SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_04915 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_04915 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 2 hits to proteins with known functional sites (download)

7os3AAA L-asparaginase II protein (see paper)
63% identity, 96% coverage: 15:367/368 of query aligns to 16:357/369 of 7os3AAA

query
sites
7os3AAA
R
 
R
G
 
G
D
 
G
S
 
I
V
 
V
E
 
E
N
 
N
T
 
S
H
 
H
R
 
R
A
 
V
H
 
H
V
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
V
D
 
D
S
 
A
N
 
K
G
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
S
 
A
F
 
L
G
 
G
D
 
N
P
 
P
S
 
T
R
 
R
V
 
M
T
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
 
K
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
I
L
 
L
E
 
E
T
 
T
G
 
E
A
 
G
L
 
V
E
 
A
R
 
G
F
 
Y
G
 
G
F
 
F
D
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
I
A
 
A
L
 
L
M
 
M
C
 
C
A
 
A
S
 
S
H
 
H
S
 
S
S
 
S
E
 
E
P
 
D
R
 
R
H
 
H
I
 
I
E
 
A
R
 
R
A
 
T
R
 
R
Q
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
S
K
 
K
A
 
I
Q
 
K
A
 
A
S
 
E
E
 
E
T
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
R
C
 
C
G
 
G
G
 
G
H
 
H
P
 
P
P
 
S
L
 
L
S
 
S
D
 
E
A
 
M
V
 
V
Y
 
N
V
 
R
D
 
S
W
 
W
I
 
I
K
 
K
R
 
Q
D
 
D
F
 
F
K
 
I
P
 
P
G
 
T
A
 
A
V
 
V
C
 
C
S
 
S
N
 
N
C
|
C
S
 
S
G
 
G
K
|
K
H
 
H
A
 
V
G
 
G
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
R
S
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
T
S
 
D
G
 
G
Y
 
Y
E
 
H
Q
 
L
P
 
P
E
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
M
Q
 
Q
I
 
G
R
 
R
V
 
V
K
 
K
H
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
A
D
 
E
V
 
L
C
 
C
D
 
D
L
 
L
P
 
D
D
 
A
D
 
G
G
 
D
V
 
V
Q
 
E
W
 
W
A
 
G
T
 
T
D
 
D
G
 
G
C
|
C
N
 
N
L
 
L
P
 
P
T
 
T
P
 
P
A
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
A
 
G
R
 
R
L
 
I
F
 
Y
A
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
S
A
 
A
Q
 
A
D
 
D
E
 
G
V
 
-
S
 
S
S
 
D
S
 
A
G
 
G
A
 
E
A
 
G
P
 
Q
N
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
C
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
H
I
 
I
Y
 
F
R
 
R
A
 
A
M
 
M
T
 
A
A
 
R
Y
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
M
V
 
V
G
 
A
G
 
G
E
 
E
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
C
 
C
T
 
T
I
 
M
L
 
L
M
 
M
N
 
R
A
 
A
F
 
F
G
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
S
 
S
Y
 
Y
G
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
R
 
R
A
 
A
S
 
S
N
 
D
R
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
-
S
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
A
Q
 
T
D
 
R
A
 
Q
Q
 
L
G
 
G
T
 
T
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
S
V
 
V
K
 
K
I
 
I
E
 
E
D
 
D
G
 
G
N
 
N
V
 
L
G
 
E
V
 
M
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
T
E
 
E
V
 
L
L
 
L
A
 
E
Q
 
R
L
 
L
D
 
G
I
 
I
G
 
G
T
 
S
A
 
P
G
 
D
Q
 
V
R
 
R
A
 
S
K
 
Q
L
 
L
D
 
A
S
 
S
F
 
F
H
 
H
T
 
H
P
 
P
R
 
Q
M
 
R
L
 
V
N
 
N
T
 
T
M
 
M
G
 
G
V
 
V
A
 
T
T
 
T
G
 
G
R
 
G
R
 
V
V
 
S
F
 
F
S
 
P
V
 
F
A
 
K
L
 
L
E
 
R
A
 
G
S
 
S

8oriD Crystal structure of rhizobium etli l-asparaginase reaiv (orthorhombic) (see paper)
34% identity, 95% coverage: 8:356/368 of query aligns to 10:331/341 of 8oriD

query
sites
8oriD
P
 
P
I
 
V
A
 
T
A
 
V
T
 
E
V
 
V
Y
 
T
R
 
R
G
 
G
D
 
L
S
 
L
V
 
V
E
 
E
N
 
S
T
 
R
H
 
H
R
 
R
A
 
G
H
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
V
D
 
D
S
 
G
N
 
D
G
 
G
R
 
K
L
 
L
L
 
F
Y
 
F
S
 
S
F
 
L
G
 
G
D
 
D
P
 
I
S
 
D
R
 
T
V
 
A
T
 
V
L
 
F
A
 
P
R
 
R
S
 
S
A
 
A
A
 
C
K
 
K
P
 
A
A
 
M
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
P
V
 
L
L
 
V
E
 
E
T
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
A
E
 
D
R
 
A
F
 
Y
G
 
G
F
 
F
D
 
G
D
 
D
A
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
M
 
A
C
 
C
A
 
A
S
 
S
H
 
H
S
 
N
S
 
G
E
 
E
P
 
E
R
 
E
H
 
H
I
 
V
E
 
A
R
 
L
A
 
A
R
 
A
Q
 
S
M
 
M
L
 
L
A
 
S
K
 
R
A
 
A
Q
 
G
A
 
R
S
 
N
E
 
V
T
 
E
D
 
A
L
 
L
R
 
E
C
 
C
G
 
G
G
 
A
H
 
H
P
 
W
P
 
S
L
 
M
S
 
N
D
 
Q
A
 
K
V
 
V
Y
 
L
V
 
I
D
 
Q
W
 
Q
I
 
A
K
 
R
R
 
S
D
 
L
F
 
D
K
 
A
P
 
P
G
 
T
A
 
A
V
 
L
C
 
H
S
 
N
N
 
N
C
|
C
S
 
S
G
 
G
K
|
K
H
 
H
A
 
A
G
 
G
M
 
F
L
 
I
A
 
C
G
 
A
A
 
C
R
 
C
S
 
H
I
 
R
G
 
D
A
 
I
A
 
D
L
 
P
S
 
K
G
 
G
Y
 
Y
E
 
V
Q
 
G
P
 
Y
E
 
E
H
 
H
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
I
 
V
R
 
E
V
 
I
K
 
R
H
 
A
T
 
V
V
 
M
A
 
E
D
 
R
V
 
L
C
 
T
D
 
G
L
 
A
P
 
V
D
 
L
D
 
G
G
 
A
V
 
E
Q
 
S
W
 
C
A
 
G
T
 
T
D
 
D
G
 
G
C
|
C
N
 
S
L
 
I
P
 
P
T
 
T
P
 
Y
A
 
A
F
 
M
P
 
P
L
 
L
D
 
R
R
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
H
L
 
G
F
 
F
A
 
A
K
 
R
L
 
M
A
 
A
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
S
 
T
S
 
G
S
 
T
G
 
G
A
 
L
A
 
E
P
 
P
N
 
-
T
 
L
R
 
R
T
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
S
A
 
R
R
 
R
I
 
L
Y
 
I
R
 
E
A
 
A
M
 
C
T
 
M
A
 
A
Y
 
E
P
 
P
E
 
F
L
 
Y
V
 
V
G
 
A
G
 
G
E
 
S
G
 
G
R
 
R
F
 
A
C
 
C
T
 
T
I
 
K
L
 
L
M
 
M
N
 
Q
A
 
I
F
 
A
G
 
P
G
 
G
A
 
R
L
 
I
V
 
F
G
 
V
K
 
K
L
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
E
G
 
G
S
 
V
Y
 
F
G
 
C
I
 
A
G
 
A
V
 
I
R
 
-
A
 
-
S
 
-
N
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
-
S
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
D
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
T
 
P
Q
 
E
G
 
K
A
 
G
L
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
S
V
 
L
K
 
K
I
 
S
E
 
E
D
 
D
G
 
G
N
 
A
V
 
T
G
 
R
V
 
A
L
 
A
Y
 
E
A
 
A
V
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
A
V
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
L
 
F
D
 
F
I
 
E
G
 
T
T
 
E
A
 
E
G
 
T
Q
 
V
R
 
H
A
 
A
K
 
A
L
 
L
D
 
M
S
 
A
F
 
F
H
 
A
T
 
A
P
 
M
R
 
P
M
 
M
L
 
R
N
 
N
T
 
W
M
 
N
G
 
G
V
 
I
A
 
H
T
 
V
G
 
G

Query Sequence

>H281DRAFT_04915 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_04915
MTLHTAGPIAATVYRGDSVENTHRAHVAVVDSNGRLLYSFGDPSRVTLARSAAKPAQALA
VLETGALERFGFDDADLALMCASHSSEPRHIERARQMLAKAQASETDLRCGGHPPLSDAV
YVDWIKRDFKPGAVCSNCSGKHAGMLAGARSIGAALSGYEQPEHPLQIRVKHTVADVCDL
PDDGVQWATDGCNLPTPAFPLDRLARLFAKLAAAQDEVSSSGAAPNTRTAALARIYRAMT
AYPELVGGEGRFCTILMNAFGGALVGKLGADGSYGIGVRASNRTAAHTSKAGAQDAQGTQ
GALGIAVKIEDGNVGVLYAVVAEVLAQLDIGTAGQRAKLDSFHTPRMLNTMGVATGRRVF
SVALEASR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory