SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_01939 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_01939 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q63XL8 Ribose-phosphate pyrophosphokinase; RPPK; 5-phospho-D-ribosyl alpha-1-diphosphate synthase; Phosphoribosyl diphosphate synthase; Phosphoribosyl pyrophosphate synthase; P-Rib-PP synthase; PRPP synthase; PRPPase; EC 2.7.6.1 from Burkholderia pseudomallei (strain K96243) (see paper)
95% identity, 100% coverage: 1:318/318 of query aligns to 1:318/318 of Q63XL8

query
sites
Q63XL8
M
 
M
S
 
S
S
 
S
H
 
H
D
 
D
G
 
G
L
 
L
M
 
M
V
 
V
F
 
F
T
 
T
G
 
G
N
 
N
A
 
A
N
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
V
 
V
K
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
A
M
 
M
V
 
V
S
 
S
R
 
R
F
 
F
S
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
I
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
R
G
 
G
K
 
K
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
C
 
C
A
 
A
P
 
P
A
 
T
N
 
N
D
 
D
N
 
N
L
 
L
M
 
M
E
 
E
L
 
L
M
 
M
I
 
I
M
 
M
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
Q
|
Q
D
 
D
R
 
R
R
 
R
P
 
P
R
 
R
S
 
S
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
S
 
S
A
 
A
K
 
K
I
 
V
V
 
V
A
 
A
N
 
N
M
 
M
L
 
L
E
 
E
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
E
R
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
T
M
 
M
D
 
D
L
 
L
H
 
H
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
F
 
F
D
 
D
I
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
P
 
P
V
 
I
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
L
R
 
R
K
 
K
Q
 
Q
N
 
N
Y
 
Y
E
 
P
N
 
D
L
 
L
L
 
L
V
 
V
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
V
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
N
 
N
C
 
C
D
 
D
L
 
L
A
 
A
I
 
I
I
 
I
D
 
D
K
 
K
R
 
R
R
 
R
P
 
P
K
 
K
A
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
V
M
 
M
N
 
N
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
V
 
V
E
 
E
G
 
G
R
 
R
T
 
T
C
 
C
V
 
V
I
 
I
M
 
M
D
 
D
D
 
D
M
 
M
V
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
L
C
 
C
K
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
K
 
K
E
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
H
 
H
P
 
P
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
A
E
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
D
 
D
T
 
T
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
S
E
 
A
E
 
E
A
 
S
R
 
L
S
 
A
C
 
C
A
 
P
K
 
K
I
 
I
R
 
R
S
 
A
L
 
L
T
 
S
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
T
F
 
F
S
 
S
R
 
R
I
 
I
R
 
R
R
 
R
G
 
G
D
 
D
S
 
S
V
 
V
M
 
M
S
 
S
L
 
L
F
 
F
A
 
A
E
 
E
S
 
S

3dahC 2.3 a crystal structure of ribose-phosphate pyrophosphokinase from burkholderia pseudomallei (see paper)
93% identity, 97% coverage: 6:312/318 of query aligns to 1:300/300 of 3dahC

query
sites
3dahC
G
 
G
L
 
L
M
 
M
V
 
V
F
 
F
T
 
T
G
 
G
N
 
N
A
 
A
N
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
V
 
V
K
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
A
M
 
M
V
 
V
S
 
S
R
 
R
F
|
F
S
 
S
D
|
D
G
 
G
E
|
E
I
 
I
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
R
G
 
G
K
 
K
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
C
 
C
A
 
A
P
 
P
A
 
T
N
 
N
D
 
D
N
 
N
L
 
L
M
 
M
E
 
E
L
 
L
M
 
M
I
 
I
M
 
M
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
Q
|
Q
D
 
D
R
 
R
R
 
R
P
 
P
R
 
R
S
 
S
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
S
 
S
A
 
A
K
 
K
I
 
V
V
 
V
A
 
A
N
 
N
M
 
M
L
 
L
E
 
E
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
E
R
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
T
M
 
M
D
 
D
L
 
L
H
 
H
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
F
 
F
D
 
D
I
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
P
 
P
V
 
I
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
L
R
 
R
K
 
K
Q
 
Q
N
 
N
Y
 
Y
E
 
P
N
 
D
L
 
L
L
 
L
V
 
V
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
V
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
N
 
N
C
 
C
D
 
D
L
 
L
A
 
A
I
 
I
I
 
I
D
 
D
K
 
K
R
 
R
R
 
R
P
 
-
K
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
V
M
 
M
N
 
N
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
V
 
V
E
 
E
G
 
G
R
 
R
T
 
T
C
 
C
V
 
V
I
 
I
M
 
M
D
 
D
D
 
D
M
 
M
V
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
L
C
 
C
K
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
K
 
K
E
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
H
 
H
P
 
P
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
A
E
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
D
 
D
T
 
T
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
S
E
 
A
E
 
E
A
 
S
R
 
L
S
 
A
C
 
C
A
 
P
K
 
K
I
 
I
R
 
R
S
 
A
L
 
L
T
 
S
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
T
F
 
F
S
 
S
R
 
R
I
 
I
R
 
R
R
 
R
G
 
G
D
 
D
S
 
S
V
 
V
M
 
M

P0A717 Ribose-phosphate pyrophosphokinase; RPPK; 5-phospho-D-ribosyl alpha-1-diphosphate synthase; Phosphoribosyl diphosphate synthase; Phosphoribosyl pyrophosphate synthase; P-Rib-PP synthase; PRPP synthase; PRPPase; EC 2.7.6.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
63% identity, 97% coverage: 7:315/318 of query aligns to 4:313/315 of P0A717

query
sites
P0A717
L
 
M
M
 
K
V
 
L
F
 
F
T
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
N
 
T
P
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
E
 
R
V
 
I
V
 
A
K
 
N
I
 
R
L
 
L
G
 
Y
I
 
T
P
 
S
L
 
L
G
 
G
K
 
D
A
 
A
M
 
A
V
 
V
S
 
G
R
 
R
F
 
F
S
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
V
Q
 
S
V
 
V
E
 
Q
I
 
I
Q
 
N
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
R
G
 
G
K
 
G
D
 
D
V
 
I
F
 
F
V
 
I
L
 
I
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
C
 
C
A
 
A
P
 
P
A
 
T
N
 
N
D
 
D
N
 
N
L
 
L
M
 
M
E
 
E
L
 
L
M
 
V
I
 
V
M
 
M
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
R
R
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
V
I
 
I
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
R
 
R
R
 
R
P
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
P
I
 
I
S
 
T
A
 
A
K
 
K
I
 
V
V
 
V
A
 
A
N
 
D
M
 
F
L
 
L
E
 
S
I
 
S
A
 
V
G
 
G
V
 
V
E
 
D
R
 
R
I
 
V
I
 
L
T
 
T
M
 
V
D
|
D
L
 
L
H
 
H
A
 
A
D
 
E
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
F
 
F
D
 
D
I
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
Y
 
F
A
 
G
T
 
S
P
 
P
V
 
I
L
 
L
L
 
L
G
 
E
D
 
D
L
 
M
R
 
L
K
 
Q
Q
 
L
N
 
N
Y
 
L
E
 
D
N
 
N
L
 
P
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
V
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
K
Q
 
L
L
 
L
N
 
N
-
 
D
C
 
T
D
 
D
L
 
M
A
 
A
I
 
I
I
 
I
D
 
D
K
 
K
R
 
R
R
 
R
P
 
P
K
 
R
A
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
S
E
 
Q
V
 
V
M
 
M
N
 
H
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
D
V
 
V
E
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
D
C
 
C
V
 
V
I
 
L
M
 
V
D
|
D
D
|
D
M
 
M
V
 
I
D
|
D
T
 
T
A
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
C
 
C
K
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
A
L
 
L
K
 
K
E
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
H
 
H
P
 
P
V
 
I
L
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
N
A
 
A
G
 
A
E
 
N
R
 
N
I
 
L
A
 
R
A
 
N
S
 
S
A
 
V
L
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
C
D
 
D
T
 
T
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
S
E
 
D
E
 
E
A
 
I
R
 
K
S
 
S
C
 
L
A
 
P
K
 
N
I
 
V
R
 
R
S
 
T
L
 
L
T
 
T
S
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
A
F
 
I
S
 
R
R
 
R
I
 
I
R
 
S
R
 
N
G
 
E
D
 
E
S
 
S
V
 
I
M
 
S
S
 
A
L
 
M
F
 
F

Sites not aligning to the query:

6asvC E. Coli prpp synthetase (see paper)
63% identity, 97% coverage: 7:315/318 of query aligns to 2:311/311 of 6asvC

query
sites
6asvC
L
 
M
M
 
K
V
 
L
F
 
F
T
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
N
 
T
P
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
E
 
R
V
 
I
V
 
A
K
 
N
I
 
R
L
 
L
G
 
Y
I
 
T
P
 
S
L
 
L
G
 
G
K
 
D
A
 
A
M
 
A
V
 
V
S
 
G
R
 
R
F
 
F
S
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
V
Q
 
S
V
 
V
E
 
Q
I
 
I
Q
 
N
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
R
G
 
G
K
 
G
D
 
D
V
 
I
F
 
F
V
 
I
L
 
I
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
C
 
C
A
 
A
P
 
P
A
 
T
N
 
N
D
 
D
N
 
N
L
 
L
M
 
M
E
 
E
L
 
L
M
 
V
I
 
V
M
 
M
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
R
R
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
V
I
 
I
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
R
 
R
R
 
R
P
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
P
I
 
I
S
 
T
A
 
A
K
 
K
I
 
V
V
 
V
A
 
A
N
 
D
M
 
F
L
 
L
E
 
S
I
 
S
A
 
V
G
 
G
V
 
V
E
 
D
R
 
R
I
 
V
I
 
L
T
 
T
M
 
V
D
 
D
L
 
L
H
 
H
A
 
A
D
 
E
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
F
 
F
D
 
D
I
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
Y
 
F
A
 
G
T
 
S
P
 
P
V
 
I
L
 
L
L
 
L
G
 
E
D
 
D
L
 
M
R
 
L
K
 
Q
Q
 
L
N
 
N
Y
 
L
E
 
D
N
 
N
L
 
P
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
|
D
V
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
K
Q
 
L
L
 
L
N
 
N
-
 
D
C
 
T
D
 
D
L
 
M
A
 
A
I
 
I
I
 
I
D
 
D
K
 
K
R
 
R
R
 
R
P
 
P
K
 
R
A
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
S
E
 
Q
V
 
V
M
 
M
N
 
H
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
D
V
 
V
E
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
D
C
 
C
V
 
V
I
 
L
M
 
V
D
|
D
D
|
D
M
 
M
V
 
I
D
|
D
T
|
T
A
x
G
G
 
G
T
|
T
L
|
L
C
 
C
K
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
A
L
 
L
K
 
K
E
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
H
 
H
P
 
P
V
 
I
L
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
N
A
 
A
G
 
A
E
 
N
R
 
N
I
 
L
A
 
R
A
 
N
S
 
S
A
 
V
L
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
C
D
 
D
T
 
T
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
S
E
 
D
E
 
E
A
 
I
R
 
K
S
 
S
C
 
L
A
 
P
K
 
N
I
 
V
R
 
R
S
 
T
L
 
L
T
 
T
S
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
A
F
 
I
S
 
R
R
 
R
I
 
I
R
 
S
R
 
N
G
 
E
D
 
E
S
 
S
V
 
I
M
 
S
S
 
A
L
 
M
F
 
F

4s2uA Crystal structure of the phosphorybosylpyrophosphate synthetase from e. Coli
63% identity, 96% coverage: 7:311/318 of query aligns to 3:308/308 of 4s2uA

query
sites
4s2uA
L
 
M
M
 
K
V
 
L
F
 
F
T
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
N
 
T
P
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
E
 
R
V
 
I
V
 
A
K
 
N
I
 
R
L
 
L
G
 
Y
I
 
T
P
 
S
L
 
L
G
 
G
K
 
D
A
 
A
M
 
A
V
 
V
S
 
G
R
 
R
F
 
F
S
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
V
Q
 
S
V
 
V
E
 
Q
I
 
I
Q
 
N
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
R
G
 
G
K
 
G
D
 
D
V
 
I
F
 
F
V
 
I
L
 
I
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
C
 
C
A
 
A
P
 
P
A
 
T
N
 
N
D
 
D
N
 
N
L
 
L
M
 
M
E
 
E
L
 
L
M
 
V
I
 
V
M
 
M
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
R
R
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
V
I
 
I
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
R
 
R
R
 
R
P
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
P
I
 
I
S
 
T
A
 
A
K
 
K
I
 
V
V
 
V
A
 
A
N
 
D
M
 
F
L
 
L
E
 
S
I
 
S
A
 
V
G
 
G
V
 
V
E
 
D
R
 
R
I
 
V
I
 
L
T
 
T
M
 
V
D
 
D
L
 
L
H
 
H
A
 
A
D
 
E
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
F
 
F
D
 
D
I
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
Y
 
F
A
 
G
T
 
S
P
 
P
V
 
I
L
 
L
L
 
L
G
 
E
D
 
D
L
 
M
R
 
L
K
 
Q
Q
 
L
N
 
N
Y
 
L
E
 
D
N
 
N
L
 
P
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
V
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
K
Q
 
L
L
 
L
N
 
N
-
 
D
C
 
T
D
 
D
L
 
M
A
 
A
I
 
I
I
 
I
D
 
D
K
 
K
R
 
R
R
 
R
P
 
P
K
 
R
A
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
S
E
 
Q
V
 
V
M
 
M
N
 
H
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
D
V
 
V
E
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
D
C
 
C
V
 
V
I
 
L
M
 
V
D
 
D
D
 
D
M
 
M
V
 
I
D
|
D
T
 
T
A
 
G
G
 
G
T
|
T
L
 
L
C
 
C
K
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
A
L
 
L
K
 
K
E
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
H
 
H
P
 
P
V
 
I
L
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
N
A
 
A
G
 
A
E
 
N
R
 
N
I
 
L
A
 
R
A
 
N
S
 
S
A
 
V
L
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
C
D
 
D
T
 
T
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
S
E
 
D
E
 
E
A
 
I
R
 
K
S
 
S
C
 
L
A
 
P
K
 
N
I
 
V
R
 
R
S
 
T
L
 
L
T
 
T
S
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
A
F
 
I
S
 
R
R
 
R
I
 
I
R
 
S
R
 
N
G
 
E
D
 
E
S
 
S
V
 
I

7xmvA E.Coli phosphoribosylpyrophosphate (prpp) synthetase type a(amp/adp) filament bound with adp, amp and r5p (see paper)
62% identity, 97% coverage: 7:315/318 of query aligns to 2:305/307 of 7xmvA

query
sites
7xmvA
L
 
M
M
 
K
V
 
L
F
 
F
T
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
N
 
T
P
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
E
 
R
V
 
I
V
 
A
K
 
N
I
 
R
L
 
L
G
 
Y
I
 
T
P
 
S
L
 
L
G
 
G
K
 
D
A
 
A
M
 
A
V
 
V
S
 
G
R
 
R
F
|
F
S
 
S
D
|
D
G
 
G
E
|
E
I
 
V
Q
 
S
V
 
V
E
 
Q
I
 
I
Q
 
N
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
R
G
 
G
K
 
G
D
 
D
V
 
I
F
 
F
V
 
I
L
 
I
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
C
 
C
A
 
A
P
 
P
A
 
T
N
 
N
D
 
D
N
 
N
L
 
L
M
 
M
E
 
E
L
 
L
M
 
V
I
 
V
M
 
M
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
R
R
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
V
I
 
I
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
Q
 
Q
D
 
D
R
|
R
R
 
R
P
x
V
R
|
R
S
 
S
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
P
I
 
I
S
 
T
A
 
A
K
 
K
I
 
V
V
 
V
A
 
A
N
 
D
M
 
F
L
 
L
E
 
S
I
 
S
A
 
V
G
 
G
V
 
V
E
 
D
R
 
R
I
 
V
I
 
L
T
 
T
M
 
V
D
 
D
L
 
L
H
|
H
A
 
A
D
x
E
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
F
 
F
D
 
D
I
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
Y
x
F
A
 
G
T
x
S
P
 
P
V
 
I
L
 
L
L
 
L
G
 
E
D
 
D
L
 
M
R
 
L
K
 
Q
Q
 
L
N
 
N
Y
 
L
E
 
D
N
 
N
L
 
P
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
V
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
|
V
R
 
R
A
 
A
R
 
R
A
|
A
L
 
I
A
 
A
K
 
K
Q
 
L
L
 
L
N
 
N
-
 
D
C
 
T
D
 
D
L
 
M
A
 
A
I
 
I
I
 
I
D
 
D
K
 
K
R
 
R
R
 
R
P
 
-
K
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
Q
V
 
V
M
 
M
N
 
H
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
D
V
 
V
E
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
D
C
 
C
V
 
V
I
 
L
M
 
V
D
|
D
D
|
D
M
|
M
V
 
I
D
|
D
T
|
T
A
 
G
G
|
G
T
|
T
L
 
L
C
 
C
K
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
A
L
 
L
K
 
K
E
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
H
 
H
P
 
P
V
 
I
L
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
N
A
 
A
G
 
A
E
 
N
R
 
N
I
 
L
A
 
R
A
 
N
S
 
S
A
 
V
L
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
C
D
 
D
T
 
T
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
S
E
 
D
E
 
E
A
 
I
R
 
K
S
 
S
C
 
L
A
 
P
K
 
N
I
 
V
R
 
R
S
 
T
L
 
L
T
 
T
S
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
A
F
 
I
S
 
R
R
 
R
I
 
I
R
 
S
R
 
N
G
 
E
D
 
E
S
 
S
V
 
I
M
 
S
S
 
A
L
 
M
F
 
F

7xmuA E.Coli phosphoribosylpyrophosphate (prpp) synthetase type a filament bound with adp, pi and r5p (see paper)
62% identity, 97% coverage: 7:315/318 of query aligns to 2:305/307 of 7xmuA

query
sites
7xmuA
L
 
M
M
 
K
V
 
L
F
 
F
T
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
N
 
T
P
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
E
 
R
V
 
I
V
 
A
K
 
N
I
 
R
L
 
L
G
 
Y
I
 
T
P
 
S
L
 
L
G
 
G
K
 
D
A
 
A
M
 
A
V
 
V
S
 
G
R
 
R
F
|
F
S
 
S
D
|
D
G
 
G
E
|
E
I
 
V
Q
 
S
V
 
V
E
 
Q
I
 
I
Q
 
N
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
R
G
 
G
K
 
G
D
 
D
V
 
I
F
 
F
V
 
I
L
 
I
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
C
 
C
A
 
A
P
 
P
A
 
T
N
 
N
D
 
D
N
 
N
L
 
L
M
 
M
E
 
E
L
 
L
M
 
V
I
 
V
M
 
M
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
R
R
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
V
I
 
I
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
Q
|
Q
D
 
D
R
|
R
R
 
R
P
 
V
R
|
R
S
 
S
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
P
I
 
I
S
 
T
A
 
A
K
 
K
I
 
V
V
 
V
A
 
A
N
 
D
M
 
F
L
 
L
E
 
S
I
 
S
A
 
V
G
 
G
V
 
V
E
 
D
R
 
R
I
 
V
I
 
L
T
 
T
M
 
V
D
 
D
L
 
L
H
|
H
A
 
A
D
x
E
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
F
 
F
D
 
D
I
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
Y
x
F
A
 
G
T
x
S
P
 
P
V
 
I
L
 
L
L
 
L
G
 
E
D
 
D
L
 
M
R
 
L
K
 
Q
Q
 
L
N
 
N
Y
 
L
E
 
D
N
 
N
L
 
P
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
|
D
V
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
|
V
R
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
K
Q
 
L
L
 
L
N
 
N
-
 
D
C
 
T
D
 
D
L
 
M
A
 
A
I
 
I
I
 
I
D
 
D
K
 
K
R
 
R
R
 
R
P
 
-
K
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
Q
V
 
V
M
 
M
N
 
H
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
D
V
 
V
E
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
D
C
 
C
V
 
V
I
 
L
M
 
V
D
|
D
D
 
D
M
|
M
V
 
I
D
|
D
T
|
T
A
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
C
 
C
K
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
A
L
 
L
K
 
K
E
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
H
 
H
P
 
P
V
 
I
L
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
N
A
 
A
G
 
A
E
 
N
R
 
N
I
 
L
A
 
R
A
 
N
S
 
S
A
 
V
L
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
C
D
 
D
T
 
T
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
S
E
 
D
E
 
E
A
 
I
R
 
K
S
 
S
C
 
L
A
 
P
K
 
N
I
 
V
R
 
R
S
 
T
L
 
L
T
 
T
S
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
A
F
 
I
S
 
R
R
 
R
I
 
I
R
 
S
R
 
N
G
 
E
D
 
E
S
 
S
V
 
I
M
 
S
S
 
A
L
 
M
F
 
F

6nfeB Crystal structure of ribose-phosphate pyrophosphokinase from legionella pneumophila with bound amp, adp, and ribose-5-phosphate
65% identity, 94% coverage: 7:305/318 of query aligns to 3:297/299 of 6nfeB

query
sites
6nfeB
L
 
M
M
 
M
V
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
N
 
N
A
 
A
N
 
N
P
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
L
E
 
K
V
 
I
V
 
S
K
 
S
I
 
H
L
 
L
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
M
 
T
V
 
V
S
 
G
R
 
T
F
|
F
S
 
S
D
|
D
G
 
G
E
|
E
I
 
T
Q
 
M
V
 
V
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
R
G
 
G
K
 
K
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
C
 
C
A
 
A
P
 
P
A
 
A
N
 
N
D
 
N
N
 
N
L
 
L
M
 
M
E
 
E
L
 
L
M
 
L
I
 
I
M
 
M
V
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
R
R
 
R
A
 
S
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
V
I
 
V
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
Q
|
Q
D
 
D
R
 
R
R
 
R
P
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
P
I
 
I
S
 
T
A
 
A
K
 
K
I
 
V
V
 
V
A
 
A
N
 
D
M
 
M
L
 
M
E
 
A
I
 
S
A
 
V
G
 
G
V
 
I
E
 
C
R
 
R
I
 
V
I
 
L
T
 
T
M
 
V
D
 
D
L
 
L
H
|
H
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
F
 
F
D
 
Y
I
 
M
P
 
P
V
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
Y
 
Y
A
 
S
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
L
 
L
G
 
E
D
 
D
L
 
I
R
 
T
K
 
K
Q
 
Q
N
 
K
Y
 
L
E
 
N
N
 
N
L
 
I
L
 
M
V
 
I
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
V
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
A
K
 
K
Q
 
R
L
 
L
N
 
N
-
 
D
C
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
S
I
 
I
I
 
I
D
 
D
K
 
K
R
 
R
R
 
R
P
 
-
K
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
A
 
S
E
 
E
V
 
V
M
 
M
N
 
H
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
V
 
P
E
 
A
G
 
N
R
 
K
T
 
N
C
 
C
V
 
I
I
 
I
M
 
V
D
|
D
D
|
D
M
x
I
V
 
V
D
|
D
T
|
T
A
|
A
G
 
G
T
|
T
L
 
L
C
 
C
K
 
T
A
 
A
A
 
A
Q
 
H
V
 
E
L
 
L
K
 
K
E
 
K
R
 
N
G
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
S
V
 
V
F
 
R
A
 
A
Y
 
Y
A
 
I
T
 
T
H
 
H
P
 
P
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
P
A
 
A
G
 
V
E
 
N
R
 
N
I
 
I
A
 
K
A
 
H
S
 
S
A
 
G
L
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
D
 
D
T
 
T
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
S
E
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
Q
S
 
N
C
 
C
A
 
E
K
 
K
I
 
I
R
 
R
S
 
V
L
 
V
T
 
S
S
 
L
A
 
A
G
 
D
L
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
T
 
A
F
 
I
S
 
K
R
 
R
I
 
V

6nfeA Crystal structure of ribose-phosphate pyrophosphokinase from legionella pneumophila with bound amp, adp, and ribose-5-phosphate
65% identity, 94% coverage: 7:305/318 of query aligns to 3:296/298 of 6nfeA

query
sites
6nfeA
L
 
M
M
 
M
V
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
N
 
N
A
 
A
N
 
N
P
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
L
E
 
K
V
 
I
V
 
S
K
 
S
I
 
H
L
 
L
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
M
 
T
V
 
V
S
 
G
R
 
T
F
|
F
S
 
S
D
|
D
G
 
G
E
|
E
I
 
T
Q
 
M
V
 
V
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
R
G
 
G
K
 
K
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
C
 
C
A
 
A
P
 
P
A
 
A
N
 
N
D
 
N
N
 
N
L
 
L
M
 
M
E
 
E
L
 
L
M
 
L
I
 
I
M
 
M
V
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
R
R
 
R
A
 
S
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
V
I
 
V
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
Q
|
Q
D
 
D
R
|
R
R
 
R
P
x
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
P
I
 
I
S
 
T
A
 
A
K
 
K
I
 
V
V
 
V
A
 
A
N
 
D
M
 
M
L
 
M
E
 
A
I
 
S
A
 
V
G
 
G
V
 
I
E
 
C
R
 
R
I
 
V
I
 
L
T
 
T
M
 
V
D
 
D
L
 
L
H
|
H
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
F
 
F
D
 
Y
I
 
M
P
 
P
V
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
Y
|
Y
A
 
S
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
L
 
L
G
 
E
D
 
D
L
 
I
R
 
T
K
 
K
Q
 
Q
N
 
K
Y
 
L
E
 
N
N
 
N
L
 
I
L
 
M
V
 
I
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
V
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
V
R
|
R
A
 
A
R
 
R
A
|
A
L
 
V
A
 
A
K
|
K
Q
 
R
L
 
L
N
 
N
-
 
D
C
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
S
I
 
I
I
 
I
D
 
D
K
 
K
R
 
R
R
 
R
P
 
-
K
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
E
V
 
V
M
 
M
N
 
H
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
V
 
P
E
 
A
G
 
N
R
 
K
T
 
N
C
 
C
V
 
I
I
 
I
M
 
V
D
|
D
D
|
D
M
x
I
V
 
V
D
|
D
T
|
T
A
|
A
G
 
G
T
|
T
L
 
L
C
 
C
K
 
T
A
 
A
A
 
A
Q
 
H
V
 
E
L
 
L
K
 
K
E
 
K
R
 
N
G
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
S
V
 
V
F
 
R
A
 
A
Y
 
Y
A
 
I
T
 
T
H
 
H
P
 
P
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
P
A
 
A
G
 
V
E
 
N
R
 
N
I
 
I
A
 
K
A
 
H
S
 
S
A
 
G
L
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
D
 
D
T
 
T
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
S
E
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
Q
S
 
N
C
 
C
A
 
E
K
 
K
I
 
I
R
 
R
S
 
V
L
 
V
T
 
S
S
 
L
A
 
A
G
 
D
L
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
T
 
A
F
 
I
S
 
K
R
 
R
I
 
V

P14193 Ribose-phosphate pyrophosphokinase; RPPK; 5-phospho-D-ribosyl alpha-1-diphosphate synthase; Phosphoribosyl diphosphate synthase; Phosphoribosyl pyrophosphate synthase; P-Rib-PP synthase; PPRibP synthase; PRPP synthase; PRPPase; EC 2.7.6.1 from Bacillus subtilis (strain 168) (see 4 papers)
54% identity, 99% coverage: 1:316/318 of query aligns to 1:317/317 of P14193

query
sites
P14193
M
|
M
S
 
S
S
 
N
H
 
Q
D
 
Y
G
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
N
L
 
L
M
 
K
V
 
I
F
 
F
T
 
S
G
 
L
N
 
N
A
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
V
 
I
V
 
A
K
 
D
I
 
I
L
 
V
G
 
G
I
 
V
P
 
Q
L
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
C
M
 
S
V
 
V
S
 
T
R
 
R
F
 
F
S
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
V
Q
 
Q
V
 
I
E
 
N
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
N
 
S
V
 
I
R
 
R
G
 
G
K
 
C
D
 
D
V
 
C
F
 
Y
V
 
I
L
 
I
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
C
 
S
A
 
D
P
 
P
A
 
V
N
 
N
D
 
E
N
 
H
L
 
I
M
 
M
E
 
E
L
 
L
M
 
L
I
 
I
M
 
M
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
K
R
 
T
I
 
I
T
 
N
A
 
I
A
 
V
I
 
I
P
 
P
Y
 
Y
F
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
Q
|
Q
D
 
D
R
 
R
R
 
K
P
 
A
R
 
R
S
 
S
A
 
-
R
 
R
V
 
E
A
 
P
I
 
I
S
 
T
A
 
A
K
 
K
I
 
L
V
 
F
A
 
A
N
 
N
M
 
L
L
 
L
E
 
E
I
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
T
R
 
R
I
 
V
I
 
I
T
 
A
M
 
L
D
 
D
L
 
L
H
 
H
A
 
A
D
 
P
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
F
 
F
D
 
D
I
 
I
P
 
P
V
 
I
D
 
D
N
 
H
I
 
L
Y
 
M
A
 
G
T
 
V
P
 
P
V
 
I
L
 
L
L
 
G
G
 
E
D
 
Y
L
 
F
R
 
E
K
 
G
Q
 
K
N
 
N
Y
 
L
E
 
E
N
 
D
L
 
I
L
 
V
V
 
I
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
V
 
H
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
T
R
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
K
L
 
L
A
 
A
K
 
D
Q
 
R
L
 
L
N
 
K
C
 
A
D
 
P
L
 
I
A
 
A
I
 
I
I
 
I
D
 
D
K
|
K
R
 
R
R
|
R
P
 
P
K
x
R
A
 
P
N
|
N
V
 
V
A
 
A
E
|
E
V
 
V
M
 
M
N
 
N
I
 
I
I
 
V
G
 
G
E
 
N
V
 
I
E
 
E
G
 
G
R
 
K
T
 
T
C
 
A
V
 
I
I
 
L
M
 
I
D
 
D
D
 
D
M
 
I
V
 
I
D
|
D
T
|
T
A
|
A
G
|
G
T
|
T
L
 
I
C
 
T
K
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
N
V
 
A
L
 
L
K
 
V
E
 
E
R
 
N
G
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
E
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
Y
 
C
A
 
C
T
 
T
H
 
H
P
 
P
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
P
A
 
A
G
 
V
E
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
N
A
 
N
S
 
S
A
 
T
L
 
I
D
 
K
E
 
E
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
D
 
N
T
 
S
I
 
I
P
 
K
L
 
L
G
 
P
E
 
E
E
 
E
A
 
-
R
 
K
S
 
K
C
 
I
A
 
E
K
 
R
I
 
F
R
 
K
S
 
Q
L
 
L
T
 
S
S
 
V
A
 
G
G
 
P
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
A
F
 
I
S
 
I
R
 
R
I
 
V
R
 
H
R
 
E
G
 
Q
D
 
Q
S
 
S
V
 
V
M
 
S
S
 
Y
L
 
L
F
 
F
A
 
S

1ibsB Phosphoribosyldiphosphate synthetase in complex with cadmium ions (see paper)
51% identity, 97% coverage: 6:315/318 of query aligns to 3:299/299 of 1ibsB

query
sites
1ibsB
G
 
N
L
 
L
M
 
K
V
 
I
F
 
F
T
 
S
G
 
L
N
 
N
A
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
V
 
I
V
 
A
K
 
D
I
 
I
L
 
V
G
 
G
I
 
V
P
 
Q
L
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
C
M
 
S
V
 
V
S
 
T
R
 
R
F
 
F
S
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
V
Q
 
Q
V
 
I
E
 
N
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
N
 
S
V
 
I
R
 
R
G
 
G
K
 
C
D
 
D
V
 
C
F
 
Y
V
 
I
L
 
I
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
C
 
S
A
 
D
P
 
P
A
 
V
N
 
N
D
 
E
N
 
H
L
 
I
M
 
M
E
 
E
L
 
L
M
 
L
I
 
I
M
 
M
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
K
R
 
T
I
 
I
T
 
N
A
 
I
A
 
V
I
 
I
P
 
P
Y
 
Y
F
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
Q
|
Q
D
 
D
R
|
R
R
 
K
P
 
S
R
 
R
S
 
E
A
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
P
I
 
I
S
 
T
A
 
A
K
 
K
I
 
L
V
 
F
A
 
A
N
 
N
M
 
L
L
 
L
E
 
E
I
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
T
R
 
R
I
 
V
I
 
I
T
 
A
M
 
L
D
 
D
L
 
L
H
 
H
A
 
A
D
 
P
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
F
 
F
D
 
D
I
 
I
P
 
P
V
 
I
D
 
D
N
 
H
I
 
L
Y
 
M
A
 
G
T
 
V
P
 
P
V
 
I
L
 
L
L
 
G
G
 
E
D
 
Y
L
 
F
R
 
E
K
 
G
Q
 
K
N
 
N
Y
 
L
E
 
E
N
 
D
L
 
I
L
 
V
V
 
I
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
V
 
H
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
T
R
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
K
L
 
L
A
 
A
K
 
D
Q
 
R
L
 
L
N
 
K
C
 
A
D
 
P
L
 
I
A
 
A
I
 
I
I
 
I
D
 
D
K
 
K
R
 
R
R
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
-
M
 
M
N
 
N
I
 
I
I
 
V
G
 
G
E
 
N
V
 
I
E
 
E
G
 
G
R
 
K
T
 
T
C
 
A
V
 
I
I
 
L
M
 
I
D
 
D
D
 
D
M
 
I
V
 
I
D
 
D
T
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
I
C
 
T
K
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
N
V
 
A
L
 
L
K
 
V
E
 
E
R
 
N
G
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
E
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
Y
 
C
A
 
C
T
 
T
H
 
H
P
 
P
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
P
A
 
A
G
 
V
E
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
N
A
 
N
S
 
S
A
 
T
L
 
I
D
 
K
E
 
E
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
D
 
N
T
 
S
I
 
I
P
 
K
L
 
L
G
 
P
E
 
E
E
 
E
A
 
-
R
 
K
S
 
K
C
 
I
A
 
E
K
 
R
I
 
F
R
 
K
S
 
Q
L
 
L
T
 
S
S
 
V
A
 
G
G
 
P
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
A
F
 
I
S
 
I
R
 
R
I
 
V
R
 
H
R
 
E
G
 
Q
D
 
Q
S
 
S
V
 
V
M
 
S
S
 
Y
L
 
L
F
 
F

1ibsA Phosphoribosyldiphosphate synthetase in complex with cadmium ions (see paper)
51% identity, 97% coverage: 6:315/318 of query aligns to 1:297/297 of 1ibsA

query
sites
1ibsA
G
 
N
L
 
L
M
 
K
V
 
I
F
 
F
T
 
S
G
 
L
N
 
N
A
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
V
 
I
V
 
A
K
 
D
I
 
I
L
 
V
G
 
G
I
 
V
P
 
Q
L
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
C
M
 
S
V
 
V
S
 
T
R
 
R
F
 
F
S
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
V
Q
 
Q
V
 
I
E
 
N
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
N
 
S
V
 
I
R
 
R
G
 
G
K
 
C
D
 
D
V
 
C
F
 
Y
V
 
I
L
 
I
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
C
 
S
A
 
D
P
 
P
A
 
V
N
 
N
D
 
E
N
 
H
L
 
I
M
 
M
E
 
E
L
 
L
M
 
L
I
 
I
M
 
M
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
K
R
 
T
I
 
I
T
 
N
A
 
I
A
 
V
I
 
I
P
 
P
Y
 
Y
F
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
Q
|
Q
D
 
D
R
|
R
R
 
K
P
 
S
R
 
R
S
 
E
A
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
P
I
 
I
S
 
T
A
 
A
K
 
K
I
 
L
V
 
F
A
 
A
N
 
N
M
 
L
L
 
L
E
 
E
I
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
T
R
 
R
I
 
V
I
 
I
T
 
A
M
 
L
D
 
D
L
 
L
H
|
H
A
 
A
D
 
P
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
F
 
F
D
 
D
I
 
I
P
 
P
V
 
I
D
 
D
N
 
H
I
 
L
Y
 
M
A
 
G
T
 
V
P
 
P
V
 
I
L
 
L
L
 
G
G
 
E
D
 
Y
L
 
F
R
 
E
K
 
G
Q
 
K
N
 
N
Y
 
L
E
 
E
N
 
D
L
 
I
L
 
V
V
 
I
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
V
 
H
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
T
R
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
K
L
 
L
A
 
A
K
 
D
Q
 
R
L
 
L
N
 
K
C
 
A
D
 
P
L
 
I
A
 
A
I
 
I
I
 
I
D
 
D
K
 
K
R
 
R
R
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
-
M
 
M
N
 
N
I
 
I
I
 
V
G
 
G
E
 
N
V
 
I
E
 
E
G
 
G
R
 
K
T
 
T
C
 
A
V
 
I
I
 
L
M
 
I
D
 
D
D
 
D
M
 
I
V
 
I
D
|
D
T
|
T
A
|
A
G
 
G
T
|
T
L
 
I
C
 
T
K
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
N
V
 
A
L
 
L
K
 
V
E
 
E
R
 
N
G
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
E
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
Y
 
C
A
 
C
T
 
T
H
 
H
P
 
P
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
P
A
 
A
G
 
V
E
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
N
A
 
N
S
 
S
A
 
T
L
 
I
D
 
K
E
 
E
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
D
 
N
T
 
S
I
 
I
P
 
K
L
 
L
G
 
P
E
 
E
E
 
E
A
 
-
R
 
K
S
 
K
C
 
I
A
 
E
K
 
R
I
 
F
R
 
K
S
 
Q
L
 
L
T
 
S
S
 
V
A
 
G
G
 
P
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
A
F
 
I
S
 
I
R
 
R
I
 
V
R
 
H
R
 
E
G
 
Q
D
 
Q
S
 
S
V
 
V
M
 
S
S
 
Y
L
 
L
F
 
F

1dkuA Crystal structures of bacillus subtilis phosphoribosylpyrophosphate synthetase: molecular basis of allosteric inhibition and activation. (see paper)
52% identity, 97% coverage: 6:315/318 of query aligns to 1:295/295 of 1dkuA

query
sites
1dkuA
G
 
N
L
 
L
M
 
K
V
 
I
F
 
F
T
 
S
G
 
L
N
 
N
A
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
V
 
I
V
 
A
K
 
D
I
 
I
L
 
V
G
 
G
I
 
V
P
 
Q
L
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
C
M
 
S
V
 
V
S
 
T
R
 
R
F
 
F
S
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
V
Q
 
Q
V
 
I
E
 
N
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
N
 
S
V
 
I
R
 
R
G
 
G
K
 
C
D
 
D
V
 
C
F
 
Y
V
 
I
L
 
I
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
C
 
S
A
 
D
P
 
P
A
 
V
N
 
N
D
 
E
N
 
H
L
 
I
M
 
M
E
 
E
L
 
L
M
 
L
I
 
I
M
 
M
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
K
R
 
T
I
 
I
T
 
N
A
 
I
A
 
V
I
 
I
P
 
P
Y
 
Y
F
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
Q
 
Q
D
 
D
R
 
R
R
x
K
P
 
A
R
 
R
S
|
S
A
 
-
R
|
R
V
 
E
A
 
P
I
 
I
S
 
T
A
 
A
K
 
K
I
 
L
V
 
F
A
 
A
N
 
N
M
 
L
L
 
L
E
 
E
I
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
T
R
 
R
I
 
V
I
 
I
T
 
A
M
 
L
D
 
D
L
 
L
H
|
H
A
 
A
D
 
P
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
F
 
F
D
 
D
I
 
I
P
 
P
V
 
I
D
|
D
N
 
H
I
 
L
Y
 
M
A
 
G
T
 
V
P
 
P
V
 
I
L
 
L
L
 
G
G
 
E
D
 
Y
L
 
F
R
 
E
K
 
G
Q
 
K
N
 
N
Y
 
L
E
 
E
N
 
D
L
 
I
L
 
V
V
 
I
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
V
 
H
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
T
R
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
K
L
 
L
A
 
A
K
 
D
Q
 
R
L
 
L
N
 
K
C
 
A
D
 
P
L
 
I
A
 
A
I
 
I
I
 
I
D
 
D
K
 
K
R
 
R
R
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
-
M
 
M
N
 
N
I
 
I
I
 
V
G
 
G
E
 
N
V
 
I
E
 
E
G
 
G
R
 
K
T
 
T
C
 
A
V
 
I
I
 
L
M
 
I
D
 
D
D
 
D
M
 
I
V
 
I
D
 
D
T
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
I
C
 
T
K
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
N
V
 
A
L
 
L
K
 
V
E
 
E
R
 
N
G
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
E
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
Y
 
C
A
 
C
T
 
T
H
 
H
P
 
P
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
P
A
 
A
G
 
V
E
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
N
A
 
N
S
 
S
A
 
T
L
 
I
D
 
K
E
 
E
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
D
 
N
T
 
S
I
 
I
P
 
K
L
 
L
G
 
K
E
 
I
E
 
E
A
 
-
R
 
-
S
 
-
C
 
-
A
 
-
K
 
R
I
 
F
R
 
K
S
 
Q
L
 
L
T
 
S
S
 
V
A
 
G
G
 
P
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
A
F
 
I
S
 
I
R
 
R
I
 
V
R
 
H
R
 
E
G
 
Q
D
 
Q
S
|
S
V
|
V
M
x
S
S
 
Y
L
 
L
F
|
F

P60891 Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1; PPRibP; Phosphoribosyl pyrophosphate synthase I; PRS-I; EC 2.7.6.1 from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
48% identity, 98% coverage: 6:317/318 of query aligns to 3:315/318 of P60891

query
sites
P60891
G
 
N
L
 
I
M
 
K
V
 
I
F
 
F
T
 
S
G
 
G
N
 
S
A
 
S
N
 
H
P
 
Q
A
 
D
L
 
L
A
x
S
Q
 
Q
E
 
K
V
 
I
V
 
A
K
 
D
I
 
R
L
 
L
G
 
G
I
 
L
P
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
V
M
 
V
V
 
T
S
 
K
R
 
K
F
 
F
S
 
S
D
 
N
G
 
Q
E
 
E
I
 
T
Q
 
C
V
 
V
E
 
E
I
 
I
Q
 
G
E
 
E
N
 
S
V
 
V
R
 
R
G
 
G
K
 
E
D
|
D
V
 
V
F
 
Y
V
 
I
L
 
V
Q
 
Q
S
 
S
T
 
G
C
 
C
A
 
G
P
 
E
A
 
I
N
 
N
D
 
D
N
 
N
L
 
L
M
 
M
E
 
E
L
 
L
M
 
L
I
 
I
M
 
M
V
 
I
D
 
N
A
 
A
L
 
C
K
 
K
R
 
I
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
S
R
 
R
I
 
V
T
 
T
A
 
A
A
 
V
I
 
I
P
 
P
Y
 
C
F
 
F
G
 
P
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
R
 
K
R
 
K
P
 
D
R
 
K
S
 
S
A
 
-
R
 
R
V
 
A
A
 
P
I
 
I
S
 
S
A
 
A
K
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
A
N
|
N
M
 
M
L
 
L
E
 
S
I
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
D
R
 
H
I
 
I
I
 
I
T
 
T
M
 
M
D
 
D
L
|
L
H
 
H
A
 
A
D
x
S
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
F
 
F
D
 
D
I
 
I
P
 
P
V
|
V
D
 
D
N
|
N
I
 
L
Y
|
Y
A
 
A
T
 
E
P
 
P
V
 
A
L
 
V
L
 
L
G
 
K
D
 
W
L
 
I
R
 
R
K
 
E
Q
 
N
-
 
I
-
 
S
N
 
E
Y
 
W
E
 
R
N
 
N
L
 
C
L
 
T
V
 
I
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
V
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
A
V
 
K
R
 
R
A
 
V
R
 
T
A
 
S
L
 
I
A
 
A
K
x
D
Q
 
R
L
 
L
N
 
N
C
 
V
D
 
D
L
 
F
A
|
A
I
 
L
I
 
I
D
x
H
K
 
K
R
 
E
R
 
R
P
 
K
K
 
K
A
 
A
N
 
N
V
 
E
A
 
V
E
x
D
V
 
R
M
 
M
N
 
V
I
 
L
I
 
V
G
 
G
E
 
D
V
 
V
E
 
K
G
 
D
R
 
R
T
 
V
C
 
A
V
 
I
I
 
L
M
x
V
D
 
D
D
 
D
M
 
M
V
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
C
G
 
G
T
 
T
L
 
I
C
 
C
K
x
H
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
V
 
K
L
 
L
K
 
L
E
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
T
Q
 
R
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
Y
 
I
A
 
L
T
 
T
H
 
H
P
 
G
V
 
I
L
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
P
A
 
A
G
 
I
E
 
S
R
 
R
I
 
I
A
 
N
A
 
N
S
 
A
A
 
C
L
 
F
D
 
E
E
 
A
L
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
D
 
N
T
 
T
I
 
I
P
 
P
L
 
Q
G
 
E
E
 
D
E
 
K
A
 
M
R
 
K
S
 
H
C
 
C
A
 
S
K
 
K
I
 
I
R
 
Q
S
 
V
L
 
I
T
 
D
S
 
I
A
 
S
G
 
M
L
 
I
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
A
F
 
I
S
 
R
R
 
R
I
 
T
R
 
H
R
 
N
G
 
G
D
 
E
S
 
S
V
 
V
M
 
S
S
 
Y
L
 
L
F
 
F
A
 
S
E
 
H

Sites not aligning to the query:

8dbkB Human prps1 with phosphate, atp, and r5p; hexamer with resolved catalytic loops (see paper)
48% identity, 98% coverage: 6:317/318 of query aligns to 2:314/316 of 8dbkB

query
sites
8dbkB
G
 
N
L
 
I
M
 
K
V
 
I
F
 
F
T
 
S
G
 
G
N
 
S
A
 
S
N
 
H
P
 
Q
A
 
D
L
 
L
A
 
S
Q
 
Q
E
 
K
V
 
I
V
 
A
K
 
D
I
 
R
L
 
L
G
 
G
I
 
L
P
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
V
M
 
V
V
 
T
S
 
K
R
 
K
F
|
F
S
 
S
D
x
N
G
 
Q
E
|
E
I
 
T
Q
 
C
V
 
V
E
 
E
I
 
I
Q
 
G
E
 
E
N
x
S
V
 
V
R
|
R
G
 
G
K
 
E
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
V
 
I
L
 
V
Q
 
Q
S
 
S
T
 
G
C
 
C
A
 
G
P
 
E
A
 
I
N
 
N
D
 
D
N
 
N
L
 
L
M
 
M
E
 
E
L
 
L
M
 
L
I
 
I
M
 
M
V
 
I
D
 
N
A
 
A
L
 
C
K
 
K
R
 
I
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
S
R
 
R
I
 
V
T
 
T
A
 
A
A
 
V
I
 
I
P
 
P
Y
 
C
F
 
F
G
 
P
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
Q
|
Q
D
 
D
R
 
K
R
 
K
P
 
D
R
 
K
S
 
S
A
 
-
R
 
R
V
 
A
A
 
P
I
 
I
S
 
S
A
 
A
K
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
A
N
 
N
M
 
M
L
 
L
E
 
S
I
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
D
R
 
H
I
 
I
I
 
I
T
 
T
M
 
M
D
 
D
L
 
L
H
|
H
A
 
A
D
 
S
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
F
 
F
D
 
D
I
 
I
P