SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_03637 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_03637 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
35% identity, 96% coverage: 9:254/255 of query aligns to 5:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
L
 
L
N
 
Q
G
 
D
R
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
R
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
A
 
L
A
 
E
F
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
V
L
 
F
V
 
M
Q
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
I
G
 
A
D
|
D
V
x
F
L
 
N
H
 
E
E
 
A
E
 
A
G
 
G
R
 
K
A
 
E
L
 
A
A
 
V
A
 
E
S
 
A
L
 
N
A
 
P
G
 
G
Q
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
A
 
V
I
 
V
Y
 
F
L
 
I
P
 
R
L
x
V
D
|
D
L
x
V
A
 
S
D
 
D
P
 
R
E
 
E
S
 
S
I
 
V
K
 
H
Q
 
R
F
 
L
A
 
V
E
 
E
Q
 
N
G
 
V
A
 
A
S
 
E
R
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
K
I
 
I
D
 
D
A
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
I
|
I
T
 
T
N
 
R
S
x
D
G
 
S
G
 
-
K
 
-
F
 
M
A
 
L
D
 
S
E
x
K
L
 
M
S
 
T
V
 
V
D
 
D
T
 
Q
W
 
F
D
 
Q
A
 
Q
V
 
V
M
 
I
N
 
N
V
 
V
N
|
N
V
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
V
W
 
F
L
 
H
M
 
C
S
 
T
T
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
L
 
M
R
 
A
D
 
E
S
 
Q
G
 
G
R
 
K
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
S
S
|
S
D
 
V
T
 
T
A
 
G
M
 
T
W
 
Y
G
 
G
A
x
N
P
x
V
K
 
G
L
x
Q
L
 
T
A
 
N
Y
|
Y
V
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
K
S
 
T
L
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
F
 
L
G
 
A
A
 
R
H
 
K
Q
 
G
V
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
L
x
F
T
|
T
E
 
E
V
x
T
E
 
A
A
x
M
T
 
V
A
 
A
Y
 
E
V
 
V
P
 
P
A
 
E
E
 
K
R
 
V
H
 
I
E
 
E
Y
x
K
Y
 
M
L
 
K
Q
 
A
G
 
Q
R
 
V
A
 
P
L
 
M
T
 
G
R
 
R
A
 
L
Q
 
G
V
 
K
P
 
P
D
 
E
D
 
D
V
 
I
T
 
A
G
 
N
P
 
A
V
 
Y
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
H
A
 
E
A
 
S
R
 
D
F
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
H
L
 
V
L
 
L
P
 
H
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
I
V
 
M
M
 
M

1nfqA Rv2002 gene product from mycobacterium tuberculosis (see paper)
39% identity, 97% coverage: 6:253/255 of query aligns to 1:238/244 of 1nfqA

query
sites
1nfqA
S
 
S
A
 
G
T
 
R
L
 
L
N
 
T
G
 
G
R
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
R
|
R
G
|
G
L
x
M
G
 
G
A
 
A
A
 
S
F
 
H
V
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
M
V
 
V
Q
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
F
G
 
G
D
|
D
V
 
I
L
|
L
H
 
D
E
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
K
A
 
A
L
 
M
A
 
A
A
 
A
S
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
D
Q
 
A
G
 
A
H
 
R
A
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
Y
L
 
V
P
 
H
L
|
L
D
|
D
L
x
V
A
 
T
D
 
Q
P
 
P
E
 
A
S
 
Q
I
 
W
K
 
K
Q
 
A
F
 
A
A
 
V
E
 
D
Q
 
T
G
 
A
A
 
V
S
 
T
R
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
L
D
 
H
A
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
I
 
I
T
x
L
N
 
N
S
 
I
G
 
G
G
 
-
K
 
-
F
 
T
A
 
I
D
 
E
E
 
D
L
 
Y
S
 
A
V
 
L
D
 
T
T
 
E
W
 
W
D
 
Q
A
 
R
V
 
I
M
 
L
N
 
D
V
 
V
N
 
N
V
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
V
W
 
F
L
 
L
M
 
G
S
 
I
T
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
V
P
 
K
Y
 
P
L
 
M
R
 
K
D
 
E
S
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
D
 
I
T
x
E
A
 
G
M
 
L
W
 
A
G
 
G
A
 
T
P
 
V
K
 
A
L
x
C
L
 
H
A
 
G
Y
|
Y
V
 
T
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
L
 
T
A
 
A
R
 
L
E
 
E
F
 
L
G
 
G
A
 
P
H
 
S
Q
 
G
V
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
I
A
 
H
P
|
P
G
 
G
L
 
L
T
x
V
E
 
K
V
x
T
E
x
P
A
x
M
T
|
T
A
 
D
Y
 
W
V
|
V
P
 
P
A
 
E
E
 
D
R
x
I
H
x
F
E
 
Q
Y
 
-
Y
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
R
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
A
V
 
E
P
 
P
D
 
V
D
 
E
V
 
V
T
 
S
G
 
N
P
 
L
V
 
V
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
S
R
 
S
F
 
Y
V
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
L
 
E
L
 
F
P
 
V
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
T
V
 
V

1nffA Crystal structure of rv2002 gene product from mycobacterium tuberculosis (see paper)
39% identity, 97% coverage: 6:253/255 of query aligns to 1:238/244 of 1nffA

query
sites
1nffA
S
 
S
A
 
G
T
 
R
L
 
L
N
 
T
G
 
G
R
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
|
G
G
 
G
A
 
A
R
|
R
G
|
G
L
x
M
G
 
G
A
 
A
A
 
S
F
 
H
V
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
M
V
 
V
Q
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
F
G
 
G
D
|
D
V
x
I
L
|
L
H
 
D
E
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
K
A
 
A
L
 
M
A
 
A
A
 
A
S
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
D
Q
 
A
G
 
A
H
 
R
A
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
Y
L
 
V
P
 
H
L
|
L
D
|
D
L
x
V
A
 
T
D
 
Q
P
 
P
E
 
A
S
 
Q
I
 
W
K
 
K
Q
 
A
F
 
A
A
 
V
E
 
D
Q
 
T
G
 
A
A
 
V
S
 
T
R
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
L
D
 
H
A
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
I
|
I
T
 
L
N
 
N
S
 
I
G
 
G
G
 
-
K
 
-
F
 
T
A
 
I
D
 
E
E
 
D
L
 
Y
S
 
A
V
 
L
D
 
T
T
 
E
W
 
W
D
 
Q
A
 
R
V
 
I
M
 
L
N
 
D
V
 
V
N
 
N
V
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
V
W
 
F
L
 
L
M
 
G
S
 
I
T
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
V
P
 
K
Y
 
P
L
 
M
R
 
K
D
 
E
S
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
D
 
I
T
 
E
A
 
G
M
 
L
W
 
A
G
 
G
A
 
T
P
 
V
K
 
A
L
 
C
L
 
H
A
 
G
Y
|
Y
V
 
T
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
L
 
T
A
 
A
R
 
L
E
 
E
F
 
L
G
 
G
A
 
P
H
 
S
Q
 
G
V
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
I
A
 
H
P
|
P
G
 
G
L
 
L
T
x
V
E
 
K
V
x
T
E
x
P
A
x
M
T
|
T
A
 
D
Y
 
W
V
 
V
P
 
P
A
 
E
E
 
D
R
 
I
H
 
F
E
 
Q
Y
 
-
Y
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
R
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
A
V
 
E
P
 
P
D
 
V
D
 
E
V
 
V
T
 
S
G
 
N
P
 
L
V
 
V
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
S
R
 
S
F
 
Y
V
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
L
 
E
L
 
F
P
 
V
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
T
V
 
V

P9WGT1 3-alpha-(or 20-beta)-hydroxysteroid dehydrogenase; NADH-dependent 3alpha, 20beta-hydroxysteroid dehydrogenase; EC 1.1.1.53 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
39% identity, 97% coverage: 6:253/255 of query aligns to 2:239/260 of P9WGT1

query
sites
P9WGT1
S
 
S
A
 
G
T
 
R
L
 
L
N
x
I
G
 
G
R
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
R
|
R
G
|
G
L
x
M
G
 
G
A
 
A
A
 
S
F
 
H
V
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
M
V
 
V
Q
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
F
G
 
G
D
|
D
V
 
I
L
 
L
H
 
D
E
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
K
A
 
A
L
x
V
A
 
A
A
 
A
S
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
D
Q
 
A
G
 
A
H
 
R
A
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
Y
L
 
V
P
 
H
L
 
L
D
|
D
L
x
V
A
 
T
D
 
Q
P
 
P
E
 
A
S
 
Q
I
 
W
K
x
T
Q
 
A
F
 
A
A
 
V
E
 
D
Q
 
T
G
 
A
A
 
V
S
 
T
R
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
L
D
 
H
A
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
I
 
I
T
 
L
N
 
N
S
 
I
G
 
G
G
 
-
K
 
-
F
 
T
A
 
I
D
 
E
E
 
D
L
 
Y
S
 
A
V
 
L
D
 
T
T
 
E
W
 
W
D
 
Q
A
 
R
V
 
I
M
 
L
N
 
D
V
 
V
N
 
N
V
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
V
W
 
F
L
 
L
M
 
G
S
 
I
T
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
V
P
 
K
Y
 
P
L
 
M
R
 
K
D
 
E
S
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
|
S
D
 
I
T
 
E
A
 
G
M
 
L
W
 
A
G
 
G
A
 
T
P
 
V
K
 
A
L
 
C
L
 
H
A
 
G
Y
|
Y
V
 
T
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
L
 
T
A
 
A
R
 
L
E
 
E
F
 
L
G
 
G
A
 
P
H
 
S
Q
 
G
V
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
I
A
 
H
P
|
P
G
|
G
L
|
L
T
x
V
E
x
K
V
x
T
E
x
P
A
x
M
T
|
T
A
 
D
Y
 
W
V
 
V
P
 
P
A
 
E
E
 
D
R
 
I
H
 
F
E
 
Q
Y
 
-
Y
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
R
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
A
V
 
E
P
 
P
D
 
V
D
 
E
V
 
V
T
 
S
G
 
N
P
 
L
V
 
V
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
S
R
 
S
F
 
Y
V
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
L
 
E
L
 
F
P
 
V
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
T
V
 
V

8cxaA Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from mycobacterium smegmatis with bound NAD
34% identity, 96% coverage: 9:252/255 of query aligns to 3:248/251 of 8cxaA

query
sites
8cxaA
L
 
L
N
 
A
G
 
N
R
 
R
R
 
V
V
 
A
L
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
L
x
I
G
 
G
A
 
R
A
 
I
F
 
Y
V
 
A
R
 
E
A
 
R
L
 
F
V
 
A
Q
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
V
G
 
A
D
|
D
V
 
I
L
 
N
H
 
E
E
 
P
E
 
K
G
 
A
R
 
T
A
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
S
S
 
S
L
 
I
A
 
T
G
 
S
Q
 
L
G
 
G
H
 
G
A
 
R
A
 
A
I
 
I
Y
 
A
L
 
A
P
 
A
L
 
V
D
 
D
L
x
V
A
 
S
D
 
D
P
 
V
E
 
E
S
 
S
I
 
V
K
 
N
Q
 
R
F
 
M
A
 
V
E
 
D
Q
 
S
G
 
A
A
 
V
S
 
E
R
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
T
I
 
V
D
 
D
A
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
|
A
I
 
I
T
 
F
N
x
S
S
 
T
-
 
L
G
 
K
G
 
M
K
 
K
F
 
P
A
 
F
D
 
E
E
 
E
L
 
I
S
 
S
V
 
G
D
 
D
T
 
E
W
 
W
D
 
D
A
 
K
V
 
L
M
 
F
N
 
A
V
 
V
N
 
N
V
 
A
R
 
K
G
 
G
T
 
T
W
 
F
L
 
L
M
 
C
S
 
C
T
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
S
P
 
P
Y
 
V
L
 
M
R
 
R
D
 
K
S
 
N
G
 
Q
R
 
Y
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
x
S
S
|
S
D
 
S
T
 
V
A
 
V
M
 
V
W
 
T
G
 
G
A
 
R
P
 
P
K
 
N
L
 
Y
L
 
A
A
 
H
Y
|
Y
V
 
I
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
W
S
 
A
M
 
L
T
 
T
R
 
H
S
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
T
E
 
E
F
 
M
G
 
G
A
 
T
H
 
D
Q
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
S
P
|
P
G
x
H
-
 
G
-
x
I
L
 
I
T
 
T
E
 
E
V
x
I
E
 
P
A
 
R
T
 
E
A
 
T
Y
 
-
V
 
I
P
 
S
A
 
E
E
 
E
R
 
G
H
 
W
E
 
R
Y
 
R
Y
 
N
L
 
L
Q
 
E
G
 
E
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
T
 
K
R
 
R
A
 
K
Q
 
G
V
 
D
P
 
A
D
 
S
D
 
D
V
 
L
T
 
V
G
 
G
P
 
I
V
 
L
L
 
L
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
S
R
 
K
F
 
F
V
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
L
 
T
L
 
V
P
 
A
V
 
L
N
 
D
G
 
A
G
 
G
F
 
L

1vl8B Crystal structure of gluconate 5-dehydrogenase (tm0441) from thermotoga maritima at 2.07 a resolution
36% identity, 97% coverage: 9:255/255 of query aligns to 4:252/252 of 1vl8B

query
sites
1vl8B
L
 
L
N
 
R
G
 
G
R
 
R
R
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
S
R
|
R
G
|
G
L
|
L
G
 
G
A
 
F
A
 
G
F
 
I
V
 
A
R
 
Q
A
 
G
L
 
L
V
 
A
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
C
Q
 
S
V
 
V
V
 
V
F
 
V
G
 
A
D
x
S
V
x
R
L
 
N
H
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
A
R
 
S
A
 
E
L
 
A
A
 
A
A
 
Q
S
 
K
L
 
L
A
 
T
G
 
E
Q
 
K
-
 
Y
G
 
G
H
 
V
A
 
E
A
 
T
I
 
M
Y
 
A
L
 
F
P
 
R
L
x
C
D
|
D
L
x
V
A
 
S
D
 
N
P
 
Y
E
 
E
S
 
E
I
 
V
K
 
K
Q
 
K
F
 
L
A
 
L
E
 
E
Q
 
A
G
 
V
A
 
K
S
 
E
R
 
K
L
 
F
G
 
G
G
 
K
I
 
L
D
 
D
A
 
T
L
 
V
I
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
A
x
G
I
|
I
T
 
N
N
 
R
S
 
R
G
 
H
G
 
P
K
 
-
F
 
-
A
 
A
D
 
E
E
 
E
L
 
F
S
 
P
V
 
L
D
 
D
T
 
E
W
 
F
D
 
R
A
 
Q
V
 
V
M
 
I
N
 
E
V
|
V
N
 
N
V
 
L
R
 
F
G
 
G
T
 
T
W
 
Y
L
 
Y
M
 
V
S
 
C
T
 
R
A
 
E
V
 
A
L
 
F
P
 
S
Y
 
L
L
 
L
R
 
R
D
 
E
S
 
S
G
 
D
R
 
N
G
 
P
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
G
S
|
S
D
 
L
T
 
T
A
 
V
M
 
E
W
 
E
-
 
V
G
 
T
A
 
M
P
 
P
K
 
N
L
x
I
L
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
A
S
 
S
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
F
 
W
G
 
G
A
 
R
H
 
Y
Q
 
G
V
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
W
-
x
Y
-
 
R
T
|
T
E
 
K
V
x
M
E
x
T
A
 
E
T
 
A
A
 
V
Y
 
F
V
 
S
P
 
D
A
 
P
E
 
E
R
 
K
H
 
L
E
 
D
Y
 
Y
Y
 
M
L
 
L
Q
 
K
G
 
R
R
 
I
A
 
P
L
 
L
T
 
G
R
 
R
A
 
T
Q
 
G
V
 
V
P
 
P
D
 
E
D
 
D
V
 
L
T
 
K
G
 
G
P
 
V
V
 
A
L
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
E
A
 
E
A
 
A
R
 
K
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
L
 
I
L
 
I
P
 
F
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
W
V
 
T
M
 
A
N
 
N

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
35% identity, 97% coverage: 8:254/255 of query aligns to 2:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
T
 
T
L
 
L
N
 
Q
G
 
G
R
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
x
S
R
|
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
A
 
R
A
 
D
F
 
I
V
 
A
R
 
I
A
 
N
L
 
L
V
 
A
Q
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
V
 
I
V
 
F
F
 
F
G
x
N
-
x
Y
D
x
N
V
x
G
L
x
S
H
 
P
E
 
E
E
 
A
G
 
A
R
 
E
A
 
E
L
 
T
A
 
A
A
 
K
S
 
L
L
 
V
A
 
A
G
 
E
Q
 
H
G
 
G
H
 
V
A
 
E
A
 
V
I
 
E
Y
 
A
L
 
M
P
 
K
L
 
A
D
x
N
L
x
V
A
 
A
D
 
I
P
 
A
E
 
E
S
 
D
I
 
V
K
 
D
Q
 
A
F
 
F
A
 
F
E
 
K
Q
 
Q
G
 
A
A
 
I
S
 
E
R
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
R
I
 
V
D
 
D
A
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
I
|
I
T
 
T
N
 
R
S
 
D
G
 
-
G
 
-
K
 
N
F
 
L
A
 
L
D
 
M
E
 
R
L
 
M
S
 
K
V
 
E
D
 
D
T
 
E
W
 
W
D
 
D
A
 
D
V
 
V
M
 
I
N
 
N
V
x
I
N
 
N
V
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
T
W
 
F
L
 
L
M
 
C
S
 
T
T
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
S
P
 
R
Y
 
T
L
 
M
R
 
M
D
 
K
S
 
Q
G
 
R
R
 
A
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
A
S
|
S
D
 
V
T
 
V
A
 
G
M
 
L
W
 
I
G
 
G
A
 
N
P
 
A
K
 
G
L
x
Q
L
 
A
A
 
N
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
T
L
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
E
F
 
L
G
 
A
A
 
P
H
 
R
Q
 
G
V
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
L
 
F
T
x
I
E
 
T
V
x
T
E
 
D
A
 
M
T
 
T
A
 
D
Y
 
K
V
 
L
P
 
D
A
 
E
E
 
K
R
 
T
H
 
K
E
 
E
Y
 
A
Y
 
M
L
 
L
Q
 
A
G
 
Q
R
 
I
A
 
P
L
 
L
T
 
G
R
 
A
A
 
Y
Q
 
G
V
 
T
P
 
T
D
 
E
D
 
D
V
 
I
T
 
A
G
 
N
P
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
S
R
 
K
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
L
 
T
L
 
L
P
 
S
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
M
V
 
V
M
 
M

2d1yA Crystal structure of tt0321 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
38% identity, 95% coverage: 11:252/255 of query aligns to 5:236/240 of 2d1yA

query
sites
2d1yA
G
 
G
R
 
K
R
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
R
|
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
F
 
I
V
 
A
R
 
Q
A
 
A
L
 
F
V
 
A
Q
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
L
V
 
V
V
 
A
F
 
L
G
 
C
D
|
D
V
 
-
L
|
L
H
x
R
E
 
P
E
 
E
G
 
G
R
 
K
A
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
E
S
 
A
L
 
I
A
 
G
G
 
G
Q
 
A
G
 
-
H
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
F
L
 
F
P
 
Q
L
x
V
D
|
D
L
|
L
A
 
E
D
 
D
P
 
E
E
 
R
S
 
E
I
 
R
K
 
V
Q
 
R
F
 
F
A
 
V
E
 
E
Q
 
E
G
 
A
A
 
A
S
 
Y
R
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
R
I
 
V
D
 
D
A
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
|
A
I
|
I
T
 
A
N
 
A
S
 
P
G
 
G
G
 
S
K
 
A
F
 
L
A
 
T
D
 
V
E
 
R
L
 
L
S
 
P
V
 
-
D
 
-
T
 
E
W
 
W
D
 
R
A
 
R
V
 
V
M
 
L
N
 
E
V
 
V
N
 
N
V
 
L
R
 
T
G
 
A
T
 
P
W
 
M
L
 
H
M
 
L
S
 
S
T
 
A
A
 
L
V
 
A
L
 
A
P
 
R
Y
 
E
L
 
M
R
 
R
D
 
K
S
 
V
G
 
G
R
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
V
A
 
A
S
|
S
D
 
V
T
 
Q
A
 
G
M
 
L
W
 
F
G
 
A
A
 
E
P
 
Q
K
 
E
L
x
N
L
 
A
A
 
A
Y
|
Y
V
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
L
I
 
V
S
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
L
E
 
D
F
 
L
G
 
A
A
 
P
H
 
L
Q
 
R
V
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
A
T
x
I
E
 
A
V
x
T
E
 
E
A
|
A
T
x
V
A
 
L
Y
 
E
V
 
A
P
 
I
A
 
A
E
 
R
R
 
R
H
 
D
E
 
W
Y
 
E
Y
 
D
L
 
L
Q
 
H
G
 
-
R
 
-
A
 
A
L
 
L
T
 
R
R
 
R
A
 
L
Q
 
G
V
 
K
P
 
P
D
 
E
D
 
E
V
 
V
T
 
A
G
 
E
P
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
E
A
 
K
A
 
A
R
 
S
F
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
L
 
I
L
 
L
P
 
P
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
M

3rwbA Crystal structure of complex of 4pal (4-pyridoxolactone) and pldh (tetrameric pyridoxal 4-dehydrogenase) from mesorhizobium loti
37% identity, 96% coverage: 9:253/255 of query aligns to 4:245/247 of 3rwbA

query
sites
3rwbA
L
 
L
N
 
A
G
 
G
R
 
K
R
 
T
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
L
x
I
G
 
G
A
 
K
A
 
A
F
 
I
V
 
A
R
 
A
A
 
R
L
 
L
V
 
A
Q
 
A
A
 
D
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
V
 
V
V
 
I
F
 
V
G
 
S
D
|
D
V
x
I
L
 
N
H
 
A
E
 
E
E
 
G
G
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
I
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
G
 
G
H
 
K
A
 
K
A
 
A
I
 
R
Y
 
A
L
 
I
P
 
A
L
 
A
D
|
D
L
x
I
A
 
S
D
 
D
P
 
P
E
 
G
S
 
S
I
 
V
K
 
K
Q
 
A
F
 
L
A
 
F
E
 
A
Q
 
E
G
 
I
A
 
Q
S
 
A
R
 
L
L
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
S
I
 
I
T
 
V
N
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
P
F
 
F
A
 
V
-
 
A
-
 
W
D
 
D
E
 
D
L
 
V
S
 
D
V
 
L
D
 
D
T
 
H
W
 
W
D
 
R
A
 
K
V
 
I
M
 
I
N
 
D
V
 
V
N
 
N
V
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
T
W
 
F
L
 
I
M
 
V
S
 
T
T
 
R
A
 
A
V
 
G
L
 
T
P
 
D
Y
 
Q
L
 
M
R
 
R
D
 
A
S
 
A
G
 
G
R
 
K
-
 
A
G
 
G
S
 
R
I
 
V
V
 
I
N
 
S
I
|
I
A
 
A
S
|
S
D
x
N
T
|
T
A
 
F
M
 
F
W
 
A
G
 
G
A
 
T
P
 
P
K
 
N
L
x
M
L
 
A
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
M
 
F
T
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
T
E
 
E
F
 
L
G
 
G
A
 
K
H
 
Y
Q
 
N
V
 
I
T
 
T
V
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
T
P
|
P
G
 
G
L
|
L
T
x
I
E
 
E
V
x
S
E
 
D
A
x
G
T
x
V
A
 
K
Y
 
A
V
 
S
P
 
P
-
x
H
A
 
N
E
 
E
R
 
A
H
 
F
E
 
G
Y
 
F
Y
 
V
L
 
E
Q
 
M
G
 
L
R
 
Q
A
 
A
L
 
M
T
 
K
R
 
G
A
 
K
Q
 
G
V
 
Q
P
 
P
D
 
E
D
 
H
V
 
I
T
 
A
G
 
D
P
 
V
V
 
V
L
 
S
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
D
A
 
A
R
 
R
F
 
W
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
L
 
T
L
 
L
P
 
N
V
 
V
N
 
D
G
 
A
G
 
G
F
 
M
V
 
V

3ndrA Crystal structure of tetrameric pyridoxal 4-dehydrogenase from mesorhizobium loti
37% identity, 96% coverage: 9:253/255 of query aligns to 4:245/247 of 3ndrA

query
sites
3ndrA
L
 
L
N
 
A
G
 
G
R
 
K
R
 
T
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
L
x
I
G
 
G
A
 
K
A
 
A
F
 
I
V
 
A
R
 
A
A
 
R
L
 
L
V
 
A
Q
 
A
A
 
D
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
V
 
V
V
 
I
F
 
V
G
 
S
D
|
D
V
x
I
L
 
N
H
 
A
E
 
E
E
 
G
G
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
I
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
G
 
G
H
 
K
A
 
K
A
 
A
I
 
R
Y
 
A
L
 
I
P
 
A
L
 
A
D
|
D
L
x
I
A
 
S
D
 
D
P
 
P
E
 
G
S
 
S
I
 
V
K
 
K
Q
 
A
F
 
L
A
 
F
E
 
A
Q
 
E
G
 
I
A
 
Q
S
 
A
R
 
L
L
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
S
I
 
I
T
 
V
N
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
P
F
 
F
A
 
V
-
 
A
-
 
W
D
 
D
E
 
D
L
 
V
S
 
D
V
 
L
D
 
D
T
 
H
W
 
W
D
 
R
A
 
K
V
 
I
M
 
I
N
 
D
V
|
V
N
 
N
V
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
T
W
 
F
L
 
I
M
 
V
S
 
T
T
 
R
A
 
A
V
 
G
L
 
T
P
 
D
Y
 
Q
L
 
M
R
 
R
D
 
A
S
 
A
G
 
G
R
 
K
-
 
A
G
 
G
S
 
R
I
 
V
V
 
I
N
 
S
I
|
I
A
 
A
S
|
S
D
 
N
T
 
T
A
 
F
M
 
F
W
 
A
G
 
G
A
 
T
P
 
P
K
 
N
L
 
M
L
 
A
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
M
 
F
T
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
T
E
 
E
F
 
L
G
 
G
A
 
K
H
 
Y
Q
 
N
V
 
I
T
 
T
V
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
T
P
|
P
G
 
G
L
|
L
T
x
I
E
 
E
V
x
S
E
 
D
A
x
G
T
x
V
A
 
K
Y
 
A
V
 
S
P
 
P
-
 
H
A
 
N
E
 
E
R
 
A
H
 
F
E
 
G
Y
 
F
Y
 
V
L
 
E
Q
 
M
G
 
L
R
 
Q
A
 
A
L
 
M
T
 
K
R
 
G
A
 
K
Q
 
G
V
 
Q
P
 
P
D
 
E
D
 
H
V
 
I
T
 
A
G
 
D
P
 
V
V
 
V
L
 
S
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
D
A
 
A
R
 
R
F
 
W
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
L
 
T
L
 
L
P
 
N
V
 
V
N
 
D
G
 
A
G
 
G
F
 
M
V
 
V

5ha5D Crystal structure of an NAD-bound oxidoreductase from brucella ovis
34% identity, 96% coverage: 9:253/255 of query aligns to 4:242/244 of 5ha5D

query
sites
5ha5D
L
 
L
N
 
K
G
 
E
R
 
K
R
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
G
R
|
R
G
|
G
L
|
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
I
V
 
S
R
 
S
A
 
G
L
 
A
V
 
A
Q
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
V
V
 
I
F
 
L
G
 
V
D
|
D
V
x
I
L
 
D
H
 
G
E
 
T
E
 
A
G
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
A
 
D
S
 
A
L
 
L
A
 
T
G
 
A
Q
 
K
G
 
G
H
 
F
A
 
V
A
 
A
I
 
E
Y
 
G
L
 
H
P
 
A
L
|
L
D
|
D
L
x
V
A
 
T
D
 
D
P
 
R
E
 
D
S
 
A
I
 
V
K
 
A
Q
 
A
F
 
L
A
 
A
E
 
D
Q
 
D
G
 
I
A
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
L
D
 
D
A
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
I
 
V
T
 
A
N
 
G
S
 
R
G
 
A
G
 
A
K
 
-
F
 
F
A
 
D
D
 
Q
E
 
P
L
 
E
S
 
A
V
 
V
D
 
E
T
 
V
W
 
W
D
 
D
A
 
R
V
 
V
M
 
I
N
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
L
R
 
E
G
 
G
T
 
A
W
 
F
L
 
N
M
 
V
S
 
S
T
 
H
A
 
A
V
 
L
L
 
V
P
 
P
Y
 
A
L
 
L
R
 
K
D
 
-
S
 
A
G
 
A
R
 
K
G
 
G
S
 
N
I
 
V
V
 
V
N
 
H
I
 
L
A
 
C
S
|
S
D
 
V
T
 
A
A
 
G
M
 
F
W
 
V
G
 
S
A
 
G
P
 
G
K
 
S
L
 
T
L
 
A
A
 
G
Y
|
Y
V
 
V
A
 
V
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
R
S
 
S
M
 
L
T
 
T
R
 
Q
S
 
V
L
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
D
F
 
L
G
 
A
A
 
P
H
 
H
Q
 
G
V
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
|
G
L
 
I
T
x
M
E
 
M
V
x
S
E
 
E
A
 
-
T
 
-
A
 
-
Y
 
-
V
 
M
P
 
A
A
 
V
E
 
A
R
 
G
H
 
T
E
 
D
Y
 
W
Y
 
F
L
 
M
Q
 
N
G
 
R
R
 
V
A
 
M
L
 
M
T
 
K
R
 
R
A
 
I
Q
 
G
V
 
E
P
 
T
D
 
S
D
 
E
V
 
V
T
 
V
G
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
P
A
 
M
A
 
A
R
 
S
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
L
 
I
L
 
L
P
 
P
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
F
V
 
L

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
34% identity, 95% coverage: 9:251/255 of query aligns to 2:241/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
N
 
Q
G
 
N
R
 
R
R
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
A
 
A
R
 
S
G
 
G
L
x
M
G
 
G
A
 
K
A
 
Q
F
 
T
V
 
A
R
 
L
A
 
R
L
 
F
V
 
A
Q
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
I
G
 
N
D
|
D
V
x
I
L
 
D
H
 
A
E
 
E
E
 
K
G
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
T
A
 
V
A
 
D
S
 
E
L
 
F
A
 
S
G
 
A
Q
 
R
G
 
G
H
 
H
A
 
R
A
 
V
I
 
L
Y
 
G
L
 
A
P
 
V
L
 
A
D
 
D
L
x
I
A
 
G
D
 
N
P
 
K
E
 
A
S
 
A
I
 
V
K
 
D
Q
 
G
F
 
M
A
 
V
E
 
K
Q
 
Q
G
 
T
A
 
I
S
 
D
R
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
x
G
I
 
M
T
 
E
N
 
R
S
 
A
G
 
G
G
 
A
K
 
-
F
 
-
A
 
L
D
 
R
E
 
K
L
 
L
S
 
S
V
 
E
D
 
A
T
 
D
W
 
W
D
 
D
A
 
V
V
 
T
M
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
V
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
T
W
 
F
L
 
L
M
 
C
S
 
T
T
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
H
P
 
G
Y
 
H
L
 
M
R
 
V
D
 
E
S
 
N
G
 
K
R
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
D
 
R
T
 
A
A
 
W
M
 
L
W
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
G
K
 
Q
L
 
T
L
 
-
A
 
P
Y
|
Y
V
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
V
S
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
E
 
E
F
 
L
G
 
G
A
 
R
H
 
A
Q
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
x
I
E
 
H
V
 
T
E
 
P
A
 
M
T
 
W
A
 
D
Y
 
E
V
 
L
P
 
P
A
 
E
E
 
K
R
 
D
H
 
Q
E
 
Q
Y
 
F
Y
 
L
L
 
L
Q
 
S
G
 
R
R
 
Q
A
 
P
L
 
T
T
 
G
R
 
K
A
 
L
Q
 
G
V
 
E
P
 
P
D
 
D
D
 
D
V
 
I
T
 
A
G
 
N
P
 
T
V
 
L
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
D
D
 
D
A
 
D
A
 
S
R
 
G
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
L
 
L
P
 
Y
V
 
V
N
 
C
G
 
G
G
 
G

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
34% identity, 95% coverage: 9:251/255 of query aligns to 3:242/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
L
 
I
N
 
Q
G
 
N
R
 
R
R
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
A
 
A
R
x
S
G
 
G
L
 
M
G
 
G
A
 
K
A
 
Q
F
 
T
V
 
A
R
 
L
A
 
R
L
 
F
V
 
A
Q
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
I
G
 
N
D
|
D
V
 
I
L
 
D
H
 
A
E
 
E
E
 
K
G
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
T
A
 
V
A
 
D
S
 
E
L
 
F
A
 
S
G
 
A
Q
 
R
G
 
G
H
 
H
A
 
R
A
 
V
I
 
L
Y
 
G
L
 
A
P
 
V
L
 
A
D
|
D
L
x
I
A
 
G
D
 
N
P
 
K
E
 
A
S
 
A
I
 
V
K
 
D
Q
 
G
F
 
M
A
 
V
E
 
K
Q
 
Q
G
 
T
A
 
I
S
 
D
R
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
I
 
M
T
 
E
N
 
R
S
 
A
G
 
G
G
 
A
K
 
-
F
 
-
A
 
L
D
 
R
E
 
K
L
 
L
S
 
S
V
 
E
D
 
A
T
 
D
W
 
W
D
 
D
A
 
V
V
 
T
M
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
V
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
T
W
 
F
L
 
L
M
 
C
S
 
T
T
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
H
P
 
G
Y
 
H
L
 
M
R
 
V
D
 
E
S
 
N
G
 
K
R
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
D
 
R
T
 
A
A
 
W
M
 
L
W
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
G
K
 
Q
L
 
T
L
 
-
A
 
P
Y
|
Y
V
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
V
S
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
E
 
E
F
 
L
G
 
G
A
 
R
H
 
A
Q
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
I
E
 
H
V
 
T
E
 
P
A
 
M
T
 
W
A
 
D
Y
 
E
V
 
L
P
 
P
A
 
E
E
 
K
R
 
D
H
 
Q
E
 
Q
Y
 
F
Y
 
L
L
 
L
Q
 
S
G
 
R
R
 
Q
A
 
P
L
 
T
T
 
G
R
 
K
A
 
L
Q
 
G
V
 
E
P
 
P
D
 
D
D
 
D
V
 
I
T
 
A
G
 
N
P
 
T
V
 
L
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
D
D
 
D
A
 
D
A
 
S
R
 
G
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
L
 
L
P
 
Y
V
 
V
N
 
C
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3ak4A Crystal structure of nadh-dependent quinuclidinone reductase from agrobacterium tumefaciens
36% identity, 97% coverage: 9:255/255 of query aligns to 5:258/258 of 3ak4A

query
sites
3ak4A
L
 
L
N
 
S
G
 
G
R
 
R
R
 
K
V
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
S
R
x
K
G
|
G
L
x
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
I
V
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
D
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
V
 
V
V
 
A
F
 
I
G
 
A
D
|
D
V
x
L
L
 
D
H
 
V
E
 
M
E
 
A
G
 
A
R
 
Q
A
 
A
L
 
V
A
 
V
A
 
A
S
 
G
L
 
L
A
 
E
G
 
N
Q
 
G
G
 
G
H
 
F
A
 
A
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
L
 
V
P
 
E
L
x
V
D
|
D
L
x
V
A
 
T
D
 
K
P
 
R
E
 
A
S
 
S
I
 
V
K
 
D
Q
 
A
F
 
A
A
 
M
E
 
Q
Q
 
K
G
 
A
A
 
I
S
 
D
R
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
F
D
 
D
A
 
L
L
 
L
I
 
C
N
 
A
N
|
N
A
|
A
A
x
G
I
 
V
T
 
S
N
 
T
S
 
M
G
 
-
G
 
-
K
 
R
F
 
P
A
 
A
D
 
V
E
 
D
L
 
I
S
 
T
V
 
D
D
 
E
T
 
E
W
 
W
D
 
D
A
 
F
V
 
N
M
 
F
N
 
D
V
 
V
N
 
N
V
 
A
R
 
R
G
 
G
T
 
V
W
 
F
L
 
L
M
 
A
S
 
N
-
 
Q
T
 
I
A
 
A
V
 
C
L
 
R
P
 
H
Y
 
F
L
 
L
R
 
A
D
 
S
S
 
N
G
 
T
R
 
K
G
 
G
S
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
D
 
L
T
 
A
A
 
A
M
 
K
W
 
V
G
 
G
A
 
A
P
 
P
K
 
L
L
|
L
L
 
A
A
 
H
Y
|
Y
V
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
F
S
 
G
M
 
W
T
 
T
R
 
Q
S
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
F
 
M
G
 
A
A
 
P
H
 
K
Q
 
N
V
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
C
P
 
P
G
|
G
L
 
F
T
x
V
-
 
K
-
x
T
-
 
A
-
x
M
-
 
Q
-
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
W
E
|
E
V
 
A
E
 
E
A
 
L
T
 
R
A
 
G
Y
 
M
V
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
A
R
 
V
H
 
R
E
 
A
Y
 
E
Y
 
Y
L
 
V
Q
 
S
G
 
L
R
 
T
A
 
P
L
 
L
T
 
G
R
 
R
A
 
I
Q
 
E
V
 
E
P
 
P
D
 
E
D
 
D
V
 
V
T
 
A
G
 
D
P
 
V
V
 
V
L
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
L
 
G
L
 
I
P
 
N
V
 
V
N
 
T
G
 
G
G
 
G
F
 
V
V
 
R
M
 
M
N
 
D

2hsdA The refined three-dimensional structure of 3alpha,20beta- hydroxysteroid dehydrogenase and possible roles of the residues conserved in short-chain dehydrogenases (see paper)
38% identity, 96% coverage: 9:252/255 of query aligns to 3:241/253 of 2hsdA

query
sites
2hsdA
L
 
L
N
 
S
G
 
G
R
 
K
R
 
T
V
 
V
L
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
R
|
R
G
|
G
L
|
L
G
 
G
A
 
A
A
 
E
F
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
Q
L
 
A
V
 
V
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
L
G
 
A
D
|
D
V
|
V
L
 
L
H
 
D
E
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
A
A
 
A
L
 
T
A
 
A
A
 
R
S
 
E
L
 
L
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
G
 
G
H
 
D
A
 
A
A
 
A
I
 
R
Y
 
Y
L
 
Q
P
 
H
L
|
L
D
 
D
L
x
V
A
 
T
D
 
I
P
 
E
E
 
E
S
 
D
I
 
W
K
 
Q
Q
 
R
F
 
V
A
 
V
E
 
A
Q
 
Y
G
 
A
A
 
R
S
 
E
R
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
S
I
 
V
D
 
D
A
 
G
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
I
 
I
T
 
-
N
 
-
S
 
S
G
 
T
G
 
G
K
 
M
F
 
F
A
 
L
D
 
E
E
 
T
L
 
E
S
 
S
V
 
V
D
 
E
T
 
R
W
 
F
D
 
R
A
 
K
V
 
V
M
 
V
N
 
E
V
 
I
N
 
N
V
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
V
W
 
F
L
 
I
M
 
G
S
 
M
T
 
K
A
 
T
V
 
V
L
 
I
P
 
P
Y
 
A
L
 
M
R
 
K
D
 
D
S
 
A
G
 
G
R
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
|
S
D
 
A
T
 
A
A
 
G
M
 
L
W
 
M
G
 
G
A
 
L
P
 
A
K
 
L
L
 
T
L
 
S
A
 
S
Y
|
Y
V
 
G
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
W
A
 
G
V
 
V
I
 
R
S
 
G
M
 
L
T
 
S
R
 
K
S
 
L
L
 
A
A
 
A
R
 
V
E
 
E
F
 
L
G
 
G
A
 
T
H
 
D
Q
 
R
V
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
V
A
 
H
P
|
P
G
|
G
L
 
M
T
|
T
E
 
Y
V
 
T
E
 
P
A
 
M
T
 
T
A
 
A
Y
 
E
V
 
T
P
 
G
A
 
I
E
 
R
R
 
Q
H
 
G
E
 
E
Y
 
G
Y
 
N
L
 
Y
Q
 
P
G
 
N
R
 
T
A
 
P
L
 
M
T
 
G
R
 
R
A
 
V
Q
 
G
V
 
E
P
 
P
D
 
G
D
 
E
V
 
I
T
 
A
G
 
G
P
 
A
V
 
V
L
 
V
F
 
K
L
 
L
L
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
T
A
 
S
R
 
S
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
L
 
E
L
 
L
P
 
A
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
W

1hdcA Mechanism of inhibition of 3alpha,20beta-hydroxysteroid dehydrogenase by a licorice-derived steroidal inhibitor (see paper)
38% identity, 96% coverage: 9:252/255 of query aligns to 3:241/253 of 1hdcA

query
sites
1hdcA
L
 
L
N
 
S
G
 
G
R
 
K
R
 
T
V
 
V
L
 
I
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
R
G
|
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
E
F
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
Q
L
 
A
V
 
V
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
L
G
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
L
H
 
D
E
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
A
A
 
A
L
 
T
A
 
A
A
 
R
S
 
E
L
 
L
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
G
 
G
H
 
D
A
 
A
A
 
A
I
 
R
Y
 
Y
L
 
Q
P
 
H
L
 
L
D
 
D
L
 
V
A
 
T
D
 
I
P
 
E
E
 
E
S
 
D
I
 
W
K
 
Q
Q
 
R
F
 
V
A
 
V
E
 
A
Q
 
Y
G
 
A
A
 
R
S
 
E
R
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
S
I
 
V
D
 
D
A
 
G
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
A
 
G
I
 
I
T
 
-
N
 
-
S
|
S
G
x
T
G
|
G
K
 
M
F
 
F
A
 
L
D
 
E
E
 
T
L
 
E
S
 
S
V
 
V
D
 
E
T
 
R
W
 
F
D
 
R
A
 
K
V
 
V
M
 
V
N
 
E
V
 
I
N
 
N
V
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
V
W
 
F
L
 
I
M
 
G
S
 
M
T
 
K
A
 
T
V
 
V
L
 
I
P
 
P
Y
 
A
L
 
M
R
 
K
D
 
D
S
 
A
G
 
G
R
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
|
S
D
 
A
T
 
A
A
 
G
M
 
L
W
 
M
G
 
G
A
 
L
P
 
A
K
x
L
L
 
T
L
 
S
A
 
S
Y
|
Y
V
 
G
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
W
A
 
G
V
 
V
I
 
R
S
 
G
M
 
L
T
 
S
R
 
K
S
 
L
L
 
A
A
 
A
R
 
V
E
 
E
F
 
L
G
 
G
A
 
T
H
 
D
Q
 
R
V
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
V
A
 
H
P
 
P
G
 
G
L
x
M
T
 
T
E
 
Y
V
 
T
E
 
P
A
x
M
T
|
T
A
 
A
Y
 
E
V
x
T
P
 
G
A
 
I
E
 
R
R
 
Q
H
 
G
E
 
E
Y
 
G
Y
 
N
L
 
Y
Q
 
P
G
 
N
R
 
T
A
 
P
L
 
M
T
 
G
R
 
R
A
 
V
Q
 
G
V
 
E
P
 
P
D
 
G
D
 
E
V
 
I
T
 
A
G
 
G
P
 
A
V
 
V
L
 
V
F
 
K
L
 
L
L
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
T
A
 
S
R
 
S
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
L
 
E
L
 
L
P
 
A
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
W

7krmC Putative fabg bound to nadh from acinetobacter baumannii
35% identity, 97% coverage: 9:255/255 of query aligns to 3:244/244 of 7krmC

query
sites
7krmC
L
 
L
N
 
Q
G
 
G
R
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
-
x
S
-
 
E
R
 
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
F
 
T
V
 
A
R
 
E
A
 
I
L
 
F
V
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
I
F
 
I
G
 
V
D
|
D
V
x
L
L
 
D
H
 
L
E
 
A
E
 
Q
G
 
S
R
 
Q
A
 
N
L
 
A
A
 
A
A
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
-
G
 
G
Q
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
-
A
 
-
I
 
M
Y
 
G
L
 
L
P
 
A
L
x
A
D
x
N
L
x
V
A
 
A
D
 
N
P
 
E
E
 
E
S
 
Q
I
 
V
K
 
K
Q
 
A
F
 
A
A
 
V
E
 
E
Q
 
Q
G
 
A
A
 
L
S
 
Q
R
 
H
L
 
Y
G
 
G
G
 
K
I
 
I
D
 
D
A
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
Q
S
 
P
G
 
I
G
 
K
K
 
T
F
 
L
A
 
-
D
 
-
E
 
D
L
 
I
S
 
Q
V
 
R
D
 
S
T
 
D
W
 
Y
D
 
D
A
 
R
V
 
V
M
 
L
N
 
D
V
|
V
N
 
S
V
 
L
R
 
R
G
 
G
T
 
T
W
 
L
L
 
I
M
 
M
S
 
S
T
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
I
P
 
P
Y
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
A
S
 
N
G
 
G
R
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
C
I
 
L
A
 
S
S
|
S
D
 
V
T
 
S
A
 
A
-
 
Q
-
 
R
-
 
G
-
 
G
-
 
G
M
 
I
W
 
F
G
 
G
A
 
G
P
 
P
K
 
H
L
 
-
L
 
-
A
 
-
Y
|
Y
V
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
L
S
 
G
M
 
L
T
 
A
R
 
K
S
 
A
L
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
G
H
 
D
Q
 
Q
V
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
L
A
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
x
I
E
 
Q
V
x
T
E
 
D
A
 
-
T
 
-
A
 
-
Y
 
-
V
 
M
P
 
N
A
 
D
E
 
D
R
 
R
H
 
R
E
 
H
Y
 
D
Y
 
I
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
R
 
I
A
 
P
L
 
L
T
 
G
R
 
R
A
 
L
Q
 
G
V
 
K
P
 
A
D
 
Q
D
 
D
V
 
V
T
 
A
G
 
N
P
 
A
V
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
L
A
 
S
R
 
A
F
 
Y
V
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
V
L
 
T
L
 
L
P
 
D
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
M
V
 
L
M
 
I
N
 
H

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
34% identity, 96% coverage: 9:254/255 of query aligns to 6:247/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
L
 
L
N
 
A
G
 
S
R
 
K
R
 
T
V
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
R
|
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
A
 
F
A
 
G
F
 
I
V
 
A
R
 
Q
A
 
V
L
 
L
V
 
A
Q
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
V
V
 
I
F
 
I
G
 
A
D
|
D
V
 
-
L
x
R
H
 
D
E
 
A
E
 
H
G
 
G
R
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
A
 
R
G
 
E
Q
 
S
G
 
G
H
 
A
A
 
Q
A
 
A
I
 
L
Y
 
F
L
 
I
P
 
S
L
x
C
D
 
N
L
x
I
A
 
A
D
 
E
P
 
K
E
 
T
S
 
Q
I
 
V
K
 
E
Q
 
A
F
 
L
A
 
F
E
 
S
Q
 
Q
G
 
A
A
 
E
S
 
E
R
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
P
I
 
V
D
 
D
A
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
x
G
I
|
I
T
 
N
N
 
R
S
 
D
G
 
A
G
 
-
K
 
-
F
 
M
A
 
L
D
 
H
E
 
K
L
 
L
S
 
T
V
 
E
D
 
A
T
 
D
W
 
W
D
 
D
A
 
T
V
 
V
M
 
I
N
 
D
V
|
V
N
 
N
V
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
T
W
 
F
L
 
L
M
 
C
S
 
M
T
 
Q
A
 
Q
V
 
A
L
 
A
P
 
I
Y
 
R
L
 
M
R
 
R
D
 
E
S
 
R
G
 
G
R
 
A
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
D
 
-
T
 
-
A
 
A
M
 
S
W
 
W
-
 
L
G
 
G
A
 
N
P
 
V
K
 
G
L
 
Q
L
 
T
A
 
N
Y
|
Y
V
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
V
S
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
K
S
 
T
L
 
A
A
 
C
R
 
R
E
 
E
F
 
L
G
 
A
A
 
K
H
 
K
Q
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
C
P
 
P
G
 
G
L
 
F
T
x
I
E
 
D
V
x
T
E
 
D
A
 
M
T
|
T
A
 
R
Y
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
E
E
 
N
R
 
V
H
 
W
E
 
Q
Y
 
I
Y
 
M
L
 
V
Q
 
S
G
 
K
R
 
I
A
 
P
L
 
A
T
 
G
R
 
Y
A
 
A
Q
 
G
V
 
E
P
 
A
D
 
K
D
 
D
V
 
V
T
 
G
G
 
E
P
 
C
V
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
G
A
 
A
R
 
R
F
 
Y
V
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
E
L
 
V
L
 
I
P
 
N
V
 
V
N
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
M
V
 
V
M
 
L

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
31% identity, 96% coverage: 8:252/255 of query aligns to 4:252/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
T
 
N
L
 
L
N
 
T
G
 
D
R
 
K
R
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
R
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
F
 
A
V
 
V
R
 
Q
A
 
A
L
 
F
V
 
L
Q
 
G
A
 
Q
G
 
Q
A
 
A
Q
 
N
V
 
V
V
 
V
F
 
V
G
 
A
D
|
D
V
x
I
L
 
D
H
 
E
E
 
A
E
 
Q
G
 
G
R
 
E
A
 
A
L
 
M
A
 
V
A
 
R
S
 
K
L
 
-
A
 
-
G
 
E
Q
 
N
G
 
N
H
 
D
A
 
R
A
 
L
I
 
H
Y
 
F
L
 
V
P
 
Q
L
x
T
D
 
D
L
x
I
A
 
T
D
 
D
P
 
E
E
 
A
S
 
A
I
 
C
K
 
Q
Q
 
H
F
 
A
A
 
V
E
 
E
Q
 
S
G
 
A
A
 
V
S
 
H
R
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
L
D
 
D
A
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
x
G
I
 
I
T
 
E
N
 
I
S
 
V
G
 
A
G
 
P
K
 
I
F
 
H
A
 
E
D
 
M
E
 
E
L
 
L
S
 
S
V
 
-
D
 
-
T
 
D
W
 
W
D
 
N
A
 
K
V
 
V
M
 
L
N
 
Q
V
 
V
N
 
N
V
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
M
W
 
F
L
 
L
M
 
M
S
 
S
T
 
K
A
 
H
V
 
A
L
 
L
P
 
K
Y
 
H
L
 
M
R
 
L
D
 
A
S
 
A
G
 
G
R
 
K
G
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
D
 
V
T
 
G
A
 
G
M
 
L
W
 
V
G
 
A
A
 
W
P
 
P
K
 
D
L
 
I
L
 
P
A
 
A
Y
|
Y
V
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
L
S
 
Q
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
L
 
M
A
 
A
R
 
V
E
 
D
F
 
Y
G
 
A
A
 
K
H
 
H
Q
 
Q
V
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
L
x
I
T
x
I
E
 
D
V
 
T
E
 
P
A
 
L
T
 
N
A
 
E
Y
 
K
V
 
S
P
 
F
A
 
L
E
 
E
R
 
N
H
 
N
E
 
E
Y
 
G
Y
 
T
L
 
L
Q
 
E
G
 
E
R
 
I
A
 
K
L
 
K
T
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
-
 
N
-
 
P
-
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
L
-
 
G
-
 
K
P
 
P
D
 
E
D
 
E
V
 
I
T
 
A
G
 
N
P
 
V
V
 
M
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
L
A
 
S
R
 
S
F
 
Y
V
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
L
 
A
L
 
I
P
 
T
V
 
A
N
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
Y

6t62A Crystal structure of acinetobacter baumannii fabg in complex with NADPH at 1.8 a resolution (see paper)
35% identity, 95% coverage: 12:254/255 of query aligns to 5:243/244 of 6t62A

query
sites
6t62A
R
 
R
R
 
K
V
 
V
-
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
I
V
 
A
R
 
Q
A
 
Q
L
 
L
V
 
I
Q
 
Q
A
 
D
G
 
G
A
 
Y
Q
 
F
V
 
V
V
 
V
F
 
-
G
 
G
D
 
T
V
x
A
L
x
T
H
 
S
E
 
E
E
 
S
G
 
G
-
 
A
R
 
Q
A
 
K
L
 
L
A
 
T
A
 
D
S
 
S
L
 
F
A
 
G
G
 
E
Q
 
Q
G
 
G
H
 
A
A
 
G
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
L
 
L
P
 
A
L
|
L
D
|
D
L
x
V
A
 
R
D
 
N
P
 
L
E
 
D
S
 
E
I
 
I
K
 
E
Q
 
A
F
 
V
A
 
V
E
 
S
Q
 
H
G
 
I
A
 
E
S
 
Q
R
 
N
L
 
Y
G
 
G
G
 
P
I
 
V
D
 
L
A
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
I
|
I
T
 
T
N
 
K
S
 
D
G
 
-
G
 
-
K
 
N
F
 
L
A
 
L
D
 
L
E
 
R
L
 
M
S
 
S
V
 
E
D
 
D
T
 
D
W
 
W
D
 
D
A
 
D
V
 
I
M
 
L
N
 
N
V
 
I
N
 
H
V
 
L
R
 
K
G
 
A
T
 
V
W
 
Y
L
 
R
M
 
L
S
 
S
T
 
K
A
 
R
V
 
V
L
 
L
P
 
K
Y
 
G
L
 
M
R
 
T
D
 
K
S
 
A
G
 
R
R
 
F
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
x
S
S
|
S
D
 
V
T
 
V
A
 
A
M
 
H
W
 
F
G
 
A
A
 
N
P
 
P
K
 
G
L
 
Q
L
 
A
A
 
N
Y
|
Y
V
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
I
I
 
E
S
 
A
M
 
F
T
 
S
R
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
F
 
M
G
 
G
A
 
S
H
 
R
Q
 
Q
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
F
T
x
I
E
 
A
V
 
T
E
 
E
A
x
M
T
 
T
A
 
D
Y
 
A
V
 
L
P
 
S
A
 
E
E
 
D
R
 
I
H
 
R
E
 
K
Y
 
K
Y
 
M
L
 
S
Q
 
D
G
 
Q
R
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
N
R
 
R
A
 
L
Q
 
G
V
 
E
P
 
P
D
 
Q
D
 
D
V
 
I
T
 
A
G
 
N
P
 
A
V
 
V
L
 
S
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
K
A
 
A
R
 
G
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
L
 
V
L
 
L
P
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
L
V
 
Y
M
 
M

Query Sequence

>H281DRAFT_03637 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_03637
MHKDASATLNGRRVLVTGGARGLGAAFVRALVQAGAQVVFGDVLHEEGRALAASLAGQGH
AAIYLPLDLADPESIKQFAEQGASRLGGIDALINNAAITNSGGKFADELSVDTWDAVMNV
NVRGTWLMSTAVLPYLRDSGRGSIVNIASDTAMWGAPKLLAYVASKGAVISMTRSLAREF
GAHQVTVNAIAPGLTEVEATAYVPAERHEYYLQGRALTRAQVPDDVTGPVLFLLSDAARF
VTGQLLPVNGGFVMN

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory