SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_05383 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_05383 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3bazA Structure of hydroxyphenylpyruvate reductase from coleus blumei in complex with NADP+ (see paper)
38% identity, 92% coverage: 27:310/310 of query aligns to 27:310/311 of 3bazA

query
sites
3bazA
Y
 
Y
A
 
W
P
 
T
D
 
Q
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
H
 
R
A
 
D
A
 
-
V
 
F
I
 
L
A
 
A
T
 
L
H
 
Q
G
 
A
A
 
E
M
 
S
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
V
T
 
G
N
 
N
G
 
S
T
 
N
R
 
A
G
 
G
I
 
A
S
 
D
A
 
A
A
 
E
E
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
A
M
 
L
P
 
P
K
 
K
L
 
L
E
 
E
F
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
S
L
 
F
G
 
S
A
x
V
G
 
G
Y
 
L
E
 
D
N
 
K
V
 
V
A
 
D
V
 
L
D
 
I
H
 
K
A
 
C
R
 
E
S
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
V
 
R
L
 
V
V
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
T
 
V
N
x
L
D
 
T
H
 
D
C
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
H
 
L
A
 
A
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
I
L
 
L
S
 
A
I
 
V
V
 
L
R
 
R
D
 
R
V
 
I
P
 
C
R
 
E
L
 
C
D
 
D
E
 
K
A
 
Y
T
 
V
R
 
R
E
 
R
G
 
G
V
 
A
W
 
W
R
 
K
D
 
F
A
 
G
-
 
D
L
 
F
P
 
K
M
 
L
R
 
T
P
 
T
D
 
K
V
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
K
R
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
L
|
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
E
 
L
K
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
E
R
 
R
G
 
A
A
 
E
G
 
A
F
 
F
D
 
D
M
 
C
E
 
P
I
 
I
G
 
S
Y
 
Y
H
 
F
N
x
S
R
|
R
K
x
S
P
 
K
R
 
K
E
 
P
G
 
N
T
 
T
S
 
N
L
 
Y
S
 
T
Y
 
Y
F
 
Y
D
 
G
G
 
S
V
 
V
E
 
V
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
W
 
N
C
 
S
D
 
D
F
 
I
L
 
L
V
 
V
I
 
V
A
 
A
T
x
C
P
|
P
G
 
L
G
 
T
A
 
P
G
 
E
T
|
T
H
 
T
H
 
H
L
 
I
I
 
I
G
 
N
A
 
R
R
 
E
V
 
V
F
 
I
E
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
F
 
V
V
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
S
x
G
R
|
R
G
 
G
S
 
P
V
 
H
L
 
V
D
 
D
T
 
E
A
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
V
Q
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
E
G
 
G
T
 
R
I
 
L
A
 
G
G
 
G
A
|
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
G
 
R
E
|
E
P
 
P
Q
 
E
P
 
V
P
 
P
A
 
E
A
 
K
L
 
L
L
 
F
K
 
G
L
 
L
R
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
G
|
G
G
 
S
R
 
G
S
 
T
P
 
V
D
 
E
A
 
T
I
 
R
A
 
K
A
 
V
A
 
M
V
 
A
N
 
D
N
 
L
F
 
V
L
 
V
R
 
G
N
 
N
A
 
L
A
 
E
R
 
A
H
 
H
F
 
F
A
 
S
G
 
G
E
 
K
P
 
P
V
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V

Q65CJ7 Hydroxyphenylpyruvate reductase; HPPR; EC 1.1.1.237 from Plectranthus scutellarioides (Coleus) (Solenostemon scutellarioides) (see paper)
38% identity, 92% coverage: 27:310/310 of query aligns to 29:312/313 of Q65CJ7

query
sites
Q65CJ7
Y
 
Y
A
 
W
P
 
T
D
 
Q
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
H
 
R
A
 
D
A
 
-
V
 
F
I
 
L
A
 
A
T
 
L
H
 
Q
G
 
A
A
 
E
M
 
S
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
V
T
 
G
N
 
N
G
 
S
T
 
N
R
 
A
G
 
G
I
 
A
S
 
D
A
 
A
A
 
E
E
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
A
M
 
L
P
 
P
K
 
K
L
 
L
E
 
E
F
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
S
L
 
F
G
 
S
A
 
V
G
 
G
Y
 
L
E
 
D
N
 
K
V
 
V
A
 
D
V
 
L
D
 
I
H
 
K
A
 
C
R
 
E
S
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
V
 
R
L
 
V
V
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
T
 
V
N
 
L
D
 
T
H
 
D
C
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
H
 
L
A
 
A
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
I
L
 
L
S
 
A
I
 
V
V
 
L
R
 
R
D
 
R
V
 
I
P
 
C
R
 
E
L
 
C
D
 
D
E
 
K
A
 
Y
T
 
V
R
 
R
E
 
R
G
 
G
V
 
A
W
 
W
R
 
K
D
 
F
A
 
G
-
 
D
L
 
F
P
 
K
M
 
L
R
 
T
P
 
T
D
 
K
V
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
K
R
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
E
 
L
K
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
E
R
 
R
G
 
A
A
 
E
G
 
A
F
 
F
D
 
D
M
 
C
E
 
P
I
 
I
G
 
S
Y
 
Y
H
 
F
N
x
S
R
|
R
K
x
S
P
 
K
R
 
K
E
 
P
G
 
N
T
 
T
S
 
N
L
 
Y
S
 
T
Y
 
Y
F
 
Y
D
 
G
G
 
S
V
 
V
E
 
V
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
W
 
N
C
 
S
D
 
D
F
 
I
L
 
L
V
 
V
I
 
V
A
 
A
T
 
C
P
 
P
G
 
L
G
 
T
A
 
P
G
 
E
T
 
T
H
 
T
H
 
H
L
 
I
I
 
I
G
 
N
A
 
R
R
 
E
V
 
V
F
 
I
E
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
F
 
V
V
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
S
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
P
V
 
H
L
 
V
D
 
D
T
 
E
A
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
V
Q
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
E
G
 
G
T
 
R
I
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
G
 
R
E
 
E
P
 
P
Q
 
E
P
 
V
P
 
P
A
 
E
A
 
K
L
 
L
L
 
F
K
 
G
L
 
L
R
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
 
H
V
 
V
G
 
G
G
 
S
R
 
G
S
 
T
P
 
V
D
 
E
A
 
T
I
 
R
A
 
K
A
 
V
A
 
M
V
 
A
N
 
D
N
 
L
F
 
V
L
 
V
R
 
G
N
 
N
A
 
L
A
 
E
R
 
A
H
 
H
F
 
F
A
 
S
G
 
G
E
 
K
P
 
P
V
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V

5v6qB Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and malonate (see paper)
42% identity, 81% coverage: 61:310/310 of query aligns to 58:310/319 of 5v6qB

query
sites
5v6qB
I
 
M
D
 
D
R
 
A
M
 
F
P
 
P
K
 
S
L
 
L
E
 
E
F
 
I
V
 
V
S
 
A
A
 
N
L
 
F
G
 
G
A
x
V
G
 
G
Y
 
Y
E
 
D
N
 
G
V
 
V
A
 
D
V
 
V
D
 
S
H
 
R
A
 
A
R
 
A
S
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
V
L
 
V
V
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
T
 
V
N
x
L
D
 
T
H
 
E
C
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
H
 
T
A
 
A
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
N
I
 
T
V
 
L
R
 
R
D
 
L
V
 
L
P
 
P
R
 
Q
L
 
A
D
 
E
E
 
Q
A
 
W
T
 
L
R
 
R
E
 
Q
G
 
G
V
 
R
W
 
W
-
 
V
-
 
R
R
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
F
P
 
P
M
 
L
R
 
S
P
 
P
-
 
L
D
 
S
V
 
L
S
 
R
G
 
G
K
 
R
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
V
x
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
E
 
L
K
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
L
A
 
E
G
 
A
F
 
F
D
 
G
M
 
V
E
 
S
I
 
I
G
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
K
 
T
P
 
P
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
L
S
 
G
L
 
F
S
 
T
Y
 
Y
F
 
H
D
 
P
G
 
T
V
 
L
E
 
V
A
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
W
 
A
C
 
V
D
 
D
F
 
T
L
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
I
T
x
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
A
 
A
G
x
S
T
|
T
H
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
G
 
N
A
 
A
R
 
D
V
 
V
F
 
L
E
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
F
 
V
V
 
L
V
 
I
N
 
N
V
|
V
S
x
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
T
L
 
V
D
 
D
T
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
V
Q
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
Q
A
 
N
G
 
G
T
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
G
 
N
E
|
E
P
 
P
Q
 
N
P
 
V
P
 
P
A
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
K
 
S
L
 
F
R
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
G
x
A
G
 
S
R
 
A
S
 
S
P
 
V
D
 
V
A
 
T
I
 
R
A
 
N
A
 
A
A
 
M
V
 
S
N
 
D
N
 
L
F
 
V
L
 
V
R
 
D
N
 
N
A
 
L
A
 
K
R
 
A
H
 
W
F
 
F
A
 
S
G
 
T
E
 
G
P
 
E
V
 
A
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V

5j23A Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with 2'-phospho-adp-ribose (see paper)
42% identity, 81% coverage: 61:310/310 of query aligns to 56:308/318 of 5j23A

query
sites
5j23A
I
 
M
D
 
D
R
 
A
M
 
F
P
 
P
K
 
S
L
 
L
E
 
E
F
 
I
V
 
V
S
 
A
A
 
N
L
 
F
G
 
G
A
x
V
G
 
G
Y
 
Y
E
 
D
N
 
G
V
 
V
A
 
D
V
 
V
D
 
S
H
 
R
A
 
A
R
 
A
S
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
V
L
 
V
V
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
T
 
V
N
x
L
D
 
T
H
 
E
C
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
D
H
 
T
A
 
A
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
N
I
 
T
V
 
L
R
 
R
D
 
L
V
 
L
P
 
P
R
 
Q
L
 
A
D
 
E
E
 
Q
A
 
W
T
 
L
R
 
R
E
 
Q
G
 
G
V
 
R
W
 
W
-
 
V
-
 
R
R
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
F
P
 
P
M
 
L
R
 
S
P
 
P
-
 
L
D
 
S
V
 
L
S
 
R
G
 
G
K
 
R
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
V
 
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
E
 
L
K
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
L
A
 
E
G
 
A
F
 
F
D
 
G
M
 
V
E
 
S
I
 
I
G
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
K
 
T
P
 
P
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
L
S
 
G
L
 
F
S
 
T
Y
 
Y
F
 
H
D
 
P
G
 
T
V
 
L
E
 
V
A
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
W
 
A
C
 
V
D
 
D
F
 
T
L
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
I
T
 
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
A
 
A
G
x
S
T
|
T
H
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
G
 
N
A
 
A
R
 
D
V
 
V
F
 
L
E
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
F
 
V
V
 
L
V
 
I
N
 
N
V
 
V
S
 
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
T
L
 
V
D
 
D
T
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
V
Q
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
Q
A
 
N
G
 
G
T
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
G
 
N
E
|
E
P
 
P
Q
 
N
P
 
V
P
 
P
A
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
K
 
S
L
 
F
R
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
G
 
A
G
 
S
R
 
A
S
 
S
P
 
V
D
 
V
A
 
T
I
 
R
A
 
N
A
 
A
A
 
M
V
 
S
N
 
D
N
 
L
F
 
V
L
 
V
R
 
D
N
 
N
A
 
L
A
 
K
R
 
A
H
 
W
F
 
F
A
 
S
G
 
T
E
 
G
P
 
E
V
 
A
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V

5v7nA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and 2-keto-d-gluconic acid (see paper)
42% identity, 81% coverage: 61:310/310 of query aligns to 57:309/319 of 5v7nA

query
sites
5v7nA
I
 
M
D
 
D
R
 
A
M
 
F
P
 
P
K
 
S
L
 
L
E
 
E
F
 
I
V
 
V
S
 
A
A
 
N
L
 
F
G
|
G
A
x
V
G
|
G
Y
 
Y
E
 
D
N
 
G
V
 
V
A
 
D
V
 
V
D
 
S
H
 
R
A
 
A
R
 
A
S
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
V
L
 
V
V
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
T
 
V
N
x
L
D
 
T
H
 
E
C
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
H
 
T
A
 
A
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
N
I
 
T
V
 
L
R
 
R
D
 
L
V
 
L
P
 
P
R
 
Q
L
 
A
D
 
E
E
 
Q
A
 
W
T
 
L
R
 
R
E
 
Q
G
 
G
V
 
R
W
 
W
-
 
V
-
 
R
R
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
F
P
 
P
M
 
L
R
 
S
P
 
P
-
 
L
D
 
S
V
 
L
S
 
R
G
 
G
K
 
R
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
V
 
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
E
 
L
K
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
L
A
 
E
G
 
A
F
 
F
D
 
G
M
 
V
E
 
S
I
 
I
G
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
K
 
T
P
 
P
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
L
S
 
G
L
 
F
S
 
T
Y
 
Y
F
 
H
D
 
P
G
 
T
V
 
L
E
 
V
A
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
W
 
A
C
 
V
D
 
D
F
 
T
L
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
I
T
x
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
A
 
A
G
x
S
T
|
T
H
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
G
 
N
A
 
A
R
 
D
V
 
V
F
 
L
E
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
F
 
V
V
 
L
V
 
I
N
 
N
V
|
V
S
x
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
T
L
 
V
D
 
D
T
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
V
Q
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
Q
A
 
N
G
 
G
T
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
G
 
N
E
|
E
P
 
P
Q
 
N
P
 
V
P
 
P
A
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
K
 
S
L
 
F
R
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
G
x
A
G
x
S
R
 
A
S
 
S
P
 
V
D
 
V
A
 
T
I
x
R
A
 
N
A
 
A
A
 
M
V
 
S
N
 
D
N
 
L
F
 
V
L
 
V
R
 
D
N
 
N
A
 
L
A
 
K
R
 
A
H
 
W
F
 
F
A
 
S
G
 
T
E
 
G
P
 
E
V
 
A
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V

5v7gA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADPH and oxalate (see paper)
42% identity, 81% coverage: 61:310/310 of query aligns to 56:308/317 of 5v7gA

query
sites
5v7gA
I
 
M
D
 
D
R
 
A
M
 
F
P
 
P
K
 
S
L
 
L
E
 
E
F
 
I
V
 
V
S
 
A
A
 
N
L
 
F
G
|
G
A
x
V
G
|
G
Y
 
Y
E
 
D
N
 
G
V
 
V
A
 
D
V
 
V
D
 
S
H
 
R
A
 
A
R
 
A
S
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
V
L
 
V
V
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
T
 
V
N
x
L
D
 
T
H
 
E
C
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
H
 
T
A
 
A
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
N
I
 
T
V
 
L
R
 
R
D
 
L
V
 
L
P
 
P
R
 
Q
L
 
A
D
 
E
E
 
Q
A
 
W
T
 
L
R
 
R
E
 
Q
G
 
G
V
 
R
W
 
W
-
 
V
-
 
R
R
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
F
P
 
P
M
 
L
R
 
S
P
 
P
-
 
L
D
 
S
V
 
L
S
 
R
G
 
G
K
 
R
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
V
x
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
E
 
L
K
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
L
A
 
E
G
 
A
F
 
F
D
 
G
M
 
V
E
 
S
I
 
I
G
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
K
 
T
P
 
P
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
L
S
 
G
L
 
F
S
 
T
Y
 
Y
F
 
H
D
 
P
G
 
T
V
 
L
E
 
V
A
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
W
 
A
C
 
V
D
 
D
F
 
T
L
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
I
T
x
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
A
 
A
G
x
S
T
|
T
H
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
G
 
N
A
 
A
R
 
D
V
 
V
F
 
L
E
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
F
 
V
V
 
L
V
 
I
N
 
N
V
|
V
S
x
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
T
L
 
V
D
 
D
T
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
V
Q
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
Q
A
 
N
G
 
G
T
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
G
 
N
E
|
E
P
 
P
Q
 
N
P
 
V
P
 
P
A
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
K
 
S
L
 
F
R
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
G
x
A
G
 
S
R
 
A
S
 
S
P
 
V
D
 
V
A
 
T
I
 
R
A
 
N
A
 
A
A
 
M
V
 
S
N
 
D
N
 
L
F
 
V
L
 
V
R
 
D
N
 
N
A
 
L
A
 
K
R
 
A
H
 
W
F
 
F
A
 
S
G
 
T
E
 
G
P
 
E
V
 
A
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
36% identity, 84% coverage: 45:304/310 of query aligns to 46:315/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
I
 
V
R
 
D
A
 
A
V
 
L
L
 
V
T
 
T
N
x
M
G
x
L
T
 
S
R
 
E
G
 
R
I
 
I
S
 
D
A
 
Q
A
 
E
E
 
V
I
 
F
D
 
E
R
 
N
M
 
A
P
 
P
K
 
R
L
 
L
E
 
R
F
 
I
V
 
V
S
 
A
A
 
N
L
x
Y
G
x
A
A
x
V
G
|
G
Y
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
I
A
 
D
V
 
V
D
 
E
H
 
E
A
 
A
R
 
T
S
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
Y
L
 
V
V
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
T
 
V
N
x
L
D
 
T
H
 
N
C
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
H
 
H
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
A
I
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
H
V
 
V
P
 
V
R
 
K
L
 
G
D
 
D
E
 
K
A
 
F
T
 
V
R
 
R
E
 
S
G
 
G
V
 
E
W
 
W
-
 
K
R
 
R
D
 
K
A
 
G
L
 
I
P
 
A
M
 
W
R
 
H
P
 
P
-
 
K
-
 
W
-
 
F
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
D
 
E
V
 
L
S
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
L
x
F
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
E
 
Q
K
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
A
A
 
K
G
 
G
F
 
F
D
 
N
M
 
M
E
 
R
I
 
I
G
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
N
x
S
R
|
R
K
 
T
P
 
R
R
 
K
-
 
S
-
 
Q
-
 
A
E
 
E
G
 
K
T
 
E
S
 
L
L
 
G
S
 
A
Y
 
E
F
 
Y
D
 
R
G
 
P
V
 
L
E
 
E
A
 
E
L
 
V
A
 
L
R
 
K
W
 
E
C
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
V
V
 
I
I
 
L
A
|
A
T
x
V
P
|
P
G
 
L
G
 
T
A
 
K
G
 
E
T
|
T
H
 
M
H
 
Y
L
 
M
I
 
I
G
 
N
A
 
E
R
 
E
V
 
R
F
 
L
E
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
P
D
 
T
G
 
A
F
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
V
x
I
S
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
I
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
K
A
 
E
G
 
G
T
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
G
 
E
E
|
E
P
 
P
Q
 
Y
P
 
Y
P
 
N
A
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
F
K
 
S
L
 
L
R
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
G
 
S
R
 
A
S
 
T
P
 
F
D
 
E
A
 
A
I
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
M
V
 
A
N
 
E
N
 
L
F
 
V
L
 
A
R
 
R
N
 
N
A
 
L
A
 
I
R
 
A
H
 
F
F
 
K
A
 
R
G
 
G
E
 
E

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
40% identity, 76% coverage: 45:280/310 of query aligns to 45:290/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
I
 
V
R
 
D
A
 
A
V
 
L
L
 
V
T
 
T
N
 
M
G
 
L
T
 
S
R
 
E
G
 
K
I
 
I
S
 
D
A
 
R
A
 
E
E
 
V
I
 
F
D
 
D
R
 
A
M
 
A
P
 
P
K
 
R
L
 
L
E
 
R
F
 
I
V
 
V
S
 
A
A
 
N
L
 
Y
G
 
A
A
x
V
G
 
G
Y
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
I
A
 
D
V
 
I
D
 
E
H
 
E
A
 
A
R
 
T
S
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
Y
L
 
V
V
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
T
 
V
N
x
L
D
 
T
H
 
D
C
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
H
 
L
A
 
A
F
 
W
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
A
I
 
A
V
 
A
R
 
R
D
 
H
V
 
V
P
 
V
R
 
K
L
 
G
D
 
D
E
 
K
A
 
F
T
 
V
R
 
R
E
 
S
G
 
G
V
 
E
W
 
W
-
 
K
R
 
R
D
 
R
A
 
G
L
 
I
P
 
A
M
 
W
R
 
H
P
 
P
-
 
K
-
 
M
-
 
F
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
D
 
D
V
 
V
S
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
|
G
L
x
F
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
E
 
Q
K
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
A
A
 
K
G
 
G
F
 
F
D
 
G
M
 
M
E
 
R
I
 
I
G
 
L
Y
 
Y
-
 
T
-
x
A
H
x
R
N
x
S
R
 
R
K
|
K
P
 
P
R
 
E
E
 
A
G
 
E
T
 
K
S
 
E
L
 
L
-
 
G
S
 
A
Y
 
E
F
 
F
D
 
K
G
 
P
V
 
L
E
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
L
R
 
R
W
 
E
C
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
T
x
V
P
|
P
G
 
L
G
 
T
A
 
K
G
x
E
T
|
T
H
 
Y
H
 
H
L
 
M
I
 
I
G
 
N
A
 
E
R
 
E
V
 
R
F
 
L
E
 
R
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
P
D
 
T
G
 
A
F
 
V
V
 
L
V
 
V
N
 
N
V
|
V
S
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
I
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
K
A
 
E
G
 
G
T
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
G
 
E
E
|
E
P
 
P
Q
 
Y
P
 
Y
P
 
D
A
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
F
K
 
A
L
 
L
R
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
G
 
S

O58320 Glyoxylate reductase; EC 1.1.1.26 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3)
36% identity, 91% coverage: 1:282/310 of query aligns to 1:293/334 of O58320

query
sites
O58320
M
 
M
K
 
K
P
 
P
S
 
K
L
 
V
L
 
F
I
 
I
L
 
T
I
 
R
H
 
E
L
 
I
D
 
P
D
 
E
A
 
V
S
 
G
R
 
I
A
 
K
S
 
M
I
 
L
E
 
E
A
 
D
E
 
E
F
 
F
D
 
E
-
 
V
S
 
E
V
 
V
Y
 
W
A
 
G
P
 
D
D
 
E
P
 
K
A
 
E
Q
 
I
H
 
P
A
 
R
A
 
E
V
 
I
I
 
L
A
 
L
T
 
K
H
 
K
G
 
V
A
 
K
M
 
E
I
 
V
R
 
D
A
 
A
V
 
L
L
 
V
T
 
T
N
 
M
G
 
L
T
 
S
R
 
E
G
 
R
I
 
I
S
 
D
A
 
K
A
 
E
E
 
V
I
 
F
D
 
E
R
 
N
M
 
A
P
 
P
K
 
K
L
 
L
E
 
R
F
 
I
V
 
V
S
 
A
A
 
N
L
 
Y
G
 
A
A
 
V
G
 
G
Y
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
I
A
 
D
V
 
I
D
 
E
H
 
E
A
 
A
R
 
T
S
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
Y
L
 
V
V
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
T
 
V
N
 
L
D
 
T
H
 
D
C
 
A
V
 
T
A
 
A
D
 
D
H
 
L
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
A
I
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
H
V
 
V
P
 
V
R
 
K
L
 
G
D
 
D
E
 
R
A
 
F
T
 
V
R
 
R
E
 
S
G
 
G
V
 
E
W
 
W
R
 
K
D
 
K
-
 
R
A
 
G
L
 
V
P
 
A
M
 
W
R
 
H
P
 
P
-
 
K
-
 
W
-
 
F
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
D
 
D
V
 
V
S
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
E
 
Q
K
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
A
A
 
K
G
 
G
F
 
F
D
 
N
M
 
M
E
 
R
I
 
I
G
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
N
x
S
R
|
R
K
x
T
P
 
R
R
 
K
E
 
E
G
 
E
T
 
V
S
 
E
L
 
R
S
 
E
Y
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
E
F
 
F
D
 
K
G
 
P
V
 
L
E
 
E
A
 
D
L
 
L
A
 
L
R
 
R
W
 
E
C
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
T
 
V
P
 
P
G
 
L
G
 
T
A
 
R
G
 
E
T
 
T
H
 
Y
H
 
H
L
 
L
I
 
I
G
 
N
A
 
E
R
 
E
V
 
R
F
 
L
E
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
K
D
 
T
G
 
A
F
 
I
V
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
S
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
V
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
K
A
 
E
G
 
G
T
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
G
 
E
E
 
E
P
 
P
Q
 
Y
P
 
Y
P
 
N
A
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
F
K
 
K
L
 
L
R
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
x
I
G
|
G
G
 
S
R
 
A
S
 
S

2dbqA Crystal structure of glyoxylate reductase (ph0597) from pyrococcus horikoshii ot3, complexed with NADP (i41) (see paper)
36% identity, 91% coverage: 1:282/310 of query aligns to 1:293/333 of 2dbqA

query
sites
2dbqA
M
 
M
K
 
K
P
 
P
S
 
K
L
 
V
L
 
F
I
 
I
L
 
T
I
 
R
H
 
E
L
 
I
D
 
P
D
 
E
A
 
V
S
 
G
R
 
I
A
 
K
S
 
M
I
 
L
E
 
E
A
 
D
E
 
E
F
 
F
D
 
E
-
 
V
S
 
E
V
 
V
Y
 
W
A
 
G
P
 
D
D
 
E
P
 
K
A
 
E
Q
 
I
H
 
P
A
 
R
A
 
E
V
 
I
I
 
L
A
 
L
T
 
K
H
 
K
G
 
V
A
 
K
M
 
E
I
 
V
R
 
D
A
 
A
V
 
L
L
 
V
T
 
T
N
 
M
G
 
L
T
 
S
R
 
E
G
 
R
I
 
I
S
 
D
A
 
K
A
 
E
E
 
V
I
 
F
D
 
E
R
 
N
M
 
A
P
 
P
K
 
K
L
 
L
E
 
R
F
 
I
V
 
V
S
 
A
A
 
N
L
 
Y
G
 
A
A
x
V
G
 
G
Y
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
I
A
 
D
V
 
I
D
 
E
H
 
E
A
 
A
R
 
T
S
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
Y
L
 
V
V
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
T
 
V
N
x
L
D
 
T
H
 
D
C
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
H
 
L
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
A
I
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
H
V
 
V
P
 
V
R
 
K
L
 
G
D
 
D
E
 
R
A
 
F
T
 
V
R
 
R
E
 
S
G
 
G
V
 
E
W
 
W
R
 
K
D
 
K
-
 
R
A
 
G
L
 
V
P
 
A
M
 
W
R
 
H
P
 
P
-
 
K
-
 
W
-
 
F
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
D
 
D
V
 
V
S
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
E
 
Q
K
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
A
A
 
K
G
 
G
F
 
F
D
 
N
M
 
M
E
 
R
I
 
I
G
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
N
x
S
R
|
R
K
x
T
P
 
R
R
 
K
E
 
E
G
 
E
T
 
V
S
 
E
L
 
R
S
 
E
Y
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
E
F
 
F
D
 
K
G
 
P
V
 
L
E
 
E
A
 
D
L
 
L
A
 
L
R
 
R
W
 
E
C
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
V
V
 
V
I
 
L
A
|
A
T
x
V
P
|
P
G
 
L
G
 
T
A
 
R
G
 
E
T
|
T
H
 
Y
H
 
H
L
 
L
I
 
I
G
 
N
A
 
E
R
 
E
V
 
R
F
 
L
E
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
K
D
 
T
G
 
A
F
 
I
V
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
S
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
V
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
K
A
 
E
G
 
G
T
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
G
 
E
E
|
E
P
 
P
Q
 
Y
P
 
Y
P
 
N
A
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
F
K
 
K
L
 
L
R
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
G
 
S
R
 
A
S
 
S

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
34% identity, 78% coverage: 45:285/310 of query aligns to 42:286/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
I
 
V
R
 
E
A
 
A
V
 
I
L
 
I
T
 
V
N
 
R
G
 
S
T
 
K
R
 
P
G
 
K
I
 
V
S
 
T
A
 
R
A
 
R
E
 
V
I
 
I
D
 
E
R
 
S
M
 
A
P
 
P
K
 
K
L
 
L
E
 
K
F
 
V
V
 
I
S
 
A
A
 
R
L
 
A
G
 
G
A
 
V
G
 
G
Y
 
L
E
 
D
N
 
N
V
 
I
A
 
D
V
 
V
D
 
E
H
 
A
A
 
A
R
 
K
S
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
E
L
 
V
V
 
V
N
 
N
G
 
A
A
 
P
G
 
A
T
 
A
N
x
S
D
 
S
H
 
R
C
 
S
V
|
V
A
 
A
D
 
E
H
 
L
A
 
A
F
 
V
A
 
G
L
 
L
L
 
M
L
 
F
S
 
S
I
 
V
V
 
A
R
 
R
D
 
K
V
 
I
P
 
A
R
 
F
L
 
A
D
 
D
E
 
R
A
 
K
T
 
M
R
 
R
E
 
E
G
 
G
V
 
V
W
 
W
R
 
A
D
 
K
A
 
K
L
 
E
P
 
A
M
 
M
R
 
G
P
 
I
D
 
E
V
 
L
S
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
L
x
F
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
E
 
Y
K
 
Q
I
 
V
A
 
A
R
 
K
R
 
I
G
 
A
A
 
N
G
 
A
F
 
L
D
 
G
M
 
M
E
 
N
I
 
I
G
 
L
Y
 
L
H
x
Y
N
x
D
R
x
P
K
 
Y
P
 
P
R
 
N
E
 
E
G
 
E
T
 
R
S
 
A
L
 
K
S
 
E
Y
 
V
-
 
N
-
 
G
-
 
K
F
 
F
D
 
V
G
 
D
V
 
L
E
 
E
A
 
T
L
 
L
A
 
L
R
 
K
W
 
E
C
 
S
D
 
D
F
 
V
L
 
V
V
 
T
I
 
I
A
 
H
T
x
V
P
|
P
G
 
L
G
 
V
A
 
E
G
 
S
T
|
T
H
 
Y
H
 
H
L
 
L
I
 
I
G
 
N
A
 
E
R
 
E
V
 
R
F
 
L
E
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
K
D
 
T
G
 
A
F
 
I
V
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
T
S
|
S
R
|
R
G
 
G
S
 
P
V
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
V
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
K
A
 
E
G
 
G
T
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
G
 
E
E
|
E
P
 
P
Q
 
L
P
 
P
P
 
K
A
 
D
-
 
H
A
 
P
L
 
L
L
 
T
K
 
K
L
 
F
R
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
G
 
A
R
 
S
S
 
T
P
 
V
D
 
E
A
 
A

2w2lA Crystal structure of the holo forms of rhodotorula graminis d- mandelate dehydrogenase at 2.5a.
32% identity, 86% coverage: 43:309/310 of query aligns to 54:337/346 of 2w2lA

query
sites
2w2lA
A
 
A
M
 
I
I
 
I
R
 
K
A
 
L
V
 
A
L
 
V
T
 
E
N
 
N
G
 
G
T
 
T
R
 
E
G
 
S
I
 
Y
-
 
P
-
 
W
S
 
N
A
 
A
A
 
D
E
 
L
I
 
I
D
 
S
R
 
H
M
 
L
P
 
P
K
 
S
-
 
S
L
 
L
E
 
K
F
 
V
V
 
F
S
 
A
A
 
A
L
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
E
 
D
N
 
W
V
 
L
A
 
D
V
 
L
D
 
D
H
 
A
A
 
L
R
 
N
S
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
V
V
 
A
L
 
F
V
 
A
N
 
N
G
 
S
A
 
R
G
 
G
T
 
A
N
x
G
D
 
D
H
 
T
C
 
A
V
x
T
A
 
S
D
 
D
H
 
L
A
 
A
F
 
L
A
 
Y
L
 
L
L
 
I
L
 
L
S
 
S
I
 
V
V
 
F
R
 
R
D
 
L
V
 
A
P
 
S
R
 
Y
L
 
S
D
 
E
E
 
R
A
 
A
T
 
A
R
 
R
E
 
T
G
 
G
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
T
V
 
F
W
 
N
R
 
R
D
 
V
A
 
H
L
 
L
P
 
E
M
 
I
R
 
G
P
 
K
D
 
S
V
 
A
S
 
H
G
 
N
K
 
P
R
 
R
-
 
G
-
 
H
-
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
|
G
N
x
A
I
|
I
G
 
Q
E
 
K
K
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
K
G
 
A
A
 
V
-
 
H
G
 
G
F
 
L
D
 
G
M
 
M
E
 
K
I
 
L
G
 
V
Y
 
Y
H
 
Y
N
x
D
R
 
V
K
 
A
P
 
P
R
 
A
E
 
D
G
 
A
T
 
E
S
 
T
L
 
E
S
 
K
Y
 
A
F
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
R
-
 
V
D
 
D
G
 
S
V
 
L
E
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
W
 
R
C
 
S
D
 
D
F
 
C
L
 
V
V
 
S
I
 
V
A
 
S
T
x
V
P
|
P
G
 
Y
G
 
M
A
 
K
G
 
L
T
|
T
H
 
H
H
 
H
L
 
L
I
 
I
G
 
D
A
 
E
R
 
A
V
 
F
F
 
F
E
 
A
A
 
A
L
 
M
G
 
K
P
 
P
D
 
G
G
 
S
F
 
R
V
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
T
S
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
P
V
 
V
L
 
I
D
 
S
T
 
Q
A
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
I
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
K
A
 
S
G
 
G
T
 
K
I
 
L
A
 
L
G
 
S
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
H
E
 
E
G
 
F
E
|
E
P
 
P
Q
 
Q
P
 
V
P
 
S
A
 
K
A
 
E
L
 
L
L
 
I
K
 
E
L
 
M
R
 
K
N
 
H
V
 
V
V
 
T
L
 
L
T
 
T
P
 
T
H
|
H
V
 
I
G
|
G
G
|
G
R
 
V
S
 
A
P
 
I
D
 
E
A
 
T
I
 
F
A
 
H
A
 
E
A
 
F
V
 
E
N
 
R
N
 
L
F
 
T
L
 
M
R
 
T
N
 
N
A
 
I
A
 
D
R
 
R
H
 
F
-
 
L
F
 
L
A
 
Q
G
 
G
E
 
K
P
 
P
V
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
33% identity, 74% coverage: 56:285/310 of query aligns to 59:291/533 of O43175

query
sites
O43175
I
 
V
S
 
T
A
 
A
A
 
D
E
 
V
I
 
I
D
 
N
R
 
A
M
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
E
 
Q
F
 
V
V
 
V
S
 
G
A
 
R
L
 
A
G
 
G
A
x
T
G
 
G
Y
 
V
E
 
D
N
 
N
V
 
V
A
 
D
V
 
L
D
 
E
H
 
A
A
 
A
R
 
T
S
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
L
 
V
V
 
M
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
N
T
 
G
N
 
N
D
 
S
H
 
L
C
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
H
 
L
A
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
S
 
C
I
 
L
V
 
A
R
 
R
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
R
 
Q
L
 
A
D
 
T
E
 
A
A
 
S
T
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
V
 
K
W
 
W
R
 
E
D
x
R
A
 
K
L
 
K
P
 
F
M
 
M
R
 
G
P
 
T
D
 
E
V
 
L
S
 
N
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
E
 
R
K
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
G
 
M
A
 
Q
G
 
S
F
 
F
D
 
G
M
 
M
E
 
K
-
 
T
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
H
x
D
N
 
-
R
 
-
K
 
-
P
 
P
R
 
I
E
 
I
G
 
S
T
 
P
S
 
E
L
 
V
S
 
S
Y
 
A
F
 
S
D
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
A
 
P
R
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
W
 
W
-
 
P
-
 
L
C
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
V
 
T
I
 
V
A
 
H
T
|
T
P
 
P
G
 
L
G
 
L
A
 
P
G
 
S
T
 
T
H
 
T
H
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
N
A
 
D
R
 
N
V
 
T
F
 
F
E
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
F
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
N
V
x
C
S
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
L
 
V
D
 
D
T
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
|
D
V
|
V
Y
 
F
E
 
T
G
 
E
E
 
E
P
 
P
Q
 
P
P
 
R
P
 
D
A
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
D
L
 
H
R
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
x
L
G
|
G
G
x
A
R
 
S
S
 
T
P
 
K
D
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
33% identity, 74% coverage: 56:285/310 of query aligns to 55:287/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
I
 
V
S
 
T
A
 
A
A
 
D
E
 
V
I
 
I
D
 
N
R
 
A
M
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
E
 
Q
F
 
V
V
 
V
S
 
G
A
 
R
L
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
Y
 
V
E
 
D
N
 
N
V
 
V
A
 
D
V
 
L
D
 
E
H
 
A
A
 
A
R
 
T
S
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
L
 
V
V
 
M
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
N
T
 
G
N
 
N
D
 
S
H
 
L
C
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
H
 
L
A
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
S
 
C
I
 
L
V
 
A
R
 
R
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
R
 
Q
L
 
A
D
 
T
E
 
A
A
 
S
T
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
V
 
K
W
 
W
R
 
E
D
 
R
A
 
K
L
 
K
P
 
F
M
 
M
R
 
G
P
 
T
D
 
E
V
 
L
S
 
N
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
E
 
R
K
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
G
 
M
A
 
Q
G
 
S
F
 
F
D
 
G
M
 
M
E
 
K
-
 
T
I
 
I
G
 
G
Y
|
Y
H
x
D
N
 
-
R
 
-
K
 
-
P
|
P
R
 
I
E
 
I
G
 
S
T
 
P
S
 
E
L
 
V
S
 
S
Y
 
A
F
 
S
D
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
A
 
P
R
x
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
W
 
W
-
 
P
-
 
L
C
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
V
 
T
I
 
V
A
x
H
T
|
T
P
|
P
G
 
L
G
 
L
A
 
P
G
 
S
T
 
T
H
 
T
H
 
G
L
|
L
I
 
L
G
 
N
A
 
D
R
 
N
V
 
T
F
 
F
E
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
F
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
L
 
V
D
 
D
T
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
T
G
 
E
E
 
E
P
 
P
Q
 
P
P
 
R
P
 
D
A
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
D
L
 
H
R
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
S
S
 
T
P
 
K
D
 
E
A
 
A

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
33% identity, 74% coverage: 56:285/310 of query aligns to 54:286/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
I
 
V
S
 
T
A
 
A
A
 
D
E
 
V
I
 
I
D
 
N
R
 
A
M
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
E
 
Q
F
 
V
V
 
V
S
 
G
A
 
R
L
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
Y
 
V
E
 
D
N
 
N
V
 
V
A
 
D
V
 
L
D
 
E
H
 
A
A
 
A
R
 
T
S
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
L
 
V
V
 
M
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
N
T
 
G
N
 
N
D
 
S
H
 
L
C
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
H
 
L
A
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
S
 
C
I
 
L
V
 
A
R
 
R
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
R
 
Q
L
 
A
D
 
T
E
 
A
A
 
S
T
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
V
 
K
W
 
W
R
 
E
D
 
R
A
 
K
L
 
K
P
 
F
M
 
M
R
 
G
P
 
T
D
 
E
V
 
L
S
 
N
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
N
x
R
I
 
I
G
 
G
E
 
R
K
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
G
 
M
A
 
Q
G
 
S
F
 
F
D
 
G
M
 
M
E
 
K
-
 
T
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
H
x
D
N
 
-
R
 
-
K
 
-
P
|
P
R
x
I
E
x
I
G
 
S
T
 
P
S
 
E
L
 
V
S
 
S
Y
 
A
F
 
S
D
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
A
 
P
R
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
W
 
W
-
 
P
-
 
L
C
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
V
 
T
I
 
V
A
x
H
T
|
T
P
 
P
G
 
L
G
x
L
A
 
P
G
 
S
T
 
T
H
 
T
H
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
N
A
 
D
R
 
N
V
 
T
F
 
F
E
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
F
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
L
 
V
D
 
D
T
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
T
G
 
E
E
 
E
P
 
P
Q
 
P
P
 
R
P
 
D
A
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
D
L
 
H
R
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
S
S
 
T
P
 
K
D
 
E
A
 
A

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
33% identity, 74% coverage: 56:285/310 of query aligns to 54:286/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
I
 
V
S
 
T
A
 
A
A
 
D
E
 
V
I
 
I
D
 
N
R
 
A
M
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
E
 
Q
F
 
V
V
 
V
S
 
G
A
 
R
L
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
Y
 
V
E
 
D
N
 
N
V
 
V
A
 
D
V
 
L
D
 
E
H
 
A
A
 
A
R
 
T
S
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
L
 
V
V
 
M
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
N
T
 
G
N
 
N
D
 
S
H
 
L
C
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
H
 
L
A
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
S
 
C
I
 
L
V
 
A
R
 
R
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
R
 
Q
L
 
A
D
 
T
E
 
A
A
 
S
T
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
V
 
K
W
 
W
R
 
E
D
 
R
A
 
K
L
 
K
P
 
F
M
 
M
R
 
G
P
 
T
D
 
E
V
 
L
S
 
N
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
x
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
E
 
R
K
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
G
 
M
A
 
Q
G
 
S
F
 
F
D
 
G
M
 
M
E
 
K
-
 
T
I
 
I
G
 
G
Y
|
Y
H
x
D
N
 
-
R
 
-
K
 
-
P
|
P
R
 
I
E
x
I
G
 
S
T
 
P
S
 
E
L
 
V
S
 
S
Y
 
A
F
 
S
D
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
A
 
P
R
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
W
 
W
-
 
P
-
 
L
C
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
V
 
T
I
 
V
A
x
H
T
|
T
P
|
P
G
 
L
G
 
L
A
 
P
G
 
S
T
 
T
H
 
T
H
 
G
L
|
L
I
 
L
G
 
N
A
 
D
R
 
N
V
 
T
F
 
F
E
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
F
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
L
 
V
D
 
D
T
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
T
G
 
E
E
 
E
P
 
P
Q
 
P
P
 
R
P
 
D
A
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
D
L
 
H
R
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
S
S
 
T
P
 
K
D
 
E
A
 
A

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
33% identity, 74% coverage: 56:285/310 of query aligns to 55:287/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
I
 
V
S
 
T
A
 
A
A
 
D
E
 
V
I
 
I
D
 
N
R
 
A
M
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
E
 
Q
F
 
V
V
 
V
S
 
G
A
 
R
L
 
A
G
 
G
A
x
T
G
 
G
Y
 
V
E
 
D
N
 
N
V
 
V
A
 
D
V
 
L
D
 
E
H
 
A
A
 
A
R
 
T
S
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
L
 
V
V
 
M
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
N
T
 
G
N
 
N
D
 
S
H
 
L
C
 
S
V
x
A
A
 
A
D
 
E
H
 
L
A
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
S
 
C
I
 
L
V
 
A
R
 
R
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
R
 
Q
L
 
A
D
 
T
E
 
A
A
 
S
T
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
V
 
K
W
 
W
R
 
E
D
 
R
A
 
K
L
 
K
P
 
F
M
 
M
R
 
G
P
 
T
D
 
E
V
 
L
S
 
N
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
|
G
L
 
L
G
 
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
E
 
R
K
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
G
 
M
A
 
Q
G
 
S
F
 
F
D
 
G
M
 
M
E
 
K
-
 
T
I
 
I
G
 
G
Y
|
Y
H
x
D
N
 
-
R
 
-
K
 
-
P
|
P
R
x
I
E
 
I
G
 
S
T
 
P
S
 
E
L
 
V
S
 
S
Y
 
A
F
 
S
D
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
A
 
P
R
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
W
 
W
-
 
P
-
 
L
C
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
V
 
T
I
 
V
A
x
H
T
|
T
P
|
P
G
 
L
G
 
L
A
 
P
G
 
S
T
|
T
H
 
T
H
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
N
A
 
D
R
 
N
V
 
T
F
 
F
E
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
F
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
N
V
x
C
S
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
L
 
V
D
 
D
T
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
T
G
 
E
E
 
E
P
 
P
Q
 
P
P
 
R
P
 
D
A
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
D
L
 
H
R
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
|
G
G
 
A
R
 
S
S
 
T
P
 
K
D
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6rj2A Crystal structure of phgdh in complex with compound 40 (see paper)
33% identity, 74% coverage: 56:285/310 of query aligns to 51:283/299 of 6rj2A

query
sites
6rj2A
I
 
V
S
 
T
A
 
A
A
 
D
E
 
V
I
 
I
D
 
N
R
 
A
M
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
E
 
Q
F
 
V
V
 
V
S
 
G
A
 
R
L
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
Y
 
V
E
 
D
N
 
N
V
 
V
A
 
D
V
 
L
D
 
E
H
 
A
A
 
A
R
 
T
S
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
L
 
V
V
 
M
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
N
T
 
G
N
 
N
D
 
S
H
 
L
C
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
H
 
L
A
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
S
 
C
I
 
L
V
 
A
R
 
R
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
R
 
Q
L
 
A
D
 
T
E
 
A
A
 
S
T
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
V
 
K
W
 
W
R
 
E
D
 
R
A
 
K
L
 
K
P
 
F
M
 
M
R
 
G
P
 
T
D
 
E
V
 
L
S
 
N
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
N
 
R
I
|
I
G
 
G
E
 
R
K
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
G
 
M
A
 
Q
G
 
S
F
 
F
D
 
G
M
 
M
E
 
K
-
 
T
I
 
I
G
 
G
Y
|
Y
H
x
D
N
 
-
R
 
-
K
 
-
P
|
P
R
x
I
E
x
I
G
 
S
T
 
P
S
 
E
L
 
V
S
 
S
Y
 
A
F
 
S
D
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
A
 
P
R
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
W
 
W
-
 
P
-
 
L
C
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
V
 
T
I
 
V
A
x
H
T
|
T
P
 
P
G
 
L
G
 
L
A
 
P
G
 
S
T
 
T
H
 
T
H
 
G
L
|
L
I
 
L
G
 
N
A
 
D
R
 
N
V
 
T
F
 
F
E
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
F
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
C
S
 
A
R
|
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
L
 
V
D
 
D
T
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
T
G
 
E
E
 
E
P
 
P
Q
 
P
P
 
R
P
 
D
A
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
D
L
 
H
R
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
S
S
 
T
P
 
K
D
 
E
A
 
A

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
33% identity, 74% coverage: 56:285/310 of query aligns to 54:286/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
I
 
V
S
 
T
A
 
A
A
 
D
E
 
V
I
 
I
D
 
N
R
 
A
M
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
E
 
Q
F
 
V
V
 
V
S
 
G
A
 
R
L
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
Y
 
V
E
 
D
N
 
N
V
 
V
A
 
D
V
 
L
D
 
E
H
 
A
A
 
A
R
 
T
S
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
L
 
V
V
 
M
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
N
T
 
G
N
 
N
D
 
S
H
 
L
C
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
H
 
L
A
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
S
 
C
I
 
L
V
 
A
R
 
R
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
R
 
Q
L
 
A
D
 
T
E
 
A
A
 
S
T
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
V
 
K
W
 
W
R
 
E
D
 
R
A
 
K
L
 
K
P
 
F
M
 
M
R
 
G
P
 
T
D
 
E
V
 
L
S
 
N
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
x
L
G
|
G
L
|
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
|
G
E
 
R
K
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
G
 
M
A
 
Q
G
 
S
F
 
F
D
 
G
M
 
M
E
 
K
-
 
T
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
H
x
D
N
 
-
R
 
-
K
 
-
P
 
P
R
 
I
E
 
I
G
 
S
T
 
P
S
 
E
L
 
V
S
 
S
Y
 
A
F
 
S
D
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
A
 
P
R
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
W
 
W
-
 
P
-
 
L
C
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
V
 
T
I
 
V
A
x
H
T
|
T
P
|
P
G
 
L
G
 
L
A
 
P
G
 
S
T
 
T
H
 
T
H
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
N
A
 
D
R
 
N
V
 
T
F
 
F
E
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
F
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
L
 
V
D
 
D
T
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
T
G
 
E
E
 
E
P
 
P
Q
 
P
P
 
R
P
 
D
A
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
D
L
 
H
R
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
S
S
 
T
P
 
K
D
 
E
A
 
A

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
33% identity, 74% coverage: 56:285/310 of query aligns to 54:286/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
I
 
V
S
 
T
A
 
A
A
 
D
E
 
V
I
 
I
D
 
N
R
 
A
M
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
E
 
Q
F
 
V
V
 
V
S
 
G
A
 
R
L
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
Y
 
V
E
 
D
N
 
N
V
 
V
A
 
D
V
 
L
D
 
E
H
 
A
A
 
A
R
 
T
S
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
L
 
V
V
 
M
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
N
T
 
G
N
 
N
D
 
S
H
 
L
C
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
H
 
L
A
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
S
 
C
I
 
L
V
 
A
R
 
R
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
R
 
Q
L
 
A
D
 
T
E
 
A
A
 
S
T
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
V
 
K
W
 
W
R
 
E
D
 
R
A
 
K
L
 
K
P
 
F
M
 
M
R
 
G
P
 
T
D
 
E
V
 
L
S
 
N
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
E
 
R
K
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
G
 
M
A
 
Q
G
 
S
F
 
F
D
 
G
M
 
M
E
 
K
-
 
T
I
 
I
G
 
G
Y
|
Y
H
x
D
N
 
-
R
 
-
K
 
-
P
|
P
R
x
I
E
x
I
G
 
S
T
 
P
S
 
E
L
 
V
S
 
S
Y
 
A
F
 
S
D
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
A
 
P
R
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
W
 
W
-
 
P
-
 
L
C
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
V
 
T
I
 
V
A
 
H
T
|
T
P
|
P
G
 
L
G
 
L
A
 
P
G
 
S
T
 
T
H
 
T
H
 
G
L
|
L
I
 
L
G
 
N
A
 
D
R
 
N
V
 
T
F
 
F
E
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
F
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
L
 
V
D
 
D
T
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
T
G
 
E
E
 
E
P
 
P
Q
 
P
P
 
R
P
 
D
A
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
D
L
 
H
R
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
S
S
 
T
P
 
K
D
 
E
A
 
A

Query Sequence

>H281DRAFT_05383 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_05383
MKPSLLILIHLDDASRASIEAEFDSVYAPDPAQHAAVIATHGAMIRAVLTNGTRGISAAE
IDRMPKLEFVSALGAGYENVAVDHARSRGIVLVNGAGTNDHCVADHAFALLLSIVRDVPR
LDEATREGVWRDALPMRPDVSGKRLGIVGLGNIGEKIARRGAGFDMEIGYHNRKPREGTS
LSYFDGVEALARWCDFLVIATPGGAGTHHLIGARVFEALGPDGFVVNVSRGSVLDTAALA
QALVAGTIAGAALDVYEGEPQPPAALLKLRNVVLTPHVGGRSPDAIAAAVNNFLRNAARH
FAGEPVLTPI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory