
x
T
S
 
T
S
 
G
E
 
E
M
 
A
Q
 
S
F
 
T
L
 
L
T
 
S
L
 
M
A
 
E
E
 
E
R
 
H
G
 
T
A
 
Q
L
 
V
G
 
I
R
 
K
F
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
R
K
 
V
V
 
A
A
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
-
V
 
I
V
 
I
S
 
A
G
 
G
H
 
T
I
 
G
S
 
A
D
 
N
D
 
S
P
 
T
D
 
R
A
 
E
Q
 
A
A
 
I
E
 
E
E
 
L
L
 
T
N
 
K
V
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
D
T
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
A
 
A
I
 
A
V
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
N
 
P
R
 
Y
L
x
Y
D
 
N
-
 
K
P
 
P
A
 
T
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
M
 
L
-
 
Y
Q
 
Q
A
 
H
F
 
Y
A
 
K
A
 
A
N
 
I
L
 
A
K
 
E
R
 
A
L
 
V
L
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
I
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
P
x
R
Y
 
T
R
 
G
R
 
V
L
 
D
L
 
L
S
 
S
D
 
N
D
 
D
E
 
T
L
 
A
K
 
V
L
 
R
C
 
L
I
 
A
D
 
E
T
 
I
G
 
P
R
 
N
F
 
I
I
 
V
M
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
D
V
 
A
S
 
T
C
 
G
D
 
D
L
 
V
A
 
P
T
 
R
V
 
G
K
 
K
R
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
D
L
 
A
A
 
L
Q
 
N
G
 
G
S
 
K
P
 
-
L
 
M
K
 
A
I
 
V
L
 
Y
N
 
S
A
 
G
N
 
D
A
 
D
A
 
E
I
 
T
A
 
A
W
 
W
D
 
E
A
 
L
M
 
M
K
 
L
A
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
D
G
 
G
F
 
N
N
x
I
G
 
S
V
 
V
F
 
T
T
 
A
N
 
N
F
 
I

Sites not aligning to the query:

4pfmA Shewanella benthica dhdps with lysine and pyruvate
27% identity, 70% coverage: 11:232/319 of query aligns to 3:218/295 of 4pfmA

query
sites
4pfmA
I
 
I
E
 
N
G
 
G
I
 
S
V
 
I
P
 
V
V
 
A
M
 
L
L
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
L
D
 
N
D
 
S
S
 
D
G
 
G
A
 
T
I
 
V
D
 
D
Y
 
Y
A
 
T
G
 
S
L
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
E
W
 
Y
Y
 
H
L
 
I
A
 
T
Q
 
E
G
 
G
S
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
I
F
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
G
Q
x
T
S
 
T
S
 
G
E
 
E
M
x
S
Q
x
A
F
 
T
L
|
L
T
 
P
L
 
I
A
 
S
E
 
E
R
x
H
G
 
I
A
 
A
L
 
V
G
 
V
R
 
G
F
 
Q
V
 
T
V
 
V
E
 
K
K
 
F
V
 
A
A
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
-
S
 
-
G
 
G
H
 
G
I
 
N
S
 
G
D
 
A
D
x
N
P
 
A
D
 
T
A
 
A
Q
x
E
A
 
A
E
 
I
E
 
E
L
 
L
N
 
T
V
 
K
A
 
A
A
 
Q
A
 
N
T
 
K
-
 
L
G
 
G
A
 
V
Q
 
A
A
 
A
I
 
M
V
 
L
L
 
G
V
 
V
T
 
T
N
 
P
R
x
Y
L
x
Y
D
 
N
-
 
K
P
 
P
A
 
S
R
 
P
E
 
K
G
 
G
M
 
L
Q
 
I
A
 
A
F
 
H
A
 
Y
A
 
T
N
 
A
L
 
V
K
 
A
R
 
A
L
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
S
S
 
T
D
 
D
L
 
I
P
 
P
L
 
Q
G
 
I
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
P
x
R
Y
 
T
R
 
A
R
 
V
L
 
D
L
 
M
S
 
L
D
 
P
D
 
E
E
 
T
L
 
I
K
 
A
L
 
Q
C
 
L
I
 
V
D
 
E
T
 
V
G
 
P
R
 
N
F
 
I
I
 
I
M
 
G
L
 
V
K
|
K
D
 
D
V
 
A
S
 
T
C
 
G
D
 
D
L
 
V
A
 
A
T
 
R
V
 
V
K
 
K
R
 
Q
R
 
L
V
 
R
A
 
D
L
 
L
A
 
C
Q
 
-
G
 
G
S
 
N
P
 
D
L
 
F
K
 
L
I
 
L
L
 
Y
N
 
S
A
 
G
N
 
D
A
 
D
A
 
A
I
 
T
A
 
A
W
 
R
D
 
E
A
 
F
M
 
L
K
 
T
A
 
L
G
 
G
S
 
G
A
 
D
G
 
G
F
 
V
N
x
I
G
 
S
V
 
V
F
 
A
T
 
N
N
 
N
F
 
I
H
 
V
T
 
P
D
 
K
L
 
L
Y
 
F
K
 
K
W
 
L
L
 
M

4i7wA Agrobacterium tumefaciens dhdps with lysine and pyruvate
29% identity, 44% coverage: 12:150/319 of query aligns to 3:136/294 of 4i7wA

query
sites
4i7wA
E
 
K
G
 
G
I
 
S
V
 
I
P
 
P
V
 
A
M
 
L
L
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
T
D
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
A
I
 
V
D
 
D
Y
 
E
A
 
Q
G
 
A
L
 
F
E
 
A
R
 
A
L
 
H
I
 
V
E
 
E
W
 
W
Y
 
Q
L
 
I
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
S
 
S
D
 
N
A
 
G
L
 
L
F
 
V
A
 
P
V
 
V
A
 
G
Q
x
T
S
 
T
S
 
G
E
 
E
M
x
S
Q
x
P
F
 
T
L
|
L
T
 
S
L
 
H
A
 
D
E
 
E
R
x
H
G
 
K
A
 
R
L
 
V
G
 
V
R
 
E
F
 
L
V
 
C
V
 
I
E
 
E
K
 
V
V
 
A
A
 
A
G
 
K
R
 
R
I
 
V
P
 
P
V
 
-
V
 
V
V
 
I
S
 
A
G
 
G
H
 
A
I
 
G
S
 
S
D
x
N
D
 
N
P
 
T
D
 
D
A
x
E
Q
 
A
A
 
I
E
 
E
E
 
L
L
 
A
N
 
L
V
 
H
A
 
A
A
 
Q
A
 
D
T
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
A
 
A
I
 
L
V
 
L
L
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
P
R
x
Y
L
x
Y
D
 
N
-
 
K
P
 
P
A
 
T
R
 
Q
E
 
K
G
 
G
M
 
L
Q
 
F
A
 
A
F
 
H
A
 
F
A
 
S
N
 
A
L
 
V
K
 
A
R
 
E
L
 
A
L
 
V
A
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
I
G
 
V
L
 
I
Y
|
Y
E
 
N
C
 
I
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Q8UGL3 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) (Agrobacterium tumefaciens (strain C58)) (see paper)
29% identity, 44% coverage: 12:150/319 of query aligns to 3:136/294 of Q8UGL3

query
sites
Q8UGL3
E
 
K
G
 
G
I
 
S
V
 
I
P
 
P
V
 
A
M
 
L
L
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
T
D
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
S
I
 
V
D
 
D
Y
 
E
A
 
K
G
 
A
L
 
F
E
 
A
R
 
A
L
 
H
I
 
V
E
 
E
W
 
W
Y
 
Q
L
 
I
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
S
 
S
D
 
N
A
 
G
L
 
L
F
 
V
A
 
P
V
 
V
A
 
G
Q
 
T
S
x
T
S
 
G
E
 
E
M
 
S
Q
x
P
F
 
T
L
 
L
T
 
S
L
 
H
A
 
D
E
 
E
R
x
H
G
 
K
A
 
R
L
 
V
G
 
V
R
 
E
F
 
L
V
 
C
V
 
I
E
 
E
K
 
V
V
 
A
A
 
A
G
 
K
R
 
R
I
 
V
P
 
P
V
 
-
V
 
V
V
 
I
S
 
A
G
 
G
H
 
A
I
 
G
S
 
S
D
x
N
D
 
N
P
 
T
D
 
D
A
x
E
Q
 
A
A
 
I
E
 
E
E
 
L
L
 
A
N
 
L
V
 
H
A
 
A
A
 
Q
A
 
E
T
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
A
 
A
I
 
L
V
 
L
L
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
P
R
x
Y
L
 
Y
D
 
N
-
 
K
P
 
P
A
 
T
R
 
Q
E
 
K
G
 
G
M
 
L
Q
 
F
A
 
A
F
 
H
A
 
F
A
 
S
N
 
A
L
 
V
K
 
A
R
 
E
L
 
A
L
 
V
A
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
I
G
 
V
L
 
I
Y
 
Y
E
 
N
C
 
I
P
 
P

Sites not aligning to the query:

5c55A Crystal structure of the y138f mutant of c.Glutamicum n- acetylneuraminic acid lyase in complex with pyruvate
26% identity, 56% coverage: 10:188/319 of query aligns to 1:175/307 of 5c55A

query
sites
5c55A
S
 
T
I
 
F
E
 
T
G
 
G
I
 
V
V
 
I
P
 
P
V
x
P
M
 
V
L
 
M
T
 
T
P
 
P
F
 
L
D
 
H
D
 
A
S
 
D
G
 
G
A
 
S
I
 
V
D
 
D
Y
 
V
A
 
E
G
 
S
L
 
L
E
 
R
R
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
D
W
 
H
Y
 
L
L
 
I
A
 
N
Q
 
G
G
 
G
S
 
V
D
 
D
A
 
G
L
 
L
F
 
F
A
 
A
V
 
L
A
 
G
Q
x
S
S
|
S
S
 
G
E
 
E
M
 
A
Q
 
A
F
 
F
L
 
L
T
 
T
L
 
R
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
G
 
K
A
 
L
L
 
A
G
 
L
R
 
T
F
 
T
V
 
I
V
 
I
E
 
E
K
 
H
V
 
T
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
T
V
 
A
S
 
-
G
 
-
H
 
-
I
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
L
 
-
N
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
E
A
 
T
T
 
T
G
 
T
A
 
A
Q
 
R
A
 
V
I
 
I
V
 
E
L
 
L
V
 
V
T
 
E
N
 
D
R
 
A
L
 
L
D
 
E
P
 
A
A
 
G
R
 
A
E
 
E
G
 
G
M
 
L
Q
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
-
 
P
-
 
F
-
x
Y
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
H
-
 
D
-
 
V
-
 
E
-
 
I
-
 
E
A
 
E
N
 
H
L
 
F
K
 
R
R
 
K
L
 
I
L
 
H
A
 
A
R
 
A
L
 
A
P
 
P
S
 
-
D
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
F
L
 
A
Y
x
F
E
 
N
C
 
I
P
 
P
A
 
V
P
x
S
Y
 
V
R
 
H
R
 
S
L
 
N
L
 
L
S
 
N
D
 
P
D
 
V
E
 
M
L
 
L
K
 
L
L
 
T
C
 
L
I
 
A
D
 
K
T
 
D
G
 
G
R
 
V
F
 
L
I
 
A
M
 
G
L
 
T
K
|
K
D
 
D
V
 
S
S
 
S
C
 
G
D
 
N
L
 
D
A
 
G
T
 
A
V
 
I
K
 
R
R
 
S
R
 
L
V
 
I

Sites not aligning to the query:

Q1JUQ0 L-2-keto-3-deoxyarabonate dehydratase; L-KDA dehydratase; 2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase; L-2-keto-3-deoxyarabinonate dehydratase; EC 4.2.1.43 from Azospirillum brasilense (see paper)
42% identity, 23% coverage: 13:85/319 of query aligns to 11:83/309 of Q1JUQ0

query
sites
Q1JUQ0
G
 
G
I
 
I
V
 
F
P
 
P
V
 
V
M
 
V
L
 
P
T
 
T
P
 
T
F
 
F
D
 
A
D
 
D
S
 
T
G
 
G
A
 
E
I
 
L
D
 
D
Y
 
L
A
 
A
G
 
S
L
 
Q
E
 
K
R
 
R
L
 
A
I
 
V
E
 
D
W
 
F
Y
 
M
L
 
I
A
 
D
Q
 
A
G
 
G
S
 
S
D
 
D
A
 
G
L
 
L
F
 
C
A
 
I
V
 
L
A
 
A
Q
 
N
S
 
F
S
 
S
E
 
E
M
 
Q
Q
 
F
F
 
A
L
 
I
T
 
T
L
 
D
A
 
D
E
 
E
R
 
R
G
 
D
A
 
V
L
 
L
G
 
T
R
 
R
F
 
T
V
 
I
V
 
L
E
 
E
K
 
H
V
 
V
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
V
S
 
T

Sites not aligning to the query:

2wpbA Crystal structure of the e192n mutant of e. Coli n-acetylneuraminic acid lyase in complex with pyruvate and the inhibitor (2r,3r)-2,3,4- trihydroxy-n,n-dipropylbutanamide in space group p21 crystal form i (see paper)
27% identity, 55% coverage: 10:186/319 of query aligns to 9:181/302 of 2wpbA

query
sites
2wpbA
S
 
N
I
 
L
E
 
R
G
 
G
I
 
V
V
 
M
P
 
A
V
 
A
M
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
S
 
Q
G
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
D
Y
 
K
A
 
A
G
 
S
L
 
L
E
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
V
E
 
Q
W
 
F
Y
 
N
L
 
I
A
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
S
 
I
D
 
D
A
 
G
L
 
L
F
 
Y
A
 
V
V
 
G
A
 
G
Q
x
S
S
 
T
S
 
G
E
 
E
M
 
A
Q
 
F
F
 
V
L
 
Q
T
 
S
L
 
L
A
 
S
E
 
E
R
 
R
G
 
E
A
 
Q
L
 
V
G
 
L
R
 
E
F
 
I
V
 
V
V
 
A
E
 
E
K
 
E
V
 
A
A
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
P
 
K
V
 
L
V
 
I
V
 
A
S
 
-
G
 
-
H
 
H
I
 
V
S
 
G
D
 
C
D
 
V
P
 
S
D
 
T
A
 
A
Q
 
E
A
 
S
E
 
Q
E
 
Q
L
 
L
N
 
A
V
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
K
-
 
R
T
 
Y
G
 
G
A
 
F
Q
 
D
A
 
A
I
 
V
V
 
S
L
 
A
V
 
V
T
 
T
N
 
P
R
 
F
L
x
Y
D
 
Y
P
 
P
A
 
F
R
 
-
E
 
-
G
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
S
F
 
F
A
 
E
A
 
E
N
 
H
L
 
C
K
 
D
R
 
H
L
 
Y
L
 
R
A
 
A
R
 
I
L
 
I
P
 
D
S
 
S
-
 
A
-
 
D
D
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
M
G
 
V
L
 
V
Y
|
Y
E
 
N
C
 
I
P
 
P
A
 
A
P
x
L
Y
 
S
R
 
G
R
 
V
L
 
K
L
 
L
S
 
T
D
 
L
D
 
D
E
 
Q
L
 
I
K
 
N
L
 
T
C
 
L
I
 
V
D
 
T
T
 
L
G
 
P
R
 
G
F
 
V
I
 
G
M
 
A
L
 
L
K
|
K
D
 
Q
V
 
T
S
 
S
C
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
Y
T
 
Q
V
 
M
K
 
E
R
 
Q

Sites not aligning to the query:

3lbcD D-sialic acid aldolase complexed with l-arabinose
27% identity, 55% coverage: 10:186/319 of query aligns to 4:176/296 of 3lbcD

query
sites
3lbcD
S
 
N
I
 
L
E
 
R
G
 
G
I
 
V
V
 
M
P
 
A
V
 
A
M
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
S
 
Q
G
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
D
Y
 
K
A
 
A
G
 
S
L
 
L
E
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
V
E
 
Q
W
 
F
Y
 
N
L
 
I
A
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
S
 
I
D
 
D
A
 
G
L
 
L
F
 
Y
A
 
V
V
 
G
A
 
G
Q
x
S
S
 
T
S
 
G
E
 
E
M
 
A
Q
 
F
F
 
V
L
 
Q
T
 
S
L
 
L
A
 
S
E
 
E
R
 
R
G
 
E
A
 
Q
L
 
V
G
 
L
R
 
E
F
 
I
V
 
V
V
 
A
E
 
E
K
 
E
V
 
A
A
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
P
 
K
V
 
L
V
 
I
V
 
-
S
 
-
G
 
A
H
 
H
I
 
V
S
 
G
D
 
C
D
 
V
P
 
S
D
 
T
A
 
A
Q
 
E
A
 
S
E
 
Q
E
 
Q
L
 
L
N
 
A
V
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
K
-
 
R
T
 
Y
G
 
G
A
 
F
Q
 
D
A
 
A
I
 
V
V
 
S
L
 
A
V
 
V
T
 
T
N
 
P
R
 
F
L
x
Y
D
 
Y
P
 
P
A
 
F
R
 
-
E
 
-
G
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
S
F
 
F
A
 
E
A
 
E
N
 
H
L
 
C
K
 
D
R
 
H
L
 
Y
L
 
R
A
 
A
R
 
I
L
 
I
P
 
D
S
 
S
-
 
A
-
 
D
D
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
M
G
 
V
L
 
V
Y
|
Y
E
 
N
C
 
I
P
 
P
A
 
A
P
x
L
Y
 
S
R
 
G
R
 
V
L
 
K
L
 
L
S
 
T
D
 
L
D
 
D
E
 
Q
L
 
I
K
 
N
L
 
T
C
 
L
I
 
V
D
 
T
T
 
L
G
 
P
R
 
G
F
 
V
I
 
G
M
 
A
L
 
L
K
|
K
D
 
Q
V
 
T
S
 
S
C
 
G
D
|
D
L
 
L
A
x
Y
T
 
Q
V
 
M
K
 
E
R
 
Q

Sites not aligning to the query:

8u8wA Crystal structure of n-acetylneuraminate lyase (nana) from klebsiella aerogenes (pyruvate and halides bound)
25% identity, 70% coverage: 11:232/319 of query aligns to 6:219/297 of 8u8wA

query
sites
8u8wA
I
 
L
E
 
R
G
 
G
I
 
V
V
 
M
P
 
P
V
x
A
M
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
D
D
 
A
S
 
Q
G
 
Q
A
 
N
I
 
I
D
 
D
Y
 
R
A
 
A
G
 
S
L
 
L
E
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
V
E
 
R
W
 
F
Y
 
N
L
 
I
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
S
 
V
D
 
D
A
 
G
L
 
V
F
 
Y
A
 
V
V
 
G
A
x
G
Q
x
S
S
x
T
S
 
G
E
 
E
M
 
A
Q
 
F
F
 
V
L
 
Q
T
 
S
L
 
L
A
 
S
E
 
E
R
 
R
G
 
E
A
 
E
L
 
V
G
 
L
R
 
E
F
 
I
V
 
V
V
 
A
E
 
E
K
 
E
V
 
A
A
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
P
 
T
V
 
L
V
 
I
V
 
-
S
 
-
G
 
A
H
 
H
I
 
V
S
 
G
D
 
C
D
 
V
P
 
S
D
 
T
A
 
A
Q
 
E
A
 
S
E
 
Q
E
 
Q
L
 
L
N
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
K
-
 
R
T
 
Y
G
 
G
A
 
F
Q
 
D
A
 
A
I
 
V
V
 
S
L
 
A
V
 
V
T
 
T
N
 
P
R
 
F
L
 
Y
D
 
Y
P
 
P
A
 
F
R
 
-
E
 
-
G
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
S
F
 
F
A
 
E
A
 
E
N
 
H
L
 
C
K
 
D
R
 
H
L
 
Y
L
 
R
A
 
A
R
 
I
L
 
I
P
 
D
S
 
S
-
 
A
-
 
D
D
 
G
L
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
V
L
 
V
Y
|
Y
E
 
N
C
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
Y
 
S
R
 
G
R
 
V
L
 
K
L
 
L
S
 
T
D
 
L
D
 
E
E
 
Q
L
 
I
K
 
N
L
 
Q
C
 
L
I
 
V
D
 
T
T
 
L
G
 
P
R
 
G
F
 
V
I
 
G
M
 
A
L
 
L
K
|
K
D
 
Q
V
 
T
S
 
S
C
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
Y
T
 
Q
V
 
M
K
 
E
R
 
Q
R
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
I
A
 
R
Q
 
R
G
 
A
S
 
H
P
 
P
-
 
E
L
 
L
K
 
V
I
 
L
L
 
Y
N
 
N
A
 
G
N
 
Y
A
 
D
A
 
E
I
 
I
A
 
F
W
 
A
D
 
S
A
 
G
M
 
L
K
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
A
A
 
D
G
 
G
F
 
-
N
 
-
G
 
G
V
 
I
F
 
G
T
 
S
N
 
T
F
 
Y
H
 
N
T
 
I
D
 
M
L
 
A
Y
 
W
K
 
R
W
 
Y
L
 
L

1fdzA N-acetylneuraminate lyase in complex with pyruvate via borohydride reduction (see paper)
27% identity, 55% coverage: 10:186/319 of query aligns to 1:173/292 of 1fdzA

query
sites
1fdzA
S
 
N
I
 
L
E
 
R
G
 
G
I
 
V
V
 
M
P
 
A
V
 
A
M
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
S
 
Q
G
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
D
Y
 
K
A
 
A
G
 
S
L
 
L
E
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
V
E
 
Q
W
 
F
Y
 
N
L
 
I
A
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
S
 
I
D
 
D
A
 
G
L
 
L
F
x
Y
A
 
V
V
 
G
A
x
G
Q
x
S
S
x
T
S
 
G
E
 
E
M
 
A
Q
 
F
F
 
V
L
 
Q
T
 
S
L
 
L
A
 
S
E
 
E
R
 
R
G
 
E
A
 
Q
L
 
V
G
 
L
R
 
E
F
 
I
V
 
V
V
 
A
E
 
E
K
 
E
V
 
G
A
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
P
 
K
V
 
L
V
 
I
V
 
A
S
 
-
G
 
-
H
 
H
I
 
V
S
 
G
D
 
C
D
 
V
P
 
T
D
 
T
A
 
A
Q
 
E
A
 
S
E
 
Q
E
 
Q
L
 
L
N
 
A
V
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
K
-
 
R
T
 
Y
G
 
G
A
 
F
Q
 
D
A
 
A
I
 
V
V
 
S
L
 
A
V
 
V
T
 
T
N
 
P
R
 
F
L
x
Y
D
 
Y
P
 
P
A
 
F
R
 
-
E
 
-
G
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
S
F
 
F
A
 
E
A
 
E
N
 
H
L
 
C
K
 
D
R
 
H
L
 
Y
L
 
R
A
 
A
R
 
I
L
 
I
P
 
D
S
 
S
-
 
A
-
 
D
D
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
M
G
 
V
L
 
V
Y
|
Y
E
 
N
C
 
I
P
 
P
A
 
A
P
x
L
Y
 
S
R
 
G
R
 
V
L
 
K
L
 
L
S
 
T
D
 
L
D
 
D
E
 
Q
L
 
I
K
 
N
L
 
T
C
 
L
I
 
V
D
 
T
T
 
L
G
 
P
R
 
G
F
 
V
I
 
G
M
 
A
L
 
L
K
|
K
D
 
Q
V
 
T
S
 
S
C
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
Y
T
 
Q
V
 
M
K
 
E
R
 
Q

Sites not aligning to the query:

1fdyA N-acetylneuraminate lyase in complex with hydroxypyruvate (see paper)
27% identity, 55% coverage: 10:186/319 of query aligns to 1:173/292 of 1fdyA

query
sites
1fdyA
S
 
N
I
 
L
E
 
R
G
 
G
I
 
V
V
 
M
P
 
A
V
 
A
M
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
S
 
Q
G
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
D
Y
 
K
A
 
A
G
 
S
L
 
L
E
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
V
E
 
Q
W
 
F
Y
 
N
L
 
I
A
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
S
 
I
D
 
D
A
 
G
L
 
L
F
x
Y
A
 
V
V
 
G
A
x
G
Q
x
S
S
x
T
S
 
G
E
 
E
M
 
A
Q
 
F
F
 
V
L
 
Q
T
 
S
L
 
L
A
 
S
E
 
E
R
 
R
G
 
E
A
 
Q
L
 
V
G
 
L
R
 
E
F
 
I
V
 
V
V
 
A
E
 
E
K
 
E
V
 
G
A
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
P
 
K
V
 
L
V
 
I
V
 
A
S
 
-
G
 
-
H
 
H
I
 
V
S
 
G
D
 
C
D
 
V
P
 
T
D
 
T
A
 
A
Q
 
E
A
 
S
E
 
Q
E
 
Q
L
 
L
N
 
A
V
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
K
-
 
R
T
 
Y
G
 
G
A
 
F
Q
 
D
A
 
A
I
 
V
V
 
S
L
 
A
V
 
V
T
 
T
N
 
P
R
 
F
L
x
Y
D
 
Y
P
 
P
A
 
F
R
 
-
E
 
-
G
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
S
F
 
F
A
 
E
A
 
E
N
 
H
L
 
C
K
 
D
R
 
H
L
 
Y
L
 
R
A
 
A
R
 
I
L
 
I
P
 
D
S
 
S
-
 
A
-
 
D
D
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
M
G
 
V
L
 
V
Y
|
Y
E
 
N
C
 
I
P
 
P
A
 
A
P
x
L
Y
 
S
R
 
G
R
 
V
L
 
K
L
 
L
S
 
T
D
 
L
D
 
D
E
 
Q
L
 
I
K
 
N
L
 
T
C
 
L
I
 
V
D
 
T
T
 
L
G
 
P
R
 
G
F
 
V
I
 
G
M
 
A
L
 
L
K
|
K
D
 
Q
V
 
T
S
 
S
C
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
Y
T
 
Q
V
 
M
K
 
E
R
 
Q

Sites not aligning to the query:

5t25A Kinetic, spectral and structural characterization of the slow binding inhibitor acetopyruvate with dihydrodipicolinate synthase from escherichia coli.
25% identity, 66% coverage: 13:223/319 of query aligns to 5:209/293 of 5t25A

query
sites
5t25A
G
 
G
I
 
S
V
 
I
P
 
V
V
 
A
M
 
I
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
D
D
 
E
S
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
V
D
 
C
Y
 
R
A
 
A
G
 
S
L
 
L
E
 
K
R
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
D
W
 
Y
Y
 
H
L
 
V
A
 
A
Q
 
S
G
 
G
S
 
T
D
 
S
A
 
A
L
 
I
F
 
V
A
 
S
V
 
V
A
 
G
Q
x
T
S
 
T
S
 
G
E
 
E
M
 
S
Q
x
A
F
 
T
L
|
L
T
 
N
L
x
H
A
 
D
E
 
E
R
 
H
G
 
A
A
 
D
L
 
V
G
 
V
R
 
M
F
 
M
V
 
T
V
 
L
E
 
D
K
 
L
V
 
A
A
 
D
G
 
G
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
A
S
 
G
G
 
T
H
 
G
I
 
A
S
x
N
D
 
A
D
 
T
P
 
A
D
x
E
A
 
A
Q
 
I
A
 
S
-
 
L
-
 
T
E
 
Q
E
 
R
L
 
F
N
 
N
V
 
D
A
 
S
A
 
G
A
 
I
T
 
V
G
 
G
A
 
C
Q
 
L
A
 
T
I
 
V
V
 
T
L
 
P
V
x
Y
T
x
Y
N
 
N
R
 
R
L
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
S
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
M
 
L
-
 
Y
Q
 
Q
A
 
H
F
 
F
A
 
K
A
 
A
N
 
I
L
 
A
K
 
E
R
 
H
L
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
T
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
Q
G
 
I
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
S
P
x
R
Y
 
T
R
 
G
R
 
C
L
 
D
L
 
L
S
 
L
D
 
P
D
 
E
E
 
T
L
 
V
K
 
G
L
 
R
C
 
L
I
 
A
D
 
K
T
 
V
G
 
K
R
 
N
F
 
I
I
 
I
M
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
E
V
 
A
S
 
T
C
 
G
D
 
N
L
 
L
A
 
T
T
 
R
V
 
V
K
 
N
R
 
Q
R
 
I
V
 
K
A
 
E
L
 
L
A
 
V
Q
 
S
G
 
D
S
 
D
P
 
-
L
 
F
K
 
V
I
 
L
L
 
L
N
 
S
A
 
G
N
 
D
A
 
D
A
 
A
I
 
S
A
 
A
W
 
L
D
 
D
A
 
F
M
 
M
K
 
Q
A
 
L
G
 
G
S
 
G
A
 
H
G
 
G
F
 
V
N
x
I
G
 
S
V
 
V
F
 
T
T
 
A
N
 
N

3s8hA Structure of dihydrodipicolinate synthase complexed with 3- hydroxypropanoic acid(hpa)at 2.70 a resolution
27% identity, 67% coverage: 11:223/319 of query aligns to 2:208/292 of 3s8hA

query
sites
3s8hA
I
 
I
E
 
A
G
 
G
I
 
S
V
 
M
P
 
V
V
x
A
M
x
L
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
D
D
 
A
S
 
Q
G
 
G
A
 
R
I
 
L
D
 
D
Y
 
W
A
 
D
G
 
S
L
 
L
E
 
A
R
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
D
W
 
F
Y
 
H
L
 
L
A
 
Q
Q
 
D
G
 
G
S
 
T
D
 
N
A
 
A
L
 
I
F
x
V
A
 
A
V
 
V
A
x
G
Q
x
T
S
x
T
S
x
G
E
 
E
M
 
S
Q
 
A
F
 
T
L
 
L
T
 
D
L
 
V
A
 
E
E
 
E
R
 
H
G
 
I
A
 
Q
L
 
V
G
 
V
R
 
R
F
 
R
V
 
V
V
 
V
E
 
D
K
 
Q
V
 
V
A
 
K
G
 
G
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
A
S
 
G
G
 
T
H
 
G
I
 
A
S
 
N
D
 
S
D
 
T
P
 
R
D
 
E
A
 
A
Q
 
V
A
 
A
E
 
L
E
 
T
L
 
-
N
 
E
V
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
S
T
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
A
 
A
I
 
C
V
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
N
 
P
R
 
Y
L
x
Y
D
 
N
-
 
K
P
 
P
A
 
T
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
M
 
M
Q
 
Y
A
 
Q
F
 
H
A
 
F
A
 
R
N
 
H
L
 
I
K
 
A
R
 
E
L
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
-
L
 
I
P
 
P
L
 
Q
G
 
I
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
P
x
R
Y
 
T
R
 
S
R
 
C
L
 
D
L
 
M
S
 
L
D
 
P
D
 
E
E
 
T
L
 
V
K
 
E
L
 
R
C
 
L
I
 
S
D
 
K
T
 
V
G
 
P
R
 
N
F
 
I
I
 
I
M
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
E
V
 
A
S
 
T
C
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
Q
T
 
R
V
 
A
K
 
K
R
 
E
R
 
V
V
 
I
A
 
E
L
 
R
A
 
V
Q
 
-
G
 
G
S
 
K
P
 
D
L
 
F
K
 
L
I
 
V
L
 
Y
N
 
S
A
 
G
N
 
D
A
 
D
A
 
A
I
 
T
A
 
A
W
 
V
D
 
E
A
 
L
M
 
M
K
 
L
A
 
L
G
 
G
S
 
G
A
 
K
G
 
G
F
 
N
N
x
I
G
 
S
V
 
V
F
 
T
T
 
A
N
 
N

3puoA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from pseudomonas aeruginosa(psdhdps)complexed with l-lysine at 2.65a resolution (see paper)
27% identity, 67% coverage: 11:223/319 of query aligns to 2:208/292 of 3puoA

query
sites
3puoA
I
 
I
E
 
A
G
 
G
I
 
S
V
 
M
P
 
V
V
 
A
M
 
L
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
D
D
 
A
S
 
Q
G
 
G
A
 
R
I
 
L
D
 
D
Y
 
W
A
 
D
G
 
S
L
 
L
E
 
A
R
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
D
W
 
F
Y
 
H
L
 
L
A
 
Q
Q
 
D
G
 
G
S
 
T
D
 
N
A
 
A
L
 
I
F
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
G
Q
x
T
S
 
T
S
 
G
E
 
E
M
x
S
Q
x
A
F
 
T
L
|
L
T
x
D
L
x
V
A
 
E
E
 
E
R
 
H
G
 
I
A
 
Q
L
 
V
G
 
V
R
 
R
F
 
R
V
 
V
V
 
V
E
 
D
K
 
Q
V
 
V
A
 
K
G
 
G
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
A
S
 
G
G
 
T
H
 
G
I
 
A
S
 
N
D
 
S
D
 
T
P
 
R
D
 
E
A
 
A
Q
 
V
A
 
A
E
 
L
E
 
T
L
 
-
N
 
E
V
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
S
T
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
A
 
A
I
 
C
V
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
N
 
P
R
 
Y
L
x
Y
D
 
N
-
 
K
P
 
P
A
 
T
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
M
 
M
Q
 
Y
A
 
Q
F
 
H
A
 
F
A
 
R
N
 
H
L
 
I
K
 
A
R
 
E
L
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
-
L
 
I
P
 
P
L
 
Q
G
 
I
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
P
x
R
Y
 
T
R
 
S
R
 
C
L
 
D
L
 
M
S
 
L
D
 
P
D
 
E
E
 
T
L
 
V
K
 
E
L
 
R
C
 
L
I
 
S
D
 
K
T
 
V
G
 
P
R
 
N
F
 
I
I
 
I
M
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
E
V
 
A
S
 
T
C
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
Q
T
 
R
V
 
A
K
 
K
R
 
E
R
 
V
V
 
I
A
 
E
L
 
R
A
 
V
Q
 
-
G
 
G
S
 
K
P
 
D
L
 
F
K
 
L
I
 
V
L
 
Y
N
 
S
A
 
G
N
 
D
A
 
D
A
 
A
I
 
T
A
 
A
W
 
V
D
 
E
A
 
L
M
 
M
K
 
L
A
 
L
G
 
G
S
 
G
A
 
K
G
 
G
F
 
N
N
x
I
G
 
S
V
 
V
F
 
T
T
 
A
N
 
N

Sites not aligning to the query:

2atsA Dihydrodipicolinate synthase co-crystallised with (s)-lysine
25% identity, 66% coverage: 13:223/319 of query aligns to 4:208/292 of 2atsA

query
sites
2atsA
G
 
G
I
 
S
V
 
I
P
 
V
V
 
A
M
 
I
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
D
D
 
E
S
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
V
D
 
C
Y
 
R
A
 
A
G
 
S
L
 
L
E
 
K
R
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
D
W
 
Y
Y
 
H
L
 
V
A
 
A
Q
 
S
G
 
G
S
 
T
D
 
S
A
 
A
L
 
I
F
 
V
A
 
S
V
 
V
A
 
G
Q
x
T
S
 
T
S
 
G
E
 
E
M
 
S
Q
x
A
F
 
T
L
|
L
T
 
N
L
x
H
A
 
D
E
 
E
R
x
H
G
 
A
A
 
D
L
 
V
G
 
V
R
 
M
F
 
M
V
 
T
V
 
L
E
 
D
K
 
L
V
 
A
A
 
D
G
 
G
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
A
S
 
G
G
 
T
H
 
G
I
 
A
S
x
N
D
 
A
D
 
T
P
 
A
D
x
E
A
 
A
Q
 
I
A
 
S
-
 
L
-
 
T
E
 
Q
E
 
R
L
 
F
N
 
N
V
 
D
A
 
S
A
 
G
A
 
I
T
 
V
G
 
G
A
 
C
Q
 
L
A
 
T
I
 
V
V
 
T
L
 
P
V
x
Y
T
x
Y
N
 
N
R
 
R
L
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
S
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
M
 
L
-
 
Y
Q
 
Q
A
 
H
F
 
F
A
 
K
A
 
A
N
 
I
L
 
A
K
 
E
R
 
H
L
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
T
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
Q
G
 
I
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
S
P
x
R
Y
 
T
R
 
G
R
 
C
L
 
D
L
 
L
S
 
L
D
 
P
D
 
E
E
 
T
L
 
V
K
 
G
L
 
R
C
 
L
I
 
A
D
 
K
T
 
V
G
 
K
R
 
N
F
 
I
I
 
I
M
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
E
V
 
A
S
 
T
C
 
G
D
 
N
L
 
L
A
 
T
T
 
R
V
 
V
K
 
N
R
 
Q
R
 
I
V
 
K
A
 
E
L
 
L
A
 
V
Q
 
S
G
 
D
S
 
D
P
 
-
L
 
F
K
 
V
I
 
L
L
 
L
N
 
S
A
 
G
N
 
D
A
 
D
A
 
A
I
 
S
A
 
A
W
 
L
D
 
D
A
 
F
M
 
M
K
 
Q
A
 
L
G
 
G
S
 
G
A
 
H
G
 
G
F
 
V
N
x
I
G
 
S
V
 
V
F
 
T
T
 
A
N
 
N

Query Sequence

>H281DRAFT_01829 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_01829
MTIAKPPTVSIEGIVPVMLTPFDDSGAIDYAGLERLIEWYLAQGSDALFAVAQSSEMQFL
TLAERGALGRFVVEKVAGRIPVVVSGHISDDPDAQAEELNVAAATGAQAIVLVTNRLDPA
REGMQAFAANLKRLLARLPSDLPLGLYECPAPYRRLLSDDELKLCIDTGRFIMLKDVSCD
LATVKRRVALAQGSPLKILNANAAIAWDAMKAGSAGFNGVFTNFHTDLYKWLRNDATRDP
ALADELATFLVLAAVSESLGYPALAKMYHQRIGTFNSIRCRVIDYDVRERFWALDAILDK
IVAGTEHFRARIAALDSSR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory