SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing HSERO_RS11480 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS11480 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5dteB Crystal structure of an abc transporter periplasmic solute binding protein (ipr025997) from actinobacillus succinogenes 130z(asuc_0081, target efi-511065) with bound d-allose
38% identity, 85% coverage: 30:296/314 of query aligns to 2:267/287 of 5dteB

query
sites
5dteB
K
 
K
P
 
P
K
 
Q
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
L
M
 
M
K
|
K
S
 
T
L
 
L
A
 
S
N
|
N
E
 
E
F
x
Y
F
 
F
L
 
I
N
 
S
M
 
M
E
 
R
N
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
E
E
 
E
Y
 
-
Q
 
-
K
 
T
A
 
A
N
 
K
A
 
Q
S
 
K
K
 
D
F
 
I
D
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
V
N
 
Q
G
 
V
I
 
A
K
 
E
D
 
K
E
 
E
Q
 
D
D
 
S
T
 
T
A
 
E
N
 
Q
Q
 
L
I
 
V
K
 
G
I
 
L
V
 
V
E
 
E
Q
 
N
M
 
M
I
 
I
V
 
A
S
 
K
K
 
K
V
 
V
N
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
I
I
 
V
A
 
T
P
 
P
A
 
N
D
 
D
S
 
S
K
 
I
A
 
A
L
 
F
V
 
I
P
 
P
V
 
A
V
 
F
K
 
Q
K
 
K
A
 
A
I
 
E
D
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
P
V
 
I
V
 
I
N
 
D
I
 
L
D
|
D
N
 
V
K
 
R
L
 
L
D
 
D
D
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
A
K
 
E
E
 
A
K
 
A
G
 
G
I
 
L
T
 
K
V
 
F
P
 
N
F
 
Y
V
 
V
G
 
G
P
 
V
D
 
D
N
 
N
R
 
F
K
 
N
G
 
G
A
 
G
K
 
Y
L
 
L
A
 
E
G
 
A
D
 
K
Y
 
N
L
 
L
G
 
A
K
 
E
Q
 
A
L
 
I
Q
 
G
K
 
K
G
 
K
D
 
G
K
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
I
S
 
P
T
 
G
T
 
V
F
 
D
N
|
N
A
 
G
Q
 
E
Q
 
Q
R
|
R
T
 
K
L
 
G
G
 
G
F
 
A
Q
 
L
D
 
K
A
 
A
M
 
F
K
 
A
D
 
E
V
 
Y
-
 
P
G
 
D
A
 
I
N
 
K
V
 
I
V
 
V
T
 
A
V
 
S
Q
 
Q
S
 
S
G
 
A
Q
 
N
W
|
W
E
 
E
I
 
T
D
 
E
Q
 
Q
G
 
A
N
 
L
K
 
N
V
 
V
A
 
T
A
 
T
S
 
N
I
 
I
L
 
L
N
 
T
A
 
A
H
 
N
P
 
P
D
 
N
I
 
I
K
 
N
A
 
G
I
 
I
L
 
F
A
 
A
G
 
A
N
 
N
D
 
D
N
 
N
M
 
M
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
T
A
 
A
I
 
V
R
 
E
A
 
N
A
 
A
G
 
G
K
 
L
T
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
V
Q
 
L
L
 
V
V
 
S
G
 
G
Y
 
Y
D
|
D
N
 
G
I
 
I
N
 
P
A
 
L
I
 
A
K
 
I
P
 
E
M
 
Y
L
 
V
K
 
K
D
 
Q
G
 
G
R
 
K
V
 
M
L
 
Q
A
 
N
T
 
T
V
 
I
D
 
D
Q
|
Q
F
 
L
A
 
P
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
V
V
 
A
F
 
I
G
 
A
I
 
I
E
 
E
T
 
H
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
Q
L
 
I
S
 
N
E
 
K
K
 
Q
K
 
E

1dbpA Identical mutations at corresponding positions in two homologous proteins with non-identical effects (see paper)
34% identity, 86% coverage: 30:299/314 of query aligns to 1:259/271 of 1dbpA

query
sites
1dbpA
K
 
K
P
 
D
K
 
T
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
M
 
V
K
 
S
S
 
T
L
 
L
A
 
N
N
|
N
E
 
P
F
|
F
F
 
F
L
 
V
N
 
S
M
 
L
E
 
K
N
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
E
 
-
Y
 
-
Q
 
K
K
 
E
A
 
A
N
 
D
A
 
K
S
 
L
K
 
G
F
 
Y
D
 
N
L
 
L
I
 
V
A
 
V
N
 
-
G
 
-
I
 
L
K
 
D
D
 
S
E
 
Q
Q
 
N
D
 
N
T
 
P
A
 
A
N
 
K
Q
 
E
I
 
L
K
 
A
I
 
N
V
 
V
E
 
Q
Q
 
D
M
 
L
I
 
T
V
 
V
S
 
R
K
 
G
V
 
T
N
 
K
A
 
I
L
 
L
V
 
L
I
 
I
A
 
N
P
 
P
A
 
T
D
 
D
S
 
S
K
 
D
A
 
A
L
 
V
V
 
D
P
 
N
V
 
A
V
 
V
K
 
K
K
 
M
A
 
A
I
 
N
D
 
Q
A
 
A
G
 
N
I
 
I
I
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
T
I
 
L
D
|
D
N
x
R
K
 
Q
L
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
K
 
A
E
 
T
K
 
K
G
 
G
I
 
E
T
 
V
V
 
V
P
 
S
F
 
H
V
 
I
G
 
A
P
 
S
D
 
D
N
 
N
R
 
V
K
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
K
L
 
I
A
 
A
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
L
 
I
G
 
A
K
 
K
Q
 
K
L
 
A
Q
 
G
K
 
E
G
 
G
D
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
I
 
E
I
 
L
E
 
Q
G
 
G
V
 
I
S
 
A
T
 
G
T
 
T
F
 
S
N
 
A
A
 
A
Q
 
R
Q
 
E
R
|
R
T
 
G
L
 
E
G
 
G
F
 
F
Q
 
Q
D
 
Q
A
 
A
M
 
V
K
 
A
D
 
A
V
 
H
G
 
K
A
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
L
T
 
A
V
 
S
Q
 
Q
S
 
P
G
 
A
Q
 
D
W
x
F
E
 
D
I
 
R
D
 
I
Q
 
K
G
 
G
N
 
L
K
 
N
V
 
V
A
 
M
A
 
Q
S
 
N
I
 
L
L
 
L
N
 
T
A
 
A
H
 
H
P
 
P
D
 
D
I
 
V
K
 
Q
A
 
A
I
 
V
L
 
F
A
 
A
G
 
Q
N
|
N
D
 
D
N
 
E
M
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
L
A
 
R
A
 
A
I
 
L
R
 
Q
A
 
T
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
S
G
 
-
K
 
D
V
 
V
Q
 
M
L
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
D
|
D
N
 
G
I
 
T
N
 
P
A
 
D
I
 
G
K
 
E
P
 
K
M
 
A
L
 
V
K
 
N
D
 
D
G
 
G
R
 
K
V
 
L
L
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
I
D
 
A
Q
 
Q
F
 
L
A
 
P
Q
 
D
Q
 
Q
Q
 
I
A
 
G
V
 
A
F
 
K
G
 
G
I
 
V
E
 
E
T
 
T
A
 
A
L
 
D
K
 
K
A
 
V
L
 
L
S
 
K
E
 
G
K
 
E
K
 
K
P
 
V
Q
 
Q
S
 
A

2ioyA Crystal structure of thermoanaerobacter tengcongensis ribose binding protein (see paper)
33% identity, 90% coverage: 33:314/314 of query aligns to 3:270/274 of 2ioyA

query
sites
2ioyA
V
 
I
A
 
G
L
 
L
V
 
V
M
 
I
K
 
S
S
 
T
L
 
L
A
 
N
N
|
N
E
 
P
F
|
F
F
|
F
L
 
V
N
 
T
M
 
L
E
 
K
N
 
N
G
 
G
A
 
A
R
 
E
E
 
E
Y
 
-
Q
 
-
K
 
K
A
 
A
N
 
K
A
 
E
S
 
L
K
 
G
F
 
Y
D
 
K
L
 
I
I
 
I
A
 
-
N
 
-
G
 
-
I
 
V
K
 
E
D
 
D
E
 
S
Q
 
Q
-
 
N
D
 
D
T
 
S
A
 
S
N
 
K
Q
 
E
I
 
L
K
 
S
I
 
N
V
 
V
E
 
E
Q
 
D
M
 
L
I
 
I
V
 
Q
S
 
Q
K
 
K
V
 
V
N
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
L
I
 
I
A
 
N
P
 
P
A
 
V
D
 
D
S
 
S
K
 
D
A
 
A
L
 
V
V
 
V
P
 
T
V
 
A
V
 
I
K
 
K
K
 
E
A
 
A
I
 
N
D
 
S
A
 
K
G
 
N
I
 
I
I
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
T
I
 
I
D
|
D
N
x
R
K
 
S
L
 
A
D
 
N
D
 
G
A
 
-
A
 
-
L
 
-
K
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
G
I
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
C
F
 
H
V
 
I
G
 
A
P
 
S
D
 
D
N
 
N
R
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
G
K
 
E
L
 
M
A
 
A
G
 
A
D
 
E
Y
 
F
L
 
I
G
 
A
K
 
K
Q
 
A
L
 
L
Q
 
K
K
 
G
G
 
K
D
 
G
K
 
N
V
 
V
A
 
V
I
 
E
I
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
I
S
 
P
T
 
G
T
 
A
F
 
S
N
x
A
A
 
A
Q
 
R
Q
 
D
R
|
R
T
 
G
L
 
K
G
 
G
F
 
F
Q
 
D
D
 
E
A
 
A
M
 
I
-
 
A
K
 
K
D
 
Y
V
 
P
G
 
D
A
 
I
N
 
K
V
 
I
V
 
V
T
 
A
V
 
K
Q
 
Q
S
 
A
G
 
A
Q
 
D
W
x
F
E
 
D
I
 
R
D
 
S
Q
 
K
G
 
G
N
 
L
K
 
S
V
 
V
A
 
M
A
 
E
S
 
N
I
 
I
L
 
L
N
 
Q
A
 
A
H
 
Q
P
 
P
D
 
K
I
 
I
K
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
F
A
 
A
G
 
Q
N
|
N
D
 
D
N
 
E
M
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
I
A
 
K
A
 
A
I
 
I
R
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
N
K
 
R
T
 
Q
G
 
G
K
 
-
V
 
I
Q
 
I
L
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
D
|
D
N
 
G
I
 
T
N
 
E
A
 
D
I
 
A
K
 
L
P
 
K
M
 
A
L
 
I
K
 
K
D
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
M
L
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
I
D
 
A
Q
|
Q
F
 
Q
A
 
P
Q
 
A
Q
 
L
Q
 
M
A
 
G
V
 
S
F
 
L
G
 
G
I
 
V
E
 
E
T
 
M
A
 
A
L
 
D
K
 
K
A
 
Y
L
 
L
-
 
K
S
 
G
E
 
E
K
 
K
K
 
I
P
 
P
Q
 
N
S
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
F
V
 
I
E
 
P
T
 
A
K
 
E
V
 
L
S
 
K
L
 
L
V
 
I
T
 
T
K
 
K

1rpjA Crystal structure of d-allose binding protein from escherichia coli (see paper)
35% identity, 78% coverage: 32:275/314 of query aligns to 3:247/288 of 1rpjA

query
sites
1rpjA
K
 
E
V
 
Y
A
 
A
L
 
V
V
 
V
M
 
L
K
|
K
S
 
T
L
 
L
A
 
S
N
|
N
E
 
P
F
|
F
F
 
W
L
 
V
N
 
D
M
 
M
E
 
K
N
 
K
G
 
G
A
 
I
R
 
E
E
 
D
Y
 
E
Q
 
A
K
 
K
A
 
T
N
 
L
A
 
G
S
 
V
K
 
S
F
 
V
D
 
D
L
 
I
I
 
F
A
 
A
N
 
S
G
 
-
I
 
-
K
 
P
D
 
S
E
|
E
Q
 
G
D
 
D
T
 
F
A
 
Q
N
 
S
Q
 
Q
I
 
L
K
 
Q
I
 
L
V
 
F
E
 
E
Q
 
D
M
 
L
I
 
S
V
 
N
S
 
K
K
 
N
V
 
Y
N
 
K
A
 
G
L
 
I
V
 
A
I
 
F
A
 
A
P
 
P
A
 
L
D
 
S
S
 
S
K
 
V
A
 
N
L
 
L
V
 
V
P
 
M
V
 
P
V
 
V
K
 
A
K
 
R
A
 
A
I
 
W
D
 
K
A
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
Y
V
 
L
V
 
V
N
 
N
I
 
L
D
|
D
N
 
E
K
 
K
L
 
I
D
 
D
D
 
M
A
 
D
A
 
N
L
 
L
K
 
K
E
 
K
K
 
A
G
 
G
I
 
G
T
 
N
V
 
V
P
 
E
-
 
A
F
 
F
V
 
V
G
 
T
P
 
T
D
 
D
N
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
V
-
 
G
R
 
A
K
 
K
G
 
G
A
 
A
K
 
S
L
 
F
A
 
I
G
 
I
D
 
D
Y
 
K
L
 
L
G
 
G
K
 
A
Q
 
E
L
 
-
Q
 
-
K
 
-
G
 
G
D
 
G
K
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
K
S
 
A
T
 
G
T
 
N
F
 
A
N
x
S
A
 
G
Q
 
E
Q
 
A
R
|
R
T
 
R
L
 
N
G
 
G
F
 
A
Q
 
T
D
 
E
A
 
A
M
 
F
K
 
K
D
 
K
V
 
A
G
 
S
A
 
Q
-
 
I
N
 
K
V
 
L
V
 
V
T
 
A
V
 
S
Q
 
Q
S
 
P
G
 
A
Q
 
D
W
|
W
E
 
D
I
 
R
D
 
I
Q
 
K
G
 
A
N
 
L
K
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
T
S
 
N
I
 
V
L
 
L
N
 
Q
A
 
R
H
 
N
P
 
P
D
 
N
I
 
I
K
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
Y
A
 
C
G
 
A
N
|
N
D
 
D
N
 
T
M
 
M
A
 
A
L
 
M
G
 
G
A
 
V
V
 
A
A
 
Q
A
 
A
I
 
V
R
 
A
A
 
N
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
Q
 
L
L
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
T
D
|
D
N
 
G
I
 
I
N
 
P
A
 
E
I
 
A
K
 
R
P
 
K
M
 
M
L
 
V
K
 
E
D
 
A
G
 
G
R
 
Q
V
 
M
L
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
D
 
A
Q
|
Q

1gudA Hinge-bending motion of d-allose binding protein from escherichia coli: three open conformations (see paper)
35% identity, 78% coverage: 32:275/314 of query aligns to 3:247/288 of 1gudA

query
sites
1gudA
K
x
E
V
 
Y
A
 
A
L
 
V
V
 
V
M
 
L
K
 
K
S
 
T
L
 
L
A
 
S
N
 
N
E
 
P
F
 
F
F
 
W
L
 
V
N
 
D
M
 
M
E
 
K
N
 
K
G
 
G
A
 
I
R
 
E
E
 
D
Y
 
E
Q
 
A
K
 
K
A
 
T
N
 
L
A
 
G
S
 
V
K
 
S
F
 
V
D
|
D
L
 
I
I
 
F
A
 
A
N
 
S
G
 
-
I
 
-
K
 
P
D
 
S
E
 
E
Q
 
G
D
 
D
T
 
F
A
 
Q
N
 
S
Q
 
Q
I
 
L
K
 
Q
I
 
L
V
 
F
E
 
E
Q
 
D
M
 
L
I
 
S
V
 
N
S
 
K
K
 
N
V
 
Y
N
 
K
A
 
G
L
 
I
V
 
A
I
 
F
A
 
A
P
 
P
A
 
L
D
 
S
S
 
S
K
 
V
A
 
N
L
 
L
V
 
V
P
 
M
V
 
P
V
 
V
K
 
A
K
 
R
A
 
A
I
 
W
D
 
K
A
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
Y
V
 
L
V
 
V
N
 
N
I
 
L
D
 
D
N
 
E
K
 
K
L
 
I
D
 
D
D
 
M
A
 
D
A
 
N
L
 
L
K
 
K
E
 
K
K
 
A
G
 
G
I
 
G
T
 
N
V
 
V
P
 
E
-
 
A
F
 
F
V
 
V
G
 
T
P
 
T
D
 
D
N
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
V
-
 
G
R
 
A
K
 
K
G
 
G
A
 
A
K
 
S
L
 
F
A
 
I
G
 
I
D
 
D
Y
 
K
L
 
L
G
 
G
K
 
A
Q
 
E
L
 
-
Q
 
-
K
 
-
G
 
G
D
 
G
K
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
K
S
 
A
T
 
G
T
 
N
F
 
A
N
 
S
A
 
G
Q
 
E
Q
 
A
R
 
R
T
 
R
L
 
N
G
 
G
F
 
A
Q
 
T
D
 
E
A
 
A
M
 
F
K
 
K
D
 
K
V
 
A
G
 
S
A
 
Q
-
 
I
N
 
K
V
 
L
V
 
V
T
 
A
V
 
S
Q
 
Q
S
 
P
G
 
A
Q
 
D
W
 
W
E
 
D
I
 
R
D
 
I
Q
 
K
G
 
A
N
 
L
K
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
T
S
 
N
I
 
V
L
 
L
N
 
Q
A
 
R
H
 
N
P
 
P
D
 
N
I
 
I
K
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
Y
A
 
C
G
 
A
N
 
N
D
 
D
N
 
T
M
 
M
A
 
A
L
 
M
G
 
G
A
 
V
V
 
A
A
 
Q
A
 
A
I
 
V
R
 
A
A
 
N
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
Q
 
L
L
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
T
D
 
D
N
 
G
I
 
I
N
 
P
A
 
E
I
 
A
K
 
R
P
 
K
M
 
M
L
 
V
K
 
E
D
 
A
G
 
G
R
 
Q
V
 
M
L
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
D
 
A
Q
 
Q

4zjpA Structure of an abc-transporter solute binding protein (sbp_ipr025997) from actinobacillus succinogenes (asuc_0197, target efi-511067) with bound beta-d-ribopyranose
33% identity, 84% coverage: 33:296/314 of query aligns to 5:256/270 of 4zjpA

query
sites
4zjpA
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
T
M
 
V
K
 
S
S
 
T
L
 
L
A
 
D
N
|
N
E
 
P
F
|
F
F
|
F
L
 
V
N
 
S
M
 
L
E
 
K
N
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
E
 
-
Y
 
-
Q
 
K
K
 
K
A
 
A
N
 
T
A
 
E
S
 
L
K
 
G
F
 
Y
D
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
V
N
 
-
G
 
-
I
 
L
K
 
D
D
 
S
E
 
Q
Q
 
N
D
 
D
T
 
P
A
 
S
N
 
K
Q
 
E
I
 
L
K
 
S
I
 
N
V
 
V
E
 
E
Q
 
D
M
 
L
I
 
T
V
 
V
S
 
R
K
 
G
V
 
A
N
 
K
A
 
V
L
 
L
V
 
L
I
 
I
A
 
N
P
 
P
A
 
T
D
 
D
S
 
S
K
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
S
P
 
N
V
 
A
V
 
V
K
 
A
K
 
I
A
 
A
I
 
N
D
 
R
A
 
N
G
 
K
I
 
I
I
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
T
I
 
L
D
|
D
N
x
R
K
 
G
L
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
K
 
A
E
 
A
K
 
K
G
 
G
I
 
E
T
 
V
V
 
V
P
 
S
F
 
H
V
 
I
G
 
A
P
 
S
D
 
D
N
 
N
R
 
V
K
 
A
G
 
G
A
 
G
K
 
K
L
 
M
A
 
A
G
 
G
D
 
D
Y
 
F
L
 
I
G
 
A
K
 
Q
Q
 
K
L
 
L
Q
 
G
K
 
D
G
 
G
D
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
I
 
Q
I
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
L
S
 
A
T
 
G
T
 
T
F
 
S
N
 
A
A
 
A
Q
 
R
Q
 
E
R
|
R
T
 
G
L
 
E
G
 
G
F
 
F
Q
 
K
D
 
Q
A
 
A
M
 
I
K
 
E
D
 
A
V
 
H
G
 
K
A
 
F
N
 
D
V
 
V
V
 
L
T
 
A
V
 
S
Q
 
Q
S
 
P
G
 
A
Q
 
D
W
x
F
E
 
D
I
 
R
D
 
T
Q
 
K
G
 
G
N
 
L
K
 
N
V
 
V
A
 
T
A
 
E
S
 
N
I
 
L
L
 
L
N
 
A
A
 
S
H
 
K
P
 
G
D
 
S
I
 
V
K
 
Q
A
 
A
I
 
I
L
 
F
A
 
A
G
 
Q
N
|
N
D
 
D
N
 
E
M
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
L
A
 
R
A
 
A
I
 
I
R
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
-
G
 
-
K
 
K
V
 
V
Q
 
L
L
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
D
|
D
N
 
G
I
 
T
N
 
E
A
 
D
I
 
G
K
 
V
P
 
K
M
 
A
L
 
V
K
 
K
D
 
S
G
 
G
R
 
K
V
 
L
L
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
V
D
 
A
Q
|
Q
F
 
Q
A
 
P
Q
 
E
Q
 
L
Q
 
I
A
 
G
V
 
S
F
 
L
G
 
G
I
 
V
E
 
E
T
 
T
A
 
A
L
 
D
K
 
K
A
 
I
L
 
L
S
 
K
E
 
G
K
 
E
K
 
K

8wlbA X-ray structure of enterobacter cloacae allose-binding protein in complex with d-psicose (see paper)
34% identity, 78% coverage: 32:275/314 of query aligns to 3:247/288 of 8wlbA

query
sites
8wlbA
K
 
E
V
 
Y
A
 
A
L
 
V
V
 
V
M
 
L
K
|
K
S
 
T
L
 
L
A
 
S
N
|
N
E
 
P
F
|
F
F
x
W
L
 
V
N
 
D
M
 
M
E
 
K
N
 
K
G
 
G
A
 
I
R
 
E
E
 
D
Y
 
E
Q
 
A
K
 
K
A
 
T
N
 
L
A
 
G
S
 
V
K
 
S
F
 
V
D
 
D
L
 
I
I
 
F
A
 
A
N
 
S
G
 
-
I
 
-
K
 
P
D
 
S
E
 
E
Q
 
G
D
 
D
T
 
F
A
 
Q
N
 
S
Q
 
Q
I
 
L
K
 
Q
I
 
L
V
 
F
E
 
E
Q
 
D
M
 
L
I
 
S
V
 
N
S
 
K
K
 
K
V
 
Y
N
 
K
A
 
G
L
 
I
V
 
A
I
 
F
A
 
A
P
 
P
A
 
L
D
 
S
S
 
S
K
 
V
A
 
N
L
 
L
V
 
V
P
 
M
V
 
P
V
 
V
K
 
A
K
 
R
A
 
A
I
 
W
D
 
Q
A
 
K
G
 
G
I
 
L
I
 
Y
V
 
L
V
 
V
N
 
N
I
 
L
D
|
D
N
x
E
K
 
K
L
 
I
D
 
D
D
 
M
A
 
D
A
 
N
L
 
L
K
 
K
E
 
K
K
 
A
G
 
G
I
 
G
T
 
N
V
 
V
P
 
E
-
 
G
F
 
F
V
 
V
G
 
T
P
 
T
D
 
D
N
 
N
R
 
V
K
 
A
-
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
G
A
 
A
G
 
D
D
 
F
Y
 
I
L
 
I
G
 
N
K
 
K
Q
 
L
L
 
G
Q
 
A
K
 
E
G
 
G
D
 
G
K
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
K
S
 
A
T
 
G
T
 
N
F
 
A
N
x
S
A
 
G
Q
 
E
Q
 
A
R
|
R
T
 
R
L
 
N
G
 
G
F
 
A
Q
 
T
D
 
E
A
 
A
M
 
F
K
 
K
D
 
K
V
 
A
G
 
N
A
 
Q
-
 
I
N
 
K
V
 
L
V
 
V
T
 
A
V
 
S
Q
 
Q
S
 
P
G
 
A
Q
 
D
W
 
W
E
 
D
I
 
R
D
 
I
Q
 
K
G
 
A
N
 
L
K
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
T
S
 
N
I
 
V
L
 
L
N
 
Q
A
 
R
H
 
N
P
 
P
D
 
N
I
 
L
K
 
K
A
 
A
I
 
F
L
 
Y
A
 
C
G
 
A
N
|
N
D
 
D
N
 
T
M
 
M
A
 
A
L
 
M
G
 
G
A
 
V
V
 
A
A
 
Q
A
 
A
I
 
V
R
 
A
A
 
N
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
I
G
 
G
K
 
K
V
 
V
Q
 
L
L
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
T
D
|
D
N
 
G
I
 
I
N
 
P
A
 
E
I
 
A
K
 
R
P
 
K
M
 
M
L
 
V
K
 
E
D
 
A
G
 
G
R
 
Q
V
 
M
L
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
D
 
A
Q
|
Q

8wl9A X-ray structure of enterobacter cloacae allose-binding protein in complex with d-ribose (see paper)
34% identity, 78% coverage: 32:275/314 of query aligns to 3:247/288 of 8wl9A

query
sites
8wl9A
K
 
E
V
 
Y
A
 
A
L
 
V
V
 
V
M
 
L
K
 
K
S
 
T
L
 
L
A
 
S
N
|
N
E
 
P
F
|
F
F
 
W
L
 
V
N
 
D
M
 
M
E
 
K
N
 
K
G
 
G
A
 
I
R
 
E
E
 
D
Y
 
E
Q
 
A
K
 
K
A
 
T
N
 
L
A
 
G
S
 
V
K
 
S
F
 
V
D
 
D
L
 
I
I
 
F
A
 
A
N
 
S
G
 
-
I
 
-
K
 
P
D
 
S
E
 
E
Q
 
G
D
 
D
T
 
F
A
 
Q
N
 
S
Q
 
Q
I
 
L
K
 
Q
I
 
L
V
 
F
E
 
E
Q
 
D
M
 
L
I
 
S
V
 
N
S
 
K
K
 
K
V
 
Y
N
 
K
A
 
G
L
 
I
V
 
A
I
 
F
A
 
A
P
 
P
A
 
L
D
 
S
S
 
S
K
 
V
A
 
N
L
 
L
V
 
V
P
 
M
V
 
P
V
 
V
K
 
A
K
 
R
A
 
A
I
 
W
D
 
Q
A
 
K
G
 
G
I
 
L
I
 
Y
V
 
L
V
 
V
N
 
N
I
 
L
D
|
D
N
 
E
K
 
K
L
 
I
D
 
D
D
 
M
A
 
D
A
 
N
L
 
L
K
 
K
E
 
K
K
 
A
G
 
G
I
 
G
T
 
N
V
 
V
P
 
E
-
 
G
F
 
F
V
 
V
G
 
T
P
 
T
D
 
D
N
 
N
R
 
V
K
 
A
-
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
G
A
 
A
G
 
D
D
 
F
Y
 
I
L
 
I
G
 
N
K
 
K
Q
 
L
L
 
G
Q
 
A
K
 
E
G
 
G
D
 
G
K
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
K
S
 
A
T
 
G
T
 
N
F
 
A
N
 
S
A
 
G
Q
 
E
Q
 
A
R
|
R
T
 
R
L
 
N
G
 
G
F
 
A
Q
 
T
D
 
E
A
 
A
M
 
F
K
 
K
D
 
K
V
 
A
G
 
N
A
 
Q
-
 
I
N
 
K
V
 
L
V
 
V
T
 
A
V
 
S
Q
 
Q
S
 
P
G
 
A
Q
 
D
W
|
W
E
 
D
I
 
R
D
 
I
Q
 
K
G
 
A
N
 
L
K
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
T
S
 
N
I
 
V
L
 
L
N
 
Q
A
 
R
H
 
N
P
 
P
D
 
N
I
 
L
K
 
K
A
 
A
I
 
F
L
 
Y
A
 
C
G
 
A
N
|
N
D
 
D
N
 
T
M
 
M
A
 
A
L
 
M
G
 
G
A
 
V
V
 
A
A
 
Q
A
 
A
I
 
V
R
 
A
A
 
N
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
I
G
 
G
K
 
K
V
 
V
Q
 
L
L
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
T
D
|
D
N
 
G
I
 
I
N
 
P
A
 
E
I
 
A
K
 
R
P
 
K
M
 
M
L
 
V
K
 
E
D
 
A
G
 
G
R
 
Q
V
 
M
L
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
D
 
A
Q
|
Q

4wutA Crystal structure of an abc transporter solute binding protein (ipr025997) from agrobacterium vitis (avi_5133, target efi-511220) with bound d-fucose
32% identity, 90% coverage: 32:314/314 of query aligns to 2:277/290 of 4wutA

query
sites
4wutA
K
 
E
V
 
I
A
 
A
L
 
V
V
 
I
M
 
V
K
|
K
S
 
T
L
 
V
A
 
N
N
 
S
E
 
T
F
 
F
F
x
W
L
 
Q
N
 
N
M
 
V
E
 
Q
N
 
K
G
 
G
A
 
A
R
 
D
E
 
A
-
 
A
-
 
I
-
 
G
Y
 
K
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
N
 
H
A
 
T
S
 
I
K
 
T
F
 
F
D
 
-
L
 
-
I
 
-
A
 
-
N
 
Q
G
 
G
I
 
P
K
 
A
D
 
A
E
|
E
Q
 
S
D
 
A
T
 
I
A
 
A
N
 
D
Q
 
Q
I
 
V
K
 
N
I
 
M
V
 
V
E
 
E
Q
 
N
M
 
A
I
 
V
V
 
N
S
 
R
K
 
K
V
 
V
N
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
L
I
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
S
D
 
D
S
 
P
K
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
V
P
 
P
V
 
A
V
 
V
K
 
K
K
 
K
A
 
A
I
 
W
D
 
E
A
 
A
G
 
R
I
 
I
I
 
P
V
 
V
V
 
V
N
 
I
I
 
I
D
|
D
N
 
S
K
 
M
L
 
L
D
 
S
D
 
K
A
 
D
A
 
A
L
 
E
K
 
K
E
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
Y
T
 
Y
V
 
Q
P
 
A
F
 
F
V
 
L
G
 
A
P
 
T
D
 
D
N
 
N
R
 
K
K
 
A
G
 
A
A
 
G
K
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
A
D
 
K
Y
 
A
L
 
M
G
 
I
K
 
Q
Q
 
K
L
 
V
Q
 
G
K
 
T
G
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
I
 
V
I
 
M
E
 
S
G
 
Y
V
 
V
S
 
A
T
 
G
T
 
A
F
 
G
N
 
S
A
 
E
Q
 
I
Q
 
G
R
|
R
T
 
V
L
 
G
G
 
G
F
 
F
Q
 
T
D
 
D
A
 
Y
M
 
I
K
|
K
-
 
A
D
 
N
V
x
S
G
 
K
A
 
L
N
 
Q
V
 
I
V
 
V
T
 
G
V
 
P
Q
 
Y
S
 
Y
G
 
S
Q
 
Q
W
 
S
E
 
Q
I
 
M
D
 
A
Q
 
T
G
 
A
N
 
L
K
x
N
V
 
Q
A
 
T
A
 
T
S
x
D
I
 
V
L
 
L
N
 
A
A
 
A
H
 
N
P
 
A
D
 
D
I
 
L
K
 
K
A
 
G
I
 
I
L
 
F
A
 
G
G
 
A
N
|
N
D
 
E
N
 
P
M
 
T
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
M
V
 
G
A
 
R
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
L
Q
 
V
L
 
A
V
 
I
G
 
G
Y
 
F
D
|
D
N
 
G
I
 
N
N
 
Q
A
 
D
I
 
L
K
 
Q
P
 
E
M
 
F
L
 
V
K
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
T
V
 
L
L
 
E
A
 
A
T
 
T
V
 
V
D
 
V
Q
|
Q
F
 
G
A
 
S
Q
 
Y
Q
 
Q
Q
 
M
A
 
G
V
 
E
F
 
K
G
 
G
I
 
V
E
 
D
T
 
T
A
 
L
L
 
L
K
 
K
A
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
K
K
 
E
K
 
K
P
 
V
Q
 
E
S
 
K
A
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
F
V
 
I
E
 
D
T
 
T
K
 
G
V
 
V
S
 
V
L
 
V
V
 
V
T
 
T
K
 
K

2fn8A Thermotoga maritima ribose binding protein ribose bound form (see paper)
29% identity, 91% coverage: 30:314/314 of query aligns to 1:280/292 of 2fn8A

query
sites
2fn8A
K
 
K
P
 
G
K
 
K
V
 
M
A
 
A
L
 
I
V
 
V
M
 
I
K
 
S
S
 
T
L
 
L
A
 
N
N
|
N
E
 
P
F
x
W
F
|
F
L
 
V
N
 
V
M
 
L
E
 
A
N
 
E
G
 
T
A
 
A
R
 
K
E
 
Q
Y
 
-
Q
 
-
K
 
-
A
 
-
N
 
R
A
 
A
S
 
E
K
 
Q
F
 
L
D
 
G
L
 
Y
I
 
E
A
 
A
N
 
T
G
 
I
I
 
F
K
 
D
D
 
S
E
 
Q
Q
 
N
D
 
D
T
 
T
A
 
A
N
 
K
Q
 
E
I
 
S
K
 
A
I
 
H
V
 
F
E
 
D
Q
 
A
M
 
I
I
 
I
V
 
A
S
 
A
K
 
G
V
 
Y
N
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
I
I
 
F
A
 
N
P
 
P
A
 
T
D
 
D
S
 
A
K
 
D
A
 
G
L
 
S
V
 
I
P
 
A
V
 
N
V
 
V
K
 
K
K
 
R
A
 
A
I
 
K
D
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
P
V
 
V
V
 
F
N
 
C
I
 
V
D
|
D
N
x
R
K
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
G
L
 
I
K
 
N
E
 
A
K
 
R
G
 
G
I
 
L
T
 
A
V
 
V
P
 
A
F
 
Q
V
 
I
G
 
Y
P
 
S
D
 
D
N
 
N
R
 
Y
K
 
Y
G
 
G
A
 
G
K
 
V
L
 
L
A
 
M
G
 
G
D
 
E
Y
 
Y
L
 
F
G
 
V
K
 
K
Q
 
F
L
 
L
Q
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
P
-
 
D
-
 
A
K
 
K
G
 
E
D
 
I
K
 
P
V
 
Y
A
 
A
I
 
E
I
 
L
E
 
L
G
 
G
V
 
I
S
 
L
T
 
S
T
 
A
F
 
Q
N
 
P
A
 
T
Q
 
W
Q
 
D
R
|
R
T
 
S
L
 
N
G
 
G
F
 
F
Q
 
H
D
 
S
A
 
V
M
 
V
K
 
D
D
 
Q
V
 
Y
G
 
P
A
 
E
-
 
F
N
 
K
V
 
M
V
 
V
T
 
A
V
 
Q
Q
 
Q
S
 
S
G
 
A
Q
 
E
W
x
F
E
 
D
I
 
R
D
 
D
Q
 
T
G
 
A
N
 
Y
K
 
K
V
 
V
A
 
T
A
 
E
S
 
Q
I
 
I
L
 
L
N
 
Q
A
 
A
H
 
H
P
 
P
D
 
E
I
 
I
K
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
W
A
 
C
G
 
G
N
|
N
D
 
D
N
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
M
A
 
K
A
 
A
I
 
C
R
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
R
T
 
T
G
 
-
K
 
D
V
 
I
Q
 
Y
L
 
I
V
 
F
G
 
G
Y
 
F
D
|
D
N
 
G
I
 
A
N
 
E
A
 
D
I
 
V
K
 
I
P
 
N
M
 
A
L
 
I
K
 
K
D
 
E
G
 
G
R
 
K
-
 
Q
V
 
I
L
 
V
A
 
A
T
 
T
V
 
I
D
 
M
Q
|
Q
F
 
F
A
 
P
Q
 
K
Q
 
L
Q
 
M
A
 
A
V
 
R
F
 
L
G
 
A
I
 
V
E
 
E
T
 
W
A
 
A
L
 
D
K
 
Q
A
 
Y
L
 
L
S
 
-
E
 
-
K
 
-
K
 
R
P
 
G
Q
 
E
S
 
R
A
 
S
L
 
F
G
 
P
G
 
E
V
 
I
V
 
V
E
 
P
T
 
V
K
 
T
V
 
V
S
 
E
L
 
L
V
 
V
T
 
T
K
 
R

2h3hA Crystal structure of the liganded form of thermotoga maritima glucose binding protein (see paper)
29% identity, 78% coverage: 70:313/314 of query aligns to 37:285/313 of 2h3hA

query
sites
2h3hA
I
 
V
K
 
P
D
 
Q
E
 
K
Q
 
E
D
 
D
T
 
I
A
 
N
N
 
A
Q
 
Q
I
 
L
K
 
Q
I
 
M
V
 
L
E
 
E
Q
 
S
M
 
F
I
 
I
V
 
A
S
 
E
K
 
G
V
 
V
N
 
N
A
 
G
L
 
I
V
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
S
D
 
D
S
 
P
K
 
T
A
 
A
L
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
T
V
 
I
K
 
K
K
 
K
A
 
A
I
 
L
D
 
E
A
 
M
G
 
G
I
 
I
I
 
P
V
 
V
V
 
V
N
 
T
I
 
L
D
|
D
N
 
T
K
 
D
L
 
S
D
 
P
D
 
D
A
 
S
A
 
G
L
 
-
K
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
T
 
R
V
 
Y
P
 
V
F
 
Y
V
 
I
G
 
G
P
 
T
D
 
D
N
 
N
R
 
Y
K
 
Q
G
 
A
A
 
G
K
 
Y
L
 
T
A
 
A
G
 
G
D
 
L
Y
 
I
L
 
M
G
 
K
K
 
E
Q
 
L
L
 
L
Q
 
G
K
 
G
G
 
K
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
I
I
 
G
E
 
T
G
 
G
V
 
S
S
 
L
T
 
T
T
 
A
F
 
M
N
|
N
A
 
S
Q
 
L
Q
 
Q
R
|
R
T
 
I
L
 
Q
G
 
G
F
 
F
Q
 
K
D
 
D
A
 
A
M
 
I
K
 
K
D
 
D
V
 
S
G
 
E
A
 
I
N
 
E
V
 
I
V
 
V
T
 
D
V
 
I
Q
 
L
S
 
N
G
 
D
Q
 
E
W
x
E
E
 
D
I
 
G
D
 
A
Q
 
R
G
 
A
N
 
V
K
 
S
V
 
L
A
 
A
A
 
E
S
 
A
I
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
H
 
H
P
 
P
D
 
D
I
 
L
K
 
D
A
 
A
I
 
F
L
 
F
A
 
G
G
 
V
N
x
Y
D
x
A
N
 
Y
M
 
N
A
 
G
L
 
P
G
 
A
A
 
Q
V
 
A
A
 
L
A
 
V
I
 
V
R
 
K
A
 
N
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
V
G
 
G
K
 
K
V
 
V
Q
 
K
L
 
I
V
 
V
G
 
C
Y
 
F
D
|
D
N
 
T
I
 
T
N
 
P
A
 
D
I
 
I
K
 
L
P
 
Q
M
 
Y
L
 
V
K
 
K
D
 
E
G
 
G
R
 
V
V
 
I
L
 
Q
A
 
A
T
 
T
V
 
M
D
 
G
Q
|
Q
F
 
R
A
 
P
Q
 
Y
Q
 
M
Q
 
M
A
 
G
V
 
Y
F
 
L
-
 
S
-
 
V
-
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
Y
-
 
L
-
 
M
-
 
N
-
 
K
-
 
I
G
 
G
I
 
V
E
 
Q
T
 
N
A
 
T
L
 
L
K
 
M
A
 
M
L
 
L
S
 
P
E
 
K
K
 
V
K
 
K
P
 
V
Q
 
D
S
 
G
A
 
K
L
 
V
G
 
D
G
 
Y
V
 
V
V
 
I
E
 
D
T
 
T
K
 
G
V
 
V
S
 
D
L
 
V
V
 
V
T
 
T

Sites not aligning to the query:

3c6qC Apo and ligand-bound form of a thermophilic glucose/xylose binding protein
29% identity, 76% coverage: 75:313/314 of query aligns to 42:285/305 of 3c6qC

query
sites
3c6qC
D
 
D
T
 
I
A
 
N
N
 
A
Q
 
Q
I
 
L
K
 
Q
I
 
M
V
 
L
E
 
E
Q
 
S
M
 
F
I
 
I
V
 
A
S
 
E
K
 
G
V
 
V
N
 
N
A
 
G
L
 
I
V
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
S
D
 
D
S
 
P
K
 
T
A
 
A
L
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
T
V
 
I
K
 
K
K
 
K
A
 
A
I
 
L
D
 
E
A
 
M
G
 
G
I
 
I
I
 
P
V
 
V
V
 
V
N
 
T
I
 
L
D
|
D
N
 
T
K
 
D
L
 
S
D
 
P
D
 
D
A
 
S
A
 
G
L
 
-
K
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
T
 
R
V
 
Y
P
 
V
F
 
Y
V
 
I
G
 
G
P
 
T
D
 
D
N
 
N
R
 
Y
K
 
Q
G
 
A
A
 
G
K
 
Y
L
 
T
A
 
A
G
 
G
D
 
L
Y
 
I
L
 
M
G
 
K
K
 
E
Q
 
L
L
 
L
Q
 
G
K
 
G
G
 
K
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
I
I
 
G
E
 
T
G
 
G
V
 
S
S
 
L
T
 
T
T
 
A
F
 
M
N
|
N
A
 
S
Q
 
L
Q
 
Q
R
|
R
T
 
I
L
 
Q
G
 
G
F
 
F
Q
 
K
D
 
D
A
 
A
M
 
I
K
 
K
D
 
D
V
 
S
G
 
E
A
 
I
N
 
E
V
 
I
V
 
V
T
 
D
V
 
I
Q
 
L
S
 
N
G
 
D
Q
 
C
W
x
E
E
 
D
I
 
G
D
 
A
Q
 
R
G
 
A
N
 
V
K
 
S
V
 
L
A
 
A
A
 
E
S
 
A
I
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
H
 
H
P
 
P
D
 
D
I
 
L
K
 
D
A
 
A
I
 
F
L
 
F
A
 
G
G
 
V
N
x
Y
D
x
A
N
 
Y
M
 
N
A
 
G
L
 
P
G
 
A
A
 
Q
V
 
A
A
 
L
A
 
V
I
 
V
R
 
K
A
 
N
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
V
G
 
G
K
 
K
V
 
V
Q
 
K
L
 
I
V
 
V
G
 
C
Y
 
F
D
|
D
N
 
T
I
 
T
N
 
P
A
 
D
I
 
I
K
 
L
P
 
Q
M
 
Y
L
 
V
K
 
K
D
 
E
G
 
G
R
 
V
V
 
I
L
 
Q
A
 
A
T
 
T
V
 
M
D
 
G
Q
|
Q
F
 
R
A
 
P
Q
 
Y
Q
 
M
Q
 
M
A
 
G
V
 
Y
F
 
L
-
 
S
-
 
V
-
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
Y
-
 
L
-
 
M
-
 
N
-
 
K
-
 
I
G
 
G
I
 
V
E
 
Q
T
 
N
A
 
T
L
 
L
K
 
M
A
 
M
L
 
L
S
 
P
E
 
K
K
 
V
K
 
K
P
 
V
Q
 
D
S
 
G
A
 
K
L
 
V
G
 
D
G
 
Y
V
 
V
V
 
I
E
 
D
T
 
T
K
 
G
V
 
V
S
 
D
L
 
V
V
 
V
T
 
T

Sites not aligning to the query:

5ibqA Crystal structure of an abc solute binding protein from rhizobium etli cfn 42 (rhe_pf00037,target efi-511357) in complex with alpha-d-apiose
31% identity, 82% coverage: 33:288/314 of query aligns to 5:251/287 of 5ibqA

query
sites
5ibqA
V
 
I
A
 
A
L
 
I
V
 
I
M
 
T
K
 
P
S
 
A
L
 
H
A
 
D
N
|
N
E
 
P
F
|
F
F
 
F
L
 
K
N
 
A
M
 
E
E
 
A
N
 
V
G
 
G
A
 
A
R
 
E
E
 
-
Y
 
-
Q
 
A
K
 
K
A
 
A
N
 
K
A
 
E
S
 
L
K
 
G
F
 
Y
D
 
E
L
 
T
I
 
L
A
 
V
N
 
-
G
 
-
I
 
M
K
 
T
D
 
H
E
 
D
Q
 
D
D
 
D
T
 
A
A
 
N
N
 
K
Q
 
Q
I
 
S
K
 
E
I
 
M
V
 
I
E
 
D
Q
 
T
M
 
A
I
 
I
V
 
G
S
 
R
K
 
G
V
 
A
N
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
I
I
 
L
A
 
D
P
 
N
A
 
A
D
 
G
S
 
A
K
 
D
A
 
A
L
 
S
V
 
V
P
 
A
V
 
A
V
 
V
K
 
K
K
 
K
A
 
A
I
 
K
D
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
P
V
 
S
V
 
F
N
 
L
I
 
I
D
|
D
N
x
R
K
 
E
L
 
I
D
 
N
D
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
K
 
-
E
 
A
K
 
T
G
 
G
I
 
V
T
 
A
V
 
V
P
 
A
F
 
Q
V
 
I
G
 
V
P
 
S
D
 
N
N
 
N
R
 
Y
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
A
 
G
G
 
A
D
 
Q
Y
 
E
L
 
F
G
 
V
K
 
K
Q
 
L
L
 
M
-
 
G
Q
 
E
K
 
K
G
 
G
D
 
N
K
 
Y
V
 
V
A
 
E
I
 
L
I
 
V
E
 
-
G
 
G
V
 
K
S
 
E
T
 
S
T
x
D
F
 
T
N
|
N
A
 
A
Q
 
G
Q
 
I
R
|
R
T
 
S
L
 
Q
G
 
G
F
 
Y
Q
 
H
D
|
D
A
 
V
M
 
I
K
x
D
D
|
D
V
 
Y
G
 
P
A
 
E
-
 
M
N
 
K
V
 
S
V
 
V
T
 
A
V
 
K
Q
 
Q
S
 
S
G
 
A
Q
 
N
W
|
W
E
 
S
I
 
Q
D
 
T
Q
 
E
G
 
A
N
 
Y
K
 
S
V
 
K
A
 
M
A
 
E
S
 
T
I
 
I
L
 
L
N
 
Q
A
 
A
H
 
N
P
 
P
D
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
G
I
 
V
L
 
I
A
 
S
G
 
G
N
|
N
D
 
D
N
 
T
M
 
M
A
 
A
L
 
M
G
 
G
A
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
L
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
R
T
 
K
G
 
-
K
 
D
V
 
V
Q
 
I
L
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
D
|
D
N
 
G
I
 
S
N
 
N
A
 
D
I
 
V
K
 
R
P
 
D
M
 
S
L
 
I
K
 
K
D
 
S
G
 
G
R
 
G
V
 
I
L
 
K
A
 
A
T
 
T
V
 
V
D
 
L
Q
 
Q
F
 
P
A
 
A
Q
 
Y
Q
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
Q
F
 
L
G
 
A
I
 
V
E
 
E
T
 
Q
A
 
A

4ry0A Crystal structure of ribose transporter solute binding protein rhe_pf00037 from rhizobium etli cfn 42, target efi-511357, in complex with d-ribose
31% identity, 82% coverage: 33:288/314 of query aligns to 5:251/287 of 4ry0A

query
sites
4ry0A
V
 
I
A
 
A
L
 
I
V
 
I
M
 
T
K
 
P
S
 
A
L
 
H
A
 
D
N
|
N
E
 
P
F
 
F
F
|
F
L
 
K
N
 
A
M
 
E
E
 
A
N
 
V
G
 
G
A
 
A
R
 
E
E
 
-
Y
 
-
Q
 
A
K
 
K
A
 
A
N
 
K
A
 
E
S
 
L
K
 
G
F
 
Y
D
 
E
L
 
T
I
 
L
A
 
V
N
 
-
G
 
-
I
 
M
K
 
T
D
 
H
E
 
D
Q
 
D
D
 
D
T
 
A
A
 
N
N
 
K
Q
 
Q
I
 
S
K
 
E
I
 
M
V
 
I
E
 
D
Q
 
T
M
 
A
I
 
I
V
 
G
S
 
R
K
 
G
V
 
A
N
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
I
I
 
L
A
 
D
P
 
N
A
 
A
D
 
G
S
 
A
K
 
D
A
 
A
L
 
S
V
 
V
P
 
A
V
 
A
V
 
V
K
 
K
K
 
K
A
 
A
I
 
K
D
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
P
V
 
S
V
 
F
N
 
L
I
 
I
D
|
D
N
x
R
K
 
E
L
 
I
D
 
N
D
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
K
 
-
E
 
A
K
 
T
G
 
G
I
 
V
T
 
A
V
 
V
P
 
A
F
 
Q
V
 
I
G
 
V
P
 
S
D
 
N
N
 
N
R
 
Y
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
A
 
G
G
 
A
D
 
Q
Y
 
E
L
 
F
G
 
V
K
 
K
Q
 
L
L
 
M
-
 
G
Q
 
E
K
 
K
G
 
G
D
 
N
K
 
Y
V
 
V
A
 
E
I
 
L
I
 
V
E
 
-
G
 
G
V
 
K
S
 
E
T
 
S
T
x
D
F
 
T
N
 
N
A
 
A
Q
 
G
Q
 
I
R
|
R
T
 
S
L
 
Q
G
 
G
F
 
Y
Q
 
H
D
|
D
A
 
V
M
 
I
K
x
D
D
|
D
V
 
Y
G
 
P
A
 
E
-
 
M
N
 
K
V
 
S
V
 
V
T
 
A
V
 
K
Q
 
Q
S
 
S
G
 
A
Q
 
N
W
|
W
E
 
S
I
 
Q
D
 
T
Q
 
E
G
 
A
N
 
Y
K
 
S
V
 
K
A
 
M
A
 
E
S
 
T
I
 
I
L
 
L
N
 
Q
A
 
A
H
 
N
P
 
P
D
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
G
I
 
V
L
 
I
A
 
S
G
 
G
N
|
N
D
 
D
N
 
T
M
 
M
A
 
A
L
 
M
G
 
G
A
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
L
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
R
T
 
K
G
 
-
K
 
D
V
 
V
Q
 
I
L
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
D
|
D
N
 
G
I
 
S
N
 
N
A
 
D
I
 
V
K
 
R
P
 
D
M
 
S
L
 
I
K
 
K
D
 
S
G
 
G
R
 
G
V
 
I
L
 
K
A
 
A
T
 
T
V
 
V
D
 
L
Q
|
Q
F
 
P
A
 
A
Q
 
Y
Q
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
Q
F
 
L
G
 
A
I
 
V
E
 
E
T
 
Q
A
 
A

4irxA Crystal structure of caulobacter myo-inositol binding protein bound to myo-inositol (see paper)
29% identity, 84% coverage: 32:295/314 of query aligns to 10:278/296 of 4irxA

query
sites
4irxA
K
 
E
V
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
S
M
 
F
K
 
N
S
 
D
L
 
L
A
 
S
N
x
Q
E
 
P
F
|
F
F
 
F
L
 
V
N
 
A
M
 
M
E
 
R
N
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
R
E
 
E
Y
 
L
Q
 
E
K
 
D
A
 
-
N
 
E
A
 
A
S
 
A
K
 
K
F
 
L
D
 
G
L
 
V
I
 
K
A
 
V
N
 
Q
G
 
V
I
 
L
K
 
D
D
 
A
E
 
Q
Q
 
N
D
 
N
T
 
S
A
 
S
N
 
K
Q
 
Q
I
 
I
K
 
S
I
 
D
V
 
L
E
 
Q
Q
 
A
M
 
A
I
 
A
V
 
V
S
 
Q
K
 
G
V
 
A
N
 
K
A
 
V
L
 
V
V
 
I
I
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
T
D
 
D
S
 
S
K
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
A
P
 
G
V
 
A
V
 
A
K
 
D
K
 
D
A
 
L
I
 
V
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
I
 
V
I
 
A
V
 
V
V
 
I
N
 
S
I
 
V
D
|
D
N
x
R
K
 
N
L
 
I
D
 
A
D
 
G
A
 
G
A
 
K
L
 
-
K
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
T
T
 
A
V
 
V
P
 
P
F
 
H
V
 
V
G
 
G
P
 
A
D
 
D
N
 
N
R
 
V
K
 
A
G
 
G
A
 
G
K
 
R
L
 
A
A
 
M
G
 
A
D
 
D
Y
 
W
L
 
V
G
 
V
K
 
K
Q
 
T
L
 
Y
Q
 
P
K
 
A
G
 
G
D
 
A
K
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
E
 
T
G
x
N
V
x
D
S
 
P
T
 
G
T
 
S
F
 
S
N
x
S
A
 
S
Q
 
I
Q
 
E
R
|
R
T
 
V
L
 
K
G
 
G
F
 
V
Q
 
H
D
 
D
A
 
G
M
 
L
K
 
A
D
 
A
V
 
G
G
 
G
A
 
P
-
 
A
-
 
F
N
 
K
V
 
I
V
 
V
T
 
T
V
 
E
Q
 
Q
S
 
T
G
 
A
Q
 
N
W
x
S
E
 
K
I
 
R
D
 
D
Q
 
Q
G
 
A
N
 
L
K
 
T
V
 
V
A
 
T
A
 
Q
S
 
N
I
 
I
L
 
L
N
 
T
A
 
S
H
 
M
-
 
R
-
 
D
-
 
T
-
 
P
P
 
P
D
 
D
I
 
V
K
 
-
A
 
-
I
 
I
L
 
L
A
 
C
G
 
L
N
|
N
D
 
D
N
 
D
M
 
M
A
 
A
L
 
M
G
 
G
A
 
A
V
 
L
A
 
E
A
 
A
I
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
-
 
L
K
 
D
T
 
S
G
 
A
K
 
K
V
 
V
Q
 
K
L
 
V
V
 
I
G
 
G
Y
 
F
D
|
D
N
 
A
I
 
I
N
 
P
A
 
E
I
 
A
K
 
L
P
 
A
M
 
R
L
 
I
K
 
K
D
 
A
G
 
G
R
 
E
V
 
M
L
 
V
A
 
A
T
 
T
V
 
V
D
 
E
Q
|
Q
-
 
N
-
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
Q
-
 
I
-
 
R
F
 
T
A
 
A
Q
 
L
Q
 
R
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
F
 
D
G
 
K
I
 
I
E
 
K
T
 
S
-
 
G
-
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
S
L
 
V
S
 
S
E
 
L
K
 
K

7e7mC Crystal structure analysis of the streptococcus agalactiae ribose binding protein rbsb
31% identity, 83% coverage: 32:291/314 of query aligns to 10:253/284 of 7e7mC

query
sites
7e7mC
K
 
K
V
 
L
A
 
G
L
 
V
V
 
S
M
 
I
K
 
S
S
 
T
L
 
T
A
 
N
N
|
N
E
 
P
F
x
Y
F
|
F
L
 
V
N
 
A
M
 
M
E
 
K
N
 
D
G
 
G
A
 
I
R
 
D
E
 
K
Y
 
Y
Q
 
-
K
 
-
A
 
A
N
 
S
A
 
N
S
 
K
K
 
K
F
 
I
D
 
S
L
 
I
I
 
K
A
 
V
N
 
A
G
 
D
I
 
A
K
 
Q
D
 
D
E
 
-
Q
 
-
D
 
D
T
 
A
A
 
A
N
 
R
Q
 
Q
I
 
A
K
 
D
I
 
D
V
 
V
E
 
Q
Q
 
N
M
 
F
I
 
I
V
 
S
S
 
Q
K
 
N
V
 
V
N
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
L
I
 
I
A
 
N
P
 
P
A
 
V
D
 
D
S
 
S
K
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
V
P
 
T
V
 
A
V
 
I
K
 
K
K
 
S
A
 
A
I
 
N
D
 
N
A
 
A
G
 
N
I
 
I
I
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
L
I
 
M
D
|
D
N
x
R
K
 
G
L
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
K
 
S
E
 
E
K
 
G
G
 
G
I
 
K
T
 
V
V
 
L
P
 
T
F
 
T
V
 
V
G
 
A
P
 
S
D
 
D
N
 
N
R
 
V
K
 
A
G
 
A
A
 
G
K
 
K
L
 
M
A
 
A
G
 
A
D
 
D
Y
 
Y
L
 
A
G
 
V
K
 
K
Q
 
K
L
 
L
Q
 
G
K
 
K
G
 
K
D
 
A
K
 
K
V
 
A
A
 
F
I
 
E
I
 
L
E
 
S
G
 
G
V
 
V
S
 
P
T
 
G
T
 
A
F
 
S
N
 
A
A
 
T
Q
 
V
Q
 
D
R
|
R
T
 
G
L
 
K
G
 
G
F
 
F
Q
 
H
D
 
S
A
 
V
M
 
A
K
 
K
D
 
S
V
 
-
G
 
K
A
 
L
N
 
D
V
 
M
V
 
L
T
 
S
V
 
S
Q
 
Q
S
 
S
G
 
A
Q
 
N
W
x
F
E
 
D
I
 
R
D
 
A
Q
 
K
G
 
A
N
 
L
K
 
N
V
 
T
A
 
T
A
 
Q
S
 
N
I
 
M
L
 
I
N
 
Q
A
 
G
H
 
H
P
 
K
D
 
D
I
 
V
K
 
Q
A
 
I
I
 
I
L
 
F
A
 
A
G
 
Q
N
|
N
D
 
D
N
 
E
M
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
A
A
 
Q
A
 
A
I
 
V
R
 
K
A
 
S
A
 
A
G
 
G
K
 
-
T
 
L
G
 
Q
K
 
N
V
 
V
Q
 
L
L
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
I
D
|
D
N
 
G
I
 
Q
N
 
P
A
 
D
I
 
A
K
 
H
P
 
D
M
 
A
L
 
I
K
 
K
D
 
K
G
 
G
R
 
D
V
 
I
L
 
S
A
 
A
T
 
T
V
 
I
D
 
-
Q
 
-
F
 
-
A
 
A
Q
|
Q
Q
 
Q
Q
 
P
A
 
A
V
 
K
F
 
M
G
 
G
I
 
-
E
 
E
T
 
I
A
 
A
L
 
I
K
 
Q
A
 
A

4yo7A Crystal structure of an abc transporter solute binding protein (ipr025997) from bacillus halodurans c-125 (bh2323, target efi- 511484) with bound myo-inositol
29% identity, 86% coverage: 32:301/314 of query aligns to 7:269/287 of 4yo7A

query
sites
4yo7A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
L
 
G
V
 
V
M
 
S
K
 
I
S
 
S
L
 
N
A
 
L
N
x
D
E
 
E
F
 
F
F
 
L
L
 
T
N
 
Y
M
 
M
E
 
Q
N
 
D
G
 
A
A
 
M
R
 
K
E
 
E
Y
 
-
Q
 
E
K
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
Y
S
 
P
K
 
D
F
 
F
D
 
E
L
 
F
I
 
I
A
 
F
N
 
S
G
 
D
I
 
A
K
 
Q
D
 
N
E
 
-
Q
 
-
D
 
D
T
 
S
A
 
T
N
 
Q
Q
 
Q
I
 
M
K
 
A
I
 
Q
V
 
V
E
 
E
Q
 
N
M
 
F
I
 
I
V
 
S
S
 
R
K
 
N
V
 
V
N
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
I
I
 
V
A
 
N
P
 
P
A
 
V
D
 
D
S
 
T
K
 
T
A
 
S
L
 
A
V
 
V
P
 
D
V
 
I
V
 
V
K
 
N
K
 
M
A
 
V
I
 
N
D
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
P
V
 
I
V
 
I
N
 
-
I
 
I
D
 
A
N
|
N
K
x
R
L
 
T
D
 
F
D
 
D
A
 
G
A
 
V
L
 
D
K
 
Q
E
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
T
 
A
V
 
T
P
 
A
F
 
F
V
 
V
G
 
G
P
 
S
D
 
E
N
 
S
R
 
I
K
 
Q
G
 
S
A
 
G
K
 
L
L
 
L
A
 
Q
G
 
M
D
 
E
Y
 
E
L
 
V
G
 
A
K
 
K
Q
 
L
L
 
L
Q
 
N
K
 
N
G
 
E
D
 
G
K
 
N
V
 
I
A
 
A
I
 
I
I
 
M
E
 
D
G
 
G
V
 
-
S
 
E
T
 
L
T
 
G
F
 
H
N
 
E
A
 
A
Q
 
Q
-
 
I
Q
 
M
R
|
R
T
 
T
L
 
E
G
 
G
F
 
N
Q
 
K
D
 
Q
A
 
I
M
 
I
K
 
E
D
 
E
V
 
H
-
 
D
G
 
G
A
 
L
N
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
L
V
 
Q
Q
 
G
S
 
T
G
 
A
Q
 
K
W
 
F
E
 
D
I
 
R
D
 
S
Q
 
E
G
 
G
N
 
M
K
 
R
V
 
L
A
 
M
A
 
E
S
 
N
I
 
W
L
 
L
N
 
N
A
 
S
H
 
G
P
 
T
D
 
E
I
 
I
K
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
V
A
 
A
G
 
N
N
|
N
D
 
D
N
 
E
M
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
I
A
 
L
A
 
A
I
 
L
R
 
E
A
 
A
A
 
V
G
 
G
K
 
K
T
x
L
G
 
D
K
 
D
V
|
V
Q
 
I
L
 
V
V
 
A
G
 
G
Y
 
I
D
|
D
N
 
A
I
 
T
N
 
P
A
 
A
I
 
A
K
 
L
P
 
E
M
 
A
L
 
M
K
 
K
D
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
L
L
 
D
A
 
V
T
 
T
V
 
V
D
 
F
Q
|
Q
F
 
D
A
 
A
Q
 
K
Q
 
G
Q
 
Q
A
 
G
V
 
A
F
 
T
G
 
S
I
 
V
E
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
V
K
 
Q
A
 
A
L
 
A
S
 
N
E
 
G
K
 
E
K
 
D
P
 
V
Q
 
E
S
 
D
A
 
A
L
 
M

P39325 Galactofuranose-binding protein YtfQ from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
34% identity, 67% coverage: 66:274/314 of query aligns to 58:267/318 of P39325

query
sites
P39325
I
 
I
A
 
A
N
 
D
G
 
G
I
 
-
K
 
-
D
 
-
E
 
Q
Q
 
Q
D
 
K
T
 
Q
A
 
E
N
 
N
Q
 
Q
I
 
I
K
 
K
I
 
A
V
 
V
E
 
R
Q
 
S
M
 
F
I
 
V
V
 
A
S
 
Q
K
 
G
V
 
V
N
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
F
I
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
V
D
 
V
S
 
A
K
 
T
A
 
G
L
 
W
V
 
E
P
 
P
V
 
V
V
 
L
K
 
K
K
 
E
A
 
A
I
 
K
D
 
D
A
 
A
G
 
E
I
 
I
I
 
P
V
 
V
V
 
F
N
 
L
I
 
L
D
|
D
N
x
R
K
 
S
L
 
I
D
 
D
D
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
V
K
 
K
E
 
D
K
 
K
G
 
S
I
 
L
T
 
Y
V
 
M
P
 
T
F
 
T
V
 
V
G
 
T
P
 
A
D
 
D
N
 
N
R
 
I
K
 
L
G
 
E
A
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
I
G
 
G
D
 
D
Y
 
W
L
 
L
G
 
V
K
 
K
Q
 
E
L
 
V
Q
 
N
-
 
G
K
 
K
G
 
P
D
x
C
K
 
N
V
 
V
A
 
V
I
 
E
I
 
L
E
 
Q
G
 
G
V
 
T
S
 
V
T
 
G
T
 
A
F
 
S
N
 
V
A
 
A
Q
 
I
Q
 
D
R
|
R
T
 
K
L
 
K
G
 
G
F
 
F
Q
 
A
D
 
E
A
 
A
M
 
I
K
 
K
D
 
N
V
 
A
-
 
P
G
 
N
A
 
I
N
 
K
V
 
I
V
 
I
T
 
R
V
 
S
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
Q
 
D
W
 
F
E
 
T
I
 
R
D
 
S
Q
 
K
G
 
G
N
 
K
K
 
E
V
 
V
A
 
M
A
 
E
S
 
S
I
 
F
L
 
I
N
 
K
A
 
A
H
 
E
-
 
N
-
 
N
-
 
G
P
 
K
D
 
N
I
 
I
K
x
C
A
 
M
I
 
V
L
 
Y
A
 
A
G
 
H
N
|
N
D
 
D
N
 
D
M
 
M
A
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
E
A
 
A
G
 
G
-
 
L
K
 
K
T
 
P
G
 
G
K
 
K
V
 
D
Q
 
I
L
 
L
V
 
T
G
 
G
-
 
S
Y
 
I
D
|
D
N
 
G
I
 
V
N
 
P
A
 
D
I
 
I
K
 
Y
P
 
K
M
 
A
L
 
M
K
 
M
D
 
D
G
 
G
R
 
E
V
 
A
L
 
N
A
 
A
T
 
S
V
 
V
D
 
E

Sites not aligning to the query:

6gt9A Crystal structure of ganp, a glucose-galactose binding protein from geobacillus stearothermophilus, in complex with galactose
28% identity, 77% coverage: 35:275/314 of query aligns to 11:243/283 of 6gt9A

query
sites
6gt9A
L
 
L
V
 
V
M
 
P
K
x
E
S
 
E
L
 
L
A
 
D
N
|
N
E
 
D
F
x
Y
F
x
W
L
 
R
N
 
L
M
 
V
E
 
E
N
 
K
G
 
G
A
 
A
R
 
-
E
 
-
Y
 
-
Q
 
-
K
 
K
A
 
A
N
 
A
A
 
A
S
 
K
K
 
E
F
 
L
D
 
G
L
 
V
I
 
D
A
 
L
N
 
E
G
 
Y
I
 
I
K
 
G
D
 
P
E
 
R
Q
 
Q
-
 
A
D
 
N
T
 
I
A
 
D
N
 
E
Q
 
H
I
 
L
K
 
R
I
 
I
V
 
L
E
 
K
Q
 
K
M
 
A
I
 
A
V
 
A
S
 
A
K
 
K
V
 
V
N
 
D
A
 
G
L
 
I
V
 
I
I
 
T
A
 
Q
P
 
G
A
 
L
D
 
T
S
 
E
K
 
A
A
 
E
L
 
F
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
I
K
 
N
K
 
E
A
 
I
I
 
T
D
 
D
A
 
K
G
 
N
I
 
I
I
 
P
V
 
V
V
 
V
N
 
T
I
 
I
D
|
D
N
 
T
K
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
D
A
 
A
A
 
P
L
 
T
K
 
S
E
 
R
K
 
R
G
 
-
I
 
-
T
 
-
V
 
V
P
 
A
F
 
Y
V
 
V
G
 
G
P
 
T
D
 
D
N
 
N
R
 
Y
K
 
Y
G
 
A
A
 
G
K
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
D
 
R
Y
 
A
L
 
L
G
 
A
K
 
E
Q
 
D
L
 
T
Q
 
K
K
 
G
G
 
K
D
 
A
K
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
E
 
T
G
 
G
V
 
S
S
 
L
T
 
T
T
 
A
F
 
A
N
x
H
A
 
Q
Q
 
Q
Q
 
L
R
|
R
T
 
V
L
 
R
G
 
G
F
 
F
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
M
 
V
K
 
R
-
 
Q
D
 
E
V
 
K
G
 
G
A
 
I
N
 
R
V
 
I
V
 
V
T
 
A
V
 
I
Q
 
E
S
 
E
G
 
S
Q
 
H
W
x
I
E
 
T
I
 
R
D
 
V
Q
 
Q
G
 
A
N
 
A
K
 
E
V
 
K
A
 
A
A
 
Y
S
 
T
I
 
I
L
 
L
N
 
K
A
 
K
H
 
H
P
 
P
D
 
D
I
 
V
K
 
N
A
 
A
I
 
F
L
 
Y
A
 
G
G
 
T
N
x
S
D
x
A
N
 
L
M
 
D
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
V
V
 
A
A
 
K
A
 
V
I
 
V
R
 
E
A
 
Q
A
 
F
G
 
H
K
 
R
T
 
E
G
 
Q
K
 
K
V
 
T
Q
 
Y
L
 
I
V
 
I
G
 
G
Y
 
F
D
|
D
N
 
T
I
 
L
N
 
P
A
 
E
I
 
T
K
 
I
P
 
R
M
 
Y
L
 
L
K
 
Q
D
 
K
G
 
G
R
 
T
V
 
I
L
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
V
D
 
V
Q
|
Q

2vk2A Crystal structure of a galactofuranose binding protein (see paper)
34% identity, 67% coverage: 66:274/314 of query aligns to 36:245/296 of 2vk2A

query
sites
2vk2A
I
 
I
A
 
A
N
 
D
G
 
G
I
 
-
K
 
-
D
 
-
E
 
Q
Q
 
Q
D
 
K
T
 
Q
A
 
E
N
 
N
Q
 
Q
I
 
I
K
 
K
I
 
A
V
 
V
E
 
R
Q
 
S
M
 
F
I
 
V
V
 
A
S
 
Q
K
 
G
V
 
V
N
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
F
I
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
V
D
 
V
S
 
A
K
 
T
A
 
G
L
 
W
V
 
E
P
 
P
V
 
V
V
 
L
K
 
K
K
 
E
A
 
A
I
 
K
D
 
D
A
 
A
G
 
E
I
 
I
I
 
P
V
 
V
V
 
F
N
 
L
I
 
L
D
|
D
N
x
R
K
 
S
L
 
I
D
 
D
D
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
V
K
 
K
E
 
D
K
 
K
G
 
S
I
 
L
T
 
Y
V
 
M
P
 
T
F
 
T
V
 
V
G
 
T
P
 
A
D
 
D
N
 
N
R
 
I
K
 
L
G
 
E
A
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
I
G
 
G
D
 
D
Y
 
W
L
 
L
G
 
V
K
 
K
Q
 
E
L
 
V
Q
 
N
-
 
G
K
 
K
G
 
P
D
 
C
K
 
N
V
 
V
A
 
V
I
 
E
I
 
L
E
 
Q
G
 
G
V
 
T
S
 
V
T
 
G
T
 
A
F
 
S
N
 
V
A
 
A
Q
 
I
Q
 
D
R
|
R
T
 
K
L
 
K
G
 
G
F
 
F
Q
 
A
D
 
E
A
 
A
M
 
I
K
 
K
D
 
N
V
 
A
-
 
P
G
 
N
A
 
I
N
 
K
V
 
I
V
 
I
T
 
R
V
 
S
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
Q
 
D
W
x
F
E
 
T
I
 
R
D
 
S
Q
 
K
G
 
G
N
 
K
K
 
E
V
 
V
A
 
M
A
 
E
S
 
S
I
 
F
L
 
I
N
 
K
A
 
A
H
 
E
-
 
N
-
 
N
-
 
G
P
 
K
D
 
N
I
 
I
K
 
C
A
 
M
I
 
V
L
 
Y
A
 
A
G
 
H
N
|
N
D
 
D
N
 
D
M
 
M
A
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
E
A
 
A
G
 
G
-
 
L
K
 
K
T
 
P
G
 
G
K
 
K
V
 
D
Q
 
I
L
 
L
V
 
T
G
 
G
-
 
S
Y
 
I
D
|
D
N
 
G
I
 
V
N
 
P
A
 
D
I
 
I
K
 
Y
P
 
K
M
 
A
L
 
M
K
 
M
D
 
D
G
 
G
R
 
E
V
 
A
L
 
N
A
 
A
T
 
S
V
 
V
D
 
E

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>HSERO_RS11480 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS11480
MNKFTRRHFAIAALACAVLPGAAMAQTPAKPKVALVMKSLANEFFLNMENGAREYQKANA
SKFDLIANGIKDEQDTANQIKIVEQMIVSKVNALVIAPADSKALVPVVKKAIDAGIIVVN
IDNKLDDAALKEKGITVPFVGPDNRKGAKLAGDYLGKQLQKGDKVAIIEGVSTTFNAQQR
TLGFQDAMKDVGANVVTVQSGQWEIDQGNKVAASILNAHPDIKAILAGNDNMALGAVAAI
RAAGKTGKVQLVGYDNINAIKPMLKDGRVLATVDQFAQQQAVFGIETALKALSEKKPQSA
LGGVVETKVSLVTK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory