SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_04927 H281DRAFT_04927 iron complex transport system ATP-binding protein to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P07821 Iron(3+)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; Ferric hydroxamate uptake protein C; Ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC; Iron(III)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; EC 7.2.2.16 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
63% identity, 95% coverage: 14:272/272 of query aligns to 7:265/265 of P07821

query
sites
P07821
H
 
H
G
 
S
E
 
D
P
 
T
M
 
T
Y
 
F
E
 
A
L
 
L
D
 
R
D
 
N
V
 
I
S
 
S
F
 
F
R
 
R
I
 
V
G
 
P
E
 
G
R
 
R
V
 
T
L
 
L
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
L
A
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
F
P
 
P
R
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
V
C
 
T
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
H
 
H
N
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
K
L
 
M
L
 
L
A
 
G
R
 
R
Q
 
H
Q
 
Q
S
 
P
P
 
P
K
 
S
A
 
E
G
 
G
T
 
E
L
 
I
R
 
L
F
 
L
A
 
D
G
 
A
R
 
Q
P
 
P
L
 
L
R
 
E
E
 
S
W
 
W
E
 
S
N
 
S
R
 
K
E
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
L
P
 
P
A
 
P
A
 
A
S
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
R
E
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
P
 
P
W
 
W
H
 
H
G
 
G
A
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
F
T
 
G
G
 
A
V
 
A
D
 
D
A
 
R
E
 
E
K
 
K
V
 
V
H
 
E
E
 
E
A
 
A
M
 
I
E
 
S
L
 
L
T
 
V
D
 
G
I
 
L
T
 
K
R
 
P
F
 
L
G
 
A
D
 
H
R
 
R
A
 
L
V
 
V
D
 
D
S
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
A
 
A
W
 
W
I
 
I
A
 
A
M
 
M
L
 
L
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
S
 
S
Q
 
R
C
 
C
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
|
E
P
 
P
I
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
H
Q
 
Q
I
 
V
E
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
S
L
 
L
V
 
V
R
 
H
T
 
R
L
 
L
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
E
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
T
V
 
V
V
 
I
V
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
D
 
D
I
 
I
N
 
N
M
 
M
A
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
Y
C
 
C
D
 
D
D
 
Y
L
 
L
I
 
V
A
 
A
L
 
L
K
 
R
N
 
G
G
 
G
R
 
E
L
 
M
L
 
I
A
 
A
S
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
P
P
 
A
E
 
E
L
 
I
I
 
M
E
 
R
E
 
G
K
 
E
M
 
T
L
 
L
G
 
E
A
 
M
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
V
 
I
P
 
P
M
 
M
G
 
G
T
 
I
V
 
L
A
 
P
H
 
H
P
 
P
R
 
A
G
 
G
G
 
A
M
 
A
P
 
P
I
 
V
S
 
S
F
 
F
A
 
V
Y
 
Y

1l7vC Bacterial abc transporter involved in b12 uptake (see paper)
35% identity, 83% coverage: 28:254/272 of query aligns to 9:231/231 of 1l7vC

query
sites
1l7vC
I
 
V
G
 
A
E
 
E
R
 
S
V
 
T
L
 
R
L
 
L
H
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
S
L
 
G
T
 
E
L
 
V
P
 
R
R
 
A
G
 
G
R
 
E
V
 
I
C
 
L
G
 
H
L
 
L
I
 
V
G
 
G
H
 
P
N
|
N
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
K
 
A
L
 
R
L
 
M
A
 
A
R
 
G
Q
 
M
Q
 
T
S
 
S
P
 
G
K
 
K
A
 
-
G
 
G
T
 
S
L
 
I
R
 
Q
F
 
F
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
P
 
P
L
 
L
R
 
E
E
 
A
W
 
W
E
 
S
N
 
A
R
 
T
E
 
K
F
 
L
A
 
A
R
 
L
Q
 
H
V
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
P
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
T
A
 
P
A
 
P
S
 
F
G
 
A
M
 
T
T
 
P
V
 
V
R
 
W
E
 
H
L
 
Y
V
 
L
A
 
T
L
 
L
G
 
H
R
 
Q
Y
 
H
P
 
-
W
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
D
R
 
K
F
 
T
T
 
R
G
 
T
V
 
E
D
 
L
A
 
L
E
 
N
K
 
D
V
 
V
H
 
A
E
 
G
A
 
A
M
 
L
E
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
D
I
 
-
T
 
-
R
 
K
F
 
L
G
 
G
D
 
-
R
 
R
A
 
S
V
 
T
D
 
N
S
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
W
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
W
 
R
I
 
L
A
 
A
M
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
L
Q
 
Q
D
 
I
S
 
T
-
 
P
-
 
Q
-
 
A
-
 
N
-
 
P
-
 
A
-
 
G
Q
 
Q
C
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
I
 
M
S
 
N
A
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
A
 
A
H
 
Q
Q
 
Q
I
 
S
E
 
A
V
 
L
L
 
D
D
 
K
L
 
I
V
 
L
R
 
S
T
 
A
L
 
L
S
 
C
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
-
G
 
G
L
 
L
G
 
A
V
 
I
V
 
V
V
 
M
V
 
S
L
 
S
H
 
H
D
 
D
I
 
L
N
 
N
M
 
H
A
 
T
A
 
L
R
 
R
F
 
H
C
 
A
D
 
H
D
 
R
L
 
A
I
 
W
A
 
L
L
 
L
K
 
K
N
 
G
G
 
G
R
 
K
L
 
M
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
T
 
R
A
 
R
P
 
E
E
 
E
L
 
V
I
 
L
E
 
T
E
 
P
K
 
P
M
 
N
L
 
L
G
 
A
A
 
Q
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
V
 
M

4fi3C Structure of vitamin b12 transporter btucd-f in a nucleotide-bound state (see paper)
35% identity, 83% coverage: 28:254/272 of query aligns to 9:231/248 of 4fi3C

query
sites
4fi3C
I
 
V
G
 
A
E
 
E
R
 
S
V
 
T
L
x
R
L
 
L
H
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
S
L
 
G
T
 
E
L
 
V
P
 
R
R
 
A
G
 
G
R
 
E
V
 
I
C
 
L
G
 
H
L
 
L
I
 
V
G
 
G
H
 
P
N
|
N
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
K
 
A
L
 
R
L
 
M
A
 
A
R
 
G
Q
 
M
Q
 
T
S
 
S
P
 
G
K
 
K
A
 
-
G
 
G
T
 
S
L
 
I
R
 
Q
F
 
F
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
P
 
P
L
 
L
R
 
E
E
 
A
W
 
W
E
 
S
N
 
A
R
 
T
E
 
K
F
 
L
A
 
A
R
 
L
Q
 
H
V
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
P
 
S
Q
|
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
T
A
 
P
A
 
P
S
 
F
G
 
A
M
 
T
T
 
P
V
 
V
R
 
W
E
 
H
L
 
Y
V
 
L
A
 
T
L
 
L
G
 
H
R
 
Q
Y
 
H
P
 
-
W
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
D
R
 
K
F
 
T
T
 
R
G
 
T
V
 
E
D
 
L
A
 
L
E
 
N
K
 
D
V
 
V
H
 
A
E
 
G
A
 
A
M
 
L
E
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
D
I
 
-
T
 
-
R
 
K
F
 
L
G
 
G
D
 
-
R
|
R
A
 
S
V
 
T
D
 
N
S
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
|
E
R
 
W
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
W
 
R
I
 
L
A
 
A
M
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
L
Q
 
Q
D
 
I
S
 
T
-
 
P
-
 
Q
-
 
A
-
 
N
-
 
P
-
 
A
-
 
G
Q
 
Q
C
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
I
 
M
S
 
C
A
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
A
 
A
H
 
Q
Q
 
Q
I
 
S
E
 
A
V
 
L
L
 
D
D
 
K
L
 
I
V
 
L
R
 
S
T
 
A
L
 
L
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
-
G
 
G
L
 
L
G
 
A
V
 
I
V
 
V
V
 
M
V
 
S
L
 
S
H
 
H
D
 
D
I
 
L
N
 
N
M
 
H
A
 
T
A
 
L
R
 
R
F
 
H
C
 
A
D
 
H
D
 
R
L
 
A
I
 
W
A
 
L
L
 
L
K
 
K
N
 
G
G
 
G
R
 
K
L
 
M
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
T
 
R
A
 
R
P
 
E
E
 
E
L
 
V
I
 
L
E
 
T
E
 
P
K
 
P
M
 
N
L
 
L
G
 
A
A
 
Q
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
V
 
M

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
29% identity, 83% coverage: 18:243/272 of query aligns to 1:229/343 of P30750

query
sites
P30750
M
 
M
Y
 
I
E
 
K
L
 
L
D
 
S
D
 
N
V
 
I
S
 
T
-
 
K
-
 
V
F
 
F
R
 
H
I
 
Q
G
 
G
E
 
T
R
 
R
V
 
T
L
 
I
-
 
Q
-
 
A
L
 
L
H
 
N
P
 
N
L
 
V
A
 
S
L
 
L
T
 
H
L
 
V
P
 
P
R
 
A
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
C
 
Y
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
H
 
A
N
x
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
K
 
R
L
 
C
L
 
V
A
 
N
R
 
L
Q
 
L
Q
 
E
S
 
R
P
 
P
K
 
T
A
 
E
G
 
G
T
 
S
L
 
V
R
 
L
F
 
V
A
 
D
G
 
G
R
 
Q
P
 
E
L
 
L
R
 
T
E
 
T
W
 
L
E
 
S
N
 
E
R
 
S
E
 
E
F
 
L
A
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
R
R
 
R
Q
 
Q
V
 
I
A
 
G
Y
 
M
L
 
I
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
Q
 
F
P
 
N
A
 
L
A
 
L
S
 
S
G
 
S
M
 
R
T
 
T
V
 
V
R
 
F
E
 
G
L
 
N
V
 
V
A
 
A
L
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
L
G
 
D
R
 
N
Y
 
T
P
 
P
W
 
K
H
 
D
G
 
E
A
 
V
L
 
K
G
 
R
R
 
R
F
 
V
T
 
T
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
V
 
-
H
 
-
E
 
E
A
 
L
M
 
L
E
 
S
L
 
L
T
 
V
D
 
G
I
 
L
T
 
G
R
 
D
F
 
K
G
 
H
D
 
D
R
 
S
A
 
Y
V
 
P
D
 
S
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
L
 
A
V
 
L
A
 
A
Q
 
S
D
 
N
S
 
P
Q
 
K
C
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
I
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
P
A
 
A
H
 
T
Q
 
T
I
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
D
 
E
L
 
L
V
 
L
R
 
K
T
 
D
L
 
I
S
 
N
Q
 
R
Q
 
R
R
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
T
V
 
I
V
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
T
H
 
H
D
 
E
I
 
M
N
 
D
M
 
V
A
 
V
A
 
K
R
 
R
F
 
I
C
 
C
D
 
D
D
 
C
L
 
V
I
 
A
A
 
V
L
 
I
K
 
S
N
 
N
G
 
G
R
 
E
L
 
L
L
 
I
A
 
E
S
 
Q
G
 
D
T
 
T
A
 
V
P
 
S
E
 
E
L
 
V
I
 
F

Sites not aligning to the query:

A0R6H8 Mycobactin import ATP-binding/permease protein IrtA; EC 7.2.2.- from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
33% identity, 85% coverage: 15:244/272 of query aligns to 605:831/860 of A0R6H8

query
sites
A0R6H8
G
 
G
E
 
E
P
 
P
M
 
A
Y
 
V
E
 
V
L
 
F
D
 
D
D
 
N
V
 
V
S
 
T
F
 
F
R
 
G
I
 
Y
G
 
R
E
 
P
R
 
D
V
 
I
-
 
P
L
 
V
L
 
L
H
 
H
P
 
D
L
 
I
A
 
S
L
 
L
T
 
Q
L
 
L
P
 
T
R
 
P
G
 
G
R
 
T
V
 
V
C
 
T
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
G
H
 
P
N
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
A
K
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
F
Q
 
H
S
 
D
P
 
V
K
 
D
A
 
A
G
 
G
T
 
A
L
 
I
R
 
R
F
 
L
A
 
G
G
 
G
R
 
R
P
 
D
L
 
I
R
 
R
E
 
T
W
 
L
E
 
T
N
 
A
R
 
D
E
 
E
F
 
L
A
 
Y
R
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
G
Y
 
F
L
 
V
P
 
L
Q
 
Q
Q
 
D
Q
 
T
P
 
Q
A
 
L
A
 
V
S
 
G
G
 
G
M
 
-
T
 
T
V
 
V
R
 
A
E
 
E
L
 
N
V
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
D
Y
 
P
P
 
-
W
 
-
H
 
D
G
 
A
A
 
S
L
 
I
G
 
E
R
 
R
F
 
I
T
 
Q
G
 
D
V
 
A
-
 
A
-
 
R
D
 
D
A
 
A
E
 
Q
K
 
I
V
 
H
H
 
D
E
 
R
A
 
I
M
 
M
E
 
R
L
 
L
T
 
P
D
 
N
I
 
G
T
 
Y
R
 
D
F
 
T
G
 
P
D
 
L
R
 
G
A
 
A
V
 
A
D
 
S
S
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
L
W
 
T
I
 
I
A
 
A
M
 
R
L
 
A
V
 
I
A
 
L
Q
 
A
D
 
D
S
 
T
Q
 
P
C
 
V
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
I
 
T
S
 
A
A
 
F
L
 
A
D
 
D
I
 
P
A
 
E
H
 
S
Q
 
E
I
 
Y
E
 
L
V
 
V
L
 
Q
D
 
Q
L
 
A
V
 
L
R
 
N
T
 
R
L
 
L
S
 
T
Q
 
R
Q
 
D
R
 
R
G
 
-
L
 
-
G
 
T
V
 
V
V
 
L
V
 
V
V
 
I
L
 
A
H
 
H
D
 
R
I
 
L
N
 
H
M
 
T
A
 
I
A
 
T
R
 
H
F
 
-
C
 
A
D
 
D
D
 
Q
L
 
I
I
 
V
A
 
V
L
 
L
K
 
E
N
 
G
G
 
G
R
 
R
L
 
I
L
 
V
A
 
E
S
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
H
P
 
E
E
 
R
L
 
L
I
 
L
E
 
D

Sites not aligning to the query:

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
29% identity, 83% coverage: 18:243/272 of query aligns to 2:230/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
M
 
M
Y
 
I
E
 
K
L
 
L
D
 
S
D
 
N
V
 
I
S
 
T
-
 
K
-
 
V
F
|
F
R
 
H
I
x
Q
G
 
G
E
 
T
R
 
R
V
 
T
L
 
I
-
 
Q
-
 
A
L
 
L
H
 
N
P
 
N
L
 
V
A
 
S
L
 
L
T
 
H
L
 
V
P
 
P
R
 
A
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
C
 
Y
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
H
 
A
N
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
K
 
R
L
 
C
L
 
V
A
 
N
R
 
L
Q
 
L
Q
 
E
S
 
R
P
 
P
K
 
T
A
 
E
G
 
G
T
 
S
L
 
V
R
 
L
F
 
V
A
 
D
G
 
G
R
 
Q
P
 
E
L
 
L
R
 
T
E
 
T
W
 
L
E
 
S
N
 
E
R
 
S
E
 
E
F
 
L
A
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
R
R
 
R
Q
 
Q
V
 
I
A
 
G
Y
 
M
L
 
I
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
Q
 
F
P
 
N
A
 
L
A
 
L
S
 
S
G
 
S
M
 
R
T
 
T
V
 
V
R
 
F
E
 
G
L
 
N
V
 
V
A
 
A
L
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
L
G
 
D
R
 
N
Y
 
T
P
 
P
W
 
K
H
 
D
G
 
E
A
 
V
L
 
K
G
 
R
R
 
R
F
 
V
T
 
T
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
V
 
-
H
 
-
E
 
E
A
 
L
M
 
L
E
 
S
L
 
L
T
 
V
D
 
G
I
 
L
T
 
G
R
 
D
F
 
K
G
 
H
D
 
D
R
 
S
A
 
Y
V
 
P
D
 
S
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
L
 
A
V
 
L
A
 
A
Q
 
S
D
 
N
S
 
P
Q
 
K
C
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
I
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
P
A
 
A
H
 
T
Q
 
T
I
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
D
 
E
L
 
L
V
 
L
R
 
K
T
 
D
L
 
I
S
 
N
Q
 
R
Q
 
R
R
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
T
V
 
I
V
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
T
H
 
H
D
 
E
I
 
M
N
 
D
M
 
V
A
 
V
A
 
K
R
 
R
F
 
I
C
 
C
D
 
D
D
 
C
L
 
V
I
 
A
A
 
V
L
 
I
K
 
S
N
 
N
G
 
G
R
 
E
L
 
L
L
 
I
A
 
E
S
 
Q
G
 
D
T
 
T
A
 
V
P
 
S
E
 
E
L
 
V
I
 
F

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
29% identity, 83% coverage: 18:243/272 of query aligns to 2:230/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
M
 
M
Y
 
I
E
 
K
L
 
L
D
 
S
D
 
N
V
 
I
S
 
T
-
 
K
-
 
V
F
|
F
R
 
H
I
 
Q
G
 
G
E
 
T
R
 
R
V
 
T
L
 
I
-
 
Q
-
 
A
L
 
L
H
 
N
P
 
N
L
 
V
A
 
S
L
 
L
T
 
H
L
 
V
P
 
P
R
 
A
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
C
 
Y
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
H
 
A
N
 
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
K
 
R
L
 
C
L
 
V
A
 
N
R
 
L
Q
 
L
Q
 
E
S
 
R
P
 
P
K
 
T
A
 
E
G
 
G
T
 
S
L
 
V
R
 
L
F
 
V
A
 
D
G
 
G
R
 
Q
P
 
E
L
 
L
R
 
T
E
 
T
W
 
L
E
 
S
N
 
E
R
 
S
E
 
E
F
 
L
A
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
R
R
 
R
Q
 
Q
V
 
I
A
 
G
Y
 
M
L
 
I
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
Q
 
F
P
 
N
A
 
L
A
 
L
S
 
S
G
 
S
M
 
R
T
 
T
V
 
V
R
 
F
E
 
G
L
 
N
V
 
V
A
 
A
L
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
L
G
 
D
R
 
N
Y
 
T
P
 
P
W
 
K
H
 
D
G
 
E
A
 
V
L
 
K
G
 
R
R
 
R
F
 
V
T
 
T
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
V
 
-
H
 
-
E
 
E
A
 
L
M
 
L
E
 
S
L
 
L
T
 
V
D
 
G
I
 
L
T
 
G
R
 
D
F
 
K
G
 
H
D
 
D
R
 
S
A
 
Y
V
 
P
D
 
S
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
L
 
A
V
 
L
A
 
A
Q
 
S
D
 
N
S
 
P
Q
 
K
C
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
I
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
P
A
 
A
H
 
T
Q
 
T
I
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
D
 
E
L
 
L
V
 
L
R
 
K
T
 
D
L
 
I
S
 
N
Q
 
R
Q
 
R
R
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
T
V
 
I
V
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
T
H
 
H
D
 
E
I
 
M
N
 
D
M
 
V
A
 
V
A
 
K
R
 
R
F
 
I
C
 
C
D
 
D
D
 
C
L
 
V
I
 
A
A
 
V
L
 
I
K
 
S
N
 
N
G
 
G
R
 
E
L
 
L
L
 
I
A
 
E
S
 
Q
G
 
D
T
 
T
A
 
V
P
 
S
E
 
E
L
 
V
I
 
F

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
29% identity, 83% coverage: 18:243/272 of query aligns to 2:230/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
M
 
M
Y
 
I
E
 
K
L
 
L
D
 
S
D
 
N
V
 
I
S
 
T
-
 
K
-
 
V
F
|
F
R
 
H
I
x
Q
G
 
G
E
 
T
R
 
R
V
 
T
L
x
I
-
 
Q
-
 
A
L
 
L
H
 
N
P
 
N
L
 
V
A
 
S
L
 
L
T
 
H
L
 
V
P
 
P
R
 
A
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
C
 
Y
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
H
 
A
N
x
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
K
 
R
L
 
C
L
 
V
A
 
N
R
 
L
Q
 
L
Q
 
E
S
 
R
P
 
P
K
 
T
A
 
E
G
 
G
T
 
S
L
 
V
R
 
L
F
 
V
A
 
D
G
 
G
R
 
Q
P
 
E
L
 
L
R
 
T
E
 
T
W
 
L
E
 
S
N
 
E
R
 
S
E
 
E
F
 
L
A
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
R
R
 
R
Q
 
Q
V
 
I
A
 
G
Y
 
M
L
 
I
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
Q
 
F
P
 
N
A
 
L
A
 
L
S
 
S
G
 
S
M
 
R
T
 
T
V
 
V
R
 
F
E
 
G
L
 
N
V
 
V
A
 
A
L
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
L
G
 
D
R
 
N
Y
 
T
P
 
P
W
 
K
H
 
D
G
 
E
A
 
V
L
 
K
G
 
R
R
 
R
F
 
V
T
 
T
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
V
 
-
H
 
-
E
 
E
A
 
L
M
 
L
E
 
S
L
 
L
T
 
V
D
 
G
I
 
L
T
 
G
R
 
D
F
 
K
G
 
H
D
 
D
R
 
S
A
 
Y
V
 
P
D
 
S
S
x
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
E
x
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
L
 
A
V
 
L
A
 
A
Q
 
S
D
 
N
S
 
P
Q
 
K
C
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
I
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
P
A
 
A
H
 
T
Q
 
T
I
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
D
 
E
L
 
L
V
 
L
R
 
K
T
 
D
L
 
I
S
 
N
Q
 
R
Q
 
R
R
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
T
V
 
I
V
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
T
H
|
H
D
 
E
I
 
M
N
 
D
M
 
V
A
 
V
A
 
K
R
 
R
F
 
I
C
 
C
D
 
D
D
 
C
L
 
V
I
 
A
A
 
V
L
 
I
K
 
S
N
 
N
G
 
G
R
 
E
L
 
L
L
 
I
A
 
E
S
 
Q
G
 
D
T
 
T
A
 
V
P
 
S
E
 
E
L
 
V
I
 
F

P59852 Lactococcin-G-processing and transport ATP-binding protein LagD; EC 3.4.22.-; EC 7.-.-.- from Lactococcus lactis subsp. lactis (Streptococcus lactis) (see paper)
27% identity, 89% coverage: 4:246/272 of query aligns to 455:694/703 of P59852

query
sites
P59852
N
 
N
L
 
T
T
 
N
V
 
I
D
 
N
S
 
I
A
 
S
R
 
K
A
 
N
V
 
I
H
 
F
G
 
N
E
 
K
P
 
D
M
 
I
Y
 
-
E
 
K
L
 
L
D
 
D
D
 
K
V
 
V
S
 
S
F
 
F
R
 
S
I
 
Y
G
 
N
E
 
M
R
 
K
V
 
L
-
 
P
L
 
V
L
 
L
H
 
R
P
 
D
L
 
V
A
 
S
L
 
L
T
 
E
L
 
I
P
 
Y
R
 
S
G
 
K
R
 
S
V
 
K
C
 
V
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
G
H
 
V
N
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
V
R
 
K
Q
 
F
Q
 
Y
S
 
D
P
 
P
K
 
S
A
 
E
G
 
G
T
 
N
L
 
I
R
 
T
F
 
Y
A
 
G
G
 
D
R
 
I
P
 
N
L
 
C
R
 
Q
E
 
D
W
 
I
E
 
E
N
 
N
R
 
H
E
 
K
F
 
L
A
 
R
R
 
N
Q
 
H
V
 
V
A
 
T
Y
 
Y
L
 
V
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
E
Q
 
S
P
 
F
A
 
F
A
 
F
S
 
N
G
 
G
M
 
T
T
 
I
V
 
I
R
 
D
E
 
N
L
 
L
V
 
T
-
 
F
A
 
G
L
 
L
G
 
S
R
 
H
Y
 
Q
P
 
P
W
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
T
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
E
A
 
F
E
 
E
K
 
K
V
 
I
H
 
F
E
 
R
A
 
A
M
 
C
E
 
K
-
 
A
-
 
A
-
 
C
L
 
L
T
 
V
D
 
D
I
 
F
T
 
I
-
 
N
-
 
Q
-
 
Q
-
 
P
-
 
L
R
 
R
F
 
F
G
 
D
-
 
S
-
 
V
-
 
L
D
 
E
R
 
E
A
 
G
V
 
G
D
 
N
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
L
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
L
 
A
V
 
I
A
 
L
Q
 
N
D
 
D
S
 
S
Q
 
E
C
 
I
L
 
I
L
 
I
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
A
I
 
T
S
 
S
A
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
T
A
 
L
H
 
L
Q
 
E
I
 
K
E
 
E
V
 
I
L
 
L
D
 
E
L
 
Y
V
 
L
R
 
I
T
 
K
L
 
L
S
 
Q
Q
 
D
Q
 
K
R
 
T
G
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
I
V
 
I
V
 
F
V
 
I
L
 
A
H
 
H
D
 
H
I
 
L
N
 
S
M
 
I
A
 
-
A
 
A
R
 
K
F
 
A
C
 
C
D
 
D
D
 
E
L
 
I
I
 
I
A
 
V
L
 
L
K
 
D
N
 
Q
G
 
G
R
 
I
L
 
L
L
 
V
A
 
G
S
 
R
G
 
G
T
 
T
A
 
H
P
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
S
E
 
E
E
 
K
K
 
E

Sites not aligning to the query:

8bmsA Cryo-em structure of the mutant solitary ecf module 2eq in msp2n2 lipid nanodiscs in the atpase closed and atp-bound conformation (see paper)
31% identity, 94% coverage: 18:272/272 of query aligns to 4:245/278 of 8bmsA

query
sites
8bmsA
M
 
I
Y
 
I
E
 
S
L
 
F
D
 
D
D
 
H
V
 
V
S
 
T
F
|
F
R
 
T
I
 
D
G
 
S
E
 
P
R
 
R
V
 
P
L
 
A
L
 
L
H
 
S
P
 
D
L
 
L
A
 
S
L
 
F
T
 
A
L
 
I
P
 
E
R
 
R
G
 
G
R
 
S
V
 
W
C
 
T
G
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
H
 
H
N
|
N
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
V
L
 
S
K
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
N
R
 
G
Q
 
L
Q
 
L
S
 
A
P
 
P
K
 
D
-
 
D
-
 
L
-
 
D
A
 
K
G
 
S
T
 
S
L
 
I
R
 
T
F
 
V
A
 
D
G
 
G
R
 
V
P
 
K
L
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
D
R
 
T
E
 
V
W
 
W
E
 
E
N
 
V
R
 
R
E
 
E
F
 
K
A
 
V
R
 
G
Q
 
I
V
 
V
A
 
F
Y
x
Q
L
 
N
P
 
P
Q
 
D
Q
 
N
Q
 
Q
P
 
F
A
 
V
A
 
-
S
 
-
G
 
G
M
 
A
T
 
T
V
 
V
R
 
S
E
 
D
L
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
F
G
 
G
R
 
L
Y
 
E
P
 
-
W
 
-
H
 
N
G
 
R
A
 
A
L
 
V
G
 
P
R
 
R
F
 
P
T
 
E
G
 
M
V
 
L
D
 
-
A
 
-
E
 
K
K
 
I
V
 
V
H
 
A
E
 
Q
A
 
A
M
 
V
E
 
A
L
 
D
T
 
V
D
 
G
I
 
M
T
 
A
R
 
D
F
x
Y
G
 
A
D
 
D
R
 
S
A
 
E
V
 
P
D
 
S
S
x
N
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
x
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
G
L
 
I
V
 
L
A
 
A
Q
 
V
D
 
K
S
 
P
Q
 
Q
C
 
V
L
 
I
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
S
I
 
T
S
 
S
A
 
M
L
 
L
D
 
D
I
 
P
A
 
E
H
 
G
Q
 
K
I
 
E
E
 
Q
V
 
I
L
 
L
D
 
D
L
 
L
V
 
V
R
 
R
T
 
K
L
 
I
S
 
K
Q
 
E
Q
 
D
R
 
N
G
 
N
L
 
L
G
 
T
V
 
V
V
 
I
V
 
S
V
 
I
L
 
T
H
|
H
D
 
D
I
 
L
N
 
E
M
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
G
F
 
-
C
 
A
D
 
D
D
 
Q
L
 
V
I
 
L
A
 
V
L
 
L
K
 
D
N
 
D
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
D
S
 
Q
G
 
G
T
 
K
A
 
P
P
 
E
E
 
E
L
 
I
I
 
F
E
 
P
E
 
K
-
 
V
K
 
E
M
 
M
L
 
L
G
 
K
A
 
R
I
 
I
Y
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
M
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
G
M
 
L
P
 
D
I
 
I
S
 
P
F
 
F
A
 
V
Y
 
Y

1jj7A Crystal structure of thE C-terminal atpase domain of human tap1 (see paper)
30% identity, 86% coverage: 13:246/272 of query aligns to 6:242/251 of 1jj7A

query
sites
1jj7A
V
 
L
H
 
H
G
 
L
E
 
E
P
 
G
M
 
L
Y
 
V
E
 
Q
L
 
F
D
 
Q
D
 
D
V
 
V
S
 
S
F
 
F
R
 
A
I
x
Y
G
 
P
E
 
N
R
 
R
-
 
P
-
 
D
-
 
V
V
 
L
L
x
V
L
 
L
H
 
Q
P
 
G
L
 
L
A
 
T
L
 
F
T
 
T
L
 
L
P
 
R
R
 
P
G
 
G
R
 
E
V
 
V
C
 
T
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
G
H
 
P
N
|
N
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
V
L
 
A
K
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
R
 
N
Q
 
L
Q
 
Y
S
 
Q
P
 
P
K
 
T
A
 
G
G
 
G
T
 
Q
L
 
L
R
 
L
F
 
L
A
 
D
G
 
G
R
 
K
P
 
P
L
 
L
R
 
P
E
 
Q
W
 
Y
E
 
E
N
 
H
R
 
R
E
 
Y
F
 
L
A
 
H
R
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
Y
 
A
L
 
V
P
 
G
Q
 
-
Q
 
Q
Q
 
E
P
 
P
A
 
Q
A
 
V
S
 
F
G
 
G
M
 
R
T
 
S
V
 
L
R
 
Q
E
 
E
L
 
N
V
 
I
A
 
A
L
 
Y
G
 
G
R
 
-
Y
 
L
P
 
T
W
 
Q
H
 
K
G
 
P
A
 
T
L
 
M
G
 
E
R
 
E
F
 
I
T
 
T
G
 
A
V
 
A
D
 
A
A
 
V
E
 
K
K
 
S
V
 
G
H
 
A
E
 
H
A
 
S
M
 
F
E
 
-
L
 
I
T
 
S
D
 
G
I
 
L
T
 
P
R
 
Q
F
 
G
G
 
Y
D
 
D
R
 
T
A
 
E
V
 
V
D
 
D
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
S
S
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
A
A
 
V
W
 
A
I
 
L
A
 
A
M
 
R
L
 
A
V
 
L
A
 
I
Q
 
R
D
 
K
S
 
P
Q
 
C
C
 
V
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
D
P
 
A
I
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
A
A
 
N
H
 
S
Q
 
Q
I
 
L
E
 
Q
V
 
V
L
 
E
D
 
Q
L
 
L
V
 
L
R
 
Y
T
 
E
L
 
S
S
 
P
Q
 
E
Q
 
R
R
 
Y
G
 
S
L
 
R
G
 
S
V
 
V
V
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
T
H
 
Q
D
 
H
I
 
L
N
 
S
M
 
L
A
 
V
A
 
E
R
 
Q
F
 
-
C
 
A
D
 
D
D
 
H
L
 
I
I
 
L
A
 
F
L
 
L
K
 
E
N
 
G
G
 
G
R
 
A
L
 
I
L
 
R
A
 
E
S
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
H
P
 
Q
E
 
Q
L
 
L
I
 
M
E
 
E
E
 
K
K
 
K

O06967 Multidrug resistance ABC transporter ATP-binding/permease protein BmrA; EC 7.6.2.- from Bacillus subtilis (strain 168) (see 2 papers)
31% identity, 82% coverage: 20:243/272 of query aligns to 342:564/589 of O06967

query
sites
O06967
E
 
Q
L
 
L
D
 
D
D
 
R
V
 
V
S
 
S
F
 
F
R
 
G
I
 
Y
G
 
K
-
 
P
E
 
D
R
 
Q
V
 
L
L
 
I
L
 
L
H
 
K
P
 
E
L
 
V
A
 
S
L
 
A
T
 
V
L
 
I
P
 
E
R
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
V
C
 
T
G
 
A
L
 
I
I
 
V
G
 
G
H
 
P
N
 
S
G
 
G
S
 
G
G
 
G
K
|
K
S
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
F
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
E
R
 
R
Q
 
F
Q
 
Y
S
 
S
P
 
P
K
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
I
R
 
R
F
 
L
A
 
G
G
 
D
R
 
E
P
 
P
L
 
V
R
 
D
E
 
T
W
 
Y
E
 
S
N
 
L
R
 
E
E
 
S
F
 
W
A
 
R
R
 
E
Q
 
H
V
 
I
A
 
G
Y
 
Y
L
 
V
P
 
S
Q
 
Q
Q
 
E
Q
 
S
P
 
P
A
 
L
A
 
M
S
 
S
G
 
G
M
 
-
T
 
T
V
 
I
R
 
R
E
 
E
L
 
N
V
 
I
A
 
C
L
 
Y
G
 
G
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
W
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
E
R
 
R
-
 
D
F
 
V
T
 
T
G
 
D
V
 
A
D
 
E
A
 
I
E
 
E
K
 
K
V
 
A
H
 
A
E
 
E
-
 
M
A
 
A
M
 
Y
E
 
A
L
 
L
T
 
N
D
 
F
I
 
I
-
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
P
-
 
N
-
 
Q
-
 
F
-
 
D
T
 
T
R
 
E
F
 
V
G
 
G
D
 
E
R
 
R
A
 
G
V
 
I
D
 
-
S
 
M
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
A
 
I
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
L
 
A
V
 
L
A
 
L
Q
 
R
D
 
N
S
 
P
Q
 
S
C
 
I
L
 
L
L
 
M
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
A
I
 
T
S
 
S
A
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
S
A
 
Q
H
 
S
Q
 
E
I
 
K
E
 
S
V
 
V
L
 
Q
D
 
Q
L
 
A
V
 
L
R
 
E
T
 
V
L
 
L
S
 
M
Q
 
E
Q
 
G
R
 
R
G
 
-
L
 
-
G
 
T
V
 
T
V
 
I
V
 
V
V
 
I
L
 
A
H
 
H
D
 
R
I
 
L
N
 
S
M
 
T
A
 
V
A
 
V
R
 
D
F
 
-
C
 
A
D
 
D
D
 
Q
L
 
L
I
 
L
A
 
F
L
 
V
K
 
E
N
 
K
G
 
G
R
 
E
L
 
I
L
 
T
A
 
G
S
 
R
G
 
G
T
 
T
A
 
H
P
 
H
E
 
E
L
 
L
I
 
M

7chaI Cryo-em structure of p.Aeruginosa mlafebd with amppnp (see paper)
30% identity, 88% coverage: 20:259/272 of query aligns to 5:247/262 of 7chaI

query
sites
7chaI
E
 
E
L
 
L
D
 
K
D
 
G
V
 
L
S
 
T
F
 
F
R
 
K
I
x
R
G
 
G
E
 
S
R
 
R
V
 
A
L
 
I
L
 
F
H
 
D
P
 
N
L
 
I
A
 
D
L
 
V
T
 
R
L
 
I
P
 
P
R
 
R
G
 
G
R
 
K
V
 
V
C
 
T
G
 
G
L
 
I
I
 
M
G
 
G
H
 
P
N
x
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
K
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
Q
 
L
S
 
R
P
 
P
K
 
S
A
 
K
G
 
G
T
 
E
L
 
V
R
 
W
F
 
V
A
 
N
G
 
G
R
 
Q
P
 
N
L
 
L
R
 
P
E
 
Q
W
 
L
E
 
S
N
 
R
R
 
G
E
 
D
F
 
L
A
 
F
-
 
D
-
 
M
-
 
R
R
 
K
Q
 
Q
V
 
F
A
 
G
Y
 
V
L
 
L
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
S
Q
 
G
P
 
A
A
 
L
A
 
F
S
 
T
G
 
D
M
 
L
T
 
D
V
 
V
R
 
F
E
 
E
L
 
N
V
 
V
A
 
A
L
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
F
P
 
P
W
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
R
R
 
V
F
 
H
T
 
T
G
 
Q
V
 
L
D
 
P
A
 
E
E
 
E
K
 
M
V
 
I
H
 
R
E
 
D
A
 
I
M
 
V
E
 
-
L
 
L
T
 
M
D
 
K
I
 
L
T
 
Q
R
 
A
F
 
V
G
 
G
D
 
L
R
 
R
A
 
G
V
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
M
-
 
P
D
 
D
S
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
M
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
A
 
V
W
 
A
I
 
L
A
 
A
M
 
R
L
 
A
V
 
I
A
 
A
Q
 
L
D
 
D
S
 
P
Q
 
Q
C
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
I
 
F
S
 
V
A
 
G
L
 
Q
D
 
D
I
 
P
A
 
I
H
 
A
Q
 
M
I
 
G
E
 
V
V
 
L
L
 
V
D
 
R
L
 
L
V
 
I
R
 
R
T
 
L
L
 
L
S
 
N
Q
 
D
Q
 
A
R
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
T
V
 
S
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
S
H
 
H
D
 
D
I
 
L
N
 
A
M
 
E
A
 
T
A
 
A
R
 
S
F
 
I
C
 
A
D
 
D
D
 
Y
L
 
I
I
 
Y
A
 
I
L
 
V
K
 
G
N
 
D
G
 
G
R
 
R
L
 
V
L
 
L
A
 
G
S
 
H
G
 
G
T
 
T
A
 
-
P
 
P
E
 
D
L
 
V
I
 
L
E
 
K
E
 
E
-
 
T
-
 
D
-
 
D
-
 
P
K
 
R
M
 
I
L
 
R
G
 
Q
A
 
F
I
 
V
Y
 
K
G
 
G
V
 
I
P
 
P
M
 
D
G
 
G
T
 
P
V
 
V

7t55A Cryo-em structure of pcat1 in the inward-facing wide conformation under atp turnover condition (see paper)
28% identity, 83% coverage: 20:246/272 of query aligns to 480:704/715 of 7t55A

query
sites
7t55A
E
 
E
L
 
F
D
 
R
D
 
N
V
 
V
S
 
D
F
 
F
R
 
R
I
x
Y
G
 
G
E
 
L
R
 
R
V
 
K
-
 
P
L
 
V
L
 
L
H
 
K
P
 
N
L
 
I
A
 
N
L
 
L
T
 
T
L
 
I
P
 
P
R
 
K
G
 
G
R
 
K
V
 
T
C
 
V
G
 
A
L
 
I
I
 
V
G
 
G
H
 
E
N
 
S
G
|
G
S
|
S
G
 
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
M
R
 
N
Q
 
F
Q
 
Y
S
 
S
P
 
P
K
 
E
A
 
K
G
 
G
T
 
D
L
 
I
R
 
L
F
 
I
A
 
N
G
 
G
R
 
H
P
 
S
L
 
I
R
 
K
E
 
N
W
 
I
E
 
S
N
 
L
R
 
E
E
 
L
F
 
I
A
 
R
R
 
K
Q
 
K
V
 
I
A
 
A
Y
 
F
L
 
V
P
 
S
Q
|
Q
Q
 
D
Q
 
V
P
 
F
A
 
I
A
 
F
S
 
S
G
 
G
M
 
-
T
 
T
V
 
V
R
 
K
E
 
E
L
 
N
V
 
L
A
 
C
L
 
L
G
 
G
R
 
N
Y
 
-
P
 
-
W
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
T
 
E
G
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
M
E
 
D
K
 
E
V
 
I
H
 
I
E
 
K
A
 
A
M
 
A
E
 
K
L
 
M
T
 
A
D
 
N
-
 
A
-
 
H
-
 
D
-
 
F
-
 
I
-
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
K
I
 
Y
T
 
D
R
 
T
F
 
F
G
 
L
D
 
N
R
 
E
A
 
S
V
 
G
D
 
A
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
E
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
L
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
L
 
A
V
 
L
A
 
L
Q
 
K
D
 
K
S
 
P
Q
 
D
C
 
I
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
I
 
T
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
I
 
S
A
 
I
H
 
T
Q
 
E
I
 
N
E
 
H
V
 
I
L
 
K
D
 
D
L
 
A
V
 
I
R
 
Y
T
 
G
L
 
L
S
 
-
Q
 
-
Q
 
E
R
 
D
G
 
D
L
 
V
G
 
T
V
 
V
V
 
I
V
 
I
V
 
I
L
 
A
H
 
H
D
 
R
I
 
L
N
 
S
M
 
T
A
 
I
A
 
V
R
 
N
F
 
-
C
 
C
D
 
D
D
 
K
L
 
I
I
 
Y
A
 
L
L
 
L
K
 
K
N
 
D
G
 
G
R
 
E
L
 
I
L
 
V
A
 
E
S
 
S
G
 
G
T
 
S
A
 
H
P
 
T
E
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
A
E
 
L
K
 
K

Sites not aligning to the query:

3vx4D Crystal structure of the nucleotide-binding domain of s. Mutans coma, a bifunctional atp-binding cassette transporter involved in the quorum-sensing pathway (see paper)
27% identity, 83% coverage: 21:246/272 of query aligns to 10:232/240 of 3vx4D

query
sites
3vx4D
L
 
F
D
 
E
D
 
N
V
 
L
S
 
S
F
 
Y
R
 
K
I
x
Y
G
 
G
-
 
F
E
 
G
R
 
R
V
 
D
L
x
T
L
 
L
H
 
S
P
 
D
L
 
I
A
 
N
L
 
L
T
 
S
L
 
I
P
 
K
R
 
K
G
 
G
R
 
S
V
 
K
C
 
V
G
 
S
L
 
L
I
 
V
G
 
G
H
 
A
N
x
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
V
R
 
N
Q
 
F
Q
 
Y
S
 
E
P
 
P
K
 
N
A
 
K
G
 
G
T
 
I
L
 
V
R
 
R
F
 
I
A
 
N
G
 
G
R
 
N
P
 
D
L
 
L
R
 
K
E
 
V
W
 
I
E
 
D
N
 
K
R
 
T
E
 
A
F
 
L
A
 
R
R
 
R
Q
 
H
V
 
I
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
|
Q
Q
 
Q
Q
 
A
P
 
Y
A
 
V
A
 
F
S
 
S
G
 
G
M
 
S
T
 
I
V
 
M
R
 
D
E
 
N
L
 
L
V
 
V
A
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
W
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
G
R
 
A
F
 
K
T
 
E
G
 
G
V
 
T
D
 
S
A
 
Q
E
 
E
K
 
D
V
 
I
H
 
I
E
 
R
A
 
A
M
 
C
E
 
E
L
 
I
T
 
A
D
 
E
I
 
I
-
 
R
-
 
S
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
Q
-
 
M
-
 
P
-
 
Q
-
 
G
-
 
Y
-
 
Q
T
 
T
R
 
E
F
 
L
G
 
S
D
 
D
R
 
G
A
 
A
V
 
-
D
 
-
S
x
G
L
x
I
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
x
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
I
W
 
A
I
 
L
A
 
A
M
 
R
L
 
A
V
 
L
A
 
L
Q
 
T
D
 
Q
S
 
A
Q
 
P
C
 
V
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
A
P
 
A
I
 
T
S
 
S
A
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
L
H
 
T
Q
 
E
I
 
K
E
 
K
V
 
I
L
 
I
D
 
S
L
 
N
V
 
L
R
 
L
T
 
Q
L
 
M
S
 
T
Q
 
E
Q
 
K
R
 
T
G
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
I
V
 
I
V
 
F
V
 
V
L
 
A
H
|
H
D
 
R
I
 
L
N
 
S
M
 
I
A
 
S
A
 
Q
R
 
R
F
 
-
C
 
T
D
 
D
D
 
E
L
 
V
I
 
I
A
 
V
L
 
M
K
 
D
N
 
Q
G
 
G
R
 
K
L
 
I
L
 
V
A
 
E
S
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
H
P
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
L
E
 
A
E
 
K
K
 
Q

P9WQI3 Trehalose import ATP-binding protein SugC; MtbSugC; Nucleotide-binding domain of SugABC transporter; NBD of SugABC transporter; SugABC transporter ATPase SugC; EC 7.5.2.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
31% identity, 76% coverage: 37:244/272 of query aligns to 23:224/393 of P9WQI3

query
sites
P9WQI3
L
 
L
A
 
N
L
 
L
T
 
T
L
 
I
P
 
A
R
 
D
G
 
G
R
 
E
V
 
F
C
 
L
G
 
I
L
 
L
I
 
V
G
 
G
H
 
P
N
 
S
G
 
G
S
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
T
L
 
L
K
 
N
L
 
M
L
 
I
A
 
A
R
 
G
Q
 
L
Q
 
E
S
 
D
P
 
I
K
 
S
A
 
S
G
 
G
T
 
E
L
 
L
R
 
R
F
 
I
A
 
A
G
 
G
R
 
E
P
 
R
L
 
V
R
 
N
E
 
E
W
 
K
E
 
A
N
 
P
R
 
K
E
 
D
F
 
-
A
 
-
R
 
R
Q
 
D
V
 
I
A
 
A
Y
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
S
Q
 
Y
P
 
A
A
 
L
A
 
Y
S
 
P
G
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
R
E
 
Q
L
 
N
V
 
I
A
 
A
L
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
F
P
 
P
W
 
L
H
 
T
G
 
L
A
 
A
L
 
K
G
 
M
R
 
R
F
 
K
T
 
A
G
 
D
V
 
I
D
 
-
A
 
A
E
 
Q
K
 
K
V
 
V
H
 
S
E
 
E
A
 
T
M
 
A
E
 
K
L
 
I
T
 
L
D
 
D
I
 
L
T
 
T
R
 
N
F
 
L
G
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
K
V
 
P
D
 
S
S
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
W
 
A
I
 
M
A
 
G
M
 
R
L
 
A
V
 
I
A
 
V
Q
 
R
D
 
H
S
 
P
Q
 
K
C
 
A
L
 
F
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
I
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
I
 
A
A
 
K
H
 
L
Q
 
R
I
 
V
E
 
Q
V
 
M
L
 
R
D
 
G
L
 
E
V
 
I
R
 
A
T
 
Q
L
 
L
S
 
Q
Q
 
R
Q
 
R
R
 
L
G
 
G
L
 
T
G
 
T
V
 
T
V
 
V
V
 
Y
V
 
V
L
 
T
H
|
H
D
 
D
I
 
Q
N
 
T
M
 
E
A
 
A
A
 
M
R
 
T
F
 
L
C
 
G
D
 
D
D
 
R
L
 
V
I
 
V
A
 
V
L
 
M
K
 
Y
N
 
G
G
 
G
R
 
I
L
 
A
L
 
Q
A
 
Q
S
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
P
P
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
Y
E
 
E

Q96J66 ATP-binding cassette sub-family C member 11; Multidrug resistance-associated protein 8; EC 7.6.2.2; EC 7.6.2.3 from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
31% identity, 78% coverage: 34:246/272 of query aligns to 527:723/1382 of Q96J66

query
sites
Q96J66
L
 
L
H
 
H
P
 
K
L
 
I
A
 
N
L
 
L
T
 
V
L
 
V
P
 
S
R
 
K
G
 
G
R
 
M
V
 
M
C
 
L
G
 
G
L
 
V
I
 
C
G
 
G
H
 
N
N
x
T
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
S
L
 
L
L
 
L
K
 
S
L
 
A
L
 
I
A
 
L
R
 
E
Q
 
E
Q
 
M
S
 
H
P
 
L
K
 
L
A
 
E
G
 
G
T
 
S
L
 
V
R
 
G
F
 
V
A
 
Q
G
 
G
R
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
W
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
S
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
V
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
A
P
 
W
A
 
I
A
 
V
S
 
S
G
 
G
M
 
N
T
 
I
V
 
R
R
 
E
E
 
N
L
 
I
V
 
L
A
 
M
L
 
G
G
 
G
R
 
A
Y
 
Y
P
 
D
W
 
K
H
 
A
G
 
R
A
 
Y
L
 
L
G
 
Q
R
 
V
F
 
L
T
 
H
G
 
C
V
 
C
D
 
S
A
 
L
E
 
N
K
 
R
V
 
D
H
 
L
E
 
E
A
 
L
M
 
L
E
 
P
L
 
F
T
 
G
D
 
D
I
 
M
T
 
T
R
 
E
F
 
I
G
 
G
D
 
E
R
|
R
A
 
G
V
 
L
D
 
N
S
 
-
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
I
W
 
S
I
 
L
A
 
A
M
 
R
L
 
A
V
|
V
A
 
Y
Q
 
S
D
 
D
S
 
R
Q
 
Q
C
 
I
L
 
Y
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
D
P
 
P
I
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
V
D
 
D
-
 
A
-
 
H
I
 
V
A
 
G
H
 
K
Q
 
H
I
 
I
E
 
F
V
 
E
L
 
E
D
 
C
L
 
I
V
 
K
R
 
K
T
 
T
L
 
L
S
 
-
Q
 
-
Q
 
-
R
 
R
G
 
G
L
 
K
G
 
T
V
 
V
V
|
V
V
 
L
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
Q
I
 
L
N
 
Q
M
 
Y
A
 
-
A
 
L
R
 
E
F
 
F
C
 
C
D
 
G
D
 
Q
L
 
I
I
 
I
A
 
L
L
 
L
K
 
E
N
 
N
G
 
G
R
 
K
L
 
I
L
 
C
A
 
E
S
 
N
G
 
G
T
 
T
A
 
H
P
 
S
E
 
E
L
 
L
I
 
M
E
 
Q
E
 
K
K
 
K

Sites not aligning to the query:

Q03518 Antigen peptide transporter 1; APT1; ATP-binding cassette sub-family B member 2; Peptide supply factor 1; Peptide transporter PSF1; PSF-1; Peptide transporter TAP1; Peptide transporter involved in antigen processing 1; Really interesting new gene 4 protein; RING4; EC 7.4.2.14 from Homo sapiens (Human) (see 10 papers)
30% identity, 86% coverage: 13:246/272 of query aligns to 497:733/748 of Q03518

query
sites
Q03518
V
 
L
H
 
H
G
 
L
E
 
E
P
 
G
M
 
L
Y
 
V
E
 
Q
L
 
F
D
 
Q
D
 
D
V
 
V
S
 
S
F
 
F
R
 
A
I
 
Y
G
 
P
E
 
N
R
 
R
-
 
P
-
 
D
-
x
V
V
 
L
L
 
V
L
 
L
H
 
Q
P
 
G
L
 
L
A
 
T
L
 
F
T
 
T
L
 
L
P
 
R
R
 
P
G
 
G
R
 
E
V
 
V
C
 
T
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
G
H
 
P
N
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
|
S
T
 
T
L
 
V
L
 
A
K
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
R
 
N
Q
 
L
Q
 
Y
S
 
Q
P
 
P
K
 
T
A
 
G
G
 
G
T
 
Q
L
 
L
R
 
L
F
 
L
A
 
D
G
 
G
R
 
K
P
 
P
L
 
L
R
 
P
E
 
Q
W
 
Y
E
 
E
N
 
H
R
 
R
E
 
Y
F
 
L
A
 
H
R
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
Y
 
A
L
 
V
P
 
-
Q
 
G
Q
 
Q
Q
 
E
P
 
P
A
 
Q
A
 
V
S
 
F
G
 
G
M
 
R
T
 
S
V
 
L
R
 
Q
E
 
E
L
 
N
V
 
I
A
 
A
L
 
Y
G
 
G
-
 
L
-
 
T
R
 
Q
Y
 
K
P
 
P
W
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
T
L
 
M
G
 
E
R
 
E
F
 
I
T
 
T
G
 
A
V
 
A
D
 
A
A
 
V
E
 
K
K
 
S
V
 
G
H
 
A
E
 
H
A
 
S
M
 
F
E
 
-
L
 
I
T
 
S
D
 
G
I
 
L
T
 
P
R
 
Q
F
 
G
G
 
Y
D
 
D
R
 
T
A
 
E
V
 
V
D
|
D
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
S
S
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
|
R
Q
 
Q
R
 
A
A
 
V
W
 
A
I
 
L
A
 
A
M
 
R
L
 
A
V
 
L
A
 
I
Q
x
R
D
 
K
S
 
P
Q
 
C
C
 
V
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
D
P
 
A
I
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
|
D
I
 
A
A
 
N
H
 
S
Q
 
Q
I
 
L
E
 
Q
V
 
V
L
 
E
D
 
Q
L
 
L
V
 
L
R
 
Y
T
 
E
L
 
S
S
 
P
Q
 
E
Q
 
R
R
 
Y
G
 
S
L
 
R
G
 
S
V
 
V
V
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
T
H
 
Q
D
 
H
I
 
L
N
 
S
M
 
L
A
 
V
A
 
E
R
 
Q
F
 
-
C
 
A
D
 
D
D
 
H
L
 
I
I
 
L
A
 
F
L
 
L
K
 
E
N
 
G
G
 
G
R
 
A
L
 
I
L
 
R
A
 
E
S
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
H
P
 
Q
E
 
Q
L
 
L
I
 
M
E
 
E
E
 
K
K
 
K

Sites not aligning to the query:

8bmpA Cryo-em structure of the folate-specific ecf transporter complex in msp2n2 lipid nanodiscs bound to atp and adp (see paper)
33% identity, 83% coverage: 18:243/272 of query aligns to 5:228/278 of 8bmpA

query
sites
8bmpA
M
 
I
Y
 
I
E
 
S
L
 
F
D
 
D
D
 
H
V
 
V
S
 
T
F
|
F
R
 
D
I
 
-
G
 
S
E
 
P
R
 
R
V
 
P
L
 
A
L
 
L
H
 
S
P
 
D
L
 
L
A
 
S
L
 
F
T
 
A
L
 
I
P
 
E
R
 
R
G
 
G
R
 
S
V
 
W
C
 
T
G
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
H
 
H
N
|
N
G
 
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
V
L
 
S
K
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
N
R
 
G
Q
 
L
Q
 
L
S
 
A
P
 
P
K
 
D
-
 
D
-
 
L
-
 
D
A
 
K
G
 
S
T
 
S
L
 
I
R
 
T
F
 
V
A
 
D
G
 
G
R
 
V
P
 
K
L
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
D
R
 
T
E
 
V
W
 
W
E
 
E
N
 
V
R
 
R
E
 
E
F
 
K
A
 
V
R
 
G
Q
 
I
V
 
V
A
 
F
Y
 
Q
L
 
N
P
 
P
Q
 
D
Q
 
N
Q
 
Q
P
 
F
A
 
V
A
 
-
S
 
-
G
 
G
M
 
A
T
 
T
V
 
V
R
 
S
E
 
D
L
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
F
G
 
G
R
 
L
Y
 
E
P
 
-
W
 
-
H
 
N
G
 
R
A
 
A
L
 
V
G
 
P
R
 
R
F
 
P
T
 
E
G
 
M
V
 
L
D
 
-
A
 
-
E
 
K
K
 
I
V
 
V
H
 
A
E
 
Q
A
 
A
M
 
V
E
 
A
L
 
D
T
 
V
D
 
G
I
 
M
T
 
A
R
 
D
F
 
Y
G
 
A
D
 
D
R
 
S
A
 
E
V
 
P
D
 
S
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
G
L
 
I
V
 
L
A
 
A
Q
 
V
D
 
K
S
 
P
Q
 
Q
C
 
V
L
 
I
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
S
I
 
T
S
 
S
A
 
M
L
 
L
D
 
D
I
 
P
A
 
E
H
 
G
Q
 
K
I
 
E
E
 
Q
V
 
I
L
 
L
D
 
D
L
 
L
V
 
V
R
 
R
T
 
K
L
 
I
S
 
K
Q
 
E
Q
 
D
R
 
N
G
 
N
L
 
L
G
 
T
V
 
V
V
 
I
V
 
S
V
 
I
L
 
T
H
 
H
D
 
D
I
 
L
N
 
E
M
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
G
F
 
-
C
 
A
D
 
D
D
 
Q
L
 
V
I
 
L
A
 
V
L
 
L
K
 
D
N
 
D
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
D
S
 
Q
G
 
G
T
 
K
A
 
P
P
 
E
E
 
E
L
 
I
I
 
F

5d3mA Folate ecf transporter: amppnp bound state (see paper)
32% identity, 83% coverage: 18:243/272 of query aligns to 5:231/280 of 5d3mA

query
sites
5d3mA
M
 
I
Y
 
I
E
 
S
L
 
F
D
 
D
D
 
H
V
 
V
S
 
T
F
|
F
R
 
T
I
 
Y
G
 
P
E
 
D
-
 
S
-
 
P
R
 
R
V
 
P
L
 
A
L
 
L
H
 
S
P
 
D
L
 
L
A
 
S
L
 
F
T
 
A
L
 
I
P
 
E
R
 
R
G
 
G
R
 
S
V
 
W
C
 
T
G
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
H
 
H
N
|
N
G
|
G
S
 
S
G
 
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
V
L
 
S
K
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
N
R
 
G
Q
 
L
Q
 
L
S
 
A
P
 
P
K
 
D
-
 
D
-
 
L
-
 
D
A
 
K
G
 
S
T
 
S
L
 
I
R
 
T
F
 
V
A
 
D
G
 
G
R
 
V
P
 
K
L
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
D
R
 
T
E
 
V
W
 
W
E
 
E
N
 
V
R
 
R
E
 
E
F
 
K
A
 
V
R
 
G
Q
 
I
V
 
V
A
 
F
Y
 
Q
L
 
N
P
 
P
Q
 
D
Q
 
N
Q
 
Q
P
 
-
A
 
-
A
 
F
S
 
V
G
 
G
M
 
A
T
 
T
V
 
V
R
 
S
E
 
D
L
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
F
G
 
G
R
 
L
Y
 
E
P
 
-
W
 
-
H
 
N
G
 
R
A
 
A
L
 
V
G
 
P
R
 
R
F
 
P
T
 
E
G
 
M
V
 
L
D
 
-
A
 
-
E
 
K
K
 
I
V
 
V
H
 
A
E
 
Q
A
 
A
M
 
V
E
 
A
L
 
D
T
 
V
D
 
G
I
 
M
T
 
A
R
 
D
F
 
Y
G
 
A
D
 
D
R
 
S
A
 
E
V
 
P
D
 
S
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
G
L
 
I
V
 
L
A
 
A
Q
 
V
D
 
K
S
 
P
Q
 
Q
C
 
V
L
 
I
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
S
I
 
T
S
 
S
A
 
M
L
 
L
D
 
D
I
 
P
A
 
E
H
 
G
Q
 
K
I
 
E
E
 
Q
V
 
I
L
 
L
D
 
D
L
 
L
V
 
V
R
 
R
T
 
K
L
 
I
S
 
K
Q
 
E
Q
 
D
R
 
N
G
 
N
L
 
L
G
 
T
V
 
V
V
 
I
V
 
S
V
 
I
L
 
T
H
 
H
D
 
D
I
 
L
N
 
E
M
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
G
F
 
-
C
 
A
D
 
D
D
 
Q
L
 
V
I
 
L
A
 
V
L
 
L
K
 
D
N
 
D
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
D
S
 
Q
G
 
G
T
 
K
A
 
P
P
 
E
E
 
E
L
 
I
I
 
F

Query Sequence

>H281DRAFT_04927 H281DRAFT_04927 iron complex transport system ATP-binding protein
MNANLTVDSARAVHGEPMYELDDVSFRIGERVLLHPLALTLPRGRVCGLIGHNGSGKSTL
LKLLARQQSPKAGTLRFAGRPLREWENREFARQVAYLPQQQPAASGMTVRELVALGRYPW
HGALGRFTGVDAEKVHEAMELTDITRFGDRAVDSLSGGERQRAWIAMLVAQDSQCLLLDE
PISALDIAHQIEVLDLVRTLSQQRGLGVVVVLHDINMAARFCDDLIALKNGRLLASGTAP
ELIEEKMLGAIYGVPMGTVAHPRGGMPISFAY

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory