SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing HSERO_RS11255 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS11255 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6b9uA Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from brucella melitensis complexed with nadh
46% identity, 99% coverage: 3:252/252 of query aligns to 2:244/244 of 6b9uA

query
sites
6b9uA
L
 
L
Q
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
F
|
F
G
 
G
E
 
E
G
 
G
I
 
M
A
 
A
K
 
K
A
 
R
Y
 
F
A
 
A
R
 
K
E
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
K
I
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
V
D
|
D
I
x
R
G
 
D
E
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
A
L
 
E
R
 
R
V
 
V
V
 
A
E
 
G
E
 
E
I
 
I
K
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
D
R
 
A
A
 
A
V
 
L
F
 
A
A
 
V
K
 
A
A
|
A
D
|
D
V
x
I
S
 
S
K
 
K
R
 
E
A
 
A
D
 
D
M
 
V
D
 
D
Q
 
A
L
 
A
L
 
V
A
 
E
T
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
S
H
 
K
F
 
F
G
 
G
K
 
K
L
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
T
 
I
T
 
G
H
 
H
R
 
K
N
 
P
R
 
Q
P
 
N
M
 
A
L
 
E
E
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
P
D
 
E
E
 
E
F
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
I
Y
 
V
A
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
K
 
R
S
 
G
I
 
V
F
 
Y
L
 
L
S
 
M
A
 
T
K
 
R
T
 
K
F
 
L
V
 
I
P
 
P
Y
 
H
F
 
F
R
 
K
Q
 
E
V
 
N
G
 
G
G
 
A
G
 
K
A
 
G
-
 
Q
-
 
E
-
 
C
-
 
V
F
 
I
I
 
L
N
 
N
I
x
V
A
 
A
S
|
S
T
 
T
A
 
G
G
 
A
I
 
G
R
 
R
P
 
P
R
 
R
P
 
P
G
 
N
L
|
L
T
 
A
W
 
W
Y
|
Y
N
 
N
G
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
G
A
 
W
V
 
V
I
 
V
T
 
S
T
 
V
S
 
T
K
 
K
S
 
A
M
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
D
 
A
K
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
V
C
 
A
V
 
L
N
 
N
P
 
P
V
 
V
I
x
A
S
x
G
A
 
E
T
|
T
G
x
P
L
|
L
L
 
L
S
 
T
E
 
T
F
|
F
M
 
M
G
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
R
K
 
K
K
 
K
F
 
F
V
 
R
A
 
D
T
 
S
I
 
I
P
 
P
M
 
M
G
 
G
R
 
R
F
 
L
S
 
L
T
 
K
P
 
P
E
 
D
D
 
D
I
 
L
A
 
A
N
 
E
A
 
A
C
 
A
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
G
 
C
S
 
S
D
 
P
E
 
Q
A
 
A
E
 
S
F
 
M
V
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
V
C
 
A
I
 
L
E
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
R
C
 
S
V
 
I

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
40% identity, 98% coverage: 2:249/252 of query aligns to 4:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
R
 
R
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
S
x
N
G
|
G
F
x
I
G
 
G
E
 
L
G
 
E
I
 
A
A
 
A
K
 
R
A
 
V
Y
 
F
A
 
M
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
K
I
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
F
G
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
A
G
 
G
L
 
K
R
 
E
V
 
A
V
 
V
E
 
E
E
 
-
I
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
A
G
 
N
G
 
P
R
 
G
A
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
I
K
 
R
A
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
K
 
D
R
 
R
A
 
E
D
 
S
M
 
V
D
 
H
Q
 
R
L
 
L
L
 
V
A
 
E
T
 
N
A
 
V
L
 
A
E
 
E
H
 
R
F
 
F
G
 
G
K
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
T
x
I
T
 
T
H
 
-
R
 
R
N
x
D
R
 
S
P
 
M
M
 
L
L
 
S
E
x
K
V
 
M
E
 
T
E
 
V
D
 
D
E
 
Q
F
 
F
D
 
Q
R
 
Q
V
 
V
Y
 
I
A
 
N
V
 
V
N
|
N
V
 
L
K
 
T
S
 
G
I
 
V
F
 
F
L
 
H
S
 
C
A
 
T
K
 
Q
T
 
A
F
 
V
V
 
L
P
 
P
Y
 
Y
F
 
M
R
 
A
Q
 
E
V
 
Q
G
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
K
F
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
S
S
|
S
T
 
V
A
 
T
G
 
G
I
 
T
R
 
Y
P
 
G
R
x
N
P
x
V
G
 
G
L
x
Q
T
 
T
W
 
N
Y
|
Y
N
 
A
G
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
T
 
G
T
 
M
S
 
T
K
 
K
S
 
T
M
 
W
A
 
A
A
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
R
D
 
K
K
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
V
N
 
A
P
|
P
V
 
G
I
x
F
S
x
T
A
 
E
T
|
T
G
 
A
L
x
M
L
 
V
S
 
A
E
 
E
F
 
-
M
 
-
G
 
-
V
 
V
P
 
P
D
 
E
T
 
K
P
 
V
E
 
I
N
 
E
R
x
K
K
 
M
K
 
K
F
 
-
V
 
-
A
 
A
T
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
M
G
 
G
R
 
R
F
 
L
S
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
C
 
Y
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
H
E
 
E
A
 
S
E
 
D
F
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
G
V
 
H
C
 
V
I
 
L
E
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
38% identity, 98% coverage: 3:249/252 of query aligns to 3:244/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
L
Q
 
D
D
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
F
x
I
G
 
G
E
 
L
G
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
H
A
 
S
Y
 
Y
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
K
I
 
V
V
 
I
V
 
V
A
 
S
D
|
D
I
|
I
G
 
N
E
 
E
A
 
D
G
 
H
G
 
G
L
 
N
R
 
K
V
 
A
V
 
V
E
 
E
E
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
R
 
E
A
 
A
V
 
S
F
 
F
A
 
V
K
 
K
A
|
A
D
|
D
V
x
T
S
 
S
K
 
N
R
 
P
A
 
E
D
 
E
M
 
V
D
 
E
Q
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
K
T
 
R
A
 
T
L
 
V
E
 
E
H
 
I
F
 
Y
G
 
G
K
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
V
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
T
 
I
T
 
G
H
 
G
R
 
E
N
 
Q
R
 
A
P
 
L
M
 
A
L
 
G
E
 
D
V
 
Y
E
 
G
E
 
L
D
 
D
E
 
S
F
 
W
D
 
R
R
 
K
V
 
V
Y
 
L
A
 
S
V
 
I
N
 
N
V
 
L
K
 
D
S
 
G
I
 
V
F
 
F
L
 
Y
S
 
G
A
 
C
K
 
K
T
 
Y
F
 
E
V
 
L
P
 
E
Y
 
Q
F
 
M
R
 
E
Q
 
K
V
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
V
F
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
M
A
 
A
S
|
S
T
 
I
A
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
V
P
 
A
R
 
A
P
 
P
G
 
L
L
 
S
T
 
S
W
 
A
Y
|
Y
N
 
T
G
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
G
T
 
L
S
 
T
K
 
K
S
 
N
M
 
I
A
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
P
 
Q
D
 
K
K
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
C
 
A
V
 
V
N
 
G
P
|
P
V
x
A
I
x
Y
S
x
I
A
 
E
T
 
T
G
 
P
L
|
L
L
 
L
S
 
E
E
 
S
F
 
L
M
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
T
P
 
K
E
 
E
N
 
M
R
 
K
K
 
E
K
 
A
F
 
L
V
 
I
A
 
S
T
 
K
I
 
H
P
 
P
M
 
M
G
 
G
R
 
R
F
 
L
S
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
E
A
 
L
C
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
G
 
S
S
 
S
D
 
E
E
 
K
A
 
S
E
 
S
F
 
F
V
 
M
T
 
T
G
 
G
V
 
G
C
 
Y
I
 
Y
E
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

8cxaA Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from mycobacterium smegmatis with bound NAD
37% identity, 99% coverage: 1:249/252 of query aligns to 1:247/251 of 8cxaA

query
sites
8cxaA
M
 
V
R
 
R
L
 
L
Q
 
A
D
 
N
K
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
S
x
Q
G
|
G
F
x
I
G
 
G
E
 
R
G
 
I
I
 
Y
A
 
A
K
 
E
A
 
R
Y
 
F
A
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
D
|
D
I
 
I
G
 
N
E
 
E
A
 
P
G
 
K
G
 
A
L
 
T
R
 
E
V
 
V
V
 
A
E
 
S
E
 
S
I
 
I
K
 
T
A
 
S
A
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
I
F
 
A
A
 
A
K
 
A
A
 
V
D
 
D
V
|
V
S
 
S
K
 
D
R
 
V
A
 
E
D
 
S
M
 
V
D
 
N
Q
 
R
L
 
M
L
 
V
A
 
D
T
 
S
A
 
A
L
 
V
E
 
E
H
 
A
F
 
F
G
 
G
K
 
T
L
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
x
A
-
 
I
-
 
F
T
x
S
T
 
T
H
 
L
R
 
K
N
 
M
R
 
K
P
 
P
M
 
F
L
 
E
E
 
E
V
 
I
E
 
S
E
 
G
D
 
D
E
 
E
F
 
W
D
 
D
R
 
K
V
 
L
Y
 
F
A
 
A
V
 
V
N
 
N
V
 
A
K
 
K
S
 
G
I
 
T
F
 
F
L
 
L
S
 
C
A
 
C
K
 
Q
T
 
A
F
 
V
V
 
S
P
 
P
Y
 
V
F
 
M
R
 
R
Q
 
K
V
 
N
G
 
Q
G
 
Y
G
 
G
A
 
R
F
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
x
S
S
|
S
T
 
S
A
 
V
G
 
V
I
 
V
R
 
T
P
 
G
R
 
R
P
 
P
G
 
N
L
 
Y
T
 
A
W
 
H
Y
|
Y
N
 
I
G
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
W
T
 
A
T
 
L
S
 
T
K
 
H
S
 
A
M
 
L
A
 
A
A
 
T
E
 
E
L
 
M
G
 
G
P
 
T
D
 
D
K
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
C
 
T
V
 
V
N
 
S
P
|
P
V
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
T
x
H
G
 
G
L
x
I
L
 
I
S
 
T
E
 
E
F
x
I
M
 
P
G
 
R
V
 
E
P
 
T
D
 
I
T
 
S
P
 
E
E
 
E
N
 
G
R
 
W
K
 
R
K
 
R
F
 
N
V
 
L
A
 
E
T
 
E
I
 
Q
P
 
A
M
 
L
G
 
K
R
 
R
F
 
K
S
 
G
T
 
D
P
 
A
E
 
S
D
 
D
I
 
L
A
 
V
N
 
G
A
 
I
C
 
L
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
S
E
 
K
F
 
F
V
 
M
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
C
 
T
I
 
V
E
 
A
V
 
L
D
 
D
G
 
A
G
 
G

4urfB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
38% identity, 99% coverage: 1:249/252 of query aligns to 1:244/248 of 4urfB

query
sites
4urfB
M
 
M
R
 
L
L
 
L
Q
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
|
G
S
x
N
G
|
G
F
x
I
G
 
G
E
 
R
G
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
L
A
 
T
Y
 
Y
A
 
A
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
N
I
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
S
D
|
D
I
|
I
G
 
S
E
 
D
A
 
E
G
 
W
G
 
G
L
 
R
R
 
E
V
 
T
V
 
L
E
 
A
E
 
L
I
 
I
K
 
E
A
 
G
A
 
K
G
 
G
G
 
G
R
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
F
A
 
Q
K
 
H
A
 
A
D
|
D
V
x
T
S
 
A
K
 
H
R
 
P
A
 
E
D
 
D
M
 
H
D
 
D
Q
 
E
L
 
L
L
 
I
A
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
K
E
 
R
H
 
A
F
 
F
G
 
G
K
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
V
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
T
x
I
T
 
S
H
x
G
R
 
E
N
 
F
R
 
T
P
 
P
M
 
T
L
 
A
E
 
E
V
 
T
E
 
T
E
 
D
D
 
A
E
 
Q
F
 
W
D
 
Q
R
|
R
V
 
V
Y
 
I
A
 
G
V
 
I
N
 
N
V
 
L
K
 
S
S
 
G
I
 
V
F
 
F
L
 
Y
S
 
G
A
 
V
K
 
R
T
 
A
F
 
Q
V
 
I
P
 
R
Y
 
A
F
 
M
R
 
L
Q
 
E
V
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
I
I
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
Q
R
 
I
P
 
G
R
 
I
P
 
E
G
 
G
L
x
I
T
 
T
W
 
P
Y
|
Y
N
 
T
G
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
V
T
 
G
T
 
L
S
 
T
K
 
K
S
 
T
M
 
V
A
 
A
A
 
W
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
P
 
S
D
 
K
K
 
G
I
 
I
R
|
R
V
 
I
N
 
N
C
 
S
V
 
V
N
 
G
P
|
P
V
x
A
I
 
F
S
x
I
A
 
N
T
|
T
G
 
T
L
 
L
L
 
-
S
 
-
E
 
-
F
 
-
M
 
-
G
 
-
V
 
V
P
 
Q
D
 
N
T
 
V
P
 
P
-
 
L
E
 
E
N
 
T
R
 
R
K
 
R
K
 
Q
F
 
L
V
 
E
A
 
Q
T
 
M
I
 
H
P
 
A
M
x
L
G
x
R
R
|
R
F
 
L
S
 
G
T
 
E
P
 
T
E
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
N
A
 
L
C
 
V
L
 
A
Y
 
W
L
 
L
G
 
S
S
|
S
D
 
D
E
 
K
A
 
A
E
 
S
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
S
C
 
Y
I
 
Y
E
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4urfA Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
38% identity, 99% coverage: 1:249/252 of query aligns to 1:244/248 of 4urfA

query
sites
4urfA
M
 
M
R
 
L
L
 
L
Q
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
|
G
S
x
N
G
|
G
F
x
I
G
 
G
E
 
R
G
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
L
A
 
T
Y
 
Y
A
 
A
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
N
I
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
S
D
|
D
I
|
I
G
 
S
E
 
D
A
 
E
G
x
W
G
 
G
L
 
R
R
 
E
V
 
T
V
 
L
E
 
A
E
 
L
I
 
I
K
 
E
A
 
G
A
 
K
G
 
G
G
 
G
R
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
F
A
 
Q
K
 
H
A
 
A
D
|
D
V
x
T
S
 
A
K
 
H
R
 
P
A
 
E
D
 
D
M
 
H
D
 
D
Q
 
E
L
 
L
L
 
I
A
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
K
E
 
R
H
 
A
F
 
F
G
 
G
K
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
V
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
T
x
I
T
x
S
H
x
G
R
x
E
N
 
F
R
x
T
P
 
P
M
 
T
L
 
A
E
|
E
V
 
T
E
x
T
E
 
D
D
 
A
E
x
Q
F
 
W
D
 
Q
R
|
R
V
 
V
Y
 
I
A
 
G
V
 
I
N
 
N
V
 
L
K
 
S
S
 
G
I
 
V
F
 
F
L
 
Y
S
 
G
A
 
V
K
 
R
T
 
A
F
 
Q
V
 
I
P
 
R
Y
 
A
F
 
M
R
 
L
Q
 
E
V
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
I
I
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
Q
R
 
I
P
 
G
R
 
I
P
 
E
G
 
G
L
x
I
T
 
T
W
 
P
Y
|
Y
N
 
T
G
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
V
T
 
G
T
 
L
S
 
T
K
 
K
S
 
T
M
 
V
A
 
A
A
 
W
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
P
x
S
D
 
K
K
x
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
C
 
S
V
 
V
N
 
G
P
|
P
V
 
A
I
 
F
S
x
I
A
 
N
T
|
T
G
 
T
L
 
L
L
 
-
S
 
-
E
 
-
F
 
-
M
 
-
G
 
-
V
 
V
P
 
Q
D
 
N
T
 
V
P
 
P
-
 
L
E
 
E
N
 
T
R
 
R
K
 
R
K
 
Q
F
 
L
V
 
E
A
 
Q
T
 
M
I
 
H
P
 
A
M
 
L
G
 
R
R
 
R
F
 
L
S
 
G
T
 
E
P
 
T
E
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
N
A
 
L
C
 
V
L
 
A
Y
 
W
L
 
L
G
 
S
S
 
S
D
 
D
E
 
K
A
 
A
E
 
S
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
V
x
S
C
x
Y
I
 
Y
E
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4ureB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
38% identity, 99% coverage: 1:249/252 of query aligns to 1:244/248 of 4ureB

query
sites
4ureB
M
 
M
R
 
L
L
 
L
Q
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
G
S
x
N
G
|
G
F
x
I
G
 
G
E
 
R
G
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
L
A
 
T
Y
 
Y
A
 
A
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
N
I
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
S
D
 
D
I
 
I
G
 
S
E
 
D
A
 
E
G
 
W
G
 
G
L
 
R
R
 
E
V
 
T
V
 
L
E
 
A
E
 
L
I
 
I
K
 
E
A
 
G
A
 
K
G
 
G
G
 
G
R
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
F
A
 
Q
K
 
H
A
 
A
D
 
D
V
 
T
S
 
A
K
 
H
R
 
P
A
 
E
D
 
D
M
 
H
D
 
D
Q
 
E
L
 
L
L
 
I
A
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
K
E
 
R
H
 
A
F
 
F
G
 
G
K
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
V
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
T
 
I
T
 
S
H
 
G
R
 
E
N
 
F
R
 
T
P
 
P
M
 
T
L
 
A
E
 
E
V
 
T
E
 
T
E
 
D
D
 
A
E
 
Q
F
 
W
D
 
Q
R
 
R
V
 
V
Y
 
I
A
 
G
V
 
I
N
 
N
V
 
L
K
 
S
S
 
G
I
 
V
F
 
F
L
 
Y
S
 
G
A
 
V
K
 
R
T
 
A
F
 
Q
V
 
I
P
 
R
Y
 
A
F
 
M
R
 
L
Q
 
E
V
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
Q
R
 
I
P
 
G
R
 
I
P
 
E
G
 
G
L
x
I
T
 
T
W
 
P
Y
|
Y
N
 
T
G
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
V
T
 
G
T
 
L
S
 
T
K
 
K
S
 
T
M
 
V
A
 
A
A
 
W
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
P
 
S
D
 
K
K
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
C
 
S
V
 
V
N
 
G
P
|
P
V
x
A
I
 
F
S
 
I
A
 
N
T
 
T
G
 
T
L
 
L
L
 
-
S
 
-
E
 
-
F
 
-
M
 
-
G
 
-
V
 
V
P
 
Q
D
 
N
T
 
V
P
 
P
-
 
L
E
 
E
N
 
T
R
 
R
K
 
R
K
 
Q
F
 
L
V
 
E
A
 
Q
T
 
M
I
 
H
P
 
A
M
 
L
G
 
R
R
 
R
F
 
L
S
 
G
T
 
E
P
 
T
E
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
N
A
 
L
C
 
V
L
 
A
Y
 
W
L
 
L
G
 
S
S
 
S
D
 
D
E
 
K
A
 
A
E
 
S
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
S
C
 
Y
I
 
Y
E
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

8y83A Crystal structure of a ketoreductase from sphingobacterium siyangense sy1 with co-enzyme
38% identity, 98% coverage: 3:249/252 of query aligns to 4:245/249 of 8y83A

query
sites
8y83A
L
 
L
Q
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
G
S
|
S
G
|
G
F
x
I
G
 
G
E
 
L
G
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
G
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
K
I
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
S
D
|
D
I
|
I
G
 
N
E
 
E
A
 
Q
G
 
A
G
 
G
L
 
N
R
 
E
V
 
T
V
 
V
E
 
K
E
 
Q
I
 
I
K
 
E
A
 
S
A
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
E
A
 
A
V
 
V
F
 
F
A
 
F
K
 
K
A
|
A
D
|
D
V
x
S
S
 
S
K
 
S
R
 
P
A
 
A
D
 
D
M
 
N
D
 
E
Q
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
G
T
 
Y
A
 
A
L
 
V
E
 
K
H
 
T
F
 
F
G
 
G
K
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
V
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
T
 
I
T
 
G
H
 
G
R
 
E
N
 
A
R
 
A
P
 
L
M
 
T
L
 
G
E
 
D
V
 
Y
E
 
S
E
 
L
D
 
D
E
 
G
F
 
W
D
 
K
R
 
K
V
 
V
Y
 
I
A
 
D
V
 
I
N
 
N
V
 
F
K
 
N
S
 
G
I
 
V
F
 
F
L
 
Y
S
 
G
A
 
C
K
 
K
T
 
Y
F
 
Q
V
 
I
P
 
E
Y
 
A
F
 
M
R
 
E
Q
 
R
V
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
V
F
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
M
A
 
A
S
 
S
T
 
I
A
 
H
G
 
G
I
 
T
R
 
V
P
 
A
R
 
A
P
 
P
G
 
M
L
 
S
T
 
S
W
 
A
Y
|
Y
N
 
T
G
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
G
T
 
L
S
 
T
K
 
K
S
 
N
M
 
I
A
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
P
 
Q
D
 
K
K
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
C
 
A
V
 
V
N
 
G
P
|
P
V
x
G
I
x
Y
S
x
I
A
 
D
T
 
T
G
 
P
L
|
L
L
 
L
S
 
A
E
 
K
F
 
L
M
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
D
P
 
K
E
 
E
N
 
H
R
 
I
K
 
N
K
 
A
F
 
L
V
 
I
A
 
S
T
 
K
I
 
H
P
 
P
M
 
I
G
 
G
R
 
R
F
 
L
S
 
G
T
 
K
P
 
A
E
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
E
A
 
L
C
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
G
 
S
S
 
S
D
 
D
E
 
K
A
 
S
E
 
S
F
 
F
V
 
M
T
 
T
G
 
G
V
 
G
C
 
Y
I
 
Y
E
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7djsD Crystal structure of isopiperitenol dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa complexed with NAD
41% identity, 98% coverage: 3:249/252 of query aligns to 3:247/251 of 7djsD

query
sites
7djsD
L
 
L
Q
 
S
D
 
G
K
 
Q
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
S
 
A
G
|
G
F
x
I
G
 
G
E
 
R
G
 
A
I
 
T
A
 
A
K
 
Q
A
 
A
Y
 
F
A
 
A
R
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
K
I
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
D
|
D
I
x
L
G
 
D
E
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
E
R
 
G
V
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
A
I
 
I
K
 
R
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
E
A
 
A
V
 
V
F
 
F
A
 
I
K
 
R
A
x
C
D
|
D
V
|
V
S
 
T
K
 
R
R
 
D
A
 
A
D
 
E
M
 
V
D
 
K
Q
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
E
T
 
G
A
 
C
L
 
A
E
 
A
H
 
A
F
 
Y
G
 
G
K
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
Y
V
 
A
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
T
 
I
T
 
E
H
 
I
R
 
E
N
 
Q
R
 
G
P
 
K
M
 
L
L
 
A
E
 
D
V
 
G
E
 
N
E
 
E
D
 
A
E
 
E
F
 
F
D
 
D
R
 
A
V
 
I
Y
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
N
V
 
V
K
 
K
S
 
G
I
 
V
F
 
W
L
 
L
S
 
C
A
 
M
K
 
K
T
 
H
F
 
Q
V
 
I
P
 
P
Y
 
L
F
 
M
R
 
L
Q
 
A
V
 
Q
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
T
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
L
R
 
G
P
 
A
R
 
A
P
 
P
G
 
K
L
 
M
T
 
S
W
 
I
Y
|
Y
N
 
A
G
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
G
T
 
L
S
 
T
K
 
K
S
 
S
M
 
A
A
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
Y
G
 
A
P
 
K
D
 
K
K
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
V
N
 
C
P
 
P
V
x
A
I
x
V
S
 
I
A
 
D
T
 
T
G
 
D
L
 
M
L
 
-
S
 
-
E
 
-
F
 
F
M
 
R
G
 
R
V
 
A
P
 
Y
D
 
E
T
 
A
P
 
D
E
 
P
N
 
R
R
 
K
K
 
A
K
 
E
F
 
F
V
 
A
A
 
A
T
 
A
I
 
M
-
 
H
P
 
P
M
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
V
S
 
G
T
 
R
P
 
V
E
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
N
 
A
A
 
A
C
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
G
 
C
S
 
S
D
 
D
E
 
N
A
 
A
E
 
G
F
 
F
V
 
T
T
 
T
G
 
G
V
 
I
C
 
A
I
 
L
E
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7v0hG Crystal structure of putative glucose 1-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia in complex with NADP and a potential reaction product
40% identity, 98% coverage: 2:249/252 of query aligns to 8:251/253 of 7v0hG

query
sites
7v0hG
R
 
K
L
 
L
Q
 
A
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
S
x
K
G
|
G
F
x
I
G
 
G
E
 
A
G
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
A
Y
 
L
A
 
A
R
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
N
-
 
Y
D
x
A
I
x
S
G
x
S
E
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
A
L
 
D
R
 
A
V
 
V
V
 
V
E
 
S
E
 
A
I
 
I
K
 
T
A
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
V
F
 
A
A
 
V
K
 
G
A
x
G
D
|
D
V
|
V
S
 
S
K
 
K
R
 
A
A
 
A
D
 
D
M
 
A
D
 
Q
Q
 
R
L
 
I
L
 
V
A
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
I
E
 
E
H
 
T
F
 
Y
G
 
G
K
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
V
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
S
G
|
G
T
 
-
T
 
V
H
x
Y
R
 
E
N
 
F
R
 
A
P
 
P
M
 
I
L
 
E
E
 
A
V
 
I
E
 
T
E
 
E
D
 
E
E
 
H
F
 
Y
D
 
R
R
 
R
V
 
Q
Y
 
F
A
 
D
V
 
T
N
 
N
V
 
V
K
 
F
S
 
G
I
 
V
F
 
L
L
 
L
S
 
T
A
 
T
K
 
Q
T
 
A
F
 
A
V
 
V
P
 
K
Y
 
H
F
 
L
R
 
G
Q
 
E
V
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
A
A
 
S
F
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
T
 
V
A
 
V
G
 
T
I
 
S
R
 
I
P
 
T
R
 
P
P
 
P
G
 
A
L
 
S
T
 
A
W
 
V
Y
|
Y
N
 
S
G
 
G
S
 
T
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
D
T
 
A
T
 
I
S
 
T
K
 
G
S
 
V
M
 
L
A
 
A
A
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
R
K
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
I
N
 
N
P
|
P
-
x
G
V
x
M
I
|
I
S
 
V
A
x
T
T
 
E
G
|
G
L
x
T
L
 
H
S
 
S
E
 
A
F
 
G
M
x
I
G
 
I
V
 
G
P
 
S
D
 
D
T
 
L
P
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
E
K
 
A
K
 
Q
F
 
V
V
 
L
A
 
G
T
 
Q
I
 
T
P
 
P
M
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
L
S
 
G
T
 
E
P
 
P
E
 
N
D
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
S
A
 
V
C
 
A
L
 
V
Y
 
F
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
E
 
R
F
 
W
V
 
M
T
 
T
G
 
G
V
 
E
C
 
H
I
 
L
E
 
V
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
35% identity, 99% coverage: 1:249/252 of query aligns to 3:251/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
M
 
M
R
 
N
L
 
L
Q
 
T
D
 
D
K
 
K
V
 
T
A
 
V
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
S
|
S
G
|
G
F
x
I
G
 
G
E
 
Y
G
 
A
I
 
A
A
 
V
K
 
Q
A
 
A
Y
 
F
A
 
L
R
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
A
 
N
I
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
D
|
D
I
|
I
G
 
D
E
 
E
A
 
A
G
 
Q
G
 
G
L
 
E
R
 
A
V
 
M
V
 
V
E
 
R
E
 
-
I
 
-
K
 
K
A
 
E
A
 
N
G
 
N
G
 
D
R
 
R
A
 
L
V
 
H
F
 
F
A
 
V
K
 
Q
A
x
T
D
 
D
V
x
I
S
 
T
K
 
D
R
 
E
A
 
A
D
 
A
M
 
C
D
 
Q
Q
 
H
L
 
A
L
 
V
A
 
E
T
 
S
A
 
A
L
 
V
E
 
H
H
 
T
F
 
F
G
 
G
K
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
V
V
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
T
 
I
T
 
-
H
 
E
R
 
I
N
 
V
R
 
A
P
 
P
M
 
I
L
 
H
E
 
E
V
 
M
E
 
E
E
 
L
D
 
S
E
 
D
F
 
W
D
 
N
R
 
K
V
 
V
Y
 
L
A
 
Q
V
 
V
N
 
N
V
 
L
K
 
T
S
 
G
I
 
M
F
 
F
L
 
L
S
 
M
A
 
S
K
 
K
T
 
H
F
 
A
V
 
L
P
 
K
Y
 
H
F
 
M
R
 
L
Q
 
A
V
 
A
G
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
N
F
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
T
 
V
A
 
G
G
 
G
I
 
L
R
 
V
P
 
A
R
 
W
P
 
P
G
 
D
L
 
I
T
 
P
W
 
A
Y
|
Y
N
 
N
G
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
L
T
 
Q
T
 
L
S
 
T
K
 
K
S
 
S
M
 
M
A
 
A
A
 
V
E
 
D
L
 
Y
G
 
A
P
 
K
D
 
H
K
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
C
V
 
V
N
 
C
P
|
P
V
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
-
F
 
-
M
 
-
G
|
G
V
x
I
P
x
I
D
 
D
T
 
T
P
 
P
E
 
L
N
 
N
R
 
E
K
 
K
K
 
S
F
 
F
V
 
L
A
 
E
T
 
N
-
 
N
-
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
V
I
 
N
P
 
P
M
 
L
G
 
L
R
 
R
F
 
L
S
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
V
C
 
M
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
L
A
 
S
E
 
S
F
 
Y
V
 
M
T
 
T
G
 
G
V
 
S
C
 
A
I
 
I
E
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
38% identity, 100% coverage: 1:252/252 of query aligns to 1:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
M
R
 
T
L
 
L
Q
 
Q
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
S
S
x
R
G
|
G
F
x
I
G
 
G
E
 
R
G
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
I
A
 
N
Y
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
N
I
 
I
V
 
F
V
 
F
A
x
N
D
x
Y
I
x
N
G
|
G
E
x
S
A
 
P
G
 
E
G
 
A
L
 
A
R
 
E
V
 
E
V
 
T
E
 
A
E
 
K
I
 
L
K
 
V
A
 
A
A
 
E
G
 
H
G
 
G
R
 
V
A
 
E
V
 
V
F
 
E
A
 
A
-
 
M
K
 
K
A
 
A
D
x
N
V
|
V
S
 
A
K
 
I
R
 
A
A
 
E
D
 
D
M
 
V
D
 
D
Q
 
A
L
 
F
L
 
F
A
 
K
T
 
Q
A
 
A
L
 
I
E
 
E
H
 
R
F
 
F
G
 
G
K
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
T
x
I
T
 
T
H
 
-
R
 
R
N
 
D
R
 
N
P
 
L
M
 
L
L
 
M
E
 
R
V
 
M
E
 
K
E
 
E
D
 
D
E
 
E
F
 
W
D
 
D
R
 
D
V
 
V
Y
 
I
A
 
N
V
x
I
N
 
N
V
 
L
K
 
K
S
 
G
I
 
T
F
 
F
L
 
L
S
 
C
A
 
T
K
 
K
T
 
A
F
 
V
V
 
S
P
 
R
Y
 
T
F
 
M
R
 
M
Q
 
K
V
 
Q
G
 
R
G
 
A
G
 
G
A
 
K
F
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
A
S
|
S
T
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
L
R
 
I
P
 
G
R
 
N
P
 
A
G
 
G
L
x
Q
T
 
A
W
 
N
Y
|
Y
N
 
V
G
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
T
 
G
T
 
L
S
 
T
K
 
K
S
 
T
M
 
T
A
 
A
A
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
D
 
R
K
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
V
N
 
A
P
|
P
V
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
G
L
 
F
L
x
I
S
 
T
E
x
T
F
 
D
M
 
M
G
 
T
V
 
D
P
 
K
D
 
L
T
 
D
P
 
E
E
 
K
N
 
T
R
 
K
K
 
E
K
 
A
F
 
M
V
 
L
A
 
A
T
 
Q
I
 
I
P
 
P
M
 
L
G
 
G
R
 
A
F
 
Y
S
 
G
T
 
T
P
 
T
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
C
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
A
A
 
S
E
 
K
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
C
 
T
I
 
L
E
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
M
C
 
V
V
 
M

5epoA The three-dimensional structure of clostridium absonum 7alpha- hydroxysteroid dehydrogenase (see paper)
36% identity, 98% coverage: 2:249/252 of query aligns to 2:247/261 of 5epoA

query
sites
5epoA
R
 
R
L
 
L
Q
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
x
S
G
 
S
G
x
T
S
x
R
G
|
G
F
x
I
G
 
G
E
 
R
G
 
A
I
 
S
A
 
A
K
 
E
A
 
A
Y
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
L
I
 
V
V
 
Y
V
 
L
A
 
A
D
 
A
I
x
R
G
 
S
E
 
E
A
 
E
G
 
L
G
 
A
L
 
N
R
 
E
V
 
V
V
 
I
E
 
A
E
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
R
 
V
A
 
A
V
 
K
F
 
F
A
 
V
K
 
Y
A
x
F
D
x
N
V
 
A
S
 
R
K
 
E
R
 
E
A
 
E
D
 
T
M
 
Y
D
 
T
Q
 
S
L
 
M
L
 
V
A
 
E
T
 
K
A
 
V
L
 
A
E
 
E
H
 
A
F
 
E
G
 
G
K
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
Y
G
|
G
T
 
G
T
|
T
H
 
N
R
 
V
N
 
N
-
 
L
-
 
D
R
 
K
P
 
N
M
 
L
L
 
T
E
 
A
V
 
G
E
 
D
E
 
T
D
 
D
E
 
E
F
 
F
D
 
F
R
 
R
V
 
I
Y
 
L
A
 
K
V
 
D
N
 
N
V
 
V
K
 
Q
S
 
S
I
 
V
F
 
Y
L
 
L
S
 
P
A
 
A
K
 
K
T
 
A
F
 
A
V
 
I
P
 
P
Y
 
H
F
 
M
R
 
E
Q
 
K
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
S
F
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
x
T
T
 
I
A
x
G
G
 
S
I
 
V
R
 
V
P
 
P
R
 
D
P
x
I
G
 
S
L
x
R
T
 
I
W
 
A
Y
|
Y
N
 
C
G
 
V
S
 
S
K
|
K
G
 
S
A
 
A
V
 
I
I
 
N
T
 
S
T
 
L
S
 
T
K
 
Q
S
 
N
M
 
I
A
 
A
A
 
L
E
 
Q
L
 
Y
G
 
A
P
 
R
D
 
K
K
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
C
 
A
V
 
V
N
 
L
P
|
P
V
x
G
I
 
L
S
x
I
A
 
G
T
|
T
G
x
R
L
x
A
L
x
A
S
 
L
E
 
E
F
x
N
M
|
M
G
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
T
P
 
D
E
 
E
N
x
F
R
 
R
K
 
D
K
 
S
F
 
F
V
 
L
A
 
G
T
 
H
I
 
V
P
 
P
M
 
L
G
 
N
R
 
R
F
 
V
S
 
G
T
 
R
P
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
C
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
Y
G
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
S
E
 
G
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
M
C
 
I
I
 
H
E
 
E
V
 
V
D
 
A
G
 
G
G
 
G

G9FRD7 7alpha-hydroxysteroid dehydrogenase; 7alpha-HSDH; NADP-dependent 7alpha-hydroxysteroid dehydrogenase; EC 1.1.1.- from Clostridium sardiniense (Clostridium absonum) (see 2 papers)
36% identity, 98% coverage: 2:249/252 of query aligns to 3:248/262 of G9FRD7

query
sites
G9FRD7
R
 
R
L
 
L
Q
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
x
S
G
x
S
G
x
T
S
x
R
G
|
G
F
x
I
G
 
G
E
 
R
G
 
A
I
 
S
A
 
A
K
 
E
A
 
A
Y
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
L
I
 
V
V
 
Y
V
 
L
A
 
A
D
 
A
I
x
R
G
 
S
E
 
E
A
 
E
G
 
L
G
 
A
L
 
N
R
 
E
V
 
V
V
 
I
E
 
A
E
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
R
 
V
A
 
A
V
 
K
F
 
F
A
 
V
K
 
Y
A
 
F
D
x
N
V
x
A
S
 
R
K
 
E
R
 
E
A
 
E
D
 
T
M
 
Y
D
 
T
Q
 
S
L
 
M
L
 
V
A
 
E
T
 
K
A
 
V
L
 
A
E
 
E
H
 
A
F
 
E
G
 
G
K
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
Y
G
 
G
T
 
G
T
 
T
H
 
N
R
 
V
N
 
N
-
 
L
-
 
D
R
 
K
P
 
N
M
 
L
L
 
T
E
 
A
V
 
G
E
 
D
E
 
T
D
 
D
E
 
E
F
 
F
D
 
F
R
 
R
V
 
I
Y
 
L
A
 
K
V
 
D
N
 
N
V
 
V
K
 
Q
S
 
S
I
 
V
F
 
Y
L
 
L
S
 
P
A
 
A
K
 
K
T
 
A
F
 
A
V
 
I
P
 
P
Y
 
H
F
 
M
R
 
E
Q
 
K
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
S
F
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
x
T
T
 
I
A
 
G
G
 
S
I
 
V
R
 
V
P
 
P
R
 
D
P
 
I
G
 
S
L
 
R
T
 
I
W
 
A
Y
|
Y
N
 
C
G
 
V
S
 
S
K
|
K
G
 
S
A
 
A
V
 
I
I
 
N
T
 
S
T
 
L
S
 
T
K
 
Q
S
 
N
M
 
I
A
 
A
A
 
L
E
 
Q
L
 
Y
G
 
A
P
 
R
D
 
K
K
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
C
 
A
V
 
V
N
 
L
P
 
P
V
 
G
I
 
L
S
x
I
A
x
G
T
|
T
G
x
R
L
x
A
L
 
A
S
 
L
E
 
E
F
 
N
M
 
M
G
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
T
P
 
D
E
 
E
N
 
F
R
 
R
K
 
D
K
 
S
F
 
F
V
 
L
A
 
G
T
 
H
I
 
V
P
 
P
M
 
L
G
 
N
R
 
R
F
 
V
S
 
G
T
 
R
P
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
C
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
Y
G
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
S
E
 
G
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
M
C
 
I
I
 
H
E
 
E
V
 
V
D
 
A
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
35% identity, 100% coverage: 1:252/252 of query aligns to 1:245/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
M
|
M
R
 
G
L
 
I
Q
 
Q
D
 
N
K
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
G
 
A
S
|
S
G
 
G
F
 
M
G
 
G
E
 
K
G
 
Q
I
 
T
A
 
A
K
 
L
A
 
R
Y
 
F
A
 
A
R
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
N
D
|
D
I
 
I
G
 
D
E
 
A
A
 
E
G
 
K
G
 
V
L
 
R
R
 
A
V
 
T
V
 
V
E
 
D
E
 
E
I
 
F
K
 
S
A
 
A
A
 
R
G
 
G
G
 
H
R
 
R
A
 
V
V
 
L
F
 
G
A
 
A
K
 
V
A
 
A
D
|
D
V
x
I
S
 
G
K
 
N
R
 
K
A
 
A
D
 
A
M
 
V
D
 
D
Q
 
G
L
 
M
L
 
V
A
 
K
T
 
Q
A
 
T
L
 
I
E
 
D
H
 
A
F
 
F
G
 
G
K
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
T
 
-
T
 
M
H
 
E
R
 
R
N
 
A
R
 
G
P
 
A
M
 
L
L
 
R
E
 
K
V
 
L
E
 
S
E
 
E
D
 
A
E
 
D
F
 
W
D
 
D
R
 
V
V
 
T
Y
 
I
A
 
N
V
 
V
N
 
N
V
 
L
K
 
K
S
 
G
I
 
T
F
 
F
L
 
L
S
 
C
A
 
T
K
 
Q
T
 
A
F
 
V
V
 
H
P
 
G
Y
 
H
F
 
M
R
 
V
Q
 
E
V
 
N
G
 
K
G
 
H
G
 
G
A
 
R
F
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
T
 
R
A
 
A
G
 
W
I
 
L
R
 
-
P
 
G
R
 
G
P
 
A
G
 
G
L
 
Q
T
 
T
W
 
P
Y
|
Y
N
 
S
G
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
V
T
 
G
T
 
M
S
 
T
K
 
R
S
 
A
M
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
R
D
 
A
K
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
C
 
C
V
 
V
N
 
A
P
 
P
V
 
G
I
 
L
S
 
I
A
 
H
T
 
T
G
 
P
L
 
M
L
 
W
S
 
D
E
 
E
F
 
L
M
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
P
 
P
E
 
E
N
 
K
R
 
D
K
 
Q
K
 
Q
F
 
F
V
 
L
A
 
L
T
 
S
-
 
R
I
 
Q
P
 
P
M
 
T
G
 
G
R
 
K
F
 
L
S
 
G
T
 
E
P
 
P
E
 
D
D
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
T
C
 
L
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
G
 
A
S
 
D
D
 
D
E
 
D
A
 
S
E
 
G
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
C
 
V
I
 
L
E
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
R
C
 
S
V
 
L

4fn4A Short-chain NAD(h)-dependent dehydrogenase/reductase from sulfolobus acidocaldarius (see paper)
35% identity, 99% coverage: 3:252/252 of query aligns to 5:253/254 of 4fn4A

query
sites
4fn4A
L
 
L
Q
 
K
D
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
F
x
I
G
 
G
E
 
R
G
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
K
Y
 
F
A
 
A
R
 
L
E
 
N
G
 
D
A
 
S
A
 
I
I
 
V
V
 
V
V
 
A
A
 
V
D
x
E
I
x
L
G
 
L
E
 
E
A
 
D
G
x
R
G
 
L
L
 
N
R
 
Q
V
 
I
V
 
V
E
 
Q
E
 
E
I
 
L
K
 
R
A
 
G
A
 
M
G
 
G
G
 
K
R
 
E
A
 
V
V
 
L
F
 
G
A
 
V
K
 
K
A
|
A
D
|
D
V
|
V
S
 
S
K
 
K
R
 
K
A
 
K
D
 
D
M
 
V
D
 
E
Q
 
E
L
 
F
L
 
V
A
 
R
T
 
R
A
 
T
L
 
F
E
 
E
H
 
T
F
 
Y
G
 
S
K
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
V
V
 
L
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
T
x
I
T
 
M
H
 
D
R
 
G
N
 
V
R
 
T
P
 
P
M
 
V
L
 
A
E
 
E
V
 
V
E
 
S
E
 
D
D
 
E
E
 
L
F
 
W
D
 
E
R
 
R
V
 
V
Y
 
L
A
 
A
V
 
V
N
 
N
V
 
L
K
 
Y
S
 
S
I
 
A
F
 
F
L
 
Y
S
 
S
A
 
S
K
 
R
T
 
A
F
 
V
V
 
I
P
 
P
Y
 
I
F
 
M
R
 
L
Q
 
K
V
 
Q
G
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
V
F
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
T
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
P
 
G
R
 
G
P
 
F
G
 
A
L
 
G
T
 
A
W
 
P
Y
|
Y
N
 
T
G
 
V
S
 
A
K
|
K
G
 
H
A
 
G
V
 
L
I
 
I
T
 
G
T
 
L
S
 
T
K
 
R
S
 
S
M
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
H
L
 
Y
G
 
G
P
 
D
D
 
Q
K
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
A
N
 
V
C
 
A
V
 
V
N
 
L
P
|
P
V
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
G
L
 
T
L
x
V
S
 
K
E
x
T
F
x
N
M
x
I
G
 
G
V
 
L
P
 
G
D
 
S
T
 
S
-
 
K
P
 
P
E
x
S
N
 
E
R
 
L
K
 
G
K
 
M
F
 
R
V