SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing HSERO_RS00735 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS00735 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1eyyA Crystal structure of the NADP+ dependent aldehyde dehydrogenase from vibrio harveyi. (see paper)
44% identity, 95% coverage: 20:522/529 of query aligns to 2:502/504 of 1eyyA

query
sites
1eyyA
D
 
D
V
 
N
A
 
V
L
 
F
H
 
Y
S
 
A
V
 
T
D
 
N
A
 
A
T
 
F
T
 
T
G
 
G
A
 
E
L
 
A
F
 
L
E
 
P
T
 
L
P
 
A
F
 
F
L
 
P
T
 
V
A
 
H
T
 
T
D
 
E
K
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
N
A
 
Q
A
 
A
V
 
A
H
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
A
Q
 
K
A
 
V
Y
 
A
P
 
R
L
 
D
Y
 
F
R
 
R
A
 
R
T
 
L
T
 
N
S
 
N
E
 
S
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
S
F
 
L
L
 
L
E
 
R
A
 
T
I
 
I
A
 
A
D
 
S
E
 
E
I
 
L
D
 
E
A
 
A
L
 
R
G
 
S
D
 
D
D
 
D
F
 
I
L
 
I
A
 
A
A
 
R
V
 
A
A
 
H
R
 
L
E
 
E
T
 
T
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
E
T
 
V
P
 
-
R
 
R
L
 
L
A
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
I
A
 
A
R
 
R
T
 
T
S
 
A
G
 
N
Q
 
Q
M
 
L
R
 
R
L
 
L
F
 
F
A
 
A
K
 
D
V
 
V
V
 
V
R
 
N
R
 
S
G
 
G
D
 
S
F
 
Y
Y
 
H
G
 
Q
A
 
A
R
 
I
I
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
P
L
 
N
P
 
P
Q
 
T
R
 
R
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
K
P
 
P
D
 
D
I
 
I
R
 
R
Q
 
R
Y
 
Q
K
 
Q
I
 
I
G
 
A
V
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
A
S
|
S
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
F
S
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
D
 
D
T
 
T
A
 
A
A
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
P
 
P
V
 
V
V
 
I
F
 
V
K
|
K
A
 
G
H
|
H
S
x
T
G
 
A
H
 
H
L
 
P
V
 
G
T
 
T
S
 
S
E
 
Q
L
 
I
V
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
C
I
 
I
E
 
E
R
 
Q
A
 
A
V
 
L
K
 
K
K
 
Q
T
 
E
G
 
Q
M
 
L
P
 
P
A
 
Q
G
 
A
T
 
I
F
 
F
N
 
T
M
 
L
I
 
L
Y
 
Q
G
 
G
D
 
N
R
 
Q
-
x
R
-
 
A
V
 
L
G
 
G
A
 
Q
Q
 
A
L
 
L
V
 
V
K
 
S
S
 
H
A
 
P
G
 
E
I
 
I
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
G
F
|
F
T
 
T
G
 
G
S
|
S
L
 
V
R
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
F
D
 
N
M
 
L
A
 
A
A
 
H
A
 
E
R
 
R
P
 
P
Q
 
E
P
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
F
F
 
Y
A
 
G
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
A
I
 
I
N
 
N
P
 
P
I
 
T
I
 
F
L
 
I
M
 
F
P
 
P
E
 
S
A
 
A
L
 
M
K
 
R
L
 
A
R
 
K
G
 
A
D
 
D
A
 
-
I
 
L
A
 
A
K
 
D
D
 
Q
L
 
F
A
 
V
G
 
A
S
 
S
V
 
M
T
 
T
V
 
M
G
 
G
V
 
C
G
 
G
Q
 
Q
L
 
F
C
|
C
T
 
T
S
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
V
L
 
V
L
 
F
G
 
A
V
 
L
R
 
N
S
 
T
P
 
P
E
 
E
L
 
T
T
 
Q
S
 
A
F
 
F
I
 
I
E
 
E
K
 
T
L
 
A
S
 
Q
A
 
S
A
 
L
F
 
I
G
 
R
G
 
Q
T
 
Q
N
 
S
P
 
P
A
 
S
T
 
T
M
 
L
L
 
L
N
 
T
S
 
P
G
 
G
G
 
I
L
 
R
T
 
D
H
 
S
Y
 
Y
N
 
Q
G
 
S
G
 
Q
V
 
V
A
 
V
R
 
S
L
 
R
T
 
G
Q
 
S
L
 
D
P
 
D
G
 
G
V
 
I
K
 
D
V
 
V
I
 
-
A
 
-
T
 
T
G
 
F
G
 
S
T
 
Q
S
 
A
Y
 
E
T
 
S
Q
 
P
A
 
C
V
 
V
P
 
A
H
 
S
L
 
A
F
 
L
K
 
F
A
 
V
D
 
T
A
 
S
A
 
S
L
 
E
L
 
N
F
 
W
S
 
R
K
 
K
E
 
H
A
 
P
P
 
A
L
 
W
E
 
E
E
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
S
 
Q
T
 
S
V
 
L
I
 
I
V
 
V
E
 
V
L
 
C
E
 
E
S
 
N
R
 
V
E
 
A
Q
 
D
L
 
M
L
 
L
D
 
S
F
 
L
A
 
S
A
 
E
K
 
M
M
 
L
N
 
A
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
A
T
 
T
L
 
I
Q
 
H
A
 
A
E
 
T
I
 
E
G
 
E
D
 
D
L
 
Y
Q
 
P
G
 
Q
N
 
V
Q
 
S
D
 
Q
L
 
L
I
 
I
A
 
P
I
 
R
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
K
 
I
A
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
V
L
 
F
N
 
N
G
 
G
F
 
W
P
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
V
E
 
E
V
 
V
C
 
G
D
 
Y
A
 
A
M
 
M
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
A
 
A
T
 
S
S
 
T
D
 
H
A
 
S
R
 
A
G
 
S
T
 
T
S
 
S
V
 
V
G
 
G
S
 
A
L
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
H
R
 
R
F
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
V
 
V
C
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
N
 
A
Y
 
L
P
 
P
D
 
E
A
 
S
M
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
D
A
 
S
L
 
L
Q
 
K
N
 
A
A
 
E
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
E
L
 
I
M
 
A
R
 
R
L
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
K

Q84LK3 Betaine aldehyde dehydrogenase 2; OsBADH2; EC 1.2.1.8 from Oryza sativa subsp. japonica (Rice) (see paper)
27% identity, 62% coverage: 126:452/529 of query aligns to 120:448/503 of Q84LK3

query
sites
Q84LK3
Y
 
Y
G
 
F
A
 
A
R
 
D
I
 
L
D
 
A
T
 
E
A
 
S
L
 
L
P
 
D
Q
 
K
R
 
R
Q
 
Q
-
 
N
-
 
A
-
 
P
-
 
V
P
 
S
L
 
L
P
 
P
R
 
M
P
 
E
D
 
N
I
 
F
R
 
K
Q
 
C
Y
 
Y
-
 
L
-
 
R
K
 
K
I
 
E
G
 
P
V
 
I
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
G
V
 
L
F
 
I
G
 
T
A
 
P
S
 
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
L
F
 
-
S
 
-
V
 
M
A
 
A
G
 
T
G
x
W
D
 
K
T
 
V
A
 
A
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
P
 
T
V
 
A
V
 
V
F
 
L
K
 
K
A
 
P
H
 
S
S
 
E
G
 
L
H
 
A
L
 
S
V
 
V
T
 
T
S
 
C
E
 
L
L
 
E
V
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
V
I
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
C
K
 
K
K
 
E
T
 
V
G
 
G
M
 
L
P
 
P
A
 
S
G
 
G
T
 
V
F
 
L
N
 
N
M
 
I
I
 
V
-
 
T
-
 
G
Y
 
L
G
 
G
D
 
S
R
 
E
V
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
P
L
 
L
V
 
S
K
 
S
S
 
H
A
 
P
G
 
G
I
 
V
Q
 
D
A
 
K
V
 
V
G
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
L
 
Y
R
 
E
G
 
T
G
 
G
R
 
K
A
 
K
L
 
I
C
 
-
D
 
-
M
 
M
A
 
A
A
 
S
A
 
A
R
 
A
P
 
P
Q
 
M
P
 
V
I
 
K
P
 
P
V
 
V
F
 
S
A
 
L
E
 
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
S
P
 
P
I
 
I
I
 
V
L
 
V
M
 
F
P
 
D
E
 
D
A
 
V
L
 
D
K
 
V
L
 
E
R
 
K
G
 
-
D
 
-
A
 
A
I
 
V
A
 
E
K
 
W
D
 
T
L
 
L
A
 
F
G
 
G
S
 
C
V
 
F
T
 
W
V
 
T
G
 
N
V
 
-
G
 
G
Q
 
Q
L
 
I
C
 
C
T
 
S
S
 
A
P
 
T
G
 
S
L
 
R
L
 
L
L
 
I
G
 
-
V
 
L
R
 
H
S
 
K
P
 
K
E
 
I
L
 
A
T
 
K
S
 
E
F
 
F
I
 
Q
E
 
E
K
 
R
L
 
M
S
 
V
A
 
A
A
 
W
F
 
A
G
 
K
G
 
N
T
 
I
N
 
K
P
 
V
A
 
S
T
 
D
M
 
P
L
 
L
N
 
E
S
 
E
G
 
G
-
 
C
-
 
R
-
 
L
G
 
G
L
 
P
T
 
V
H
 
V
Y
 
S
N
 
E
G
 
G
G
 
Q
V
 
Y
A
 
E
R
 
K
L
 
I
T
 
K
Q
 
Q
L
 
F
P
 
V
G
 
S
V
 
T
K
 
-
V
 
A
I
 
K
A
 
S
T
 
Q
G
 
G
G
 
A
T
 
T
S
 
I
Y
 
L
T
 
T
Q
 
G
A
 
G
V
 
V
-
 
R
-
 
P
P
 
K
H
 
H
L
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
G
F
 
F
K
 
Y
A
 
I
D
 
E
A
 
P
A
 
T
L
 
I
L
 
I
F
 
T
S
 
D
K
 
V
E
 
D
A
 
T
P
 
S
L
 
M
E
 
Q
-
 
I
-
 
W
-
 
R
E
 
E
E
 
E
V
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
S
 
V
T
 
L
V
 
C
I
 
V
V
 
K
E
 
E
L
 
F
E
 
S
S
 
T
R
 
E
E
 
E
Q
 
E
L
 
A
L
 
I
D
 
E
F
 
L
A
 
A
A
 
N
K
 
D
M
 
T
N
 
H
G
 
Y
Q
 
G
L
 
L
T
 
A
A
 
G
T
 
A
L
 
V
Q
 
L
A
 
S
E
 
-
I
 
-
G
 
G
D
 
D
L
 
R
Q
 
E
G
 
R
N
 
C
Q
 
Q
D
 
R
L
 
L
I
 
T
A
 
E
I
 
-
L
 
-
E
 
E
Q
 
I
K
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
I
L
 
I
L
 
W
L
 
V
N
 
N

2opxA Crystal structure of lactaldehyde dehydrogenase from escherichia coli
26% identity, 79% coverage: 10:425/529 of query aligns to 8:413/477 of 2opxA

query
sites
2opxA
Y
 
Y
I
 
I
G
 
D
G
 
G
Q
 
Q
-
 
F
R
 
V
S
 
T
G
 
W
Q
 
R
G
 
G
D
 
D
V
 
A
A
 
W
L
 
I
H
 
D
S
 
V
V
 
V
D
 
N
-
 
P
A
 
A
T
 
T
T
 
E
G
 
A
A
 
V
L
 
I
F
 
S
E
 
R
T
 
I
P
 
P
F
 
D
L
 
G
T
 
Q
A
 
A
T
 
E
D
 
D
K
 
A
E
 
R
V
 
-
A
 
-
A
 
K
A
 
A
V
 
I
H
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
Y
 
Q
P
 
P
L
 
E
Y
 
W
R
 
E
A
 
A
T
 
L
T
 
P
S
 
A
E
 
I
Q
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
S
F
 
W
L
 
L
E
 
R
A
 
K
I
 
I
A
 
S
D
 
A
E
 
G
I
 
I
D
 
R
A
 
E
L
 
R
G
 
A
D
 
T
D
 
E
F
 
I
L
 
S
A
 
A
A
 
L
V
 
I
A
 
V
R
 
E
E
 
E
T
 
G
A
 
G
L
 
-
P
 
-
A
 
K
T
 
I
P
 
Q
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
E
-
 
V
E
 
E
R
 
V
A
 
A
R
x
F
T
 
T
S
 
A
G
 
D
Q
 
Y
M
 
I
R
 
D
L
 
Y
F
 
M
A
 
A
K
 
E
V
 
W
V
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
-
D
 
-
F
 
Y
Y
 
E
G
 
G
A
 
E
R
 
I
I
 
I
D
 
Q
T
 
S
A
 
D
L
 
R
P
 
P
Q
 
G
R
 
E
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
N
I
 
I
R
 
L
Q
 
L
Y
 
F
K
 
K
I
 
R
G
 
A
V
 
L
G
 
G
P
 
V
V
 
T
A
 
T
V
 
G
F
 
I
G
 
L
A
 
P
S
 
W
N
|
N
F
|
F
P
 
P
L
 
-
A
 
-
F
 
F
S
 
F
V
 
L
A
 
I
G
 
A
G
 
R
D
 
K
T
 
M
A
 
A
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
T
G
 
G
C
 
N
P
 
T
V
 
I
V
 
V
F
 
I
K
|
K
A
 
-
H
 
-
S
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
P
S
 
S
E
 
E
L
 
F
V
 
T
-
 
P
-
 
N
-
 
N
A
 
A
D
 
I
A
 
A
I
 
F
E
 
A
R
 
K
A
 
I
V
 
V
K
 
D
K
 
E
T
 
I
G
 
G
M
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
G
T
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
L
I
 
V
Y
 
L
G
 
G
-
 
R
-
 
G
D
 
E
R
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
Q
Q
 
E
L
 
L
V
 
A
K
 
G
S
 
N
A
 
P
G
 
K
I
 
V
Q
 
A
A
 
M
V
 
V
G
 
S
F
 
M
T
 
T
G
 
G
S
 
S
L
 
V
R
 
S
G
 
A
G
 
G
R
 
E
A
 
K
L
 
I
C
 
-
D
 
-
M
 
M
A
 
A
A
 
T
A
 
A
R
 
A
P
 
K
Q
 
N
P
 
I
I
 
T
P
 
K
V
 
V
F
 
C
A
 
L
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
A
P
 
P
I
 
A
I
 
I
L
 
V
M
 
M
P
 
D
E
 
D
A
 
A
-
 
D
L
 
L
K
 
E
L
 
L
R
 
A
G
 
V
D
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
V
K
 
D
D
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
S
V
 
R
T
 
V
V
 
I
G
 
N
V
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
C
|
C
T
x
N
S
 
C
P
 
A
G
 
E
L
 
R
L
 
V
L
 
Y
G
 
-
V
 
V
R
 
Q
S
 
K
P
 
G
E
 
I
L
 
Y
T
 
D
S
 
Q
F
 
F
I
 
V
E
 
N
K
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
E
A
 
A
F
 
M
G
 
Q
G
 
A
T
 
V
-
 
Q
-
x
F
-
x
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
E
-
x
R
-
 
N
-
x
D
-
x
I
-
x
A
-
 
M
-
 
G
-
 
P
M
 
L
L
 
I
N
 
N
S
 
A
G
 
A
G
 
A
L
 
L
T
 
E
H
 
R
Y
 
V
N
 
E
G
 
Q
G
 
K
V
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
A
T
 
V
Q
 
E
L
 
-
P
 
E
G
 
G
V
 
A
K
 
R
V
 
V
I
 
-
A
 
A
T
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
K
S
 
A
Y
 
-
T
 
V
Q
 
E
A
 
G
V
 
K
P
 
G
H
 
Y
L
x
Y
F
 
Y
K
 
P
A
 
P
D
 
T
A
 
L
A
 
L
L
 
L
L
 
D
F
 
V
S
 
R
K
 
Q
E
 
E
-
 
M
A
 
S
P
 
I
L
 
M
E
 
H
E
 
E
E
|
E
V
 
T
F
 
F
G
 
G
P
 
P
S
 
V
T
 
L
V
 
P
I
 
V
V
 
V
E
 
A
L
 
F
E
 
D
S
 
T
R
 
L
E
 
E
Q
 
E
L
 
A
L
 
I
D
 
S
F
 
M
A
 
A
A
 
N
K
 
D
M
 
S
N
 
D
G
 
Y
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
S
T
 
S
L
 
I

Sites not aligning to the query:

3jz4A Crystal structure of e. Coli NADP dependent enzyme (see paper)
29% identity, 56% coverage: 45:340/529 of query aligns to 48:324/481 of 3jz4A

query
sites
3jz4A
E
 
E
V
 
T
A
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
I
H
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
N
Q
 
R
A
 
A
Y
 
L
P
 
P
L
 
A
Y
 
W
R
 
R
A
 
A
T
 
L
T
 
T
S
 
A
E
 
K
Q
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
T
F
 
I
L
 
L
E
 
R
A
 
N
I
 
W
A
 
F
D
 
N
E
 
L
I
 
M
D
 
M
A
 
E
L
 
H
G
 
Q
D
 
D
D
 
D
F
 
L
L
 
A
A
 
R
A
 
L
V
 
M
A
 
T
R
 
L
E
 
E
T
 
Q
A
 
G
L
 
K
P
 
P
A
 
-
T
 
L
P
 
A
R
 
E
L
 
A
A
 
K
G
 
G
E
 
E
R
 
I
A
 
S
R
 
Y
T
 
A
S
 
A
G
 
S
Q
 
F
M
 
I
R
 
E
L
 
W
F
 
F
A
 
A
K
 
E
V
 
E
V
 
G
R
 
K
R
 
R
G
 
-
D
 
-
F
 
I
Y
 
Y
G
 
G
A
 
-
R
 
-
I
 
-
D
 
D
T
 
T
A
 
-
L
 
I
P
 
P
Q
 
G
R
 
H
Q
 
Q
P
 
A
L
 
D
P
 
K
R
 
R
P
 
L
D
 
I
I
 
V
R
 
I
Q
 
K
Y
 
Q
K
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
G
 
-
P
 
-
V
 
T
A
 
A
V
 
A
F
 
I
G
 
T
A
x
P
S
x
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
A
A
 
A
F
 
M
S
 
I
V
 
T
A
 
R
G
 
-
G
 
-
D
 
K
T
 
A
A
 
G
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
P
 
T
V
 
M
V
 
V
F
 
L
K
|
K
A
 
P
H
x
A
S
|
S
G
 
Q
H
 
T
L
 
P
V
 
F
T
 
S
S
 
A
E
 
L
L
 
A
V
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
L
I
 
A
E
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
-
K
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
G
M
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
T
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
V
I
 
V
Y
 
T
G
 
G
D
 
S
-
x
A
-
 
G
R
 
A
V
 
V
G
|
G
A
 
N
Q
 
E
L
 
L
V
 
T
K
 
S
S
 
N
A
 
P
G
 
L
I
 
V
Q
 
R
A
 
K
V
 
L
G
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
L
 
T
R
 
E
G
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
Q
L
 
L
C
 
M
D
 
E
M
 
Q
A
 
C
A
 
A
A
 
K
R
 
D
P
 
I
Q
 
K
P
 
K
I
 
V
P
 
S
V
 
L
F
 
-
A
 
-
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
N
N
 
A
P
 
P
I
 
F
I
 
I
L
 
V
M
 
F
P
 
D
E
 
D
A
 
A
L
 
-
K
 
-
L
 
-
R
 
D
G
 
L
D
 
D
A
 
K
I
 
A
A
 
V
K
 
E
D
 
G
L
 
A
A
 
L
G
 
A
S
 
S
V
 
K
T
 
F
V
 
R
G
 
N
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
T
C
|
C
T
 
V
S
 
C
P
 
A
G
 
N
L
 
R
L
 
L
L
 
Y
G
 
-
V
 
V
R
 
Q
S
 
D
P
 
G
E
 
V
L
 
Y
T
 
D
S
 
R
F
 
F
I
 
A
E
 
E
K
 
K
L
 
L
S
 
Q
A
 
Q
A
 
A
F
 
M
G
 
S
G
 
K
T
 
L
N
 
H
P
 
I
A
 
G
T
 
D
M
 
G
L
 
L
N
 
D
S
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2impA Crystal structure of lactaldehyde dehydrogenase from e. Coli: the ternary complex with lactate (occupancy 0.5) and nadh. Crystals soaked with (l)-lactate. (see paper)
26% identity, 79% coverage: 10:425/529 of query aligns to 8:413/477 of 2impA

query
sites
2impA
Y
 
Y
I
 
I
G
 
D
G
 
G
Q
 
Q
-
 
F
R
 
V
S
 
T
G
 
W
Q
 
R
G
 
G
D
 
D
V
 
A
A
 
W
L
 
I
H
 
D
S
 
V
V
 
V
D
 
N
-
 
P
A
 
A
T
 
T
T
 
E
G
 
A
A
 
V
L
 
I
F
 
S
E
 
R
T
 
I
P
 
P
F
 
D
L
 
G
T
 
Q
A
 
A
T
 
E
D
 
D
K
 
A
E
 
R
V
 
-
A
 
-
A
 
K
A
 
A
V
 
I
H
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
Y
 
Q
P
 
P
L
 
E
Y
 
W
R
 
E
A
 
A
T
 
L
T
 
P
S
 
A
E
 
I
Q
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
S
F
 
W
L
 
L
E
 
R
A
 
K
I
 
I
A
 
S
D
 
A
E
 
G
I
 
I
D
 
R
A
 
E
L
 
R
G
 
A
D
 
S
D
 
E
F
 
I
L
 
S
A
 
A
A
 
L
V
 
I
A
 
V
R
 
E
E
 
E
T
 
G
A
 
G
L
 
-
P
 
-
A
 
K
T
 
I
P
 
Q
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
E
-
 
V
E
 
E
R
 
V
A
 
A
R
 
F
T
 
T
S
 
A
G
 
D
Q
 
Y
M
 
I
R
 
D
L
 
Y
F
 
M
A
 
A
K
 
E
V
 
W
V
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
-
D
 
-
F
 
Y
Y
 
E
G
 
G
A
 
E
R
 
I
I
 
I
D
 
Q
T
 
S
A
 
D
L
 
R
P
 
P
Q
 
G
R
 
E
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
N
I
 
I
R
 
L
Q
 
L
Y
 
F
K
 
K
I
 
R
G
 
A
V
 
L
G
 
G
P
 
V
V
 
T
A
 
T
V
 
G
F
x
I
G
x
L
A
x
P
S
x
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
-
A
 
-
F
 
F
S
 
F
V
 
L
A
 
I
G
 
A
G
 
R
D
 
K
T
 
M
A
 
A
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
T
G
 
G
C
 
N
P
 
T
V
 
I
V
 
V
F
 
I
K
|
K
A
 
-
H
 
-
S
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
P
S
 
S
E
|
E
L
x
F
V
 
T
-
 
P
-
 
N
-
 
N
A
 
A
D
 
I
A
 
A
I
 
F
E
 
A
R
 
K
A
 
I
V
 
V
K
 
D
K
 
E
T
 
I
G
 
G
M
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
G
T
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
L
I
 
V
Y
 
L
-
 
G
-
 
R
G
|
G
D
 
E
R
 
T
V
 
V
G
|
G
A
x
Q
Q
 
E
L
 
L
V
 
A
K
 
G
S
 
N
A
 
P
G
 
K
I
 
V
Q
 
A
A
 
M
V
 
V
G
 
S
F
 
M
T
 
T
G
 
G
S
|
S
L
 
V
R
 
S
G
x
A
G
 
G
R
 
E
A
x
K
L
 
I
C
 
-
D
 
-
M
 
M
A
 
A
A
 
T
A
 
A
R
 
A
P
 
K
Q
 
N
P
 
I
I
 
T
P
 
K
V
 
V
F
 
C
A
 
L
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
A
P
 
P
I
 
A
I
 
I
L
 
V
M
 
M
P
 
D
E
 
D
A
 
A
-
 
D
L
 
L
K
 
E
L
 
L
R
 
A
G
 
V
D
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
V
K
 
D
D
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
S
V
 
R
T
 
V
V
 
I
G
 
N
V
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
C
|
C
T
 
N
S
 
C
P
 
A
G
 
E
L
 
R
L
 
V
L
 
Y
G
 
-
V
 
V
R
 
Q
S
 
K
P
 
G
E
 
I
L
 
Y
T
 
D
S
 
Q
F
 
F
I
 
V
E
 
N
K
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
E
A
 
A
F
 
M
G
 
Q
G
 
A
T
 
V
-
 
Q
-
 
F
-
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
E
-
 
R
-
 
N
-
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
M
-
 
G
-
 
P
M
 
L
L
 
I
N
 
N
S
 
A
G
 
A
G
 
A
L
 
L
T
 
E
H
x
R
Y
 
V
N
 
E
G
 
Q
G
 
K
V
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
A
T
 
V
Q
 
E
L
 
-
P
 
E
G
 
G
V
 
A
K
 
R
V
 
V
I
 
-
A
 
A
T
 
F
G
 
G
G
 
G
T
 
K
S
 
A
Y
 
-
T
 
V
Q
 
E
A
 
G
V
 
K
P
 
G
H
 
Y
L
 
Y
F
 
Y
K
 
P
A
 
P
D
 
T
A
 
L
A
 
L
L
 
L
L
 
D
F
 
V
S
 
R
K
 
Q
E
 
E
-
 
M
A
 
S
P
 
I
L
 
M
E
 
H
E
 
E
E
|
E
V
 
T
F
 
F
G
 
G
P
 
P
S
 
V
T
 
L
V
 
P
I
 
V
V
 
V
E
 
A
L
 
F
E
 
D
S
 
T
R
 
L
E
 
E
Q
 
D
L
 
A
L
 
I
D
 
S
F
 
M
A
 
A
A
 
N
K
 
D
M
 
S
N
 
D
G
 
Y
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
S
T
 
S
L
 
I

Sites not aligning to the query:

2iluA Crystal structure of lactaldehyde dehydrogenase from e. Coli: the binary complex with NADPH (see paper)
26% identity, 79% coverage: 10:425/529 of query aligns to 8:413/477 of 2iluA

query
sites
2iluA
Y
 
Y
I
 
I
G
 
D
G
 
G
Q
 
Q
-
 
F
R
 
V
S
 
T
G
 
W
Q
 
R
G
 
G
D
 
D
V
 
A
A
 
W
L
 
I
H
 
D
S
 
V
V
 
V
D
 
N
-
 
P
A
 
A
T
 
T
T
 
E
G
 
A
A
 
V
L
 
I
F
 
S
E
 
R
T
 
I
P
 
P
F
 
D
L
 
G
T
 
Q
A
 
A
T
 
E
D
 
D
K
 
A
E
 
R
V
 
-
A
 
-
A
 
K
A
 
A
V
 
I
H
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
Y
 
Q
P
 
P
L
 
E
Y
 
W
R
 
E
A
 
A
T
 
L
T
 
P
S
 
A
E
 
I
Q
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
S
F
 
W
L
 
L
E
 
R
A
 
K
I
 
I
A
 
S
D
 
A
E
 
G
I
 
I
D
 
R
A
 
E
L
 
R
G
 
A
D
 
S
D
 
E
F
 
I
L
 
S
A
 
A
A
 
L
V
 
I
A
 
V
R
 
E
E
 
E
T
 
G
A
 
G
L
 
-
P
 
-
A
 
K
T
 
I
P
 
Q
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
E
-
 
V
E
 
E
R
 
V
A
 
A
R
 
F
T
 
T
S
 
A
G
 
D
Q
 
Y
M
 
I
R
 
D
L
 
Y
F
 
M
A
 
A
K
 
E
V
 
W
V
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
-
D
 
-
F
 
Y
Y
 
E
G
 
G
A
 
E
R
 
I
I
 
I
D
 
Q
T
 
S
A
 
D
L
 
R
P
 
P
Q
 
G
R
 
E
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
N
I
 
I
R
 
L
Q
 
L
Y
 
F
K
 
K
I
 
R
G
 
A
V
 
L
G
 
G
P
 
V
V
 
T
A
 
T
V
 
G
F
x
I
G
x
L
A
x
P
S
x
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
-
A
 
-
F
 
F
S
 
F
V
 
L
A
 
I
G
 
A
G
 
R
D
 
K
T
 
M
A
 
A
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
T
G
 
G
C
 
N
P
 
T
V
 
I
V
 
V
F
 
I
K
|
K
A
 
-
H
 
-
S
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
P
S
|
S
E
|
E
L
 
F
V
 
T
-
 
P
-
 
N
-
 
N
A
 
A
D
 
I
A
 
A
I
 
F
E
 
A
R
 
K
A
 
I
V
 
V
K
 
D
K
 
E
T
 
I
G
 
G
M
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
G
T
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
L
I
 
V
Y
 
L
-
 
G
-
x
R
G
|
G
D
 
E
R
 
T
V
 
V
G
|
G
A
x
Q
Q
 
E
L
 
L
V
 
A
K
 
G
S
 
N
A
 
P
G
 
K
I
 
V
Q
 
A
A
 
M
V
 
V
G
 
S
F
 
M
T
 
T
G
 
G
S
|
S
L
 
V
R
 
S
G
x
A
G
 
G
R
 
E
A
x
K
L
x
I
C
 
-
D
 
-
M
 
M
A
 
A
A
 
T
A
 
A
R
 
A
P
 
K
Q
 
N
P
 
I
I
 
T
P
 
K
V
 
V
F
 
C
A
 
L
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
A
P
 
P
I
 
A
I
 
I
L
 
V
M
 
M
P
 
D
E
 
D
A
 
A
-
 
D
L
 
L
K
 
E
L
 
L
R
 
A
G
 
V
D
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
V
K
 
D
D
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
S
V
 
R
T
 
V
V
 
I
G
 
N
V
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
C
|
C
T
 
N
S
 
C
P
 
A
G
 
E
L
 
R
L
 
V
L
 
Y
G
 
-
V
 
V
R
 
Q
S
 
K
P
 
G
E
 
I
L
 
Y
T
 
D
S
 
Q
F
 
F
I
 
V
E
 
N
K
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
E
A
 
A
F
 
M
G
 
Q
G
 
A
T
 
V
-
 
Q
-
 
F
-
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
E
-
 
R
-
 
N
-
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
M
-
 
G
-
 
P
M
 
L
L
 
I
N
|
N
S
 
A
G
 
A
G
 
A
L
 
L
T
 
E
H
x
R
Y
 
V
N
 
E
G
 
Q
G
 
K
V
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
A
T
 
V
Q
 
E
L
 
-
P
 
E
G
 
G
V
 
A
K
 
R
V
 
V
I
 
-
A
 
A
T
 
F
G
 
G
G
 
G
T
 
K
S
 
A
Y
 
-
T
 
V
Q
 
E
A
 
G
V
 
K
P
 
G
H
 
Y
L
 
Y
F
 
Y
K
 
P
A
 
P
D
 
T
A
 
L
A
 
L
L
 
L
L
 
D
F
 
V
S
 
R
K
 
Q
E
 
E
-
 
M
A
 
S
P
 
I
L
 
M
E
 
H
E
 
E
E
|
E
V
 
T
F
|
F
G
 
G
P
 
P
S
 
V
T
 
L
V
 
P
I
 
V
V
 
V
E
 
A
L
 
F
E
 
D
S
 
T
R
 
L
E
 
E
Q
 
D
L
 
A
L
 
I
D
 
S
F
 
M
A
 
A
A
 
N
K
 
D
M
 
S
N
 
D
G
 
Y
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
S
T
 
S
L
 
I

Sites not aligning to the query:

P25526 Succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP(+)] GabD; SSDH; Glutarate-semialdehyde dehydrogenase; EC 1.2.1.79; EC 1.2.1.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
29% identity, 56% coverage: 45:340/529 of query aligns to 49:325/482 of P25526

query
sites
P25526
E
 
E
V
 
T
A
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
I
H
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
N
Q
 
R
A
 
A
Y
 
L
P
 
P
L
 
A
Y
 
W
R
 
R
A
 
A
T
 
L
T
 
T
S
 
A
E
 
K
Q
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
T
F
 
I
L
 
L
E
 
R
A
 
N
I
 
W
A
 
F
D
 
N
E
 
L
I
 
M
D
 
M
A
 
E
L
 
H
G
 
Q
D
 
D
D
 
D
F
 
L
L
 
A
A
 
R
A
 
L
V
 
M
A
 
T
R
 
L
E
 
E
T
 
Q
A
 
G
L
 
K
P
 
P
A
 
-
T
 
L
P
 
A
R
 
E
L
 
A
A
 
K
G
 
G
E
 
E
R
 
I
A
 
S
R
 
Y
T
 
A
S
 
A
G
 
S
Q
 
F
M
 
I
R
 
E
L
 
W
F
 
F
A
 
A
K
 
E
V
 
E
V
 
G
R
 
K
R
 
R
G
 
-
D
 
-
F
 
I
Y
 
Y
G
 
G
A
 
-
R
 
-
I
 
-
D
 
D
T
 
T
A
 
-
L
 
I
P
 
P
Q
 
G
R
 
H
Q
 
Q
P
 
A
L
 
D
P
 
K
R
 
R
P
 
L
D
 
I
I
 
V
R
 
I
Q
 
K
Y
 
Q
K
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
G
 
-
P
 
-
V
 
T
A
 
A
V
 
A
F
 
I
G
 
T
A
 
P
S
x
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
A
A
 
A
F
 
M
S
 
I
V
 
T
A
 
R
G
 
-
G
 
-
D
 
K
T
 
A
A
 
G
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
P
 
T
V
 
M
V
 
V
F
 
L
K
|
K
A
x
P
H
x
A
S
|
S
G
 
Q
H
 
T
L
 
P
V
 
F
T
 
S
S
 
A
E
 
L
L
 
A
V
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
L
I
 
A
E
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
-
K
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
G
M
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
T
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
V
I
 
V
Y
 
T
G
 
G
D
 
S
-
 
A
-
 
G
R
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
N
Q
 
E
L
 
L
V
 
T
K
 
S
S
 
N
A
 
P
G
 
L
I
 
V
Q
 
R
A
 
K
V
 
L
G
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
L
 
T
R
 
E
G
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
Q
L
 
L
C
 
M
D
 
E
M
 
Q
A
 
C
A
 
A
A
 
K
R
 
D
P
 
I
Q
 
K
P
 
K
I
 
V
P
 
S
V
 
L
F
 
-
A
 
-
E
 
E
M
x
L
S
 
G
S
 
G
I
 
N
N
 
A
P
 
P
I
 
F
I
 
I
L
 
V
M
 
F
P
 
D
E
 
D
A
 
A
L
 
-
K
 
-
L
 
-
R
 
D
G
 
L
D
 
D
A
 
K
I
 
A
A
 
V
K
 
E
D
 
G
L
 
A
A
 
L
G
 
A
S
 
S
V
 
K
T
 
F
V
 
R
G
 
N
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
T
C
 
C
T
 
V
S
 
C
P
 
A
G
 
N
L
 
R
L
 
L
L
 
Y
G
 
-
V
 
V
R
 
Q
S
 
D
P
 
G
E
 
V
L
 
Y
T
 
D
S
 
R
F
 
F
I
 
A
E
 
E
K
 
K
L
 
L
S
 
Q
A
 
Q
A
 
A
F
 
V
G
 
S
G
 
K
T
 
L
N
 
H
P
 
I
A
 
G
T
 
D
M
 
G
L
 
L
N
 
D
S
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P25553 Lactaldehyde dehydrogenase; Aldehyde dehydrogenase A; Glycolaldehyde dehydrogenase; EC 1.2.1.22; EC 1.2.1.21 from Escherichia coli (strain K12) (see 5 papers)
26% identity, 79% coverage: 10:425/529 of query aligns to 10:415/479 of P25553

query
sites
P25553
Y
 
Y
I
 
I
G
 
D
G
 
G
Q
 
Q
-
 
F
R
 
V
S
 
T
G
 
W
Q
 
R
G
 
G
D
 
D
V
 
A
A
 
W
L
 
I
H
 
D
S
 
V
V
 
V
D
 
N
-
 
P
A
 
A
T
 
T
T
 
E
G
 
A
A
 
V
L
 
I
F
 
S
E
 
R
T
 
I
P
 
P
F
 
D
L
 
G
T
 
Q
A
 
A
T
 
E
D
 
D
K
 
A
E
 
R
V
 
-
A
 
-
A
 
K
A
 
A
V
 
I
H
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
Y
 
Q
P
 
P
L
 
E
Y
 
W
R
 
E
A
 
A
T
 
L
T
 
P
S
 
A
E
 
I
Q
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
S
F
 
W
L
 
L
E
 
R
A
 
K
I
 
I
A
 
S
D
 
A
E
 
G
I
 
I
D
 
R
A
 
E
L
 
R
G
 
A
D
 
S
D
 
E
F
 
I
L
 
S
A
 
A
A
 
L
V
 
I
A
 
V
R
 
E
E
 
E
T
 
G
A
 
G
L
 
-
P
 
-
A
 
K
T
 
I
P
 
Q
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
E
-
 
V
E
 
E
R
 
V
A
 
A
R
 
F
T
 
T
S
 
A
G
 
D
Q
 
Y
M
 
I
R
 
D
L
 
Y
F
 
M
A
 
A
K
 
E
V
 
W
V
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
-
D
 
-
F
 
Y
Y
 
E
G
 
G
A
 
E
R
 
I
I
 
I
D
 
Q
T
 
S
A
 
D
L
 
R
P
 
P
Q
 
G
R
 
E
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
N
I
 
I
R
 
L
Q
 
L
Y
 
F
K
 
K
I
 
R
G
 
A
V
 
L
G
 
G
P
 
V
V
 
T
A
 
T
V
 
G
F
 
I
G
x
L
A
 
P
S
 
W
N
 
N
F
 
F
P
 
P
L
 
-
A
 
-
F
 
F
S
 
F
V
 
L
A
 
I
G
 
A
G
x
R
D
 
K
T
 
M
A
 
A
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
T
G
 
G
C
 
N
P
 
T
V
 
I
V
 
V
F
 
I
K
|
K
A
 
-
H
 
-
S
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
V
 
-
T
x
P
S
|
S
E
|
E
L
x
F
V
 
T
-
 
P
-
 
N
-
 
N
A
 
A
D
 
I
A
 
A
I
 
F
E
 
A
R
 
K
A
 
I
V
 
V
K
 
D
K
 
E
T
 
I
G
 
G
M
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
G
T
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
L
I
 
V
Y
 
L
-
 
G
-
 
R
G
 
G
D
 
E
R
 
T
V
 
V
G
 
G
A
x
Q
Q
 
E
L
 
L
V
 
A
K
 
G
S
 
N
A
 
P
G
 
K
I
 
V
Q
 
A
A
 
M
V
 
V
G
 
S
F
 
M
T
 
T
G
 
G
S
|
S
L
 
V
R
 
S
G
 
A
G
 
G
R
 
E
A
 
K
L
 
I
C
 
-
D
 
-
M
 
M
A
 
A
A
 
T
A
 
A
R
 
A
P
 
K
Q
 
N
P
 
I
I
 
T
P
 
K
V
 
V
F
 
C
A
 
L
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
A
P
 
P
I
 
A
I
 
I
L
 
V
M
 
M
P
 
D
E
 
D
A
 
A
-
 
D
L
 
L
K
 
E
L
 
L
R
 
A
G
 
V
D
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
V
K
 
D
D
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
S
V
 
R
T
 
V
V
 
I
G
 
N
V
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
C
 
C
T
x
N
S
 
C
P
 
A
G
 
E
L
 
R
L
 
V
L
 
Y
G
 
-
V
 
V
R
 
Q
S
 
K
P
 
G
E
 
I
L
 
Y
T
 
D
S
 
Q
F
 
F
I
 
V
E
 
N
K
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
E
A
 
A
F
 
M
G
 
Q
G
 
A
T
 
V
-
 
Q
-
 
F
-
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
E
-
 
R
-
 
N
-
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
M
-
 
G
-
 
P
M
 
L
L
 
I
N
 
N
S
 
A
G
 
A
G
 
A
L
 
L
T
 
E
H
x
R
Y
 
V
N
 
E
G
 
Q
G
 
K
V
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
A
T
 
V
Q
 
E
L
 
-
P
 
E
G
 
G
V
 
A
K
 
R
V
 
V
I
 
-
A
 
A
T
 
F
G
 
G
G
 
G
T
 
K
S
 
A
Y
 
-
T
 
V
Q
 
E
A
 
G
V
 
K
P
 
G
H
 
Y
L
 
Y
F
 
Y
K
 
P
A
 
P
D
 
T
A
 
L
A
 
L
L
 
L
L
 
D
F
 
V
S
 
R
K
 
Q
E
 
E
-
 
M
A
 
S
P
 
I
L
 
M
E
 
H
E
 
E
E
 
E
V
 
T
F
 
F
G
 
G
P
 
P
S
 
V
T
 
L
V
 
P
I
 
V
V
 
V
E
 
A
L
 
F
E
 
D
S
 
T
R
 
L
E
 
E
Q
 
D
L
 
A
L
 
I
D
 
S
F
 
M
A
 
A
A
 
N
K
 
D
M
 
S
N
 
D
G
 
Y
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
S
T
 
S
L
 
I

Sites not aligning to the query:

Q9H2A2 2-aminomuconic semialdehyde dehydrogenase; Aldehyde dehydrogenase 12; Aldehyde dehydrogenase family 8 member A1; EC 1.2.1.32 from Homo sapiens (Human) (see paper)
22% identity, 77% coverage: 23:427/529 of query aligns to 25:425/487 of Q9H2A2

query
sites
Q9H2A2
L
 
I
H
 
D
S
 
S
V
 
Y
D
 
D
A
 
P
T
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
E
L
 
V
F
 
Y
E
 
C
T
 
R
P
 
V
F
 
P
L
 
N
T
 
S
A
 
G
T
 
K
D
 
D
K
 
-
E
 
E
V
 
I
A
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
H
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
R
Q
 
E
A
 
A
Y
 
F
P
 
P
L
 
S
Y
 
W
R
 
S
A
 
S
T
 
R
T
 
S
S
 
P
E
 
Q
Q
 
E
R
 
R
A
 
S
Q
 
R
F
 
V
L
 
L
E
 
N
A
 
Q
I
 
V
A
 
A
D
 
D
E
 
L
I
 
L
D
 
E
A
 
Q
L
 
S
G
 
L
D
 
E
D
 
E
F
 
F
L
 
A
A
 
Q
A
 
A
V
 
E
A
 
S
R
 
K
E
 
D
T
 
Q
A
 
G
L
 
K
P
 
T
A
 
L
T
 
A
P
 
L
R
 
A
L
 
R
A
 
T
G
 
M
E
 
D
R
 
I
A
 
P
R
|
R
T
 
S
S
 
V
G
 
Q
Q
 
N
M
 
F
R
 
R
L
 
F
F
 
F
A
 
A
K
 
S
V
 
S
V
 
S
R
 
L
R
 
H
G
 
H
D
 
T
F
 
S
Y
 
E
G
 
C
A
 
T
R
 
Q
I
 
M
D
 
D
T
 
H
A
 
L
L
 
G
P
 
C
Q
 
M
R
 
H
Q
 
Y
P
 
T
L
 
V
P
 
R
R
 
A
P
 
P
D
 
-
I
 
-
R
 
-
Q
 
-
Y
 
-
K
 
-
I
 
-
G
 
-
V
 
V
G
 
G
P
 
V
V
 
A
A
 
G
V
 
L
F
 
I
G
 
S
A
 
P
S
 
W
N
|
N
F
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
Y
F
 
-
S
 
-
V
 
L
A
 
L
G
 
T
G
 
W
D
 
K
T
 
I
A
 
A
A
 
P
A
 
A
L
 
M
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
T
V
 
V
V
 
I
F
 
A
K
 
K
A
 
P
H
 
S
S
 
E
G
 
L
H
 
T
L
 
S
V
 
V
T
 
T
S
 
A
E
 
W
L
 
M
V
 
L
A
 
C
D
 
K
A
 
L
I
 
L
E
 
D
R
 
K
A
 
A
V
 
-
K
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
G
M
 
V
P
 
P
A
 
P
G
 
G
T
 
V
F
 
V
N
 
N
M
 
I
I
 
V
Y
 
F
G
 
G
D
 
T
-
 
G
-
 
P
R
 
R
V
 
V
G
 
G
A
 
E
Q
 
A
L
 
L
V
 
V
K
 
S
S
 
H
A
 
P
G
 
E
I
 
V
Q
 
P
A
 
L
V
 
I
G
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
L
 
Q
R
 
P
G
 
T
G
 
A
R
 
E
A
 
R
L
 
I
C
 
T
D
 
Q
M
 
L
A
 
S
A
 
A
A
 
-
R
 
-
P
 
P
Q
 
H
P
 
C
I
 
K
P
 
K
V
 
L
F
 
S
A
 
L
E
 
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
N
P
 
P
I
 
A
I
 
I
L
 
I
M
 
F
P
 
E
E
 
D
A
 
A
L
 
-
K
 
-
L
 
-
R
 
N
G
 
L
D
 
D
A
 
E
I
 
C
A
 
I
K
 
P
D
 
A
L
 
T
A
 
V
G
 
R
S
 
S
V
 
S
T
 
F
V
 
A
G
 
N
V
 
Q
G
 
G
Q
 
E
L
 
I
C
 
C
T
 
L
S
 
C
P
 
T
G
 
S
L
 
R
L
 
I
L
 
F
-
 
V
-
 
Q
-
 
K
G
 
S
V
 
I
R
 
Y
S
 
S
P
 
E
E
 
F
L
 
L
T
 
K
S
 
R
F
 
F
I
 
V
E
 
E
K
 
A
L
 
T
S
 
R
A
 
K
A
 
W
F
 
K
G
 
V
G
 
G
T
 
I
N
 
P
P
 
S
A
 
D
T
 
P
M
 
L
L
 
V
N
 
S
S
 
I
G
 
G
G
 
A
L
 
L
-
 
I
-
 
S
-
 
K
-
 
A
-
 
H
-
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
R
T
 
S
H
 
Y
Y
 
V
N
 
K
G
 
R
G
 
A
V
 
L
A
 
A
R
 
E
L
 
G
T
 
A
Q
 
Q
L
 
I
P
 
W
-
 
C
G
 
G
V
 
E
K
 
G
V
 
V
I
 
D
A
 
K
T
 
L
G
 
S
G
 
L
T
 
P
S
 
A
Y
 
R
T
 
N
Q
 
Q
A
 
A
V
 
G
P
 
Y
H
 
F
L
 
M
F
 
L
K
 
P
A
 
T
D
 
V
A
 
I
A
 
T
L
 
D
L
 
I
F
 
K
S
 
D
K
 
E
E
 
S
A
 
C
P
 
C
L
 
M
E
 
T
E
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
S
 
V
T
 
T
V
 
C
I
 
V
V
 
V
E
 
P
L
 
F
E
 
D
S
 
S
R
 
E
E
 
E
Q
 
E
L
 
V
L
 
I
D
 
E
F
 
R
A
 
A
A
 
N
K
 
N
M
 
V
N
 
K
G
 
Y
Q
 
G
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
V
Q
 
W
A
 
S

Sites not aligning to the query:

4u3wA X-ray crystal structure of 2-aminomuconate 6-semialdehyde dehydrogenase from burkholderia cenocepacia
30% identity, 39% coverage: 49:255/529 of query aligns to 47:243/485 of 4u3wA

query
sites
4u3wA
A
 
A
V
 
A
H
 
H
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
Q
 
K
A
 
A
Y
 
G
P
 
-
L
 
-
Y
 
W
R
 
R
A
 
D
T
 
T
T
 
T
S
 
P
E
 
A
Q
 
Q
R
 
R
A
 
A
Q
 
A
F
 
W
L
 
L
E
 
H
A
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
G
I
 
I
D
 
E
A
 
A
L
 
R
G
 
F
D
 
D
D
 
E
F
 
F
L
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
E
A
 
V
R
 
A
E
 
D
T
 
T
A
 
G
L
 
R
P
 
P
A
 
V
T
 
A
P
 
Q
R
 
A
L
 
R
A
 
T
G
 
L
E
 
D
R
 
I
A
 
A
R
 
R
T
 
G
S
 
I
G
 
A
Q
 
N
M
 
F
R
 
R
L
 
T
F
 
F
A
 
A
K
 
D
V
 
L
V
 
V
R
 
R
-
 
T
-
 
A
R
 
S
G
 
G
D
 
E
F
 
Y
Y
 
F
-
 
E
-
 
T
-
 
H
-
 
A
-
 
A
-
 
D
G
 
G
A
 
S
R
 
E
I
 
L
D
 
I
T
 
N
A
 
Y
L
 
V
P
 
-
Q
 
T
R
 
R
Q
 
K
P
 
P
L
 
L
P
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
I
 
-
R
 
-
Q
 
-
Y
 
-
K
 
-
I
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
G
P
 
V
V
 
I
A
 
G
V
 
I
F
 
I
G
 
S
A
 
P
S
 
W
N
|
N
F
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
L
F
 
L
S
 
F
V
 
T
A
 
-
G
 
-
G
 
W
D
 
K
T
 
V
A
 
A
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
M
G
 
G
C
 
N
P
 
C
V
 
V
V
 
V
F
 
A
K
|
K
A
 
P
H
 
S
S
 
E
G
 
E
H
 
T
L
 
P
V
 
S
T
 
S
S
 
A
E
 
T
L
 
L
V
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
V
I
 
M
E
 
H
R
 
-
A
 
-
V
 
-
K
 
-
K
 
D
T
 
V
G
 
G
M
 
L
P
 
P
A
 
P
G
 
G
T
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
L
I
 
I
Y
 
H
G
 
G
-
 
H
-
 
G
-
 
Q
D
 
N
R
 
A
V
 
A
G
 
G
A
 
E
Q
 
F
L
 
L
V
 
T
K
 
R
S
 
H
A
 
P
G
 
D
I
 
I
Q
 
S
A
 
A
V
 
I
G
 
T
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
E
L
 
S
R
 
R
G
 
T
G
 
G
R
 
S
A
 
T
L
 
I
C
 
M
D
 
K
M
 
A
A
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3hazA Crystal structure of bifunctional proline utilization a (puta) protein (see paper)
27% identity, 53% coverage: 151:431/529 of query aligns to 641:918/983 of 3hazA

query
sites
3hazA
G
 
G
V
 
R
G
 
G
P
 
V
V
 
F
A
 
V
V
 
A
F
x
I
G
x
S
A
x
P
S
x
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
x
I
S
 
F
V
 
L
A
 
-
G
 
-
G
 
G
D
 
Q
T
 
V
A
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
M
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
S
V
 
V
V
 
V
F
 
A
K
|
K
-
x
P
A
|
A
H
 
E
S
 
Q
G
 
T
H
 
P
L
 
R
V
 
I
T
 
A
S
 
R
E
 
E
L
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
L
V
 
L
K
 
H
K
 
E
T
 
A
G
 
G
M
 
I
P
 
P
A
 
K
G
 
S
T
 
A
F
 
L
N
 
Y
M
 
L
I
 
V
Y
 
T
G
 
G
D
 
D
-
x
G
R
 
R
V
 
I
G
|
G
A
|
A
Q
 
A
L
 
L
V
 
T
K
 
A
S
 
H
A
 
P
G
 
D
I
 
I
Q
 
A
A
 
G
V
 
V
G
 
V
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
L
 
T
R
 
E
G
x
V
G
 
A
R
 
R
A
 
S
L
x
I
C
 
N
D
 
R
M
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
K
P
 
D
Q
 
G
P
 
P
I
 
I
-
 
V
P
 
P
V
 
L
F
 
I
A
 
A
E
|
E
M
x
T
S
 
G
S
 
G
I
 
I
N
 
N
P
 
A
I
 
M
I
 
I
L
 
A
M
 
D
P
 
A
E
 
T
A
 
A
L
 
L
K
 
P
L
 
-
R
 
-
G
 
-
D
 
E
A
 
Q
I
 
V
A
 
A
K
 
D
D
 
D
L
 
V
A
 
V
G
 
T
S
 
S
V
 
A
T
 
F
V
 
R
G
 
S
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
R
C
|
C
T
 
S
S
 
A
P
 
L
G
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
F
G
 
-
V
 
V
R
 
Q
S
 
E
P
 
D
E
 
V
L
 
A
T
 
D
S
 
R
F
 
M
I
 
I
E
 
E
K
 
M
L
 
V
S
 
A
A
 
G
A
 
A
F
 
A
G
 
R
-
 
E
-
 
L
-
 
K
-
 
I
-
 
G
-
 
D
-
 
P
-
 
S
-
 
D
-
 
V
G
 
A
T
 
T
N
 
H
P
 
V
A
 
G
T
 
P
M
 
V
L
 
I
N
 
D
S
 
V
G
 
E
G
 
A
L
 
K
T
 
Q
H
 
R
Y
 
L
N
 
D
G
 
A
G
 
H
V
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
M
T
 
K
Q
 
T
L
 
E
P
 
A
G
 
R
V
 
L
K
 
H
V
 
-
I
 
F
A
 
A
T
 
G
G
 
P
G
 
A
T
 
P
S
 
E
Y
 
G
T
 
C
Q
 
F
A
 
V
V
 
A
P
 
P
H
 
H
L
 
I
F
 
F
K
 
E
A
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
F
 
L
S
 
T
K
 
E
E
 
A
A
 
G
P
 
Q
L
 
L
E
 
T
E
 
E
E
|
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
S
 
I
T
 
L
V
 
H
I
 
V
V
 
V
E
 
R
L
 
Y
-
 
R
-
 
P
E
 
E
S
 
N
R
 
L
E
 
E
Q
 
R
L
 
V
L
 
L
D
 
R
F
 
A
A
 
I
A
 
E
K
 
R
M
 
T
N
 
G
G
 
Y
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
L
T
 
G
L
 
V
Q
 
H
A
 
S
E
 
R
I
 
I
G
 
D
D
 
D

Sites not aligning to the query:

6wsbA Crystal structure of a betaine aldehyde dehydrogenase from burkholderia pseudomallei bound to cofactor NAD (see paper)
25% identity, 73% coverage: 27:411/529 of query aligns to 16:403/489 of 6wsbA

query
sites
6wsbA
D
 
D
A
 
A
T
 
T
T
 
S
G
 
G
A
 
K
L
 
T
F
 
F
E
 
D
T
 
T
-
 
F
-
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
A
P
 
R
F
 
V
L
 
Q
T
 
Q
A
 
A
T
 
S
D
 
A
K
 
D
E
 
D
V
 
V
A
 
D
A
 
R
A
 
A
V
 
V
H
 
A
A
 
S
A
 
A
E
 
R
Q
 
E
A
 
G
Y
 
Q
P
 
R
L
 
E
Y
 
W
R
 
A
A
 
A
T
 
M
T
 
T
S
 
A
E
 
M
Q
 
Q
R
 
R
A
 
S
Q
 
R
F
 
I
L
 
L
E
 
R
A
 
R
I
 
A
A
 
V
D
 
E
E
 
L
I
 
L
D
 
R
A
 
E
L
 
R
G
 
N
D
 
D
D
 
A
F
 
L
L
 
A
A
 
E
A
 
L
V
 
E
A
 
M
R
 
R
E
 
D
T
 
T
A
 
G
L
 
K
P
 
P
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
I
A
 
A
G
 
E
E
 
T
R
 
R
A
 
A
R
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
M
 
-
R
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
V
K
 
D
V
 
I
V
 
V
R
 
T
R
 
G
G
 
A
D
 
D
F
 
V
-
 
I
-
 
E
Y
 
Y
G
 
Y
A
 
A
R
 
G
I
 
L
D
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
I
P
 
E
Q
 
G
R
 
L
Q
 
Q
P
 
V
L
 
P
P
 
L
R
 
R
P
 
P
D
 
E
I
 
S
R
 
F
Q
 
V
Y
 
Y
-
 
T
-
 
R
K
 
R
I
 
E
G
 
P
V
 
L
G
 
G
P
 
V
V
 
C
A
 
A
V
 
G
F
x
I
G
|
G
A
|
A
S
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
I
A
 
-
F
 
-
S
 
Q
V
 
I
A
 
A
G
 
C
G
 
W
D
 
K
T
 
S
A
 
A
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
A
V
 
M
V
 
I
F
 
F
K
|
K
A
 
P
H
 
S
S
x
E
G
 
-
H
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
V
S
 
T
E
 
P
L
 
L
V
 
S
A
 
A
D
 
L
A
 
K
I
 
L
E
 
A
R
 
E
A
 
I
V
 
Y
K
 
T
K
 
E
T
 
A
G
 
G
M
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
T
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
V
I
 
V
Y
 
Q
G
 
G
D
 
D
-
x
G
R
 
S
V
 
V
G
|
G
A
|
A
Q
 
L
L
 
L
V
 
S
K
 
A
S
 
H
A
 
P
G
 
G
I
 
I
Q
 
A
A
 
K
V
 
V
G
 
S
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
x
G
L
 
V
R
 
E
G
x
T
G
 
G
R
 
K
A
 
K
L
x
V
C
 
M
D
 
S
M
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
A
R
 
S
P
 
S
Q
 
L
P
 
K
I
 
-
P
 
E
V
 
V
F
 
T
A
 
M
E
|
E
M
x
L
S
x
G
S
 
G
I
 
K
N
 
S
P
 
P
I
 
L
I
 
I
L
 
V
M
 
F
P
 
D
E
 
D
A
 
A
L
 
D
K
 
L
L
 
D
R
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
R
I
 
A
A
 
A
K
 
D
D
 
I
L
 
A
A
 
V
G
 
T
S
 
A
V
 
N
T
 
F
V
 
F
G
 
S
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
C
|
C
T
 
T
S
 
N
P
 
-
G
 
G
L
 
T
L
 
R
L
 
V
G
 
F
V
 
V
R
 
Q
S
 
Q
P
 
A
E
 
V
L
 
K
T
 
D
S
 
A
F
 
F
I
 
V
E
 
E
K
 
R
L
 
V
S
 
L
A
 
A
-
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
I
-
 
R
-
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
S
-
 
D
-
 
S
-
 
D
-
 
T
A
 
N
F
 
F
G
 
G
G
 
P
T
 
L
N
 
A
P
 
S
A
 
A
T
 
A
M
 
Q
L
 
L
N
 
D
S
 
K
G
 
-
G
 
V
L
 
L
T
 
G
H
 
Y
Y
 
I
N
 
D
G
 
S
G
 
G
V
 
K
A
 
A
R
 
E
L
 
G
T
 
A
Q
 
K
L
 
L
-
 
L
-
 
A
P
 
G
G
 
G
V
 
A
K
 
R
V
 
L
I
 
V
A
 
N
T
 
D
G
 
H
G
 
F
T
 
A
S
 
S
Y
 
G
T
 
Q
Q
 
Y
A
 
V
V
 
A
P
 
P
H
 
T
L
 
V
F
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
C
K
 
R
A
 
D
D
 
D
A
 
M
A
 
R
L
 
I
L
 
-
F
 
-
S
 
-
K
 
-
E
 
-
A
 
-
P
 
-
L
 
V
E
 
R
E
 
E
E
|
E
V
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
S
 
V
T
 
M
V
 
S
I
 
I
V
 
L
E
 
S
L
 
F
E
 
E
S
 
T
R
 
E
E
 
D
Q
 
E
L
 
A
L
 
I

Sites not aligning to the query:

5kj5B Crystal structure of 2-aminomuconate 6-semialdehyde dehydrogenase n169d in complex with NAD+ (see paper)
24% identity, 79% coverage: 9:426/529 of query aligns to 6:421/484 of 5kj5B

query
sites
5kj5B
N
 
N
Y
 
Y
I
 
I
G
 
D
G
 
G
Q
 
N
R
 
F
S
 
V
G
 
T
Q
 
S
G
 
A
D
 
S
V
 
-
A
 
S
L
 
F
H
 
A
S
 
N
V
 
I
D
 
N
A
 
P
T
 
V
T
 
N
G
 
G
A
 
K
L
 
L
F
 
I
E
 
S
T
 
D
P
 
V
F
 
F
L
 
-
T
 
E
A
 
A
T
 
D
D
 
A
K
 
K
E
 
Q
V
 
V
A
 
N
A
 
E
A
 
A
V
 
V
H
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
Q
 
N
A
 
A
Y
 
L
P
 
K
-
 
G
L
 
P
Y
 
W
R
 
G
A
 
K
T
 
L
T
 
S
S
 
V
E
 
Q
Q
 
D
R
 
R
A
 
A
Q
 
A
F
 
L
L
 
I
E
 
H
A
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
G
I
 
I
D
 
Q
A
 
A
L
 
R
G
 
F
D
 
E
D
 
E
F
 
F
L
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
E
A
 
V
R
 
A
E
 
D
T
 
T
A
 
G
L
 
R
P
 
P
A
 
V
T
 
H
P
 
Q
R
 
A
L
 
R
A
 
T
G
 
L
E
 
D
R
 
I
A
 
P
R
 
R
T
 
A
S
 
I
G
 
A
Q
 
N
M
 
F
R
 
R
L
 
T
F
 
F
A
 
A
K
 
D
V
 
L
V
 
A
R
 
K
R
 
T
G
 
S
D
 
H
-
 
T
-
 
D
-
 
L
F
 
F
Y
 
E
G
 
M
A
 
S
R
 
T
I
 
S
D
 
D
T
 
G
A
 
S
L
 
G
P
 
A
Q
 
L
R
 
N
Q
 
Y
P
 
T
L
 
V
P
 
R
R
 
K
P
 
P
D
 
-
I
 
-
R
 
-
Q
 
-
Y
 
-
K
 
-
I
 
-
G
 
-
V
 
L
G
 
G
P
 
V
V
 
I
A
 
G
V
 
V
F
x
I
G
x
S
A
x
P
S
x
W
N
x
D
F
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
L
F
x
L
S
 
F
V
 
T
A
 
-
G
 
-
G
 
W
D
 
K
T
 
V
A
 
A
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
C
G
 
G
C
 
N
P
 
T
V
 
V
V
 
V
F
 
A
K
|
K
A
 
P
H
 
S
S
 
E
G
 
E
H
 
S
L
 
P
V
 
S
T
 
S
S
 
A
E
 
T
L
 
L
V
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
V
I
 
M
E
 
H
R
 
D
A
 
A
V
 
-
K
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
G
M
 
V
P
 
P
A
 
P
G
 
G
T
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
L
I
 
I
Y
 
H
G
 
G
-
 
F
-
x
G
-
x
K
D
 
D
R
 
S
V
 
A
G
|
G
A
 
E
Q
 
F
L
 
L
V
 
T
K
 
Q
S
 
H
A
 
P
G
 
G
I
 
I
Q
 
S
A
 
A
V
 
L
G
 
T
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
x
E
L
 
S
R
 
K
G
x
T
G
 
G
R
 
S
A
 
T
L
 
I
C
 
-
D
 
-
M
 
M
A
 
K
A
 
A
A
 
V
R
 
A
P
 
D
Q
 
G
P
 
V
I
 
K
P
 
E
V
 
V
F
 
S
A
 
F
E
|
E
M
x
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
N
P
 
A
I
 
A
I
 
V
L
 
V
M
 
F
P
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
-
K
 
-
L
 
-
R
 
D
G
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
A
A
 
I
K
 
E
D
 
G
L
 
V
A
 
L
G
 
R
S
 
S
V
 
S
T
 
F
V
 
T
G
 
N
V
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
C
|
C
T
 
L
S
 
C
P
 
S
G
 
E
L
 
R
L
 
V
L
 
Y
G
 
V
V
 
H
R
 
R
S
 
S
-
 
I
-
 
F
P
 
D
E
 
E
L
 
F
T
 
V
S
 
S
F
 
G
I
 
L
-
 
K
-
 
V
-
 
E
-
 
A
E
 
E
K
 
R
L
 
L
S
 
V
A
 
V
A
 
G
F
 
Y
-
 
P
-
 
D
-
 
Q
G
 
D
G
 
G
T
 
V
N
 
N
P
 
M
A
 
G
T
 
P
M
 
L
L
 
I
N
 
S
S
 
H
G
 
G
G
 
H
-
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
V
L
 
L
T
 
S
H
 
Y
Y
 
Y
N
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
R
L
 
L
T
 
A
Q
 
V
L
 
D
P
 
E
G
 
G
V
 
A
K
 
T
V
 
V
I
 
V
A
 
T
T
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
V
-
 
P
-
 
K
-
 
F
-
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
R
-
 
D
-
 
Q
-
 
G
S
 
A
Y
 
Y
T
 
V
Q
 
Q
A
 
-
V
 
-
P
 
P
H
 
T
L
 
I
F
 
W
K
 
T
A
 
G
D
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
L
F
 
S
S
 
D
K
 
K
E
 
A
A
 
R
P
 
C
L
 
V
E
 
T
E
 
E
E
|
E
V
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
S
 
V
T
 
C
V
 
H
I
 
I
V
 
S
E
 
P
L
 
F
E
 
D
S
 
D
R
 
E
E
 
D
Q
 
E
L
 
V
L
 
I
D
 
N
F
 
R
A
 
V
A
 
N
K
 
D
M
 
S
N
 
N
G
 
Y
Q
 
G
L
 
L
T
 
A
A
 
C
T
 
A
L
 
I
Q
 
W

Sites not aligning to the query:

5kllA Crystal structure of 2-hydroxymuconate-6-semialdehyde derived tautomeric intermediate in 2-aminomuconate 6-semialdehyde dehydrogenase n169d (see paper)
24% identity, 79% coverage: 9:426/529 of query aligns to 5:420/483 of 5kllA

query
sites
5kllA
N
 
N
Y
 
Y
I
 
I
G
 
D
G
 
G
Q
 
N
R
 
F
S
 
V
G
 
T
Q
 
S
G
 
A
D
 
S
V
 
-
A
 
S
L
 
F
H
 
A
S
 
N
V
 
I
D
 
N
A
 
P
T
 
V
T
 
N
G
 
G
A
 
K
L
 
L
F
 
I
E
 
S
T
 
D
P
 
V
F
 
F
L
 
-
T
 
E
A
 
A
T
 
D
D
 
A
K
 
K
E
 
Q
V
 
V
A
 
N
A
 
E
A
 
A
V
 
V
H
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
Q
 
N
A
 
A
Y
 
L
P
 
K
-
 
G
L
 
P
Y
 
W
R
 
G
A
 
K
T
 
L
T
 
S
S
 
V
E
 
Q
Q
 
D
R
 
R
A
 
A
Q
 
A
F
 
L
L
 
I
E
 
H
A
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
G
I
 
I
D
 
Q
A
 
A
L
 
R
G
 
F
D
 
E
D
 
E
F
 
F
L
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
E
A
 
V
R
 
A
E
 
D
T
 
T
A
 
G
L
 
R
P
 
P
A
 
V
T
 
H
P
 
Q
R
 
A
L
 
R
A
 
T
G
 
L
E
 
D
R
 
I
A
 
P
R
|
R
T
 
A
S
 
I
G
 
A
Q
 
N
M
 
F
R
 
R
L
 
T
F
 
F
A
 
A
K
 
D
V
 
L
V
 
A
R
 
K
R
 
T
G
 
S
D
 
H
-
 
T
-
 
D
-
 
L
F
 
F
Y
 
E
G
 
M
A
 
S
R
 
T
I
 
S
D
 
D
T
 
G
A
 
S
L
 
G
P
 
A
Q
 
L
R
 
N
Q
 
Y
P
 
T
L
 
V
P
 
R
R
 
K
P
 
P
D
 
-
I
 
-
R
 
-
Q
 
-
Y
 
-
K
 
-
I
 
-
G
 
-
V
 
L
G
 
G
P
 
V
V
 
I
A
 
G
V
 
V
F
 
I
G
 
S
A
 
P
S
 
W
N
x
D
F
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
L
F
x
L
S
 
F
V
 
T
A
 
-
G
 
-
G
x
W
D
 
K
T
 
V
A
 
A
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
C
G
 
G
C
 
N
P
 
T
V
 
V
V
 
V
F
 
A
K
|
K
A
 
P
H
 
S
S
 
E
G
 
E
H
 
S
L
 
P
V
 
S
T
 
S
S
 
A
E
 
T
L
 
L
V
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
V
I
 
M
E
 
H
R
 
D
A
 
A
V
 
-
K
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
G
M
 
V
P
 
P
A
 
P
G
 
G
T
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
L
I
 
I
Y
 
H
G
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
K
D
 
D
R
 
S
V
 
A
G
 
G
A
 
E
Q
 
F
L
 
L
V
 
T
K
 
Q
S
 
H
A
 
P
G
 
G
I
 
I
Q
 
S
A
 
A
V
 
L
G
 
T
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
E
L
 
S
R
 
K
G
 
T
G
 
G
R
 
S
A
 
T
L
 
I
C
 
-
D
 
-
M
 
M
A
 
K
A
 
A
A
 
V
R
 
A
P
 
D
Q
 
G
P
 
V
I
 
K
P
 
E
V
 
V
F
 
S
A
 
F
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
N
P
 
A
I
 
A
I
 
V
L
 
V
M
 
F
P
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
-
K
 
-
L
 
-
R
 
D
G
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
A
A
 
I
K
 
E
D
 
G
L
 
V
A
 
L
G
 
R
S
 
S
V
 
S
T
 
F
V
 
T
G
 
N
V
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
C
|
C
T
 
L
S
 
C
P
 
S
G
 
E
L
 
R
L
 
V
L
 
Y
G
 
V
V
 
H
R
 
R
S
 
S
-
 
I
-
 
F
P
 
D
E
 
E
L
 
F
T
 
V
S
 
S
F
 
G
I
 
L
-
 
K
-
 
V
-
 
E
-
 
A
E
 
E
K
 
R
L
 
L
S
 
V
A
 
V
A
 
G
F
 
Y
-
 
P
-
 
D
-
 
Q
G
 
D
G
 
G
T
 
V
N
 
N
P
 
M
A
 
G
T
 
P
M
 
L
L
 
I
N
 
S
S
 
H
G
 
G
G
 
H
-
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
V
L
 
L
T
 
S
H
 
Y
Y
 
Y
N
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
R
L
 
L
T
 
A
Q
 
V
L
 
D
P
 
E
G
 
G
V
 
A
K
 
T
V
 
V
I
 
V
A
 
T
T
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
V
-
 
P
-
 
K
-
 
F
-
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
R
-
 
D
-
 
Q
-
 
G
S
 
A
Y
 
Y
T
 
V
Q
 
Q
A
 
-
V
 
-
P
 
P
H
 
T
L
 
I
F
 
W
K
 
T
A
 
G
D
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
L
F
 
S
S
 
D
K
 
K
E
 
A
A
 
R
P
 
C
L
 
V
E
 
T
E
 
E
E
|
E
V
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
S
 
V
T
 
C
V
 
H
I
 
I
V
 
S
E
 
P
L
 
F
E
 
D
S
 
D
R
 
E
E
 
D
Q
 
E
L
 
V
L
 
I
D
 
N
F
 
R
A
 
V
A
 
N
K
 
D
M
 
S
N
 
N
G
 
Y
Q
 
G
L
 
L
T
 
A
A
 
C
T
 
A
L
 
I
Q
 
W

Sites not aligning to the query:

P43353 Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1; Aldehyde dehydrogenase 7; EC 1.2.1.28; EC 1.2.1.5; EC 1.2.1.7 from Homo sapiens (Human) (see paper)
23% identity, 71% coverage: 39:416/529 of query aligns to 4:357/468 of P43353

query
sites
P43353
L
 
L
T
 
G
A
 
D
T
 
T
D
 
L
K
 
R
E
 
R
V
 
L
A
 
R
A
 
E
A
 
A
V
 
F
H
 
H
A
 
A
A
 
G
E
 
R
Q
 
T
A
 
R
Y
 
P
P
 
A
L
 
E
Y
 
F
R
 
R
A
 
A
T
 
A
T
 
Q
S
 
L
E
 
Q
Q
 
G
R
 
L
A
 
G
Q
 
R
F
 
F
L
 
L
E
 
Q
A
 
E
I
 
N
A
 
K
D
 
Q
E
 
L
I
 
L
-
 
H
D
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
A
D
 
Q
D
 
D
F
 
-
L
 
L
A
 
H
A
 
K
V
 
S
A
 
A
R
 
F
E
 
E
T
 
S
A
 
E
L
 
V
P
 
S
A
 
E
T
 
V
P
 
A
R
 
I
L
 
S
A
 
Q
G
 
G
E
 
E
R
 
V
A
 
T
R
 
L
T
 
A
S
 
L
G
 
R
Q
 
N
M
 
L
R
 
R
L
 
A
F
 
W
A
 
M
K
 
K
V
 
D
V
 
E
R
 
R
R
 
V
G
 
P
D
 
K
F
 
N
Y
 
L
G
 
A
A
 
T
R
 
Q
I
 
L
D
 
D
T
 
S
A
 
A
L
 
F
P
 
I
Q
 
R
R
 
K
Q
 
E
P
 
P
L
 
F
P
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
I
 
-
R
 
-
Q
 
-
Y
 
-
K
 
-
I
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
G
P
 
L
V
 
V
A
 
L
V
 
I
F
 
I
G
 
A
A
 
P
S
 
W
N
 
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
N
F
 
L
S
 
T
V
 
L
A
 
V
G
 
-
G
 
-
D
 
P
T
 
L
A
 
V
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
C
V
 
V
V
 
V
F
 
L
K
 
K
A
 
P
H
 
S
S
 
E
G
 
I
H
 
S
L
 
K
V
 
N
T
 
V
S
 
E
E
 
K
L
 
I
V
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
V
I
 
L
E
 
P
R
 
Q
A
 
Y
V
 
V
K
 
D
K
 
Q
T
 
S
G
 
C
M
 
F
P
 
A
A
 
V
G
 
-
T
 
-
F
 
-
N
 
-
M
 
V
I
 
L
Y
 
G
G
 
G
D
 
P
R
 
Q
V
 
E
G
 
T
A
 
G
Q
 
Q
L
 
L
V
 
L
K
 
E
S
 
H
A
 
R
G
 
-
I
 
F
Q
 
D
A
 
Y
V
 
I
G
 
F
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
L
 
P
R
 
R
G
 
V
G
 
G
R
 
K
A
 
I
L
 
V
C
 
-
D
 
-
M
 
M
A
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
A
P
 
K
Q
 
H
P
 
L
I
 
T
P
 
P
V
 
V
F
 
T
A
 
L
E
 
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
N
P
 
P
I
 
C
I
 
Y
L
 
V
M
 
D
P
 
D
E
 
N
A
 
C
L
 
-
K
 
-
L
 
-
R
 
D
G
 
P
D
 
Q
A
 
T
I
 
V
A
 
A
K
 
N
D
 
R
L
 
V
A
 
A
G
 
W
S
 
F
V
 
R
T
 
Y
V
 
F
G
 
N
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
T
C
 
C
T
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
D
L
 
Y
L
 
V
L
 
L
G
 
C
V
 
-
R
 
-
S
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
M
T
 
Q
S
 
E
F
 
R
I
 
L
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
L
E
 
Q
K
 
S
L
 
T
S
 
I
A
 
T
A
 
R
F
 
F
G
 
Y
G
 
G
T
 
D
N
 
D
P
 
P
A
 
Q
T
 
S
M
 
S
L
 
P
N
 
N
S
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
I
T
 
I
H
 
N
Y
 
-
N
 
Q
G
 
K
G
 
Q
V
 
F
A
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
R
Q
 
A
L
 
L
P
 
L
G
 
G
V
 
C
K
 
G
V
 
R
I
 
V
A
 
A
T
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
Q
S
 
S
Y
 
-
T
 
D
Q
 
E
A
 
S
V
 
D
P
 
R
H
 
Y
L
 
I
F
 
A
K
 
P
A
 
T
D
 
V
A
 
L
A
 
V
L
 
D
L
 
V
F
 
Q
S
 
E
K
 
M
E
 
E
A
 
P
P
 
V
L
 
M
E
 
Q
E
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
S
 
I
T
 
L
V
 
P
I
 
I
V
 
V
E
 
N
L
 
V
E
 
Q
S
 
S
R
 
L
E
 
D
Q
 
E
L
 
A
L
 
I
D
 
E
F
 
F
A
 
I
A
 
N
K
 
R

Sites not aligning to the query:

4o6rA Crystal structure of a putative aldehyde dehydrogenase from burkholderia cenocepacia
24% identity, 70% coverage: 45:414/529 of query aligns to 42:404/489 of 4o6rA

query
sites
4o6rA
E
 
D
V
 
V
A
 
D
A
 
L
A
 
A
V
 
V
H
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
T
Q
 
R
A
 
A
Y
 
F
P
 
P
L
 
A
Y
 
W
R
 
S
A
 
A
T
 
M
T
 
P
S
 
A
E
 
A
Q
 
E
R
 
R
A
 
G
Q
 
R
F
 
L
L
 
L
E
 
L
A
 
R
I
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
A
I
 
I
D
 
E
A
 
A
L
 
N
G
 
T
D
 
E
D
 
A
F
 
L
L
 
A
A
 
Q
A
 
L
V
 
E
A
 
S
R
 
L
E
 
D
T
 
T
A
 
G
L
 
H
P
 
P
A
 
I
T
 
R
P
 
D
R
 
S
L
 
R
A
 
A
G
 
L
E
 
D
R
 
V
A
 
P
R
 
R
T
 
T
S
 
A
G
 
A
Q
 
C
M
 
F
R
 
R
L
 
Y
F
 
F
A
 
G
K
 
G
V
 
M
V
 
A
R
 
D
R
 
K
G
 
L
D
 
Q
F
 
G
Y
 
S
G
 
V
A
 
I
R
 
P
I
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
G
L
 
F
-
 
L
-
 
N
-
 
Y
P
 
V
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
A
P
 
P
L
 
-
P
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
I
 
-
R
 
-
Q
 
-
Y
 
-
K
 
-
I
 
-
G
 
-
V
 
I
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
G
V
 
Q
F
x
I
G
x
V
A
 
P
S
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
M
F
 
F
S
 
T
V
 
-
A
 
-
G
 
S
G
 
W
D
 
K
T
 
M
A
 
G
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
T
V
 
V
V
 
V
F
 
L
K
|
K
A
 
-
H
 
-
S
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
P
S
 
S
E
 
E
L
 
I
V
 
T
A
 
P
D
 
L
A
 
S
I
 
T
E
 
L
R
 
R
A
 
I
V
 
V
K
 
E
-
 
L
-
 
M
-
 
A
K
 
E
T
 
V
G
 
G
M
 
F
P
 
P
A
 
A
G
 
G
T
 
V
F
 
V
N
 
N
M
 
I
I
 
V
-
 
P
-
 
G
Y
 
Y
G
|
G
D
 
H
R
 
T
V
 
A
G
|
G
A
x
Q
Q
 
R
L
 
L
V
 
A
K
 
E
S
 
H
A
 
P
G
 
G
I
 
V
Q
 
G
A
 
K
V
 
I
G
 
A
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
L
 
T
R
 
A
G
x
T
G
 
G
R
 
R
A
x
R
L
 
I
C
 
V
D
 
E
M
 
A
A
 
S
A
 
Q
A
 
G
R
 
N
P
 
L
Q
 
K
P
 
R
I
 
V
P
 
Q
V
 
L
F
 
-
A
 
-
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
G
P
 
A
I
 
N
I
 
I
L
 
V
M
 
F
P
 
D
E
 
D
A
 
A
L
 
-
K
 
-
L
 
-
R
 
N
G
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
A
A
 
I
K
 
N
D
 
G
L
 
A
A
 
A
G
 
W
S
 
A
V
 
I
T
 
F
V
 
H
G
 
N
V
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
L
 
A
C
|
C
T
 
I
S
 
A
P
 
-
G
 
G
L
 
S
L
 
R
L
 
L
G
 
V
V
 
L
R
 
H
S
 
E
P
 
R
E
 
I
L
 
A
T
 
D
S
 
A
F
 
F
I
 
L
E
 
E
K
 
R
L
 
F
S
 
V
A
 
A
A
 
L
F
 
A
G
 
S
G
 
S
T
 
I
N
 
R
P
 
I
A
 
G
T
 
N
M
 
P
L
 
L
N
 
D
S
 
P
-
 
N
-
 
T
-
 
E
-
 
M
G
 
G
G
 
P
L
 
L
T
 
T
-
 
S
-
 
K
-
 
Q
H
 
H
Y
 
L
N
 
D
G
 
R
G
 
V
V
 
L
A
 
S
R
 
Y
-
 
V
-
 
D
L
 
V
T
 
A
Q
 
R
L
 
E
P
 
Q
G
 
G
V
 
G
K
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
T
T
 
G
G
 
G
G
 
S
T
 
A
S
 
P
Y
 
Q
T
 
D
Q
 
P
A
 
A
V
 
L
P
 
A
H
 
N
L
 
G
F
 
Y
K
 
Y
A
 
V
D
 
R
A
 
P
A
 
T
L
 
I
L
 
V
F
 
E
S
 
A
K
 
K
E
 
H
A
 
A
P
 
T
-
 
D
-
 
R
-
 
V
L
 
A
E
 
Q
E
 
E
E
|
E
V
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
S
 
F
T
 
V
V
 
T
I
 
V
V
 
L
E
 
R
L
 
F
E
 
G
S
 
S
R
 
D
E
 
D
Q
 
E
L
 
A
L
 
L
D
 
A
F
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4yweA Crystal structure of a putative aldehyde dehydrogenase from burkholderia cenocepacia
31% identity, 32% coverage: 162:330/529 of query aligns to 147:305/476 of 4yweA

query
sites
4yweA
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
M
A
 
-
F
 
-
S
 
Q
V
 
I
A
 
F
G
 
G
G
 
R
D
 
S
T
 
V
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
A
V
 
C
V
 
V
F
 
V
K
|
K
-
 
P
-
 
A
-
 
E
-
x
D
A
 
A
H
 
C
S
 
L
G
 
S
H
 
V
L
 
L
V
 
R
T
 
V
S
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
K
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
G
M
 
L
P
 
P
A
 
A
G
 
G
T
 
A
F
 
L
N
 
N
M
 
I
I
 
V
-
 
T
-
 
G
Y
 
Y
G
 
G
D
 
H
R
 
E
V
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
L
 
L
V
 
A
K
 
R
S
 
H
A
 
P
G
 
G
I
 
I
Q
 
D
A
 
H
V
 
I
G
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
L
 
P
R
 
A
G
 
T
G
 
G
R
 
K
A
 
L
L
 
V
C
 
T
D
 
Q
M
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
E
R
 
-
P
 
-
Q
 
N
P
 
H
I
 
V
P
 
P
V
 
V
F
 
T
A
 
L
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
S
P
 
P
I
 
Q
I
 
I
L
 
V
M
 
F
P
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
D
K
 
L
L
 
-
R
 
-
G
 
-
D
 
D
A
 
A
I
 
A
A
 
L
K
 
P
D
 
V
L
 
L
A
 
V
G
 
S
S
 
A
V
 
I
T
 
V
V
 
Q
G
 
N
V
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
T
C
|
C
T
 
S
S
 
A
P
 
G
G
 
S
L
 
R
L
 
V
L
 
L
G
 
-
V
 
I
R
 
E
S
 
R
P
 
A
E
 
V
L
 
Y
T
 
E
S
 
P
F
 
L
I
 
V
E
 
E
K
 
R
L
 
L
S
 
A
A
 
T
A
 
A
F
 
F
G
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6bsnA Structure of proline utilization a (puta) with proline bound in remote sites (see paper)
27% identity, 53% coverage: 151:431/529 of query aligns to 632:909/973 of 6bsnA

query
sites
6bsnA
G
 
G
V
 
R
G
 
G
P
 
V
V
 
F
A
 
V
V
 
A
F
 
I
G
 
S
A
 
P
S
x
W
N
|
N
F
|
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
I
S
 
F
V
 
L
A
 
-
G
 
-
G
 
G
D
 
Q
T
 
V
A
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
M
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
S
V
 
V
V
 
V
F
 
A
K
 
K
-
 
P
A
 
A
H
 
E
S
 
Q
G
 
T
H
 
P
L
 
R
V
 
I
T
 
A
S
 
R
E
 
E
L
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
L
V
 
L
K
 
H
K
 
E
T
 
A
G
 
G
M
 
I
P
 
P
A
 
K
G
 
S
T
 
A
F
 
L
N
 
Y
M
 
L
I
 
V
Y
 
T
G
 
G
D
 
D
-
 
G
R
 
R
V
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
L
 
L
V
 
T
K
 
A
S
 
H
A
 
P
G
 
D
I
 
I
Q
 
A
A
 
G
V
 
V
G
 
V
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
 
S
L
 
T
R
 
E
G
 
V
G
 
A
R
 
R
A
 
S
L
 
I
C
 
N
D
 
R
M
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
K
P
 
D
Q
 
G
P
 
P
I
 
I
-
 
V
P
 
P
V
 
L
F
 
I
A
 
A
E
|
E
M
 
T
S
 
G
S
 
G
I
 
I
N
 
N
P
 
A
I
 
M
I
 
I
L
 
A
M
 
D
P
 
A
E
 
T
A
 
A
L
 
L
K
 
P
L
 
-
R
 
-
G
 
-
D
 
E
A
 
Q
I
 
V
A
 
A
K
 
D
D
 
D
L
 
V
A
 
V
G
 
T
S
 
S
V
 
A
T
 
F
V
 
R
G
 
S
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
x
R
C
x
A
T
x
S
S
 
A
P
 
L
G
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
F
G
 
-
V
 
V
R
 
Q
S
 
E
P
 
D
E
 
V
L
 
A
T
 
D
S
 
R
F
 
M
I
 
I
E
 
E
K
 
M
L
 
V
S
 
A
A
 
G
A
 
A
F
 
A
G
 
R
-
 
E
-
 
L
-
 
K
-
 
I
-
 
G
-
 
D
-
 
P
-
 
S
-
 
D
-
 
V
G
 
A
T
 
T
N
 
H
P
 
V
A
 
G
T
 
P
M
 
V
L
 
I
N
 
D
S
 
V
G
 
E
G
 
A
L
 
K
T
 
Q
H
 
R
Y
 
L
N
 
D
G
 
A
G
 
H
V
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
M
T
 
K
Q
 
T
L
 
E
P
 
A
G
 
R
V
 
L
K
 
H
V
 
-
I
 
F
A
 
A
T
 
G
G
 
P
G
 
A
T
 
P
S
 
E
Y
 
G
T
 
C
Q
 
F
A
 
V
V
 
A
P
 
P
H
 
H
L
 
I
F
 
F
K
 
E
A
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
F
 
L
S
 
T
K
 
E
E
 
A
A
 
G
P
 
Q
L
 
L
E
 
T
E
 
E
E
 
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
S
 
I
T
 
L
V
 
H
I
 
V
V
 
V
E
 
R
L
 
Y
-
 
R
-
 
P
E
 
E
S
 
N
R
 
L
E
 
E
Q
 
R
L
 
V
L
 
L
D
 
R
F
 
A
A
 
I
A
 
E
K
 
R
M
 
T
N
 
G
G
 
Y
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
L
T
 
G
L
 
V
Q
 
H
A
 
S
E
 
R
I
 
I
G
 
D
D
 
D

Sites not aligning to the query:

4neaA 1.90 angstrom resolution crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from staphylococcus aureus in complex with NAD+ and bme-free cys289 (see paper)
27% identity, 51% coverage: 42:310/529 of query aligns to 53:305/505 of 4neaA

query
sites
4neaA
T
 
T
D
 
K
K
 
E
E
 
D
V
 
A
A
 
E
A
 
R
A
 
A
V
 
I
H
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
R
Q
 
R
A
 
A
Y
 
F
P
 
E
L
 
S
-
 
G
-
 
E
Y
 
W
R
 
S
A
 
Q
T
 
E
T
 
T
S
 
A
E
 
E
Q
 
T
R
 
R
A
 
G
Q
 
K
F
 
K
L
 
V
E
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
K
I
 
I
D
 
K
A
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
D
 
E
F
 
H
L
 
R
A
 
E
A
 
A
V
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
L
T
 
E
A
 
T
L
 
L
P
 
D
A
 
T
T
 
G
P
 
K
R
 
T
L
 
L
A
 
E
G
 
E
E
 
S
R
 
Y
A
 
A
R
 
D
T
 
M
S
 
D
G
 
D
Q
 
I
M
 
H
R
 
N
L
 
V
F
 
F
A
 
M
K
 
Y
V
 
F
V
 
A
R
 
G
R
 
L
G
 
A
D
 
D
F
 
K
Y
 
D
G
 
G
A
 
G
R
 
E
-
 
M
I
 
I
D
 
D
T
 
S
A
 
-
L
 
-
P
 
-
Q
 
-
R
 
-
Q
 
-
P
 
P
L
 
I
P
 
P
R
 
D
P
 
T
D
 
E
I
 
S
R
 
K
Q
 
I
Y
 
V
K
 
K
I
 
E
G
 
P
V
 
V
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
T
V
 
Q
F
 
I
G
 
T
A
x
P
S
 
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
L
F
 
-
S
 
-
V
 
Q
A
 
A
G
 
S
G
 
W
D
 
K
T
 
I
A
 
A
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
T
G
 
G
C
 
C
P
 
S
V
 
L
V
 
V
F
 
M
K
|
K
A
 
P
H
 
S
S
x
E
G
 
I
H
 
T
L
 
P
V
 
L
T
 
T
S
 
T
E
 
I
L
 
R
V
 
V
A
 
F
D
 
E
A
 
L
I
 
M
E
 
E
R
 
-
A
 
-
V
 
-
K
 
-
K
 
E
T
 
V
G
 
G
M
 
F
P
 
P
A
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
I
N
 
N
M
 
L
I
 
I
Y
 
L
-
 
G
-
 
A
G
|
G
D
 
S
R
 
E
V
 
V
G
|
G
A
 
D
Q
 
V
L
 
M
V
 
S
K
 
G
S
 
H
A
 
K
G
 
E
I
 
V
Q
 
D
A
 
L
V
 
V
G
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
x
G
L
 
I
R
 
E
G
x
T
G
 
G
R
 
K
A
x
H
L
x
I
C
 
M
D
 
K
M
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
N
R
 
N
P
 
V
Q
 
T
P
 
N
I
 
I
P
 
A
V
 
L
F
 
-
A
 
-
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
N
P
 
P
I
 
N
I
 
I
L
 
I
M
 
F
P
 
D
E
 
D
A
 
A
-
 
D
L
 
F
K
 
E
L
 
L
R
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
A
I
 
V
A
 
D
K
 
Q
D
 
A
L
 
L
A
 
N
G
 
G
S
 
G
V
 
Y
T
 
-
V
 
F
G
 
H
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
C
|
C
T
 
S
S
 
A
P
 
G
G
 
S
L
 
R
L
 
I
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6mvtA Structure of a bacterial aldh16 complexed with nadh (see paper)
26% identity, 62% coverage: 126:453/529 of query aligns to 127:429/751 of 6mvtA

query
sites
6mvtA
Y
 
Y
G
 
A
A
 
Q
R
 
L
I
 
M
D
 
G
T
 
T
A
 
E
L
 
M
P
 
P
Q
 
D
R
 
R
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
P
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
I
 
-
R
 
-
Q
 
-
Y
 
-
K
 
-
I
 
-
G
 
G
V
 
V
-
 
C
G
 
G
P
 
Q
V
|
V
A
x
I
V
 
P
F
 
W
G
 
-
A
 
-
S
 
-
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
L
F
 
-
S
 
-
V
 
M
A
 
L
G
 
A
G
 
W
D
 
K
T
 
I
A
 
A
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
M
G
 
G
C
 
N
P
 
T
V
 
V
V
 
V
F
 
L
K
|
K
A
 
P
H
 
A
S
x
E
G
 
W
H
 
T
L
 
P
V
 
L
T
 
T
S
 
A
E
 
L
L
 
L
V
 
F
A
 
A
D
 
D
A
 
I
I
 
C
E
 
G
R
 
Q
A
 
A
V
 
-
K
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
G
M
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
T
 
V
F
 
V
N
 
N
M
 
I
I
 
V
Y
 
T
G
 
G
D
 
D
R
x
G
V
 
A
G
 
V
A
x
G
Q
x
E
L
 
M
V
 
I
K
 
V
S
 
T
A
 
A
G
 
Q
I
 
V
Q
 
D
A
 
K
V
 
V
G
 
A
F
|
F
T
 
T
G
 
G
S
|
S
L
 
T
R
 
A
G
x
V
G
 
G
R
 
R
A
 
R
L
 
I
C
 
R
D
 
E
M
 
A
A
 
T
A
 
A
A
 
G
R
 
T
P
 
G
Q
 
K
P
 
A
I
 
L
P
 
S
V
 
L
F
 
-
A
 
-
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
G
P
 
P
I
 
Y
I
 
V
L
 
V
M
 
C
P
 
D
E
 
D
A
 
A
L
 
-
K
 
-
L
 
-
R
 
D
G
 
I
D
 
D
A
 
S
I
 
A
A
 
V
K
 
E
D
 
G
L
 
L
A
 
V
G
 
D
S
 
A
V
 
I
T
 
W
V
 
F
G
 
N
V
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
C
|
C
T
 
C
S
 
A
P
 
G
G
 
S
L
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
-
V
 
V
R
 
Q
S
 
E
P
 
G
E
 
I
L
 
A
T
 
D
S
 
V
F
 
F
I
 
H
E
 
A
K
 
K
L
 
L
S
 
R
A
 
A
A
 
R
F
 
M
G
 
D
-
 
S
-
 
L
-
 
R
-
 
I
G
 
G
T
 
D
N
 
P
P
 
L
A
 
D
T
 
K
M
 
C
L
 
I
N
 
D
S
 
I
G
 
G
G
 
A
L
 
M
T
 
V
H
 
H
Y
 
P
N
x
D
G
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
Q
L
 
L
T
 
A
Q
x
R
L
 
V
P
 
R
G
 
D
V
 
M
K
 
V
V
 
A
I
 
A
A
 
N
T
 
T
G
 
D
G
 
G
T
 
E
S
 
V
Y
 
Y
T
 
Q
Q
 
T
A
 
A
V
 
V
P
 
P
H
 
A
L
 
G
F
 
C
K
 
Y
A
 
Y
D
 
P
A
 
P
A
 
T
L
 
L
L
 
I
-
 
S
-
 
G
F
 
L
S
 
A
K
 
P
E
 
A
A
 
S
P
 
P
L
 
L
-
 
M
E
 
Q
E
 
Q
E
 
E
V
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
S
 
V
T
 
L
V
 
V
I
 
S
V
 
T
E
 
T
L
 
F
E
 
R
S
 
T
R
 
P
E
 
A
Q
 
E
L
 
A
L
 
V
D
 
E
F
 
I
A
 
A
A
 
N
K
 
N
M
 
T
N
 
A
G
 
Y
Q
 
G
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
S
L
 
V
Q
 
W
A
 
S
E
 
E
I
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
N
 
N
Q
 
V
D
 
N
L
 
L
I
 
A
A
 
L
I
 
D
L
 
L
E
 
A
Q
 
P
K
 
K
-
 
L
-
 
V
A
 
A
G
 
G
R
 
I
L
 
V
L
 
W
L
 
I
N
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>HSERO_RS00735 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS00735
VSFNILGHNYIGGQRSGQGDVALHSVDATTGALFETPFLTATDKEVAAAVHAAEQAYPLY
RATTSEQRAQFLEAIADEIDALGDDFLAAVARETALPATPRLAGERARTSGQMRLFAKVV
RRGDFYGARIDTALPQRQPLPRPDIRQYKIGVGPVAVFGASNFPLAFSVAGGDTAAALAA
GCPVVFKAHSGHLVTSELVADAIERAVKKTGMPAGTFNMIYGDRVGAQLVKSAGIQAVGF
TGSLRGGRALCDMAAARPQPIPVFAEMSSINPIILMPEALKLRGDAIAKDLAGSVTVGVG
QLCTSPGLLLGVRSPELTSFIEKLSAAFGGTNPATMLNSGGLTHYNGGVARLTQLPGVKV
IATGGTSYTQAVPHLFKADAALLFSKEAPLEEEVFGPSTVIVELESREQLLDFAAKMNGQ
LTATLQAEIGDLQGNQDLIAILEQKAGRLLLNGFPTGVEVCDAMVHGGPYPATSDARGTS
VGSLAIERFLRPVCYQNYPDAMLPAALQNANPLGLMRLVDGEQTRATVG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory