SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_04150 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_04150 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2ioyA Crystal structure of thermoanaerobacter tengcongensis ribose binding protein (see paper)
37% identity, 85% coverage: 43:313/317 of query aligns to 3:274/274 of 2ioyA

query
sites
2ioyA
I
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
V
F
 
I
Q
 
S
E
 
T
L
 
L
N
 
N
N
|
N
P
 
P
Y
x
F
F
|
F
V
 
V
T
 
T
M
 
L
Q
 
K
K
 
N
A
 
G
L
 
A
N
 
E
D
 
E
A
 
K
A
 
A
A
 
K
S
 
E
T
 
L
G
 
G
A
 
Y
T
 
K
V
 
I
I
 
I
V
 
V
T
 
E
D
 
D
A
 
S
H
 
Q
H
 
N
D
 
D
V
 
S
S
 
S
K
 
K
Q
 
E
V
 
L
S
 
S
D
 
N
V
 
V
E
 
E
D
 
D
M
 
L
L
 
I
Q
 
Q
K
 
Q
K
 
K
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
L
 
L
V
 
I
N
 
N
P
 
P
T
 
V
D
 
D
S
 
S
T
 
D
G
 
A
I
 
V
Q
 
V
S
 
T
A
 
A
V
 
I
T
 
K
S
 
E
A
 
A
K
 
N
K
 
S
A
 
K
G
 
N
V
 
I
V
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
T
V
 
I
D
|
D
A
x
R
N
 
S
A
 
A
N
 
N
-
 
G
G
 
G
P
 
D
V
 
V
D
 
V
S
 
C
F
 
H
V
 
I
G
 
A
S
 
S
K
 
D
N
 
N
F
 
V
D
 
K
A
 
G
G
 
G
Q
 
E
M
 
M
A
 
A
C
 
A
E
 
E
Y
 
F
L
 
I
S
 
A
K
 
K
S
 
A
I
 
L
G
 
K
G
 
G
S
 
K
G
 
G
E
 
N
V
 
V
A
 
V
I
 
E
L
 
L
D
 
E
G
 
G
I
 
I
P
 
P
-
 
G
V
 
A
V
 
S
P
x
A
I
 
A
L
 
R
E
 
D
R
|
R
V
 
G
R
 
K
G
 
G
C
 
F
K
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
K
S
 
Y
P
 
P
G
 
D
V
 
I
K
 
K
L
 
I
V
 
V
D
 
A
T
 
K
Q
 
Q
N
 
A
G
 
A
K
 
D
Q
x
F
E
 
D
R
 
R
A
 
S
T
 
K
A
 
G
L
 
L
S
 
S
V
 
V
T
 
M
E
 
E
N
 
N
M
 
I
I
 
L
Q
 
Q
A
 
A
H
 
Q
P
 
P
N
 
K
L
 
I
K
 
D
G
 
A
V
 
V
F
 
F
S
 
A
V
 
Q
N
|
N
D
 
D
G
 
E
G
 
M
S
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
I
S
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
S
 
A
S
 
A
G
 
N
K
 
R
D
 
Q
-
 
G
I
 
I
K
 
I
L
 
V
T
 
V
S
 
G
V
 
F
D
|
D
G
 
G
A
 
T
P
 
E
E
 
D
A
 
A
I
 
L
A
 
K
A
 
A
I
 
I
Q
 
K
K
 
E
P
 
-
N
 
-
S
 
G
K
 
K
F
 
M
V
 
A
E
 
A
T
 
T
S
 
I
A
 
A
Q
|
Q
F
 
Q
P
 
P
A
 
A
D
 
-
Q
 
-
V
 
L
R
 
M
I
 
G
A
 
S
L
 
L
G
 
G
I
 
V
A
 
E
Y
 
M
A
 
A
K
 
D
K
 
K
W
 
Y
-
 
L
-
 
K
G
 
G
A
 
E
N
 
K
V
 
I
P
 
P
K
 
N
A
 
F
I
 
I
P
 
P
V
 
A
D
 
E
V
 
L
K
 
K
M
 
L
I
 
I
D
 
T
K
 
K
S
 
E
N
 
N
A
 
V
K
 
Q

7e7mC Crystal structure analysis of the streptococcus agalactiae ribose binding protein rbsb
33% identity, 88% coverage: 38:317/317 of query aligns to 6:284/284 of 7e7mC

query
sites
7e7mC
A
 
A
A
 
K
P
 
D
L
 
L
K
 
K
I
 
L
G
 
G
M
 
V
T
 
S
F
 
I
Q
 
S
E
 
T
L
 
T
N
 
N
N
|
N
P
 
P
Y
|
Y
F
|
F
V
 
V
T
 
A
M
 
M
Q
 
K
K
 
D
A
 
G
L
 
I
N
 
D
D
 
K
A
 
Y
A
 
A
A
 
S
S
 
N
T
 
K
G
 
K
A
 
I
T
 
S
V
 
I
I
 
K
V
 
V
T
 
A
D
 
D
A
 
A
H
 
Q
H
 
D
D
 
D
V
 
A
S
 
A
K
 
R
Q
 
Q
V
 
A
S
 
D
D
 
D
V
 
V
E
 
Q
D
 
N
M
 
F
L
 
I
Q
 
S
K
 
Q
K
 
N
I
 
V
D
 
D
I
 
A
L
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
P
 
P
T
 
V
D
 
D
S
 
S
T
 
K
G
 
A
I
 
I
Q
 
V
S
 
T
A
 
A
V
 
I
T
 
K
S
 
S
A
 
A
K
 
N
K
 
N
A
 
A
G
 
N
V
 
I
V
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
L
V
 
M
D
|
D
A
x
R
N
 
G
A
 
S
N
 
E
-
 
G
G
 
G
P
 
K
V
 
V
D
 
L
S
 
T
F
 
T
V
 
V
G
 
A
S
 
S
K
 
D
N
 
N
F
 
V
D
 
A
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
M
 
M
A
 
A
C
 
A
E
 
D
Y
 
Y
L
 
A
S
 
V
K
 
K
S
 
K
I
 
L
G
 
G
G
 
K
S
 
K
G
 
A
E
 
K
V
 
A
A
 
F
I
 
E
L
 
L
D
 
S
G
 
G
I
 
V
P
 
P
-
 
G
V
 
A
V
 
S
P
 
A
I
 
T
L
 
V
E
 
D
R
|
R
V
 
G
R
 
K
G
 
G
C
 
F
K
 
H
A
 
-
A
 
S
L
 
V
A
 
A
K
 
K
S
 
S
P
 
K
G
 
-
V
 
L
K
 
D
L
 
M
V
 
L
D
 
S
T
 
S
Q
 
Q
N
 
S
G
 
A
K
 
N
Q
x
F
E
 
D
R
 
R
A
 
A
T
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
N
V
 
T
T
 
T
E
 
Q
N
 
N
M
 
M
I
 
I
Q
 
Q
A
 
G
H
 
H
P
 
K
N
 
D
L
 
V
K
 
Q
G
 
I
V
 
I
F
 
F
S
 
A
V
 
Q
N
|
N
D
 
D
G
 
E
G
 
M
S
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
A
S
 
Q
A
 
A
I
 
V
E
 
K
S
 
S
S
 
A
G
 
G
-
 
L
K
 
Q
D
 
N
I
 
V
K
 
L
L
 
I
T
 
V
S
 
G
V
 
I
D
|
D
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
E
 
D
A
 
A
I
 
H
A
 
D
A
 
A
I
 
I
Q
 
K
K
 
K
P
 
G
N
 
D
S
 
-
K
 
-
F
 
I
V
 
S
E
 
A
T
 
T
S
 
I
A
 
A
Q
|
Q
F
 
Q
P
 
P
A
 
A
D
 
K
Q
 
M
V
 
G
R
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
Q
I
 
A
A
 
A
Y
 
I
A
 
D
K
 
Y
K
 
Y
W
 
K
G
 
G
A
 
K
N
 
K
V
 
V
P
 
E
K
 
K
A
 
E
I
 
T
P
 
I
V
 
S
D
 
P
V
 
I
K
 
Y
M
 
L
I
 
V
D
 
T
K
 
K
S
 
D
N
 
N
A
 
V
K
 
E
G
 
K
F
 
Y
S
 
N
W
 
W

5dteB Crystal structure of an abc transporter periplasmic solute binding protein (ipr025997) from actinobacillus succinogenes 130z(asuc_0081, target efi-511065) with bound d-allose
35% identity, 77% coverage: 42:284/317 of query aligns to 4:256/287 of 5dteB

query
sites
5dteB
K
 
Q
I
 
I
G
 
A
M
 
L
T
 
L
F
 
M
Q
x
K
E
 
T
L
 
L
N
 
S
N
|
N
P
 
E
Y
|
Y
F
 
F
V
 
I
T
 
S
M
 
M
Q
 
R
K
 
Q
A
 
G
L
 
A
N
 
E
D
 
E
A
 
T
A
 
A
A
 
K
S
 
Q
T
 
K
G
 
D
A
 
I
T
 
D
V
 
L
I
 
I
V
 
V
T
 
Q
D
 
V
A
 
A
H
 
E
H
 
K
D
 
E
V
 
D
S
 
S
K
 
T
Q
 
E
-
 
Q
-
 
L
V
 
V
S
 
G
D
 
L
V
 
V
E
 
E
D
 
N
M
 
M
L
 
I
Q
 
A
K
 
K
K
 
K
I
 
V
D
 
D
I
 
A
L
 
I
L
 
I
V
 
V
N
 
T
P
 
P
T
 
N
D
 
D
S
 
S
T
 
I
G
 
A
I
 
F
Q
 
I
S
 
P
A
 
A
V
 
F
T
 
Q
S
 
K
A
 
A
K
 
E
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
P
V
 
I
V
 
I
A
 
D
V
 
L
D
|
D
-
 
V
-
 
R
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
K
-
 
A
A
 
A
N
 
E
A
 
A
N
 
A
G
 
G
P
 
L
V
 
K
D
 
F
S
 
N
F
 
Y
V
 
V
G
 
G
S
 
V
K
 
D
N
 
N
F
 
F
D
 
N
A
 
G
G
 
G
Q
 
Y
M
 
L
A
 
E
C
 
A
E
 
K
Y
 
N
L
 
L
S
 
A
K
 
E
S
 
A
I
 
I
G
 
G
G
 
K
S
 
K
G
 
G
E
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
L
D
 
E
G
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
G
V
 
V
P
 
D
I
x
N
L
 
G
E
 
E
-
 
Q
R
|
R
V
 
K
R
 
G
G
 
G
C
 
A
K
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
F
A
 
A
K
 
E
S
 
Y
P
 
P
G
 
D
V
 
I
K
 
K
L
 
I
V
 
V
D
 
A
T
 
S
Q
 
Q
N
 
S
G
 
A
K
 
N
Q
x
W
E
 
E
R
 
T
A
 
E
T
 
Q
A
 
A
L
 
L
S
 
N
V
 
V
T
 
T
E
 
T
N
 
N
M
 
I
I
 
L
Q
 
T
A
 
A
H
 
N
P
 
P
N
 
N
L
 
I
K
 
N
G
 
G
V
 
I
F
 
F
S
 
A
V
 
A
N
 
N
D
 
D
G
 
N
G
 
M
S
 
A
M
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
V
S
 
T
A
 
A
I
 
V
E
 
E
S
 
N
S
 
A
G
 
G
-
 
L
-
 
A
K
 
G
D
 
K
I
 
V
K
 
L
L
 
V
T
 
S
S
 
G
V
 
Y
D
|
D
G
 
G
A
 
I
P
 
P
E
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
E
A
 
Y
I
 
V
Q
 
K
K
 
Q
P
 
-
N
 
-
S
 
G
K
 
K
F
 
M
V
 
Q
E
 
N
T
 
T
S
 
I
A
 
D
Q
|
Q
F
 
L
P
 
P
A
 
K
D
 
K
Q
 
Q
V
 
V
R
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
I

1dbpA Identical mutations at corresponding positions in two homologous proteins with non-identical effects (see paper)
33% identity, 84% coverage: 43:309/317 of query aligns to 4:270/271 of 1dbpA

query
sites
1dbpA
I
 
I
G
 
A
M
 
L
T
 
V
F
 
V
Q
 
S
E
 
T
L
 
L
N
 
N
N
|
N
P
 
P
Y
x
F
F
 
F
V
 
V
T
 
S
M
 
L
Q
 
K
K
 
D
A
 
G
L
 
A
N
 
Q
D
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
D
S
 
K
T
 
L
G
 
G
A
 
Y
T
 
N
V
 
L
I
 
V
V
 
V
T
 
L
D
 
D
A
 
S
H
 
Q
H
 
N
D
 
N
V
 
P
S
 
A
K
 
K
Q
 
E
V
 
L
S
 
A
D
 
N
V
 
V
E
 
Q
D
 
D
M
 
L
L
 
T
Q
 
V
K
 
R
K
 
G
I
 
T
D
 
K
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
N
 
N
P
 
P
T
 
T
D
 
D
S
 
S
T
 
D
G
 
A
I
 
V
Q
 
D
S
 
N
A
 
A
V
 
V
T
 
K
S
 
M
A
 
A
K
 
N
K
 
Q
A
 
A
G
 
N
V
 
I
V
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
T
V
 
L
D
|
D
A
x
R
N
 
Q
A
 
A
-
 
T
N
 
K
G
 
G
P
 
E
V
 
V
D
 
V
S
 
S
F
 
H
V
 
I
G
 
A
S
 
S
K
 
D
N
 
N
F
 
V
D
 
L
A
 
G
G
 
G
Q
 
K
M
 
I
A
 
A
C
 
G
E
 
D
Y
 
Y
L
 
I
S
 
A
K
 
K
S
 
K
I
 
A
G
 
G
G
 
E
S
 
G
G
 
A
E
 
K
V
 
V
A
 
I
I
 
E
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
I
 
I
P
 
A
-
 
G
V
 
T
V
 
S
P
 
A
I
 
A
L
 
R
E
 
E
R
|
R
V
 
G
R
 
E
G
 
G
C
 
F
K
 
Q
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
A
 
A
K
 
-
S
 
A
P
 
H
G
 
K
V
 
F
K
 
N
L
 
V
V
 
L
D
 
A
T
 
S
Q
 
Q
N
 
P
G
 
A
K
 
D
Q
x
F
E
 
D
R
 
R
A
 
I
T
 
K
A
 
G
L
 
L
S
 
N
V
 
V
T
 
M
E
 
Q
N
 
N
M
 
L
I
 
L
Q
 
T
A
 
A
H
 
H
P
 
P
N
 
D
L
 
V
K
 
Q
G
 
A
V
 
V
F
 
F
S
 
A
V
 
Q
N
|
N
D
 
D
G
 
E
G
 
M
S
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
R
A
 
A
I
 
L
E
 
Q
S
 
T
S
 
A
G
 
G
K
 
K
-
 
S
D
 
D
I
 
V
K
 
M
L
 
V
T
 
V
S
 
G
V
 
F
D
|
D
G
 
G
A
 
T
P
 
P
E
 
D
A
 
G
I
 
E
A
 
K
A
 
A
I
 
V
Q
 
N
K
 
-
P
 
-
N
 
D
S
 
G
K
 
K
F
 
L
V
 
A
E
 
A
T
 
T
S
 
I
A
 
A
Q
 
Q
F
 
L
P
 
P
A
 
-
D
 
D
Q
 
Q
V
 
I
R
 
G
I
 
-
A
 
A
L
 
K
G
 
G
I
 
V
A
 
E
Y
 
T
A
 
A
K
 
D
K
 
K
-
 
V
-
 
L
W
 
K
G
 
G
A
 
E
N
 
K
V
 
V
P
 
Q
K
 
A
A
 
K
I
 
Y
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
L
K
 
K
M
 
L
I
 
V
D
 
V
K
 
K

2fn8A Thermotoga maritima ribose binding protein ribose bound form (see paper)
29% identity, 87% coverage: 42:316/317 of query aligns to 3:287/292 of 2fn8A

query
sites
2fn8A
K
 
K
I
 
M
G
 
A
M
 
I
T
 
V
F
 
I
Q
 
S
E
 
T
L
 
L
N
 
N
N
|
N
P
 
P
Y
x
W
F
|
F
V
 
V
T
 
V
M
 
L
Q
 
A
K
 
E
A
 
T
L
 
A
N
 
K
D
 
Q
A
 
R
A
 
A
A
 
E
S
 
Q
T
 
L
G
 
G
A
 
Y
T
 
E
V
 
A
I
 
T
V
 
I
T
 
F
D
 
D
A
 
S
H
 
Q
H
 
N
D
 
D
V
 
T
S
 
A
K
 
K
Q
 
E
V
 
S
S
 
A
D
 
H
V
 
F
E
 
D
D
 
A
M
 
I
L
 
I
Q
 
A
K
 
A
K
 
G
I
 
Y
D
 
D
I
 
A
L
 
I
L
 
I
V
 
F
N
 
N
P
 
P
T
 
T
D
 
D
S
 
A
T
 
D
G
 
G
I
 
S
Q
 
I
S
 
A
A
 
N
V
 
V
T
 
K
S
 
R
A
 
A
K
 
K
K
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
P
V
 
V
V
 
F
A
 
C
V
 
V
D
|
D
A
x
R
-
 
G
-
 
I
N
 
N
A
 
A
N
 
R
G
 
G
P
 
L
V
 
A
D
 
V
S
 
A
F
 
Q
V
 
I
G
 
Y
S
 
S
K
 
D
N
 
N
F
 
Y
D
 
Y
A
 
G
G
 
G
Q
 
V
M
 
L
A
 
M
C
 
G
E
 
E
Y
 
Y
L
 
F
S
 
V
K
 
K
S
 
F
I
 
L
G
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
P
G
 
D
S
 
A
G
 
K
E
 
E
V
 
I
A
 
P
I
 
Y
L
 
A
D
 
E
G
 
L
I
 
L
P
 
G
V
 
I
V
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
Q
P
 
P
I
 
T
L
 
W
E
 
D
R
|
R
V
 
S
R
 
N
G
 
G
C
 
F
K
 
H
A
 
S
A
 
V
L
 
V
A
 
D
K
 
Q
S
 
Y
P
 
P
G
 
E
V
 
F
K
 
K
L
 
M
V
 
V
D
 
A
T
 
Q
Q
 
Q
N
 
S
G
 
A
K
 
E
Q
x
F
E
 
D
R
 
R
A
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
Y
S
 
K
V
 
V
T
 
T
E
 
E
N
 
Q
M
 
I
I
 
L
Q
 
Q
A
 
A
H
 
H
P
 
P
N
 
E
L
 
I
K
 
K
G
 
A
V
 
I
F
 
W
S
 
C
V
 
G
N
|
N
D
 
D
G
 
A
G
 
M
S
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
M
S
 
K
A
 
A
I
 
C
E
 
E
S
 
A
S
 
A
G
 
G
K
 
R
-
 
T
D
 
D
I
 
I
K
 
Y
L
 
I
T
 
F
S
 
G
V
 
F
D
|
D
G
 
G
A
 
A
P
 
E
E
 
D
A
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
I
 
I
Q
 
-
K
 
K
P
 
E
N
 
G
S
 
K
K
 
Q
F
 
I
V
 
V
E
 
A
T
 
T
S
 
I
A
 
M
Q
|
Q
F
 
F
P
 
P
A
 
K
D
 
L
Q
 
M
V
 
A
R
 
R
I
 
L
A
 
A
L
 
V
G
 
E
I
 
W
A
 
A
Y
 
D
A
 
Q
K
 
Y
K
 
L
W
 
R
G
 
G
A
 
E
-
 
R
N
 
S
V
 
F
P
 
P
K
 
E
A
 
I
I
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
T
V
 
V
K
 
E
M
 
L
I
 
V
D
 
T
K
 
R
S
 
E
N
 
N
A
 
I
K
 
D
G
 
K
F
 
Y
S
 
T

4zjpA Structure of an abc-transporter solute binding protein (sbp_ipr025997) from actinobacillus succinogenes (asuc_0197, target efi-511067) with bound beta-d-ribopyranose
31% identity, 84% coverage: 43:307/317 of query aligns to 5:268/270 of 4zjpA

query
sites
4zjpA
I
 
I
G
 
A
M
 
L
T
 
T
F
 
V
Q
 
S
E
 
T
L
 
L
N
 
D
N
|
N
P
 
P
Y
x
F
F
|
F
V
 
V
T
 
S
M
 
L
Q
 
K
K
 
D
A
 
G
L
 
A
N
 
Q
D
 
K
A
 
K
A
 
A
A
 
T
S
 
E
T
 
L
G
 
G
A
 
Y
T
 
K
V
 
L
I
 
V
V
 
V
T
 
L
D
 
D
A
 
S
H
 
Q
H
 
N
D
 
D
V
 
P
S
 
S
K
 
K
Q
 
E
V
 
L
S
 
S
D
 
N
V
 
V
E
 
E
D
 
D
M
 
L
L
 
T
Q
 
V
K
 
R
K
 
G
I
 
A
D
 
K
I
 
V
L
 
L
L
 
L
V
 
I
N
 
N
P
 
P
T
 
T
D
 
D
S
 
S
T
 
A
G
 
A
I
 
V
Q
 
S
S
 
N
A
 
A
V
 
V
T
 
A
S
 
I
A
 
A
K
 
N
K
 
R
A
 
N
G
 
K
V
 
I
V
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
T
V
 
L
D
|
D
A
x
R
N
 
G
-
 
A
A
 
A
N
 
K
G
 
G
P
 
E
V
 
V
D
 
V
S
 
S
F
 
H
V
 
I
G
 
A
S
 
S
K
 
D
N
 
N
F
 
V
D
 
A
A
 
G
G
 
G
Q
 
K
M
 
M
A
 
A
C
 
G
E
 
D
Y
 
F
L
 
I
S
 
A
K
 
Q
S
 
K
I
 
L
G
 
G
G
 
D
S
 
G
G
 
A
E
 
K
V
 
V
A
 
I
I
 
Q
L
 
L
D
 
E
G
 
G
I
 
L
P
 
A
-
 
G
V
 
T
V
 
S
P
 
A
I
 
A
L
 
R
E
 
E
R
|
R
V
 
G
R
 
E
G
 
G
C
 
F
K
 
K
A
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
-
K
 
E
S
 
A
P
 
H
G
 
K
V
 
F
K
 
D
L
 
V
V
 
L
D
 
A
T
 
S
Q
 
Q
N
 
P
G
 
A
K
 
D
Q
x
F
E
 
D
R
 
R
A
 
T
T
 
K
A
 
G
L
 
L
S
 
N
V
 
V
T
 
T
E
 
E
N
 
N
M
 
L
I
 
L
Q
 
A
A
 
S
H
 
K
P
 
G
N
 
S
L
 
V
K
 
Q
G
 
A
V
 
I
F
 
F
S
 
A
V
 
Q
N
|
N
D
 
D
G
 
E
G
 
M
S
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
R
A
 
A
I
 
I
E
 
S
S
 
A
S
 
A
G
 
G
K
 
K
D
 
K
I
 
V
K
 
L
L
 
V
T
 
V
S
 
G
V
 
F
D
|
D
G
 
G
A
 
T
P
 
E
E
 
D
A
 
G
I
 
V
A
 
K
A
 
A
I
 
V
Q
 
K
K
 
-
P
 
-
N
 
S
S
 
G
K
 
K
F
 
L
V
 
A
E
 
A
T
 
T
S
 
V
A
 
A
Q
|
Q
F
 
Q
P
 
P
A
 
-
D
 
-
Q
 
E
V
 
L
R
 
I
I
 
G
A
 
S
L
 
L
G
 
G
I
 
V
A
 
E
Y
 
T
A
 
A
K
 
D
K
 
K
W
 
I
-
 
L
-
 
K
G
 
G
A
 
E
N
 
K
V
 
V
P
 
D
K
 
A
A
 
K
I
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
A
V
 
L
K
 
K
M
 
V
I
 
V

4irxA Crystal structure of caulobacter myo-inositol binding protein bound to myo-inositol (see paper)
32% identity, 80% coverage: 41:294/317 of query aligns to 9:270/296 of 4irxA

query
sites
4irxA
L
 
M
K
 
E
I
 
V
G
 
V
M
 
V
T
 
S
F
 
F
Q
 
N
E
 
D
L
 
L
N
 
S
N
x
Q
P
 
P
Y
x
F
F
 
F
V
 
V
T
 
A
M
 
M
Q
 
R
K
 
R
A
 
E
L
 
L
N
 
E
D
 
D
A
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
K
T
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
K
V
 
V
I
 
Q
V
 
V
T
 
L
D
 
D
A
 
A
H
 
Q
H
 
N
D
 
N
V
 
S
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
V
 
I
S
 
S
D
 
D
V
 
L
E
 
Q
D
 
A
M
 
A
L
 
A
Q
 
V
K
 
Q
K
 
G
I
 
A
D
 
K
I
 
V
L
 
V
L
 
I
V
 
V
N
 
A
P
 
P
T
 
T
D
 
D
S
 
S
T
 
K
G
 
A
I
 
L
Q
 
A
S
 
G
A
 
A
V
 
A
T
 
D
S
 
D
A
 
L
K
 
V
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
S
V
 
V
D
|
D
A
x
R
N
 
N
A
 
I
N
 
A
G
 
G
P
 
G
V
 
K
D
 
T
S
 
A
-
 
V
-
 
P
F
 
H
V
 
V
G
 
G
S
 
A
K
 
D
N
 
N
F
 
V
D
 
A
A
 
G
G
 
G
Q
 
R
M
 
A
A
 
M
C
 
A
E
 
D
Y
 
W
L
 
V
S
 
V
K
 
K
S
 
T
I
 
Y
G
 
P
G
 
A
S
 
G
G
 
A
E
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
V
L
 
I
D
 
T
G
x
N
I
x
D
P
 
P
-
 
G
V
 
S
V
 
S
P
x
S
I
 
S
L
 
I
E
 
E
R
|
R
V
 
V
R
 
K
G
 
G
C
 
V
K
 
H
A
 
D
A
 
G
L
 
L
A
 
A
K
 
A
-
 
G
S
 
G
P
 
P
G
 
A
V
 
F
K
 
K
L
 
I
V
 
V
D
 
T
T
 
E
Q
 
Q
N
 
T
G
 
A
K
 
N
Q
x
S
E
 
K
R
 
R
A
 
D
T
 
Q
A
 
A
L
 
L
S
 
T
V
 
V
T
 
T
E
 
Q
N
 
N
M
 
I
I
 
L
Q
 
T
A
 
S
H
 
M
-
 
R
-
 
D
-
 
T
-
 
P
P
 
P
N
 
D
L
 
V
K
 
-
G
 
-
V
 
I
F
 
L
S
 
C
V
 
L
N
|
N
D
 
D
G
 
D
G
 
M
S
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
E
A
 
A
I
 
V
E
 
R
S
 
A
S
 
A
G
 
G
K
 
L
D
 
D
-
 
S
-
 
A
-
 
K
I
 
V
K
 
K
L
 
V
T
 
I
S
 
G
V
 
F
D
|
D
G
 
A
A
 
I
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
R
I
 
I
Q
 
K
K
 
A
P
 
-
N
 
-
S
 
G
K
 
E
F
 
M
V
 
V
E
 
A
T
 
T
S
 
V
A
 
E
Q
|
Q
F
 
N
P
 
P
A
 
G
D
 
L
Q
 
Q
V
 
I
R
 
R
I
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
R
I
 
Q
A
 
A
Y
 
V
A
 
D
K
 
K
-
 
I
K
 
K
W
 
S
G
 
G
A
 
A

5hqjA Crystal structure of abc transporter solute binding protein b1g1h7 from burkholderia graminis c4d1m, target efi-511179, in complex with d-arabinose
33% identity, 56% coverage: 53:231/317 of query aligns to 18:199/289 of 5hqjA

query
sites
5hqjA
P
 
P
Y
x
F
F
 
F
V
 
D
T
 
D
M
 
C
Q
 
N
K
 
K
A
 
G
L
 
A
N
 
K
D
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
D
S
 
K
T
 
A
G
 
G
A
 
V
T
 
K
V
 
Y
-
 
Q
I
 
W
V
 
V
T
 
V
D
 
P
A
 
Q
H
 
N
H
 
T
D
 
Q
V
 
G
S
 
S
K
 
T
Q
 
Q
V
 
V
S
 
Q
D
 
I
V
 
I
E
 
E
D
 
D
M
 
L
L
 
I
Q
 
S
K
 
R
K
 
H
I
 
V
D
 
D
I
 
G
L
 
I
L
 
A
V
 
I
N
 
S
P
 
V
T
 
N
D
 
E
S
 
P
T
 
K
G
 
S
I
 
V
Q
 
E
S
 
S
A
 
V
V
 
M
T
 
K
S
 
R
A
 
A
K
 
E
K
 
Q
A
 
S
G
 
G
V
 
I
V
 
K
V
 
V
V
 
L
A
 
T
V
 
Y
D
|
D
A
 
S
N
 
D
A
 
S
N
 
P
G
 
K
P
 
S
V
 
G
D
 
R
S
 
S
-
 
M
F
 
Y
V
 
I
G
 
G
S
 
T
K
 
N
N
 
N
F
 
E
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
Q
 
A
M
 
T
A
 
M
C
 
A
E
 
E
Y
 
T
L
 
M
S
 
G
K
 
K
S
 
A
I
 
L
G
 
N
G
 
G
S
 
Q
G
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
I
D
 
T
G
 
G
-
 
Q
I
 
L
P
 
G
V
 
A
V
 
V
P
x
N
I
 
L
L
 
N
E
 
E
R
|
R
V
 
I
R
 
A
G
 
G
C
 
I
K
 
K
A
 
K
A
 
G
L
 
L
A
 
A
K
 
K
S
 
Y
P
 
P
G
 
G
V
 
I
K
 
K
L
 
V
V
 
V
D
 
E
T
 
T
Q
 
Q
N
 
G
G
 
T
K
 
D
Q
 
D
E
 
D
R
 
L
A
 
A
T
 
R
A
 
G
L
 
V
S
 
S
V
 
V
T
 
V
E
 
E
N
 
T
M
 
T
I
 
L
Q
 
R
A
 
A
H
 
H
P
 
P
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
I
F
 
F
S
 
G
V
 
V
N
x
S
D
x
Q
G
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4ry9B Crystal structure of carbohydrate transporter solute binding protein veis_2079 from verminephrobacter eiseniae ef01-2, target efi-511009, a complex with d-talitol
31% identity, 87% coverage: 41:315/317 of query aligns to 3:290/297 of 4ry9B

query
sites
4ry9B
L
 
F
K
 
K
I
 
I
G
 
G
M
 
V
T
 
S
F
 
M
Q
x
K
E
 
T
L
 
L
N
 
S
N
 
A
P
 
P
Y
|
Y
F
|
F
V
 
A
T
 
A
M
 
Q
Q
 
M
K
 
E
A
 
A
L
 
A
N
 
K
D
 
A
A
 
R
A
 
G
A
 
K
S
 
E
T
 
L
G
 
G
A
 
Y
T
 
E
V
 
V
I
 
L
V
 
A
T
 
T
D
 
D
A
 
A
H
 
Q
H
 
G
D
 
K
V
 
L
S
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
V
 
I
S
 
S
D
 
D
V
 
V
E
 
E
D
 
D
M
 
L
L
 
V
Q
 
T
K
 
R
K
 
G
I
 
V
D
 
K
I
 
L
L
 
L
L
 
I
V
 
I
N
 
N
P
 
P
T
 
A
D
|
D
S
|
S
T
 
E
G
 
G
I
 
L
Q
 
V
S
 
N
A
 
A
V
 
V
T
 
N
S
 
N
A
 
A
K
 
S
K
 
A
A
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
V
V
 
I
D
|
D
A
x
S
N
x
T
A
 
L
N
 
N
G
 
-
P
 
P
V
 
R
D
 
A
S
 
N
F
 
F
V
 
V
G
 
T
-
 
Q
-
 
V
-
 
Q
S
 
S
K
 
S
N
 
N
F
 
S
D
 
I
A
 
N
G
 
G
Q
 
A
M
 
L
A
 
V
C
 
G
E
 
H
Y
 
W
L
 
V
S
 
I
K
 
E
S
 
E
I
 
V
G
 
G
G
 
N
-
 
K
S
 
S
G
 
L
E
 
K
V
 
I
A
 
A
I
 
L
L
 
L
D
 
S
G
 
G
I
 
E
P
 
K
V
 
G
V
x
N
P
|
P
I
 
V
-
 
G
L
 
Q
E
 
E
R
|
R
V
 
R
R
 
L
G
 
G
C
 
V
-
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
I
-
 
I
K
 
E
A
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
R
K
 
K
-
 
F
-
 
G
S
 
K
P
 
A
G
 
D
V
 
L
K
 
T
L
 
V
V
 
V
D
 
G
T
 
Q
Q
 
G
N
 
W
G
 
G
K
 
H
Q
x
W
E
 
N
R
 
D
A
 
E
T
 
G
A
 
G
L
 
L
S
 
K
V
 
A
T
 
M
E
 
E
N
 
D
M
 
L
I
 
L
Q
 
V
A
 
A
H
 
N
P
 
K
N
 
D
L
 
I
K
 
N
G
 
M
V
 
V
F
 
L
S
 
G
V
 
E
N
|
N
D
 
D
G
 
S
G
 
M
S
 
V
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
R
S
 
R
A
 
A
I
 
I
E
 
E
S
 
S
S
 
A
G
 
G
K
 
R
D
 
T
-
 
G
-
 
I
I
 
L
K
 
L
L
 
V
T
 
A
S
 
A
V
 
A
D
|
D
G
 
A
A
 
Q
P
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
L
I
 
I
Q
 
K
K
 
Q
P
 
-
N
 
-
S
 
G
K
 
K
F
 
Y
V
 
G
E
 
V
T
 
T
S
 
G
A
 
L
Q
 
N
F
 
D
P
 
P
A
 
A
D
 
L
Q
 
V
V
 
A
R
 
R
I
 
T
A
 
A
-
 
I
-
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
V
A
 
K
Y
 
V
A
 
V
K
 
K
K
 
G
W
 
E
G
 
V
A
 
K
N
 
D
V
 
V
P
 
P
K
 
K
A
 
Q
I
 
T
P
 
L
V
 
T
D
 
T
V
 
P
K
 
A
M
 
A
I
 
I
D
 
T
K
 
K
S
 
G
N
 
N
A
 
V
K
 
D
G
 
K
F
 
F

4ry9A Crystal structure of carbohydrate transporter solute binding protein veis_2079 from verminephrobacter eiseniae ef01-2, target efi-511009, a complex with d-talitol
31% identity, 87% coverage: 41:315/317 of query aligns to 3:290/297 of 4ry9A

query
sites
4ry9A
L
 
F
K
 
K
I
 
I
G
 
G
M
 
V
T
 
S
F
 
M
Q
x
K
E
 
T
L
 
L
N
 
S
N
 
A
P
 
P
Y
|
Y
F
|
F
V
 
A
T
 
A
M
 
Q
Q
 
M
K
 
E
A
 
A
L
 
A
N
 
K
D
 
A
A
 
R
A
 
G
A
 
K
S
 
E
T
 
L
G
 
G
A
 
Y
T
 
E
V
 
V
I
 
L
V
 
A
T
 
T
D
 
D
A
 
A
H
 
Q
H
 
G
D
 
K
V
 
L
S
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
V
 
I
S
 
S
D
 
D
V
 
V
E
 
E
D
 
D
M
 
L
L
 
V
Q
 
T
K
 
R
K
 
G
I
 
V
D
 
K
I
 
L
L
 
L
L
 
I
V
 
I
N
 
N
P
 
P
T
 
A
D
 
D
S
 
S
T
 
E
G
 
G
I
 
L
Q
 
V
S
 
N
A
 
A
V
 
V
T
 
N
S
 
N
A
 
A
K
 
S
K
 
A
A
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
V
V
 
I
D
|
D
A
x
S
N
 
T
A
 
L
N
 
N
G
 
-
P
 
P
V
 
R
D
 
A
S
 
N
F
 
F
V
 
V
G
 
T
-
 
Q
-
 
V
-
 
Q
S
 
S
K
 
S
N
 
N
F
 
S
D
 
I
A
 
N
G
 
G
Q
 
A
M
 
L
A
 
V
C
 
G
E
 
H
Y
 
W
L
 
V
S
 
I
K
 
E
S
 
E
I
 
V
G
 
G
G
 
N
-
 
K
S
 
S
G
 
L
E
 
K
V
 
I
A
 
A
I
 
L
L
 
L
D
 
S
G
 
G
I
 
E
P
 
K
V
 
G
V
x
N
P
 
P
I
 
V
-
 
G
L
 
Q
E
 
E
R
|
R
V
 
R
R
 
L
G
 
G
C
 
V
-
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
I
-
 
I
K
 
E
A
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
R
K
 
K
-
 
F
-
 
G
S
 
K
P
 
A
G
 
D
V
 
L
K
 
T
L
 
V
V
 
V
D
 
G
T
 
Q
Q
 
G
N
 
W
G
 
G
K
 
H
Q
x
W
E
 
N
R
 
D
A
 
E
T
 
G
A
 
G
L
 
L
S
 
K
V
 
A
T
 
M
E
 
E
N
 
D
M
 
L
I
 
L
Q
 
V
A
 
A
H
 
N
P
 
K
N
 
D
L
 
I
K
 
N
G
 
M
V
 
V
F
 
L
S
 
G
V
 
E
N
|
N
D
 
D
G
 
S
G
 
M
S
 
V
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
R
S
 
R
A
 
A
I
 
I
E
 
E
S
 
S
S
 
A
G
 
G
K
 
R
D
 
T
-
 
G
-
 
I
I
 
L
K
 
L
L
 
V
T
 
A
S
 
A
V
 
A
D
|
D
G
 
A
A
 
Q
P
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
L
I
 
I
Q
 
K
K
 
Q
P
 
-
N
 
-
S
 
G
K
 
K
F
 
Y
V
 
G
E
 
V
T
 
T
S
 
G
A
 
L
Q
 
N
F
 
D
P
 
P
A
 
A
D
 
L
Q
 
V
V
 
A
R
 
R
I
 
T
A
 
A
-
 
I
-
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
V
A
 
K
Y
 
V
A
 
V
K
 
K
K
 
G
W
 
E
G
 
V
A
 
K
N
 
D
V
 
V
P
 
P
K
 
K
A
 
Q
I
 
T
P
 
L
V
 
T
D
 
T
V
 
P
K
 
A
M
 
A
I
 
I
D
 
T
K
 
K
S
 
G
N
 
N
A
 
V
K
 
D
G
 
K
F
 
F

1rpjA Crystal structure of d-allose binding protein from escherichia coli (see paper)
29% identity, 83% coverage: 45:308/317 of query aligns to 6:282/288 of 1rpjA

query
sites
1rpjA
M
 
V
T
 
V
F
 
L
Q
x
K
E
 
T
L
 
L
N
 
S
N
|
N
P
 
P
Y
x
F
F
 
W
V
 
V
T
 
D
M
 
M
Q
 
K
K
 
K
A
 
G
L
 
I
N
 
E
D
 
D
A
 
E
A
 
A
A
 
K
S
 
T
T
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
S
V
 
V
I
 
D
V
 
I
-
 
F
-
 
A
T
 
S
D
 
P
A
 
S
H
x
E
H
 
G
D
 
D
V
 
F
S
 
Q
K
 
S
Q
 
Q
V
 
L
S
 
Q
D
 
L
V
 
F
E
 
E
D
 
D
M
 
L
L
 
S
Q
 
N
K
 
K
K
 
N
I
 
Y
D
 
K
I
 
G
L
 
I
L
 
A
V
 
F
N
 
A
P
 
P
T
 
L
D
 
S
S
 
S
T
 
V
G
 
N
I
 
L
Q
 
V
S
 
M
A
 
P
V
 
V
T
 
A
S
 
R
A
 
A
K
 
W
K
 
K
A
 
K
G
 
G
V
 
I
V
 
Y
V
 
L
V
 
V
A
 
N
V
 
L
D
|
D
A
 
E
N
 
K
-
 
I
-
 
D
-
 
M
-
 
D
-
 
N
-
 
L
-
 
K
-
 
K
A
 
A
N
 
G
G
 
G
P
 
N
V
 
V
D
 
E
S
 
A
F
 
F
V
 
V
G
 
T
S
 
T
K
 
D
N
 
N
F
 
V
D
 
A
A
 
V
G
 
G
Q
 
A
M
 
K
A
 
G
C
 
A
E
 
S
Y
 
F
L
 
I
S
 
I
K
 
D
S
 
K
I
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
E
G
 
G
-
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
I
D
 
E
G
 
G
I
 
K
P
 
A
V
 
G
V
 
N
P
 
A
I
x
S
L
 
G
E
 
E
-
 
A
R
|
R
V
 
R
R
 
N
G
 
G
C
 
A
K
 
T
A
 
E
A
 
A
L
 
F
A
 
K
K
 
K
S
 
A
P
 
S
G
 
Q
V
 
I
K
 
K
L
 
L
V
 
V
D
 
A
T
 
S
Q
 
Q
N
 
P
G
 
A
K
 
D
Q
x
W
E
 
D
R
 
R
A
 
I
T
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
D
V
 
V
T
 
A
E
 
T
N
 
N
M
 
V
I
 
L
Q
 
Q
A
 
R
H
 
N
P
 
P
N
 
N
L
 
I
K
 
K
G
 
A
V
 
I
F
 
Y
S
 
C
V
 
A
N
|
N
D
 
D
G
 
T
G
 
M
S
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
V
L
 
A
S
 
Q
A
 
A
I
 
V
E
 
A
S
 
N
S
 
A
G
 
G
K
 
K
D
 
T
I
 
G
K
 
K
L
 
V
T
 
L
S
 
V
V
 
V
-
 
G
-
 
T
D
|
D
G
 
G
A
 
I
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
R
A
 
K
A
 
M
I
 
V
Q
 
E
K
 
A
P
 
-
N
 
-
S
 
G
K
 
Q
F
 
M
V
 
T
E
 
A
T
 
T
S
 
V
A
 
A
Q
|
Q
F
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
D
Q
 
I
V
 
G
R
 
A
I
 
T
A
 
G
L
 
L
G
 
K
I
 
L
A
 
M
Y
 
V
-
 
D
A
 
A
K
 
E
K
 
K
W
 
S
G
 
G
A
 
K
N
 
V
V
 
I
P
 
P
K
 
L
A
 
D
I
 
K
P
 
A
V
 
P
D
 
E
V
 
F
K
 
K
M
 
L
I
 
V
D
 
D

1gudA Hinge-bending motion of d-allose binding protein from escherichia coli: three open conformations (see paper)
29% identity, 83% coverage: 45:308/317 of query aligns to 6:282/288 of 1gudA

query
sites
1gudA
M
 
V
T
 
V
F
 
L
Q
 
K
E
 
T
L
 
L
N
 
S
N
 
N
P
 
P
Y
 
F
F
 
W
V
 
V
T
 
D
M
 
M
Q
 
K
K
 
K
A
 
G
L
 
I
N
 
E
D
 
D
A
 
E
A
 
A
A
 
K
S
 
T
T
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
S
V
 
V
I
x
D
V
 
I
-
 
F
-
 
A
T
 
S
D
 
P
A
 
S
H
 
E
H
 
G
D
 
D
V
 
F
S
 
Q
K
 
S
Q
 
Q
V
 
L
S
 
Q
D
 
L
V
 
F
E
 
E
D
 
D
M
 
L
L
 
S
Q
 
N
K
 
K
K
 
N
I
 
Y
D
 
K
I
 
G
L
 
I
L
 
A
V
 
F
N
 
A
P
 
P
T
 
L
D
 
S
S
 
S
T
 
V
G
 
N
I
 
L
Q
 
V
S
 
M
A
 
P
V
 
V
T
 
A
S
 
R
A
 
A
K
 
W
K
 
K
A
 
K
G
 
G
V
 
I
V
 
Y
V
 
L
V
 
V
A
 
N
V
 
L
D
 
D
A
 
E
N
 
K
-
 
I
-
 
D
-
 
M
-
 
D
-
 
N
-
 
L
-
 
K
-
 
K
A
 
A
N
 
G
G
 
G
P
 
N
V
 
V
D
 
E
S
 
A
F
 
F
V
 
V
G
 
T
S
 
T
K
 
D
N
 
N
F
 
V
D
 
A
A
 
V
G
 
G
Q
 
A
M
 
K
A
 
G
C
 
A
E
 
S
Y
 
F
L
 
I
S
 
I
K
 
D
S
 
K
I
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
E
G
 
G
-
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
I
D
 
E
G
 
G
I
 
K
P
 
A
V
 
G
V
 
N
P
 
A
I
 
S
L
 
G
E
 
E
-
 
A
R
 
R
V
 
R
R
 
N
G
 
G
C
 
A
K
 
T
A
 
E
A
 
A
L
 
F
A
 
K
K
 
K
S
 
A
P
 
S
G
 
Q
V
 
I
K
 
K
L
 
L
V
 
V
D
 
A
T
 
S
Q
 
Q
N
 
P
G
 
A
K
 
D
Q
 
W
E
 
D
R
 
R
A
 
I
T
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
D
V
 
V
T
 
A
E
 
T
N
 
N
M
 
V
I
 
L
Q
 
Q
A
 
R
H
 
N
P
 
P
N
 
N
L
 
I
K
 
K
G
 
A
V
 
I
F
 
Y
S
 
C
V
 
A
N
 
N
D
 
D
G
 
T
G
 
M
S
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
V
L
 
A
S
 
Q
A
 
A
I
 
V
E
 
A
S
 
N
S
 
A
G
 
G
K
 
K
D
 
T
I
 
G
K
 
K
L
 
V
T
 
L
S
 
V
V
 
V
-
 
G
-
 
T
D
 
D
G
 
G
A
 
I
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
R
A
 
K
A
 
M
I
 
V
Q
 
E
K
 
A
P
 
-
N
 
-
S
 
G
K
 
Q
F
 
M
V
 
T
E
 
A
T
 
T
S
 
V
A
 
A
Q
 
Q
F
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
D
Q
 
I
V
 
G
R
 
A
I
 
T
A
 
G
L
 
L
G
 
K
I
 
L
A
 
M
Y
 
V
-
 
D
A
 
A
K
 
E
K
 
K
W
 
S
G
 
G
A
 
K
N
 
V
V
 
I
P
 
P
K
 
L
A
 
D
I
 
K
P
 
A
V
 
P
D
 
E
V
 
F
K
 
K
M
 
L
I
 
V
D
 
D

Sites not aligning to the query:

8wlbA X-ray structure of enterobacter cloacae allose-binding protein in complex with d-psicose (see paper)
29% identity, 83% coverage: 45:308/317 of query aligns to 6:282/288 of 8wlbA

query
sites
8wlbA
M
 
V
T
 
V
F
 
L
Q
x
K
E
 
T
L
 
L
N
 
S
N
|
N
P
 
P
Y
x
F
F
x
W
V
 
V
T
 
D
M
 
M
Q
 
K
K
 
K
A
 
G
L
 
I
N
 
E
D
 
D
A
 
E
A
 
A
A
 
K
S
 
T
T
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
S
V
 
V
I
 
D
V
 
I
-
 
F
-
 
A
T
 
S
D
 
P
A
 
S
H
 
E
H
 
G
D
 
D
V
 
F
S
 
Q
K
 
S
Q
 
Q
V
 
L
S
 
Q
D
 
L
V
 
F
E
 
E
D
 
D
M
 
L
L
 
S
Q
 
N
K
 
K
K
 
K
I
 
Y
D
 
K
I
 
G
L
 
I
L
 
A
V
 
F
N
 
A
P
 
P
T
 
L
D
 
S
S
 
S
T
 
V
G
 
N
I
 
L
Q
 
V
S
 
M
A
 
P
V
 
V
T
 
A
S
 
R
A
 
A
K
 
W
K
 
Q
A
 
K
G
 
G
V
 
L
V
 
Y
V
 
L
V
 
V
A
 
N
V
 
L
D
|
D
A
x
E
N
 
K
-
 
I
-
 
D
-
 
M
-
 
D
-
 
N
-
 
L
-
 
K
-
 
K
A
 
A
N
 
G
G
 
G
P
 
N
V
 
V
D
 
E
S
 
G
F
 
F
V
 
V
G
 
T
S
 
T
K
 
D
N
 
N
F
 
V
D
 
A
A
 
V
G
 
G
Q
 
A
M
 
K
A
 
G
C
 
A
E
 
D
Y
 
F
L
 
I
S
 
I
K
 
N
S
 
K
I
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
E
G
 
G
-
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
I
D
 
E
G
 
G
I
 
K
P
 
A
V
 
G
V
 
N
P
 
A
I
x
S
L
 
G
E
 
E
-
 
A
R
|
R
V
 
R
R
 
N
G
 
G
C
 
A
K
 
T
A
 
E
A
 
A
L
 
F
A
 
K
K
 
K
S
 
A
P
 
N
G
 
Q
V
 
I
K
 
K
L
 
L
V
 
V
D
 
A
T
 
S
Q
 
Q
N
 
P
G
 
A
K
 
D
Q
 
W
E
 
D
R
 
R
A
 
I
T
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
D
V
 
V
T
 
A
E
 
T
N
 
N
M
 
V
I
 
L
Q
 
Q
A
 
R
H
 
N
P
 
P
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
A
V
 
F
F
 
Y
S
 
C
V
 
A
N
|
N
D
 
D
G
 
T
G
 
M
S
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
V
L
 
A
S
 
Q
A
 
A
I
 
V
E
 
A
S
 
N
S
 
A
G
 
G
K
 
K
-
 
I
-
 
G
D
 
K
I
 
V
K
 
L
L
 
V
T
 
V
S
 
G
V
 
T
D
|
D
G
 
G
A
 
I
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
R
A
 
K
A
 
M
I
 
V
Q
 
E
K
 
A
P
 
-
N
 
-
S
 
G
K
 
Q
F
 
M
V
 
T
E
 
A
T
 
T
S
 
V
A
 
A
Q
|
Q
F
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
D
Q
 
I
V
 
G
R
 
A
I
 
T
A
 
G
L
 
L
G
 
K
I
 
L
A
 
M
Y
 
V
-
 
D
A
 
A
K
 
A
K
 
K
W
 
T
G
 
G
A
 
K
N
 
V
V
 
I
P
 
P
K
 
L
A
 
E
I
 
K
P
 
T
V
 
P
D
 
E
V
 
F
K
 
K
M
 
L
I
 
V
D
 
D

8wl9A X-ray structure of enterobacter cloacae allose-binding protein in complex with d-ribose (see paper)
29% identity, 83% coverage: 45:308/317 of query aligns to 6:282/288 of 8wl9A

query
sites
8wl9A
M
 
V
T
 
V
F
 
L
Q
 
K
E
 
T
L
 
L
N
 
S
N
|
N
P
 
P
Y
x
F
F
 
W
V
 
V
T
 
D
M
 
M
Q
 
K
K
 
K
A
 
G
L
 
I
N
 
E
D
 
D
A
 
E
A
 
A
A
 
K
S
 
T
T
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
S
V
 
V
I
 
D
V
 
I
-
 
F
-
 
A
T
 
S
D
 
P
A
 
S
H
 
E
H
 
G
D
 
D
V
 
F
S
 
Q
K
 
S
Q
 
Q
V
 
L
S
 
Q
D
 
L
V
 
F
E
 
E
D
 
D
M
 
L
L
 
S
Q
 
N
K
 
K
K
 
K
I
 
Y
D
 
K
I
 
G
L
 
I
L
 
A
V
 
F
N
 
A
P
 
P
T
 
L
D
 
S
S
 
S
T
 
V
G
 
N
I
 
L
Q
 
V
S
 
M
A
 
P
V
 
V
T
 
A
S
 
R
A
 
A
K
 
W
K
 
Q
A
 
K
G
 
G
V
 
L
V
 
Y
V
 
L
V
 
V
A
 
N
V
 
L
D
|
D
A
 
E
N
 
K
-
 
I
-
 
D
-
 
M
-
 
D
-
 
N
-
 
L
-
 
K
-
 
K
A
 
A
N
 
G
G
 
G
P
 
N
V
 
V
D
 
E
S
 
G
F
 
F
V
 
V
G
 
T
S
 
T
K
 
D
N
 
N
F
 
V
D
 
A
A
 
V
G
 
G
Q
 
A
M
 
K
A
 
G
C
 
A
E
 
D
Y
 
F
L
 
I
S
 
I
K
 
N
S
 
K
I
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
E
G
 
G
-
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
I
D
 
E
G
 
G
I
 
K
P
 
A
V
 
G
V
 
N
P
 
A
I
 
S
L
 
G
E
 
E
-
 
A
R
|
R
V
 
R
R
 
N
G
 
G
C
 
A
K
 
T
A
 
E
A
 
A
L
 
F
A
 
K
K
 
K
S
 
A
P
 
N
G
 
Q
V
 
I
K
 
K
L
 
L
V
 
V
D
 
A
T
 
S
Q
 
Q
N
 
P
G
 
A
K
 
D
Q
x
W
E
 
D
R
 
R
A
 
I
T
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
D
V
 
V
T
 
A
E
 
T
N
 
N
M
 
V
I
 
L
Q
 
Q
A
 
R
H
 
N
P
 
P
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
A
V
 
F
F
 
Y
S
 
C
V
 
A
N
|
N
D
 
D
G
 
T
G
 
M
S
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
V
L
 
A
S
 
Q
A
 
A
I
 
V
E
 
A
S
 
N
S
 
A
G
 
G
K
 
K
-
 
I
-
 
G
D
 
K
I
 
V
K
 
L
L
 
V
T
 
V
S
 
G
V
 
T
D
|
D
G
 
G
A
 
I
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
R
A
 
K
A
 
M
I
 
V
Q
 
E
K
 
A
P
 
-
N
 
-
S
 
G
K
 
Q
F
 
M
V
 
T
E
 
A
T
 
T
S
 
V
A
 
A
Q
|
Q
F
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
D
Q
 
I
V
 
G
R
 
A
I
 
T
A
 
G
L
 
L
G
 
K
I
 
L
A
 
M
Y
 
V
-
 
D
A
 
A
K
 
A
K
 
K
W
 
T
G
 
G
A
 
K
N
 
V
V
 
I
P
 
P
K
 
L
A
 
E
I
 
K
P
 
T
V
 
P
D
 
E
V
 
F
K
 
K
M
 
L
I
 
V
D
 
D

2x7xA Fructose binding periplasmic domain of hybrid two component system bt1754 (see paper)
26% identity, 79% coverage: 62:312/317 of query aligns to 23:276/301 of 2x7xA

query
sites
2x7xA
L
 
L
N
 
R
D
 
E
A
 
A
A
 
M
A
 
F
S
 
Y
T
 
N
G
 
G
A
 
V
T
 
S
V
 
V
I
 
E
V
 
I
T
 
R
D
 
S
A
 
A
H
 
G
H
 
D
D
 
D
V
 
N
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
V
 
A
S
 
E
D
 
D
V
 
V
E
 
H
D
 
Y
M
 
F
L
 
M
Q
 
D
K
 
E
K
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
L
L
 
I
V
 
I
N
 
S
P
 
A
T
 
N
D
 
E
S
 
A
T
 
A
G
 
P
I
 
M
Q
 
T
S
 
P
A
 
I
V
 
V
T
 
E
S
 
E
A
 
A
K
 
Y
K
 
Q
A
 
K
G
 
G
V
 
I
V
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
L
V
 
V
D
|
D
A
x
R
N
 
K
-
 
I
A
 
L
N
 
S
G
 
D
P
 
K
V
 
Y
D
 
T
S
 
A
F
 
Y
V
 
I
G
 
G
S
 
A
K
 
D
N
 
N
F
 
Y
D
 
E
A
 
I
G
 
G
Q
 
R
M
 
S
A
 
V
C
 
G
E
 
N
Y
 
Y
L
 
I
S
 
A
K
 
S
S
 
S
I
 
L
G
 
K
G
 
G
S
 
K
G
 
G
E
 
N
V
 
I
A
 
V
I
 
E
L
 
L
D
 
T
G
 
G
I
 
L
P
 
S
-
 
G
V
 
S
V
 
T
P
|
P
I
 
A
L
 
M
E
 
E
R
|
R
V
 
H
R
 
Q
G
 
G
C
 
F
K
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
S
K
 
K
S
 
F
P
 
P
G
 
D
V
 
I
K
 
K
L
 
L
V
 
I
D
 
D
T
 
K
Q
 
A
N
 
D
G
 
A
K
 
A
Q
x
W
E
 
E
R
 
R
A
 
G
T
 
P
A
 
A
L
 
E
S
 
I
V
 
E
T
 
M
E
 
D
N
 
S
M
 
M
I
 
L
Q
 
R
A
 
R
H
 
H
P
 
P
N
 
K
L
 
I
K
 
D
G
 
A
V
 
V
F
 
Y
S
 
A
V
 
H
N
|
N
D
 
D
G
x
R
G
 
I
S
 
A
M
 
P
G
 
G
A
 
A
L
 
Y
S
 
Q
A
 
A
I
 
A
E
 
K
S
 
M
S
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
E
K
 
K
D
 
E
I
 
M
K
 
I
L
 
F
T
 
V
S
 
G
V
 
I
D
|
D
G
 
A
A
 
L
P
 
P
E
 
G
A
 
K
I
 
G
A
 
N
A
 
G
I
 
L
Q
 
E
K
 
L
P
 
V
N
 
L
S
 
D
K
 
S
F
 
V
V
 
L
E
 
D
T
 
A
S
 
T
A
 
F
Q
 
I
F
 
Y
P
 
P
-
 
T
-
 
N
A
 
G
D
 
D
Q
 
K
V
 
V
-
 
L
R
 
Q
I
 
L
A
 
A
L
 
M
G
 
D
I
 
I
A
 
L
Y
 
E
A
 
K
K
 
K
K
 
P
W
 
Y
G
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
P
 
P
K
 
K
A
 
E
I
 
T
P
 
V
V
 
M
D
 
N
V
 
T
K
 
A
M
 
V
I
 
V
D
 
D
K
 
R
S
 
T
N
 
N
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2rjoA Crystal structure of twin-arginine translocation pathway signal protein from burkholderia phytofirmans
30% identity, 69% coverage: 43:262/317 of query aligns to 6:239/322 of 2rjoA

query
sites
2rjoA
I
 
L
G
 
A
M
 
C
T
 
S
F
 
F
Q
x
R
E
 
S
L
 
L
N
 
T
N
|
N
P
 
P
Y
 
Y
F
x
Y
V
 
T
T
 
A
M
 
F
Q
 
N
K
 
K
A
 
G
L
 
A
N
 
Q
D
 
S
A
 
F
A
 
A
A
 
K
S
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
L
T
 
P
V
 
Y
I
 
V
V
 
P
T
 
L
D
 
T
A
 
T
H
 
E
H
 
G
D
 
S
V
 
S
S
 
E
K
 
K
Q
 
G
V
 
I
S
 
A
D
 
D
V
 
I
E
 
R
D
 
A
M
 
L
L
 
L
Q
 
Q
K
 
K
K
 
T
I
 
G
D
 
G
I
 
N
L
 
L
L
 
V
V
 
L
N
 
N
-
 
V
-
x
D
P
 
P
T
 
N
D
 
D
S
 
S
T
 
A
G
 
D
I
 
A
Q
 
R
S
 
V
A
 
I
V
 
V
T
 
E
S
 
A
A
 
C
K
 
S
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
A
V
 
Y
V
 
V
V
 
T
A
 
T
V
 
I
D
 
-
A
 
-
N
 
-
A
x
W
N
|
N
G
 
K
P
 
P
V
 
K
D
 
D
-
 
L
-
 
H
-
 
P
-
 
W
-
 
D
-
 
Y
-
 
N
-
 
P
S
 
N
F
 
Y
V
 
V
G
 
A
S
 
H
K
 
L
N
 
S
F
 
Y
D
 
D
A
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
Y
G
 
G
Q
 
E
M
 
E
A
 
T
C
 
A
E
 
T
Y
 
Q
L
 
L
S
 
F
K
 
K
S
 
S
I
 
M
G
 
G
G
 
G
S
 
K
G
 
G
E
 
G
V
 
V
A
 
V
I
 
A
L
 
L
D
 
G
G
 
G
I
 
I
-
 
F
P
 
S
V
x
N
V
 
V
P
|
P
I
 
A
L
 
I
E
 
E
R
|
R
V
 
K
R
 
A
G
 
G
C
 
L
K
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
K
K
 
K
S
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
K
 
Q
L
 
L
V
 
L
D
 
D
T
 
F
Q
 
Q
N
 
V
G
 
A
K
 
D
Q
x
W
E
 
N
R
 
S
A
 
Q
T
 
K
A
 
A
L
 
F
S
 
P
V
 
I
T
 
M
E
 
Q
-
 
A
N
 
W
M
 
M
I
 
T
Q
 
R
A
 
F
H
 
N
P
 
S
N
 
K
L
 
I
K
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
W
S
 
A
V
 
A
N
 
N
D
 
D
G
 
D
G
 
M
S
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
I
S
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
R
S
 
A
S
 
E
G
 
G
-
 
L
-
 
A
K
 
G
D
 
Q
I
 
I
K
 
P
L
 
V
T
 
T
S
 
G
V
 
M
D
|
D
G
 
G
A
 
T
P
 
Q
E
 
P
A
 
G
I
 
L
A
 
V
A
 
A
I
 
I
Q
 
K

4yo7A Crystal structure of an abc transporter solute binding protein (ipr025997) from bacillus halodurans c-125 (bh2323, target efi- 511484) with bound myo-inositol
27% identity, 70% coverage: 43:263/317 of query aligns to 9:234/287 of 4yo7A

query
sites
4yo7A
I
 
I
G
 
G
M
 
V
T
 
S
F
 
I
Q
 
S
E
 
N
L
 
L
N
x
D
N
 
-
P
 
E
Y
 
F
F
 
L
V
 
T
T
 
Y
M
 
M
Q
 
Q
K
 
D
A
 
A
L
 
M
N
 
K
D
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
N
T
 
Y
-
 
P
G
 
D
A
 
F
T
 
E
V
 
F
I
 
I
V
 
F
T
 
S
D
 
D
A
 
A
H
 
Q
H
 
N
D
 
D
V
 
S
S
 
T
K
 
Q
Q
 
Q
V
 
M
S
 
A
D
 
Q
V
 
V
E
 
E
D
 
N
M
 
F
L
 
I
Q
 
S
K
 
R
K
 
N
I
 
V
D
 
D
I
 
A
L
 
I
L
 
I
V
 
V
N
 
N
P
 
P
T
 
V
D
 
D
S
 
T
T
 
T
G
 
S
I
 
A
Q
 
V
S
 
D
A
 
I
V
 
V
T
 
N
S
 
M
A
 
V
K
 
N
K
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
P
V
 
I
V
 
I
A
 
I
V
 
A
D
x
N
A
x
R
N
 
T
A
 
F
N
 
D
G
 
G
P
 
-
V
 
V
D
 
D
-
 
Q
-
 
A
-
 
T
S
 
A
F
 
F
V
 
V
G
 
G
S
 
S
K
 
E
N
 
S
F
 
I
D
 
Q
A
 
S
G
 
G
Q
 
L
M
 
L
A
 
Q
C
 
M
E
 
E
Y
 
E
L
 
V
S
 
A
K
 
K
S
 
L
I
 
L
G
 
N
G
 
N
S
 
E
G
 
G
E
 
N
V
 
I
A
 
A
I
 
I
L
 
M
D
 
D
G
 
G
-
 
E
I
 
L
P
 
G
V
 
H
V
 
E
P
 
A
I
 
Q
L
 
I
E
 
M
R
|
R
V
 
T
R
 
E
G
 
G
C
 
N
K
 
K
A
 
Q
A
 
I
L
 
I
A
 
E
K
 
E
S
 
H
P
 
D
G
 
G
V
 
L
K
 
E
L
 
V
V
 
V
D
 
L
T
 
Q
Q
 
G
N
 
T
G
 
A
K
 
K
Q
 
F
E
 
D
R
 
R
A
 
S
T
 
E
A
 
G
L
 
M
S
 
R
V
 
L
T
 
M
E
 
E
N
 
N
M
 
W
I
 
L
Q
 
N
A
 
S
H
 
G
P
 
T
N
 
E
L
 
I
K
 
D
G
 
A
V
 
V
F
 
V
S
 
A
V
 
N
N
|
N
D
 
D
G
 
E
G
 
M
S
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
I
S
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
E
S
 
A
S
 
V
G
 
G
K
 
K
-
x
L
-
 
D
D
 
D
I
x
V
K
 
I
L
 
V
T
 
A
S
 
G
V
 
I
D
|
D
G
 
A
A
 
T
P
 
P
E
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
E
A
 
A
I
 
M
Q
 
K
K
 
E

Sites not aligning to the query:

A0QYB5 D-threitol-binding protein from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
28% identity, 88% coverage: 19:297/317 of query aligns to 9:290/349 of A0QYB5

query
sites
A0QYB5
A
 
A
L
 
I
F
 
A
A
 
S
S
 
A
L
 
T
A
 
A
F
 
L
S
 
G
L
 
L
S
 
G
M
 
L
I
 
T
A
 
A
V
 
C
-
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
A
Q
 
N
A
 
S
A
 
D
P
 
T
L
 
T
K
 
R
I
 
I
G
 
G
M
 
V
T
 
T
F
 
V
Q
x
Y
E
 
D
L
 
M
N
 
S
N
 
S
P
 
-
Y
 
-
F
 
F
V
 
I
T
 
T
M
 
A
Q
 
G
K
 
K
A
 
E
L
 
G
N
 
M
D
 
D
A
 
A
-
 
Y
A
 
A
A
 
K
S
 
D
T
 
N
G
 
N
A
 
I
T
 
E
V
 
L
I
 
I
V
 
W
T
 
N
D
 
S
A
 
A
H
 
N
H
 
L
D
 
D
V
 
V
S
 
S
K
 
T
Q
 
Q
V
 
A
S
 
S
D
 
Q
V
 
V
E
 
D
D
 
S
M
 
M
L
 
I
Q
 
N
K
 
Q
K
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
A
L
 
I
L
 
I
V
 
V
N
 
V
P
 
P
T
 
V
D
 
Q
S
 
A
T
 
D
G
 
S
I
 
L
Q
 
A
S
 
P
A
 
Q
V
 
V
T
 
A
S
 
S
A
 
A
K
 
K
K
 
A
A
 
K
G
 
G
V
 
I
V
 
P
V
 
L
V
 
V
A
 
P
V
 
V
D
x
N
A
 
A
N
 
A
A
 
L
N
 
D
G
 
S
P
 
K
-
 
D
V
 
I
D
 
A
S
 
G
F
 
N
V
 
V
G
 
Q
S
 
P
K
 
D
N
 
D
F
 
V
D
 
A
A
 
A
G
 
G
Q
 
A
M
 
Q
A
 
E
C
 
M
E
 
Q
Y
 
M
L
 
M
S
 
A
K
 
D
S
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
K
G
 
G
E
 
N
V
 
I
A
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
I
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
P
I
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
S
-
 
G
-
 
E
L
 
L
E
 
D
R
|
R
V
 
S
R
 
K
G
 
G
C
 
I
K
 
E
A
 
Q
A
 
V
L
 
L
A
 
A
K
 
K
S
 
Y
P
 
P
G
 
D
V
 
I
K
 
K
L
 
V
V
 
L
D
 
A
T
 
K
Q
 
D
N
 
T
G
 
A
K
 
N
Q
 
W
E
 
K
R
 
R
A
 
D
T
 
E
A
 
A
L
 
V
S
 
N
V
 
K
T
 
M
E
 
K
N
 
N
M
 
W
I
 
I
Q
 
S
A
 
G
H
 
F
-
 
G
P
 
P
N
 
Q
L
 
I
K
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
V
S
 
A
V
 
Q
N
|
N
D
 
D
G
 
D
G
 
M
S
 
G
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
A
 
A
I
 
L
E
 
K
S
 
E
S
 
S
G
 
G
K
 
R
-
 
T
D
 
G
I
 
V
K
 
P
L
 
I
T
 
V
S
 
G
V
 
I
D
|
D
G
 
G
A
 
I
P
 
E
E
 
D
A
 
G
I
 
L
A
 
N
A
 
A
I
 
V
Q
 
K
K
 
-
P
 
-
N
 
S
S
 
G
K
 
D
F
 
F
V
 
I
E
 
G
T
 
T
S
 
S
A
 
L
Q
|
Q
F
 
N
P
 
G
A
 
T
D
 
-
Q
 
-
V
 
V
R
 
E
I
 
L
A
 
A
L
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
A
Y
 
V
A
 
A
K
 
N
K
 
R
W
 
L
G
 
A
A
 
K
N
 
G
V
 
E
P
 
P

6hyhA Crystal structure of msmeg_1712 from mycobacterium smegmatis in complex with beta-d-fucofuranose (see paper)
28% identity, 64% coverage: 60:261/317 of query aligns to 21:234/304 of 6hyhA

query
sites
6hyhA
K
 
E
A
 
S
L
 
I
N
 
K
D
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
E
S
 
E
T
 
A
G
 
G
A
 
V
T
 
N
V
 
L
I
 
K
V
 
F
T
 
A
D
 
D
A
 
A
H
 
N
H
 
G
D
 
E
V
 
Q
S
 
E
K
 
K
Q
 
Q
V
 
I
S
 
S
D
 
A
V
 
I
E
 
R
D
 
S
M
 
F
L
 
I
Q
 
Q
K
 
Q
K
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
I
L
 
A
V
 
F
N
 
S
P
 
P
T
 
V
D
 
V
S
 
R
T
 
T
G
 
G
I
 
W
Q
x
D
S
 
A
A
 
V
V
 
L
T
 
Q
S
 
E
A
 
T
K
 
K
K
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
P
V
 
V
V
 
I
-
 
L
-
 
T
-
x
D
-
x
R
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
T
N
 
Q
A
x
D
N
 
T
G
 
D
P
 
V
V
 
Y
D
 
K
S
 
T
F
 
F
V
 
I
G
 
G
S
 
A
K
 
D
N
x
F
F
 
I
D
 
E
A
 
E
G
 
G
Q
 
R
M
 
R
A
 
A
C
 
G
E
 
Q
Y
 
W
L
 
V
S
 
A
K
 
D
S
 
Q
I
 
Y
G
 
A
-
 
S
G
 
A
S
 
T
G
 
G
E
 
P
V
 
V
A
 
N
I
 
I
-
 
V
-
 
Q
L
 
L
D
 
E
G
 
G
I
 
T
P
 
T
-
 
G
V
 
A
V
x
D
P
|
P
I
 
A
L
 
I
E
x
D
R
|
R
V
 
K
R
 
T
G
 
G
C
 
F
K
 
A
A
 
E
A
 
G
L
 
I
A
 
S
K
 
K
S
 
N
P
 
P
G
 
N
V
 
L
K
 
K
L
 
I
V
 
V
D
 
A
T
 
S
Q
 
Q
N
 
T
G
 
G
K
 
D
Q
x
F
E
 
T
R
 
R
A
 
S
T
 
G
A
 
G
L
 
K
S
 
Q
V
 
V
T
 
M
E
 
E
N
 
A
M
 
F
I
 
L
Q
 
K
A
 
S
H
 
T
P
 
P
N
 
Q
L
 
I
K
 
D
G
 
V
V
 
V
F
 
F
S
 
A
V
 
Q
N
|
N
D
 
D
G
 
D
G
 
M
S
 
G
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
M
S
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
E
S
 
A
S
 
A
G
 
G
K
 
K
-
 
K
-
 
P
-
 
G
-
 
T
D
 
D
I
 
I
K
 
K
L
 
I
T
 
V
S
 
A
V
 
V
D
|
D
G
 
A
A
 
T
P
 
H
E
 
D
A
 
G
I
 
M
A
 
Q
A
 
A
I
 
L

Sites not aligning to the query:

6hbmA Crystal structure of msmeg_1712 from mycobacterium smegmatis in complex with alpha-l-arabinofuranose (see paper)
28% identity, 64% coverage: 60:261/317 of query aligns to 21:234/304 of 6hbmA

query
sites
6hbmA
K
 
E
A
 
S
L
 
I
N
 
K
D
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
E
S
 
E
T
 
A
G
 
G
A
 
V
T
 
N
V
 
L
I
 
K
V
 
F
T
 
A
D
 
D
A
 
A
H
 
N
H
 
G
D
 
E
V
 
Q
S
 
E
K
 
K
Q
 
Q
V
 
I
S
 
S
D
 
A
V
 
I
E
 
R
D
 
S
M
 
F
L
 
I
Q
 
Q
K
 
Q
K
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
I
L
 
A
V
 
F
N
 
S
P
 
P
T
 
V
D
 
V
S
 
R
T
 
T
G
 
G
I
 
W
Q
x
D
S
 
A
A
 
V
V
 
L
T
 
Q
S
 
E
A
 
T
K
 
K
K
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
P
V
 
V
V
 
I
-
 
L
-
 
T
-
x
D
-
x
R
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
T
N
 
Q
A
x
D
N
 
T
G
 
D
P
 
V
V
 
Y
D
 
K
S
 
T
F
 
F
V
 
I
G
 
G
S
 
A
K
 
D
N
 
F
F
 
I
D
 
E
A
 
E
G
 
G
Q
 
R
M
 
R
A
 
A
C
 
G
E
 
Q
Y
 
W
L
 
V
S
 
A
K
 
D
S
 
Q
I
 
Y
G
 
A
-
 
S
G
 
A
S
 
T
G
 
G
E
 
P
V
 
V
A
 
N
I
 
I
-
 
V
-
 
Q
L
 
L
D
 
E
G
 
G
I
 
T
P
 
T
-
 
G
V
 
A
V
 
D
P
 
P
I
 
A
L
 
I
E
 
D
R
|
R
V
 
K
R
 
T
G
 
G
C
 
F
K
 
A
A
 
E
A
 
G
L
 
I
A
 
S
K
 
K
S
 
N
P
 
P
G
 
N
V
 
L
K
 
K
L
 
I
V
 
V
D
 
A
T
 
S
Q
 
Q
N
 
T
G
 
G
K
 
D
Q
 
F
E
 
T
R
 
R
A
 
S
T
 
G
A
 
G
L
 
K
S
 
Q
V
 
V
T
 
M
E
 
E
N
 
A
M
 
F
I
 
L
Q
 
K
A
 
S
H
 
T
P
 
P
N
 
Q
L
 
I
K
 
D
G
 
V
V
 
V
F
 
F
S
 
A
V
 
Q
N
|
N
D
 
D
G
 
D
G
 
M
S
 
G
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
M
S
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
E
S
 
A
S
 
A
G
 
G
K
 
K
-
 
K
-
 
P
-
 
G
-
 
T
D
 
D
I
 
I
K
 
K
L
 
I
T
 
V
S
 
A
V
 
V
D
|
D
G
 
A
A
 
T
P
 
H
E
 
D
A
 
G
I
 
M
A
 
Q
A
 
A
I
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>H281DRAFT_04150 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_04150
MTQTTFKHASLNTFARRGALFASLAFSLSMIAVPAAQAAPLKIGMTFQELNNPYFVTMQK
ALNDAAASTGATVIVTDAHHDVSKQVSDVEDMLQKKIDILLVNPTDSTGIQSAVTSAKKA
GVVVVAVDANANGPVDSFVGSKNFDAGQMACEYLSKSIGGSGEVAILDGIPVVPILERVR
GCKAALAKSPGVKLVDTQNGKQERATALSVTENMIQAHPNLKGVFSVNDGGSMGALSAIE
SSGKDIKLTSVDGAPEAIAAIQKPNSKFVETSAQFPADQVRIALGIAYAKKWGANVPKAI
PVDVKMIDKSNAKGFSW

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory