SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing HSERO_RS05240 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS05240 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4gvxA Crystal structure of a short chain dehydrogenase homolog (target efi- 505321) from burkholderia multivorans, with bound NADP and l-fucose
77% identity, 100% coverage: 1:257/258 of query aligns to 1:257/258 of 4gvxA

query
sites
4gvxA
L
 
M
D
 
D
L
 
L
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
G
A
 
A
I
 
I
S
 
S
L
 
M
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
R
A
 
A
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
A
R
|
R
S
x
H
A
 
A
P
 
P
E
 
D
S
 
G
Q
 
A
F
 
F
W
 
L
E
 
D
R
 
A
L
 
L
T
 
A
A
 
Q
V
 
R
Q
 
Q
P
 
P
R
 
R
A
 
A
A
 
T
L
 
Y
F
 
L
Q
 
P
L
 
V
E
|
E
L
|
L
Q
 
Q
D
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
Q
C
 
C
R
 
R
E
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
Q
T
 
T
I
 
I
E
 
A
R
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
|
N
D
 
D
S
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
R
D
 
D
E
 
A
F
 
F
V
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
R
 
R
N
 
N
L
 
L
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
Y
V
 
A
M
 
M
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
C
 
C
V
 
V
P
 
P
H
 
H
L
 
L
K
 
K
A
 
A
T
 
T
R
 
R
G
 
G
A
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
I
S
|
S
S
|
S
K
|
K
T
 
T
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
|
Q
G
 
G
N
 
N
T
|
T
S
 
S
G
 
G
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
R
E
 
E
W
 
W
A
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
R
D
 
E
D
 
H
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
I
 
I
P
|
P
A
|
A
E
|
E
V
|
V
M
 
M
T
|
T
P
 
P
L
|
L
Y
|
Y
E
 
R
K
 
N
W
|
W
I
 
I
A
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
E
H
 
D
P
 
P
Q
 
E
E
 
A
K
 
K
L
 
L
D
 
A
A
 
E
I
 
I
T
 
A
S
 
A
K
 
K
I
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
K
 
R
R
 
R
F
 
F
T
 
T
T
 
T
S
 
P
E
 
D
E
 
E
M
 
I
A
 
A
D
 
D
M
 
T
A
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
P
R
 
R
S
 
A
S
 
S
H
 
H
T
 
T
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
I
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
H
 
H
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L

4gloA Crystal structure of a short chain dehydrogenase homolog (target efi- 505321) from burkholderia multivorans, with bound NAD
77% identity, 100% coverage: 1:257/258 of query aligns to 1:257/258 of 4gloA

query
sites
4gloA
L
 
M
D
 
D
L
 
L
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
G
A
 
A
I
 
I
S
 
S
L
 
M
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
R
A
 
A
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
V
F
 
F
A
|
A
R
|
R
S
 
H
A
 
A
P
 
P
E
 
D
S
 
G
Q
 
A
F
 
F
W
 
L
E
 
D
R
 
A
L
 
L
T
 
A
A
 
Q
V
 
R
Q
 
Q
P
 
P
R
 
R
A
 
A
A
 
T
L
 
Y
F
 
L
Q
 
P
L
x
V
E
|
E
L
|
L
Q
 
Q
D
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
Q
C
 
C
R
 
R
E
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
Q
T
 
T
I
 
I
E
 
A
R
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
V
N
 
N
D
 
D
S
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
R
D
 
D
E
 
A
F
 
F
V
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
R
 
R
N
 
N
L
 
L
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
Y
V
 
A
M
 
M
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
C
 
C
V
 
V
P
 
P
H
 
H
L
 
L
K
 
K
A
 
A
T
 
T
R
 
R
G
 
G
A
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
I
S
|
S
S
|
S
K
 
K
T
 
T
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
N
 
N
T
|
T
S
 
S
G
 
G
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
R
E
 
E
W
 
W
A
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
R
D
 
E
D
 
H
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
I
 
I
P
|
P
A
 
A
E
 
E
V
|
V
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
|
L
Y
 
Y
E
 
R
K
 
N
W
 
W
I
 
I
A
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
E
H
 
D
P
 
P
Q
 
E
E
 
A
K
 
K
L
 
L
D
 
A
A
 
E
I
 
I
T
 
A
S
 
A
K
 
K
I
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
K
 
R
R
 
R
F
 
F
T
 
T
T
 
T
S
 
P
E
 
D
E
 
E
M
 
I
A
 
A
D
 
D
M
 
T
A
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
P
R
 
R
S
 
A
S
 
S
H
 
H
T
 
T
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
I
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
H
 
H
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L

4gkbB Crystal structure of a short chain dehydrogenase homolog (target efi- 505321) from burkholderia multivorans, unliganded structure
77% identity, 100% coverage: 1:257/258 of query aligns to 1:257/258 of 4gkbB

query
sites
4gkbB
L
 
M
D
 
D
L
 
L
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
G
A
 
A
I
 
I
S
 
S
L
 
M
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
R
A
 
A
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
A
R
 
R
S
 
H
A
 
A
P
 
P
E
 
D
S
 
G
Q
 
A
F
 
F
W
 
L
E
 
D
R
 
A
L
 
L
T
 
A
A
 
Q
V
 
R
Q
 
Q
P
 
P
R
 
R
A
 
A
A
 
T
L
 
Y
F
 
L
Q
 
P
L
 
V
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
Q
C
 
C
R
 
R
E
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
Q
T
 
T
I
 
I
E
 
A
R
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
N
D
 
D
S
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
R
D
 
D
E
 
A
F
 
F
V
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
R
 
R
N
 
N
L
 
L
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
Y
V
 
A
M
 
M
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
C
 
C
V
 
V
P
 
P
H
 
H
L
 
L
K
 
K
A
 
A
T
 
T
R
 
R
G
 
G
A
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
V
 
I
S
 
S
S
|
S
K
 
K
T
 
T
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
N
 
N
T
|
T
S
 
S
G
 
G
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
R
E
 
E
W
 
W
A
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
R
D
 
E
D
 
H
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
I
 
I
P
 
P
A
 
A
E
 
E
V
 
V
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
R
K
 
N
W
|
W
I
 
I
A
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
E
H
 
D
P
 
P
Q
 
E
E
 
A
K
 
K
L
 
L
D
 
A
A
 
E
I
 
I
T
 
A
S
 
A
K
 
K
I
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
K
 
R
R
 
R
F
 
F
T
 
T
T
 
T
S
 
P
E
 
D
E
 
E
M
 
I
A
 
A
D
 
D
M
 
T
A
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
E
x
P
R
 
R
S
 
A
S
|
S
H
 
H
T
 
T
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
I
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
H
 
H
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L

A0A0H3KNE7 L-fucose dehydrogenase; EC 1.1.1.435 from Burkholderia multivorans (strain ATCC 17616 / 249) (see paper)
77% identity, 100% coverage: 1:257/258 of query aligns to 1:257/258 of A0A0H3KNE7

query
sites
A0A0H3KNE7
L
 
M
D
 
D
L
 
L
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
|
S
G
 
G
I
|
I
G
 
G
A
 
G
A
 
A
I
 
I
S
 
S
L
 
M
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
R
A
 
A
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
A
R
|
R
S
x
H
A
 
A
P
 
P
E
 
D
S
 
G
Q
 
A
F
 
F
W
 
L
E
 
D
R
 
A
L
 
L
T
 
A
A
 
Q
V
 
R
Q
 
Q
P
 
P
R
 
R
A
 
A
A
 
T
L
 
Y
F
 
L
Q
 
P
L
 
V
E
|
E
L
|
L
Q
 
Q
D
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
Q
C
 
C
R
 
R
E
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
Q
T
 
T
I
 
I
E
 
A
R
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
|
N
D
 
D
S
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
R
D
 
D
E
 
A
F
 
F
V
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
R
 
R
N
 
N
L
 
L
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
Y
V
 
A
M
 
M
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
C
 
C
V
 
V
P
 
P
H
 
H
L
 
L
K
 
K
A
 
A
T
 
T
R
 
R
G
 
G
A
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
V
 
I
S
 
S
S
|
S
K
|
K
T
 
T
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
|
Q
G
 
G
N
 
N
T
 
T
S
 
S
G
 
G
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
R
E
 
E
W
 
W
A
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
R
D
 
E
D
 
H
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
I
 
I
P
 
P
A
|
A
E
|
E
V
|
V
M
 
M
T
|
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
R
K
 
N
W
 
W
I
 
I
A
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
E
H
 
D
P
 
P
Q
 
E
E
 
A
K
 
K
L
 
L
D
 
A
A
 
E
I
 
I
T
 
A
S
 
A
K
 
K
I
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
K
 
R
R
 
R
F
 
F
T
 
T
T
 
T
S
 
P
E
 
D
E
 
E
M
 
I
A
 
A
D
 
D
M
 
T
A
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
P
R
 
R
S
 
A
S
 
S
H
 
H
T
 
T
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
I
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
H
 
H
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L

6ds1B Crystal structure of cj0485 dehydrogenase in complex with NADP+ (see paper)
48% identity, 100% coverage: 1:258/258 of query aligns to 1:258/260 of 6ds1B

query
sites
6ds1B
L
 
M
D
 
D
L
 
L
N
 
K
L
 
I
Q
 
K
D
 
N
K
 
K
V
 
V
V
 
C
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
Y
A
 
G
I
 
I
S
 
A
L
 
K
Q
 
L
L
 
W
A
 
A
A
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
F
 
F
A
x
S
R
|
R
S
 
S
A
 
M
P
 
P
E
 
K
S
 
E
Q
 
H
F
 
D
W
 
K
E
 
E
R
 
-
L
 
L
T
 
K
A
 
K
V
 
L
Q
 
S
P
 
S
R
 
E
A
 
Y
A
 
E
L
 
F
F
 
Y
Q
 
E
L
x
I
E
x
D
L
|
L
Q
 
K
D
 
N
D
 
Y
A
 
E
R
 
Q
C
 
I
R
 
E
E
 
K
A
 
L
V
 
V
A
 
K
G
 
K
T
 
V
I
 
A
E
 
I
R
 
K
F
 
H
G
 
G
R
 
G
L
 
I
D
 
Y
G
 
A
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
T
N
 
N
D
 
D
S
 
N
V
 
L
G
 
H
L
 
I
E
 
E
-
 
N
A
 
T
G
 
S
R
 
T
D
 
Q
E
 
D
F
 
L
V
 
I
A
 
K
S
 
S
L
 
Y
E
 
E
R
 
N
N
 
N
L
 
L
I
 
F
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
Y
V
 
T
M
 
M
A
 
T
H
 
K
Y
 
E
C
 
C
V
 
L
P
 
P
H
 
Y
L
 
I
K
 
K
A
 
K
T
 
E
R
 
Q
G
 
G
A
 
S
I
 
I
I
 
L
N
 
N
V
x
I
S
x
V
S
|
S
K
 
K
T
 
T
A
 
G
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
N
 
R
T
 
T
S
 
S
G
 
A
Y
|
Y
C
 
A
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
M
S
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
R
E
 
E
W
 
W
A
 
A
A
 
C
A
 
A
L
 
F
R
 
A
D
 
K
D
 
D
G
 
N
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
I
I
 
A
P
|
P
A
|
A
E
 
E
V
|
V
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
K
 
K
W
 
W
I
 
L
A
 
Q
T
 
N
F
 
F
D
 
P
H
 
N
P
 
P
Q
 
K
E
 
E
K
 
Q
L
 
Y
D
 
E
A
 
K
I
 
I
T
 
A
S
 
K
K
 
A
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
K
 
H
R
 
R
F
 
F
T
 
T
T
 
T
S
 
I
E
 
E
E
 
E
M
 
I
A
 
A
D
 
N
M
 
T
A
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
T
L
 
L
S
 
S
E
 
P
R
 
L
S
 
A
S
 
S
H
 
H
T
 
T
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
W
 
I
I
 
L
F
 
M
V
 
P
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
V
H
 
H
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
N

H9XP47 Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; BDH; meso-2,3-BDH; (R,S)-butane-2,3-diol dehydrogenase; NAD(H)-dependent meso-2,3-BDH; SmBdh; EC 1.1.1.- from Serratia marcescens (see paper)
35% identity, 98% coverage: 3:254/258 of query aligns to 1:245/251 of H9XP47

query
sites
H9XP47
L
 
M
N
 
R
L
 
F
Q
 
D
D
 
N
K
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
G
S
x
N
G
 
G
I
x
M
G
 
G
A
 
E
A
 
A
I
 
A
S
 
A
L
 
R
Q
 
R
L
 
F
A
 
S
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
I
 
I
P
 
-
V
 
V
V
 
V
F
 
L
A
 
A
R
x
D
S
 
W
A
 
A
P
 
K
E
 
E
S
 
A
Q
 
V
F
 
-
W
 
-
E
 
D
R
 
K
L
 
V
T
 
A
A
 
A
V
 
S
Q
 
L
P
 
P
-
 
K
-
 
G
R
 
R
A
 
A
A
 
M
L
 
A
F
 
V
Q
 
H
L
 
I
E
x
D
L
x
V
Q
 
S
D
 
D
D
 
H
A
 
V
R
 
A
C
 
V
R
 
E
E
 
K
A
 
M
V
 
M
A
 
N
G
 
E
T
 
V
I
 
A
E
 
E
R
 
K
F
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
H
-
 
V
-
 
A
D
 
G
S
 
S
V
 
V
G
 
-
L
 
L
E
 
E
A
 
T
G
 
S
R
 
I
D
 
D
E
 
D
F
 
W
V
 
R
A
 
R
S
 
I
L
 
A
E
 
G
R
 
V
N
 
D
L
 
I
I
 
D
H
 
G
Y
 
V
Y
 
V
V
 
F
M
 
C
A
 
S
H
 
K
Y
 
F
C
 
A
V
 
L
P
 
P
H
 
H
L
 
L
K
 
L
A
 
K
T
 
T
R
 
K
G
 
G
A
 
C
I
 
I
I
 
V
N
 
N
V
 
T
S
 
A
S
|
S
K
x
V
T
x
S
A
 
G
V
 
L
T
 
G
G
 
G
Q
 
D
G
 
W
N
 
G
T
 
A
S
 
A
G
 
Y
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
Q
 
V
L
 
V
S
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
E
 
A
W
 
M
A
 
A
A
 
L
A
 
D
L
 
H
R
 
G
D
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
V
I
 
C
P
 
P
A
 
S
E
 
L
V
|
V
M
 
K
T
|
T
P
 
N
L
 
M
Y
 
T
E
 
N
K
 
G
W
 
W
I
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
K
 
I
L
x
R
D
|
D
A
x
K
I
 
F
T
 
N
S
 
E
K
 
R
I
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
-
R
 
R
F
 
A
T
 
A
T
 
E
S
 
P
E
 
E
E
 
E
M
 
V
A
 
A
D
 
A
M
 
V
A
 
M
V
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
D
S
 
A
S
 
S
H
 
F
T
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
W
 
N
I
 
I
F
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
A
T
 
T
H
 
A
L
 
S
D
 
D

Sites not aligning to the query:

6vspB Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
35% identity, 98% coverage: 5:256/258 of query aligns to 5:249/252 of 6vspB

query
sites
6vspB
L
 
F
Q
 
D
D
 
N
K
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
G
S
x
N
G
|
G
I
 
M
G
 
G
A
 
E
A
 
A
I
 
A
S
 
A
L
 
R
Q
 
R
L
 
F
A
 
S
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
I
 
I
P
 
-
V
 
V
V
 
V
F
 
L
A
 
A
R
x
D
S
x
W
A
 
A
P
 
K
E
 
E
S
 
A
Q
 
V
F
 
-
W
 
-
E
 
D
R
 
K
L
 
V
T
 
A
A
 
A
V
 
S
Q
 
L
P
 
P
-
 
K
-
 
G
R
 
R
A
 
A
A
 
M
L
 
A
F
 
V
Q
 
H
L
x
I
E
x
D
L
x
V
Q
 
S
D
 
D
D
 
H
A
 
V
R
 
A
C
 
V
R
 
E
E
 
K
A
 
M
V
 
M
A
 
N
G
 
E
T
 
V
I
 
A
E
 
E
R
 
K
F
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
V
 
V
N
 
H
-
 
V
-
 
A
D
 
G
S
 
S
V
 
V
G
 
-
L
 
L
E
 
E
A
 
T
G
 
S
R
 
I
D
 
D
E
 
D
F
 
W
V
 
R
A
 
R
S
 
I
L
 
A
E
 
G
R
 
V
N
 
D
L
 
I
I
 
D
H
 
G
Y
 
V
Y
 
V
V
 
F
M
 
C
A
 
S
H
 
K
Y
 
F
C
 
A
V
 
L
P
 
P
H
 
H
L
 
L
K
 
L
A
 
K
T
 
T
R
 
K
G
 
G
A
 
C
I
 
I
I
 
V
N
 
N
V
 
T
S
 
A
S
|
S
K
 
V
T
 
S
A
 
G
V
 
L
T
 
G
G
 
G
Q
 
D
G
 
W
N
 
G
T
 
A
S
 
A
G
 
Y
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
S
 
A
K
 
K
G
 
G
A
 
A
Q
 
V
L
 
V
S
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
E
 
A
W
 
M
A
 
A
A
 
L
A
 
D
L
 
H
R
 
G
D
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
V
I
 
C
P
 
P
A
 
S
E
 
L
V
 
V
M
 
K
T
 
T
P
 
N
L
 
M
Y
 
T
E
 
N
K
 
G
W
 
W
I
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
K
 
I
L
 
R
D
 
D
A
 
K
I
 
F
T
 
N
S
 
E
K
 
R
I
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
-
R
 
R
F
 
A
T
 
A
T
 
E
S
 
P
E
 
E
E
 
E
M
 
V
A
 
A
D
 
A
M
 
V
A
 
M
V
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
D
S
 
A
S
 
S
H
 
F
T
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
W
 
N
I
 
I
F
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
A
T
 
T
H
 
A
L
 
S
D
 
D
R
 
G
A
 
A

6vspA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
35% identity, 98% coverage: 5:256/258 of query aligns to 3:247/251 of 6vspA

query
sites
6vspA
L
 
F
Q
 
D
D
 
N
K
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
G
S
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
A
 
E
A
 
A
I
 
A
S
 
A
L
 
R
Q
 
R
L
 
F
A
 
S
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
I
 
I
P
 
-
V
 
V
V
 
V
F
 
L
A
 
A
R
x
D
S
x
W
A
|
A
P
 
K
E
 
E
S
 
A
Q
 
V
F
 
-
W
 
-
E
 
D
R
 
K
L
 
V
T
 
A
A
 
A
V
 
S
Q
 
L
P
 
P
-
 
K
-
 
G
R
 
R
A
 
A
A
 
M
L
 
A
F
 
V
Q
 
H
L
x
I
E
x
D
L
x
V
Q
 
S
D
 
D
D
 
H
A
 
V
R
 
A
C
 
V
R
 
E
E
 
K
A
 
M
V
 
M
A
 
N
G
 
E
T
 
V
I
 
A
E
 
E
R
 
K
F
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
|
V
N
 
H
-
 
V
-
 
A
D
 
G
S
 
S
V
 
V
G
 
-
L
 
L
E
 
E
A
 
T
G
 
S
R
 
I
D
 
D
E
 
D
F
 
W
V
 
R
A
 
R
S
 
I
L
 
A
E
 
G
R
x
V
N
 
D
L
 
I
I
 
D
H
 
G
Y
 
V
Y
 
V
V
 
F
M
 
C
A
 
S
H
 
K
Y
 
F
C
 
A
V
 
L
P
 
P
H
 
H
L
 
L
K
 
L
A
 
K
T
 
T
R
 
K
G
 
G
A
 
C
I
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
T
S
 
A
S
|
S
K
 
V
T
 
S
A
 
G
V
 
L
T
 
G
G
 
G
Q
 
D
G
 
W
N
 
G
T
 
A
S
 
A
G
 
Y
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
Q
 
V
L
 
V
S
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
E
 
A
W
 
M
A
 
A
A
 
L
A
 
D
L
 
H
R
 
G
D
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
V
I
 
C
P
|
P
A
x
S
E
x
L
V
|
V
M
 
K
T
|
T
P
x
N
L
x
M
Y
x
T
E
 
N
K
 
G
W
 
W
I
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
K
 
I
L
 
R
D
 
D
A
 
K
I
 
F
T
 
N
S
 
E
K
 
R
I
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
-
R
 
R
F
 
A
T
 
A
T
 
E
S
 
P
E
 
E
E
 
E
M
 
V
A
 
A
D
 
A
M
 
V
A
 
M
V
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
D
S
 
A
S
 
S
H
 
F
T
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
W
 
N
I
 
I
F
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
A
T
 
T
H
 
A
L
 
S
D
 
D
R
 
G
A
 
A

6xewA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
35% identity, 97% coverage: 5:254/258 of query aligns to 3:245/251 of 6xewA

query
sites
6xewA
L
 
F
Q
 
D
D
 
N
K
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
G
S
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
A
 
E
A
 
A
I
 
A
S
 
A
L
 
R
Q
 
R
L
 
F
A
 
S
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
I
 
I
P
 
-
V
 
V
V
 
V
F
 
L
A
 
A
R
x
D
S
x
W
A
|
A
P
 
K
E
 
E
S
 
A
Q
 
V
F
 
-
W
 
-
E
 
D
R
 
K
L
 
V
T
 
A
A
 
A
V
 
S
Q
 
L
P
 
P
-
 
K
-
 
G
R
 
R
A
 
A
A
 
M
L
 
A
F
 
V
Q
 
H
L
x
I
E
x
D
L
x
V
Q
 
S
D
 
D
D
 
H
A
 
V
R
 
A
C
 
V
R
 
E
E
 
K
A
 
M
V
 
M
A
 
N
G
 
E
T
 
V
I
 
A
E
 
E
R
 
K
F
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
V
N
 
H
-
 
V
-
 
A
D
 
G
S
 
S
V
 
V
G
 
-
L
 
L
E
 
E
A
 
T
G
 
S
R
 
I
D
 
D
E
 
D
F
 
W
V
 
R
A
 
R
S
 
I
L
 
A
E
 
G
R
x
V
N
 
D
L
 
I
I
 
D
H
 
G
Y
 
V
Y
 
V
V
 
F
M
 
C
A
 
S
H
 
K
Y
 
F
C
 
A
V
 
L
P
 
P
H
 
H
L
 
L
K
 
L
A
 
K
T
 
T
R
 
K
G
 
G
A
 
C
I
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
T
S
 
A
S
|
S
K
 
V
T
x
S
A
 
G
V
 
L
T
 
G
G
 
G
Q
 
D
G
 
W
N
 
G
T
 
A
S
 
A
G
 
Y
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
Q
 
V
L
 
V
S
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
E
 
A
W
 
M
A
 
A
A
 
L
A
 
D
L
 
H
R
 
G
D
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
V
I
 
C
P
 
P
A
x
S
E
x
L
V
|
V
M
 
K
T
|
T
P
x
N
L
x
M
Y
x
T
E
 
N
K
 
G
W
 
W
I
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
K
 
I
L
 
R
D
 
D
A
 
K
I
 
F
T
 
N
S
 
E
K
 
R
I
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
-
R
 
R
F
 
A
T
 
A
T
 
E
S
 
P
E
 
E
E
 
E
M
 
V
A
 
A
D
 
A
M
 
V
A
 
M
V
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
D
S
 
A
S
 
S
H
 
F
T
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
W
 
N
I
 
I
F
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
A
T
 
T
H
 
A
L
 
S
D
 
D

1vl8B Crystal structure of gluconate 5-dehydrogenase (tm0441) from thermotoga maritima at 2.07 a resolution
37% identity, 97% coverage: 3:251/258 of query aligns to 2:250/252 of 1vl8B

query
sites
1vl8B
L
 
F
N
 
D
L
 
L
Q
 
R
D
 
G
K
 
R
V
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
S
S
x
R
G
|
G
I
x
L
G
 
G
A
 
F
A
 
G
I
 
I
S
 
A
L
 
Q
Q
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
A
G
 
G
A
 
C
I
 
S
P
 
V
V
 
V
V
 
V
F
 
A
A
x
S
R
|
R
S
 
N
A
 
L
P
 
E
E
 
E
-
 
A
S
 
S
Q
 
E
F
 
A
W
 
A
E
 
Q
R
 
K
L
 
L
T
 
T
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
A
 
G
V
 
V
Q
 
E
P
 
T
R
 
M
A
 
A
A
 
-
L
 
-
F
 
F
Q
 
R
L
x
C
E
x
D
L
x
V
Q
 
S
D
 
N
D
 
Y
A
 
E
R
 
E
C
 
V
R
 
K
E
 
K
A
 
L
V
 
L
A
 
E
G
 
A
T
 
V
I
 
K
E
 
E
R
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
L
D
 
D
G
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
V
x
I
N
 
N
D
 
R
S
 
R
-
 
H
V
 
P
G
 
A
L
 
E
E
 
E
A
 
F
G
 
P
R
 
L
D
 
D
E
 
E
F
 
F
V
 
R
A
 
Q
S
 
V
L
 
I
E
 
E
R
x
V
N
 
N
L
 
L
I
 
F
H
 
G
Y
 
T
Y
 
Y
V
 
Y
M
 
V
A
 
C
H
 
R
Y
 
E
C
 
A
V
 
F
P
 
S
H
 
L
L
 
L
K
 
R
A
 
E
T
 
S
R
 
D
G
 
N
-
 
P
A
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
I
S
 
G
S
|
S
K
 
L
T
 
T
A
 
V
-
 
E
-
 
E
V
 
V
T
 
T
G
 
-
Q
 
M
G
 
P
N
 
N
T
x
I
S
 
S
G
 
A
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
Q
 
V
L
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
T
R
 
K
E
 
A
W
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
E
L
 
W
R
 
G
D
 
R
D
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
V
L
 
I
I
 
A
P
|
P
A
x
G
E
 
W
V
x
Y
M
 
R
T
|
T
P
 
K
L
x
M
Y
x
T
E
 
E
K
 
-
W
 
-
I
 
-
A
 
A
T
 
V
F
 
F
D
 
S
H
 
D
P
 
P
Q
 
-
E
 
E
K
 
K
L
 
L
D
 
D
A
 
Y
I
 
M
T
 
L
S
 
K
K
 
R
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
K
 
-
R
 
R
F
 
T
T
 
G
T
 
V
S
 
P
E
 
E
E
 
D
M
 
L
A
 
K
D
 
G
M
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
E
R
 
E
S
 
A
S
 
K
H
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
W
 
I
I
 
I
F
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
W
T
 
T

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
33% identity, 97% coverage: 3:251/258 of query aligns to 3:253/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
L
 
M
N
 
N
L
 
L
Q
 
T
D
 
D
K
 
K
V
 
T
V
 
V
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
I
 
A
S
 
V
L
 
Q
Q
 
A
L
 
F
A
 
L
A
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
I
 
N
P
 
V
V
 
V
V
 
V
F
 
A
A
x
D
R
x
I
S
 
D
A
 
E
P
 
A
E
 
Q
S
 
G
Q
 
E
F
 
A
W
 
M
E
 
V
R
 
R
L
 
-
T
 
K
A
 
E
V
 
N
Q
 
N
P
 
D
R
 
R
A
 
L
A
 
H
L
 
F
F
 
V
Q
 
Q
L
x
T
E
 
D
L
x
I
Q
 
T
D
 
D
D
 
E
A
 
A
R
 
A
C
 
C
R
 
Q
E
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
E
G
 
S
T
 
A
I
 
V
E
 
H
R
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
I
N
 
E
D
 
I
S
 
V
V
 
A
G
 
P
L
 
I
-
 
H
E
 
E
A
 
M
G
 
E
R
 
L
D
 
S
E
 
D
F
 
W
V
 
N
A
 
K
S
 
V
L
 
L
E
 
Q
R
 
V
N
 
N
L
 
L
I
 
T
H
 
G
Y
 
M
Y
 
F
V
 
L
M
 
M
A
 
S
H
 
K
Y
 
H
C
 
A
V
 
L
P
 
K
H
 
H
-
 
M
L
 
L
K
 
A
A
 
A
T
 
G
R
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
T
S
 
C
S
|
S
K
 
V
T
 
G
A
 
G
V
 
L
T
 
V
G
 
A
Q
 
W
G
 
P
N
 
D
T
 
I
S
 
P
G
 
A
Y
|
Y
C
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
Q
 
V
L
 
L
S
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
K
E
 
S
W
 
M
A
 
A
A
 
V
A
 
D
L
 
Y
R
 
A
D
 
K
D
 
H
G
 
Q
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
V
I
 
C
P
|
P
A
x
G
E
x
I
V
x
I
M
 
D
T
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
N
E
 
E
K
 
K
-
 
S
W
 
F
I
 
L
A
 
E
T
 
N
F
 
N
D
 
E
H
 
G
P
 
T
Q
 
L
E
 
E
K
 
E
L
 
I
D
 
K
A
 
K
I
 
E
T
 
K
S
 
A
K
 
K
I
 
V
P
 
N
L
 
P
G
 
L
K
 
L
R
 
R
F
 
L
T
 
G
T
 
K
S
 
P
E
 
E
E
 
E
M
 
I
A
 
A
D
 
N
M
 
V
A
 
M
V
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
L
S
 
S
S
 
S
H
 
Y
T
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
W
 
A
I
 
I
F
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T

4qecA Elxo with NADP bound (see paper)
30% identity, 94% coverage: 8:250/258 of query aligns to 3:245/248 of 4qecA

query
sites
4qecA
K
 
K
V
 
N
V
 
V
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
F
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
K
A
 
Q
I
 
V
S
 
A
L
 
L
Q
 
E
L
 
F
A
 
L
A
 
K
E
 
N
G
 
D
A
 
Y
I
 
H
P
 
V
V
 
C
V
 
I
F
 
T
A
x
S
R
|
R
S
 
Y
-
 
F
A
 
E
P
x
K
E
 
E
S
 
K
Q
 
R
F
 
I
W
 
P
E
 
H
R
 
L
L
 
F
T
 
S
A
 
S
V
 
Y
Q
 
E
P
 
E
R
 
N
A
 
I
A
 
S
L
 
F
F
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
E
x
D
L
x
V
Q
 
T
D
 
D
D
 
E
A
 
E
R
 
Q
C
 
V
R
 
N
E
 
E
A
 
I
V
 
I
A
 
N
G
 
K
T
 
I
I
 
V
E
 
K
R
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
N
 
S
D
 
L
S
 
S
V
 
D
G
 
G
L
 
L
-
 
L
-
 
T
E
 
E
A
 
T
G
 
K
R
 
T
D
 
T
E
 
D
F
 
F
V
 
N
A
 
K
S
 
M
L
 
I
E
 
N
R
 
T
N
|
N
L
 
I
I
 
L
H
 
G
Y
 
T
Y
 
Y
V
 
F
M
 
C
A
 
M
H
 
K
Y
 
Y
C
 
A
V
 
L
P
 
K
H
 
H
L
 
M
-
 
Q
K
 
K
A
 
V
T
 
S
R
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
I
S
 
S
S
|
S
K
 
I
T
 
T
A
 
G
V
 
L
T
 
S
G
 
G
Q
 
F
G
 
P
N
 
Y
T
 
S
S
 
I
G
 
L
Y
|
Y
C
 
G
A
 
S
S
 
T
K
|
K
G
 
H
A
 
A
Q
 
V
L
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
E
 
G
W
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
E
L
 
F
R
 
A
D
 
D
D
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
K
V
 
I
N
 
N
A
 
A
L
 
V
I
 
A
P
|
P
A
 
G
E
 
I
V
x
I
M
 
K
T
 
T
P
 
E
L
 
T
Y
 
L
E
 
Q
K
 
K
W
 
E
I
 
I
A
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
D
H
 
S
P
 
G
Q
 
E
E
 
F
K
 
S
L
 
E
D
 
D
A
 
S
I
 
I
T
 
S
S
 
S
K
 
I
I
 
H
P
 
P
L
 
M
G
 
-
K
 
Q
R
 
K
F
 
L
T
 
G
T
 
T
S
 
T
E
 
L
E
 
D
M
 
V
A
 
A
D
 
K
M
 
G
A
 
I
V
 
Y
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
N
E
 
E
R
 
D
S
 
N
S
 
N
H
 
F
T
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
H
W
 
V
I
 
L
F
 
S
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
33% identity, 96% coverage: 3:249/258 of query aligns to 1:244/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
M
N
 
T
L
 
L
Q
 
Q
D
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
D
I
 
I
S
 
A
L
 
I
Q
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
I
 
N
P
 
I
V
 
F
V
 
F
F
x
N
A
x
Y
R
x
N
S
x
G
A
x
S
P
 
P
E
 
E
S
 
A
Q
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
A
-
 
K
-
 
L
F
 
V
W
 
A
E
 
E
R
 
H
L
 
G
T
 
V
A
 
E
V
 
V
Q
 
E
P
 
A
R
 
M
A
 
K
A
 
A
L
x
N
F
x
V
Q
 
A
L
 
I
E
 
A
L
 
E
Q
 
D
D
 
V
D
 
D
A
 
A
R
 
F
C
 
F
R
 
K
E
 
Q
A
 
A
V
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
I
 
I
E
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
V
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
N
 
T
-
 
R
D
 
D
S
 
N
V
 
L
G
 
L
L
 
M
E
 
R
A
 
M
G
 
K
R
 
E
D
 
D
E
 
E
F
 
W
V
 
D
A
 
D
S
 
V
L
 
I
E
 
N
R
x
I
N
 
N
L
 
L
I
 
K
H
 
G
Y
 
T
Y
 
F
V
 
L
M
 
C
A
 
T
H
 
K
Y
 
A
C
 
V
V
 
S
P
 
R
H
 
T
L
 
M
K
 
M
A
 
K
T
 
Q
R
 
R
-
 
A
G
 
G
A
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
M
S
 
A
S
|
S
K
 
V
T
 
V
A
 
G
V
 
L
T
 
I
G
 
G
Q
 
N
G
 
A
N
 
G
T
x
Q
S
 
A
G
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
A
A
 
G
Q
 
V
L
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
E
 
T
W
 
T
A
 
A
A
 
R
A
 
E
L
 
L
R
 
A
D
 
P
D
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
I
 
A
P
|
P
A
 
G
E
 
F
V
x
I
M
 
T
T
|
T
P
 
D
L
 
M
Y
 
T
E
 
D
K
 
K
W
 
L
I
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
D
Q
 
E
E
 
K
K
 
T
L
 
K
D
 
E
A
 
A
I
 
M
T
 
L
S
 
A
K
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
K
 
A
R
 
-
F
 
Y
T
 
G
T
 
T
S
 
T
E
 
E
E
 
D
M
 
I
A
 
A
D
 
N
M
 
A
A
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
A
S
 
S
S
 
K
H
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
W
 
T
I
 
L
F
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
33% identity, 96% coverage: 5:251/258 of query aligns to 5:259/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
L
 
L
Q
 
D
D
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
E
I
 
I
S
 
A
L
 
K
Q
 
K
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
I
 
K
P
 
V
V
 
V
V
 
I
F
 
S
A
x
D
R
x
M
S
 
N
A
 
A
P
 
E
E
 
K
S
 
C
Q
 
Q
F
 
E
W
 
T
E
 
A
R
 
N
L
 
S
T
 
L
A
 
K
V
 
E
Q
 
Q
P
 
G
R
 
F
A
 
D
A
 
A
L
 
L
F
 
S
Q
 
A
-
 
P
L
 
C
E
x
D
L
x
V
Q
 
T
D
 
D
D
 
E
A
 
D
R
 
A
C
 
Y
R
 
K
E
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
E
G
 
L
T
 
T
I
 
Q
E
 
K
R
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
T
L
 
V
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
F
N
x
Q
D
 
H
S
 
V
V
 
A
G
 
P
L
 
I
E
 
E
A
 
-
G
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
E
F
 
F
V
 
P
A
 
T
S
 
A
L
 
V
E
 
F
R
 
Q
N
 
K
L
 
L
I
 
V
H
 
Q
Y
 
V
-
 
M
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
A
Y
 
F
V
 
I
M
 
G
A
 
I
H
 
K
Y
 
H
C
 
V
V
 
L
P
 
P
H
 
I
L
 
M
K
 
K
A
 
A
T
 
Q
R
 
K
-
 
Y
G
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
M
S
x
A
S
|
S
K
 
I
T
x
N
A
 
G
V
 
L
T
 
I
G
 
G
Q
 
F
G
 
A
N
 
G
T
x
K
S
 
A
G
 
G
Y
|
Y
C
 
N
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
H
A
 
G
Q
 
V
L
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
E
 
V
W
 
A
A
 
A
A
 
L
A
 
E
L
 
C
R
 
A
D
 
R
D
 
D
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
C
P
|
P
A
x
G
E
 
Y
V
|
V
M
 
D
T
|
T
P
 
P
L
|
L
Y
 
V
E
 
R
K
 
G
W
x
Q
I
 
I
A
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
T
-
 
R
-
 
N
-
 
V
T
 
S
F
 
L
D
 
D
H
 
S
P
 
A
Q
 
L
E
 
E
K
 
-
L
 
-
D
 
D
A
 
V
I
 
I
T
 
L
S
 
A
K
 
M
I
 
V
P
 
P
L
 
Q
G
 
-
K
 
K
R
 
R
F
 
L
T
 
L
T
 
S
S
 
V
E
 
E
E
 
E
M
 
I
A
 
A
D
 
D
M
 
Y
A
 
A
V
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
S
R
 
K
S
 
A
S
 
G
H
 
G
T
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
W
 
A
I
 
V
F
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
33% identity, 96% coverage: 5:251/258 of query aligns to 4:258/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
L
 
L
Q
 
D
D
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
E
I
 
I
S
 
A
L
 
K
Q
 
K
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
I
 
K
P
 
V
V
 
V
V
 
I
F
 
S
A
x
D
R
x
M
S
 
N
A
 
A
P
 
E
E
 
K
S
 
C
Q
 
Q
F
 
E
W
 
T
E
 
A
R
 
N
L
 
S
T
 
L
A
 
K
V
 
E
Q
 
Q
P
 
G
R
 
F
A
 
D
A
 
A
L
 
L
F
 
S
Q
 
A
-
 
P
L
 
C
E
x
D
L
x
V
Q
 
T
D
 
D
D
 
E
A
 
D
R
 
A
C
 
Y
R
 
K
E
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
E
G
 
L
T
 
T
I
 
Q
E
 
K
R
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
T
L
 
V
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
F
N
x
Q
D
 
H
S
 
V
V
 
A
G
 
P
L
 
I
E
 
E
A
 
-
G
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
E
F
 
F
V
 
P
A
 
T
S
 
A
L
 
V
E
 
F
R
 
Q
N
 
K
L
 
L
I
 
V
H
 
Q
Y
 
V
-
 
M
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
A
Y
 
F
V
 
I
M
 
G
A
 
I
H
 
K
Y
 
H
C
 
V
V
 
L
P
 
P
H
 
I
L
 
M
K
 
K
A
 
A
T
 
Q
R
 
K
-
 
Y
G
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
M
S
x
A
S
|
S
K
 
I
T
 
N
A
 
G
V
 
L
T
 
I
G
 
G
Q
 
F
G
 
A
N
 
G
T
x
K
S
 
A
G
 
G
Y
|
Y
C
 
N
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
H
A
 
G
Q
 
V
L
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
E
 
V
W
 
A
A
 
A
A
 
L
A
 
E
L
 
C
R
 
A
D
 
R
D
 
D
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
C
P
 
P
A
 
G
E
x
Y
V
|
V
M
 
D
T
|
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
V
E
 
R
K
 
G
W
x
Q
I
 
I
A
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
T
-
 
R
-
 
N
-
 
V
T
 
S
F
 
L
D
 
D
H
 
S
P
 
A
Q
 
L
E
 
E
K
 
-
L
 
-
D
 
D
A
 
V
I
 
I
T
 
L
S
 
A
K
 
M
I
 
V
P
 
P
L
 
Q
G
 
-
K
 
K
R
 
R
F
 
L
T
 
L
T
 
S
S
 
V
E
 
E
E
 
E
M
 
I
A
 
A
D
 
D
M
 
Y
A
 
A
V
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
S
R
 
K
S
 
A
S
 
G
H
 
G
T
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
W
 
A
I
 
V
F
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
33% identity, 95% coverage: 5:249/258 of query aligns to 3:236/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
L
 
L
Q
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
x
K
G
|
G
I
x
L
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
I
 
I
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
L
 
Y
A
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
I
 
-
P
 
-
V
 
K
V
 
V
F
 
I
A
 
A
R
 
G
S
x
D
A
x
L
P
 
G
E
 
D
S
 
-
Q
 
-
F
 
-
W
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
L
T
 
T
A
 
Y
V
 
S
Q
 
H
P
 
P
R
 
N
A
 
V
A
 
E
L
 
G
F
 
M
Q
 
Y
L
|
L
E
x
N
L
x
V
Q
 
T
D
 
D
D
 
V
A
 
T
R
 
G
C
 
V
R
 
E
E
 
K
A
 
F
V
 
Y
A
 
Q
G
 
S
T
 
V
I
 
I
E
 
D
R
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
 
K
L
 
I
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
-
 
T
N
 
K
D
 
D
S
 
A
V
 
M
G
 
T
L
 
R
E
 
K
A
 
M
G
 
T
R
 
E
D
 
A
E
 
Q
F
 
W
V
 
D
A
 
A
S
 
V
L
 
I
E
 
D
R
 
V
N
 
N
L
 
L
I
 
K
H
 
G
Y
 
V
Y
 
F
V
 
N
M
 
L
A
 
T
H
 
R
Y
 
L
C
 
V
V
 
G
P
 
P
H
 
Q
L
 
M
K
 
Q
A
 
T
T
 
N
-
 
G
R
 
Y
G
 
G
A
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
I
S
 
S
S
|
S
K
 
V
T
 
V
A
 
G
V
 
V
T
 
F
G
 
G
Q
 
N
G
 
I
N
 
G
T
 
Q
S
 
A
G
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
A
A
 
G
Q
 
V
L
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
M
E
 
T
W
 
W
A
 
A
A
 
K
-
 
E
-
 
F
A
 
A
L
 
L
R
 
K
D
 
G
D
 
A
G
 
N
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
I
I
 
A
P
|
P
A
x
G
E
 
Y
V
x
I
M
 
M
T
|
T
P
 
D
L
 
I
Y
 
L
E
 
K
K
 
T
W
 
V
I
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
P
Q
 
Q
E
 
D
K
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
K
I
 
F
T
 
A
S
 
A
K
 
L
I
 
T
P
 
M
L
 
L
G
 
-
K
 
N
R
 
R
F
 
L
T
 
G
T
 
Q
S
 
P
E
 
E
E
 
E
M
 
I
A
 
A
D
 
K
M
 
V
A
 
A
V
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
D
S
 
A
S
 
S
H
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
W
 
T
I
 
I
F
 
N
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
31% identity, 95% coverage: 5:249/258 of query aligns to 5:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
E
I
 
A
S
 
A
L
 
R
Q
 
V
L
 
F
A
 
M
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
I
 
-
P
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
I
A
 
A
R
 
-
S
x
D
A
x
F
P
 
N
E
 
E
S
 
A
Q
 
A
F
 
G
W
 
K
E
 
E
R
 
A
L
 
V
T
 
E
A
 
A
V
 
-
Q
 
N
P
 
P
R
 
G
A
 
V
A
 
V
L
 
F
F
 
I
Q
 
R
L
x
V
E
x
D
L
x
V
Q
 
S
D
 
D
D
 
R
A
 
E
R
 
S
C
 
V
R
 
H
E
 
R
A
 
L
V
 
V
A
 
E
G
 
N
T
 
V
I
 
A
E
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
I
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
N
 
T
-
 
R
D
|
D
S
 
S
V
 
M
G
 
L
L
 
S
E
x
K
A
 
M
G
 
T
R
 
V
D
 
D
E
 
Q
F
 
F
V
 
Q
A
 
Q
S
 
V
L
 
I
E
 
N
R
 
V
N
|
N
L
 
L
I
 
T
H
 
G
Y
 
V
Y
 
F
V
 
H
M
 
C
A
 
T
H
 
Q
Y
 
A
C
 
V
V
 
L
P
 
P
H
 
Y
L
 
M
-
 
A
K
 
E
A
 
Q
T
 
G
R
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
T
S
 
S
S
|
S
K
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
T
T
 
Y
G
 
G
Q
x
N
G
x
V
N
 
G
T
x
Q
S
 
T
G
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
Q
 
V
L
 
I
S
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
K
E
 
T
W
 
W
A
 
A
A
 
K
A
 
E
L
 
L
R
 
A
D
 
R
D
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
I
 
A
P
|
P
A
 
G
E
x
F
V
x
T
M
 
E
T
|
T
P
 
A
L
x
M
Y
 
V
E
 
A
K
 
E
W
 
V
I
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
P
Q
 
E
E
 
K
K
 
V
L
 
I
D
 
E
A
x
K
I
 
M
T
 
K
S
 
A
K
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
G
K
 
-
R
 
R
F
 
L
T
 
G
T
 
K
S
 
P
E
 
E
E
 
D
M
 
I
A
 
A
D
 
N
M
 
A
A
 
Y
V
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
H
R
 
E
S
 
S
S
 
D
H
 
Y
T
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
H
W
 
V
I
 
L
F
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
31% identity, 95% coverage: 5:249/258 of query aligns to 11:262/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
L
 
F
Q
 
T
D
 
D
K
 
R
V
 
V
V
 
V
I
x
L
V
x
I
T
|
T
G
|
G
G
|
G
A
x
G
S
|
S
G
|
G
I
x
L
G
|
G
A
x
R
A
|
A
I
x
T
S
x
A
L
x
V
Q
x
R
L
|
L
A
|
A
A
|
A
E
|
E
G
|
G
A
|
A
-
x
K
I
x
L
P
x
S
V
x
L
V
 
V
F
 
D
A
 
V
R
 
S
S
 
S
A
 
E
P
 
G
E
 
L
S
 
E
Q
 
A
F
 
S
W
 
K
E
 
A
R
 
A
L
 
V
T
 
L
A
 
E
V
 
T
Q
 
A
P
 
P
R
 
D
A
 
A
A
 
E
L
 
V
F
 
L
Q
 
T
L
 
T
-
 
V
-
 
A
E
 
D
L
 
V
Q
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
R
 
Q
C
 
V
R
 
E
E
 
A
A
 
Y
V
 
V
A
 
T
G
 
A
T
 
T
I
 
T
E
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
F
V
 
F
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
-
x
E
-
 
G
-
 
K
-
 
Q
N
 
N
D
 
P
S
 
T
V
 
E
G
 
S
L
 
F
E
 
T
A
 
A
G
 
A
R
 
E
D
 
F
E
 
D
F
 
K
V
 
V
A
 
V
S
 
S
L
 
I
E
 
-
R
 
-
N
 
N
L
 
L
I
 
R
H
 
G
Y
 
V
Y
 
F
V
 
L
M
 
G
A
 
L
H
 
E
Y
 
K
C
 
V
V
 
L
P
 
K
H
 
I
L
 
M
K
 
R
A
 
E
T
 
Q
-
 
G
R
 
S
G
 
G
A
 
M
I
 
V
I
 
V
N
 
N
V
 
T
S
 
A
S
 
S
K
 
V
T
 
G
A
 
G
V
 
I
T
 
R
G
 
G
Q
 
I
G
 
G
N
 
N
T
 
Q
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
G
 
H
A
 
G
Q
 
V
L
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
R
E
 
N
W
 
S
A
 
A
A
 
V
A
 
E
L
 
Y
R
 
G
D
 
R
D
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
L
 
I
I
 
A
P
 
P
A
 
G
E
 
A
V
 
I
M
 
W
T
 
T
P
 
P
L
 
M
Y
 
V
E
 
E
K
 
N
W
 
S
I
 
M
A
 
K
T
 
Q
F
 
L
D
 
D
-
 
P
-
 
E
H
 
N
P
 
P
Q
 
R
E
 
K
K
 
A
L
 
A
D
 
E
A
 
E
I
 
F
T
 
I
S
 
Q
K
 
V
I
 
N
P
 
P
L
 
-
G
 
S
K
 
K
R
 
R
F
 
Y
T
 
G
T
 
E
S
 
A
E
 
P
E
 
E
M
 
I
A
 
A
D
 
A
M
 
V
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
D
R
 
D
S
 
A
S
 
S
H
 
Y
T
 
V
T
 
N
G
 
A
Q
 
T
W
 
V
I
 
V
F
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1iy8A Crystal structure of levodione reductase (see paper)
31% identity, 95% coverage: 5:249/258 of query aligns to 2:253/258 of 1iy8A

query
sites
1iy8A
L
 
F
Q
 
T
D
 
D
K
 
R
V
 
V
V
 
V
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
G
S
|
S
G
|
G
I
x
L
G
 
G
A
 
R
A
 
A
I
 
T
S
 
A
L
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
-
 
K
I
 
L
P
 
S
V
 
L
V
 
V
F
x
D
A
x
V
R
 
S
S
 
S
A
 
E
P
 
G
E
 
L
S
 
E
Q
 
A
F
 
S
W
 
K
E
 
A
R
 
A
L
 
V
T
 
L
A
 
E
V
 
T
Q
 
A
P
 
P
R
 
D
A
 
A
A
 
E
L
 
V
F
 
L
Q
 
T
L
 
T
-
 
V
-
x
A
E
x
D
L
x
V
Q
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
R
 
Q
C
 
V
R
 
E
E
 
A
A
 
Y
V
 
V
A
 
T
G
 
A
T
 
T
I
 
T
E
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
F
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
Q
N
 
N
D
 
P
S
 
T
V
 
E
G
 
S
L
 
F
E
 
T
A
 
A
G
 
A
R
 
E
D
 
F
E
 
D
F
 
K
V
 
V
A
 
V
S
 
S
L
 
I
E
 
-
R
 
-
N
 
N
L
 
L
I
 
R
H
 
G
Y
 
V
Y
 
F
V
 
L
M
 
G
A
 
L
H
 
E
Y
 
K
C
 
V
V
 
L
P
 
K
H
 
I
L
 
M
K
 
R
A
 
E
T
 
Q
-
 
G
R
 
S
G
 
G
A
 
M
I
 
V
I
 
V
N
 
N
V
x
T
S
 
A
S
|
S
K
 
V
T
 
G
A
 
G
V
 
I
T
 
R
G
 
G
Q
 
I
G
 
G
N
 
N
T
x
Q
S
 
S
G
 
G
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
H
A
 
G
Q
 
V
L
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
R
E
 
N
W
 
S
A
 
A
A
 
V
A
 
E
L
 
Y
R
 
G
D
 
R
D
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
L
 
I
I
 
A
P
|
P
A
x
G
E
 
A
V
 
I
M
 
W
T
|
T
P
|
P
L
x
M
Y
 
V
E
 
E
K
 
N
W
 
S
I
 
M
A
 
K
T
 
Q
F
 
L
D
 
D
-
 
P
-
 
E
H
 
N
P
 
P
Q
 
R
E
 
K
K
 
A
L
 
A
D
 
E
A
 
E
I
 
F
T
 
I
S
 
Q
K
 
V
I
 
N
P
 
P
L
 
-
G
 
S
K
 
K
R
 
R
F
 
Y
T
 
G
T
 
E
S
 
A
E
 
P
E
 
E
M
 
I
A
 
A
D
 
A
M
 
V
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
D
R
 
D
S
 
A
S
 
S
H
 
Y
T
 
V
T
 
N
G
 
A
Q
 
T
W
 
V
I
 
V
F
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
33% identity, 96% coverage: 5:251/258 of query aligns to 3:246/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
L
Q
 
D
D
 
N
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
V
S
 
A
L
 
H
Q
 
S
L
 
Y
A
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
I
 
K
P
 
V
V
 
I
V
 
V
F
 
S
A
x
D
R
x
I
S
 
N
A
 
E
P
 
D
E
 
H
-
 
G
S
 
N
Q
 
K
F
 
A
W
 
V
E
 
E
R
 
D
L
 
I
T
 
K
A
 
A
V
 
Q
Q
 
G
P
 
G
R
 
E
A
 
A
A
 
S
L
 
F
F
 
V
Q
 
K
L
x
A
E
x
D
L
x
T
Q
 
S
D
 
N
D
 
P
A
 
E
R
 
E
C
 
V
R
 
E
E
 
A
A
 
L
V
 
V
A
 
K
G
 
R
T
 
T
I
 
V
E
 
E
R
 
I
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
N
 
G
D
 
G
S
 
E
V
 
Q
G
 
A
L
 
L
-
 
A
-
 
G
E
 
D
A
 
Y
G
 
G
R
 
L
D
 
D
E
 
S
F
 
W
V
 
R
A
 
K
S
 
V
L
 
L
E
 
S
R
 
I
N
 
N
L
 
L
I
 
D
H
 
G
Y
 
V
Y
 
F
V
 
Y
M
 
G
A
 
C
H
 
K
Y
 
Y
C
 
E
V
 
L
P
 
E
H
 
Q
L
 
M
-
 
E
K
 
K
A
 
N
T
 
G
R
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
M
S
 
A
S
|
S
K
 
I
T
 
H
A
 
G
V
 
I
T
 
V
G
 
A
Q
 
A
G
 
P
N
 
L
T
 
S
S
 
S
G
 
A
Y
|
Y
C
 
T
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
H
A
 
A
Q
 
V
L
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
E
 
N
W
 
I
A
 
G
A
 
A
A
 
E
L
 
Y
R
 
G
D
 
Q
D
 
K
G
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
V
I
 
G
P
|
P
A
|
A
E
x
Y
V
x
I
M
 
E
T
 
T
P
 
P
L
|
L
Y
 
L
E
 
E
K
 
S
W
 
L
I
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
T
Q
 
K
E
 
E
K
 
M
L
 
K
D
 
E
A
 
A
I
 
L
T
 
I
S
 
S
K
 
K
I
 
H
P
 
P
L
 
M
G
 
G
K
 
-
R
 
R
F
 
L
T
 
G
T
 
K
S
 
P
E
 
E
E
 
E
M
 
V
A
 
A
D
 
E
M
 
L
A
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
S
S
 
S
E
 
E
R
 
K
S
 
S
S
 
S
H
 
F
T
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
G
W
 
Y
I
 
Y
F
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T

Query Sequence

>HSERO_RS05240 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS05240
LDLNLQDKVVIVTGGASGIGAAISLQLAAEGAIPVVFARSAPESQFWERLTAVQPRAALF
QLELQDDARCREAVAGTIERFGRLDGLVNNAGVNDSVGLEAGRDEFVASLERNLIHYYVM
AHYCVPHLKATRGAIINVSSKTAVTGQGNTSGYCASKGAQLSLTREWAAALRDDGVRVNA
LIPAEVMTPLYEKWIATFDHPQEKLDAITSKIPLGKRFTTSEEMADMAVFLLSERSSHTT
GQWIFVDGGYTHLDRALT

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory