SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_03644 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_03644 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5gtlA NADPH complex structure of aldehyde dehydrogenase from bacillus cereus
40% identity, 94% coverage: 17:487/499 of query aligns to 19:487/491 of 5gtlA

query
sites
5gtlA
I
 
M
F
 
F
I
 
I
G
 
N
G
 
G
E
 
E
W
 
F
R
 
V
Q
 
S
G
 
A
-
 
I
R
 
G
G
 
G
N
 
K
P
 
T
Y
 
F
K
 
E
S
 
T
L
 
Y
Y
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
T
Q
 
E
S
 
D
V
 
V
N
 
L
M
 
A
E
 
V
I
 
V
S
 
C
T
 
E
A
 
A
N
 
Q
A
 
E
D
 
E
D
 
D
A
 
I
R
 
D
E
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
R
I
 
S
A
 
A
W
 
F
R
 
E
K
 
S
S
 
G
D
 
P
W
 
W
S
 
A
G
 
E
L
 
M
K
 
T
P
 
T
H
 
A
Q
 
E
R
 
R
A
 
A
L
 
H
I
 
L
L
 
I
Y
 
Y
R
 
K
I
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
M
 
E
A
 
E
R
 
H
H
 
R
E
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
E
R
 
A
R
 
L
D
 
D
N
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
P
-
 
Y
-
 
Q
I
 
V
G
 
A
E
 
L
T
 
D
R
 
D
V
 
D
L
 
I
V
 
S
A
 
A
S
 
T
A
 
V
A
 
E
N
 
N
T
 
-
F
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
F
 
Y
A
 
A
A
 
G
C
 
W
L
 
T
E
 
T
T
 
K
L
 
I
D
 
I
E
 
G
E
 
Q
V
 
T
T
 
I
P
 
P
S
 
I
R
 
S
G
 
K
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
T
 
N
M
 
Y
S
 
T
V
 
R
Y
 
H
E
 
E
P
 
P
I
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
V
A
 
G
A
 
Q
I
|
I
T
 
I
P
|
P
W
 
W
N
|
N
S
 
F
P
 
P
I
 
L
A
 
V
S
 
M
D
 
S
A
 
S
Q
 
W
K
 
K
L
 
M
A
 
G
P
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
T
G
 
G
N
 
C
A
 
T
V
 
I
V
 
V
L
 
L
K
|
K
P
 
P
A
|
A
E
|
E
V
x
Q
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
S
S
 
L
L
 
L
A
 
Y
L
 
A
A
 
A
R
 
K
I
 
L
C
 
F
E
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
F
P
 
P
K
 
N
G
 
G
V
 
V
I
 
V
S
 
N
V
 
F
L
 
V
P
 
P
G
 
G
K
 
F
G
|
G
S
 
P
V
 
E
I
 
A
G
|
G
D
 
A
V
 
A
L
 
I
V
 
V
R
 
N
H
 
H
P
 
H
L
 
D
V
 
I
K
 
D
K
 
K
V
 
V
S
 
A
F
 
F
T
 
T
G
|
G
G
x
S
T
 
T
E
 
V
V
x
T
G
 
G
R
 
K
G
 
Y
I
 
I
A
 
M
R
 
R
I
 
Q
A
 
S
A
 
A
D
 
E
K
 
M
L
 
I
M
 
K
P
 
H
V
 
V
S
 
T
L
 
L
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
T
 
N
V
 
I
V
 
I
F
 
L
D
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
E
H
 
E
A
 
A
V
 
I
N
 
N
G
 
G
V
 
A
L
 
F
Y
 
Q
G
 
G
I
 
I
F
 
M
S
 
Y
S
 
N
S
 
H
G
 
G
E
 
Q
A
 
N
C
|
C
I
 
S
A
 
A
G
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
V
F
 
F
V
 
V
Q
 
H
R
 
R
S
 
K
V
 
H
Y
 
Y
D
 
E
A
 
T
F
 
V
M
 
V
K
 
D
R
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
K
G
 
M
A
 
A
R
 
N
K
 
N
L
 
V
R
 
K
V
 
L
G
 
G
D
 
A
P
 
G
S
 
M
R
 
E
V
 
K
E
 
E
T
 
T
Q
 
E
M
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
L
I
 
V
T
 
S
Q
 
K
A
 
K
H
 
Q
R
 
Q
E
 
E
T
 
R
V
 
V
E
 
L
R
 
N
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
L
 
Q
G
 
G
L
 
K
E
 
K
E
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
T
L
 
V
L
 
A
C
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
P
 
A
V
 
L
G
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
K
G
 
G
T
 
Y
Y
 
F
F
 
V
Q
 
K
P
 
P
T
 
T
I
 
V
L
 
F
E
 
T
G
 
D
L
 
V
S
 
T
N
 
D
N
 
D
A
 
M
R
 
T
I
 
I
C
 
V
Q
 
K
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
V
V
 
V
A
 
V
M
 
L
P
 
P
F
 
F
D
 
D
D
 
S
E
 
T
A
 
E
S
 
E
L
 
V
L
 
I
K
 
E
E
 
R
A
 
A
N
 
N
N
 
N
S
 
S
V
 
S
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
W
 
W
T
 
T
R
 
Q
D
 
N
Y
 
I
K
 
K
R
 
T
A
 
G
Y
 
H
R
 
Q
T
 
V
A
 
A
R
 
N
A
 
K
L
 
L
E
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
T
I
 
V
W
 
W
I
 
I
N
 
N
T
 
D
Y
 
Y
K
 
N
L
 
L
F
 
E
S
 
N
I
 
A
S
 
A
T
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
G
G
 
G
W
 
Y
K
 
K
E
 
Q
S
 
S
G
 
G
M
 
I
G
 
G
R
 
R
E
|
E
K
 
L
G
 
G
R
 
S
L
 
Y
G
 
A
I
 
L
R
 
D
E
 
N
Y
 
Y
M
 
T
Q
 
E
Q
 
V
K
 
K
S
 
S
L
 
V
Y
 
W

5gtkA NAD+ complex structure of aldehyde dehydrogenase from bacillus cereus
40% identity, 94% coverage: 17:487/499 of query aligns to 19:487/491 of 5gtkA

query
sites
5gtkA
I
 
M
F
 
F
I
 
I
G
 
N
G
 
G
E
 
E
W
 
F
R
 
V
Q
 
S
G
 
A
-
 
I
R
 
G
G
 
G
N
 
K
P
 
T
Y
 
F
K
 
E
S
 
T
L
 
Y
Y
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
T
Q
 
E
S
 
D
V
 
V
N
 
L
M
 
A
E
 
V
I
 
V
S
 
C
T
 
E
A
 
A
N
 
Q
A
 
E
D
 
E
D
 
D
A
 
I
R
 
D
E
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
R
I
 
S
A
 
A
W
 
F
R
 
E
K
 
S
S
 
G
D
 
P
W
 
W
S
 
A
G
 
E
L
 
M
K
 
T
P
 
T
H
 
A
Q
 
E
R
 
R
A
 
A
L
 
H
I
 
L
L
 
I
Y
 
Y
R
 
K
I
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
M
 
E
A
 
E
R
 
H
H
 
R
E
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
E
R
 
A
R
 
L
D
 
D
N
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
P
-
 
Y
-
 
Q
I
 
V
G
 
A
E
 
L
T
 
D
R
 
D
V
 
D
L
 
I
V
 
S
A
 
A
S
 
T
A
 
V
A
 
E
N
 
N
T
 
-
F
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
F
 
Y
A
 
A
A
 
G
C
 
W
L
 
T
E
 
T
T
 
K
L
 
I
D
 
I
E
 
G
E
 
Q
V
 
T
T
 
I
P
 
P
S
 
I
R
 
S
G
 
K
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
T
 
N
M
 
Y
S
 
T
V
 
R
Y
 
H
E
 
E
P
 
P
I
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
V
A
 
G
A
 
Q
I
|
I
T
x
I
P
|
P
W
|
W
N
|
N
S
 
F
P
 
P
I
 
L
A
 
V
S
 
M
D
 
S
A
 
S
Q
 
W
K
 
K
L
 
M
A
 
G
P
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
T
G
 
G
N
 
C
A
 
T
V
 
I
V
 
V
L
 
L
K
|
K
P
 
P
A
 
A
E
|
E
V
 
Q
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
S
S
 
L
L
 
L
A
 
Y
L
 
A
A
 
A
R
 
K
I
 
L
C
 
F
E
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
F
P
 
P
K
 
N
G
 
G
V
 
V
I
 
V
S
 
N
V
 
F
L
 
V
P
 
P
G
 
G
K
 
F
G
|
G
S
 
P
V
 
E
I
 
A
G
|
G
D
x
A
V
 
A
L
 
I
V
 
V
R
 
N
H
 
H
P
 
H
L
 
D
V
 
I
K
 
D
K
 
K
V
 
V
S
 
A
F
|
F
T
 
T
G
|
G
G
x
S
T
 
T
E
 
V
V
x
T
G
 
G
R
 
K
G
x
Y
I
 
I
A
 
M
R
 
R
I
 
Q
A
 
S
A
 
A
D
 
E
K
 
M
L
 
I
M
 
K
P
 
H
V
 
V
S
 
T
L
 
L
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
T
 
N
V
 
I
V
 
I
F
 
L
D
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
E
H
 
E
A
 
A
V
 
I
N
 
N
G
 
G
V
 
A
L
 
F
Y
 
Q
G
 
G
I
 
I
F
 
M
S
 
Y
S
 
N
S
 
H
G
 
G
E
 
Q
A
 
N
C
|
C
I
 
S
A
 
A
G
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
V
F
 
F
V
 
V
Q
 
H
R
 
R
S
 
K
V
 
H
Y
 
Y
D
 
E
A
 
T
F
 
V
M
 
V
K
 
D
R
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
K
G
 
M
A
 
A
R
 
N
K
 
N
L
 
V
R
 
K
V
 
L
G
 
G
D
 
A
P
 
G
S
 
M
R
 
E
V
 
K
E
 
E
T
 
T
Q
 
E
M
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
L
I
 
V
T
 
S
Q
 
K
A
 
K
H
x
Q
R
 
Q
E
 
E
T
x
R
V
 
V
E
 
L
R
 
N
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
L
 
Q
G
 
G
L
 
K
E
 
K
E
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
T
L
 
V
L
 
A
C
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
P
 
A
V
 
L
G
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
K
G
 
G
T
 
Y
Y
 
F
F
 
V
Q
 
K
P
 
P
T
 
T
I
 
V
L
 
F
E
 
T
G
 
D
L
 
V
S
 
T
N
 
D
N
 
D
A
 
M
R
 
T
I
 
I
C
 
V
Q
 
K
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
V
V
 
V
A
 
V
M
 
L
P
 
P
F
 
F
D
 
D
D
 
S
E
 
T
A
 
E
S
 
E
L
 
V
L
 
I
K
 
E
E
 
R
A
 
A
N
 
N
N
 
N
S
 
S
V
 
S
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
W
 
W
T
 
T
R
 
Q
D
 
N
Y
 
I
K
 
K
R
 
T
A
 
G
Y
 
H
R
 
Q
T
 
V
A
 
A
R
 
N
A
 
K
L
 
L
E
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
T
I
 
V
W
 
W
I
 
I
N
 
N
T
 
D
Y
 
Y
K
 
N
L
 
L
F
 
E
S
 
N
I
 
A
S
 
A
T
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
G
G
 
G
W
 
Y
K
 
K
E
 
Q
S
 
S
G
 
G
M
 
I
G
 
G
R
 
R
E
|
E
K
 
L
G
 
G
R
 
S
L
 
Y
G
 
A
I
 
L
R
 
D
E
 
N
Y
 
Y
M
 
T
Q
 
E
Q
 
V
K
 
K
S
 
S
L
 
V
Y
 
W

7radA Crystal structure analysis of aldh1b1
41% identity, 95% coverage: 12:486/499 of query aligns to 10:484/493 of 7radA

query
sites
7radA
V
 
I
P
 
P
T
 
Y
G
 
N
D
 
Q
I
 
L
F
 
F
I
 
I
G
 
N
G
 
N
E
 
E
W
 
W
R
 
Q
Q
 
D
G
 
A
-
 
V
R
 
S
G
 
K
N
 
K
P
 
T
Y
 
F
K
 
P
S
 
T
L
 
V
Y
 
N
P
 
P
A
 
T
D
 
T
Q
 
G
S
 
E
V
 
V
N
 
I
M
 
G
E
 
H
I
 
V
S
 
A
T
 
E
A
 
G
N
 
D
A
 
R
D
 
A
D
 
D
A
 
V
R
 
D
E
 
R
A
 
A
V
 
V
E
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
R
I
 
E
A
 
A
W
 
F
R
 
R
-
 
L
K
 
G
S
 
S
D
 
P
W
 
W
S
 
R
G
 
R
L
 
M
K
 
D
P
 
A
H
 
S
Q
 
E
R
 
R
A
 
G
L
 
R
I
 
L
L
 
L
Y
 
N
R
 
R
I
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
V
M
 
E
A
 
R
R
 
D
H
 
R
E
 
V
A
 
Y
L
 
L
A
 
A
Q
 
S
L
 
L
Q
 
E
R
 
T
R
 
L
D
 
D
N
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
P
I
 
F
G
 
Q
E
 
E
T
 
S
R
 
Y
V
 
A
L
|
L
-
 
D
V
 
L
A
 
D
S
x
E
A
 
V
A
 
I
N
 
K
T
 
V
F
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
F
 
F
A
 
A
A
 
G
C
 
W
L
 
A
E
 
D
T
 
K
L
 
W
D
 
H
E
 
G
E
 
K
V
 
T
T
 
I
P
 
P
S
 
M
R
 
D
G
 
G
D
 
Q
Y
 
H
L
 
F
T
 
C
M
 
F
S
 
T
V
 
R
Y
 
H
E
 
E
P
 
P
I
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
C
A
 
G
A
 
Q
I
|
I
T
x
I
P
|
P
W
|
W
N
|
N
S
x
F
P
 
P
I
 
L
A
 
V
S
x
M
D
 
Q
A
 
G
Q
 
W
K
 
K
L
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
T
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
V
 
V
L
 
M
K
|
K
P
 
V
A
 
A
E
|
E
V
 
Q
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
S
S
 
A
L
 
L
A
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
S
I
 
L
C
 
I
E
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
F
P
 
P
K
 
P
G
 
G
V
 
V
I
 
V
S
 
N
V
 
I
L
 
I
P
 
T
G
 
G
K
 
Y
G
|
G
S
 
P
V
 
T
I
 
A
G
|
G
D
x
A
V
 
A
L
 
I
V
 
A
R
 
Q
H
 
H
P
 
M
L
 
D
V
 
V
K
 
D
K
 
K
V
 
V
S
 
A
F
 
F
T
|
T
G
|
G
G
x
S
T
 
T
E
 
E
V
|
V
G
 
G
R
 
H
G
 
L
I
 
I
A
 
Q
R
 
K
I
 
A
A
 
A
A
 
G
D
 
D
-
 
S
K
 
N
L
 
L
M
 
K
P
 
R
V
 
V
S
 
T
L
 
L
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
T
 
S
V
 
I
V
 
V
F
 
L
D
 
A
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
M
D
 
E
H
 
H
A
 
A
V
 
V
N
 
E
G
 
Q
V
 
C
L
 
H
Y
x
E
G
 
A
I
 
L
F
 
F
S
x
F
S
 
N
S
 
M
G
 
G
E
 
Q
A
 
C
C
|
C
I
 
C
A
 
A
G
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
T
F
 
F
V
 
V
Q
 
E
R
 
E
S
 
S
V
 
I
Y
 
Y
D
 
N
A
 
E
F
 
F
M
 
L
K
 
E
R
 
R
L
 
T
V
 
V
E
 
E
G
 
K
A
 
A
R
 
K
K
 
Q
L
 
R
R
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
N
P
 
P
S
 
F
R
 
E
V
 
L
E
 
D
T
 
T
Q
 
Q
M
 
Q
G
 
G
P
 
P
L
 
Q
I
 
V
T
 
D
Q
 
K
A
 
E
H
 
Q
R
 
F
E
 
E
T
 
R
V
 
V
E
 
L
R
 
G
Y
 
Y
V
 
I
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
Q
E
 
K
E
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
K
L
 
L
L
 
L
C
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
P
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
F
R
 
G
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
T
 
F
Y
 
F
F
 
I
Q
 
K
P
 
P
T
 
T
I
 
V
L
 
F
E
 
G
G
 
G
L
 
V
S
 
Q
N
 
D
N
 
D
A
 
M
R
 
R
I
 
I
C
 
A
Q
 
K
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
Q
V
 
P
A
 
L
M
 
F
P
 
K
F
 
F
D
 
K
D
 
K
E
 
I
A
 
E
S
 
E
L
 
V
L
 
V
K
 
E
E
 
R
A
 
A
N
 
N
N
 
N
S
 
T
V
 
R
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
V
W
 
F
T
 
T
R
 
R
D
 
D
Y
 
L
K
 
D
R
 
K
A
 
A
Y
 
M
R
 
Y
T
 
F
A
 
T
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
T
 
T
I
 
V
W
 
W
I
 
V
N
 
N
T
 
T
Y
 
Y
K
x
N
L
 
I
F
x
V
S
 
T
I
 
C
S
 
H
T
 
T
P
 
P
F
 
F
S
 
G
G
 
G
W
 
F
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
M
 
N
G
 
G
R
 
R
E
 
E
K
 
L
G
 
G
R
 
E
L
 
D
G
 
G
I
 
L
R
 
K
E
 
A
Y
 
Y
M
 
T
Q
 
E
Q
 
V
K
 
K
S
 
T
L
 
V

7mjdA Crystal structure analysis of aldh1b1
41% identity, 95% coverage: 12:486/499 of query aligns to 10:484/493 of 7mjdA

query
sites
7mjdA
V
 
I
P
 
P
T
 
Y
G
 
N
D
 
Q
I
 
L
F
 
F
I
 
I
G
 
N
G
 
N
E
 
E
W
 
W
R
 
Q
Q
 
D
G
 
A
-
 
V
R
 
S
G
 
K
N
 
K
P
 
T
Y
 
F
K
 
P
S
 
T
L
 
V
Y
 
N
P
 
P
A
 
T
D
 
T
Q
 
G
S
 
E
V
 
V
N
 
I
M
 
G
E
 
H
I
 
V
S
 
A
T
 
E
A
 
G
N
 
D
A
 
R
D
 
A
D
 
D
A
 
V
R
 
D
E
 
R
A
 
A
V
 
V
E
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
R
I
 
E
A
 
A
W
 
F
R
 
R
-
 
L
K
 
G
S
 
S
D
 
P
W
 
W
S
 
R
G
 
R
L
 
M
K
 
D
P
 
A
H
 
S
Q
 
E
R
 
R
A
 
G
L
 
R
I
 
L
L
 
L
Y
 
N
R
 
R
I
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
V
M
 
E
A
 
R
R
 
D
H
 
R
E
 
V
A
 
Y
L
 
L
A
 
A
Q
 
S
L
 
L
Q
 
E
R
 
T
R
 
L
D
 
D
N
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
P
I
 
F
G
 
Q
E
 
E
T
 
S
R
 
Y
V
 
A
L
 
L
-
 
D
V
 
L
A
 
D
S
x
E
A
 
V
A
 
I
N
 
K
T
 
V
F
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
F
 
F
A
 
A
A
 
G
C
 
W
L
 
A
E
 
D
T
 
K
L
 
W
D
 
H
E
 
G
E
 
K
V
 
T
T
 
I
P
 
P
S
 
M
R
 
D
G
 
G
D
 
Q
Y
 
H
L
 
F
T
 
C
M
 
F
S
 
T
V
 
R
Y
 
H
E
 
E
P
 
P
I
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
C
A
 
G
A
 
Q
I
|
I
T
x
I
P
|
P
W
|
W
N
|
N
S
 
F
P
 
P
I
 
L
A
 
V
S
x
M
D
 
Q
A
 
G
Q
 
W
K
 
K
L
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
T
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
V
 
V
L
 
M
K
|
K
P
 
V
A
 
A
E
|
E
V
 
Q
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
S
S
 
A
L
 
L
A
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
S
I
 
L
C
 
I
E
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
F
P
 
P
K
 
P
G
 
G
V
 
V
I
 
V
S
 
N
V
 
I
L
 
I
P
 
T
G
 
G
K
 
Y
G
|
G
S
 
P
V
 
T
I
 
A
G
|
G
D
 
A
V
 
A
L
 
I
V
 
A
R
 
Q
H
 
H
P
 
M
L
 
D
V
 
V
K
 
D
K
 
K
V
 
V
S
 
A
F
|
F
T
|
T
G
|
G
G
x
S
T
 
T
E
 
E
V
|
V
G
 
G
R
 
H
G
 
L
I
 
I
A
 
Q
R
 
K
I
 
A
A
 
A
A
 
G
D
 
D
-
 
S
K
 
N
L
 
L
M
 
K
P
 
R
V
 
V
S
 
T
L
 
L
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
T
 
S
V
 
I
V
 
V
F
 
L
D
 
A
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
M
D
 
E
H
 
H
A
 
A
V
 
V
N
 
E
G
 
Q
V
 
C
L
 
H
Y
x
E
G
 
A
I
 
L
F
 
F
S
x
F
S
 
N
S
 
M
G
 
G
E
 
Q
A
 
C
C
|
C
I
 
C
A
 
A
G
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
T
F
 
F
V
 
V
Q
 
E
R
 
E
S
 
S
V
 
I
Y
 
Y
D
 
N
A
 
E
F
 
F
M
 
L
K
 
E
R
 
R
L
 
T
V
 
V
E
 
E
G
 
K
A
 
A
R
 
K
K
 
Q
L
 
R
R
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
N
P
 
P
S
 
F
R
 
E
V
 
L
E
 
D
T
 
T
Q
 
Q
M
 
Q
G
 
G
P
 
P
L
 
Q
I
 
V
T
 
D
Q
 
K
A
 
E
H
 
Q
R
 
F
E
 
E
T
 
R
V
 
V
E
 
L
R
 
G
Y
 
Y
V
 
I
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
Q
E
 
K
E
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
K
L
 
L
L
 
L
C
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
P
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
F
R
 
G
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
T
 
F
Y
 
F
F
 
I
Q
 
K
P
 
P
T
 
T
I
 
V
L
 
F
E
 
G
G
 
G
L
 
V
S
 
Q
N
 
D
N
 
D
A
 
M
R
 
R
I
 
I
C
 
A
Q
 
K
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
Q
V
 
P
A
 
L
M
 
F
P
 
K
F
 
F
D
 
K
D
 
K
E
 
I
A
 
E
S
 
E
L
 
V
L
 
V
K
 
E
E
 
R
A
 
A
N
 
N
N
 
N
S
 
T
V
 
R
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
V
W
 
F
T
 
T
R
 
R
D
 
D
Y
 
L
K
 
D
R
 
K
A
 
A
Y
 
M
R
 
Y
T
 
F
A
 
T
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
T
 
T
I
 
V
W
 
W
I
 
V
N
 
N
T
 
T
Y
 
Y
K
x
N
L
 
I
F
x
V
S
 
T
I
 
C
S
 
H
T
 
T
P
 
P
F
 
F
S
 
G
G
 
G
W
 
F
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
M
 
N
G
 
G
R
 
R
E
 
E
K
 
L
G
 
G
R
 
E
L
 
D
G
 
G
I
 
L
R
 
K
E
 
A
Y
 
Y
M
 
T
Q
 
E
Q
 
V
K
 
K
S
 
T
L
 
V

7mjcA Crystal structure analysis of aldh1b1
41% identity, 95% coverage: 12:486/499 of query aligns to 10:484/493 of 7mjcA

query
sites
7mjcA
V
 
I
P
 
P
T
 
Y
G
 
N
D
 
Q
I
 
L
F
 
F
I
 
I
G
 
N
G
 
N
E
 
E
W
 
W
R
 
Q
Q
 
D
G
 
A
-
 
V
R
 
S
G
 
K
N
 
K
P
 
T
Y
 
F
K
 
P
S
 
T
L
 
V
Y
 
N
P
 
P
A
 
T
D
 
T
Q
 
G
S
 
E
V
 
V
N
 
I
M
 
G
E
 
H
I
 
V
S
 
A
T
 
E
A
 
G
N
 
D
A
 
R
D
 
A
D
 
D
A
 
V
R
 
D
E
 
R
A
 
A
V
 
V
E
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
R
I
 
E
A
 
A
W
 
F
R
 
R
-
 
L
K
 
G
S
 
S
D
 
P
W
 
W
S
 
R
G
 
R
L
 
M
K
 
D
P
 
A
H
 
S
Q
 
E
R
 
R
A
 
G
L
 
R
I
 
L
L
 
L
Y
 
N
R
 
R
I
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
V
M
 
E
A
 
R
R
 
D
H
 
R
E
 
V
A
 
Y
L
 
L
A
 
A
Q
 
S
L
 
L
Q
 
E
R
 
T
R
 
L
D
 
D
N
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
P
I
 
F
G
 
Q
E
 
E
T
 
S
R
 
Y
V
 
A
L
 
L
-
 
D
V
 
L
A
 
D
S
 
E
A
 
V
A
 
I
N
 
K
T
 
V
F
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
F
 
F
A
 
A
A
 
G
C
 
W
L
 
A
E
 
D
T
 
K
L
 
W
D
 
H
E
 
G
E
 
K
V
 
T
T
 
I
P
 
P
S
 
M
R
 
D
G
 
G
D
 
Q
Y
 
H
L
 
F
T
 
C
M
 
F
S
 
T
V
 
R
Y
 
H
E
 
E
P
 
P
I
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
C
A
 
G
A
 
Q
I
|
I
T
x
I
P
|
P
W
|
W
N
|
N
S
 
F
P
 
P
I
 
L
A
 
V
S
 
M
D
 
Q
A
 
G
Q
 
W
K
 
K
L
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
T
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
V
 
V
L
 
M
K
|
K
P
 
V
A
 
A
E
|
E
V
 
Q
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
S
S
 
A
L
 
L
A
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
S
I
 
L
C
 
I
E
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
F
P
 
P
K
 
P
G
 
G
V
 
V
I
 
V
S
 
N
V
 
I
L
 
I
P
 
T
G
 
G
K
 
Y
G
|
G
S
 
P
V
 
T
I
 
A
G
|
G
D
 
A
V
 
A
L
 
I
V
 
A
R
 
Q
H
 
H
P
 
M
L
 
D
V
 
V
K
 
D
K
 
K
V
 
V
S
 
A
F
 
F
T
|
T
G
|
G
G
x
S
T
 
T
E
 
E
V
|
V
G
 
G
R
 
H
G
 
L
I
 
I
A
 
Q
R
 
K
I
 
A
A
 
A
A
 
G
D
 
D
-
 
S
K
 
N
L
 
L
M
 
K
P
 
R
V
 
V
S
 
T
L
 
L
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
T
 
S
V
 
I
V
 
V
F
 
L
D
 
A
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
M
D
 
E
H
 
H
A
 
A
V
 
V
N
 
E
G
 
Q
V
 
C
L
 
H
Y
 
E
G
 
A
I
 
L
F
 
F
S
 
F
S
 
N
S
 
M
G
 
G
E
 
Q
A
 
C
C
|
C
I
 
C
A
 
A
G
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
T
F
 
F
V
 
V
Q
 
E
R
 
E
S
 
S
V
 
I
Y
 
Y
D
 
N
A
 
E
F
 
F
M
 
L
K
 
E
R
 
R
L
 
T
V
 
V
E
 
E
G
 
K
A
 
A
R
 
K
K
 
Q
L
 
R
R
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
N
P
 
P
S
 
F
R
 
E
V
 
L
E
 
D
T
 
T
Q
 
Q
M
 
Q
G
 
G
P
 
P
L
 
Q
I
 
V
T
 
D
Q
 
K
A
 
E
H
 
Q
R
 
F
E
 
E
T
 
R
V
 
V
E
 
L
R
 
G
Y
 
Y
V
 
I
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
Q
E
 
K
E
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
K
L
 
L
L
 
L
C
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
P
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
F
R
 
G
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
T
 
F
Y
 
F
F
 
I
Q
 
K
P
 
P
T
 
T
I
 
V
L
 
F
E
 
G
G
 
G
L
 
V
S
 
Q
N
 
D
N
 
D
A
 
M
R
 
R
I
 
I
C
 
A
Q
 
K
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
Q
V
 
P
A
 
L
M
 
F
P
 
K
F
 
F
D
 
K
D
 
K
E
 
I
A
 
E
S
 
E
L
 
V
L
 
V
K
 
E
E
 
R
A
 
A
N
 
N
N
 
N
S
 
T
V
 
R
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
V
W
 
F
T
 
T
R
 
R
D
 
D
Y
 
L
K
 
D
R
 
K
A
 
A
Y
 
M
R
 
Y
T
 
F
A
 
T
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
T
 
T
I
 
V
W
 
W
I
 
V
N
 
N
T
 
T
Y
 
Y
K
 
N
L
 
I
F
 
V
S
 
T
I
 
C
S
 
H
T
 
T
P
 
P
F
 
F
S
 
G
G
 
G
W
 
F
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
M
 
N
G
 
G
R
 
R
E
 
E
K
 
L
G
 
G
R
 
E
L
 
D
G
 
G
I
 
L
R
 
K
E
 
A
Y
 
Y
M
 
T
Q
 
E
Q
 
V
K
 
K
S
 
T
L
 
V

4neaA 1.90 angstrom resolution crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from staphylococcus aureus in complex with NAD+ and bme-free cys289 (see paper)
38% identity, 96% coverage: 18:497/499 of query aligns to 21:502/505 of 4neaA

query
sites
4neaA
F
 
Y
I
 
I
G
 
D
G
 
G
E
 
E
W
 
W
-
 
V
R
 
E
Q
 
S
G
 
A
R
 
N
G
 
K
N
 
N
P
 
T
Y
 
R
K
 
D
S
 
I
L
 
I
Y
 
N
P
 
P
A
 
Y
D
 
N
Q
 
Q
S
 
E
V
 
V
N
 
I
M
 
F
E
 
T
I
 
V
S
 
S
T
 
E
A
 
G
N
 
T
A
 
K
D
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
E
E
 
R
A
 
A
V
 
I
E
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
R
I
 
R
A
 
A
W
 
F
R
 
E
K
 
S
S
 
G
D
 
E
W
 
W
S
 
S
G
 
Q
L
 
E
K
 
T
P
 
A
H
 
E
Q
 
T
R
 
R
A
 
G
L
 
K
I
 
K
L
 
V
Y
 
R
R
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
K
I
 
I
M
 
K
A
 
E
R
 
H
H
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
Q
 
E
R
 
T
R
 
L
D
 
D
N
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
T
I
 
L
G
 
E
E
 
E
T
 
S
R
 
Y
V
 
A
L
 
D
V
 
M
A
 
D
S
 
D
A
 
I
A
 
H
N
 
N
T
 
V
F
 
F
R
 
M
Y
 
Y
F
 
F
A
 
A
A
 
G
C
 
L
L
 
A
E
 
D
T
 
K
L
 
D
D
 
G
E
 
G
E
 
E
V
 
M
T
 
I
P
 
D
S
 
S
R
 
P
-
 
I
G
 
P
D
 
D
Y
 
T
L
 
E
T
 
S
M
 
K
S
 
I
V
 
V
Y
 
K
E
 
E
P
 
P
I
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
V
A
 
T
A
 
Q
I
 
I
T
 
T
P
|
P
W
 
W
N
|
N
S
 
Y
P
 
P
I
 
L
A
 
L
S
 
Q
D
 
A
A
 
S
Q
 
W
K
 
K
L
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
T
G
 
G
N
 
C
A
 
S
V
 
L
V
 
V
L
 
M
K
|
K
P
 
P
A
 
S
E
|
E
V
 
I
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
T
S
 
T
L
 
I
A
 
R
L
 
V
A
 
F
R
 
E
I
 
L
C
 
M
E
 
E
E
 
E
A
 
V
G
 
G
V
 
F
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
T
I
 
I
S
 
N
V
 
L
L
 
I
P
 
L
G
 
G
K
 
A
G
|
G
S
 
S
V
 
E
I
 
V
G
|
G
D
 
D
V
 
V
L
 
M
V
 
S
R
 
G
H
 
H
P
 
K
L
 
E
V
 
V
K
 
D
K
 
L
V
 
V
S
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
G
|
G
T
 
I
E
 
E
V
x
T
G
 
G
R
 
K
G
x
H
I
|
I
A
 
M
R
 
K
I
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
N
K
 
N
L
 
V
M
 
T
P
 
N
V
 
I
S
 
A
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
N
P
 
P
T
 
N
V
 
I
V
 
I
F
 
F
D
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
F
D
 
E
H
 
L
A
 
A
V
 
V
N
 
D
G
 
Q
V
 
A
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
I
 
G
F
 
Y
S
 
F
S
 
H
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
V
C
|
C
I
 
S
A
 
A
G
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
I
F
 
L
V
 
V
Q
 
Q
R
 
N
S
 
S
V
 
I
Y
 
K
D
 
D
A
 
K
F
 
F
M
 
E
K
 
Q
R
 
A
L
 
L
V
 
I
E
 
D
G
 
R
A
 
V
R
 
K
K
 
K
L
 
I
R
 
K
V
 
L
G
 
G
D
 
N
P
 
G
S
 
F
R
 
D
V
 
A
E
 
D
T
 
T
Q
 
E
M
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
V
I
 
I
T
 
S
Q
 
T
A
 
E
H
 
H
R
 
R
E
 
N
T
 
K
V
 
I
E
 
E
R
 
S
Y
 
Y
V
 
M
A
 
D
L
 
V
G
 
A
L
 
K
E
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
T
L
 
I
L
 
A
C
 
V
G
 
G
G
 
G
E
 
K
R
 
R
P
 
P
V
 
D
G
 
R
D
 
D
G
 
D
R
 
L
E
 
K
Q
 
D
G
 
G
T
 
L
Y
 
F
F
 
F
Q
 
E
P
 
P
T
 
T
I
 
V
L
 
I
E
 
T
G
 
N
L
 
C
S
 
D
N
 
T
N
 
S
A
 
M
R
 
R
I
 
I
C
 
V
Q
 
Q
E
 
E
E
|
E
I
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
V
V
 
T
A
 
V
M
 
E
P
 
G
F
 
F
D
 
E
D
 
T
E
 
E
A
 
Q
S
 
E
L
 
A
L
 
I
K
 
Q
E
 
L
A
 
A
N
 
N
N
 
D
S
 
S
V
 
I
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
G
G
 
A
I
 
V
W
 
F
T
 
S
R
 
K
D
 
D
Y
 
I
K
 
G
R
 
K
A
 
A
Y
 
Q
R
 
R
T
 
V
A
 
A
R
 
N
A
 
K
L
 
L
E
 
K
A
 
L
G
 
G
T
 
T
I
 
V
W
 
W
I
 
I
N
 
N
T
 
D
Y
 
F
K
 
H
L
 
P
F
 
Y
S
 
F
I
 
A
S
 
Q
T
 
A
P
 
P
F
 
W
S
 
G
G
 
G
W
 
Y
K
 
K
E
 
Q
S
 
S
G
 
G
M
 
I
G
 
G
R
 
R
E
|
E
K
 
L
G
 
G
R
 
K
L
 
E
G
 
G
I
 
L
R
 
E
E
 
E
Y
 
Y
M
 
L
Q
 
V
Q
 
S
K
 
K
S
 
H
L
 
I
Y
 
L
W
 
T
G
 
N
L
 
T
N
 
N
D
 
P
A
 
Q
P
 
L
L
 
V
A
 
N
W
 
W

4o6rA Crystal structure of a putative aldehyde dehydrogenase from burkholderia cenocepacia
42% identity, 91% coverage: 34:487/499 of query aligns to 24:476/489 of 4o6rA

query
sites
4o6rA
L
 
L
Y
 
N
P
 
P
A
 
H
D
 
D
Q
 
G
S
 
S
V
 
V
N
 
I
M
 
T
E
 
K
I
 
I
S
 
A
T
 
A
A
 
A
N
 
T
A
 
A
D
 
A
D
 
D
A
 
V
R
 
D
E
 
L
A
 
A
V
 
V
E
 
D
A
 
A
A
 
A
D
 
T
I
 
R
A
 
A
W
 
F
R
 
P
K
 
A
S
 
-
D
 
-
W
 
W
S
 
S
G
 
A
L
 
M
K
 
P
P
 
A
H
 
A
Q
 
E
R
 
R
A
 
G
L
 
R
I
 
L
L
 
L
Y
 
L
R
 
R
I
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
A
I
 
I
M
 
E
A
 
A
R
 
N
H
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
E
R
 
S
R
 
L
D
 
D
N
 
T
G
 
G
K
 
H
P
 
P
I
 
I
G
 
R
E
 
D
T
 
S
R
 
R
V
 
A
L
 
L
-
 
D
V
 
V
A
 
P
S
 
R
A
 
T
A
 
A
N
 
A
T
 
C
F
 
F
R
 
R
Y
 
Y
F
 
F
A
 
G
A
 
G
C
 
M
L
 
A
E
 
D
T
 
K
L
 
L
D
 
Q
E
 
G
E
 
S
V
 
V
T
 
I
P
 
P
S
 
V
R
 
D
G
 
T
D
 
G
Y
 
F
L
 
L
T
 
N
M
 
Y
S
 
V
V
 
Q
Y
 
R
E
 
A
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
V
A
 
G
A
 
Q
I
|
I
T
x
V
P
 
P
W
 
W
N
|
N
S
 
F
P
 
P
I
 
L
A
 
M
S
 
F
D
 
T
A
 
S
Q
 
W
K
 
K
L
 
M
A
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
V
 
V
L
 
L
K
|
K
P
 
P
A
 
S
E
 
E
V
 
I
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
S
S
 
T
L
 
L
A
 
R
L
 
I
A
 
V
R
 
E
I
 
L
C
 
M
E
 
A
E
 
E
A
 
V
G
 
G
V
 
F
P
 
P
K
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
V
S
 
N
V
 
I
L
 
V
P
 
P
G
 
G
K
 
Y
G
|
G
S
 
H
V
 
T
I
 
A
G
|
G
D
x
Q
V
 
R
L
 
L
V
 
A
R
 
E
H
 
H
P
 
P
L
 
G
V
 
V
K
 
G
K
 
K
V
 
I
S
 
A
F
|
F
T
 
T
G
|
G
G
x
S
T
 
T
E
 
A
V
x
T
G
 
G
R
 
R
G
x
R
I
 
I
A
 
V
R
 
E
I
 
A
A
 
S
A
 
Q
D
 
G
K
 
N
L
 
L
M
 
K
P
 
R
V
 
V
S
 
Q
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
G
P
 
A
T
 
N
V
 
I
V
 
V
F
 
F
D
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
N
L
 
L
D
 
D
H
 
A
A
 
A
V
 
I
N
 
N
G
 
G
V
 
A
L
 
A
Y
 
W
G
 
A
I
 
I
F
 
F
S
 
H
S
 
N
S
 
Q
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
C
|
C
I
 
I
A
 
A
G
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
L
F
 
V
V
 
L
Q
 
H
R
 
E
S
 
R
V
 
I
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
F
 
F
M
 
L
K
 
E
R
 
R
L
 
F
V
 
V
E
 
A
G
 
L
A
 
A
R
 
S
K
 
S
L
 
I
R
 
R
V
 
I
G
 
G
D
 
N
P
 
P
S
 
L
R
 
D
V
 
P
E
 
N
T
 
T
Q
 
E
M
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
L
I
 
T
T
 
S
Q
 
K
A
 
Q
H
 
H
R
 
L
E
 
D
T
 
R
V
 
V
E
 
L
R
 
S
Y
 
Y
V
 
V
A
 
D
L
 
V
G
 
A
L
 
R
E
 
E
E
 
Q
G
 
G
G
 
G
R
 
R
L
 
V
L
 
L
C
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
S
R
 
A
P
 
P
V
 
Q
G
 
D
D
 
P
G
 
A
R
 
L
E
 
A
Q
 
N
G
 
G
T
 
Y
Y
 
Y
F
 
V
Q
 
R
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
V
E
 
E
G
 
A
L
 
K
S
 
H
N
 
A
N
 
T
A
 
D
R
 
R
I
 
V
C
 
A
Q
 
Q
E
 
E
E
|
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
F
L
 
V
V
 
T
A
 
V
M
 
L
P
 
R
F
 
F
D
 
G
D
 
S
E
 
D
A
 
D
S
 
E
L
 
A
L
 
L
K
 
A
E
 
I
A
 
A
N
 
N
N
 
A
S
 
T
V
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
G
A
 
S
G
 
G
I
 
L
W
 
W
T
 
T
R
 
N
D
 
D
Y
 
L
K
 
S
R
 
R
A
 
A
Y
 
H
R
 
R
T
 
M
A
 
A
R
 
A
A
 
R
L
 
I
E
 
D
A
 
A
G
 
G
T
 
M
I
 
C
W
 
W
I
 
I
N
 
N
T
 
C
Y
 
Y
K
 
K
L
 
R
F
 
V
S
 
N
I
 
P
S
 
G
T
 
S
P
 
P
F
 
F
S
 
G
G
 
G
W
 
V
K
 
G
E
 
K
S
 
S
G
 
G
M
 
Y
G
 
G
R
 
R
E
|
E
K
 
M
G
 
G
R
 
F
L
 
E
G
 
A
I
 
M
R
 
H
E
 
D
Y
 
Y
M
 
T
Q
 
E
Q
 
A
K
 
R
S
 
S
L
 
V
Y
 
W

Q9HTJ1 NAD/NADP-dependent betaine aldehyde dehydrogenase; BADH; EC 1.2.1.8 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see 2 papers)
40% identity, 95% coverage: 17:492/499 of query aligns to 9:485/490 of Q9HTJ1

query
sites
Q9HTJ1
I
 
L
F
 
Y
I
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
R
W
 
Y
R
 
V
Q
 
E
G
 
A
R
 
S
-
 
S
G
 
G
N
 
A
P
 
T
Y
 
F
K
 
E
S
 
T
L
 
I
Y
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
N
Q
 
G
S
 
E
V
 
V
N
 
L
M
 
A
E
 
K
I
 
V
S
 
Q
T
 
R
A
 
A
N
 
S
A
 
R
D
 
E
D
 
D
A
 
V
R
 
E
E
 
R
A
 
A
V
 
V
E
 
Q
A
 
S
A
 
A
D
 
-
I
 
V
A
 
E
W
 
G
R
 
Q
K
 
K
S
 
V
D
 
-
W
 
W
S
 
A
G
 
A
L
 
M
K
 
T
P
 
A
H
 
M
Q
 
Q
R
 
R
A
 
S
L
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
R
R
 
R
I
 
A
A
 
V
D
 
D
L
 
I
I
 
L
M
 
R
A
 
E
R
 
R
H
 
N
E
 
D
A
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
L
 
L
Q
 
E
R
 
T
R
 
L
D
 
D
N
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
I
 
L
G
 
A
E
 
E
T
 
T
R
 
R
-
 
S
V
 
V
L
 
D
V
 
I
A
 
V
S
 
T
A
 
G
A
 
A
N
 
D
T
 
V
F
 
L
R
 
E
Y
 
Y
F
 
Y
A
 
A
A
 
G
C
 
L
L
 
V
E
 
P
T
 
A
L
 
I
D
 
E
E
 
G
E
 
E
V
 
Q
T
 
I
P
 
P
S
 
L
R
 
R
G
 
E
D
 
T
Y
 
S
L
 
F
T
 
V
M
 
Y
S
 
T
V
 
R
Y
 
R
E
 
E
P
 
P
I
 
L
G
 
G
V
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
G
I
 
I
T
x
G
P
x
A
W
|
W
N
|
N
S
 
Y
P
 
P
I
 
V
A
 
Q
S
 
I
D
 
A
A
 
L
Q
 
W
K
|
K
L
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
M
V
 
I
L
 
F
K
|
K
P
|
P
A
x
S
E
|
E
V
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
T
S
 
A
L
 
L
A
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
E
I
 
I
C
 
Y
E
 
T
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
K
 
D
G
 
G
V
 
V
I
 
F
S
 
N
V
 
V
L
 
L
P
 
T
G
 
G
K
 
S
G
|
G
S
 
R
V
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
Q
V
 
W
L
 
L
V
 
T
R
 
E
H
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
I
K
 
E
K
 
K
V
 
I
S
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
T
|
T
E
x
S
V
x
T
G
 
G
R
 
K
G
 
K
I
 
V
-
 
M
A
 
A
R
 
S
I
 
A
A
 
S
A
 
S
D
 
S
K
 
S
L
 
L
M
 
K
P
 
E
V
 
V
S
 
T
L
 
M
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
T
 
L
V
 
I
V
 
I
F
 
F
D
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
D
H
 
R
A
 
A
V
 
A
N
 
D
G
 
I
V
 
A
L
 
V
Y
 
M
G
 
A
I
 
N
F
 
F
S
 
F
S
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
Q
A
 
V
C
|
C
I
 
T
A
 
N
G
 
G
S
 
T
R
 
R
L
 
V
F
 
F
V
 
I
Q
 
H
R
 
R
S
 
S
V
 
Q
Y
 
Q
D
 
A
A
 
R
F
 
F
M
 
E
K
 
A
R
 
K
L
 
V
V
 
L
E
 
E
G
 
R
A
 
V
R
 
Q
K
 
R
L
 
I
R
 
R
V
 
L
G
 
G
D
 
D
P
 
P
S
 
Q
R
 
D
V
 
E
E
 
N
T
 
T
Q
 
N
M
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
L
I
 
V
T
 
S
Q
 
F
A
 
P
H
 
H
R
 
M
E
 
E
T
 
S
V
 
V
E
 
L
R
 
G
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
L
 
S
G
 
G
L
 
K
E
 
A
E
 
Q
G
 
K
G
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
L
C
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
P
 
V
V
 
T
G
 
D
D
 
G
G
 
A
R
 
F
E
 
G
Q
 
K
G
 
G
T
 
A
Y
 
Y
F
 
V
Q
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
L
 
F
E
 
T
G
 
D
L
 
C
S
 
R
N
 
D
N
 
D
A
 
M
R
 
T
I
 
I
C
 
V
Q
 
R
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
M
V
 
S
A
 
I
M
 
L
P
 
V
F
 
Y
D
 
D
D
 
D
E
 
E
A
 
D
S
 
E
L
 
A
L
 
I
K
 
R
E
 
R
A
 
A
N
 
N
N
 
D
S
 
T
V
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
W
 
V
T
 
T
R
 
Q
D
 
D
Y
 
L
K
 
A
R
 
R
A
 
A
Y
 
H
R
 
R
T
 
A
A
 
I
R
 
H
A
 
R
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
I
 
C
W
 
W
I
 
I
N
 
N
T
 
T
Y
 
W
K
 
G
L
 
E
F
 
S
S
 
P
I
 
A
S
 
E
T
 
M
P
 
P
F
 
V
S
 
G
G
 
G
W
 
Y
K
 
K
E
 
Q
S
 
S
G
 
G
M
 
V
G
 
G
R
 
R
E
|
E
K
 
N
G
 
G
R
 
L
L
 
T
G
 
T
I
 
L
R
 
A
E
 
H
Y
 
Y
M
 
T
Q
 
R
Q
 
I
K
 
K
S
 
S
L
 
V
Y
 
Q
W
 
V
G
 
E
L
 
L
N
 
G
D
 
D

4cazA Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa in complex with nadh
40% identity, 95% coverage: 17:492/499 of query aligns to 8:484/489 of 4cazA

query
sites
4cazA
I
 
L
F
 
Y
I
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
R
W
 
Y
R
 
V
Q
 
E
G
 
A
R
 
S
-
 
S
G
 
G
N
 
A
P
 
T
Y
 
F
K
 
E
S
 
T
L
 
I
Y
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
N
Q
 
G
S
 
E
V
 
V
N
 
L
M
 
A
E
 
K
I
 
V
S
 
Q
T
 
R
A
 
A
N
 
S
A
 
R
D
 
E
D
 
D
A
 
V
R
 
E
E
 
R
A
 
A
V
 
V
E
 
Q
A
 
S
A
 
A
D
 
-
I
 
V
A
 
E
W
 
G
R
 
Q
K
 
K
S
 
V
D
 
-
W
 
W
S
 
A
G
 
A
L
 
M
K
 
T
P
 
A
H
 
M
Q
 
Q
R
 
R
A
 
S
L
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
R
R
 
R
I
 
A
A
 
V
D
 
D
L
 
I
I
 
L
M
 
R
A
 
E
R
 
R
H
 
N
E
 
D
A
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
L
 
L
Q
 
E
R
 
T
R
 
L
D
 
D
N
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
I
 
L
G
 
A
E
 
E
T
 
T
R
 
R
-
 
S
V
 
V
L
 
D
V
 
I
A
 
V
S
 
T
A
 
G
A
 
A
N
 
D
T
 
V
F
 
L
R
 
E
Y
 
Y
F
 
Y
A
 
A
A
 
G
C
 
L
L
 
V
E
 
P
T
 
A
L
 
I
D
 
E
E
 
G
E
 
E
V
 
Q
T
 
I
P
 
P
S
 
L
R
 
R
G
 
E
D
 
T
Y
 
S
L
 
F
T
 
V
M
 
Y
S
 
T
V
 
R
Y
 
R
E
 
E
P
 
P
I
 
L
G
 
G
V
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
G
I
|
I
T
x
G
P
 
A
W
|
W
N
|
N
S
 
Y
P
 
P
I
 
V
A
 
Q
S
 
I
D
 
A
A
 
L
Q
 
W
K
 
K
L
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
M
V
 
I
L
 
F
K
|
K
P
 
P
A
 
S
E
|
E
V
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
T
S
 
A
L
 
L
A
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
E
I
 
I
C
 
Y
E
 
T
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
K
 
D
G
 
G
V
 
V
I
 
F
S
 
N
V
 
V
L
 
L
P
 
T
G
 
G
K
 
S
G
|
G
S
 
R
V
 
E
I
 
V
G
|
G
D
 
Q
V
 
W
L
 
L
V
 
T
R
 
E
H
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
I
K
 
E
K
 
K
V
 
I
S
 
S
F
|
F
T
|
T
G
|
G
G
|
G
T
 
T
E
 
S
V
x
T
G
 
G
R
 
K
G
 
K
I
x
V
-
 
M
A
 
A
R
 
S
I
 
A
A
 
S
A
 
S
D
 
S
K
 
S
L
 
L
M
 
K
P
 
E
V
 
V
S
 
T
L
 
M
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
T
 
L
V
 
I
V
 
I
F
 
F
D
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
D
H
 
R
A
 
A
V
 
A
N
 
D
G
 
I
V
 
A
L
 
V
Y
 
M
G
 
A
I
 
N
F
 
F
S
 
F
S
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
Q
A
 
V
C
|
C
I
 
T
A
 
N
G
 
G
S
 
T
R
 
R
L
 
V
F
 
F
V
 
I
Q
 
H
R
 
R
S
 
S
V
 
Q
Y
 
Q
D
 
A
A
 
R
F
 
F
M
 
E
K
 
A
R
 
K
L
 
V
V
 
L
E
 
E
G
 
R
A
 
V
R
 
Q
K
 
R
L
 
I
R
 
R
V
 
L
G
 
G
D
 
D
P
 
P
S
 
Q
R
 
D
V
 
E
E
 
N
T
 
T
Q
 
N
M
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
L
I
 
V
T
 
S
Q
 
F
A
 
P
H
 
H
R
 
M
E
 
E
T
 
S
V
 
V
E
 
L
R
 
G
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
L
 
S
G
 
G
L
 
K
E
 
A
E
 
Q
G
 
K
G
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
L
C
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
P
 
V
V
 
T
G
 
D
D
 
G
G
 
A
R
 
F
E
 
G
Q
 
K
G
 
G
T
 
A
Y
 
Y
F
 
V
Q
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
L
 
F
E
 
T
G
 
D
L
 
C
S
 
R
N
 
D
N
 
D
A
 
M
R
 
T
I
 
I
C
 
V
Q
 
R
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
M
V
 
S
A
 
I
M
 
L
P
 
V
F
 
Y
D
 
D
D
 
D
E
 
E
A
 
D
S
 
E
L
 
A
L
 
I
K
 
R
E
 
R
A
 
A
N
 
N
N
 
D
S
 
T
V
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
W
 
V
T
 
T
R
 
Q
D
 
D
Y
 
L
K
 
A
R
 
R
A
 
A
Y
 
H
R
 
R
T
 
A
A
 
I
R
 
H
A
 
R
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
I
 
C
W
 
W
I
 
I
N
 
N
T
 
T
Y
 
W
K
 
G
L
 
E
F
 
S
S
 
P
I
 
A
S
 
E
T
 
M
P
 
P
F
 
V
S
 
G
G
 
G
W
 
Y
K
 
K
E
 
Q
S
 
S
G
 
G
M
 
V
G
 
G
R
 
R
E
|
E
K
 
N
G
 
G
R
 
L
L
 
T
G
 
T
I
 
L
R
 
A
E
 
H
Y
 
Y
M
 
T
Q
 
R
Q
 
I
K
 
K
S
 
S
L
 
V
Y
 
Q
W
 
V
G
 
E
L
 
L
N
 
G
D
 
D

2woxA Betaine aldehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa with NAD(p) h-catalytic thiol adduct. (see paper)
40% identity, 95% coverage: 17:492/499 of query aligns to 8:484/489 of 2woxA

query
sites
2woxA
I
 
L
F
 
Y
I
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
R
W
 
Y
R
 
V
Q
 
E
G
 
A
R
 
S
-
 
S
G
 
G
N
 
A
P
 
T
Y
 
F
K
 
E
S
 
T
L
 
I
Y
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
N
Q
 
G
S
 
E
V
 
V
N
 
L
M
 
A
E
 
K
I
 
V
S
 
Q
T
 
R
A
 
A
N
 
S
A
 
R
D
 
E
D
 
D
A
 
V
R
 
E
E
 
R
A
 
A
V
 
V
E
 
Q
A
 
S
A
 
A
D
 
-
I
 
V
A
 
E
W
 
G
R
 
Q
K
 
K
S
 
V
D
 
-
W
 
W
S
 
A
G
 
A
L
 
M
K
 
T
P
 
A
H
 
M
Q
 
Q
R
 
R
A
 
S
L
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
R
R
 
R
I
 
A
A
 
V
D
 
D
L
 
I
I
 
L
M
 
R
A
 
E
R
 
R
H
 
N
E
 
D
A
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
L
 
L
Q
 
E
R
 
T
R
 
L
D
 
D
N
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P