SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing HSERO_RS02925 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS02925 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6d9yB Crystal structure of a short chain dehydrogenase/reductase sdr from burkholderia phymatum with partially occupied NAD
45% identity, 97% coverage: 9:244/244 of query aligns to 6:251/251 of 6d9yB

query
sites
6d9yB
D
 
D
F
 
L
G
 
E
D
 
G
C
 
R
V
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
H
 
A
G
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
I
 
V
S
 
A
A
 
Q
R
 
R
L
 
A
A
 
L
A
 
R
G
 
S
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
V
 
A
V
 
L
W
 
W
D
|
D
Q
x
L
H
 
D
H
 
A
D
 
E
A
 
R
A
 
L
S
 
A
P
 
R
Y
 
S
R
 
E
Q
 
R
Q
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
K
-
 
V
-
 
C
-
 
A
-
 
V
S
 
T
I
x
V
D
|
D
I
x
Q
T
 
T
D
 
K
A
 
E
P
 
A
A
 
Q
V
 
I
M
 
E
Q
 
A
A
 
A
A
 
V
Q
 
G
E
 
K
L
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
A
T
 
F
G
 
G
R
 
A
I
 
I
D
 
D
F
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
 
C
A
|
A
G
 
G
Y
 
I
A
 
T
G
 
G
P
 
G
T
 
N
V
 
G
P
 
T
L
 
T
D
 
W
E
 
E
Y
 
L
D
 
E
V
 
P
G
 
D
E
 
V
W
 
W
H
 
R
R
 
Q
I
 
V
V
 
I
Q
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
I
G
 
G
V
 
P
F
 
Y
H
 
L
A
 
V
C
 
C
R
 
R
S
 
A
V
 
V
T
 
V
P
 
P
A
 
Q
M
 
M
R
 
L
A
 
K
A
 
Q
R
 
G
R
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
L
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
K
E
 
E
G
 
G
T
 
N
P
 
P
N
 
N
A
 
A
S
 
S
A
 
H
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
I
A
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
L
 
L
G
 
G
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
T
S
 
K
G
 
N
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
T
P
|
P
A
|
A
A
|
A
V
x
A
K
 
K
T
|
T
A
 
E
L
 
I
L
 
F
G
 
D
Q
 
S
M
 
M
S
 
K
P
 
Q
A
 
E
H
 
H
V
 
I
Q
 
D
T
 
Y
M
 
M
I
 
L
A
 
S
K
 
K
S
 
I
P
 
P
M
 
M
H
 
N
R
 
R
L
 
F
G
 
L
S
 
L
V
 
P
D
 
D
E
 
E
V
 
A
A
 
A
D
 
S
M
 
L
C
 
I
A
 
L
W
 
W
L
 
L
C
 
G
S
 
S
G
 
E
S
 
D
C
 
C
S
 
A
F
 
F
N
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
S
V
 
V
F
 
F
D
 
D
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
T
Y
 
Y

5h5xC Crystal structure of nadh bound carbonyl reductase from streptomyces coelicolor
40% identity, 92% coverage: 9:233/244 of query aligns to 10:246/257 of 5h5xC

query
sites
5h5xC
D
 
E
F
 
F
G
 
A
D
 
G
C
 
R
V
 
T
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
H
 
A
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
T
S
 
A
A
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
V
W
 
A
D
|
D
Q
x
F
H
 
N
H
 
A
D
 
E
A
 
G
A
 
A
S
 
E
P
 
K
Y
 
A
R
 
A
Q
 
A
Q
 
E
-
 
L
-
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
V
S
 
E
I
x
L
D
|
D
I
 
V
T
 
T
D
 
R
A
 
-
P
 
P
A
 
E
V
 
S
M
 
V
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
V
E
 
G
L
 
F
L
 
A
A
 
V
D
 
D
T
 
T
-
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
F
 
L
L
 
A
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
Y
 
I
A
 
G
G
 
G
P
 
P
T
 
S
V
 
A
P
 
P
L
 
T
D
 
G
E
 
E
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
G
 
A
E
 
A
W
 
Y
H
 
Q
R
 
R
I
 
V
V
 
V
Q
 
R
V
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
H
 
Y
A
 
S
C
 
M
R
 
R
S
 
Y
V
 
E
T
 
L
P
 
P
A
 
A
M
 
I
R
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
G
R
 
K
G
 
G
-
 
G
R
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
V
A
 
A
S
|
S
L
 
I
A
 
L
G
 
G
K
 
S
E
 
V
G
 
G
T
 
F
P
 
A
N
 
G
A
 
S
S
 
P
A
 
A
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
A
L
 
A
G
 
A
K
 
A
E
 
E
L
 
Y
A
 
A
E
 
A
S
 
R
G
 
G
V
 
I
L
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
G
P
|
P
A
x
G
A
 
F
V
x
I
K
 
D
T
|
T
A
 
P
L
 
L
L
 
L
G
 
K
Q
 
T
M
 
M
S
 
E
P
 
E
A
 
A
H
 
A
V
 
Y
Q
 
K
T
 
G
M
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
L
S
 
H
P
 
P
M
 
A
H
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
R
V
 
S
D
 
D
E
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
E
M
 
L
C
 
I
A
 
V
W
 
F
L
 
L
C
 
L
S
 
S
G
 
D
S
 
R
C
 
A
S
 
S
F
 
F
N
 
V
T
 
A
G
 
G
A
 
S

1zemA Crystal structure of NAD+-bound xylitol dehydrogenase (see paper)
33% identity, 95% coverage: 10:240/244 of query aligns to 3:260/260 of 1zemA

query
sites
1zemA
F
 
F
G
 
N
D
 
G
C
 
K
V
 
V
A
 
C
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
H
 
G
G
|
G
G
x
N
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
T
S
 
A
A
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
E
G
 
E
G
 
G
A
 
T
Q
 
A
V
 
I
V
 
A
V
 
L
W
 
L
D
|
D
Q
x
M
H
 
N
H
 
R
D
 
E
A
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
A
A
 
E
S
 
A
P
 
S
Y
 
V
R
 
R
Q
 
E
Q
 
K
S
 
G
I
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
R
-
 
S
-
 
Y
-
 
V
-
 
C
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
S
A
 
E
P
 
E
A
 
A
V
 
V
M
 
I
Q
 
G
A
 
T
A
 
V
Q
 
D
E
 
S
L
 
V
L
 
V
A
 
R
D
 
D
T
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
F
 
F
L
 
L
I
 
F
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
Y
 
Y
A
 
Q
G
 
G
P
 
A
T
 
F
V
 
A
P
 
P
L
 
V
D
 
Q
E
 
D
Y
 
Y
D
 
P
V
 
S
G
 
D
E
 
D
W
 
F
H
 
A
R
 
R
I
 
V
V
 
L
Q
 
T
V
 
I
N
 
N
L
 
V
L
 
T
G
 
G
V
 
A
F
 
F
H
 
H
A
 
V
C
 
L
R
 
K
S
 
A
V
 
V
T
 
S
P
 
R
A
 
Q
M
 
M
R
 
I
A
 
T
A
 
Q
R
 
N
R
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
L
 
M
A
 
A
G
 
G
K
 
V
E
 
K
G
 
G
T
 
P
P
 
P
N
 
N
A
 
M
S
 
A
A
 
A
Y
|
Y
S
 
G
A
 
T
A
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
A
V
 
I
L
 
I
A
 
A
L
 
L
T
 
T
K
 
E
S
 
T
L
 
A
G
 
A
K
 
L
E
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
P
S
 
Y
G
 
N
V
 
I
L
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
S
P
|
P
-
 
G
-
 
Y
-
x
M
-
 
G
-
 
P
-
 
G
-
 
F
-
 
M
-
 
W
-
 
E
-
 
R
-
 
Q
-
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
Q
A
 
A
A
 
K
V
 
V
K
 
G
T
 
S
A
 
Q
L
 
Y
L
 
F
G
 
S
Q
 
T
M
x
D
S
 
P
P
 
K
A
 
V
H
 
V
V
 
A
Q
 
Q
T
 
Q
M
 
M
I
 
I
A
 
G
K
 
S
S
 
V
P
 
P
M
 
M
H
 
R
R
 
R
L
 
Y
G
 
G
S
 
D
V
 
I
D
 
N
E
 
E
V
 
I
A
 
P
D
 
G
M
 
V
C
 
V
A
 
A
W
 
F
L
 
L
C
 
L
S
 
G
G
 
D
S
 
D
C
 
S
S
 
S
F
 
F
N
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
V
V
 
N
F
 
L
D
 
P
L
 
I
S
 
A
G
 
G
G
 
G

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
33% identity, 94% coverage: 12:240/244 of query aligns to 7:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
D
 
D
C
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
H
 
A
G
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
E
I
 
A
S
 
A
A
 
R
R
 
V
L
 
F
A
 
M
A
 
K
G
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
I
W
 
A
D
|
D
Q
x
F
H
 
N
H
 
E
D
 
A
A
 
A
A
 
G
S
 
K
P
 
E
Y
 
A
R
 
V
Q
 
E
Q
 
A
S
 
N
-
 
P
-
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
F
-
 
I
-
 
R
I
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
A
 
R
P
 
E
A
 
S
V
 
V
M
 
H
Q
 
R
A
 
L
A
 
V
Q
 
E
E
 
N
L
 
V
L
 
A
A
 
E
D
 
R
T
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
F
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
Y
x
I
A
 
T
G
 
R
P
x
D
T
 
S
V
 
M
P
 
-
L
 
L
D
 
S
E
x
K
Y
 
M
D
 
T
V
 
V
G
 
D
E
 
Q
W
 
F
H
 
Q
R
 
Q
I
 
V
V
 
I
Q
 
N
V
 
V
N
|
N
L
 
L
L
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
H
 
H
A
 
C
C
 
T
R
 
Q
S
 
A
V
 
V
T
 
L
P
 
P
A
 
Y
M
 
M
R
 
A
A
 
E
A
 
Q
R
 
G
R
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
S
S
|
S
L
 
V
A
 
T
G
 
G
K
 
T
E
 
Y
G
 
G
T
x
N
P
x
V
N
 
G
A
x
Q
S
 
T
A
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
I
A
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
W
G
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
R
S
 
K
G
 
G
V
 
I
L
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
 
G
A
x
F
V
x
T
K
 
E
T
|
T
A
 
A
L
x
M
L
 
V
G
 
A
Q
 
E
M
 
V
S
 
P
P
 
E
A
 
K
H
 
V
V
 
I
Q
 
E
T
x
K
M
 
M
I
 
K
A
 
A
K
 
Q
S
 
V
P
 
P
M
 
M
H
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
K
V
 
P
D
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
D
 
N
M
 
A
C
 
Y
A
 
L
W
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
G
 
H
S
 
E
C
 
S
S
 
D
F
 
Y
N
 
V
T
 
N
G
 
G
A
 
H
V
 
V
F
 
L
D
 
H
L
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G

5vmlA Crystal structure of acetoacetyl-coa reductase from burkholderia pseudomallei 1710b with bound NADP
35% identity, 93% coverage: 14:240/244 of query aligns to 4:241/245 of 5vmlA

query
sites
5vmlA
V
 
I
A
 
A
V
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
H
 
M
G
|
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
T
A
 
S
I
 
I
S
 
C
A
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
H
A
 
K
G
 
D
G
 
G
A
 
F
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
A
-
 
G
-
x
C
-
x
G
-
 
P
-
 
N
-
 
S
-
 
P
-
x
R
-
 
R
-
 
V
-
 
K
W
 
W
-
 
L
-
 
E
D
 
D
Q
 
Q
H
 
K
H
 
A
D
 
L
A
 
G
A
 
F
S
 
D
P
 
F
Y
 
Y
R
 
A
Q
 
S
Q
 
E
S
x
G
I
 
-
D
x
N
I
x
V
T
 
G
D
 
D
A
 
W
P
 
D
A
 
S
V
 
T
M
 
K
Q
 
Q
A
 
A
A
 
F
Q
 
D
E
 
K
L
 
V
L
 
K
A
 
A
D
 
E
T
 
V
G
 
G
R
 
E
I
 
I
D
 
D
F
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
Y
x
I
A
 
T
G
 
R
P
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
-
L
 
F
D
 
R
E
 
K
Y
 
M
D
 
T
V
 
R
G
 
E
E
 
D
W
 
W
H
 
Q
R
 
A
I
 
V
V
 
I
Q
 
D
V
 
T
N
|
N
L
 
L
L
 
T
G
 
S
V
 
L
F
 
F
H
 
N
A
 
V
C
 
T
R
 
K
S
 
Q
V
 
V
T
 
I
P
 
D
A
 
G
M
 
M
R
 
V
A
 
E
A
 
R
R
 
G
R
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
|
S
L
 
V
A
 
N
G
 
G
K
 
Q
E
 
K
G
 
G
T
 
Q
P
 
F
N
 
G
A
 
Q
S
 
T
A
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
T
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
I
L
 
H
A
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
M
S
 
S
L
 
L
G
 
A
K
 
Q
E
 
E
L
 
V
A
 
A
E
 
T
S
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
S
P
|
P
A
x
G
A
 
Y
V
x
I
K
 
G
T
 
T
A
 
D
L
 
M
L
 
V
G
 
K
Q
 
A
M
 
I
S
 
R
P
 
P
A
 
D
H
 
V
V
 
L
Q
 
E
T
 
K
M
 
I
I
 
V
A
 
A
K
 
T
S
 
I
P
 
P
M
 
V
H
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
P
D
 
D
E
 
E
V
 
I
A
 
G
D
 
S
M
 
I
C
 
V
A
 
A
W
 
W
L
 
L
C
 
A
S
 
S
G
 
E
S
 
E
C
 
S
S
 
G
F
 
F
N
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
D
F
 
F
D
 
S
L
 
L
S
 
N
G
 
G
G
 
G

5vt6A Crystal structure of acetoacetyl-coa reductase from burkholderia pseudomallei 1710b complexed with NADP
36% identity, 93% coverage: 14:240/244 of query aligns to 3:241/245 of 5vt6A

query
sites
5vt6A
V
 
V
A
 
A
V
 
F
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
H
 
M
G
|
G
G
|
G
I
x
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
I
S
 
S
A
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
H
A
 
D
G
 
A
G
 
G
A
 
M
Q
 
A
V
 
V
V
 
A
V
 
V
-
 
S
-
x
H
-
x
S
-
 
E
-
 
R
-
x
N
-
 
D
-
 
H
-
 
V
-
 
S
-
 
T
W
 
W
D
 
L
Q
 
M
H
 
H
H
 
E
-
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
G
S
 
R
P
 
D
Y
 
F
R
 
K
Q
 
A
Q
 
Y
S
 
A
I
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
A
D
 
D
A
 
F
P
 
E
A
 
S
V
 
C
M
 
E
Q
 
R
A
 
C
A
 
A
Q
 
E
E
 
K
L
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
V
D
 
D
F
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
Y
x
I
A
 
T
G
 
R
P
 
D
T
 
A
V
 
T
P
 
F
L
 
M
D
 
-
E
 
K
Y
 
M
D
 
T
V
 
K
G
 
G
E
x
D
W
 
W
H
 
D
R
 
A
I
 
V
V
 
M
Q
 
R
V
 
T
N
 
D
L
 
L
L
 
D
G
 
A
V
 
M
F
 
F
H
 
N
A
 
V
C
 
T
R
 
K
S
 
Q
V
 
F
T
 
I
P
 
A
A
 
G
M
 
M
R
 
V
A
 
E
A
 
R
R
 
R
R
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
G
S
|
S
L
 
V
A
 
N
G
 
G
K
 
S
E
 
R
G
 
G
T
 
A
P
 
F
N
 
G
A
 
Q
S
 
A
A
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
I
L
 
H
A
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
L
G
 
A
K
 
L
E
 
E
L
 
T
A
 
A
E
 
K
S
 
R
G
 
G
V
 
I
L
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
S
P
|
P
A
 
G
A
x
Y
V
x
L
K
 
A
T
|
T
A
 
A
L
 
M
L
 
V
G
 
-
Q
 
E
M
 
A
S
 
V
P
 
P
A
 
Q
H
 
D
V
 
V
-
 
L
-
 
E
Q
 
A
T
 
K
M
 
I
I
 
L
A
 
P
K
 
Q
S
 
I
P
 
P
M
 
V
H
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
R
V
 
P
D
 
D
E
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
A
M
 
L
C
 
I
A
 
A
W
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
S
G
 
D
S
 
D
C
 
A
S
 
G
F
 
F
N
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
D
F
 
L
D
 
A
L
 
I
S
 
N
G
 
G
G
 
G

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
34% identity, 93% coverage: 14:240/244 of query aligns to 7:244/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
H
 
G
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
V
S
 
A
A
 
H
R
 
S
L
 
Y
A
 
A
A
 
K
G
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
V
W
 
S
D
|
D
Q
x
I
H
 
N
H
 
E
D
 
D
-
 
H
-
 
G
-
 
N
-
 
K
A
 
A
A
 
V
S
 
E
P
 
D
Y
 
I
R
 
K
Q
 
A
Q
 
Q
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
 
F
-
 
V
S
 
K
I
x
A
D
|
D
I
x
T
T
 
S
D
 
N
A
 
P
P
 
E
A
 
E
V
 
V
M
 
E
Q
 
A
A
 
L
A
 
V
Q
 
K
E
 
R
L
 
T
L
 
V
A
 
E
D
 
I
T
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
F
 
I
L
 
A
I
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
Y
 
I
A
 
G
G
 
G
P
 
E
T
 
Q
V
 
A
P
 
L
L
 
A
D
 
G
E
 
D
Y
 
Y
D
 
G
V
 
L
G
 
D
E
 
S
W
 
W
H
 
R
R
 
K
I
 
V
V
 
L
Q
 
S
V
 
I
N
 
N
L
 
L
L
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
H
 
Y
A
 
G
C
 
C
R
 
K
S
 
Y
V
 
E
T
 
L
P
 
E
A
 
Q
M
 
M
R
 
E
A
 
K
A
 
N
R
 
G
R
 
G
G
 
G
R
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
M
A
 
A
S
|
S
L
 
I
A
 
H
G
 
G
K
 
I
E
 
V
G
 
A
T
 
A
P
 
P
N
 
L
A
 
S
S
 
S
A
 
A
Y
|
Y
S
 
T
A
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
A
V
 
V
L
 
V
A
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
N
L
 
I
G
 
G
K
 
A
E
 
E
L
 
Y
A
 
G
E
 
Q
S
 
K
G
 
N
V
 
I
L
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
G
P
|
P
A
|
A
A
x
Y
V
x
I
K
 
E
T
 
T
A
 
P
L
|
L
L
 
L
G
 
E
Q
 
S
M
 
L
S
 
T
P
 
K
A
 
E
H
 
M
V
 
K
Q
 
E
T
 
A
M
 
L
I
 
I
A
 
S
K
 
K
S
 
H
P
 
P
M
 
M
H
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
K
V
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
E
M
 
L
C
 
V
A
 
L
W
 
F
L
 
L
C
 
S
S
 
S
G
 
E
S
 
K
C
 
S
S
 
S
F
 
F
N
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
G
V
 
Y
F
 
Y
D
 
L
L
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G

4k6fB X-ray crystal structure of a putative acetoacetyl-coa reductase from burkholderia cenocepacia bound to the co-factor NADP
35% identity, 93% coverage: 14:241/244 of query aligns to 3:242/245 of 4k6fB

query
sites
4k6fB
V
 
I
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
H
 
M
G
 
G
G
|
G
I
 
L
G
 
G
A
 
E
A
 
A
I
 
V
S
 
S
A
 
I
R
 
R
L
 
L
A
 
N
A
 
D
G
 
A
G
 
G
A
 
H
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
V
-
 
T
-
x
Y
-
x
S
-
 
P
-
 
N
-
x
N
-
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
D
-
 
R
W
 
W
-
 
L
D
 
T
Q
 
E
H
 
M
H
 
H
D
 
A
A
 
A
A
 
G
S
 
R
P
 
E
Y
 
F
R
 
H
Q
 
A
Q
 
Y
S
 
P
I
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
A
D
 
D
A
 
H
P
 
D
A
 
S
V
 
C
M
 
Q
Q
 
Q
A
 
C
A
 
I
Q
 
E
E
 
K
L
 
I
L
 
V
A
 
R
D
 
D
T
 
V
G
 
G
R
 
P
I
 
V
D
 
D
F
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
Y
x
I
A
 
T
G
 
-
P
 
R
T
 
D
V
 
M
P
 
T
L
 
L
D
 
R
E
 
K
Y
 
L
D
 
D
V
 
K
G
 
V
E
x
N
W
 
W
H
 
D
R
 
A
I
 
V
V
 
I
Q
 
R
V
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
D
G
 
S
V
 
V
F
 
F
H
 
N
A
 
M
C
 
T
R
 
K
S
 
P
V
 
V
T
 
C
P
 
D
A
 
G
M
 
M
R
 
V
A
 
E
A
 
R
R
 
G
R
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
|
S
L
 
V
A
 
N
G
 
G
K
 
S
E
 
K
G
 
G
T
 
S
P
 
V
N
 
G
A
 
Q
S
 
T
A
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
M
L
 
H
A
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
S
 
S
L
 
L
G
 
A
K
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
R
S
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
S
P
 
P
A
 
G
A
 
Y
V
 
L
K
 
A
T
 
T
A
 
K
L
 
M
L
 
V
G
 
T
Q
 
A
M
 
I
S
 
P
P
 
Q
A
 
D
H
 
I
V
 
L
Q
 
D
T
 
T
M
 
K
I
 
I
-
 
L
A
 
P
K
 
Q
S
 
I
P
 
P
M
 
A
H
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
K
V
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
A
M
 
L
C
 
V
A
 
A
W
 
Y
L
 
L
C
 
C
S
 
S
G
 
E
S
 
E
C
 
A
S
 
G
F
 
F
N
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
V
 
N
F
 
I
D
 
A
L
 
I
S
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
Q

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
33% identity, 95% coverage: 9:240/244 of query aligns to 1:239/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
D
 
N
F
 
F
G
 
E
D
 
G
C
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
H
x
S
G
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
I
 
I
S
 
A
A
 
E
R
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
V
x
T
W
 
S
D
 
E
Q
 
N
H
 
G
H
 
A
D
 
Q
A
 
A
A
 
I
S
 
S
P
 
D
Y
 
Y
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
G
R
 
K
Q
 
G
Q
 
L
S
 
M
I
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
A
 
P
P
 
A
A
 
S
V
 
I
M
 
E
Q
 
S
A
 
V
A
 
L
Q
 
E
E
 
K
L
 
I
L
 
R
A
 
A
D
 
E
T
 
F
G
 
G
R
 
E
I
 
V
D
 
D
F
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
Y
x
I
A
 
T
G
 
R
P
 
D
T
 
N
V
 
L
P
 
L
L
 
M
D
 
R
E
 
M
Y
 
K
D
 
D
V
 
E
G
 
-
E
|
E
W
 
W
H
 
N
R
 
D
I
 
I
V
 
I
Q
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
H
 
R
A
 
L
C
 
S
R
 
K
S
 
A
V
 
V
T
 
M
P
 
R
A
 
A
M
 
M
R
 
M
A
 
K
A
 
K
R
 
R
R
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
|
S
L
 
V
A
 
V
G
 
G
K
 
T
E
 
M
G
 
G
T
 
N
P
 
G
N
 
G
A
x
Q
S
 
A
A
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
I
A
 
G
L
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
S
L
 
L
G
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
E
 
S
S
 
R
G
 
G
V
 
I
L
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
A
 
F
V
x
I
K
 
E
T
 
T
A
 
D
L
 
M
L
 
T
G
 
R
Q
 
A
M
 
L
S
 
S
P
 
D
A
 
D
H
 
Q
V
 
R
Q
 
A
T
 
G
M
 
I
I
 
L
A
 
A
K
 
Q
S
 
V
P
 
P
M
 
A
H
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
A
D
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
N
M
 
A
C
 
V
A
 
A
W
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
G
 
D
S
 
E
C
 
A
S
 
A
F
 
Y
N
 
I
T
 
T
G
 
G
A
x
E
V
x
T
F
 
L
D
 
H
L
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
33% identity, 95% coverage: 9:240/244 of query aligns to 2:240/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
D
 
N
F
 
F
G
 
E
D
 
G
C
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
x
A
H
x
S
G
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
I
 
I
S
 
A
A
 
E
R
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
V
x
T
W
 
S
D
 
E
Q
 
N
H
 
G
H
 
A
D
 
Q
A
 
A
A
 
I
S
 
S
P
 
D
Y
 
Y
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
G
R
 
K
Q
 
G
Q
 
L
S
 
M
I
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
A
 
P
P
 
A
A
 
S
V
 
I
M
 
E
Q
 
S
A
 
V
A
 
L
Q
 
E
E
 
K
L
 
I
L
 
R
A
 
A
D
 
E
T
 
F
G
 
G
R
 
E
I
 
V
D
 
D
F
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
A
 
T
G
 
R
P
 
D
T
 
N
V
 
L
P
 
L
L
 
M
D
 
R
E
 
M
Y
 
K
D
 
D
V
 
E
G
 
-
E
 
E
W
 
W
H
 
N
R
 
D
I
 
I
V
 
I
Q
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
H
 
R
A
 
L
C
 
S
R
 
K
S
 
A
V
 
V
T
 
M
P
 
R
A
 
A
M
 
M
R
 
M
A
 
K
A
 
K
R
 
R
R
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
S
L
 
V
A
 
V
G
 
G
K
 
T
E
 
M
G
 
G
T
 
N
P
 
G
N
 
G
A
 
Q
S
 
A
A
 
N
Y
|
Y
S
x
A
A
|
A
A
|
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
I
A
 
G
L
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
S
L
 
L
G
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
E
 
S
S
 
R
G
 
G
V
 
I
L
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
G
A
 
F
V
x
I
K
 
E
T
 
T
A
 
D
L
 
M
L
 
T
G
 
R
Q
 
A
M
 
L
S
 
S
P
 
D
A
 
D
H
 
Q
V
 
R
Q
 
A
T
 
G
M
 
I
I
 
L
A
 
A
K
 
Q
S
 
V
P
 
P
M
 
A
H
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
A
D
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
N
M
 
A
C
 
V
A
 
A
W
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
G
 
D
S
 
E
C
 
A
S
 
A
F
 
Y
N
 
I
T
 
T
G
 
G
A
x
E
V
 
T
F
 
L
D
 
H
L
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G

P14697 Acetoacetyl-CoA reductase; EC 1.1.1.36 from Cupriavidus necator (strain ATCC 17699 / DSM 428 / KCTC 22496 / NCIMB 10442 / H16 / Stanier 337) (Ralstonia eutropha) (see 2 papers)
34% identity, 93% coverage: 14:240/244 of query aligns to 5:242/246 of P14697

query
sites
P14697
V
 
I
A
 
A
V
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
M
G
|
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
C
A
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
K
G
 
D
G
 
G
A
 
F
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
A
-
 
G
-
 
C
-
x
G
-
 
P
-
 
N
-
 
S
-
 
P
-
x
R
-
 
R
-
 
E
-
 
K
W
 
W
-
 
L
D
 
E
Q
|
Q
H
 
Q
H
 
K
D
 
A
A
 
L
A
 
G
S
 
F
P
 
D
Y
 
F
R
 
I
Q
 
A
Q
 
S
S
 
E
I
x
G
D
x
N
I
x
V
T
 
A
D
 
D
A
 
W
P
 
D
A
 
S
V
 
T
M
 
K
Q
 
T
A
 
A
A
 
F
Q
 
D
E
 
K
L
 
V
L
 
K
A
 
S
D
 
E
T
 
V
G
 
G
R
 
E
I
 
V
D
 
D
F
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
Y
x
I
A
x
T
G
 
R
P
x
D
T
 
V
V
 
V
P
 
-
L
 
F
D
 
R
E
x
K
Y
 
M
D
 
T
V
 
R
G
 
A
E
 
D
W
 
W
H
 
D
R
 
A
I
 
V
V
 
I
Q
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
T
G
 
S
V
 
L
F
 
F
H
 
N
A
 
V
C
 
T
R
 
K
S
 
Q
V
 
V
T
 
I
P
 
D
A
 
G
M
 
M
R
 
A
A
 
D
A
 
R
R
 
G
R
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
 
S
L
 
V
A
 
N
G
 
G
K
 
Q
E
 
K
G
 
G
T
x
Q
P
x
F
N
 
G
A
x
Q
S
 
T
A
 
N
Y
 
Y
S
 
S
A
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
H
A
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
M
S
 
A
L
 
L
G
 
A
K
 
Q
E
 
E
L
 
V
A
 
A
E
x
T
S
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
S
P
|
P
A
x
G
A
x
Y
V
x
I
K
 
A
T
 
T
A
 
D
L
 
M
L
 
V
G
 
K
Q
 
A
M
 
I
S
x
R
P
 
Q
A
 
D
H
 
V
V
 
L
Q
 
D
T
 
K
M
 
I
I
 
V
A
 
A
K
 
T
S
 
I
P
 
P
M
 
V
H
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
L
V
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
S
M
 
I
C
 
C
A
 
A
W
 
W
L
 
L
C
 
S
S
 
S
G
 
E
S
 
E
C
 
S
S
 
G
F
 
F
N
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
D
F
 
F
D
 
S
L
 
L
S
 
N
G
 
G
G
 
G

3vzsB Crystal structure of phab from ralstonia eutropha in complex with acetoacetyl-coa and NADP (see paper)
34% identity, 93% coverage: 14:240/244 of query aligns to 8:245/249 of 3vzsB

query
sites
3vzsB
V
 
I
A
 
A
V
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
H
 
M
G
 
G
G
 
G
I
|
I
G
 
G
A
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
C
A
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
K
G
 
D
G
 
G
A
 
F
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
A
-
 
G
-
 
C
-
x
G
-
 
P
-
 
N
-
 
S
-
 
P
-
x
R
-
 
R
-
 
E
-
 
K
W
 
W
-
 
L
D
 
E
Q
 
Q
H
 
Q
H
 
K
D
 
A
A
 
L
A
 
G
S
 
F
P
 
D
Y
 
F
R
 
I
Q
 
A
Q
 
S
S
 
E
I
x
G
D
x
N
I
x
V
T
 
A
D
 
D
A
 
W
P
 
D
A
 
S
V
 
T
M
 
K
Q
 
T
A
 
A
A
 
F
Q
 
D
E
 
K
L
 
V
L
 
K
A
 
S
D
 
E
T
 
V
G
 
G
R
 
E
I
 
V
D
 
D
F
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
Y
x
I
A
x
T
G
 
R
P
x
D
T
 
V
V
 
V
P
 
-
L
 
F
D
 
R
E
 
K
Y
 
M
D
 
T
V
 
R
G
 
A
E
 
D
W
 
W
H
 
D
R
 
A
I
 
V
V
 
I
Q
 
D
V
 
T
N
|
N
L
 
L
L
 
T
G
 
S
V
 
L
F
 
F
H
 
N
A
 
V
C
 
T
R
 
K
S
 
Q
V
 
V
T
 
I
P
 
D
A
 
G
M
 
M
R
 
A
A
 
D
A
 
R
R
 
G
R
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
|
S
L
 
V
A
 
N
G
 
G
K
 
Q
E
 
K
G
 
G
T
x
Q
P
x
F
N
 
G
A
x
Q
S
 
T
A
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
T
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
H
A
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
M
S
 
A
L
 
L
G
 
A
K
 
Q
E
 
E
L
 
V
A
 
A
E
 
T
S
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
S
P
|
P
A
x
G
A
x
Y
V
x
I
K
 
A
T
 
T
A
 
D
L
x
M
L
x
V
G
 
K
Q
 
A
M
 
I
S
x
R
P
 
Q
A
 
D
H
 
V
V
 
L
Q
 
D
T
 
K
M
 
I
I
 
V
A
 
A
K
 
T
S
 
I
P
 
P
M
 
V
H
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
L
V
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
S
M
 
I
C
 
C
A
 
A
W
 
W
L
 
L
C
 
S
S
 
S
G
 
E
S
 
E
C
 
S
S
 
G
F
 
F
N
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
D
F
 
F
D
 
S
L
 
L
S
 
N
G
 
G
G
 
G

1q7cA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase y151f mutant in complex with NADPH fragment (see paper)
33% identity, 95% coverage: 9:240/244 of query aligns to 1:239/243 of 1q7cA

query
sites
1q7cA
D
 
N
F
 
F
G
 
E
D
 
G
C
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
H
x
S
G
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
I
 
I
S
 
A
A
 
E
R
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
I
-
 
G
-
 
T
-
x
A
V
x
T
W
 
S
D
 
E
Q
 
N
H
 
G
H
 
A
D
 
Q
A
 
A
A
 
I
S
 
S
P
 
D
Y
 
Y
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
G
R
 
K
Q
 
G
Q
 
L
S
 
M
I
x
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
A
 
P
P
 
A
A
 
S
V
 
I
M
 
E
Q
 
S
A
 
V
A
 
L
Q
 
E
E
 
K
L
 
I
L
 
R
A
 
A
D
 
E
T
 
F
G
 
G
R
 
E
I
 
V
D
 
D
F
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
Y
x
I
A
 
T
G
 
R
P
 
D
T
 
N
V
 
L
P
 
L
L
 
M
D
 
R
E
 
M
Y
 
K
D
 
D
V
 
E
G
 
-
E
 
E
W
 
W
H
 
N
R
 
D
I
 
I
V
 
I
Q
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
H
 
R
A
 
L
C
 
S
R
 
K
S
 
A
V
 
V
T
 
M
P
 
R
A
 
A
M
 
M
R
 
M
A
 
K
A
 
K
R
 
R
R
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
|
S
L
 
V
A
 
V
G
 
G
K
 
T
E
 
M
G
 
G
T
 
N
P
 
G
N
 
G
A
x
Q
S
 
A
A
 
N
Y
x
F
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
I
A
 
G
L
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
S
L
 
L
G
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
E
 
S
S
 
R
G
 
G
V
 
I
L
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
G
A
 
F
V
 
I
K
 
E
T
 
T
A
 
D
L
 
M
L
 
T
G
 
R
Q
 
A
M
 
L
S
 
S
P
 
D
A
 
D
H
 
Q
V
 
R
Q
 
A
T
 
G
M
 
I
I
 
L
A
 
A
K
 
Q
S
 
V
P
 
P
M
 
A
H
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
A
D
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
N
M
 
A
C
 
V
A
 
A
W
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
G
 
D
S
 
E
C
 
A
S
 
A
F
 
Y
N
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
V
 
T
F
 
L
D
 
H
L
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
33% identity, 95% coverage: 10:240/244 of query aligns to 3:240/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
F
 
F
G
 
E
D
 
G
C
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
H
x
S
G
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
I
 
I
S
 
A
A
 
E
R
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
G
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
V
x
T
W
 
S
D
 
E
Q
 
S
H
 
G
H
 
A
D
 
Q
A
 
A
A
 
I
S
 
S
P
 
D
Y
 
Y
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
G
R
 
K
Q
 
G
Q
 
L
S
 
M
I
x
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
A
 
P
P
 
A
A
 
S
V
 
I
M
 
E
Q
 
S
A
 
V
A
 
L
Q
 
E
E
 
N
L
 
V
L
 
R
A
 
A
D
 
E
T
 
F
G
 
G
R
 
E
I
 
V
D
 
D
F
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
Y
x
I
A
 
T
G
 
R
P
 
D
T
 
N
V
 
L
P
 
L
L
 
M
D
 
R
E
 
M
Y
 
K
D
 
D
V
 
-
G
 
D
E
 
E
W
 
W
H
 
N
R
 
D
I
 
I
V
 
I
Q
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
H
 
R
A
 
L
C
 
S
R
 
K
S
 
A
V
 
V
T
 
M
P
 
R
A
 
A
M
 
M
R
 
M
A
 
K
A
 
K
R
 
R
R
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
|
S
L
 
V
A
 
V
G
 
G
K
 
T
E
 
M
G
 
G
T
 
N
P
 
A
N
 
G
A
 
Q
S
 
A
A
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
I
A
 
G
L
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
S
L
 
L
G
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
E
 
S
S
 
R
G
 
G
V
 
I
L
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
G
A
 
F
V
 
I
K
 
E
T
 
T
A
 
D
L
 
M
L
 
T
G
 
R
Q
 
A
M
 
L
S
 
T
P
 
D
A
 
E
H
 
Q
V
 
R
Q
 
A
T
 
G
M
 
T
I
 
L
A
 
A
K
 
A
S
 
V
P
 
P
M
 
A
H
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
T
V
 
P
D
 
N
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
S
M
 
A
C
 
V
A
 
A
W
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
G
 
D
S
 
E
C
 
A
S
 
S
F
 
Y
N
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
V
 
T
F
 
L
D
 
H
L
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
33% identity, 95% coverage: 10:240/244 of query aligns to 3:240/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
F
 
F
G
 
E
D
 
G
C
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
H
 
S
G
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
I
 
I
S
 
A
A
 
E
R
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
G
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
G
W
 
T
D
 
A
Q
 
T
H
 
S
H
 
E
D
 
N
A
 
G
A
 
A
-
 
K
-
 
N
-
 
I
S
 
S
P
 
D
Y
 
Y
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
G
R
 
K
Q
 
G
Q
 
L
S
 
M
I
 
L
D
 
N
I
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
P
P
 
A
A
 
S
V
 
I
M
 
E
Q
 
S
A
 
V
A
 
L
Q
 
E
E
 
N
L
 
I
L
 
R
A
 
A
D
 
E
T
 
F
G
 
G
R
 
E
I
 
V
D
 
D
F
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
A
 
T
G
 
R
P
 
D
T
 
N
V
 
L
P
 
L
L
 
M
D
 
R
E
 
M
Y
 
K
D
 
D
V
 
-
G
 
D
E
 
E
W
 
W
H
 
N
R
 
D
I
 
I
V
 
I
Q
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
H
 
R
A
 
L
C
 
S
R
 
K
S
 
A
V
 
V
T
 
M
P
 
R
A
 
A
M
|
M
R
 
M
A
 
K
A
 
K
R
 
R
R
 
C
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
S
L
 
V
A
 
V
G
 
G
K
 
T
E
 
M
G
 
G
T
 
N
P
 
A
N
 
G
A
 
Q
S
 
A
A
 
N
Y
 
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
I
A
 
G
L
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
S
L
 
L
G
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
E
 
S
S
 
R
G
 
G
V
 
I
L
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
G
A
 
F
V
 
I
K
 
E
T
 
T
A
 
D
L
 
M
L
 
T
G
 
R
Q
 
A
M
 
L
S
 
S
P
 
D
A
 
D
H
 
Q
V
 
R
Q
 
A
T
 
G
M
 
I
I
 
L
A
 
A
K
 
Q
S
 
V
P
 
P
M
 
A
H
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
A
D
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
S
M
 
A
C
 
V
A
 
A
W
 
F
L
 
L
C
x
A
S
|
S
G
 
D
S
 
E
C
 
A
S
 
S
F
 
Y
N
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
V
 
T
F
 
L
D
 
H
L
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G

4urfB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
35% identity, 93% coverage: 15:240/244 of query aligns to 8:244/248 of 4urfB

query
sites
4urfB
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
H
x
G
G
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
T
I
 
I
S
 
A
A
 
L
R
 
T
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
W
 
S
D
|
D
-
x
I
-
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
W
-
 
G
-
 
R
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
I
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
F
Q
 
Q
H
 
H
H
 
A
D
|
D
A
x
T
A
 
A
S
 
H
P
 
P
Y
 
-
R
 
-
Q
 
-
Q
 
-
S
 
-
I
 
-
D
 
-
I
 
-
T
 
E
D
 
D
A
 
H
P
 
D
A
 
E
V
 
L
M
 
I
Q
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
E
 
R
L
 
A
L
 
F
A
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
F
 
I
L
 
A
I
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
Y
x
I
A
 
S
G
|
G
P
 
E
T
 
F
V
 
T
P
 
P
L
 
T
D
 
A
E
 
E
Y
 
T
D
 
T
V
 
D
G
 
A
E
 
Q
W
 
W
H
 
Q
R
|
R
I
 
V
V
 
I
Q
 
G
V
 
I
N
 
N
L
 
L
L
 
S
G
 
G
V
 
V
F
 
F
H
 
Y
A
 
G
C
 
V
R
 
R
S
 
A
V
 
Q
T
 
I
P
 
R
A
 
A
M
 
M
R
 
L
A
 
E
A
 
T
R
 
G
R
 
G
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
L
 
I
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
E
 
I
G
 
G
T
 
I
P
 
E
N
 
G
A
x
I
S
 
T
A
 
P
Y
|
Y
S
 
T
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
V
G
 
A
K
 
W
E
 
E
L
 
Y
A
 
G
E
 
S
S
 
K
G
 
G
V
 
I
L
x
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
I
 
V
A
 
G
P
|
P
A
|
A
A
 
F
V
x
I
K
 
N
T
|
T
A
 
T
L
 
L
L
 
V
G
 
-
Q
 
Q
M
 
N
S
 
V
P
 
P
A
 
L
H
 
E
V
 
T
Q
 
R
T
 
R
M
 
Q
I
 
L
A
 
E
K
 
Q
-
 
M
S
 
H
P
 
A
M
x
L
H
x
R
R
|
R
L
 
L
G
 
G
S
 
E
V
 
T
D
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
N
M
 
L
C
 
V
A
 
A
W
 
W
L
 
L
C
 
S
S
|
S
G
 
D
S
 
K
C
 
A
S
 
S
F
 
F
N
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
V
 
Y
F
 
Y
D
 
A
L
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G

4urfA Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
35% identity, 93% coverage: 15:240/244 of query aligns to 8:244/248 of 4urfA

query
sites
4urfA
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
H
x
G
G
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
T
I
 
I
S
 
A
A
 
L
R
 
T
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
W
 
S
D
|
D
-
x
I
-
 
S
-
 
D
-
 
E
-
x
W
-
 
G
-
 
R
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
I
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
F
Q
 
Q
H
 
H
H
 
A
D
|
D
A
x
T
A
 
A
S
 
H
P
 
P
Y
 
-
R
 
-
Q
 
-
Q
 
-
S
 
-
I
 
-
D
 
-
I
 
-
T
 
E
D
 
D
A
 
H
P
 
D
A
 
E
V
 
L
M
 
I
Q
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
E
 
R
L
 
A
L
 
F
A
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
F
 
I
L
 
A
I
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
Y
x
I
A
x
S
G
|
G
P
x
E
T
 
F
V
x
T
P
 
P
L
 
T
D
 
A
E
|
E
Y
 
T
D
x
T
V
 
D
G
 
A
E
x
Q
W
 
W
H
 
Q
R
|
R
I
 
V
V
 
I
Q
 
G
V
 
I
N
 
N
L
 
L
L
 
S
G
 
G
V
 
V
F
 
F
H
 
Y
A
 
G
C
 
V
R
 
R
S
 
A
V
 
Q
T
 
I
P
 
R
A
 
A
M
 
M
R
 
L
A
 
E
A
 
T
R
 
G
R
 
G
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
L
 
I
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
E
 
I
G
 
G
T
 
I
P
 
E
N
 
G
A
x
I
S
 
T
A
 
P
Y
|
Y
S
 
T
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
V
G
 
A
K
 
W
E
 
E
L
 
Y
A
 
G
E
x
S
S
 
K
G
|