SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_02701 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_02701 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 5 hits to proteins with known functional sites (download)

P76014 PEP-dependent dihydroxyacetone kinase, ADP-binding subunit DhaL; EC 2.7.1.121 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
31% identity, 97% coverage: 1:202/208 of query aligns to 1:204/210 of P76014

query
sites
P76014
M
 
M
S
 
S
V
 
L
S
 
S
N
 
R
N
 
T
E
 
Q
L
 
I
R
 
V
E
 
N
L
 
W
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
C
L
 
G
N
 
D
A
 
I
L
 
F
P
 
S
A
 
T
H
 
E
A
 
S
D
 
E
E
 
Y
L
 
L
R
 
T
D
 
G
L
 
L
D
|
D
A
 
R
A
 
E
L
 
I
G
 
G
D
|
D
G
 
A
D
|
D
L
x
H
G
|
G
I
x
L
T
x
N
V
 
M
R
 
N
A
 
R
G
 
G
S
 
F
A
 
S
A
 
K
V
 
V
V
 
V
N
 
E
A
 
K
L
 
L
A
 
P
A
 
A
L
 
I
P
 
A
D
 
D
G
 
-
A
 
K
S
 
D
L
 
I
S
 
G
D
 
F
V
 
I
L
 
L
L
 
K
A
 
N
A
 
T
G
 
G
K
 
M
A
 
T
F
 
L
S
 
L
T
 
S
A
 
S
N
 
V
P
 
G
S
 
G
T
x
A
F
x
S
A
 
G
A
 
P
L
 
L
V
 
F
G
 
G
G
 
T
G
 
F
L
 
F
L
 
I
A
 
R
A
 
A
A
 
A
K
 
Q
A
 
A
V
 
T
P
 
Q
G
 
A
V
 
R
Q
 
Q
G
 
S
V
 
L
G
 
T
R
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
L
L
 
Y
A
 
Q
I
 
M
G
 
F
R
 
R
A
 
D
V
 
G
A
 
A
G
 
D
R
 
G
I
 
V
V
 
I
E
 
S
R
 
R
G
|
G
K
 
K
S
 
A
Q
 
E
L
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
K
T
 
T
V
x
M
L
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
W
L
 
V
P
 
P
S
 
V
L
 
V
D
 
E
T
 
S
L
 
L
E
 
R
A
 
Q
S
 
S
Q
 
S
G
 
E
S
 
Q
A
 
N
V
 
L
E
 
S
L
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
A
M
 
A
I
 
S
A
 
S
T
 
I
A
 
A
Q
 
E
E
 
S
G
 
A
V
 
A
A
 
Q
A
 
S
T
 
T
A
 
I
S
 
T
I
 
M
Q
 
Q
S
 
A
R
 
R
K
 
K
G
 
G
R
|
R
A
 
A
A
 
S
W
 
Y
V
 
L
Q
 
G
E
 
E
R
 
R
S
 
S
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
Q
D
|
D
P
|
P
G
|
G
A
 
A
T
 
T
A
 
S
Y
 
V
V
 
M
R
 
F
F
 
M
L
 
M
Q
 
Q
A
 
M
L
 
L

4lrzA Crystal structure of the e.Coli dhar(n)-dhal complex (see paper)
31% identity, 97% coverage: 2:202/208 of query aligns to 3:205/211 of 4lrzA

query
sites
4lrzA
S
 
S
V
 
L
S
 
S
N
 
R
N
 
T
E
 
Q
L
 
I
R
 
V
E
 
N
L
 
W
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
C
L
 
G
N
 
D
A
 
I
L
 
F
P
 
S
A
 
T
H
 
E
A
 
S
D
 
E
E
 
Y
L
 
L
R
 
T
D
 
G
L
 
L
D
|
D
A
 
R
A
 
E
L
 
I
G
 
G
D
|
D
G
 
A
D
|
D
L
x
H
G
 
G
I
 
L
T
 
N
V
 
M
R
 
N
A
 
R
G
 
G
S
 
F
A
 
S
A
 
K
V
 
V
V
 
V
N
 
E
A
 
K
L
 
L
A
 
P
A
 
A
L
 
I
P
 
A
D
 
D
G
 
-
A
 
K
S
 
D
L
 
I
S
 
G
D
 
F
V
 
I
L
 
L
L
 
K
A
 
N
A
 
T
G
 
G
K
 
M
A
 
T
F
 
L
S
 
L
T
 
S
A
 
S
N
 
V
P
 
G
S
x
G
T
x
A
F
x
S
A
 
G
A
 
P
L
|
L
V
 
F
G
 
G
G
 
T
G
 
F
L
 
F
L
 
I
A
 
R
A
 
A
A
 
A
K
 
Q
A
 
A
V
 
T
P
 
Q
G
 
A
V
 
R
Q
 
Q
G
 
S
V
 
L
G
 
T
R
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
L
L
 
Y
A
 
Q
I
 
M
G
 
F
R
 
R
A
 
D
V
 
G
A
 
A
G
 
D
R
 
G
I
 
V
V
 
I
E
 
S
R
 
R
G
|
G
K
 
K
S
 
A
Q
 
E
L
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
K
T
|
T
V
x
M
L
 
C
D
 
D
A
 
V
L
 
W
L
 
V
P
 
P
S
 
V
L
 
V
D
 
E
T
 
S
L
 
L
E
 
R
A
 
Q
S
 
S
Q
 
S
G
 
E
S
 
Q
A
 
N
V
 
L
E
 
S
L
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
A
M
 
A
I
 
S
A
 
S
T
 
I
A
 
A
Q
 
E
E
 
S
G
 
A
V
 
A
A
 
Q
A
 
S
T
 
T
A
 
I
S
 
T
I
 
M
Q
 
Q
S
 
A
R
 
R
K
 
K
G
|
G
R
 
R
A
 
A
A
 
S
W
 
Y
V
 
L
Q
 
G
E
 
E
R
 
R
S
 
S
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
Q
D
|
D
P
|
P
G
|
G
A
 
A
T
 
T
A
 
S
Y
 
V
V
 
M
R
 
F
F
 
M
L
 
M
Q
 
Q
A
 
M
L
 
L

Q9CIV7 PTS-dependent dihydroxyacetone kinase, ADP-binding subunit DhaL; EC 2.7.1.121 from Lactococcus lactis subsp. lactis (strain IL1403) (Streptococcus lactis) (see paper)
28% identity, 88% coverage: 26:207/208 of query aligns to 25:192/192 of Q9CIV7

query
sites
Q9CIV7
L
 
L
R
 
S
D
 
E
L
 
L
D
|
D
A
 
G
A
 
P
L
 
I
G
 
G
D
|
D
G
 
G
D
|
D
L
x
H
G
|
G
I
x
A
T
x
N
V
 
M
R
 
A
A
 
R
G
 
G
S
 
M
A
 
S
A
 
E
V
 
T
V
 
M
N
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
E
A
 
-
L
 
V
P
 
S
D
 
N
G
 
F
A
 
G
S
 
N
L
 
V
S
 
S
D
 
E
V
 
I
L
 
F
L
 
K
A
 
K
A
 
V
G
 
A
K
 
M
A
 
T
F
 
L
S
 
M
T
 
S
A
 
K
N
 
V
P
 
G
S
 
G
T
x
A
F
x
S
A
 
G
A
 
P
L
 
L
V
 
Y
G
 
G
G
 
S
G
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
M
A
 
S
K
 
K
A
 
T
V
 
-
P
 
-
G
 
A
V
 
I
Q
 
E
G
 
T
V
 
L
G
 
D
R
 
T
A
 
S
E
 
E
A
 
L
L
 
I
A
 
Y
I
 
A
G
 
G
R
 
L
A
 
E
V
 
A
A
 
-
G
 
-
R
 
-
I
 
I
V
 
Q
E
 
K
R
|
R
G
|
G
K
 
K
S
 
A
Q
 
Q
L
 
V
G
 
G
D
 
E
K
 
K
T
 
T
V
x
M
L
 
V
D
 
D
A
 
I
L
 
W
L
 
S
P
 
A
S
 
F
L
 
L
D
 
N
T
 
D
L
 
L
E
 
Q
A
 
T
S
 
D
Q
 
S
G
 
A
S
 
S
A
 
K
V
 
D
E
 
N
L
 
L
L
 
-
D
 
-
A
 
-
M
 
-
I
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
Q
 
E
E
 
K
G
 
V
V
 
V
A
 
K
A
 
A
T
 
S
A
 
A
S
 
G
I
 
L
Q
 
L
S
 
A
R
 
T
K
 
K
G
 
G
R
|
R
A
 
A
A
 
S
W
x
Y
V
 
L
Q
 
G
E
 
E
R
 
R
S
 
S
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
I
D
|
D
P
|
P
G
|
G
A
 
T
T
 
Q
A
 
S
Y
 
S
V
 
A
R
 
Y
F
 
L
L
 
F
Q
 
E
A
 
T
L
 
L
R
 
L
E
 
E
A
 
V
C
 
V
A
 
A

3cr3A Structure of a transient complex between dha-kinase subunits dham and dhal from lactococcus lactis (see paper)
28% identity, 88% coverage: 26:207/208 of query aligns to 25:192/192 of 3cr3A

query
sites
3cr3A
L
 
L
R
 
S
D
 
E
L
 
L
D
|
D
A
 
G
A
 
P
L
 
I
G
 
G
D
|
D
G
 
G
D
|
D
L
x
H
G
 
G
I
 
A
T
x
N
V
 
M
R
 
A
A
 
R
G
 
G
S
 
M
A
 
S
A
 
E
V
 
T
V
 
M
N
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
E
A
 
-
L
 
V
P
 
S
D
 
N
G
 
F
A
 
G
S
 
N
L
 
V
S
 
S
D
 
E
V
 
I
L
 
F
L
 
K
A
 
K
A
 
V
G
 
A
K
 
M
A
 
T
F
 
L
S
 
M
T
 
S
A
 
K
N
 
V
P
 
G
S
x
G
T
x
A
F
x
S
A
 
G
A
 
P
L
|
L
V
 
Y
G
 
G
G
 
S
G
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
M
A
 
S
K
 
K
A
 
T
V
 
-
P
 
-
G
 
A
V
 
I
Q
 
E
G
 
T
V
 
L
G
 
D
R
 
T
A
 
S
E
 
E
A
 
L
L
 
I
A
 
Y
I
 
A
G
 
G
R
 
L
A
 
E
V
 
A
A
 
-
G
 
-
R
 
-
I
 
I
V
 
Q
E
 
K
R
 
R
G
|
G
K
 
K
S
x
A
Q
 
Q
L
 
V
G
 
G
D
 
E
K
 
K
T
|
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
A
 
I
L
 
W
L
 
S
P
 
A
S
 
F
L
 
L
D
 
N
T
 
D
L
 
L
E
 
Q
A
 
T
S
 
D
Q
 
S
G
 
A
S
 
S
A
 
K
V
 
D
E
 
N
L
 
L
L
 
-
D
 
-
A
 
-
M
 
-
I
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
Q
 
E
E
 
K
G
 
V
V
 
V
A
 
K
A
 
A
T
 
S
A
 
A
S
 
G
I
 
L
Q
 
L
S
 
A
R
 
T
K
 
K
G
 
G
R
 
R
A
 
A
A
 
S
W
 
Y
V
 
L
Q
 
G
E
 
E
R
 
R
S
 
S
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
I
D
|
D
P
|
P
G
|
G
A
 
T
T
 
Q
A
 
S
Y
 
S
V
 
A
R
 
Y
F
 
L
L
 
F
Q
 
E
A
 
T
L
 
L
R
 
L
E
 
E
A
 
V
C
 
V
A
 
A

P45510 Dihydroxyacetone kinase; DHA kinase; Glycerone kinase; EC 2.7.1.29 from Citrobacter freundii (see 2 papers)
29% identity, 96% coverage: 10:208/208 of query aligns to 363:552/552 of P45510

query
sites
P45510
E
 
E
L
 
L
L
 
V
T
 
T
R
 
A
A
 
T
L
 
L
N
 
S
A
 
D
L
 
L
P
 
E
A
 
T
H
 
H
A
 
-
D
 
-
E
 
-
L
 
L
R
 
N
D
 
A
L
 
L
D
|
D
A
 
A
A
 
K
L
 
V
G
 
G
D
|
D
G
|
G
D
|
D
L
x
T
G
 
G
I
 
S
T
 
T
V
 
F
R
 
A
A
 
A
G
 
A
S
 
A
A
 
R
A
 
E
V
 
I
V
 
A
N
 
S
A
 
L
L
 
L
A
 
H
-
 
R
-
 
Q
A
 
Q
L
 
L
P
 
P
D
 
L
G
 
N
A
 
-
S
 
N
L
 
L
S
 
A
D
 
T
V
 
L
L
 
F
L
 
A
A
 
L
A
 
I
G
 
G
K
 
E
A
 
R
F
 
L
S
 
T
T
 
V
A
 
V
N
 
M
P
 
G
S
 
G
T
x
S
F
x
S
A
 
G
A
 
V
L
 
L
V
 
M
G
 
S
G
 
I
G
 
F
L
 
F
L
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
G
K
 
Q
A
 
K
V
 
L
P
 
E
G
 
-
V
 
-
Q
 
Q
G
 
G
V
 
A
G
 
N
R
 
V
A
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
N
I
 
T
G
 
G
R
 
L
A
 
A
V
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
Q
I
 
M
V
 
K
E
 
F
R
 
Y
G
|
G
K
 
G
S
 
A
Q
 
D
L
 
E
G
 
G
D
 
D
K
 
R
T
|
T
V
x
M
L
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
Q
P
 
P
S
 
A
L
 
L
D
 
T
T
 
S
L
 
L
E
 
L
A
 
A
S
 
-
Q
 
Q
G
 
P
S
 
K
A
 
N
V
 
L
E
 
Q
L
 
A
L
 
A
D
 
F
A
 
D
M
 
A
I
 
A
A
 
Q
T
 
A
A
 
G
Q
 
A
E
 
E
G
 
R
V
 
T
A
 
C
A
 
L
T
 
S
A
 
S
S
 
-
I
 
-
Q
 
K
S
 
A
R
 
N
K
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
A
A
 
S
W
 
Y
V
 
L
Q
 
S
E
 
S
R
 
E
S
 
S
-
 
L
I
 
L
G
 
G
H
 
N
A
 
M
D
|
D
P
|
P
G
|
G
A
 
A
T
 
Q
A
 
R
Y
 
L
V
 
A
R
 
M
F
 
V
L
 
F
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
A
E
 
E
A
 
S
C
 
E
A
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>H281DRAFT_02701 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_02701
MSVSNNELRELLTRALNALPAHADELRDLDAALGDGDLGITVRAGSAAVVNALAALPDGA
SLSDVLLAAGKAFSTANPSTFAALVGGGLLAAAKAVPGVQGVGRAEALAIGRAVAGRIVE
RGKSQLGDKTVLDALLPSLDTLEASQGSAVELLDAMIATAQEGVAATASIQSRKGRAAWV
QERSIGHADPGATAYVRFLQALREACAG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory