SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_03822 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_03822 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5dteB Crystal structure of an abc transporter periplasmic solute binding protein (ipr025997) from actinobacillus succinogenes 130z(asuc_0081, target efi-511065) with bound d-allose
30% identity, 83% coverage: 34:299/320 of query aligns to 3:267/287 of 5dteB

query
sites
5dteB
P
 
P
K
 
Q
I
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
L
L
 
M
K
|
K
S
 
T
I
 
L
N
 
S
D
x
N
P
 
E
F
x
Y
T
 
F
V
 
I
A
 
S
M
 
M
A
 
R
N
 
Q
A
 
G
A
 
A
K
 
E
N
 
E
Y
 
T
Q
 
A
Q
 
K
H
 
Q
Y
 
-
A
 
-
S
 
K
Q
 
D
F
 
I
A
 
D
L
 
L
T
 
I
V
 
V
R
 
Q
G
 
V
T
 
A
A
 
E
T
 
K
E
 
E
A
 
D
D
 
S
T
 
T
A
 
E
G
 
Q
Q
 
L
I
 
V
R
 
G
I
 
L
V
 
V
D
 
E
D
 
N
L
 
M
I
 
I
K
 
A
A
 
K
K
 
K
M
 
V
N
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
I
I
 
V
A
 
T
P
 
P
S
 
N
G
 
D
S
 
S
K
 
I
P
 
A
L
 
F
T
 
I
A
 
P
V
 
A
V
 
F
A
 
Q
R
 
K
A
 
A
I
 
E
K
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
P
V
 
I
V
 
I
S
 
D
I
 
L
D
|
D
N
 
V
P
 
R
L
 
L
D
 
D
D
 
A
A
 
K
S
 
A
Q
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
G
I
 
L
S
 
K
V
 
F
P
 
N
F
 
Y
V
 
V
G
 
G
P
 
V
D
 
D
N
 
N
R
 
F
K
 
N
G
 
G
A
 
G
T
 
Y
L
 
L
V
 
E
A
 
A
N
 
K
Y
 
N
L
 
L
A
 
A
G
 
E
R
 
A
L
 
I
Q
 
G
A
 
K
G
 
K
D
 
G
Q
 
N
V
 
V
G
 
A
I
 
I
I
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
P
A
 
G
D
 
V
R
 
D
N
|
N
A
 
G
Q
 
E
E
 
Q
R
|
R
T
 
K
A
 
G
G
 
G
-
 
A
Y
 
L
R
 
K
D
 
A
V
 
F
M
 
A
S
 
E
T
 
Y
A
 
P
G
 
D
M
 
I
Q
 
K
V
 
I
V
 
V
A
 
A
T
 
S
Q
 
Q
A
 
S
A
 
A
D
 
N
W
|
W
E
 
E
Y
 
T
G
 
E
K
 
Q
G
 
A
R
 
L
D
 
N
V
 
V
A
 
T
S
 
T
K
 
N
M
 
I
L
 
L
G
 
T
Q
 
A
H
 
N
P
 
P
Q
 
N
I
 
I
R
 
N
G
 
G
L
 
I
L
 
F
C
 
A
A
 
A
N
 
N
D
 
D
N
 
N
M
 
M
A
 
A
M
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
V
D
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
E
D
 
N
A
 
A
G
 
G
R
 
L
T
 
A
G
 
G
G
 
K
V
 
V
Y
 
L
I
 
V
T
 
S
G
 
G
Y
 
Y
N
x
D
A
 
G
I
 
I
E
 
P
A
 
L
I
 
A
K
 
I
P
 
E
L
 
Y
I
 
V
A
 
K
D
 
Q
G
 
G
H
 
K
V
 
M
L
 
Q
A
 
N
T
 
T
V
 
I
N
 
D
Q
|
Q
F
 
L
A
 
P
D
 
K
R
 
K
Q
 
Q
A
 
V
V
 
A
F
 
I
G
 
A
M
 
I
D
 
E
V
 
H
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
Q
V
 
I
T
 
N
E
 
K
Q
 
Q
R
 
E

1rpjA Crystal structure of d-allose binding protein from escherichia coli (see paper)
34% identity, 76% coverage: 37:278/320 of query aligns to 5:247/288 of 1rpjA

query
sites
1rpjA
A
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
L
K
|
K
S
 
T
I
 
L
N
 
S
D
x
N
P
 
P
F
|
F
T
 
W
V
 
V
A
 
D
M
 
M
A
 
K
N
 
K
A
 
G
A
 
I
K
 
E
N
 
D
Y
 
E
Q
 
A
Q
 
K
H
 
T
Y
 
L
A
 
G
S
 
-
Q
 
-
F
 
V
A
 
S
L
 
V
T
 
D
V
 
I
R
 
F
G
 
A
T
 
S
A
 
P
T
 
S
E
|
E
A
 
G
D
 
D
T
 
F
A
 
Q
G
 
S
Q
 
Q
I
 
L
R
 
Q
I
 
L
V
 
F
D
 
E
D
 
D
L
 
L
I
 
S
K
 
N
A
 
K
K
 
N
M
 
Y
N
 
K
A
 
G
I
 
I
V
 
A
I
 
F
A
 
A
P
 
P
S
 
L
G
 
S
S
 
S
K
 
V
P
 
N
L
 
L
T
 
V
A
 
M
V
 
P
V
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
W
K
 
K
A
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
Y
V
 
L
V
 
V
S
 
N
I
 
L
D
|
D
N
 
E
P
 
K
L
 
I
D
 
D
-
 
M
D
 
D
A
 
N
S
 
L
Q
 
K
D
 
K
A
 
A
A
 
G
K
 
G
I
 
N
S
 
V
V
 
E
P
 
A
F
 
F
V
 
V
G
 
T
P
 
T
D
 
D
N
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
V
-
 
G
R
 
A
K
 
K
G
 
G
A
 
A
T
 
S
L
 
F
V
 
I
A
 
I
N
 
D
Y
 
K
L
 
L
A
 
G
G
 
A
R
 
E
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
G
D
 
G
Q
 
E
V
 
V
G
 
A
I
 
I
I
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
K
A
 
A
A
 
G
D
 
N
R
 
A
N
x
S
A
 
G
Q
 
E
E
 
A
R
|
R
T
 
R
A
 
N
G
 
G
Y
 
A
R
 
T
D
 
E
V
 
A
M
 
F
S
 
K
T
 
K
A
 
A
G
 
S
-
 
Q
M
 
I
Q
 
K
V
 
L
V
 
V
A
 
A
T
 
S
Q
 
Q
A
 
P
A
 
A
D
 
D
W
|
W
E
 
D
Y
 
R
G
 
I
K
 
K
G
 
A
R
 
L
D
 
D
V
 
V
A
 
A
S
 
T
K
 
N
M
 
V
L
 
L
G
 
Q
Q
 
R
H
 
N
P
 
P
Q
 
N
I
 
I
R
 
K
G
 
A
L
 
I
L
 
Y
C
 
C
A
 
A
N
|
N
D
 
D
N
 
T
M
 
M
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
V
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
R
 
A
D
 
N
A
 
A
G
 
G
R
 
K
T
 
T
G
 
G
G
 
K
V
 
V
Y
 
L
I
 
V
T
 
V
G
 
G
Y
 
T
N
x
D
A
 
G
I
 
I
E
 
P
A
 
E
I
 
A
K
 
R
P
 
K
L
 
M
I
 
V
A
 
E
D
 
A
G
 
G
H
 
Q
V
 
M
L
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
N
 
A
Q
|
Q

1gudA Hinge-bending motion of d-allose binding protein from escherichia coli: three open conformations (see paper)
34% identity, 76% coverage: 37:278/320 of query aligns to 5:247/288 of 1gudA

query
sites
1gudA
A
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
L
K
 
K
S
 
T
I
 
L
N
 
S
D
 
N
P
 
P
F
 
F
T
 
W
V
 
V
A
 
D
M
 
M
A
 
K
N
 
K
A
 
G
A
 
I
K
 
E
N
 
D
Y
 
E
Q
 
A
Q
 
K
H
 
T
Y
 
L
A
 
G
S
 
-
Q
 
-
F
 
V
A
 
S
L
 
V
T
x
D
V
 
I
R
 
F
G
 
A
T
 
S
A
 
P
T
 
S
E
 
E
A
 
G
D
 
D
T
 
F
A
 
Q
G
 
S
Q
 
Q
I
 
L
R
 
Q
I
 
L
V
 
F
D
 
E
D
 
D
L
 
L
I
 
S
K
 
N
A
 
K
K
 
N
M
 
Y
N
 
K
A
 
G
I
 
I
V
 
A
I
 
F
A
 
A
P
 
P
S
 
L
G
 
S
S
 
S
K
 
V
P
 
N
L
 
L
T
 
V
A
 
M
V
 
P
V
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
W
K
 
K
A
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
Y
V
 
L
V
 
V
S
 
N
I
 
L
D
 
D
N
 
E
P
 
K
L
 
I
D
 
D
-
 
M
D
 
D
A
 
N
S
 
L
Q
 
K
D
 
K
A
 
A
A
 
G
K
 
G
I
 
N
S
 
V
V
 
E
P
 
A
F
 
F
V
 
V
G
 
T
P
 
T
D
 
D
N
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
V
-
 
G
R
 
A
K
 
K
G
 
G
A
 
A
T
 
S
L
 
F
V
 
I
A
 
I
N
 
D
Y
 
K
L
 
L
A
 
G
G
 
A
R
 
E
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
G
D
 
G
Q
 
E
V
 
V
G
 
A
I
 
I
I
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
K
A
 
A
A
 
G
D
 
N
R
 
A
N
 
S
A
 
G
Q
 
E
E
 
A
R
 
R
T
 
R
A
 
N
G
 
G
Y
 
A
R
 
T
D
 
E
V
 
A
M
 
F
S
 
K
T
 
K
A
 
A
G
 
S
-
 
Q
M
 
I
Q
 
K
V
 
L
V
 
V
A
 
A
T
 
S
Q
 
Q
A
 
P
A
 
A
D
 
D
W
 
W
E
 
D
Y
 
R
G
 
I
K
 
K
G
 
A
R
 
L
D
 
D
V
 
V
A
 
A
S
 
T
K
 
N
M
 
V
L
 
L
G
 
Q
Q
 
R
H
 
N
P
 
P
Q
 
N
I
 
I
R
 
K
G
 
A
L
 
I
L
 
Y
C
 
C
A
 
A
N
 
N
D
 
D
N
 
T
M
 
M
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
V
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
R
 
A
D
 
N
A
 
A
G
 
G
R
 
K
T
 
T
G
 
G
G
 
K
V
 
V
Y
 
L
I
 
V
T
 
V
G
 
G
Y
 
T
N
 
D
A
 
G
I
 
I
E
 
P
A
 
E
I
 
A
K
 
R
P
 
K
L
 
M
I
 
V
A
 
E
D
 
A
G
 
G
H
 
Q
V
 
M
L
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
N
 
A
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

8wlbA X-ray structure of enterobacter cloacae allose-binding protein in complex with d-psicose (see paper)
33% identity, 76% coverage: 37:278/320 of query aligns to 5:247/288 of 8wlbA

query
sites
8wlbA
A
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
L
K
|
K
S
 
T
I
 
L
N
 
S
D
x
N
P
 
P
F
|
F
T
x
W
V
 
V
A
 
D
M
 
M
A
 
K
N
 
K
A
 
G
A
 
I
K
 
E
N
 
D
Y
 
E
Q
 
A
Q
 
K
H
 
T
Y
 
L
A
 
G
S
 
-
Q
 
-
F
 
V
A
 
S
L
 
V
T
 
D
V
 
I
R
 
F
G
 
A
T
 
S
A
 
P
T
 
S
E
 
E
A
 
G
D
 
D
T
 
F
A
 
Q
G
 
S
Q
 
Q
I
 
L
R
 
Q
I
 
L
V
 
F
D
 
E
D
 
D
L
 
L
I
 
S
K
 
N
A
 
K
K
 
K
M
 
Y
N
 
K
A
 
G
I
 
I
V
 
A
I
 
F
A
 
A
P
 
P
S
 
L
G
 
S
S
 
S
K
 
V
P
 
N
L
 
L
T
 
V
A
 
M
V
 
P
V
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
W
K
 
Q
A
 
K
G
 
G
I
 
L
I
 
Y
V
 
L
V
 
V
S
 
N
I
 
L
D
|
D
N
x
E
P
 
K
L
 
I
D
 
D
-
 
M
D
 
D
A
 
N
S
 
L
Q
 
K
D
 
K
A
 
A
A
 
G
K
 
G
I
 
N
S
 
V
V
 
E
P
 
G
F
 
F
V
 
V
G
 
T
P
 
T
D
 
D
N
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
V
-
 
G
R
 
A
K
 
K
G
 
G
A
 
A
T
 
D
L
 
F
V
 
I
A
 
I
N
 
N
Y
 
K
L
 
L
A
 
G
G
 
A
R
 
E
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
G
D
 
G
Q
 
E
V
 
V
G
 
A
I
 
I
I
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
K
A
 
A
A
 
G
D
 
N
R
 
A
N
x
S
A
 
G
Q
 
E
E
 
A
R
|
R
T
 
R
A
 
N
G
 
G
Y
 
A
R
 
T
D
 
E
V
 
A
M
 
F
S
 
K
T
 
K
A
 
A
G
 
N
-
 
Q
M
 
I
Q
 
K
V
 
L
V
 
V
A
 
A
T
 
S
Q
 
Q
A
 
P
A
 
A
D
 
D
W
 
W
E
 
D
Y
 
R
G
 
I
K
 
K
G
 
A
R
 
L
D
 
D
V
 
V
A
 
A
S
 
T
K
 
N
M
 
V
L
 
L
G
 
Q
Q
 
R
H
 
N
P
 
P
Q
 
N
I
 
L
R
 
K
G
 
A
L
 
F
L
 
Y
C
 
C
A
 
A
N
|
N
D
 
D
N
 
T
M
 
M
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
V
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
R
 
A
D
 
N
A
 
A
G
 
G
R
 
K
T
 
I
G
 
G
G
 
K
V
 
V
Y
 
L
I
 
V
T
 
V
G
 
G
Y
 
T
N
x
D
A
 
G
I
 
I
E
 
P
A
 
E
I
 
A
K
 
R
P
 
K
L
 
M
I
 
V
A
 
E
D
 
A
G
 
G
H
 
Q
V
 
M
L
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
N
 
A
Q
|
Q

8wl9A X-ray structure of enterobacter cloacae allose-binding protein in complex with d-ribose (see paper)
33% identity, 76% coverage: 37:278/320 of query aligns to 5:247/288 of 8wl9A

query
sites
8wl9A
A
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
L
K
 
K
S
 
T
I
 
L
N
 
S
D
x
N
P
 
P
F
|
F
T
 
W
V
 
V
A
 
D
M
 
M
A
 
K
N
 
K
A
 
G
A
 
I
K
 
E
N
 
D
Y
 
E
Q
 
A
Q
 
K
H
 
T
Y
 
L
A
 
G
S
 
-
Q
 
-
F
 
V
A
 
S
L
 
V
T
 
D
V
 
I
R
 
F
G
 
A
T
 
S
A
 
P
T
 
S
E
 
E
A
 
G
D
 
D
T
 
F
A
 
Q
G
 
S
Q
 
Q
I
 
L
R
 
Q
I
 
L
V
 
F
D
 
E
D
 
D
L
 
L
I
 
S
K
 
N
A
 
K
K
 
K
M
 
Y
N
 
K
A
 
G
I
 
I
V
 
A
I
 
F
A
 
A
P
 
P
S
 
L
G
 
S
S
 
S
K
 
V
P
 
N
L
 
L
T
 
V
A
 
M
V
 
P
V
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
W
K
 
Q
A
 
K
G
 
G
I
 
L
I
 
Y
V
 
L
V
 
V
S
 
N
I
 
L
D
|
D
N
 
E
P
 
K
L
 
I
D
 
D
-
 
M
D
 
D
A
 
N
S
 
L
Q
 
K
D
 
K
A
 
A
A
 
G
K
 
G
I
 
N
S
 
V
V
 
E
P
 
G
F
 
F
V
 
V
G
 
T
P
 
T
D
 
D
N
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
V
-
 
G
R
 
A
K
 
K
G
 
G
A
 
A
T
 
D
L
 
F
V
 
I
A
 
I
N
 
N
Y
 
K
L
 
L
A
 
G
G
 
A
R
 
E
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
G
D
 
G
Q
 
E
V
 
V
G
 
A
I
 
I
I
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
K
A
 
A
A
 
G
D
 
N
R
 
A
N
 
S
A
 
G
Q
 
E
E
 
A
R
|
R
T
 
R
A
 
N
G
 
G
Y
 
A
R
 
T
D
 
E
V
 
A
M
 
F
S
 
K
T
 
K
A
 
A
G
 
N
-
 
Q
M
 
I
Q
 
K
V
 
L
V
 
V
A
 
A
T
 
S
Q
 
Q
A
 
P
A
 
A
D
 
D
W
|
W
E
 
D
Y
 
R
G
 
I
K
 
K
G
 
A
R
 
L
D
 
D
V
 
V
A
 
A
S
 
T
K
 
N
M
 
V
L
 
L
G
 
Q
Q
 
R
H
 
N
P
 
P
Q
 
N
I
 
L
R
 
K
G
 
A
L
 
F
L
 
Y
C
 
C
A
 
A
N
|
N
D
 
D
N
 
T
M
 
M
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
V
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
R
 
A
D
 
N
A
 
A
G
 
G
R
 
K
T
 
I
G
 
G
G
 
K
V
 
V
Y
 
L
I
 
V
T
 
V
G
 
G
Y
 
T
N
x
D
A
 
G
I
 
I
E
 
P
A
 
E
I
 
A
K
 
R
P
 
K
L
 
M
I
 
V
A
 
E
D
 
A
G
 
G
H
 
Q
V
 
M
L
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
N
 
A
Q
|
Q

2ioyA Crystal structure of thermoanaerobacter tengcongensis ribose binding protein (see paper)
27% identity, 88% coverage: 36:316/320 of query aligns to 3:269/274 of 2ioyA

query
sites
2ioyA
I
 
I
A
 
G
L
 
L
V
 
V
L
 
I
K
 
S
S
 
T
I
 
L
N
 
N
D
x
N
P
 
P
F
|
F
T
x
F
V
 
V
A
 
T
M
 
L
A
 
K
N
 
N
A
 
G
A
 
A
K
 
-
N
 
-
Y
 
-
Q
 
-
Q
 
E
H
 
E
Y
 
K
A
 
A
S
 
K
Q
 
E
F
 
L
A
 
G
L
 
Y
T
 
K
V
 
I
R
 
I
G
 
V
T
 
E
A
 
D
T
 
S
E
 
Q
A
 
N
D
 
D
T
 
S
A
 
S
G
 
K
Q
 
E
I
 
L
R
 
S
I
 
N
V
 
V
D
 
E
D
 
D
L
 
L
I
 
I
K
 
Q
A
 
Q
K
 
K
M
 
V
N
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
L
I
 
I
A
 
N
P
 
P
S
 
V
G
 
D
S
 
S
K
 
D
P
 
A
L
 
V
T
 
V
A
 
T
V
 
A
V
 
I
A
 
K
R
 
E
A
 
A
I
 
N
K
 
S
A
 
K
G
 
N
I
 
I
I
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
T
I
 
I
D
|
D
N
x
R
P
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
S
Q
 
A
D
 
N
A
 
G
A
 
G
K
 
D
I
 
V
S
 
-
V
 
V
P
 
C
F
 
H
V
 
I
G
 
A
P
 
S
D
 
D
N
 
N
R
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
G
T
 
E
L
 
M
V
 
A
A
 
A
N
 
E
Y
 
F
L
 
I
A
 
A
G
 
K
R
 
A
L
 
L
Q
 
K
A
 
G
G
 
K
D
 
G
Q
 
N
V
 
V
G
 
V
I
 
E
I
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
P
A
 
G
D
 
A
R
 
S
N
x
A
A
 
A
Q
 
R
E
 
D
R
|
R
T
 
G
A
 
K
G
 
G
Y
 
F
R
 
D
D
 
E
V
 
A
M
 
I
S
 
A
T
 
K
-
 
Y
A
 
P
G
 
D
M
 
I
Q
 
K
V
 
I
V
 
V
A
 
A
T
 
K
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
D
 
D
W
x
F
E
 
D
Y
 
R
G
 
S
K
 
K
G
 
G
R
 
L
D
 
S
V
 
V
A
 
M
S
 
E
K
 
N
M
 
I
L
 
L
G
 
Q
Q
 
A
H
 
Q
P
 
P
Q
 
K
I
 
I
R
 
D
G
 
A
L
 
V
L
 
F
C
 
A
A
 
Q
N
|
N
D
 
D
N
 
E
M
 
M
A
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
I
D
 
K
A
 
A
V
 
I
R
 
E
D
 
A
A
 
A
G
 
N
R
 
R
T
 
Q
G
 
-
G
 
G
V
 
I
Y
 
I
I
 
V
T
 
V
G
 
G
Y
 
F
N
x
D
A
 
G
I
 
T
E
 
E
A
 
D
I
 
A
K
 
L
P
 
K
L
 
A
I
 
I
A
 
K
D
 
E
G
 
G
H
 
K
V
 
M
L
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
I
N
 
A
Q
|
Q
F
 
Q
A
 
P
D
 
A
R
 
L
Q
 
M
A
 
G
V
 
S
F
 
L
G
 
G
M
 
V
D
 
E
V
 
M
A
 
A
L
 
D
K
 
K
A
 
Y
V
 
L
T
 
-
E
 
-
Q
 
-
R
 
-
K
 
K
Q
 
G
R
 
E
E
 
K
L
 
I
S
 
P
R
 
N
T
 
F
I
 
I
E
 
P
T
 
A
P
 
E
L
 
L
Q
 
K
L
 
L
V
 
I
T
 
T

2fn8A Thermotoga maritima ribose binding protein ribose bound form (see paper)
28% identity, 88% coverage: 35:316/320 of query aligns to 3:279/292 of 2fn8A

query
sites
2fn8A
K
 
K
I
 
M
A
 
A
L
 
I
V
 
V
L
 
I
K
 
S
S
 
T
I
 
L
N
 
N
D
x
N
P
 
P
F
x
W
T
x
F
V
 
V
A
 
V
M
 
L
A
 
A
N
 
E
A
 
T
A
 
A
K
 
K
N
 
-
Y
 
-
Q
 
-
Q
 
-
H
 
Q
Y
 
R
A
 
A
S
 
E
Q
 
Q
F
 
L
A
 
G
L
 
Y
T
 
E
V
 
A
R
 
T
G
 
I
T
 
F
A
 
D
T
 
S
E
 
Q
A
 
N
D
 
D
T
 
T
A
 
A
G
 
K
Q
 
E
I
 
S
R
 
A
I
 
H
V
 
F
D
 
D
D
 
A
L
 
I
I
 
I
K
 
A
A
 
A
K
 
G
M
 
Y
N
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
I
I
 
F
A
 
N
P
 
P
S
 
T
G
 
D
S
 
A
K
 
D
P
 
G
L
 
S
T
 
I
A
 
A
V
 
N
V
 
V
A
 
K
R
 
R
A
 
A
I
 
K
K
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
P
V
 
V
V
 
F
S
 
C
I
 
V
D
|
D
N
x
R
P
 
G
L
 
I
D
 
N
D
 
-
A
 
-
S
 
-
Q
 
-
D
 
-
A
 
A
A
 
R
K
 
G
I
 
L
S
 
A
V
 
V
P
 
A
F
 
Q
V
 
I
G
 
Y
P
 
S
D
 
D
N
 
N
R
 
Y
K
 
Y
G
 
G
A
 
G
T
 
V
L
 
L
V
 
M
A
 
G
N
 
E
Y
 
Y
L
 
F
A
 
V
G
 
K
R
 
F
L
 
L
Q
 
K
A
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
P
-
 
D
G
 
A
D
 
K
Q
 
E
V
 
I
G
 
P
I
 
Y
I
 
A
E
 
E
-
 
L
-
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
L
A
 
S
D
 
A
R
 
Q
N
 
P
A
 
T
Q
 
W
E
 
D
R
|
R
T
 
S
A
 
N
G
 
G
Y
 
F
R
 
H
D
 
S
V
 
V
M
 
V
S
 
D
-
 
Q
T
 
Y
A
 
P
G
 
E
M
 
F
Q
 
K
V
 
M
V
 
V
A
 
A
T
 
Q
Q
 
Q
A
 
S
A
 
A
D
 
E
W
x
F
E
 
D
Y
 
R
G
 
D
K
 
T
G
 
A
R
 
Y
D
 
K
V
 
V
A
 
T
S
 
E
K
 
Q
M
 
I
L
 
L
G
 
Q
Q
 
A
H
 
H
P
 
P
Q
 
E
I
 
I
R
 
K
G
 
A
L
 
I
L
 
W
C
 
C
A
 
G
N
|
N
D
 
D
N
 
A
M
 
M
A
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
M
D
 
K
A
 
A
V
 
C
R
 
E
D
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
-
G
 
D
V
 
I
Y
 
Y
I
 
I
T
 
F
G
 
G
Y
 
F
N
x
D
A
 
G
I
 
A
E
 
E
A
 
D
I
 
V
K
 
I
P
 
N
L
 
A
I
 
I
A
 
K
D
 
E
G
 
G
-
 
K
H
 
Q
V
 
I
L
 
V
A
 
A
T
 
T
V
 
I
N
 
M
Q
|
Q
F
 
F
A
 
P
D
 
K
R
 
L
Q
 
M
A
 
A
V
 
R
F
 
L
G
 
A
M
 
V
D
 
E
V
 
W
A
 
A
L
 
D
K
 
Q
A
 
Y
V
 
L
T
 
-
E
 
-
Q
 
-
R
 
R
K
 
G
Q
 
E
R
 
R
E
 
S
L
 
F
S
 
P
R
 
E
T
 
I
I
 
V
E
 
P
T
 
V
P
 
T
L
 
V
Q
 
E
L
 
L
V
 
V
T
 
T

1dbpA Identical mutations at corresponding positions in two homologous proteins with non-identical effects (see paper)
27% identity, 83% coverage: 36:301/320 of query aligns to 4:258/271 of 1dbpA

query
sites
1dbpA
I
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
V
K
 
S
S
 
T
I
 
L
N
 
N
D
x
N
P
 
P
F
|
F
T
 
F
V
 
V
A
 
S
M
 
L
A
 
K
N
 
D
A
 
G
A
 
A
K
 
-
N
 
-
Y
 
-
Q
 
-
Q
 
Q
H
 
K
Y
 
E
A
 
A
S
 
D
Q
 
K
F
 
L
A
 
G
L
 
Y
T
 
N
V
 
L
R
 
V
G
 
V
T
 
L
A
 
D
T
 
S
E
 
Q
A
 
N
D
 
N
T
 
P
A
 
A
G
 
K
Q
 
E
I
 
L
R
 
A
I
 
N
V
 
V
D
 
Q
D
 
D
L
 
L
I
 
T
K
 
V
A
 
R
K
 
G
M
 
T
N
 
K
A
 
I
I
 
L
V
 
L
I
 
I
A
 
N
P
 
P
S
 
T
G
 
D
S
 
S
K
 
D
P
 
A
L
 
V
T
 
D
A
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
K
R
 
M
A
 
A
I
 
N
K
 
Q
A
 
A
G
 
N
I
 
I
I
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
T
I
 
L
D
|
D
N
 
-
P
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
-
S
x
R
Q
 
Q
D
 
A
A
 
T
A
 
K
K
 
G
I
 
E
S
 
V
V
 
V
P
 
S
F
 
H
V
 
I
G
 
A
P
 
S
D
 
D
N
 
N
R
 
V
K
 
L
G
 
G
A
 
G
T
 
K
L
 
I
V
 
A
A
 
G
N
 
D
Y
 
Y
L
 
I
A
 
A
G
 
K
R
 
K
L
 
A
Q
 
G
A
 
E
G
 
G
D
 
A
Q
 
K
V
 
V
G
 
I
I
 
E
I
 
L
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
A
 
A
A
 
G
D
 
T
R
 
S
N
 
A
A
 
A
Q
 
R
E
 
E
R
|
R
T
 
G
A
 
E
G
 
G
Y
 
F
R
 
Q
D
 
Q
V
 
A
M
 
V
S
 
A
T
 
A
A
 
H
G
 
K
M
 
F
Q
 
N
V
 
V
V
 
L
A
 
A
T
 
S
Q
 
Q
A
 
P
A
 
A
D
 
D
W
x
F
E
 
D
Y
 
R
G
 
I
K
 
K
G
 
G
R
 
L
D
 
N
V
 
V
A
 
M
S
 
Q
K
 
N
M
 
L
L
 
L
G
 
T
Q
 
A
H
 
H
P
 
P
Q
 
D
I
 
V
R
 
Q
G
 
A
L
 
V
L
 
F
C
 
A
A
 
Q
N
|
N
D
 
D
N
 
E
M
 
M
A
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
L
D
 
R
A
 
A
V
 
L
R
 
Q
D
 
T
A
 
A
G
 
G
R
 
K
T
 
S
G
 
-
G
 
D
V
 
V
Y
 
M
I
 
V
T
 
V
G
 
G
Y
 
F
N
x
D
A
 
G
I
 
T
E
 
P
A
 
D
I
 
G
K
 
E
P
 
K
L
 
A
I
 
V
A
 
N
D
 
D
G
 
G
H
 
K
V
 
L
L
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
I
N
 
A
Q
 
Q
F
 
L
A
 
P
D
 
D
R
 
Q
Q
 
I
A
 
G
V
 
A
F
 
K
G
 
G
M
 
V
D
 
E
V
 
T
A
 
A
L
 
D
K
 
K
A
 
V
V
 
L
T
 
K
E
 
G
Q
 
E
R
 
K
K
 
V
Q
 
Q

4wutA Crystal structure of an abc transporter solute binding protein (ipr025997) from agrobacterium vitis (avi_5133, target efi-511220) with bound d-fucose
25% identity, 88% coverage: 35:316/320 of query aligns to 2:276/290 of 4wutA

query
sites
4wutA
K
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
V
V
 
I
L
 
V
K
|
K
S
 
T
I
 
V
N
 
N
D
 
S
P
 
T
F
 
F
T
x
W
V
 
Q
A
 
N
M
 
V
-
 
Q
-
 
K
-
 
G
A
 
A
N
 
D
A
 
A
A
 
A
K
 
I
N
 
G
Y
 
K
Q
 
Q
Q
 
K
H
 
A
Y
 
H
A
 
T
S
 
-
Q
 
-
F
 
-
A
 
-
L
 
I
T
 
T
V
 
F
R
 
Q
G
 
G
T
 
P
A
 
A
T
 
A
E
|
E
A
 
S
D
 
A
T
 
I
A
 
A
G
 
D
Q
 
Q
I
 
V
R
 
N
I
 
M
V
 
V
D
 
E
D
 
N
L
 
A
I
 
V
K
 
N
A
 
R
K
 
K
M
 
V
N
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
L
I
 
L
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
D
S
 
P
K
 
D
P
 
A
L
 
L
T
 
V
A
 
P
V
 
A
V
 
V
A
 
K
R
 
K
A
 
A
I
 
W
K
 
E
A
 
A
G
 
R
I
 
I
I
 
P
V
 
V
V
 
V
S
 
I
I
 
I
D
|
D
N
 
S
P
 
M
L
 
L
D
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
S
Q
 
K
D
 
D
A
 
A
A
 
E
K
 
K
I
 
Y
S
 
Y
V
 
Q
P
 
A
F
 
F
V
 
L
G
 
A
P
 
T
D
 
D
N
 
N
R
 
K
K
 
A
G
 
A
A
 
G
T
 
E
L
 
L
V
 
A
A
 
A
N
 
K
Y
 
A
L
 
M
A
 
I
G
 
Q
R
 
K
L
 
V
Q
 
G
A
 
T
G
 
E
D
 
G
Q
 
K
V
 
I
G
 
A
I
 
V
I
 
M
E
 
S
G
 
Y
I
 
V
A
 
A
A
 
G
D
 
A
R
 
G
N
 
S
A
 
E
Q
 
I
E
 
G
R
|
R
T
 
V
A
 
G
G
 
G
Y
 
F
R
 
T
D
 
D
-
 
Y
V
 
I
M
x
K
S
 
A
T
 
N
A
x
S
G
 
K
M
 
L
Q
 
Q
V
 
I
V
 
V
A
 
G
T
 
P
Q
 
Y
A
 
Y
A
 
S
D
 
Q
W
 
S
E
 
Q
Y
 
M
G
 
A
K
 
T
G
 
A
R
 
L
D
x
N
V
 
Q
A
 
T
S
 
T
K
x
D
M
 
V
L
 
L
G
 
A
Q
 
A
H
 
N
P
 
A
Q
 
D
I
 
L
R
 
K
G
 
G
L
 
I
L
 
F
C
 
G
A
 
A
N
|
N
D
 
E
N
 
P
M
 
T
A
 
A
M
 
I
G
 
G
A
 
M
A
 
G
D
 
R
A
 
A
V
 
I
R
 
K
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
K
T
 
A
G
 
G
G
 
K
V
 
L
Y
 
V
I
 
A
T
 
I
G
 
G
Y
 
F
N
x
D
A
 
G
I
 
N
E
 
Q
A
 
D
I
 
L
K
 
Q
P
 
E
L
 
F
I
 
V
A
 
K
D
 
D
G
 
G
H
 
T
V
 
L
L
 
E
A
 
A
T
 
T
V
 
V
N
 
V
Q
|
Q
F
 
G
A
 
S
D
 
Y
R
 
Q
Q
 
M
A
 
G
V
 
E
F
 
K
G
 
G
M
 
V
D
 
D
V
 
T
A
 
L
L
 
L
K
 
K
A
 
L
V
 
L
T
 
S
E
 
K
Q
 
E
R
 
K
K
 
-
Q
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
V
S
 
E
R
 
K
T
 
F
I
 
I
E
 
D
T
 
T
P
 
G
L
 
V
Q
 
V
L
 
V
V
 
V
T
 
T

4zjpA Structure of an abc-transporter solute binding protein (sbp_ipr025997) from actinobacillus succinogenes (asuc_0197, target efi-511067) with bound beta-d-ribopyranose
26% identity, 88% coverage: 36:316/320 of query aligns to 5:269/270 of 4zjpA

query
sites
4zjpA
I
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
T
L
 
V
K
 
S
S
 
T
I
 
L
N
 
D
D
x
N
P
 
P
F
|
F
T
x
F
V
 
V
A
 
S
M
 
L
A
 
K
N
 
D
A
 
G
A
 
A
K
 
-
N
 
-
Y
 
-
Q
 
-
Q
 
Q
H
 
K
Y
 
K
A
 
A
S
 
T
Q
 
E
F
 
L
A
 
G
L
 
Y
T
 
K
V
 
L
R
 
V
G
 
V
T
 
L
A
 
D
T
 
S
E
 
Q
A
 
N
D
 
D
T
 
P
A
 
S
G
 
K
Q
 
E
I
 
L
R
 
S
I
 
N
V
 
V
D
 
E
D
 
D
L
 
L
I
 
T
K
 
V
A
 
R
K
 
G
M
 
A
N
 
K
A
 
V
I
 
L
V
 
L
I
 
I
A
 
N
P
 
P
S
 
T
G
 
D
S
 
S
K
 
A
P
 
A
L
 
V
T
 
S
A
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
I
A
 
A
I
 
N
K
 
R
A
 
N
G
 
K
I
 
I
I
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
T
I
 
L
D
|
D
N
 
-
P
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
-
Q
x
R
D
 
G
A
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
G
S
 
E
V
 
V
-
 
V
P
 
S
F
 
H
V
 
I
G
 
A
P
 
S
D
 
D
N
 
N
R
 
V
K
 
A
G
 
G
A
 
G
T
 
K
L
 
M
V
 
A
A
 
G
N
 
D
Y
 
F
L
 
I
A
 
A
G
 
Q
R
 
K
L
 
L
Q
 
G
A
 
D
G
 
G
D
 
A
Q
 
K
V
 
V
G
 
I
I
 
Q
I
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
G
D
 
T
R
 
S
N
 
A
A
 
A
Q
 
R
E
 
E
R
|
R
T
 
G
A
 
E
G
 
G
Y
 
F
R
 
K
D
 
Q
V
 
A
M
 
I
S
 
E
T
 
A
A
 
H
G
 
K
M
 
F
Q
 
D
V
 
V
V
 
L
A
 
A
T
 
S
Q
 
Q
A
 
P
A
 
A
D
 
D
W
x
F
E
 
D
Y
 
R
G
 
T
K
 
K
G
 
G
R
 
L
D
 
N
V
 
V
A
 
T
S
 
E
K
 
N
M
 
L
L
 
L
G
 
A
Q
 
S
H
 
K
P
 
G
Q
 
S
I
 
V
R
 
Q
G
 
A
L
 
I
L
 
F
C
 
A
A
 
Q
N
|
N
D
 
D
N
 
E
M
 
M
A
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
L
D
 
R
A
 
A
V
 
I
R
 
S
D
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
K
T
 
K
G
 
-
G
 
-
V
 
V
Y
 
L
I
 
V
T
 
V
G
 
G
Y
 
F
N
x
D
A
 
G
I
 
T
E
 
E
A
 
D
I
 
G
K
 
V
P
 
K
L
 
A
I
 
V
A
 
K
D
 
S
G
 
G
H
 
K
V
 
L
L
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
V
N
 
A
Q
|
Q
F
 
Q
A
 
P
D
 
E
R
 
L
Q
 
I
A
 
G
V
 
S
F
 
L
G
 
G
M
 
V
D
 
E
V
 
T
A
 
A
L
 
D
K
 
K
A
 
I
V
 
L
T
 
-
E
 
-
Q
 
-
R
 
-
K
 
K
Q
 
G
R
 
E
E
 
K
L
 
V
S
 
D
R
 
A
T
 
K
I
 
I
E
 
P
T
 
V
P
 
A
L
 
L
Q
 
K
L
 
V
V
 
V
T
 
T

5ibqA Crystal structure of an abc solute binding protein from rhizobium etli cfn 42 (rhe_pf00037,target efi-511357) in complex with alpha-d-apiose
28% identity, 84% coverage: 36:304/320 of query aligns to 5:267/287 of 5ibqA

query
sites
5ibqA
I
 
I
A
 
A
L
 
I
V
 
I
L
 
T
K
 
P
S
 
A
I
 
H
N
 
D
D
x
N
P
 
P
F
|
F
T
 
F
V
 
K
A
 
A
M
 
E
A
 
A
N
 
V
A
 
G
A
 
A
K
 
-
N
 
-
Y
 
-
Q
 
-
Q
 
E
H
 
A
Y
 
K
A
 
A
S
 
K
Q
 
E
F
 
L
A
 
G
L
 
Y
T
 
E
V
 
T
R
 
L
G
 
V
T
 
M
A
 
T
T
 
H
E
 
D
A
 
D
D
 
D
T
 
A
A
 
N
G
 
K
Q
 
Q
I
 
S
R
 
E
I
 
M
V
 
I
D
 
D
D
 
T
L
 
A
I
 
I
K
 
G
A
 
R
K
 
G
M
 
A
N
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
I
I
 
L
A
 
D
P
 
N
S
 
A
G
 
G
S
 
A
K
 
D
P
 
A
L
 
S
T
 
V
A
 
A
V
 
A
V
 
V
A
 
K
R
 
K
A
 
A
I
 
K
K
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
P
V
 
S
V
 
F
S
 
L
I
 
I
D
|
D
N
x
R
P
 
E
L
 
I
D
 
N
D
 
-
A
 
-
S
 
-
Q
 
-
D
 
-
A
 
A
A
 
T
K
 
G
I
 
V
S
 
A
V
 
V
P
 
A
F
 
Q
V
 
I
G
 
V
P
 
S
D
 
N
N
 
N
R
 
Y
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
Q
L
 
L
V
 
G
A
 
A
N
 
Q
Y
 
E
L
 
F
A
 
V
G
 
K
R
 
L
L
 
M
-
 
G
Q
 
E
A
 
K
G
 
G
D
 
N
Q
 
Y
V
 
V
G
 
E
I
 
L
I
 
V
E
 
-
G
 
G
I
 
K
A
 
E
A
 
S
D
|
D
R
 
T
N
|
N
A
 
A
Q
 
G
E
 
I
R
|
R
T
 
S
A
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
R
 
H
D
|
D
V
 
V
M
 
I
S
x
D
T
x
D
-
 
Y
A
 
P
G
 
E
M
 
M
Q
 
K
V
 
S
V
 
V
A
 
A
T
 
K
Q
 
Q
A
 
S
A
 
A
D
 
N
W
|
W
E
 
S
Y
 
Q
G
 
T
K
 
E
G
 
A
R
 
Y
D
 
S
V
 
K
A
 
M
S
 
E
K
 
T
M
 
I
L
 
L
G
 
Q
Q
 
A
H
 
N
P
 
P
Q
 
D
I
 
I
R
 
K
G
 
G
L
 
V
L
 
I
C
 
S
A
 
G
N
|
N
D
 
D
N
 
T
M
 
M
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
A
 
I
D
 
A
A
 
A
V
 
L
R
 
Q
D
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
K
G
 
-
G
 
D
V
 
V
Y
 
I
I
 
V
T
 
V
G
 
G
Y
 
F
N
x
D
A
 
G
I
 
S
E
 
N
A
 
D
I
 
V
K
 
R
P
 
D
L
 
S
I
 
I
A
 
K
D
 
S
G
 
G
H
 
G
V
 
I
L
 
K
A
 
A
T
 
T
V
 
V
N
 
L
Q
 
Q
F
 
P
A
 
A
D
 
Y
R
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
Q
F
 
L
G
 
A
M
 
V
-
 
E
-
 
Q
-
 
A
D
 
D
V
 
A
A
 
Y
L
 
I
K
 
K
A
 
N
V
 
K
T
 
T
E
 
T
Q
 
P
R
 
K
K
 
E
Q
 
E
R
 
K
E
 
Q
L
 
L

4ry0A Crystal structure of ribose transporter solute binding protein rhe_pf00037 from rhizobium etli cfn 42, target efi-511357, in complex with d-ribose
28% identity, 84% coverage: 36:304/320 of query aligns to 5:267/287 of 4ry0A

query
sites
4ry0A
I
 
I
A
 
A
L
 
I
V
 
I
L
 
T
K
 
P
S
 
A
I
 
H
N
 
D
D
x
N
P
 
P
F
 
F
T
x
F
V
 
K
A
 
A
M
 
E
A
 
A
N
 
V
A
 
G
A
 
A
K
 
-
N
 
-
Y
 
-
Q
 
-
Q
 
E
H
 
A
Y
 
K
A
 
A
S
 
K
Q
 
E
F
 
L
A
 
G
L
 
Y
T
 
E
V
 
T
R
 
L
G
 
V
T
 
M
A
 
T
T
 
H
E
 
D
A
 
D
D
 
D
T
 
A
A
 
N
G
 
K
Q
 
Q
I
 
S
R
 
E
I
 
M
V
 
I
D
 
D
D
 
T
L
 
A
I
 
I
K
 
G
A
 
R
K
 
G
M
 
A
N
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
I
I
 
L
A
 
D
P
 
N
S
 
A
G
 
G
S
 
A
K
 
D
P
 
A
L
 
S
T
 
V
A
 
A
V
 
A
V
 
V
A
 
K
R
 
K
A
 
A
I
 
K
K
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
P
V
 
S
V
 
F
S
 
L
I
 
I
D
|
D
N
x
R
P
 
E
L
 
I
D
 
N
D
 
-
A
 
-
S
 
-
Q
 
-
D
 
-
A
 
A
A
 
T
K
 
G
I
 
V
S
 
A
V
 
V
P
 
A
F
 
Q
V
 
I
G
 
V
P
 
S
D
 
N
N
 
N
R
 
Y
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
Q
L
 
L
V
 
G
A
 
A
N
 
Q
Y
 
E
L
 
F
A
 
V
G
 
K
R
 
L
L
 
M
-
 
G
Q
 
E
A
 
K
G
 
G
D
 
N
Q
 
Y
V
 
V
G
 
E
I
 
L
I
 
V
E
 
-
G
 
G
I
 
K
A
 
E
A
 
S
D
|
D
R
 
T
N
 
N
A
 
A
Q
 
G
E
 
I
R
|
R
T
 
S
A
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
R
 
H
D
|
D
V
 
V
M
 
I
S
x
D
T
x
D
-
 
Y
A
 
P
G
 
E
M
 
M
Q
 
K
V
 
S
V
 
V
A
 
A
T
 
K
Q
 
Q
A
 
S
A
 
A
D
 
N
W
|
W
E
 
S
Y
 
Q
G
 
T
K
 
E
G
 
A
R
 
Y
D
 
S
V
 
K
A
 
M
S
 
E
K
 
T
M
 
I
L
 
L
G
 
Q
Q
 
A
H
 
N
P
 
P
Q
 
D
I
 
I
R
 
K
G
 
G
L
 
V
L
 
I
C
 
S
A
 
G
N
|
N
D
 
D
N
 
T
M
 
M
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
A
 
I
D
 
A
A
 
A
V
 
L
R
 
Q
D
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
K
G
 
-
G
 
D
V
 
V
Y
 
I
I
 
V
T
 
V
G
 
G
Y
 
F
N
x
D
A
 
G
I
 
S
E
 
N
A
 
D
I
 
V
K
 
R
P
 
D
L
 
S
I
 
I
A
 
K
D
 
S
G
 
G
H
 
G
V
 
I
L
 
K
A
 
A
T
 
T
V
 
V
N
 
L
Q
|
Q
F
 
P
A
 
A
D
 
Y
R
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
Q
F
 
L
G
 
A
M
 
V
-
 
E
-
 
Q
-
 
A
D
 
D
V
 
A
A
 
Y
L
 
I
K
 
K
A
 
N
V
 
K
T
 
T
E
 
T
Q
 
P
R
 
K
K
 
E
Q
 
E
R
 
K
E
 
Q
L
 
L

4irxA Crystal structure of caulobacter myo-inositol binding protein bound to myo-inositol (see paper)
28% identity, 75% coverage: 39:278/320 of query aligns to 11:249/296 of 4irxA

query
sites
4irxA
V
 
V
L
 
V
K
 
V
S
 
S
I
 
F
N
 
N
D
 
D
-
 
L
-
 
S
-
x
Q
P
 
P
F
|
F
T
 
F
V
 
V
A
 
A
M
 
M
A
 
-
N
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
R
N
 
R
Y
 
E
Q
 
L
Q
 
E
H
 
D
Y
 
E
A
 
A
S
 
A
Q
 
K
F
 
L
A
 
G
L
 
V
T
 
K
V
 
V
R
 
Q
G
 
V
T
 
L
A
 
D
T
 
A
E
 
Q
A
 
N
D
 
N
T
 
S
A
 
S
G
 
K
Q
 
Q
I
 
I
R
 
S
I
 
D
V
 
L
D
 
Q
D
 
A
L
 
A
I
 
A
K
 
V
A
 
Q
K
 
G
M
 
A
N
 
K
A
 
V
I
 
V
V
 
I
I
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
T
G
 
D
S
 
S
K
 
K
P
 
A
L
 
L
T
 
A
A
 
G
V
 
A
V
 
A
A
 
D
R
 
D
A
 
L
I
 
V
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
I
 
V
I
 
A
V
 
V
V
 
I
S
 
S
I
 
V
D
|
D
N
x
R
P
 
N
L
 
I
D
 
A
D
 
-
A
 
-
S
 
-
Q
 
-
D
 
-
A
 
G
A
 
G
K
 
K
I
 
T
S
 
A
V
 
V
P
 
P
F
 
H
V
 
V
G
 
G
P
 
A
D
 
D
N
 
N
R
 
V
K
 
A
G
 
G
A
 
G
T
 
R
L
 
A
V
 
M
A
 
A
N
 
D
Y
 
W
L
 
V
A
 
V
G
 
K
R
 
T
L
 
Y
Q
 
P
A
 
A
G
 
G
D
 
A
Q
 
R
V
 
V
G
 
V
I
 
V
I
 
I
E
 
T
G
x
N
I
x
D
A
 
P
A
 
G
D
 
S
R
 
S
N
x
S
A
 
S
Q
 
I
E
 
E
R
|
R
T
 
V
A
 
K
G
 
G
Y
 
V
R
 
H
D
 
D
V
 
G
M
 
L
S
 
A
T
 
A
A
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
A
M
 
F
Q
 
K
V
 
I
V
 
V
A
 
T
T
 
E
Q
 
Q
A
 
T
A
 
A
D
 
N
W
x
S
E
 
K
Y
 
R
G
 
D
K
 
Q
G
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
T
R
 
Q
D
 
N
V
 
I
A
 
L
S
 
T
K
 
S
M
 
M
L
 
R
G
 
D
Q
 
T
H
 
P
P
 
P
Q
 
D
I
 
V
R
 
-
G
 
-
L
 
I
L
 
L
C
 
C
A
 
L
N
|
N
D
 
D
N
 
D
M
 
M
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
A
 
L
D
 
E
A
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
A
A
 
A
G
 
G
-
 
L
R
 
D
T
 
S
G
 
A
G
 
K
V
 
V
Y
 
K
I
 
V
T
 
I
G
 
G
Y
 
F
N
x
D
A
 
A
I
 
I
E
 
P
A
 
E
I
 
A
K
 
L
P
 
A
L
 
R
I
 
I
A
 
K
D
 
A
G
 
G
H
 
E
V
 
M
L
 
V
A
 
A
T
 
T
V
 
V
N
 
E
Q
|
Q

7e7mC Crystal structure analysis of the streptococcus agalactiae ribose binding protein rbsb
25% identity, 88% coverage: 35:316/320 of query aligns to 10:275/284 of 7e7mC

query
sites
7e7mC
K
 
K
I
 
L
A
 
G
L
 
V
V
 
S
L
 
I
K
 
S
S
 
T
I
 
T
N
 
N
D
x
N
P
 
P
F
x
Y
T
x
F
V
 
V
A
 
A
M
 
M
A
 
-
N
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
K
N
 
D
Y
 
G
Q
 
I
Q
 
D
H
 
K
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
Q
 
N
F
 
K
A
 
K
L
 
I
T
 
S
V
 
I
R
 
K
G
 
V
T
 
A
A
 
D
T
 
A
E
 
Q
A
 
D
D
 
D
T
 
A
A
 
A
G
 
R
Q
 
Q
I
 
A
R
 
D
I
 
D
V
 
V
D
 
Q
D
 
N
L
 
F
I
 
I
K
 
S
A
 
Q
K
 
N
M
 
V
N
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
L
I
 
I
A
 
N
P
 
P
S
 
V
G
 
D
S
 
S
K
 
K
P
 
A
L
 
I
T
 
V
A
 
T
V
 
A
V
 
I
A
 
K
R
 
S
A
 
A
I
 
N
K
 
N
A
 
A
G
 
N
I
 
I
I
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
-
I
 
-
D
 
-
N
 
-
P
 
-
L
 
L
D
 
M
D
|
D
A
x
R
S
 
G
Q
 
S
D
 
E
A
 
G
A
 
G
K
 
K
I
 
V
S
 
-
V
 
L
P
 
T
F
 
T
V
 
V
G
 
A
P
 
S
D
 
D
N
 
N
R
 
V
K
 
A
G
 
A
A
 
G
T
 
K
L
 
M
V
 
A
A
 
A
N
 
D
Y
 
Y
L
 
A
A
 
V
G
 
K
R
 
K
L
 
L
Q
 
G
A
 
K
G
 
K
D
 
A
Q
 
K
V
 
A
G
 
F
I
 
E
I
 
L
E
 
S
G
 
G
I
 
V
A
 
P
A
 
G
D
 
A
R
 
S
N
 
A
A
 
T
Q
 
V
E
 
D
R
|
R
T
 
G
A
 
K
G
 
G
Y
 
F
R
 
H
D
 
S
V
 
V
M
 
-
S
 
A
T
 
K
A
 
S
G
 
K
M
 
L
Q
 
D
V
 
M
V
 
L
A
 
S
T
 
S
Q
 
Q
A
 
S
A
 
A
D
 
N
W
x
F
E
 
D
Y
 
R
G
 
A
K
 
K
G
 
A
R
 
L
D
 
N
V
 
T
A
 
T
S
 
Q
K
 
N
M
 
M
L
 
I
G
 
Q
Q
 
G
H
 
H
P
 
K
Q
 
D
I
 
V
R
 
Q
G
 
I
L
 
I
L
 
F
C
 
A
A
 
Q
N
|
N
D
 
D
N
 
E
M
 
M
A
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
R
 
K
D
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
L
T
 
Q
G
 
-
G
 
N
V
 
V
Y
 
L
I
 
I
T
 
V
G
 
G
Y
 
I
N
x
D
A
 
G
I
 
Q
E
 
P
A
 
D
I
 
A
K
 
H
P
 
D
L
 
A
I
 
I
A
 
K
D
 
K
G
 
G
H
 
D
V
 
I
L
 
S
A
 
A
T
 
T
V
 
I
N
 
A
Q
|
Q
F
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
Q
Q
 
P
A
 
A
V
 
K
F
 
M
G
 
G
M
 
-
D
 
E
V
 
I
A
 
A
L
 
I
K
 
Q
A
 
A
V
 
A
T
 
I
E
 
D
Q
 
Y
R
 
Y
K
 
K
Q
 
G
R
 
K
E
 
K
L
 
V
S
 
E
R
 
K
T
 
E
I
 
T
E
 
I
T
 
S
P
 
P
L
 
I
Q
 
Y
L
 
L
V
 
V
T
 
T

4rxmA Crystal structure of periplasmic abc transporter solute binding protein a7jw62 from mannheimia haemolytica phl213, target efi-511105, in complex with myo-inositol
23% identity, 84% coverage: 36:305/320 of query aligns to 7:267/291 of 4rxmA

query
sites
4rxmA
I
 
V
A
 
V
L
 
F
V
 
S
L
 
L
K
 
P
S
 
N
I
 
L
N
 
S
D
 
S
P
 
P
F
 
F
T
x
E
V
 
V
A
 
Q
M
 
L
A
 
Q
N
 
K
A
 
V
A
 
A
K
 
-
N
 
-
Y
 
-
Q
 
-
Q
 
V
H
 
E
Y
 
T
A
 
S
S
 
K
Q
 
K
F
 
L
A
x
E
L
x
I
T
 
K
V
 
L
R
 
Q
G
 
V
T
 
L
A
 
D
T
 
G
E
 
Q
A
 
S
D
 
S
T
 
S
A
 
T
G
 
K
Q
 
Q
I
 
A
R
 
S
I
 
D
V
 
L
D
 
E
D
 
N
L
 
A
I
 
I
K
 
T
A
 
R
K
 
G
M
 
A
N
 
K
A
 
G
I
 
I
V
 
I
I
 
I
A
 
S
P
 
P
S
 
N
G
 
D
S
 
V
K
 
N
P
 
A
L
 
I
T
 
S
A
 
G
V
 
A
V
 
V
A
 
E
R
 
E
A
 
I
I
 
I
K
 
K
A
 
E
G
 
K
I
 
I
I
 
P
V
 
A
V
 
A
S
 
T
I
 
L
D
|
D
N
x
R
P
 
K
L
 
V
D
 
E
D
 
S
A
 
S
S
 
K
Q
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
-
I
 
-
S
 
P
V
 
V
P
 
P
F
 
H
V
 
F
G
 
G
P
 
A
D
 
N
N
 
N
R
 
Y
K
 
T
G
 
G
A
 
G
T
 
Q
L
 
E
V
 
V
A
 
A
N
 
K
Y
 
A
L
 
V
A
 
K
G
 
A
R
 
K
L
 
Y
Q
 
P
A
 
N
G
 
G
D
 
A
Q
 
K
V
 
I
G
 
I
I
 
L
I
 
L
E
 
T
G
 
G
I
 
Q
A
 
P
A
 
G
D
 
S
R
 
T
N
x
S
A
 
N
Q
 
I
E
 
E
R
|
R
T
 
T
A
 
K
G
 
G
Y
 
I
R
 
R
D
 
D
V
 
E
M
 
L
S
 
A
T
 
A
A
 
G
G
 
G
-
 
D
-
 
K
M
 
Y
Q
 
K
V
 
I
V
 
V
A
 
V
T
 
D
Q
 
Q
A
 
T
A
 
G
D
 
N
W
|
W
E
 
L
Y
 
R
G
 
S
K
 
E
G
 
G
-
 
L
R
 
R
D
 
I
V
 
I
A
 
E
S
 
S
K
 
V
M
 
L
-
 
P
-
 
T
L
 
L
G
 
K
Q
 
E
H
 
K
P
 
P
Q
 
E
I
 
V
R
 
-
G
 
-
L
 
I
L
 
I
C
 
S
A
 
A
N
|
N
D
 
D
N
 
D
M
 
M
A
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
I
D
 
E
A
 
A
V
 
L
R
 
R
D
 
S
A
 
Q
G
 
G
-
 
L
R
 
K
T
 
A
G
 
G
G
 
D
V
 
I
Y
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Y
 
F
N
x
D
A
 
S
I
 
T
E
 
P
A
 
E
I
 
A
K
 
L
P
 
A
L
 
R
I
 
V
A
 
K
D
 
D
G
 
G
H
 
W
V
 
L
L
 
Y
A
 
L
T
 
T
V
 
-
N
 
-
Q
 
-
F
 
-
A
 
A
D
 
D
R
x
Q
Q
 
R
A
 
P
V
 
S
F
 
F
G
 
A
M
 
V
D
 
S
V
 
T
A
 
A
L
 
L
K
 
E
A
 
Q
V
 
V
T
 
V
E
 
G
Q
 
N
-
 
I
R
 
R
K
 
E
Q
 
S
R
 
K
E
 
E
L
 
V
S
 
S

Sites not aligning to the query:

4rxmB Crystal structure of periplasmic abc transporter solute binding protein a7jw62 from mannheimia haemolytica phl213, target efi-511105, in complex with myo-inositol
23% identity, 84% coverage: 36:305/320 of query aligns to 5:265/288 of 4rxmB

query
sites
4rxmB
I
 
V
A
 
V
L
 
F
V
 
S
L
 
L
K
 
P
S
 
N
I
 
L
N
 
S
D
 
S
P
 
P
F
 
F
T
x
E
V
 
V
A
 
Q
M
 
L
A
 
Q
N
 
K
A
 
V
A
 
A
K
 
-
N
 
-
Y
 
-
Q
 
-
Q
 
V
H
 
E
Y
 
T
A
 
S
S
 
K
Q
 
K
F
 
L
A
 
E
L
 
I
T
 
K
V
 
L
R
 
Q
G
 
V
T
 
L
A
 
D
T
 
G
E
 
Q
A
 
S
D
 
S
T
 
S
A
 
T
G
 
K
Q
 
Q
I
 
A
R
 
S
I
 
D
V
 
L
D
 
E
D
 
N
L
 
A
I
 
I
K
 
T
A
 
R
K
 
G
M
 
A
N
 
K
A
 
G
I
 
I
V
 
I
I
 
I
A
 
S
P
 
P
S
 
N
G
 
D
S
 
V
K
 
N
P
 
A
L
 
I
T
 
S
A
 
G
V
 
A
V
 
V
A
 
E
R
 
E
A
 
I
I
 
I
K
 
K
A
 
E
G
 
K
I
 
I
I
 
P
V
 
A
V
 
A
S
 
T
I
 
L
D
|
D
N
x
R
P
 
K
L
 
V
D
 
E
D
 
S
A
 
S
S
 
K
Q
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
-
I
 
-
S
 
P
V
 
V
P
 
P
F
 
H
V
 
F
G
 
G
P
 
A
D
 
N
N
 
N
R
 
Y
K
 
T
G
 
G
A
 
G
T
 
Q
L
 
E
V
 
V
A
 
A
N
 
K
Y
 
A
L
 
V
A
 
K
G
 
A
R
 
K
L
 
Y
Q
 
P
A
 
N
G
 
G
D
 
A
Q
 
K
V
 
I
G
 
I
I
 
L
I
 
L
E
 
T
G
 
G
I
 
Q
A
 
P
A
 
G
D
 
S
R
 
T
N
x
S
A
 
N
Q
 
I
E
 
E
R
|
R
T
 
T
A
 
K
G
 
G
Y
 
I
R
 
R
D
 
D
V
 
E
M
 
L
S
 
A
T
 
A
A
 
G
G
 
G
-
 
D
-
 
K
M
 
Y
Q
 
K
V
 
I
V
 
V
A
 
V
T
 
D
Q
 
Q
A
 
T
A
 
G
D
 
N
W
|
W
E
 
L
Y
 
R
G
 
S
K
 
E
G
 
G
-
 
L
R
 
R
D
 
I
V
 
I
A
 
E
S
 
S
K
 
V
M
 
L
-
 
P
-
 
T
L
|
L
G
x
K
Q
x
E
H
 
K
P
 
P
Q
 
E
I
 
V
R
 
-
G
 
-
L
 
I
L
 
I
C
 
S
A
 
A
N
|
N
D
 
D
N
 
D
M
 
M
A
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
I
D
 
E
A
 
A
V
 
L
R
 
R
D
 
S
A
 
Q
G
 
G
-
 
L
R
 
K
T
 
A
G
 
G
G
 
D
V
 
I
Y
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Y
 
F
N
x
D
A
 
S
I
 
T
E
 
P
A
 
E
I
 
A
K
 
L
P
 
A
L
 
R
I
 
V
A
 
K
D
 
D
G
 
G
H
 
W
V
 
L
L
 
Y
A
 
L
T
 
T
V
 
-
N
 
-
Q
 
-
F
 
-
A
 
A
D
 
D
R
x
Q
Q
 
R
A
 
P
V
 
S
F
 
F
G
 
A
M
 
V
D
 
S
V
 
T
A
 
A
L
 
L
K
 
E
A
 
Q
V
 
V
T
 
V
E
 
G
Q
 
N
-
 
I
R
 
R
K
 
E
Q
 
S
R
 
K
E
 
E
L
 
V
S
 
S

4rxtA Crystal structure of carbohydrate transporter solute binding protein arad_9553 from agrobacterium radiobacter, target efi-511541, in complex with d-arabinose
28% identity, 77% coverage: 72:318/320 of query aligns to 41:283/295 of 4rxtA

query
sites
4rxtA
G
 
G
T
 
A
A
 
Q
T
 
A
E
|
E
A
 
T
D
 
D
T
 
V
A
 
N
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
R
 
S
I
 
I
V
 
L
D
 
E
D
 
N
L
 
A
I
 
V
K
 
A
A
 
G
K
 
K
M
 
P
N
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
I
A
 
S
P
 
P
S
 
T
G
 
E
S
 
F
K
 
K
P
 
A
L
 
L
T
 
G
A
 
K
V
 
P
V
 
V
A
 
D
R
 
E
A
 
A
I
 
A
K
 
K
A
 
S
G
 
-
I
 
V
I
 
P
V
 
I
V
 
I
S
 
G
I
 
I
D
|
D
N
 
S
P
 
G
L
 
A
D
 
D
D
 
-
A
 
-
S
 
-
Q
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
S
K
 
K
I
 
A
S
 
F
V
 
K
P
 
S
F
 
F
V
 
L
G
 
T
P
 
T
D
 
D
N
 
N
R
 
T
K
 
Q
G
 
G
A
 
G
T
 
R
L
 
I
V
 
A
A
 
A
N
 
D
Y
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
A
L
 
I
Q
 
K
A
 
A
-
 
M
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
V
V
 
V
G
 
-
I
 
I
I
 
I
E
 
T
G
 
N
I
 
T
A
 
P
A
 
G
D
 
A
R
 
G
N
x
S
A
 
L
Q
 
E
E
 
Q
R
|
R
T
 
R
A
 
T
G
 
G
Y
 
F
R
 
L
D
 
D
V
 
Q
M
 
V
S
 
K
T
 
T
-
 
K
-
 
Y
A
 
P
G
 
G
M
 
L
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
D
Q
 
K
A
 
Y
A
 
A
D
 
D
W
 
G
E
 
Q
Y
 
A
G
 
T
K
 
T
G
 
G
R
 
L
D
 
N
V
 
I
A
 
M
S
 
T
K
 
D
M
 
L
L
 
I
G
 
T
Q
 
A
H
 
N
P
 
P
Q
 
K
I
 
I
R
 
V
G
 
G
L
 
V
L
 
F
C
 
A
A
 
S
N
|
N
D
 
L
N
 
I
M
 
M
A
 
A
M
 
Q
G
 
G
A
 
V
A
 
G
D
 
Q
A
 
A
V
 
I
R
 
A
D
 
E
A
 
N
G
 
K
R
 
L
T
 
S
G
 
D
G
 
K
V
 
V
Y
 
K
I
 
V
T
 
I
G
 
G
Y
 
F
N
x
D
A
 
S
I
 
D
E
 
D
A
 
K
I
 
T
K
 
L
P
 
G
L
 
F
I
 
L
A
 
K
D
 
S
G
 
G
H
 
A
V
 
I
L
 
A
A
 
G
T
 
L
V
 
V
N
 
V
Q
|
Q
F
 
D
A
 
P
D
 
Y
R
 
R
Q
 
M
A
 
G
V
 
Y
F
 
D
G
 
G
M
 
I
D
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
L
K
 
-
A
 
A
V
 
V
T
 
S
E
 
-
Q
 
-
R
 
-
K
 
K
Q
 
G
R
 
E
E
 
K
L
 
V
S
 
E
R
 
A
T
 
N
I
 
V
E
 
D
T
 
T
P
 
G
L
 
A
Q
 
N
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
K
A
 
A

Sites not aligning to the query:

A0QYB5 D-threitol-binding protein from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
26% identity, 83% coverage: 54:320/320 of query aligns to 50:304/349 of A0QYB5

query
sites
A0QYB5
A
 
A
A
 
G
K
 
K
N
 
E
Y
 
G
Q
 
M
Q
 
D
H
 
A
Y
 
Y
A
 
A
S
 
K
Q
 
D
F
 
N
A
 
N
L
 
I
T
 
E
V
 
L
R
 
I
G
 
W
T
 
N
A
 
S
T
 
A
E
 
N
A
 
L
D
 
D
T
 
V
A
 
S
G
 
T
Q
 
Q
I
 
A
R
 
S
I
 
Q
V
 
V
D
 
D
D
 
S
L
 
M
I
 
I
K
 
N
A
 
Q
K
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
I
I
 
V
A
 
V
P
 
P
S
 
V
G
 
Q
S
 
A
K
 
D
P
 
S
L
 
L
T
 
A
A
 
P
V
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
S
A
 
A
I
 
K
K
 
A
A
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
P
V
 
L
V
 
V
S
 
P
I
 
V
D
x
N
N
 
A
P
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
-
A
 
-
S
 
S
Q
 
K
D
 
D
A
 
I
A
 
A
K
 
G
I
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
N
V
 
V
G
 
Q
P
 
P
D
 
D
N
 
D
R
 
V
K
 
A
G
 
A
A
 
G
T
 
A
L
 
Q
V
 
E
A
 
M
N
 
Q
Y
 
M
L
 
M
A
 
A
G
 
D
R
 
R
L
 
L
Q
 
G
A
 
G
G
 
K
D
 
G
Q
 
N
V
 
I
G
 
V
I
 
I
I
 
L
E
 
Q
G
 
G
I
 
P
A
 
L
A
 
G
D
 
Q
R
 
S
N
 
G
A
 
E
Q
 
L
E
 
D
R
|
R
T
 
S
A
 
K
G
 
G
Y
 
I
R
 
E
D
 
Q
V
 
V
M
 
L
S
 
A
T
 
K
-
 
Y
A
 
P
G
 
D
M
 
I
Q
 
K
V
 
V
V
 
L
A
 
A
T
 
K
Q
 
D
A
 
T
A
 
A
D
 
N
W
 
W
E
 
K
Y
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
R
D
 
D
V
 
E
A
 
A
S
 
V
K
 
N
M
 
K
L
 
M
-
 
K
-
 
N
-
 
W
-
 
I
-
 
S
G
 
G
Q
 
F
H
 
G
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
R
 
D
G
 
G
L
 
V
L
 
V
C
 
A
A
 
Q
N
|
N
D
 
D
N
 
D
M
 
M
A
 
G
M
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
L
D
 
Q
A
 
A
V
 
L
R
 
K
D
 
E
A
 
S
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
-
G
 
G
V
 
V
Y
 
P
I
 
I
T
 
V
G
 
G
Y
 
I
N
x
D
A
 
G
I
 
I
E
 
E
A
 
D
I
 
G
K
 
L
P
 
N
L
 
A
I
 
V
A
 
K
D
 
S
G
 
G
H
 
D
V
 
F
L
 
I
A
 
G
T
 
T
V
 
S
N
 
L
Q
|
Q
F
 
N
A
 
G
D
 
T
R
 
V
Q
 
E
A
 
L
V
 
A
F
 
A
G
 
G
M
 
L
D
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
N
K
 
R
A
 
L
V
 
A
T
 
K
E
 
G
Q
 
E
R
 
P
K
 
V
Q
 
N
R
 
K
E
 
E
L
 
-
S
 
-
R
 
-
T
 
-
I
 
-
E
 
-
T
 
-
P
 
P
L
 
V
Q
 
Y
L
 
I
V
 
M
T
 
P
A
 
A
A
 
I
T
 
T
R
 
K

Sites not aligning to the query:

4rsmA Crystal structure of carbohydrate transporter msmeg_3599 from mycobacterium smegmatis str. Mc2 155, target efi-510970, in complex with d-threitol (see paper)
28% identity, 74% coverage: 54:291/320 of query aligns to 18:250/315 of 4rsmA

query
sites
4rsmA
A
 
A
A
 
G
K
 
K
N
 
E
Y
 
G
Q
 
M
Q
 
D
H
 
A
Y
 
Y
A
 
A
S
 
K
Q
 
D
F
 
N
A
 
N
L
 
I
T
 
E
V
 
L
R
 
I
G
 
W
T
 
N
A
 
S
T
 
A
E
 
N
A
 
L
D
 
D
T
 
V
A
 
S
G
 
T
Q
 
Q
I
 
A
R
 
S
I
 
Q
V
 
V
D
 
D
D
 
S
L
 
M
I
 
I
K
 
N
A
 
Q
K
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
I
I
 
V
A
 
V
P
 
P
S
 
V
G
 
Q
S
 
A
K
 
D
P
 
S
L
 
L
T
 
A
A
 
P
V
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
S
A
 
A
I
 
K
K
 
A
A
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
P
V
 
L
V
 
V
S
 
P
I
 
V
D
x
N
N
 
A
P
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
-
A
 
-
S
 
S
Q
 
K
D
 
D
A
 
I
A
 
A
K
 
G
I
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
N
V
 
V
G
 
Q
P
 
P
D
 
D
N
 
D
R
 
V
K
 
A
G
 
A
A
 
G
T
 
A
L
 
Q
V
 
E
A
 
M
N
 
Q
Y
 
M
L
 
M
A
 
A
G
 
D
R
 
R
L
 
L
Q
 
G
A
 
G
G
 
K
D
 
G
Q
 
N
V
 
I
G
 
V
I
 
I
I
 
L
E
 
Q
G
 
G
I
 
P
A
 
L
A
 
G
D
 
Q
R
 
S
N
 
G
A
 
E
Q
 
L
E
 
D
R
|
R
T
 
S
A
 
K
G
 
G
Y
 
I
R
 
E
D
 
Q
V
 
V
M
 
L
S
 
A
T
 
K
-
 
Y
A
 
P
G
 
D
M
 
I
Q
 
K
V
 
V
V
 
L
A
 
A
T
 
K
Q
 
D
A
 
T
A
 
A
D
 
N
W
|
W
E
 
K
Y
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
R
D
 
D
V
 
E
A
 
A
S
 
V
K
 
N
M
 
K
L
 
M
-
 
K
-
 
N
-
 
W
-
 
I
-
 
S
G
 
G
Q
 
F
H
 
G
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
R
 
D
G
 
G
L
 
V
L
 
V
C
 
A
A
 
Q
N
|
N
D
 
D
N
 
D
M
 
M
A
 
G
M
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
L
D
 
Q
A
 
A
V
 
L
R
 
K
D
 
E
A
 
S
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
-
G
 
G
V
 
V
Y
 
P
I
 
I
T
 
V
G
 
G
Y
 
I
N
x
D
A
 
G
I
 
I
E
 
E
A
 
D
I
 
G
K
 
L
P
 
N
L
 
A
I
 
V
A
 
K
D
 
S
G
 
G
H
 
D
V
 
F
L
 
I
A
 
G
T
 
T
V
 
S
N
 
L
Q
|
Q
F
 
N
A
 
G
D
 
T
R
 
V
Q
 
E
A
 
L
V
 
A
F
 
A
G
 
G
M
 
L
D
 
A
V
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2x7xA Fructose binding periplasmic domain of hybrid two component system bt1754 (see paper)
24% identity, 67% coverage: 47:260/320 of query aligns to 2:219/301 of 2x7xA

query
sites
2x7xA
F
 
F
T
 
R
V
 
I
A
 
G
M
 
V
A
 
A
N
 
Q
A
 
C
A
 
S
K
 
D
N
x
D
Y
 
S
Q
x
W
Q
x
R
H
 
H
Y
 
K
A
 
M
S
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
I
-
 
L
Q
 
R
F
 
E
A
 
A
L
 
M
T
 
F
V
 
Y
R
 
N
G
 
G
T
 
V
A
 
S
T
 
V
E
 
E
A
 
I
D
 
R
T
 
S
A
 
A
G
 
G
-
 
D
-
 
D
-
 
N
-
 
S
-
 
K
Q
 
Q
I
 
A
R
 
E
I
 
D
V
 
V
D
 
H
D
 
Y
L
 
F
I
 
M
K
 
D
A
 
E
K
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
L
I
 
L
V
 
I
I
 
I
A
 
S
P
 
A
S
 
N
G
 
E
S
 
A
K
 
A
P
 
P
L
 
M
T
 
T
A
 
P
V
 
I
V
 
V
A
 
E
R
 
E
A
 
A
I
 
Y
K
 
Q
A
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
L
I
 
V
D
|
D
N
x
R
P
 
K
L
 
I
D
 
L
D
 
S
A
 
D
S
 
K
Q
 
Y
D
 
T
A
 
A
A
 
-
K
 
-
I
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
Y
V
 
I
G
 
G
P
 
A
D
 
D
N
 
N
R
 
Y
K
 
E
G
 
I
A
 
G
T
 
R
L
 
S
V
 
V
A
 
G
N
 
N
Y
 
Y
L
 
I
A
 
A
G
 
S
R
 
S
L
 
L
Q
 
K
A
 
G
G
 
K
D
 
G
Q
 
N
V
 
I
G
 
V
I
 
E
I
 
L
E
 
T
G
 
G
I
 
L
A
 
S
A
 
G
D
 
S
R
 
T
N
x
P
A
 
A
Q
 
M
E
 
E
R
|
R
T
 
H
A
 
Q
G
 
G
Y
 
F
R
 
M
D
 
A
V
 
A
M
 
I
S
 
S
T
 
K
-
 
F
A
 
P
G
 
D
M
 
I
Q
 
K
V
 
L
V
 
I
A
 
D
T
 
K
Q
 
A
A
 
D
A
 
A
D
 
A
W
|
W
E
 
E
Y
 
R
G
 
G
K
 
P
G
 
A
R
 
E
D
 
I
V
 
E
A
 
M
S
 
D
K
 
S
M
 
M
L
 
L
G
 
R
Q
 
R
H
 
H
P
 
P
Q
 
K
I
 
I
R
 
D
G
 
A
L
 
V
L
 
Y
C
 
A
A
 
H
N
|
N
D
 
D
N
x
R
M
 
I
A
 
A
M
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
Y
D
 
Q
A
 
A
V
 
A
R
 
K
D
 
M
A
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
E
G
 
K
G
 
E
V
 
M
Y
 
I
I
 
F
T
 
V
G
 
G
Y
 
I
N
x
D
A
 
A
I
 
L

Query Sequence

>H281DRAFT_03822 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_03822
MTQEMRRRVLIAGALAAAGLTRAAGAATVEGGMPKIALVLKSINDPFTVAMANAAKNYQQ
HYASQFALTVRGTATEADTAGQIRIVDDLIKAKMNAIVIAPSGSKPLTAVVARAIKAGII
VVSIDNPLDDASQDAAKISVPFVGPDNRKGATLVANYLAGRLQAGDQVGIIEGIAADRNA
QERTAGYRDVMSTAGMQVVATQAADWEYGKGRDVASKMLGQHPQIRGLLCANDNMAMGAA
DAVRDAGRTGGVYITGYNAIEAIKPLIADGHVLATVNQFADRQAVFGMDVALKAVTEQRK
QRELSRTIETPLQLVTAATR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory