SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_06342 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_06342 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3fcrA Crystal structure of putative aminotransferase (yp_614685.1) from silicibacter sp. Tm1040 at 1.80 a resolution
43% identity, 94% coverage: 5:447/473 of query aligns to 7:457/458 of 3fcrA

query
sites
3fcrA
S
 
Q
L
 
L
I
 
D
E
 
Q
A
 
W
D
 
D
R
 
R
Q
 
D
H
 
N
L
 
F
I
 
F
H
 
H
P
 
P
V
x
S
I
 
T
N
 
H
Y
 
L
R
 
A
A
 
Q
H
 
H
E
 
-
A
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
E
T
 
S
-
 
A
-
 
N
-
 
R
V
 
V
L
 
I
E
 
K
S
 
T
A
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
I
R
 
E
D
 
D
A
 
R
A
 
D
G
 
G
N
 
T
E
 
K
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
A
F
 
F
S
 
A
G
 
G
L
 
L
W
 
Y
C
 
C
V
 
V
N
 
N
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
R
Q
 
Q
S
 
E
I
 
I
V
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
I
T
 
A
A
 
D
Q
 
Q
M
 
A
K
 
R
K
 
E
L
 
L
P
 
A
Y
 
Y
A
 
Y
T
 
H
S
 
S
Y
 
Y
F
 
V
H
 
G
F
 
H
G
 
G
S
 
T
E
 
E
P
 
A
A
 
S
I
 
I
E
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
K
 
M
L
 
I
A
 
L
S
 
D
V
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
K
S
 
N
L
 
M
Q
 
S
H
 
K
V
 
V
Y
 
Y
F
 
F
T
 
G
L
 
L
G
 
G
G
|
G
S
|
S
D
 
D
A
 
A
V
 
N
D
 
E
S
 
T
A
 
N
I
 
V
R
 
K
F
 
L
I
 
I
T
 
W
H
 
Y
Y
 
Y
F
 
N
N
 
N
A
 
I
T
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
E
K
 
K
K
 
K
H
 
K
I
 
I
I
 
I
A
 
S
L
 
R
Q
 
W
R
 
R
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
S
 
S
S
 
G
S
 
L
M
 
V
G
 
T
A
 
G
G
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
G
L
 
L
P
 
E
A
 
L
F
 
F
H
 
H
R
 
K
N
 
K
F
 
F
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
V
P
 
E
N
 
Q
Q
 
V
H
 
I
H
 
H
L
 
T
P
 
E
S
 
A
P
 
P
Y
 
Y
A
 
Y
Y
 
F
R
 
R
S
 
R
N
 
E
F
 
D
A
 
L
D
 
N
-
 
Q
-
 
T
D
 
E
A
 
E
A
 
Q
L
 
F
I
 
V
A
 
A
A
 
H
S
 
C
V
 
V
A
 
A
A
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
A
K
 
L
V
 
I
A
 
E
E
 
R
L
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
N
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
F
F
 
I
C
 
G
E
|
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
L
G
 
G
S
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
V
V
 
P
P
 
P
P
 
P
F
 
A
G
 
G
W
 
Y
L
 
W
K
 
E
A
 
A
M
 
I
R
 
Q
E
 
T
S
 
V
C
 
L
R
 
N
K
 
K
L
 
H
G
 
D
I
 
I
L
 
L
F
 
L
L
 
V
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
x
V
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
L
G
 
G
P
 
T
L
 
M
F
 
F
A
 
G
C
 
S
Q
 
D
G
 
H
E
 
Y
S
 
G
V
 
L
E
 
E
P
 
P
D
 
D
L
 
I
M
 
I
T
 
T
V
 
I
A
 
A
K
|
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
S
G
 
A
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
M
 
L
G
 
S
A
 
G
V
 
S
L
 
I
M
 
V
S
 
S
D
 
D
E
 
K
I
 
V
Y
 
W
Q
 
K
G
 
V
I
 
L
A
 
E
D
 
Q
G
 
G
-
 
T
D
 
D
A
 
E
E
 
N
A
 
G
I
 
P
V
 
I
G
 
G
H
 
H
G
 
G
H
 
W
T
|
T
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
H
 
H
P
 
P
V
 
I
S
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
A
G
 
G
L
 
V
E
 
A
V
 
N
L
 
L
R
 
K
L
 
L
Y
 
L
H
 
D
E
 
E
G
 
L
G
 
N
L
 
L
L
 
V
A
 
S
N
 
N
-
 
A
G
 
G
A
 
E
A
 
V
R
 
G
A
 
A
P
 
Y
R
 
L
F
 
N
A
 
A
R
 
T
G
 
M
L
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
S
E
 
Q
H
 
H
P
 
A
L
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
S
 
V
R
 
R
H
 
G
R
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
C
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
F
V
 
V
S
 
K
N
 
D
K
 
R
D
 
D
S
 
S
K
 
R
A
 
T
Q
 
F
F
 
F
D
 
D
P
 
A
A
 
A
L
 
D
K
 
K
L
 
I
S
 
G
E
 
P
R
 
Q
I
 
I
A
 
S
A
 
A
A
 
K
A
 
L
Y
 
L
E
 
E
-
 
Q
N
 
D
R
 
K
L
 
I
I
 
I
F
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
M
-
 
P
-
 
Q
G
 
G
D
 
D
N
 
-
I
 
I
L
 
L
G
|
G
F
 
F
A
 
A
P
 
P
A
 
P
L
 
F
S
 
C
Y
 
L
T
 
T
E
 
R
S
 
A
D
 
E
F
 
A
D
 
D
M
 
Q
M
 
V
F
 
V
E
 
E
R
 
G
L
 
T
E
 
L
K
 
R
T
 
A
L
 
V
D
 
K
D
 
A
V
 
V
L
 
L

5kr6B Directed evolution of transaminases by ancestral reconstruction. Using old proteins for new chemistries
41% identity, 93% coverage: 5:446/473 of query aligns to 8:456/460 of 5kr6B

query
sites
5kr6B
S
 
D
L
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
M
D
 
D
R
 
R
Q
 
A
H
 
H
L
 
F
I
 
F
H
 
H
P
 
P
V
 
S
I
 
T
N
 
H
Y
 
L
R
 
R
A
 
D
H
 
H
E
 
A
A
 
S
R
 
G
G
 
E
V
 
L
-
 
P
-
 
G
T
 
R
V
 
I
L
 
I
E
 
T
S
 
G
A
 
G
S
 
K
G
 
G
A
 
I
F
 
R
L
 
I
R
 
Q
D
 
D
A
 
S
A
 
E
G
 
G
N
 
R
E
 
E
L
 
Y
L
 
I
D
 
D
A
 
A
F
 
F
S
 
A
G
 
G
L
 
L
W
 
Y
C
 
C
V
 
V
N
 
N
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
R
Q
 
T
S
 
E
I
 
I
V
 
A
E
 
D
A
 
A
A
 
I
T
 
Y
A
 
E
Q
 
Q
M
 
A
K
 
K
K
 
E
L
 
L
P
 
A
Y
 
Y
A
 
Y
T
 
H
S
 
T
Y
 
Y
F
 
V
H
 
G
F
 
H
G
 
S
S
 
N
E
 
E
P
 
P
A
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
S
Q
 
E
K
 
R
L
 
I
A
 
I
-
 
R
S
 
E
V
 
W
A
 
A
P
 
P
A
 
A
S
 
G
L
 
M
Q
 
S
H
 
K
V
 
V
Y
 
Y
F
 
Y
T
 
G
L
 
M
G
x
S
G
|
G
S
|
S
D
 
D
A
 
A
V
 
N
D
 
E
S
 
T
A
 
Q
I
 
I
R
 
K
F
 
L
I
 
V
T
 
W
H
 
Y
Y
 
Y
F
 
N
N
 
N
A
 
V
T
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
Q
K
 
K
K
 
K
H
 
K
I
 
I
I
 
I
A
 
S
L
 
R
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
S
 
S
S
 
G
S
 
I
M
 
M
G
 
T
A
 
G
G
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
A
F
 
F
H
 
H
R
 
N
N
 
H
F
 
F
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
L
P
 
E
N
 
P
Q
 
I
H
 
R
H
 
H
L
 
T
P
 
T
S
 
C
P
 
P
Y
 
H
A
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
S
 
A
N
 
P
F
 
A
A
 
G
D
 
M
D
 
S
A
 
E
A
 
A
L
 
E
I
 
F
A
 
S
A
 
R
S
 
H
V
 
C
A
 
A
-
 
D
A
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
K
 
M
V
 
I
A
 
L
E
 
A
L
 
E
G
 
G
A
 
P
D
 
D
N
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
F
F
 
I
C
 
G
E
|
E
P
 
P
I
 
V
Q
 
M
G
 
G
S
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
V
V
 
P
P
 
P
P
 
P
F
 
E
G
 
G
W
 
Y
L
 
W
K
 
E
A
 
A
M
 
I
R
 
Q
E
 
A
S
 
V
C
 
L
R
 
N
K
 
K
L
 
Y
G
 
D
I
 
I
L
 
L
F
 
L
L
 
I
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
 
V
T
 
C
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
P
 
S
L
 
M
F
 
F
A
 
G
C
 
S
Q
 
H
G
 
H
E
 
Y
S
 
G
V
 
M
E
 
K
P
 
P
D
 
D
L
 
L
M
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
K
|
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
S
G
 
A
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
M
 
L
G
 
S
A
 
G
V
 
V
L
 
I
M
 
V
S
 
G
D
 
E
E
 
K
I
 
V
Y
 
W
Q
 
K
G
 
V
I
 
L
A
 
E
D
 
Q
G
 
G
-
 
S
D
 
D
A
 
Q
E
 
Y
A
 
G
I
 
P
V
 
I
G
 
G
H
 
H
G
 
G
H
 
W
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
A
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
I
S
 
C
A
 
A
A
 
A
I
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
A
V
 
N
L
 
L
R
 
D
L
 
I
Y
 
I
H
 
E
E
 
R
G
 
E
G
 
N
L
 
L
L
 
T
A
 
G
N
 
N
G
 
A
A
 
A
A
 
D
R
 
T
A
 
G
P
 
A
R
 
Y
F
 
F
-
 
Q
A
 
Q
R
 
R
G
 
M
L
 
R
D
 
E
A
 
T
L
 
F
L
 
G
E
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
S
 
V
R
 
R
H
 
G
R
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
M
G
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
F
V
 
V
S
 
A
N
 
D
K
 
K
D
 
D
S
 
K
K
 
R
A
 
T
Q
 
R
F
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
S
L
 
L
K
 
K
L
 
V
S
 
G
E
 
P
R
 
R
I
 
V
A
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
C
Y
 
L
E
 
E
N
 
D
R
 
G
L
 
M
I
 
I
F
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
M
-
 
P
-
 
H
G
 
G
D
 
D
N
 
-
I
 
I
L
 
L
G
 
G
F
 
F
A
 
A
P
 
P
A
 
P
L
 
L
S
 
V
Y
 
I
T
 
T
E
 
R
S
 
A
D
 
E
F
 
V
D
 
D
M
 
E
M
 
I
F
 
V
E
 
D
R
 
I
L
 
A
E
 
K
K
 
Q
T
 
A
L
 
V
D
 
D
D
 
A
V
 
V

5kr5A Directed evolution of transaminases by ancestral reconstruction. Using old proteins for new chemistries
40% identity, 94% coverage: 3:446/473 of query aligns to 2:452/455 of 5kr5A

query
sites
5kr5A
I
 
L
Q
 
E
S
 
Q
L
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
M
D
 
D
R
 
R
Q
 
A
H
 
H
L
 
F
I
 
M
H
 
H
P
 
P
V
 
S
I
 
T
N
 
H
Y
 
A
R
 
Y
A
 
D
H
 
H
E
 
A
A
 
S
R
 
G
G
 
A
V
 
L
-
 
P
-
 
G
T
 
R
V
 
I
L
 
I
E
 
T
S
 
G
A
 
G
S
 
K
G
 
G
A
 
I
F
 
R
L
 
I
R
 
E
D
 
D
A
 
H
A
 
E
G
 
G
N
 
R
E
 
E
L
 
Y
L
 
I
D
 
D
A
 
A
F
 
F
S
 
A
G
 
G
L
 
L
W
 
Y
C
 
C
V
 
V
N
 
N
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
R
Q
x
E
S
 
E
I
 
V
V
 
A
E
x
D
A
 
A
A
 
I
T
 
Y
A
 
E
Q
 
Q
M
 
A
K
 
K
K
 
Q
L
 
L
P
 
A
Y
 
Y
A
 
Y
T
 
H
S
 
T
Y
 
Y
F
 
V
H
 
G
F
 
H
G
 
S
S
 
N
E
 
D
P
 
P
A
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
S
Q
 
S
K
 
R
L
 
I
-
 
I
A
 
E
S
 
D
V
 
W
A
 
A
P
 
P
A
 
A
S
 
G
L
 
M
Q
 
K
H
 
K
V
 
V
Y
 
F
F
 
Y
T
 
G
L
 
M
G
x
S
G
|
G
S
|
S
D
 
D
A
 
A
V
 
N
D
 
E
S
 
T
A
 
Q
I
 
I
R
 
K
F
 
L
I
 
V
T
 
W
H
 
Y
Y
 
Y
F
 
N
N
 
N
A
 
V
T
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
N
K
 
K
K
 
K
H
 
K
I
 
I
I
 
I
A
 
A
L
 
R
Q
 
E
R
 
R
G
 
S
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
S
 
S
S
 
G
S
 
I
M
 
V
G
 
T
A
 
G
G
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
S
F
 
F
H
 
H
R
 
Q
N
 
H
F
 
F
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
I
P
 
D
N
 
R
Q
 
V
H
 
K
H
 
H
L
 
T
P
 
V
S
 
C
P
 
P
Y
 
H
A
 
W
Y
 
Y
R
 
N
S
 
A
N
 
P
F
 
P
A
 
G
-
 
M
D
 
S
D
 
E
A
 
A
A
 
Q
L
 
F
I
 
V
A
 
A
A
 
Y
S
 
C
V
 
V
A
 
E
A
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
K
 
L
V
 
I
A
 
A
E
 
R
L
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
N
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
F
F
 
I
C
 
A
E
|
E
P
 
P
I
 
V
Q
 
M
G
 
G
S
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
V
V
 
P
P
 
P
P
 
P
F
 
Q
G
 
G
W
 
Y
L
 
W
K
 
E
A
 
A
M
 
I
R
 
Q
E
 
A
S
 
V
C
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
H
G
 
D
I
 
I
L
 
L
F
 
L
L
 
I
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
 
V
T
 
C
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
L
G
 
G
P
 
S
L
 
K
F
 
T
A
 
G
C
 
S
Q
 
E
G
 
H
E
 
Y
S
 
G
V
 
I
E
 
K
P
 
P
D
 
D
L
 
L
M
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
K
|
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
S
G
 
A
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
M
 
L
G
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
I
M
 
V
S
 
S
D
 
E
E
 
K
I
 
V
Y
 
W
Q
 
D
G
 
V
I
 
I
A
 
E
D
 
K
G
 
G
D
 
S
A
 
R
E
 
E
-
 
H
A
 
G
I
 
V
V
 
M
G
 
G
H
 
H
G
 
G
H
x
W
T
|
T
Y
 
Y
S
 
S
A
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
C
A
 
A
A
 
A
I
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
A
V
 
N
L
 
L
R
 
D
L
 
I
Y
 
L
H
 
E
E
 
R
G
 
E
G
 
N
L
 
L
L
 
T
A
 
G
N
 
N
G
 
A
A
 
A
A
 
D
R
 
V
A
 
G
P
 
A
R
 
Y
F
 
L
A
 
Q
R
 
Q
G
 
R
L
 
L
-
 
H
D
 
E
A
 
A
L
 
F
L
 
G
E
 
A
H
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
S
 
V
R
 
R
H
 
G
R
 
V
G
 
G
L
 
M
L
 
L
G
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
F
V
 
M
S
 
A
N
 
D
K
 
K
D
 
G
S
 
A
K
 
R
A
 
T
Q
 
P
F
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
V
S
 
S
E
 
Q
R
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
L
E
 
E
N
x
D
R
 
G
L
 
L
I
 
I
F
 
V
R
 
R
A
 
A
F
 
L
-
 
P
-
 
H
G
 
G
D
 
D
N
 
-
I
 
I
L
 
L
G
 
G
F
 
F
A
 
A
P
 
P
A
 
P
L
 
L
S
 
V
Y
 
T
T
 
T
E
 
R
S
 
A
D
 
E
F
 
V
D
 
D
M
 
E
M
 
I
F
 
V
E
 
A
R
 
I
L
 
A
E
 
K
K
x
E
T
 
A
L
 
F
D
 
D
D
 
E
V
 
V

7qx0B Transaminase structure of plurienzyme (tr2e2) in complex with plp (see paper)
38% identity, 92% coverage: 10:446/473 of query aligns to 9:438/443 of 7qx0B

query
sites
7qx0B
D
 
D
R
 
A
Q
 
A
H
 
H
L
 
H
I
 
L
H
 
H
P
 
P
V
 
F
I
 
T
N
 
D
Y
 
Y
R
 
G
A
 
E
H
 
L
E
 
N
A
 
T
R
 
K
G
 
G
V
 
S
T
 
R
V
 
I
L
 
I
E
 
T
S
 
R
A
 
A
S
 
E
G
 
G
A
 
C
F
 
Y
L
 
L
R
 
W
D
 
D
A
 
S
A
 
D
G
 
G
N
 
N
E
 
Q
L
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
G
F
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
L
W
 
W
C
 
C
V
 
V
N
 
N
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
R
Q
 
K
S
 
E
I
 
L
V
 
A
E
 
E
A
 
V
A
 
A
T
 
Y
A
 
R
Q
 
Q
M
 
M
K
 
Q
K
 
E
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
A
 
Y
T
 
N
S
 
N
Y
 
F
F
 
F
H
 
Q
F
 
C
G
 
S
S
 
H
E
 
P
P
 
P
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
S
Q
 
R
K
 
L
L
 
L
A
 
S
S
 
E
V
 
V
A
 
T
P
 
P
A
 
K
S
 
H
L
 
M
Q
 
N
H
 
H
V
 
V
Y
 
F
F
 
F
T
 
T
L
 
G
G
x
S
G
|
G
S
|
S
D
 
D
A
 
S
V
 
N
D
 
D
S
 
T
A
 
I
I
 
L
R
 
R
F
 
M
I
 
V
T
 
R
H
 
Y
Y
 
Y
F
 
W
N
 
K
A
 
L
T
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
S
 
Y
K
 
K
K
 
K
H
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
S
L
 
R
Q
 
E
R
 
N
G
 
A
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
S
 
S
S
 
T
S
 
V
M
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
S
L
 
L
T
 
S
A
 
G
L
 
M
P
 
K
A
 
A
F
 
M
H
 
H
R
 
S
N
 
H
F
 
G
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
I
P
 
P
N
 
G
Q
 
I
H
 
E
H
 
H
L
 
I
P
 
E
S
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
A
 
H
Y
 
F
-
 
G
R
 
R
S
 
A
N
 
P
F
 
D
A
 
M
D
 
D
D
 
P
A
 
A
A
 
E
L
 
F
I
 
G
A
 
R
A
 
Q
S
 
A
V
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
R
K
 
K
V
 
I
A
 
D
E
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
C
N
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
F
F
 
I
C
 
A
E
|
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
S
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
I
P
 
P
P
 
P
F
 
D
G
 
S
W
 
Y
L
 
W
K
 
P
A
 
E
M
 
I
R
 
K
E
 
R
S
 
I
C
 
C
R
 
A
K
 
E
L
 
R
G
 
D
I
 
I
L
 
L
F
 
L
L
 
I
A
 
V
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
|
I
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
L
G
 
G
P
 
T
L
 
W
F
 
F
A
 
G
C
 
S
Q
 
Q
G
 
Y
E
 
Y
S
 
D
V
 
L
E
 
Q
P
 
P
D
 
D
L
 
L
M
 
M
T
 
P
V
 
I
A
 
A
K
|
K
G
 
G
L
 
L
T
 
S
A
 
S
G
 
G
Y
 
Y
A
 
M
P
 
P
M
 
I
G
 
G
A
 
G
V
 
V
L
 
M
M
 
V
S
 
S
D
 
D
E
 
R
I
 
V
Y
 
-
Q
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
A
E
 
K
A
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
E
H
 
E
G
 
G
H
 
G
T
 
E
Y
 
Y
S
 
S
A
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
A
L
 
A
E
 
E
V
 
N
L
 
I
R
 
R
L
 
I
Y
 
M
H
 
R
E
 
D
G
 
E
G
 
G
L
 
I
L
 
I
A
 
E
N
 
R
-
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
E
R
 
I
A
 
A
P
 
P
R
 
Y
F
 
L
A
 
Q
R
 
A
G
 
R
L
 
W
D
 
R
A
 
E
L
 
L
L
 
G
E
 
E
H
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
S
 
A
R
 
R
H
 
G
R
 
V
G
 
G
L
 
M
L
 
V
G
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
K
N
 
S
K
 
K
D
 
Q
S
 
P
K
 
L
A
 
E
Q
 
R
F
 
F
D
 
E
P
 
E
A
 
P
L
 
G
K
 
K
L
 
V
S
 
G
E
 
S
R
 
L
I
 
C
A
 
R
A
 
D
A
 
L
A
 
S
Y
 
V
E
 
K
N
 
N
R
 
G
L
 
L
I
 
V
F
 
M
R
 
R
A
 
A
F
 
V
G
 
G
D
 
G
N
 
T
I
 
M
L
 
I
G
 
-
F
 
I
A
 
S
P
 
P
A
 
P
L
 
L
S
 
V
Y
 
L
T
 
S
E
 
R
S
 
E
D
 
Q
F
 
V
D
 
D
M
 
E
M
 
L
F
 
I
E
 
D
R
 
K
L
 
A
E
 
R
K
 
R
T
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
E
V
 
T

5kr3A Directed evolution of transaminases by ancestral reconstruction. Using old proteins for new chemistries
40% identity, 94% coverage: 3:446/473 of query aligns to 5:453/458 of 5kr3A

query
sites
5kr3A
I
 
L
Q
 
D
S
 
Q
L
 
L
I
 
F
E
 
E
A
 
M
D
 
D
R
 
R
Q
 
A
H
 
H
L
 
F
I
 
M
H
 
H
P
 
P
V
 
S
I
 
T
N
 
H
Y
 
A
R
 
H
A
 
D
H
 
H
E
 
A
A
 
S
R
 
G
G
 
A
V
 
L
-
 
P
-
 
G
T
 
R
V
 
I
L
 
I
E
 
T
S
 
G
A
 
G
S
 
K
G
 
G
A
 
I
F
 
R
L
 
I
R
 
E
D
 
D
A
 
H
A
 
E
G
 
G
N
 
R
E
 
E
L
 
Y
L
 
I
D
 
D
A
 
A
F
 
F
S
 
A
G
 
G
L
 
L
W
 
Y
C
 
C
V
 
V
N
 
N
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
R
Q
 
T
S
 
E
I
 
V
V
 
A
E
 
D
A
 
A
A
 
I
T
 
Y
A
 
E
Q
 
Q
M
 
A
K
 
K
K
 
Q
L
 
L
P
 
A
Y
 
Y
A
 
Y
T
 
H
S
 
T
Y
 
Y
F
 
V
H
 
G
F
 
H
G
 
S
S
 
T
E
 
D
P
 
A
A
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
S
Q
 
S
K
 
R
L
 
I
A
 
I
-
 
R
S
 
D
V
 
W
A
 
A
P
 
P
A
 
A
S
 
G
L
 
M
Q
 
K
H
 
K
V
 
V
Y
 
Y
F
 
Y
T
 
G
L
 
M
G
x
S
G
|
G
S
|
S
D
 
D
A
 
A
V
 
N
D
 
E
S
 
T
A
 
Q
I
 
I
R
 
K
F
 
L
I
 
V
T
 
W
H
 
Y
Y
 
Y
F
 
N
N
 
N
A
 
V
T
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
N
K
 
K
K
 
K
H
 
K
I
 
I
I
 
I
A
 
S
L
 
R
Q
 
E
R
 
R
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
S
 
S
S
 
G
S
 
I
M
 
V
G
 
T
A
 
G
G
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
S
F
 
F
H
 
H
R
 
Q
N
 
H
F
 
F
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
I
P
 
D
N
 
R
Q
 
V
H
 
K
H
 
H
L
 
T
P
 
V
S
 
C
P
 
P
Y
 
H
A
 
W
Y
 
Y
R
 
R
S
 
A
N
 
P
F
 
M
A
 
S
D
 
E
D
 
-
A
 
A
A
 
Q
L
 
F
I
 
V
A
 
A
A
 
Y
S
 
C
V
 
V
A
 
E
A
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
K
 
L
V
 
I
A
 
A
E
 
R
L
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
N
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
F
F
 
I
C
 
A
E
|
E
P
 
P
I
 
V
Q
 
M
G
 
G
S
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
I
V
 
P
P
 
P
P
 
P
F
 
Q
G
 
G
W
 
Y
L
 
W
K
 
E
A
 
A
M
 
I
R
 
Q
E
 
A
S
 
V
C
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
H
G
 
D
I
 
I
L
 
L
F
 
L
L
 
I
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
 
V
T
 
C
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
L
G
 
G
P
 
S
L
 
K
F
 
M
A
 
G
C
 
S
Q
 
Q
G
 
H
E
 
Y
S
 
G
V
 
I
E
 
K
P
 
P
D
 
D
L
 
L
M
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
K
|
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
S
G
 
A
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
M
 
L
G
 
S
A
 
G
V
 
V
L
 
I
M
 
V
S
 
G
D
 
E
E
 
K
I
 
V
Y
 
W
Q
 
D
G
 
V
I
 
I
A
 
E
D
 
K
G
 
G
D
 
S
A
 
Q
E
 
E
-
 
H
A
 
G
I
 
P
V
 
M
G
 
G
H
 
H
G
 
G
H
 
W
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
A
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
I
S
 
C
A
 
A
A
 
A
I
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
A
V
 
N
L
 
L
R
 
D
L
 
I
Y
 
L
H
 
E
E
 
R
G
 
E
G
 
N
L
 
L
L
 
T
A
 
G
N
 
N
G
 
A
A
 
A
A
 
D
R
 
V
A
 
G
P
 
A
R
 
Y
F
 
L
A
 
Q
R
 
Q
G
 
R
L
 
L
-
 
H
D
 
E
A
 
A
L
 
F
L
 
G
E
 
A
H
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
S
 
V
R
 
R
H
 
G
R
 
V
G
 
G
L
 
M
L
 
L
G
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
F
V
 
M
S
 
A
N
 
D
K
 
K
D
 
D
S
 
A
K
 
R
A
 
T
Q
 
P
F
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
V
S
 
G
E
 
P
R
 
K
I
 
V
A
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
L
E
 
E
N
 
D
R
 
G
L
 
M
I
 
I
F
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
M
-
 
P
-
 
H
G
 
G
D
 
D
N
 
-
I
 
I
L
 
L
G
 
G
F
 
F
A
 
A
P
 
P
A
 
P
L
 
L
S
 
V
Y
 
T
T
 
T
E
 
R
S
 
A
D
 
E
F
 
V
D
 
D
M
 
E
M
 
I
F
 
V
E
 
G
R
 
I
L
 
A
E
 
K
K
 
Q
T
 
A
L
 
V
D
 
D
D
 
E
V
 
V

5kquC Directed evolution of transaminases by ancestral reconstruction. Using old proteins for new chemistries
40% identity, 94% coverage: 5:449/473 of query aligns to 6:457/459 of 5kquC

query
sites
5kquC
S
 
Q
L
 
L
I
 
F
E
 
E
A
 
Q
D
 
D
R
 
R
Q
 
A
H
 
H
L
 
F
I
 
M
H
 
H
P
 
P
V
 
S
I
 
T
N
 
H
Y
 
A
R
 
H
A
 
D
H
 
H
E
 
A
A
 
S
R
 
G
G
 
A
V
 
L
-
 
P
-
 
G
T
 
R
V
 
I
L
 
I
E
 
T
S
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
I
F
 
R
L
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
H
A
 
E
G
 
G
N
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
A
F
 
F
S
 
A
G
 
G
L
 
L
W
 
Y
C
 
C
V
 
V
N
 
N
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
R
Q
 
T
S
 
E
I
 
V
V
 
A
E
 
D
A
 
A
A
 
I
T
 
Y
A
 
K
Q
 
Q
M
 
A
K
 
K
K
 
E
L
 
L
P
 
A
Y
 
Y
A
 
Y
T
 
H
S
 
T
Y
 
Y
F
 
V
H
 
G
F
 
H
G
 
S
S
 
T
E
 
E
P
 
A
A
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
S
Q
 
S
K
 
R
L
 
I
A
 
I
-
 
R
S
 
D
V
 
W
A
 
A
P
 
P
A
 
A
S
 
G
L
 
M
Q
 
K
H
 
K
V
 
V
Y
 
Y
F
 
Y
T
 
G
L
 
L
G
x
S
G
|
G
S
|
S
D
 
D
A
 
A
V
 
N
D
 
E
S
 
T
A
 
Q
I
 
I
R
 
K
F
 
L
I
 
V
T
 
R
H
 
Y
Y
 
Y
F
 
N
N
 
N
A
 
V
T
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
Q
K
 
K
K
 
K
H
 
K
I
 
I
I
 
I
A
 
S
L
 
R
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
S
 
S
S
 
G
S
 
I
M
 
M
G
 
T
A
 
G
G
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
S
F
 
F
H
 
H
R
 
Q
N
 
H
F
 
F
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
V
P
 
E
N
 
G
Q
 
I
H
 
K
H
 
H
L
 
T
P
 
V
S
 
C
P
 
P
Y
 
H
A
 
W
Y
 
Y
R
 
K
S
 
A
N
 
P
F
 
A
A
 
G
-
 
M
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
F
I
 
V
A
 
R
A
 
Y
S
 
C
V
 
A
A
 
D
A
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
K
 
L
V
 
I
A
 
L
E
 
A
L
 
E
G
 
G
A
 
P
D
 
D
N
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
F
F
 
I
C
 
G
E
 
E
P
 
P
I
 
V
Q
 
M
G
 
G
S
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
 
P
F
 
K
G
 
G
W
 
Y
L
 
W
K
 
E
A
 
A
M
 
I
R
 
Q
E
 
A
S
 
V
C
 
L
R
 
N
K
 
K
L
 
Y
G
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
L
L
 
I
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
 
V
T
 
C
G
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
L
G
 
G
P
 
S
L
 
K
F
 
M
A
 
G
C
 
S
Q
 
Q
G
 
R
E
 
Y
S
 
G
V
 
M
E
 
R
P
 
P
D
 
D
L
 
L
M
 
I
T
 
T
V
 
T
A
 
A
K
|
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
S
G
 
A
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
M
 
L
G
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
I
M
 
V
S
 
G
D
 
E
E
 
K
I
 
V
Y
 
W
Q
 
D
G
 
V
I
 
I
A
 
E
D
 
K
G
 
A
-
 
S
D
 
Q
A
 
K
E
 
E
A
 
G
I
 
A
V
 
M
G
 
G
H
 
H
G
 
G
H
x
W
T
|
T
Y
 
Y
S
 
S
A
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
I
S
 
C
A
 
A
A
 
A
I
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
A
V
 
N
L
 
L
R
 
D
L
 
I
Y
 
L
H
 
E
E
 
R
G
 
E
G
 
N
L
 
L
L
 
T
A
 
A
N
 
N
G
 
A
A
 
A
A
 
D
R
 
V
A
 
G
P
 
A
R
 
Y
F
 
L
A
 
N
R
 
Q
G
 
R
L
 
L
D
 
R
A
 
E
L
 
T
L
 
F
E
 
E
-
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
S
 
V
R
 
R
H
 
G
R
 
D
G
 
G
L
 
M
L
 
L
G
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
F
V
 
M
S
 
A
N
 
D
K
 
R
D
 
E
S
 
A
K
 
R
A
 
T
Q
 
P
F
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
V
S
 
G
E
 
P
R
 
K
I
 
V
A
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
C
Y
 
L
E
 
E
N
 
D
R
 
G
L
 
M
I
 
I
F
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
M
-
 
P
-
 
H
G
 
G
D
 
D
N
 
-
I
 
I
L
 
L
G
 
G
F
 
F
A
 
A
P
 
P
A
 
P
L
 
L
S
 
V
Y
 
L
T
 
T
E
 
R
S
 
A
D
 
E
F
 
A
D
 
D
M
 
E
M
 
I
F
 
V
E
 
G
R
 
I
L
 
A
E
 
K
K
 
A
T
 
A
L
 
V
D
 
D
D
 
E
V
 
V
L
 
A
A
 
G
Q
 
E

7qx3A Structure of the transaminase tr2e2 with eos (see paper)
39% identity, 88% coverage: 31:446/473 of query aligns to 3:417/422 of 7qx3A

query
sites
7qx3A
V
 
I
L
 
I
E
 
T
S
 
R
A
 
A
S
 
E
G
 
G
A
 
C
F
 
Y
L
 
L
R
 
W
D
 
D
A
 
S
A
 
D
G
 
G
N
 
N
E
 
Q
L
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
G
F
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
L
W
 
W
C
 
C
V
 
V
N
 
N
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
R
Q
 
K
S
 
E
I
 
L
V
 
A
E
 
E
A
 
V
A
 
A
T
 
Y
A
 
R
Q
 
Q
M
 
M
K
 
Q
K
 
E
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
A
 
Y
T
 
N
S
 
N
Y
 
F
F
 
F
H
 
Q
F
 
C
G
 
S
S
 
H
E
 
P
P
 
P
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
S
Q
 
R
K
 
L
L
 
L
A
 
S
S
 
E
V
 
V
A
 
T
P
 
P
A
 
K
S
 
H
L
 
M
Q
 
N
H
 
H
V
 
V
Y
 
F
F
 
F
T
 
T
L
 
G
G
 
S
G
 
G
S
 
S
D
 
D
A
 
S
V
 
N
D
 
D
S
 
T
A
 
I
I
 
L
R
 
R
F
 
M
I
 
V
T
 
R
H
 
Y
Y
 
Y
F
 
W
N
 
K
A
 
L
T
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
S
 
Y
K
 
K
K
 
K
H
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
S
L
 
R
Q
 
E
R
 
N
G
 
A
Y
|
Y
H
 
H
G
 
G
S
 
S
S
 
T
S
 
V
M
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
S
L
 
L
T
 
S
A
 
G
L
 
M
P
 
K
A
 
A
F
 
M
H
 
H
R
 
S
N
 
H
F
 
G
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
I
P
 
P
N
 
G
Q
 
I
H
 
E
H
 
H
L
 
I
P
 
E
S
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
A
 
H
Y
 
F
-
 
G
R
 
R
S
 
A
N
 
P
F
 
D
A
 
M
D
 
D
D
 
P
A
 
A
A
 
E
L
 
F
I
 
G
A
 
R
A
 
Q
S
 
A
V
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
R
K
 
K
V
 
I
A
 
D
E
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
C
N
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
F
F
 
I
C
 
A
E
 
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
S
x
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
I
P
 
P
P
 
P
F
 
D
G
 
S
W
 
Y
L
 
W
K
 
P
A
 
E
M
 
I
R
 
K
E
 
R
S
 
I
C
 
C
R
 
A
K
 
E
L
 
R
G
 
D
I
 
I
L
 
L
F
 
L
L
 
I
A
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
L
G
 
G
P
 
T
L
 
W
F
 
F
A
 
G
C
 
S
Q
 
Q
G
 
Y
E
 
Y
S
 
D
V
 
L
E
 
Q
P
 
P
D
 
D
L
 
L
M
 
M
T
 
P
V
 
I
A
 
A
K
|
K
G
 
G
L
 
L
T
 
S
A
 
S
G
 
G
Y
 
Y
A
 
M
P
 
P
M
 
I
G
 
G
A
 
G
V
 
V
L
 
M
M
 
V
S
 
S
D
 
D
E
 
R
I
 
V
Y
 
A
Q
 
K
G
 
V
I
 
V
A
 
I
D
 
E
G
 
E
D
 
G
A
 
G
E
 
E
A
 
F
I
 
F
V
 
-
G
 
-
H
 
H
G
 
G
H
 
Y
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
A
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
A
L
 
A
E
 
E
V
 
N
L
 
I
R
 
R
L
 
I
Y
 
M
H
 
R
E
 
D
G
 
E
G
 
G
L
 
I
L
 
I
A
 
E
N
 
R
-
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
E
R
 
I
A
 
A
P
 
P
R
 
Y
F
 
L
A
 
Q
R
 
A
G
 
R
L
 
W
D
 
R
A
 
E
L
 
L
L
 
G
E
 
E
H
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
S
 
A
R
 
R
H
 
G
R
 
V
G
 
G
L
 
M
L
 
V
G
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
K
N
 
S
K
 
K
D
 
Q
S
 
P
K
 
L
A
 
E
Q
 
R
F
 
F
D
 
E
P
 
E
A
 
P
L
 
G
K
 
K
L
 
V
S
 
G
E
 
S
R
 
L
I
 
C
A
 
R
A
 
D
A
 
L
A
 
S
Y
 
V
E
 
K
N
 
N
R
 
G
L
 
L
I
 
V
F
 
M
R
 
R
A
 
A
F
 
V
G
 
G
D
 
G
N
 
T
I
 
M
L
 
I
G
 
-
F
 
I
A
 
S
P
 
P
A
 
P
L
 
L
S
 
V
Y
 
L
T
 
S
E
 
R
S
 
E
D
 
Q
F
 
V
D
 
D
M
 
E
M
 
L
F
 
I
E
 
D
R
 
K
L
 
A
E
 
R
K
 
R
T
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
E
V
 
T

6g4fA Crystal structure of the omega transaminase from pseudomonas jessenii in complex with pmp (see paper)
39% identity, 93% coverage: 5:446/473 of query aligns to 2:445/451 of 6g4fA

query
sites
6g4fA
S
 
S
L
 
L
I
 
P
E
 
E
A
 
K
D
 
D
R
 
I
Q
 
Q
H
 
Y
L
 
Q
I
 
L
H
 
H
P
 
P
V
x
Y
I
 
T
N
 
N
Y
 
A
R
 
R
A
 
L
H
 
H
E
 
Q
A
 
E
R
 
L
G
 
G
V
 
P
T
 
L
V
 
I
L
 
I
E
 
E
S
 
R
A
 
G
S
 
E
G
 
G
A
 
I
F
 
Y
L
 
V
R
 
Y
D
 
D
A
 
D
A
 
Q
G
 
G
N
 
K
E
 
G
L
 
Y
L
 
I
D
 
E
A
 
A
F
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
L
W
 
W
C
 
S
V
 
A
N
 
A
V
 
L
G
 
G
Y
 
F
G
 
S
Q
 
N
Q
 
Q
S
 
R
I
 
L
V
 
I
E
 
K
A
 
A
A
 
A
T
 
E
A
 
Q
Q
 
Q
M
 
F
K
 
N
K
 
T
L
 
L
P
 
P
Y
 
F
A
 
Y
T
 
H
S
 
L
Y
 
F
F
 
S
H
 
H
F
 
K
G
 
S
S
 
H
E
 
R
P
 
P
A
 
S
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
I
S
 
E
V
 
M
A
 
A
P
 
P
A
 
V
S
 
P
L
 
M
Q
 
S
H
 
K
V
 
V
Y
 
F
F
 
F
T
 
T
L
 
N
G
x
S
G
|
G
S
|
S
D
 
E
A
 
A
V
 
N
D
 
D
S
 
T
A
 
V
I
 
V
R
 
K
F
 
M
I
 
V
T
 
W
H
 
Y
Y
 
L
F
 
N
N
 
N
A
 
A
T
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
S
 
A
K
 
K
K
 
K
H
 
K
I
 
F
I
 
I
A
 
S
L
 
R
Q
 
V
R
 
N
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
S
 
I
S
 
T
S
 
V
M
 
A
G
 
S
A
 
A
G
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
G
F
 
N
H
 
Q
R
 
R
N
 
G
F
 
F
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
L
P
 
P
N
 
G
Q
 
F
H
 
L
H
 
H
L
 
V
P
 
G
S
 
C
P
 
P
Y
 
H
A
 
H
Y
 
Y
R
 
R
-
 
F
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
E
S
 
E
N
 
H
F
 
F
A
 
A
D
 
D
D
 
R
A
 
L
A
 
A
L
 
V
I
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
Q
K
 
K
V
 
I
A
 
L
E
 
A
L
 
E
G
 
G
A
 
P
D
 
E
N
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
F
F
 
I
C
 
G
E
|
E
P
 
P
I
 
L
Q
 
M
G
 
G
S
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
 
P
F
 
R
G
 
T
W
 
Y
L
 
W
K
 
E
A
 
K
M
 
I
R
 
Q
E
 
K
S
 
V
C
 
C
R
 
R
K
 
K
L
 
Y
G
 
D
I
 
I
L
 
L
F
 
V
L
 
I
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
|
I
T
 
C
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
P
 
Q
L
 
M
F
 
F
A
 
G
C
 
S
Q
 
Q
G
 
T
E
 
F
S
 
G
V
 
I
E
 
Q
P
 
P
D
 
D
L
 
I
M
 
M
T
 
V
V
 
L
A
 
S
K
|
K
G
 
Q
L
 
L
T
 
S
A
 
S
G
 
S
Y
 
Y
A
 
Q
P
 
P
M
 
I
G
 
A
A
 
A
V
 
I
L
 
L
M
 
I
S
 
N
D
 
A
E
 
P
I
 
V
Y
 
F
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
A
D
 
D
-
 
Q
G
 
S
D
 
Q
A
 
A
E
 
L
A
 
G
I
 
A
V
 
L
G
 
G
H
 
H
G
 
G
H
 
F
T
 
T
Y
 
G
S
 
S
A
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
A
A
 
T
A
 
A
I
 
V
G
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
N
L
 
L
R
 
K
L
 
I
Y
 
I
H
 
E
E
 
E
G
 
E
G
 
S
L
 
L
L
 
V
A
 
E
N
 
H
G
 
A
A
 
A
A
 
Q
R
 
M
A
 
G
P
 
Q
R
 
L
F
 
L
A
 
R
R
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
Q
A
 
H
L
 
F
L
 
I
E
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
S
 
I
R
 
R
H
 
G
R
 
C
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
A
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
G
N
 
D
K
 
R
D
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
A
Q
 
P
F
 
Y
D
 
Q
P
 
A
A
 
L
L
 
G
K
 
T
L
 
L
S
 
G
E
 
R
R
 
Y
I
 
M
A
 
A
A
 
G
A
 
R
A
 
A
Y
 
Q
E
 
E
N
 
H
R
 
G
L
 
M
I
 
I
F
 
T
R
 
R
A
 
A
F
 
M
G
 
G
D
 
D
N
 
A
I
 
V
L
 
-
G
 
A
F
 
F
A
 
C
P
 
P
A
 
P
L
 
L
S
 
I
Y
 
V
T
 
N
E
 
E
S
 
Q
D
 
E
F
 
V
D
 
G
M
 
M
M
 
I
F
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
F
E
 
A
K
 
R
T
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
D
V
 
T

6g4eA Crystal structure of the omega transaminase from pseudomonas jessenii in complex with plp and 6-aminohexanoate (6-aca) (see paper)
39% identity, 93% coverage: 5:446/473 of query aligns to 2:445/451 of 6g4eA

query
sites
6g4eA
S
 
S
L
 
L
I
 
P
E
 
E
A
 
K
D
 
D
R
 
I
Q
 
Q
H
 
Y
L
 
Q
I
 
L
H
 
H
P
 
P
V
x
Y
I
 
T
N
 
N
Y
 
A
R
 
R
A
 
L
H
 
H
E
 
Q
A
 
E
R
 
L
G
 
G
V
 
P
T
 
L
V
 
I
L
 
I
E
 
E
S
 
R
A
 
G
S
 
E
G
 
G
A
 
I
F
 
Y
L
 
V
R
 
Y
D
 
D
A
 
D
A
 
Q
G
 
G
N
 
K
E
 
G
L
 
Y
L
 
I
D
 
E
A
 
A
F
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
L
W
 
W
C
 
S
V
 
A
N
 
A
V
 
L
G
 
G
Y
 
F
G
 
S
Q
 
N
Q
 
Q
S
 
R
I
 
L
V
 
I
E
 
K
A
 
A
A
 
A
T
 
E
A
 
Q
Q
 
Q
M
 
F
K
 
N
K
 
T
L
 
L
P
 
P
Y
 
F
A
 
Y
T
 
H
S
 
L
Y
 
F
F
 
S
H
 
H
F
 
K
G
 
S
S
 
H
E
 
R
P
 
P
A
 
S
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
I
S
 
E
V
 
M
A
 
A
P
 
P
A
 
V
S
 
P
L
 
M
Q
 
S
H
 
K
V
 
V
Y
 
F
F
 
F
T
 
T
L
 
N
G
x
S
G
|
G
S
|
S
D
 
E
A
 
A
V
 
N
D
 
D
S
 
T
A
 
V
I
 
V
R
 
K
F
 
M
I
 
V
T
 
W
H
 
Y
Y
 
L
F
 
N
N
 
N
A
 
A
T
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
S
 
A
K
 
K
K
 
K
H
 
K
I
 
F
I
 
I
A
 
S
L
 
R
Q
 
V
R
 
N
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
S
 
I
S
 
T
S
 
V
M
 
A
G
 
S
A
 
A
G
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
G
F
 
N
H
 
Q
R
 
R
N
 
G
F
 
F
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
L
P
 
P
N
 
G
Q
 
F
H
 
L
H
 
H
L
 
V
P
 
G
S
 
C
P
 
P
Y
 
H
A
 
H
Y
 
Y
R
 
R
-
 
F
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
E
S
 
E
N
 
H
F
 
F
A
 
A
D
 
D
D
 
R
A
 
L
A
 
A
L
 
V
I
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
Q
K
 
K
V
 
I
A
 
L
E
 
A
L
 
E
G
 
G
A
 
P
D
 
E
N
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
F
F
 
I
C
 
G
E
|
E
P
 
P
I
 
L
Q
 
M
G
 
G
S
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
 
P
F
 
R
G
 
T
W
 
Y
L
 
W
K
 
E
A
 
K
M
 
I
R
 
Q
E
 
K
S
 
V
C
 
C
R
 
R
K
 
K
L
 
Y
G
 
D
I
 
I
L
 
L
F
 
V
L
 
I
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
|
I
T
 
C
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
P
 
Q
L
 
M
F
 
F
A
 
G
C
 
S
Q
 
Q
G
 
T
E
 
F
S
 
G
V
 
I
E
 
Q
P
 
P
D
 
D
L
 
I
M
 
M
T
 
V
V
 
L
A
 
S
K
|
K
G
 
Q
L
 
L
T
 
S
A
 
S
G
 
S
Y
 
Y
A
 
Q
P
 
P
M
 
I
G
 
A
A
 
A
V
 
I
L
 
L
M
 
I
S
 
N
D
 
A
E
 
P
I
 
V
Y
 
F
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
A
D
 
D
-
 
Q
G
 
S
D
 
Q
A
 
A
E
 
L
A
 
G
I
 
A
V
 
L
G
 
G
H
 
H
G
 
G
H
 
F
T
 
T
Y
 
G
S
 
S
A
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
A
A
 
T
A
 
A
I
 
V
G
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
N
L
 
L
R
 
K
L
 
I
Y
 
I
H
 
E
E
 
E
G
 
E
G
 
S
L
 
L
L
 
V
A
 
E
N
 
H
G
 
A
A
 
A
A
 
Q
R
 
M
A
 
G
P
 
Q
R
 
L
F
 
L
A
 
R
R
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
Q
A
 
H
L
 
F
L
 
I
E
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
S
 
I
R
 
R
H
 
G
R
 
C
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
A
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
G
N
 
D
K
 
R
D
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
A
Q
 
P
F
 
Y
D
 
Q
P
 
A
A
 
L
L
 
G
K
 
T
L
 
L
S
 
G
E
 
R
R
 
Y
I
 
M
A
 
A
A
 
G
A
 
R
A
 
A
Y
 
Q
E
 
E
N
 
H
R
 
G
L
 
M
I
 
I
F
 
T
R
|
R
A
 
A
F
x
M
G
 
G
D
 
D
N
 
A
I
 
V
L
 
-
G
 
A
F
 
F
A
 
C
P
 
P
A
 
P
L
 
L
S
 
I
Y
 
V
T
 
N
E
 
E
S
 
Q
D
 
E
F
 
V
D
 
G
M
 
M
M
 
I
F
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
F
E
 
A
K
 
R
T
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
D
V
 
T

6g4dB Crystal structure of the omega transaminase from pseudomonas jessenii in complex with plp (see paper)
39% identity, 93% coverage: 5:446/473 of query aligns to 2:445/453 of 6g4dB

query
sites
6g4dB
S
 
S
L
 
L
I
 
P
E
 
E
A
 
K
D
 
D
R
 
I
Q
 
Q
H
 
Y
L
 
Q
I
 
L
H
 
H
P
 
P
V
x
Y
I
 
T
N
 
N
Y
 
A
R
 
R
A
 
L
H
 
H
E
 
Q
A
 
E
R
 
L
G
 
G
V
 
P
T
 
L
V
 
I
L
 
I
E
 
E
S
 
R
A
 
G
S
 
E
G
 
G
A
 
I
F
 
Y
L
 
V
R
 
Y
D
 
D
A
 
D
A
 
Q
G
 
G
N
 
K
E
 
G
L
 
Y
L
 
I
D
 
E
A
 
A
F
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
L
W
 
W
C
 
S
V
 
A
N
 
A
V
 
L
G
 
G
Y
 
F
G
 
S
Q
 
N
Q
 
Q
S
 
R
I
 
L
V
 
I
E
 
K
A
 
A
A
 
A
T
 
E
A
 
Q
Q
 
Q
M
 
F
K
 
N
K
 
T
L
 
L
P
 
P
Y
 
F
A
 
Y
T
 
H
S
 
L
Y
 
F
F
 
S
H
 
H
F
 
K
G
 
S
S
 
H
E
 
R
P
 
P
A
 
S
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
I
S
 
E
V
 
M
A
 
A
P
 
P
A
 
V
S
 
P
L
 
M
Q
 
S
H
 
K
V
 
V
Y
 
F
F
 
F
T
 
T
L
 
N
G
x
S
G
|
G
S
|
S
D
 
E
A
 
A
V
 
N
D
 
D
S
 
T
A
 
V
I
 
V
R
 
K
F
 
M
I
 
V
T
 
W
H
 
Y
Y
 
L
F
 
N
N
 
N
A
 
A
T
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
S
 
A
K
 
K
K
 
K
H
 
K
I
 
F
I
 
I
A
 
S
L
 
R
Q
 
V
R
 
N
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
S
 
I
S
 
T
S
 
V
M
 
A
G
 
S
A
 
A
G
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
G
F
 
N
H
 
Q
R
 
R
N
 
G
F
 
F
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
L
P
 
P
N
 
G
Q
 
F
H
 
L
H
 
H
L
 
V
P
 
G
S
 
C
P
 
P
Y
 
H
A
 
H
Y
 
Y
R
 
R
-
 
F
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
E
S
 
E
N
 
H
F
 
F
A
 
A
D
 
D
D
 
R
A
 
L
A
 
A
L
 
V
I
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
Q
K
 
K
V
 
I
A
 
L
E
 
A
L
 
E
G
 
G
A
 
P
D
 
E
N
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
F
F
 
I
C
 
G
E
|
E
P
 
P
I
 
L
Q
 
M
G
 
G
S
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
 
P
F
 
R
G
 
T
W
 
Y
L
 
W
K
 
E
A
 
K
M
 
I
R
 
Q
E
 
K
S
 
V
C
 
C
R
 
R
K
 
K
L
 
Y
G
 
D
I
 
I
L
 
L
F
 
V
L
 
I
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
|
I
T
 
C
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
P
 
Q
L
 
M
F
 
F
A
 
G
C
 
S
Q
 
Q
G
 
T
E
 
F
S
 
G
V
 
I
E
 
Q
P
 
P
D
 
D
L
 
I
M
 
M
T
 
V
V
 
L
A
 
S
K
|
K
G
 
Q
L
 
L
T
 
S
A
 
S
G
 
S
Y
 
Y
A
 
Q
P
 
P
M
 
I
G
 
A
A
 
A
V
 
I
L
 
L
M
 
I
S
 
N
D
 
A
E
 
P
I
 
V
Y
 
F
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
A
D
 
D
-
 
Q
G
 
S
D
 
Q
A
 
A
E
 
L
A
 
G
I
 
A
V
 
L
G
 
G
H
 
H
G
 
G
H
 
F
T
 
T
Y
 
G
S
 
S
A
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
A
A
 
T
A
 
A
I
 
V
G
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
N
L
 
L
R
 
K
L
 
I
Y
 
I
H
 
E
E
 
E
G
 
E
G
 
S
L
 
L
L
 
V
A
 
E
N
 
H
G
 
A
A
 
A
A
 
Q
R
 
M
A
 
G
P
 
Q
R
 
L
F
 
L
A
 
R
R
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
Q
A
 
H
L
 
F
L
 
I
E
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
S
 
I
R
 
R
H
 
G
R
 
C
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
A
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
G
N
 
D
K
 
R
D
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
A
Q
 
P
F
 
Y
D
 
Q
P
 
A
A
 
L
L
 
G
K
 
T
L
 
L
S
 
G
E
 
R
R
 
Y
I
 
M
A
 
A
A
 
G
A
 
R
A
 
A
Y
 
Q
E
 
E
N
 
H
R
 
G
L
 
M
I
 
I
F
 
T
R
 
R
A
 
A
F
 
M
G
 
G
D
 
D
N
 
A
I
 
V
L
 
-
G
 
A
F
 
F
A
 
C
P
 
P
A
 
P
L
 
L
S
 
I
Y
 
V
T
 
N
E
 
E
S
 
Q
D
 
E
F
 
V
D
 
G
M
 
M
M
 
I
F
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
F
E
 
A
K
 
R
T
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
D
V
 
T

6gwiB The crystal structure of halomonas elongata amino-transferase (see paper)
38% identity, 95% coverage: 1:449/473 of query aligns to 1:448/450 of 6gwiB

query
sites
6gwiB
M
 
M
P
 
Q
I
 
T
Q
 
Q
S
 
D
L
 
Y
I
 
Q
E
 
A
A
 
L
D
 
D
R
 
R
Q
 
A
H
 
H
L
 
H
I
 
L
H
 
H
P
 
P
V
x
F
I
 
T
N
 
D
Y
 
F
R
 
K
A
 
A
H
 
L
E
 
G
A
 
E
R
 
E
G
 
G
V
 
S
T
 
R
V
 
V
L
 
V
E
 
T
S
 
H
A
 
A
S
 
E
G
 
G
A
 
V
F
 
Y
L
 
I
R
 
H
D
 
D
A
 
S
A
 
E
G
 
G
N
 
N
E
 
R
L
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
G
F
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
L
W
 
W
C
 
C
V
 
V
N
 
N
V
 
L
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
R
Q
 
R
S
 
E
I
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
M
 
L
K
 
E
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
A
 
Y
T
 
N
S
 
T
Y
 
F
F
 
F
H
 
K
F
 
T
G
 
T
S
 
H
E
 
P
P
 
P
A
 
A
I
 
V
E
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
C
S
 
D
V
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
A
S
 
H
L
 
I
Q
 
N
H
 
R
V
 
V
Y
 
F
F
 
F
T
 
T
L
 
G
G
x
S