SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing HSERO_RS05745 HSERO_RS05745 NADP-dependent malic enzyme oxidoreductase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P76558 NADP-dependent malic enzyme; NADP-ME; EC 1.1.1.40 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
60% identity, 98% coverage: 12:752/758 of query aligns to 5:755/759 of P76558

query
sites
P76558
L
 
L
R
 
K
D
 
Q
A
 
S
A
 
A
R
 
L
E
 
D
Y
 
F
H
 
H
R
 
E
T
 
F
P
 
P
S
 
V
R
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
E
 
Q
V
 
V
R
 
S
P
 
P
T
 
T
K
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
A
N
 
T
Q
 
Q
R
 
R
D
 
D
L
 
L
S
 
A
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
Y
 
A
P
 
P
C
 
C
L
 
L
D
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
K
D
 
D
P
 
P
L
 
L
K
|
K
A
 
A
F
 
Y
D
 
K
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
R
 
R
G
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
I
S
 
S
N
 
N
G
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
 
K
G
 
G
C
 
V
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
K
F
 
F
A
 
A
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
D
I
 
I
E
 
E
L
 
V
A
 
D
E
 
E
N
 
L
D
 
D
P
 
P
D
 
D
K
 
K
L
 
F
V
 
I
E
 
E
I
 
V
I
 
V
A
 
A
S
 
A
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
 
E
D
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
A
P
 
P
E
 
E
C
 
C
F
 
F
Y
 
Y
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
L
 
L
S
 
R
A
 
E
R
 
R
M
 
M
N
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
 
D
D
 
D
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
I
S
 
S
S
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
I
L
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
L
E
 
R
L
 
V
V
 
V
G
 
E
K
 
K
D
 
N
I
 
I
G
 
S
K
 
D
V
 
V
K
 
R
I
 
M
A
 
V
V
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
C
 
C
V
 
M
E
 
N
V
 
L
M
 
L
I
 
V
G
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
L
K
 
Q
R
 
K
E
 
H
N
 
N
V
 
I
Y
 
V
M
 
V
V
 
C
D
 
D
S
 
S
K
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
P
 
E
G
 
P
G
 
N
L
 
M
D
 
A
A
 
E
S
 
T
K
 
K
Q
 
A
R
 
A
Y
 
Y
A
 
A
I
 
V
K
 
V
T
 
D
E
 
D
A
 
G
-
 
K
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
D
D
 
D
V
 
V
V
 
I
N
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
I
F
 
F
L
 
L
G
 
G
C
 
C
S
 
S
A
 
G
P
 
P
G
 
K
V
 
V
L
 
L
S
 
T
A
 
Q
E
 
E
M
 
M
V
 
V
K
 
K
T
 
K
M
 
M
A
 
A
D
 
R
K
 
A
P
 
P
I
 
M
I
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
N
P
 
P
E
 
E
P
 
P
E
 
E
I
 
I
R
 
L
P
 
P
E
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
S
 
E
V
 
V
R
 
R
P
 
P
D
 
D
C
 
A
I
 
I
I
 
I
A
 
C
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
N
 
N
V
 
V
L
 
L
C
 
C
F
 
F
P
 
P
Y
 
F
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
C
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
K
 
A
I
 
I
T
 
N
E
 
E
A
 
E
M
 
M
K
 
K
L
 
L
A
 
A
C
 
A
V
 
V
R
 
R
E
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
H
A
 
A
E
 
E
T
 
Q
S
 
S
A
 
E
E
 
V
V
 
V
S
 
A
A
 
S
A
 
A
Y
 
Y
P
 
G
G
 
D
K
 
Q
E
 
D
L
 
L
V
 
S
F
 
F
G
 
G
A
 
P
D
 
E
Y
 
Y
L
 
I
I
 
I
P
 
P
T
 
K
P
 
P
F
 
F
D
 
D
S
 
P
R
 
R
L
 
L
I
 
I
L
 
V
K
 
K
I
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
V
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
M
E
 
E
S
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
R
 
R
P
 
P
I
 
I
K
 
A
D
 
D
Y
 
F
D
 
D
A
 
V
Y
 
Y
R
 
I
A
 
D
E
 
K
L
 
L
T
 
T
R
 
E
F
 
F
I
 
V
Y
 
Y
Q
 
K
T
 
T
G
 
N
M
 
L
F
 
F
M
 
M
Q
 
K
P
 
P
V
 
I
F
 
F
N
 
S
T
 
Q
A
 
A
K
 
R
V
 
K
A
 
A
P
 
P
Q
 
K
R
 
R
V
 
V
V
 
V
Y
 
L
A
 
P
D
 
E
G
 
G
Q
 
E
D
 
E
E
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
R
 
H
A
 
A
V
 
T
Q
 
Q
F
 
E
V
 
L
A
 
V
D
 
T
E
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
K
P
 
P
I
 
I
L
 
L
V
 
I
G
 
G
A
 
R
P
 
P
A
 
N
A
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
M
G
 
R
I
 
I
K
 
Q
K
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
Q
I
 
I
K
 
K
I
 
A
G
 
G
Q
 
V
N
 
D
V
 
F
Q
 
E
V
 
I
I
 
V
D
 
N
P
 
N
A
 
E
T
 
S
D
 
D
A
 
P
R
 
R
V
 
F
A
 
K
Q
 
E
Y
 
Y
A
 
W
A
 
T
Q
 
E
Y
 
Y
-
 
F
-
 
Q
-
 
I
-
 
M
K
 
K
D
 
R
G
 
R
G
 
G
E
 
V
A
 
T
D
 
Q
V
 
E
R
 
Q
A
 
A
S
 
Q
G
 
R
S
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
S
-
 
N
-
 
P
-
 
T
-
 
V
-
 
I
-
 
G
A
 
A
L
 
I
M
 
M
V
 
V
K
 
Q
A
 
R
G
 
G
D
 
E
A
 
A
D
 
D
A
 
A
M
 
M
L
 
I
C
 
C
G
 
G
L
 
T
D
 
V
G
 
G
N
 
D
Y
 
Y
D
 
H
G
 
E
H
 
H
L
 
F
A
 
S
H
 
V
V
 
V
E
 
K
K
 
N
V
 
V
I
 
F
G
 
G
L
 
Y
K
 
R
Q
 
D
G
 
G
A
 
V
Q
 
H
E
 
T
F
 
A
A
 
G
A
 
A
L
 
M
N
 
N
A
 
A
V
 
L
L
 
L
L
 
L
P
 
P
D
 
S
Q
 
G
T
 
N
L
 
T
F
 
F
I
 
I
T
 
A
D
 
D
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
D
 
D
T
 
E
P
 
P
D
 
D
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
E
I
 
I
A
 
T
Q
 
L
A
 
M
A
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
T
V
 
V
A
 
R
R
 
R
F
 
F
G
 
G
V
 
I
P
 
E
P
 
P
K
 
R
V
 
V
A
 
A
F
 
L
L
 
L
S
 
S
H
 
H
S
 
S
N
 
N
R
 
F
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
D
R
 
C
P
 
P
S
 
S
A
 
S
R
 
S
K
 
K
M
 
M
A
 
R
A
 
Q
A
 
A
H
 
L
E
 
E
A
 
L
F
 
V
K
 
R
K
 
E
L
 
R
A
 
A
P
 
P
E
 
E
V
 
L
E
 
M
S
 
I
A
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
M
H
 
H
G
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
V
E
 
E
K
 
A
I
 
I
R
 
R
N
 
N
N
 
D
A
 
R
G
 
-
L
 
M
A
 
P
D
 
D
S
 
S
G
 
S
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
S
A
 
A
N
 
N
V
 
I
L
 
L
V
 
V
C
 
M
P
 
P
N
 
N
L
 
M
D
 
E
A
 
A
A
 
A
N
 
R
I
 
I
L
 
S
F
 
Y
N
 
N
V
 
L
L
 
L
K
 
R
T
 
V
S
 
S
S
 
S
G
 
S
Q
 
E
G
 
G
T
 
V
T
 
T
I
 
V
G
 
G
P
 
P
I
 
V
L
 
L
L
 
M
G
 
G
A
 
V
A
 
A
A
 
K
P
 
P
V
 
V
H
 
H
V
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
S
 
I
S
 
A
T
 
S
V
 
V
R
 
R
R
 
R
V
 
I
I
 
V
N
 
N
M
 
M
T
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
V
A
 
V
K
 
E
A
 
A
Q
 
Q

6zngF Maeb full-length acetyl-coa bound state (see paper)
48% identity, 97% coverage: 19:752/758 of query aligns to 11:744/753 of 6zngF

query
sites
6zngF
Y
 
Y
H
 
H
R
 
Q
T
 
Q
P
 
G
S
 
K
R
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
E
 
E
V
 
V
R
 
I
P
 
S
T
 
S
K
 
K
P
 
P
L
 
C
S
 
A
N
 
T
Q
 
E
R
 
K
D
 
D
L
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
S
 
S
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
Y
 
A
P
 
P
C
 
C
L
 
K
D
 
A
I
 
I
E
 
A
A
 
K
D
 
D
P
 
P
L
 
A
K
 
K
A
 
V
F
 
Y
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
R
 
K
G
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
I
S
 
S
N
 
N
G
 
G
T
 
T
A
|
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
A
A
 
A
S
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
G
C
 
I
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
Q
F
 
F
A
 
A
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
D
I
 
I
E
 
E
L
 
V
A
 
A
E
 
A
N
 
T
D
 
D
P
 
V
D
 
D
K
 
V
L
 
F
V
 
C
E
 
N
I
 
A
I
 
V
A
 
R
S
 
V
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
K
A
 
A
P
 
P
E
 
E
C
 
C
F
 
F
Y
 
E
I
 
I
E
 
E
Q
 
E
K
 
R
L
 
L
S
 
K
A
 
K
R
 
E
M
 
M
N
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
V
S
 
S
S
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
N
 
N
G
 
A
L
 
C
E
 
S
L
 
I
V
 
T
G
 
N
K
 
R
D
 
K
I
 
M
G
 
E
K
 
T
V
 
V
K
 
R
I
 
I
A
 
V
V
 
V
S
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
A
I
 
N
A
 
S
C
 
C
V
 
A
E
 
K
V
 
I
M
 
F
I
 
I
G
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
A
K
 
R
R
 
R
E
 
E
N
 
N
V
 
I
Y
 
I
M
 
M
V
 
C
D
 
D
S
 
S
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
E
 
K
G
 
G
R
 
R
P
 
T
G
 
A
G
 
G
L
 
M
D
 
N
A
 
K
S
 
Y
K
 
K
Q
 
E
R
 
Y
Y
 
F
A
 
A
I
 
S
K
 
E
T
 
T
E
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
T
D
 
E
V
 
A
V
 
L
N
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
V
F
 
F
L
 
V
G
 
G
C
 
L
S
 
S
A
 
V
P
 
A
G
 
G
V
 
A
L
 
L
S
 
T
A
 
P
E
 
E
M
 
M
V
 
L
K
 
K
T
 
D
M
 
M
A
 
A
D
 
K
K
 
D
P
 
P
I
 
I
I
 
I
L
 
F
A
 
A
L
 
M
A
 
A
N
|
N
P
 
P
E
 
E
P
 
P
E
 
E
I
 
I
R
 
T
P
 
P
E
 
D
L
 
K
A
 
A
K
 
R
S
 
A
V
 
A
R
 
R
P
 
P
D
 
D
C
 
A
I
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
N
 
N
V
 
V
L
 
L
C
 
G
F
 
F
P
 
P
Y
 
S
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
C
 
T
G
 
R
A
 
S
T
 
T
K
 
Q
I
 
I
T
 
N
E
 
E
A
 
E
M
 
M
K
 
K
L
 
L
A
 
A
C
 
A
V
 
V
R
 
H
E
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
K
L
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
E
E
 
G
T
 
-
S
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
G
 
G
K
 
K
E
 
S
L
 
F
V
 
K
F
 
F
G
 
G
A
 
R
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
P
 
P
T
 
K
P
 
P
F
 
F
D
 
D
S
 
T
R
 
R
L
 
V
I
 
L
L
 
L
K
 
W
I
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
M
E
 
K
S
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
R
 
R
P
 
A
I
 
I
K
 
E
D
 
D
Y
 
W
D
 
D
A
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
A
 
E
E
 
S
L
 
L
T
 
E
R
 
A
F
 
L
I
 
Q
Y
 
G
Q
 
P
T
 
S
G
 
K
M
 
V
F
 
F
M
 
I
Q
 
R
P
 
S
V
 
A
F
 
I
N
 
N
T
 
R
A
 
V
K
 
H
V
 
Q
A
 
N
P
 
S
Q
 
A
-
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
L
-
 
P
R
 
R
V
 
I
V
 
V
Y
 
F
A
 
P
D
 
E
G
 
G
Q
 
T
D
 
S
E
 
T
R
 
K
V
 
V
L
 
L
R
 
K
A
 
A
V
 
L
Q
 
A
F
 
T
V
 
L
A
 
V
D
 
E
E
 
E
G
 
K
L
 
I
A
 
C
A
 
Q
P
 
P
I
 
I
L
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
Y
P
 
P
A
 
E
A
 
R
I
 
V
E
 
K
A
 
E
G
 
K
I
 
I
K
 
K
K
 
-
A
 
-
G
 
A
L
 
L
R
 
D
I
 
I
K
 
P
I
 
L
G
 
L
Q
 
N
N
 
D
V
 
V
Q
 
S
V
 
I
I
 
V
D
 
H
P
 
P
A
 
S
T
 
S
D
 
H
A
 
P
R
 
K
V
 
Y
A
 
F
Q
 
S
-
 
F
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
L
Y
 
Y
A
 
S
A
 
L
Q
x
R
Y
 
Q
K
 
R
D
x
K
G
 
G
-
 
I
-
 
N
-
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
D
 
E
-
 
R
V
 
L
R
 
M
A
 
A
S
 
D
G
 
P
S
 
N
L
 
Y
L
 
F
A
 
A
A
 
A
L
 
M
M
 
M
V
 
V
K
 
N
A
 
Q
G
 
G
D
 
E
A
 
A
D
 
D
A
 
G
M
 
M
L
 
V
C
 
S
G
 
G
L
 
S
D
 
S
G
 
I
N
 
N
Y
|
Y
D
x
A
G
 
D
H
 
A
L
 
V
A
x
R
H
 
P
V
 
I
E
x
L
K
 
Q
V
 
T
I
 
I
G
 
G
L
 
V
-
 
Y
K
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
I
Q
x
P
E
 
-
F
 
-
A
 
A
A
 
G
L
 
L
N
 
N
A
 
F
V
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
E
D
 
D
Q
 
K
T
 
F
L
 
L
F
 
V
I
 
L
T
 
A
D
 
D
T
 
T
Y
x
T
V
|
V
N
|
N
D
x
L
T
 
N
P
 
P
D
 
T
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
L
 
C
A
 
A
R
 
Q
I
 
I
A
 
A
Q
 
L
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
K
E
 
I
V
 
V
A
 
E
R
 
Y
F
 
F
G
 
G
V
 
I
P
 
E
P
 
P
K
 
R
V
 
V
A
 
A
F
 
M
L
 
L
S
 
S
H
x
Y
S
 
S
N
 
N
R
 
F
G
 
-
S
 
S
S
 
G
S
 
A
R
 
E
P
 
G
S
 
T
A
 
P
R
 
R
K
 
K
M
 
M
A
 
K
A
 
K
A
 
A
H
 
A
E
 
E
A
 
I
F
 
A
K
 
R
K
 
S
L
 
L
A
 
R
P
 
P
E
 
D
V
 
L
E
 
M
S
 
I
A
 
E
G
 
G
E
 
D
L
 
M
H
x
Q
G
 
A
D
 
D
A
 
T
A
 
A
L
 
V
S
 
N
E
 
P
K
 
E
I
 
I
R
 
M
N
 
E
N
 
R
A
 
L
G
 
-
L
 
F
A
 
P
D
 
F
S
 
S
G
 
G
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
G
A
 
A
N
 
N
V
 
V
L
 
L
V
 
V
C
 
F
P
 
P
N
 
N
L
|
L
D
 
E
A
 
S
A
 
S
N
|
N
I
 
I
L
 
A
F
 
Y
N
 
K
V
 
L
L
 
I
K
 
Q
T
 
-
S
 
Q
S
 
I
G
 
G
Q
 
K
G
 
A
T
 
E
T
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
I
 
F
L
 
L
L
 
T
G
 
G
A
 
V
A
 
R
A
 
R
P
 
S
V
 
A
H
 
N
V
 
V
L
 
L
T
x
Q
P
 
R
S
 
T
S
 
T
T
 
T
V
 
V
R
 
D
R
 
G
V
 
I
I
 
V
N
 
N
M
 
S
T
 
V
A
 
V
L
 
F
A
 
T
A
 
A
A
 
L
K
 
E
A
 
A
Q
 
Q

6zn4A Maeb malic enzyme domain apoprotein (see paper)
62% identity, 52% coverage: 19:414/758 of query aligns to 10:405/406 of 6zn4A

query
sites
6zn4A
Y
 
Y
H
 
H
R
 
Q
T
 
Q
P
 
G
S
 
K
R
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
E
 
E
V
 
V
R
 
I
P
 
S
T
 
S
K
 
K
P
 
P
L
 
C
S
 
A
N
 
T
Q
 
E
R
 
K
D
 
D
L
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
S
 
S
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
Y
 
A
P
 
P
C
 
C
L
 
K
D
 
A
I
 
I
E
 
A
A
 
K
D
 
D
P
 
P
L
 
A
K
 
K
A
 
V
F
 
Y
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
R
 
K
G
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
I
S
 
S
N
 
N
G
 
G
T
 
T
A
|
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
A
A
 
A
S
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
G
C
 
I
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
Q
F
 
F
A
 
A
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
D
I
 
I
E
 
E
L
 
V
A
 
A
E
 
A
N
 
T
D
 
D
P
 
V
D
 
D
K
 
V
L
 
F
V
 
C
E
 
N
I
 
A
I
 
V
A
 
R
S
 
V
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
K
A
 
A
P
 
P
E
 
E
C
 
C
F
 
F
Y
 
E
I
 
I
E
 
E
Q
 
E
K
 
R
L
 
L
S
 
K
A
 
K
R
 
E
M
 
M
N
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
V
S
 
S
S
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
N
 
N
G
 
A
L
 
C
E
 
S
L
 
I
V
 
T
G
 
N
K
 
R
D
 
K
I
 
M
G
 
E
K
 
T
V
 
V
K
 
R
I
 
I
A
 
V
V
 
V
S
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
A
I
 
N
A
 
S
C
 
C
V
 
A
E
 
K
V
 
I
M
 
F
I
 
I
G
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
A
K
 
R
R
 
R
E
 
E
N
 
N
V
 
I
Y
 
I
M
 
M
V
 
C
D
 
D
S
 
S
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
E
 
K
G
 
G
R
 
R
P
 
T
G
 
A
G
 
G
L
 
M
D
 
N
A
 
K
S
 
Y
K
 
K
Q
 
E
R
 
Y
Y
 
F
A
 
A
I
 
S
K
 
E
T
 
T
E
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
T
D
 
E
V
 
A
V
 
L
N
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
V
F
 
F
L
 
V
G
 
G
C
 
L
S
 
S
A
 
V
P
 
A
G
 
G
V
 
A
L
 
L
S
 
T
A
 
P
E
 
E
M
 
M
V
 
L
K
 
K
T
 
D
M
 
M
A
 
A
D
 
K
K
 
D
P
 
P
I
 
I
I
 
I
L
 
F
A
 
A
L
 
M
A
 
A
N
|
N
P
 
P
E
 
E
P
 
P
E
 
E
I
 
I
R
 
T
P
 
P
E
 
D
L
 
K
A
 
A
K
 
R
S
 
A
V
 
A
R
 
R
P
 
P
D
 
D
C
 
A
I
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
N
 
N
V
 
V
L
 
L
C
 
G
F
 
F
P
 
P
Y
 
S
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
C
 
T
G
 
R
A
 
S
T
 
T
K
 
Q
I
 
I
T
 
N
E
 
E
A
 
E
M
 
M
K
 
K
L
 
L
A
 
A
C
 
A
V
 
V
R
 
H
E
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
K
L
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
E
E
 
D
T
 
V
S
 
P
A
 
D
E
 
K
V
 
V
S
 
S
A
 
A
A
 
T
Y
 
Y
P
 
G
G
 
G
K
 
K
E
 
S
L
 
F
V
 
K
F
 
F
G
 
G
A
 
R
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
P
 
P
T
 
K
P
 
P
F
 
F
D
 
D
S
 
T
R
 
R
L
 
V
I
 
L
L
 
L
K
 
W
I
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
M
E
 
K
S
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
R
 
R

6zn7A Maeb malic enzyme domain apoprotein (see paper)
62% identity, 52% coverage: 19:414/758 of query aligns to 10:405/405 of 6zn7A

query
sites
6zn7A
Y
 
Y
H
 
H
R
 
Q
T
 
Q
P
 
G
S
 
K
R
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
E
 
E
V
 
V
R
 
I
P
 
S
T
 
S
K
 
K
P
 
P
L
 
C
S
 
A
N
 
T
Q
 
E
R
 
K
D
 
D
L
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
S
 
S
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
Y
 
A
P
 
P
C
 
C
L
 
K
D
 
A
I
 
I
E
 
A
A
 
K
D
 
D
P
 
P
L
 
A
K
 
K
A
 
V
F
 
Y
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
R
 
K
G
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
I
S
 
S
N
 
N
G
 
G
T
 
T
A
|
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
A
A
 
A
S
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
G
C
 
I
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
Q
F
 
F
A
 
A
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
D
I
 
I
E
 
E
L
 
V
A
 
A
E
 
A
N
 
T
D
 
D
P
 
V
D
 
D
K
 
V
L
 
F
V
 
C
E
 
N
I
 
A
I
 
V
A
 
R
S
 
V
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
K
A
 
A
P
 
P
E
 
E
C
 
C
F
 
F
Y
 
E
I
 
I
E
 
E
Q
 
E
K
 
R
L
 
L
S
 
K
A
 
K
R
 
E
M
 
M
N
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
T
|
T
A
 
A
I
 
I
I
 
V
S
 
S
S
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
N
 
N
G
 
A
L
 
C
E
 
S
L
 
I
V
 
T
G
 
N
K
 
R
D
 
K
I
 
M
G
 
E
K
 
T
V
 
V
K
 
R
I
 
I
A
 
V
V
 
V
S
x
N
G
 
G
A
|
A
G
|
G
A
|
A
A
x
S
A
 
A
I
 
N
A
 
S
C
 
C
V
 
A
E
 
K
V
 
I
M
 
F
I
 
I
G
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
A
K
 
R
R
 
R
E
 
E
N
 
N
V
 
I
Y
 
I
M
 
M
V
 
C
D
|
D
S
|
S
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
E
 
K
G
 
G
R
 
R
P
 
T
G
 
A
G
 
G
L
 
M
D
 
N
A
 
K
S
 
Y
K
|
K
Q
 
E
R
 
Y
Y
 
F
A
 
A
I
 
S
K
 
E
T
 
T
E
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
T
D
 
E
V
 
A
V
 
L
N
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
V
F
 
F
L
 
V
G
 
G
C
x
L
S
|
S
A
x
V
P
 
A
G
 
G
V
 
A
L
 
L
S
 
T
A
 
P
E
 
E
M
 
M
V
 
L
K
 
K
T
 
D
M
 
M
A
 
A
D
 
K
K
 
D
P
 
P
I
 
I
I
 
I
L
 
F
A
 
A
L
x
M
A
 
A
N
|
N
P
 
P
E
 
E
P
 
P
E
 
E
I
 
I
R
 
T
P
 
P
E
 
D
L
 
K
A
 
A
K
 
R
S
 
A
V
 
A
R
 
R
P
 
P
D
 
D
C
 
A
I
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
|
V
N
 
N
N
 
N
V
 
V
L
 
L
C
 
G
F
 
F
P
 
P
Y
 
S
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
C
 
T
G
 
R
A
 
S
T
 
T
K
 
Q
I
 
I
T
 
N
E
 
E
A
 
E
M
 
M
K
 
K
L
 
L
A
 
A
C
 
A
V
 
V
R
 
H
E
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
K
L
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
E
E
 
D
T
 
V
S
 
P
A
 
D
E
 
K
V
 
V
S
 
S
A
 
A
A
 
T
Y
 
Y
P
 
G
G
 
G
K
 
K
E
 
S
L
 
F
V
 
K
F
 
F
G
 
G
A
 
R
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
P
 
P
T
 
K
P
 
P
F
 
F
D
 
D
S
 
T
R
 
R
L
 
V
I
 
L
L
 
L
K
 
W
I
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
M
E
 
K
S
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
R
 
R

5ceeA Malic enzyme from candidatus phytoplasma aywb in complex with NAD and mg2+ (see paper)
47% identity, 49% coverage: 37:411/758 of query aligns to 25:385/387 of 5ceeA

query
sites
5ceeA
S
 
Q
N
 
N
Q
 
L
R
 
D
D
 
D
L
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
V
Y
|
Y
S
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
Y
 
E
P
 
P
C
 
C
L
 
L
D
 
K
I
 
I
E
 
K
A
 
E
D
 
N
P
 
P
L
 
S
K
 
D
A
 
V
F
 
Y
D
 
R
Y
 
Y
T
 
T
S
 
M
R
 
K
G
 
G
N
 
N
L
 
M
V
 
V
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
T
N
 
N
G
 
G
T
 
T
A
|
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
K
A
 
A
S
 
S
K
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
A
C
 
I
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
E
F
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
S
F
 
F
D
 
P
I
 
I
E
 
C
L
 
I
A
 
D
E
 
S
N
 
T
D
 
D
P
 
S
D
 
Q
K
 
E
L
 
I
V
 
V
E
 
N
I
 
I
I
 
V
A
 
S
S
 
K
L
 
I
E
 
S
P
 
T
T
 
V
L
 
F
G
 
G
G
 
A
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
K
A
 
S
P
 
P
E
 
Q
C
 
C
F
 
I
Y
 
E
I
 
I
E
 
E
Q
 
D
K
 
A
L
 
L
S
 
K
A
 
A
R
 
K
M
 
L
N
 
D
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
T
|
T
A
 
A
I
 
I
I
 
V
S
 
V
S
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
I
L
 
L
N
 
N
G
 
A
L
 
L
E
 
K
L
 
V
V
 
V
G
 
K
K
 
K
D
 
S
I
 
I
G
 
E
K
 
D
V
 
V
K
 
Q
I
 
V
A
 
V
V
 
I
S
x
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
A
 
S
A
|
A
A
 
G
I
 
M
A
 
A
C
 
I
V
 
A
E
 
K
V
 
M
M
 
L
I
 
L
G
 
L
L
 
L
G
 
-
V
 
-
K
 
K
R
 
V
E
 
N
N
 
N
V
 
V
Y
 
V
M
 
L
V
 
V
D
|
D
S
x
K
K
 
T
G
 
G
V
 
T
I
 
L
Y
 
Y
E
 
K
G
 
G
R
 
V
P
 
A
G
 
N
G
 
L
L
 
N
D
 
E
A
 
P
S
 
Q
K
 
K
Q
 
K
R
 
L
Y
 
V
A
 
E
I
 
V
K
 
T
T
 
N
-
 
K
-
 
Y
-
 
Q
E
 
E
A
 
K
R
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
K
D
 
E
V
 
V
V
 
L
N
 
K
G
 
G
A
 
K
D
 
D
V
 
I
F
 
F
L
 
I
G
 
G
C
x
V
S
|
S
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
x
I
L
 
V
S
 
T
A
 
A
E
 
E
M
 
M
V
 
V
K
 
A
T
 
T
M
 
M
A
 
A
D
 
K
K
 
D
P
 
A
I
 
I
I
 
V
L
 
F
A
 
A
L
|
L
A
 
A
N
|
N
P
 
P
E
 
V
P
 
P
E
 
E
I
 
I
R
 
M
P
 
P
E
 
D
L
 
E
A
 
A
K
 
K
S
 
K
-
 
G
-
 
G
V
 
A
R
 
R
P
 
-
D
 
-
C
 
-
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
F
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
|
V
N
 
N
N
|
N
V
 
C
L
 
L
C
 
A
F
 
F
P
 
P
Y
 
G
I
 
V
F
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
T
L
 
L
D
 
D
C
 
A
G
 
K
A
 
A
T
 
T
K
 
Q
I
 
I
T
 
T
E
 
E
A
 
E
M
 
M
K
 
K
L
 
K
A
 
A
C
 
A
V
 
T
R
 
Y
E
 
A
I
 
L
A
 
K
D
 
N
L
 
I
A
 
I
K
 
K
A
 
E
E
 
Q
T
 
D
S
 
L
A
 
N
E
 
E
V
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
N
Y
 
N
L
 
I
I
 
L
P
 
P
T
 
T
P
 
S
F
 
F
D
 
N
S
 
K
R
 
E
L
 
V
I
 
V
L
 
K
K
 
Q
I
 
I
A
 
A
P
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
C
K
 
K
A
 
V
A
 
A
A
 
K
E
 
E
S
 
T
G
 
G
V
 
V

2dvmA NAD complex structure of ph1275 protein from pyrococcus horikoshii
44% identity, 54% coverage: 12:417/758 of query aligns to 1:402/438 of 2dvmA

query
sites
2dvmA
L
 
I
R
 
R
D
 
E
A
 
K
A
 
A
R
 
L
E
 
E
Y
 
F
H
 
H
R
 
K
T
 
N
-
 
N
-
 
F
P
 
P
S
 
G
R
 
N
G
 
G
K
 
K
I
 
I
E
 
E
V
 
V
R
 
I
P
 
P
T
 
K
K
 
V
P
 
S
L
 
L
S
 
E
N
 
S
Q
 
R
R
 
E
D
 
E
L
 
L
S
 
T
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
S
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
Y
 
E
P
 
P
C
 
C
L
 
K
D
 
E
I
 
I
E
 
A
A
 
R
D
 
D
P
 
P
L
 
G
K
 
K
A
 
V
F
 
Y
D
 
E
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
R
 
K
G
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
V
S
 
S
N
 
D
G
 
G
T
 
S
A
x
R
V
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
A
S
 
G
K
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
A
C
 
L
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
R
F
 
F
A
 
G
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
A
F
 
F
D
 
P
I
 
I
E
 
M
L
 
I
A
 
K
E
 
E
N
 
Q
D
 
E
P
 
P
D
 
N
K
 
K
L
 
F
V
 
I
E
 
D
I
 
I
I
 
V
A
 
K
S
 
A
L
 
I
E
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
A
A
 
S
P
 
P
E
 
K
C
 
C
F
 
F
Y
 
Y
I
 
I
E
 
L
Q
 
E
K
 
R
L
 
L
S
 
R
A
 
E
R
 
E
M
 
L
N
 
D
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
Q
G
 
G
T
|
T
A
 
A
I
 
A
I
 
V
S
 
V
S
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
L
N
 
N
G
 
A
L
 
L
E
 
K
L
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
K
D
 
K
I
 
I
G
 
S
K
 
E
V
 
I
K
 
T
I
 
L
A
 
A
V
 
L
S
 
F
G
 
G
A
 
A
G
|
G
A
|
A
A
|
A
A
 
G
I
 
F
A
 
A
C
 
T
V
 
L
E
 
R
V
 
I
M
 
L
I
 
T
G
 
E
L
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
R
 
P
E
 
E
N
 
N
V
 
V
Y
 
R
M
 
V
V
|
V
D
x
E
S
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
I
x
L
Y
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
K
P
|
P
-
 
R
-
 
I
-
 
L
-
 
T
G
 
S
G
 
D
L
 
L
D
 
D
A
 
L
S
 
E
K
 
K
-
 
L
-
 
F
-
 
P
-
 
Y
Q
 
R
R
 
G
Y
 
W
A
 
L
I
 
L
-
 
K
K
 
K
T
 
T
E
 
N
A
 
G
R
 
E
T
 
N
L
 
I
-
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
P
A
 
Q
D
 
E
V
 
A
V
 
L
N
 
K
G
 
D
A
 
A
D
 
D
V
 
V
F
 
L
L
 
I
G
 
S
C
x
F
S
x
T
-
 
R
-
 
P
A
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
I
S
 
K
A
 
P
E
 
Q
M
 
W
V
 
I
K
 
E
T
 
K
M
 
M
A
 
N
D
 
E
K
 
D
P
 
A
I
 
I
I
 
V
L
 
F
A
 
P
L
|
L
A
 
A
N
|
N
P
 
P
E
 
V
P
 
P
E
 
E
I
 
I
R
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
E
A
 
A
K
 
K
S
 
K
V
 
A
R
 
G
P
 
A
D
 
R
C
 
-
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
 
I
N
 
N
N
|
N
V
 
L
L
 
L
C
 
G
F
 
F
P
 
P
Y
 
G
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
C
 
V
G
 
R
A
 
A
T
 
R
K
 
T
I
 
I
T
 
T
E
 
D
A
 
S
M
 
M
K
 
I
L
 
I
A
 
A
C
 
A
V
 
A
R
 
K
E
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
S
L
 
I
A
 
V
K
 
E
A
 
-
E
 
E
T
 
P
S
 
S
A
 
E
E
 
E
V
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
N
L
 
I
I
 
I
P
 
P
T
 
S
P
 
P
F
 
L
D
 
N
S
 
P
R
 
I
L
 
V
I
 
Y
L
 
A
K
 
R
I
 
E
A
 
A
P
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
A
K
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
M
E
 
K
S
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
R
R
 
T
P
 
K
I
 
V
K
 
K

2a9fA Crystal structure of a putative malic enzyme ((s)-malate:nad+ oxidoreductase (decarboxylating))
49% identity, 44% coverage: 26:360/758 of query aligns to 18:350/383 of 2a9fA

query
sites
2a9fA
G
 
G
K
 
K
I
 
L
E
 
E
V
 
V
R
 
Q
P
 
P
T
 
K
K
 
V
P
 
D
L
 
I
S
 
K
N
 
T
Q
 
K
R
 
H
D
 
D
L
 
L
S
 
S
L
 
I
A
 
A
Y
|
Y
S
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
Y
 
S
P
 
V
C
 
S
L
 
S
D
 
A
I
 
I
E
 
A
A
 
K
D
 
D
P
 
K
L
 
T
K
 
L
A
 
A
F
 
Y
D
 
D
Y
 
L
T
 
T
S
 
T
R
 
K
G
 
K
N
 
N
L
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
I
S
 
S
N
 
D
G
 
G
T
 
T
A
|
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
E
A
 
A
S
 
A
K
 
M
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
A
C
 
A
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
A
F
 
I
D
 
P
I
 
I
E
 
V
L
 
L
A
 
D
E
 
T
N
 
K
D
 
D
P
 
T
D
 
E
K
 
E
L
 
I
V
 
I
E
 
S
I
 
I
I
 
V
A
 
K
S
 
A
L
 
L
E
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
S
A
 
A
P
 
P
E
 
R
C
 
C
F
 
F
Y
 
E
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
K
 
R
L
 
L
S
 
I
A
 
K
R
 
E
M
 
C
N
 
H
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
V
S
 
V
S
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
I
L
 
F
N
 
N
G
 
S
L
 
L
E
 
K
L
 
L
V
 
L
G
 
K
K
 
K
D
 
S
I
 
L
G
 
D
K
 
E
V
 
V
K
 
S
I
 
I
A
 
V
V
 
V
S
 
N
G
 
G
A
 
G
G
 
G
A
 
S
A
 
A
A
 
G
I
 
L
A
 
S
C
 
I
V
 
T
E
 
R
V
 
K
M
 
L
I
 
L
G
 
A
L
 
A
G
 
G
V
 
A
K
 
T
R
 
K
E
 
-
N
 
-
V
 
V
Y
 
T
M
 
V
V
 
V
D
 
D
S
 
K
K
 
F
G
 
G
V
 
I
I
 
I
Y
 
N
E
 
E
G
 
Q
R
 
E
P
 
A
G
 
A
G
 
Q
L
 
L
D
 
A
A
 
P
S
 
D
K
 
I
Q
 
A
R
 
K
Y
 
V
A
 
T
I
 
N
K
 
R
T
 
E
-
 
F
E
 
K
A
 
S
R
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
D
V
 
A
V
 
L
N
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
I
F
 
F
L
 
I
G
 
G
C
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
S
 
K
A
 
A
E
 
E
M
 
W
V
 
I
K
 
S
T
 
K
M
 
M
A
 
A
D
 
A
K
 
R
P
 
P
I
 
V
I
 
I
L
 
F
A
 
A
L
 
M
A
 
A
N
|
N
P
 
P
E
 
I
P
 
P
E
 
E
I
 
I
R
 
Y
P
 
P
E
 
D
L
 
E
A
 
A
K
 
L
S
 
E
V
 
A
R
 
G
P
 
A
D
 
-
C
 
Y
I
 
I
I
 
V
A
 
G
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
F
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
 
I
N
 
N
N
 
N
V
 
V
L
 
L
C
 
A
F
 
F
P
 
P
Y
 
G
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
C
 
A
G
 
R
A
 
A
T
 
K
K
 
T
I
 
I
T
 
T
E
 
V
A
 
E
M
 
M
K
 
Q
L
 
I
A
 
A
C
 
A
V
 
A
R
 
K
E
 
G
I
 
I
A
 
A
D
 
S
L
 
L

2haeD Crystal structure of a putative malic enzyme (malate oxidoreductase)
46% identity, 52% coverage: 16:406/758 of query aligns to 2:373/373 of 2haeD

query
sites
2haeD
A
 
A
R
 
L
E
 
E
Y
 
L
H
 
H
R
 
R
T
 
F
P
 
-
S
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
I
E
 
R
V
 
T
R
 
A
P
 
L
T
 
P
K
 
V
P
 
E
L
 
K
S
 
V
N
 
D
Q
 
R
R
 
E
D
 
T
L
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
L
Y
|
Y
S
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
Y
 
D
P
 
V
C
 
A
L
 
R
D
 
A
I
 
C
E
 
A
A
 
E
D
 
D
P
 
P
L
 
E
K
 
K
A
 
T
F
 
Y
D
 
V
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
R
 
R
G
 
W
N
 
N
L
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
V
S
 
S
N
 
D
G
 
G
T
 
S
A
|
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
A
 
G
S
 
A
K
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
A
C
 
F
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
D
V
 
I
D
 
D
V
 
A
F
 
F
D
 
P
I
 
I
E
 
C
L
 
L
A
 
S
E
 
E
N
 
S
D
 
E
P
 
E
D
 
E
K
 
K
L
 
I
V
 
I
E
 
S
I
 
I
I
 
V
A
 
K
S
 
S
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
S
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
K
C
 
C
F
 
F
Y
 
R
I
 
I
E
 
L
Q
 
Q
K
 
R
L
 
L
S
 
S
A
 
E
R
 
E
M
 
M
N
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
V
I
 
V
S
 
V
S
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
F
L
 
L
N
 
N
G
 
A
L
 
L
E
 
K
L
 
L
V
 
T
G
 
E
K
 
K
D
 
K
I
 
I
G
 
E
K
 
E
V
 
V
K
 
K
I
 
V
A
 
V
V
 
V
S
 
N
G
 
G
A
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
G
I
 
Y
A
 
N
C
 
I
V
 
V
E
 
K
V
 
F
M
 
L
I
 
L
G
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
V
K
 
K
R
 
-
E
 
-
N
 
N
V
 
V
Y
 
V
M
 
A
V
 
V
D
 
D
S
 
R
K
 
K
G
 
G
V
 
I
I
 
L
Y
 
N
E
 
E
G
 
N
R
 
D
P
 
P
G
 
E
G
 
T
L
 
C
D
 
L
A
 
N
S
 
E
K
 
Y
Q
 
E
R
 
I
Y
 
A
A
 
R
I
 
I
K
 
T
T
 
N
E
 
P
A
 
E
R
 
R
T
 
L
L
 
S
A
 
G
D
 
D
V
 
L
-
 
E
-
 
T
-
 
A
V
 
L
N
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
F
F
 
F
L
 
I
G
 
G
C
 
V
S
 
S
A
 
R
P
 
G
G
 
N
V
 
I
L
 
L
S
 
K
A
 
P
E
 
E
M
 
W
V
 
I
K
 
K
T
 
K
M
 
M
A
 
S
D
 
R
K
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
I
L
 
F
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
|
N
P
 
P
E
 
V
P
 
P
E
 
E
I
 
I
R
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
R
S
 
E
V
 
A
R
 
G
P
 
A
D
 
-
C
 
F
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
H
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
N
 
N
V
 
L
L
 
L
C
 
A
F
 
F
P
 
P
Y
 
G
I
 
I
F
 
M
R
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
V
D
 
E
C
 
-
G
 
K
A
 
R
T
 
S
K
 
K
I
 
I
T
 
T
E
 
K
A
 
N
M
 
M
K
 
L
L
 
L
A
 
S
C
 
A
V
 
V
R
 
E
E
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
R
L
 
S
A
 
C
K
 
E
A
 
P
E
 
E
T
 
-
S
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
P
D
 
E
Y
 
R
L
 
I
I
 
I
P
 
P
T
 
E
P
 
A
F
 
F
D
 
D
S
 
M
R
 
K
L
 
V
I
 
H
L
 
L
K
 
N
I
 
V
A
 
Y
P
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
K
K
 
G
A
 
S
A
 
A

2haeB Crystal structure of a putative malic enzyme (malate oxidoreductase)
46% identity, 52% coverage: 16:406/758 of query aligns to 2:373/373 of 2haeB

query
sites
2haeB
A
 
A
R
 
L
E
 
E
Y
 
L
H
 
H
R
 
R
T
 
F
P
 
-
S
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
I
E
 
R
V
 
T
R
 
A
P
 
L
T
 
P
K
 
V
P
 
E
L
 
K
S
 
V
N
 
D
Q
 
R
R
 
E
D
 
T
L
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
L
Y
|
Y
S
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
Y
 
D
P
 
V
C
 
A
L
 
R
D
 
A
I
 
C
E
 
A
A
 
E
D
 
D
P
 
P
L
 
E
K
 
K
A
 
T
F
 
Y
D
 
V
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
R
 
R
G
 
W
N
 
N
L
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
V
S
 
S
N
 
D
G
 
G
T
 
S
A
|
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
A
 
G
S
 
A
K
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
A
C
 
F
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
D
V
 
I
D
 
D
V
 
A
F
 
F
D
 
P
I
 
I
E
 
C
L
 
L
A
 
S
E
 
E
N
 
S
D
 
E
P
 
E
D
 
E
K
 
K
L
 
I
V
 
I
E
 
S
I
 
I
I
 
V
A
 
K
S
 
S
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
S
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
K
C
 
C
F
 
F
Y
 
R
I
 
I
E
 
L
Q
 
Q
K
 
R
L
 
L
S
 
S
A
 
E
R
 
E
M
 
M
N
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
Q
G
 
G
T
|
T
A
 
A
I
 
V
I
 
V
S
 
V
S
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
F
L
 
L
N
 
N
G
 
A
L
 
L
E
 
K
L
 
L
V
 
T
G
 
E
K
 
K
D
 
K
I
 
I
G
 
E
K
 
E
V
 
V
K
 
K
I
 
V
A
 
V
V
 
V
S
x
N
G
 
G
A
 
I
G
|
G
A
|
A
A
|
A
A
 
G
I
 
Y
A
 
N
C
 
I
V
 
V
E
 
K
V
 
F
M
 
L
I
 
L
G
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
V
K
 
K
R
 
-
E
 
-
N
 
N
V
 
V
Y
 
V
M
 
A
V
 
V
D
|
D
S
x
R
K
 
K
G
 
G
V
 
I
I
 
L
Y
 
N
E
 
E
G
 
N
R
 
D
P
 
P
G
 
E
G
 
T
L
 
C
D
 
L
A
 
N
S
 
E
K
 
Y
Q
 
E
R
 
I
Y
 
A
A
 
R
I
 
I
K
 
T
T
 
N
E
 
P
A
 
E
R
 
R
T
 
L
L
 
S
A
 
G
D
 
D
V
 
L
-
 
E
-
 
T
-
 
A
V
 
L
N
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
F
F
 
F
L
 
I
G
 
G
C
x
V
S
|
S
A
x
R
P
 
G
G
 
N
V
 
I
L
 
L
S
 
K
A
 
P
E
 
E
M
 
W
V
 
I
K
 
K
T
 
K
M
 
M
A
 
S
D
 
R
K
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
I
L
 
F
A
 
A
L
|
L
A
|
A
N
|
N
P
 
P
E
 
V
P
 
P
E
 
E
I
 
I
R
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
R
S
 
E
V
 
A
R
 
G
P
 
A
D
 
-
C
 
F
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
H
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
N
|
N
V
 
L
L
 
L
C
 
A
F
 
F
P
 
P
Y
 
G
I
 
I
F
 
M
R
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
V
D
 
E
C
 
-
G
 
K
A
 
R
T
 
S
K
 
K
I
 
I
T
 
T
E
 
K
A
 
N
M
 
M
K
 
L
L
 
L
A
 
S
C
 
A
V
 
V
R
 
E
E
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
R
L
 
S
A
 
C
K
 
E
A
 
P
E
 
E
T
 
-
S
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
P
D
 
E
Y
 
R
L
 
I
I
 
I
P
 
P
T
 
E
P
 
A
F
 
F
D
 
D
S
 
M
R
 
K
L
 
V
I
 
H
L
 
L
K
 
N
I
 
V
A
 
Y
P
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
K
K
 
G
A
 
S
A
 
A

1xcoD Crystal structure of a phosphotransacetylase from bacillus subtilis in complex with acetylphosphate (see paper)
29% identity, 42% coverage: 437:751/758 of query aligns to 3:324/325 of 1xcoD

query
sites
1xcoD
M
 
M
Q
 
A
P
 
D
V
 
L
F
 
F
N
 
S
T
 
T
A
 
V
-
 
Q
-
 
E
K
 
K
V
 
V
A
 
A
P
 
G
Q
 
K
-
 
D
-
 
V
R
 
K
V
 
I
V
 
V
Y
 
F
A
 
P
D
 
E
G
 
G
Q
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
R
V
 
I
L
 
L
R
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
F
 
K
V
 
L
A
 
A
D
 
G
E
 
N
G
 
K
L
 
V
A
 
L
A
 
N
P
 
P
I
 
I
L
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
N
P
 
E
A
 
N
A
 
E
I
 
I
E
 
Q
A
 
A
G
 
K
I
 
A
K
 
K
K
 
E
A
 
-
G
 
-
L
 
L
R
 
N
I
 
L
K
 
T
I
 
L
G
 
G
Q
 
-
N
 
G
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
I
 
Y
D
 
D
P
 
P
A
 
H
T
 
T
D
 
Y
A
 
E
-
 
G
-
 
M
-
 
E
R
 
D
V
 
L
A
 
V
Q
 
Q
Y
 
A
A
 
F
A
 
V
Q
 
E
Y
x
R
K
x
R
D
 
K
G
 
G
G
x
K
E
 
A
A
 
T
D
 
E
V
 
E
R
 
Q
A
 
A
S
 
R
G
 
K
S
 
A
L
 
L
L
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
N
-
 
Y
-
 
F
A
 
G
A
 
T
L
 
M
M
 
L
V
 
V
K
 
Y
A
 
K
G
 
G
D
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
G
M
 
L
L
 
V
C
 
S
G
 
G
L
 
A
D
 
A
G
 
H
N
 
S
Y
x
T
D
 
A
G
 
D
H
 
T
L
 
V
A
 
R
H
 
P
V
 
A
E
 
L
K
 
Q
V
 
I
I
 
I
G
x
K
L
 
T
K
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
V
Q
 
K
E
 
K
F
 
T
A
 
S
A
 
G
L
 
V
N
 
F
A
 
I
V
 
M
L
 
A
L
 
R
P
 
G
D
 
E
Q
 
E
T
 
Q
L
 
Y
F
 
V
I
 
F
T
 
A
D
 
D
T
 
C
Y
 
A
V
 
I
N
 
N
D
 
I
T
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
S
E
 
Q
Q
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
E
I
 
I
A
 
A
Q
 
I
A
 
E
A
 
S
A
 
A
E
 
N
E
 
T
V
 
A
A
 
K
R
 
M
F
 
F
G
 
D
V
 
I
P
 
E
P
 
P
K
 
R
V
 
V
A
 
A
F
 
M
L
 
L
S
 
S
H
 
F
S
 
S
N
 
T
R
 
K
G
 
G
S
 
S
S
 
A
S
 
K
R
 
S
P
 
D
S
 
E
A
 
T
R
 
E
K
 
K
M
 
V
A
 
A
A
 
D
A
 
A
H
 
V
E
 
K
A
 
I
F
 
A
K
 
K
K
 
E
L
 
K
A
 
A
P
 
P
E
 
E
V
 
L
E
 
T
S
 
L
A
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
F
H
 
Q
G
 
F
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
F
S
 
V
E
 
P
K
 
S
I
 
V
R
 
A
N
 
E
N
 
K
A
 
K
G
 
A
L
 
-
A
 
P
D
 
D
S
 
S
G
 
E
L
 
I
T
 
K
G
 
G
A
 
D
A
 
A
N
 
N
V
 
V
L
 
F
V
 
V
C
 
F
P
 
P
N
 
S
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
G
N
 
N
I
 
I
L
 
G
F
x
Y
N
x
K
V
 
I
L
 
A
K
 
Q
T
 
-
S
 
R
S
 
L
G
 
G
Q
 
N
G
 
F
T
 
E
T
 
A
I
 
V
G
 
G
P
 
P
I
 
I
L
 
L
L
 
Q
G
 
G
A
 
L
A
x
N
A
 
M
P
 
P
V
 
V
H
 
N
V
 
D
L
 
L
T
x
S
P
x
R
S
 
G
S
 
C
T
 
N
V
 
A
R
 
E
R
 
D
V
 
V
I
 
Y
N
 
N
M
 
L
T
 
A
A
 
L
L
 
I
A
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
Q
A
 
A

6ioxA Crystal structure of porphyromonas gingivalis phosphotransacetylase in complex with acetyl-coa (see paper)
29% identity, 42% coverage: 436:751/758 of query aligns to 7:334/339 of 6ioxA

query
sites
6ioxA
F
 
L
M
 
I
Q
 
Q
P
 
D
V
 
V
F
 
I
N
 
R
T
 
R
A
 
A
K
 
Q
V
 
E
A
 
N
P
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
V
 
V
Y
 
L
A
 
P
D
 
E
G
 
G
Q
 
L
D
 
E
E
 
P
R
 
R
V
 
T
L
 
L
R
 
E
A
 
A
V
 
A
Q
 
D
F
 
R
V
 
L
A
 
M
D
 
A
E
 
D
G
 
K
L
 
V
A
 
V
A
 
N
P
 
I
I
 
I
L
 
L
V
 
I
G
 
G
A
 
N
P
 
V
A
 
D
A
 
S
I
 
V
E
 
K
A
 
A
G
 
K
I
 
V
K
 
A
K
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
K
I
 
-
K
 
N
I
 
L
G
 
D
Q
 
E
N
 
A
V
 
V
Q
 
-
V
 
I
I
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
N
T
 
N
D
 
H
A
 
P
R
 
K
V
 
K
A
 
Q
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
T
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
Q
A
 
I
Q
 
R
Y
 
Q
K
 
K
D
 
K
G
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
E
G
 
K
E
 
A
A
 
A
D
 
E
V
 
L
R
 
V
A
 
E
S
 
N
G
 
P
S
 
L
L
 
Y
L
 
L
A
 
G
A
 
C
L
 
L
M
 
I
V
 
V
K
 
K
A
 
S
G
 
G
D
 
D
A
 
A
D
 
D
A
 
G
M
 
L
L
 
I
C
 
A
G
 
G
L
 
A
D
 
Q
G
 
N
N
 
T
Y
 
T
D
 
G
G
 
D
H
 
V
L
 
L
A
 
R
H
 
P
V
 
A
E
x
L
K
 
Q
V
 
V
I
 
I
G
 
K
L
 
T
K
 
A
Q
 
P
G
 
G
A
 
M
Q
 
T
E
x
S
F
x
V
A
 
S
A
 
G
L
 
T
N
 
F
A
 
L
V
 
L
L
 
F
L
 
T
P
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
Y
-
 
G
-
 
K
D
 
D
Q
 
G
T
 
L
L
 
L
F
 
L
I
 
V
T
 
A
D
 
D
T
 
C
Y
x
A
V
|
V
N
 
I
D
 
P
T
 
N
P
 
P
D
 
T
A
 
A
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
I
 
I
A
 
A
Q
 
V
A
 
A
A
 
T
A
 
A
E
 
R
E
 
T
V
 
A
A
 
K
R
 
A
F
 
I
G
 
A
-
 
D
V
 
I
P
 
E
P
 
P
K
 
R
V
 
V
A
 
A
F
 
M
L
 
L
S
 
S
H
 
F
S
 
S
N
 
T
R
 
K
G
 
G
S
 
S
S
 
A
S
 
K
R
 
H
P
 
E
S
 
M
A
 
T
R
 
D
K
 
K
M
 
V
A
 
V
A
 
E
A
 
A
H
 
T
E
 
R
A
 
M
F
 
A
K
 
Q
K
 
E
L
 
M
A
 
A
P
 
P
E
 
D
V
 
L
E
 
L
S
 
I
A
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
M
H
 
Q
G
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
V
E
 
E
K
 
R
I
 
V
R
 
-
N
 
-
N
 
-
A
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
K
-
 
A
-
 
P
D
 
G
S
 
S
G
 
N
L
 
V
T
 
A
G
 
G
A
 
K
A
 
A
N
 
N
V
 
V
L
 
L
V
 
V
C
 
F
P
 
P
N
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
V
A
 
G
N
 
N
I
 
I
L
 
A
F
 
Y
N
 
K
V
 
L
L
 
V
K
 
E
T
 
-
S
 
R
S
 
L
G
 
G
Q
 
H
G
 
A
T
 
E
T
 
A
I
 
V
G
 
G
P
 
P
I
 
I
L
 
L
L
 
Q
G
 
G
A
 
M
A
 
A
A
 
A
P
 
P
V
 
V
H
 
N
V
 
D
L
 
L
T
 
S
P
 
R
S
 
G
S
 
C
T
 
S
V
 
V
R
 
E
R
 
D
V
 
I
I
 
Y
N
 
R
M
 
M
T
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
T
A
 
A
A
 
N
K
 
Q
A
 
A

Q8ZND6 Phosphate acetyltransferase; Phosphotransacetylase; EC 2.3.1.222; EC 2.3.1.8 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
27% identity, 42% coverage: 436:751/758 of query aligns to 391:709/714 of Q8ZND6

query
sites
Q8ZND6
F
 
F
M
 
R
Q
 
Y
P
 
Q
V
 
L
F
 
T
N
 
E
T
 
L
A
 
A
K
 
R
V
 
K
A
 
A
P
 
G
Q
 
K
R
 
R
V
 
V
V
 
V
Y
 
L
A
 
P
D
 
E
G
 
G
Q
 
D
D
 
E
E
 
P
R
 
R
V
 
T
L
 
V
R
 
K
A
 
A
V
 
A
Q
 
A
F
 
I
V
 
C
A
 
A
D
 
E
E
 
R
G
 
G
L
 
I
A
 
A
A
 
T
P
 
C
I
 
V
L
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
N
P
 
P
A
 
D
A
 
E
I
 
I
E
 
N
A
 
R
G
 
V
I
 
A
K
 
A
K
 
S
A
 
Q
G
 
G
L
 
-
R
 
-
I
 
V
K
 
E
I
 
L
G
 
G
Q
 
A
N
 
G
V
 
I
Q
 
E
V
 
I
I
 
V
D
 
D
P
 
P
A
 
E
T
 
V
-
 
V
-
 
R
D
 
E
A
 
S
R
 
Y
V
 
V
A
 
A
Q
 
R
Y
 
L
A
 
V
A
 
E
Q
 
L
Y
 
R
K
 
K
D
 
S
G
 
K
G
 
G
E
 
M
A
 
T
D
 
E
V
 
P
R
 
V
A
 
A
S
 
R
G
 
E
S
 
Q
L
 
L
-
 
E
-
 
D
-
 
N
-
 
V
-
 
V
L
 
L
A
 
G
A
 
T
L
 
L
M
 
M
V
 
L
K
 
E
A
 
Q
G
 
D
D
 
E
A
 
V
D
 
D
A
 
G
M
 
L
L
 
V
C
 
S
G
 
G
L
 
A
D
 
V
G
 
H
N
 
T
Y
 
T
D
 
A
G
 
N
H
 
T
L
 
I
A
 
R
H
 
P
V
 
P
E
 
L
K
 
Q
V
 
L
I
 
I
G
 
K
L
 
T
K
 
A
Q
 
P
G
 
G
A
 
S
Q
 
S
E
 
L
F
 
V
A
 
S
A
 
S
L
 
V
N
 
F
A
 
F
V
 
M
L
 
L
L
 
L
P
 
P
D
 
E
Q
 
Q
T
 
V
L
 
Y
F
 
V
I
 
Y
T
 
G
D
 
D
T
 
C
Y
 
A
V
 
I
N
 
N
D
 
P
T
 
D
P
 
P
D
 
T
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
E
I
 
I
A
 
A
Q
 
I
A
 
Q
A
 
S
A
 
A
E
 
D
E
 
S
V
 
A
A
 
I
R
 
A
F
 
F
G
 
G
V
 
I
P
 
E
P
 
P
K
 
R
V
 
V
A
 
A
F
 
M
L
 
L
S
 
S
H
 
Y
S
 
S
N
 
T
R
 
G
G
 
T
S
 
S
S
 
G
S
 
A
R
 
G
P
 
S
S
 
D
A
 
V
R
 
E
K
 
K
M
 
V
A
 
R
A
 
E
A
 
A
H
 
T
E
 
R
A
 
L
F
 
A
K
 
Q
K
 
E
L
 
K
A
 
R
P
 
P
E
 
D
V
 
L
E
 
M
S
 
I
A
 
D
G
 
G
E
 
P
L
 
L
H
 
Q
G
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
V
S
 
M
E
 
A
K
 
D
I
 
V
R
 
A
N
 
K
N
 
S
A
 
K
G
 
A
L
 
-
A
 
P
D
 
N
S
 
S
G
 
P
L
 
V
T
 
A
G
 
G
A
 
R
A
 
A
N
 
T
V
 
V
L
 
F
V
 
I
C
 
F
P
 
P
N
 
D
L
 
L
D
 
N
A
 
T
A
 
G
N
 
N
I
 
T
L
 
T
F
 
Y
N
 
K
V
 
A
L
 
V
K
 
Q
T
 
R
S
 
S
S
 
A
G
 
D
Q
 
L
G
 
-
T
 
I
T
 
S
I
 
I
G
 
G
P
 
P
I
 
M
L
 
L
L
 
Q
G
 
G
A
 
M
A
 
R
A
 
K
P
 
P
V
 
V
H
 
N
V
 
D
L
 
L
T
 
S
P
 
R
S
 
G
S
 
A
T
 
L
V
 
V
R
 
D
R
 
D
V
 
I
I
 
V
N
 
Y
M
 
T
T
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
T
A
 
A
A
 
I
K
 
Q
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P16243 NADP-dependent malic enzyme, chloroplastic; NADP-ME; EC 1.1.1.40 from Zea mays (Maize) (see 3 papers)
28% identity, 46% coverage: 66:414/758 of query aligns to 221:612/636 of P16243

query
sites
P16243
D
 
N
Y
 
W
T
 
P
S
 
H
R
 
R
G
 
N
N
 
I
L
 
Q
V
 
V
A
 
I
V
 
C
I
 
V
S
 
T
N
 
D
G
 
G
T
 
E
A
x
R
V
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
D
I
 
L
G
 
G
P
 
-
L
 
C
A
 
Q
S
 
G
K
 
M
P
 
G
V
 
I
M
 
P
E
 
V
G
 
G
K
|
K
G
 
L
C
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
T
K
 
A
F
 
L
A
 
G
G
 
G
V
 
V
D
 
D
-
 
P
-
 
S
-
 
V
-
 
C
-
 
L
-
 
P
-
 
I
V
 
T
F
 
I
D
 
D
I
 
V
-
 
G
-
 
T
-
 
N
-
 
N
E
 
E
L
 
F
A
 
L
E
 
L
N
 
N
D
 
D
P
 
E
-
 
F
-
 
Y
-
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
R
-
 
Q
-
 
K
-
 
R
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
E
-
 
E
-
 
Y
D
 
D
K
 
E
L
 
L
V
 
I
E
 
E
I
 
E
I
 
F
A
 
M
S
 
S
L
 
A
E
 
V
P
 
K
T
 
Q
L
 
F
G
 
Y
G
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
L
I
 
I
N
 
Q
L
 
F
E
 
E
D
 
D
I
 
F
K
 
A
A
 
N
P
 
H
E
 
N
C
 
A
F
 
F
Y
 
D
I
 
L
E
 
L
Q
x
E
K
 
K
L
 
Y
S
 
S
A
 
K
R
 
S
M
 
H
N
 
-
I
 
-
P
 
L
V
 
V
F
 
F
H
 
N
D
 
D
D
 
D
Q
 
I
H
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
S
I
 
V
S
 
V
S
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
L
N
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
K
L
 
M
V
 
V
G
 
G
K
 
G
D
 
T
I
 
L
G
 
A
K
 
E
V
 
Q
K
 
T
I
 
Y
A
 
L
V
 
F
S
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
E
A
|
A
A
 
G
I
 
T
A
 
G
C
 
I
V
x
A
E
 
E
V
 
-
M
 
L
I
 
I
G
 
A
L
 
L
G
 
E
V
 
I
K
 
S
-
 
K
-
 
Q
-
 
T
-
 
N
-
 
A
-
 
P
-
 
I
-
 
E
-
 
E
-
 
C
R
 
R
E
 
K
N
 
K
V
 
V
Y
 
W
M
 
L
V
 
V
D
 
D
S
 
S
K
 
K
G
 
G
V
 
L
I
 
I
Y
 
V
E
 
D
G
 
S
R
 
R
P
 
K
G
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
Q
A
 
P
S
 
F
K
|
K
Q
x
K
R
 
P
Y
 
W
A
 
A
I
 
H
K
 
E
T
 
H
E
 
E
A
 
P
-
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
Y
D
 
D
V
 
A
V
 
V
N
 
Q
G
 
S
A
 
I
D
 
K
-
 
P
-
 
T
V
 
V
F
 
L
L
 
I
G
 
G
C
 
T
S
 
S
A
 
G
P
 
V
G
 
G
-
 
R
V
 
T
L
 
F
S
 
T
A
 
K
E
 
E
M
 
I
V
 
I
K
 
E
T
 
A
M
 
M
A
 
S
-
 
S
-
 
F
-
 
N
D
 
E
K
 
R
P
 
P
I
 
I
I
 
I
L
 
F
A
 
S
L
 
L
A
 
S
N
 
N
P
 
P
-
 
T
-
 
S
E
 
H
P
 
S
E
 
E
I
 
C
R
 
T
P
 
A
E
 
E
L
x
Q
A
 
A
K
 
Y
S
 
T
V
 
W
-
 
S
R
 
Q
P
 
G
D
 
R
C
 
S
I
 
I
I
 
F
A
 
A
T
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
F
-
 
A
-
 
P
-
 
V
-
 
E
-
 
Y
-
 
E
G
 
G
R
 
K
S
 
T
D
 
F
Y
 
V
P
 
P
N
 
G
Q
 
Q
V
 
S
N
 
N
N
 
N
V
 
A
L
 
Y
C
 
I
F
 
F
P
 
P
Y
 
G
I
x
L
F
 
G
R
 
L
G
 
G
A
 
L
L
 
V
D
 
I
C
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
V
K
 
R
I
 
V
T
 
H
E
 
E
A
 
D
M
 
M
K
 
L
L
 
L
A
 
A
C
 
A
V
 
S
R
 
K
E
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
Q
A
 
A
K
 
-
A
 
T
E
 
Q
T
 
D
S
 
N
A
 
F
E
 
E
V
 
K
S
 
G
A
 
S
A
 
I
Y
 
F
P
 
P
G
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
I
 
-
P
 
-
T
 
-
P
 
P
F
 
F
D
 
T
S
 
S
-
 
I
-
 
R
R
 
K
L
 
I
I
 
S
L
 
A
K
 
H
I
 
I
A
 
A
P
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
K
 
G
A
 
K
A
 
A
A
 
Y
E
 
E
S
 
L
G
 
G
V
 
L
A
 
A
T
 
T
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1gq2A Malic enzyme from pigeon liver (see paper)
28% identity, 45% coverage: 76:413/758 of query aligns to 137:516/555 of 1gq2A

query
sites
1gq2A
V
 
V
I
 
V
S
 
T
N
 
D
G
 
G
T
 
E
A
x
R
V
 
I
L
|
L
G
|
G
L
 
L
G
 
G
N
 
D
I
 
L
G
 
G
P
 
C
L
 
Y
A
 
G
S
 
M
K
 
G
-
 
I
P
 
P
V
 
V
M
 
-
E
 
-
G
 
G
K
|
K
G
 
L
C
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
T
K
 
A
F
 
C
A
 
G
G
 
G
V
 
V
-
 
K
-
 
P
-
 
H
-
 
Q
-
 
C
-
 
L
-
 
P
-
 
V
-
 
M
-
 
L
D
 
D
V
 
V
-
 
G
F
 
T
D
 
D
I
 
N
E
 
E
L
 
T
A
 
L
E
 
L
N
 
K
D
 
D
P
 
P
-
 
L
-
 
Y
-
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
R
-
 
H
-
 
K
-
 
R
-
 
I
-
 
R
-
 
G
-
 
Q
-
 
A
-
 
Y
-
 
D
-
 
D
-
 
L
-
 
L
D
 
D
K
 
E
L
 
F
V
 
M
E
 
E
I
 
A
I
 
V
A
 
T
S
 
S
L
 
R
E
 
Y
P
 
G
T
 
M
L
 
N
G
 
C
G
 
L
I
 
I
N
 
Q
L
 
F
E
|
E
D
|
D
I
 
F
K
 
A
A
x
N
P
 
A
E
 
N
C
 
A
F
 
F
Y
 
R
I
 
L
E
 
L
Q
 
H
K
 
K
L
 
Y
S
 
-
A
 
-
R
 
R
M
 
N
N
 
K
I
 
Y
P
 
C
V
 
T
F
 
F
H
 
N
D
|
D
D
|
D
Q
 
I
H
 
Q
G
 
G
T
|
T
A
 
A
I
 
S
I
 
V
S
 
A
S
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
L
N
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
R
L
 
I
V
 
T
G
 
K
K
 
N
D
 
R
I
 
L
G
 
S
K
 
D
V
 
H
K
 
T
I
 
V
A
 
L
V
 
F
S
 
Q
G
|
G
A
|
A
G
|
G
A
x
E
A
|
A
A
 
A
I
 
L
A
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
N
-
 
L
C
 
I
V
 
V
E
 
M
V
 
A
M
 
M
I
 
Q
G
 
K
L
 
E
G
 
G
V
 
V
K
 
S
R
 
K
E
 
E
N
 
E
-
 
A
-
 
I
-
 
K
-
 
R
V
 
I
Y
 
W
M
 
M
V
|
V
D
|
D
S
|
S
K
 
K
G
 
G
V
 
L
I
 
I
Y
 
V
E
 
K
G
 
G
R
 
R
P
 
-
G
 
A
G
 
S
L
 
L
D
 
T
A
 
P
S
 
E
K
 
K
Q
 
E
R
 
H
Y
 
F
A
 
A
I
 
H
K
 
E
-
 
H
T
 
C
E
 
E
A
 
M
R
 
K
T
 
N
L
 
L
A
 
E
D
 
D
V
 
I
V
 
V
N
 
K
G
 
D
A
 
I
D
 
K
-
 
P
-
 
T
V
 
V
F
 
L
L
 
I
G
 
G
C
 
V
S
x
A
A
 
A
-
x
I
P
 
G
G
 
G
V
 
A
L
 
F
S
 
T
A
 
Q
E
 
Q
M
 
I
V
 
L
K
 
Q
T
 
D
M
 
M
A
 
A
-
 
A
-
 
F
-
 
N
D
 
K
K
 
R
P
 
P
I
 
I
I
 
I
L
 
F
A
 
A
L
|
L
A
 
S
N
|
N
P
 
P
E
 
T
P
 
S
E
 
K
I
 
A
R
 
E
-
 
C
-
 
T
-
 
A
P
 
E
E
 
Q
L
 
L
A
 
Y
K
 
K
S
 
Y
V
 
T
R
 
E
P
 
G
D
 
R
C
 
G
I
 
I
I
 
F
A
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
F
-
 
D
-
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
P
T
 
S
G
 
G
R
 
Q
S
 
T
D
 
L
Y
 
Y
P
 
P
N
 
G
Q
 
Q
V
x
G
N
|
N
N
|
N
V
 
S
L
 
Y
C
 
V
F
 
F
P
 
P
Y
 
G
I
 
V
F
 
A
R
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
I
D
 
S
C
 
C
G
 
G
A
 
L
T
 
K
K
 
H
I
 
I
T
 
G
E
 
D
A
 
D
M
 
V
K
 
F
L
 
L
A
 
T
C
 
T
V
 
A
R
 
E
E
 
V
I
 
I
A
 
A
D
 
Q
L
 
E
A
 
V
K
 
S
A
 
E
E
 
E
T
 
N
S
 
L
A
 
Q
E
 
E
V
 
-
S
 
G
A
 
R
A
 
L
Y
 
Y
P
 
P
G
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
I
 
-
P
 
P
T
 
L
P
 
V
F
 
T
D
 
I
S
 
Q
R
 
Q
L
 
V
I
 
S
L
 
L
K
 
K
I
 
I
A
 
A
P
 
V
A
 
R
V
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
Y
E
 
R
S
 
N
G
 
N
V
 
T
A
 
A
T
 
S

Sites not aligning to the query:

P38503 Phosphate acetyltransferase; Phosphotransacetylase; EC 2.3.1.8 from Methanosarcina thermophila (see 2 papers)
25% identity, 42% coverage: 436:753/758 of query aligns to 4:332/333 of P38503

query
sites
P38503
F
 
F
M
 
L
Q
 
E
P
 
K
V
 
I
F
 
S
N
 
E
T
 
R
A
 
A
K
 
K
V
 
K
A
 
L
P
 
N
Q
 
K
R
 
T
V
 
I
V
 
A
Y
 
L
A
 
P
D
 
E
G
 
T
Q
 
E
D
 
D
E
 
I
R
 
R
V
 
T
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
V
 
A
Q
 
A
F
 
K
V
 
I
A
 
L
D
 
E
E
 
R
G
 
G
L
 
I
A
 
A
A
 
D
P
 
I
I
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
N
P
 
E
A
 
A
A
 
D
I
 
I
E
 
K
A
 
A
G
 
L
I
 
A
K
 
G
K
 
D
A
 
L
G
 
D
L
 
L
R
 
-
I
 
-
K
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
S
N
 
K
V
 
A
Q
 
K
V
 
I
I
 
V
D
 
D
P
 
P
A
 
K
T
 
T
D
 
Y
A
 
E
R
 
K
V
 
K
A
 
D
Q
 
E
Y
 
Y
A
 
I
A
 
N
Q
 
A
Y
 
F
-
 
Y
-
 
E
-
 
L
-
 
R
K
 
K
D
 
H
G
 
K
G
 
G
-
 
I
-
 
T
-
 
L
-
 
E
-
 
N
E
 
A
A
 
A
D
 
E
V
 
I
R
 
M
A
 
S
S
 
D
G
 
Y
S
 
V
L
 
Y
L
 
F
A
 
A
A
 
V
L
 
M
M
 
M
V
 
A
K
 
K
A
 
L
G
 
G
D
 
E
A
 
V
D
 
D
A
 
G
M
 
V
L
 
V
C
 
S
G
 
G
L
 
A
D
 
A
G
 
H
N
 
S
Y
 
S
D
 
S
G
 
D
H
 
T
L
 
L
A
 
R
H
 
P
V
 
A
E
 
V
K
 
Q
V
 
I
I
 
V
G
 
K
L
 
T
K
 
A
Q
 
K
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
E
 
L
F
 
A
A
 
S
A
 
A
L
 
F
N
 
F
A
 
I
V
 
I
L
 
S
L
 
V
P
 
P
D
 
D
-
x
C
-
 
E
-
 
Y
-
 
G
-
 
S
-
 
D
Q
 
G
T
 
T
L
 
F
F
 
L
I
 
F
T
 
A
D
 
D
T
 
S
Y
 
G
V
 
M
N
 
V
D
 
E
T
 
M
P
 
P
D
 
S
A
 
V
E
 
E
Q
 
D
L
 
V
A
 
A
R
 
N
I
 
I
A
 
A
Q
 
V
A
 
I
A
 
S
A
 
A
E
 
K
E
 
T
V
 
F
A
 
E
R
 
L
F
 
L
G
 
V
V
 
Q
P
 
D
-
 
V
P
 
P
K
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
M
L
 
L
S
 
S
H
 
Y
S
 
S
N
 
T
R
 
K
G
 
G
S
 
S
S
 
A
S
 
K
R
 
S
P
 
K
S
 
L
A
 
T
R
 
E
K
 
A
M
 
T
A
 
I
A
 
A
A
 
S
H
 
T
E
 
K
A
 
L
F
 
A
K
 
Q
K
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
D
V
 
I
E
 
A
S
 
I
A
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
L
H
 
Q
G
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
I
S
 
V
E
 
P
K
 
K
I
 
V
R
 
A
N
 
A
N
 
S
A
 
K
G
 
A
L
 
-
A
 
P
D
 
G
S
 
S
G
 
P
L
 
V
T
 
A
G
 
G
A
 
K
A
 
A
N
 
N
V
 
V
L
 
F
V
 
I
C
 
F
P
 
P
N
 
D
L
 
L
D
 
N
A
 
C
A
 
G
N
 
N
I
 
I
L
 
A
F
 
Y
N
 
K
V
 
I
L
 
A
K
 
Q
T
 
R
S
 
L
S
 
A
G
 
-
Q
 
K
G
 
A
T
 
E
T
 
A
I
 
Y
G
 
G
P
 
P
I
 
I
L
 
T
L
 
Q
G
 
G
A
 
L
A
 
A
A
 
K
P
 
P
V
 
I
H
 
N
V
 
D
L
 
L
T
 
S
P
 
R
S
 
G
S
 
C
T
 
S
V
 
D
R
 
E
R
 
D
V
 
I
I
 
V
N
 
G
M
 
A
T
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
T
A
 
C
-
 
V
-
 
Q
A
 
A
K
 
A
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D

Sites not aligning to the query:

P40927 NADP-dependent malic enzyme; NADP-ME; EC 1.1.1.40 from Columba livia (Rock dove) (see 3 papers)
28% identity, 45% coverage: 76:413/758 of query aligns to 138:517/557 of P40927

query
sites
P40927
V
 
V
I
 
V
S
 
T
N
x
D
G
 
G
T
 
E
A
x
R
V
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
D
I
 
L
G
 
G
P
 
C
L
 
Y
A
 
G
S
 
M
K
 
G
-
 
I
P
 
P
V
 
V
M
 
-
E
 
-
G
 
G
K
|
K
G
 
L
C
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
T
K
 
A
F
 
C
A
 
G
G
 
G
V
 
V
-
 
K
-
 
P
-
 
H
-
 
Q
-
 
C
-
 
L
-
 
P
-
 
V
-
 
M
-
 
L
D
 
D
V
 
V
-
 
G
F
 
T
D
 
D
I
 
N
E
 
E
L
 
T
A
 
L
E
 
L
N
 
K
D
|
D
P
 
P
-
 
L
-
 
Y
-
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
R
-
 
H
-
 
K
-
 
R
-
 
I
-
 
R
-
 
G
-
 
Q
-
 
A
-
 
Y
-
 
D
-
 
D
-
 
L
-
 
L
D
 
D
K
 
E
L
 
F
V
 
M
E
 
E
I
 
A
I
 
V
A
 
T
S
 
S
L
 
R
E
 
Y
P
 
G
T
 
M
L
 
N
G
 
C
G
 
L
I
 
I
N
 
Q
L
 
F
E
|
E
D
|
D
I
 
F
K
 
A
A
x
N
P
 
A
E
 
N
C
 
A
F
 
F
Y
 
R
I
 
L
E
 
L
Q
 
H
K
 
K
L
 
Y
S
 
-
A
 
-
R
 
R
M
 
N
N
 
K
I
 
Y
P
 
C
V
 
T
F
 
F
H
 
N
D
 
D
D
|
D
Q
 
I
H
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
S
I
 
V
S
 
A
S
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
L
N
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
R
L
 
I
V
 
T
G
 
K
K
 
N
D
 
R
I
 
L
G
 
S
K
 
D
V
 
H
K
 
T
I
 
V
A
 
L
V
 
F
S
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
|
G
A
x
E
A
|
A
A
 
A
I
 
L
A
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
N
-
 
L
C
 
I
V
 
V
E
 
M
V
 
A
M
 
M
I
 
Q
G
 
K
L
 
E
G
 
G
V
 
V
K
 
S
R
 
K
E
 
E
N
 
E
-
 
A
-
 
I
-
 
K
-
 
R
V
 
I
Y
 
W
M
 
M
V
 
V
D
 
D
S
|
S
K
 
K
G
 
G
V
 
L
I
 
I
Y
 
V
E
 
K
G
 
G
R
 
R
P
 
-
G
 
A
G
 
S
L
 
L
D
 
T
A
 
P
S
 
E
K
|
K
Q
 
E
R
 
H
Y
 
F
A
 
A
I
 
H
K
 
E
-
 
H
T
 
C
E
 
E
A
 
M
R
 
K
T
 
N
L
 
L
A
 
E
D
 
D
V
 
I
V
 
V
N
 
K
G
 
D
A
 
I
D
 
K
-
 
P
-
 
T
V
 
V
F
 
L
L
 
I
G
 
G
C
 
V
S
 
A
A
 
A
-
 
I
P
 
G
G
 
G
V
 
A
L
 
F
S
 
T
A
 
Q
E
 
Q
M
 
I
V
 
L
K
 
Q
T
 
D
M
 
M
A
 
A
-
 
A
-
 
F
-
 
N
D
 
K
K
 
R
P
 
P
I
 
I
I
 
I
L
 
F
A
 
A
L
 
L
A
 
S
N
|
N
P
 
P
E
 
T
P
 
S
E
 
K
I
 
A
R
 
E
-
 
C
-
 
T
-
 
A
P
 
E
E
 
Q
L
 
L
A
 
Y
K
 
K
S
 
Y
V
 
T
R
 
E
P
 
G
D
 
R
C
 
G
I
 
I
I
 
F
A
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
F
-
 
D
-
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
P
T
 
S
G
 
G
R
 
Q
S
 
T
D
 
L
Y
 
Y
P
 
P
N
 
G
Q
 
Q
V
 
G
N
 
N
N
|
N
V
 
S
L
 
Y
C
 
V
F
 
F
P
 
P
Y
 
G
I
 
V
F
 
A
R
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
I
D
 
S
C
 
C
G
 
G
A
 
L
T
 
K
K
 
H
I
 
I
T
 
G
E
x
D
A
 
D
M
 
V
K
 
F
L
 
L
A
 
T
C
 
T
V
 
A
R
 
E
E
 
V
I
 
I
A
 
A
D
 
Q
L
 
E
A
 
V
K
 
S
A
 
E
E
 
E
T
 
N
S
 
L
A
 
Q
E
 
E
V
 
-
S
 
G
A
 
R
A
 
L
Y
 
Y
P
 
P
G
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
I
 
-
P
 
P
T
 
L
P
 
V
F
 
T
D
 
I
S
 
Q
R
 
Q
L
 
V
I
 
S
L
 
L
K
 
K
I
 
I
A
 
A
P
 
V
A
 
R
V
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
Y
E
 
R
S
 
N
G
 
N
V
 
T
A
 
A
T
 
S

2af3C Phosphotransacetylase from methanosarcina thermophila soaked with coenzyme a (see paper)
25% identity, 42% coverage: 436:753/758 of query aligns to 3:331/332 of 2af3C

query
sites
2af3C
F
 
F
M
 
L
Q
 
E
P
 
K
V
 
I
F
 
S
N
 
E
T
 
R
A
 
A
K
 
K
V
 
K
A
 
L
P
 
N
Q
 
K
R
 
T
V
 
I
V
 
A
Y
 
L
A
 
P
D
 
E
G
 
T
Q
 
E
D
 
D
E
 
I
R
 
R
V
 
T
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
V
 
A
Q
 
A
F
 
K
V
 
I
A
 
L
D
 
E
E
 
R
G
 
G
L
 
I
A
 
A
A
 
D
P
 
I
I
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
N
P
 
E
A
 
A
A
 
D
I
 
I
E
 
K
A
 
A
G
 
L
I
 
A
K
 
G
K
 
D
A
 
L
G
 
D
L
 
L
R
 
-
I
 
-
K
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
S
N
 
K
V
 
A
Q
 
K
V
 
I
I
 
V
D
 
D
P
 
P
A
 
K
T
 
T
D
 
Y
A
 
E
R
 
K
V
 
K
A
 
D
Q
 
E
Y
 
Y
A
 
I
A
 
N
Q
 
A
Y
 
F
-
 
Y
-
 
E
-
 
L
-
x
R
K
 
K
D
 
H
G
 
K
G
 
G
-
 
I
-
 
T
-
 
L
-
 
E
-
 
N
E
 
A
A
 
A
D
 
E
V
 
I
R
 
M
A
 
S
S
 
D
G
 
Y
S
 
V
L
 
Y
L
 
F
A
 
A
A
 
V
L
 
M
M
 
M
V
 
A
K
 
K
A
 
L
G
 
G
D
 
E
A
 
V
D
 
D
A
 
G
M
 
V
L
 
V
C
 
S
G
 
G
L
 
A
D
 
A
G
 
H
N
 
S
Y
x
S
D
 
S
G
 
D
H
 
T
L
|
L
A
 
R
H
 
P
V
 
A
E
x
V
K
 
Q
V
 
I
I
 
V
G
 
K
L
 
T
K
 
A
Q
 
K
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
E
x
L
F
x
A
A
 
S
A
 
A
L
 
F
N
 
F
A
 
I
V
 
I
L
 
S
L
 
V
P
 
P
D
 
D
-
 
C
-
 
E
-
 
Y
-
 
G
-
 
S
-
 
D
Q
 
G
T
 
T
L
 
F
F
 
L
I
 
F
T
 
A
D
 
D
T
 
S
Y
x
G
V
x
M
N
x
V
D
x
E
T
 
M
P
 
P
D
 
S
A
 
V
E
 
E
Q
 
D
L
 
V
A
 
A
R
 
N
I
 
I
A
 
A
Q
 
V
A
 
I
A
 
S
A
 
A
E
 
K
E
 
T
V
 
F
A
 
E
R
 
L
F
 
L
G
 
V
V
 
Q
P
 
D
-
 
V
P
 
P
K
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
M
L
 
L
S
 
S
H
 
Y
S
 
S
N
 
T
R
 
K
G
 
G
S
 
S
S
 
A
S
 
K
R
 
S
P
 
K
S
 
L
A
 
T
R
 
E
K
 
A
M
 
T
A
 
I
A
 
A
A
 
S
H
 
T
E
 
K
A
 
L
F
 
A
K
 
Q
K
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
D
V
 
I
E
 
A
S
 
I
A
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
L
H
 
Q
G
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
I
S
 
V
E
 
P
K
 
K
I
 
V
R
 
A
N
 
A
N
 
S
A
 
K
G
 
A
L
 
-
A
 
P
D
 
G
S
 
S
G
 
P
L
 
V
T
 
A
G
 
G
A
 
K
A
 
A
N
 
N
V
 
V
L
 
F
V
 
I
C
 
F
P
 
P
N
 
D
L
 
L
D
 
N
A
 
C
A
 
G
N
|
N
I
 
I
L
 
A
F
x
Y
N
x
K
V
 
I
L
 
A
K
x
Q
T
 
R
S
 
L
S
 
A
G
 
-
Q
 
K
G
 
A
T
 
E
T
 
A
I
 
Y
G
|
G
P
|
P
I
 
I
L
x
T
L
 
Q
G
 
G
A
 
L
A
 
A
A
 
K
P
 
P
V
 
I
H
 
N
V
x
D
L
|
L
T
x
S
P
 
R
S
 
G
S
 
C
T
 
S
V
 
D
R
 
E
R
 
D
V
 
I
I
 
V
N
 
G
M
 
A
T
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
T
A
 
C
-
 
V
-
 
Q
A
 
A
K
 
A
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D

6c7nB Monoclinic form of malic enzyme from sorghum at 2 angstroms resolution (see paper)
28% identity, 39% coverage: 66:364/758 of query aligns to 138:492/553 of 6c7nB

query
sites
6c7nB
D
 
N
Y
 
W
T
 
P
S
 
H
R
 
R
G
 
N
N
 
V
L
 
Q
V
 
V
A
 
I
V
 
C
I
 
V
S
 
T
N
 
D
G
 
G
T
 
E
A
x
R
V
 
I
L
|
L
G
|
G
L
 
L
G
 
G
N
 
D
I
 
L
G
 
G
P
 
-
L
 
C
A
 
Q
S
 
G
K
 
M
P
 
G
V
 
I
M
 
P
E
 
V
G
 
G
K
|
K
G
 
L
C
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
T
K
 
A
F
 
L
A
 
G
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
P
-
 
S
-
 
A
-
 
C
-
 
L
-
 
P
F
 
I
D
 
T
I
 
I
E
 
D
L
 
V
A
 
G
E
 
T
N
 
N
D
 
N
P
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
F
-
 
Y
-
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
R
-
 
Q
-
 
K
-
 
R
-
 
A
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
E
-
 
Y
D
 
D
K
 
E
L
 
L
V
 
M
E
 
E
I
 
E
I
 
F
A
 
M
S
 
A
L
 
A
E
 
V
P
 
K
T
 
T
L
 
F
G
 
Y
G
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
L
I
 
I
N
 
Q
L
 
F
E
|
E
D
|
D
I
 
F
K
 
A
A
x
N
P
 
H
E
 
N
C
 
A
F
 
F
Y
 
D
I
 
L
E
 
L
Q
 
E
K
 
K
L
 
Y
S
 
S
A
 
-
R
 
K
M
 
T
N
 
H
I
 
L
P
 
-
V
 
V
F
 
F
H
 
N
D
|
D
D
|
D
Q
 
I
H
 
Q
G
 
G
T
|
T
A
 
A
I
 
S
I
 
V
S
 
V
S
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
L
N
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
K
L
 
M
V
 
V
G
 
G
K
 
G
D
 
T
I
 
L
G
 
A
K
 
E
V
 
Q
K
 
T
I
 
Y
A
 
L
V
 
F
S
x
L
G
|
G
A
|
A
G
|
G
A
x
E
A
|
A
A
 
G
I
 
T
A
 
G
C
 
I
V
 
A
E
 
E
V
 
-
M
 
L
I
 
I
G
 
A
L
 
L
G
 
E
V
 
M
K
 
S
-
 
K
-
 
Q
-
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
P
-
 
I
-
 
E
-
 
E
-
 
C
R
 
R
E
 
K
N
 
K
V
 
V
Y
 
W
M
 
L
V
 
V
D
|
D
S
|
S
K
 
K
G
 
G
V
 
L
I
 
I
Y
 
V
E
 
D
G
 
S
R
 
R
P
 
K
G
 
S
G
 
S
L
|
L
D
 
A
A
 
P
S
 
F
K
|
K
Q
 
K
R
 
P
Y
 
W
A
 
A
I
 
H
K
 
E
T
 
H
E
 
E
A
 
P
-
 
L
R
 
T
T
 
T
L
 
L
A
 
Y
D
 
D
V
 
A
V
 
V
N
 
Q
G
 
S
A
 
I
D
 
K
-
 
P
-
 
T
V
 
V
F
 
L
L
 
I
G
 
G
C
x
T
S
|
S
A
 
G
P
 
V
G
 
G
-
 
R
V
 
T
L
 
F
S
 
T
A
 
K
E
 
E
M
 
I
V
 
V
K
 
E
T
 
A
M
 
M
A
 
A
-
 
S
-
 
I
-
 
N
D
 
E
K
 
R
P
 
P
I
 
I
I
 
I
L
 
F
A
 
S
L
|
L
A
x
S
N
|
N
P
 
P
-
 
T
-
 
S
E
 
H
P
 
S
E
 
E
I
 
C
R
 
T
P
 
A
E
 
E
L
 
Q
A
 
A
K
 
Y
S
 
T
-
 
W
V
 
T
R
 
Q
P
 
G
D
 
R
C
 
A
I
 
V
I
 
F
A
 
A
T
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
F
-
 
A
-
 
P
-
 
V
-
 
E
-
 
Y
-
 
D
G
 
G
R
 
K
S
 
T
D
 
F
Y
 
V
P
 
P
N
 
G
Q
 
Q
V
x
S
N
 
N
N
|
N
V
 
A
L
 
Y
C
 
I
F
 
F
P
 
P
Y
 
G
I
 
L
F
 
G
R
 
L
G
 
G
A
 
L
L
 
V
D
 
I
C
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
V
K
 
R
I
 
V
T
 
H
E
 
E
A
 
D
M
 
M
K
 
L
L
 
L
A
 
A
C
 
A
V
 
S
R
 
A
E
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
Q
A
 
A
K
 
T
A
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

6c7nA Monoclinic form of malic enzyme from sorghum at 2 angstroms resolution (see paper)
28% identity, 39% coverage: 66:364/758 of query aligns to 138:492/553 of 6c7nA

query
sites
6c7nA
D
 
N
Y
 
W
T
 
P
S
 
H
R
 
R
G
 
N
N
 
V
L
 
Q
V
 
V
A
 
I
V
 
C
I
 
V
S
 
T
N
 
D
G
 
G
T
 
E
A
x
R
V
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
D
I
 
L
G
 
G
P
 
-
L
 
C
A
 
Q
S
 
G
K
 
M
P
 
G
V
 
I
M
 
P
E
 
V
G
 
G
K
|
K
G
 
L
C
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
T
K
 
A
F
 
L
A
 
G
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
P
-
 
S
-
 
A
-
 
C
-
 
L
-
 
P
F
 
I
D
 
T
I
 
I
E
 
D
L
 
V
A
 
G
E
 
T
N
 
N
D
 
N
P
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
F
-
 
Y
-
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
R
-
 
Q
-
 
K
-
 
R
-
 
A
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
E
-
 
Y
D
 
D
K
 
E
L
 
L
V
 
M
E
 
E
I
 
E
I
 
F
A
 
M
S
 
A
L
 
A
E
 
V
P
 
K
T
 
T
L
 
F
G
 
Y
G
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
L
I
 
I
N
 
Q
L
 
F
E
|
E
D
|
D
I
 
F
K
 
A
A
 
N
P
 
H
E
 
N
C
 
A
F
 
F
Y
 
D
I
 
L
E
 
L
Q
 
E
K
 
K
L
 
Y
S
 
S
A
 
-
R
 
K
M
 
T
N
 
H
I
 
L
P
 
-
V
 
V
F
 
F
H
 
N
D
|
D
D
|
D
Q
 
I
H
 
Q
G
 
G
T
|
T
A
 
A
I
 
S
I
 
V
S
 
V
S
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
L
N
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
K
L
 
M
V
 
V
G
 
G
K
 
G
D
 
T
I
 
L
G
 
A
K
 
E
V
 
Q
K
 
T
I
 
Y
A
 
L
V
 
F
S
x
L
G
|
G
A
|
A
G
|
G
A
x
E
A
|
A
A
 
G
I
 
T
A
 
G
C
 
I
V
 
A
E
 
E
V
 
-
M
 
L
I
 
I
G
 
A
L
 
L
G
 
E
V
 
M
K
 
S
-
 
K
-
 
Q
-
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
P
-
 
I
-
 
E
-
 
E
-
 
C
R
 
R
E
 
K
N
 
K
V
 
V
Y
 
W
M
 
L
V
 
V
D
|
D
S
|
S
K
 
K
G
 
G
V
 
L
I
 
I
Y
 
V
E
 
D
G
 
S
R
 
R
P
 
K
G
 
S
G
 
S
L
|
L
D
 
A
A
 
P
S
 
F
K
|
K
Q
 
K
R
 
P
Y
 
W
A
 
A
I
 
H
K
 
E
T
 
H
E
 
E
A
 
P
-
 
L
R
 
T
T
 
T
L
 
L
A
 
Y
D
 
D
V
 
A
V
 
V
N
 
Q
G
 
S
A
 
I
D
 
K
-
 
P
-
 
T
V
 
V
F
 
L
L
 
I
G
 
G
C
x
T
S
|
S
A
 
G
P
 
V
G
 
G
-
 
R
V
 
T
L
 
F
S
 
T
A
 
K
E
 
E
M
 
I
V
 
V
K
 
E
T
 
A
M
 
M
A
 
A
-
 
S
-
 
I
-
 
N
D
 
E
K
 
R
P
 
P
I
 
I
I
 
I
L
 
F
A
 
S
L
|
L
A
x
S
N
|
N
P
 
P
-
 
T
-
 
S
E
 
H
P
 
S
E
 
E
I
 
C
R
 
T
P
 
A
E
 
E
L
 
Q
A
 
A
K
 
Y
S
 
T
-
 
W
V
 
T
R
 
Q
P
 
G
D
 
R
C
 
A
I
 
V
I
 
F
A
 
A
T
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
F
-
 
A
-
 
P
-
 
V
-
 
E
-
 
Y
-
 
D
G
 
G
R
 
K
S
 
T
D
 
F
Y
 
V
P
 
P
N
 
G
Q
 
Q
V
x
S
N
 
N
N
 
N
V
 
A
L
 
Y
C
 
I
F
 
F
P
 
P
Y
 
G
I
 
L
F
 
G
R
 
L
G
 
G
A
 
L
L
 
V
D
 
I
C
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
V
K
 
R
I
 
V
T
 
H
E
 
E
A
 
D
M
 
M
K
 
L
L
 
L
A
 
A
C
 
A
V
 
S
R
 
A
E
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
Q
A
 
A
K
 
T
A
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

7x11A Crystal structure of me1 in complex with NADPH (see paper)
25% identity, 45% coverage: 76:413/758 of query aligns to 144:523/564 of 7x11A

query
sites
7x11A
V
 
V
I
 
V
S
 
T
N
 
D
G
 
G
T
 
E
A
x
R
V
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
D
I
 
L
G
 
G
-
 
C
-
 
N
-
 
G
-
 
M
-
 
G
-
 
I
-
 
P
-
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
Y
-
 
T
-
 
A
-
 
C
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
N
P
 
P
L
 
Q
A
 
E
S
 
C
K
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
I
E
 
L
G
 
D
K
 
V
G
 
G
C
 
T
-
 
E
-
 
N
-
 
E
-
 
E
L
 
L
F
 
L
K
 
K
K
 
D
-
 
P
-
 
L
F
 
Y
A
 
I
G
 
G
V
 
L
D
 
R
V
 
Q
F
 
R
D
 
R
I
 
V
E
 
R
L
 
G
A
 
S
E
 
E
N
 
Y
D
 
D
P
 
D
-
 
F
-
 
L
D
 
D
K
 
E
L
 
F
V
 
M
E
 
E
I
 
A
I
 
V
A
 
S
S
 
S
L
 
K
E
 
Y
P
 
G
T
 
M
L
 
N
G
 
C
G
 
L
I
 
I
N
 
Q
L
 
F
E
|
E
D
|
D
I
 
F
K
 
A
A
x
N
P
 
V
E
 
N
C
 
A
F
|
F
Y
 
R
I
 
L
E
 
L
Q
 
N
K
 
K
L
 
Y
S
 
-
A
 
-
R
 
R
M
 
N
N
 
Q
I
 
Y
P
 
C
V
 
T
F
 
F
H
 
N
D
 
D
D
|
D
Q
x
I
H
x
Q
G
 
G
T
|
T
A
 
A
I
 
S
I
 
V
S
 
A
S
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
L
N
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
R
L
 
I
V
 
T
G
 
K
K
 
N
D
 
K
I
 
L
G
 
S
K
 
D
V
 
Q
K
 
T
I
 
I
A
 
L
V
 
F
S
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
|
G
A
x
E
A
|
A
A
 
A
I
x
L
A
x
G
C
 
I
V
 
A
E
x
H
V
 
L
M
 
I
I
 
V
G
 
-
L
 
M
G
 
A
V
 
L
K
 
E
R
 
K
E
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
P
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
I
-
 
K
N
 
K
V
 
I
Y
 
W
M
 
L
V
 
V
D
|
D
S
|
S
K
|
K
G
 
G
V
 
L
I
 
I
Y
 
V
E
 
K
G
 
G
R
 
R
P
 
-
G
 
A
G
 
S
L
 
L
D
 
T
A
 
Q
S
x
E
K
|
K
Q
 
E
R
 
K
Y
 
F
A
 
A
I
 
H
K
 
E
-
 
H
T
 
E
E
 
E
A
 
M
R
 
K
T
 
N
L
 
L
A
 
E
D
 
A
V
 
I
V
 
V
N
 
Q
-
 
E
-
 
I
G
 
K
A
 
P
D
 
T
V
 
A
F
 
L
L
 
I
G
 
G
C
x
V
S
x
A
A
|
A
-
x
I
P
 
G
G
 
G
V
 
A
L
 
F
S
 
S
A
 
E
E
 
Q
M
 
I
V
 
L
K
 
K
T
 
D
M
 
M
A
 
A
-
 
A
-
 
F
-
 
N
D
 
E
K
 
R
P
 
P
I
 
I
I
 
I
L
 
F
A
 
A
L
|
L
A
x
S
N
|
N
P
 
P
E
 
T
P
 
S
E
 
K
I
 
A
R
 
E
-
 
C
-
 
S
-
 
A
P
 
E
E
 
Q
L
 
C
A
 
Y
K
 
K
S
 
I
V
 
T
R
 
K
P
 
G
D
 
R
C
 
A
I
 
I
I
 
F
A
 
A
T
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
F
-
 
D
-
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
P
-
 
N
G
 
G
R
 
Q
S
 
T
D
 
L
Y
 
Y
P
 
P
N
 
G
Q
 
Q
V
x
G
N
 
N
N
 
N
V
 
S
L
 
Y
C
 
V
F
 
F
P
 
P
Y
 
G
I
 
V
F
 
A
R
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
V
D
 
A
C
 
C
G
 
G
A
 
L
T
 
R
K
 
Q
I
 
I
T
 
T
E
x
D
A
 
N
M
 
I
K
 
F
L
 
L
A
 
T
C
 
T
V
 
A
R
 
E
E
 
V
I
 
I
A
 
A
D
 
Q
L
 
Q
A
 
V
K
 
-
A
 
S
E
 
D
T
 
K
S
 
H
A
 
L
E
 
E
V
 
E
S
 
G
A
 
R
A
 
L
Y
 
Y
P
 
P
G
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
I
 
-
P
 
P
T
 
L
P
 
N
F
 
T
D
 
I
S
 
R
R
 
D
L
 
V
I
 
S
L
 
L
K
 
K
I
 
I
A
 
A
P
 
E
A
 
K
V
 
I
A
 
V
K
 
K
A
 
D
A
 
A
A
 
Y
E
 
Q
S
 
E
G
 
K
V
 
T
A
 
A
T
 
T

Query Sequence

>HSERO_RS05745 HSERO_RS05745 NADP-dependent malic enzyme oxidoreductase
MTQQISAAEQLLRDAAREYHRTPSRGKIEVRPTKPLSNQRDLSLAYSPGVAYPCLDIEAD
PLKAFDYTSRGNLVAVISNGTAVLGLGNIGPLASKPVMEGKGCLFKKFAGVDVFDIELAE
NDPDKLVEIIASLEPTLGGINLEDIKAPECFYIEQKLSARMNIPVFHDDQHGTAIISSAA
LLNGLELVGKDIGKVKIAVSGAGAAAIACVEVMIGLGVKRENVYMVDSKGVIYEGRPGGL
DASKQRYAIKTEARTLADVVNGADVFLGCSAPGVLSAEMVKTMADKPIILALANPEPEIR
PELAKSVRPDCIIATGRSDYPNQVNNVLCFPYIFRGALDCGATKITEAMKLACVREIADL
AKAETSAEVSAAYPGKELVFGADYLIPTPFDSRLILKIAPAVAKAAAESGVATRPIKDYD
AYRAELTRFIYQTGMFMQPVFNTAKVAPQRVVYADGQDERVLRAVQFVADEGLAAPILVG
APAAIEAGIKKAGLRIKIGQNVQVIDPATDARVAQYAAQYKDGGEADVRASGSLLAALMV
KAGDADAMLCGLDGNYDGHLAHVEKVIGLKQGAQEFAALNAVLLPDQTLFITDTYVNDTP
DAEQLARIAQAAAEEVARFGVPPKVAFLSHSNRGSSSRPSARKMAAAHEAFKKLAPEVES
AGELHGDAALSEKIRNNAGLADSGLTGAANVLVCPNLDAANILFNVLKTSSGQGTTIGPI
LLGAAAPVHVLTPSSTVRRVINMTALAAAKAQDGKSKA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory