SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing HSERO_RS05525 HSERO_RS05525 ketohydroxyglutarate aldolase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 12 hits to proteins with known functional sites (download)

3vcrA Crystal structure of a putative kdpg (2-keto-3-deoxy-6- phosphogluconate) aldolase from oleispira antarctica (see paper)
50% identity, 97% coverage: 7:209/209 of query aligns to 8:216/216 of 3vcrA

query
sites
3vcrA
I
 
L
M
 
A
R
 
N
A
 
T
S
 
K
P
 
P
V
 
L
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
V
I
 
I
D
 
D
K
 
D
F
 
L
E
 
V
H
 
H
A
 
A
V
 
I
P
 
P
L
 
M
A
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
V
R
 
H
V
 
L
L
 
L
E
|
E
I
 
V
T
 
T
L
 
L
R
|
R
T
 
T
E
 
E
H
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
S
A
 
A
I
 
I
A
 
K
E
 
K
S
 
A
V
 
V
P
 
P
D
 
E
A
 
A
I
 
I
V
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
T
|
T
L
 
V
T
 
C
S
 
T
P
 
A
E
 
D
E
 
D
F
 
F
T
 
Q
A
 
K
S
 
A
R
 
I
D
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
Q
F
 
F
G
 
I
V
|
V
S
|
S
P
|
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
K
A
 
A
K
 
K
R
 
Q
S
 
V
G
 
K
L
 
L
P
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
W
-
 
Q
-
 
G
-
 
V
L
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
V
M
 
A
T
 
T
P
 
A
S
 
S
E
 
E
V
 
V
M
 
M
A
 
I
A
 
A
R
 
A
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
F
 
I
R
 
T
Q
 
Q
L
 
L
K
|
K
L
 
C
F
 
F
P
 
P
A
 
A
V
 
S
P
 
A
A
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
A
G
 
K
M
 
L
L
 
L
N
 
K
G
 
A
I
 
W
A
 
S
G
 
G
P
 
P
L
 
F
A
 
P
D
 
D
V
 
I
S
 
Q
F
 
F
C
 
C
P
 
P
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
S
Q
 
K
E
 
D
T
 
N
A
 
Y
P
 
K
Q
 
E
F
 
Y
L
 
L
A
 
G
C
 
L
K
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
I
C
 
C
V
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
W
 
W
L
 
L
T
 
T
P
 
E
K
 
S
A
 
K
A
 
L
I
 
L
E
 
I
A
 
E
G
 
G
D
 
D
W
 
W
D
 
N
K
 
E
I
 
V
T
 
T
E
 
R
I
 
R
A
 
A
K
 
S
A
 
E
A
 
I
S
 
V
A
 
K
L
 
L
K
 
S
K
 
D
V
 
I

1euaA Schiff base intermediate in kdpg aldolase from escherichia coli (see paper)
54% identity, 87% coverage: 22:203/209 of query aligns to 26:207/213 of 1euaA

query
sites
1euaA
F
 
L
E
 
E
H
 
H
A
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
M
A
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
L
E
|
E
I
 
V
T
 
T
L
 
L
R
|
R
T
 
T
E
 
E
H
 
C
G
 
A
L
 
V
P
 
D
A
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
K
S
 
E
V
 
V
P
 
P
D
 
E
A
 
A
I
 
I
V
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
T
|
T
L
 
V
T
 
L
S
 
N
P
 
P
E
 
Q
E
 
Q
F
 
L
T
 
A
A
 
E
S
 
V
R
 
T
D
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
Q
F
 
F
G
 
A
V
x
I
S
 
S
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
E
A
 
P
L
 
L
I
 
L
E
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
T
R
 
E
S
 
G
G
 
T
L
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
I
M
 
S
T
 
T
P
 
V
S
 
S
E
 
E
V
 
L
M
 
M
A
 
L
A
 
G
R
 
M
E
 
D
A
 
Y
G
 
G
F
 
L
R
 
K
Q
 
E
L
 
F
K
|
K
L
 
F
F
 
F
P
 
P
A
 
A
V
 
E
P
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
K
M
 
A
L
 
L
N
 
Q
G
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
 
F
A
 
S
D
 
Q
V
 
V
S
 
R
F
 
F
C
 
C
P
 
P
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
S
Q
 
P
E
 
A
T
 
N
A
 
Y
P
 
R
Q
 
D
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
C
 
L
K
 
K
N
 
S
V
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
W
 
W
L
 
L
T
 
V
P
 
P
K
 
A
A
 
D
A
 
A
I
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
D
W
 
Y
D
 
D
K
 
R
I
 
I
T
 
T
E
 
K
I
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
E
A
 
A

P0A955 KHG/KDPG aldolase; EC 4.1.3.16; EC 4.1.2.14 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
54% identity, 87% coverage: 22:203/209 of query aligns to 26:207/213 of P0A955

query
sites
P0A955
F
 
L
E
 
E
H
 
H
A
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
M
A
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
L
E
|
E
I
 
V
T
 
T
L
 
L
R
|
R
T
 
T
E
 
E
H
 
C
G
 
A
L
 
V
P
 
D
A
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
K
S
 
E
V
 
V
P
 
P
D
 
E
A
 
A
I
 
I
V
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
T
|
T
L
 
V
T
 
L
S
 
N
P
 
P
E
 
Q
E
 
Q
F
 
L
T
 
A
A
 
E
S
 
V
R
 
T
D
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
Q
F
 
F
G
 
A
V
 
I
S
 
S
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
E
A
 
P
L
 
L
I
 
L
E
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
T
R
 
E
S
 
G
G
 
T
L
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
I
M
 
S
T
 
T
P
 
V
S
 
S
E
 
E
V
 
L
M
 
M
A
 
L
A
 
G
R
 
M
E
 
D
A
 
Y
G
 
G
F
 
L
R
 
K
Q
 
E
L
 
F
K
|
K
L
 
F
F
 
F
P
 
P
A
 
A
V
 
E
P
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
K
M
 
A
L
 
L
N
 
Q
G
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
 
F
A
 
S
D
 
Q
V
 
V
S
 
R
F
 
F
C
 
C
P
 
P
T
|
T
G
 
G
G
|
G
I
 
I
T
 
S
Q
 
P
E
 
A
T
x
N
A
 
Y
P
 
R
Q
 
D
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
C
 
L
K
 
K
N
 
S
V
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
G
 
G
S
|
S
W
 
W
L
 
L
T
 
V
P
 
P
K
 
A
A
 
D
A
 
A
I
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
D
W
 
Y
D
 
D
K
 
R
I
 
I
T
 
T
E
 
K
I
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
E
A
 
A

1wauA Structure of kdpg aldolase e45n mutant (see paper)
53% identity, 87% coverage: 22:203/209 of query aligns to 26:207/213 of 1wauA

query
sites
1wauA
F
 
L
E
 
E
H
 
H
A
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
M
A
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
L
E
x
N
I
 
V
T
 
T
L
 
L
R
|
R
T
 
T
E
 
E
H
 
C
G
 
A
L
 
V
P
 
D
A
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
K
S
 
E
V
 
V
P
 
P
D
 
E
A
 
A
I
 
I
V
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
V
T
 
L
S
 
N
P
 
P
E
 
Q
E
 
Q
F
 
L
T
 
A
A
 
E
S
 
V
R
 
T
D
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
Q
F
 
F
G
 
A
V
 
I
S
 
S
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
E
A
 
P
L
 
L
I
 
L
E
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
T
R
 
E
S
 
G
G
 
T
L
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
I
M
 
S
T
 
T
P
 
V
S
 
S
E
 
E
V
 
L
M
 
M
A
 
L
A
 
G
R
 
M
E
 
D
A
 
Y
G
 
G
F
 
L
R
 
K
Q
 
E
L
 
F
K
|
K
L
 
F
F
 
F
P
 
P
A
 
A
V
 
E
P
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
K
M
 
A
L
 
L
N
 
Q
G
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
 
F
A
 
S
D
 
Q
V
 
V
S
 
R
F
 
F
C
 
C
P
 
P
T
 
T
G
|
G
G
|
G
I
 
I
T
 
S
Q
 
P
E
 
A
T
 
N
A
 
Y
P
 
R
Q
 
D
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
C
 
L
K
 
K
N
 
S
V
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
G
 
G
S
|
S
W
 
W
L
 
L
T
 
V
P
 
P
K
 
A
A
 
D
A
 
A
I
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
D
W
 
Y
D
 
D
K
 
R
I
 
I
T
 
T
E
 
K
I
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
E
A
 
A

2c0aB Mechanism of the class i kdpg aldolase (see paper)
53% identity, 87% coverage: 22:203/209 of query aligns to 27:208/214 of 2c0aB

query
sites
2c0aB
F
 
L
E
 
E
H
 
H
A
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
M
A
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
L
E
x
N
I
 
V
T
 
T
L
 
L
R
|
R
T
 
T
E
 
E
H
 
C
G
 
A
L
 
V
P
 
D
A
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
K
S
 
E
V
 
V
P
 
P
D
 
E
A
 
A
I
 
I
V
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
V
T
 
L
S
 
N
P
 
P
E
 
Q
E
 
Q
F
 
L
T
 
A
A
 
E
S
 
V
R
 
T
D
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
Q
F
 
F
G
 
A
V
 
I
S
 
S
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
E
A
 
P
L
 
L
I
 
L
E
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
T
R
 
E
S
 
G
G
 
T
L
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
I
M
 
S
T
 
T
P
 
V
S
 
S
E
 
E
V
 
L
M
 
M
A
 
L
A
 
G
R
 
M
E
 
D
A
 
Y
G
 
G
F
 
L
R
 
K
Q
x
E
L
 
F
K
|
K
L
 
F
F
 
F
P
 
P
A
 
A
V
 
E
P
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
K
M
 
A
L
 
L
N
 
Q
G
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
 
F
A
 
S
D
 
Q
V
 
V
S
 
R
F
 
F
C
 
C
P
 
P
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
S
Q
 
P
E
 
A
T
 
N
A
 
Y
P
 
R
Q
 
D
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
C
 
L
K
 
K
N
 
S
V
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
W
 
W
L
 
L
T
 
V
P
 
P
K
 
A
A
 
D
A
 
A
I
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
D
W
 
Y
D
 
D
K
 
R
I
 
I
T
 
T
E
 
K
I
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6oviA Crystal structure of kdpg aldolase from legionella pneumophila with pyruvate captured at low ph as a covalent carbinolamine intermediate
46% identity, 97% coverage: 7:208/209 of query aligns to 8:209/210 of 6oviA

query
sites
6oviA
I
 
V
M
 
F
R
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
P
V
 
V
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
V
I
 
I
D
 
K
K
 
E
F
 
L
E
 
E
H
 
D
A
 
A
V
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
F
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
H
V
 
V
L
 
L
E
|
E
I
 
V
T
 
T
L
 
L
R
|
R
T
 
T
E
 
P
H
 
V
G
 
A
L
 
I
P
 
K
A
 
A
I
 
L
R
 
E
A
 
L
I
 
L
A
 
I
E
 
N
S
 
T
V
 
F
P
 
P
D
 
D
A
 
E
I
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
A
G
 
G
T
|
T
L
 
V
T
 
I
S
 
T
P
 
P
E
 
G
E
 
Q
F
 
F
T
 
H
A
 
D
S
 
V
R
 
V
D
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
R
F
 
F
G
 
A
V
 
I
S
 
S
P
|
P
G
 
G
L
 
Q
T
 
T
P
 
R
A
 
E
L
 
L
I
 
L
E
 
I
A
 
A
A
 
G
K
 
Q
R
 
K
S
 
S
G
 
E
L
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
V
M
 
A
T
 
S
P
 
V
S
 
S
E
 
E
V
 
L
M
 
M
A
 
E
A
 
G
R
 
L
E
 
G
A
 
M
G
 
G
F
 
Y
R
 
N
Q
 
H
L
 
F
K
|
K
L
 
F
F
|
F
P
 
P
A
 
A
V
 
A
P
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
I
G
 
P
M
 
M
L
 
L
N
 
K
G
 
A
I
 
I
A
 
S
G
 
G
P
 
V
L
 
F
A
 
P
D
 
Q
V
 
V
S
 
K
F
 
F
C
 
C
P
 
P
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
N
Q
 
S
E
 
K
T
 
N
A
 
Y
P
 
E
Q
 
E
F
 
Y
L
 
L
A
 
C
C
 
L
K
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
A
C
 
C
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
S
W
 
W
L
 
I
T
 
V
P
 
P
K
 
E
A
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
K
A
 
N
G
 
H
D
 
N
W
 
W
D
 
S
K
 
L
I
 
I
T
 
T
E
 
E
I
 
L
A
 
C
K
 
M
A
 
A
A
 
V
S
 
S
A
 
S
L
 
Q
K
 
K
K
 
R

1mxsA Crystal structure of 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate (kdpg) aldolase from pseudomonas putida. (see paper)
45% identity, 96% coverage: 7:206/209 of query aligns to 13:212/216 of 1mxsA

query
sites
1mxsA
I
 
I
M
 
C
R
 
E
A
 
K
S
 
A
P
 
R
V
 
I
I
 
L
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
T
I
 
I
D
 
A
K
 
R
F
 
E
E
 
E
H
 
D
A
 
I
V
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
A
R
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
T
L
 
L
E
|
E
I
 
V
T
 
T
L
 
L
R
|
R
T
 
S
E
 
Q
H
 
H
G
 
G
L
 
L
P
 
K
A
 
A
I
 
I
R
 
Q
A
 
V
I
 
L
A
 
R
E
 
E
S
 
Q
V
 
R
P
 
P
D
 
E
A
 
L
I
 
C
V
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
T
|
T
L
 
V
T
 
L
S
 
D
P
 
R
E
 
S
E
 
M
F
 
F
T
 
A
A
 
A
S
 
V
R
 
E
D
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
Q
F
 
F
G
 
V
V
|
V
S
x
T
P
|
P
G
 
G
L
 
I
T
 
T
P
 
E
A
 
D
L
 
I
I
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
K
 
V
R
 
D
S
 
S
G
 
E
L
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
I
M
 
S
T
 
T
P
 
P
S
 
S
E
 
E
V
 
I
M
 
M
A
 
M
A
 
G
R
 
Y
E
 
A
A
 
L
G
 
G
F
 
Y
R
 
R
Q
 
R
L
 
F
K
|
K
L
 
L
F
 
F
P
 
P
A
 
A
V
 
E
P
 
I
A
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
A
M
 
A
L
 
I
N
 
K
G
 
A
I
 
F
A
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
F
A
 
G
D
 
D
V
 
I
S
 
R
F
 
F
C
 
C
P
 
P
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
N
Q
 
P
E
 
A
T
 
N
A
 
V
P
 
R
Q
 
N
F
 
Y
L
 
M
A
 
A
C
 
L
K
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
G
 
T
S
 
T
W
 
W
L
 
M
T
 
L
P
 
D
K
 
S
A
 
S
A
 
W
I
 
I
E
 
K
A
 
N
G
 
G
D
 
D
W
 
W
D
 
A
K
 
R
I
 
I
T
 
E
E
 
A
I
 
C
A
 
S
K
 
A
A
 
E
A
 
A
S
 
I
A
 
A
L
 
L

P00885 2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate aldolase; KDPG-aldolase; Phospho-2-dehydro-3-deoxygluconate aldolase; Phospho-2-keto-3-deoxygluconate aldolase; EC 4.1.2.14 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see paper)
45% identity, 96% coverage: 7:206/209 of query aligns to 23:222/226 of P00885

query
sites
P00885
I
 
I
M
 
C
R
 
E
A
 
K
S
 
A
P
 
R
V
 
I
I
 
L
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
T
I
 
I
D
 
A
K
 
R
F
 
E
E
 
E
H
 
D
A
 
I
V
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
A
R
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
T
L
 
L
E
 
E
I
 
V
T
 
T
L
 
L
R
 
R
T
 
S
E
 
Q
H
 
H
G
 
G
L
 
L
P
 
K
A
 
A
I
 
I
R
 
Q
A
 
V
I
 
L
A
 
R
E
 
E
S
 
Q
V
 
R
P
 
P
D
 
E
A
 
L
I
 
C
V
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
V
T
 
L
S
 
D
P
 
R
E
 
S
E
 
M
F
 
F
T
 
A
A
 
A
S
 
V
R
 
E
D
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
Q
F
 
F
G
 
V
V
 
V
S
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
I
T
 
T
P
 
E
A
 
D
L
 
I
I
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
K
 
V
R
 
D
S
 
S
G
 
E
L
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
I
M
 
S
T
 
T
P
 
P
S
 
S
E
 
E
V
 
I
M
 
M
A
 
M
A
 
G
R
 
Y
E
 
A
A
 
L
G
 
G
F
 
Y
R
 
R
Q
 
R
L
 
F
K
|
K
L
 
L
F
 
F
P
 
P
A
 
A
V
 
E
P
 
I
A
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
A
M
 
A
L
 
I
N
 
K
G
 
A
I
 
F
A
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
F
A
 
G
D
 
D
V
 
I
S
 
R
F
 
F
C
 
C
P
 
P
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
N
Q
 
P
E
 
A
T
 
N
A
 
V
P
 
R
Q
 
N
F
 
Y
L
 
M
A
 
A
C
 
L
K
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
G
 
T
S
 
G
W
 
W
L
 
M
T
 
L
P
 
D
K
 
S
A
 
S
A
 
W
I
 
I
E
 
K
A
 
N
G
 
G
D
 
D
W
 
W
D
 
A
K
 
R
I
 
I
T
 
E
E
 
A
I
 
C
A
 
S
K
 
A
A
 
E
A
 
A
S
 
I
A
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5xsfA Crystal structure of the 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase of zymomonas mobilis zm4 with 3-phosphoglycerate
44% identity, 100% coverage: 1:208/209 of query aligns to 2:205/209 of 5xsfA

query
sites
5xsfA
M
 
M
K
 
R
T
 
D
T
 
I
L
 
D
E
 
S
I
 
V
M
 
M
R
 
R
A
 
L
S
 
A
P
 
P
V
 
V
I
 
M
P
 
P
V
 
V
I
 
L
A
x
V
I
 
I
D
x
E
K
x
D
F
 
I
E
 
A
H
x
D
A
 
A
V
 
K
P
 
P
L
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
L
R
 
N
V
 
V
L
 
L
E
 
E
I
 
V
T
 
T
L
 
L
R
 
R
T
 
T
E
 
P
H
 
C
G
 
A
L
 
L
P
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
-
I
 
I
A
 
M
E
 
K
S
 
E
V
 
V
P
 
P
D
 
G
A
 
A
I
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
V
T
 
L
S
 
N
P
 
A
E
 
K
E
 
M
F
 
L
T
 
D
A
 
Q
S
 
A
R
 
Q
D
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
C
V
 
E
F
 
F
G
 
F
V
 
V
S
 
S
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
A
A
 
D
L
 
L
I
 
G
E
 
K
A
 
H
A
 
A
K
 
V
R
 
A
S
 
Q
G
 
K
L
 
A
P
 
A
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
V
M
 
A
T
 
N
P
 
A
S
 
A
E
 
D
V
 
V
M
 
M
A
 
L
A
 
G
R
 
L
E
 
D
A
 
L
G
 
G
F
 
L
R
 
D
Q
 
R
L
 
F
K
 
K
L
 
F
F
 
F
P
 
P
A
 
A
V
 
E
P
 
N
A
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
L
G
 
P
M
 
A
L
 
L
N
 
K
G
 
S
I
 
M
A
 
A
G
 
S
P
 
V
L
 
F
A
 
R
D
 
Q
V
 
V
S
 
R
F
 
F
C
 
C
P
 
P
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
T
Q
 
P
E
 
T
T
 
S
A
 
A
P
 
P
Q
 
K
F
 
Y
L
 
L
A
 
E
C
 
N
K
 
P
N
 
S
V
 
I
V
 
L
C
 
C
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
S
W
 
W
L
 
V
T
 
V
P
 
P
K
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
A
G
 
G
D
 
K
W
 
P
D
 
D
-
 
V
-
 
A
K
 
K
I
 
I
T
 
T
E
 
A
I
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
F
K
 
K
K
 
R

1wa3D Mechanism of the class i kdpg aldolase (see paper)
32% identity, 94% coverage: 6:202/209 of query aligns to 4:194/203 of 1wa3D

query
sites
1wa3D
E
 
E
I
 
L
M
 
F
R
 
K
A
 
K
S
 
H
P
 
K
V
 
I
I
 
V
P
 
A
V
 
V
I
 
L
A
 
R
I
 
A
D
 
N
K
 
S
F
 
V
E
 
E
H
 
E
A
 
A
V
 
K
P
 
E
L
 
K
A
 
A
R
 
L
A
 
A
L
 
V
V
 
F
A
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
V
R
 
H
V
 
L
L
 
I
E
|
E
I
 
I
T
 
T
L
 
F
R
x
T
T
 
V
E
 
P
H
 
D
G
 
A
L
 
D
P
 
T
A
 
V
I
 
I
R
 
K
A
 
E
I
 
L
A
 
S
E
 
F
-
 
L
S
 
K
V
 
E
P
 
K
D
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
I
G
 
G
V
 
A
G
 
G
T
|
T
L
 
V
T
 
T
S
 
S
P
 
V
E
 
E
E
 
Q
F
 
C
T
 
R
A
 
K
S
 
A
R
 
V
D
 
E
A
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
E
F
 
F
G
 
I
V
 
V
S
|
S
P
|
P
G
 
H
L
 
L
T
 
D
P
 
E
A
 
E
L
 
I
I
 
S
E
 
Q
A
 
F
A
 
C
K
 
K
R
 
E
S
 
K
G
 
G
L
 
V
P
 
F
L
 
Y
L
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
M
 
M
T
 
T
P
 
P
S
 
T
E
 
E
V
 
L
M
 
V
A
 
K
A
 
A
R
 
M
E
 
K
A
 
L
G
 
G
F
 
H
R
 
T
Q
 
I
L
 
L
K
|
K
L
 
L
F
|
F
P
 
P
A
 
G
V
 
-
P
 
E
A
 
V
G
 
V
G
 
G
V
 
P
G
 
Q
M
 
F
L
 
V
N
 
K
G
 
A
I
 
M
A
 
K
G
 
G
P
 
P
L
 
F
A
 
P
D
 
N
V
 
V
S
 
K
F
 
F
C
 
V
P
 
P
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
 
V
T
 
N
Q
 
L
E
 
D
T
 
N
A
 
V
P
 
C
Q
 
E
F
 
W
L
 
F
A
 
K
C
 
A
K
 
-
N
 
G
V
 
V
V
 
L
C
 
A
V
 
V
G
 
G
-
 
V
G
|
G
S
|
S
W
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
A
I
 
L
E
 
V
A
 
K
G
 
G
D
 
T
W
 
P
D
 
D
K
 
E
I
 
V
T
 
R
E
 
E
I
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
A

Q6BF16 2-dehydro-3-deoxy-6-phosphogalactonate aldolase; 2-oxo-3-deoxygalactonate 6-phosphate aldolase; 6-phospho-2-dehydro-3-deoxygalactonate aldolase; 6-phospho-2-keto-3-deoxygalactonate aldolase; KDPGal; EC 4.1.2.21 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
29% identity, 78% coverage: 8:169/209 of query aligns to 1:166/205 of Q6BF16

query
sites
Q6BF16
M
 
M
R
 
Q
A
 
W
S
 
Q
P
 
T
V
 
K
I
 
L
P
 
P
V
 
L
I
 
I
A
 
A
I
 
I
D
 
L
K
x
R
F
 
G
-
 
I
-
 
T
-
 
P
E
 
D
H
 
E
A
 
A
V
 
L
P
 
A
L
 
H
A
 
V
R
 
G
A
 
A
L
 
V
V
 
I
A
 
D
G
 
A
G
 
G
I
 
F
R
 
D
V
 
A
L
 
V
E
|
E
I
 
I
T
 
P
L
 
L
R
 
N
T
 
S
E
 
P
H
 
Q
G
 
W
L
 
E
P
 
Q
A
 
S
I
 
I
R
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
E
 
D
S
 
A
V
 
Y
P
 
G
D
 
D
-
 
K
A
 
A
I
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
A
G
 
G
T
|
T
L
 
V
T
 
L
S
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
F
 
V
T
 
D
A
 
A
S
 
L
R
 
A
D
 
R
A
 
M
G
 
G
A
 
C
V
 
Q
F
 
L
G
 
I
V
 
V
S
 
T
P
 
P
G
 
N
L
 
I
T
 
H
P
 
S
A
 
E
L
 
V
I
 
I
E
 
R
A
 
R
A
 
A
K
 
V
R
 
G
S
 
Y
G
 
G
L
 
M
P
 
T
L
 
V
L
 
C
P
 
P
G
 
G
V
 
C
M
 
A
T
 
T
P
 
A
S
 
T
E
 
E
V
 
A
M
 
F
A
 
T
A
 
A
R
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
A
R
 
Q
Q
 
A
L
 
L
K
|
K
L
 
I
F
 
F
P
 
P
A
 
S
V
 
-
P
 
S
A
 
A
G
 
F
G
 
G
V
 
P
G
 
Q
M
 
Y
L
 
I
N
 
K
G
 
A
I
 
L
A
 
K
G
 
A
P
 
V
L
 
L
-
 
P
A
 
S
D
 
D
V
 
I
S
 
A
F
 
V
C
 
F
P
 
A
T
x
V
G
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
T
Q
 
P
E
 
E
T
 
N
A
 
L
P
 
A
Q
 
Q
F
 
W
L
 
I

2v82A Kdpgal complexed to kdpgal (see paper)
30% identity, 75% coverage: 14:169/209 of query aligns to 6:165/205 of 2v82A

query
sites
2v82A
I
 
L
P
 
P
V
 
L
I
 
I
A
 
A
I
 
I
D
 
L
K
x
R
F
 
G
-
 
I
-
 
T
-
 
P
E
 
D
H
 
E
A
 
A
V
 
L
P
 
A
L
 
H
A
 
V
R
 
G
A
 
A
L
 
V
V
 
I
A
 
D
G
 
A
G
 
G
I
 
F
R
 
D
V
 
A
L
 
V
E
|
E
I
 
I
T
 
P
L
 
L
R
x
N
T
 
S
E
 
P
H
 
Q
G
 
W
L
 
E
P
 
Q
A
 
S
I
 
I
R
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
E
 
D
S
 
A
V
 
Y
P
 
G
D
 
D
-
 
K
A
 
A
I
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
A
G
 
G
T
|
T
L
 
V
T
 
L
S
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
F
 
V
T
 
D
A
 
A
S
 
L
R
 
A
D
 
R
A
 
M
G
 
G
A
 
C
V
 
Q
F
 
L
G
 
I
V
|
V
S
x
T
P
 
P
G
 
N
L
 
I
T
 
H
P
 
S
A
 
E
L
 
V
I
 
I
E
 
R
A
 
R
A
 
A
K
 
V
R
 
G
S
 
Y
G
 
G
L
 
M
P
 
T
L
 
V
L
 
C
P
 
P
G
 
G
V
 
C
M
 
A
T
 
T
P
 
A
S
 
T
E
 
E
V
 
A
M
 
F
A
 
T
A
 
A
R
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
A
R
 
Q
Q
 
A
L
 
L
K
|
K
L
 
I
F
|
F
P
 
P
A
 
S
V
 
-
P
 
S
A
 
A
G
 
F
G
 
G
V
 
P
G
 
Q
M
 
Y
L
 
I
N
 
K
G
 
A
I
 
L
A
 
K
G
 
A
P
 
V
L
 
L
-
 
P
A
 
S
D
 
D
V
 
I
S
 
A
F
 
V
C
 
F
P
 
A
T
x
V
G
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
T
Q
 
P
E
 
E
T
 
N
A
 
L
P
 
A
Q
 
Q
F
 
W
L
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>HSERO_RS05525 HSERO_RS05525 ketohydroxyglutarate aldolase
MKTTLEIMRASPVIPVIAIDKFEHAVPLARALVAGGIRVLEITLRTEHGLPAIRAIAESV
PDAIVGVGTLTSPEEFTASRDAGAVFGVSPGLTPALIEAAKRSGLPLLPGVMTPSEVMAA
REAGFRQLKLFPAVPAGGVGMLNGIAGPLADVSFCPTGGITQETAPQFLACKNVVCVGGS
WLTPKAAIEAGDWDKITEIAKAASALKKV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory