SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_03942 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_03942 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6tg9A Cryo-em structure of nadh reduced form of NAD+-dependent formate dehydrogenase from rhodobacter capsulatus (see paper)
68% identity, 94% coverage: 38:960/983 of query aligns to 8:938/949 of 6tg9A

query
sites
6tg9A
D
 
D
Y
 
M
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
K
R
 
R
H
 
E
A
 
G
D
 
-
I
 
A
D
 
P
V
 
V
T
 
H
L
 
L
E
 
T
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
V
A
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
T
 
T
S
 
S
V
 
V
M
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
A
I
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
I
N
 
S
V
 
I
P
 
P
K
 
K
L
 
L
C
|
C
A
 
A
T
 
T
D
 
D
S
 
N
L
 
V
E
 
E
P
 
P
F
x
V
G
|
G
S
 
S
C
|
C
R
 
R
L
 
L
C
|
C
L
 
M
V
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
G
 
G
K
 
M
R
 
R
G
 
G
Y
 
T
P
 
P
A
 
T
S
 
S
C
|
C
T
 
T
T
 
T
P
 
P
V
 
V
E
 
A
A
 
P
G
 
G
M
 
M
K
 
R
V
 
V
R
 
H
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
D
 
P
R
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
S
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
R
N
 
G
V
 
V
M
 
M
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
I
 
I
S
 
S
D
 
D
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
 
D
C
|
C
L
 
L
T
 
T
C
|
C
P
 
A
A
|
A
N
 
N
G
 
G
D
 
D
C
|
C
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
M
 
M
A
 
A
G
 
G
V
 
A
T
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
R
E
 
E
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
-
 
Q
-
 
A
-
 
K
-
 
D
-
 
T
-
 
H
-
 
F
-
 
A
-
 
R
-
 
R
G
 
D
I
 
A
D
 
T
G
 
G
A
 
P
N
 
N
H
 
P
L
 
R
Q
 
Y
D
 
I
K
 
P
K
 
K
D
 
D
E
 
N
S
 
S
N
 
N
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
T
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
A
 
A
K
 
K
C
|
C
I
|
I
V
|
V
C
|
C
N
x
M
R
 
R
C
|
C
V
 
V
R
 
R
A
 
A
C
|
C
E
 
E
E
 
E
T
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
L
T
 
T
I
 
V
A
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
F
E
 
D
S
 
A
R
 
R
V
x
I
A
 
S
A
 
P
S
 
A
E
 
A
N
 
P
Q
 
D
P
 
-
F
 
F
M
 
L
E
 
S
S
 
S
E
 
D
C
|
C
V
 
V
S
|
S
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
V
 
V
S
 
Q
A
 
A
C
|
C
P
 
P
T
|
T
A
|
A
T
 
T
L
 
L
Q
 
V
E
 
E
K
 
K
T
 
S
V
 
V
V
 
E
M
 
R
L
 
I
G
 
G
Q
 
T
A
 
P
E
 
E
H
 
R
S
 
K
V
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
T
C
|
C
A
 
A
Y
|
Y
C
|
C
G
 
G
V
|
V
G
 
G
C
|
C
S
 
S
F
|
F
K
 
E
A
 
A
E
 
H
M
 
M
K
 
L
G
 
G
N
 
D
Q
 
Q
V
 
L
V
 
V
R
 
R
M
 
M
V
 
V
P
 
P
F
 
W
K
 
K
N
 
G
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
N
 
N
E
 
R
G
 
G
H
 
H
A
 
S
C
|
C
V
 
V
K
|
K
G
 
G
R
 
R
F
 
F
A
 
A
W
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
H
 
H
K
 
Q
D
 
D
R
 
R
I
 
I
T
 
L
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
R
 
R
A
 
D
K
 
K
I
 
I
T
 
T
D
 
D
P
 
P
W
 
W
R
 
R
E
 
E
V
 
V
S
 
N
W
 
W
E
 
T
E
 
E
A
 
A
I
 
L
N
 
D
Y
 
F
A
 
T
A
 
A
S
 
T
E
 
R
F
 
L
R
 
R
R
 
A
I
 
L
Q
 
R
A
 
D
K
 
S
H
 
H
G
 
G
R
 
A
D
 
D
S
 
A
I
 
L
G
 
G
G
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
S
 
S
R
|
R
C
|
C
T
 
T
N
 
N
E
 
E
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
L
 
L
V
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
V
F
 
F
G
 
G
N
 
T
N
 
N
N
 
N
V
 
T
D
 
D
T
 
T
C
 
C
A
 
A
R
 
R
V
 
V
C
|
C
H
|
H
S
 
S
P
 
P
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
Q
T
 
T
L
 
F
G
 
G
E
 
T
S
 
S
A
 
A
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
T
 
D
F
 
F
A
 
D
S
 
S
V
 
V
D
 
E
K
 
E
A
 
T
D
 
D
V
 
L
I
 
A
M
 
L
V
 
V
I
 
I
G
|
G
A
|
A
N
 
N
P
 
P
T
 
T
D
|
D
G
|
G
H
|
H
P
 
P
V
|
V
F
 
F
G
 
A
S
 
S
R
 
R
L
 
L
K
 
R
R
 
K
R
 
R
V
 
L
R
 
R
E
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
I
 
I
V
 
V
V
 
V
D
 
D
P
|
P
R
|
R
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
L
V
 
L
D
 
N
T
 
T
P
 
P
H
 
H
V
 
R
K
 
G
A
 
E
S
 
A
H
 
W
H
 
H
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
R
 
K
P
|
P
G
 
G
T
 
T
N
|
N
V
 
V
A
 
A
I
 
V
V
 
M
N
 
T
A
 
A
L
 
M
A
 
A
H
 
H
V
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
E
 
E
G
 
Q
L
 
I
L
 
F
N
 
D
E
 
K
A
 
R
F
 
F
I
 
I
S
 
G
E
 
D
R
 
R
C
 
C
E
 
D
G
 
-
R
 
-
A
 
-
F
 
W
D
 
D
Q
 
E
W
 
W
R
 
A
D
 
D
-
 
Y
-
 
A
-
 
E
F
 
F
V
 
V
A
 
A
L
 
N
P
 
P
E
 
E
N
 
Y
A
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
T
 
V
E
 
E
A
 
S
V
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
K
 
G
D
 
L
V
 
L
R
 
R
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
A
Y
 
Y
A
 
A
T
 
A
G
 
A
G
 
P
N
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
L
|
L
G
|
G
V
 
V
T
 
T
E
 
E
H
|
H
A
 
S
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
T
 
T
M
 
T
V
 
V
M
 
I
G
 
A
I
 
I
A
 
A
N
 
N
L
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
M
T
 
T
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
R
 
R
E
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
P
 
P
L
 
L
R
 
R
G
|
G
Q
|
Q
N
 
N
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
C
 
C
D
 
D
M
 
M
G
 
G
S
 
S
F
 
F
P
 
P
H
 
H
E
 
E
L
 
F
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
H
 
H
I
 
V
S
 
S
D
 
D
T
 
D
I
 
A
V
 
T
R
 
R
S
 
G
Q
 
L
F
 
F
E
 
E
D
 
R
A
 
T
W
 
W
N
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
Q
 
S
T
 
S
E
 
E
P
 
P
G
 
G
L
 
L
R
 
R
I
 
I
P
 
P
N
 
N
M
 
M
F
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
V
D
 
E
G
 
G
S
 
R
F
 
F
M
 
K
G
 
A
L
 
L
Y
 
Y
C
 
V
Q
 
Q
G
|
G
E
|
E
D
 
D
I
 
I
V
 
L
Q
 
Q
S
|
S
D
 
D
P
 
P
N
 
D
T
 
T
H
 
R
H
 
H
V
 
V
A
 
S
A
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
A
S
 
A
M
 
M
E
 
D
C
 
L
I
 
V
V
 
I
V
 
V
Q
 
H
D
 
D
I
 
L
F
 
F
L
 
L
N
|
N
E
 
E
T
 
T
A
 
A
K
 
N
Y
 
Y
A
 
A
H
 
H
V
 
V
L
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
G
S
|
S
T
 
T
F
 
F
L
 
L
E
 
E
K
|
K
D
 
D
G
 
G
T
 
T
F
 
F
T
 
T
N
 
N
A
 
A
E
 
E
R
 
R
R
 
R
I
 
I
S
 
N
R
 
R
V
 
V
R
 
R
K
 
R
V
 
V
M
 
M
P
 
A
P
 
P
V
 
K
P
 
A
G
 
G
Y
 
F
A
 
A
D
|
D
W
 
W
E
 
E
V
 
V
T
 
T
L
 
Q
L
 
M
L
 
L
S
 
A
R
 
N
A
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
A
E
 
G
M
 
W
D
 
H
Y
 
Y
A
 
T
H
 
H
P
 
P
S
 
S
E
 
E
I
 
I
M
 
M
D
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
A
L
 
T
T
 
T
P
 
P
T
 
G
F
 
F
H
 
A
G
 
A
V
 
V
S
 
T
Y
 
Y
K
 
E
K
 
M
I
 
L
D
 
D
E
 
A
L
 
R
G
 
G
S
 
S
I
 
V
Q
 
Q
W
 
W
P
 
P
C
 
C
N
 
N
E
 
E
E
 
K
A
 
A
P
 
P
D
 
E
G
 
G
T
 
S
P
 
P
T
 
I
M
 
M
H
 
H
I
 
V
D
 
E
T
 
G
F
 
F
V
 
V
R
 
R
G
 
G
K
 
K
G
 
G
K
 
R
F
 
F
V
 
I
I
 
R
T
 
T
K
 
A
F
 
Y
I
 
L
A
 
P
S
 
T
P
 
D
E
 
E
K
 
K
V
 
T
T
 
G
R
 
P
K
 
R
F
 
F
P
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
L
T
|
T
T
|
T
G
 
G
R
|
R
I
|
I
L
|
L
S
 
S
Q
 
Q
Y
 
Y
N
|
N
V
|
V
G
 
G
A
 
A
Q
|
Q
T
 
T
R
 
R
R
 
R
T
 
T
E
 
E
N
 
N
S
 
T
R
 
V
W
 
W
H
 
H
D
 
G
E
 
E
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
I
H
 
H
P
 
P
H
 
T
D
 
D
A
 
A
E
 
E
E
 
T
R
 
R
G
 
G
I
 
I
K
 
R
T
 
D
G
 
G
D
 
D
W
 
W
V
 
V
G
 
R
I
 
L
E
 
A
S
 
S
R
 
R
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
T
 
T
V
 
T
L
 
L
R
 
R
A
 
A
K
 
T
V
 
V
T
 
T
E
 
D
R
 
R
M
 
V
Q
 
S
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
T
 
T
F
 
F
H
 
H
F
 
H
P
 
P
E
 
D
S
 
T
G
 
Q
A
 
A
N
|
N
V
 
V
I
 
V
T
 
T
T
 
T
D
 
D
S
 
T
S
 
S
D
 
D
W
 
W
A
 
A
T
 
T
N
 
N
C
 
C
P
 
P
E
 
E
Y
|
Y
K
|
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
M
 
A
P
 
A
V
 
S
E
 
N
Q
 
G
P
 
P
S
 
S
Q
 
D
W
 
W
Q
 
Q
K
 
Q
E
 
D
Y
 
Y

7vw6A Cryo-em structure of formate dehydrogenase 1 from methylorubrum extorquens am1 (see paper)
36% identity, 92% coverage: 50:949/983 of query aligns to 2:912/913 of 7vw6A

query
sites
7vw6A
V
 
I
T
 
A
L
 
F
E
 
E
I
 
F
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
A
 
Q
V
 
V
T
 
E
V
 
A
P
 
Q
A
 
P
G
 
G
T
 
E
S
 
T
V
 
I
M
 
W
R
 
A
A
 
V
A
 
A
I
 
K
E
 
R
A
 
L
G
 
G
V
 
T
N
 
H
V
 
I
P
 
P
K
x
H
L
 
L
C
|
C
-
x
H
-
 
K
A
 
P
T
 
D
D
 
P
S
 
G
L
 
Y
E
 
R
P
 
P
F
 
D
G
|
G
S
 
N
C
|
C
R
|
R
L
 
A
C
|
C
L
 
M
V
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
G
 
G
K
 
E
R
 
R
G
 
V
Y
 
L
P
 
A
A
 
A
S
 
S
C
|
C
T
 
K
T
 
R
P
 
T
V
 
P
E
 
A
A
 
I
G
 
G
M
 
M
K
 
K
V
 
V
R
 
K
T
 
S
Q
 
A
S
 
T
D
 
E
R
 
R
L
 
A
Q
 
T
S
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
A
N
 
M
V
 
V
M
 
L
E
 
E
L
 
L
Y
 
L
I
 
V
S
 
A
D
 
D
H
 
Q
P
 
P
L
 
E
D
 
R
C
 
A
L
 
T
T
 
S
C
 
H
P
 
D
A
 
P
N
 
S
G
 
S
D
 
H
C
 
F
E
 
W
L
 
V
Q
 
Q
D
 
-
M
 
-
A
 
A
G
 
D
V
 
V
T
 
L
G
 
D
L
 
V
R
 
T
E
 
E
V
 
S
R
 
R
Y
 
F
G
 
-
I
 
-
D
 
P
G
 
A
A
 
A
N
 
E
H
 
R
L
 
W
Q
 
-
D
 
-
K
 
T
K
 
S
D
 
D
E
 
V
S
 
S
N
 
H
P
 
P
Y
 
A
F
 
M
T
 
S
Y
 
V
D
 
N
P
 
L
A
 
D
K
 
A
C
|
C
I
|
I
V
x
Q
C
|
C
N
|
N
R
 
L
C
|
C
V
 
V
R
 
R
A
 
A
C
|
C
E
 
R
E
 
E
T
 
V
Q
 
Q
G
 
V
T
x
N
F
 
D
A
x
V
L
x
I
T
 
G
I
 
M
A
 
A
G
 
Y
R
 
R
G
 
A
F
 
A
E
 
G
S
 
S
R
 
K
V
|
V
A
 
V
A
 
F
S
 
D
E
 
F
N
 
D
Q
 
D
P
 
P
F
 
M
M
 
G
E
 
G
S
 
S
E
 
T
C
|
C
V
|
V
S
x
A
C
|
C
G
|
G
A
 
E
C
|
C
V
 
V
S
 
Q
A
 
A
C
|
C
P
|
P
T
|
T
A
 
G
T
x
A
L
|
L
Q
 
M
E
 
P
K
 
A
T
 
A
V
 
Y
V
 
L
M
 
D
L
 
A
G
 
N
Q
 
Q
A
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
V
-
 
Y
-
 
P
E
 
D
H
 
R
S
 
E
V
 
V
V
 
K
T
 
S
T
 
L
C
|
C
A
 
P
Y
 
Y
C
|
C
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
|
C
S
 
Q
F
 
V
K
 
S
A
 
Y
E
 
K
M
 
V
K
 
K
G
 
D
N
 
E
Q
 
R
V
 
I
V
 
V
R
 
-
M
 
Y
V
 
A
P
 
E
F
 
G
K
 
V
N
 
N
G
 
G
Q
 
P
A
 
A
N
 
N
E
 
Q
G
 
N
H
 
R
A
 
L
C
|
C
V
 
V
K
|
K
G
|
G
R
 
R
F
 
F
A
 
G
W
 
F
G
 
D
Y
 
Y
A
 
V
T
 
H
H
 
H
K
 
P
D
 
H
R
 
R
I
 
L
T
 
T
K
 
V
P
 
P
M
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
L
K
 
E
-
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
N
-
 
D
-
 
Q
-
 
V
-
 
D
I
 
P
T
 
A
D
 
N
P
 
P
W
 
W
-
 
T
-
 
H
-
 
F
R
 
R
E
 
E
V
 
A
S
 
T
W
 
W
E
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
L
N
 
D
Y
 
R
A
 
A
A
 
A
S
 
G
E
 
G
F
 
L
R
 
K
R
 
A
I
 
I
Q
 
R
A
 
D
K
 
T
H
 
N
G
 
G
R
 
R
D
 
K
S
 
A
I
 
L
G
 
A
G
 
G
I
 
F
T
 
G
S
 
S
S
 
A
R
x
K
C
 
G
T
 
S
N
 
N
E
 
E
E
 
E
T
 
A
Y
 
Y
L
 
L
V
 
F
Q
 
Q
K
 
K
L
 
L
V
 
V
R
 
R
A
 
L
A
 
G
F
 
F
G
 
G
N
 
T
N
 
N
N
 
N
V
 
V
D
 
D
T
 
H
C
|
C
A
 
T
R
 
R
V
 
L
C
|
C
H
 
H
S
 
A
P
 
S
T
 
S
G
 
V
Y
 
A
G
 
A
L
 
L
K
 
M
T
 
E
T
 
G
L
 
L
G
 
N
E
 
S
S
 
G
A
 
A
G
 
V
T
 
T
Q
 
A
T
 
P
F
 
F
A
 
S
S
 
A
V
 
A
D
 
L
K
 
D
A
 
A
D
 
E
V
 
V
I
 
I
M
 
V
V
 
V
I
 
I
G
|
G
A
 
A
N
|
N
P
 
P
T
 
T
D
 
V
G
x
N
H
 
H
P
 
P
V
|
V
F
 
A
G
 
A
S
 
T
R
 
F
L
 
L
K
 
K
R
 
N
R
 
A
V
 
V
R
 
K
E
 
Q
-
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
I
 
I
V
 
I
V
 
M
D
|
D
P
|
P
R
|
R
R
 
R
I
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
Q
T
 
T
P
 
L
H
 
S
V
 
R
K
 
H
A
 
A
S
 
Y
H
 
R
H
 
H
L
 
L
Q
 
A
L
x
F
R
 
R
P
 
P
G
|
G
T
 
S
N
x
D
V
 
V
A
 
A
I
 
M
V
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
M
A
 
L
H
 
N
V
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
N
 
D
E
 
E
A
 
Q
F
 
Y
I
 
I
S
 
A
E
 
G
R
 
Y
C
 
T
E
 
E
G
 
N
R
 
-
A
 
-
F
 
F
D
 
E
Q
 
A
W
 
L
R
 
R
D
 
E
F
 
K
V
 
I
A
 
V
L
 
-
P
 
-
E
 
D
N
 
F
A
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
K
T
 
M
E
 
A
A
 
S
V
 
V
T
 
C
G
 
G
V
 
I
P
 
D
A
 
A
K
 
E
D
 
T
V
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
V
A
 
A
R
 
R
I
 
L
Y
 
Y
A
 
A
T
 
R
G
 
A
G
 
K
N
 
S
A
 
S
A
 
L
I
 
I
Y
 
F
Y
 
W
G
|
G
L
x
M
G
|
G
V
 
V
T
 
S
E
x
Q
H
|
H
A
 
V
Q
 
H
G
 
G
S
 
T
T
 
D
M
 
N
V
 
S
M
 
R
G
 
C
I
 
L
A
 
I
N
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
L
A
 
I
T
 
T
G
 
G
N
 
Q
I
 
I
G
 
G
R
 
R
E
 
P
G
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
H
P
 
P
L
 
L
R
 
R
G
|
G
Q
|
Q
N
 
N
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
S
 
A
C
 
S
D
 
D
M
 
A
G
 
G
S
 
L
F
 
I
P
 
P
H
 
M
E
 
V
L
 
Y
P
 
P
G
 
D
Y
 
Y
R
 
Q
H
 
S
I
 
V
S
 
E
D
 
K
T
 
D
I
 
A
V
 
V
R
 
R
S
 
E
Q
 
L
F
 
F
E
 
E
D
 
E
A
 
F
W
 
W
N
 
G
V
 
Q
T
 
S
L
 
L
Q
 
D
T
 
P
E
 
Q
P
 
K
G
 
G
L
 
L
R
 
T
I
 
V
P
 
V
N
 
E
M
 
I
F
 
M
E
 
R
A
 
A
A
 
I
L
 
H
D
 
A
G
 
G
S
 
E
F
 
I
M
 
R
G
 
G
L
 
M
Y
 
F
C
 
V
Q
 
E
G
|
G
E
 
E
D
x
N
I
 
P
V
 
A
Q
 
M
S
|
S
D
 
D
P
 
P
N
 
D
T
 
L
H
 
N
H
 
H
V
 
A
A
 
R
A
 
H
A
 
A
L
 
L
S
 
A
S
 
M
M
 
L
E
 
D
C
 
H
I
 
L
V
 
V
V
 
V
Q
|
Q
D
|
D
I
x
L
F
 
F
L
 
L
N
 
T
E
 
E
T
 
T
A
 
A
K
 
F
Y
 
H
A
 
A
H
 
D
V
 
V
L
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
A
S
 
S
T
 
A
F
 
F
L
 
A
E
 
E
K
 
K
D
 
A
G
 
G
T
 
T
F
 
F
T
 
T
N
 
N
A
 
T
E
 
D
R
 
R
R
 
R
I
 
V
S
 
Q
R
 
I
V
 
A
R
 
Q
K
 
P
V
 
V
M
 
V
P
 
A
P
 
P
V
 
-
P
 
P
G
 
G
Y
 
D
A
 
A
-
 
R
-
 
Q
D
 
D
W
 
W
E
 
W
V
 
I
T
 
I
L
 
Q
L
 
E
L
 
L
S
 
A
R
 
R
A
 
R
L
 
L
G
 
D
Y
 
L
E
 
D
M
 
W
D
 
N
Y
 
Y
A
 
G
H
 
G
P
 
P
S
 
A
E
 
D
I
 
I
M
 
F
D
 
A
E
 
E
I
 
M
A
 
A
R
 
Q
L
 
V
T
 
M
P
 
P
T
 
S
F
 
L
H
 
N
G
 
N
V
 
I
S
 
T
Y
 
W
K
 
E
K
 
R
I
 
L
D
 
E
E
 
R
L
 
E
G
 
G
S
 
A
I
 
V
Q
 
T
W
 
Y
P
 
P
C
 
V
N
 
D
E
 
A
E
 
P
A
 
D
P
 
Q
D
 
P
G
 
G
T
 
N
P
 
E
T
 
I
M
 
I
H
 
F
I
 
Y
D
 
A
T
 
G
F
 
F
V
 
P
-
 
T
-
 
E
R
 
S
G
 
G
K
 
R
G
 
A
K
 
K
F
 
I
V
 
V
I
 
P
T
 
A
K
 
A
F
 
I
I
 
V
A
 
P
S
 
P
P
 
D
E
 
E
K
 
V
V
 
P
T
 
D
R
 
D
K
 
E
F
 
F
P
 
P
L
 
M
L
 
V
L
 
L
T
 
S
T
|
T
G
 
G
R
|
R
I
x
V
L
|
L
S
 
E
Q
x
H
Y
x
W
N
x
H
V
x
T
G
 
G
A
 
S
Q
x
M
T
 
T
R
 
R
R
 
R
T
 
A
E
 
G
N
 
V
-
 
L
S
 
D
R
 
A
W
 
L
H
 
E
D
 
P
E
 
E
D
 
A
R
 
V
L
 
A
E
 
F
L
 
M
H
 
A
P
 
P
H
 
K
D
 
E
A
 
L
E
 
Y
E
 
R
R
 
L
G
 
G
I
 
L
K
 
R
T
 
P
G
 
G
D
 
G
W
 
S
V
 
M
G
 
R
I
 
L
E
 
E
S
 
T
R
 
R
A
 
R
G
 
G
Q
 
A
T
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
A
 
V
K
 
R
V
 
S
T
 
D
E
 
R
R
 
D
M
 
V
Q
 
P
P
 
I
G
 
G
V
 
M
V
 
I
Y
 
F
T
 
M
T
 
P
F
|
F
H
 
C
F
 
Y
P
 
A
E
 
E
S
 
A
G
 
A
A
 
A
N
|
N
V
 
L
I
 
L
T
 
T
T
 
N
D
 
P
S
 
A
S
 
L
D
 
D
W
 
P
A
 
L
T
 
G
N
 
K
C
 
I
P
 
P
E
 
E
Y
x
F
K
|
K
V
 
F
T
 
C
A
 
A
V
 
A
Q
 
R
V
 
V
M
 
V
P
 
P

1fdiA Oxidized form of formate dehydrogenase h from e. Coli complexed with the inhibitor nitrite (see paper)
37% identity, 72% coverage: 270:974/983 of query aligns to 4:708/715 of 1fdiA

query
sites
1fdiA
V
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
V
C
|
C
A
 
P
Y
|
Y
C
|
C
G
 
A
V
x
S
G
 
G
C
|
C
S
 
K
F
 
I
K
 
N
A
 
L
E
 
V
M
 
V
K
 
D
G
 
N
N
 
G
Q
 
K
V
 
I
V
 
V
R
 
R
M
 
-
V
 
A
P
 
E
F
 
A
K
 
A
N
 
Q
G
 
G
Q
 
K
A
 
T
N
 
N
E
 
Q
G
 
G
H
 
T
A
x
L
C
|
C
V
 
L
K
|
K
G
 
G
R
 
Y
F
 
Y
A
 
G
W
 
W
G
 
D
Y
 
F
A
 
I
T
 
N
H
 
D
K
 
T
D
 
Q
-
 
I
-
 
L
-
 
T
-
 
P
R
 
R
I
 
L
T
 
K
K
 
T
P
 
P
M
 
M
I
 
I
R
 
R
A
 
R
K
 
Q
I
 
R
T
 
G
D
 
G
P
 
K
W
 
L
R
 
E
E
 
P
V
 
V
S
 
S
W
 
W
E
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
L
N
 
N
Y
 
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
E
E
 
R
F
 
L
R
 
S
R
 
A
I
 
I
Q
 
K
A
 
E
K
 
K
H
 
Y
G
 
G
R
 
P
D
 
D
S
 
A
I
 
I
G
 
Q
G
 
T
I
 
T
T
 
G
S
|
S
S
 
S
R
|
R
C
x
G
T
 
T
-
 
G
N
 
N
E
 
E
E
 
T
T
 
N
Y
 
Y
L
 
V
V
 
M
Q
 
Q
K
 
K
L
 
F
V
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
V
F
 
I
G
 
G
N
 
T
N
 
N
N
 
N
V
 
V
D
|
D
T
 
C
C
 
C
A
 
A
R
 
R
V
|
V
C
|
C
H
|
H
S
 
G
P
 
P
T
 
S
G
 
V
Y
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
H
T
 
Q
T
 
S
L
 
V
G
 
G
E
 
N
S
 
G
A
 
A
G
 
M
T
 
S
Q
 
N
T
 
A
F
 
I
A
 
N
S
 
E
V
 
I
D
 
D
K
 
N
A
 
T
D
 
D
V
 
L
I
 
V
M
 
F
V
 
V
I
x
F
G
|
G
A
x
Y
N
|
N
P
 
P
T
 
A
D
|
D
G
x
S
H
 
H
P
|
P
V
x
I
F
 
V
G
 
A
S
 
N
R
 
H
L
 
V
K
 
I
R
 
N
R
 
A
V
 
K
R
 
R
E
 
N
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
I
I
 
I
V
 
V
V
x
C
D
|
D
P
|
P
R
|
R
R
 
K
I
 
I
D
 
E
I
 
T
V
 
A
D
 
R
T
 
I
P
 
-
H
 
-
V
 
-
K
 
-
A
 
A
S
 
D
H
 
M
H
 
H
L
 
I
Q
 
A
L
|
L
R
 
K
P
 
N
G
|
G
T
 
S
N
|
N
V
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
M
A
 
G
H
 
H
V
 
V
I
 
I
V
 
I
T
 
E
E
 
E
G
 
N
L
 
L
L
 
Y
N
 
D
E
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
V
S
 
A
E
 
S
R
 
R
C
 
T
E
 
E
G
 
G
R
 
-
A
 
-
F
 
F
D
 
E
Q
 
E
W
 
Y
R
 
R
D
 
K
F
 
I
V
 
V
A
 
E
L
 
-
P
 
-
E
 
G
N
 
Y
A
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
S
T
 
V
E
 
E
A
 
D
V
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
S
A
 
A
K
 
S
D
 
E
V
 
I
R
 
R
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
M
Y
 
Y
A
 
A
T
 
Q
G
 
A
G
 
K
N
 
S
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
L
Y
 
W
G
|
G
L
x
M
G
|
G
V
 
V
T
 
T
E
 
Q
H
x
F
A
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
S
 
V
T
 
E
M
 
T
V
 
V
M
 
R
G
 
S
I
 
L
A
 
T
N
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
N
I
 
L
G
 
G
R
 
K
E
 
P
G
 
H
V
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
N
P
 
P
L
 
V
R
|
R
G
|
G
Q
|
Q
N
 
N
N
 
N
V
|
V
Q
 
Q
G
 
G
S
 
A
C
 
C
D
 
D
M
 
M
G
 
G
S
 
A
F
 
L
P
 
P
H
 
D
E
 
T
L
 
Y
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
R
 
Q
H
 
Y
I
 
V
S
 
K
D
 
D
T
 
P
I
 
A
V
 
N
R
 
R
S
 
E
Q
 
K
F
 
F
E
 
A
D
 
K
A
 
A
W
 
W
N
 
G
V
 
V
-
 
E
T
 
S
L
 
L
Q
 
P
T
 
A
E
 
H
P
 
T
G
 
G
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
P
 
S
N
 
E
M
 
L
F
 
P
E
 
H
A
 
R
A
 
A
L
 
A
D
 
H
G
 
G
S
 
E
F
 
V
M
 
R
G
 
A
L
 
A
Y
 
Y
C
 
I
Q
 
M
G
|
G
E
|
E
D
 
D
I
 
P
V
 
L
Q
 
Q
S
x
T
D
 
D
P
 
A
N
 
E
T
 
L
H
 
S
H
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
K
A
 
A
L
 
F
S
 
E
S
 
D
M
 
L
E
 
E
C
 
L
I
 
V
V
 
I
V
 
V
Q
|
Q
D
|
D
I
|
I
F
 
F
L
 
M
N
 
T
E
 
K
T
 
T
A
 
A
K
 
S
Y
 
A
A
 
A
H
 
D
V
 
V
L
 
I
L
 
L
P
 
P
G
x
S
S
 
T
T
 
S
F
 
W
L
 
G
E
 
E
K
 
H
D
 
E
G
 
G
T
 
V
F
 
F
T
 
T
N
 
A
A
 
A
E
 
D
R
 
R
R
 
G
I
 
F
S
 
Q
R
 
R
V
 
F
R
 
F
K
 
K
-
 
A
V
 
V
M
 
E
P
 
P
P
 
K
V
 
W
P
 
D
G
 
L
Y
 
K
A
 
T
D
|
D
W
 
W
E
 
Q
V
 
I
T
 
I
L
 
S
L
 
E
L
 
I
S
 
A
R
 
T
A
 
R
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
E
 
P
M
 
M
D
 
H
Y
 
Y
A
 
N
H
 
N
P
 
T
S
 
Q
E
 
E
I
 
I
M
 
W
D
 
D
E
 
E
I
 
L
A
 
R
R
 
H
L
 
L
T
 
C
P
 
P
T
 
D
F
 
F
H
 
Y
G
 
G
V
 
A
S
 
T
Y
 
Y
K
 
E
K
 
K
I
 
M
D
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
S
 
F
I
 
I
Q
 
Q
W
 
W
P
 
P
C
 
C
N
 
R
E
 
D
-
 
T
-
 
S
E
 
D
A
 
A
P
 
D
D
 
Q
G
 
G
T
 
T
P
 
S
T
 
Y
M
 
L
H
 
F
I
 
K
D
 
E
T
 
K
F
 
F
-
 
D
-
 
T
V
 
P
R
 
N
G
 
G
K
 
L
G
 
A
K
 
Q
F
 
F
V
 
F
I
 
T
T
 
C
K
 
D
F
 
W
I
 
V
A
 
A
S
 
P
P
 
I
E
 
D
K
 
K
V
 
L
T
 
T
R
 
D
K
 
E
F
 
Y
P
 
P
L
 
M
L
 
V
L
 
L
T
 
S
T
|
T
G
x
V
R
|
R
I
x
E
L
 
V
S
 
G
Q
x
H
Y
|
Y
N
x
S
V
x
C
G
 
R
A
 
S
Q
 
M
T
 
T
R
 
G
R
 
N
T
 
C
E
 
A
N
 
A
-
 
L
S
 
A
R
 
A
W
 
L
H
 
A
D
 
D
E
 
E
-
 
P
D
 
G
R
 
Y
L
 
A
E
 
Q
L
 
I
H
 
N
P
 
T
H
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
K
E
 
R
R
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
E
T
 
D
G
 
E
D
 
A
W
 
L
V
 
V
G
 
W
I
 
V
E
 
H
S
 
S
R
 
R
A
 
K
G
 
G
Q
 
K
T
 
I
V
 
I
L
 
T
R
 
R
A
 
A
K
 
Q
V
 
V
T
 
S
E
 
D
R
 
R
M
 
P
Q
 
N
P
 
K
G
 
G
V
 
A
V
 
I
Y
 
Y
T
 
M
T
 
T
F
x
Y
H
 
Q
F
 
W
P
 
W
E
 
I
S
 
G
G
 
A
A
 
C
N
|
N
V
 
E
I
 
L
T
 
V
T
 
T
D
 
E
S
 
N
S
 
L
D
 
S
W
 
P
A
 
I
T
 
T
N
 
K
C
 
T
P
 
P
E
 
E
Y
|
Y
K
|
K
V
 
Y
T
 
C
A
 
A
V
 
V
Q
 
R
V
 
V
M
 
E
P
 
P
V
 
I
E
 
A
Q
 
D
P
 
-
S
 
-
Q
 
-
W
 
-
Q
 
Q
K
 
R
E
 
A
Y
 
A
S
 
E
R
 
Q
F
 
Y
N
 
V
A
 
I
E
 
D
Q
 
E
L
 
Y
E
 
N
L
 
K
L
 
L
K
 
K
Q
 
T
R
 
R

P07658 Formate dehydrogenase H; Formate dehydrogenase-H subunit alpha; FDH-H; Formate-hydrogen-lyase-linked, selenocysteine-containing polypeptide; EC 1.17.98.4 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
37% identity, 72% coverage: 270:974/983 of query aligns to 4:708/715 of P07658

query
sites
P07658
V
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
V
C
|
C
A
 
P
Y
|
Y
C
|
C
G
 
A
V
 
S
G
 
G
C
|
C
S
 
K
F
 
I
K
 
N
A
 
L
E
 
V
M
 
V
K
 
D
G
 
N
N
 
G
Q
 
K
V
 
I
V
 
V
R
 
R
M
 
-
V
 
A
P
 
E
F
 
A
K
 
A
N
 
Q
G
 
G
Q
 
K
A
 
T
N
 
N
E
 
Q
G
 
G
H
 
T
A
 
L
C
|
C
V
 
L
K
|
K
G
 
G
R
 
Y
F
 
Y
A
 
G
W
 
W
G
 
D
Y
 
F
A
 
I
T
 
N
H
 
D
K
 
T
D
 
Q
-
 
I
-
 
L
-
 
T
-
 
P
R
 
R
I
 
L
T
 
K
K
 
T
P
 
P
M
 
M
I
 
I
R
 
R
A
 
R
K
 
Q
I
 
R
T
 
G
D
 
G
P
 
K
W
 
L
R
 
E
E
 
P
V
 
V
S
 
S
W
 
W
E
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
L
N
 
N
Y
 
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
E
E
 
R
F
 
L
R
 
S
R
 
A
I
 
I
Q
 
K
A
 
E
K
 
K
H
 
Y
G
 
G
R
 
P
D
 
D
S
 
A
I
 
I
G
 
Q
G
 
T
I
 
T
T
 
G
S
 
S
S
 
S
R
 
R
C
 
G
T
 
T
-
 
G
N
 
N
E
 
E
E
 
T
T
 
N
Y
 
Y
L
 
V
V
 
M
Q
 
Q
K
 
K
L
 
F
V
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
V
F
 
I
G
 
G
N
 
T
N
 
N
N
 
N
V
 
V
D
 
D
T
 
C
C
 
C
A
 
A
R
 
R
V
 
V
C
x
U
H
 
H
S
 
G
P
 
P
T
 
S
G
 
V
Y
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
H
T
 
Q
T
 
S
L
 
V
G
 
G
E
 
N
S
 
G
A
 
A
G
 
M
T
 
S
Q
 
N
T
 
A
F
 
I
A
 
N
S
 
E
V
 
I
D
 
D
K
 
N
A
 
T
D
 
D
V
 
L
I
 
V
M
 
F
V
 
V
I
 
F
G
 
G
A
 
Y
N
 
N
P
 
P
T
 
A
D
 
D
G
 
S
H
 
H
P
 
P
V
 
I
F
 
V
G
 
A
S
 
N
R
 
H
L
 
V
K
 
I
R
 
N
R
 
A
V
 
K
R
 
R
E
 
N
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
I
I
 
I
V
 
V
V
 
C
D
 
D
P
 
P
R
 
R
R
 
K
I
 
I
D
 
E
I
 
T
V
 
A
D
 
R
T
 
I
P
 
-
H
 
-
V
 
-
K
 
-
A
 
A
S
 
D
H
 
M
H
 
H
L
 
I
Q
 
A
L
 
L
R
 
K
P
 
N
G
 
G
T
 
S
N
 
N
V
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
M
A
 
G
H
 
H
V
 
V
I
 
I
V
 
I
T
 
E
E
 
E
G
 
N
L
 
L
L
 
Y
N
 
D
E
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
V
S
 
A
E
 
S
R
 
R
C
 
T
E
 
E
G
 
G
R
 
-
A
 
-
F
 
F
D
 
E
Q
 
E
W
 
Y
R
 
R
D
 
K
F
 
I
V
 
V
A
 
E
L
 
-
P
 
-
E
 
G
N
 
Y
A
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
S
T
 
V
E
 
E
A
 
D
V
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
S
A
 
A
K
 
S
D
 
E
V
 
I
R
 
R
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
M
Y
 
Y
A
 
A
T
 
Q
G
 
A
G
 
K
N
 
S
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
L
Y
 
W
G
 
G
L
x
M
G
 
G
V
 
V
T
 
T
E
x
Q
H
 
F
A
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
S
 
V
T
 
E
M
 
T
V
 
V
M
 
R
G
 
S
I
 
L
A
 
T
N
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
N
I
 
L
G
 
G
R
 
K
E
 
P
G
 
H
V
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
N
P
 
P
L
 
V
R
 
R
G
 
G
Q
|
Q
N
 
N
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
S
 
A
C
 
C
D
 
D
M
 
M
G
 
G
S
 
A
F
 
L
P
 
P
H
 
D
E
 
T
L
 
Y
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
R
 
Q
H
 
Y
I
 
V
S
 
K
D
 
D
T
 
P
I
 
A
V
 
N
R
 
R
S
 
E
Q
 
K
F
 
F
E
 
A
D
 
K
A
 
A
W
 
W
N
 
G
V
 
V
-
 
E
T
 
S
L
 
L
Q
 
P
T
 
A
E
 
H
P
 
T
G
 
G
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
P
 
S
N
 
E
M
 
L
F
 
P
E
 
H
A
 
R
A
 
A
L
 
A
D
 
H
G
 
G
S
 
E
F
 
V
M
 
R
G
 
A
L
 
A
Y
 
Y
C
 
I
Q
 
M
G
 
G
E
 
E
D
 
D
I
 
P
V
 
L
Q
 
Q
S
 
T
D
 
D
P
 
A
N
 
E
T
 
L
H
 
S
H
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
K
A
 
A
L
 
F
S
 
E
S
 
D
M
 
L
E
 
E
C
 
L
I
 
V
V
 
I
V
 
V
Q
 
Q
D
 
D
I
 
I
F
 
F
L
 
M
N
 
T
E
 
K
T
 
T
A
 
A
K
 
S
Y
 
A
A
 
A
H
 
D
V
 
V
L
 
I
L
 
L
P
 
P
G
x
S
S
 
T
T
 
S
F
 
W
L
 
G
E
 
E
K
 
H
D
 
E
G
 
G
T
 
V
F
 
F
T
 
T
N
 
A
A
 
A
E
 
D
R
 
R
R
 
G
I
 
F
S
 
Q
R
 
R
V
 
F
R
 
F
K
 
K
-
 
A
V
 
V
M
 
E
P
 
P
P
 
K
V
 
W
P
 
D
G
 
L
Y
 
K
A
 
T
D
|
D
W
 
W
E
 
Q
V
 
I
T
 
I
L
 
S
L
 
E
L
 
I
S
 
A
R
 
T
A
 
R
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
E
 
P
M
 
M
D
 
H
Y
 
Y
A
 
N
H
 
N
P
 
T
S
 
Q
E
 
E
I
 
I
M
 
W
D
 
D
E
 
E
I
 
L
A
 
R
R
 
H
L
 
L
T
 
C
P
 
P
T
 
D
F
 
F
H
 
Y
G
 
G
V
 
A
S
 
T
Y
 
Y
K
 
E
K
 
K
I
 
M
D
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
S
 
F
I
 
I
Q
 
Q
W
 
W
P
 
P
C
 
C
N
 
R
E
 
D
-
 
T
-
 
S
E
 
D
A
 
A
P
 
D
D
 
Q
G
 
G
T
 
T
P
 
S
T
 
Y
M
 
L
H
 
F
I
 
K
D
 
E
T
 
K
F
 
F
-
 
D
-
 
T
V
 
P
R
 
N
G
 
G
K
 
L
G
 
A
K
 
Q
F
 
F
V
 
F
I
 
T
T
 
C
K
 
D
F
 
W
I
 
V
A
 
A
S
 
P
P
 
I
E
 
D
K
 
K
V
 
L
T
 
T
R
 
D
K
 
E
F
 
Y
P
 
P
L
 
M
L
 
V
L
 
L
T
 
S
T
 
T
G
 
V
R
 
R
I
 
E
L
 
V
S
 
G
Q
 
H
Y
 
Y
N
 
S
V
x
C
G
 
R
A
 
S
Q
 
M
T
 
T
R
 
G
R
 
N
T
 
C
E
 
A
N
 
A
-
 
L
S
 
A
R
 
A
W
 
L
H
 
A
D
 
D
E
 
E
-
 
P
D
 
G
R
 
Y
L
 
A
E
 
Q
L
 
I
H
 
N
P
 
T
H
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
K
E
 
R
R
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
E
T
 
D
G
 
E
D
 
A
W
 
L
V
 
V
G
 
W
I
 
V
E
 
H
S
 
S
R
 
R
A
 
K
G
 
G
Q
 
K
T
 
I
V
 
I
L
 
T
R
 
R
A
 
A
K
 
Q
V
 
V
T
 
S
E
 
D
R
 
R
M
 
P
Q
 
N
P
 
K
G
 
G
V
 
A
V
 
I
Y
 
Y
T
 
M
T
 
T
F
x
Y
H
x
Q
F
 
W
P
 
W
E
 
I
S
 
G
G
 
A
A
 
C
N
 
N
V
 
E
I
 
L
T
 
V
T
 
T
D
 
E
S
 
N
S
 
L
D
 
S
W
 
P
A
 
I
T
 
T
N
 
K
C
 
T
P
 
P
E
 
E
Y
|
Y
K
|
K
V
 
Y
T
 
C
A
 
A
V
 
V
Q
 
R
V
 
V
M
 
E
P
 
P
V
 
I
E
 
A
Q
 
D
P
 
-
S
 
-
Q
 
-
W
 
-
Q
 
Q
K
 
R
E
 
A
Y
 
A
S
 
E
R
 
Q
F
 
Y
N
 
V
A
 
I
E
 
D
Q
 
E
L
 
Y
E
 
N
L
 
K
L
 
L
K
 
K
Q
 
T
R
 
R

2iv2X Reinterpretation of reduced form of formate dehydrogenase h from e. Coli (see paper)
37% identity, 72% coverage: 270:974/983 of query aligns to 4:690/697 of 2iv2X

query
sites
2iv2X
V
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
V
C
|
C
A
 
P
Y
 
Y
C
|
C
G
 
A
V
x
S
G
 
G
C
|
C
S
 
K
F
 
I
K
 
N
A
 
L
E
 
V
M
 
V
K
 
D
G
 
N
N
 
G
Q
 
K
V
 
I
V
 
V
R
 
R
M
 
-
V
 
A
P
 
E
F
 
A
K
 
A
N
 
Q
G
 
G
Q
 
K
A
 
T
N
 
N
E
 
Q
G
 
G
H
 
T
A
x
L
C
|
C
V
 
L
K
|
K
G
|
G
R
 
Y
F
 
Y
A
 
G
W
 
W
G
 
D
Y
 
F
A
 
I
T
 
N
H
 
D
K
 
T
D
 
Q
-
 
I
-
 
L
-
 
T
-
 
P
R
 
R
I
 
L
T
 
K
K
 
T
P
 
P
M
 
M
I
 
I
R
 
R
A
 
R
K
 
Q
I
 
R
T
 
G
D
 
G
P
 
K
W
 
L
R
 
E
E
 
P
V
 
V
S
 
S
W
 
W
E
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
L
N
 
N
Y
 
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
E
E
 
R
F
 
L
R
 
S
R
 
A
I
 
I
Q
 
K
A
 
E
K
 
K
H
 
Y
G
 
G
R
 
P
D
 
D
S
 
A
I
 
I
G
 
Q
G
 
T
I
 
T
T
 
G
S
|
S
S
 
S
R
|
R
C
x
G
T
|
T
-
 
G
N
 
N
E
 
E
E
 
T
T
 
N
Y
 
Y
L
 
V
V
 
M
Q
 
Q
K
 
K
L
 
F
V
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
V
F
 
I
G
 
G
N
 
T
N
 
N
N
 
N
V
 
V
D
 
D
T
 
C
C
 
C
A
|
A
R
 
R
V
 
V
C
|
C
H
|
H
S
 
G
P
 
P
T
 
S
G
 
V
Y
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
H
T
 
Q
T
 
S
L
 
V
G
 
G
E
 
N
S
 
G
A
 
A
G
 
M
T
 
S
Q
 
N
T
 
A
F
 
I
A
 
N
S
 
E
V
 
I
D
 
D
K
 
N
A
 
T
D
 
D
V
 
L
I
 
V
M
 
F
V
 
V
I
x
F
G
|
G
A
x
Y
N
|
N
P
 
P
T
 
A
D
|
D
G
x
S
H
 
H
P
 
P
V
x
I
F
 
V
G
 
A
S
 
N
R
 
H
L
 
V
K
 
I
R
 
N
R
 
A
V
 
K
R
 
R
E
 
N
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
I
I
 
I
V
 
V
V
 
C
D
|
D
P
|
P
R
|
R
R
 
K
I
 
I
D
 
E
I
 
T
V
 
A
D
 
R
T
 
I
P
 
-
H
 
-
V
 
-
K
 
-
A
 
A
S
 
D
H
 
M
H
 
H
L
 
I
Q
 
A
L
 
L
R
 
K
P
 
N
G
 
G
T
 
S
N
|
N
V
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
M
A
 
G
H
 
H
V
 
V
I
 
I
V
 
I
T
 
E
E
 
E
G
 
N
L
 
L
L
 
Y
N
 
D
E
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
V
S
 
A
E
 
S
R
 
R
C
 
T
E
 
E
G
 
G
R
 
-
A
 
-
F
 
F
D
 
E
Q
 
E
W
 
Y
R
 
R
D
 
K
F
 
I
V
 
V
A
 
E
L
 
-
P
 
-
E
 
G
N
 
Y
A
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
S
T
 
V
E
 
E
A
 
D
V
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
S
A
 
A
K
 
S
D
 
E
V
 
I
R
 
R
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
M
Y
 
Y
A
 
A
T
 
Q
G
 
A
G
 
K
N
 
S
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
L
Y
 
W
G
|
G
L
x
M
G
 
G
V
 
V
T
 
T
E
 
Q
H
x
F
A
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
S
 
V
T
 
E
M
 
T
V
 
V
M
 
R
G
 
S
I
 
L
A
 
T
N
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
N
I
 
L
G
 
G
R
 
K
E
 
P
G
 
H
V
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
N
P
 
P
L
 
V
R
|
R
G
|
G
Q
|
Q
N
 
N
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
S
 
A
C
 
C
D
 
D
M
 
M
G
 
G
S
 
A
F
 
L
P
 
P
H
 
D
E
 
T
L
 
Y
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
R
 
Q
H
 
Y
I
 
V
S
 
K
D
 
D
T
 
P
I
 
A
V
 
N
R
 
R
S
 
E
Q
 
K
F
 
F
E
 
A
D
 
K
A
 
A
W
 
W
N
 
G
V
 
V
-
 
E
T
 
S
L
 
L
Q
 
P
T
 
A
E
 
H
P
 
T
G
 
G
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
P
 
S
N
 
E
M
 
L
F
 
P
E
 
H
A
 
R
A
 
A
L
 
A
D
 
H
G
 
G
S
 
E
F
 
V
M
 
R
G
 
A
L
 
A
Y
 
Y
C
 
I
Q
 
M
G
|
G
E
|
E
D
|
D
I
 
P
V
 
L
Q
 
Q
S
x
T
D
 
D
P
x
A
N
 
E
T
 
L
H
 
S
H
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
K
A
 
A
L
 
F
S
 
E
S
 
D
M
 
L
E
 
E
C
 
L
I
 
V
V
 
I
V
 
V
Q
|
Q
D
|
D
I
|
I
F
 
F
L
 
M
N
 
T
E
 
K
T
 
T
A
 
A
K
 
S
Y
 
A
A
 
A
H
 
D
V
 
V
L
 
I
L
 
L
P
 
P
G
x
S
S
 
T
T
 
S
F
 
W
L
 
G
E
 
E
K
 
H
D
 
E
G
 
G
T
 
V
F
 
F
T
 
T
N
 
A
A
 
A
E
 
D
R
 
R
R
 
G
I
 
F
S
 
Q
R
 
R
V
 
F
R
 
F
K
 
K
-
 
A
V
 
V
M
 
E
P
 
P
P
 
K
V
 
W
P
 
D
G
 
L
Y
 
K
A
 
T
D
|
D
W
 
W
E
 
Q
V
 
I
T
 
I
L
 
S
L
 
E
L
 
I
S
 
A
R
 
T
A
 
R
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
E
 
P
M
 
M
D
 
H
Y
 
Y
A
 
N
H
 
N
P
 
T
S
 
Q
E
 
E
I
 
I
M
 
W
D
 
D
E
 
E
I
 
L
A
 
R
R
 
H
L
 
L
T
 
C
P
 
P
T
 
D
F
 
F
H
 
Y
G
 
G
V
 
A
S
 
T
Y
 
Y
K
 
E
K
 
K
I
 
M
D
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
S
 
F
I
 
I
Q
 
Q
W
 
W
P
 
P
C
 
C
N
 
R
E
 
D
-
 
T
-
 
S
E
 
D
A
 
A
P
 
D
D
 
Q
G
 
G
T
 
T
P
 
S
T
 
Y
M
 
L
H
 
F
I
 
K
D
 
E
T
 
K
F
 
F
-
 
D
-
 
T
V
 
P
R
 
N
G
 
G
K
 
L
G
 
A
K
 
Q
F
 
F
V
 
F
I
 
T
T
 
C
K
 
D
F
 
W
I
 
V
A
 
A
S
 
P
P
 
I
E
 
D
K
 
K
V
 
L
T
 
T
R
 
D
K
 
E
F
 
Y
P
 
P
L
 
M
L
 
V
L
 
L
T
 
S
T
 
T
G
 
V
R
|
R
I
x
E
L
x
V
S
 
G
Q
x
H
Y
|
Y
N
x
S
V
x
C
G
 
R
A
 
S
Q
 
M
T
 
T
R
 
G
R
 
N
T
 
C
E
 
A
N
 
A
-
 
L
S
 
A
R
 
A
W
 
L
H
 
A
D
 
D
E
 
E
-
 
P
D
 
G
R
 
Y
L
 
A
E
 
Q
L
 
I
H
 
N
P
 
T
H
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
K
E
 
R
R
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
E
T
 
D
G
 
E
D
 
A
W
 
L
V
 
V
G
 
W
I
 
V
E
 
H
S
 
S
R
 
R
A
 
K
G
 
G
Q
 
K
T
 
I
V
 
I
L
 
T
R
 
R
A
 
A
K
 
Q
V
 
V
T
 
S
E
 
D
R
 
R
M
 
P
Q
 
N
P
 
K
G
 
G
V
 
A
V
 
I
Y
 
Y
T
 
M
T
 
T
F
 
Y
H
 
Q
F
 
W
P
 
-
E
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
I
 
-
T
 
-
T
 
-
D
 
-
S
 
-
S
 
-
D
 
-
W
 
W
A
 
-
T
 
-
N
 
-
C
 
-
P
 
P
E
 
E
Y
|
Y
K
|
K
V
 
Y
T
 
C
A
 
A
V
 
V
Q
 
R
V
 
V
M
 
E
P
 
P
V
 
I
E
 
A
Q
 
D
P
 
-
S
 
-
Q
 
-
W
 
-
Q
 
Q
K
 
R
E
 
A
Y
 
A
S
 
E
R
 
Q
F
 
Y
N
 
V
A
 
I
E
 
D
Q
 
E
L
 
Y
E
 
N
L
 
K
L
 
L
K
 
K
Q
 
T
R
 
R

7qv7S Cryo-em structure of hydrogen-dependent co2 reductase. (see paper)
39% identity, 59% coverage: 267:844/983 of query aligns to 1:571/571 of 7qv7S

query
sites
7qv7S
E
 
Q
H
 
E
S
 
K
V
 
V
V
 
L
T
 
T
T
 
T
C
|
C
A
 
P
Y
 
Y
C
|
C
G
 
G
V
 
T
G
|
G
C
|
C
S
 
G
F
 
L
K
 
Y
A
 
L
E
 
K
M
 
V
K
 
E
G
 
N
N
 
E
Q
 
K
V
 
I
V
 
V
R
 
G
M
 
V
V
 
E
P
 
P
F
 
D
K
 
K
N
 
L
G
 
H
Q
 
P
A
 
V
N
 
N
E
 
Q
G
 
G
H
 
E
A