SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing HSERO_RS05340 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS05340 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q920P0 L-xylulose reductase; XR; Dicarbonyl/L-xylulose reductase; EC 1.1.1.10 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
43% identity, 100% coverage: 1:240/241 of query aligns to 3:243/244 of Q920P0

query
sites
Q920P0
M
 
L
S
 
G
F
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
R
T
 
R
V
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
C
 
T
A
 
V
L
 
L
L
 
A
L
 
L
A
 
Q
Q
 
A
R
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
I
 
V
A
 
A
L
 
V
A
 
S
R
 
R
T
 
T
A
 
R
S
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
D
R
 
S
L
 
L
Q
 
V
E
 
R
E
 
E
I
 
C
-
 
P
G
 
G
A
 
V
R
 
E
V
 
P
I
 
V
A
 
C
V
 
V
D
 
D
L
 
L
S
 
A
D
 
D
P
 
W
A
 
E
A
 
A
A
 
T
R
 
E
R
 
Q
A
 
A
M
 
L
A
 
S
E
 
N
A
 
V
G
 
G
T
 
P
A
 
V
D
 
D
F
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
N
S
 
N
A
 
A
G
 
A
I
 
V
N
 
A
V
 
T
L
 
L
E
 
Q
S
 
P
V
 
F
L
 
L
E
 
E
M
 
V
S
 
T
D
 
K
E
 
E
G
 
A
Y
 
C
E
 
D
A
 
T
V
 
S
L
 
F
G
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
F
R
 
R
A
 
A
A
 
V
L
 
V
I
 
Q
T
 
V
C
 
S
Q
 
Q
A
 
I
F
 
V
A
 
A
R
 
R
M
 
G
R
 
M
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
G
 
V
G
 
P
G
 
G
A
 
A
M
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
V
T
 
S
S
|
S
I
x
Q
A
 
A
G
 
S
H
 
Q
R
 
R
G
 
A
F
x
L
E
 
T
Q
 
N
H
|
H
L
 
T
C
 
V
Y
|
Y
A
 
C
A
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
L
E
 
D
G
 
M
A
 
L
T
 
T
R
 
K
V
 
V
L
 
M
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
H
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
N
P
 
P
T
 
T
I
 
V
T
 
V
L
 
M
T
 
T
E
 
P
L
 
M
A
 
G
E
 
R
A
 
A
A
x
N
W
|
W
S
 
S
D
 
D
P
 
P
A
 
H
K
 
K
S
 
A
G
 
K
P
 
V
M
 
M
M
 
L
A
 
D
R
 
R
H
 
I
P
 
P
S
 
L
A
 
G
R
 
K
F
 
F
A
 
A
S
 
E
P
 
V
E
 
E
D
 
N
V
 
V
A
 
V
R
 
D
S
 
T
I
 
I
A
 
L
M
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
P
 
N
D
 
R
A
 
S
A
 
S
M
 
M
L
 
T
N
 
T
G
 
G
A
 
S
V
 
A
V
 
L
P
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A

3d3wA Structure of l-xylulose reductase with bound coenzyme, phosphate and hydroxide. (see paper)
42% identity, 100% coverage: 1:240/241 of query aligns to 3:243/244 of 3d3wA

query
sites
3d3wA
M
 
L
S
 
F
F
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
R
T
 
R
V
 
V
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
|
G
R
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
G
C
 
T
A
 
V
L
 
Q
L
 
A
L
 
L
A
 
H
Q
 
A
R
 
T
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
A
L
 
V
A
x
S
R
|
R
T
|
T
A
 
Q
S
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
D
R
 
S
L
 
L
Q
 
V
E
 
R
E
 
E
I
 
C
-
 
P
G
 
G
A
 
I
R
 
E
V
 
P
I
 
V
A
 
C
V
|
V
D
 
D
L
|
L
S
 
G
D
 
D
P
 
W
A
 
E
A
 
A
A
 
T
R
 
E
R
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
G
E
 
S
A
 
V
G
 
G
T
 
P
A
 
V
D
 
D
F
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
x
A
I
 
V
N
 
A
V
 
L
L
 
L
E
 
Q
S
 
P
V
 
F
L
 
L
E
 
E
M
 
V
S
 
T
D
 
K
E
 
E
G
 
A
Y
 
F
E
 
D
A
 
R
V
 
S
L
 
F
G
 
E
V
|
V
N
 
N
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
V
L
 
I
I
 
Q
T
 
V
C
 
S
Q
 
Q
A
 
I
F
 
V
A
 
A
R
 
R
M
 
G
R
 
L
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
G
 
V
G
 
P
G
 
G
A
 
A
M
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
V
T
x
S
S
|
S
I
 
Q
A
 
C
G
 
S
H
 
Q
R
 
R
G
 
A
F
 
V
E
 
T
Q
 
N
H
|
H
L
 
S
C
 
V
Y
|
Y
A
 
C
A
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
L
E
 
D
G
 
M
A
 
L
T
 
T
R
 
K
V
 
V
L
 
M
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
H
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
N
P
|
P
T
|
T
I
 
V
T
x
V
L
 
M
T
|
T
E
x
S
L
x
M
A
x
G
E
 
Q
A
 
A
A
 
T
W
 
W
S
 
S
D
 
D
P
 
P
A
 
H
K
 
K
S
 
A
G
 
K
P
 
T
M
 
M
M
 
L
A
 
N
R
 
R
H
 
I
P
 
P
S
 
L
A
 
G
R
 
K
F
 
F
A
 
A
S
 
E
P
 
V
E
 
E
D
 
H
V
 
V
A
 
V
R
 
N
S
 
A
I
 
I
A
 
L
M
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
P
 
D
D
 
R
A
 
S
A
 
G
M
 
M
L
 
T
N
 
T
G
 
G
A
 
S
V
 
T
V
 
L
P
 
P
V
 
V
D
 
E
G
 
G
G
 
G
F
 
F
L
 
W
A
 
A

1pr9A Human l-xylulose reductase holoenzyme (see paper)
42% identity, 100% coverage: 1:240/241 of query aligns to 3:243/244 of 1pr9A

query
sites
1pr9A
M
 
L
S
 
F
F
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
R
T
 
R
V
 
V
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
|
G
R
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
G
C
 
T
A
 
V
L
 
Q
L
 
A
L
 
L
A
 
H
Q
 
A
R
 
T
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
A
L
 
V
A
x
S
R
|
R
T
|
T
A
 
Q
S
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
D
R
 
S
L
 
L
Q
 
V
E
 
R
E
 
E
I
 
C
-
 
P
G
 
G
A
 
I
R
 
E
V
 
P
I
 
V
A
 
C
V
 
V
D
 
D
L
|
L
S
 
G
D
 
D
P
 
W
A
 
E
A
 
A
A
 
T
R
 
E
R
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
G
E
 
S
A
 
V
G
 
G
T
 
P
A
 
V
D
 
D
F
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
N
S
x
N
A
 
A
G
x
A
I
 
V
N
 
A
V
 
L
L
 
L
E
 
Q
S
 
P
V
 
F
L
 
L
E
 
E
M
 
V
S
 
T
D
 
K
E
 
E
G
 
A
Y
 
F
E
 
D
A
 
R
V
 
S
L
 
F
G
 
E
V
|
V
N
 
N
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
V
L
 
I
I
 
Q
T
 
V
C
 
S
Q
 
Q
A
 
I
F
 
V
A
 
A
R
 
R
M
 
G
R
 
L
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
G
 
V
G
 
P
G
 
G
A
 
A
M
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
V
T
 
S
S
|
S
I
 
Q
A
x
C
G
 
S
H
 
Q
R
 
R
G
 
A
F
 
V
E
 
T
Q
 
N
H
|
H
L
 
S
C
 
V
Y
|
Y
A
 
C
A
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
L
E
 
D
G
 
M
A
 
L
T
 
T
R
 
K
V
 
V
L
 
M
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
H
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
N
P
 
P
T
|
T
I
 
V
T
x
V
L
 
M
T
|
T
E
 
S
L
x
M
A
 
G
E
 
Q
A
 
A
A
 
T
W
 
W
S
 
S
D
 
D
P
 
P
A
 
H
K
 
K
S
 
A
G
 
K
P
 
T
M
 
M
M
 
L
A
 
N
R
 
R
H
 
I
P
 
P
S
 
L
A
 
G
R
 
K
F
 
F
A
 
A
S
 
E
P
 
V
E
 
E
D
 
H
V
 
V
A
 
V
R
 
N
S
 
A
I
 
I
A
 
L
M
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
P
 
D
D
 
R
A
 
S
A
 
G
M
 
M
L
 
T
N
 
T
G
 
G
A
 
S
V
 
T
V
 
L
P
 
P
V
 
V
D
 
E
G
 
G
G
 
G
F
 
F
L
 
W
A
 
A

Q7Z4W1 L-xylulose reductase; XR; Carbonyl reductase II; Dicarbonyl/L-xylulose reductase; Kidney dicarbonyl reductase; kiDCR; Short chain dehydrogenase/reductase family 20C member 1; Sperm surface protein P34H; EC 1.1.1.10 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
42% identity, 100% coverage: 1:240/241 of query aligns to 3:243/244 of Q7Z4W1

query
sites
Q7Z4W1
M
 
L
S
 
F
F
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
R
T
 
R
V
 
V
I
x
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
R
x
K
G
|
G
I
|
I
G
|
G
R
|
R
A
x
G
C
x
T
A
x
V
L
x
Q
L
x
A
L
|
L
A
x
H
Q
x
A
R
x
T
G
|
G
A
|
A
Q
x
R
V
|
V
I
x
V
A
|
A
L
x
V
A
x
S
R
|
R
T
|
T
A
 
Q
S
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
D
R
 
S
L
 
L
Q
 
V
E
 
R
E
 
E
I
 
C
-
 
P
G
 
G
A
 
I
R
 
E
V
 
P
I
 
V
A
 
C
V
 
V
D
 
D
L
 
L
S
 
G
D
 
D
P
 
W
A
 
E
A
 
A
A
 
T
R
 
E
R
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
G
E
 
S
A
 
V
G
 
G
T
 
P
A
 
V
D
 
D
F
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
N
S
 
N
A
 
A
G
 
A
I
 
V
N
 
A
V
 
L
L
 
L
E
 
Q
S
 
P
V
 
F
L
 
L
E
 
E
M
 
V
S
 
T
D
 
K
E
 
E
G
 
A
Y
 
F
E
 
D
A
 
R
V
 
S
L
 
F
G
 
E
V
 
V
N
|
N
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
V
L
 
I
I
 
Q
T
 
V
C
 
S
Q
 
Q
A
 
I
F
 
V
A
 
A
R
 
R
M
 
G
R
 
L
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
G
 
V
G
 
P
G
 
G
A
 
A
M
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
V
T
 
S
S
|
S
I
 
Q
A
 
C
G
 
S
H
 
Q
R
 
R
G
 
A
F
 
V
E
 
T
Q
 
N
H
 
H
L
 
S
C
 
V
Y
 
Y
A
 
C
A
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
L
E
 
D
G
 
M
A
 
L
T
 
T
R
 
K
V
 
V
L
 
M
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
H
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
N
P
 
P
T
 
T
I
 
V
T
 
V
L
 
M
T
 
T
E
 
S
L
 
M
A
 
G
E
 
Q
A
 
A
A
 
T
W
 
W
S
 
S
D
 
D
P
 
P
A
 
H
K
 
K
S
 
A
G
 
K
P
 
T
M
 
M
M
 
L
A
 
N
R
 
R
H
 
I
P
 
P
S
 
L
A
 
G
R
 
K
F
 
F
A
 
A
S
 
E
P
 
V
E
 
E
D
 
H
V
 
V
A
 
V
R
 
N
S
 
A
I
 
I
A
 
L
M
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
P
 
D
D
 
R
A
 
S
A
 
G
M
 
M
L
 
T
N
 
T
G
 
G
A
 
S
V
 
T
V
 
L
P
 
P
V
 
V
D
 
E
G
 
G
G
 
G
F
 
F
L
 
W
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1cydA Carbonyl reductase complexed with NADPH and 2-propanol (see paper)
38% identity, 100% coverage: 1:240/241 of query aligns to 1:241/242 of 1cydA

query
sites
1cydA
M
 
L
S
 
N
F
 
F
A
 
S
G
 
G
K
 
L
T
 
R
V
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
|
G
R
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
D
C
 
T
A
 
V
L
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
H
Q
 
A
R
 
S
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
A
L
 
V
A
 
T
R
|
R
T
|
T
A
 
N
S
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
V
R
 
S
L
 
L
Q
 
A
E
 
K
E
 
E
I
 
C
-
 
P
G
 
G
A
 
I
R
 
E
V
 
P
I
 
V
A
 
C
V
 
V
D
|
D
L
|
L
S
 
G
D
 
D
P
 
W
A
 
D
A
 
A
A
 
T
R
 
E
R
 
K
A
 
A
M
 
L
A
 
G
E
 
G
A
 
I
G
 
G
T
 
P
A
 
V
D
 
D
F
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
N
S
x
N
A
 
A
G
x
A
I
 
L
N
 
V
V
 
I
L
 
M
E
 
Q
S
 
P
V
 
F
L
 
L
E
 
E
M
 
V
S
 
T
D
 
K
E
 
E
G
 
A
Y
 
F
E
 
D
A
 
R
V
 
S
L
 
F
G
 
S
V
|
V
N
 
N
L
 
L
R
 
R
A
 
S
A
 
V
L
 
F
I
 
Q
T
 
V
C
 
S
Q
 
Q
A
 
M
F
 
V
A
 
A
R
 
R
M
 
D
R
 
M
I
 
I
A
 
N
Q
 
R
G
 
G
G
 
V
G
 
P
G
 
G
A
 
S
M
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
V
T
 
S
S
|
S
I
 
M
A
 
V
G
 
A
H
 
H
R
 
V
G
 
T
F
 
F
E
 
P
Q
 
N
H
x
L
L
 
I
C
 
T
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
M
E
 
T
G
 
M
A
 
L
T
 
T
R
 
K
V
 
A
L
 
M
A
 
A
R
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
H
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
N
P
|
P
T
|
T
I
x
V
T
x
V
L
 
L
T
|
T
E
 
D
L
x
M
A
x
G
E
 
K
A
 
K
A
x
V
W
 
S
S
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
E
K
 
F
S
 
A
G
 
R
P
 
K
M
 
L
M
 
K
A
 
E
R
 
R
H
 
H
P
 
P
S
 
L
A
 
R
R
 
K
F
 
F
A
 
A
S
 
E
P
 
V
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
V
R
 
N
S
 
S
I
 
I
A
 
L
M
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
P
 
D
D
 
R
A
 
S
A
 
A
M
 
S
L
 
T
N
 
S
G
 
G
A
 
G
V
 
G
V
 
I
P
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
A
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
A
 
A

P08074 Carbonyl reductase [NADPH] 2; Adipocyte protein P27; AP27; Lung carbonyl reductase; LCR; NADPH-dependent carbonyl reductase 2; EC 1.1.1.184 from Mus musculus (Mouse) (see 2 papers)
38% identity, 100% coverage: 1:240/241 of query aligns to 3:243/244 of P08074

query
sites
P08074
M
 
L
S
 
N
F
 
F
A
 
S
G
 
G
K
 
L
T
 
R
V
 
A
I
x
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
R
x
K
G
|
G
I
|
I
G
|
G
R
|
R
A
x
D
C
x
T
A
x
V
L
x
K
L
x
A
L
|
L
A
x
H
Q
x
A
R
x
S
G
|
G
A
|
A
Q
x
K
V
|
V
I
x
V
A
|
A
L
x
V
A
x
T
R
|
R
T
 
T
A
 
N
S
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
V
R
 
S
L
 
L
Q
 
A
E
 
K
E
 
E
I
 
C
-
 
P
G
 
G
A
 
I
R
 
E
V
 
P
I
 
V
A
 
C
V
 
V
D
 
D
L
 
L
S
 
G
D
 
D
P
 
W
A
 
D
A
 
A
A
 
T
R
 
E
R
 
K
A
 
A
M
 
L
A
 
G
E
 
G
A
 
I
G
 
G
T
 
P
A
 
V
D
 
D
F
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
N
S
 
N
A
 
A
G
 
A
I
 
L
N
 
V
V
 
I
L
 
M
E
 
Q
S
 
P
V
 
F
L
 
L
E
 
E
M
 
V
S
 
T
D
 
K
E
 
E
G
 
A
Y
 
F
E
 
D
A
 
R
V
 
S
L
 
F
G
 
S
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
R
A
 
S
A
 
V
L
 
F
I
 
Q
T
 
V
C
 
S
Q
 
Q
A
 
M
F
 
V
A
 
A
R
 
R
M
 
D
R
 
M
I
 
I
A
 
N
Q
 
R
G
 
G
G
 
V
G
 
P
G
 
G
A
 
S
M
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
V
T
 
S
S
 
S
I
 
M
A
 
V
G
 
A
H
 
H
R
 
V
G
 
T
F
 
F
E
 
P
Q
 
N
H
 
L
L
 
I
C
 
T
Y
 
Y
A
 
S
A
 
S
S
 
T
K
 
K
A
 
G
G
 
A
L
 
M
E
 
T
G
 
M
A
 
L
T
 
T
R
 
K
V
 
A
L
 
M
A
 
A
R
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
H
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
N
P
 
P
T
 
T
I
 
V
T
 
V
L
 
L
T
 
T
E
 
D
L
 
M
A
 
G
E
 
K
A
 
K
A
 
V
W
 
S
S
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
E
K
 
F
S
 
A
G
 
R
P
 
K
M
 
L
M
 
K
A
 
E
R
 
R
H
 
H
P
 
P
S
 
L
A
 
R
R
 
K
F
 
F
A
 
A
S
 
E
P
 
V
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
V
R
 
N
S
 
S
I
 
I
A
 
L
M
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
P
 
D
D
 
R
A
 
S
A
 
A
M
 
S
L
 
T
N
 
S
G
 
G
A
 
G
V
 
G
V
 
I
P
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
A
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
A
 
A

4hp8B Crystal structure of a putative 2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase from agrobacterium tumefaciens (target efi-506435) with bound NADP
38% identity, 100% coverage: 1:240/241 of query aligns to 4:245/246 of 4hp8B

query
sites
4hp8B
M
 
F
S
 
S
F
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
R
T
 
K
V
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
N
R
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
C
 
I
A
 
A
L
 
V
L
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
R
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
E
V
 
V
I
 
V
A
 
C
L
 
A
A
 
A
R
|
R
T
x
R
A
 
A
S
 
P
D
 
D
-
 
E
-
 
T
L
 
L
A
 
D
R
 
I
L
 
I
Q
 
A
E
 
K
E
 
D
I
 
G
G
 
G
-
 
N
A
 
A
R
 
S
V
 
A
I
 
L
A
 
L
V
 
I
D
|
D
L
x
F
S
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
 
D
A
 
S
M
 
F
A
 
T
E
 
D
A
 
A
G
 
G
T
 
F
A
 
-
D
 
D
F
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
S
x
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
N
 
I
V
 
R
L
 
R
E
 
A
S
 
D
V
 
S
L
 
V
E
 
E
M
 
F
S
 
S
D
 
E
E
 
L
G
 
D
Y
 
W
E
 
D
A
 
E
V
 
V
L
 
M
G
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
L
L
 
F
I
 
F
T
 
T
C
 
T
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
K
M
 
E
R
 
L
I
 
L
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
G
 
R
G
 
S
G
 
G
A
 
K
M
 
V
V
 
V
N
 
N
I
|
I
T
 
A
S
|
S
I
 
L
A
 
L
G
 
S
H
 
F
R
 
Q
G
 
G
F
 
G
E
 
I
Q
 
R
H
x
V
L
 
P
C
 
S
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
L
 
V
E
 
A
G
 
G
A
 
L
T
 
T
R
 
K
V
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
N
E
 
E
L
 
W
G
 
A
P
 
A
H
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
A
P
|
P
T
x
G
I
 
Y
T
x
I
L
 
E
T
|
T
E
 
N
L
x
N
A
x
T
E
 
E
A
 
A
A
 
L
W
 
R
S
 
A
D
 
D
P
 
A
A
 
A
K
 
R
S
 
N
G
 
K
P
 
A
M
 
I
M
 
L
A
 
E
R
 
R
H
 
I
P
 
P
S
 
A
A
 
G
R
 
R
F
 
W
A
 
G
S
 
H
P
 
S
E
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
R
 
G
S
 
A
I
 
A
A
 
V
M
 
F
L
 
L
L
 
S
S
 
S
P
 
A
D
 
A
A
 
A
A
 
D
M
 
Y
L
 
V
N
 
H
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
L
P
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
W
L
 
L
A
 
A

7do7A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NAD and l-rhamnose bound-form) (see paper)
40% identity, 97% coverage: 6:239/241 of query aligns to 6:252/256 of 7do7A

query
sites
7do7A
K
 
K
T
 
T
V
 
V
I
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
C
 
A
A
 
A
L
 
R
L
 
E
L
 
C
A
 
A
Q
 
R
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
-
L
 
I
A
 
G
R
 
H
T
x
S
A
 
G
S
 
S
D
 
D
L
 
E
A
 
G
R
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
S
L
 
L
Q
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
I
-
 
A
-
 
A
-
 
F
G
 
G
A
 
G
R
 
T
V
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
-
 
G
-
 
A
D
|
D
L
x
A
S
 
A
D
 
D
P
 
L
A
 
D
A
 
S
A
 
G
R
 
E
R
 
K
A
 
L
M
 
V
A
 
A
E
 
A
A
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
F
G
 
G
T
 
S
A
 
V
D
 
D
F
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
N
 
C
V
 
P
L
x
F
E
 
H
S
 
S
V
 
F
L
 
L
E
 
D
M
 
M
S
 
P
D
 
R
E
 
E
G
 
L
Y
 
Y
E
 
L
A
 
K
V
 
T
L
 
V
G
 
G
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
N
A
 
G
A
 
A
L
 
Y
I
 
F
T
 
T
C
 
V
Q
 
Q
A
 
A
F
 
A
A
 
A
R
 
R
M
 
R
R
 
M
I
 
K
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
G
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
M
 
I
V
 
I
N
 
A
I
x
V
T
x
S
S
|
S
I
 
I
A
x
S
G
 
A
H
 
L
R
 
V
G
 
G
F
 
G
E
 
A
Q
 
M
H
x
Q
L
 
T
C
 
H
Y
|
Y
A
 
T
A
 
P
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
L
G
 
S
A
 
L
T
 
M
R
 
Q
V
 
S
L
 
C
A
 
A
R
 
I
E
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
L
P
|
P
T
x
G
I
 
T
T
x
I
L
 
A
T
|
T
E
 
D
L
x
I
A
x
N
E
 
K
A
 
E
A
 
D
W
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
L
A
 
E
K
 
K
S
 
R
G
 
E
P
 
R
M
 
M
M
 
T
A
 
S
R
 
R
H
 
V
P
 
P
S
 
L
A
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
S
 
E
P
 
P
E
 
D
D
 
D
V
 
L
A
 
A
R
 
G
S
 
P
I
 
I
A
 
V
M
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
x
D
D
x
M
A
 
A
A
x
R
M
 
Y
L
 
V
N
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
S
V
 
L
P
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
L
L
 
F

7b81A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1-dehydrogenase (NAD bound-form) (see paper)
40% identity, 97% coverage: 6:239/241 of query aligns to 6:252/256 of 7b81A

query
sites
7b81A
K
 
K
T
 
T
V
 
V
I
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
C
 
A
A
 
A
L
 
R
L
 
E
L
 
C
A
 
A
Q
 
R
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
-
L
 
I
A
 
G
R
 
H
T
 
S
A
 
G
S
 
S
D
 
D
L
 
E
A
 
G
R
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
S
L
 
L
Q
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
I
-
 
A
-
 
A
-
 
F
G
 
G
A
 
G
R
 
T
V
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
-
 
G
-
 
A
D
|
D
L
x
A
S
 
A
D
 
D
P
 
L
A
 
D
A
 
S
A
 
G
R
 
E
R
 
K
A
 
L
M
 
V
A
 
A
E
 
A
A
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
F
G
 
G
T
 
S
A
 
V
D
 
D
F
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
N
 
C
V
 
P
L
 
F
E
 
H
S
 
S
V
 
F
L
 
L
E
 
D
M
 
M
S
 
P
D
 
R
E
 
E
G
 
L
Y
 
Y
E
 
L
A
 
K
V
 
T
L
 
V
G
 
G
V
x
T
N
 
N
L
 
L
R
 
N
A
 
G
A
 
A
L
 
Y
I
 
F
T
 
T
C
 
V
Q
 
Q
A
 
A
F
 
A
A
 
A
R
 
R
M
 
R
R
 
M
I
 
K
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
G
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
M
 
I
V
 
I
N
 
A
I
x
V
T
 
S
S
|
S
I
 
I
A
 
S
G
 
A
H
 
L
R
 
V
G
 
G
F
 
G
E
 
A
Q
 
M
H
 
Q
L
 
T
C
 
H
Y
|
Y
A
 
T
A
 
P
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
L
G
 
S
A
 
L
T
 
M
R
 
Q
V
 
S
L
 
C
A
 
A
R
 
I
E
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
L
P
|
P
T
x
G
I
 
T
T
x
I
L
 
A
T
|
T
E
 
D
L
x
I
A
 
N
E
 
K
A
 
E
A
 
D
W
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
L
A
 
E
K
 
K
S
 
R
G
 
E
P
 
R
M
 
M
M
 
T
A
 
S
R
 
R
H
 
V
P
 
P
S
 
L
A
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
S
 
E
P
 
P
E
 
D
D
 
D
V
 
L
A
 
A
R
 
G
S
 
P
I
 
I
A
 
V
M
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
D
D
 
M
A
 
A
A
 
R
M
 
Y
L
 
V
N
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
S
V
 
L
P
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
L
L
 
F

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
35% identity, 100% coverage: 1:241/241 of query aligns to 1:244/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
M
 
M
S
 
N
F
 
F
A
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
V
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
x
S
R
|
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
C
 
I
A
 
A
L
 
E
L
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
T
A
 
A
R
x
T
T
 
S
A
 
E
S
 
N
D
 
G
L
 
A
A
 
Q
R
 
A
L
 
I
Q
 
S
E
 
D
E
 
Y
I
 
L
G
 
G
A
 
A
-
 
N
-
 
G
R
 
K
V
 
G
I
 
L
A
 
M
V
 
L
D
x
N
L
x
V
S
 
T
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
S
A
 
I
R
 
E
R
 
S
A
 
V
M
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
I
-
 
R
A
 
A
E
 
E
A
 
F
G
 
G
T
 
E
A
 
V
D
 
D
F
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
S
x
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
R
L
 
D
E
 
N
S
 
L
V
 
L
L
 
M
E
 
R
M
 
M
S
 
K
D
 
D
E
 
E
G
 
E
Y
 
W
E
 
N
A
 
D
V
 
I
L
 
I
G
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
S
A
 
S
A
 
V
L
 
F
I
 
R
T
 
L
C
 
S
Q
 
K
A
 
A
F
 
V
A
 
M
R
 
R
M
 
A
R
 
M
I
 
M
A
 
K
Q
 
K
G
 
-
G
 
R
G
 
H
G
 
G
A
 
R
M
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
T
 
G
S
 
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
H
 
T
R
 
M
G
 
G
F
 
N
E
 
G
Q
 
G
H
 
Q
L
 
A
C
 
N
Y
|
Y
A
|
A
A
|
A
S
x
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
I
G
 
G
A
 
F
T
 
S
R
 
K
V
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
P
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
T
 
G
I
 
F
T
x
I
L
 
E
T
 
T
E
 
D
L
 
M
A
 
T
E
 
R
A
 
-
A
 
A
W
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
D
A
 
Q
K
 
R
S
 
A
G
 
G
P
 
-
M
 
I
M
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
V
P
 
P
S
 
A
A
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
S
 
G
P
 
A
E
 
Q
D
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
A
M
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
Y
L
 
I
N
 
T
G
 
G
A
x
E
V
 
T
V
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
M
L
 
Y
A
 
M
V
 
V

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
34% identity, 100% coverage: 1:241/241 of query aligns to 1:244/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
M
 
M
S
 
S
F
 
F
A
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
V
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
C
 
I
A
 
A
L
 
E
L
 
T
L
 
L
A
 
V
Q
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
T
A
 
A
R
x
T
T
 
S
A
 
E
S
 
S
D
 
G
L
 
A
A
 
Q
R
 
A
L
 
I
Q
 
S
E
 
D
E
 
Y
I
 
L
G
 
G
A
 
A
-
 
N
-
 
G
R
 
K
V
 
G
I
 
L
A
 
M
V
x
L
D
x
N
L
x
V
S
 
T
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
S
A
 
I
R
 
E
R
 
S
A
 
V
M
 
L
-
 
E
-
 
N
-
 
V
-
 
R
A
 
A
E
 
E
A
 
F
G
 
G
T
 
E
A
 
V
D
 
D
F
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
S
 
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
N
 
T
V
 
R
L
 
D
E
 
N
S
 
L
V
 
L
L
 
M
E
 
R
M
 
M
S
 
K
D
 
D
E
 
D
G
 
E
Y
 
W
E
 
N
A
 
D
V
 
I
L
 
I
G
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
S
A
 
S
A
 
V
L
 
F
I
 
R
T
 
L
C
 
S
Q
 
K
A
 
A
F
 
V
A
 
M
R
 
R
M
 
A
R
 
M
I
 
M
A
 
K
Q
 
K
G
 
-
G
 
R
G
 
H
G
 
G
A
 
R
M
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
T
 
G
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
H
 
T
R
 
M
G
 
G
F
 
N
E
 
A
Q
 
G
H
 
Q
L
 
A
C
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
I
G
 
G
A
 
F
T
 
S
R
 
K
V
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
P
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
T
 
G
I
 
F
T
 
I
L
 
E
T
 
T
E
 
D
L
 
M
A
 
T
E
 
R
A
 
-
A
 
A
W
 
L
S
 
T
D
 
D
P
 
E
A
 
Q
K
 
R
S
 
A
G
 
G
P
 
T
M
 
L
M
 
A
A
 
A
R
 
-
H
 
V
P
 
P
S
 
A
A
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
S
 
T
P
 
P
E
 
N
D
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
S
S
 
A
I
 
V
A
 
A
M
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
S
M
 
Y
L
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
E
V
 
T
V
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
M
L
 
Y
A
 
M
V
 
V

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
34% identity, 100% coverage: 1:241/241 of query aligns to 1:244/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
M
 
M
S
 
S
F
 
F
A
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
V
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
C
 
I
A
 
A
L
 
E
L
 
T
L
 
L
A
 
V
Q
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
T
A
 
A
R
 
T
T
 
S
A
 
E
S
 
N
D
 
G
L
 
A
A
 
K
R
 
N
L
 
I
Q
 
S
E
 
D
E
 
Y
I
 
L
G
 
G
A
 
A
-
 
N
-
 
G
R
 
K
V
 
G
I
 
L
A
 
M
V
 
L
D
 
N
L
 
V
S
 
T
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
S
A
 
I
R
 
E
R
 
S
A
 
V
M
 
L
-
 
E
-
 
N
-
 
I
-
 
R
A
 
A
E
 
E
A
 
F
G
 
G
T
 
E
A
 
V
D
 
D
F
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
S
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
R
L
 
D
E
 
N
S
 
L
V
 
L
L
 
M
E
 
R
M
 
M
S
 
K
D
 
D
E
 
D
G
 
E
Y
 
W
E
 
N
A
 
D
V
 
I
L
 
I
G
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
S
A
 
S
A
 
V
L
 
F
I
 
R
T
 
L
C
 
S
Q
 
K
A
 
A
F
 
V
A
 
M
R
 
R
M
 
A
R
x
M
I
 
M
A
 
K
Q
 
K
G
 
R
G
 
C
G
 
G
G
 
-
A
 
R
M
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
T
 
G
S
 
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
H
 
T
R
 
M
G
 
G
F
 
N
E
 
A
Q
 
G
H
 
Q
L
 
A
C
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
I
G
 
G
A
 
F
T
 
S
R
 
K
V
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
P
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
T
 
G
I
 
F
T
 
I
L
 
E
T
 
T
E
 
D
L
 
M
A
 
T
E
 
R
A
 
-
A
 
A
W
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
D
A
 
Q
K
 
R
S
 
A
G
 
G
P
 
-
M
 
I
M
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
V
P
 
P
S
 
A
A
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
S
 
G
P
 
A
E
 
Q
D
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
S
S
 
A
I
 
V
A
 
A
M
 
F
L
 
L
L
x
A
S
|
S
P
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
S
M
 
Y
L
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
E
V
 
T
V
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
M
L
 
Y
A
 
M
V
 
V

4za2D Crystal structure of pectobacterium carotovorum 2-keto-3-deoxy-d- gluconate dehydrogenase complexed with NAD+ (see paper)
32% identity, 100% coverage: 1:240/241 of query aligns to 6:246/247 of 4za2D

query
sites
4za2D
M
 
F
S
 
D
F
 
L
A
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
C
G
x
D
R
 
T
G
 
G
I
x
L
G
 
G
R
 
Q
A
 
G
C
 
M
A
 
A
L
 
I
L
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
R
 
A
G
 
G
A
 
C
Q
 
D
V
 
I
I
 
V
A
 
G
L
 
V
A
 
N
R
x
I
T
 
V
A
 
E
-
 
P
S
 
K
D
 
D
L
 
T
A
 
I
R
 
E
L
 
K
Q
 
V
E
 
T
E
 
A
I
 
L
G
 
G
A
 
R
R
 
R
V
 
F
I
 
L
A
 
S
V
 
L
-
 
T
-
 
A
D
|
D
L
x
M
S
 
S
D
 
N
P
 
V
A
 
S
A
 
G
-
 
H
-
 
A
-
 
E
-
 
L
A
 
V
R
 
E
R
 
K
A
 
A
M
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
F
G
 
G
T
 
H
A
 
V
D
 
D
F
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
N
 
I
V
 
R
L
 
R
E
 
E
S
 
D
V
 
A
L
 
I
E
 
E
M
 
F
S
 
S
D
 
E
E
 
K
G
 
N
Y
 
W
E
 
D
A
 
D
V
 
V
L
 
M
G
 
N
V
x
L
N
 
N
L
 
I
R
 
K
A
 
S
A
 
V
L
 
F
I
 
F
T
 
M
C
 
S
Q
 
Q
A
 
T
F
 
V
A
 
A
R
 
R
M
 
Q
R
 
F
I
 
I
A
 
K
Q
 
Q
G
 
G
G
 
K
G
 
G
G
 
G
A
 
K
M
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
T
 
A
S
|
S
I
 
M
A
 
L
G
 
S
H
 
F
R
 
Q
G
 
G
F
 
G
E
 
I
Q
 
R
H
 
V
L
 
P
C
 
S
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
S
G
 
A
L
 
V
E
 
M
G
 
G
A
 
V
T
 
T
R
 
R
V
 
L
L
 
M
A
 
A
R
 
N
E
 
E
L
 
W
G
 
A
P
 
K
H
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
A
P
 
P
T
x
G
I
 
Y
T
x
M
L
 
A
T
|
T
E
 
N
L
x
N
A
 
T
E
 
Q
A
 
-
A
 
-
W
 
-
S
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
E
K
 
R
S
 
S
G
 
K
P
 
E
M
 
I
M
 
L
A
 
D
R
 
R
H
 
I
P
 
P
S
 
A
A
 
G
R
 
R
F
 
W
A
 
G
S
 
L
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
V
 
L
A
 
M
R
 
G
S
 
P
I
 
S
A
 
V
M
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
S
D
 
A
A
 
S
A
 
D
M
 
Y
L
 
I
N
 
N
G
 
G
A
 
Y
V
 
T
V
 
I
P
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
W
L
 
L
A
 
A

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
33% identity, 100% coverage: 1:241/241 of query aligns to 4:247/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
M
 
M
S
 
N
F
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
R
|
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
C
 
I
A
 
A
L
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
T
A
 
A
R
x
T
T
 
S
A
 
E
S
 
S
D
 
G
L
 
A
A
 
Q
R
 
A
L
 
I
Q
 
S
E
 
D
E
 
Y
I
 
L
G
 
G
-
 
D
-
 
N
A
 
G
R
 
K
V
 
G
I
 
M
A
 
A
V
 
L
D
x
N
L
x
V
S
 
T
D
 
N
P
 
P
-
 
E
-
 
S
-
 
I
-
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
L
R
 
K
R
 
A
A
 
I
M
 
T
A
 
D
E
 
E
A
 
F
G
 
G
T
 
G
A
 
V
D
 
D
F
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
N
 
T
V
 
R
L
 
D
E
 
N
S
 
L
V
 
L
L
 
M
E
 
R
M
 
M
S
 
K
D
 
E
E
 
E
G
 
E
Y
 
W
E
 
S
A
 
D
V
 
I
L
 
M
G
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
T
A
 
S
A
 
I
L
 
F
I
 
R
T
 
L
C
 
S
Q
 
K
A
 
A
F
 
V
A
 
L
R
 
R
-
 
G
-
 
M
M
 
M
R
 
K
I
 
K
A
 
R
Q
 
Q
G
 
G
G
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
R
M
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
V
T
 
G
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
H
 
T
R
 
M
G
 
G
F
 
N
E
 
A
Q
 
G
H
 
Q
L
 
A
C
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
E
 
I
G
 
G
A
 
F
T
 
T
R
 
K
V
 
S
L
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
P
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
A
P
|
P
T
x
G
I
 
F
T
x
I
L
 
E
T
|
T
E
 
D
L
x
M
A
 
T
E
 
K
A
 
-
A
 
A
W
 
L
S
 
N
D
 
D
P
 
E
A
 
Q
K
 
R
S
 
T
G
 
A
P
 
T
M
 
-
M
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
V
P
 
P
S
 
A
A
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
S
 
D
P
 
P
E
 
R
D
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
S
S
 
A
I
 
V
A
 
A
M
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
P
D
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
Y
L
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
E
V
 
T
V
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
M
L
 
Y
A
 
M
V
 
I

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
35% identity, 100% coverage: 2:241/241 of query aligns to 1:243/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
S
 
N
F
 
F
A
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
V
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
C
 
I
A
 
A
L
 
E
L
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
T
A
 
A
R
x
T
T
 
S
A
 
E
S
 
N
D
 
G
L
 
A
A
 
Q
R
 
A
L
 
I
Q
 
S
E
 
D
E
 
Y
I
 
L
G
 
G
A
 
A
-
 
N
-
 
G
R
 
K
V
 
G
I
 
L
A
 
M
V
 
L
D
x
N
L
x
V
S
 
T
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
S
A
 
I
R
 
E
R
 
S
A
 
V
M
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
I
-
 
R
A
 
A
E
 
E
A
 
F
G
 
G
T
 
E
A
 
V
D
 
D
F
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
N
 
T
V
 
R
L
 
D
E
 
N
S
 
L
V
 
L
L
 
M
E
 
R
M
 
M
S
 
K
D
 
D
E
 
E
G
x
E
Y
 
W
E
 
N
A
 
D
V
 
I
L
 
I
G
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
S
A
 
S
A
 
V
L
 
F
I
 
R
T
 
L
C
 
S
Q
 
K
A
 
A
F
 
V
A
 
M
R
 
R
M
 
A
R
 
M
I
 
M
A
 
K
Q
 
K
G
 
R
G
 
H
G
 
G
G
 
-
A
 
R
M
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
T
 
G
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
H
 
T
R
 
M
G
 
G
F
 
N
E
 
G
Q
 
G
H
x
Q
L
 
A
C
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
I
G
 
G
A
 
F
T
 
S
R
 
K
V
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
P
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
|
P
T
x
G
I
 
F
T
x
I
L
 
E
T
 
T
E
 
D
L
 
M
A
 
T
E
 
R
A
 
-
A
 
A
W
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
D
A
 
Q
K
 
R
S
 
A
G
 
G
P
 
-
M
 
I
M
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
V
P
 
P
S
 
A
A
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
S
 
G
P
 
A
E
 
Q
D
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
A
M
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
Y
L
 
I
N
 
T
G
 
G
A
x
E
V
x
T
V
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
M
L
 
Y
A
 
M
V
 
V

5t2uA Short chain dehydrogenase/reductase family protein (see paper)
35% identity, 100% coverage: 1:241/241 of query aligns to 2:241/241 of 5t2uA

query
sites
5t2uA
M
 
M
S
 
E
F
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
L
T
 
T
V
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
T
R
 
S
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
C
 
S
A
 
A
L
 
R
L
 
L
L
 
M
A
 
A
Q
 
A
R
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
V
 
V
I
 
V
A
 
I
L
 
T
A
 
G
R
|
R
T
x
D
A
 
A
S
 
Q
D
x
R
L
 
G
A
 
E
R
 
Q
L
 
A
Q
 
A
E
 
A
E
 
D
I
 
I
G
 
G
-
 
H
-
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
F
I
 
V
A
 
Q
V
 
A
D
|
D
L
|
L
S
 
G
D
 
D
P
 
L
A
 
D
A
 
S
A
 
V
R
 
A
R
 
D
A
 
L
M
 
A
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
G
 
P
T
 
D
A
 
V
D
 
D
F
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
N
x
Y
V
 
P
L
 
Q
E
 
A
S
 
S
V
 
T
L
 
F
E
 
D
M
 
Q
S
 
D
D
 
V
E
 
A
G
 
G
Y
 
F
E
 
Q
A
 
Q
V
 
L
L
 
F
G
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
V
R
 
R
A
 
G
A
 
T
L
 
Y
I
 
F
T
 
L
C
 
V
Q
 
A
A
 
A
F
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
G
R
 
M
I
 
V
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
G
 
H
G
 
G
G
 
-
A
 
S
M
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
T
 
T
S
x
T
I
 
L
A
 
A
G
 
A
H
 
H
R
 
K
G
 
G
F
 
F
E
 
P
Q
 
G
H
x
T
L
 
S
C
 
V
Y
|
Y
A
 
G
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
S
A
 
L
T
 
T
R
 
R
V
 
T
L
 
W
A
 
A
R
 
A
E
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
A
H
 
N
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
S
P
|
P
T
 
G
I
x
P
T
|
T
L
 
R
T
|
T
E
 
P
L
x
T
A
x
T
E
 
L
A
 
E
A
 
Q
W
 
L
S
 
G
D
 
D
P
 
F
A
 
I
K
 
D
S
 
D
G
 
-
P
 
-
M
 
V
M
 
A
A
 
A
R
 
G
H
 
L
P
 
P
S
 
L
A
 
R
R
 
R
F
 
T
A
 
A
S
 
A
P
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
Q
S
 
A
I
 
V
A
 
L
M
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
P
D
 
R
A
 
A
A
 
S
M
 
F
L
 
V
N
 
T
G
 
G
A
 
S
V
 
T
V
 
L
P
 
Y
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
G
L
 
Y
A
 
A
V
 
V

1q7cA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase y151f mutant in complex with NADPH fragment (see paper)
34% identity, 100% coverage: 2:241/241 of query aligns to 1:243/243 of 1q7cA

query
sites
1q7cA
S
 
N
F
 
F
A
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
V
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
C
 
I
A
 
A
L
 
E
L
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
T
A
|
A
R
x
T
T
 
S
A
 
E
S
 
N
D
 
G
L
 
A
A
 
Q
R
 
A
L
 
I
Q
 
S
E
 
D
E
 
Y
I
 
L
G
 
G
A
 
A
-
 
N
-
 
G
R
 
K
V
 
G
I
 
L
A
 
M
V
x
L
D
x
N
L
x
V
S
 
T
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
S
A
 
I
R
 
E
R
 
S
A
 
V
M
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
I
-
 
R
A
 
A
E
 
E
A
 
F
G
 
G
T
 
E
A
 
V
D
 
D
F
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
S
 
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
N
 
T
V
 
R
L
 
D
E
 
N
S
 
L
V
 
L
L
 
M
E
 
R
M
 
M
S
 
K
D
 
D
E
 
E
G
 
E
Y
 
W
E
 
N
A
 
D
V
 
I
L
 
I
G
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
S
A
 
S
A
 
V
L
 
F
I
 
R
T
 
L
C
 
S
Q
 
K
A
 
A
F
 
V
A
 
M
R
 
R
M
 
A
R
 
M
I
 
M
A
 
K
Q
 
K
G
 
R
G
 
H
G
 
G
G
 
-
A
 
R
M
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
T
 
G
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
H
 
T
R
 
M
G
 
G
F
 
N
E
 
G
Q
 
G
H
x
Q
L
 
A
C
 
N
Y
x
F
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
I
G
 
G
A
 
F
T
 
S
R
 
K
V
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
P
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
T
 
G
I
 
F
T
 
I
L
 
E
T
 
T
E
 
D
L
 
M
A
 
T
E
 
R
A
 
-
A
 
A
W
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
D
A
 
Q
K
 
R
S
 
A
G
 
G
P
 
-
M
 
I
M
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
V
P
 
P
S
 
A
A
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
S
 
G
P
 
A
E
 
Q
D
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
A
M
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
Y
L
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
E
V
 
T
V
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
M
L
 
Y
A
 
M
V
 
V

2d1yA Crystal structure of tt0321 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
38% identity, 99% coverage: 3:240/241 of query aligns to 3:238/240 of 2d1yA

query
sites
2d1yA
F
 
F
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
G
V
 
V
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
A
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
C
 
I
A
 
A
L
 
Q
L
 
A
L
 
F
A
 
A
Q
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
-
V
 
L
I
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
C
R
x
D
T
x
L
A
x
R
S
 
P
D
 
E
L
 
G
A
 
K
R
 
E
L
 
V
Q
 
A
E
 
E
E
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
G
R
 
A
V
 
F
I
 
F
A
 
Q
V
|
V
D
|
D
L
|
L
S
 
E
D
 
D
P
 
E
A
 
R
A
 
E
A
 
R
R
 
V
R
 
R
A
 
F
M
 
V
A
 
E
E
 
E
A
 
A
-
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
 
L
G
 
G
T
 
R
A
 
V
D
 
D
F
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
x
A
I
|
I
N
 
A
V
 
A
L
 
P
E
 
G
S
 
S
V
 
A
L
 
L
E
 
T
M
 
V
S
 
R
D
 
L
E
 
P
G
 
E
Y
 
W
E
 
R
A
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
E
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
T
A
 
A
A
 
P
L
 
M
I
 
-
T
 
H
C
 
L
Q
 
S
A
 
A
F
 
L
A
 
A
R
 
A
M
 
R
R
 
E
I
 
M
A
 
R
Q
 
K
G
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
M
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
V
T
 
A
S
|
S
I
 
V
A
 
Q
G
 
G
H
 
L
R
 
F
G
 
A
F
 
E
E
 
Q
Q
 
E
H
x
N
L
 
A
C
 
A
Y
|
Y
A
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
L
 
L
E
 
V
G
 
N
A
 
L
T
 
T
R
 
R
V
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
L
E
 
D
L
 
L
G
 
A
P
 
P
H
 
L
G
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
T
x
G
I
 
A
T
x
I
L
 
A
T
|
T
E
 
E
-
x
A
-
x
V
-
 
L
-
 
E
-
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
R
A
 
R
A
 
D
W
 
W
S
 
E
D
 
D
P
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
P
 
-
M
 
-
M
 
-
A
 
-
R
 
L
H
 
H
P
 
A
S
 
L
A
 
R
R
 
R
F
 
L
A
 
G
S
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
E
S
 
A
I
 
V
A
 
L
M
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
E
D
 
K
A
 
A
A
 
S
M
 
F
L
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
L
P
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
M
L
 
T
A
 
A

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
32% identity, 99% coverage: 1:239/241 of query aligns to 1:246/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
M
S
 
T
F
 
L
A
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
D
C
 
I
A
 
A
L
 
I
L
 
N
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
R
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
V
 
I
I
 
F
-
 
F
-
x
N
-
x
Y
-
x
N
A
x
G
L
x
S
A
 
P
R
 
E
T
 
A
A
 
A
S
 
E
D
 
E
L
 
T
A
 
A
R
 
K
L
 
L
Q
 
V
E
 
A
E
 
E
I
 
H
G
 
G
A
 
V
R
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
M
-
 
K
-
 
A
-
x
N
I
x
V
A
 
A
V
 
I
D
 
A
L
 
E
S
 
D
D
 
V
P
 
D
A
 
A
A
 
F
A
 
F
R
 
K
R
 
Q
A
 
A
M
 
I
A
 
E
E
 
R
A
 
F
G
 
G
T
 
R
A
 
V
D
 
D
F
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
N
 
T
V
 
R
L
 
D
E
 
N
S
 
L
V
 
L
L
 
M
E
 
R
M
 
M
S
 
K
D
 
E
E
 
D
G
 
E
Y
 
W
E
 
D
A
 
D
V
 
V
L
 
I
G
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
L
R
 
K
A
 
G
A
 
T
L
 
F
I
 
L
T
 
C
C
 
T
Q
 
K
A
 
A
F
 
V
A
 
S
R
 
R
M
 
T
R
 
M
I
 
M
A
 
K
Q
 
Q
G
 
R
G
 
A
G
 
G
G
 
-
A
 
K
M
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
T
 
A
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
H
 
L
R
 
I
G
 
G
F
 
N
E
 
A
Q
 
G
H
x
Q
L
 
A
C
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
E
 
I
G
 
G
A
 
L
T
 
T
R
 
K
V
 
T
L
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
T
 
G
I
 
F
T
x
I
L
 
T
T
|
T
E
 
D
L
 
M
A
 
T
E
 
D
A
 
K
A
 
L
W
 
-
S
 
-
D
 
D
P
 
E
A
 
K
K
 
T
S
 
K
G
 
E
P
 
A
M
 
M
M
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
I
P
 
P
S
 
L
A
 
G
R
 
A
F
 
Y
A
 
G
S
 
T
P
 
T
E
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
R
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
L
M
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
D
D
 
A
A
 
S
A
 
K
M
 
Y
L
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
Q
V
 
T
V
 
L
P
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
M
L
 
V

7do6A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NADP bound-form) (see paper)
39% identity, 97% coverage: 6:239/241 of query aligns to 6:243/247 of 7do6A

query
sites
7do6A
K
 
K
T
 
T
V
 
V
I
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
C
 
A
A
 
A
L
 
R
L
 
E
L
 
C
A
 
A
Q
 
R
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
-
L
 
I
A
 
G
R
x
H
T
x
S
A
 
G
S
 
S
D
 
D
L
 
E
A
x
G
R
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
S
L
 
L
Q
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
I
-
 
A
-
 
A
-
 
F
G
 
G
A
 
G
R
 
T
V
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
-
 
G
-
 
A
D
|
D
L
x
A
S
 
A
D
 
D
P
 
L
A
 
D
A
 
S
A
 
G
R
 
E
R
 
K
A
 
L
M
 
V
A
 
A
E
 
A
A
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
F
G
 
G
T
 
S
A
 
V
D
 
D
F
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
N
 
C
V
 
P
L
 
F
E
 
H
S
 
S
V
 
F
L
 
L
E
 
D
M
 
M
S
 
P
D
 
R
E
 
E
G
 
L
Y
 
Y
E
 
L
A
 
K
V
 
T
L
 
V
G
 
G
V
x
T
N
 
N
L
 
L
R
 
N
A
 
G
A
 
A
L
 
Y
I
 
F
T
 
T
C
 
V
Q
 
Q
A
 
A
F
 
A
A
 
A
R
 
R
M
 
R
R
 
M
I
 
K
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
G
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
M
 
I
V
 
I
N
 
A
I
 
V
T
 
S
S
|
S
I
 
I
A
 
S
G
 
A
H
 
L
R
 
V
G
 
G
F
 
G
E
 
A
Q
 
M
H
 
Q
L
 
T
C
 
H
Y
|
Y
A
 
T
A
 
P
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
L
G
 
S
A
 
L
T
 
M
R
 
Q
V
 
S
L
 
C
A
 
A
R
 
I
E
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
L
P
 
P
T
 
-
I
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
G
A
 
T
W
x
I
S
 
A
D
 
D
P
 
L
A
 
E
K
 
K
S
 
R
G
 
E
P
 
R
M
 
M
M
 
T
A
 
S
R
 
R
H
 
V
P
 
P
S
 
L
A
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
S
 
E
P
 
P
E
 
D
D
 
D
V
 
L
A
 
A
R
 
G
S
 
P
I
 
I
A
 
V
M
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
D
D
 
M
A
 
A
A
 
R
M
 
Y
L
 
V
N
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
S
V
 
L
P
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
L
L
 
F

Query Sequence

>HSERO_RS05340 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS05340
MSFAGKTVIITGAGRGIGRACALLLAQRGAQVIALARTASDLARLQEEIGARVIAVDLSD
PAAARRAMAEAGTADFLINSAGINVLESVLEMSDEGYEAVLGVNLRAALITCQAFARMRI
AQGGGGAMVNITSIAGHRGFEQHLCYAASKAGLEGATRVLARELGPHGIRVNAVAPTITL
TELAEAAWSDPAKSGPMMARHPSARFASPEDVARSIAMLLSPDAAMLNGAVVPVDGGFLA
V

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory