SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_06337 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_06337 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 13 hits to proteins with known functional sites (download)

7cyxA Crystal strcuture of glycine oxidase from bacillus cereus atcc 14579 (see paper)
25% identity, 86% coverage: 27:390/424 of query aligns to 3:351/363 of 7cyxA

query
sites
7cyxA
D
 
D
V
 
V
V
 
A
V
 
I
I
|
I
G
|
G
A
 
G
G
|
G
F
x
V
T
x
I
G
 
G
L
 
S
S
 
S
A
 
V
A
 
A
L
 
H
A
 
F
L
 
L
G
 
A
K
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
H
S
 
K
V
 
V
T
 
A
V
 
I
V
|
V
D
x
E
A
x
K
G
 
Q
R
 
S
V
 
I
G
 
A
G
 
S
G
x
E
A
|
A
S
|
S
G
 
K
R
 
A
N
x
A
G
 
A
G
|
G
Q
x
L
V
 
L
N
 
G
T
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
V
A
 
A
L
 
Y
A
 
N
A
 
P
Q
 
L
L
 
F
G
 
E
I
 
L
E
 
A
R
 
R
A
 
E
S
 
S
A
 
-
C
 
-
Y
 
-
R
 
R
A
 
A
F
 
I
A
 
F
D
 
P
A
 
Q
V
 
L
D
 
A
T
 
A
V
 
V
E
 
-
R
 
-
L
 
-
I
 
L
R
 
R
E
 
E
E
 
K
Q
 
T
-
 
G
I
 
V
D
 
D
C
 
I
D
 
G
Y
 
Y
L
 
E
A
 
E
S
 
K
G
 
G
K
 
I
L
 
Y
K
 
R
L
 
I
A
 
A
S
 
Q
K
 
N
P
 
E
H
 
D
H
 
E
L
 
K
A
 
E
H
 
R
L
 
I
E
 
L
K
 
H
T
 
I
A
 
M
D
 
D
L
 
W
I
 
Q
R
 
Q
R
 
K
T
 
T
V
 
G
D
 
E
T
 
-
D
 
D
I
 
S
E
 
Y
L
 
F
I
 
L
D
 
T
G
 
G
D
 
D
R
 
H
I
 
V
R
 
R
S
 
E
E
 
K
-
 
E
-
 
P
V
 
Y
Q
 
L
S
 
S
D
 
E
S
 
S
F
 
I
H
 
I
G
 
G
G
 
A
L
 
V
L
 
Y
Q
 
Y
R
 
P
H
 
K
G
 
D
G
 
G
Q
 
H
M
 
V
H
 
I
M
 
A
G
 
P
K
 
E
F
 
L
T
 
T
V
 
K
G
 
A
L
 
F
A
 
A
E
 
H
A
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
I
R
 
S
G
 
G
A
 
A
K
 
D
L
 
I
Y
 
Y
E
 
E
N
 
Q
A
 
T
A
 
E
V
|
V
T
 
F
S
 
D
I
 
I
-
 
R
V
 
I
K
 
E
D
 
N
G
 
N
G
 
K
A
 
V
H
 
T
R
 
G
V
 
V
V
 
I
T
 
T
T
 
S
R
 
E
G
 
G
E
 
I
V
 
V
R
 
T
A
 
C
K
 
E
Q
 
K
V
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
A
T
x
G
G
|
G
P
 
S
S
x
W
R
 
S
H
 
T
G
 
K
P
 
L
F
 
L
G
 
S
W
 
Y
Y
 
F
R
 
H
R
 
R
R
 
D
L
 
W
A
 
G
P
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
I
 
-
V
 
-
V
 
-
T
 
T
E
 
Y
P
 
P
L
 
V
P
 
K
P
 
G
E
 
E
L
 
V
L
 
V
A
 
A
K
 
-
V
 
-
L
 
V
P
 
R
N
 
S
R
 
R
R
 
K
A
 
Q
Y
 
L
T
 
L
T
 
K
T
 
A
R
 
P
L
 
I
M
 
F
H
 
Q
N
 
E
Y
 
R
F
 
F
R
 
Y
V
 
I
T
 
T
P
 
P
D
 
K
-
 
R
-
 
G
S
 
G
R
 
R
L
 
Y
L
 
V
F
 
I
G
 
G
G
 
A
R
 
T
A
 
M
R
 
K
-
 
P
-
 
H
-
 
T
F
 
F
T
 
N
A
 
K
S
 
T
E
 
V
R
 
Q
P
 
P
S
 
E
D
 
S
A
 
I
K
 
T
S
 
S
G
 
-
R
 
-
I
 
I
L
 
L
Q
 
E
Q
 
R
G
 
A
L
 
Y
A
 
T
V
 
I
M
 
L
F
 
-
P
 
P
M
 
A
L
 
L
S
 
K
S
 
E
A
 
A
R
 
E
I
 
W
D
 
E
Y
 
S
C
 
T
W
 
W
G
 
A
G
|
G
L
 
L
V
x
R
D
x
P
I
 
Q
S
 
S
A
 
N
D
 
H
R
 
E
L
 
A
P
 
P
H
 
Y
A
 
M
G
 
G
Q
 
E
H
 
H
D
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
F
 
A
S
 
C
M
 
T
G
 
G
Y
 
H
S
x
Y
G
x
R
H
x
N
G
|
G
T
x
I
Q
 
L
M
 
L
S
 
S
T
 
P
H
 
I
M
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
Y
M
 
M
A
 
A
D
 
D
V
 
L
M
 
I
D
 
E
G
 
G
R
 
K
E
 
Q
D
 
E
R
 
N
N
 
H

5i39A High resolution structure of l-amino acid deaminase from proteus vulgaris with the deletion of the specific insertion sequence (see paper)
23% identity, 88% coverage: 14:387/424 of query aligns to 13:370/383 of 5i39A

query
sites
5i39A
F
 
F
V
 
V
T
 
E
A
 
G
C
 
T
E
 
E
G
 
G
P
 
A
V
 
L
D
 
P
G
 
K
L
 
Q
A
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
I
x
V
G
|
G
A
 
A
G
|
G
F
x
I
T
x
L
G
 
G
L
 
I
S
 
M
A
 
T
A
 
A
L
 
I
A
 
N
L
 
L
G
 
V
K
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
L
S
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
I
V
|
V
D
x
E
A
x
K
G
 
G
R
 
N
V
 
I
G
 
A
G
 
G
G
 
E
A
x
Q
S
|
S
G
 
S
R
 
R
N
x
F
G
x
Y
G
 
G
Q
|
Q
V
x
A
N
 
I
T
 
S
G
 
Y
V
 
K
A
 
M
Q
 
P
D
 
D
F
 
E
V
 
T
A
 
F
L
 
L
A
 
L
A
 
H
Q
 
H
L
 
L
G
 
G
I
 
K
E
 
H
R
 
R
A
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
Y
 
W
R
 
R
A
 
E
F
 
M
A
 
N
D
 
A
A
 
K
V
 
V
D
 
G
T
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
Q
 
-
I
 
I
D
 
D
C
 
T
D
 
T
Y
 
Y
L
 
R
A
 
T
S
 
Q
G
 
G
K
 
R
L
 
V
K
 
E
L
 
V
A
 
P
S
 
L
K
 
D
P
 
E
H
 
E
H
 
D
L
 
L
A
 
V
H
 
N
L
 
V
E
 
R
K
 
K
T
 
W
A
 
I
D
 
D
L
 
E
I
 
R
R
 
S
R
 
K
T
 
N
V
 
V
D
 
G
T
 
S
D
 
D
I
 
I
-
 
P
-
 
F
-
 
K
-
 
T
E
 
R
L
 
I
I
 
I
D
 
E
G
 
G
D
 
A
R
 
E
I
 
L
R
 
N
S
 
Q
E
 
R
V
 
L
Q
 
R
S
 
G
D
 
A
S
 
T
F
 
T
H
 
D
G
 
W
G
 
K
L
 
I
-
 
A
-
 
G
L
 
F
Q
 
E
R
 
E
H
 
D
G
 
S
G
 
G
Q
 
S
M
 
F
H
 
D
M
 
P
G
 
E
K
 
V
F
 
A
T
 
T
V
 
F
G
 
V
L
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
Y
A
 
A
V
 
K
R
 
K
R
 
M
G
 
G
A
 
V
K
 
R
L
 
I
Y
 
Y
E
 
T
N
 
Q
A
 
C
A
|
A
V
x
A
T
 
R
S
 
G
I
 
L
V
 
E
K
 
T
D
 
Q
G
 
A
G
 
G
A
 
V
-
 
I
H
 
S
R
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
E
R
 
K
G
 
G
E
 
A
V
 
I
R
 
K
A
 
T
K
 
S
Q
 
Q
V
 
V
L
 
V
I
 
V
A
 
A
T
x
G
G
|
G
P
 
V
S
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
-
W
|
W
Y
 
S
R
 
R
R
 
L
R
 
F
L
 
M
A
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
I
 
-
V
 
-
V
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
P
 
-
E
 
Q
L
 
N
L
 
L
A
 
N
K
 
V
V
 
D
L
 
V
P
 
P
N
 
T
R
 
L
R
 
P
A
 
A
Y
 
Y
T
x
Q
T
 
S
T
x
Q
R
 
Q
L
 
L
M
 
I
H
 
S
N
 
G
Y
 
S
F
 
-
R
 
P
V
 
T
T
 
A
P
 
P
D
 
G
S
 
G
R
 
N
L
 
V
L
 
A
F
 
L
G
x
P
G
 
G
R
 
G
A
 
I
R
 
F
F
 
F
T
 
R
A
 
E
S
 
Q
E
 
A
R
 
D
P
 
G
S
 
T
D
 
Y
A
 
A
K
 
T
S
 
S
G
 
P
R
 
R
I
 
V
L
 
I
-
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
S
Q
 
L
Q
 
E
G
 
K
L
 
L
A
 
K
V
 
A
M
 
E
F
 
F
P
 
P
M
 
A
L
 
F
S
 
K
S
 
E
A
 
S
R
 
K
I
 
L
D
 
I
Y
 
D
C
 
Q
W
 
W
G
 
S
G
|
G
L
 
A
V
x
M
D
 
A
I
 
I
S
 
A
A
 
P
D
 
D
R
 
E
L
 
N
P
 
P
-
 
I
-
 
I
-
 
S
H
 
E
A
 
V
G
 
K
Q
 
E
H
 
Y
D
 
P
G
 
G
I
 
L
Y
 
V
F
 
I
S
 
N
M
 
T
G
 
A
Y
 
-
S
x
T
G
|
G
H
x
W
G
|
G
T
x
M
Q
x
T
M
 
E
S
 
S
T
 
P
H
 
V
M
 
S
G
 
A
Q
 
E
V
 
L
M
 
T
A
 
A
D
 
D
V
 
L
M
 
L
D
 
L
G
 
G
R
 
K
E
 
K

5hxwA L-amino acid deaminase from proteus vulgaris (see paper)
27% identity, 52% coverage: 14:235/424 of query aligns to 5:219/433 of 5hxwA

query
sites
5hxwA
F
 
F
V
 
V
T
 
E
A
 
G
C
 
T
E
 
E
G
 
G
P
 
A
V
 
L
D
 
P
G
 
K
L
 
Q
A
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
I
x
V
G
|
G
A
 
A
G
|
G
F
x
I
T
x
L
G
 
G
L
 
I
S
 
M
A
 
T
A
 
A
L
 
I
A
 
N
L
 
L
G
 
V
K
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
L
S
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
I
V
 
V
D
x
E
A
x
K
G
 
G
R
 
N
V
 
I
G
 
A
G
 
G
G
x
E
A
x
Q
S
|
S
G
 
S
R
|
R
N
x
F
G
x
Y
G
|
G
Q
|
Q
V
x
A
N
 
I
T
 
S
G
 
Y
V
 
K
A
 
M
Q
 
P
D
 
D
F
 
E
V
 
T
A
 
F
L
 
L
A
 
L
A
 
H
Q
 
H
L
 
L
G
 
G
I
 
K
E
 
H
R
 
R
A
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
Y
 
W
R
 
R
A
 
E
F
 
M
A
 
N
D
 
A
A
 
K
V
 
V
D
 
G
T
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
Q
 
-
I
 
I
D
 
D
C
 
T
D
 
T
Y
 
Y
L
 
R
A
 
T
S
 
Q
G
 
G
K
 
R
L
 
V
K
 
E
L
 
V
A
 
P
S
 
L
K
 
D
P
 
E
H
 
E
H
 
D
L
 
L
A
 
V
H
 
N
L
 
V
E
 
R
K
 
K
T
 
W
A
 
I
D
 
D
L
 
E
I
 
R
R
 
S
R
 
K
T
 
N
V
 
V
D
 
G
T
 
S
D
 
D
I
 
I
-
 
P
-
 
F
-
 
K
-
 
T
E
 
R
L
 
I
I
 
I
D
 
E
G
 
G
D
 
A
R
 
E
I
 
L
R
 
N
S
 
Q
E
 
R
V
 
L
Q
 
R
S
 
G
D
 
A
S
 
T
F
 
T
H
 
D
G
 
W
G
 
K
L
 
I
-
 
A
-
 
G
L
 
F
Q
 
E
R
 
E
H
 
D
G
 
S
G
 
G
Q
 
S
M
 
F
H
 
D
M
 
P
G
 
E
K
 
V
F
 
A
T
 
T
V
 
F
G
 
V
L
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
Y
A
 
A
V
 
K
R
 
K
R
 
M
G
 
G
A
 
V
K
 
R
L
 
I
Y
 
Y
E
 
T
N
 
Q
A
 
C
A
|
A
V
x
A
T
 
R
S
 
G
I
 
L
V
 
E
K
 
T
D
 
Q
G
 
A
G
 
G
A
 
V
-
 
I
H
 
S
R
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
E
R
 
K
G
 
G
E
 
A
V
 
I
R
 
K
A
 
T
K
 
S
Q
 
Q
V
 
V
L
 
V
I
 
V
A
 
A
T
x
G
G
|
G

Sites not aligning to the query:

S5FMM4 Glycine oxidase; GO; BliGO; EC 1.4.3.19 from Bacillus licheniformis (see paper)
24% identity, 84% coverage: 39:395/424 of query aligns to 18:358/369 of S5FMM4

query
sites
S5FMM4
S
 
S
A
 
I
A
 
A
L
 
Y
A
 
H
L
 
L
G
 
A
K
 
K
R
 
A
G
 
G
A
 
K
S
 
K
V
 
T
T
 
A
V
 
V
V
 
F
D
 
E
A
 
S
G
 
G
R
 
E
V
 
V
G
 
G
G
 
K
G
 
K
A
 
A
S
 
T
G
 
S
R
 
A
N
 
A
G
 
A
G
 
G
Q
 
M
V
 
L
N
x
G
T
 
A
G
 
H
V
x
A
A
 
E
Q
 
C
D
 
D
F
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
K
A
 
P
Q
 
G
L
 
T
G
 
F
I
 
F
E
 
E
R
 
F
A
 
A
S
 
R
A
 
A
C
 
S
Y
 
Q
R
 
K
A
 
A
F
 
Y
A
 
K
D
 
R
A
 
L
V
 
T
D
 
G
T
 
E
V
 
L
E
x
K
R
 
D
L
 
I
I
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
S
Q
 
G
I
 
I
D
 
D
C
 
I
D
 
R
Y
 
R
L
 
H
A
 
D
S
 
G
G
 
G
K
 
I
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
F
K
 
S
P
 
E
H
 
S
H
 
D
L
 
R
A
 
E
H
 
H
L
 
L
E
 
M
K
 
Q
T
 
M
A
 
G
D
 
A
L
 
L
I
 
-
R
 
-
R
 
-
T
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
D
D
 
S
I
 
V
E
 
E
L
 
W
I
 
L
D
 
E
G
 
A
D
 
D
R
 
E
I
 
V
R
 
-
S
 
Y
E
 
K
V
 
L
Q
 
E
S
 
P
D
 
N
S
 
A
F
 
G
H
 
K
G
 
G
G
 
I
L
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
N
L
 
F
Q
 
I
R
 
R
H
 
D
G
 
D
G
 
V
Q
 
H
M
 
V
H
 
E
M
 
P
G
 
A
K
 
A
F
 
V
T
 
C
V
 
R
G
 
A
L
 
F
A
 
A
E
 
R
A
 
G
A
 
A
V
 
R
R
 
M
R
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
L
 
V
Y
 
F
E
 
E
N
 
Y
A
 
T
A
 
P
V
 
V
T
 
L
S
 
S
I
 
I
V
 
E
K
 
S
D
 
E
G
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
V
R
 
R
V
 
V
V
 
T
T
 
S
T
 
A
R
 
S
G
 
G
E
 
T
V
 
A
R
 
E
A
 
A
K
 
E
Q
 
H
V
 
A
L
 
V
I
 
I
A
 
A
T
x
S
G
 
G
P
 
V
S
 
W
R
 
S
H
 
G
G
 
A
P
 
L
F
 
F
G
 
-
W
 
-
Y
 
-
R
 
-
R
 
K
R
 
Q
L
 
I
A
 
G
P
 
L
V
 
D
G
 
K
S
 
R
F
 
F
I
 
Y
V
 
-
V
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
P
L
 
V
P
 
K
P
 
G
E
 
E
L
 
C
L
 
L
A
 
S
K
 
-
V
 
-
L
 
V
P
 
W
N
 
N
R
 
D
R
 
G
A
 
I
Y
 
S
T
 
L
T
 
T
T
 
R
R
 
T
L
 
L
M
 
Y
H
 
H
N
 
D
Y
 
H
F
 
C
R
 
Y
V
 
I
T
 
V
P
 
P
-
 
R
-
 
H
D
 
S
S
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
V
F
 
V
G
 
G
G
 
A
R
 
T
A
 
M
R
 
K
-
 
P
F
 
G
T
 
D
A
 
W
S
 
N
E
 
E
R
 
Q
P
 
P
S
 
E
D
 
L
A
 
G
K
 
G
S
 
I
G
 
E
R
 
E
I
 
L
L
 
I
Q
 
R
Q
 
K
G
 
A
L
 
K
A
 
S
V
 
-
M
 
M
F
 
L
P
 
P
M
 
G
L
 
I
S
 
E
S
 
S
A
 
M
R
 
K
I
 
I
D
 
D
Y
 
Q
C
 
C
W
 
W
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
R
D
 
P
I
 
E
S
 
T
A
 
G
D
 
D
R
 
G
L
 
N
P
 
P
H
 
Y
A
 
I
G
 
G
Q
 
R
H
 
H
-
 
P
-
 
E
-
 
N
D
 
D
G
 
R
I
 
I
Y
 
L
F
 
F
S
 
A
M
 
A
G
 
G
Y
 
H
S
 
F
G
 
R
H
 
N
G
 
G
T
x
I
Q
 
L
M
 
L
S
 
A
T
 
P
H
 
A
M
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
M
M
|
M
A
 
A
D
 
D
V
 
M
M
 
I
D
 
L
G
 
G
R
 
N
E
 
P
D
 
V
R
 
K
N
 
T
P
 
E
W
 
W
G
 
I
E
 
E
S
 
A

O31616 Glycine oxidase; GO; EC 1.4.3.19 from Bacillus subtilis (strain 168) (see 3 papers)
22% identity, 82% coverage: 44:392/424 of query aligns to 23:355/369 of O31616

query
sites
O31616
L
 
L
G
 
A
K
 
K
R
 
E
G
 
N
A
 
K
S
 
N
V
 
T
T
 
A
V
 
L
V
 
F
D
x
E
A
x
S
G
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
R
A
x
T
S
x
T
G
 
S
R
 
-
N
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
V
 
-
N
 
-
T
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
-
A
 
A
L
 
A
A
|
A
A
x
G
Q
x
M
L
 
L
G
|
G
I
 
A
E
 
H
R
x
A
A
 
E
S
 
C
A
 
E
C
 
E
Y
 
R
R
 
D
A
 
A
F
 
F
A
 
F
D
 
D
A
 
F
V
 
A
D
 
M
T
 
H
V
 
S
E
 
Q
R
 
R
L
 
L
I
 
Y
R
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
G
E
 
E
E
 
E
Q
 
L
-
 
Y
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
G
I
 
V
D
 
D
C
 
I
D
 
R
Y
 
Q
L
 
H
A
 
N
S
 
G
G
 
G
K
 
M
L
 
F
K
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
F
K
 
S
P
 
E
H
 
E
H
 
D
L
 
V
A
 
L
H
 
Q
L
 
L
E
 
R
K
 
Q
T
 
M
A
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
D
R
 
S
R
 
V
T
 
S
V
 
W
D
 
Y
T
 
S
D
 
K
I
 
E
E
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
E
G
 
K
D
 
E
R
 
P
I
 
Y
R
 
A
S
 
S
E
 
-
V
 
-
Q
 
-
S
 
G
D
 
D
S
 
I
F
 
F
H
 
G
G
 
A
G
 
S
L
 
F
L
 
I
Q
 
Q
R
 
-
H
 
-
G
 
-
G
 
D
Q
 
D
M
 
V
H
 
H
M
 
V
G
 
E
K
 
P
F
 
Y
T
 
F
V
 
V
G
 
C
L
 
K
A
 
A
-
 
Y
-
 
V
E
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
K
R
 
M
R
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
E
L
 
I
Y
 
F
E
 
E
N
 
H
A
 
T
A
 
P
V
|
V
T
 
L
S
 
H
I
 
V
V
 
E
K
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
E
A
 
A
H
 
L
R
 
F
V
 
I
V
 
K
T
 
T
T
 
P
R
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
V
R
 
W
A
 
A
K
 
N
Q
 
H
V
 
V
L
 
V
I
 
V
A
 
A
T
 
S
G
 
G
P
 
V
S
 
W
R
 
S
H
 
-
G
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
G
W
 
M
Y
 
F
R
 
F
R
 
K
R
 
Q
L
 
L
A
 
G
P
 
L
V
 
N
G
 
N
S
 
A
F
 
F
I
 
L
V
 
-
V
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
P
L
 
V
P
 
K
P
 
G
E
 
E
L
 
C
L
 
L
A
 
S
K
 
-
V
 
-
L
 
V
P
 
W
N
 
N
R
 
D
R
 
D
A
 
I
Y
 
P
T
 
L
T
 
T
T
 
K
R
 
T
L
 
L
M
 
Y
H
 
H
N
 
D
Y
x
H
F
 
C
R
 
Y
V
 
I
T
 
V
P
 
P
-
 
R
-
 
K
D
 
S
S
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
V
F
 
V
G
 
G
G
 
A
R
 
T
A
 
M
R
 
K
F
 
P
T
 
G
A
 
D
S
 
W
E
 
S
R
 
E
P
 
T
S
 
P
D
 
D
A
 
L
K
 
G
S
 
G
G
 
L
R
 
E
I
 
S
L
 
V
Q
 
M
Q
 
K
G
 
K
L
 
A
A
 
K
V
 
T
M
 
M
F
 
L
P
 
P
M
 
A
L
 
I
S
 
Q
S
 
N
A
 
M
R
 
K
I
 
V
D
 
D
Y
 
R
C
 
F
W
 
W
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
x
R
D
 
P
I
 
G
S
 
T
A
 
K
D
 
D
R
 
G
L
 
K
P
 
P
H
 
Y
A
 
I
G
 
G
Q
 
R
H
 
H
-
 
P
-
 
E
-
 
D
D
 
S
G
 
R
I
 
I
Y
 
L
F
 
F
S
 
A
M
 
A
G
 
G
Y
x
H
S
x
F
G
x
R
H
x
N
G
|
G
T
x
I
Q
x
L
M
 
L
S
 
A
T
 
P
H
 
A
M
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
L
M
 
I
A
 
S
D
 
D
V
 
L
M
 
I
D
 
M
G
 
N
R
 
K
E
 
E
D
 
V
R
 
N
N
 
Q
P
 
D
W
 
W

Sites not aligning to the query:

1ng3A Complex of thio (glycine oxidase) with acetyl-glycine (see paper)
22% identity, 82% coverage: 44:392/424 of query aligns to 23:355/364 of 1ng3A

query
sites
1ng3A
L
 
L
G
 
A
K
 
K
R
 
E
G
 
N
A
 
K
S
 
N
V
 
T
T
 
A
V
 
L
V
x
F
D
x
E
A
x
S
G
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
G
 
G
G
x
R
A
x
T
S
x
T
G
 
S
R
 
-
N
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
V
 
-
N
 
-
T
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
-
A
 
A
L
x
A
A
|
A
A
x
G
Q
x
M
L
 
L
G
 
G
I
 
A
E
 
H
R
 
A
A
 
E
S
 
C
A
 
E
C
 
E
Y
 
R
R
 
D
A
 
A
F
 
F
A
 
F
D
 
D
A
 
F
V
 
A
D
 
M
T
 
H
V
 
S
E
 
Q
R
 
R
L
 
L
I
 
Y
R
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
G
E
 
E
E
 
E
Q
 
L
-
 
Y
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
G
I
 
V
D
 
D
C
 
I
D
x
R
Y
 
Q
L
 
H
A
 
N
S
 
G
G
 
G
K
 
M
L
 
F
K
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
F
K
 
S
P
 
E
H
 
E
H
 
D
L
 
V
A
 
L
H
 
Q
L
 
L
E
 
R
K
 
Q
T
 
M
A
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
D
R
 
S
R
 
V
T
 
S
V
 
W
D
 
Y
T
 
S
D
 
K
I
 
E
E
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
E
G
 
K
D
 
E
R
 
P
I
 
Y
R
 
A
S
 
S
E
 
-
V
 
-
Q
 
-
S
 
G
D
 
D
S
 
I
F
 
F
H
 
G
G
 
A
G
 
S
L
 
F
L
 
I
Q
 
Q
R
 
-
H
 
-
G
 
-
G
 
D
Q
 
D
M
 
V
H
 
H
M
 
V
G
 
E
K
 
P
F
 
Y
T
 
F
V
 
V
G
 
C
L
 
K
A
 
A
-
 
Y
-
 
V
E
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
K
R
 
M
R
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
E
L
 
I
Y
 
F
E
 
E
N
 
H
A
 
T
A
 
P
V
|
V
T
 
L
S
 
H
I
 
V
V
 
E
K
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
E
A
 
A
H
 
L
R
 
F
V
 
I
V
 
K
T
 
T
T
 
P
R
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
V
R
 
W
A
 
A
K
 
N
Q
 
H
V
 
V
L
 
V
I
 
V
A
 
A
T
x
S
G
|
G
P
 
V
S
x
W
R
 
S
H
 
-
G
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
G
W
 
M
Y
x
F
R
 
F
R
 
K
R
 
Q
L
 
L
A
 
G
P
 
L
V
 
N
G
 
N
S
 
A
F
 
F
I
 
L
V
 
-
V
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
P
L
 
V
P
 
K
P
 
G
E
 
E
L
 
C
L
 
L
A
 
S
K
 
-
V
 
-
L
 
V
P
 
W
N
 
N
R
 
D
R
 
D
A
 
I
Y
 
P
T
 
L
T
 
T
T
 
K
R
 
T
L
 
L
M
 
Y
H
 
H
N
 
D
Y
 
H
F
 
C
R
x
Y
V
 
I
T
 
V
P
 
P
-
 
R
-
 
K
D
 
S
S
 
G
R
|
R
L
 
L
L
 
V
F
 
V
G
 
G
G
 
A
R
 
T
A
 
M
R
 
K
F
 
P
T
 
G
A
 
D
S
 
W
E
 
S
R
 
E
P
 
T
S
 
P
D
 
D
A
 
L
K
 
G
S
 
G
G
 
L
R
 
E
I
 
S
L
 
V
Q
 
M
Q
 
K
G
 
K
L
 
A
A
 
K
V
 
T
M
 
M
F
 
L
P
 
P
M
 
P
L
 
I
S
 
Q
S
 
N
A
 
M
R
 
K
I
 
V
D
 
D
Y
 
R
C
 
F
W
 
W
G
 
A
G
|
G
L
 
L
V
x
R
D
 
P
I
 
G
S
 
T
A
 
K
D
 
D
R
 
G
L
 
K
P
 
P
H
 
Y
A
 
I
G
 
G
Q
 
R
H
 
H
-
 
P
-
 
E
-
 
D
D
 
S
G
 
R
I
 
I
Y
 
L
F
 
F
S
 
A
M
 
A
G
 
G
Y
x
H
S
 
F
G
x
R
H
x
N
G
|
G
T
x
I
Q
 
L
M
 
L
S
 
A
T
 
P
H
 
A
M
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
L
M
 
I
A
 
S
D
 
D
V
 
L
M
 
I
D
 
M
G
 
N
R
 
K
E
 
E
D
 
V
R
 
N
N
 
Q
P
 
D
W
 
W

Sites not aligning to the query:

3if9A Crystal structure of glycine oxidase g51s/a54r/h244a mutant in complex with inhibitor glycolate (see paper)
22% identity, 82% coverage: 44:392/424 of query aligns to 23:355/364 of 3if9A

query
sites
3if9A
L
 
L
G
 
A
K
 
K
R
 
E
G
 
N
A
 
K
S
 
N
V
 
T
T
 
A
V
 
L
V
 
F
D
x
E
A
x
S
G
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
R
A
x
T
S
x
T
G
 
S
R
 
-
N
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
V
 
-
N
 
-
T
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
-
A
 
A
L
x
A
A
|
A
A
x
G
Q
x
M
L
 
L
G
 
S
I
 
A
E
 
H
R
 
R
A
 
E
S
 
C
A
 
E
C
 
E
Y
 
R
R
 
D
A
 
A
F
 
F
A
 
F
D
 
D
A
 
F
V
 
A
D
 
M
T
 
H
V
 
S
E
 
Q
R
 
R
L
 
L
I
 
Y
R
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
G
E
 
E
E
 
E
Q
 
L
-
 
Y
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
G
I
 
V
D
 
D
C
 
I
D
 
R
Y
 
Q
L
 
H
A
 
N
S
 
G
G
 
G
K
 
M
L
 
F
K
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
F
K
 
S
P
 
E
H
 
E
H
 
D
L
 
V
A
 
L
H
 
Q
L
 
L
E
 
R
K
 
Q
T
 
M
A
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
D
R
 
S
R
 
V
T
 
S
V
 
W
D
 
Y
T
 
S
D
 
K
I
 
E
E
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
E
G
 
K
D
 
E
R
 
P
I
 
Y
R
 
A
S
 
S
E
 
-
V
 
-
Q
 
-
S
 
G
D
 
D
S
 
I
F
 
F
H
 
G
G
 
A
G
 
S
L
 
F
L
 
I
Q
 
Q
R
 
-
H
 
-
G
 
-
G
 
D
Q
 
D
M
 
V
H
 
H
M
 
V
G
 
E
K
 
P
F
 
Y
T
 
F
V
 
V
G
 
C
L
 
K
A
 
A
-
 
Y
-
 
V
E
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
K
R
 
M
R
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
E
L
 
I
Y
 
F
E
 
E
N
 
H
A
 
T
A
x
P
V
|
V
T
 
L
S
 
H
I
 
V
V
 
E
K
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
E
A
 
A
H
 
L
R
 
F
V
 
I
V
 
K
T
 
T
T
 
P
R
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
V
R
 
W
A
 
A
K
 
N
Q
 
H
V
 
V
L
 
V
I
 
V
A
 
A
T
x
S
G
|
G
P
 
V
S
x
W
R
 
S
H
 
-
G
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
G
W
 
M
Y
x
F
R
 
F
R
 
K
R
 
Q
L
 
L
A
 
G
P
 
L
V
 
N
G
 
N
S
 
A
F
 
F
I
 
L
V
 
-
V
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
P
L
 
V
P
 
K
P
 
G
E
 
E
L
 
C
L
 
L
A
 
S
K
 
-
V
 
-
L
 
V
P
 
W
N
 
N
R
 
D
R
 
D
A
 
I
Y
 
P
T
 
L
T
 
T
T
 
K
R
 
T
L
 
L
M
 
Y
H
 
H
N
 
D
Y
 
A
F
 
C
R
x
Y
V
 
I
T
 
V
P
 
P
-
 
R
-
 
K
D
 
S
S
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
V
F
 
V
G
 
G
G
 
A
R
 
T
A
 
M
R
 
K
F
 
P
T
 
G
A
 
D
S
 
W
E
 
S
R
 
E
P
 
T
S
 
P
D
 
D
A
 
L
K
 
G
S
 
G
G
 
L
R
 
E
I
 
S
L
 
V
Q
 
M
Q
 
K
G
 
K
L
 
A
A
 
K
V
 
T
M
 
M
F
 
L
P
 
P
M
 
A
L
 
I
S
 
Q
S
 
N
A
 
M
R
 
K
I
 
V
D
 
D
Y
 
R
C
 
F
W
 
W
G
 
A
G
|
G
L
 
L
V
x
R
D
 
P
I
 
G
S
 
T
A
 
K
D
 
D
R
 
G
L
 
K
P
 
P
H
 
Y
A
 
I
G
 
G
Q
 
R
H
 
H
-
 
P
-
 
E
-
 
D
D
 
S
G
 
R
I
 
I
Y
 
L
F
 
F
S
 
A
M
 
A
G
 
G
Y
x
H
S
x
F
G
x
R
H
x
N
G
|
G
T
x
I
Q
 
L
M
 
L
S
 
A
T
 
P
H
 
A
M
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
L
M
 
I
A
 
S
D
 
D
V
 
L
M
 
I
D
 
M
G
 
N
R
 
K
E
 
E
D
 
V
R
 
N
N
 
Q
P
 
D
W
 
W

Sites not aligning to the query:

4yshA Crystal structure of glycine oxidase from geobacillus kaustophilus
26% identity, 75% coverage: 68:387/424 of query aligns to 50:355/370 of 4yshA

query
sites
4yshA
G
 
G
G
 
A
Q
|
Q
V
 
S
N
 
E
T
 
F
G
 
S
V
 
T
A
 
S
Q
 
S
D
 
P
F
 
L
V
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
A
A
 
L
Q
 
Q
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
Y
 
S
R
 
R
A
 
A
F
 
L
A
 
M
D
 
P
A
 
A
V
 
L
D
 
-
T
 
-
V
 
A
E
 
E
R
 
E
L
 
L
I
 
R
R
 
E
E
 
R
E
 
T
Q
 
G
I
 
I
D
 
D
C
 
I
D
 
G
Y
 
L
L
 
V
A
 
E
S
 
K
G
 
G
K
 
L
L
 
I
K
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
T
K
 
T
P
 
E
H
 
E
H
 
E
L
 
A
A
 
D
H
 
D
L
 
L
E
 
Y
K
 
R
T
 
H
A
 
Y
D
 
T
L
 
F
I
 
W
R
 
R
R
 
G
T
 
I
V
 
G
D
 
E
T
 
P
D
 
V
I
 
Q
E
 
W
L
 
L
I
 
T
D
 
K
G
 
G
D
 
E
R
 
A
I
 
L
R
 
E
S
 
M
E
 
E
V
 
P
Q
 
R
-
 
L
S
 
A
D
 
E
S
 
A
F
 
L
H
 
A
G
 
G
G
 
A
L
 
M
L
 
Y
Q
 
I
R
 
P
H
 
G
G
 
D
G
 
G
Q
 
Q
M
 
V
H
 
S
M
 
A
G
 
P
K
 
D
F
 
L
T
 
A
V
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
Y
A
 
A
A
 
A
V
 
A
R
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
C
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
N
 
Y
A
 
T
A
 
E
V
|
V
T
 
F
S
 
D
I
 
I
V
 
R
K
 
S
D
 
D
G
 
S
G
 
S
A
 
G
H
 
H
R
 
V
V
 
L
V
 
D
T
 
T
T
 
T
R
 
G
G
 
G
E
 
T
V
 
F
R
 
A
A
 
A
K
 
E
Q
 
A
V
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
A
T
x
S
G
|
G
-
 
A
-
x
W
P
 
A
S
 
A
R
 
R
H
 
L
G
 
G
P
 
A
F
 
R
G
 
V
W
 
G
Y
 
L
R
 
S
R
 
L
R
 
S
L
 
V
A
 
Y
P
 
P
V
 
V
-
 
K
G
 
G
S
 
E
F
 
C
I
 
V
V
 
M
V
 
V
T
 
R
E
 
A
P
 
P
L
 
V
P
 
P
P
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
K
 
-
V
 
-
L
 
-
P
 
-
N
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
L
Y
 
L
T
 
Q
T
 
T
T
 
T
R
 
V
L
 
F
M
 
A
H
 
K
N
 
N
Y
 
G
F
 
C
R
 
Y
V
 
I
T
 
V
P
 
P
D
 
K
S
 
S
-
 
G
-
 
N
R
 
R
L
 
L
L
 
L
F
x
I
G
 
G
G
 
A
R
 
T
A
 
S
R
 
T
F
 
P
T
 
G
A
 
T
S
 
F
E
 
D
R
 
R
P
 
R
S
 
V
D
 
S
A
 
A
K
 
G
S
 
G
G
 
V
R
 
M
I
 
N
L
|
L
Q
 
L
Q
 
H
G
 
R
L
 
A
A
 
A
V
 
H
M
 
L
F
 
V
P
 
P
M
 
D
L
 
I
S
 
E
S
 
Q
A
 
A
R
 
E
I
 
W
D
 
V
Y
 
A
C
 
S
W
 
W
G
 
S
G
|
G
L
 
I
V
x
R
D
 
P
I
 
Q
S
 
T
A
 
E
D
 
D
R
 
G
L
 
L
P
 
P
H
 
Y
A
 
L
G
 
G
Q
 
E
H
 
H
D
 
P
-
 
E
-
 
R
-
 
R
G
 
G
I
 
L
Y
 
F
F
 
V
S
 
A
M
 
A
G
 
G
Y
x
H
S
 
Y
G
x
R
H
x
N
G
|
G
T
x
I
Q
x
L
M
 
L
S
 
S
T
 
P
H
 
L
M
 
T
G
 
G
Q
 
L
V
 
L
M
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
L
M
 
V
D
 
E
G
 
R
R
 
K
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Q5L2C2 Glycine oxidase; GO; GOX; GOXK; EC 1.4.3.19 from Geobacillus kaustophilus (strain HTA426)
25% identity, 75% coverage: 68:387/424 of query aligns to 51:357/377 of Q5L2C2

query
sites
Q5L2C2
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
V
 
S
N
 
E
T
 
F
G
 
S
V
 
T
A
 
S
Q
 
S
D
 
P
F
 
L
V
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
A
A
 
L
Q
 
Q
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
Y
 
S
R
 
R
A
 
A
F
 
L
A
 
M
D
 
P
A
 
A
V
 
L
D
 
-
T
 
-
V
 
A
E
 
E
R
 
E
L
 
L
I
 
R
R
 
E
E
 
R
E
 
T
Q
 
G
I
 
I
D
 
D
C
 
I
D
 
G
Y
 
L
L
 
V
A
 
E
S
 
K
G
 
G
K
 
L
L
 
I
K
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
T
K
 
T
P
 
E
H
 
E
H
 
E
L
 
A
A
 
D
H
 
D
L
 
L
E
 
Y
K
 
R
T
 
H
A
 
Y
D
 
T
L
 
F
I
 
W
R
 
R
R
 
G
T
 
I
V
 
G
D
 
E
T
 
P
D
 
V
I
 
Q
E
 
W
L
 
L
I
 
T
D
 
K
G
 
G
D
 
E
R
 
A
I
 
L
R
 
E
S
 
M
E
 
E
-
 
P
-
 
R
V
 
L
Q
 
A
S
 
A
D
 
E
S
 
A
F
 
L
H
 
A
G
 
G
G
 
A
L
 
M
L
 
Y
Q
 
I
R
 
P
H
 
G
G
 
D
G
 
G
Q
 
Q
M
 
V
H
 
S
M
 
A
G
 
P
K
 
D
F
 
L
T
 
A
V
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
Y
A
 
A
A
 
A
V
 
A
R
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
C
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
N
 
Y
A
 
T
A
 
E
V
|
V
T
 
F
S
 
D
I
 
I
V
 
R
K
 
S
D
 
D
G
 
S
G
 
S
A
 
G
H
 
H
R
 
V
V
 
L
V
 
D
T
 
T
T
 
T
R
 
G
G
 
G
E
 
T
V
 
F
R
 
A
A
 
A
K
 
E
Q
 
A
V
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
S
G
 
G
-
 
A
-
 
W
P
 
A
S
 
A
R
 
R
H
 
L
G
 
G
P
 
A
F
 
R
G
 
V
W
 
G
Y
 
L
R
 
S
R
 
L
R
 
S
L
 
V
A
 
Y
P
 
P
V
 
V
-
 
K
G
 
G
S
 
E
F
 
C
I
 
V
V
 
M
V
 
V
T
 
R
E
 
A
P
 
P
L
 
V
P
 
P
P
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
K
 
-
V
 
-
L
 
-
P
 
-
N
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
L
Y
 
L
T
 
Q
T
 
T
T
 
T
R
 
V
L
 
F
M
 
A
H
 
K
N
 
N
Y
 
G
F
 
C
R
 
Y
V
 
I
T
 
V
P
 
P
D
 
K
S
 
S
-
 
G
-
 
N
R
 
R
L
 
L
L
 
L
F
 
I
G
 
G
G
 
A
R
 
T
A
 
S
R
 
T
F
 
P
T
 
G
A
 
T
S
 
F
E
 
D
R
 
R
P
 
R
S
 
V
D
 
S
A
 
A
K
 
G
S
 
G
G
 
V
R
 
M
I
 
N
L
 
L
Q
 
L
Q
 
H
G
 
R
L
 
A
A
 
A
V
 
H
M
 
L
F
 
V
P
 
P
M
 
D
L
 
I
S
 
E
S
 
Q
A
 
A
R
 
E
I
 
W
D
 
V
Y
 
A
C
 
S
W
 
W
G
 
S
G
 
G
L
 
I
V
x
R
D
 
P
I
 
Q
S
 
T
A
 
E
D
 
D
R
 
G
L
 
L
P
 
P
H
 
Y
A
 
L
G
 
G
Q
 
E
H
 
H
D
 
P
-
 
E
-
 
R
-
 
R
G
 
G
I
 
L
Y
 
F
F
 
V
S
 
A
M
 
A
G
 
G
Y
x
H
S
x
Y
G
x
R
H
x
N
G
|
G
T
x
I
Q
x
L
M
 
L
S
 
S
T
 
P
H
 
L
M
 
T
G
 
G
Q
 
L
V
 
L
M
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
L
M
 
V
D
 
E
G
 
R
R
 
K
E
 
E

Sites not aligning to the query:

4yshB Crystal structure of glycine oxidase from geobacillus kaustophilus
26% identity, 75% coverage: 68:387/424 of query aligns to 50:355/368 of 4yshB

query
sites
4yshB
G
 
G
G
 
A
Q
|
Q
V
 
S
N
 
E
T
 
F
G
 
S
V
 
T
A
 
S
Q
 
S
D
 
P
F
 
L
V
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
A
A
 
L
Q
 
Q
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
Y
 
S
R
 
R
A
 
A
F
 
L
A
 
M
D
 
P
A
 
A
V
 
L
D
 
-
T
 
-
V
 
A
E
 
E
R
 
E
L
 
L
I
 
R
R
 
E
E
 
R
E
 
T
Q
 
G
I
 
I
D
 
D
C
 
I
D
 
G
Y
 
L
L
 
V
A
 
E
S
 
K
G
 
G
K
 
L
L
 
I
K
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
T
K
 
T
P
 
E
H
 
E
H
 
E
L
 
A
A
 
D
H
 
D
L
 
L
E
 
Y
K
 
R
T
 
H
A
 
Y
D
 
T
L
 
F
I
 
W
R
 
R
R
 
G
T
 
I
V
 
G
D
 
E
T
 
P
D
 
V
I
 
Q
E
 
W
L
 
L
I
 
T
D
 
K
G
 
G
D
 
E
R
 
A
I
 
L
R
 
E
S
 
M
E
 
E
V
 
P
Q
 
R
-
 
L
S
 
A
D
 
E
S
 
A
F
 
L
H
 
A
G
 
G
G
 
A
L
 
M
L
 
Y
Q
 
I
R
 
P
H
 
G
G
 
D
G
 
G
Q
 
Q
M
 
V
H
 
S
M
 
A
G
 
P
K
 
D
F
 
L
T
 
A
V
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
Y
A
 
A
A
 
A
V
 
A
R
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
C
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
N
 
Y
A
 
T
A
 
E
V
|
V
T
 
F
S
 
D
I
 
I
V
 
R
K
 
S
D
 
D
G
 
S
G
 
S
A
 
G
H
 
H
R
 
V
V
 
L
V
 
D
T
 
T
T
 
T
R
 
G
G
 
G
E
 
T
V
 
F
R
 
A
A
 
A
K
 
E
Q
 
A
V
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
A
T
x
S
G
 
G
-
 
A
-
x
W
P
 
A
S
 
A
R
 
R
H
 
L
G
 
G
P
 
A
F
 
R
G
 
V
W
 
G
Y
 
L
R
 
S
R
 
L
R
 
S
L
 
V
A
 
Y
P
 
P
V
 
V
-
 
K
G
 
G
S
 
E
F
 
C
I
 
V
V
 
M
V
 
V
T
 
R
E
 
A
P
 
P
L
 
V
P
 
P
P
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
K
 
-
V
 
-
L
 
-
P
 
-
N
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
L
Y
 
L
T
 
Q
T
 
T
T
 
T
R
 
V
L
 
F
M
 
A
H
 
K
N
 
N
Y
x
G
F
 
C
R
x
Y
V
 
I
T
 
V
P
 
P
D
 
K
S
 
S
-
 
G
-
 
N
R
 
R
L
 
L
L
 
L
F
x
I
G
 
G
G
x
A
R
 
T
A
 
S
R
 
T
F
 
P
T
 
G
A
 
T
S
 
F
E
 
D
R
 
R
P
 
R
S
 
V
D
 
S
A
 
A
K
 
G
S
 
G
G
 
V
R
 
M
I
 
N
L
|
L
Q
 
L
Q
 
H
G
 
R
L
 
A
A
 
A
V
 
H
M
 
L
F
 
V
P
 
P
M
 
D
L
 
I
S
 
E
S
 
Q
A
 
A
R
 
E
I
 
W
D
 
V
Y
 
A
C
 
S
W
 
W
G
 
S
G
|
G
L
 
I
V
x
R
D
 
P
I
 
Q
S
 
T
A
 
E
D
 
D
R
 
G
L
 
L
P
 
P
H
 
Y
A
 
L
G
 
G
Q
 
E
H
 
H
D
 
P
-
 
E
-
 
R
-
 
R
G
 
G
I
 
L
Y
 
F
F
 
V
S
 
A
M
 
A
G
 
G
Y
x
H
S
 
Y
G
x
R
H
x
N
G
|
G
T
x
I
Q
x
L
M
 
L
S
 
S
T
 
P
H
 
L
M
 
T
G
 
G
Q
 
L
V
 
L
M
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
L
M
 
V
D
 
E
G
 
R
R
 
K
E
 
E

Sites not aligning to the query:

5fjnA Structure of l-amino acid deaminase from proteus myxofaciens in complex with anthranilate (see paper)
26% identity, 52% coverage: 14:235/424 of query aligns to 17:231/447 of 5fjnA

query
sites
5fjnA
F
 
F
V
 
V
T
 
E
A
 
S
C
 
T
E
 
E
G
 
G
P
 
A
V
 
L
D
 
P
G
 
S
L
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
I
I
|
I
G
|
G
A
 
G
G
|
G
F
x
I
T
x
Q
G
 
G
L
 
I
S
 
M
A
 
T
A
 
A
L
 
I
A
 
N
L
 
L
G
 
A
K
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
M
S
 
S
V
 
V
T
 
T
V
 
I
V
x
L
D
x
E
A
x
K
G
 
G
R
 
E
V
 
V
G
 
A
G
 
G
G
x
E
A
x
Q
S
|
S
G
 
G
R
 
R
N
x
A
G
x
Y
G
x
S
Q
|
Q
V
 
I
N
 
I
T
 
S
G
 
Y
V
 
Q
A
 
T
Q
 
S
D
 
P
F
 
E
V
 
I
A
 
F
L
 
P
A
 
L
A
 
H
Q
 
H
L
 
Y
G
 
G
I
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
K
A
 
I
C
 
L
Y
 
W
R
 
R
A
 
G
F
 
M
A
 
N
D
 
E
A
 
K
V
 
I
D
 
G
T
 
A
V
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
Q
 
-
I
 
-
D
 
D
C
 
T
D
 
S
Y
 
Y
L
 
R
A
 
T
S
 
Q
G
 
G
K
 
R
L
 
V
K
 
E
L
 
A
A
 
L
S
 
A
K
 
D
P
 
E
H
 
K
H
 
A
L
 
L
A
 
D
H
 
R
L
 
A
E
 
Q
K
 
E
T
 
W
A
 
I
D
 
K
L
 
T
I
 
A
R
 
K
R
 
E
T
 
T
V
 
A
D
 
G
T
 
F
D
 
D
I
 
V
E
 
P
L
 
L
I
 
-
D
 
N
G
 
T
D
 
R
R
 
I
I
 
I
R
 
K
S
 
G
E
 
E
V
 
E
Q
 
L
S
 
S
D
 
N
S
 
R
F
 
L
H
 
V
G
 
G
-
 
A
-
 
Q
-
 
T
-
 
P
-
 
W
-
 
T
-
 
V
G
 
A
L
 
A
L
 
F
Q
 
E
R
 
E
H
 
D
G
 
S
G
 
G
Q
 
S
M
 
V
H
 
D
M
 
P
G
 
E
K
 
T
F
 
G
T
 
T
V
 
P
G
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
R
A
 
Y
A
 
A
V
 
K
R
 
Q
R
 
I
G
 
G
A
 
V
K
 
K
L
 
I
Y
 
Y
E
 
T
N
 
H
A
 
C
A
 
A
V
|
V
T
 
R
S
 
G
I
 
I
V
 
E
K
 
T
D
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
K
-
 
I
H
 
S
R
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
E
R
 
K
G
 
G
E
 
A
V
 
I
R
 
R
A
 
T
K
 
S
Q
 
N
V
 
V
L
 
V
I
 
L
A
 
A
T
x
G
G
|
G

Sites not aligning to the query:

5fjmA Structure of l-amino acid deaminase from proteus myxofaciens (see paper)
26% identity, 52% coverage: 14:235/424 of query aligns to 17:231/447 of 5fjmA

query
sites
5fjmA
F
 
F
V
 
V
T
 
E
A
 
S
C
 
T
E
 
E
G
 
G
P
 
A
V
 
L
D
 
P
G
 
S
L
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
I
I
|
I
G
|
G
A
 
G
G
|
G
F
x
I
T
x
Q
G
 
G
L
 
I
S
 
M
A
 
T
A
 
A
L
 
I
A
 
N
L
 
L
G
 
A
K
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
M
S
 
S
V
 
V
T
 
T
V
 
I
V
x
L
D
x
E
A
x
K
G
 
G
R
 
E
V
 
V
G
 
A
G
 
G
G
x
E
A
x
Q
S
|
S
G
 
G
R
 
R
N
x
A
G
x
Y
G
x
S
Q
|
Q
V
 
I
N
 
I
T
 
S
G
 
Y
V
 
Q
A
 
T
Q
 
S
D
 
P
F
 
E
V
 
I
A
 
F
L
 
P
A
 
L
A
 
H
Q
 
H
L
 
Y
G
 
G
I
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
K
A
 
I
C
 
L
Y
 
W
R
 
R
A
 
G
F
 
M
A
 
N
D
 
E
A
 
K
V
 
I
D
 
G
T
 
A
V
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
Q
 
-
I
 
-
D
 
D
C
 
T
D
 
S
Y
 
Y
L
 
R
A
 
T
S
 
Q
G
 
G
K
 
R
L
 
V
K
 
E
L
 
A
A
 
L
S
 
A
K
 
D
P
 
E
H
 
K
H
 
A
L
 
L
A
 
D
H
 
R
L
 
A
E
 
Q
K
 
E
T
 
W
A
 
I
D
 
K
L
 
T
I
 
A
R
 
K
R
 
E
T
 
T
V
 
A
D
 
G
T
 
F
D
 
D
I
 
V
E
 
P
L
 
L
I
 
-
D
 
N
G
 
T
D
 
R
R
 
I
I
 
I
R
 
K
S
 
G
E
 
E
V
 
E
Q
 
L
S
 
S
D
 
N
S
 
R
F
 
L
H
 
V
G
 
G
-
 
A
-
 
Q
-
 
T
-
 
P
-
 
W
-
 
T
-
 
V
G
 
A
L
 
A
L
 
F
Q
 
E
R
 
E
H
 
D
G
 
S
G
 
G
Q
 
S
M
 
V
H
 
D
M
 
P
G
 
E
K
 
T
F
 
G
T
 
T
V
 
P
G
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
R
A
 
Y
A
 
A
V
 
K
R
 
Q
R
 
I
G
 
G
A
 
V
K
 
K
L
 
I
Y
 
Y
E
 
T
N
 
H
A
 
C
A
 
A
V
|
V
T
 
R
S
 
G
I
 
I
V
 
E
K
 
T
D
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
K
-
 
I
H
 
S
R
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
E
R
 
K
G
 
G
E
 
A
V
 
I
R
 
R
A
 
T
K
 
S
Q
 
N
V
 
V
L
 
V
I
 
L
A
 
A
T
x
G
G
|
G

Sites not aligning to the query:

8p84B X-ray structure of thermoanaerobacterales bacterium monoamine oxidase (see paper)
28% identity, 50% coverage: 27:240/424 of query aligns to 5:268/450 of 8p84B

query
sites
8p84B
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
I
x
V
G
|
G
A
 
A
G
|
G
F
 
F
T
x
A
G
 
G
L
 
L
S
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
A
L
 
V
G
 
H
K
 
E
R
 
A
G
 
G
A
 
R
S
 
S
V
 
V
T
 
L
V
 
V
V
 
L
D
x
E
A
|
A
-
x
R
G
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
x
R
A
x
T
S
 
C
G
 
T
R
 
E
N
 
E
-
 
H
-
 
H
-
 
G
-
 
T
-
 
W
-
 
I
-
 
D
-
 
L
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
V
 
-
N
x
W
T
 
I
G
 
G
V
 
P
A
 
G
Q
 
Q
D
 
D
F
 
R
V
 
V
-
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
V
E
 
E
-
 
T
-
 
Y
-
 
P
-
 
Q
-
 
P
-
 
T
-
 
E
-
 
G
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
V
-
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
E
-
 
P
-
 
Q
R
 
R
A
 
A
S
 
P
A
 
D
C
 
V
Y
 
A
R
 
L
A
 
A
F
 
F
A
 
S
D
 
D
A
 
E
V
 
E
D
 
L
T
 
T
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
-
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
A
V
 
L
E
 
E
R
 
A
L
 
I
I
 
A
R
x
E
E
 
K
E
 
V
Q
 
P
I
 
L
D
 
D
C
 
A
D
 
P
Y
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
P
G
 
E
K
 
A
L
 
A
K
 
A
L
 
W
A
 
D
S
 
A
K
 
T
-
 
T
-
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
W
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
T
-
 
G
-
 
V
P
 
P
H
 
D
H
 
R
L
 
V
A
 
A
H
 
G
L
 
L
-
 
F
E
 
E
K
 
V
T
 
A
A
 
V
D
 
Q
L
 
A
I
 
V
R
 
F
R
 
A
T
 
A
V
 
T
D
 
S
T
 
A
D
 
Q
I
 
L
E
 
S
L
 
L
I
 
L
D
 
H
G
 
A
D
 
A
R
 
H
I
 
Y
R
 
-
S
 
-
E
 
-
V
 
V
Q
x
H
S
 
S
D
 
A
S
 
G
F
 
G
H
 
W
G
 
S
G
 
K
L
 
L
L
 
T
Q
 
D
R
 
T
H
 
E
G
 
G
G
 
G
Q
 
-
M
 
A
H
 
Q
M
 
Q
G
 
D
K
 
R
F
 
L
T
 
V
V
 
G
G
 
G
L
 
V
A
 
Q
E
 
P
A
 
L
A
 
A
V
 
E
R
 
R
R
 
L
G
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
L
Y
 
P
E
 
D
N
 
G
A
 
A
-
 
L
-
 
R
-
 
L
-
 
S
-
 
T
A
 
P
V
|
V
T
 
R
S
 
G
I
 
L
V
 
A
K
 
Q
D
 
D
G
 
G
G
 
D
A
 
G
H
 
V
R
 
T
V
 
V
V
 
R
T
 
T
T
 
A
R
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
V
R
 
R
A
 
A
K
 
R
Q
 
R
V
 
A
L
 
I
I
 
V
A
 
A
T
x
V
G
 
P
P
 
P
S
 
T
R
 
L
H
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>H281DRAFT_06337 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_06337
MKLESYWLDTAPPFVTACEGPVDGLADVVVIGAGFTGLSAALALGKRGASVTVVDAGRVG
GGASGRNGGQVNTGVAQDFVALAAQLGIERASACYRAFADAVDTVERLIREEQIDCDYLA
SGKLKLASKPHHLAHLEKTADLIRRTVDTDIELIDGDRIRSEVQSDSFHGGLLQRHGGQM
HMGKFTVGLAEAAVRRGAKLYENAAVTSIVKDGGAHRVVTTRGEVRAKQVLIATGPSRHG
PFGWYRRRLAPVGSFIVVTEPLPPELLAKVLPNRRAYTTTRLMHNYFRVTPDSRLLFGGR
ARFTASERPSDAKSGRILQQGLAVMFPMLSSARIDYCWGGLVDISADRLPHAGQHDGIYF
SMGYSGHGTQMSTHMGQVMADVMDGREDRNPWGESEWAAIPGHTGKPWFLPLVGTYYRIK
DIFY

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory