SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_02712 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_02712 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P04983 Ribose import ATP-binding protein RbsA; EC 7.5.2.7 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
45% identity, 98% coverage: 9:503/505 of query aligns to 4:491/501 of P04983

query
sites
P04983
F
 
L
L
 
L
E
 
Q
M
 
L
R
 
K
N
 
G
I
 
I
S
 
D
R
 
K
T
 
A
F
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
S
R
 
G
V
 
A
N
 
A
L
 
L
E
 
N
I
 
V
R
 
Y
A
 
P
G
 
G
E
 
R
V
 
V
L
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
V
G
 
G
E
 
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
M
M
 
M
K
 
K
I
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
A
 
T
P
 
R
D
 
D
P
 
-
G
 
A
G
 
G
T
 
T
I
 
L
L
 
L
V
 
W
E
 
L
G
 
G
Q
 
K
E
 
E
V
 
T
A
 
T
L
 
F
A
 
T
D
 
G
S
 
P
H
 
K
H
 
S
A
 
S
R
 
Q
T
 
E
L
 
A
G
 
G
V
 
I
N
 
G
I
 
I
I
 
I
Y
 
H
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
N
V
 
L
V
 
I
G
 
P
N
 
Q
L
 
L
T
 
T
V
 
I
G
 
A
E
 
E
N
 
N
I
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
G
R
 
R
E
 
E
P
 
F
R
 
V
T
 
N
R
 
R
L
 
F
G
 
G
L
 
K
I
 
I
D
 
D
R
 
W
P
 
K
R
 
T
M
 
M
Y
 
Y
R
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
D
E
 
K
V
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
K
I
 
L
D
 
N
M
 
L
D
 
R
I
 
F
D
 
K
P
 
S
A
 
D
T
 
K
R
 
L
V
 
V
S
 
G
E
 
D
L
 
L
S
 
S
V
 
I
G
 
G
Q
 
D
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
M
I
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
V
L
 
L
C
 
S
A
 
F
R
 
E
S
 
S
K
 
K
A
 
V
I
 
I
I
 
I
M
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
D
S
 
A
L
 
L
S
 
T
H
 
D
H
 
T
E
 
E
T
 
T
S
 
E
V
 
S
L
 
L
L
 
F
G
 
R
I
 
V
V
 
I
K
 
R
R
 
E
L
 
L
R
 
K
E
 
S
R
 
Q
N
 
G
I
 
R
A
 
G
V
 
I
V
 
V
Y
 
Y
I
 
I
S
 
S
H
 
H
R
 
R
L
 
M
E
 
K
E
 
E
I
 
I
F
 
F
E
 
E
L
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
D
V
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
F
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
T
 
F
V
 
I
G
 
A
T
 
E
A
 
R
P
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
S
M
 
L
T
 
T
R
 
E
E
 
D
T
 
S
L
 
L
V
 
I
R
 
E
L
 
M
M
 
M
V
 
V
A
 
G
R
 
R
E
 
K
L
 
L
S
 
E
E
 
D
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
-
E
 
-
P
 
-
Q
 
-
S
 
P
H
 
H
A
 
L
S
 
D
R
 
K
D
 
A
P
 
P
V
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
G
A
 
D
L
 
I
S
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
V
V
 
D
R
 
N
K
 
L
A
 
C
E
 
G
P
 
P
R
 
G
I
 
V
R
 
N
D
 
D
I
 
V
S
 
S
F
 
F
T
 
T
L
 
L
H
 
R
R
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
V
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
M
G
 
G
S
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
T
E
 
E
I
 
L
M
 
M
E
 
K
M
 
V
I
 
L
F
 
Y
G
 
G
-
 
A
M
 
L
R
 
P
A
 
R
C
 
T
T
 
S
G
 
G
S
 
Y
V
 
V
K
 
T
I
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
H
P
 
E
V
 
V
S
 
V
I
 
T
R
 
R
N
 
S
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
A
 
G
I
 
L
R
 
A
S
 
N
G
 
G
I
 
I
G
 
V
F
 
Y
V
 
I
T
 
S
E
 
E
D
 
D
R
 
R
K
 
K
A
 
R
Q
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
M
 
M
T
 
S
V
 
V
R
 
K
E
 
E
N
 
N
F
 
M
S
 
S
L
 
L
T
 
T
H
 
A
L
 
L
E
 
R
R
 
Y
Y
 
F
S
 
S
-
 
R
P
 
A
F
 
G
Q
 
G
F
 
S
V
 
L
Q
 
K
H
 
H
A
 
A
R
 
D
E
 
E
R
 
Q
E
 
Q
S
 
A
C
 
V
R
 
S
R
 
D
F
 
F
V
 
I
R
 
R
M
 
L
L
 
F
G
 
N
I
 
V
K
 
K
T
 
T
P
 
P
G
 
S
V
 
M
E
 
E
Q
 
Q
K
 
A
V
 
I
V
 
G
N
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
Q
 
Q
K
 
K
I
 
V
V
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
W
 
G
V
 
L
A
 
M
R
 
T
S
 
R
P
 
P
K
 
K
V
 
V
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
R
 
R
G
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
K
E
 
E
V
 
I
H
 
Y
A
 
Q
L
 
L
I
 
I
A
 
N
R
 
Q
L
 
F
A
 
K
A
 
A
E
 
D
G
 
G
I
 
L
G
 
S
V
 
I
I
 
I
V
 
L
I
 
V
S
 
S
S
 
S
D
 
E
L
 
M
L
 
P
E
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
G
V
 
M
S
 
S
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
I
T
 
V
V
 
M
R
 
H
E
 
E
G
 
G
R
 
H
I
 
L
S
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
F
S
 
T
R
 
R
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A
S
 
T
Q
 
Q
E
 
E
K
 
V
V
 
L
M
 
M
A
 
A
L
 
A
A
 
A

P75831 Macrolide export ATP-binding/permease protein MacB; EC 7.6.2.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
34% identity, 44% coverage: 8:230/505 of query aligns to 3:226/648 of P75831

query
sites
P75831
P
 
P
F
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
L
R
 
K
N
 
D
I
 
I
S
 
R
R
 
R
T
 
S
F
 
Y
P
 
P
G
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
Q
V
 
V
K
 
E
A
 
V
L
 
L
D
 
K
R
 
G
V
 
I
N
 
S
L
 
L
E
 
D
I
 
I
R
 
Y
A
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
M
L
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
V
G
 
G
E
 
A
N
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
K
 
N
I
 
I
L
 
L
T
 
-
G
 
G
I
 
C
Y
 
L
A
 
D
P
 
K
D
 
A
P
 
T
G
 
S
G
 
G
T
 
T
I
 
Y
L
 
R
V
 
V
E
 
A
G
 
G
Q
 
Q
E
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
T
A
 
L
D
 
D
S
 
A
H
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
A
H
 
Q
A
 
L
R
 
R
T
 
R
L
 
E
G
 
H
V
 
F
N
 
G
I
 
F
I
 
I
Y
 
F
Q
 
Q
E
 
R
L
 
Y
A
 
H
V
 
L
V
 
L
G
 
S
N
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
A
G
 
E
E
 
Q
N
 
N
I
 
V
F
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
E
E
 
V
P
 
P
R
 
A
T
 
V
R
 
Y
L
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
E
D
 
R
R
 
K
P
 
Q
R
 
R
M
 
L
Y
 
L
R
 
R
E
 
-
A
 
A
R
 
Q
E
 
E
V
 
L
L
 
L
A
 
Q
T
 
R
I
 
L
D
 
G
M
 
L
D
 
E
I
 
D
D
 
R
P
 
T
A
 
E
T
 
Y
R
 
Y
V
 
P
S
 
A
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
I
 
V
E
 
S
I
 
I
A
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
M
A
 
N
R
 
G
S
 
G
K
 
Q
A
 
V
I
 
I
I
 
L
M
 
A
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
G
S
 
A
L
 
L
S
 
D
H
 
S
H
 
H
E
 
S
T
 
G
S
 
E
V
 
E
L
 
V
L
 
M
G
 
A
I
 
I
V
 
L
K
 
H
R
 
Q
L
 
L
R
 
R
E
 
D
R
 
R
N
 
G
I
 
H
A
 
T
V
 
V
V
 
I
Y
 
I
I
 
V
S
 
T
H
 
H
R
 
D
L
 
-
E
 
P
E
 
Q
I
 
V
F
 
A
E
 
A
L
 
Q
A
 
A
D
 
E
R
 
R
V
 
V
T
 
I
V
 
E
L
 
I
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
E
T
 
I
V
 
V
G
 
R
T
 
N
A
 
P
P
 
P

P69874 Spermidine/putrescine import ATP-binding protein PotA; EC 7.6.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
29% identity, 43% coverage: 8:224/505 of query aligns to 16:225/378 of P69874

query
sites
P69874
P
 
P
F
 
L
L
 
V
E
 
Q
M
 
L
R
 
A
N
 
G
I
 
I
S
 
R
R
 
K
T
x
C
F
|
F
P
 
D
G
 
G
V
 
K
K
 
E
A
 
V
L
 
I
D
 
P
R
 
Q
V
 
L
N
 
D
L
 
L
E
 
T
I
 
I
R
 
N
A
 
N
G
 
G
E
 
E
V
x
F
L
 
L
A
 
T
L
 
L
A
 
L
G
 
G
E
 
P
N
 
S
G
 
G
A
x
C
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
V
M
x
L
K
 
R
I
 
L
L
 
I
T
 
A
G
 
G
I
 
L
Y
 
E
A
 
T
P
 
V
D
 
D
P
 
-
G
 
S
G
 
G
T
 
R
I
 
I
L
 
M
V
x
L
E
 
D
G
 
N
Q
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
T
L
 
H
A
 
V
D
 
P
S
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
A
R
 
E
T
 
N
L
 
R
G
 
Y
V
 
V
N
 
N
I
 
T
I
 
V
Y
 
F
Q
 
Q
E
 
S
L
 
Y
A
 
A
V
 
L
V
 
F
G
 
P
N
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
F
E
 
E
N
 
N
I
 
V
-
 
A
F
 
F
L
 
G
A
 
L
R
 
R
E
 
M
P
 
Q
R
 
K
T
 
T
R
 
P
L
 
A
G
 
A
L
 
E
I
 
I
D
 
-
R
 
T
P
 
P
R
 
R
M
 
V
Y
 
M
R
 
-
E
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
E
V
 
A
L
 
L
A
 
R
T
 
M
I
x
V
D
 
Q
M
 
L
D
 
E
I
 
T
D
 
F
P
 
A
A
 
Q
T
 
R
R
 
K
V
 
P
S
 
H
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
I
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
V
C
 
V
A
 
N
R
 
K
S
 
P
K
 
R
A
 
L
I
 
L
I
 
L
M
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
S
T
 
L
A
 
S
S
 
A
L
 
L
S
 
D
H
 
Y
H
 
K
E
 
L
T
 
R
S
 
K
V
 
Q
L
 
M
L
 
Q
G
 
N
I
 
E
V
 
L
K
 
K
R
 
A
L
 
L
-
 
Q
R
 
R
E
 
K
R
 
L
N
 
G
I
 
I
A
 
T
V
 
F
V
 
V
Y
 
F
I
 
V
S
 
T
H
 
H
R
 
D
L
 
Q
E
 
E
E
 
E
I
 
A
F
 
L
E
 
T
L
 
M
A
 
S
D
 
D
R
 
R
V
 
I
T
 
V
V
 
V
L
 
M
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1oxvD Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
31% identity, 48% coverage: 12:254/505 of query aligns to 6:250/353 of 1oxvD

query
sites
1oxvD
M
 
V
R
 
K
N
 
N
I
 
V
S
 
S
R
 
K
T
 
V
F
|
F
P
 
K
G
 
K
V
 
G
K
 
K
-
x
V
-
 
V
A
|
A
L
 
L
D
 
D
R
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
I
E
 
N
I
 
I
R
 
E
A
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
R
L
 
F
A
 
G
L
 
I
A
 
L
G
 
G
E
x
P
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
F
M
 
M
K
 
R
I
 
I
L
 
I
T
 
A
G
 
G
I
 
L
Y
 
D
A
 
V
P
 
P
D
 
S
P
 
T
G
 
-
G
 
G
T
 
E
I
 
L
L
 
Y
V
 
F
E
 
D
G
 
D
Q
 
R
E
 
L
V
 
V
A
 
A
-
 
S
-
 
N
-
 
G
-
 
K
L
 
L
A
 
I
D
 
V
S
 
P
H
 
P
H
 
E
A
 
D
R
 
R
T
 
K
L
 
I
G
 
G
V
 
-
N
 
-
I
 
M
I
 
V
Y
 
F
Q
|
Q
E
 
T
L
 
W
A
 
A
V
 
L
V
 
Y
G
 
P
N
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
A
G
 
F
E
 
E
N
 
N
I
 
I
F
 
A
L
 
F
A
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
P
R
 
L
T
 
T
R
 
N
L
 
M
G
 
K
L
 
M
I
 
-
D
 
S
R
 
K
P
 
E
R
 
E
M
 
I
Y
 
R
R
 
K
E
 
R
A
 
V
R
 
E
E
 
E
V
 
V
L
 
A
A
 
K
T
 
I
I
 
L
D
 
D
M
 
I
D
 
H
I
 
H
D
 
V
P
 
L
A
 
N
T
 
H
R
 
F
V
 
P
S
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
S
V
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
I
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
V
A
 
K
R
 
D
S
 
P
K
 
S
A
 
L
I
 
L
I
 
L
M
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
A
 
S
S
 
N
L
 
L
S
 
D
H
 
A
H
 
R
E
 
M
T
 
R
S
 
D
V
 
S
L
 
A
L
 
R
G
 
A
I
 
L
V
 
V
K
 
K
R
 
E
L
 
V
R
 
Q
E
 
S
R
 
R
-
 
L
N
 
G
I
 
V
A
 
T
V
 
L
V
 
L
Y
 
V
I
 
V
S
 
S
H
 
H
R
 
D
L
 
P
E
 
A
E
 
D
I
 
I
F
 
F
E
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
V
D
 
K
G
 
G
R
 
K
T
 
L
V
 
V
G
 
Q
T
 
V
A
 
G
P
 
K
I
 
P
A
 
E
D
 
D
M
 
L
T
 
Y
R
 
-
E
 
D
T
 
N
L
 
P
V
 
V
R
 
S
L
 
I
M
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
S
-
 
L
-
 
I
-
 
G
E
 
E
L
 
I
S
 
N
E
 
E
L
 
L
Y
 
E
G
 
G
E
 
K

1oxvA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
31% identity, 48% coverage: 12:254/505 of query aligns to 6:250/353 of 1oxvA

query
sites
1oxvA
M
 
V
R
 
K
N
 
N
I
 
V
S
 
S
R
 
K
T
 
V
F
|
F
P
 
K
G
 
K
V
 
G
K
 
K
-
x
V
-
 
V
A
|
A
L
 
L
D
 
D
R
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
I
E
 
N
I
 
I
R
 
E
A
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
R
L
 
F
A
 
G
L
 
I
A
 
L
G
 
G
E
x
P
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
F
M
 
M
K
 
R
I
 
I
L
 
I
T
 
A
G
 
G
I
 
L
Y
 
D
A
 
V
P
 
P
D
 
S
P
 
T
G
 
-
G
 
G
T
 
E
I
 
L
L
 
Y
V
 
F
E
 
D
G
 
D
Q
 
R
E
 
L
V
 
V
A
 
A
-
 
S
-
 
N
-
 
G
-
 
K
L
 
L
A
 
I
D
 
V
S
 
P
H
 
P
H
 
E
A
 
D
R
 
R
T
 
K
L
 
I
G
 
G
V
 
-
N
 
-
I
 
M
I
 
V
Y
 
F
Q
 
Q
E
 
T
L
 
W
A
 
A
V
 
L
V
 
Y
G
 
P
N
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
A
G
 
F
E
 
E
N
 
N
I
 
I
F
 
A
L
 
F
A
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
P
R
 
L
T
 
T
R
 
N
L
 
M
G
 
K
L
 
M
I
 
-
D
 
S
R
 
K
P
 
E
R
 
E
M
 
I
Y
 
R
R
 
K
E
 
R
A
 
V
R
 
E
E
 
E
V
 
V
L
 
A
A
 
K
T
 
I
I
 
L
D
 
D
M
 
I
D
 
H
I
 
H
D
 
V
P
 
L
A
 
N
T
 
H
R
 
F
V
 
P
S
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
S
V
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
I
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
V
A
 
K
R
 
D
S
 
P
K
 
S
A
 
L
I
 
L
I
 
L
M
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
A
 
S
S
 
N
L
 
L
S
 
D
H
 
A
H
 
R
E
 
M
T
 
R
S
 
D
V
 
S
L
 
A
L
 
R
G
 
A
I
 
L
V
 
V
K
 
K
R
 
E
L
 
V
R
 
Q
E
 
S
R
 
R
-
 
L
N
 
G
I
 
V
A
 
T
V
 
L
V
 
L
Y
 
V
I
 
V
S
 
S
H
 
H
R
 
D
L
 
P
E
 
A
E
 
D
I
 
I
F
 
F
E
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
V
D
 
K
G
 
G
R
 
K
T
 
L
V
 
V
G
 
Q
T
 
V
A
 
G
P
 
K
I
 
P
A
 
E
D
 
D
M
 
L
T
 
Y
R
 
-
E
 
D
T
 
N
L
 
P
V
 
V
R
 
S
L
 
I
M
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
S
-
 
L
-
 
I
-
 
G
E
 
E
L
 
I
S
 
N
E
 
E
L
 
L
Y
 
E
G
 
G
E
 
K

1oxuA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
31% identity, 48% coverage: 12:254/505 of query aligns to 6:250/353 of 1oxuA

query
sites
1oxuA
M
 
V
R
 
K
N
 
N
I
 
V
S
 
S
R
 
K
T
 
V
F
|
F
P
 
K
G
 
K
V
 
G
K
 
K
-
 
V
-
 
V
A
|
A
L
 
L
D
 
D
R
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
I
E
 
N
I
 
I
R
 
E
A
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
R
L
 
F
A
 
G
L
 
I
A
 
L
G
 
G
E
 
P
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
F
M
 
M
K
 
R
I
 
I
L
 
I
T
 
A
G
 
G
I
 
L
Y
 
D
A
 
V
P
 
P
D
 
S
P
 
T
G
 
-
G
 
G
T
 
E
I
 
L
L
 
Y
V
 
F
E
 
D
G
 
D
Q
 
R
E
 
L
V
 
V
A
 
A
-
 
S
-
 
N
-
 
G
-
 
K
L
 
L
A
 
I
D
 
V
S
 
P
H
 
P
H
 
E
A
 
D
R
 
R
T
 
K
L
 
I
G
 
G
V
 
-
N
 
-
I
 
M
I
 
V
Y
 
F
Q
 
Q
E
 
T
L
 
W
A
 
A
V
 
L
V
 
Y
G
 
P
N
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
A
G
 
F
E
 
E
N
 
N
I
 
I
F
 
A
L
 
F
A
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
P
R
 
L
T
 
T
R
 
N
L
 
M
G
 
K
L
 
M
I
 
-
D
 
S
R
 
K
P
 
E
R
 
E
M
 
I
Y
 
R
R
 
K
E
 
R
A
 
V
R
 
E
E
 
E
V
 
V
L
 
A
A
 
K
T
 
I
I
 
L
D
 
D
M
 
I
D
 
H
I
 
H
D
 
V
P
 
L
A
 
N
T
 
H
R
 
F
V
 
P
S
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
S
V
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
I
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
V
A
 
K
R
 
D
S
 
P
K
 
S
A
 
L
I
 
L
I
 
L
M
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
A
 
S
S
 
N
L
 
L
S
 
D
H
 
A
H
 
R
E
 
M
T
 
R
S
 
D
V
 
S
L
 
A
L
 
R
G
 
A
I
 
L
V
 
V
K
 
K
R
 
E
L
 
V
R
 
Q
E
 
S
R
 
R
-
 
L
N
 
G
I
 
V
A
 
T
V
 
L
V
 
L
Y
 
V
I
 
V
S
 
S
H
 
H
R
 
D
L
 
P
E
 
A
E
 
D
I
 
I
F
 
F
E
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
V
D
 
K
G
 
G
R
 
K
T
 
L
V
 
V
G
 
Q
T
 
V
A
 
G
P
 
K
I
 
P
A
 
E
D
 
D
M
 
L
T
 
Y
R
 
-
E
 
D
T
 
N
L
 
P
V
 
V
R
 
S
L
 
I
M
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
S
-
 
L
-
 
I
-
 
G
E
 
E
L
 
I
S
 
N
E
 
E
L
 
L
Y
 
E
G
 
G
E
 
K

Q97UY8 Glucose import ATP-binding protein GlcV; EC 7.5.2.- from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
31% identity, 48% coverage: 12:254/505 of query aligns to 6:250/353 of Q97UY8

query
sites
Q97UY8
M
 
V
R
 
K
N
 
N
I
 
V
S
 
S
R
 
K
T
 
V
F
 
F
P
 
K
G
 
K
V
 
G
K
 
K
-
 
V
-
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
D
R
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
I
E
 
N
I
 
I
R
 
E
A
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
R
L
 
F
A
 
G
L
 
I
A
 
L
G
 
G
E
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
F
M
 
M
K
 
R
I
 
I
L
 
I
T
 
A
G
 
G
I
 
L
Y
 
D
A
 
V
P
 
P
D
 
S
P
 
T
G
 
-
G
 
G
T
 
E
I
 
L
L
 
Y
V
 
F
E
 
D
G
 
D
Q
 
R
E
 
L
V
 
V
A
 
A
-
 
S
-
 
N
-
 
G
-
 
K
L
 
L
A
 
I
D
 
V
S
 
P
H
 
P
H
 
E
A
 
D
R
 
R
T
 
K
L
 
I
G
 
G
V
 
-
N
 
-
I
 
M
I
 
V
Y
 
F
Q
 
Q
E
 
T
L
 
W
A
 
A
V
 
L
V
 
Y
G
 
P
N
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
A
G
 
F
E
 
E
N
 
N
I
 
I
F
 
A
L
 
F
A
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
P
R
 
L
T
 
T
R
 
N
L
 
M
G
 
K
L
 
M
I
 
-
D
 
S
R
 
K
P
 
E
R
 
E
M
 
I
Y
 
R
R
 
K
E
 
R
A
 
V
R
 
E
E
 
E
V
 
V
L
 
A
A
 
K
T
 
I
I
 
L
D
 
D
M
 
I
D
 
H
I
 
H
D
 
V
P
 
L
A
 
N
T
 
H
R
 
F
V
 
P
S
 
R
E
 
E
L
 
L
S
|
S
V
 
G
G
|
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
I
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
V
A
 
K
R
 
D
S
 
P
K
 
S
A
 
L
I
 
L
I
 
L
M
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
A
 
S
S
 
N
L
 
L
S
 
D
H
 
A
H
 
R
E
 
M
T
 
R
S
 
D
V
 
S
L
 
A
L
 
R
G
 
A
I
 
L
V
 
V
K
 
K
R
 
E
L
 
V
R
 
Q
E
 
S
R
 
R
-
 
L
N
 
G
I
 
V
A
 
T
V
 
L
V
 
L
Y
 
V
I
 
V
S
 
S
H
 
H
R
 
D
L
 
P
E
 
A
E
 
D
I
 
I
F
 
F
E
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
V
D
 
K
G
 
G
R
 
K
T
 
L
V
 
V
G
 
Q
T
 
V
A
 
G
P
 
K
I
 
P
A
 
E
D
 
D
M
 
L
T
 
Y
R
 
-
E
 
D
T
 
N
L
 
P
V
 
V
R
 
S
L
 
I
M
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
S
-
 
L
-
 
I
-
 
G
E
 
E
L
 
I
S
 
N
E
 
E
L
 
L
Y
 
E
G
 
G
E
 
K

7w78A Heme exporter hrtba in complex with mg-amppnp (see paper)
31% identity, 44% coverage: 8:228/505 of query aligns to 3:218/218 of 7w78A

query
sites
7w78A
P
 
P
F
 
V
L
 
L
E
 
S
M
 
I
R
 
T
N
 
N
I
 
A
S
 
S
R
 
V
T
 
V
F
x
Y
P
 
P
G
 
D
-
 
G
-
 
I
-
 
S
-
 
T
V
|
V
K
 
T
A
|
A
L
 
L
D
 
D
R
 
S
V
 
A
N
 
N
L
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
F
A
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
L
L
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
V
G
 
G
E
|
E
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
L
K
 
S
I
 
I
L
 
-
T
 
A
G
 
G
I
 
F
Y
 
L
A
 
Q
P
 
E
D
 
P
P
 
T
G
 
S
G
 
G
T
 
T
I
 
V
L
 
T
V
 
L
E
 
H
G
 
G
Q
 
A
E
 
E
V
 
G
A
 
-
L
 
-
A
 
L
D
 
D
S
 
A
H
 
T
H
 
S
A
 
T
R
 
R
T
 
R
L
 
E
G
 
H
V
 
I
N
 
G
I
 
F
I
 
V
Y
 
F
Q
|
Q
E
 
Q
L
 
P
A
 
N
V
 
L
V
 
L
G
 
G
N
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
A
G
 
R
E
 
E
N
 
Q
I
 
L
F
 
L
L
 
I
A
 
T
R
 
D
E
 
H
P
 
L
R
 
R
T
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
G
L
 
I
I
 
-
D
 
-
R
 
K
P
 
P
R
 
R
M
 
K
Y
 
D
R
 
R
E
 
-
A
 
A
R
 
D
E
 
E
V
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
R
I
 
V
D
 
G
M
 
L
D
 
K
I
 
G
D
 
L
P
 
G
A
 
G
T
 
R
R
 
R
V
 
V
S
 
A
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
I
 
V
E
 
N
I
 
I
A
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
M
A
 
G
R
 
N
S
 
P
K
 
Q
A
 
L
I
 
L
I
 
L
M
 
A
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
S
 
A
L
 
L
S
 
D
H
 
A
H
 
R
E
 
L
T
 
S
S
 
K
V
 
E
L
 
I
L
 
V
G
 
E
I
 
L
V
 
L
K
 
R
R
 
D
L
 
V
-
 
T
R
 
K
E
 
E
R
 
F
N
 
A
I
 
L
A
 
A
V
 
T
V
 
L
Y
 
M
I
 
V
S
 
T
H
|
H
R
 
D
L
 
R
E
 
S
E
 
Q
I
 
L
F
 
-
E
 
A
L
 
Y
A
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
F
T
 
V
V
 
E
L
 
M
R
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
K
T
 
A
V
 
L
G
 
Q
T
 
T

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp- binding cassette of an abc transporter (see paper)
29% identity, 43% coverage: 10:226/505 of query aligns to 5:229/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
L
 
L
E
 
R
M
 
T
R
 
E
N
 
N
I
 
I
S
 
V
R
 
K
T
 
Y
F
|
F
P
 
G
G
 
E
V
x
F
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
R
 
G
V
 
V
N
 
S
L
 
I
E
 
S
I
 
V
R
 
N
A
 
K
G
 
G
E
 
D
V
 
V
L
 
T
A
 
L
L
 
I
A
 
I
G
 
G
E
 
P
N
|
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
I
K
 
N
I
 
V
L
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
F
Y
 
L
A
 
K
P
 
A
D
 
D
P
 
E
G
 
G
G
 
-
T
 
R
I
 
V
L
 
Y
V
 
F
E
 
E
G
 
N
Q
 
K
E
 
D
V
 
I
A
 
T
-
 
N
-
 
K
-
 
E
L
 
P
A
 
A
D
 
E
S
 
L
H
 
Y
H
 
H
-
 
Y
-
 
G
-
 
I
A
 
V
R
 
R
T
 
T
L
 
F
G
 
Q
V
 
T
N
 
P
I
 
Q
I
 
P
Y
 
L
Q
 
K
E
 
E
L
 
M
A
 
T
V
 
V
V
 
L
G
 
E
N
 
N
L
 
L
T
 
L
V
 
I
G
 
G
E
 
E
N
 
-
I
 
I
F
 
C
L
 
P
A
 
G
R
 
E
E
 
S
P
 
P
R
 
L
T
 
N
R
 
S
L
 
L
-
 
F
-
 
Y
-
 
K
-
 
K
G
 
W
L
 
I
I
 
P
D
 
K
R
 
E
P
 
E
R
 
E
M
 
M
Y
 
V
R
 
E
E
 
K
A
 
A
R
 
F
E
 
K
V
 
I
L
 
L
A
 
E
T
 
F
I
 
L
D
 
K
M
 
L
D
 
S
I
 
H
D
 
L
P
 
Y
A
 
D
T
 
R
R
 
K
V
 
A
S
 
G
E
 
E
L
 
L
S
 
S
V
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
M
Q
 
K
M
 
L
I
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
G
K
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
M
A
 
T
R
 
N
S
 
P
K
 
K
A
 
M
I
 
I
I
 
V
M
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
I
A
 
A
S
 
G
L
 
V
S
 
A
H
 
P
H
 
G
E
 
L
T
 
A
S
 
H
V
 
D
L
 
I
L
 
F
G
 
N
I
 
H
V
 
V
K
 
L
R
 
E
L
 
L
R
 
K
E
 
A
R
 
K
N
 
G
I
 
I
A
 
T
V
 
F
V
 
L
Y
 
I
I
 
I
S
 
E
H
 
H
R
 
R
L
 
L
E
 
D
E
 
I
I
 
V
F
 
L
E
 
N
L
 
Y
A
 
I
D
 
D
R
 
H
V
 
L
T
 
Y
V
 
V
L
 
M
R
 
F
D
 
N
G
 
G
R
 
Q
T
 
I
V
 
I

7w79A Heme exporter hrtba in complex with mn-amppnp (see paper)
31% identity, 43% coverage: 8:226/505 of query aligns to 3:216/216 of 7w79A

query
sites
7w79A
P
 
P
F
 
V
L
 
L
E
x
S
M
 
I
R
 
T
N
 
N
I
 
A
S
 
S
R
 
V
T
 
V
F
x
Y
P
 
P
G
 
D
-
 
G
-
 
I
-
 
S
-
 
T
V
|
V
K
 
T
A
|
A
L
 
L
D
 
D
R
 
S
V
 
A
N
 
N
L
 
V
E
|
E
I
 
I
R
 
F
A
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
L
L
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
V
G
 
G
E
|
E
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
L
K
 
S
I
 
I
L
 
-
T
 
A
G
 
G
I
 
F
Y
 
L
A
 
Q
P
 
E
D
 
P
P
 
T
G
 
S
G
 
G
T
 
T
I
 
V
L
 
T
V
 
L
E
 
H
G
 
G
Q
 
A
E
 
E
V
 
G
A
 
-
L
 
-
A
 
L
D
 
D
S
 
A
H
 
T
H
 
S
A
 
T
R
 
R
T
 
R
L
 
E
G
 
H
V
 
I
N
 
G
I
 
F
I
 
V
Y
 
F
Q
|
Q
E
 
Q
L
 
P
A
 
N
V
 
L
V
 
L
G
 
G
N
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
A
G
 
R
E
 
E
N
 
Q
I
 
L
F
 
L
L
 
I
A
 
T
R
 
D
E
 
H
P
 
L
R
 
R
T
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
G
L
 
I
I
 
-
D
 
-
R
 
K
P
 
P
R
 
R
M
 
K
Y
 
D
R
 
R
E
 
-
A
 
A
R
 
D
E
 
E
V
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
R
I
 
V
D
 
G
M
 
L
D
 
K
I
 
G
D
 
L
P
 
G
A
 
G
T
 
R
R
 
R
V
 
V
S
 
A
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
I
 
V
E
 
N
I
 
I
A
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
M
A
 
G
R
 
N
S
 
P
K
 
Q
A
 
L
I
 
L
I
 
L
M
 
A
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
S
 
A
L
 
L
S
 
D
H
 
A
H
 
R
E
 
L
T
 
S
S
 
K
V
 
E
L
 
I
L
 
V
G
 
E
I
 
L
V
 
L
K
 
R
R
 
D
L
 
V
-
 
T
R
 
K
E
 
E
R
 
F
N
 
A
I
 
L
A
 
A
V
 
T
V
 
L
Y
 
M
I
 
V
S
 
T
H
|
H
R
 
D
L
 
R
E
 
S
E
 
Q
I
 
L
F
 
-
E
 
A
L
 
Y
A
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
F
T
 
V
V
 
E
L
 
M
R
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
K
T
 
A
V
 
L

2pclA Crystal structure of abc transporter with complex (aq_297) from aquifex aeolicus vf5
29% identity, 43% coverage: 10:227/505 of query aligns to 4:218/223 of 2pclA

query
sites
2pclA
L
 
L
E
 
R
M
 
A
R
 
E
N
 
N
I
 
I
S
 
K
R
 
K
T
 
V
F
 
I
P
 
R
G
 
G
V
 
Y
K
 
E
A
 
I
L
 
L
D
 
K
R
 
G
V
 
I
N
 
S
L
 
L
E
 
S
I
 
V
R
 
K
A
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
F
L
 
V
A
 
S
L
 
I
A
 
I
G
 
G
E
 
A
N
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
L
K
 
Y
I
 
I
L
 
L
T
 
G
G
 
L
I
 
L
Y
 
D
A
 
A
P
 
P
D
 
T
P
 
E
G
 
-
G
 
G
T
 
K
I
 
V
L
 
F
V
 
L
E
 
E
G
 
G
Q
 
K
E
 
E
V
 
V
A
 
D
L
 
Y
A
 
T
D
 
N
S
 
E
H
 
K
H
 
E
-
 
L
-
 
S
-
 
L
A
 
L
R
 
R
T
 
N
L
 
R
G
 
K
V
 
L
N
 
G
I
 
F
I
 
V
Y
 
F
Q
 
Q
E
 
F
L
 
H
A
 
Y
V
 
L
V
 
I
G
 
P
N
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
A
G
 
L
E
 
E
N
 
N
I
 
V
F
 
I
L
 
V
A
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
P
R
 
M
T
 
L
R
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
-
I
 
-
D
 
-
R
 
K
P
 
P
R
 
K
M
 
-
Y
 
-
R
 
K
E
 
E
A
 
A
R
 
K
E
 
E
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
Y
V
 
L
L
 
L
A
 
S
T
 
E
I
 
L
D
 
G
M
 
L
D
 
G
I
 
D
D
 
K
P
 
L
A
 
S
T
 
R
R
 
K
V
 
P
S
 
Y
E
 
E
L
 
L
S
 
S
V
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
I
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
A
 
N
R
 
E
S
 
P
K
 
I
A
 
L
I
 
L
I
 
F
M
 
A
D
 
D
E
|
E
P
|
P
T
|
T
A
 
G
S
 
N
L
 
L
S
 
D
H
 
S
H
 
A
E
 
N
T
 
T
S
 
K
V
 
R
L
 
V
L
 
M
G
 
D
I
 
I
V
 
F
K
 
L
R
 
K
L
 
I
R
 
N
E
 
E
R
 
G
N
 
G
I
 
T
A
 
S
V
 
I
V
 
V
Y
 
M
I
 
V
S
x
T
H
 
H
R
 
E
L
 
-
E
 
R
E
 
E
I
 
L
F
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
D
 
H
R
 
R
V
 
T
T
 
L
V
 
E
L
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
K
T
 
V
V
 
V
G
 
G

3b5zA Crystal structure of msba from salmonella typhimurium with adp vanadate (see paper)
34% identity, 42% coverage: 10:223/505 of query aligns to 333:545/572 of 3b5zA

query
sites
3b5zA
L
 
L
E
 
E
M
 
F
R
 
R
N
 
N
I
 
V
S
 
T
R
 
F
T
 
T
F
 
Y
P
 
P
G
 
G
-
 
R
-
 
E
V
 
V
K
 
P
A
 
A
L
 
L
D
 
R
R
 
N
V
 
I
N
 
N
L
 
L
E
 
K
I
 
I
R
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
K
V
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
V
G
 
G
E
 
R
N
 
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
I
M
 
A
K
 
S
I
 
L
L
 
I
T
 
T
G
 
R
I
 
F
Y
 
Y
A
 
D
P
 
I
D
 
D
P
 
E
G
 
G
G
 
H
T
 
I
I
 
L
L
 
M
V
 
-
E
 
-
G
 
-
Q
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
D
S
 
G
H
 
H
H
 
D
A
 
L
R
 
R
T
 
E
L
 
Y
G
 
T
V
 
L
N
 
A
I
 
S
I
 
L
Y
 
R
Q
 
N
E
 
Q
L
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
G
 
S
-
 
Q
-
 
N
-
 
V
-
 
H
-
 
L
-
 
F
N
 
N
L
 
D
T
 
T
V
 
V
G
 
A
E
 
N
N
 
N
I
 
I
F
 
A
L
 
Y
A
 
A
R
 
R
-
 
T
E
 
E
P
 
E
R
 
Y
T
 
S
R
 
R
L
 
E
G
 
Q
L
 
I
I
 
E
D
 
E
R
 
A
P
 
A
R
 
R
M
 
M
Y
 
-
R
 
A
E
 
Y
A
 
A
R
 
M
E
 
D
V
 
F
L
 
I
A
 
N
T
 
K
I
 
M
D
 
D
M
 
N
D
 
G
I
 
L
D
 
D
P
 
-
A
 
-
T
 
T
R
 
I
V
 
I
S
 
G
E
 
E
-
 
N
-
 
G
-
 
V
-
x
L
L
 
L
S
|
S
V
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
I
 
I
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
L
A
 
R
R
 
D
S
 
S
K
 
P
A
 
I
I
 
L
I
 
I
M
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
S
 
A
L
 
L
S
 
D
H
 
T
H
 
E
E
 
S
T
 
E
S
 
R
V
 
A
L
 
I
L
 
Q
G
 
A
I
 
A
V
 
L
K
 
D
R
 
E
L
 
L
R
 
Q
E
 
K
R
 
N
N
 
R
I
 
T
A
 
S
V
 
L
V
 
V
Y
 
-
I
 
I
S
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
L
E
 
S
E
 
T
I
 
I
F
 
-
E
 
E
L
 
Q
A
 
A
D
 
D
R
 
E
V
 
I
T
 
V
V
 
V
L
 
V
R
 
E
D
 
D
G
 
G

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
28% identity, 47% coverage: 8:243/505 of query aligns to 1:240/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
P
 
P
F
 
I
L
 
I
E
 
R
M
 
I
R
 
R
N
 
N
I
 
L
S
 
H
R
 
K
T
 
W
F
|
F
P
 
G
G
 
P
V
x
L
K
 
H
A
x
V
L
 
L
D
 
K
R
 
G
V
 
I
N
 
H
L
 
L
E
 
E
I
 
V
R
 
A
A
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
K
L
 
L
A
 
V
L
 
I
A
 
I
G
 
G
E
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
I
K
 
R
I
 
T
L
 
I
T
 
N
G
 
R
I
 
L
Y
 
E
A
 
D
P
 
F
D
 
Q
P
 
E
G
 
G
G
 
-
T
 
E
I
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
D
G
 
G
Q
 
-
E
 
-
V
 
L
A
 
S
L
 
V
A
 
K
D
 
D
S
 
D
H
 
R
H
 
A
A
 
L
R
 
R
T
 
E
L
 
I
-
 
R
-
 
R
G
 
E
V
 
V
N
 
G
I
 
M
I
 
V
Y
 
F
Q
 
Q
E
 
Q
L
 
F
A
 
N
V
 
L
V
 
F
G
 
P
N
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
L
E
 
E
N
 
N
I
 
V
F
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
P
E
 
-
P
 
-
R
 
-
T
 
M
R
 
R
L
 
V
G
 
R
L
 
R
I
 
W
D
 
P
R
 
R
P
 
E
R
 
K
M
 
A
Y
 
E
R
 
K
E
 
K
A
 
A
R
 
L
E
 
E
V
 
L
L
 
L
A
 
E
T
 
R
I
 
V
D
 
G
M
 
I
D
 
-
I
 
L
D
 
D
P
 
Q
A
 
A
T
 
R
R
 
K
V
 
Y
-
 
P
S
 
A
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
I
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
A
 
M
R
 
E
S
 
P
K
 
K
A
 
I
I
 
M
I
 
L
M
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
S
 
A
L
 
L
S
 
D
H
 
P
H
 
E
E
 
M
T
 
V
S
 
G
V
 
E
L
 
V
L
 
L
G
 
D
I
 
V
V
 
M
K
 
R
R
 
D
L
 
L
R
 
A
E
 
Q
R
 
G
N
 
G
I
 
M
A
 
T
V
 
M
V
 
V
Y
 
V
I
 
V
S
 
T
H
 
H
R
 
E
L
 
M
E
 
G
E
 
F
I
 
A
F
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
V
V
 
F
L
 
M
R
 
D
D
 
G
G
 
G
R
 
Q
T
 
I
V
 
V
G
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
F
T
 
T
A
 
R
P
 
P
I
 
K
A
 
E
D
 
E
M
 
R
T
 
T
R
 
R
E
 
S
T
 
F
L
 
L
V
 
Q
R
 
R
L
 
V
M
 
L

5lj7A Structure of aggregatibacter actinomycetemcomitans macb bound to atp (p21) (see paper)
26% identity, 62% coverage: 10:322/505 of query aligns to 4:304/592 of 5lj7A

query
sites
5lj7A
L
 
I
E
 
E
M
 
I
R
 
K
N
 
Q
I
 
L
S
 
N
R
 
R
T
 
Y
F
|
F
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
E
P
 
N
G
 
R
V
 
V
K
 
H
A
x
V
L
 
L
D
 
K
R
 
D
V
 
I
N
 
S
L
 
L
E
 
S
I
 
I
R
 
E
A
 
R
G
 
G
E
 
D
V
 
F
L
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
M
G
 
G
E
 
Q
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
M
K
 
N
I
 
I
L
 
I
T
 
-
G
 
G
I
 
C
Y
 
L
A
 
D
P
 
T
D
 
A
P
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
S
I
 
S
L
 
K
V
 
I
E
 
D
G
 
G
Q
 
K
E
 
E
-
 
T
V
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
T
D
 
N
S
 
D
H
 
Q
H
 
L
A
 
S
-
 
D
-
 
L
R
 
R
T
 
S
L
 
Q
G
 
K
V
 
F
N
 
G
I
 
F
I
 
I
Y
 
F
Q
|
Q
E
 
R
L
 
Y
A
 
N
V
 
L
V
 
L
G
 
S
N
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
A
G
 
A
E
 
E
N
 
N
I
 
V
F
 
A
L
 
L
A
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
P
R
 
A
T
 
I
R
 
Y
L
 
A
G
 
G
L
 
M
I
 
P
D
 
Q
R
 
S
P
 
Q
R
 
R
M
 
L
Y
 
E
R
 
R
E
 
-
A
 
A
R
 
K
E
 
Q
V
 
L
L
 
L
A
 
E
T
 
K
I
 
L
D
 
G
M
 
L
D
 
G
I
 
D
D
x
K
P
 
W
A
 
Q
T
 
N
R
 
K
V
 
P
S
x
N
E
x
Q
L
|
L
S
|
S
V
x
G
G
|
G
Q
|
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
I
 
V
E
 
S
I
 
I
A
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
M
A
 
N
R
 
G
S
 
G
K
 
E
A
 
I
I
 
I
I
 
L
M
 
A
D
|
D
E
x
Q
P
 
P
T
 
T
A
 
G
S
x
A
L
 
L
S
 
D
H
 
S
H
 
H
E
 
S
T
 
G
S
 
E
V
 
N
L
 
V
L
 
M
G
 
E
I
 
I
V
 
L
K
 
R
R
 
Q
L
 
L
R
 
H
E
 
E
R
 
E
N
 
G
I
 
H
A
 
T
V
 
I
V
 
I
Y
 
M
I
 
V
S
 
T
H
|
H
R
 
D
L
 
-
E
 
K
E
 
H
I
 
I
F
 
A
E
 
A
L
 
S
A
 
A
D
 
N
R
 
R
V
 
I
T
 
I
V
 
E
L
 
I
R
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
E
T
 
I
V
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
I
A
 
S
D
 
D
M
 
T
T
 
Q
R
 
K
E
 
-
T
 
-
L
 
-
V
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
R
E
 
Q
L
 
V
S
 
K
E
 
S
L
 
A
Y
 
V
G
 
K
E
 
N
P
 
P
Q
 
-
S
 
S
H
 
V
A
 
F
S
 
S
R
 
K
D
 
D
P
 
Q
V
 
L
L
 
M
E
 
E
V
 
A
R
 
F
A
 
R
L
 
M
S
 
S
L
 
V
K
 
S
P
 
A
V
 
I
R
 
V
K
 
A
A
 
H
E
 
K
P
 
M
R
 
R
I
 
-
R
 
-
D
 
-
I
 
-
S
 
S
F
 
L
T
 
L
L
 
T
H
 
M
R
 
L
G
 
G
E
 
I
V
 
I
L
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
T
G
 
S
L
 
V
V
 
V
-
 
S
-
 
V
-
 
V
-
 
A
-
 
L
G
 
G
S
 
N
G
 
G
-
 
S
R
 
Q
T
 
Q
E
 
K
I
 
I
M
 
L
E
 
E
M
 
N
I
 
I
F
 
R
G
 
G
M
 
I
R
 
G
A
 
T
C
 
N
T
 
T
G
 
M
S
 
T
V
 
I

5lilA Structure of aggregatibacter actinomycetemcomitans macb bound to atpys (p21) (see paper)
26% identity, 62% coverage: 10:322/505 of query aligns to 4:304/615 of 5lilA

query
sites
5lilA
L
 
I
E
 
E
M
 
I
R
 
K
N
 
Q
I
 
L
S
 
N
R
 
R
T
 
Y
F
|
F
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
E
P
 
N
G
 
R
V
 
V
K
 
H
A
x
V
L
 
L
D
 
K
R
 
D
V
 
I
N
 
S
L
 
L
E
 
S
I
 
I
R
 
E
A
 
R
G
 
G
E
 
D
V
 
F
L
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
M
G
 
G
E
 
Q
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
M
K
 
N
I
 
I
L
 
I
T
 
-
G
 
G
I
 
C
Y
 
L
A
 
D
P
 
T
D
 
A
P
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
S
I
 
S
L
 
K
V
 
I
E
 
D
G
 
G
Q
 
K
E
 
E
-
 
T
V
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
T
D
 
N
S
 
D
H
 
Q
H
 
L
A
 
S
-
 
D
-
 
L
R
 
R
T
 
S
L
 
Q
G
 
K
V
 
F
N
 
G
I
 
F
I
 
I
Y
 
F
Q
|
Q
E
 
R
L
 
Y
A
 
N
V
 
L
V
 
L
G
 
S
N
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
A
G
 
A
E
 
E
N
 
N
I
 
V
F
 
A
L
 
L
A
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
P
R
 
A
T
 
I
R
 
Y
L
 
A
G
 
G
L
 
M
I
 
P
D
 
Q
R
 
S
P
 
Q
R
 
R
M
 
L
Y
 
E
R
 
R
E
 
-
A
 
A
R
 
K
E
 
Q
V
 
L
L
 
L
A
 
E
T
 
K
I
 
L
D
 
G
M
 
L
D
 
G
I
 
D
D
x
K
P
 
W
A
 
Q
T
x
N
R
 
K
V
 
P
S
 
N
E
x
Q
L
|
L
S
|
S
V
x
G
G
|
G
Q
|
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
I
 
V
E
 
S
I
 
I
A
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
M
A
 
N
R
 
G
S
 
G
K
 
E
A
 
I
I
 
I
I
 
L
M
 
A
D
|
D
E
x
Q
P
 
P
T
 
T
A
 
G
S
x
A
L
 
L
S
 
D
H
 
S
H
 
H
E
 
S
T
 
G
S
 
E
V
 
N
L
 
V
L
 
M
G
 
E
I
 
I
V
 
L
K
 
R
R
 
Q
L
 
L
R
 
H
E
 
E
R
 
E
N
 
G
I
 
H
A
 
T
V
 
I
V
 
I
Y
 
M
I
 
V
S
 
T
H
|
H
R
 
D
L
 
-
E
 
K
E
 
H
I
 
I
F
 
A
E
 
A
L
 
S
A
 
A
D
 
N
R
 
R
V
 
I
T
 
I
V
 
E
L
 
I
R
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
E
T
 
I
V
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
I
A
 
S
D
 
D
M
 
T
T
 
Q
R
 
K
E
 
-
T
 
-
L
 
-
V
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
R
E
 
Q
L
 
V
S
 
K
E
 
S
L
 
A
Y
 
V
G
 
K
E
 
N
P
 
P
Q
 
-
S
 
S
H
 
V
A
 
F
S
 
S
R
 
K
D
 
D
P
 
Q
V
 
L
L
 
M
E
 
E
V
 
A
R
 
F
A
 
R
L
 
M
S
 
S
L
 
V
K
 
S
P
 
A
V
 
I
R
 
V
K
 
A
A
 
H
E
 
K
P
 
M
R
 
R
I
 
-
R
 
-
D
 
-
I
 
-
S
 
S
F
 
L
T
 
L
L
 
T
H
 
M
R
 
L
G
 
G
E
 
I
V
 
I
L
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
T
G
 
S
L
 
V
V
 
V
-
 
S
-
 
V
-
 
V
-
 
A
-
 
L
G
 
G
S
 
N
G
 
G
-
 
S
R
 
Q
T
 
Q
E
 
K
I
 
I
M
 
L
E
 
E
M
 
N
I
 
I
F
 
R
G
 
G
M
 
I
R
 
G
A
 
T
C
 
N
T
 
T
G
 
M
S
 
T
V
 
I

7ph2A Nanodisc reconstituted msba in complex with nanobodies, spin-labeled at position a60c (see paper)
34% identity, 42% coverage: 10:223/505 of query aligns to 331:543/569 of 7ph2A

query
sites
7ph2A
L
 
V
E
 
E
M
 
F
R
 
R
N
 
N
I
 
V
S
 
T
R
 
F
T
 
T
F
 
Y
P
 
P
G
 
G
-
 
R
-
 
D
V
 
V
K
 
P
A
 
A
L
 
L
D
 
R
R
 
N
V
 
I
N
 
N
L
 
L
E
 
K
I
 
I
R
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
K
V
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
V
G
 
G
E
 
R
N
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
I
M
 
A
K
 
S
I
 
L
L
 
I
T
 
T
G
 
R
I
 
F
Y
 
Y
A
 
D
P
 
I
D
 
D
P
 
E
G
 
G
G
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
Q
 
-
E
 
E
V
 
I
A
 
-
L
 
L
A
 
M
D
 
D
S
 
G
H
 
H
H
 
D
A
 
L
R
 
R
T
 
E
L
 
Y
G
 
T
V
 
L
N
 
A
I
 
S
I
 
L
Y
 
R
Q
 
N
E
 
Q
L
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
G
 
S
-
 
Q
-
 
N
-
 
V
-
 
H
-
 
L
-
 
F
N
 
N
L
 
D
T
 
T
V
 
V
G
 
A
E
 
N
N
 
N
I
 
I
F
 
A
L
 
Y
A
 
A
R
 
R
-
 
T
E
 
E
P
 
Q
R
 
Y
T
 
S
R
 
R
L
 
E
G
 
Q
L
 
I
I
 
E
D
 
E
R
 
A
P
 
A
R
 
R
M
 
M
Y
 
-
R
 
A
E
 
Y
A
 
A
R
 
M
E
 
D
V
 
F
L
 
I
A
 
N
T
 
K
I
 
M
D
 
D
M
 
N
D
 
G
I
 
L
D
 
D
P
 
-
A
 
-
T
 
T
R
 
V
V
 
I
S
 
G
E
 
E
-
 
N
-
 
G
-
 
V
-
 
L
L
 
L
S
 
S
V
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
I
 
I
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
L
A
 
R
R
 
D
S
 
S
K
 
P
A
 
I
I
 
L
I
 
I
M
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
S
 
A
L
 
L
S
 
D
H
 
T
H
 
E
E
 
S
T
 
E
S
 
R
V
 
A
L
 
I
L
 
Q
G
 
A
I
 
A
V
 
L
K
 
D
R
 
E
L
 
L
R
 
Q
E
 
K
R
 
N
N
 
R
I
 
T
A
 
S
V
 
L
V
 
V
Y
 
-
I
 
I
S
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
L
E
 
S
E
 
T
I
 
I
F
 
-
E
 
E
L
 
K
A
 
A
D
 
D
R
 
E
V
 
I
T
 
V
V
 
V
L
 
V
R
 
E
D
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5ws4A Crystal structure of tripartite-type abc transporter macb from acinetobacter baumannii (see paper)
29% identity, 44% coverage: 9:230/505 of query aligns to 4:226/650 of 5ws4A

query
sites
5ws4A
F
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
V
R
 
S
N
 
N
I
 
L
S
 
V
R
 
R
T
 
E
F
|
F
P
 
P
G
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
T
V
 
I
K
 
Q
A
x
I
L
 
L
D
 
K
R
 
G
V
 
I
N
 
D
L
 
L
E
 
T
I
 
I
R
 
Y
A
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
L
L
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
V
G
 
G
E
 
Q
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
M
K
 
N
I
 
I
L
 
L
T
 
G
G
 
C
I
 
L
Y
 
D
A
 
R
P
 
P
D
 
-
P
 
T
G
 
S
G
 
G
T
 
S
I
 
Y
L
 
K
V
 
V
E
 
N
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
V
 
T
A
 
G
L
 
K
A
 
L
D
 
E
S
 
P
H
 
D
H
 
Q
A
 
L
R
 
A
T
 
Q
L
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
E
G
 
Y
V
 
F
N
 
G
I
 
F
I
 
I
Y
 
F
Q
 
Q
E
 
R
L
 
Y
A
 
H
V
 
L
V
 
L
G
 
G
N
 
D
L
 
L
T
 
S
V
 
A
G
 
E
E
 
G
N
 
N
I
 
V
F
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
E
E
 
V
P
 
P
R
 
A
T
 
V
R
 
Y
L
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
T
D
 
P
R
 
A
P
 
D
R
 
R
M
 
K
Y
 
Q
R
 
R
E
 
-
A
 
A
R
 
T
E
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
T
T
 
E
I
 
L
D
 
G
M
 
L
D
 
G
I
 
T
D
 
K
P
 
T
A
 
Q
T
 
N
R
 
R
V
 
P
S
 
S
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
I
 
V
E
 
S
I
 
I
A
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
M
A
 
N
R
 
G
S
 
G
K
 
D
A
 
V
I
 
I
I
 
L
M
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
G
S
 
A
L
 
L
S
 
D
H
 
S
H
 
H
E
 
S
T
 
G
S
 
V
V
 
E
L
 
V
L
 
M
G
 
R
I
 
I
V
 
L
K
 
R
R
 
E
L
 
L
R
 
N
E
 
A
R
 
A
N
 
G
I
 
H
A
 
T
V
 
I
V
 
I
Y
 
L
I
 
V
S
 
T
H
 
H
R
 
D
L
 
M
E
 
-
E
 
Q
I
 
V
F
 
A
E
 
K
L
 
N
A
 
A
D
 
T
R
 
R
V
 
I
T
 
I
V
 
E
L
 
I
R
 
S
D
 
D
G
 
G
R
 
E
T
 
I
V
 
I
G
 
S
T
 
D
A
 
R
P
 
P

6bppA E. Coli msba in complex with lps and inhibitor g092 (see paper)
33% identity, 42% coverage: 10:223/505 of query aligns to 339:551/576 of 6bppA

query
sites
6bppA
L
 
V
E
 
E
M
 
F
R
 
R
N
 
N
I
 
V
S
 
T
R
 
F
T
 
T
F
 
Y
P
 
P
G
 
G
-
 
R
-
 
D
V
 
V
K
 
P
A
 
A
L
 
L
D
 
R
R
 
N
V
 
I
N
 
N
L
 
L
E
 
K
I
 
I
R
 
P
A