SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_02738 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_02738 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 3 hits to proteins with known functional sites (download)

Q8PHA1 Molybdate-binding protein ModA; Molybdate/tungstate-binding protein ModA from Xanthomonas axonopodis pv. citri (strain 306) (see 2 papers)
26% identity, 96% coverage: 8:259/262 of query aligns to 6:254/258 of Q8PHA1

query
sites
Q8PHA1
F
 
F
L
 
W
R
 
Q
A
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
C
A
 
V
A
 
L
L
 
M
L
 
L
S
 
T
G
 
L
A
 
P
L
 
V
I
 
L
S
 
A
T
 
S
A
 
A
V
 
-
H
 
Q
A
 
T
A
 
A
D
 
P
V
 
V
H
 
T
V
 
V
L
 
F
A
 
A
T
 
A
G
 
A
A
x
S
L
 
L
S
 
K
A
 
E
A
 
S
F
 
M
R
 
D
E
 
E
L
 
A
G
 
A
P
 
T
G
 
A
Y
 
Y
E
 
E
R
 
K
Q
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
T
H
 
P
L
 
V
I
 
R
I
 
V
S
 
S
W
 
Y
G
 
A
P
 
A
S
|
S
Y
 
-
G
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
S
A
 
A
L
 
L
P
 
A
M
 
R
R
 
Q
I
 
I
R
 
E
N
 
Q
G
 
G
E
 
A
A
 
P
M
 
A
D
 
D
V
 
V
C
 
F
L
 
F
M
 
S
I
 
A
R
x
D
P
 
L
A
 
E
L
 
W
D
 
M
E
 
D
Q
 
Y
I
 
L
S
 
Q
Q
 
Q
-
 
H
G
 
G
K
 
L
F
 
V
L
 
L
P
 
P
D
 
A
T
 
Q
R
 
R
T
 
H
D
 
N
L
 
L
V
 
L
A
 
G
S
 
N
R
 
T
-
 
L
I
 
V
G
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
P
Q
 
A
A
 
S
G
 
S
M
 
K
P
 
L
K
 
R
P
 
V
D
 
D
V
 
P
S
 
R
T
 
A
V
 
P
D
 
G
K
 
A
L
 
I
R
 
A
N
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
G
T
 
E
A
 
N
K
 
G
S
 
R
V
 
L
A
 
A
F
 
V
S
 
G
E
 
Q
G
 
T
A
 
A
S
 
S
-
 
V
-
 
P
-
x
A
G
 
G
T
x
K
Y
 
Y
I
 
A
T
 
A
G
 
A
T
 
A
L
 
L
F
 
R
P
 
-
R
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
Q
M
 
W
N
 
D
A
 
S
R
 
V
S
 
S
V
 
N
Q
 
R
I
 
L
K
 
A
G
 
E
K
 
S
E
 
E
L
 
S
V
|
V
G
 
R
T
 
A
A
 
A
-
 
L
-
 
M
-
 
L
I
 
V
E
 
S
R
 
R
G
 
G
D
 
E
A
 
A
E
 
P
L
 
L
G
 
G
L
 
I
Q
 
V
Q
x
Y
I
 
G
S
 
S
E
 
D
L
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
D
Q
 
A
G
 
K
I
 
V
Q
 
R
Y
 
V
V
 
V
G
 
A
P
 
T
L
 
F
P
 
P
E
 
D
E
 
D
V
 
S
Q
 
H
K
 
D
A
 
A
S
 
I
V
 
V
V
 
Y
S
 
P
A
 
V
A
 
A
V
 
A
S
 
L
T
 
K
S
 
N
A
 
S
Q
 
N
E
 
N
R
 
-
E
 
P
G
 
A
A
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
F
I
 
V
S
 
S
Y
 
W
L
 
L
K
 
G
T
 
S
P
 
K
A
 
P
A
 
A
S
 
K
A
 
A
V
 
I
F
 
F
E
 
A
K
 
R
T
 
R
G
 
G
L
 
F

2h5yB Crystallographic structure of the molybdate-binding protein of xanthomonas citri at 1.7 ang resolution bound to molybdate (see paper)
27% identity, 88% coverage: 30:259/262 of query aligns to 3:230/233 of 2h5yB

query
sites
2h5yB
A
 
A
D
 
P
V
 
V
H
 
T
V
 
V
L
 
F
A
 
A
T
x
A
G
x
A
A
x
S
L
 
L
S
 
K
A
 
E
A
 
S
F
 
M
R
 
D
E
 
E
L
 
A
G
 
A
P
 
T
G
 
A
Y
 
Y
E
 
E
R
 
K
Q
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
T
H
 
P
L
 
V
I
 
R
I
 
V
S
 
S
W
 
Y
G
 
A
P
x
A
S
|
S
Y
 
-
G
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
S
A
 
A
L
 
L
P
 
A
M
 
R
R
 
Q
I
 
I
R
 
E
N
 
Q
G
 
G
E
 
A
A
 
P
M
 
A
D
 
D
V
 
V
C
 
F
L
 
L
M
 
S
I
x
A
R
 
D
P
 
L
A
 
E
L
 
W
D
 
M
E
 
D
Q
 
Y
I
 
L
S
 
Q
Q
 
Q
-
 
H
G
 
G
K
 
L
F
 
V
L
 
L
P
 
P
D
 
A
T
 
Q
R
 
R
T
 
H
D
 
N
L
 
L
V
 
L
A
 
G
S
 
N
R
 
T
-
 
L
I
 
V
G
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
P
Q
 
A
A
 
S
G
 
S
M
 
K
P
 
L
K
 
R
P
 
V
D
 
D
V
 
P
S
 
R
T
 
A
V
 
P
D
 
G
K
 
A
L
 
I
R
 
A
N
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
G
T
 
E
A
 
N
K
 
G
S
 
R
V
 
L
A
 
A
F
 
V
S
 
G
E
 
Q
G
 
T
A
 
A
S
 
S
-
x
V
-
x
P
-
x
A
G
 
G
T
 
K
Y
 
Y
I
 
A
T
 
A
G
 
A
T
 
A
L
 
L
F
 
R
P
 
-
R
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
Q
M
 
W
N
 
D
A
 
S
R
 
V
S
 
S
V
 
N
Q
 
R
I
 
L
K
 
A
G
 
E
K
 
S
E
 
E
L
x
S
V
|
V
G
 
R
T
 
A
A
 
A
-
 
L
-
 
M
-
 
L
I
 
V
E
 
S
R
 
R
G
 
G
D
 
E
A
 
A
E
 
P
L
 
L
G
 
G
L
 
I
Q
 
V
Q
x
Y
I
 
G
S
 
S
E
 
D
L
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
D
Q
 
A
G
 
K
I
 
V
Q
 
R
Y
 
V
V
 
V
G
 
A
P
 
T
L
 
F
P
 
P
E
 
D
E
 
D
V
 
S
Q
 
H
K
 
D
A
 
A
S
 
I
V
 
V
V
 
Y
S
 
P
A
 
V
A
 
A
V
 
A
S
 
L
T
 
K
S
 
N
A
 
S
Q
 
N
E
 
N
R
 
-
E
 
P
G
 
A
A
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
F
I
 
V
S
 
S
Y
 
W
L
 
L
K
 
G
T
 
S
P
 
K
A
 
P
A
 
A
S
 
K
A
 
A
V
 
I
F
 
F
E
 
A
K
 
R
T
 
R
G
 
G
L
 
F

2h5yA Crystallographic structure of the molybdate-binding protein of xanthomonas citri at 1.7 ang resolution bound to molybdate (see paper)
27% identity, 88% coverage: 30:259/262 of query aligns to 2:229/232 of 2h5yA

query
sites
2h5yA
A
 
A
D
 
P
V
 
V
H
 
T
V
 
V
L
 
F
A
 
A
T
x
A
G
x
A
A
x
S
L
 
L
S
 
K
A
 
E
A
 
S
F
 
M
R
 
D
E
 
E
L
 
A
G
 
A
P
 
T
G
 
A
Y
 
Y
E
 
E
R
 
K
Q
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
T
H
 
P
L
 
V
I
 
R
I
 
V
S
 
S
W
 
Y
G
 
A
P
x
A
S
|
S
Y
 
-
G
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
S
A
 
A
L
 
L
P
 
A
M
 
R
R
 
Q
I
 
I
R
 
E
N
 
Q
G
 
G
E
 
A
A
 
P
M
 
A
D
 
D
V
 
V
C
 
F
L
 
L
M
 
S
I
x
A
R
 
D
P
 
L
A
 
E
L
 
W
D
 
M
E
 
D
Q
 
Y
I
 
L
S
 
Q
Q
 
Q
-
 
H
G
 
G
K
 
L
F
 
V
L
 
L
P
 
P
D
 
A
T
 
Q
R
 
R
T
 
H
D
 
N
L
 
L
V
 
L
A
 
G
S
 
N
R
 
T
-
 
L
I
 
V
G
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
P
Q
 
A
A
 
S
G
 
S
M
 
K
P
 
L
K
 
R
P
 
V
D
 
D
V
 
P
S
 
R
T
 
A
V
 
P
D
 
G
K
 
A
L
 
I
R
 
A
N
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
G
T
 
E
A
 
N
K
 
G
S
 
R
V
 
L
A
 
A
F
 
V
S
 
G
E
 
Q
G
x
T
A
 
A
S
 
S
-
x
V
-
x
P
-
x
A
G
 
G
T
 
K
Y
 
Y
I
 
A
T
 
A
G
 
A
T
 
A
L
 
L
F
x
R
P
 
-
R
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
Q
M
 
W
N
 
D
A
 
S
R
 
V
S
 
S
V
 
N
Q
 
R
I
 
L
K
 
A
G
 
E
K
 
S
E
 
E
L
x
S
V
|
V
G
 
R
T
 
A
A
 
A
-
 
L
-
 
M
-
 
L
I
 
V
E
x
S
R
|
R
G
 
G
D
 
E
A
 
A
E
 
P
L
 
L
G
 
G
L
 
I
Q
 
V
Q
x
Y
I
 
G
S
 
S
E
 
D
L
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
D
Q
 
A
G
x
K
I
 
V
Q
 
R
Y
 
V
V
 
V
G
 
A
P
 
T
L
 
F
P
 
P
E
 
D
E
 
D
V
 
S
Q
 
H
K
 
D
A
 
A
S
 
I
V
 
V
V
 
Y
S
 
P
A
 
V
A
 
A
V
 
A
S
 
L
T
 
K
S
 
N
A
 
S
Q
 
N
E
 
N
R
 
-
E
 
P
G
 
A
A
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
F
I
 
V
S
 
S
Y
 
W
L
 
L
K
 
G
T
 
S
P
 
K
A
 
P
A
 
A
S
 
K
A
 
A
V
 
I
F
 
F
E
 
A
K
 
R
T
 
R
G
 
G
L
 
F

Query Sequence

>H281DRAFT_02738 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_02738
MIVNNANFLRAALSAALLSGALISTAVHAADVHVLATGALSAAFRELGPGYERQTGNHLI
ISWGPSYGTSADALPMRIRNGEAMDVCLMIRPALDEQISQGKFLPDTRTDLVASRIGVAV
QAGMPKPDVSTVDKLRNALLTAKSVAFSEGASGTYITGTLFPRLGIAHQMNARSVQIKGK
ELVGTAIERGDAELGLQQISELRAIQGIQYVGPLPEEVQKASVVSAAVSTSAQEREGAAA
LISYLKTPAASAVFEKTGLDPI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory