SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_05724 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_05724 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3hazA Crystal structure of bifunctional proline utilization a (puta) protein (see paper)
26% identity, 71% coverage: 125:528/566 of query aligns to 568:957/983 of 3hazA

query
sites
3hazA
A
 
A
S
 
A
F
 
L
E
 
E
I
 
Q
G
 
A
Y
 
A
S
 
H
V
 
L
M
 
L
H
 
E
T
 
S
T
 
R
G
 
S
Q
 
A
A
 
H
F
 
F
M
 
I
M
 
A
A
 
L
F
 
L
Q
 
Q
A
 
R
G
 
E
G
 
G
P
 
G
H
 
K
A
 
T
Q
 
L
D
 
D
R
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
S
A
 
E
V
 
L
V
 
R
Y
 
E
A
 
A
W
 
A
D
 
D
Q
 
F
L
 
C
R
 
R
R
 
Y
I
 
Y
P
 
A
A
 
A
D
 
Q
A
 
G
H
 
R
-
 
K
-
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
S
-
 
E
-
 
T
-
 
A
W
 
M
E
 
P
K
 
G
P
 
P
Q
 
T
G
 
G
K
 
E
N
 
S
P
 
N
P
 
A
L
 
L
A
 
T
M
 
M
Q
 
R
K
 
G
R
 
R
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
V
 
-
P
 
-
R
 
-
G
 
G
T
 
V
A
 
F
L
 
V
V
 
A
L
x
I
G
x
S
C
x
P
C
x
W
T
x
N
F
 
F
P
 
P
T
 
L
W
 
A
N
x
I
G
 
F
Y
 
L
P
 
G
G
 
Q
L
 
V
F
 
T
A
 
A
D
 
A
L
 
L
A
 
M
T
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
S
V
 
V
I
 
V
V
 
A
K
|
K
P
|
P
H
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
P
 
-
L
x
A
A
 
E
V
 
Q
T
 
T
V
 
P
R
 
R
I
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
A
V
 
L
L
 
L
R
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
I
D
 
P
P
 
K
N
 
S
V
 
A
V
 
L
T
 
Y
L
 
L
L
 
V
A
 
T
T
 
-
E
 
-
P
 
-
N
 
G
D
|
D
G
|
G
A
 
R
I
 
I
V
x
G
Q
x
A
S
 
A
L
 
L
A
 
T
V
 
A
R
 
H
P
 
P
E
 
D
I
 
I
K
 
A
L
 
G
I
 
V
D
 
V
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
Q
 
E
-
x
V
-
 
A
-
 
R
-
 
S
-
x
I
N
 
N
G
 
R
T
 
A
W
 
L
L
 
A
E
 
A
R
 
K
N
 
D
A
 
G
H
 
P
Q
 
I
A
 
V
Q
 
P
V
 
L
Y
 
I
T
 
A
E
|
E
K
x
T
A
x
G
G
 
G
V
 
I
N
 
N
Q
 
A
I
 
M
V
 
I
I
 
A
D
 
D
S
 
A
A
 
T
D
 
A
D
 
L
I
 
P
K
 
E
A
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
D
N
 
D
I
 
V
A
 
V
F
 
T
S
 
S
L
 
A
A
 
F
L
 
R
Y
 
S
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
M
 
R
C
|
C
T
 
S
A
 
A
P
 
L
Q
 
R
N
 
L
I
 
L
Y
 
F
V
 
V
P
 
Q
R
 
E
D
 
D
G
 
-
I
 
-
Q
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
V
F
 
A
D
 
D
E
 
R
V
 
M
A
 
I
Q
 
E
A
 
M
I
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
A
Q
 
R
K
 
E
L
 
L
-
 
K
V
 
I
A
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
S
R
 
D
A
 
V
V
 
A
E
 
T
L
 
H
L
 
V
G
 
G
A
 
P
I
 
V
Q
 
I
N
 
D
E
 
V
G
 
E
V
 
A
A
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
D
 
D
E
 
-
A
 
-
A
 
A
T
 
H
L
 
I
G
 
A
R
 
R
V
 
M
L
 
K
V
 
T
E
 
E
S
 
A
Q
 
R
A
 
L
-
 
H
L
 
F
E
 
A
H
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
P
A
 
E
G
 
G
A
 
C
R
 
F
V
 
V
R
 
-
T
 
A
P
 
P
L
 
H
V
 
I
L
 
F
Q
 
E
L
 
L
D
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
T
D
 
E
G
 
A
E
 
G
Q
 
Q
F
 
L
T
 
T
K
 
E
E
|
E
W
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
I
 
I
S
 
L
F
 
H
V
 
V
I
 
V
A
 
R
T
 
Y
D
 
R
S
 
P
T
 
E
A
 
N
H
 
L
S
 
E
L
 
R
D
 
V
L
 
L
A
 
R
G
 
A
T
 
I
I
 
E
A
 
R
A
 
T
E
 
G
H
 
Y
G
 
G
A
 
-
L
|
L
T
 
T
L
 
L
S
 
G
V
 
V
Y
 
H
S
 
S
-
 
R
-
 
I
-
 
D
-
 
D
T
 
S
D
 
I
E
 
E
A
 
A
V
 
I
L
 
I
D
 
D
Q
 
R
A
 
V
H
 
Q
E
 
V
A
 
-
S
 
-
I
 
-
R
 
-
G
 
G
G
 
N
V
 
I
A
 
Y
L
 
V
S
 
N
I
 
R
N
 
N
L
 
M
T
 
I
G
 
G
G
 
A
V
 
V
F
 
V
V
 
G
N
 
V
Q
 
Q
S
 
P
A
x
F
A
 
G
F
 
G
S
 
N
D
 
G
F
 
L
H
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2eiwA Crystal analysis of delta1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus thermophilus with bound l-proline
25% identity, 60% coverage: 195:535/566 of query aligns to 172:499/516 of 2eiwA

query
sites
2eiwA
V
 
V
P
 
P
R
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
G
L
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
A
C
 
P
C
 
W
T
x
N
F
|
F
P
 
P
T
 
V
W
 
A
N
 
I
G
 
F
Y
 
T
P
 
G
G
 
M
L
 
I
F
 
V
A
 
G
D
 
P
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
A
K
|
K
P
 
P
H
 
A
P
 
E
G
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
V
P
 
V
L
 
G
A
 
A
V
 
K
T
 
V
V
 
F
R
 
-
I
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
E
V
 
I
L
 
F
R
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
D
 
P
P
 
P
N
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
N
L
 
F
L
 
L
A
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
P
N
 
G
D
 
V
G
 
G
A
 
E
I
 
E
V
 
V
Q
 
G
S
 
A
L
 
Y
A
 
L
V
 
V
R
 
E
-
 
H
P
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
R
L
 
F
I
 
I
D
 
N
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
L
Q
 
E
N
 
V
G
 
G
-
 
L
-
 
K
-
 
I
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
T
 
T
W
 
W
L
 
F
E
 
K
R
 
R
N
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
V
 
A
Y
 
Y
T
 
V
E
|
E
K
 
T
A
 
G
G
 
G
V
 
K
N
 
N
Q
 
A
I
 
I
V
 
I
I
 
V
D
 
D
S
 
E
A
 
T
D
 
A
D
 
D
I
 
F
K
 
D
A
 
L
V
 
A
A
 
A
R
 
E
N
 
G
I
 
V
A
 
V
F
 
V
S
 
S
L
 
A
A
 
Y
L
 
G
Y
 
F
S
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
M
 
K
C
|
C
T
x
S
A
 
A
P
 
A
Q
 
S
N
 
R
I
 
L
Y
 
I
V
 
L
P
 
T
R
 
Q
D
 
G
G
 
-
I
 
-
Q
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
A
F
 
Y
D
 
E
E
 
P
V
 
V
A
 
L
Q
 
E
A
 
R
I
 
V
A
 
L
G
 
K
A
 
R
V
 
A
Q
 
E
K
 
R
L
 
L
V
 
S
A
 
V
D
 
G
P
 
P
A
 
A
R
 
E
A
 
E
V
 
N
E
 
P
L
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
E
Q
 
Q
N
 
E
E
 
R
G
 
K
V
 
V
A
 
L
Q
 
S
R
 
Y
V
 
I
D
 
E
E
 
I
A
 
G
A
 
K
T
 
N
L
 
E
G
 
G
R
 
Q
V
 
L
L
 
V
V
 
L
E
 
G
S
 
G
Q
 
K
A
 
R
L
 
L
E
 
E
H
 
G
P
 
E
A
 
G
F
 
Y
A
 
F
G
 
I
A
 
A
R
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
P
L
 
T
V
 
V
L
 
F
Q
 
T
L
 
-
D
 
E
A
 
V
A
 
P
T
 
P
D
 
K
G
 
A
E
 
R
Q
 
I
F
 
A
T
 
Q
K
 
E
E
|
E
W
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
L
F
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
R
T
 
V
D
 
K
S
 
D
T
 
F
A
 
A
H
 
E
S
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
V
A
 
A
G
 
N
T
 
D
I
 
T
A
 
P
A
 
Y
E
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
G
S
 
G
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
T
 
R
D
 
K
E
 
R
A
 
E
V
 
H
L
 
L
D
 
E
Q
 
W
A
 
A
H
 
R
E
 
R
A
 
E
S
 
F
I
 
H
R
 
V
G
 
G
G
 
N
V
 
L
A
 
Y
L
 
F
S
 
N
I
 
R
N
 
K
L
 
I
T
|
T
G
|
G
G
x
A
V
 
L
F
 
V
V
 
G
N
 
V
Q
 
Q
S
 
P
A
 
-
A
 
-
F
|
F
S
 
G
D
 
G
F
 
F
H
 
K
G
 
L
T
 
S
G
 
G
A
 
T
N
 
N
P
 
A
A
 
K
A
x
T
N
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2j5nA 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus thermophirus with bound inhibitor glycine and NAD.
25% identity, 60% coverage: 195:535/566 of query aligns to 172:499/516 of 2j5nA

query
sites
2j5nA
V
 
V
P
 
P
R
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
G
L
 
V
V
 
V
L
x
I
G
x
A
C
x
P
C
x
W
T
x
N
F
 
F
P
 
P
T
 
V
W
 
A
N
x
I
G
 
F
Y
 
T
P
 
G
G
 
M
L
 
I
F
 
V
A
 
G
D
 
P
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
A
K
|
K
P
|
P
H
x
A
P
x
E
G
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
V
P
 
V
L
 
G
A
 
A
V
 
K
T
 
V
V
 
F
R
 
-
I
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
E
V
 
I
L
 
F
R
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
D
 
P
P
 
P
N
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
N
L
 
F
L
 
L
A
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
P
N
 
G
D
 
V
G
|
G
A
x
E
I
 
E
V
 
V
Q
x
G
S
x
A
L
 
Y
A
 
L
V
 
V
R
 
E
-
 
H
P
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
R
L
 
F
I
 
I
D
 
N
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
L
Q
 
E
N
x
V
G
 
G
-
 
L
-
 
K
-
 
I
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
T
 
T
W
 
W
L
 
F
E
 
K
R
 
R
N
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
V
 
A
Y
 
Y
T
 
V
E
|
E
K
x
T
A
x
G
G
 
G
V
 
K
N
 
D
Q
 
A
I
 
I
V
 
I
I
 
V
D
 
D
S
 
E
A
 
T
D
 
A
D
 
D
I
 
F
K
 
D
A
 
L
V
 
A
A
 
A
R
 
E
N
 
G
I
 
V
A
 
V
F
 
V
S
 
S
L
 
A
A
 
Y
L
 
G
Y
 
F
S
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
M
 
K
C
|
C
T
x
S
A
 
A
P
 
A
Q
 
S
N
 
R
I
 
L
Y
 
I
V
 
L
P
 
T
R
 
Q
D
 
G
G
 
-
I
 
-
Q
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
A
F
 
Y
D
 
E
E
 
P
V
 
V
A
 
L
Q
 
E
A
 
R
I
 
V
A
 
L
G
 
K
A
 
R
V
 
A
Q
 
E
K
 
R
L
 
L
V
 
S
A
 
V
D
 
G
P
 
P
A
 
A
R
 
E
A
 
E
V
 
N
E
 
P
L
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
E
Q
 
Q
N
 
E
E
 
R
G
 
K
V
 
V
A
 
L
Q
 
S
R
 
Y
V
 
I
D
 
E
E
 
I
A
 
G
A
 
K
T
 
N
L
 
E
G
 
G
R
 
Q
V
 
L
L
 
V
V
 
L
E
 
G
S
 
G
Q
 
K
A
 
R
L
 
L
E
 
E
H
 
G
P
 
E
A
 
G
F
 
Y
A
 
F
G
 
I
A
 
A
R
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
P
L
 
T
V
 
V
L
 
F
Q
 
T
L
 
-
D
 
E
A
 
V
A
 
P
T
 
P
D
 
K
G
 
A
E
 
R
Q
 
I
F
 
A
T
 
Q
K
 
E
E
|
E
W
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
L
F
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
R
T
 
V
D
 
K
S
 
D
T
 
F
A
 
A
H
 
E
S
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
V
A
 
A
G
 
N
T
 
D
I
 
T
A
 
P
A
 
Y
E
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
G
S
 
G
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
T
 
R
D
 
K
E
 
R
A
 
E
V
 
H
L
 
L
D
 
E
Q
 
W
A
 
A
H
 
R
E
 
R
A
 
E
S
 
F
I
 
H
R
 
V
G
 
G
G
 
N
V
 
L
A
 
Y
L
 
F
S
 
N
I
 
R
N
 
K
L
 
I
T
|
T
G
|
G
G
x
A
V
 
L
F
 
V
V
 
G
N
 
V
Q
 
Q
S
 
P
A
 
-
A
 
-
F
|
F
S
 
G
D
 
G
F
 
F
H
 
K
G
 
L
T
 
S
G
 
G
A
 
T
N
 
N
P
 
A
A
 
K
A
x
T
N
 
G
A
 
A

2ej6A Crystal analysis of delta1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus thermophilus with bound d-proline
25% identity, 60% coverage: 195:535/566 of query aligns to 172:499/516 of 2ej6A

query
sites
2ej6A
V
 
V
P
 
P
R
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
G
L
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
A
C
 
P
C
 
W
T
x
N
F
|
F
P
 
P
T
 
V
W
 
A
N
x
I
G
 
F
Y
 
T
P
 
G
G
 
M
L
 
I
F
 
V
A
 
G
D
 
P
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
A
K
|
K
P
 
P
H
 
A
P
 
E
G
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
V
P
 
V
L
 
G
A
 
A
V
 
K
T
 
V
V
 
F
R
 
-
I
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
E
V
 
I
L
 
F
R
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
D
 
P
P
 
P
N
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
N
L
 
F
L
 
L
A
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
P
N
 
G
D
 
V
G
 
G
A
 
E
I
 
E
V
 
V
Q
 
G
S
 
A
L
 
Y
A
 
L
V
 
V
R
 
E
-
 
H
P
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
R
L
 
F
I
 
I
D
 
N
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
L
Q
 
E
N
 
V
G
 
G
-
 
L
-
 
K
-
 
I
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
T
 
T
W
 
W
L
 
F
E
 
K
R
 
R
N
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
V
 
A
Y
 
Y
T
 
V
E
|
E
K
 
T
A
 
G
G
 
G
V
 
K
N
 
D
Q
 
A
I
 
I
V
 
I
I
 
V
D
 
D
S
 
E
A
 
T
D
 
A
D
 
D
I
 
F
K
 
D
A
 
L
V
 
A
A
 
A
R
 
E
N
 
G
I
 
V
A
 
V
F
 
V
S
 
S
L
 
A
A
 
Y
L
 
G
Y
 
F
S
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
M
 
K
C
|
C
T
x
S
A
 
A
P
 
A
Q
 
S
N
 
R
I
 
L
Y
 
I
V
 
L
P
 
T
R
 
Q
D
 
G
G
 
-
I
 
-
Q
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
A
F
 
Y
D
 
E
E
 
P
V
 
V
A
 
L
Q
 
E
A
 
R
I
 
V
A
 
L
G
 
K
A
 
R
V
 
A
Q
 
E
K
 
R
L
 
L
V
 
S
A
 
V
D
 
G
P
 
P
A
 
A
R
 
E
A
 
E
V
 
N
E
 
P
L
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
E
Q
 
Q
N
 
E
E
 
R
G
 
K
V
 
V
A
 
L
Q
 
S
R
 
Y
V
 
I
D
 
E
E
 
I
A
 
G
A
 
K
T
 
N
L
 
E
G
 
G
R
 
Q
V
 
L
L
 
V
V
 
L
E
 
G
S
 
G
Q
 
K
A
 
R
L
 
L
E
 
E
H
 
G
P
 
E
A
 
G
F
 
Y
A
 
F
G
 
I
A
 
A
R
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
P
L
 
T
V
 
V
L
 
F
Q
 
T
L
 
-
D
 
E
A
 
V
A
 
P
T
 
P
D
 
K
G
 
A
E
 
R
Q
 
I
F
 
A
T
 
Q
K
 
E
E
|
E
W
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
L
F
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
R
T
 
V
D
 
K
S
 
D
T
 
F
A
 
A
H
 
E
S
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
V
A
 
A
G
 
N
T
 
D
I
 
T
A
 
P
A
 
Y
E
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
G
S
 
G
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
T
 
R
D
 
K
E
 
R
A
 
E
V
 
H
L
 
L
D
 
E
Q
 
W
A
 
A
H
 
R
E
 
R
A
 
E
S
 
F
I
 
H
R
 
V
G
 
G
G
 
N
V
 
L
A
 
Y
L
 
F
S
 
N
I
 
R
N
 
K
L
 
I
T
|
T
G
|
G
G
x
A
V
 
L
F
 
V
V
 
G
N
 
V
Q
 
Q
S
 
P
A
 
-
A
 
-
F
|
F
S
 
G
D
 
G
F
 
F
H
 
K
G
 
L
T
 
S
G
 
G
A
 
T
N
 
N
P
 
A
A
 
K
A
x
T
N
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2eitA Crystal analysis of delta1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus thermophilus with bound l-alanine and NAD
25% identity, 60% coverage: 195:535/566 of query aligns to 172:499/516 of 2eitA

query
sites
2eitA
V
 
V
P
 
P
R
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
G
L
 
V
V
 
V
L
x
I
G
x
A
C
x
P
C
x
W
T
x
N
F
|
F
P
 
P
T
 
V
W
 
A
N
x
I
G
 
F
Y
 
T
P
 
G
G
 
M
L
 
I
F
 
V
A
 
G
D
 
P
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
A
K
|
K
P
|
P
H
x
A
P
x
E
G
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
V
P
 
V
L
 
G
A
 
A
V
 
K
T
 
V
V
 
F
R
 
-
I
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
E
V
 
I
L
 
F
R
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
D
 
P
P
 
P
N
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
N
L
 
F
L
 
L
A
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
P
N
 
G
D
 
V
G
|
G
A
x
E
I
 
E
V
 
V
Q
x
G
S
x
A
L
 
Y
A
 
L
V
 
V
R
 
E
-
 
H
P
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
R
L
 
F
I
 
I
D
 
N
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
L
Q
 
E
N
x
V
G
 
G
-
 
L
-
 
K
-
 
I
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
T
 
T
W
 
W
L
 
F
E
 
K
R
 
R
N
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
V
 
A
Y
 
Y
T
 
V
E
|
E
K
x
T
A
x
G
G
 
G
V
 
K
N
 
D
Q
 
A
I
 
I
V
 
I
I
 
V
D
 
D
S
 
E
A
 
T
D
 
A
D
 
D
I
 
F
K
 
D
A
 
L
V
 
A
A
 
A
R
 
E
N
 
G
I
 
V
A
 
V
F
 
V
S
 
S
L
 
A
A
 
Y
L
 
G
Y
 
F
S
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
M
 
K
C
|
C
T
x
S
A
 
A
P
 
A
Q
 
S
N
 
R
I
 
L
Y
 
I
V
 
L
P
 
T
R
 
Q
D
 
G
G
 
-
I
 
-
Q
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
A
F
 
Y
D
 
E
E
 
P
V
 
V
A
 
L
Q
 
E
A
 
R
I
 
V
A
 
L
G
 
K
A
 
R
V
 
A
Q
 
E
K
 
R
L
 
L
V
 
S
A
 
V
D
 
G
P
 
P
A
 
A
R
 
E
A
 
E
V
 
N
E
 
P
L
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
E
Q
 
Q
N
 
E
E
 
R
G
 
K
V
 
V
A
 
L
Q
 
S
R
 
Y
V
 
I
D
 
E
E
 
I
A
 
G
A
 
K
T
 
N
L
 
E
G
 
G
R
 
Q
V
 
L
L
 
V
V
 
L
E
 
G
S
 
G
Q
 
K
A
 
R
L
 
L
E
 
E
H
 
G
P
 
E
A
 
G
F
 
Y
A
 
F
G
 
I
A
 
A
R
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
P
L
 
T
V
 
V
L
 
F
Q
 
T
L
 
-
D
 
E
A
 
V
A
 
P
T
 
P
D
 
K
G
 
A
E
 
R
Q
 
I
F
 
A
T
 
Q
K
 
E
E
|
E
W
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
L
F
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
R
T
 
V
D
 
K
S
 
D
T
 
F
A
 
A
H
 
E
S
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
V
A
 
A
G
 
N
T
 
D
I
 
T
A
 
P
A
 
Y
E
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
G
S
 
G
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
T
 
R
D
 
K
E
 
R
A
 
E
V
 
H
L
 
L
D
 
E
Q
 
W
A
 
A
H
 
R
E
 
R
A
 
E
S
 
F
I
 
H
R
 
V
G
 
G
G
 
N
V
 
L
A
 
Y
L
 
F
S
 
N
I
 
R
N
 
K
L
 
I
T
|
T
G
|
G
G
x
A
V
 
L
F
 
V
V
 
G
N
 
V
Q
 
Q
S
 
P
A
 
-
A
 
-
F
|
F
S
 
G
D
 
G
F
 
F
H
 
K
G
 
L
T
 
S
G
 
G
A
 
T
N
 
N
P
 
A
A
 
K
A
x
T
N
 
G
A
 
A

2eiiA Crystal analysis of delta1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus thermophilus with bound l-valine and NAD.
25% identity, 60% coverage: 195:535/566 of query aligns to 172:499/516 of 2eiiA

query
sites
2eiiA
V
 
V
P
 
P
R
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
G
L
 
V
V
 
V
L
x
I
G
x
A
C
x
P
C
x
W
T
x
N
F
|
F
P
 
P
T
 
V
W
 
A
N
x
I
G
 
F
Y
 
T
P
 
G
G
 
M
L
 
I
F
 
V
A
 
G
D
 
P
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
A
K
|
K
P
|
P
H
x
A
P
x
E
G
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
V
P
 
V
L
 
G
A
 
A
V
 
K
T
 
V
V
 
F
R
 
-
I
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
E
V
 
I
L
 
F
R
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
D
 
P
P
 
P
N
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
N
L
 
F
L
 
L
A
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
P
N
 
G
D
 
V
G
|
G
A
x
E
I
 
E
V
 
V
Q
x
G
S
x
A
L
 
Y
A
 
L
V
 
V
R
 
E
-
 
H
P
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
R
L
 
F
I
 
I
D
 
N
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
L
Q
 
E
N
x
V
G
 
G
-
 
L
-
 
K
-
 
I
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
T
 
T
W
 
W
L
 
F
E
 
K
R
 
R
N
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
V
 
A
Y
 
Y
T
 
V
E
|
E
K
x
T
A
x
G
G
 
G
V
 
K
N
 
D
Q
 
A
I
 
I
V
 
I
I
 
V
D
 
D
S
 
E
A
 
T
D
 
A
D
 
D
I
 
F
K
 
D
A
 
L
V
 
A
A
 
A
R
 
E
N
 
G
I
 
V
A
 
V
F
 
V
S
 
S
L
 
A
A
 
Y
L
 
G
Y
 
F
S
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
M
 
K
C
|
C
T
x
S
A
 
A
P
 
A
Q
 
S
N
 
R
I
 
L
Y
 
I
V
 
L
P
 
T
R
 
Q
D
 
G
G
 
-
I
 
-
Q
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
A
F
 
Y
D
 
E
E
 
P
V
 
V
A
 
L
Q
 
E
A
 
R
I
 
V
A
 
L
G
 
K
A
 
R
V
 
A
Q
 
E
K
 
R
L
 
L
V
 
S
A
 
V
D
 
G
P
 
P
A
 
A
R
 
E
A
 
E
V
 
N
E
 
P
L
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
E
Q
 
Q
N
 
E
E
 
R
G
 
K
V
 
V
A
 
L
Q
 
S
R
 
Y
V
 
I
D
 
E
E
 
I
A
 
G
A
 
K
T
 
N
L
 
E
G
 
G
R
 
Q
V
 
L
L
 
V
V
 
L
E
 
G
S
 
G
Q
 
K
A
 
R
L
 
L
E
 
E
H
 
G
P
 
E
A
 
G
F
 
Y
A
 
F
G
 
I
A
 
A
R
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
P
L
 
T
V
 
V
L
 
F
Q
 
T
L
 
-
D
 
E
A
 
V
A
 
P
T
 
P
D
 
K
G
 
A
E
 
R
Q
 
I
F
 
A
T
 
Q
K
 
E
E
|
E
W
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
L
F
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
R
T
 
V
D
 
K
S
 
D
T
 
F
A
 
A
H
 
E
S
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
V
A
 
A
G
 
N
T
 
D
I
 
T
A
 
P
A
 
Y
E
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
G
L
|
L
T
 
T
L
 
G
S
 
G
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
T
 
R
D
 
K
E
 
R
A
 
E
V
 
H
L
 
L
D
 
E
Q
 
W
A
 
A
H
 
R
E
 
R
A
 
E
S
 
F
I
 
H
R
 
V
G
 
G
G
 
N
V
 
L
A
 
Y
L
 
F
S
 
N
I
 
R
N
 
K
L
 
I
T
|
T
G
|
G
G
x
A
V
 
L
F
 
V
V
 
G
N
 
V
Q
 
Q
S
 
P
A
 
-
A
 
-
F
|
F
S
 
G
D
 
G
F
 
F
H
 
K
G
 
L
T
 
S
G
 
G
A
 
T
N
 
N
P
 
A
A
 
K
A
x
T
N
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2ehuA Crystal analysis of 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus with bound NAD and inhibitor l-serine
25% identity, 60% coverage: 195:535/566 of query aligns to 172:499/516 of 2ehuA

query
sites
2ehuA
V
 
V
P
 
P
R
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
G
L
 
V
V
 
V
L
x
I
G
x
A
C
x
P
C
x
W
T
x
N
F
|
F
P
 
P
T
 
V
W
 
A
N
x
I
G
 
F
Y
 
T
P
 
G
G
 
M
L
 
I
F
 
V
A
 
G
D
 
P
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
A
K
|
K
P
|
P
H
x
A
P
x
E
G
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
V
P
 
V
L
 
G
A
 
A
V
 
K
T
 
V
V
 
F
R
 
-
I
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
E
V
 
I
L
 
F
R
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
D
 
P
P
 
P
N
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
N
L
 
F
L
 
L
A
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
P
N
 
G
D
 
V
G
|
G
A
x
E
I
 
E
V
 
V
Q
x
G
S
x
A
L
 
Y
A
 
L
V
 
V
R
 
E
-
 
H
P
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
R
L
 
F
I
 
I
D
 
N
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
L
Q
 
E
N
x
V
G
 
G
-
 
L
-
 
K
-
 
I
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
T
 
T
W
 
W
L
 
F
E
 
K
R
 
R
N
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
V
 
A
Y
 
Y
T
 
V
E
|
E
K
x
T
A
x
G
G
 
G
V
 
K
N
 
D
Q
 
A
I
 
I
V
 
I
I
 
V
D
 
D
S
 
E
A
 
T
D
 
A
D
 
D
I
 
F
K
 
D
A
 
L
V
 
A
A
 
A
R
 
E
N
 
G
I
 
V
A
 
V
F
 
V
S
 
S
L
 
A
A
 
Y
L
 
G
Y
 
F
S
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
M
x
K
C
|
C
T
x
S
A
 
A
P
 
A
Q
 
S
N
 
R
I
 
L
Y
 
I
V
 
L
P
 
T
R
 
Q
D
 
G
G
 
-
I
 
-
Q
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
A
F
 
Y
D
 
E
E
 
P
V
 
V
A
 
L
Q
 
E
A
 
R
I
 
V
A
 
L
G
 
K
A
 
R
V
 
A
Q
 
E
K
 
R
L
 
L
V
 
S
A
 
V
D
 
G
P
 
P
A
 
A
R
 
E
A
 
E
V
 
N
E
 
P
L
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
E
Q
 
Q
N
 
E
E
 
R
G
 
K
V
 
V
A
 
L
Q
 
S
R
 
Y
V
 
I
D
 
E
E
 
I
A
 
G
A
 
K
T
 
N
L
 
E
G
 
G
R
 
Q
V
 
L
L
 
V
V
 
L
E
 
G
S
 
G
Q
 
K
A
 
R
L
 
L
E
 
E
H
 
G
P
 
E
A
 
G
F
 
Y
A
 
F
G
 
I
A
 
A
R
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
P
L
 
T
V
 
V
L
 
F
Q
 
T
L
 
-
D
 
E
A
 
V
A
 
P
T
 
P
D
 
K
G
 
A
E
 
R
Q
 
I
F
 
A
T
 
Q
K
 
E
E
|
E
W
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
L
F
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
R
T
 
V
D
 
K
S
 
D
T
 
F
A
 
A
H
 
E
S
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
V
A
 
A
G
 
N
T
 
D
I
 
T
A
 
P
A
 
Y
E
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
G
S
 
G
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
T
 
R
D
 
K
E
 
R
A
 
E
V
 
H
L
 
L
D
 
E
Q
 
W
A
 
A
H
 
R
E
 
R
A
 
E
S
 
F
I
 
H
R
 
V
G
 
G
G
 
N
V
 
L
A
 
Y
L
 
F
S
 
N
I
 
R
N
 
K
L
 
I
T
|
T
G
|
G
G
x
A
V
 
L
F
 
V
V
 
G
N
 
V
Q
 
Q
S
 
P
A
 
-
A
 
-
F
|
F
S
 
G
D
 
G
F
 
F
H
 
K
G
 
L
T
 
S
G
 
G
A
 
T
N
 
N
P
 
A
A
 
K
A
x
T
N
 
G
A
 
A

2ehqA Crystal analysis of 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus with bound NADP (see paper)
25% identity, 60% coverage: 195:535/566 of query aligns to 172:499/516 of 2ehqA

query
sites
2ehqA
V
 
V
P
 
P
R
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
G
L
 
V
V
 
V
L
x
I
G
x
A
C
x
P
C
x
W
T
x
N
F
 
F
P
 
P
T
 
V
W
 
A
N
x
I
G
 
F
Y
 
T
P
 
G
G
 
M
L
 
I
F
 
V
A
 
G
D
 
P
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
A
K
|
K
P
|
P
H
x
A
P
x
E
G
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
V
P
 
V
L
 
G
A
 
A
V
 
K
T
 
V
V
 
F
R
 
-
I
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
E
V
 
I
L
 
F
R
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
D
 
P
P
 
P
N
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
N
L
 
F
L
 
L
A
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
P
N
 
G
D
x
V
G
|
G
A
x
E
I
 
E
V
 
V
Q
x
G
S
x
A
L
 
Y
A
 
L
V
 
V
R
 
E
-
 
H
P
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
R
L
 
F
I
 
I
D
 
N
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
L
Q
 
E
N
x
V
G
 
G
-
 
L
-
 
K
-
 
I
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
T
 
T
W
 
W
L
 
F
E
 
K
R
 
R
N
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
V
 
A
Y
 
Y
T
 
V
E
|
E
K
x
T
A
x
G
G
 
G
V
 
K
N
 
D
Q
 
A
I
 
I
V
 
I
I
 
V
D
 
D
S
 
E
A
 
T
D
 
A
D
 
D
I
 
F
K
 
D
A
 
L
V
 
A
A
 
A
R
 
E
N
 
G
I
 
V
A
 
V
F
 
V
S
 
S
L
 
A
A
 
Y
L
 
G
Y
 
F
S
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
M
 
K
C
|
C
T
 
S
A
 
A
P
 
A
Q
 
S
N
 
R
I
 
L
Y
 
I
V
 
L
P
 
T
R
 
Q
D
 
G
G
 
-
I
 
-
Q
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
A
F
 
Y
D
 
E
E
 
P
V
 
V
A
 
L
Q
 
E
A
 
R
I
 
V
A
 
L
G
 
K
A
 
R
V
 
A
Q
 
E
K
 
R
L
 
L
V
 
S
A
 
V
D
 
G
P
 
P
A
 
A
R
 
E
A
 
E
V
 
N
E
 
P
L
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
E
Q
 
Q
N
 
E
E
 
R
G
 
K
V
 
V
A
 
L
Q
 
S
R
 
Y
V
 
I
D
 
E
E
 
I
A
 
G
A
 
K
T
 
N
L
 
E
G
 
G
R
 
Q
V
 
L
L
 
V
V
 
L
E
 
G
S
 
G
Q
 
K
A
 
R
L
 
L
E
 
E
H
 
G
P
 
E
A
 
G
F
 
Y
A
 
F
G
 
I
A
 
A
R
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
P
L
 
T
V
 
V
L
 
F
Q
 
T
L
 
-
D
 
E
A
 
V
A
 
P
T
 
P
D
 
K
G
 
A
E
 
R
Q
 
I
F
 
A
T
 
Q
K
 
E
E
|
E
W
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
L
F
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
R
T
 
V
D
 
K
S
 
D
T
 
F
A
 
A
H
 
E
S
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
V
A
 
A
G
 
N
T
 
D
I
 
T
A
 
P
A
 
Y
E
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
G
S
 
G
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
T
 
R
D
 
K
E
 
R
A
 
E
V
 
H
L
 
L
D
 
E
Q
 
W
A
 
A
H
 
R
E
 
R
A
 
E
S
 
F
I
 
H
R
 
V
G
 
G
G
 
N
V
 
L
A
 
Y
L
 
F
S
 
N
I
 
R
N
 
K
L
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
L
F
 
V
V
 
G
N
 
V
Q
 
Q
S
 
P
A
 
-
A
 
-
F
|
F
S
 
G
D
 
G
F
 
F
H
 
K
G
 
L
T
 
S
G
 
G
A
 
T
N
 
N
P
 
A
A
 
K
A
x
T
N
 
G
A
 
A

2bhqA Crystal analysis of 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus with bound product glutamate. (see paper)
25% identity, 60% coverage: 195:535/566 of query aligns to 172:499/516 of 2bhqA

query
sites
2bhqA
V
 
V
P
 
P
R
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
G
L
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
A
C
 
P
C
 
W
T
x
N
F
|
F
P
 
P
T
 
V
W
 
A
N
x
I
G
 
F
Y
 
T
P
 
G
G
 
M
L
 
I
F
 
V
A
 
G
D
 
P
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
A
K
|
K
P
 
P
H
 
A
P
 
E
G
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
V
P
 
V
L
 
G
A
 
A
V
 
K
T
 
V
V
 
F
R
 
-
I
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
E
V
 
I
L
 
F
R
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
D
 
P
P
 
P
N
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
N
L
 
F
L
 
L
A
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
P
N
 
G
D
 
V
G
 
G
A
 
E
I
 
E
V
 
V
Q
 
G
S
 
A
L
 
Y
A
 
L
V
 
V
R
 
E
-
 
H
P
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
R
L
 
F
I
 
I
D
 
N
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
L
Q
 
E
N
 
V
G
 
G
-
 
L
-
 
K
-
 
I
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
T
 
T
W
 
W
L
 
F
E
 
K
R
 
R
N
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
V
 
A
Y
 
Y
T
 
V
E
|
E
K
 
T
A
 
G
G
 
G
V
 
K
N
 
D
Q
 
A
I
 
I
V
 
I
I
 
V
D
 
D
S
 
E
A
 
T
D
 
A
D
 
D
I
 
F
K
 
D
A
 
L
V
 
A
A
 
A
R
 
E
N
 
G
I
 
V
A
 
V
F
 
V
S
 
S
L
 
A
A
 
Y
L
 
G
Y
 
F
S
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
M
x
K
C
|
C
T
x
S
A
 
A
P
 
A
Q
 
S
N
 
R
I
 
L
Y
 
I
V
 
L
P
 
T
R
 
Q
D
 
G
G
 
-
I
 
-
Q
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
A
F
 
Y
D
 
E
E
 
P
V
 
V
A
 
L
Q
 
E
A
 
R
I
 
V
A
 
L
G
 
K
A
 
R
V
 
A
Q
 
E
K
 
R
L
 
L
V
 
S
A
 
V
D
 
G
P
 
P
A
 
A
R
 
E
A
 
E
V
 
N
E
 
P
L
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
E
Q
 
Q
N
 
E
E
 
R
G
 
K
V
 
V
A
 
L
Q
 
S
R
 
Y
V
 
I
D
 
E
E
 
I
A
 
G
A
 
K
T
 
N
L
 
E
G
 
G
R
 
Q
V
 
L
L
 
V
V
 
L
E
 
G
S
 
G
Q
 
K
A
 
R
L
 
L
E
 
E
H
 
G
P
 
E
A
 
G
F
 
Y
A
 
F
G
 
I
A
 
A
R
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
P
L
 
T
V
 
V
L
 
F
Q
 
T
L
 
-
D
 
E
A
 
V
A
 
P
T
 
P
D
 
K
G
 
A
E
 
R
Q
 
I
F
 
A
T
 
Q
K
 
E
E
|
E
W
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
L
F
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
R
T
 
V
D
 
K
S
 
D
T
 
F
A
 
A
H
 
E
S
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
V
A
 
A
G
 
N
T
 
D
I
 
T
A
 
P
A
 
Y
E
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
G
S
 
G
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
T
 
R
D
 
K
E
 
R
A
 
E
V
 
H
L
 
L
D
 
E
Q
 
W
A
 
A
H
 
R
E
 
R
A
 
E
S
 
F
I
 
H
R
 
V
G
 
G
G
 
N
V
 
L
A
 
Y
L
 
F
S
 
N
I
 
R
N
 
K
L
 
I
T
|
T
G
|
G
G
x
A
V
 
L
F
 
V
V
 
G
N
 
V
Q
 
Q
S
 
P
A
 
-
A
 
-
F
|
F
S
 
G
D
 
G
F
 
F
H
 
K
G
 
L
T
 
S
G
 
G
A
 
T
N
 
N
P
 
A
A
 
K
A
x
T
N
 
G
A
 
A

2bhpA Crystal analysis of 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus with bound NAD. (see paper)
25% identity, 60% coverage: 195:535/566 of query aligns to 172:499/516 of 2bhpA

query
sites
2bhpA
V
 
V
P
 
P
R
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
G
L
 
V
V
 
V
L
x
I
G
x
A
C
x
P
C
x
W
T
x
N
F
 
F
P
 
P
T
 
V
W
 
A
N
x
I
G
 
F
Y
 
T
P
 
G
G
 
M
L
 
I
F
 
V
A
 
G
D
 
P
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
A
K
|
K
P
|
P
H
x
A
P
x
E
G
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
V
P
 
V
L
 
G
A
 
A
V
 
K
T
 
V
V
 
F
R
 
-
I
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
E
V
 
I
L
 
F
R
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
D
 
P
P
 
P
N
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
N
L
 
F
L
 
L
A
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
P
N
 
G
D
 
V
G
|
G
A
x
E
I
 
E
V
 
V
Q
x
G
S
x
A
L
 
Y
A
 
L
V
 
V
R
 
E
-
 
H
P
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
R
L
 
F
I
 
I
D
 
N
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
L
Q
 
E
N
x
V
G
 
G
-
 
L
-
 
K
-
 
I
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
T
 
T
W
 
W
L
 
F
E
 
K
R
 
R
N
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
V
 
A
Y
 
Y
T
 
V
E
|
E
K
x
T
A
x
G
G
 
G
V
 
K
N
 
D
Q
 
A
I
 
I
V
 
I
I
 
V
D
 
D
S
 
E
A
 
T
D
 
A
D
 
D
I
 
F
K
 
D
A
 
L
V
 
A
A
 
A
R
 
E
N
 
G
I
 
V
A
 
V
F
 
V
S
 
S
L
 
A
A
 
Y
L
 
G
Y
 
F
S
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
M
 
K
C
|
C
T
 
S
A
 
A
P
 
A
Q
 
S
N
 
R
I
 
L
Y
 
I
V
 
L
P
 
T
R
 
Q
D
 
G
G
 
-
I
 
-
Q
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
A
F
 
Y
D
 
E
E
 
P
V
 
V
A
 
L
Q
 
E
A
 
R
I
 
V
A
 
L
G
 
K
A
 
R
V
 
A
Q
 
E
K
 
R
L
 
L
V
 
S
A
 
V
D
 
G
P
 
P
A
 
A
R
 
E
A
 
E
V
 
N
E
 
P
L
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
E
Q
 
Q
N
 
E
E
 
R
G
 
K
V
 
V
A
 
L
Q
 
S
R
 
Y
V
 
I
D
 
E
E
 
I
A
 
G
A
 
K
T
 
N
L
 
E
G
 
G
R
 
Q
V
 
L
L
 
V
V
 
L
E
 
G
S
 
G
Q
 
K
A
 
R
L
 
L
E
 
E
H
 
G
P
 
E
A
 
G
F
 
Y
A
 
F
G
 
I
A
 
A
R
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
P
L
 
T
V
 
V
L
 
F
Q
 
T
L
 
-
D
 
E
A
 
V
A
 
P
T
 
P
D
 
K
G
 
A
E
 
R
Q
 
I
F
 
A
T
 
Q
K
 
E
E
|
E
W
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
L
F
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
R
T
 
V
D
 
K
S
 
D
T
 
F
A
 
A
H
 
E
S
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
V
A
 
A
G
 
N
T
 
D
I
 
T
A
 
P
A
 
Y
E
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
G
S
 
G
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
T
 
R
D
 
K
E
 
R
A
 
E
V
 
H
L
 
L
D
 
E
Q
 
W
A
 
A
H
 
R
E
 
R
A
 
E
S
 
F
I
 
H
R
 
V
G
 
G
G
 
N
V
 
L
A
 
Y
L
 
F
S
 
N
I
 
R
N
 
K
L
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
L
F
 
V
V
 
G
N
 
V
Q
 
Q
S
 
P
A
 
-
A
 
-
F
|
F
S
 
G
D
 
G
F
 
F
H
 
K
G
 
L
T
 
S
G
 
G
A
 
T
N
 
N
P
 
A
A
 
K
A
x
T
N
 
G
A
 
A

1eyyA Crystal structure of the NADP+ dependent aldehyde dehydrogenase from vibrio harveyi. (see paper)
27% identity, 51% coverage: 198:488/566 of query aligns to 134:410/504 of 1eyyA

query
sites
1eyyA
G
 
G
T
 
P
A
 
V
L
 
A
V
 
V
L
x
F
G
 
G
C
 
A
C
x
S
T
x
N
F
 
F
P
 
P
T
 
L
W
 
A
N
 
F
G
 
S
Y
 
A
P
 
A
G
 
G
-
 
G
-
 
D
L
 
T
F
 
A
A
 
S
D
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
G
 
G
N
 
C
A
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
V
K
|
K
P
 
G
H
|
H
P
x
T
G
 
A
A
 
H
I
 
P
L
 
G
P
 
T
L
 
S
A
 
Q
V
 
I
T
 
V
V
 
A
R
 
E
I
 
C
A
 
I
R
 
E
D
 
Q
V
 
A
L
 
L
R
 
K
E
 
Q
A
 
E
G
 
Q
F
 
L
D
 
P
P
 
Q
N
 
A
V
 
I
V
 
F
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
-
T
 
-
E
 
Q
P
 
G
N
 
N
D
 
Q
G
x
R
A
 
A
I
 
L
V
x
G
Q
|
Q
S
 
A
L
 
L
A
 
V
V
 
S
R
 
H
P
 
P
E
 
E
I
 
I
K
 
K
L
 
A
I
 
V
D
 
G
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
 
V
Q
 
G
N
x
G
G
 
G
T
 
R
W
 
A
L
|
L
E
 
F
R
 
N
N
 
L
A
 
A
H
 
H
Q
 
E
-
 
R
-
 
P
-
 
E
-
 
P
A
 
I
Q
 
P
V
 
F
Y
 
Y
T
 
G
E
|
E
K
 
L
A
 
G
G
 
A
V
 
I
N
 
N
-
 
P
Q
 
T
I
 
F
V
 
I
I
 
F
D
 
P
S
 
S
A
 
A
D
 
M
D
 
R
I
 
A
K
 
K
A
 
A
-
 
D
V
 
L
A
 
A
R
 
D
N
 
Q
I
 
F
A
 
V
F
 
A
S
 
S
L
 
M
A
 
T
L
 
M
Y
 
G
S
 
C
G
 
G
Q
 
Q
M
 
F
C
|
C
T
 
T
A
 
K
P
 
P
Q
 
G
N
 
V
I
 
V
Y
 
F
V
 
-
P
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
A
I
 
L
Q
 
N
T
 
T
A
 
P
D
 
E
G
 
-
T
 
T
L
 
Q
S
 
A
F
 
F
D
 
I
E
 
E
V
 
T
A
 
A
Q
 
Q
A
 
S
I
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
L
V
 
I
A
 
R
D
 
Q
P
 
Q
A
 
S
R
 
P
A
 
S
V
 
T
E
 
L
L
 
L
L
 
T
G
 
P
A
 
G
I
|
I
Q
 
R
N
 
D
E
 
S
G
 
Y
V
 
Q
A
 
S
Q
 
Q
R
 
V
V
 
V
D
 
S
E
 
R
A
 
G
A
 
S
T
 
D
L
 
D
G
 
G
R
 
I
V
 
D
L
 
V
V
 
T
E
 
F
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
L
 
-
E
 
E
H
 
S
P
 
P
A
 
C
F
 
V
A
 
A
G
 
S
A
 
A
R
 
L
V
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
F
V
 
V
L
 
T
Q
 
S
L
 
S
D
 
E
A
 
N
A
 
W
T
 
R
D
 
K
G
 
H
E
 
P
Q
 
A
F
 
W
T
 
E
K
 
E
E
 
E
W
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
I
 
Q
S
 
S
F
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
V
T
 
C
D
 
E
S
 
N
T
 
V
A
 
A
H
 
D
S
 
M
L
 
L
D
 
S
L
 
L
A
 
S
G
 
E
T
 
M
I
 
L
A
 
A
A
 
-
E
 
-
H
 
-
G
 
G
A
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
A
S
 
T
V
 
I
Y
 
H
S
 
A
T
 
T
D
 
E
E
 
E

6j76A Structure of 3,6-anhydro-l-galactose dehydrogenase in complex with nap (see paper)
26% identity, 68% coverage: 87:469/566 of query aligns to 39:402/477 of 6j76A

query
sites
6j76A
S
 
S
D
 
D
P
 
A
D
 
E
A
 
R
L
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
T
E
 
T
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
D
 
E
W
 
W
R
 
-
A
 
A
A
 
K
G
 
Q
P
 
P
Q
 
A
A
 
R
W
 
Q
I
 
R
G
 
A
V
 
E
S
 
V
L
 
L
E
 
R
I
 
K
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
N
 
I
R
 
R
A
 
D
S
 
N
F
 
K
E
 
Q
I
 
Y
G
 
L
Y
 
A
S
 
E
V
 
L
M
 
L
H
 
-
T
 
V
T
 
K
G
 
E
Q
 
Q
A
 
G
F
 
K
M
 
L
M
 
L
A
 
K
F
 
V
Q
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
E
P
 
V
H
 
E
A
 
A
Q
 
T
D
 
S
R
 
T
A
 
F
L
 
I
E
 
E
A
 
-
V
 
-
V
 
-
Y
 
Y
A
 
A
W
 
C
D
 
D
Q
 
W
L
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
M
P
 
D
A
 
G
D
 
D
A
 
I
H
 
-
W
 
-
E
 
V
K
 
K
P
 
S
Q
 
D
G
 
N
K
 
A
N
 
N
P
 
E
P
 
Q
L
 
I
A
 
M
M
 
I
Q
 
H
K
 
K
R
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
V
 
I
P
 
P
R
 
R
G
 
G
T
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
A
L
x
I
G
x
T
C
x
A
C
x
W
T
x
N
F
 
F
P
 
P
T
 
L
W
 
A
N
 
L
G
 
A
Y
 
G
P
 
R
G
 
K
L
 
I
F
 
G
A
 
P
D
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
S
V
 
I
I
 
V
V
 
V
K
|
K
P
|
P
H
x
T
P
x
S
G
 
E
A
 
T
I
 
-
L
 
-
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
-
T
 
T
V
 
L
R
 
E
I
 
L
A
 
G
R
 
Y
D
 
-
V
 
L
L
 
A
R
 
E
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
F
 
I
D
 
P
P
 
A
N
 
G
V
 
V
V
 
L
T
 
N
L
 
I
L
 
V
A
 
T
T
 
G
E
 
-
P
 
-
N
x
G
D
x
G
G
x
R
A
 
T
I
 
L
V
x
G
Q
x
N
S
 
E
L
 
L
A
 
V
V
 
G
R
 
H
P
 
R
E
 
M
I
 
T
K
 
N
L
 
M
I
 
V
D
 
S
F
 
M
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
Q
 
P
N
x
A
G
 
G
T
 
Q
W
x
S
L
x
I
E
 
I
R
 
R
N
 
A
A
 
S
-
 
A
-
 
N
H
 
N
Q