SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_04686 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_04686 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3ozwA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with ketoconazole (see paper)
54% identity, 98% coverage: 4:396/401 of query aligns to 2:397/403 of 3ozwA

query
sites
3ozwA
L
 
L
T
 
T
A
 
Q
E
 
K
Q
 
T
I
 
K
A
 
D
R
 
I
V
 
V
K
 
K
A
 
A
T
 
T
V
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
H
G
 
G
T
 
Y
T
 
D
I
 
I
T
 
I
K
 
K
H
 
C
F
 
F
Y
 
Y
K
 
Q
R
 
R
M
 
M
F
 
F
A
 
E
R
 
A
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
K
N
 
N
L
x
V
F
|
F
N
 
N
Q
 
M
T
x
A
H
 
H
Q
 
Q
Q
 
E
S
x
Q
G
 
G
N
 
Q
Q
|
Q
P
 
Q
E
 
Q
T
x
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
E
N
 
N
I
 
I
D
 
E
N
 
D
L
 
P
G
 
N
A
 
S
L
 
L
G
 
M
P
 
A
T
 
V
V
 
L
S
 
K
R
 
N
I
|
I
A
 
A
N
 
N
K
 
K
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
|
L
N
 
G
I
x
V
R
 
K
P
 
P
E
 
E
H
x
Q
Y
|
Y
P
 
P
I
 
I
V
|
V
G
 
G
R
 
E
H
 
H
L
|
L
L
 
L
G
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
K
D
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
N
A
 
A
V
 
A
D
 
T
Q
 
D
P
 
D
T
 
I
L
 
I
D
 
S
A
 
A
W
 
W
Q
 
A
V
 
Q
A
 
A
Y
|
Y
G
 
G
Q
 
N
L
 
L
A
|
A
N
 
D
I
 
V
F
x
L
V
 
M
G
 
G
T
 
M
E
 
E
A
 
S
K
 
E
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
G
 
R
A
 
S
A
 
A
-
 
E
-
 
Q
-
 
P
-
 
G
-
 
G
W
 
W
S
 
K
G
 
G
F
 
W
R
 
R
P
 
T
F
 
F
K
 
V
V
 
I
A
 
R
R
 
E
K
 
K
Q
 
R
V
 
P
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
F
 
F
Y
 
I
L
 
L
T
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
G
A
 
P
A
 
V
C
 
V
D
 
N
F
 
F
E
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
T
S
 
S
V
 
V
K
 
A
R
 
I
F
 
D
V
 
V
D
 
P
K
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
L
D
 
Q
Q
 
Q
P
 
I
R
|
R
Q
|
Q
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
M
P
 
P
H
 
N
G
 
G
K
 
R
W
 
S
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
|
S
V
|
V
K
|
K
R
 
R
E
|
E
D
 
G
G
 
G
R
 
G
E
 
P
D
 
Q
I
 
-
A
x
P
P
 
P
G
|
G
H
x
Y
V
|
V
S
|
S
N
 
N
L
 
L
L
 
L
H
 
H
A
 
D
D
 
H
V
 
V
E
 
N
E
 
V
G
 
G
T
 
D
V
 
Q
V
 
V
H
 
K
V
 
L
S
 
A
A
 
A
P
 
P
M
 
Y
G
 
G
D
 
S
F
 
F
T
 
H
L
 
I
D
 
D
R
 
V
K
 
D
K
 
A
T
 
K
T
 
T
P
 
P
V
 
I
V
 
V
L
 
L
M
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
|
V
G
 
G
V
 
L
T
|
T
P
 
P
M
 
M
T
 
V
S
 
S
M
 
M
L
 
L
S
 
K
T
 
V
I
 
A
L
 
L
A
 
-
D
 
Q
G
 
A
S
 
P
E
 
P
R
 
R
S
 
Q
V
 
V
T
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
H
A
 
G
C
 
A
R
 
R
N
 
N
G
 
S
R
 
A
V
 
V
H
 
H
A
 
A
F
 
M
R
 
R
Q
 
D
W
 
R
L
 
L
N
 
R
E
 
E
T
 
A
V
 
A
A
 
K
S
 
T
H
 
Y
S
 
E
N
 
N
V
 
L
K
 
D
R
 
L
V
 
F
V
 
V
F
 
F
Y
 
Y
E
 
D
A
 
Q
V
 
P
G
 
L
E
 
P
G
 
E
D
 
D
R
 
V
R
 
Q
G
 
G
V
 
R
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
F
 
Y
D
 
P
G
 
G
R
 
L
L
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
K
G
 
Q
I
 
I
A
 
E
G
 
K
Q
 
S
V
 
I
I
 
L
V
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
V
 
I
P
 
P
F
 
F
M
 
M
R
 
R
A
 
M
Q
 
Q
C
 
H
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
D
 
H
P
 
E
A
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
T
 
Y
E
 
E
V
|
V
F
|
F
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3ozvA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with econazole (see paper)
54% identity, 98% coverage: 4:396/401 of query aligns to 2:397/403 of 3ozvA

query
sites
3ozvA
L
 
L
T
 
T
A
 
Q
E
 
K
Q
 
T
I
 
K
A
 
D
R
 
I
V
 
V
K
 
K
A
 
A
T
 
T
V
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
H
G
 
G
T
 
Y
T
 
D
I
|
I
T
 
I
K
 
K
H
 
C
F
|
F
Y
 
Y
K
 
Q
R
 
R
M
 
M
F
 
F
A
 
E
R
 
A
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
V
F
|
F
N
|
N
Q
 
M
T
x
A
H
 
H
Q
|
Q
Q
 
E
S
 
Q
G
 
G
N
 
Q
Q
 
Q
P
 
Q
E
 
Q
T
 
A
L
|
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
E
N
 
N
I
 
I
D
 
E
N
 
D
L
 
P
G
 
N
A
 
S
L
 
L
G
 
M
P
 
A
T
 
V
V
 
L
S
 
K
R
 
N
I
|
I
A
 
A
N
 
N
K
|
K
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
|
L
N
 
G
I
x
V
R
 
K
P
 
P
E
 
E
H
x
Q
Y
|
Y
P
 
P
I
 
I
V
|
V
G
 
G
R
 
E
H
 
H
L
|
L
L
 
L
G
 
A
A
 
A
I
|
I
V
 
K
D
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
N
A
 
A
V
 
A
D
 
T
Q
 
D
P
 
D
T
 
I
L
 
I
D
 
S
A
 
A
W
 
W
Q
 
A
V
 
Q
A
 
A
Y
|
Y
G
 
G
Q
 
N
L
 
L
A
|
A
N
 
D
I
 
V
F
x
L
V
 
M
G
 
G
T
 
M
E
 
E
A
 
S
K
 
E
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
G
 
R
A
 
S
A
 
A
-
 
E
-
 
Q
-
 
P
-
 
G
-
 
G
W
 
W
S
 
K
G
 
G
F
 
W
R
 
R
P
 
T
F
 
F
K
 
V
V
 
I
A
 
R
R
 
E
K
 
K
Q
 
R
V
 
P
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
F
 
F
Y
 
I
L
 
L
T
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
G
A
 
P
A
 
V
C
 
V
D
 
N
F
 
F
E
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
T
S
 
S
V
 
V
K
 
A
R
 
I
F
 
D
V
 
V
D
 
P
K
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
L
D
 
Q
Q
 
Q
P
 
I
R
|
R
Q
|
Q
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
M
P
 
P
H
 
N
G
 
G
K
 
R
W
 
S
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
|
S
V
|
V
K
|
K
R
 
R
E
|
E
D
 
G
G
 
G
R
 
G
E
 
P
D
 
Q
I
 
-
A
x
P
P
 
P
G
|
G
H
x
Y
V
|
V
S
|
S
N
 
N
L
 
L
L
 
L
H
 
H
A
 
D
D
 
H
V
 
V
E
 
N
E
 
V
G
 
G
T
 
D
V
 
Q
V
 
V
H
 
K
V
 
L
S
 
A
A
 
A
P
 
P
M
 
Y
G
 
G
D
 
S
F
 
F
T
 
H
L
 
I
D
 
D
R
 
V
K
 
D
K
 
A
T
 
K
T
 
T
P
 
P
V
 
I
V
 
V
L
 
L
M
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
|
V
G
 
G
V
 
L
T
|
T
P
 
P
M
 
M
T
 
V
S
 
S
M
 
M
L
 
L
S
 
K
T
 
V
I
 
A
L
 
L
A
 
-
D
 
Q
G
 
A
S
 
P
E
 
P
R
 
R
S
 
Q
V
 
V
T
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
H
A
 
G
C
 
A
R
 
R
N
 
N
G
 
S
R
 
A
V
 
V
H
 
H
A
 
A
F
 
M
R
 
R
Q
 
D
W
 
R
L
 
L
N
 
R
E
 
E
T
 
A
V
 
A
A
 
K
S
 
T
H
 
Y
S
 
E
N
 
N
V
 
L
K
 
D
R
 
L
V
 
F
V
 
V
F
 
F
Y
 
Y
E
 
D
A
 
Q
V
 
P
G
 
L
E
 
P
G
 
E
D
 
D
R
 
V
R
 
Q
G
 
G
V
 
R
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
F
 
Y
D
 
P
G
 
G
R
 
L
L
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
K
G
 
Q
I
 
I
A
 
E
G
 
K
Q
 
S
V
 
I
I
 
L
V
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
V
 
I
P
 
P
F
 
F
M
 
M
R
 
R
A
 
M
Q
 
Q
C
 
H
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
D
 
H
P
 
E
A
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
T
 
Y
E
 
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G

3ozuA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with miconazole (see paper)
54% identity, 98% coverage: 4:396/401 of query aligns to 2:397/403 of 3ozuA

query
sites
3ozuA
L
 
L
T
 
T
A
 
Q
E
 
K
Q
 
T
I
 
K
A
 
D
R
 
I
V
 
V
K
 
K
A
 
A
T
 
T
V
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
H
G
 
G
T
 
Y
T
 
D
I
 
I
T
x
I
K
 
K
H
 
C
F
|
F
Y
 
Y
K
 
Q
R
 
R
M
 
M
F
 
F
A
 
E
R
 
A
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
V
F
|
F
N
|
N
Q
 
M
T
x
A
H
|
H
Q
 
Q
Q
 
E
S
 
Q
G
 
G
N
 
Q
Q
 
Q
P
 
Q
E
 
Q
T
x
A
L
|
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
E
N
 
N
I
 
I
D
 
E
N
 
D
L
 
P
G
 
N
A
 
S
L
 
L
G
 
M
P
 
A
T
 
V
V
 
L
S
 
K
R
 
N
I
|
I
A
 
A
N
 
N
K
 
K
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
|
L
N
 
G
I
x
V
R
 
K
P
 
P
E
 
E
H
x
Q
Y
|
Y
P
 
P
I
 
I
V
|
V
G
 
G
R
 
E
H
 
H
L
|
L
L
 
L
G
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
K
D
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
N
A
 
A
V
 
A
D
 
T
Q
 
D
P
 
D
T
 
I
L
 
I
D
 
S
A
 
A
W
|
W
Q
 
A
V
 
Q
A
|
A
Y
|
Y
G
 
G
Q
 
N
L
|
L
A
|
A
N
 
D
I
 
V
F
x
L
V
 
M
G
 
G
T
 
M
E
 
E
A
 
S
K
 
E
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
G
 
R
A
 
S
A
 
A
-
 
E
-
 
Q
-
 
P
-
 
G
-
 
G
W
 
W
S
 
K
G
 
G
F
 
W
R
 
R
P
 
T
F
 
F
K
 
V
V
 
I
A
 
R
R
 
E
K
 
K
Q
 
R
V
 
P
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
F
 
F
Y
 
I
L
 
L
T
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
G
A
 
P
A
 
V
C
 
V
D
 
N
F
 
F
E
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
T
S
 
S
V
 
V
K
 
A
R
 
I
F
 
D
V
 
V
D
 
P
K
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
L
D
 
Q
Q
 
Q
P
 
I
R
|
R
Q
|
Q
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
M
P
 
P
H
 
N
G
 
G
K
 
R
W
 
S
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
|
S
V
|
V
K
|
K
R
 
R
E
|
E
D
 
G
G
 
G
R
 
G
E
 
P
D
 
Q
I
 
-
A
x
P
P
 
P
G
|
G
H
x
Y
V
|
V
S
|
S
N
 
N
L
 
L
L
 
L
H
 
H
A
 
D
D
 
H
V
 
V
E
 
N
E
 
V
G
 
G
T
 
D
V
 
Q
V
 
V
H
 
K
V
 
L
S
 
A
A
 
A
P
 
P
M
 
Y
G
 
G
D
 
S
F
 
F
T
 
H
L
 
I
D
 
D
R
 
V
K
 
D
K
 
A
T
 
K
T
 
T
P
 
P
V
 
I
V
 
V
L
 
L
M
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
V
 
L
T
 
T
P
 
P
M
 
M
T
 
V
S
 
S
M
 
M
L
 
L
S
 
K
T
 
V
I
 
A
L
 
L
A
 
-
D
 
Q
G
 
A
S
 
P
E
 
P
R
 
R
S
 
Q
V
 
V
T
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
H
A
 
G
C
 
A
R
 
R
N
 
N
G
 
S
R
 
A
V
 
V
H
 
H
A
 
A
F
 
M
R
 
R
Q
 
D
W
 
R
L
 
L
N
 
R
E
 
E
T
 
A
V
 
A
A
 
K
S
 
T
H
 
Y
S
 
E
N
 
N
V
 
L
K
 
D
R
 
L
V
 
F
V
 
V
F
 
F
Y
 
Y
E
 
D
A
 
Q
V
 
P
G
 
L
E
 
P
G
 
E
D
 
D
R
 
V
R
 
Q
G
 
G
V
 
R
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
F
 
Y
D
 
P
G
 
G
R
 
L
L
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
K
G
 
Q
I
 
I
A
 
E
G
 
K
Q
 
S
V
 
I
I
 
L
V
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
V
 
I
P
 
P
F
 
F
M
 
M
R
 
R
A
 
M
Q
 
Q
C
 
H
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
D
 
H
P
 
E
A
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
T
 
Y
E
|
E
V
|
V
F
 
F
G
|
G

Sites not aligning to the query:

P39662 Flavohemoprotein; FHP; Flavohemoglobin; Hemoglobin-like protein; Nitric oxide dioxygenase; NO oxygenase; NOD; EC 1.14.12.17 from Cupriavidus necator (strain ATCC 17699 / DSM 428 / KCTC 22496 / NCIMB 10442 / H16 / Stanier 337) (Ralstonia eutropha) (see paper)
54% identity, 98% coverage: 4:396/401 of query aligns to 2:397/403 of P39662

query
sites
P39662
L
 
L
T
 
T
A
 
Q
E
 
K
Q
 
T
I
 
K
A
 
D
R
 
I
V
 
V
K
 
K
A
 
A
T
 
T
V
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
H
G
 
G
T
 
Y
T
 
D
I
 
I
T
 
I
K
 
K
H
 
C
F
 
F
Y
 
Y
K
 
Q
R
 
R
M
 
M
F
 
F
A
 
E
R
 
A
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
V
F
 
F
N
 
N
Q
 
M
T
 
A
H
 
H
Q
 
Q
Q
 
E
S
 
Q
G
 
G
N
 
Q
Q
 
Q
P
 
Q
E
 
Q
T
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
|
A
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
E
N
 
N
I
 
I
D
 
E
N
 
D
L
 
P
G
 
N
A
 
S
L
 
L
G
 
M
P
 
A
T
 
V
V
 
L
S
 
K
R
 
N
I
 
I
A
 
A
N
 
N
K
 
K
H
 
H
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
G
I
 
V
R
 
K
P
 
P
E
 
E
H
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
V
|
V
G
 
G
R
 
E
H
 
H
L
 
L
L
 
L
G
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
K
D
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
N
A
 
A
V
 
A
D
 
T
Q
 
D
P
 
D
T
 
I
L
 
I
D
 
S
A
 
A
W
 
W
Q
 
A
V
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
N
L
 
L
A
 
A
N
 
D
I
 
V
F
 
L
V
 
M
G
 
G
T
 
M
E
 
E
A
 
S
K
 
E
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
G
 
R
A
 
S
A
 
A
-
 
E
-
 
Q
-
 
P
-
 
G
-
 
G
W
 
W
S
 
K
G
 
G
F
 
W
R
 
R
P
 
T
F
 
F
K
 
V
V
 
I
A
 
R
R
 
E
K
 
K
Q
 
R
V
 
P
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
F
 
F
Y
 
I
L
 
L
T
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
G
A
 
P
A
 
V
C
 
V
D
 
N
F
 
F
E
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
T
S
 
S
V
 
V
K
 
A
R
 
I
F
 
D
V
 
V
D
 
P
K
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
L
D
 
Q
Q
 
Q
P
 
I
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
M
P
 
P
H
 
N
G
 
G
K
 
R
W
 
S
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
 
S
V
 
V
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
G
G
 
G
R
 
G
E
 
P
D
 
Q
I
 
-
A
 
P
P
 
P
G
 
G
H
 
Y
V
 
V
S
 
S
N
 
N
L
 
L
L
 
L
H
 
H
A
 
D
D
 
H
V
 
V
E
 
N
E
 
V
G
 
G
T
 
D
V
 
Q
V
 
V
H
 
K
V
 
L
S
 
A
A
 
A
P
 
P
M
 
Y
G
 
G
D
 
S
F
 
F
T
 
H
L
 
I
D
 
D
R
 
V
K
 
D
K
 
A
T
 
K
T
 
T
P
 
P
V
 
I
V
 
V
L
 
L
M
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
V
 
L
T
 
T
P
 
P
M
 
M
T
 
V
S
 
S
M
 
M
L
 
L
S
 
K
T
 
V
I
 
A
L
 
L
A
 
-
D
 
Q
G
 
A
S
 
P
E
 
P
R
 
R
S
 
Q
V
 
V
T
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
H
A
 
G
C
 
A
R
 
R
N
 
N
G
 
S
R
 
A
V
 
V
H
 
H
A
 
A
F
 
M
R
 
R
Q
 
D
W
 
R
L
 
L
N
 
R
E
 
E
T
 
A
V
 
A
A
 
K
S
 
T
H
 
Y
S
 
E
N
 
N
V
 
L
K
 
D
R
 
L
V
 
F
V
 
V
F
 
F
Y
 
Y
E
 
D
A
 
Q
V
 
P
G
 
L
E
 
P
G
 
E
D
 
D
R
 
V
R
 
Q
G
 
G
V
 
R
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
F
 
Y
D
 
P
G
 
G
R
 
L
L
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
K
G
 
Q
I
 
I
A
 
E
G
 
K
Q
 
S
V
 
I
I
 
L
V
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
V
 
I
P
 
P
F
 
F
M
 
M
R
 
R
A
 
M
Q
 
Q
C
 
H
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
D
 
H
P
 
E
A
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
T
 
Y
E
 
E
V
 
V
F
 
F
G
 
G

1cqxA Crystal structure of the flavohemoglobin from alcaligenes eutrophus at 1.75 a resolution (see paper)
54% identity, 98% coverage: 4:396/401 of query aligns to 2:397/403 of 1cqxA

query
sites
1cqxA
L
 
L
T
 
T
A
 
Q
E
 
K
Q
 
T
I
 
K
A
 
D
R
 
I
V
 
V
K
 
K
A
 
A
T
 
T
V
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
H
G
 
G
T
 
Y
T
 
D
I
 
I
T
 
I
K
 
K
H
 
C
F
 
F
Y
 
Y
K
 
Q
R
 
R
M
 
M
F
 
F
A
 
E
R
 
A
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
V
F
|
F
N
|
N
Q
 
M
T
x
A
H
|
H
Q
 
Q
Q
 
E
S
 
Q
G
 
G
N
 
Q
Q
 
Q
P
 
Q
E
 
Q
T
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
E
N
 
N
I
 
I
D
 
E
N
 
D
L
 
P
G
 
N
A
 
S
L
 
L
G
 
M
P
 
A
T
 
V
V
 
L
S
 
K
R
 
N
I
|
I
A
 
A
N
 
N
K
 
K
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
|
L
N
 
G
I
x
V
R
 
K
P
 
P
E
 
E
H
x
Q
Y
|
Y
P
 
P
I
 
I
V
|
V
G
 
G
R
 
E
H
 
H
L
 
L
L
 
L
G
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
K
D
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
N
A
 
A
V
 
A
D
 
T
Q
 
D
P
 
D
T
 
I
L
 
I
D
 
S
A
 
A
W
 
W
Q
 
A
V
 
Q
A
 
A
Y
|
Y
G
 
G
Q
 
N
L
|
L
A
|
A
N
 
D
I
 
V
F
x
L
V
 
M
G
 
G
T
 
M
E
 
E
A
 
S
K
 
E
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
G
 
R
A
 
S
A
 
A
-
 
E
-
 
Q
-
 
P
-
 
G
-
 
G
W
 
W
S
 
K
G
 
G
F
 
W
R
 
R
P
 
T
F
 
F
K
 
V
V
 
I
A
 
R
R
 
E
K
 
K
Q
 
R
V
 
P
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
F
 
F
Y
 
I
L
 
L
T
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
G
A
 
P
A
 
V
C
 
V
D
 
N
F
 
F
E
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
V
 
T
S
 
S
V
 
V
K
 
A
R
 
I
F
 
D
V
 
V
D
 
P
K
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
L
D
 
Q
Q
 
Q
P
 
I
R
|
R
Q
|
Q
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
M
P
 
P
H
 
N
G
 
G
K
 
R
W
 
T
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
|
S
V
 
V
K
 
K
R
 
R
E
|
E
D
 
G
G
 
G
R
 
G
E
 
P
D
x
Q
I
 
-
A
x
P
P
 
P
G
|
G
H
x
Y
V
|
V
S
|
S
N
 
N
L
 
L
L
 
L
H
 
H
A
 
D
D
 
H
V
 
V
E
 
N
E
 
V
G
 
G
T
 
D
V
 
Q
V
 
V
H
 
K
V
 
L
S
 
A
A
 
A
P
 
P
M
 
Y
G
 
G
D
 
S
F
 
F
T
 
H
L
 
I
D
 
D
R
 
V
K
 
D
K
 
A
T
 
K
T
 
T
P
 
P
V
 
I
V
 
V
L
 
L
M
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
V
 
L
T
 
T
P
 
P
M
 
M
T
 
V
S
 
S
M
 
M
L
 
L
S
 
K
T
 
V
I
 
A
L
 
L
A
 
-
D
 
Q
G
 
A
S
 
P
E
 
P
R
 
R
S
 
Q
V
 
V
T
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
H
A
 
G
C
 
A
R
 
R
N
 
N
G
 
S
R
 
A
V
 
V
H
 
H
A
 
A
F
 
M
R
 
R
Q
 
D
W
 
R
L
 
L
N
 
R
E
 
E
T
 
A
V
 
A
A
 
K
S
 
T
H
 
Y
S
 
E
N
 
N
V
 
L
K
 
D
R
 
L
V
 
F
V
 
V
F
 
F
Y
 
Y
E
 
D
A
 
Q
V
 
P
G
 
L
E
 
P
G
 
E
D
 
D
R
 
V
R
 
Q
G
 
G
V
 
R
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
F
 
Y
D
 
P
G
 
G
R
 
L
L
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
K
G
 
Q
I
 
I
A
 
E
G
 
K
Q
 
S
V
 
I
I
 
L
V
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
V
 
I
P
 
P
F
 
F
M
 
M
R
 
R
A
 
M
Q
 
Q
C
 
H
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
D
 
H
P
 
E
A
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
T
 
Y
E
 
E
V
|
V
F
 
F
G
|
G

Sites not aligning to the query:

1gvhA The x-ray structure of ferric escherichia coli flavohemoglobin reveals an unespected geometry of the distal heme pocket (see paper)
43% identity, 98% coverage: 4:396/401 of query aligns to 2:391/396 of 1gvhA

query
sites
1gvhA
L
 
L
T
 
D
A
 
A
E
 
Q
Q
 
T
I
 
I
A
 
A
R
 
T
V
 
V
K
 
K
A
 
A
T
 
T
V
 
I
P
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
V
E
 
E
H
 
T
G
 
G
T
 
P
T
 
K
I
 
L
T
 
T
K
 
A
H
 
H
F
 
F
Y
 
Y
K
 
D
R
 
R
M
 
M
F
 
F
A
 
T
R
 
H
H
 
N
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
K
N
 
E
L
 
I
F
|
F
N
 
N
Q
 
M
T
x
S
H
 
N
Q
|
Q
Q
 
R
S
x
N
G
 
G
N
 
D
Q
|
Q
P
 
R
E
 
E
T
x
A
L
|
L
A
 
F
R
 
N
A
|
A
V
x
I
Y
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
S
N
 
N
I
 
I
D
 
E
N
 
N
L
 
L
G
 
P
A
 
A
L
 
L
G
 
L
P
 
P
T
 
A
V
 
V
S
 
E
R
 
K
I
|
I
A
 
A
N
 
Q
K
|
K
H
|
H
A
 
T
S
 
S
L
 
F
N
 
Q
I
|
I
R
 
K
P
 
P
E
 
E
H
x
Q
Y
|
Y
P
 
N
I
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
E
H
 
H
L
 
L
L
 
L
G
 
A
A
 
T
I
 
L
V
 
D
D
 
E
V
 
M
L
 
F
G
 
S
D
 
P
A
 
G
V
 
-
D
 
-
Q
 
Q
P
 
E
T
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
W
 
W
Q
 
G
V
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
V
L
|
L
A
 
A
N
 
N
I
 
V
F
|
F
V
 
I
G
 
N
T
 
R
E
 
E
A
 
A
K
 
E
L
 
I
Y
 
Y
-
 
N
-
 
E
-
 
N
-
 
A
-
 
S
E
 
K
G
 
A
A
 
G
A
 
G
W
 
W
S
 
E
G
 
G
F
 
T
R
 
R
P
 
D
F
 
F
K
 
R
V
 
I
A
 
V
R
 
A
K
 
K
Q
 
T
V
 
P
E
 
R
S
 
S
D
 
A
E
 
L
I
 
I
T
 
T
S
 
S
F
 
F
Y
 
E
L
 
L
T
 
E
P
 
P
A
 
V
D
 
D
G
 
G
S
 
G
A
 
A
A
 
V
C
 
A
D
 
E
F
 
Y
E
 
R
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
V
 
L
S
 
G
V
 
V
K
 
W
R
 
L
F
 
K
V
 
P
D
 
E
K
 
G
L
 
F
G
 
P
V
 
H
D
 
Q
Q
 
E
P
 
I
R
|
R
Q
|
Q
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
S
 
T
D
 
R
A
 
K
P
 
P
H
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
G
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
x
A
V
|
V
K
 
K
R
 
R
E
|
E
D
 
E
G
 
G
R
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
G
|
G
H
x
Q
V
|
V
S
|
S
N
 
N
L
 
W
L
 
L
H
 
H
A
 
N
D
 
H
V
 
A
E
 
N
E
 
V
G
 
G
T
 
D
V
 
V
V
 
V
H
 
K
V
 
L
S
 
V
A
 
A
P
 
P
M
 
A
G
 
G
D
 
D
F
 
F
T
 
F
L
 
M
D
 
A
R
 
V
K
 
A
K
 
D
T
 
D
T
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
T
L
 
L
M
 
I
S
 
S
G
 
A
G
 
G
V
|
V
G
 
G
V
 
Q
T
|
T
P
 
P
M
 
M
T
 
L
S
 
A
M
 
M
L
 
L
S
 
D
T
 
T
I
 
L
L
 
A
A
 
K
D
 
A
G
 
G
S
 
H
E
 
T
R
 
A
S
 
Q
V
 
V
T
 
N
F
 
W
V
 
F
H
 
H
A
 
A
C
 
A
R
 
E
N
 
N
G
 
G
R
 
D
V
 
V
H
 
H
A
 
A
F
 
F
R
 
A
Q
 
D
W
 
E
L
 
V
N
 
K
E
 
E
T
 
L
V
 
G
A
 
Q
S
 
S
H
 
L
S
 
P
N
 
R
V
 
F
K
 
T
R
 
A
V
 
H
V
 
T
F
 
W
Y
 
Y
E
 
R
A
 
Q
V
 
P
G
 
S
E
 
E
G
 
A
D
 
D
R
 
R
R
 
A
G
 
K
V
 
G
D
 
Q
Y
 
F
D
 
D
F
 
S
D
 
E
G
 
G
R
 
L
L
 
M
D
 
D
V
 
L
A
 
S
G
 
K
I
 
L
A
 
E
G
 
G
Q
 
A
V
 
F
I
 
S
V
 
D
P
 
P
D
 
T
A
 
M
D
 
Q
Y
 
F
Y
 
Y
I
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
V
 
V
P
 
G
F
 
F
M
 
M
R
 
Q
A
 
F
Q
 
T
C
 
A
D
 
K
A
 
Q
L
 
L
A
 
V
A
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
K
P
 
Q
A
 
E
R
 
N
I
 
I
H
 
H
T
 
Y
E
|
E
V
 
C
F
|
F
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P24232 Flavohemoprotein; Flavohemoglobin; HMP; Hemoglobin-like protein; Nitric oxide dioxygenase; NO oxygenase; NOD; EC 1.14.12.17 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
43% identity, 98% coverage: 4:396/401 of query aligns to 2:391/396 of P24232

query
sites
P24232
L
 
L
T
 
D
A
 
A
E
 
Q
Q
 
T
I
 
I
A
 
A
R
 
T
V
 
V
K
 
K
A
 
A
T
 
T
V
 
I
P
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
V
E
 
E
H
 
T
G
 
G
T
 
P
T
 
K
I
 
L
T
 
T
K
 
A
H
 
H
F
 
F
Y
|
Y
K
 
D
R
 
R
M
 
M
F
 
F
A
 
T
R
 
H
H
 
N
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
K
N
 
E
L
 
I
F
 
F
N
 
N
Q
 
M
T
 
S
H
 
N
Q
 
Q
Q
 
R
S
 
N
G
 
G
N
 
D
Q
 
Q
P
 
R
E
 
E
T
 
A
L
 
L
A
 
F
R
 
N
A
 
A
V
 
I
Y
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
S
N
 
N
I
 
I
D
 
E
N
 
N
L
 
L
G
 
P
A
 
A
L
 
L
G
 
L
P
 
P
T
 
A
V
 
V
S
 
E
R
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
Q
K
 
K
H
 
H
A
 
T
S
 
S
L
 
F
N
 
Q
I
 
I
R
 
K
P
 
P
E
 
E
H
 
Q
Y
|
Y
P
 
N
I
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
E
H
 
H
L
 
L
L
 
L
G
 
A
A
 
T
I
 
L
V
 
D
D
 
E
V
 
M
L
 
F
G
 
S
D
 
P
A
 
G
V
 
-
D
 
-
Q
 
Q
P
 
E
T
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
W
 
W
Q
 
G
V
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
V
L
 
L
A
 
A
N
 
N
I
 
V
F
 
F
V
 
I
G
 
N
T
 
R
E
|
E
A
 
A
K
 
E
L
 
I
Y
 
Y
-
 
N
-
 
E
-
 
N
-
 
A
-
 
S
E
 
K
G
 
A
A
 
G
A
 
G
W
 
W
S
 
E
G
 
G
F
 
T
R
 
R
P
 
D
F
 
F
K
 
R
V
 
I
A
 
V
R
 
A
K
 
K
Q
 
T
V
 
P
E
 
R
S
 
S
D
 
A
E
 
L
I
 
I
T
 
T
S
 
S
F
 
F
Y
 
E
L
 
L
T
 
E
P
 
P
A
 
V
D
 
D
G
 
G
S
 
G
A
 
A
A
 
V
C
 
A
D
 
E
F
 
Y
E
 
R
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
L
S
 
G
V
 
V
K
 
W
R
 
L
F
 
K
V
 
P
D
 
E
K
 
G
L
 
F
G
 
P
V
 
H
D
 
Q
Q
 
E
P
 
I
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
S
 
T
D
 
R
A
 
K
P
 
P
H
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
G
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
 
A
V
 
V
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
E
G
 
G
R
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
G
H
 
Q
V
 
V
S
 
S
N
 
N
L
 
W
L
 
L
H
 
H
A
 
N
D
 
H
V
 
A
E
 
N
E
 
V
G
 
G
T
 
D
V
 
V
V
 
V
H
 
K
V
 
L
S
 
V
A
 
A
P
 
P
M
 
A
G
 
G
D
 
D
F
 
F
T
 
F
L
 
M
D
 
A
R
 
V
K
 
A
K
 
D
T
 
D
T
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
T
L
 
L
M
 
I
S
 
S
G
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
V
 
Q
T
 
T
P
 
P
M
 
M
T
 
L
S
 
A
M
 
M
L
 
L
S
 
D
T
 
T
I
 
L
L
 
A
A
 
K
D
 
A
G
 
G
S
 
H
E
 
T
R
 
A
S
 
Q
V
 
V
T
 
N
F
 
W
V
 
F
H
 
H
A
 
A
C
 
A
R
 
E
N
 
N
G
 
G
R
 
D
V
 
V
H
 
H
A
 
A
F
 
F
R
 
A
Q
 
D
W
 
E
L
 
V
N
 
K
E
 
E
T
 
L
V
 
G
A
 
Q
S
 
S
H
 
L
S
 
P
N
 
R
V
 
F
K
 
T
R
 
A
V
 
H
V
 
T
F
 
W
Y
 
Y
E
 
R
A
 
Q
V
 
P
G
 
S
E
 
E
G
 
A
D
 
D
R
 
R
R
 
A
G
 
K
V
 
G
D
 
Q
Y
 
F
D
 
D
F
 
S
D
 
E
G
 
G
R
 
L
L
 
M
D
 
D
V
 
L
A
 
S
G
 
K
I
 
L
A
 
E
G
 
G
Q
 
A
V
 
F
I
 
S
V
 
D
P
 
P
D
 
T
A
 
M
D
 
Q
Y
 
F
Y
 
Y
I
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
V
 
V
P
 
G
F
 
F
M
 
M
R
 
Q
A
 
F
Q
 
T
C
 
A
D
 
K
A
 
Q
L
 
L
A
 
V
A
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
K
P
 
Q
A
 
E
R
 
N
I
 
I
H
 
H
T
 
Y
E
 
E
V
 
C
F
 
F
G
 
G

4g1bA X-ray structure of yeast flavohemoglobin in complex with econazole (see paper)
38% identity, 96% coverage: 12:396/401 of query aligns to 10:391/398 of 4g1bA

query
sites
4g1bA
V
 
I
K
 
K
A
 
A
T
 
T
V
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
E
E
 
Q
H
 
Q
G
 
G
T
 
T
T
 
V
I
 
I
T
 
T
K
 
R
H
 
T
F
|
F
Y
|
Y
K
 
K
R
 
N
M
 
M
F
 
L
A
 
T
R
 
E
H
 
H
P
 
T
E
 
E
L
 
L
K
 
L
N
 
N
L
x
I
F
|
F
N
|
N
Q
 
R
T
|
T
H
x
N
Q
 
Q
Q
 
K
S
x
V
G
 
G
N
 
A
Q
 
Q
P
 
P
E
 
N
T
x
A
L
|
L
A
 
A
R
 
T
A
x
T
V
 
V
Y
 
L
A
 
A
Y
 
A
A
 
A
A
 
K
N
 
N
I
 
I
D
 
D
N
 
D
L
 
L
G
 
S
A
 
V
L
 
L
G
 
M
P
 
D
T
 
H
V
 
V
S
 
K
R
x
Q
I
|
I
A
 
G
N
 
H
K
|
K
H
|
H
A
 
R
S
 
A
L
|
L
N
 
Q
I
|
I
R
 
K
P
 
P
E
 
E
H
|
H
Y
|
Y
P
 
P
I
 
I
V
|
V
G
 
G
R
 
E
H
 
Y
L
|
L
L
 
L
G
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
K
D
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
A
V
 
A
D
 
T
Q
 
P
P
 
E
T
 
I
L
 
I
D
 
N
A
 
A
W
 
W
Q
 
G
V
 
E
A
 
A
Y
|
Y
G
 
Q
Q
 
A
L
 
I
A
 
A
N
 
D
I
 
I
F
|
F
V
 
I
G
 
T
T
 
V
E
 
E
A
 
K
K
 
K
L
 
M
Y
 
Y
E
 
E
G
 
E
A
 
A
A
 
L
W
 
W
S
 
P
G
 
G
F
 
W
R
 
K
P
 
P
F
 
F
K
 
E
V
 
I
A
 
T
R
 
A
K
 
K
Q
 
E
V
 
Y
E
 
V
S
 
A
D
 
S
E
 
D
I
 
I
T
 
V
S
 
E
F
 
F
Y
 
T
L
 
V
T
 
K
P
 
P
A
 
K
D
 
F
G
 
G
S
 
S
A
 
G
-
 
I
-
 
E
-
 
L
-
 
E
A
 
S
C
 
L
D
 
P
F
 
I
E
 
T
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
V
 
I
S
 
T
V
 
V
K
 
N
R
 
T
-
 
H
-
 
P
F
 
I
V
 
R
D
 
Q
K
 
E
L
 
N
G
 
Q
V
 
Y
D
 
D
Q
 
A
P
 
L
R
|
R
Q
x
H
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
S
 
C
D
 
S
A
 
A
P
 
S
H
 
T
G
 
K
K
 
N
W
 
G
L
 
L
R
 
R
I
 
F
S
x
A
V
 
V
K
|
K
R
 
M
E
|
E
D
 
A
G
 
A
R
 
R
E
 
E
D
 
N
I
x
F
A
x
P
P
 
A
G
|
G
H
x
L
V
|
V
S
|
S
N
 
E
L
 
Y
L
 
L
H
 
H
A
 
K
D
 
D
V
 
A
E
 
K
E
 
V
G
 
G
T
 
D
V
 
E
V
 
I
H
 
K
V
 
L
S
 
S
A
 
A
P
 
P
M
 
A
G
 
G
D
 
D
F
 
F
T
 
A
L
 
I
D
 
N
R
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
I
-
 
H
K
 
Q
K
 
N
T
 
E
T
 
V
P
 
P
V
 
L
V
 
V
L
 
L
M
 
L
S
 
S
G
 
S
G
 
G
V
|
V
G
 
G
V
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
L
T
 
L
S
 
A
M
 
M
L
 
L
S
 
E
T
 
E
I
 
Q
L
 
V
A
 
K
D
 
C
G
 
N
S
 
P
E
 
N
R
 
R
S
 
P
V
 
I
T
 
Y
F
 
W
V
 
I
H
 
Q
A
 
S
C
 
S
R
 
Y
N
 
D
G
 
E
R
 
K
V
 
T
H
 
Q
A
 
A
F
 
F
R
 
K
Q
 
K
W
 
H
L
 
V
N
 
D
E
 
E
T
 
L
V
 
L
A
 
A
S
 
E
H
 
C
S
 
A
N
 
N
V
 
V
K
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
I
F
 
-
Y
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
-
V
 
V
D
 
H
Y
 
T
D
 
D
F
 
T
D
 
E
G
 
P
R
 
L
L
 
I
D
 
N
V
 
A
A
 
A
G
 
F
I
 
L
A
 
K
G
 
E
Q
 
K
V
 
S
I
 
P
V
 
A
P
 
-
D
 
H
A
 
A
D
 
D
Y
 
V
Y
 
Y
I
 
T
C
 
C
G
 
G
P
 
S
V
 
L
P
 
A
F
 
F
M
 
M
R
 
Q
A
 
A
Q
 
M
C
 
I
D
 
G
A
 
H
L
 
L
A
 
K
A
 
E
L
 
L
G
 
E
V
 
H
D
 
R
P
 
D
A
 
D
R
 
M
I
 
I
H
 
H
T
 
Y
E
 
E
V
 
P
F
|
F
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q03331 Flavohemoprotein; Flavohemoglobin; Hemoglobin-like protein; Nitric oxide dioxygenase; NO oxygenase; NOD; EC 1.14.12.17 from Candida norvegensis (Yeast) (Candida mycoderma) (see paper)
33% identity, 99% coverage: 1:396/401 of query aligns to 10:384/390 of Q03331

query
sites
Q03331
M
 
I
T
 
V
A
 
P
L
 
L
T
 
T
A
 
P
E
 
T
Q
 
E
I
 
I
A
 
N
R
 
F
V
 
L
K
 
Q
A
 
S
T
 
L
V
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
V
A
 
K
E
 
E
H
 
H
G
 
G
T
 
V
T
 
T
I
 
V
T
 
T
K
 
S
H
 
T
F
 
M
Y
 
Y
K
 
K
R
 
Y
M
 
M
F
 
F
A
 
Q
R
 
T
H
 
Y
P
 
P
E
 
E
L
 
V
K
 
R
N
 
S
L
 
Y
F
 
F
N
 
N
Q
 
M
T
 
T
H
 
N
Q
 
Q
Q
 
K
S
 
T
G
 
G
N
 
R
Q
 
Q
P
 
P
E
 
K
T
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
F
A
 
S
V
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
Y
 
Y
A
 
I
A
 
L
N
 
H
I
 
L
D
 
N
N
 
D
L
 
L
G
 
T
A
 
P
L
 
I
G
 
S
P
 
G
T
 
F
V
 
V
S
 
N
R
 
Q
I
 
I
A
 
V
N
 
L
K
 
K
H
 
H
A
 
C
S
 
G
L
 
L
N
 
G
I
 
I
R
 
K
P
 
P
E
 
D
H
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
I
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
E
H
 
S
L
 
L
L
 
V
G
 
Q
A
 
A
I
 
F
V
 
K
D
 
M
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
E
A
 
A
V
 
A
D
 
D
Q
 
E
P
 
H
T
 
F
L
 
V
D
 
E
A
 
V
W
 
F
Q
 
K
V
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
N
L
 
L
A
 
A
N
 
Q
I
 
T
F
 
L
V
 
I
G
 
D
T
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
S
L
 
V
Y
 
Y
E
 
K
G
 
T
A
 
L
A
 
A
W
 
W
S
 
E
G
 
E
F
 
F
R
 
K
P
 
D
F
 
F
K
 
R
V
 
V
A
 
T
R
 
K
K
 
L
Q
 
V
V
 
K
E
 
E
S
 
A
D
 
E
E
 
D
I
 
V
T
 
T
S
 
S
F
 
V
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
V
D
 
D
G
 
G
S
 
F
A
 
K
A
 
L
C
 
K
D
 
P
F
 
I
E
 
I
P
 
P
G
 
G
Q
 
E
Y
 
Y
V
 
I
S
 
S
V
 
F
K
 
R
R
 
W
F
 
D
V
 
I
D
 
H
K
 
N
L
 
P
G
 
D
V
 
I
D
 
T
-
 
D
-
 
I
Q
 
Q
P
 
P
R
 
R
Q
 
E
Y
 
Y
S
 
S
L
 
I
S
 
S
D
 
Q
A
 
D
P
 
V
H
 
K
G
 
E
K
 
N
W
 
E
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
 
S
V
 
V
K
 
R
R
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
D
 
D
I
 
I
A
 
-
P
 
-
G
 
G
H
 
I
V
 
V
S
 
S
N
 
D
L
 
Y
L
 
I
H
 
N
A
 
K
D
 
K
V
 
L
E
 
Q
E
 
V
G
 
G
T
 
D
V
 
I
V
 
V
H
 
P
V
 
V
S
 
H
A
 
A
P
 
P
M
 
V
G
 
G
D
 
T
F
 
M
T
 
K
L
 
Y
D
 
D
R
 
S
-
 
I
K
 
S
K
 
K
T
 
K
T
 
G
P
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
V
M
 
L
S
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
I
G
 
G
V
 
I
T
 
T
P
 
P
M
 
M
T
 
I
S
 
P
M
 
I
L
 
I
S
 
E
T
 
H
I
 
A
L
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
S
 
-
E
 
-
R
 
K
S
 
D
V
 
V
T
 
E
F
 
L
V
 
Y
H
 
Y
A
 
S
C
 
N
R
 
R
N
 
S
G
 
Y
R
 
Q
V
 
S
H
 
E
A
 
P
F
 
F
R
 
R
Q
 
E
W
 
F
L
 
F
N
 
-
E
 
-
T
 
-
V
 
-
A
 
-
S
 
-
H
 
-
S
 
S
N
 
N
V
 
L
K
 
E
R
 
K
V
 
-
V
 
-
F
 
-
Y
 
-
E
 
E
A
 
N
V
 
N
G
 
G
E
 
K
G
 
F
D
 
K
R
 
L
R
 
N
G
 
N
V
 
Y
D
 
I
Y
 
S
D
 
A
F
 
E
D
 
N
G
 
Q
R
 
K
L
 
L
D
 
Q
V
 
V
A
 
K
G
 
D
I
 
L
A
 
-
G
 
-
Q
 
E
V
 
H
I
 
I
V
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
E
-
 
Y
D
 
D
Y
 
V
Y
 
Y
I
 
L
C
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
V
P
 
A
F
 
Y
M
 
M
R
 
H
A
 
E
Q
 
F
C
 
K
D
 
T
A
 
Y
L
 
L
A
 
V
A
 
G
L
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
-
P
 
-
A
 
S
R
 
D
I
 
L
H
 
K
T
 
M
E
 
E
V
 
F
F
 
F
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6o0aA Crystal structure of flavohemoglobin from malassezia yamatoensis with bound fad and heme determined by iron sad phasing (see paper)
32% identity, 96% coverage: 12:396/401 of query aligns to 11:383/383 of 6o0aA

query
sites
6o0aA
V
 
I
K
 
Q
A
 
A
T
 
T
V
 
L
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
E
 
E
H
 
R
G
 
I
T
 
P
T
 
H
I
 
I
T
 
T
K
 
P
H
 
V
F
 
F
Y
 
Y
K
 
G
R
 
D
M
 
M
F
 
L
A
 
Q
R
 
A
H
 
R
P
 
P
E
 
D
L
 
L
K
 
L
N
 
D
-
 
G
L
x
M
F
|
F
N
x
S
Q
 
R
T
x
S
H
 
A
Q
 
Q
Q
x
R
S
x
D
G
 
G
N
 
T
Q
 
Q
P
 
A
E
 
R
T
 
A
L
|
L
A
 
A
R
 
G
A
x
S
V
 
I
Y
 
A
A
 
I
Y
 
F
A
 
A
A
 
Q
N
 
W
I
 
I
D
 
L
N
 
Q
L
 
H
G
 
P
A
 
N
L
 
T
G
 
F
P
 
P
-
 
E
-
 
E
T
 
M
V
 
L
S
 
S
R
|
R
I
x
V
A
 
A
N
 
N
K
 
K
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
|
L
N
 
G
I
x
L
R
 
Q
P
 
P
E
 
D
H
x
E
Y
|
Y
P
 
D
I
 
T
V
|
V
G
 
Y
R
 
K
H
 
Y
L
 
L
L
 
F
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
A
D
 
K
V
 
D
L
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
A
V
 
A
D
 
T
Q
 
P
P
 
D
T
 
I
L
 
V
D
 
E
A
 
A
W
 
W
Q
 
T
V
 
E
A
 
V
Y
|
Y
G
 
W
Q
 
L
L
|
L
A
 
A
N
 
R
I
 
A
F
 
L
V
 
I
G
 
N
T
 
L
E
 
E
A
 
R
K
 
K
L
 
L
Y
 
Y
E
 
A
G
 
Q
A
 
Q
A
 
A
W
 
N
S
 
N
G
 
I
F
 
V
R
 
R
-
 
A
P
 
K
F
 
F
K
 
K
V
 
L
A
 
V
R
 
K
K
 
R
Q
 
T
V
 
Q
E
 
V
S
 
T
D
 
K
E
 
D
I
 
V
T
 
V
S
 
D
F
 
M
Y
 
V
L
 
F
T
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
N
S
 
T
A
 
A
A
 
M
C
 
T
D
 
P
F
 
G
E
 
K
P
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
V
 
I
S
 
S
V
 
I
-
 
Y
K
 
A
R
 
R
F
 
T
V
 
S
D
 
D
K
 
-
L
 
-
G
 
G
V
 
L
D
 
L
Q
 
Q
P
 
P
R
|
R
Q
|
Q
Y
x
F
S
x
T
L
 
L
S
 
L
D
 
P
A
 
S
P
 
E
H
 
E
G
 
T
K
 
Q
W
 
R
L
 
-
R
 
R
I
 
I
S
 
A
V
 
I
K
|
K
R
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
L
A
x
D
P
 
P
G
x
H
H
x
G
V
x
E
S
x
M
N
x
T
L
 
T
L
 
I
H
 
F
A
 
Q
D
 
N
V
 
Q
E
 
E
E
 
V
G
 
G
T
 
A
V
 
L
V
 
L
H
 
D
V
 
I
S
 
S
A
 
N
P
 
P
M
 
Y
G
 
G
D
 
D
F
 
M
T
 
T
L
 
L
D
 
E
R
 
T
K
 
L
K
 
E
T
 
T
-
 
D
-
 
P
-
 
N
T
 
S
P
 
P
V
 
L
V
 
V
L
 
L
M
 
I
S
 
C
G
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
G
V
 
V
T
|
T
P
 
P
M
 
V
T
 
L
S
 
A
M
 
F
L
 
V
S
 
E
T
 
K
I
 
L
L
 
A
A
 
A
D
 
Q
G
 
K
S
 
S
E
 
E
R
 
R
S
 
E
V
 
V
T
 
M
F
 
I
V
 
I
H
 
A
A
 
S
C
 
S
R
 
R
N
 
S
G
 
L
R
 
A
V
 
E
H
 
A
A
 
P
F
 
L
R
 
R
Q
 
G
W
 
E
L
 
L
N
 
L
E
 
E
T
 
R
V
 
A
A
 
K
S
 
E
H
 
L
S
 
K
N
 
K
V
 
A
K
 
K
R
 
-
V
 
-
V
 
V
F
 
L
Y
 
Y
E
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
G
D
 
T
R
 
T
R
 
Q
G
 
E
V
 
K
D
 
D
Y
 
G
D
 
D
F
 
F
D
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
V
A
 
S
G
 
T
I
 
L
A
 
D
G
 
-
Q
 
-
V
 
-
I
 
I
V
 
P
P
 
A
D
 
N
A
 
A
D
 
S
Y
 
V
Y
 
F
I
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
V
 
L
P
 
K
F
 
F
M
 
M
R
 
Q
A
 
E
Q
 
M
C
 
R
D
 
S
A
 
H
L
 
L
A
 
V
A
 
E
L
 
A
G
 
G
V
 
I
D
 
A
P
 
K
A
 
H
R
 
K
I
 
I
H
 
F
T
 
Y
E
|
E
V
 
I
F
|
F
G
|
G

4eh1A Crystal structure of the flavohem-like-fad/NAD binding domain of nitric oxide dioxygenase from vibrio cholerae o1 biovar el tor
42% identity, 61% coverage: 152:396/401 of query aligns to 4:236/237 of 4eh1A

query
sites
4eh1A
R
 
R
P
 
T
F
 
F
K
 
V
V
 
V
A
 
R
R
 
E
K
 
K
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
S
 
S
D
 
A
E
 
Y
I
 
V
T
 
T
S
 
S
F
 
F
Y
 
V
L
 
L
T
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
G
A
 
A
A
 
V
C
 
L
D
 
D
F
 
Y
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
V
 
I
S
 
G
V
 
I
K
 
E
R
 
V
F
 
T
V
 
P
D
 
E
K
 
G
L
 
S
G
 
D
V
 
Y
D
 
R
Q
 
E
P
 
I
R
|
R
Q
|
Q
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
S
 
S
D
 
H
A
 
A
P
 
S
H
 
N
G
 
G
K
 
R
W
 
E
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
|
S
V
|
V
K
 
K
R
 
R
E
|
E
D
 
G
G
 
V
R
 
G
E
 
S
D
 
D
I
 
-
A
x
N
P
 
P
G
|
G
H
x
L
V
|
V
S
|
S
N
 
H
L
 
Y
L
 
L
H
 
H
A
 
N
D
 
N
V
 
V
E
 
K
E
 
V
G
 
G
T
 
D
V
 
S
V
 
V
H
 
K
V
 
L
S
 
Y
A
 
A
P
 
P
M
 
A
G
 
G
D
 
D
-
 
F
F
 
F
T
 
Y
L
 
V
D
 
E
R
 
R
K
 
E
K
 
R
T
 
-
T
 
-
P
 
P
V
 
V
V
 
V
L
 
L
M
 
I
S
 
S
G
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
V
 
A
T
|
T
P
 
P
M
 
M
T
 
Q
S
 
A
M
 
I
L
 
L
S
 
H
T
 
T
I
 
-
L
 
L
A
 
A
D
 
K
G
 
Q
S
 
N
E
 
K
R
 
S
S
 
G
V
 
V
T
 
T
F
 
Y
V
 
L
H
 
Y
A
 
A
C
 
C
R
 
N
N
 
S
G
 
A
R
 
K
V
 
E
H
 
H
A
 
T
F
 
F
R
 
A
Q
 
Q
W
 
E
L
 
T
N
 
A
E
 
Q
T
 
L
V
 
I
A
 
A
S
 
Q
H
 
Q
S
 
G
N
 
W
V
 
M
K
 
Q
R
 
Q
V
 
V
V
 
W
F
 
Y
Y
 
R
E
 
D
A
 
-
V
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
R
 
-
R
 
E
G
 
S
V
 
A
D
 
D
Y
 
D
D
 
V
F
 
L
D
 
Q
G
 
G
R
 
E
L
 
M
D
 
Q
V
 
L
A
 
A
G
 
-
I
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
E
V
 
L
I
 
I
V
 
L
P
 
P
-
 
I
-
 
E
D
 
D
A
 
G
D
 
D
Y
 
F
Y
 
Y
I
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
V
 
I
P
 
G
F
 
F
M
 
M
R
 
Q
A
 
Y
Q
 
V
C
 
V
D
 
K
A
 
Q
L
 
L
A
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
K
A
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
T
 
Y
E
|
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G

3tm9A Y29a mutant of vitreoscilla stercoraria hemoglobin (see paper)
52% identity, 36% coverage: 4:146/401 of query aligns to 2:144/146 of 3tm9A

query
sites
3tm9A
L
 
L
T
 
D
A
 
Q
E
 
Q
Q
 
T
I
 
I
A
 
N
R
 
I
V
 
I
K
 
K
A
 
A
T
 
T
V
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
K
E
 
E
H
 
H
G
 
G
T
 
V
T
 
T
I
 
I
T
 
T
K
 
T
H
 
T
F
 
F
Y
 
A
K
 
K
R
 
N
M
 
L
F
 
F
A
 
A
R
 
K
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
V
K
 
R
N
 
P
L
|
L
F
|
F
N
 
D
Q
 
M
T
 
G
H
 
R
Q
 
Q
Q
 
E
S
 
S
G
 
L
N
 
E
Q
|
Q
P
 
P
E
 
K
T
 
A
L
|
L
A
 
A
R
 
M
A
x
T
V
 
V
Y
 
L
A
 
A
Y
 
A
A
 
A
A
 
Q
N
 
N
I
 
I
D
 
E
N
 
N
L
 
L
G
 
P
A
 
A
L
 
I
G
 
L
P
 
P
T
 
A
V
 
V
S
 
K
R
 
K
I
|
I
A
 
A
N
 
V
K
|
K
H
|
H
A
 
C
S
 
Q
L
 
A
N
 
G
I
x
V
R
 
A
P
 
A
E
 
A
H
 
H
Y
|
Y
P
 
P
I
 
I
V
|
V
G
 
G
R
 
Q
H
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
K
D
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
A
V
 
A
D
 
T
Q
 
D
P
 
D
T
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
W
 
W
Q
 
G
V
 
K
A
 
A
Y
|
Y
G
 
G
Q
 
V
L
 
I
A
 
A
N
 
D
I
 
V
F
|
F
V
 
I
G
 
Q
T
 
V
E
 
E
A
 
A
K
 
D
L
 
L
Y
 
Y
E
 
A
G
 
Q
A
 
A

4vhbA Thiocyanate adduct of the bacterial hemoglobin from vitreoscilla sp. (see paper)
51% identity, 36% coverage: 4:146/401 of query aligns to 2:136/138 of 4vhbA

query
sites
4vhbA
L
 
L
T
 
D
A
 
Q
E
 
Q
Q
 
T
I
 
I
A
 
N
R
 
I
V
 
I
K
 
K
A
 
A
T
 
T
V
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
K
E
 
E
H
 
H
G
 
G
T
 
V
T
 
T
I
 
I
T
 
T
K
 
T
H
 
T
F
|
F
Y
 
Y
K
 
K
R
 
N
M
 
L
F
 
F
A
 
A
R
 
K
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
V
K
 
R
N
 
P
L
|
L
F
|
F
N
 
E
Q
 
Q
T
 
-
H
 
-
Q
 
-
Q
 
-
S
 
-
G
 
-
N
 
-
Q
 
-
P
 
P
E
 
K
T
 
A
L
|
L
A
 
A
R
 
M
A
x
T
V
 
V
Y
 
L
A
 
A
Y
 
A
A
 
A
A
 
Q
N
 
N
I
 
I
D
 
E
N
 
N
L
 
L
G
 
P
A
 
A
L
 
I
G
 
L
P
 
P
T
 
A
V
 
V
S
 
K
R
 
K
I
|
I
A
 
A
N
 
V
K
|
K
H
|
H
A
 
C
S
 
Q
L
 
A
N
 
G
I
x
V
R
 
A
P
 
A
E
 
A
H
|
H
Y
|
Y
P
 
P
I
 
I
V
|
V
G
 
G
R
 
Q
H
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
K
D
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
A
V
 
A
D
 
T
Q
 
D
P
 
D
T
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
W
 
W
Q
 
G
V
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
V
L
 
I
A
 
A
N
 
D
I
 
V
F
|
F
V
 
I
G
 
Q
T
 
V
E
 
E
A
 
A
K
 
D
L
 
L
Y
 
Y
E
 
A
G
 
Q
A
 
A

3vhbA Imidazole adduct of the bacterial hemoglobin from vitreoscilla sp. (see paper)
51% identity, 36% coverage: 4:146/401 of query aligns to 1:134/135 of 3vhbA

query
sites
3vhbA
L
 
L
T
 
D
A
 
Q
E
 
Q
Q
 
T
I
 
I
A
 
N
R
 
I
V
 
I
K
 
K
A
 
A
T
 
T
V
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
K
E
 
E
H
 
H
G
 
G
T
 
V
T
 
T
I
 
I
T
 
T
K
 
T
H
 
T
F
 
F
Y
|
Y
K
 
K
R
 
N
M
 
L
F
 
F
A
 
A
R
 
K
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
V
K
 
R
N
 
P
L
 
L
F
|
F
N
 
-
Q
 
-
T
 
-
H
 
-
Q
 
-
Q
 
-
S
 
-
G
 
-
N
 
-
Q
 
Q
P
 
P
E
 
K
T
 
A
L
|
L
A
 
A
R
 
M
A
x
T
V
 
V
Y
 
L
A
 
A
Y
 
A
A
 
A
A
 
Q
N
 
N
I
 
I
D
 
E
N
 
N
L
 
L
G
 
P
A
 
A
L
 
I
G
 
L
P
 
P
T
 
A
V
 
V
S
 
K
R
 
K
I
|
I
A
 
A
N
 
V
K
|
K
H
|
H
A
 
C
S
 
Q
L
 
A
N
 
G
I
x
V
R
 
A
P
 
A
E
 
A
H
|
H
Y
|
Y
P
 
P
I
 
I
V
|
V
G
 
G
R
 
Q
H
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
K
D
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
A
V
 
A
D
 
T
Q
 
D
P
 
D
T
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
W
 
W
Q
 
G
V
 
K
A
 
A
Y
|
Y
G
 
G
Q
 
V
L
 
I
A
 
A
N
 
D
I
 
V
F
|
F
V
 
I
G
 
Q
T
 
V
E
 
E
A
 
A
K
 
D
L
 
L
Y
 
Y
E
 
A
G
 
Q
A
 
A

2wy4A Structure of bacterial globin from campylobacter jejuni at 1.35 a resolution (see paper)
45% identity, 35% coverage: 5:144/401 of query aligns to 1:138/139 of 2wy4A

query
sites
2wy4A
T
 
T
A
 
K
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
A
 
Q
R
 
I
V
 
I
K
 
K
A
 
D
T
 
C
V
 
V
P
 
P
V
 
I
L
 
L
A
 
Q
E
 
K
H
 
N
G
 
G
T
 
E
T
 
D
I
 
L
T
 
T
K
 
N
H
 
E
F
 
F
Y
 
Y
K
 
K
R
 
I
M
 
M
F
 
F
A
 
N
R
 
D
H
 
Y
P
 
P
E
 
E
L
 
V
K
 
K
N
 
P
L
x
M
F
|
F
N
|
N
Q
 
M
T
 
E
H
 
K
Q
 
Q
Q
 
I
S
 
S
G
 
G
N
 
E
Q
|
Q
P
 
P
E
 
K
T
 
A
L
|
L
A
 
A
R
 
M
A
|
A
V
 
I
Y
 
L
A
 
M
Y
 
A
A
 
A
A
 
K
N
 
N
I
 
I
D
 
E
N
 
N
L
 
L
G
 
E
A
 
N
L
 
M
G
 
R
P
 
S
T
 
F
V
 
V
S
 
D
R
 
K
I
x
V
A
 
A
N
 
I
K
x
T
H
|
H
A
 
V
S
 
N
L
|
L
N
 
G
I
x
V
R
 
K
P
 
E
E
 
E
H
|
H
Y
|
Y
P
 
P
I
 
I
V
|
V
G
 
G
R
 
A
H
 
C
L
 
L
L
 
L
G
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
K
D
 
N
V
 
L
L
 
L
G
 
N
D
 
P
A
 
-
V
 
-
D
 
D
Q
 
E
P
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
K
A
 
A
W
 
W
Q
 
E
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
K
L
 
I
A
 
A
N
 
K
I
 
F
F
x
Y
V
 
I
G
 
D
T
 
I
E
 
E
A
 
K
K
 
K
L
 
L
Y
 
Y
E
 
D

7dihA Crystal structure of thermoglobin y29f mutant in complex with imidazole
43% identity, 35% coverage: 4:143/401 of query aligns to 2:136/139 of 7dihA

query
sites
7dihA
L
 
L
T
 
S
A
 
E
E
 
E
Q
 
T
I
 
I
A
 
R
R
 
V
V
 
I
K
 
K
A
 
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
K
E
 
E
H
 
H
G
 
G
T
 
T
T
 
E
I
 
I
T
 
T
K
 
A
H
 
R
F
 
M
Y
 
F
K
 
E
R
 
L
M
 
L
F
 
F
A
 
S
R
 
K
H
 
Y
P
 
P
E
 
K
L
 
T
K
 
K
N
 
E
L
|
L
F
|
F
N
 
A
Q
 
G
T
x
A
H
 
-
Q
 
-
Q
 
-
S
|
S
G
 
E
N
 
E
Q
|
Q
P
 
P
E
 
K
T
 
K
L
|
L
A
 
A
R
 
N
A
 
A
V
 
I
Y
 
I
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
T
N
 
Y
I
 
I
D
 
D
N
 
R
L
 
L
G
 
E
A
 
E
L
 
L
G
 
D
P
 
N
T
 
A
V
 
I
S
 
S
R
 
T
I
|
I
A
 
A
N
 
R
K
x
S
H
|
H
A
 
V
S
 
R
L
 
R
N
 
N
I
x
V
R
 
K
P
 
P
E
 
E
H
|
H
Y
|
Y
P
 
P
I
 
L
V
|
V
G
 
K
R
 
E
H
 
C
L
 
L
L
 
L
G
 
Q
A
 
A
I
 
I
V
 
E
D
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
N
D
 
P
A
 
G
V
 
-
D
 
-
Q
 
E
P
 
E
T
 
V
L
 
L
D
 
K
A
 
A
W
 
W
Q
 
E
V
 
E
A
 
A
Y
|
Y
G
 
D
Q
 
F
L
|
L
A
 
A
N
 
K
I
 
T
F
 
L
V
 
I
G
 
T
T
 
L
E
 
E
A
 
K
K
 
K
L
 
L
Y
 
Y

6wk3D Engineered carbene transferase rmanod q52v, putative nitric oxide dioxygenase from rhodothermus marinus (see paper)
36% identity, 33% coverage: 12:143/401 of query aligns to 14:141/146 of 6wk3D

query
sites
6wk3D
V
 
V
K
 
R
A
 
A
T
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
A
L
 
L
A
 
Q
E
 
K
H
 
H
G
 
S
T
 
V
T
 
A
I
 
I
T
 
S
K
 
A
H
 
T
F
 
M
Y
 
Y
K
 
R
R
 
L
M
 
L
F
 
F
A
 
E
R
 
R
H
 
Y
P
 
P
E
 
E
L
 
T
K
 
R
N
 
S
L
|
L
F
|
F
N
 
E
Q
 
L
T
 
P
H
x
E
Q
 
R
Q
 
V
S
 
I
G
x
H
N
 
K
Q
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
L
|
L
A
 
A
R
 
S
A
 
A
V
 
L
Y
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
R
N
 
S
I
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
P
G
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
Q
P
 
A
T
 
A
V
 
I
S
 
R
R
|
R
I
x
M
A
 
V
N
 
L
K
x
S
H
|
H
A
 
A
S
x
R
L
x
A
N
 
G
I
x
V
R
 
Q
P
 
A
E
 
V
H
|
H
Y
|
Y
P
 
P
I
 
L
V
|
V
G
 
W
R
 
E
H
 
C
L
 
L
L
 
R
G
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
K
D
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
P
A
 
D
V
 
A
D
 
T
Q
 
E
P
 
T
T
 
L
L
 
L
D
 
Q
A
 
A
W
 
W
Q
 
K
V
 
E
A
 
A
Y
|
Y
G
 
D
Q
 
F
L
 
L
A
 
A
N
 
H
I
 
L
F
 
L
V
 
S
G
 
T
T
 
K
E
 
E
A
 
A
K
 
Q
L
 
V
Y
 
Y

1krhA X-ray structure of benzoate dioxygenase reductase (see paper)
27% identity, 60% coverage: 156:397/401 of query aligns to 112:336/337 of 1krhA

query
sites
1krhA
V
 
L
A
 
A
R
 
R
K
 
V
Q
 
E
V
 
N
E
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
S
I
 
T
T
 
I
S
 
T
F
 
F
Y
 
D
L
 
I
T
 
Q
P
 
L
A
 
D
D
 
D
G
 
G
S
 
Q
A
 
P
A
 
D
C
 
I
D
 
H
F
 
F
E
 
L
P
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
V
 
V
S
 
N
V
 
V
K
 
T
R
 
L
F
 
-
V
 
-
D
 
-
K
 
-
L
 
P
G
 
G
V
 
T
D
 
T
Q
 
E
P
 
T
R
|
R
Q
x
S
Y
|
Y
S
|
S
L
 
F
S
 
S
D
 
S
A
 
Q
P
 
P
H
 
G
G
 
N
K
 
R
W
 
L
L
 
T
R
 
G
I
 
F
S
x
V
V
|
V
K
 
R
R
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
D
 
N
I
 
V
A
 
P
P
 
Q
G
|
G
H
x
K
V
x
M
S
|
S
N
 
E
L
 
Y
L
 
L
H
 
S
A
 
V
D
 
Q
V
 
A
E
 
K
E
 
A
G
 
G
T
 
D
V
 
K
V
 
M
H
 
S
V
 
F
S
 
T
A
 
G
P
 
P
M
 
F
G
 
G
D
 
S
F
 
F
T
 
Y
L
 
L
D
 
-
R
 
R
K
 
D
K
 
V
T
 
K
T
 
R
P
 
P
V
 
V
V
 
L
L
 
M
M
 
L
S
 
A
G
 
G
G
 
G
V
x
T
G
 
G
V
 
I
T
 
A
P
 
P
M
 
F
T
 
L
S
 
S
M
 
M
L
 
L
S
 
Q
T
 
V
I
 
L
L
 
E
A
 
Q
D
 
K
G
 
G
S
 
S
E
 
E
R
 
H
S
 
P
V
 
V
T
 
R
F
 
L
V
 
V
H
 
F
A
 
G
C
 
V
R
 
T
N
 
Q
G
 
D
-
 
C
-
 
D
-
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
E
R
 
Q
V
 
L
H
 
D
A
 
A
F
 
L
R
 
Q
Q
 
Q
-
 
K
-
 
L
-
 
P
W
 
W
L
 
F
N
 
E
E
 
-
T
 
-
V
 
-
A
 
-
S
 
-
H
 
-
S
 
-
N
 
-
V
 
-
K
 
Y
R
 
R
V
 
T
V
 
V
F
 
V
Y
 
A
E
 
H
A
 
A
V
 
E
G
 
S
E
 
Q
G
 
H
D
 
E
R
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
Y
D
 
-
Y
 
-
D
 
-
F
 
V
D
 
T
G
 
G
R
 
H
L
 
I
D
 
E
V
 
Y
A
 
D
G
 
W
I
 
L
A
 
N
G
 
G
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
V
 
-
P
 
G
D
 
E
A
 
V
D
 
D
Y
 
V
Y
 
Y
I
 
L
C
|
C
G
 
G
P
 
P
V
 
V
P
 
P
F
 
M
M
 
V
R
 
E
A
 
A
Q
 
V
C
 
R
D
 
S
A
 
W
L
 
L
A
 
D
A
 
T
L
 
Q
G
 
G
V
 
I
D
 
Q
P
 
P
A
 
A
R
 
N
I
 
F
H
 
L
T
 
F
E
|
E
V
 
K
F
|
F
G
x
S
S
x
A

Sites not aligning to the query:

P33164 Phthalate dioxygenase reductase; PDR; EC 1.-.-.- from Burkholderia cepacia (Pseudomonas cepacia) (see paper)
34% identity, 40% coverage: 150:309/401 of query aligns to 8:156/322 of P33164

query
sites
P33164
G
 
G
F
 
F
R
 
L
P
 
R
F
 
L
K
 
K
V
 
I
A
 
A
R
 
S
K
 
K
Q
 
E
V
 
K
E
 
I
S
 
A
D
 
R
E
 
D
I
 
I
T
 
W
S
 
S
F
 
F
Y
 
E
L
 
L
T
 
T
P
 
D
A
 
P
D
 
Q
G
 
G
S
 
A
A
 
P
A
 
L
C
 
P
D
 
P
F
 
F
E
 
E
P
 
A
G
 
G
Q
 
A
Y
 
N
V
 
L
S
 
T
V
 
V
K
 
A
R
 
-
F
 
-
V
 
-
D
 
-
K
 
-
L
 
V
G
 
P
V
 
N
D
 
G
Q
 
S
P
 
R
R
|
R
Q
x
T
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
-
 
C
S
 
N
D
 
D
A
 
S
P
 
Q
H
 
E
G
 
R
K
 
N
W
 
R
L
 
Y
R
 
V
I
 
I
S
x
A
V
|
V
K
|
K
R
 
R
E
 
D
-
 
S
D
 
N
G
 
G
R
|
R
E
x
G
D
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
G
|
G
H
x
S
V
 
I
S
 
S
N
 
F
L
 
I
L
 
-
H
 
-
A
 
D
D
 
D
V
 
T
E
 
S
E
 
E
G
 
G
T
 
D
V
 
A
V
 
V
H
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
L
P
 
P
M
 
R
G
 
N
D
 
E
F
 
F
T
 
P
L
 
L
D
 
D
R
 
-
K
 
K
K
 
R
T
 
A
T
 
K
P
 
S
V
 
F
V
 
I
L
 
L
M
 
V
S
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
I
G
 
G
V
 
I
T
|
T
P
 
P
M
 
M
T
 
L
S
 
S
M
 
M
L
 
A
S
 
R
T
 
Q
I
 
L
L
 
R
A
 
A
D
 
E
G
 
G
S
 
L
E
 
-
R
 
R
S
 
S
V
 
F
T
 
R
F
 
L
V
 
Y
H
 
Y
A
 
L
C
 
T
R
 
R
N
 
D
G
 
P
R
 
E
V
 
G
H
 
T
A
 
A
F
 
F

Sites not aligning to the query:

2piaA Phthalate dioxygenase reductase: a modular structure for electron transfer from pyridine nucleotides to [2fe-2s] (see paper)
34% identity, 40% coverage: 150:309/401 of query aligns to 7:155/321 of 2piaA

query
sites
2piaA
G
 
G
F
 
F
R
 
L
P
 
R
F
 
L
K
 
K
V
 
I
A
 
A
R
 
S
K
 
K
Q
 
E
V
 
K
E
 
I
S
 
A
D
 
R
E
 
D
I
 
I
T
 
W
S
 
S
F
 
F
Y
 
E
L
 
L
T
 
T
P
 
D
A
 
P
D
 
Q
G
 
G
S
 
A
A
 
P
A
 
L
C
 
P
D
 
P
F
 
F
E
 
E
P
 
A
G
 
G
Q
 
A
Y
x
N
V
 
L
S
 
T
V
 
V
K
 
A
R
 
-
F
 
-
V
 
-
D
 
-
K
 
-
L
 
V
G
 
P
V
 
N
D
 
G
Q
 
S
P
 
R
R
|
R
Q
x
T
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
-
 
C
S
 
N
D
 
D
A
 
S
P
 
Q
H
 
E
G
 
R
K
 
N
W
 
R
L
 
Y
R
 
V
I
 
I
S
x
A
V
|
V
K
 
K
R
 
R
E
 
D
-
 
S
D
 
N
G
|
G
R
|
R
E
 
G
D
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
G
|
G
H
x
S
V
 
I
S
 
S
N
 
F
L
 
I
L
 
-
H
 
-
A
 
D
D
 
D
V
 
T
E
 
S
E
 
E
G
 
G
T
 
D
V
 
A
V
 
V
H
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
L
P
 
P
M
 
R
G
 
N
D
 
E
F
 
F
T
 
P
L
 
L
D
 
D
R
 
-
K
 
K
K
 
R
T
 
A
T
 
K
P
 
S
V
 
F
V
 
I
L
 
L
M
 
V
S
 
A
G
 
G
G
 
G
V
x
I
G
 
G
V
 
I
T
|
T
P
 
P
M
 
M
T
 
L
S
 
S
M
 
M
L
 
A
S
 
R
T
 
Q
I
 
L
L
 
R
A
 
A
D
 
E
G
 
G
S
 
L
E
 
-
R
 
R
S
 
S
V
 
F
T
 
R
F
 
L
V
 
Y
H
 
Y
A
 
L
C
 
T
R
 
R
N
 
D
G
 
P
R
 
E
V
 
G
H
 
T
A
 
A
F
 
F

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>H281DRAFT_04686 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_04686
MTALTAEQIARVKATVPVLAEHGTTITKHFYKRMFARHPELKNLFNQTHQQSGNQPETLA
RAVYAYAANIDNLGALGPTVSRIANKHASLNIRPEHYPIVGRHLLGAIVDVLGDAVDQPT
LDAWQVAYGQLANIFVGTEAKLYEGAAWSGFRPFKVARKQVESDEITSFYLTPADGSAAC
DFEPGQYVSVKRFVDKLGVDQPRQYSLSDAPHGKWLRISVKREDGREDIAPGHVSNLLHA
DVEEGTVVHVSAPMGDFTLDRKKTTPVVLMSGGVGVTPMTSMLSTILADGSERSVTFVHA
CRNGRVHAFRQWLNETVASHSNVKRVVFYEAVGEGDRRGVDYDFDGRLDVAGIAGQVIVP
DADYYICGPVPFMRAQCDALAALGVDPARIHTEVFGSGVVE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory