SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_05319 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_05319 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4ur8A Crystal structure of keto-deoxy-d-galactarate dehydratase complexed with 2-oxoadipic acid (see paper)
54% identity, 98% coverage: 4:301/305 of query aligns to 3:298/304 of 4ur8A

query
sites
4ur8A
P
 
P
Q
 
E
E
 
Q
L
 
I
K
 
K
Q
 
T
I
 
A
V
 
L
S
 
G
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
S
F
|
F
P
 
P
V
 
V
T
 
T
D
 
H
F
 
F
D
 
D
E
 
A
K
 
E
G
 
G
D
 
R
F
 
F
R
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
S
Y
 
Y
A
 
R
E
 
E
R
 
H
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
L
A
 
A
P
 
G
Y
 
Y
G
 
K
A
 
A
S
 
P
A
 
V
L
 
L
F
 
F
V
 
A
A
 
A
G
 
G
G
|
G
T
|
T
G
 
G
E
 
E
F
 
F
F
 
F
S
 
S
L
 
L
T
 
K
H
 
P
D
 
D
D
 
E
Y
 
I
S
 
P
N
 
T
V
 
I
V
 
V
R
 
A
T
 
A
A
 
A
T
 
K
E
 
E
V
 
V
C
 
A
K
 
-
G
 
G
K
 
E
V
 
T
P
 
A
I
 
I
L
 
V
A
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
G
 
Y
P
 
G
T
 
T
R
 
E
V
 
I
A
 
A
I
 
V
A
 
D
Y
 
I
A
 
A
K
 
R
E
 
S
A
 
V
E
 
E
R
 
K
H
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
L
M
 
L
P
 
P
H
 
H
Y
 
Y
L
|
L
T
 
I
E
 
D
A
 
A
C
 
P
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
A
 
A
H
 
H
A
 
I
E
 
K
E
 
K
V
 
V
C
 
C
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
P
 
-
N
 
G
M
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
M
I
 
V
Y
|
Y
N
 
N
R
 
R
A
 
D
N
 
N
S
 
S
K
 
V
L
 
L
N
 
Q
A
 
A
D
 
D
M
 
T
L
 
L
E
 
A
G
 
R
L
 
L
A
 
C
E
 
D
R
 
E
C
 
C
P
 
P
N
 
N
L
 
L
I
 
V
G
 
G
F
 
F
K
|
K
D
 
D
G
 
G
V
 
T
G
 
G
E
 
D
I
 
I
E
 
G
N
 
L
M
 
V
V
 
R
T
 
Q
I
 
I
R
 
T
R
 
A
R
 
K
L
 
M
G
 
G
D
 
D
R
 
R
F
 
L
S
 
M
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
M
P
 
P
T
 
T
A
 
A
E
 
E
V
 
L
Y
 
F
A
 
A
A
 
E
A
 
A
Y
 
Y
K
 
L
A
 
G
L
 
A
G
 
G
V
 
F
P
 
T
V
 
T
Y
 
Y
S
|
S
S
 
S
A
 
A
V
 
V
F
 
F
N
 
N
F
 
F
I
 
V
P
 
P
K
 
G
T
 
L
A
 
A
M
 
N
D
 
E
F
 
F
Y
 
Y
R
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
R
A
 
A
D
 
G
D
 
E
H
 
R
A
 
A
T
 
T
V
 
C
G
 
E
K
 
R
L
 
I
I
 
L
D
 
V
E
 
D
F
 
F
F
 
F
L
 
Y
P
 
P
Y
 
F
L
 
M
K
 
A
I
 
I
R
 
R
N
 
N
R
 
R
R
 
A
A
 
K
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
S
 
S
I
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
K
 
R
L
 
L
V
 
Q
G
 
G
H
 
F
S
 
N
A
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
V
R
 
R
A
 
A
P
 
P
L
 
L
T
 
K
D
 
D
L
 
L
T
 
T
E
 
N
E
 
E
E
 
E
M
 
I
A
 
G
Q
 
M
L
 
L
D
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
I
K
 
G
T
 
T

5hwnB Crystal structure of keto-deoxy-d-galactarate dehydratase complexed with pyruvate (see paper)
54% identity, 98% coverage: 4:301/305 of query aligns to 3:298/310 of 5hwnB

query
sites
5hwnB
P
 
P
Q
 
E
E
 
Q
L
 
I
K
 
K
Q
 
T
I
 
A
V
 
L
S
 
G
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
S
F
|
F
P
 
P
V
 
V
T
 
T
D
 
H
F
 
F
D
 
D
E
 
A
K
 
E
G
 
G
D
 
R
F
 
F
R
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
S
Y
 
Y
A
 
R
E
 
E
R
 
H
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
L
A
 
A
P
 
G
Y
 
Y
G
 
K
A
 
A
S
 
P
A
 
V
L
 
L
F
 
F
V
 
A
A
 
A
G
 
G
G
|
G
T
|
T
G
 
G
E
 
E
F
 
F
F
 
F
S
 
S
L
 
L
T
 
K
H
 
P
D
 
D
D
 
E
Y
 
I
S
 
P
N
 
T
V
 
I
V
 
V
R
 
A
T
 
A
A
 
A
T
 
K
E
 
E
V
 
V
C
 
A
K
 
-
G
 
G
K
 
E
V
 
T
P
 
A
I
 
I
L
 
V
A
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
G
 
Y
P
 
G
T
 
T
R
 
E
V
 
I
A
 
A
I
 
V
A
 
D
Y
 
I
A
 
A
K
 
R
E
 
S
A
 
V
E
 
E
R
 
K
H
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
L
M
 
L
P
 
P
H
 
H
Y
 
Y
L
|
L
T
 
I
E
 
D
A
 
A
C
 
P
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
A
 
A
H
 
H
A
 
I
E
 
K
E
 
K
V
 
V
C
 
C
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
P
 
-
N
 
G
M
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
M
I
 
V
Y
|
Y
N
 
N
R
 
R
A
 
D
N
 
N
S
 
S
K
 
V
L
 
L
N
 
Q
A
 
A
D
 
D
M
 
T
L
 
L
E
 
A
G
 
R
L
 
L
A
 
C
E
 
D
R
 
E
C
 
C
P
 
P
N
 
N
L
 
L
I
 
V
G
 
G
F
 
F
K
|
K
D
 
D
G
 
G
V
 
T
G
 
G
E
 
D
I
 
I
E
 
G
N
 
L
M
 
V
V
 
R
T
 
Q
I
 
I
R
 
T
R
 
A
R
 
K
L
 
M
G
 
G
D
 
D
R
 
R
F
 
L
S
 
M
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
M
P
 
P
T
 
T
A
 
A
E
 
E
V
 
L
Y
 
F
A
 
A
A
 
E
A
 
A
Y
 
Y
K
 
L
A
 
G
L
 
A
G
 
G
V
 
F
P
 
T
V
 
T
Y
 
Y
S
|
S
S
 
S
A
 
A
V
 
V
F
 
F
N
 
N
F
 
F
I
 
V
P
 
P
K
 
G
T
 
L
A
 
A
M
 
N
D
 
E
F
 
F
Y
 
Y
R
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
R
A
 
A
D
 
G
D
 
E
H
 
R
A
 
A
T
 
T
V
 
C
G
 
E
K
 
R
L
 
I
I
 
L
D
 
V
E
 
D
F
 
F
F
 
F
L
 
Y
P
 
P
Y
 
F
L
 
M
K
 
A
I
 
I
R
 
R
N
 
N
R
 
R
R
 
A
A
 
K
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
S
 
S
I
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
K
 
R
L
 
L
V
 
Q
G
 
G
H
 
F
S
 
N
A
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
V
R
 
R
A
 
A
P
 
P
L
 
L
T
 
K
D
 
D
L
 
L
T
 
T
E
 
N
E
 
E
E
 
E
M
 
I
A
 
G
Q
 
M
L
 
L
D
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
I
K
 
G
T
 
T

7mjfA Crystal structure of candidatus liberibacter solanacearum dihydrodipicolinate synthase with pyruvate and succinic semi-aldehyde bound in active site
26% identity, 93% coverage: 20:303/305 of query aligns to 10:292/296 of 7mjfA

query
sites
7mjfA
V
 
I
T
 
T
D
 
P
F
 
F
D
 
T
E
 
K
K
 
D
G
 
N
D
 
L
F
 
I
R
 
D
A
 
E
D
 
D
T
 
S
Y
 
F
A
 
V
E
 
D
R
 
H
L
 
I
E
 
E
W
 
W
L
 
Q
A
 
I
P
 
S
Y
 
E
G
 
G
A
 
S
S
 
S
A
 
G
L
 
L
F
 
V
V
 
P
A
 
A
G
 
G
G
x
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
F
 
S
F
 
S
S
 
T
L
 
L
T
 
S
H
 
Y
D
 
E
D
 
E
Y
 
H
S
 
C
N
 
R
V
 
V
V
 
V
R
 
E
T
 
L
A
 
C
T
 
V
E
 
K
V
 
T
C
 
A
K
 
A
G
 
G
K
 
R
V
 
V
P
 
P
I
 
V
L
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
-
 
S
G
 
N
P
 
N
T
 
T
R
 
K
V
 
E
A
 
S
I
 
I
A
 
E
Y
 
L
A
 
A
K
 
Q
E
 
Y
A
 
A
E
 
Q
R
 
N
H
 
T
G
 
G
A
 
A
N
 
D
G
 
A
I
 
L
L
 
L
L
 
V
M
 
V
P
 
V
H
 
P
Y
 
Y
L
 
Y
T
 
N
E
 
K
A
 
P
C
 
N
Q
 
K
E
 
K
G
 
G
I
 
L
A
 
L
A
 
A
H
 
H
A
 
F
E
 
G
E
 
S
V
 
I
C
 
A
K
 
N
S
 
A
V
 
V
P
 
-
N
 
S
M
 
L
G
 
P
V
 
I
I
 
Y
I
 
I
Y
|
Y
N
 
N
-
 
N
-
 
P
-
 
S
R
|
R
A
 
T
N
 
V
S
 
I
K
 
E
L
 
M
N
 
D
A
 
V
D
 
D
M
 
T
L
 
M
E
 
A
G
 
E
L
 
L
A
 
V
E
 
K
R
 
T
C
 
Y
P
 
S
N
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
V
K
|
K
D
 
D
G
 
A
V
 
T
G
 
G
E
 
R
I
 
I
E
 
E
N
 
L
M
 
A
V
 
S
T
 
G
I
 
Q
R
 
R
R
 
I
R
 
A
L
 
C
G
 
G
D
 
S
R
 
D
F
 
F
S
 
I
Y
 
Q
L
 
L
G
 
S
G
|
G
L
 
D
P
 
D
T
 
S
A
 
S
E
 
A
V
 
L
Y
 
G
A
 
F
A
 
N
A
 
V
Y
 
H
K
 
G
A
 
G
L
 
V
G
 
G
V
 
C
P
 
-
V
 
-
Y
 
-
S
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
T
F
 
A
N
 
N
F
 
V
I
 
A
P
 
P
K
 
R
T
 
I
A
 
C
M
 
A
D
 
E
F
 
F
Y
 
Q
R
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
S
A
 
E
D
 
G
D
 
D
H
 
Y
A
 
R
T
 
Q
V
 
A
G
 
L
K
 
E
L
 
Y
I
 
Q
D
 
D
E
 
K
F
 
L
F
 
F
-
 
P
-
 
L
-
 
H
-
 
Q
L
 
A
P
 
L
Y
 
F
L
 
I
K
 
E
I
 
P
R
 
S
N
 
I
R
 
S
R
 
S
A
 
V
G
 
K
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
S
 
S
I
 
R
V
 
L
K
 
G
A
 
R
G
 
N
A
 
V
K
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
-
H
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
V
R
 
R
A
 
A
P
 
P
L
 
M
T
 
V
D
 
S
L
 
I
T
 
L
E
 
E
E
 
K
E
 
E
-
 
T
M
 
M
A
 
F
Q
 
A
L
 
I
D
 
D
A
 
Q
L
 
A
I
 
L
K
 
D
T
 
H
L
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7lvlA Dihydrodipicolinate synthase bound with allosteric inhibitor (s)- lysine from candidatus liberibacter solanacearum
26% identity, 93% coverage: 20:303/305 of query aligns to 10:292/296 of 7lvlA

query
sites
7lvlA
V
 
I
T
 
T
D
 
P
F
 
F
D
 
T
E
 
K
K
 
D
G
 
N
D
 
L
F
 
I
R
 
D
A
 
E
D
 
D
T
 
S
Y
 
F
A
 
V
E
 
D
R
 
H
L
 
I
E
 
E
W
 
W
L
 
Q
A
 
I
P
 
S
Y
 
E
G
 
G
A
 
S
S
 
S
A
 
G
L
 
L
F
 
V
V
 
P
A
 
A
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
x
S
F
x
S
S
 
T
L
|
L
T
 
S
H
 
Y
D
 
E
D
 
E
Y
 
H
S
 
C
N
 
R
V
 
V
V
 
V
R
 
E
T
 
L
A
 
C
T
 
V
E
 
K
V
 
T
C
 
A
K
 
A
G
 
G
K
 
R
V
 
V
P
 
P
I
 
V
L
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
-
 
S
G
 
N
P
 
N
T
 
T
R
 
K
V
 
E
A
 
S
I
 
I
A
 
E
Y
 
L
A
 
A
K
 
Q
E
 
Y
A
 
A
E
 
Q
R
 
N
H
 
T
G
 
G
A
 
A
N
 
D
G
 
A
I
 
L
L
 
L
L
 
V
M
 
V
P
 
V
H
 
P
Y
|
Y
L
x
Y
T
 
N
E
 
K
A
 
P
C
 
N
Q
 
K
E
 
K
G
 
G
I
 
L
A
 
L
A
 
A
H
 
H
A
 
F
E
 
G
E
 
S
V
 
I
C
 
A
K
 
N
S
 
A
V
 
V
P
 
-
N
 
S
M
 
L
G
 
P
V
 
I
I
 
Y
I
 
I
Y
|
Y
N
 
N
-
 
N
-
 
P
-
 
S
R
|
R
A
 
T
N
 
V
S
 
I
K
 
E
L
 
M
N
 
D
A
 
V
D
 
D
M
 
T
L
 
M
E
 
A
G
 
E
L
 
L
A
 
V
E
 
K
R
 
T
C
 
Y
P
 
S
N
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
V
K
|
K
D
 
D
G
 
A
V
 
T
G
 
G
E
 
R
I
 
I
E
 
E
N
 
L
M
 
A
V
 
S
T
 
G
I
 
Q
R
 
R
R
 
I
R
 
A
L
 
C
G
 
G
D
 
S
R
 
D
F
 
F
S
 
I
Y
 
Q
L
 
L
G
 
S
G
 
G
L
 
D
P
 
D
T
 
S
A
 
S
E
 
A
V
 
L
Y
 
G
A
 
F
A
 
N
A
 
V
Y
 
H
K
 
G
A
 
G
L
 
V
G
 
G
V
 
C
P
 
-
V
 
-
Y
 
-
S
x
I
S
 
S
A
 
V
V
 
T
F
 
A
N
 
N
F
 
V
I
 
A
P
 
P
K
 
R
T
 
I
A
 
C
M
 
A
D
 
E
F
 
F
Y
 
Q
R
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
S
A
 
E
D
 
G
D
 
D
H
 
Y
A
 
R
T
 
Q
V
 
A
G
 
L
K
 
E
L
 
Y
I
 
Q
D
 
D
E
 
K
F
 
L
F
 
F
-
 
P
-
 
L
-
 
H
-
 
Q
L
 
A
P
 
L
Y
 
F
L
 
I
K
 
E
I
 
P
R
 
S
N
 
I
R
 
S
R
 
S
A
 
V
G
 
K
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
S
 
S
I
 
R
V
 
L
K
 
G
A
 
R
G
 
N
A
 
V
K
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
-
H
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
V
R
 
R
A
 
A
P
 
P
L
 
M
T
 
V
D
 
S
L
 
I
T
 
L
E
 
E
E
 
K
E
 
E
-
 
T
M
 
M
A
 
F
Q
 
A
L
 
I
D
 
D
A
 
Q
L
 
A
I
 
L
K
 
D
T
 
H
L
 
I
G
 
G

Q8UGL3 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) (Agrobacterium tumefaciens (strain C58)) (see paper)
28% identity, 95% coverage: 13:303/305 of query aligns to 3:291/294 of Q8UGL3

query
sites
Q8UGL3
Q
 
K
G
 
G
L
 
S
L
 
I
S
 
P
F
 
A
P
 
L
V
 
I
T
 
T
D
 
P
F
 
F
D
 
T
E
 
D
K
 
N
G
 
G
D
 
S
F
 
V
R
 
D
A
 
E
D
 
K
T
 
A
Y
 
F
A
 
A
E
 
A
R
 
H
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
Q
A
 
I
P
 
A
Y
 
E
G
 
G
A
 
S
S
 
N
A
 
G
L
 
L
F
 
V
V
 
P
A
 
V
G
 
G
G
 
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
F
 
S
F
x
P
S
 
T
L
 
L
T
 
S
H
 
H
D
 
D
D
 
E
Y
x
H
S
 
K
N
 
R
V
 
V
V
 
V
R
 
E
T
 
L
A
 
C
T
 
I
E
 
E
V
 
V
C
 
A
K
 
A
G
 
K
K
 
R
V
 
V
P
 
P
I
 
V
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
-
 
S
G
x
N
P
 
N
T
 
T
R
 
D
V
x
E
A
 
A
I
 
I
A
 
E
Y
 
L
A
 
A
K
 
L
E
 
H
A
 
A
E
 
Q
R
 
E
H
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
D
G
 
A
I
 
L
L
 
L
L
 
V
M
 
V
P
 
T
H
 
P
Y
|
Y
L
 
Y
T
 
N
E
 
K
A
 
P
C
 
T
Q
 
Q
E
 
K
G
 
G
I
 
L
A
 
F
A
 
A
H
 
H
A
 
F
E
 
S
E
 
A
V
 
V
C
 
A
K
 
E
S
 
A
V
 
V
P
 
-
N
 
K
M
 
L
G
 
P
V
 
I
I
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
-
 
I
-
 
P
-
 
P
R
 
R
A
 
S
N
 
V
S
 
V
K
 
D
L
 
M
N
 
S
A
 
P
D
 
E
M
 
T
L
 
M
E
 
G
G
 
A
L
 
L
A
 
V
E
 
K
R
 
A
C
 
H
P
 
K
N
 
N
L
 
I
I
 
I
G
 
G
F
 
V
K
|
K
D
 
D
G
 
A
V
 
T
G
 
G
E
 
K
I
 
L
E
 
D
N
 
R
M
 
V
V
 
S
T
 
E
I
 
Q
R
 
R
R
 
I
R
 
S
L
 
C
G
 
G
D
 
K
R
 
D
F
 
F
S
 
V
Y
 
Q
L
 
L
G
 
S
G
 
G
L
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
E
E
 
D
V
 
G
Y
 
T
A
 
A
A
 
L
A
 
G
Y
 
F
K
 
N
A
 
A
L
 
H
G
 
G
V
 
G
P
 
V
V
 
G
Y
 
C
S
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
T
F
 
A
N
 
N
F
 
V
I
 
A
P
 
P
K
 
R
T
 
L
A
 
C
M
 
S
D
 
E
F
 
F
Y
 
Q
R
 
A
A
 
A
I
 
M
A
 
L
A
 
A
D
 
G
D
 
D
H
 
Y
A
 
A
T
 
K
V
 
A
G
 
L
K
 
E
L
 
Y
I
 
Q
D
 
D
E
 
R
F
 
-
F
 
L
L
 
M
P
 
P
Y
 
L
L
 
H
K
 
R
I
 
A
R
 
I
N
 
F
R
 
M
R
 
E
A
 
P
G
 
G
-
 
V
-
 
C
-
 
G
-
 
T
-
 
K
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
S
 
S
I
 
K
V
 
T
K
 
R
A
 
G
G
 
G
A
 
N
K
 
R
L
 
R
V
 
-
G
 
-
H
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
V
R
 
R
A
 
S
P
 
P
L
 
L
T
 
M
D
 
S
L
 
T
T
 
L
E
 
E
E
 
P
E
 
A
M
 
T
-
 
E
A
 
A
Q
 
A
L
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
A
I
 
L
K
 
K
T
 
H
L
 
A
G
 
G

Q07607 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; Protein MosA; EC 4.3.3.7 from Rhizobium meliloti (Ensifer meliloti) (Sinorhizobium meliloti) (see paper)
29% identity, 95% coverage: 13:303/305 of query aligns to 3:289/292 of Q07607

query
sites
Q07607
Q
 
E
G
 
G
L
 
S
L
 
I
S
 
T
F
 
A
P
 
L
V
 
V
T
 
T
D
 
P
F
 
F
D
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
A
D
 
D
F
 
D
R
 
R
A
 
I
D
 
D
T
 
E
Y
 
V
A
 
A
-
 
L
-
 
H
E
 
D
R
 
L
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
Q
A
 
I
P
 
E
Y
 
E
G
 
G
A
 
S
S
 
F
A
 
G
L
 
L
F
 
V
V
 
P
A
 
C
G
 
G
G
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
S
F
 
P
S
 
T
L
 
L
T
 
S
H
 
K
D
 
S
D
 
E
Y
 
H
S
 
E
N
 
Q
V
 
V
V
 
V
R
 
E
T
 
I
A
 
T
T
 
I
E
 
K
V
 
T
C
 
A
K
 
N
G
 
G
K
 
R
V
 
V
P
 
P
I
 
V
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
-
 
S
G
 
N
P
 
S
T
 
T
R
 
A
V
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
Y
 
F
A
 
V
K
 
R
E
 
H
A
 
A
E
 
Q
R
 
N
H
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
D
G
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
M
 
V
P
 
S
H
 
P
Y
 
Y
L
 
Y
T
 
N
E
 
K
A
 
P
C
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
Y
A
 
Q
H
 
H
-
 
F
-
 
K
A
 
A
E
 
I
E
 
D
V
 
A
C
 
A
K
 
S
S
 
T
V
 
I
P
 
P
N
 
-
M
 
-
G
 
-
V
 
I
I
 
I
I
 
V
Y
 
Y
N
 
N
-
 
I
-
 
P
-
 
G
R
 
R
A
 
S
N
 
A
S
 
I
K
 
E
L
 
I
N
 
H
A
 
V
D
 
E
M
 
T
L
 
L
E
 
A
G
 
R
L
 
I
A
 
F
E
 
E
R
 
D
C
 
C
P
 
P
N
 
N
L
 
V
I
 
K
G
 
G
F
 
V
K
|
K
D
 
D
G
 
A
V
 
T
G
 
G
E
 
N
I
 
L
E
 
L
N
 
R
M
 
P
V
 
S
T
 
L
I
 
E
R
 
R
R
 
M
R
 
A
L
 
C
G
 
G
D
 
E
R
 
D
F
 
F
S
 
N
Y
 
L
L
 
L
G
 
T
G
 
G
L
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
E
E
 
D
V
 
G
Y
 
T
A
 
A
A
 
L
A
 
G
Y
 
Y
K
 
M
A
 
A
L
 
H
G
 
G
V
 
G
P
 
H
V
 
G
Y
 
C
S
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
T
F
 
A
N
 
N
F
 
V
I
 
A
P
 
P
K
 
A
T
 
L
A
 
C
M
 
A
D
 
D
F
 
F
Y
 
Q
R
 
Q
A
 
A
I
 
C
A
 
L
A
 
N
D
 
G
D
 
D
H
 
F
A
 
A
T
 
A
V
 
A
G
 
L
K
 
K
L
 
L
I
 
Q
D
 
D
E
 
R
F
 
-
F
 
L
L
 
M
P
 
P
-
 
L
-
 
H
-
 
R
-
 
A
-
 
L
Y
 
F
L
 
L
K
 
E
I
 
T
R
 
N
N
 
P
R
 
A
R
 
G
A
 
A
G
 
K
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
S
 
-
I
 
-
V
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
K
 
Q
L
 
R
V
 
L
G
 
G
H
 
R
S
 
M
A
 
R
G
 
G
P
 
D
V
 
L
R
 
R
A
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
V
D
 
T
L
 
I
T
 
S
E
 
P
E
 
S
E
 
F
M
 
Q
A
 
E
Q
 
E
L
 
I
D
 
D
A
 
D
L
 
A
I
 
M
K
 
R
T
 
H
L
 
A
G
 
G

4i7wA Agrobacterium tumefaciens dhdps with lysine and pyruvate
27% identity, 95% coverage: 13:303/305 of query aligns to 3:291/294 of 4i7wA

query
sites
4i7wA
Q
 
K
G
 
G
L
 
S
L
 
I
S
 
P
F
 
A
P
 
L
V
 
I
T
 
T
D
 
P
F
 
F
D
 
T
E
 
D
K
 
N
G
 
G
D
 
A
F
 
V
R
 
D
A
 
E
D
 
Q
T
 
A
Y
 
F
A
 
A
E
 
A
R
 
H
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
Q
A
 
I
P
 
A
Y
 
E
G
 
G
A
 
S
S
 
N
A
 
G
L
 
L
F
 
V
V
 
P
A
 
V
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
x
S
F
x
P
S
 
T
L
|
L
T
 
S
H
 
H
D
 
D
D
 
E
Y
x
H
S
 
K
N
 
R
V
 
V
V
 
V
R
 
E
T
 
L
A
 
C
T
 
I
E
 
E
V
 
V
C
 
A
K
 
A
G
 
K
K
 
R
V
 
V
P
 
P
I
 
V
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
-
 
S
G
x
N
P
 
N
T
 
T
R
 
D
V
x
E
A
 
A
I
 
I
A
 
E
Y
 
L
A
 
A
K
 
L
E
 
H
A
 
A
E
 
Q
R
 
D
H
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
D
G
 
A
I
 
L
L
 
L
L
 
V
M
 
V
P
 
T
H
 
P
Y
|
Y
L
x
Y
T
 
N
E
 
K
A
 
P
C
 
T
Q
 
Q
E
 
K
G
 
G
I
 
L
A
 
F
A
 
A
H
 
H
A
 
F
E
 
S
E
 
A
V
 
V
C
 
A
K
 
E
S
 
A
V
 
V
P
 
-
N
 
K
M
 
L
G
 
P
V
 
I
I
 
V
I
 
I
Y
|
Y
N
 
N
-
 
I
-
 
P
-
 
P
R
|
R
A
 
S
N
 
V
S
 
V
K
 
D
L
 
M
N
 
S
A
 
P
D
 
E
M
 
T
L
 
M
E
 
G
G
 
A
L
 
L
A
 
V
E
 
K
R
 
A
C
 
H
P
 
K
N
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
V
K
|
K
D
 
D
G
 
A
V
 
T
G
 
G
E
 
K
I
 
L
E
 
D
N
 
R
M
 
V
V
 
S
T
 
E
I
 
Q
R
 
R
R
 
I
R
 
S
L
 
C
G
 
G
D
 
K
R
 
D
F
 
F
S
 
I
Y
 
Q
L
 
L
G
 
S
G
 
G
L
 
E
P
 
D
T
 
S
A
 
T
E
 
A
V
 
L
Y
 
G
A
 
F
A
 
N
A
 
A
Y
 
H
K
 
G
A
 
G
L
 
V
G
 
G
V
 
C
P
x
I
V
 
S
Y
 
V
S
 
S
S
 
A
A
 
-
V
 
-
F
 
-
N
 
N
F
 
V
I
 
A
P
 
P
K
 
R
T
 
L
A
 
C
M
 
S
D
 
E
F
 
F
Y
 
Q
R
 
A
A
 
A
I
 
M
A
 
L
A
 
A
D
 
G
D
 
D
H
 
Y
A
 
A
T
 
K
V
 
A
G
 
L
K
 
E
L
 
Y
I
 
Q
D
 
D
E
 
R
F
 
-
F
 
L
L
 
M
P
 
P
Y
 
L
L
 
H
K
 
R
I
 
A
R
 
I
N
 
F
R
 
M
R
 
E
A
 
P
G
 
G
-
 
V
-
 
C
-
 
G
-
 
T
-
 
K
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
S
 
S
I
 
K
V
 
T
K
 
R
A
 
G
G
 
C
A
 
N
K
 
R
L
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
K
V
 
V
R
 
R
A
 
S
P
 
P
L
 
L
T
 
M
D
 
S
L
 
T
T
 
L
E
 
E
E
 
P
E
 
A
M
 
T
-
 
E
A
 
A
Q
 
A
L
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
A
I
 
L
K
 
K
T
 
H
L
 
A
G
 
G

5ktlA Dihydrodipicolinate synthase from the industrial and evolutionarily important cyanobacteria anabaena variabilis. (see paper)
27% identity, 94% coverage: 15:302/305 of query aligns to 8:292/295 of 5ktlA

query
sites
5ktlA
L
 
V
L
 
L
S
 
T
F
 
A
P
 
M
V
 
I
T
 
T
D
 
P
F
 
F
D
 
K
E
 
A
K
 
D
G
 
G
D
 
S
F
 
V
R
 
N
A
 
Y
D
 
A
T
 
V
Y
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
L
L
 
A
E
 
A
W
 
H
L
 
L
A
 
V
P
 
D
Y
 
N
G
 
G
A
 
T
S
 
D
A
 
T
L
 
L
F
 
V
V
 
V
A
 
C
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
x
S
F
 
P
S
 
T
L
|
L
T
 
S
H
 
W
D
 
D
D
 
E
Y
x
E
S
 
Y
N
 
N
V
 
L
V
 
F
R
 
V
T
x
E
A
 
V
T
 
L
E
x
Q
V
 
T
C
 
V
K
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
A
P
 
K
I
 
V
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
C
G
 
G
-
 
S
G
 
N
P
 
S
T
 
T
R
 
K
V
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
Y
 
A
A
 
T
K
 
Q
E
 
K
A
 
A
E
 
A
R
 
K
H
 
I
G
 
G
A
 
V
N
 
H
G
 
G
I
 
T
L
 
L
L
 
Q
M
 
V
P
 
V
H
 
P
Y
 
Y
L
x
Y
T
 
N
E
 
K
A
 
P
C
 
P
Q
 
Q
E
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
A
 
Q
H
 
H
A
 
F
E
 
Q
E
 
A
V
 
I
C
 
A
K
 
Q
S
 
A
V
 
C
P
 
P
N
 
D
M
 
L
G
 
P
V
 
L
I
 
L
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
G
R
|
R
A
 
T
N
 
G
S
 
Q
K
 
N
L
 
L
N
 
S
A
 
P
D
 
E
M
 
T
L
 
V
E
 
V
G
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
-
C
 
I
P
 
D
N
 
N
L
 
I
I
 
I
G
 
G
F
 
V
K
|
K
D
 
E
G
 
A
V
 
S
G
 
G
E
 
N
I
 
L
E
 
D
N
 
Q
M
 
A
V
 
G
T
 
E
I
 
I
R
 
R
R
 
R
R
 
S
L
 
T
G
 
P
D
 
K
R
 
E
F
 
F
S
 
Q
Y
 
I
L
 
Y
G
 
A
G
 
G
L
 
D
P
 
D
T
 
S
A
 
L
E
 
T
V
 
L
Y
 
P
A
 
L
A
 
L
A
 
A
Y
 
I
K
 
G
A
 
A
L
 
K
G
 
G
-
 
V
V
|
V
P
 
S
V
 
V
Y
 
A
S
 
S
S
 
H
A
 
L
V
 
V
F
 
G
N
 
N
F
 
Q
I
 
L
P
 
Q
K
 
Q
T
 
M
A
 
I
M
 
Q
D
 
A
F
 
F
Y
 
N
R
 
S
-
 
G
-
 
Q
-
 
V
A
 
T
I
 
V
A
 
A
A
 
S
D
 
D
D
 
I
H
 
H
A
 
L
T
 
R
V
 
L
G
 
L
K
 
P
L
 
L
I
 
F
D
 
K
E
 
A
F
 
L
F
 
F
L
 
I
P
 
T
Y
 
T
L
 
N
K
 
P
I
 
I
R
 
P
N
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
Y
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
I
 
-
V
 
I
K
 
K
A
 
Q
G
 
A
A
 
L
K
 
K
L
 
L
V
 
Q
G
 
G
H
 
W
S
 
E
A
 
V
G
 
G
P
 
S
V
 
T
R
 
R
A
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
S
D
 
D
L
 
A
T
 
D
E
 
A
E
 
E
E
 
V
M
 
S
A
 
Q
Q
 
K
L
 
L
D
 
E
A
 
A
L
 
V
I
 
M
K
 
K
T
 
H
L
 
L

4m19A Dihydrodipicolinate synthase from c. Jejuni with pyruvate bound to the active site and lysine bound to allosteric site (see paper)
33% identity, 55% coverage: 14:181/305 of query aligns to 6:176/296 of 4m19A

query
sites
4m19A
G
 
G
L
 
A
L
 
M
S
 
T
F
 
A
P
 
L
V
 
I
T
 
T
D
 
P
F
 
F
D
 
-
E
 
K
K
 
N
G
 
G
D
 
K
F
 
V
R
 
D
A
 
E
D
 
Q
T
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
R
R
 
L
L
 
I
E
 
K
W
 
R
L
 
Q
A
 
I
P
 
E
Y
 
N
G
 
G
A
 
I
S
 
D
A
 
A
L
 
V
F
 
V
V
 
P
A
 
V
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
x
S
F
x
A
S
 
T
L
|
L
T
 
T
H
|
H
D
 
E
D
 
E
Y
x
H
S
 
R
N
 
T
V
 
C
V
 
I
R
 
E
T
 
I
A
 
A
T
 
V
E
 
E
V
 
T
C
 
C
K
 
K
G
 
G
-
 
T
K
 
K
V
 
V
P
 
K
I
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
-
 
S
G
x
N
P
 
A
T
 
T
R
 
H
V
x
E
A
 
A
I
 
V
A
 
G
Y
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
F
A
 
A
E
 
K
R
 
E
H
 
H
G
 
G
A
 
A
N
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
S
M
 
V
P
 
A
H
 
P
Y
|
Y
L
x
Y
T
 
N
E
 
K
A
 
P
C
 
T
Q
 
Q
E
 
Q
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
A
 
E
H
 
H
A
 
Y
E
 
K
E
 
A
V
 
I
C
 
A
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
P
 
-
N
 
D
M
 
I
G
 
P
V
 
V
I
 
L
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
G
R
|
R
A
 
T
N
 
G
S
 
C
K
 
E
L
 
I
N
 
S
A
 
T
D
 
D
M
 
T
L
 
I
E
 
I
G
 
K
L
 
L
A
 
F
E
 
R
R
 
D
C
 
C
P
 
E
N
 
N
L
 
I
I
 
Y
G
 
G
F
 
V
K
|
K
D
 
E
G
 
A
V
 
S
G
 
G
E
 
N
I
 
I
E
 
D
N
 
K
M
 
C
V
 
V
T
 
D
I
 
L

Sites not aligning to the query:

6u01B Dihydrodipicolinate synthase (dhdps) from c.Jejuni, n84d mutant with pyruvate bound in the active site (see paper)
33% identity, 55% coverage: 14:181/305 of query aligns to 6:176/296 of 6u01B

query
sites
6u01B
G
 
G
L
 
A
L
 
M
S
 
T
F
 
A
P
 
L
V
 
I
T
 
T
D
 
P
F
 
F
D
 
-
E
 
K
K
 
N
G
 
G
D
 
K
F
 
V
R
 
D
A
 
E
D
 
Q
T
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
R
R
 
L
L
 
I
E
 
K
W
 
R
L
 
Q
A
 
I
P
 
E
Y
 
N
G
 
G
A
 
I
S
 
D
A
 
A
L
 
V
F
 
V
V
 
P
A
 
V
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
S
F
 
A
S
 
T
L
 
L
T
 
T
H
 
H
D
 
E
D
 
E
Y
 
H
S
 
R
N
 
T
V
 
C
V
 
I
R
 
E
T
 
I
A
 
A
T
 
V
E
 
E
V
 
T
C
 
C
K
 
K
G
 
G
-
 
T
K
 
K
V
 
V
P
 
K
I
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
S
-
 
D
P
 
A
T
 
T
R
 
H
V
 
E
A
 
A
I
 
V
A
 
G
Y
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
F
A
 
A
E
 
K
R
 
E
H
 
H
G
 
G
A
 
A
N
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
S
M
 
V
P
 
A
H
 
P
Y
 
Y
L
x
Y
T
 
N
E
 
K
A
 
P
C
 
T
Q
 
Q
E
 
Q
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
A
 
E
H
 
H
A
 
Y
E
 
K
E
 
A
V
 
I
C
 
A
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
P
 
-
N
 
D
M
 
I
G
 
P
V
 
V
I
 
L
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
G
R
|
R
A
 
T
N
 
G
S
 
C
K
 
E
L
 
I
N
 
S
A
 
T
D
 
D
M
 
T
L
 
I
E
 
I
G
 
K
L
 
L
A
 
F
E
 
R
R
 
D
C
 
C
P
 
E
N
 
N
L
 
I
I
 
Y
G
 
G
F
 
V
K
|
K
D
 
E
G
 
A
V
 
S
G
 
G
E
 
N
I
 
I
E
 
D
N
 
K
M
 
C
V
 
V
T
 
D
I
 
L

Sites not aligning to the query:

7kkdB Dihydrodipicolinate synthase (dhdps) from c.Jejuni, n84a mutant with pyruvate bound in the active site and r,r-bislysine bound at the allosteric site
33% identity, 55% coverage: 14:181/305 of query aligns to 16:186/306 of 7kkdB

query
sites
7kkdB
G
 
G
L
 
A
L
 
M
S
 
T
F
 
A
P
 
L
V
 
I
T
 
T
D
 
P
F
 
F
D
 
-
E
 
K
K
 
N
G
 
G
D
 
K
F
 
V
R
 
D
A
 
E
D
 
Q
T
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
R
R
 
L
L
 
I
E
 
K
W
 
R
L
 
Q
A
 
I
P
 
E
Y
 
N
G
 
G
A
 
I
S
 
D
A
 
A
L
 
V
F
 
V
V
 
P
A
 
V
G
 
G
G
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
x
S
F
 
A
S
 
T
L
|
L
T
 
T
H
 
H
D
 
E
D
 
E
Y
x
H
S
 
R
N
 
T
V
 
C
V
 
I
R
 
E
T
 
I
A
 
A
T
 
V
E
 
E
V
 
T
C
 
C
K
 
K
G
 
G
-
 
T
K
 
K
V
 
V
P
 
K
I
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
S
P
 
A
-
 
A
T
 
T
R
 
H
V
x
E
A
 
A
I
 
V
A
 
G
Y
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
F
A
 
A
E
 
K
R
 
E
H
 
H
G
 
G
A
 
A
N
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
S
M
 
V
P
 
A
H
 
P
Y
|
Y
L
 
Y
T
 
N
E
 
K
A
 
P
C
 
T
Q
 
Q
E
 
Q
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
A
 
E
H
 
H
A
 
Y
E
 
K
E
 
A
V
 
I
C
 
A
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
P
 
-
N
 
D
M
 
I
G
 
P
V
 
V
I
 
L
I
 
L
Y
 
Y
N
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
G
R
 
R
A
 
T
N
 
G
S
 
C
K
 
E
L
 
I
N
 
S
A
 
T
D
 
D
M
 
T
L
 
I
E
 
I
G
 
K
L
 
L
A
 
F
E
 
R
R
 
D
C
 
C
P
 
E
N
 
N
L
 
I
I
 
Y
G
 
G
F
 
V
K
 
K
D
 
E
G
 
A
V
 
S
G
 
G
E
 
N
I
 
I
E
 
D
N
 
K
M
 
C
V
 
V
T
 
D
I
 
L

5ud6C Crystal structure of dhdps from cyanidioschyzon merolae with lysine bound
29% identity, 84% coverage: 41:295/305 of query aligns to 34:288/299 of 5ud6C

query
sites
5ud6C
L
 
L
A
 
A
P
 
E
Y
 
N
G
 
G
A
 
S
S
 
D
A
 
A
L
 
I
F
 
I
V
 
V
A
|
A
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
x
S
F
x
A
S
 
T
L
 
L
T
 
T
H
x
W
D
 
S
D
 
E
Y
x
E
S
 
Y
N
 
E
V
 
L
V
 
F
R
 
R
T
 
V
A
 
V
T
 
K
E
 
S
V
 
A
C
 
V
K
 
A
G
 
G
-
 
T
K
 
K
V
 
C
P
 
R
I
 
V
L
 
I
A
 
A
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
S
-
x
N
P
 
S
T
 
T
R
 
E
V
x
E
A
 
A
I
 
I
A
 
E
Y
 
A
A
 
T
K
 
K
E
 
K
A
 
S
E
 
A
R
 
K
H
 
L
G
 
G
A
 
L
N
 
D
G
 
G
I
 
T
L
 
L
L
 
Q
M
 
V
P
 
V
H
 
P
Y
|
Y
L
x
Y
T
 
N
E
 
K
A
 
P
C
 
P
Q
 
Q
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
A
 
M
A
 
A
H
 
H
A
 
F
E
 
R
E
 
A
V
 
I
C
 
A
K
 
N
S
 
A
V
 
A
P
 
P
N
 
D
M
 
L
G
 
P
V
 
M
I
 
M
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
-
 
I
-
 
P
-
 
G
R
|
R
A
 
T
N
 
G
S
 
I
K
 
N
L
 
M
N
 
T
A
 
A
D
 
E
M
 
T
L
 
S
E
 
I
G
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
M
C
 
C
P
 
P
N
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
A
F
 
L
K
|
K
D
 
E
G
 
A
V
 
S
G
 
G
E
 
N
I
 
L
E
 
E
N
 
Q
M
 
F
V
 
A
T
 
R
I
 
I
R
 
R
R
 
R
R
 
A
L
 
T
G
 
S
D
 
P
R
 
D
F
 
F
S
 
A
Y
 
L
L
 
Y
G
 
S
G
 
G
L
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
D
K
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
T
V
 
L
P
 
P
V
 
L
Y
 
L
S
 
S
S
 
L
A
 
G
V
 
-
F
 
G
N
 
N
F
 
G
I
 
V
P
x
V
K
 
S
T
 
V
A
 
A
M
 
S
D
 
H
F
 
F
Y
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
I
A
 
G
A
 
P
D
 
E
D
 
I
H
 
Q
A
 
R
T
 
M
V
 
I
G
 
E
K
 
H
L
 
F
I
 
V
D
 
D
-
 
L
-
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
E
E
 
E
F
 
A
F
 
F
L
 
R
P
 
I
Y
 
H
L
 
C
K
 
R
I
 
Y
R
 
M
N
 
D
R
 
L
R
 
F
A
 
E
G
 
A
Y
 
L
A
 
F
V
 
V
S
 
M
I
 
A
-
 
N
-
 
P
-
 
I
-
 
P
V
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
A
A
 
L
K
 
R
L
 
L
V
 
L
G
 
G
H
 
W
S
 
P
A
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
T
R
 
R
A
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
D
 
D
L
 
I
T
 
T
E
 
A
E
 
S
E
 
A
M
 
E
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L

7kg2A Dihydrodipicolinate synthase (dhdps) from c.Jejuni, h59k mutant with pyruvate bound in the active site and l-histidine bound at the allosteric site
33% identity, 55% coverage: 14:181/305 of query aligns to 6:176/296 of 7kg2A

query
sites
7kg2A
G
 
G
L
 
A
L
 
M
S
 
T
F
 
A
P
 
L
V
 
I
T
 
T
D
 
P
F
 
F
D
 
-
E
 
K
K
 
N
G
 
G
D
 
K
F
 
V
R
 
D
A
 
E
D
 
Q
T
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
R
R
 
L
L
 
I
E
 
K
W
 
R
L
 
Q
A
 
I
P
 
E
Y
 
N
G
 
G
A
 
I
S
 
D
A
 
A
L
 
V
F
 
V
V
 
P
A
 
V
G
 
G
G
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
x
S
F
x
A
S
 
T
L
|
L
T
 
T
H
 
H
D
 
E
D
 
E
Y
x
K
S
 
R
N
 
T
V
 
C
V
 
I
R
 
E
T
 
I
A
 
A
T
 
V
E
 
E
V
 
T
C
 
C
K
 
K
G
 
G
-
 
T
K
 
K
V
 
V
P
 
K
I
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
-
 
S
G
x
N
P
 
A
T
 
T
R
 
H
V
x
E
A
 
A
I
 
V
A
 
G
Y
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
F
A
 
A
E
 
K
R
 
E
H
 
H
G
 
G
A
 
A
N
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
S
M
 
V
P
 
A
H
 
P
Y
|
Y
L
 
Y
T
 
N
E
 
K
A
 
P
C
 
T
Q
 
Q
E
 
Q
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
A
 
E
H
 
H
A
 
Y
E
 
K
E
 
A
V
 
I
C
 
A
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
P
 
-
N
 
D
M
 
I
G
 
P
V
 
V
I
 
L
I
 
L
Y
 
Y
N
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
G
R
 
R
A
 
T
N
 
G
S
 
C
K
 
E
L
 
I
N
 
S
A
 
T
D
 
D
M
 
T
L
 
I
E
 
I
G
 
K
L
 
L
A
 
F
E
 
R
R
 
D
C
 
C
P
 
E
N
 
N
L
 
I
I
 
Y
G
 
G
F
 
V
K
 
K
D
 
E
G
 
A
V
 
S
G
 
G
E
 
N
I
 
I
E
 
D
N
 
K
M
 
C
V
 
V
T
 
D
I
 
L

5t25A Kinetic, spectral and structural characterization of the slow binding inhibitor acetopyruvate with dihydrodipicolinate synthase from escherichia coli.
26% identity, 93% coverage: 20:303/305 of query aligns to 11:291/293 of 5t25A

query
sites
5t25A
V
 
V
T
 
T
D
 
P
F
 
M
D
 
D
E
 
E
K
 
K
G
 
G
D
 
N
F
 
V
R
 
C
A
 
R
D
 
A
T
 
S
Y
 
L
A
 
K
E
 
K
R
 
L
L
 
I
E
 
D
W
 
Y
L
 
H
A
 
V
P
 
A
Y
 
S
G
 
G
A
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
I
F
 
V
V
 
S
A
 
V
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
S
F
x
A
S
 
T
L
|
L
T
 
N
H
|
H
D
 
D
D
 
E
Y
 
H
S
 
A
N
 
D
V
 
V
V
 
V
R
 
M
T
 
M
A
 
T
T
 
L
E
 
D
V
 
L
C
 
A
K
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
I
P
 
P
I
 
V
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
-
 
A
G
x
N
P
 
A
T
 
T
R
 
A
V
x
E
A
 
A
I
 
I
A
 
S
Y
 
L
A
 
T
K
 
Q
E
 
R
A
 
F
E
 
N
R
 
D
H
 
S
G
 
G
A
 
I
N
 
V
G
 
G
I
 
C
L
 
L
L
 
T
M
 
V
P
 
T
H
 
P
Y
|
Y
L
x
Y
T
 
N
E
 
R
A
 
P
C
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
A
 
Q
H
 
H
A
 
F
E
 
K
E
 
A
V
 
I
C
 
A
K
 
E
S
 
H
V
 
T
P
 
-
N
 
D
M
 
L
G
 
P
V
 
Q
I
 
I
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
R
 
-
A
 
V
N
 
P
S
 
S
K
x
R
L
 
T
N
 
G
A
 
C
D
 
D
M
 
L
L
 
L
E
 
P
-
 
E
-
 
T
-
 
V
G
 
G
L
 
R
A
 
L
E
 
A
R
 
K
C
 
V
P
 
K
N
 
N
L
 
I
I
 
I
G
 
G
F
 
I
K
|
K
D
 
E
G
 
A
V
 
T
G
 
G
E
 
N
I
 
L
E
 
T
N
 
R
M
 
V
V
 
N
T
 
Q
I
 
I
R
 
K
R
 
E
R
 
L
L
 
V
G
 
S
D
 
D
R
 
D
F
 
F
S
 
V
Y
 
L
L
 
L
G
 
S
G
 
G
L
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
D
E
 
D
V
 
A
Y
 
S
A
 
A
A
 
L
A
 
D
Y
 
F
K
 
M
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
V
 
G
P
 
H
V
 
G
Y
 
V
S
x
I
S
 
S
A
 
V
V
 
T
F
 
A
N
 
N
F
 
V
I
 
A
P
 
A
K
 
R
T
 
D
A
 
M
M
 
A
D
 
Q
F
 
M
Y
 
C
R
 
K
A
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
E
D
 
G
H
 
H
A
 
F
T
 
A
V
 
E
G
 
A
K
 
R
L
 
V
I
 
I
D
 
N
E
 
Q
F
 
R
F
 
L
L
 
M
P
 
P
Y
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
L
R
 
H
N
 
N
R
 
K
R
 
L
A
 
F
G
 
V
Y
 
E
A
 
P
V
 
N
S
 
P
I
 
I
-
 
P
V
 
V
K
 
K
A
 
W
G
 
A
A
 
C
K
 
K
L
 
E
V
 
L
G
 
G
H
 
L
S
 
V
A
 
A
-
 
T
G
 
D
P
 
T
V
 
L
R
 
R
A
 
L
P
 
P
L
 
M
T
 
T
D
 
P
L
 
I
T
 
T
E
 
D
E
 
S
E
 
G
M
 
R
A
 
E
Q
 
T
L
 
V
D
 
R
A
 
A
L
 
A
I
 
L
K
 
K
T
 
H
L
 
A
G
 
G

2atsA Dihydrodipicolinate synthase co-crystallised with (s)-lysine
26% identity, 93% coverage: 20:303/305 of query aligns to 10:290/292 of 2atsA

query
sites
2atsA
V
 
V
T
 
T
D
 
P
F
 
M
D
 
D
E
 
E
K
 
K
G
 
G
D
 
N
F
 
V
R
 
C
A
 
R
D
 
A
T
 
S
Y
 
L
A
 
K
E
 
K
R
 
L
L
 
I
E
 
D
W
 
Y
L
 
H
A
 
V
P
 
A
Y
 
S
G
 
G
A
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
I
F
 
V
V
 
S
A
 
V
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
S
F
x
A
S
 
T
L
|
L
T
 
N
H
|
H
D
 
D
D
 
E
Y
x
H
S
 
A
N
 
D
V
 
V
V
 
V
R
 
M
T
 
M
A
 
T
T
 
L
E
 
D
V
 
L
C
 
A
K
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
I
P
 
P
I
 
V
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
-
 
A
G
x
N
P
 
A
T
 
T
R
 
A
V
x
E
A
 
A
I
 
I
A
 
S
Y
 
L
A
 
T
K
 
Q
E
 
R
A
 
F
E
 
N
R
 
D
H
 
S
G
 
G
A
 
I
N
 
V
G
 
G
I
 
C
L
 
L
L
 
T
M
 
V
P
 
T
H
 
P
Y
|
Y
L
x
Y
T
 
N
E
 
R
A
 
P
C
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
A
 
Q
H
 
H
A
 
F
E
 
K
E
 
A
V
 
I
C
 
A
K
 
E
S
 
H
V
 
T
P
 
-
N
 
D
M
 
L
G
 
P
V
 
Q
I
 
I
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
R
 
-
A
 
V
N
 
P
S
 
S
K
x
R
L
 
T
N
 
G
A
 
C
D
 
D
M
 
L
L
 
L
E
 
P
-
 
E
-
 
T
-
 
V
G
 
G
L
 
R
A
 
L
E
 
A
R
 
K
C
 
V
P
 
K
N
 
N
L
 
I
I
 
I
G
 
G
F
 
I
K
|
K
D
 
E
G
 
A
V
 
T
G
 
G
E
 
N
I
 
L
E
 
T
N
 
R
M
 
V
V
 
N
T
 
Q
I
 
I
R
 
K
R
 
E
R
 
L
L
 
V
G
 
S
D
 
D
R
 
D
F
 
F
S
 
V
Y
 
L
L
 
L
G
 
S
G
 
G
L
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
D
E
 
D
V
 
A
Y
 
S
A
 
A
A
 
L
A
 
D
Y
 
F
K
 
M
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
V
 
G
P
 
H
V
 
G
Y
 
V
S
x
I
S
 
S
A
 
V
V
 
T
F
 
A
N
 
N
F
 
V
I
 
A
P
 
A
K
 
R
T
 
D
A
 
M
M
 
A
D
 
Q
F
 
M
Y
 
C
R
 
K
A
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
E
D
 
G
H
 
H
A
 
F
T
 
A
V
 
E
G
 
A
K
 
R
L
 
V
I
 
I
D
 
N
E
 
Q
F
 
R
F
 
L
L
 
M
P
 
P
Y
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
L
R
 
H
N
 
N
R
 
K
R
 
L
A
 
F
G
 
V
Y
 
E
A
 
P
V
 
N
S
 
P
I
 
I
-
 
P
V
 
V
K
 
K
A
 
W
G
 
A
A
 
C
K
 
K
L
 
E
V
 
L
G
 
G
H
 
L
S
 
V
A
 
A
-
 
T
G
 
D
P
 
T
V
 
L
R
 
R
A
 
L
P
 
P
L
 
M
T
 
T
D
 
P
L
 
I
T
 
T
E
 
D
E
 
S
E
 
G
M
 
R
A
 
E
Q
 
T
L
 
V
D
 
R
A
 
A
L
 
A
I
 
L
K
 
K
T
 
H
L
 
A
G
 
G

P0A6L2 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Escherichia coli (strain K12) (see 7 papers)
26% identity, 93% coverage: 20:303/305 of query aligns to 10:290/292 of P0A6L2

query
sites
P0A6L2
V
 
V
T
 
T
D
 
P
F
 
M
D
 
D
E
 
E
K
 
K
G
 
G
D
 
N
F
 
V
R
 
C
A
 
R
D
 
A
T
 
S
Y
 
L
A
 
K
E
 
K
R
 
L
L
 
I
E
 
D
W
 
Y
L
 
H
A
 
V
P
 
A
Y
 
S
G
 
G
A
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
I
F
 
V
V
 
S
A
 
V
G
 
G
G
x
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
F
 
S
F
 
A
S
 
T
L
 
L
T
 
N
H
 
H
D
 
D
D
 
E
Y
 
H
S
 
A
N
 
D
V
 
V
V
 
V
R
 
M
T
 
M
A
 
T
T
 
L
E
 
D
V
 
L
C
 
A
K
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
I
P
 
P
I
 
V
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
-
 
A
G
 
N
P
 
A
T
 
T
R
 
A
V
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
S
Y
 
L
A
 
T
K
 
Q
E
 
R
A
 
F
E
 
N
R
 
D
H
 
S
G
 
G
A
 
I
N
 
V
G
 
G
I
 
C
L
 
L
L
 
T
M
 
V
P
 
T
H
 
P
Y
 
Y
L
x
Y
T
 
N
E
 
R
A
 
P
C
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
A
 
Q
H
 
H
A
 
F
E
 
K
E
 
A
V
 
I
C
 
A
K
 
E
S
 
H
V
 
T
P
 
-
N
 
D
M
 
L
G
 
P
V
 
Q
I
 
I
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
R
 
-
A
 
V
N
 
P
S
 
S
K
x
R
L
 
T
N
 
G
A
 
C
D
 
D
M
 
L
L
 
L
E
 
P
-
 
E
-
 
T
-
 
V
G
 
G
L
 
R
A
 
L
E
 
A
R
 
K
C
 
V
P
 
K
N
 
N
L
 
I
I
 
I
G
 
G
F
 
I
K
|
K
D
 
E
G
 
A
V
 
T
G
 
G
E
 
N
I
 
L
E
 
T
N
 
R
M
 
V
V
 
N
T
 
Q
I
 
I
R
 
K
R
 
E
R
 
L
L
 
V
G
 
S
D
 
D
R
 
D
F
 
F
S
 
V
Y
 
L
L
 
L
G
 
S
G
 
G
L
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
D
E
 
D
V
 
A
Y
 
S
A
 
A
A
 
L
A
 
D
Y
 
F
K
 
M
A
 
Q
L
|
L
G
 
G
V
 
G
P
 
H
V
 
G
Y
 
V
S
x
I
S
 
S
A
 
V
V
 
T
F
 
A
N
 
N
F
 
V
I
 
A
P
 
A
K
 
R
T
 
D
A
 
M
M
 
A
D
 
Q
F
 
M
Y
 
C
R
 
K
A
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
E
D
 
G
H
 
H
A
 
F
T
 
A
V
 
E
G
 
A
K
 
R
L
 
V
I
 
I
D
 
N
E
 
Q
F
 
R
F
 
L
L
 
M
P
 
P
Y
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
L
R
 
H
N
 
N
R
 
K
R
 
L
A
 
F
G
 
V
Y
 
E
A
 
P
V
 
N
S
 
P
I
 
I
-
 
P
V
 
V
K
 
K
A
 
W
G
 
A
A
 
C
K
 
K
L
 
E
V
 
L
G
 
G
H
 
L
S
 
V
A
 
A
-
 
T
G
 
D
P
 
T
V
 
L
R
 
R
A
 
L
P
 
P
L
 
M
T
 
T
D
 
P
L
 
I
T
 
T
E
 
D
E
 
S
E
 
G
M
 
R
A
 
E
Q
 
T
L
 
V
D
 
R
A
 
A
L
 
A
I
 
L
K
 
K
T
 
H
L
 
A
G
 
G

1o5kA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase (tm1521) from thermotoga maritima at 1.80 a resolution
24% identity, 93% coverage: 20:303/305 of query aligns to 11:293/295 of 1o5kA

query
sites
1o5kA
V
 
V
T
 
T
D
 
P
F
 
F
D
 
-
E
 
K
K
 
N
G
 
G
D
 
E
F
 
L
R
 
D
A
 
L
D
 
E
T
 
S
Y
 
Y
A
 
E
E
 
R
R
 
L
L
 
V
E
 
R
W
 
Y
L
 
Q
A
 
L
P
 
E
Y
 
N
G
 
G
A
 
V
S
 
N
A
 
A
L
 
L
F
 
I
V
 
V
A
 
L
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
S
F
 
P
S
 
T
L
 
V
T
 
N
H
 
E
D
 
D
D
 
E
Y
 
R
S
 
E
N
 
K
V
 
L
V
 
V
R
 
S
T
 
R
A
 
T
T
 
L
E
|
E
V
 
I
C
 
V
K
x
D
G
 
G
K
 
K
V
 
I
P
 
P
I
 
V
L
 
I
A
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
-
 
T
G
 
N
P
 
S
T
 
T
R
 
E
V
 
K
A
 
T
I
 
L
A
 
K
Y
 
L
A
 
V
K
 
K
E
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
K
H
 
L
G
 
G
A
 
A
N
 
N
G
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
V
M
 
V
P
 
T
H
 
P
Y
 
Y
L
x
Y
T
 
N
E
 
K
A
 
P
C
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
A
 
Q
H
 
H
A
 
Y
E
 
K
E
 
Y
V
 
I
C
 
S
K
 
E
S
 
R
V
 
T
P
 
-
N
 
D
M
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
V
I
 
V
Y
|
Y
N
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
G
R
|
R
A
 
T
N
 
G
S
 
V
K
 
N
L
 
V
N
 
L
A
 
P
D
 
E
M
 
T
L
 
A
E
 
A
G
 
R
L
 
I
A
 
A
E
 
A
R
 
D
C
 
L
P
 
K
N
 
N
L
 
V
I
 
V
G
 
G
F
 
I
K
|
K
D
 
E
G
 
A
-
 
N
-
 
P
-
 
D
V
 
I
G
 
D
E
 
Q
I
 
I
E
 
D
N
 
R
M
 
T
V
 
V
T
 
S
I
 
L
R
 
T
R
 
K
R
 
Q
L
 
A
G
 
R
D
 
S
R
 
D
F
 
F
S
 
M
Y
 
V
L
 
W
G
 
S
G
 
G
L
 
N
P
 
D
T
 
D
A
 
R
E
 
T
V
 
F
Y
 
Y
A
 
L
A
 
L
A
 
C
Y
 
A
K
 
G
A
 
G
L
 
D
G
 
G
V
 
V
P
 
-
V
 
-
Y
 
-
S
x
I
S
 
S
A
 
V
V
 
V
F
 
S
N
 
N
F
 
V
I
 
A
P
 
P
K
 
K
T
 
Q
A
 
M
M
 
V
D
 
E
F
 
L
Y
 
C
R
 
A
A
 
E
I
 
Y
A
 
F
A
 
S
D
 
G
D
 
N
-
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
S
-
 
R
-
 
E
-
 
V
H
 
H
A
 
R
T
 
K
V
 
L
G
 
R
K
 
P
L
 
L
I
 
M
D
 
K
E
 
A
F
 
L
F
 
F
L
 
V
P
 
E
Y
 
T
L
 
N
K
 
P
I
 
I
R
 
P
N
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
Y
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
I
 
-
V
 
V
K
 
K
A
 
A
G
 
A
A
 
L
K
 
N
L
 
L
V
 
M
G
 
G
H
 
F
S
 
I
A
 
E
G
 
N
P
 
E
V
 
L
R
 
R
A
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
V
D
 
P
L
 
A
T
 
S
E
 
E
E
 
K
E
 
T
M
 
V
A
 
E
Q
 
L
L
 
L
D
 
R