SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_06327 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_06327 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6s87D Crystal structure of 2-methylcitrate synthase (prpc) from pseudomonas aeruginosa in complex with oxaloacetate.
54% identity, 92% coverage: 22:272/272 of query aligns to 2:249/365 of 6s87D

query
sites
6s87D
L
 
L
S
 
R
G
 
G
V
 
Q
T
 
V
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
T
 
T
A
 
A
L
 
L
C
 
S
T
 
T
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
T
 
E
G
 
G
N
 
A
D
 
G
L
 
L
H
 
T
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
I
 
V
L
 
R
D
 
D
I
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
A
C
 
A
E
 
I
F
 
F
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
V
 
L
H
 
Y
E
 
G
K
 
E
L
 
L
P
 
P
T
 
N
Q
 
K
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
T
 
D
A
 
A
Y
 
Y
K
 
L
T
 
K
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
A
 
G
L
 
Q
R
 
R
G
 
D
L
 
L
P
 
P
A
 
Q
N
 
A
V
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
V
L
 
L
E
 
E
W
 
R
I
 
I
P
 
P
A
 
K
A
 
D
A
 
A
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
D
V
 
V
M
 
M
R
 
R
T
 
T
G
 
G
V
 
A
S
 
S
V
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
L
L
 
E
P
 
P
E
 
E
K
 
L
D
 
-
D
 
-
H
 
-
N
 
S
L
 
F
P
 
D
G
 
Q
A
 
Q
R
 
R
D
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
D
K
 
R
L
 
L
M
 
L
A
 
A
S
 
A
L
 
F
G
 
P
S
 
A
M
 
I
L
 
M
L
 
T
Y
 
Y
W
 
W
Y
 
Y
H
 
R
Y
 
F
S
 
T
H
 
H
N
 
E
G
 
G
K
 
Q
R
 
R
I
 
I
E
 
D
V
 
C
E
 
N
T
 
S
D
 
D
D
 
E
D
 
P
S
 
T
I
 
I
G
 
G
G
 
G
H
 
H
F
 
F
L
 
L
H
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
H
G
 
G
V
 
K
E
 
K
P
 
P
S
 
S
K
 
E
S
 
L
W
 
H
V
 
V
D
 
K
A
 
V
M
 
M
H
 
N
V
 
V
S
 
S
L
 
L
N
 
I
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
|
H
E
 
E
F
 
F
N
|
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
F
T
 
T
G
 
A
R
 
R
V
 
V
I
 
C
A
 
A
G
 
S
T
 
T
G
 
L
S
 
S
D
 
D
I
 
L
Y
 
Y
S
 
S
A
 
C
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
S
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
K
 
L
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
E
 
E
V
 
A
A
 
A
F
 
M
E
 
E
I
 
L
Q
 
I
S
 
E
R
 
R
Y
 
F
Q
 
S
T
 
S
P
 
P
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
E
 
T
S
 
A
D
 
E
I
 
L
R
 
L
R
 
K
R
 
M
V
 
L
E
 
E
N
 
R
K
 
K
E
 
D
V
 
K
V
 
I
I
 
M
G
 
G
F
 
F

Sites not aligning to the query:

O34002 2-methylcitrate synthase; 2-MCS; MCS; Citrate synthase; EC 2.3.3.5; EC 2.3.3.16 from Antarctic bacterium DS2-3R (see 2 papers)
44% identity, 83% coverage: 15:240/272 of query aligns to 3:227/379 of O34002

query
sites
O34002
K
 
E
P
 
P
K
 
T
K
 
I
S
 
H
V
 
K
A
 
G
L
 
L
S
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
D
N
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
I
C
 
S
T
 
K
V
 
V
G
 
N
K
 
S
T
 
D
G
 
T
N
 
N
D
 
S
L
 
L
H
 
L
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
P
I
 
V
L
 
Q
D
 
E
I
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
K
C
 
C
E
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
Q
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
V
 
W
H
 
N
E
 
S
K
 
E
L
 
L
P
 
P
T
 
N
Q
 
D
A
 
S
E
 
E
L
 
L
T
 
K
A
 
A
Y
 
F
K
 
V
T
 
N
K
 
F
L
 
E
K
 
R
A
 
S
L
 
H
R
 
R
G
 
K
L
 
L
P
 
D
A
 
E
N
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
G
A
 
A
L
 
I
E
 
D
W
 
L
I
 
L
P
 
S
A
 
T
A
 
A
A
 
C
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
D
V
 
V
M
 
A
R
 
R
T
 
T
G
 
A
V
 
V
S
 
S
V
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
A
V
 
N
L
 
H
P
 
A
E
 
R
K
 
A
D
 
Q
D
 
D
H
 
S
N
 
S
L
 
P
P
 
E
G
 
A
A
 
N
R
 
L
D
 
E
I
 
K
A
 
A
D
 
M
K
 
S
L
 
L
M
 
L
A
 
A
S
 
T
L
 
F
G
 
P
S
 
S
M
 
V
L
 
V
L
 
A
Y
 
Y
W
 
D
Y
 
Q
H
 
R
Y
 
R
S
 
R
H
 
R
N
 
G
G
 
E
K
 
E
R
 
L
I
 
I
E
 
E
V
 
P
E
 
R
T
 
E
D
 
D
D
 
L
D
 
D
S
 
-
I
 
Y
G
 
S
G
 
A
H
 
N
F
 
F
L
 
L
H
 
W
L
 
M
L
 
T
H
 
F
G
 
G
V
 
E
E
 
E
P
 
A
S
 
A
K
 
P
S
 
E
W
 
V
V
 
V
D
 
E
A
 
A
M
 
F
H
 
N
V
 
V
S
 
S
L
 
M
N
 
I
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
 
H
E
 
S
F
 
F
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
T
F
 
F
T
 
T
G
 
A
R
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
T
G
 
S
T
 
T
G
 
L
S
 
A
D
 
D
I
 
L
Y
 
H
S
 
S
A
 
A
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
G
P
 
P
K
 
L
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1a59A Cold-active citrate synthase (see paper)
44% identity, 83% coverage: 15:240/272 of query aligns to 1:225/377 of 1a59A

query
sites
1a59A
K
 
E
P
 
P
K
 
T
K
 
I
S
 
H
V
 
K
A
 
G
L
 
L
S
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
D
N
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
I
C
 
S
T
 
K
V
 
V
G
 
N
K
 
S
T
 
D
G
 
T
N
 
N
D
 
S
L
 
L
H
 
L
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
P
I
 
V
L
 
Q
D
 
E
I
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
K
C
 
C
E
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
Q
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
V
 
W
H
 
N
E
 
S
K
 
E
L
 
L
P
 
P
T
 
N
Q
 
D
A
 
S
E
 
E
L
 
L
T
 
K
A
 
A
Y
 
F
K
 
V
T
 
N
K
 
F
L
 
E
K
 
R
A
 
S
L
 
H
R
 
R
G
 
K
L
 
L
P
 
D
A
 
E
N
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
G
A
 
A
L
 
I
E
 
D
W
 
L
I
 
L
P
 
S
A
 
T
A
 
A
A
 
C
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
D
V
 
V
M
 
A
R
 
R
T
 
T
G
 
A
V
 
V
S
 
S
V
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
A
V
 
N
L
 
H
P
 
A
E
 
R
K
 
A
D
 
Q
D
 
D
H
 
S
N
 
S
L
 
P
P
 
E
G
 
A
A
 
N
R
 
L
D
 
E
I
 
K
A
 
A
D
 
M
K
 
S
L
 
L
M
 
L
A
 
A
S
 
T
L
 
F
G
 
P
S
 
S
M
 
V
L
 
V
L
 
A
Y
 
Y
W
 
D
Y
 
Q
H
 
R
Y
 
R
S
 
R
H
 
R
N
 
G
G
 
E
K
 
E
R
 
L
I
 
I
E
 
E
V
 
P
E
 
R
T
 
E
D
 
D
D
 
L
D
 
D
S
 
-
I
 
Y
G
 
S
G
 
A
H
 
N
F
 
F
L
 
L
H
 
W
L
 
M
L
 
T
H
 
F
G
 
G
V
 
E
E
 
E
P
 
A
S
 
A
K
 
P
S
 
E
W
 
V
V
 
V
D
 
E
A
 
A
M
 
F
H
 
N
V
 
V
S
 
S
L
 
M
N
 
I
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
 
H
E
 
S
F
 
F
N
 
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
F
T
 
T
G
 
A
R
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
T
G
 
S
T
 
T
G
 
L
S
 
A
D
 
D
I
 
L
Y
 
H
S
 
S
A
 
A
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
G
P
|
P
K
x
L
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
|
A
N
 
N
E
 
E

Sites not aligning to the query:

I6Y9Q3 2-methylcitrate synthase; 2-MCS; MCS; Citrate synthase; EC 2.3.3.5; EC 2.3.3.16 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv)
38% identity, 95% coverage: 15:272/272 of query aligns to 25:279/393 of I6Y9Q3

query
sites
I6Y9Q3
K
 
R
P
 
P
K
 
D
K
 
I
S
 
K
V
 
K
A
 
G
L
 
L
S
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
V
A
 
V
G
 
D
N
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
I
C
 
S
T
 
K
V
 
V
G
 
V
K
 
P
T
 
Q
G
 
T
N
 
N
D
 
S
L
 
L
H
 
T
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
P
I
 
V
L
 
Q
D
 
D
I
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
R
C
 
C
E
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
Q
I
 
V
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
L
 
L
V
 
W
H
 
R
E
 
G
K
 
E
L
 
L
P
 
P
T
 
T
Q
 
D
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
A
A
 
L
Y
 
F
K
 
S
T
 
Q
K
x
R
L
 
E
K
 
R
A
 
A
L
 
S
R
 
R
G
 
R
L
 
V
P
 
D
A
 
R
N
 
S
V
 
M
K
 
L
A
 
S
A
 
L
L
 
L
E
 
A
W
 
K
I
 
L
P
 
P
A
 
D
A
 
N
A
 
C
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
D
V
 
V
M
 
V
R
 
R
T
 
T
G
 
A
V
 
I
S
 
S
V
 
Y
L
 
L
G
 
G
T
 
A
V
 
E
L
 
D
P
 
P
E
 
D
K
 
E
D
 
D
D
 
D
H
 
A
N
 
A
L
 
-
P
 
-
G
 
A
A
 
N
R
 
R
D
 
A
I
 
K
A
 
A
D
 
M
K
 
R
L
 
M
M
 
M
A
 
A
S
 
V
L
 
L
G
 
P
S
 
T
M
 
I
L
 
V
L
 
A
Y
 
I
W
 
D
Y
 
M
H
 
R
Y
 
R
S
 
R
H
 
R
N
 
G
G
 
L
K
 
P
R
 
P
I
 
I
E
 
A
V
 
P
E
 
H
T
 
S
D
 
G
D
 
L
D
 
-
S
 
G
I
 
Y
G
 
A
G
 
Q
H
 
N
F
 
F
L
 
L
H
 
H
L
 
M
L
 
C
H
 
F
G
 
G
V
 
E
E
 
V
P
 
P
S
 
E
K
 
T
S
 
A
W
 
V
V
 
V
D
 
S
A
 
A
M
 
F
H
 
E
V
 
Q
S
 
S
L
 
M
N
 
I
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
|
H
E
 
G
F
 
F
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
T
F
 
F
T
 
A
G
 
A
R
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
T
G
 
S
T
 
T
G
 
Q
S
 
S
D
 
D
I
 
I
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
G
P
 
R
K
 
L
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
E
 
E
V
 
A
A
 
V
F
 
M
E
 
H
I
 
D
Q
 
M
S
 
I
R
 
E
Y
 
I
Q
 
G
T
 
D
P
 
P
D
 
A
E
 
N
A
 
A
E
 
R
S
 
E
D
 
W
I
 
L
R
 
R
R
 
A
R
 
K
V
 
L
E
 
A
N
 
R
K
 
K
E
 
E
V
 
K
V
 
I
I
 
M
G
 
G
F
 
F

Sites not aligning to the query:

1aj8A Citrate synthase from pyrococcus furiosus (see paper)
37% identity, 92% coverage: 22:271/272 of query aligns to 5:254/371 of 1aj8A

query
sites
1aj8A
L
 
L
S
 
E
G
 
D
V
 
V
T
 
Y
A
 
I
G
 
D
N
 
Q
T
 
T
A
 
N
L
 
I
C
 
C
T
 
Y
V
 
I
G
 
D
K
 
G
T
 
K
G
 
E
N
 
G
D
 
K
L
 
L
H
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
S
I
 
V
L
 
E
D
 
E
I
 
L
A
 
A
G
 
E
N
 
L
C
 
S
E
 
T
F
 
F
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
V
 
W
H
 
W
E
 
G
K
 
K
L
 
L
P
 
P
T
 
S
Q
 
L
A
 
S
E
 
E
L
 
L
T
 
E
A
 
N
Y
 
F
K
 
K
T
 
K
K
 
E
L
 
L
K
 
A
A
 
K
L
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
K
N
 
E
V
 
V
K
 
I
A
 
E
A
 
I
L
 
M
E
 
E
W
 
A
I
 
L
P
 
P
A
 
K
A
 
N
A
 
T
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
G
V
 
A
M
 
L
R
 
R
T
 
T
G
 
I
V
 
I
S
 
S
V
 
Y
L
 
L
G
 
G
T
 
N
V
 
I
L
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
D
D
 
D
D
 
S
H
 
G
N
 
D
L
 
I
P
 
P
G
 
V
A
 
T
R
 
P
D
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
Y
-
 
R
I
 
I
A
 
G
D
 
I
K
 
S
L
 
V
M
 
T
A
 
A
S
 
K
L
 
I
G
 
P
S
 
T
M
 
I
L
 
V
L
 
A
Y
 
N
W
 
W
Y
 
Y
H
 
R
Y
 
I
S
 
K
H
 
-
N
 
N
G
 
G
K
 
L
R
 
E
I
 
Y
E
 
V
V
 
P
E
 
P
T
 
K
D
 
E
D
 
K
D
 
L
S
 
S
I
 
H
G
 
A
G
 
A
H
 
N
F
 
F
L
 
L
H
 
Y
L
 
M
L
 
L
H
 
H
G
 
G
V
 
E
E
 
E
P
 
P
S
 
P
K
 
K
S
 
E
W
 
W
V
 
E
D
 
K
A
 
A
M
 
M
H
 
D
V
 
V
S
 
A
L
 
L
N
 
I
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
 
H
E
 
E
F
 
I
N
 
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
L
T
 
A
G
 
V
R
 
M
V
 
T
I
 
V
A
 
G
G
 
S
T
 
T
G
 
L
S
 
S
D
 
D
I
 
Y
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
I
 
I
T
 
L
G
 
A
A
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
G
P
 
P
K
x
I
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
|
A
N
 
V
E
 
E
V
 
E
A
 
A
F
 
I
E
 
K
I
 
Q
Q
 
F
S
 
M
R
 
E
Y
 
I
Q
 
G
T
 
S
P
 
P
D
 
E
E
 
K
A
 
V
E
 
E
S
 
E
D
 
W
I
 
F
R
 
F
R
 
K
R
 
A
V
 
L
E
 
Q
N
 
Q
K
 
K
E
 
R
V
x
K
V
x
I
I
x
M
G
|
G

Sites not aligning to the query:

P39120 Citrate synthase 2; Citrate synthase II; EC 2.3.3.16 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
38% identity, 92% coverage: 22:272/272 of query aligns to 7:255/372 of P39120

query
sites
P39120
L
 
L
S
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
V
A
 
A
G
 
T
N
 
T
T
 
S
A
 
S
L
 
V
C
 
S
T
 
S
V
 
I
G
 
-
K
 
-
T
 
I
G
 
D
N
 
D
D
 
T
L
 
L
H
 
T
Y
 
Y
R
 
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
L
 
D
D
 
D
I
 
L
A
 
T
G
 
E
N
 
N
C
 
A
E
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
I
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
V
 
W
H
 
H
E
 
L
K
 
R
L
 
L
P
 
P
T
 
N
Q
 
K
A
 
K
E
 
E
L
 
L
T
 
E
A
 
E
Y
 
L
K
 
K
T
 
Q
K
 
Q
L
 
L
K
 
A
A
 
K
L
 
E
R
 
A
G
 
A
L
 
V
P
 
P
A
 
Q
N
 
E
V
 
I
K
 
I
A
 
E
A
 
H
L
 
F
E
 
K
-
 
S
W
 
Y
I
 
S
P
 
L
A
 
E
A
 
N
A
 
V
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
A
V
 
A
M
 
L
R
 
R
T
 
T
G
 
A
V
 
I
S
 
S
V
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
L
V
 
L
L
 
D
P
 
S
E
 
E
K
 
A
D
 
D
D
 
T
H
 
M
N
 
N
L
 
P
P
 
E
G
 
A
A
 
N
R
 
Y
D
 
R
I
 
K
A
 
A
D
 
I
K
 
R
L
 
L
M
 
Q
A
 
A
S
 
K
L
 
V
G
 
P
S
 
G
M
 
L
L
 
V
L
 
A
Y
 
A
W
 
F
Y
 
S
H
 
R
Y
 
I
S
 
R
H
 
K
N
 
G
G
 
L
K
 
E
R
 
P
I
 
V
E
 
E
V
 
-
E
 
P
T
 
R
D
 
E
D
 
D
D
 
Y
S
 
G
I
 
I
G
 
A
G
 
E
H
 
N
F
 
F
L
 
L
H
 
Y
L
 
T
L
 
L
H
 
N
G
 
G
V
 
E
E
 
E
P
 
P
S
 
S
K
 
P
S
 
I
W
 
E
V
 
V
D
 
E
A
 
A
M
 
F
H
 
N
V
 
K
S
 
A
L
 
L
N
 
I
L
 
L
Y
 
H
A
 
A
E
 
D
H
 
H
E
 
E
F
 
L
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
T
F
 
F
T
 
T
G
 
A
R
 
R
V
 
V
I
 
C
A
 
V
G
 
A
T
 
T
G
 
L
S
 
S
D
 
D
I
 
I
Y
 
Y
S
 
S
A
 
G
I
 
I
T
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
G
P
 
P
K
 
L
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
E
 
E
V
 
G
A
 
V
F
 
M
E
 
K
I
 
M
Q
 
L
S
 
T
R
 
E
Y
 
I
Q
 
G
T
 
E
P
 
V
D
 
E
E
 
N
A
 
A
E
 
E
S
 
P
D
 
Y
I
 
I
R
 
R
R
 
A
R
 
K
V
 
L
E
 
E
N
 
K
K
 
K
E
 
E
V
 
K
V
 
I
I
 
M
G
 
G
F
 
F

Sites not aligning to the query:

1ixeA Crystal structure of citrate synthase from thermus thermophilus hb8 (see paper)
34% identity, 92% coverage: 22:271/272 of query aligns to 5:253/371 of 1ixeA

query
sites
1ixeA
L
 
L
S
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
L
A
 
F
G
 
T
N
 
E
T
 
S
A
 
R
L
 
M
C
 
C
T
 
Y
V
 
I
G
 
D
K
 
G
T
 
Q
G
 
Q
N
 
G
D
 
K
L
 
L
H
 
Y
Y
 
Y
R
 
Y
G
 
G
Y
 
I
D
 
P
I
 
I
L
 
Q
D
 
E
I
 
L
A
 
A
G
 
E
N
 
K
C
 
S
E
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
E
I
 
T
A
 
T
Y
 
F
L
 
L
L
 
L
V
 
L
H
 
H
E
 
G
K
 
R
L
 
L
P
 
P
T
 
R
Q
 
R
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
T
 
E
A
 
E
Y
 
F
K
 
S
T
 
A
K
 
A
L
 
L
K
 
A
A
 
R
L
 
R
R
 
R
G
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
N
 
H
V
 
L
K
 
L
A
 
E
A
 
S
L
 
F
E
 
K
W
 
R
I
 
Y
P
 
P
A
 
V
A
 
S
A
 
A
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
S
V
 
F
M
 
L
R
 
R
T
 
T
G
 
A
V
 
V
S
 
S
V
 
E
L
 
F
G
 
G
T
 
M
V
 
L
L
 
D
P
 
P
E
 
T
K
 
E
D
 
G
D
 
D
H
 
I
N
 
S
L
 
R
P
 
E
G
 
A
A
 
L
R
 
Y
D
 
E
I
 
K
A
 
G
D
 
L
K
 
D
L
 
L
M
 
I
A
 
A
S
 
K
L
 
F
G
 
A
S
 
T
M
 
I
L
 
V
L
 
A
Y
 
A
W
 
N
Y
 
K
H
 
R
Y
 
L
S
 
K
H
 
-
N
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
E
I
 
P
E
 
I
V
 
P
E
 
P
T
 
R
D
 
E
D
 
D
D
 
L
S
 
S
I
 
H
G
 
A
G
 
A
H
 
N
F
 
F
L
 
L
H
 
Y
L
 
M
L
 
A
H
 
N
G
 
G
V
 
V
E
 
E
P
 
P
S
 
S
K
 
P
S
 
E
W
 
Q
V
 
A
D
 
R
A
 
L
M
 
M
H
 
D
V
 
A
S
 
A
L
 
L
N
 
I
L
 
L
Y
 
H
A
 
A
E
 
E
H
 
H
E
 
G
F
 
F
N
 
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
F
T
 
T
G
 
A
R
 
I
V
 
A
I
 
A
A
 
F
G
 
S
T
 
T
G
 
E
S
 
T
D
 
D
I
 
L
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
I
 
I
T
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
A
A
 
S
L
 
L
R
 
K
G
 
G
P
 
P
K
 
R
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
|
A
N
 
N
E
 
E
V
 
A
A
 
V
F
 
M
E
 
R
I
 
M
Q
 
I
S
 
Q
R
 
E
Y
 
I
Q
 
G
T
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
R
A
 
A
E
 
R
S
 
E
D
 
W
I
 
V
R
 
R
R
 
E
R
 
K
V
 
L
E
 
A
N
 
K
K
|
K
E
 
E
V
x
R
V
x
I
I
x
M
G
|
G

Sites not aligning to the query:

1iomA Crystal structure of citrate synthase from thermus thermophilus hb8 (see paper)
34% identity, 92% coverage: 22:271/272 of query aligns to 5:253/374 of 1iomA

query
sites
1iomA
L
 
L
S
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
L
A
 
F
G
 
T
N
 
E
T
 
S
A
 
R
L
 
M
C
 
C
T
 
Y
V
 
I
G
 
D
K
 
G
T
 
Q
G
 
Q
N
 
G
D
 
K
L
 
L
H
 
Y
Y
 
Y
R
 
Y
G
 
G
Y
 
I
D
 
P
I
 
I
L
 
Q
D
 
E
I
 
L
A
 
A
G
 
E
N
 
K
C
 
S
E
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
E
I
 
T
A
 
T
Y
 
F
L
 
L
L
 
L
V
 
L
H
 
H
E
 
G
K
 
R
L
 
L
P
 
P
T
 
R
Q
 
R
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
T
 
E
A
 
E
Y
 
F
K
 
S
T
 
A
K
 
A
L
 
L
K
 
A
A
 
R
L
 
R
R
 
R
G
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
N
 
H
V
 
L
K
 
L
A
 
E
A
 
S
L
 
F
E
 
K
W
 
R
I
 
Y
P
 
P
A
 
V
A
 
S
A
 
A
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
S
V
 
F
M
 
L
R
 
R
T
 
T
G
 
A
V
 
V
S
 
S
V
 
E
L
 
F
G
 
G
T
 
M
V
 
L
L
 
D
P
 
P
E
 
T
K
 
E
D
 
G
D
 
D
H
 
I
N
 
S
L
 
R
P
 
E
G
 
A
A
 
L
R
 
Y
D
 
E
I
 
K
A
 
G
D
 
L
K
 
D
L
 
L
M
 
I
A
 
A
S
 
K
L
 
F
G
 
A
S
 
T
M
 
I
L
 
V
L
 
A
Y
 
A
W
 
N
Y
 
K
H
 
R
Y
 
L
S
 
K
H
 
-
N
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
E
I
 
P
E
 
I
V
 
P
E
 
P
T
 
R
D
 
E
D
 
D
D
 
L
S
 
S
I
 
H
G
 
A
G
 
A
H
 
N
F
 
F
L
 
L
H
 
Y
L
 
M
L
 
A
H
 
N
G
 
G
V
 
V
E
 
E
P
 
P
S
 
S
K
 
P
S
 
E
W
 
Q
V
 
A
D
 
R
A
 
L
M
 
M
H
 
D
V
 
A
S
 
A
L
 
L
N
 
I
L
 
L
Y
 
H
A
 
A
E
 
E
H
|
H
E
 
G
F
 
F
N
|
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
F
T
 
T
G
 
A
R
 
I
V
 
A
I
 
A
A
 
F
G
 
S
T
 
T
G
 
E
S
 
T
D
 
D
I
 
L
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
I
 
I
T
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
A
A
 
S
L
 
L
R
 
K
G
 
G
P
 
P
K
 
R
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
E
 
E
V
 
A
A
 
V
F
 
M
E
 
R
I
 
M
Q
 
I
S
 
Q
R
 
E
Y
 
I
Q
 
G
T
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
R
A
 
A
E
 
R
S
 
E
D
 
W
I
 
V
R
 
R
R
 
E
R
 
K
V
 
L
E
 
A
N
 
K
K
 
K
E
 
E
V
 
R
V
 
I
I
 
M
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6abyA Crystal structure of citrate synthase (msed_1522) from metallosphaera sedula in complex with oxaloacetate (see paper)
34% identity, 92% coverage: 22:272/272 of query aligns to 7:251/372 of 6abyA

query
sites
6abyA
L
 
L
S
 
E
G
 
D
V
 
I
T
 
A
A
 
I
G
 
K
N
 
E
T
 
T
A
 
S
L
 
I
C
 
T
T
 
Y
V
 
I
G
 
D
K
 
G
T
 
E
G
 
L
N
 
G
D
 
R
L
 
L
H
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
S
I
 
I
L
 
F
D
 
D
I
 
L
A
 
A
G
 
S
N
 
F
C
 
S
E
 
N
F
 
F
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
V
 
W
H
 
Y
E
 
G
K
 
K
L
 
L
P
 
P
T
 
T
Q
 
R
A
 
H
E
 
E
L
 
L
T
 
D
A
 
D
Y
 
F
K
 
K
T
 
S
K
 
R
L
 
L
K
 
A
A
 
E
L
 
E
R
 
R
G
 
S
L
 
I
P
 
S
A
 
E
N
 
D
V
 
I
K
 
S
A
 
T
A
 
F
L
 
V
E
 
K
W
 
R
I
 
T
P
 
A
A
 
K
A
 
F
A
 
G
H
 
N
P
 
P
M
 
M
D
 
D
V
 
I
M
 
L
R
 
R
T
 
T
G
 
T
V
 
V
S
 
S
V
 
M
L
 
M
G
 
G
T
 
-
V
 
-
L
 
L
P
 
E
E
 
D
K
 
R
D
 
S
D
 
E
H
 
G
N
 
D
L
 
L
P
 
I
G
 
G
A
 
K
R
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
A
D
 
I
K
 
K
L
 
M
M
 
T
A
 
A
S
 
K
L
 
I
G
 
P
S
 
T
M
 
I
L
 
I
L
 
S
Y
 
L
W
 
I
Y
 
Q
H
 
R
Y
 
T
S
 
R
H
 
R
N
 
N
G
 
Q
K
 
E
R
 
F
I
 
V
E
 
E
V
 
-
E
 
-
T
 
-
D
 
P
D
 
D
D
 
P
S
 
S
I
 
L
G
 
S
-
 
H
-
 
S
G
 
E
H
 
N
F
 
F
L
 
L
H
 
Y
L
 
M
L
 
I
H
 
R
G
 
G
V
 
E
E
 
R
P
 
P
S
 
S
K
 
P
S
 
S
W
 
D
V
 
T
D
 
R
A
 
V
M
 
L
H
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
N
 
M
L
 
L
Y
 
H
A
 
M
E
 
D
H
|
H
E
 
E
F
 
M
N
|
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
M
T
 
A
G
 
C
R
 
L
V
 
V
I
 
V
A
 
A
G
 
S
T
 
T
G
 
L
S
 
S
D
 
D
I
 
I
Y
 
Y
S
 
S
A
 
S
I
 
V
T
 
V
G
 
A
A
 
G
I
 
I
G
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
G
P
 
P
K
 
L
H
|
H
G
|
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
E
 
S
V
 
E
A
 
A
F
 
L
E
 
K
I
 
Q
Q
 
F
S
 
M
R
 
E
Y
 
I
Q
 
E
T
 
T
P
 
P
D
 
D
E
 
N
A
 
V
E
 
E
S
 
K
D
 
Y
I
 
V
R
 
M
R
 
N
R
 
K
V
 
L
E
 
S
N
 
S
K
 
G
E
 
Q
V
x
R
V
x
L
I
 
M
G
 
G
F
|
F

Sites not aligning to the query:

6abxA Crystal structure of citrate synthase (msed_1522) from metallosphaera sedula in complex with citrate (see paper)
34% identity, 92% coverage: 22:272/272 of query aligns to 7:251/370 of 6abxA

query
sites
6abxA
L
 
L
S
 
E
G
 
D
V
 
I
T
 
A
A
 
I
G
 
K
N
 
E
T
 
T
A
 
S
L
 
I
C
 
T
T
 
Y
V
 
I
G
 
D
K
 
G
T
 
E
G
 
L
N
 
G
D
 
R
L
 
L
H
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
S
I
 
I
L
 
F
D
 
D
I
 
L
A
 
A
G
 
S
N
 
F
C
 
S
E
 
N
F
 
F
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
V
 
W
H
 
Y
E
 
G
K
 
K
L
 
L
P
 
P
T
 
T
Q
 
R
A
 
H
E
 
E
L
 
L
T
 
D
A
 
D
Y
 
F
K
 
K
T
 
S
K
 
R
L
 
L
K
 
A
A
 
E
L
 
E
R
 
R
G
 
S
L
 
I
P
 
S
A
 
E
N
 
D
V
 
I
K
 
S
A
 
T
A
 
F
L
 
V
E
 
K
W
 
R
I
 
T
P
 
A
A
 
K
A
 
F
A
 
G
H
 
N
P
 
P
M
 
M
D
 
D
V
 
I
M
 
L
R
 
R
T
 
T
G
 
T
V
 
V
S
 
S
V
 
M
L
 
M
G
 
G
T
 
-
V
 
-
L
 
L
P
 
E
E
 
D
K
 
R
D
 
S
D
 
E
H
 
G
N
 
D
L
 
L
P
 
I
G
 
G
A
 
K
R
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
A
D
 
I
K
 
K
L
 
M
M
 
T
A
 
A
S
 
K
L
 
I
G
 
P
S
 
T
M
 
I
L
 
I
L
 
S
Y
 
L
W
 
I
Y
 
Q
H
 
R
Y
 
T
S
 
R
H
 
R
N
 
N
G
 
Q
K
 
E
R
 
F
I
 
V
E
 
E
V
 
-
E
 
-
T
 
-
D
 
P
D
 
D
D
 
P
S
 
S
I
 
L
G
 
S
-
 
H
-
 
S
G
 
E
H
 
N
F
 
F
L
 
L
H
 
Y
L
 
M
L
 
I
H
 
R
G
 
G
V
 
E
E
 
R
P
 
P
S
 
S
K
 
P
S
 
S
W
 
D
V
 
T
D
 
R
A
 
V
M
 
L
H
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
N
 
M
L
 
L
Y
 
H
A
 
M
E
 
D
H
|
H
E
 
E
F
 
M
N
|
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
M
T
 
A
G
 
C
R
 
L
V
 
V
I
 
V
A
 
A
G
 
S
T
 
T
G
 
L
S
 
S
D
 
D
I
 
I
Y
 
Y
S
 
S
A
 
S
I
 
V
T
 
V
G
 
A
A
 
G
I
 
I
G
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
G
P
 
P
K
 
L
H
|
H
G
|
G
G
|
G
A
 
A
N
 
N
E
 
S
V
 
E
A
 
A
F
 
L
E
 
K
I
 
Q
Q
 
F
S
 
M
R
 
E
Y
 
I
Q
 
E
T
 
T
P
 
P
D
 
D
E
 
N
A
 
V
E
 
E
S
 
K
D
 
Y
I
 
V
R
 
M
R
 
N
R
 
K
V
 
L
E
 
S
N
 
S
K
 
G
E
 
Q
V
 
R
V
 
L
I
 
M
G
 
G
F
 
F

Sites not aligning to the query:

2c6xA Structure of bacillus subtilis citrate synthase
32% identity, 92% coverage: 22:272/272 of query aligns to 5:249/363 of 2c6xA

query
sites
2c6xA
L
 
L
S
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
T
A
 
C
G
 
V
N
 
E
T
 
T
A
 
S
L
 
I
C
 
S
T
 
H
V
 
I
G
 
D
K
 
G
T
 
E
G
 
K
N
 
G
D
 
R
L
 
L
H
 
I
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
Y
 
H
D
 
H
I
 
A
L
 
K
D
 
D
I
 
I
A
 
A
G
 
L
N
 
N
C
 
H
E
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
E
I
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
L
 
I
V
 
L
H
 
F
E
 
G
K
 
K
L
 
L
P
 
P
T
 
S
Q
 
T
A
 
E
E
 
E
L
 
L
T
 
Q
A
 
V
Y
 
F
K
 
K
T
 
D
K
 
K
L
 
L
K
 
A
A
 
A
L
 
E
R
 
R
G
 
N
L
 
L
P
 
P
A
 
E
N
 
H
V
 
I
K
 
E
A
 
R
A
 
L
L
 
I
E
 
Q
W
 
S
I
 
L
P
 
P
A
 
N
A
 
N
A
 
M
H
 
D
P
 
D
M
 
M
D
 
S
V
 
V
M
 
L
R
 
R
T
 
T
G
 
V
V
 
V
S
 
S
V
 
A
L
 
L
G
 
G
T
 
-
V
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
E
D
 
N
D
 
T
H
 
Y
N
 
T
L
 
F
P
 
H
G
 
P
A
 
K
R
 
T
D
 
E
I
 
E
A
 
A
D
 
I
K
 
R
L
 
L
M
 
I
A
 
A
S
 
I
L
 
T
G
 
P
S
 
S
M
 
I
L
 
I
L
 
A
Y
 
Y
W
 
R
Y
 
K
H
 
R
Y
 
W
S
 
T
H
 
R
N
 
G
G
 
E
K
 
Q
R
 
A
I
 
I
E
 
A
V
 
P
E
 
S
T
 
S
D
 
Q
D
 
Y
D
 
G
S
 
H
I
 
V
G
 
E
G
 
N
H
 
Y
F
 
Y
L
 
-
H
 
Y
L
 
M
L
 
L
H
 
T
G
 
G
V
 
E
E
 
Q
P
 
P
S
 
S
K
 
E
S
 
A
W
 
K
V
 
K
D
 
K
A
 
A
M
 
L
H
 
E
V
 
T
S
 
Y
L
 
M
N
 
I
L
 
L
Y
 
A
A
 
T
E
 
E
H
 
H
E
 
G
F
 
M
N
 
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
F
T
 
S
G
 
A
R
 
R
V
 
V
I
 
T
A
 
L
G
 
S
T
 
T
G
 
E
S
 
S
D
 
D
I
 
L
Y
 
V
S
 
S
A
 
A
I
 
V
T
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
L
G
 
G
A
 
T
L
 
M
R
 
K
G
 
G
P
 
P
K
 
L
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
P
E
 
S
V
 
A
A
 
V
F
 
T
E
 
K
I
 
M
Q
 
L
S
 
E
R
 
D
Y
 
I
Q
 
G
T
 
E
P
 
K
D
 
E
E
 
H
A
 
A
E
 
E
S
 
A
D
 
Y
I
 
L
R
 
K
R
 
E
R
 
K
V
x
L
E
 
E
N
 
K
K
 
G
E
|
E
V
x
R
V
x
L
I
x
M
G
 
G
F
|
F

Sites not aligning to the query:

6abwA Crystal structure of citrate synthase (msed_0281) from metallosphaera sedula in complex with acetyl-coa (see paper)
32% identity, 91% coverage: 25:272/272 of query aligns to 3:248/369 of 6abwA

query
sites
6abwA
V
 
V
T
 
F
A
 
I
G
 
K
N
 
T
T
 
T
A
 
S
L
 
L
C
 
T
T
 
Y
V
 
I
G
 
D
K
 
G
T
 
E
G
 
N
N
 
G
D
 
I
L
 
L
H
 
R
Y
 
Y
R
 
G
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
L
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
V
G
 
E
N
 
H
C
 
T
E
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
V
Y
 
H
L
 
L
L
 
M
V
 
L
H
 
Y
E
 
G
K
 
D
L
 
L
P
 
P
T
 
T
Q
 
K
A
 
L
E
 
Q
L
 
L
T
 
Q
A
 
R
Y
 
L
K
 
K
T
 
S
K
 
A
L
 
L
K
 
D
A
 
E
L
 
A
R
 
Y
G
 
E
L
 
V
P
 
P
A
 
Q
N
 
Q
V
 
V
K
 
I
A
 
D
A
 
M
L
 
I
E
 
Y
W
 
S
I
 
L
P
 
P
A
 
R
A
 
D
A
 
S
H
 
D
P
 
A
M
 
V
D
 
G
V
 
M
M
 
M
R
 
E
T
 
T
G
 
A
V
 
F
S
 
S
V
 
A
L
 
L
G
 
S
T
 
S
V
 
I
-
 
Y
-
 
G
L
 
M
P
 
P
E
 
W
K
 
N
D
 
K
D
 
A
H
 
T
N
 
N
L
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
R
D
 
D
I
 
N
A
 
A
D
 
V
K
 
K
L
 
L
M
 
V
A
 
A
S
 
R
L
 
A
G
 
S
S
 
T
M
 
V
L
 
V
L
 
A
Y
 
N
W
 
V
Y
 
L
H
 
R
Y
 
-
S
 
A
H
 
K
N
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
K
I
 
P
E
 
A
V
 
I
E
 
P
T
 
E
D
 
P
D
 
S
D
 
E
S
 
S
I
 
F
G
 
A
G
 
K
H
 
S
F
 
F
L
 
L
H
 
K
L
 
A
L
 
S
H
 
F
G
 
S
V
 
R
E
 
T
P
 
P
S
 
T
K
 
E
S
 
E
W
 
E
V
 
V
D
 
K
A
 
A
M
 
M
H
 
D
V
 
A
S
 
A
L
 
L
N
 
I
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
E
 
D
H
 
H
E
 
E
F
 
V
N
 
P
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
T
T
 
A
G
 
A
R
 
L
V
 
V
I
 
T
A
 
S
G
 
S
T
 
T
G
 
L
S
 
S
D
 
D
I
 
I
Y
 
Y
S
 
S
A
 
C
I
 
V
T
 
V
G
 
A
A
 
A
I
 
L
G
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
G
P
|
P
K
x
L
H
|
H
G
|
G
G
|
G
A
|
A
N
 
A
E
 
E
V
 
E
A
 
A
F
 
F
E
 
K
I
 
Q
Q
 
F
S
 
V
R
 
E
Y
 
I
Q
 
G
T
 
E
P
 
P
D
 
D
E
 
M
A
 
T
E
 
E
S
 
S
D
 
W
I
 
F
R
 
K
R
 
R
R
 
K
-
 
I
V
 
I
E
 
E
N
 
G
K
 
K
E
 
S
V
x
R
V
x
L
I
x
M
G
|
G
F
|
F

Sites not aligning to the query:

2h12B Structure of acetobacter aceti citrate synthase complexed with oxaloacetate and carboxymethyldethia coenzyme a (cmx) (see paper)
32% identity, 81% coverage: 28:248/272 of query aligns to 45:275/426 of 2h12B

query
sites
2h12B
G
 
G
N
 
E
T
 
T
A
 
A
L
 
A
C
 
C
T
 
N
V
 
S
G
 
K
K
 
I
T
 
T
G
 
F
N
 
I
D
 
D
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
G
-
 
V
L
 
L
H
 
L
Y
 
H
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
P
I
 
I
L
 
A
D
 
Q
I
 
L
A
 
A
G
 
E
N
 
N
C
 
A
E
 
S
F
 
Y
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
I
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
V
 
L
H
 
N
E
 
G
K
 
E
L
 
L
P
 
P
T
 
N
Q
 
K
A
 
A
E
 
Q
L
 
Y
T
 
D
A
 
T
Y
 
F
K
 
T
T
 
N
K
 
T
L
 
L
K
 
T
A
 
N
L
 
H
R
 
T
G
 
L
L
 
L
P
 
H
A
 
E
N
 
Q
V
 
I
K
 
R
A
 
N
A
 
F
L
 
F
E
 
N
W
 
G
I
 
F
P
 
R
A
 
R
A
 
D
A
 
A
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
A
V
 
I
M
 
L
R
 
C
T
 
G
G
 
T
V
 
V
S
 
G
V
 
A
L
 
L
G
 
S
T
 
A
V
 
F
L
 
Y
P
 
P
E
 
D
K
 
A
D
 
N
D
 
D
H
 
I
N
 
A
L
 
I
P
 
P
G
 
A
A
 
N
R
 
R
D
 
D
I
 
L
A
 
A
D
 
A
-
 
M
K
 
R
L
 
L
M
 
I
A
 
A
S
 
K
L
 
I
G
 
P
S
 
T
M
 
I
L
 
A
L
 
A
Y
 
W
W
 
A
Y
 
Y
H
 
K
Y
 
Y
S
 
T
H
 
Q
N
 
-
G
 
G
K
 
E
R
 
A
I
 
F
E
 
I
V
 
Y
E
 
P
T
 
R
D
 
N
D
 
D
D
 
L
S
 
N
I
 
Y
G
 
A
G
 
E
H
 
N
F
 
F
L
 
L
H
 
S
L
 
M
L
 
M
H
 
F
G
 
A
-
 
R
-
 
M
V
 
S
E
 
E
P
 
P
S
 
Y
K
 
K
S
 
V
-
 
N
-
 
P
-
 
V
W
 
L
V
 
A
D
 
R
A
 
A
M
 
M
H
 
N
V
 
R
S
 
I
L
 
L
N
 
I
L
 
L
Y
 
H
A
 
A
E
 
D
H
|
H
E
 
E
F
 
Q
N
|
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
S
T
 
T
G
 
V
R
 
R
V
 
L
I
 
A
A
 
G
G
 
S
T
 
T
G
 
G
S
 
A
D
 
N
I
 
P
Y
 
F
S
 
A
A
 
C
I
 
I
T
 
A
G
 
A
A
 
G
I
 
I
G
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
W
G
 
G
P
|
P
K
x
A
H
|
H
G
|
G
G
 
G
A
|
A
N
 
N
E
 
E
V
 
A
A
 
V
F
 
L
E
 
K
I
 
M
Q
 
L
S
 
A
R
 
R

Sites not aligning to the query:

P9WPD5 Citrate synthase 1; EC 2.3.3.16 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
28% identity, 93% coverage: 20:272/272 of query aligns to 47:307/431 of P9WPD5

query
sites
P9WPD5
V
 
V
A
 
G
L
 
F
S
 
A
G
 
N
V
 
T
T
 
A
A
 
A
G
 
A
N
 
K
T
 
S
A
 
S
L
 
I
C
 
T
T
 
Y
V
 
I
G
 
D
K
 
G
T
 
D
G
 
A
N
 
G
D
 
I
L
 
L
H
 
R
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
P
I
 
I
L
 
D
D
 
Q
I
 
L
A
 
A
G
 
E
N
 
K
C
 
S
E
 
T
F
 
F
E
 
I
E
 
E
I
 
V
A
 
C
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
V
 
I
H
 
Y
E
 
G
K
 
E
L
 
L
P
 
P
T
 
D
Q
 
T
A
 
D
E
 
Q
L
 
L
T
 
A
A
 
Q
Y
 
F
K
 
T
T
 
G
K
 
R
L
 
I
K
 
Q
A
 
R
L
 
H
R
 
T
G
 
M
L
 
L
P
 
H
A
 
E
N
 
D
V
 
L
K
 
K
A
 
R
A
 
F
L
 
F
E
 
D
W
 
G
I
 
F
P
 
P
A
 
R
A
 
N
A
 
A
H
 
H
P
 
P
M
 
M
D
 
P
V
 
V
M
 
L
R
 
S
T
 
S
G
 
V
V
 
V
S
 
N
V
 
A
L
 
L
G
 
S
T
 
A
V
 
Y
L
 
Y
P
 
Q
E
 
D
K
 
A
D
 
L
D
 
D
H
 
P
N
 
M
L
 
D
P
 
N
G
 
G
A
 
Q
R
 
V
D
 
E
I
 
L
A
 
S
D
 
T
-
 
I
K
 
R
L
 
L
M
 
L
A
 
A
S
 
K
L
 
L
G
 
P
S
 
T
M
 
I
L
 
A
L
 
A
Y
 
Y
W
 
A
Y
 
Y
H
 
K
Y
 
K
S
 
S
H
 
-
N
 
V
G
 
G
K
 
Q
R
 
P
I
 
F
E
 
L
V
 
Y
E
 
P
T
 
D
D
 
N
D
 
S
D
 
L
S
 
T
I
 
L
G
 
V
G
 
E
H
 
N
F
 
F
L
 
L
H
 
R
L
 
L
L
 
T
H
 
F
G
 
G
V
 
F
-
 
P
-
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
Y
K
 
Q
S
 
A
-
 
D
-
 
P
-
 
E
W
 
V
V
 
V
D
 
R
A
 
A
M
 
L
H
 
D
V
 
M
S
 
L
L
 
F
N
 
I
L
 
L
Y
 
H
A
 
A
E
 
D
H
 
H
E
 
E
F
 
Q
N
 
N
A
 
C
S
 
S
T
 
T
F
 
S
T
 
T
G
 
V
R
 
R
V
 
L
I
 
V
A
 
G
G
 
S
T
 
S
G
 
R
S
 
A
D
 
N
I
 
L
Y
 
F
S
 
T
A
 
S
I
 
I
T
 
S
G
 
G
A
 
G
I
 
I
G
 
N
A
 
A
L
 
L
R
 
W
G
 
G
P
 
P
K
 
L
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
E
 
Q
V
 
A
A
 
V
F
 
L
E
 
E
I
 
M
Q
 
L
S
 
E
R
 
G
Y
 
I
Q
 
R
T
 
D
P
 
S
D
 
G
E
 
D
A
 
D
E
 
V
S
 
S
D
 
E
I
 
F
R
 
V
R
 
R
R
 
K
V
 
V
E
 
K
N
 
N
K
 
R
E
 
E
V
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
K
V
 
L
I
 
M
G
 
G
F
 
F

Sites not aligning to the query:

2r9eA The structure of the binary complex of citryl dethia coa and citrate synthase from the thermophilic archaeonthermoplasma acidophilum
32% identity, 93% coverage: 19:272/272 of query aligns to 5:258/381 of 2r9eA

query
sites
2r9eA
S
 
S
V
 
K
A
 
G
L
 
L
S
 
E
G
 
D
V
 
V
T
 
N
A
 
I
G
 
K
N
 
W
T
 
T
A
 
R
L
 
L
C
 
T
T
 
T
V
 
I
G
 
D
K
 
G
T
 
N
G
 
K
N
 
G
D
 
I
L
 
L
H
 
R
Y
 
Y
R
 
G
G
 
G
Y
 
Y
D
 
S
I
 
V
L
 
E
D
 
D
I
 
I
-
 
I
A
 
A
G
 
S
N
 
G
C
 
A
E
 
Q
F
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
L
 
F
V
 
L
H
 
Y
E
 
G
K
 
N
L
 
L
P
 
P
T
 
T
Q
 
E
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
T
 
R
A
 
K
Y
 
Y
K
 
K
T
 
E
K
 
T
L
 
V
K
 
Q
A
 
K
L
 
G
R
 
Y
G
 
K
L
 
I
P
 
P
A
 
D
N
 
F
V
 
V
K
 
I
A
 
N
A
 
A
L
 
I
E
 
R
W
 
Q
I
 
L
P
 
P
A
 
R
A
 
E
A
 
S
H
 
D
P
 
-
M
 
A
D
 
V
V
 
A
M
 
M
R
 
Q
T
 
M
G
 
A
V
 
A
S
 
V
V
 
A
L
 
A
G
 
M
T
 
A
V
 
A
L
 
S
P
 
E
E
 
T
K
 
K
D
 
F
D
 
K
H
 
W
N
 
N
L
 
K
P
 
D
G
 
T
A
 
D
R
 
R
D
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
A
K
 
E
L
 
M
M
 
I
A
 
G
S
 
R
L
 
M
G
 
S
S
 
A
M
 
I
L
 
T
L
 
V
Y
 
N
W
 
V
Y
 
Y
H
 
R
Y
 
H
S
 
I
H
 
M
N
 
N
G
 
M
K
 
P
R
 
-
I
 
A
E
 
E
V
 
L
E
 
P
T
 
K
D
 
P
D
 
S
D
 
D
S
 
S
I
 
Y
G
 
A
G
 
E
H
 
S
F
 
F
L
 
L
H
 
N
L
 
A
L
 
A
H
 
F
G
 
G
V
 
R
E
 
K
P
 
A
S
 
T
K
 
K
S
 
E
W
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
A
M
 
M
H
 
N
V
 
T
S
 
A
L
 
L
N
 
I
L
 
L
Y
 
Y
A
 
T
E
 
D
H
|
H
E
 
E
F
 
V
N
x
P
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
T
T
 
A
G
 
G
R
 
L
V
 
V
I
 
A
A
 
V
G
 
S
T
 
T
G
 
L
S
 
S
D
 
D
I
 
M
Y
 
Y
S
 
S
A
 
G
I
 
I
T
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
L
G
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
G
P
|
P
K
x
L
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
|
A
N
 
A
E
 
E
V
 
A
A
 
A
F
 
I
E
 
A
I
 
Q
Q
 
F
S
 
D
R
 
E
Y
 
I
Q
 
K
T
 
D
P
 
P
D
 
A
E
 
M
A
 
V
E
 
E
S
 
K
D
 
W
I
 
F
R
 
N
R
 
D
R
 
N
V
 
I
E
 
I
N
 
N
-
 
G
K
 
K
E
 
K
V
x
R
V
x
L
I
x
M
G
|
G
F
|
F

Sites not aligning to the query:

2r26A The structure of the ternary complex of carboxymethyl coenzyme a and oxalateacetate with citrate synthase from the thermophilic archaeonthermoplasma acidophilum
32% identity, 93% coverage: 19:272/272 of query aligns to 5:258/381 of 2r26A

query
sites
2r26A
S
 
S
V
 
K
A
 
G
L
 
L
S
 
E
G
 
D
V
 
V
T
 
N
A
 
I
G
 
K
N
 
W
T
 
T
A
 
R
L
 
L
C
 
T
T
 
T
V
 
I
G
 
D
K
 
G
T
 
N
G
 
K
N
 
G
D
 
I
L
 
L
H
 
R
Y
 
Y
R
 
G
G
 
G
Y
 
Y
D
 
S
I
 
V
L
 
E
D
 
D
I
 
I
-
 
I
A
 
A
G
 
S
N
 
G
C
 
A
E
 
Q
F
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
L
 
F
V
 
L
H
 
Y
E
 
G
K
 
N
L
 
L
P
 
P
T
 
T
Q
 
E
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
T
 
R
A
 
K
Y
 
Y
K
 
K
T
 
E
K
 
T
L
 
V
K
 
Q
A
 
K
L
 
G
R
 
Y
G
 
K
L
 
I
P
 
P
A
 
D
N
 
F
V
 
V
K
 
I
A
 
N
A
 
A
L
 
I
E
 
R
W
 
Q
I
 
L
P
 
P
A
 
R
A
 
E
A
 
S
H
 
D
P
 
-
M
 
A
D
 
V
V
 
A
M
 
M
R
 
Q
T
 
M
G
 
A
V
 
A
S
 
V
V
 
A
L
 
A
G
 
M
T
 
A
V
 
A
L
 
S
P
 
E
E
 
T
K
 
K
D
 
F
D
 
K
H
 
W
N
 
N
L
 
K
P
 
D
G
 
T
A
 
D
R
 
R
D
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
A
K
 
E
L
 
M
M
 
I
A
 
G
S
 
R
L
 
M
G
 
S
S
 
A
M
 
I
L
 
T
L
 
V
Y
 
N
W
 
V
Y
 
Y
H
 
R
Y
 
H
S
 
I
H
 
M
N
 
N
G
 
M
K
 
P
R
 
-
I
 
A
E
 
E
V
 
L
E
 
P
T
 
K
D
 
P
D
 
S
D
 
D
S
 
S
I
 
Y
G
 
A
G
 
E
H
 
S
F
 
F
L
 
L
H
 
N
L
 
A
L
 
A
H
 
F
G
 
G
V
 
R
E
 
K
P
 
A
S
 
T
K
 
K
S
 
E
W
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
A
M
 
M
H
 
N
V
 
T
S
 
A
L
 
L
N
 
I
L
 
L
Y
 
Y
A
 
T
E
 
D
H
|
H
E
 
E
F
 
V
N
x
P
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
T
T
 
A
G
 
G
R
 
L
V
 
V
I
 
A
A
 
V
G
 
S
T
 
T
G
 
L
S
 
S
D
 
D
I
 
M
Y
 
Y
S
 
S
A
 
G
I
 
I
T
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
L
G
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
G
P
 
P
K
x
L
H
|
H
G
|
G
G
 
G
A
|
A
N
 
A
E
 
E
V
 
A
A
 
A
F
 
I
E
 
A
I
 
Q
Q
 
F
S
 
D
R
 
E
Y
 
I
Q
 
K
T
 
D
P
 
P
D
 
A
E
 
M
A
 
V
E
 
E
S
 
K
D
 
W
I
 
F
R
 
N
R
 
D
R
 
N
V
 
I
E
 
I
N
 
N
-
 
G
K
 
K
E
 
K
V
x
R
V
x
L
I
x
M
G
|
G
F
|
F

Sites not aligning to the query:

2ifcC The structure of the binary complex of oxalateacetate with citrate synthase from the thermophilic archaeon thermolasma acidophilum
32% identity, 93% coverage: 19:272/272 of query aligns to 5:258/382 of 2ifcC

query
sites
2ifcC
S
 
S
V
 
K
A
 
G
L
 
L
S
 
E
G
 
D
V
 
V
T
 
N
A
 
I
G
 
K
N
 
W
T
 
T
A
 
R
L
 
L
C
 
T
T
 
T
V
 
I
G
 
D
K
 
G
T
 
N
G
 
K
N
 
G
D
 
I
L
 
L
H
 
R
Y
 
Y
R
 
G
G
 
G
Y
 
Y
D
 
S
I
 
V
L
 
E
D
 
D
I
 
I
-
 
I
A
 
A
G
 
S
N
 
G
C
 
A
E
 
Q
F
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
L
 
F
V
 
L
H
 
Y
E
 
G
K
 
N
L
 
L
P
 
P
T
 
T
Q
 
E
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
T
 
R
A
 
K
Y
 
Y
K
 
K
T
 
E
K
 
T
L
 
V
K
 
Q
A
 
K
L
 
G
R
 
Y
G
 
K
L
 
I
P
 
P
A
 
D
N
 
F
V
 
V
K
 
I
A
 
N
A
 
A
L
 
I
E
 
R
W
 
Q
I
 
L
P
 
P
A
 
R
A
 
E
A
 
S
H
 
D
P
 
-
M
 
A
D
 
V
V
 
A
M
 
M
R
 
Q
T
 
M
G
 
A
V
 
A
S
 
V
V
 
A
L
 
A
G
 
M
T
 
A
V
 
A
L
 
S
P
 
E
E
 
T
K
 
K
D
 
F
D
 
K
H
 
W
N
 
N
L
 
K
P
 
D
G
 
T
A
 
D
R
 
R
D
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
A
K
 
E
L
 
M
M
 
I
A
 
G
S
 
R
L
 
M
G
 
S
S
 
A
M
 
I
L
 
T
L
 
V
Y
 
N
W
 
V
Y
 
Y
H
 
R
Y
 
H
S
 
I
H
 
M
N
 
N
G
 
M
K
 
P
R
 
-
I
 
A
E
 
E
V
 
L
E
 
P
T
 
K
D
 
P
D
 
S
D
 
D
S
 
S
I
 
Y
G
 
A
G
 
E
H
 
S
F
 
F
L
 
L
H
 
N
L
 
A
L
 
A
H
 
F
G
 
G
V
 
R
E
 
K
P
 
A
S
 
T
K
 
K
S
 
E
W
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
A
M
 
M
H
 
N
V
 
T
S
 
A
L
 
L
N
 
I
L
 
L
Y
 
Y
A
 
T
E
 
D
H
|
H
E
 
E
F
 
V
N
x
P
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
T
T
 
A
G
 
G
R
 
L
V
 
V
I
 
A
A
 
V
G
 
S
T
 
T
G
 
L
S
 
S
D
 
D
I
 
M
Y
 
Y
S
 
S
A
 
G
I
 
I
T
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
L
G
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
G
P
 
P
K
 
L
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
A
E
 
E
V
 
A
A
 
A
F
 
I
E
 
A
I
 
Q
Q
 
F
S
 
D
R
 
E
Y
 
I
Q
 
K
T
 
D
P
 
P
D
 
A
E
 
M
A
 
V
E
 
E
S
 
K
D
 
W
I
 
F
R
 
N
R
 
D
R
 
N
V
 
I
E
 
I
N
 
N
-
 
G
K
 
K
E
 
K
V
 
R
V
 
L
I
 
M
G
 
G
F
 
F

Sites not aligning to the query:

4yboB Structure of citrate synthase from the thermoacidophilic euryarchaeon thermolasma acidophilum (see paper)
32% identity, 93% coverage: 19:272/272 of query aligns to 4:257/381 of 4yboB

query
sites
4yboB
S
 
S
V
 
K
A
 
G
L
 
L
S
 
E
G
 
D
V
 
V
T
 
N
A
 
I
G
 
K
N
 
W
T
 
T
A
 
R
L
 
L
C
 
T
T
 
T
V
 
I
G
 
D
K
 
G
T
 
N
G
 
K
N
 
G
D
 
I
L
 
L
H
 
R
Y
 
Y
R
 
G
G
 
G
Y
 
Y
D
 
S
I
 
V
L
 
E
D
 
D
I
 
I
-
 
I
A
 
A
G
 
S
N
 
G
C
 
A
E
 
Q
F
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
L
 
F
V
 
L
H
 
Y
E
 
G
K
 
N
L
 
L
P
 
P
T
 
T
Q
 
E
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
T
 
R
A
 
K
Y
 
Y
K
 
K
T
 
E
K
 
T
L
 
V
K
 
Q
A
 
K
L
 
G
R
 
Y
G
 
K
L
 
I
P
 
P
A
 
D
N
 
F
V
 
V
K
 
I
A
 
N
A
 
A
L
 
I
E
 
R
W
 
Q
I
 
L
P
 
P
A
 
R
A
 
E
A
 
S
H
 
D
P
 
-
M
 
A
D
 
V
V
 
A
M
 
M
R
 
Q
T
 
M
G
 
A
V
 
A
S
 
V
V
 
A
L
 
A
G
 
M
T
 
A
V
 
A
L
 
S
P
 
E
E
 
T
K
 
K
D
 
F
D
 
K
H
 
W
N
 
N
L
 
K
P
 
D
G
 
T
A
 
D
R
 
R
D
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
A
K
 
E
L
 
M
M
 
I
A
 
G
S
 
R
L
 
M
G
 
S
S
 
A
M
 
I
L
 
T
L
 
V
Y
 
N
W
 
V
Y
 
Y
H
 
R
Y
 
H
S
 
I
H
 
M
N
 
N
G
 
M
K
 
P
R
 
-
I
 
A
E
 
E
V
 
L
E
 
P
T
 
K
D
 
P
D
 
S
D
 
D
S
 
S
I
 
Y
G
 
A
G
 
E
H
 
S
F
 
F
L
 
L
H
 
N
L
 
A
L
 
A
H
 
F
G
 
G
V
 
R
E
 
K
P
 
A
S
 
T
K
 
K
S
 
E
W
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
A
M
 
M
H
 
N
V
 
T
S
 
A
L
 
L
N
 
I
L
 
L
Y
 
Y
A
 
T
E
 
D
H
 
H
E
 
E
F
 
V
N
 
P
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
T
T
 
A
G
 
G
R
 
L
V
 
V
I
 
A
A
 
V
G
 
S
T
 
T
G
 
L
S
 
S
D
 
D
I
 
M
Y
 
Y
S
 
S
A
 
G
I
 
I
T
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
L
G
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
G
P
 
P
K
 
L
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
A
E
 
E
V
 
A
A
 
A
F
 
I
E
 
A
I
 
Q
Q
 
F
S
 
D
R
 
E
Y
 
I
Q
 
K
T
 
D
P
 
P
D
 
A
E
 
M
A
 
V
E
 
E
S
 
K
D
 
W
I
 
F
R
 
N
R
 
D
R
 
N
V
 
I
E
 
I
N
 
N
-
 
G
K
 
K
E
 
K
V
 
R
V
 
L